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JP2005274368A - バイオチップ用基板 - Google Patents

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JP2005274368A
JP2005274368A JP2004088406A JP2004088406A JP2005274368A JP 2005274368 A JP2005274368 A JP 2005274368A JP 2004088406 A JP2004088406 A JP 2004088406A JP 2004088406 A JP2004088406 A JP 2004088406A JP 2005274368 A JP2005274368 A JP 2005274368A
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JP
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hoch
hooc
film
sicl
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Application number
JP2004088406A
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English (en)
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Koichiro Nakamura
浩一郎 中村
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Nippon Sheet Glass Co Ltd
Original Assignee
Nippon Sheet Glass Co Ltd
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Publication date
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Priority to US11/087,616 priority patent/US20050214841A1/en
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Abstract


【課題】 微量の生体関連物質を微少領域に付着、保持するためバイオチッピ用基板を提供する。とくに微量の液体を基板上の複数箇所に高密度に保持することができ、その量のばらつきが小さく、また繰り返し再現性が良好な選択付着性を備えたバイオチップ用基板を提供する。
【解決手段】 平板状基板10の表面に所定の規則で配列された凹部20を形成する。この凹部表面は金属膜40で被覆し、その表面に金属と親和性を有する化合物を介して生体関連物質を固定するためのリンカーを導入する。凹部と凹部の間の平坦部の表面には撥水性被膜42を形成する。
【選択図】 図2

Description

本発明は、生命科学分野等で使用されるバイオチップに関し、とくに微少領域に選択的に特定物質を付着または保持する機能を有するバイオチップ用基板に関する。
生命科学の分野では、マイクロ化学反応器、ゲノム解析用チップ、プロテイン解析用チップなどを用いた超微少量、超高感度分析のため、機能素子の高集積化、高密度アレイ化が進んでいる。このため、これらに用いられる基板には選択付着性が要求されている。これらの基板では、微少量の生体関連物質溶液等の液体試料を選択的に所定箇所に保持し、分析や反応に供することができる。
このような機能は基板表面に特定の物質の分子と結合する機能を有する箇所(機能性結合サイト)を高密度に形成することによって実現できる。これらの技術については、例えば特許文献1〜5などに開示されている。
特表平9−500568号公報 特開2002−131327号公報 特開2002−307801号公報 特開2002−283530号公報 特開2003−121442号公報
しかしながら、上記特許文献に開示されている方法は、いずれも基板の平坦な表面上へのパターンを形成する方法であり、機能性結合サイトが平坦部にあるため、微量の生体関連物質等の試料を、基板表面の複数箇所に保持する際に、保持量のばらつきが大きく、また繰り返し再現性が悪いという問題があった。また結合部位を高密度化すると、近接する結合部位同士の距離が近くなり、隣接する試料が混入するという問題があった。
本発明はこのような課題を解決するためになされたものであって、微量の特定物質を微小領域に高密度に再現性よく付着、保持できるバイオチップ用基板を提供することを目的とする。
本発明のバイオチップ用基板は、表面に所定の規則で配列された凹部を有し、その凹部の所定部分をAu、Ag、Cu、Pdから選ばれた少なくとも1つの元素からなる金属膜によって被覆する。
上記の金属膜で被覆された凹部に、これらの金属と親和性を有する特定化学物質を微小領域に再現性よく付着、保持させることができる。
この金属膜上に生体関連物質を固定するためのリンカーが結合されていることが望ましく、とくにこのリンカーを金属膜上にチオエーテル結合を介して結合することが望ましい。
基板の凹部に、上記の金属と親和性があり、かつ生体関連物質を選択的に固定する機能をもつ官能基を有するリンカーを結合することにより、DNA等の生体関連物質を微小領域に効果的に付着、保持することができる。
さらに凹部表面の所定部分を除く基板表面を撥水性被膜で被覆することが望ましい。基板の所定部分以外を撥水性被膜で覆うことにより、特定化学物質は所定部分にのみ付着し、それ以外の部分には付着しにくくなり、選択性を高めることができる。
本発明のバイオチップ用基板は、凹部に微量の特定物質を安定に付着または保持させることができ、隣接した凹部へ混入することを防止できる。また付着物質の量のばらつきが低減され、繰り返し再現性も向上させることができ、優れた付着、保持機能を有するバイオチップ用基板を提供することができる。
以下に本発明の実施形態について詳細に説明する。
本発明のバイオチップ用基板の一例を図1に示す。平板状基板10の表面に、生体関連物質溶液等の液体材料を保持するための複数の凹部20が形成されている。この例では隣接する凹部と凹部の間はもとの平板状基板表面である平坦部30が存在する。そしてこの凹部表面と、それ以外の基板の平坦部表面とに、特定の生体関連物質試料に対する付着力に差異を与えるような処理を施すことにより、凹部20における試料の保持性能を向上させることができる。
本発明の基板に用いる材料としては、ガラス、セラミックス、半導体、金属、樹脂等をあげることができる。利用できるガラスの種類としては、石英ガラス(線膨張係数α=0.5ppm/K)、無アルカリガラス、ソーダライムガラスなどを例示できる。さらに、ゼロデュア(ショット社、α=−2ppm/K)、ネオセラム(日本電気硝子社、α=0.15ppm/K)などのような低膨張結晶化ガラス、パイレックス(コーニング社、α=3.25ppm/K)、BK7(ショット社、α=7.1ppm/K)などが挙げられる。
またウェハ形態で提供されているシリコン、InP、GaAsなどの半導体材料も使用可能である。樹脂材料については、エポキシ樹脂、アクリル樹脂、ポリカーボネート樹脂、ポリイミド樹脂、フッ素系樹脂などを挙げることができる。これらの中でも、耐熱性、透明性、化学的安定性に優れたガラスを用いることがもっとも好ましい。
図2は本発明のバイオチップ用基板の断面図を示している。平板状基板10に設けた凹部20内の表面に金属膜40が形成され、平坦部の表面には撥水性被膜42が形成されている。代表的な金属膜は金(Au)膜であるが、これに限られず、銀(Ag)、銅(Cu)、パラジウム(Pd)などを用いることもできる。
図では凹部20内の全表面に金属膜が形成されているが、必要に応じて所定部分、例えば凹部の底部分のみに形成してもよい。
さらに上記の金属膜表面に生体関連物質およびそれらを結合する化合物を選択的に固定する機能をもつ官能基を有するリンカーを導入する。
ここで生体関連物質とは、DNA、RNAなどの核酸類、たんぱく質、脂質、糖類、ビタミン、ホルモン、酵素などである。
これらの生体関連物質を選択的に固定することができる官能基としては、アミノ基、メルカプト基、カルボキシル基、スルホン酸基、ヒドロキシル基、アルキル基、フェニル基などを例示できる。
この中でも、AuあるいはAg、Cu、Pdと親和性が高いメルカプト基を有し、生体関連物質を化学的に結合できるカルボキシル基を有する化合物を用いることが好ましい。このような化合物としては、3−メルカプトプロピオン酸、3,3‘−ジチオジチオプロピオン酸が好ましい。
他にも、アルキル基、ヒドロキシル基、アミノ基などを含有するアルキルチオール化合物、ヒドロキシアルキルチオール化合物、アミノアルキルチオール化合物を用いても良い。また、これらのジスルフィド化合物である、アルキルジスルフィド化合物、ヒドロキシ基含有アルキルジスルフィド化合物、カルボキシル基含有アルカンチオール、アミノ基含有アルキルジスルフィド化合物をあげることができる。
これらの具体的な例としては、
CH3(CH230SH、CH3(CH225SH、
CH3(CH220SH、CH3(CH219SH、
CH3(CH218SH、CH3(CH217SH、
CH3(CH216SH、CH3(CH215SH、
CH3(CH214SH、CH3(CH213SH、
CH3(CH212SH、CH3(CH211SH、
CH3(CH210SH、CH3(CH29SH、
CH3(CH28SH、CH3(CH27SH、
CH3(CH26SH、CH3(CH25SH、
CH3(CH24SH、CH3(CH23SH、
CH3(CH22SH、CH3CH2SH、
のようなアルカンチオール、
HOCH2(CH230SH、HOCH2(CH225SH、
HOCH2(CH220SH、HOCH2(CH219SH、
HOCH2(CH218SH、HOCH2(CH217SH、
HOCH2(CH216SH、HOCH2(CH215SH、
HOCH2(CH214SH、HOCH2(CH213SH、
HOCH2(CH212SH、HOCH2(CH211SH、
HOCH2(CH210SH、HOCH2(CH29SH、
HOCH2(CH28SH、HOCH2(CH27SH、
HOCH2(CH26SH、HOCH2(CH25SH、
HOCH2(CH24SH、HOCH2(CH23SH、
HOCH2(CH22SH、HOCH2CH2SH、
のようなヒドロキシ基含有アルカンチオール、
HOOC(CH230SH、HOOC(CH225SH、
HOOC(CH220SH、HOOC(CH219SH、
HOOC(CH218SH、HOOC(CH217SH、
HOOC(CH216SH、HOOC(CH215SH、
HOOC(CH214SH、HOOC(CH213SH、
HOOC(CH212SH、HOOC(CH211SH、
HOOC(CH210SH、HOOC(CH29SH、
HOOC(CH28SH、HOOC(CH27SH、
HOOC(CH26SH、HOOC(CH25SH、
HOOC(CH24SH、HOOC(CH23SH、
HOOC(CH22SH、HOOCCH2SH、
のようなカルボキシル基含有アルカンチオール、
2N(CH230SH、H2N(CH225SH、
2N(CH220SH、H2N(CH219SH、
2N(CH218SH、H2N(CH217SH、
2N(CH216SH、H2N(CH215SH、
2N(CH214SH、H2N(CH213SH、
2N(CH212SH、H2N(CH211SH、
2N(CH210SH、H2N(CH29SH、
2N(CH28SH、H2N(CH27SH、
2N(CH26SH、H2N(CH25SH、
2N(CH24SH、H2N(CH23SH、
2N(CH22SH、H2NCH2SH、
のようなアミノ基含有アルカンチオール、
[CH3(CH230S] 2、[CH3(CH225S] 2
[CH3(CH220S] 2、[CH3(CH219S] 2
[CH3(CH218S] 2、[CH3(CH217S] 2
[CH3(CH216S] 2、[CH3(CH215S] 2
[CH3(CH214S] 2、[CH3(CH213S] 2
[CH3(CH212S] 2、[CH3(CH211S] 2
[CH3(CH210S] 2、[CH3(CH29S] 2
[CH3(CH28S] 2、[CH3(CH27S] 2
[CH3(CH26S] 2、[CH3(CH25S] 2
[CH3(CH24S] 2、[CH3(CH23S] 2
[CH3(CH22S] 2、[CH3CH2S] 2
のようなアルキルジスルフィド化合物、
[HOCH2(CH230S] 2、[HOCH2(CH225S] 2
[HOCH2(CH220S] 2、[HOCH2(CH219S] 2
[HOCH2(CH218S] 2、[HOCH2(CH217S] 2
[HOCH2(CH216S] 2、[HOCH2(CH215S] 2
[HOCH2(CH214S] 2、[HOCH2(CH213S] 2
[HOCH2(CH212S] 2、[HOCH2(CH211S] 2
[HOCH2(CH210S] 2、[HOCH2(CH29S] 2
[HOCH2(CH28S] 2、[HOCH2(CH27S] 2
[HOCH2(CH26S] 2、[HOCH2(CH25S] 2
[HOCH2(CH24S] 2、[HOCH2(CH23S] 2
[HOCH2(CH22S] 2、[HOCH2CH2S] 2
のようなヒドロキシ基含有アルキルジスルフィド化合物、
[HOOC(CH230S] 2、[HOOC(CH225S] 2
[HOOC(CH220SH、[HOOC(CH219S] 2
[HOOC(CH218SH、[HOOC(CH217S] 2
[HOOC(CH216SH、[HOOC(CH215S] 2
[HOOC(CH214SH、[HOOC(CH213S] 2
[HOOC(CH212SH、[HOOC(CH211S] 2
[HOOC(CH210SH、[HOOC(CH29S] 2
[HOOC(CH28SH、[HOOC(CH27S] 2
[HOOC(CH26SH、[HOOC(CH25S] 2
[HOOC(CH24SH、[HOOC(CH23S] 2
[HOOC(CH22SH、[HOOCCH2S] 2
のようなカルボキシル基含アルキルジスルフィド化合物、
[H2N(CH230S] 2、[H2N(CH225S] 2
[H2N(CH220S] 2、[H2N(CH219S] 2
[H2N(CH218S] 2、[H2N(CH217S] 2
[H2N(CH216S] 2、[H2N(CH215S] 2
[H2N(CH214S] 2、[H2N(CH213S] 2
[H2N(CH212S] 2、[H2N(CH211S] 2
[H2N(CH210S] 2、[H2N(CH29S] 2
[H2N(CH28S] 2、[H2N(CH27S] 2
[H2N(CH26S] 2、[H2N(CH25S] 2
[H2N(CH24S] 2、[H2N(CH23S] 2
[H2N(CH22S] 2、[H2NCH2S] 2
のようなアミノ基含有アルキルジスルフィド化合物を例示することができる。
一方、基板の凹部表面の所定部分以外の部分、とくに基板の平坦部分の表面は撥水性であることが好ましい。撥水性を与える材料としては、撥水性基を有するテトラフルオロエチレン、環状パーフルオロポリマー、フルオロアルキルシラン、アルキルシラン、シリコーン、ポリシランなどを例示することができる。
撥水性基を有する化合物としては撥水性基を有するシラン化合物が好ましく使用される。その例として、1個または2個以上の撥水性基、例えばアルキル基、フルオロアルキル基などを分子内に有するシラン化合物を挙げることができる。
アルキル基を有するシラン化合物としては、
CH3(CH230SiCl3、CH3(CH220SiCl3
CH3(CH218SiCl3、CH3(CH216SiCl3
CH3(CH214SiCl3、CH3(CH212SiCl3
CH3(CH210SiCl3、CH3(CH29SiCl3
CH3(CH28SiCl3、CH3(CH27SiCl3
CH3(CH26SiCl3、CH3(CH25SiCl3
CH3(CH24SiCl3、CH3(CH23SiCl3
CH3(CH22SiCl3、CH3CH2SiCl3
(CH3CH22SiCl2、(CH3CH23SiCl、
CH3SiCl3、(CH32SiCl2、(CH33SiCl、
のようなアルキル基含有クロロシラン、
CH3(CH230Si(OCH33、CH3(CH220Si(OCH33
CH3(CH218Si(OCH33、CH3(CH216Si(OCH33
CH3(CH214Si(OCH33、CH3(CH212Si(OCH33
CH3(CH210Si(OCH33、CH3(CH29Si(OCH33
CH3(CH28Si(OCH33、CH3(CH27Si(OCH33
CH3(CH26Si(OCH33、CH3(CH25Si(OCH33
CH3(CH24Si(OCH33、CH3(CH23Si(OCH33
CH3(CH22Si(OCH33、CH3CH2Si(OCH33
(CH3CH22Si(OCH32、(CH3CH23SiOCH3
CH3Si(OCH33、(CH32Si(OCH32、(CH33SiOCH3
CH3(CH230Si(OC253、CH3(CH220Si(OC253
CH3(CH218Si(OC253、CH3(CH216Si(OC253
CH3(CH214Si(OC253、CH3(CH212Si(OC253
CH3(CH210Si(OC253、CH3(CH29Si(OC253
CH3(CH28Si(OC253、CH3(CH27Si(OC253
CH3(CH26Si(OC253、CH3(CH25Si(OC253
CH3(CH24Si(OC253、CH3(CH23Si(OC253
CH3(CH22Si(OC253、CH3CH2Si(OC253
(CH3CH22Si(OC252、(CH3CH23SiOC25
CH3Si(OC253、(CH32Si(OC252、(CH33SiOC25
のようなアルキル基含有アルコキシシラン、
CH3(CH230Si(OCOCH33、CH3(CH220Si(OCOCH33
CH3(CH218Si(OCOCH33、CH3(CH216Si(OCOCH33
CH3(CH214Si(OCOCH33、CH3(CH212Si(OCOCH33
CH3(CH210Si(OCOCH33、CH3(CH29Si(OCOCH33
CH3(CH28Si(OCOCH33、CH3(CH27Si(OCOCH33
CH3(CH26Si(OCOCH33、CH3(CH25Si(OCOCH33
CH3(CH24Si(OCOCH33、CH3(CH23Si(OCOCH33
CH3(CH22Si(OCOCH33、CH3CH2Si(OCOCH33
(CH3CH22Si(OCOCH32、(CH3CH23SiOCOCH3
CH3Si(OCOCH33、(CH32Si(OCOCH32
(CH33SiOCOCH3
のようなアルキル基含有アシロキシシラン、
CH3(CH230Si(NCO)3、CH3(CH220Si(NCO)3
CH3(CH218Si(NCO)3、CH3(CH216Si(NCO)3
CH3(CH214Si(NCO)3、CH3(CH212Si(NCO)3
CH3(CH210Si(NCO)3、CH3(CH29Si(NCO)3
CH3(CH28Si(NCO)3、CH3(CH27Si(NCO)3
CH3(CH26Si(NCO)3、CH3(CH25Si(NCO)3
CH3(CH24Si(NCO)3、CH3(CH23Si(NCO)3
CH3(CH22Si(NCO)3、CH3CH2Si(NCO)3
(CH3CH22Si(NCO)2、(CH3CH23SiNCO、
CH3Si(NCO)3、(CH32Si(NCO)2
(CH33SiNCO、
のようなアルキル基含有イソシアネートシランを例示することができる。
フロオロアルキル基を有するシラン化合物としては、
CF3(CF211(CH22SiCl3
CF3(CF210(CH22Si(Cl)3
CF3(CF29(CH22SiCl3
CF3(CF28(CH22SiCl3
CF3(CF27(CH22SiCl3
CF3(CF26(CH22SiCl3
CF3(CF25(CH22SiCl3
CF3(CF24(CH22SiCl3
CF3(CF23(CH22SiCl3
CF3(CF22(CH22SiCl3
CF3CF2(CH22SiCl3
CF3(CH22SiCl3、
のようなフロオロアルキル基含有トリクロロシラン、
CF3(CF211(CH22Si(OCH33
CF3(CF210(CH22Si(OCH33
CF3(CF29(CH22Si(OCH33
CF3(CF28(CH22Si(OCH33
CF3(CF27(CH22Si(OCH33
CF3(CF26(CH22Si(OCH33
CF3(CF25(CH22Si(OCH33
CF3(CF24(CH22Si(OCH33
CF3(CF23(CH22Si(OCH33
CF3(CF22(CH22Si(OCH33
CF3CF2(CH22Si(OCH33
CF3(CH22Si(OCH33
CF3(CF211(CH22Si(OC253
CF3(CF210(CH22Si(OC253
CF3(CF29(CH22Si(OC253
CF3(CF28(CH22Si(OC253
CF3(CF27(CH22Si(OC253
CF3(CF26(CH22Si(OC253
CF3(CF25(CH22Si(OC253
CF3(CF24(CH22Si(OC253
CF3(CF23(CH22Si(OC253
CF3(CF22(CH22Si(OC253
CF3CF2(CH22Si(OC253
CF3(CH22Si(OC253
のようなフロオロアルキル基含有トリアルコキシシラン、
CF3(CF211(CH22Si(OCOCH33
CF3(CF210(CH22Si(OCOCH33
CF3(CF29(CH22Si(OCOCH33
CF3(CF28(CH22Si(OCOCH33
CF3(CF27(CH22Si(OCOCH33
CF3(CF26(CH22Si(OCOCH33
CF3(CF25(CH22Si(OCOCH33
CF3(CF24(CH22Si(OCOCH33
CF3(CF23(CH22Si(OCOCH33
CF3(CF22(CH22Si(OCOCH33
CF3CF2(CH22Si(OCOCH33
CF3(CH22Si(OCOCH33 、
のようなフロオロアルキル基含有トリアシロキシシラン、
CF3(CF211(CH22Si(NCO)3
CF3(CF210(CH22Si(NCO)3
CF3(CF29(CH22Si(NCO)3
CF3(CF28(CH22Si(NCO)3
CF3(CF27(CH22Si(NCO)3
CF3(CF26(CH22Si(NCO)3
CF3(CF25(CH22Si(NCO)3
CF3(CF24(CH22Si(NCO)3
CF3(CF23(CH22Si(NCO)3
CF3(CF22(CH22Si(NCO)3
CF3CF2(CH22Si(NCO)3
CF3(CH22Si(NCO)3、
ようなフロオロアルキル基含有トリイソシアネートシランを例示することができる。
これらの中でフロオロアルキル基含有トリアルコキシシラン、特にフッ素原子の数が13〜22のフロオロアルキルトリメトキシシラン、フロオロアルキルトリエトキシシランが好ましく用いられる。
ここに例示した化合物を用いて、本発明の基板の平坦部の表面を単独もしくは異なる物質を組み合わせて被覆することで、平坦部には生体関連物質が付着しにくくなり、例え凹部間が接近していても生体関連物質試料は隣接凹部へ混入しにくくなる。
本発明の基板は、上記特許文献1〜5などが開示されている基板とは異なり、あらかじめ基板表面に凹部を有しており、この凹部自身がとくに液体を保持する機能をもつ。この液体の保持機能は固体基板表面における液体の接触角で評価できる。接触角θは図3に示すように固体基板12表面に滴下した液滴100が基板表面と接触する角度で定義される。
本発明においては、凹部と平坦部の接触角の差を、20度より大きくすることで、定量性、再現性に優れ、高密度な結合部位を有するバイオチップ用基板を提供することができる。凹部のない平坦な基板表面においては、より大きな接触角の差が必要であり、本発明により被覆材料の選択範囲が広くなる。接触角の差は、さらに好ましくは、50度より大きく、より好ましくは、80度より大きくする。これによりさらに選択的に優れた基板を提供することができる。
なお、接触角の最大値は180度である。この場合、液体は基板をまったく濡らさず、球状の液滴となる。本発明の基板においても撥水性を付与した平坦部での理想的な接触角は180度である。
本発明の基板は規則的に配列された凹部を有することが特徴である。凹部の形状、高さ、幅、密度は、本発明の基板が用いられるバイオチップに応じて必要な形態をとればよい。凹部の形状としては、球面状、円錐状、三角錐状、四角錐状、溝状、円柱状、線状、Y分岐線状などが挙げられる。
配列された凹部が球面状、円錐状、三角錐状、四角錐状、溝状、円柱状などである場合については、1cm2当り4個以上、好ましくは、100個以上、さらに好ましくは、10,000個以上とする。また、線状凹部の場合は線幅を3,000マイクロメートル以下、好ましくは、10マイクロメートル以下とする。これにより、高密度の微細パターン構造を有するバイオチップ用基板を得ることができる。
次に本発明のバイオチップ用基板の製造方法について説明する。基本的には基板表面の凹部を予め加工し、その後に凹部あるいは平坦部にそれぞれ所望の付着性を備えた材質の被膜を形成する。
規則的に配列された凹部を有する基板の製造方法としては、フォトリソグラフィ、電子線リソグラフィー、陽子線リソグラフィー、X線リソグラフィーなどによるマスクパターンの形成とレーザアブレージョン法、ウェットエッチング法などによる凹部形成を組み合わせた方法を例示できる。
基板表面に被膜を形成する方法としては、湿式法と乾式法(真空法)を例示できる。
湿式法については、スピンコート法、ディップコート法、スプレーコート法、フローコート法、メニスカスコート法、グラビア印刷法、フレキソ印刷法、ナノインプリンティング法、ソフトリソグラフィー法、マイクロコンタクトプリンティング法などを例示できる。とくにソフトリソグラフィー法は凹部を有する基板表面の平坦部にのみ選択的に溶液を付着させる方法として、簡便で低コストな方法である。
乾式法(真空法)については、蒸着法、スパッタ法、イオンビーム法、CVD法、MOCVD法などがあげられる。これらの方法を組み合わせることにより、基板表面の所定部分に所定の材質の被膜を形成することができる。
以下に具体的な実施例について説明する。
石英ガラス基板(厚み2mm、寸法50mm×50mm)上に、Cr膜をスパッタリング法により成膜し、さらにフォトレジストをスピンコート法により塗布した。つぎにこのフォトレジスト膜を、縦方向に50個、横方向に50個、合計2500個の開口部が碁盤の目状に配列したパターンで露光し、露光部分のフォトレジストを現像、除去した。このフォトレジスト膜をマスクとしてCr膜をエッチングし、開口を形成した。
このフォトレジスト付きCr膜で被覆されたガラス基板を、超純水(比抵抗値:18MΩ・cm)で洗浄した後、49%フッ化水素酸を用いてエッチングを行い球面状の凹部を形成した。この後、超純水で後洗浄した後、NaOH水溶液にてフォトレジスト膜を剥離した。
この状態では凹部表面は基板のガラスが露出しており、平坦部はCr膜によって被覆されている。この状態の基板表面全体にスパッタリング法でAu膜を成膜した。次いで硝酸2アンモニウムセリウム水溶液を用いて、Crマスクを剥離除去し、球状凹部の内部にのみAu膜を有する基板を得た。
つぎに平坦部に、つぎに示すようなソフトリソグラフィー法により、撥水層を形成した。
表面が平坦で厚さ約1mmの板状ポリジメチルシロキサン(PDMS)をスタンパとして用いる。フルオロアルキルシランを酸触媒と水により加水分解したアルコール溶液を平皿状の容器に入れ、スタンパの一方の表面をこの液に接触させる。次に、スタンパを上記の基板の表面に接触させてスタンパ表面の液を、基板の表面に転写した。引き続き室温で、24時間乾燥した。
この基板表面の水の接触角を測定すると、平坦部の表面では110度であった(基板A)。
つぎに基板Aの凹部内にDNAを固定するため、図4に示すような過程で処理を行った。
まず、1ミリモル濃度の3,3’−ジチオジプロピオン酸水溶液3mlの中に基板Aを30分間浸漬した。これによってAu膜表面はカルボキシル基が導入される(図4(b))。
つぎに100mg/mlの濃度のN−ヒドロキシコハク酸イミドと塩酸1−エチル−3−(3−ジメチルアミノプロピル)カルボジイミドの混合水溶液に浸漬し、基板表面のカルボキシル基と30分間反応させた後、乾燥させた。これによってAu膜表面にはチオール基が導入される(図4(c))。
次いでアビジンを緩衝液(pH=8.0、10mlのトリスー塩酸、0.2モル塩化ナトリウム)で0.2mg/mlとなるように調製し、その溶液1mlに基板を1時間浸漬した。1モル濃度のエタノールアミン水溶液1mlに基板を30分間浸して未反応のカルボキシル基を不活性化した。以上により、凹部内のAu膜上がチオエーテル結合によってアビジン修飾される(図4(d)、基板B)。この基板BがDNAを固定するためのリンカーを備えた本発明のバイオチップ用基板である。
この基板Bをつぎのように処理することにより、DNAを基板凹部にのみ固定することができる。緩衝液(pH=8.0、10mlのトリスー塩酸、0.2モル塩化ナトリウム)にビオチン化DNAを1マイクロモルになるようにした1mlの溶液に25℃で30分間浸漬し、アビジンをリンカーとしてビオチン修飾DNAを固定した基板Cを得た(図4(e))。
つぎに蛍光強度を増強して観察するため、図5に示すように、DNA同士を結合させる。FITC修飾したDNAを緩衝液(pH=7.9、10mlのトリスー塩酸、0.2モル塩化ナトリウム)で希釈した溶液1mlに基板Bを60℃で30分間浸漬させてDNA同士を結合させた(図5(b))。結合したDNAは、蛍光顕微鏡(励起光450〜490nm、吸収光515〜565nm)により蛍光を観察して、DNAが基板凹部に固定されているのを確認した。
本実施例では、実施例1同様に作製した基板Aの凹部のAu膜上にのみ選択的に、アルカンチオールを導入した。
エイコサンチオール[CH3(CH219SH]の3%(重量/体積比)エタノール溶液を準備し、これに基板Aを浸漬した後、3時間室温で放置した。アルカンチオールは、撥水性平坦部には付着せず、チオール基と反応性の高いAu膜上にのみ成膜された。以後、実施例1と同様の処理で、チオエーテル結合を介してリンカーを導入したバイオチップ用基板を得ることができる。
本実施例では、実施例1同様に作製した基板Aの凹部のAu膜上にのみ選択的に、ヒドロキシ基含有アルカンチオールを導入した。
11−メルカプト−1−ウンデカノール[HS(CH210SH]の3%(重量/体積比)エタノール溶液を準備し、これに基板Aを浸漬した後、3時間室温で放置した。11−メルカプト−1−ウンデカノールは、撥水性平坦部には付着せず、チオール基と反応性の高いAu膜上にのみ成膜された。以後、実施例1と同様の処理で、チオエーテル結合を介してリンカーを導入したバイオチップ用基板を得ることができる。
本実施例では、実施例1同様に作製した基板Aの凹部のAu膜上にのみ選択的に、カルボキシル基含有アルカンチオールを導入した。
16−メルカプトヘキサデカン酸[HOOC(CH215SH]の3%(重量/体積比)エタノール溶液を準備し、これに基板Aを浸漬した後、3時間室温で放置した。16−メルカプトヘキサデカン酸は、撥水性平坦部には付着せず、チオール基と反応性の高いAu膜上にのみ成膜された。以後、実施例1と同様の処理で、チオエーテル結合を介してリンカーを導入したバイオチップ用基板を得ることができる。
本実施例では、実施例1同様に作製した基板Aの凹部のAu膜上にのみ選択的に、アミノ基含有アルカンチオールを導入した。
11−アミノ−1−ウンデカンチオール[H2N(CH211SH]の3%(重量/体積比)エタノール溶液を準備し、これに基板Aを浸漬した後、3時間室温で放置した。11−アミノ−1−ウンデカンチオール酸は、撥水性平坦部には付着せず、チオール基と反応性の高いAu膜上にのみ成膜された。以後、実施例1と同様の処理で、チオエーテル結合を介してリンカーを導入したバイオチップ用基板を得ることができる。
石英ガラス基板(厚み2mm、寸法50mm×50mm)上に、Cr膜をスパッタリング法により成膜し、さらにフォトレジストをスピンコート法により塗布した。つぎにこのフォトレジスト膜を、縦方向に50個、横方向に50個、合計2500個の開口部が碁盤の目状に配列したパターンで露光し、露光部分のフォトレジストを現像、除去した。このフォトレジスト膜をマスクとしてCr膜をエッチングし、開口を形成した。
このフォトレジスト付きCr膜で被覆されたガラス基板を、超純水(比抵抗値:18MΩ・cm)で洗浄した後、49%フッ化水素酸を用いてエッチングを行い球面状の凹部を形成した。この後、超純水で後洗浄した後、NaOH水溶液にてフォトレジスト膜を剥離した。この後、超純水で後洗浄した後、NaOH水溶液にてフォトレジスト膜を剥離した。更に硝酸2アンモニウムセリウム水溶液を用いて、Crマスクを剥離除去した。
つぎに平坦部に、つぎに示すようなソフトリソグラフィー法により、撥水層を形成した。
表面が平坦で厚さ約1mmの板状ポリジメチルシロキサン(PDMS)をスタンパとして用いる。フルオロアルキルシランを酸触媒と水により加水分解したアルコール溶液を平皿状の容器に入れ、スタンパの一方の表面をこの液に接触させる。次に、スタンパを上記の基板の表面に接触させてスタンパ表面の液を基板の表面に転写した。引き続き室温で24時間乾燥した。
この基板表面の水の接触角を測定すると、平坦部の表面では110度であった。
次に、このガラス基板の平坦部に相当する部分を遮蔽し、凹部に相当する部分にのみ開口部を有するガラス製マスクを準備する。このマスクの開口部と基板の凹部を位置合わせして密着させ、スパッタリング法により、凹部にのみ、Ag膜を成膜した。実施例1における基板Aをこの基板に置き換えて、凹部のAg膜上にのみ選択的にチオール化合物を成膜した。以後、実施例1と同様の処理で、チオエーテル結合を介してリンカーを導入したバイオチップ用基板を得ることができる。
実施例6におけるAg膜の代わりに、Cu膜を成膜したほかは、同様にして凹部のCu膜上にのみ選択的にチオール化合物を成膜したバイオチップ用基板を得た。
実施例6におけるAg膜の代わりに、Pd膜を成膜したほかは、同様にして凹部のPd膜上にのみ選択的にチオール化合物を成膜したバイオチップ用基板を得た。
本発明のバイオチップ用基板の一例を示す斜視図である。 バイオチップ用基板の一例の断面模式図である。 液滴の接触角を説明する図である。 基板凹部の修飾過程を示す図である。 DNAの結合過程を示す図である。
符号の説明
10 基板
20 凹部
30 平坦部
40 金属膜
42 撥水性被膜
100 液滴

Claims (4)

  1. 表面に所定の規則で配列された凹部を有するバイオチップ用基板であって、前記凹部表面の所定部分はAu、Ag、Cu、Pdから選ばれた少なくとも1つの元素からなる金属膜によって被覆されていることを特徴とするバイオチップ用基板。
  2. 前記金属膜上に生体関連物質を固定するためのリンカーが結合されていることを特徴とする請求項1に記載のバイオチップ用基板。
  3. 前記リンカーはチオエーテル結合を介して前記金属膜と結合されていることを特徴とする請求項2に記載のバイオチップ用基板。
  4. 前記凹部表面の所定部分を除く前記基板表面が撥水性被膜で被覆されていることを特徴とする請求項1、2または3に記載のバイオチップ用基板。
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