JP2003518361A - 更なるｐｒｏポリペプチドとその配列 - Google Patents

Abstract

(57)【要約】 膜結合タンパク質及びレセプター分子は、製薬及び診断薬としてを含む様々な産業上の用途を有する。レセプターイムノアドヘシンは、例えば、レセプター-リガンド相互作用をブロックする治療薬として用いられる。また膜結合タンパク質は、関連するレセプター／リガンド相互作用の潜在的なペプチド又は小分子インヒビターのスクリーニングにも使用できる。新規な天然のレセプター又は膜結合タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規なレセプター又は膜結合タンパク質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスクリーニングに集中している。本発明は、新規なポリペプチド及びこれらのポリペプチドをコードする核酸分子に係る。またここで、これらの核酸配列を含むベクター及び宿主細胞、異種ポリペプチドに融合した本発明のポリペプチドを含むキメラポリペプチド分子、本発明のポリペプチドに結合する抗体、及び本発明のポリペプチドの製造方法も提供する。

Description

【発明の詳細な説明】

【０００１】 (発明の分野) 本発明は、一般的に、新規なＤＮＡの同定及び単離、及び新規なポリペプチド
の組換え生産に関する。

【０００２】 (発明の背景) 細胞外タンパク質は、特に、多細胞生物の形成、分化及び維持において重要な
役割を担っている。多くの個々の細胞の運命、例えば増殖、泳動、分化又は他の
細胞との相互作用は、典型的には、他の細胞及び／又は直近の環境から受け取る
情報に支配される。この情報は、しばしば分泌ポリペプチド(例えば、分裂促進
因子、生存因子、細胞障害性因子、分化因子、神経ペプチド、及びホルモン)に
より伝達され、これが、翻って多様な細胞レセプター又は膜結合タンパク質によ
り受け取られ解釈される。これらの分泌ポリペプチド又はシグナル分子は、通常
は細胞分泌経路を通過して、細胞外環境におけるその作用部位に到達する。 分泌タンパク質は、製薬、診断、バイオセンサー及びバイオリアクターを含む
、様々な産業上の利用性を有している。血栓溶解剤、インターフェロン、インタ
ーロイキン、エリスロポエチン、コロニー刺激因子、及び種々の他のサイトカイ
ンのような、現在入手可能な大抵のタンパク質薬物は分泌タンパク質である。新
規な未変性分泌タンパク質を同定する努力が産業界及び学術界の両方によってな
されている。多くの努力が新規な分泌タンパク質のコード配列を同定するために
哺乳類組換えＤＮＡライブラリーのスクリーニングに注がれている。スクリーニ
ング方法及び技術の例は文献に記載されている[例えば、Klein等, Proc. Natl.
Acad. Sci. 93;7108-7113(1996);米国特許第５５３６６３７号を参照されたい]
。 膜結合タンパク質及びレセプターは、多細胞生物の形成、分化及び維持におい
て重要な役割を担っている。多くの個々の細胞の運命、例えば増殖、遊走、分化
又は他の細胞との相互作用は、典型的には他の細胞及び／又は直近の環境から受
け取られる情報に支配される。この情報は、しばしば分泌ポリペプチド(例えば
、分裂促進因子、生存因子、細胞障害性因子、分化因子、神経ペプチド、及びホ
ルモン)により伝達され、これが次に多様な細胞レセプター又は膜結合タンパク
質により受け取られ解釈される。このような膜結合タンパク質及び細胞レセプタ
ーは、これらに限定されるものではないが、サイトカインレセプター、レセプタ
ーキナーゼ、レセプターホスファターゼ、細胞-細胞間相互作用に関与するレセ
プター、及びセレクチン及びインテグリンのような細胞接着分子を含む。例えば
、細胞の増殖及び分化を調節するシグナルの伝達は、様々な細胞タンパク質のリ
ン酸化により部分的に調節される。そのプロセスを触媒する酵素であるプロテイ
ンチロシンキナーゼはまた成長因子レセプターとしても作用する。具体例には、
繊維芽細胞増殖因子及び神経成長因子レセプターが含まれる。 膜結合タンパク質及びレセプター分子は、製薬及び診断薬を含む、様々な産業
上の利用性を有している。例えば、レセプターイムノアドヘシンはレセプター-
リガンド間相互作用を阻止する治療薬として使用することができる。膜結合タン
パク質はまた、関連するレセプター／リガンド間相互作用の可能性のあるペプチ
ド又は小分子インヒビターをスクリーニングするために使用することもできる。 新規な未変性レセプター又は膜結合タンパク質を同定するための努力が産業界
と学術界の双方によってなされている。多くの努力が、新規なレセプター又は膜
結合タンパク質のコード配列を同定するために、哺乳動物の組換えＤＮＡライブ
ラリーのスクリーニングに注がれている。

【０００３】 １．ＰＲＯ１５６０ テトラスパン(tetraspan)ファミリーのタンパク質は成長して、ショウジョウ
バエを含む様々な種からの約２０の既知の遺伝子を包含する。またテトラスパン
はトランスメンブレン４（ＴＭ４）スーパーファミリーとしても知られ、細胞膜
における形成機能を有すると提唱されている。それらの他の分子と相互作用する
能力及び細胞接着、活性化及び分化といった多様な活性における機能は、大きな
分子複合体を統合する役割を暗示している。Skubitz等, J. Immunology, 157: 3
617-3626 (1996)。またテトラスパン群はシュワン細胞生物学における顕著な機
能を持つタンパク質の組とも考えられている。Mirsky及びJessen, Curr. Opin.
Neurobiol., 6(1): 89-96 (1996)。テトラスパン（テトラスパニン(tetraspanin
)と呼ばれることもある）は、Maecker等, FASEB, 11: 428-442 (1997)に更に記
載されている。よって、テトラスパンファミリーのメンバーは興味の対象である
。 ２．ＰＲＯ４４４ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ４４４ポリペプチドと
命名する新規な分泌ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載する。 ３．ＰＲＯ１０１８ 新規な天然の膜貫通及びレセプタータンパク質を同定し特徴づけるために産業
上及び学術上の両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な
膜貫通タンパク質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮ
Ａライブラリのスクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１
０１８と命名する新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載す
る。 ４．ＰＲＯ１７７３ レチノイン酸生合成における第１の律速段階は、レチノールのレチナールへの
変換を必要とする。レチノールデヒドロゲナーゼタンパク質は、基質としてのホ
ロ-細胞性レチノール結合性タンパク質を認識に機能し、それによりレチノイン
酸のその基質からの生合成の第１段階を触媒する酵素である。種々のレチノール
デヒドロゲナーゼ遺伝子がクローン化さら特徴付けされており、これらの遺伝子
の産物は網膜色素変性症、乾癬、アクネ及び種々の癌の治療に潜在的に有用であ
ると示唆されている（Chai等, J. Biol. Chem. 270: 28408-28412 (1995)及び C
hai等, Gene 169: 219-222 (1996))。レチノールデヒドロゲナーゼの明らかな重
要性が与えられたので、レチノールデヒドロゲナーゼと相同性を持つ新規なポリ
ペプチドの同定及び特徴付けは非常に興味深い。ここで我々は、ここにＰＲＯ１
７７３ポリペプチドと命名する、レチノールデヒドロゲナーゼタンパク質と相同
性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載する。 ５．ＰＲＯ１４７７ グリコシル化は、段階-及び組織特異的方式におけるタンパク質の物理化学的
及び生物学的特性の調節のための重要なメカニズムである。サッカロミセスセレ
ヴィシアエにおけるグリコシル化に含まれる重要な酵素の一つはアルファ１，２
-マンノシダーゼという、Ｎ-結合オリゴ糖の形成中にMan9GlcNAc2をMan8GlcNAc2
に変換する酵素である。サッカロミセスセレヴィシアエのアルファ１，２-マン
ノシダーゼ酵素は、酵母から哺乳動物に保存されるクラスＩアルファ１，２-マ
ンノシダーゼのメンバーである。グリコシル化及びグリコシル化によって調節さ
れる物理化学的活性においてアルファ１，２-マンノシダーゼにより果たされる
重要な役割が与えられたので、１又は複数のマンノシダーゼと相同性を持つ新規
なポリペプチドの同定は非常に興味深い。ここで我々は、ここにＰＲＯ１４７７
ポリペプチドと命名する、マンノシダーゼタンパク質に相同性を持つ新規なポリ
ペプチドの同定及び特徴づけについて記載する。

【０００４】 ６．ＰＲＯ１４７８ 近年、ＩＩ型膜貫通タンパク質をコードするガラクトシルトランスフェラーゼ
遺伝子の新たなサブファミリーがマウスゲノムライブラリから同定された（henn
et等, (1998) J. Biol. Chem. 273(1): 58-65）。ガラクトシルトランスフェラ
ーゼは一般的に全て興味の対象である。ベータ-１,４-ガラクトシルトランスフ
ェラーゼは、２つの細胞下成分で見出され、２つの異なる機能を発揮すると考え
られている。Evans等, Ioessays, 17(3): 261-268 (1995)。ベータ-１,４-ガラ
クトシルトランスフェラーゼはDubois及びShur, Adv. Exp. Med. Biol., 376: 1
05-114 (1995)に可能性のあるトランスデューシングレセプターとして記載され
、更に Shur, Glycobiology, 1(6): 563-575 (1991)に報告されている。細胞表
面ガラクトシルトランスフェラーゼの発現及び機能は、Shur, Biochim. Biophys
. Acta., 988(3): 389-409 (1989)で報告されている。さらに、哺乳動物受精中
のガラクトシルトランスフェラーゼのレセプター機能は、Shur, Adv. Exp. Biol
., 207: 79-93 (1986)に記載され、細胞性相互作用中のレセプター機能はShur,
Mol. Cell Biochem., 6l(2): 143-158 (1984)に記載されている。よって、ガラ
クトシルトランスフェラーゼ及びその関連タンパク質は興味深いことが理解され
る。 ７．ＰＲＯ８３１ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ８３１ポリペプチドと
命名する新規な分泌ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載する。 ８．ＰＲＯ１１１３ タンパク質-タンパク質相互作用はレセプター及び抗原複合体及びシグナル伝
達機構に関連するものを含む。タンパク質-タンパク質相互作用の基となる構造
的及び機能的機構についてよく知られているように、タンパク質-タンパク質相
互作用は、タンパク質-タンパク質相互作用の特定の結果を調節するように更に
容易に操作することができる。従って、タンパク質-タンパク質相互作用の基と
なる機構は科学及び医学界にとって興味深い。 ロイシンリッチ反復を含む全てのタンパク質はタンパク質-タンパク質相互作
用に関与していると考えられている。ロイシンリッチ反復は多様な機能を持つ多
くのタンパク質と細胞位置に存在する短い配列モチーフである。リボ核酸インヒ
ビタータンパク質の結晶構造から、ロイシンリッチ反復はβ-α構造単位に対応
することが明らかになった。これらの単位は、一面が溶媒に暴露された平行なβ
シートを形成するように配置され、タンパク質は珍しい非球状の形状を獲得する
。これらの二つの特徴はロイシンリッチ反復を含むタンパク質のタンパク質結合
機能の原因であることが示されている。Kobe及びDeisenhofer, Trends Biochem.
Sci., 19(10):415-421 (Oct.1994)を参照されたい。 個体発生の間にコラーゲン原線維を配向し指令する組織オーガナイザーとなり
、創傷治癒、組織修復、及び腫瘍ストローマ形成のような病理プロセスに関与す
るロイシンリッチプロテオグリカンについて研究が報告されている。Iozzo, R.V
., Crit.Rev.Biochem.Mol.Biol., 32(2):141-174 (1997)。創傷治癒、組織修復
におけるロイシンリッチタンパク質の関与を示す他の研究は、De La Salle, C.
等, Vouv.Rev.Fr.Hematol. (Germany),37(4):215-222 (1995)であり、出血疾患
ベルナール-スーリエ症候群に伴う複合体におけるロイシンリッチモチーフの突
然変異を報告しており、Chlemetson,K.J., Thromb. Haemost. (Germany),74(1):
111-116 (July 1995)は、血小板がロイシンリッチ反復を有していることを報告
しており、La Jolla Cancer Research FoundationのRuoslahti, E.I.等のWO9110
727-Aは、トランスフォーミング成長因子βに結合するデコリンがガンの治療、
創傷治癒及び瘢痕化に関与していることを報告している。結合組織、皮膚及び骨
のような組織の再成長に関連する創傷治癒及び付随する治療法において；ヒトと
動物における体成長を促進することで；及び他の成長関連プロセスを刺激する点
で有用であることにおいて、この群のタンパク質に機能が関連しているのはイン
スリン様成長因子(ＩＧＦ)である。ＩＧＦの酸不安定サブユニット(ＡＬＳ)はま
たＩＧＦの半減期を増大させインビボのＩＧＦ複合体の一部である点で興味深い
。ロイシンリッチ反復を有することが報告されている他のタンパク質は、アルツ
ハイマー病のような神経変性疾患、パーキンソン病のような神経損傷の治療にお
いて、及びガンの診断に対して有用であることが報告されているＳＬＩＴタンパ
ク質である。エール大学のArtavanistsakonas,S.及びRothberg,J.M.のWO9210518
-A1を参照。また興味深いのはＬＩＧ-１、すなわちマウス脳のグリア細胞中に特
異的に発現され、ロイシンリッチ反復及び免疫グロブリン様ドメインを有する膜
糖タンパク質である。Suzuki等,J.Biol.Chem.(U.S.),271(37):22522 (1996)。ロ
イシンリッチ反復を有するタンパク質の生物学的機能を報告している他の研究に
は：Tayar, N.等, Mol.Cell Endocrinol., (Ireland), 125(1-2):65-70 (Dec.19
96)(ゴナドトロピンレセプター関連)；Miura,Y.等,Nippon Rinsho (Japan), 54(
7):1784-1789 (July 1996)(アポトーシス関連)；Harris,P.C.等, J.Am.Soc.Neph
rol., 6(4):1125-1133 (Oct.1995)(腎疾患関連)が含まれる。

【０００５】 ９．ＰＲＯ１１９４ 核遺伝子ＰＥＴ１１７及びＰＥＴ１１９は、Ｓ．セレビシアエにおける活性チ
トクロームｃオキシダーゼの組み立てに必要であり、従って興味深い。また興味
深いのは、これらの遺伝子と配列同一性を持つ核酸である。ＰＥＴ遺伝子は、Mc
Ewen等, Curr. Genet., 23(1): 9-14 (1993)に更に記載されている。 １０．ＰＲＯ１１１０ 骨髄は哺乳動物において多くの重要な役割を果たす。これらの役割の一つは、
血液及び免疫系の重要な細胞及び他の成分に分化する種々の前駆細胞の供給源を
提供する。このように、骨髄系の機能は非常に興味深い。ここで我々は、ここに
ＰＲＯ１１１０ポリペプチドと命名する、骨髄アップレギュレートタンパク質と
相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載する １１．ＰＲＯ１３７８ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質
についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのス
クリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１３７８ポリペプチ
ドと命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 １２．ＰＲＯ１４８１ 新規な天然のタンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両方
の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規なタンパク質について
のコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスクリーニ
ングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１４８１ポリペプチドと命名
する、新規なタンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。

【０００６】 １３．ＰＲＯ１１８９ 増殖又は分化のトリガーに含まれうる幹細胞及び前駆細胞上のレセプタータン
パク質において非常な興味が存在する。ＩＩ型膜貫通タンパク質は、出生後の下
顎関節突起成長の外側軟骨膜縁における増殖性前駆細胞で同定された。実験者は
、Ｅ２５が軟骨−骨形成性分化の有用なマーカーとなりうると結論した（Deleer
snijder等, J. Biol. Chem. 271(32): 19475-19482 (1996)）。 １４．ＰＲＯ１４１５ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１４１５ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載す
る。 １５．ＰＲＯ１４１１ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１４１１ポリペプチド
と命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 １６．ＰＲＯ１２９５ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質
についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのス
クリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１２９５ポリペプチ
ドと命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。

【０００７】 １７．ＰＲＯ１３５９ ヒアルロニダーゼ、シアリルトランスフェラーゼ、ウロキナーゼ型プラスミノ
ーゲンアクチベータ、プラスミン、マトリクス金属プロテアーゼなどの酵素は、
細胞外マトリクス分子の異化において中心的役割を果たす。このように、これら
の酵素及びその阻害剤は、転位性癌及びその治療において役割を果たしうる。Va
n Aswegen及びdu Plessis, Med. Hypotheses, 48(5): 443-447 (1997)。前記の
理由、並びに基質特異性例におけるそれらの多様性により、シアリルトランスフ
ェラーゼは特に興味深い。例えば、興味の対象となるペプチドは、Kurosawa等,
J. Biol. Chem., 269(2): 1402-1409 (1994)に記載されているようなＧａｌＮＡ
ｃアルファ２,６-シアリルトランスフェラーゼである。このペプチドは構成され
て分泌され、その触媒活性を保持する。発現された酵素は、アシアロムチン(asi
alomucin)及びアシアロフェツインの向けた活性を示すが、他の糖タンパク質は
試験されていない。シアリル化は重要な機能であり、このようなシアリルトラン
スフェラーゼ、及び配列同一性によって関連するペプチドが興味の対象である。
シアリルトランスフェラーゼは文献に更に記載されており、例えば、Sjoberg等,
J. Biol. Chem., 271(13): 7450-7459 (1996), Tsuji, J. Biochem., 120(1):
1-13 (1996)及びHarduin-Lepers等, Glycobiology, 5(8): 741-758 (1995)を参
照のこと。 １８．ＰＲＯ１１９０ Kang等は、Ｉｇスーパーファミリーの新規な細胞表面糖タンパク質の同定を報
告した（J. Cell biol. (1997) 138(1): 203-213）。Ｉｇスーパーファミリーの
細胞接着分子は、細胞遊走、成長調節、及び腫瘍形成を含む広範な生物学的プロ
セスに含まれている。Kang等の研究は、ＣＤＯ機能の喪失が発癌において役割を
果たすことを示唆している。従って、さらなるＣＤＯ様分子、より一般的にはＩ
ｇスーパーファミリーの細胞接着分子の同定は興味の対象である。 １９．ＰＲＯ１７７２ ペプチダーゼは、ペプチド基質を特異的又は非特異的に切断するのに機能する
酵素的タンパク質である。ペプチダーゼは一般的に、哺乳動物及び非哺乳類生物
における多くの極めて重要な生物学的プロセスに含まれる。様々な異なる哺乳動
物及び非哺乳類生物からの多数の異なるペプチダーゼ酵素が同定されて特徴付け
されている。哺乳動物ペプチダーゼ酵素は、例えばタンパク質消化、活性化、不
活性化、又はペプチドホルモン活性の変調、及びタンパク質及び酵素の生理学的
特性の変更を含む多くの異なる生物学的プロセスにおいて重要な役割を果たす。 ペプチダーゼ酵素により担われる重要な生理学的役割に鑑みて、新規な天然の
ペプチダーゼ相同体を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両方の努力が
現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク質についての
コード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスクリーニン
グに集中している。スクリーニング方法及び技術の例は文献に記載されている［
例えば、Klein等, Proc. Natl. Acad. Sci., 93: 7108-7113 (1996); 米国特許
第5,536,637号参照］。ここで我々は、ここにＰＲＯ１７７２ポリペプチドと命
名する、種々のペプチダーゼ酵素と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定につ
いて記載する。

【０００８】 ２０．ＰＲＯ１２４８ プテイティブプロテイン(putative protein)-２（ＰＵＴ-２）はヒト疾患遺伝
子Ｌ１ＣＡＭ、Ｇ６ＰＤ及びＰ５５の相同体である（Riboldi Tunnicliffe等, G
enome Analysis, 投稿）。このように、ＰＵＴ-２反と相同性を持つＤＮＡをコ
ードするポリペプチドの同定は興味の対象である。ここで我々は、ここにＰＲＯ
１２４８ポリペプチドと命名する、ＰＵＴ-２反と相同性を持つ新規なポリペプ
チドの同定及び特徴づけについて記載する。 ２１．ＰＲＯ１３１６ Ｄｉｃｋｋｏｐｆ(ｄｋｋ)は、システインリッチなドメインと高度の相同性（
即ち、８０−９０％）を有する分泌タンパク質のファミリーのメンバーである。
このファミリーの最初に発見されたメンバーであるＤｋｋ−１は、シュペーマン
形成体(Spemann organizer)上で潜在的な頭部インダクギン(head-inducgin)活性
を有する。Glinka等, Nature, 391(6665):357-362 (1998)。両生類胚のシュペー
マン形成体は、２つの別々の活性、即ち体幹形成体及び頭部形成体に細分できる
。Ｄｋｋ−１は、アフリカツメガエル胚での頭部誘導に十分かつ必要であること
がわかり、さらにＷｎｔシグナル伝達の潜在的なアンタゴニストであり、Ｄｋｋ
遺伝子が分泌Ｗｎｔインヒビターの全ファミリーをコードしていることを示唆し
ている。 Ｗｎｔ遺伝子ファミリーのメンバーは、正常な発育及び分化並びに腫瘍形成に
おいて機能する、Ｗｎｔは大きなＩＤＥにファミリーによってコードされ、その
メンバーは回虫、昆虫、軟骨魚、及び脊椎動物で見出されている。Holland等, D
ev. Suppl., 125-133 (1994)。Ｗｎｔ遺伝子は、胚における細胞の運命及び挙動
をレセプター媒介経路の活性化を通して変調させる分泌糖タンパク質のファミリ
ーをコードする。 Ｗｎｔ遺伝子における突然変異の研究は、成長調節及び組織パターニングにお
けるＷｎｔの役割を示した。ショウジョウバエにおいて、無羽（ｗｇ）はＷｎｔ
関連遺伝子をコードし（Rijsewik等, Cell, 50: 649-657 (1987)）、ｗｇ変異は
胚外胚葉、神経形成、及び成虫原基成長のパターンを変更させた。Morata及びLa
werence, Dev. Biol., 56: 227-240 (1977); Baker, Dev. Biol., 125: 96-108
(1988); Klingensmith及びNusse, Dev. Biol., 166: 396--414 (1994)。線虫に
おいては、ｌｉｎ-４４が非対称的細胞分裂に必要なＷｎｔ相同体をコードする
。Herman及びHorvitz, Development, 120: 1035-1047 (1994)。マウスにおける
ノックアウト突然変異は、Ｗｎｔが脳の発達（McMahon及びBradley, Cell, 62:
1073-1085 (1990); Thomas及びCappechi, Nature, 346: 847-850 (1990)）、及
び腎臓（Stark等, Nature, 372: 679-683 (1994)）、尾芽（Takada等, Genes Ce
v., 8: 174-189 (1994)）、及び肢芽についての胚原基の成長に必須であること
を示した。哺乳動物腺におけるＷｎｔの過剰発現は、哺乳動物の過形成及び腫瘍
（McMahon, 上掲 (1992); Nusse及びVarmus, H.E., Cell 69: 1073-1087 (1992)
）、及び早熟性肺胞発達をもたらす。Bradley等, Dev. Biol., 170: 553-563 (1
995)。さらに、移植された哺乳動物上皮の原宿主におけるＷｎｔ-４の構成的発
現は、妊娠-様成長パターンに類似する高度に分岐した組織をもたらす。Bradley
等, Dev. Biol., 170: 553-563 (1995)。 Ｗｎｔ／Ｗｇシグナル伝達経路は、生物体の生物学的発達において重要な役割
を果たし、幾つかのヒト癌に関連している。またこの経路は腫瘍抑制遺伝子ＡＰ
Ｃも含んでいる。ＡＰＣ遺伝子における突然変異は、ヒト結腸直腸癌の散発性及
び遺伝形態の発達と関連している。例えば、Ｗｎｔ-２レベルの向上が結腸直腸
癌で観察されている。Vider, B-Z.等, Oncogene 12: 153-158 (1996)。

【０００９】 ２２．ＰＲＯ１１９７ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質
についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのス
クリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１１９７ポリペプチ
ドと命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 ２３．ＰＲＯ１２９３ 免疫グロブリンは抗体分子、Ｂ細胞膜上の抗原に対するレセプター及び血漿細
胞の分泌生成物の両方として機能するタンパク質である。全ての抗体分子と同様
に、免疫グロブリンは２つの主要な機能：それらが抗原に特異的に結合すること
及びそれらが限られた数の生物学的エフェクター機能に参加することを果たす。
従って、Ｉｇスーパーファミリーの新規なメンバー及びその断片も興味の対象で
ある。種々のウイルスによるレセプターとして作用する分子、及び免疫機能を調
節するものは特に興味深い。また特に興味深いのは、ウイルスレセプターとして
作用する又は免疫機能を調節する公知のＩｇファミリーメンバーと相同性を持つ
ような分子である。よって、Ｉｇスーパーファミリーのメンバー又はその断片（
即ち、重鎖及び軽鎖断片）と相同性を持つ分子は特に興味深い。 ここで我々は、ここにＰＲＯ１２９３ポリペプチドと命名する、免疫グロブリ
ン重鎖可変領域タンパク質と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づ
けについて記載する。 ２４．ＰＲＯ１３８０ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１３８０ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載す
る。

【００１０】 ２５．ＰＲＯ１２６５ 生理学的及び代謝経路に新規な分泌タンパク質の同定は、それらの潜在的な製
薬剤としての用途により興味の対象である。特に興味深いのは、免疫反応及び炎
症メカニズムに潜在的に含まれる新規なポリペプチドの同定である。ＩＬ-４に
対してマウスＢ細胞で発現される新規なポリペプチドが最近同定された。このポ
リペプチドをコードする遺伝子は、インターロイキン−４誘発遺伝子、又は「Ｆ
ｉｇ１」と呼ばれている（Chu等, Proc. Natl. Acad. Sci. (1997) 94(6): 2507
-2512）。 ２６．ＰＲＯ１２５０ 長鎖脂肪酸ＣｏＡリガーゼは、種々の異なる生理学的プロセスで重要な役割を
果たす機能である長鎖脂肪酸を互いに結合させるために機能する酵素タンパク質
である、この酵素タンパク質の重要な機能が与えられたので、新規な長鎖脂肪酸
ＣｏＡリガーゼ相同体を同定し特徴づけるための努力が現在なされている。ここ
で我々は、ここにＰＲＯ１２５０ポリペプチドと命名する、長鎖脂肪酸ＣｏＡリ
ガーゼと相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載する
。 ２７．ＰＲＯ１４７５ Ｎ-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼタンパク質は、哺乳類生物に
おいて様々な重要な生物学的機能を与える酵素ファミリーを含む。例として、Ｕ
ＤＰ-Ｎ-アセチルグルコサミン：アルファ-３-Ｄ-マンノシドビート-１,２-Ｎ-
アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼＩは、高級-マンノース-Ｎ-グリカ
ンのハイブリッド及び複合Ｎ-グリカンへの変換に必須の第１段階を触媒する酵
素タンパク質である（Sarkar等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88: 234-238 (1
991)）。Ｎ-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ酵素の明らかな重要性
が与えられたので、Ｎ-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼタンパク質
と相同性を有する新規なポリペプチドの同定及び特徴付けは非常に興味深い。こ
こで我々は、ここにＰＲＯ１４７５ポリペプチドと命名する、Ｎ-アセチルグル
コサミニルトランスフェラーゼタンパク質と相同性を持つ新規なポリペプチドの
同定及び特徴づけについて記載する。 ２８．ＰＲＯ１３７７ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上
の両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパ
ク質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリ
のスクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１３７７ポリペ
プチドと命名する、新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載
する。

【００１１】 ２９．ＰＲＯ１３２６ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１３２６ポリペプチド
と命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 ３０．ＰＲＯ１２４９ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上
の両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパ
ク質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリ
のスクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１２４９ポリペ
プチドと命名する、新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載
する。 ３１．ＰＲＯ１３１５ 多くの重要なサイトカインタンパク質が同定され、特徴づけられ、特定の細胞
表面レセプター複合体を通したシグナルが示されている。例えば、クラスＩＩサ
イトカインレセプターファミリー（ＣＲＦ２）はインターフェロンレセプター、
インターロイキン-１０レセプター及び組織因子ＣＲＦＢ４を含む（Spencer等,
J. Exp. Med. 187: 571-578 (1998)及びKotenko等, Embo J. 16: 5894-5903 (19
97)）。即ち、種々のサイトカインタンパク質によって発揮される生物学的活性
の多くは、標的細胞表面のサイトカインレセプタータンパク質の存在に完全に依
存している。従って、一又は複数のサイトカインレセプターファミリーと相同性
を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴付けは非常に興味深い。ここで我々は
、ここにＰＲＯ１３１５ポリペプチドと命名する、サイトカインレセプターファ
ミリー-４タンパク質と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づけに
ついて記載する。 ３２．ＰＲＯ１５９９ グランザイムＭはナチュラルキラー細胞セリンプロテアーゼである。ヒト遺伝
子は７．５キロベースであり、他のセリンプロテアーゼと同様のエキソン−イン
トロン構造を持ち、染色体１９ｐ１３.３上のセリンプロテアーゼ遺伝子素ラス
ターと密接に結合している（Pilat等, Genomics, 24: 445-450 (1994)）。グラ
ンザイムＭはヒトのナチュラルキラー白血病細胞系、非刺激ヒト末梢血液単球及
び非処理精製ＣＤ３-ＤＣ５６^＋大顆粒リンパ球で見出されている（Smyth等, J.
Immunol. 151: 6195-6205 (1993)）。

【００１２】 ３３．ＰＲＯ１４３０ レダクターゼは、様々な哺乳動物組織に見られる酵素的タンパク質の大きな部
類を形成し、これらの組織の正しい機能発現のために重要な役割を果たす。これ
らは、反応性酸素種の水への変換を触媒する抗酸化酵素である。レダクターゼの
異常なレベル及び機能発現が、発作、心臓発作、酸化ストレス、高血圧、及び良
性及び悪性腫瘍の進行を含む幾つかの疾患及び障害に含まれている。例えば、悪
性前立腺上皮は、このような抗酸化酵素の発現の低下を伴う［Baker等, Prostat
e 32(4): 229-233 (1997)］。国際特許出願番号WO9622360-A1は、前立腺癌の診
断及び治療及び新規なアンタゴニストのスクリーニングに有用な前立腺特異的レ
ダクターゼを記載している。アルファ-レダクターゼの阻害剤は、良性前立腺過
形成の治療に使用された（Anderson, Drugs Aging (1996) 6(5): 388-396）。こ
れらの理由により、レダクターゼファミリーの新規なメンバーの同定は、癌及び
他の疾患及び障害の治療及び診断のための興味の対象である。 ３４．ＰＲＯ１３７４ プロリル４-ヒロキシラーゼ（Ｐ４ＨＡ）は、コラーゲンにおける４-ヒドロキ
シプロリンの形成を触媒する。Annunen等, J. Biol. Chem., 272(28): 17342-17
348 (1997); Helaakoski等, PNAS USA, 92(10): 4427-4431 (1995); 及び Hopki
nson等, Gene, 149(2): 391-392 (1994)。この酵素及びそれに関連する分子は興
味の対象である。 ３５．ＰＲＯ１３１１ 「トランスメンブレン４（ＴＭ４）スーパーファミリー」とも呼ばれるテトラ
スパンファミリーのタンパク質は、細胞膜における形成機能を有すると提唱され
ている。これらは大きな分子複合体と相互作用し、細胞接着、活性化及び分化と
いったような多様な活性において機能すると考えられている（Maecker等 FASEB
(1997) 11: 428-442参照）。従って、テトラスパンファミリーのタンパク質の新
規なメンバーの同定は興味の対象である。新規な天然の膜貫通タンパク質を同定
するために産業上及び学術上の両方の努力が現在なされている。これらの努力の
多くは、新規なレセプタータンパク質についてのコード化配列を同定するための
哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスクリーニングに集中している。 ３６．ＰＲＯ１３５７ エブネリン(Ebnerin)は哺乳動物のエブナー腺に関連する細胞表面タンパク質
である。 新規なタンパク質、特にエブネリン又は他の唾液腺関連タンパク質と配列相同性
を持つものを同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両方の努力がなされて
いる。これらの努力の多くは、新規なレセプタータンパク質についてのコード化
配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスクリーニングに集中
している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１３５７ポリペプチドと命名する、フォ
ン・エブナー・マイナー唾液腺関連タンパク質と有意な相同性を持つ新規なタン
パク質の同定について記載する。

【００１３】 ３７．ＰＲＯ１２４４ 注目を集めている膜貫通タンパク質の一つの型は、着床関連子宮タンパク質で
ある。このタンパク質の欠乏又は異常は流産を誘発することがある。従って、着
床関連タンパク質の同定及び特徴づけは興味の対象である。 ３８．ＰＲＯ１２４６ 骨関連スルファターゼは、骨組織におけるプロテオグリカン糖鎖の硫酸基を分
解することが示された酵素的タンパク質である（オーストラリア特許公開番号AU
93/44921-A、1994年3月3日）。その特異的なスルファターゼ活性のために、骨関
連スルファターゼは骨代謝疾患の治療における用途が見出されうる。このように
、骨関連スルファターゼに配列類似性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴
付けは非常に興味深い。ここで我々は、ここにＰＲＯ１２４６ポリペプチドと命
名する、骨関連スルファターゼと相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特
徴づけについて記載する。 ３９．ＰＲＯ１３５６ クロストリジウム・パーフリンゲンス(Clostridium perfringens)エンテロト
キシン(ＣＰＥ)は、Ｃ．パーフリンゲンスＡ型の食中毒の症状を起こす毒性因子
であると考えられており、また他のヒト及び獣医学的病気に関連している可能性
もある(McClane, Toxicon. 34: 1335-1343 (1996))。ＣＰＥはクロストリジウム
・パーフリンゲンスエンテロトキシンレセプター(ＣＰＥ-Ｒ)と称される約５０
ｋＤの細胞表面レセプタータンパク質に結合し、細胞表面上に約９０,０００ｋ
Ｄの複合体を形成することにより、その有害な細胞機能を発揮する。ＣＰＥ-Ｒ
タンパク質をコードするｃＤＮＡはヒト及びマウスの両方において同定され、特
徴づけられている(Katahira等, J. Cell. Biol. 136: 1239-1247 (1997)及びKat
ahira等, J. Biol. Chem. 272: 26652-26658 (1997))。ＣＰＥ毒素は哺乳類宿主
の種々の病気の原因であることが報告されており、これらの病気はＣＰＥ-Ｒに
ＣＰＥ毒素が結合することにより開始されるので、新規なＣＰＥ-Ｒ相同体の同
定にはかなりの関心がある。我々は、ここでＰＲＯ１３５６と命名する、ＣＰＥ
-Ｒに対して相同性を有する新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについてこ
こに記載する。

【００１４】 ４０．ＰＲＯ１２７５ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１２７５ポリペプチド
と命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 ４１．ＰＲＯ１２７４ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１２７４ポリペプチド
と命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 ４２．ＰＲＯ１４１２ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１４１２ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載す
る。 ４３．ＰＲＯ１５５７ 神経発達において役割を担う分泌ヤンの同定は興味の対象である。組織因子の
ようなタンパク質は、神経性疾患及び障害の理解及び可能性のある治療における
用途が見出される。アフリカツメガエルから単離したコルジン(chordin)タンパ
ク質は、アフリカツメガエル頭部、体肢及び尾肢発達の形成中心において細胞−
細胞相互作用を調節する潜在的な背方化因子である（Sakai等 (1994) Cell 79(5
): 779-790; また Mullins, (1998) Trends Genet. 14(4): 127-129; 及びKasse
l等 (1998) Trends Genet. 14(5): 169-171も参照）。これは、神経及び筋肉細
胞培養用の培養培地の成分として使用でき、神経変性疾患及び神経損傷の治療に
用途を持ちうる（米国特許第5,679,783号）。 ４４．ＰＲＯ１２８６ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１２８６ポリペプチド
と命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。

【００１５】 ４５．ＰＲＯ１２９４ 臭覚神経上皮の細胞外粘膜マトリクスは、臭覚伝達器を収容する化学受容性繊
毛と密接に接触した高度に組織された構造である。この細胞外マトリクスの主要
なタンパク質成分は、オルファクトメジンという臭覚神経上皮で発現される糖タ
ンパク質であり、分子間ジスルフィド結合を形成して高分子を生成する（Yokoe
等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 4655-4659 (1993), Bal等, Biochemistry
32: 1047-1053 (1993)及びSnyder等, Biochemistry 30: 9143-9153 (1991)）。
オルファクトメジンは、臭覚ニューロンの尖端樹状突起上の化学受容性繊毛の維
持、成長又は分化に影響することが示唆されている。この重要な役割が与えられ
たので、オルファクトメジンと相同性を有する新規なポリペプチドの同定及び特
徴付けに重大な興味がある。ここに我々は、オルファクトメジンタンパク質に対
して相同性を有する新規なポリペプチドの同及び特徴付けについて記載する。 我々は、ここでＰＲＯ１２９４ポリペプチドと命名する、オルファクトメジン
タンパク質に対して相同性を有する新規なポリペプチドの同及び特徴付けについ
てここに記載する。 ４６．ＰＲＯ１３４７ ブチロフィリン(butyrophilin)は、哺乳類の乳の脂肪球膜に結合した全タンパ
ク質の４０％以上を構成している乳糖タンパク質である。ブチロフィリンｍＲＮ
Ａの発現は、妊娠終期での乳脂肪の生成の開始と相関しており、乳汁分泌期を通
して維持されていることが示されている。ブチロフィリンはウシ、マウス及びヒ
トにおいて同定されており(Taylor等, Biochim. Biophys. Acta 1306:1-4(1996)
、Ishii等, Biochim. Biophys. Acta 1245:285-292(1995)、Mather等, J. Dairy
Sci. 76:3832-3850(1993)、Sato等, J. Biochem., 117(1): 147-157 (!995)及
びBanghart等, J. Biol. Chem. 273:4171-4179(1998)を参照)、脂肪グロブリン
膜内に取り込まれるＩ型膜貫通タンパク質である。ブチロフィリンは、キサンチ
ンデヒドロゲナーゼ／オキシダーゼ及び授乳の間の尖端表面からの乳脂肪小球の
発芽と放出において機能する他のタンパク質との複合体の集合体に対する主要な
足場としての役割を果たしうることが示唆されている(Banghart等, 上掲)。ブチ
ロフィリンは、哺乳類の乳生成において明らかに重要な役割を担っているので、
新規なブチロフィリン相同体の同定にはかなりの関心がある。 ４７．ＰＲＯ１３０５ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１３０５ポリペプチド
と命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。

【００１６】 ４８．ＰＲＯ１２７３ リポカリン(lipocalin)タンパク質ファミリーは、小さな細胞外タンパク質の
大きな群である。このファミリーは配列レベルで大きな多様性を示す；しかし、
殆どのリポカリンは特徴的に保存された配列モチーフを共有する。リポカリンは
、レチノール輸送、無脊椎動物の潜在性呈色、臭覚及びフェロモン輸送、及びプ
ロスタグランジン合成に含まれることが知られている。またリポカリンは、細胞
恒常性の調節及び免疫反応の変調に関係し、キャリアタンパク質として内因性及
び外因性化合物の一般的な清浄化で作用する。Flower, Biochem. J., 318(Pt 1)
: 1-14 (1996): Flower, FEBS Lett., 354(1): 7-11 (1994)。よって、リポカリ
ンタンパク質ファミリーのメンバーは興味の対象である。 ４９．ＰＲＯ１３０２ ＣＤ３３は、シアル酸タイプと末端近くの糖へのその結合の両方に対して異な
る特異性を有するシアル酸依存性結合を媒介可能なタンパク質のシアロアドヘシ
ン(sialoadhesin)ファミリーのメンバーである細胞表面タンパク質である。ＣＤ
３３は初期の脊髄及び幾つかの単球細胞系において特異的に発現しており、例え
ば急性非リンパ球性白血病(ANLL)を含む、種々の脊髄腫瘍と強く関連しているこ
とが示されてる。このように、ＣＤ３３はタンパク質の高レベル発現に関連した
癌の治療を潜在的な標的として示唆されている。ＣＤ３３一つの相同体がTakei
等, Cytogenet. Cell Genet. 78:295-300(1997)に記載されている。他の研究は
、急性骨髄性白血病のためのＣＤ３３モノクローナル抗体の骨髄移植における使
用を記載している。Robertson等, Prog. Clin. Biol. Res., 389: 47-63 (1994)
。 さらに、シアロアドヘシンのメンバーが、正常条件下並びに炎症反応中の両方
でマクロファージ機能の範囲に寄与するという研究が報告された。Crocker等, G
lycoconj. J., 14(5): 601-609 (1997)。さらに、これらのタンパク質は、例え
ば血液新生、神経発達及び免疫性といった多様な生物学的プロセスに関連する。
Kelm等, Glycoconj. J., 13(6): 913-926 (1996)。よって、配列同一性によりＣ
Ｄ３３に関連する新規なポリペプチドは興味の対象である。

【００１７】 ５０．ＰＲＯ１２８３ 臭覚受容は、臭気物質と鼻上皮に位置する臭覚受容細胞の化学受容性絨毛との
相互作用を解して起こる。鼻上皮関連臭気物質結合タンパク質の多様性に基づい
て、哺乳動物臭覚系は多数の異なる臭気物質分子を認識し識別できる。この点に
おいて、多数の異なる臭気物質結合タンパク質及びそれらのコード化ＤＮＡが最
近同定され特徴付けられた（Dear等, Biochemistry 30: 10376-10382 (1991)、
Pevsner等, Science 241: 336-339 (1988)、Buck等, Cell 65: 175-187 (1991)
及びBreer等, J. Recept. Res., 13: 527-540 (1993)）。哺乳動物臭覚系による
臭気物質検出のメカニズムの研究は興味の対象であるので、臭気物質結合タンパ
ク質の同定はかなりの興味がある。ここで我々は、ここにＰＲＯ１２８３ポリペ
プチドと命名する、臭気物質結合タンパク質と相同性を持つ新規なポリペプチド
の同定及び特徴づけについて記載する。 ５１．ＰＲＯ１２７９ プロテアーゼは哺乳類及び非哺乳類生物における多数の非常に重要な生物学的
プロセスに関与している酵素タンパク質である。種々の異なる哺乳類及び非哺乳
類生物からの多くの異なるプロテアーゼ酵素が同定され特徴づけられており、種
々のセリン含有タンパク質に対する特異的活性を示すセリンプロテアーゼを含む
。哺乳類のプロテアーゼ酵素は生物学的プロセス、例えばタンパク質の消化、活
性化、不活性化、又はペプチドホルモン活性の変調、及びタンパク質及び酵素の
物理学的特性の改変において、重要な役割を担っている。 ニューロプシンは、そのｍＲＮＡが中枢神経系で発現される新規なセリンプロ
テアーゼである。マウスニューロプシンがクローニングされ、研究はそれが海馬
可塑性に含まれることを示した。またニューロプシンは細胞外マトリクス変調及
び細胞遊走に関連することも示された。一般的には、Chen等, Neurosci., 7(2):
5088-5097 (1995)及びChen等, J. Histochem. Cytochem., 46: 313-320 (1998)
を参照。我々は、ここでＰＲＯ１２７９ポリペプチドと命名する、ニューロプシ
ンタンパク質に対して相同性を有する新規なポリペプチドの同定及び特徴付けに
ついてここに記載する。 ５２．ＰＲＯ１３０４ イムノフィリンは、シクロスポリンＡ、ＦＫ５０６及びラパマイシン等の免疫
抑制剤に対するレセプターとして機能するタンパク質ファミリーである。イムノ
フィリンには、２つの別個のクラス、すなわち(１)ＦＫ５０６及びラパマイシン
に結合するＦＫ５０６-結合タンパク質(FKBP)と、(２)サイクロスポリンＡに結
合するサイクロフィリンとして生じる。ＦＫ５０６-結合タンパク質に関しては
、ＦＫ５０６／ＦＫＢＰ複合体は、セリン／スレオニンプロテインホスファター
ゼ２Ｂ(カルシニュリン)の活性を阻害する機能を有し、よって免疫抑制活性をも
たらすと報告されている。また、ＦＫＢＰイムノフィリンは哺乳類の神経系で見
出されており、免疫抑制をなすプロセスとは独立したメカニズムを通しての中枢
神経系における軸索再生に関与していると報告されている(Gold, 上掲)。よって
、ＦＫＢＰイムノフィリンに対して相同性を有する新規なポリペプチドの同定に
はかなりの関心がある。 我々は、ここでＰＲＯ１３０４と命名する、ＦＫ５０６結合タンパク質に対し
て相同性を有する新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについてここに記載す
る。

【００１８】 ５３．ＰＲＯ１３１７ その発現が白血球集団の刺激に際して増大する分子の同定は、これらの分子の
構造及び機能への洞察が活性化に伴う細胞内及び細胞間事象の更なる理解を導く
ので、かなりの興味がある。そのような分子の一つであるＣＤ９７は、リンパ球
の活性化に際して即座にアップレギュレートされる細胞表面抗原であり、最近の
幾つかの出版物の主題となっている（Eicher等, Tissue Antigens (1997) 50(5)
: 429-438; Aust等, Cancer Res. (1997) 57(9): 1798-1806参照）。ＣＤ９７に
対して強く陽性の白血球は、正常リンパ組織におけるＣＤ９７発現に対して炎症
部位に集中する。ＣＤ９７の可溶性サブユニットでありＣＤ９７アルファは、炎
症組織からの体液中で見出された（Gray等, J. Immunol. (1996) 157(12): 5438
-5447）。 ５４．ＰＲＯ１３０３ プロテアーゼは哺乳類及び非哺乳類生物における多数の非常に重要な生物学的
プロセスに関与している酵素タンパク質である。種々の異なる哺乳類及び非哺乳
類生物からの多くの異なるプロテアーゼ酵素が同定され特徴づけられており、種
々のセリン含有タンパク質に対する特異的活性を示すセリンプロテアーゼを含む
。哺乳類のプロテアーゼ酵素は生物学的プロセス、例えばタンパク質の消化、活
性化、不活性化、又はペプチドホルモン活性の変調、及びタンパク質及び酵素の
物理学的特性の改変において、重要な役割を担っている。 ニューロプシンは、そのｍＲＮＡが中枢神経系で発現される新規なセリンプロ
テアーゼである。マウスニューロプシンがクローニングされ、研究はそれが海馬
可塑性に含まれることを示した。またニューロプシンは細胞外マトリクス変調及
び細胞遊走に関連することも示された。一般的には、Chen等, Neurosci., 7(2):
5088-5097 (1995)及びChen等, J. Histochem. Cytochem., 46: 313-320 (1998)
を参照。他の研究は、キンドリングがマウス脳においてニューロプシンｍＲＮＡ
を誘発することを報告した。Okabe等 Brain Res., 728(1): 116-120 (1996)。さ
らに、反応性酸素種の生成が、回避学習における障害に関連する辺縁領域でのニ
ューロプシン転写において重要な役割を果たすという研究が報告された。Akita
等, Brain Res., 769(1): 86-96 (1997)。よって、ニューロプシン、及びアゴニ
スト及びアンタゴニストを含む関連タンパク質及び薬剤は興味の対象である。

【００１９】 ５５．ＰＲＯ１３０６ 哺乳動物疾患及び障害において役割を担い、新たな治療方法を導くタンパク質
の同定は非常に興味深い。マクロファージポリペプチドであるデインテイン(dai
ntain)／アロジェニック炎症因子１（デインテイン／ＡＩＦ１）は、糖尿病前記
のラットの膵臓で同定され、インシュリン分泌に直接影響を与えることが特定さ
れた。マウスに低用量で静脈内注射された場合、デインテイン／ＡＩＦ１はグル
コース刺激インシュリン分泌とともにグルコース排除の付随する機能障害を阻害
する。より高い用量では、デインテイン／ＡＩＦ１はグルコース刺激インシュリ
ン分泌を増強し、グルコース排除を促進する。よって、デインテイン／ＡＩＦ１
はインシュリン依存性真正糖尿病の病原に関連する役割を担う（Chen等, Proc.
Natl. Acad. Sci. (1997) 94(25): 13879-13884）。またＡＩＦ-１は、ラット及
びヒトのアロジェニック心臓移植拒絶にも含まれ（Utans等, Transplantation (
1996) 61(9): 1387-1392）、マクロファージ活性化及び機能発現において役割を
担いうる（Utans等, J. Clin. Invest. (1995) 95(6): 2954-2962）。 ５６．ＰＲＯ１１１３ タンパク質-タンパク質相互作用はレセプター及び抗原複合体及びシグナル伝
達機構に関連するものを含む。タンパク質-タンパク質相互作用の基となる構造
的及び機能的機構についてよく知られているように、タンパク質-タンパク質相
互作用は、タンパク質-タンパク質相互作用の特定の結果を調節するように更に
容易に操作することができる。従って、タンパク質-タンパク質相互作用の基と
なる機構は科学及び医学界にとって興味深い。 ロイシンリッチ反復を含む全てのタンパク質はタンパク質-タンパク質相互作
用に関与していると考えられている。個体発生の間にコラーゲン原線維を配向し
指令する組織オーガナイザーとなり、創傷治癒、組織修復、及び腫瘍ストローマ
形成のような病理プロセスに関与するロイシンリッチプロテオグリカンについて
研究が報告されている。Iozzo, R.V., Crit.Rev.Biochem.Mol.Biol., 32(2):141
-174 (1997)。創傷治癒、組織修復におけるロイシンリッチタンパク質の関与を
示す他の研究は、De La Salle, C.等, Vouv.Rev.Fr.Hematol. (Germany),37(4):
215-222 (1995)であり、出血疾患ベルナール-スーリエ症候群に伴う複合体にお
けるロイシンリッチモチーフの突然変異を報告しており、Chlemetson,K.J., Thr
omb. Haemost. (Germany),74(1):111-116 (July 1995)は、血小板がロイシンリ
ッチ反復を有していることを報告している。 ロイシンリッチ反復を有することが報告されている他のタンパク質は、アルツ
ハイマー病のような神経変性疾患、パーキンソン病のような神経損傷の治療にお
いて、及びガンの診断に対して有用であることが報告されているＳＬＩＴタンパ
ク質である。エール大学のArtavanistsakonas,S.及びRothberg,J.M.のWO9210518
-A1を参照。ｓｌｉｔタンパク質が特徴付けられ、グリア細胞によって分泌され
、ショウジョウバエの軸索経路の形成並びに細胞外タンパク質相互作用の媒介に
含まれると報告されている。Wharton及びCrews, Mech. Dev., 40(3): 141-154 9
1993; Rothberg及びArtavanis-Tsakonas, J. Mol. Biol., 227(2): 367-370 (19
92); Rothberg等, Genes Dev., 4(12A): 2169-2187 (1990); 及びRothberg等, C
ell, 55(6): 1047-1059 (1988)。

【００２０】 ５７．ＰＲＯ１２７８ リゾチームは分泌タンパク質であり、或る種の微生物のムコペプチド細胞壁構
造で起こるＮ-アセチルムラミン酸(muramic acid)とＮ-アセチルグルコサミンと
の［ベータ］１,４-グルコシド結合を主に加水分解する。リゾチームは動物及び
植物に広く分布している。それは、哺乳動物分泌及び唾液、涙、乳、頚管粘液、
白血球、腎臓などを含む組織で見出された。リゾチームファミリーのタンパク質
の新規なメンバーの同定は、代謝機能及び機能不全でリゾチームが担う様々な役
割により興味の対象である。リゾチームの異常レベルは種々の疾患状態に含まれ
る。リゾチームは抗-微生物、鎮痛、及び抗侵害特性を持つと報告されている。
リゾチームのさらなる特徴及び可能な用途は、米国特許第5,618,712号に記載さ
れている。 ５８．ＰＲＯ１２９８ グリコシル化はタンパク質の運命、例えばそれが分泌されるか否かを決定する
ことができる。また、糖タンパク質は、多くの構造的及び機能的役割を、特に細
胞膜の一部として担う。従って、グリコシル化は興味の対象である。酵母におけ
る初期Ｎ-グリコシル化遺伝子の成長関連配向調節に関する研究が報告された。K
ukuruzinska及びLennon, Glycobiology, 4(4): 437-443 (1994)。さらに、タン
パク質グリコシル化と糖タンパク質の脂肪アシル化との関係が、酵母における野
生型アスパラギン関連グリコシル化欠失突然変異において研究された。Appukutt
an, FEBS Lett., 255(1): 139-142 (1989)。酵母におけるアスパラギン関連オリ
ゴ糖の生合成も突然変異を用いて研究された。Jackson等, Glycobiology, 3(4):
357-364 (1993)。タンパク質グリコシル化を欠く酵母変異体も、Huffacker及び
Robbins, PNAS, 80(24): 7466-7470 (1983)に報告されている。

【００２１】 ５９．ＰＲＯ１３０１ チトクロムＰ４５０タンパク質は、ヒドロキシル化に含まれるモノオキシゲナ
ーゼ酵素の大きな部類である。ヒドロキシル化反応は、コレステロール及びステ
ロイドホルモンの合成において重要である。チトクロムＰ４５０ファミリーの酵
素は、アラキドン酸などの代謝内生化合物において重要な役割を担う。またこれ
らの酵素は、外来物質の代謝、例えば身体からの薬物の除去においても重要であ
る［例えば、Peterson, Aliment. Pharmacol. Ther., 9: 1-9 (1995)参照］。さ
らに、チトクロムＰ４５０経路を経て生成された代謝物は、発癌、血圧調節及び
腎臓機能においても役割を担う［例えば、Rahman等, Am. J. Hypertens., 10: 3
56-365 (1997)参照］。 ６０．ＰＲＯ１２６８ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１２６８ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載す
る。 ６１．ＰＲＯ１２６９ 最も普通の型の白血球細胞である顆粒球は、腫瘍細胞及び微生物に対する免疫
性細胞毒性を媒介する能力を持つ。従って、これらの細胞により生成される様々
な因子を同定することは、それらの製薬剤としての潜在的用途のために興味の対
象である。Selstedの特許出願番号WO9729765-A1は、ウシ及びマウス顆粒球から
単離された顆粒球ペプチドＡの同定を記載している。これらのペプチドの幾つか
の用途が特定され、治療用途、農業薬としての用途、食品の防腐剤としての用途
、水処理剤としての用途を含む。 ６２．ＰＲＯ１３２７ ニューレキソフィリン(neurexophilin)は、固定化アルファ-ラトロトキシン上
でのアフィニティクロマトグラフィの間にニューレキシン(neurexin)Ｉとともに
精製されたニューロン糖タンパク質として発見されたタンパク質である（Missle
r等, J. Neurosci. 18: 3630-3638 (1998)）。最近のデータは、哺乳動物の脳が
ニューレキソフィリンに対する４つの遺伝子を含み、その産物は５つのドメイン
：（１）Ｎ-末端シグナルペプチド、（２）可変Ｎ-末端ドメイン、（３）高度に
保存されたＮ-グリコシル化された中心ドメイン、（４）短いリンカードメイン
及び（５）保存されたシステインリッチのＣ-末端ドメインからなる共通の構造
を有することを示した（Missler等, 上掲）。さらにこれらのデータは、ニュー
レキソフィリンが合成及びアルファ-ニューレキシンへの結合の後に、タンパク
質分解的に加工されることを示した。ニューレキソフィリンの構造及び特徴は、
それらがアルファ-ニューレキシンを介してシグナル伝達しうる神経ペプチドと
して機能することを示している。従って、ニューレキソフィリンに対して相同性
を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴付けはかなり興味深い。 ここで我々は、ここにＰＲＯ１３２７ポリペプチドと命名する、ニューレキソ
フィリンと相同性を有する新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載
する。

【００２２】 ６３．ＰＲＯ１３８２ セレベリンは、脳全体に見られる分泌された後シナプス神経ペプチドである。
このタンパク質の最高濃度は小脳に見られた。また、下垂体、脊髄、及び副腎で
も検出された（Satoh等, J. Endocrinol. (1997) 15491: 27-34）。小脳のパー
キンジェ(Purkinje)細胞の成熟の実験のための定量的マーカーとして及び神経発
達を図表化するためにセレベリンを用いる可能性が報告された（Slemmon等, Pro
c Natl Acad. Sci. (1985) 82(20):7145-7148参照）。セレベリンのレベルの有
意な減少が、脊髄小脳性悪化、オリーブ橋小脳萎縮（ＯＰＣＡＱ）及びシャイ‐
ドレーガー症候群の患者から死後の実験で得たヒト脳で見られ、これらの小脳疾
患においてセレベリンが重要な病態生理学的役割を担うことが示唆された（Mizu
no等, Brain Res. (1995) 686(1): 115-118; Mizuno等, No To Shinkei (195) 4
7(11): 1069-1074）。神経発達及び神経疾患及び障害におけるセレベリンの重要
性に鑑みて、このタンパク質ファミリーのメンバーの同定及び特徴付け羽興味深
い（Yiangou等, J. Neurochem (1989) 53(3): 886-889及びMugnaini等, Synapse
(1988) 2(2): 125-138も参照）。 ６４．ＰＲＯ１３２８ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１３２８ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載す
る。 ６５．ＰＲＯ１３２５ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１３２５ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載す
る。

【００２３】 ６６．ＰＲＯ１３４０ カドヘリンはホモタイプの細胞性認識の主要なメディエータであり、組織発達
の形態形成的検出において顕著な役割を担うことが知られている。カドヘリンは
、多様なタンパク質のファミリーであり、神経組織を含む様々な組織で同定され
ている（Suzuki等, Cell Regul., 2: 261-270 (1991)）。Ｋｓｐ-カドヘリンは
、カドヘリン多遺伝子ファミリーの腎臓特異的メンバーである（Thomson等, Bio
l. Chem., 270: 17594-17601 (1995)）。カドヘリンは、ヒトの癌において重要
な役割を担うと考えられている（Yap, Cancer Invest., 16: 252-261 (1998)）
。 ６７．ＰＲＯ１３３９ カルボキシペプチダーゼは興味深い。カルボキシペプチダーゼＥは広範なペプ
チドホルモンの生合成に含まれることがわかった。Fricker, Annu. Rev. Physio
l., 50: 309-321 (1988)。このカルボキシペプチダーゼは肥満と関連していた。
Leiter, J. Endocrinol., 155(2): 211-214 (1997)。カルボキシペプチダーゼＭ
はマクロファージ突然変異のマーカーとして報告された。Krause等, Immunol. R
ev., 161: 119-127 (1998)。ヒト肥満細胞カルボキシペプチダーゼはアレルギー
と関連すると報告された。Goldstein等, Monogr. Allergy, 27: 132-145 (1990)
。カルボキシペプチダーゼＡ２も、Faming等, J. Biol. Chem, 266(36): 24606-
24612 (1991)で報告された。この分野で知られている特に興味深い他のカルボキ
シペプチダーゼは、ヒト膵臓カルボキシペプチダーゼ２、カルボキシペプチダー
ゼａ１及びカルボキシペプチダーゼＢを含む。従って、カルボキシペプチダーゼ
ファミリーの新規なメンバーは興味の対象である。 ６８．ＰＲＯ１３３７ 特に興味深いのは、潜在的治療用途を持つ又は血液関連疾患の診断で有用な血
液関連タンパク質の同定である。チロキシン結合性グロブリン（ＴＢＧ）は肝臓
によって合成されて血流中に分泌される。それは、ヒト血清における主要な甲状
腺ホルモン輸送タンパク質である（Refetoff等, Horm. Res. (1996) 45(3-5): 1
28-138）。ＴＢＧの高い血清レベルが高サイロキシン血症を起こすことが見出さ
れた（Leahy等, Postgrad Med. J. (1984) 60(703): 324-327）。従って、ＴＢ
Ｇタンパク質の同定及び特徴付けは興味の対象であり（Flink等 Proc. Natl. Ac
ad. Sci. USA (1986) 83(20): 7708-7712; Bartalena等, Acta Med. Austriaca,
(1988) 15 Suppl 1: 12-15を参照）、異常なＴＢＧタンパク質の同定を含む（R
efetoff, Endocr Rev. (1989) 10(3): 275-293）。多くの努力は新規な分泌タン
パク質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラ
リのスクリーニングに集中している。スクリーニングの方法及び技術の例は文献
に記載されている（例えば、Klein等, Proc. Natl. Acad. Sci., 93: 7108-7113
(1996); 米国特許第5,536,637号参照）。

【００２４】 ６９．ＰＲＯ１３４２ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１３４２ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載す
る。 ７０．ＰＲＯ１３４３ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１３４３ポリペプチド
と命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 ７１．ＰＲＯ１４８０ セマホリンは膜貫通及び分泌タンパク質の大きなファミリーであり、その多く
は神経系で発現される。セマホリンファミリーのメンバーはリガンドとレセプタ
ーの両方を含んでいる（Eckhardt等, Mol. Cell. Neurosci., 9: 409-419 (1997
)）。研究により、胚運動及び中枢神経系軸索誘導及びシナプス形成に対するセ
マホリンの役割が明らかになった（Catalano等, Mol. Cell. Neurosci., 11: 17
3-182 (1998); Kitsukawa等, Neuron, 19: 995-1005 (1997); Yu等, Neuron, 20
: 207-220 (1998)）。セマホリンはニューロン成長円錐崩壊を誘発し、それらの
インビボ経路を変更することが示された（Shoji等, Development, 125: 1275-12
83 (1998)）。セマホリンファミリーのメンバーは、免疫学的に活性で、ヒト単
球におけるサイトカインの生成を含むことが示された（Comeau等, Immunity, 8:
473-482 (1998)）。またセマホリンは癌においても役割を担う。マウスセマホ
リン遺伝子の発現は、マウス腫瘍細胞系の転位と関連することが知られている（
Christensen等, Cancer Res., 58: 1238-1244 (1998)）。

【００２５】 ７２．ＰＲＯ１４８７ フリンジ(Fringe)は、ショウジョウバエ羽の成虫原基の背側区画にあるノッチ
のセレート(serrate)-媒介活性化を阻害するタンパク質である（Fleming等, Dev
elopment, 124(15): 2973-81 (1997); Wu等, Science (1996) 272(5273): 355-3
58参照）。またフリンジタンパク質は、肢芽成長に必須の外胚葉性頂提の肥厚化
がフリンジを発現する背側細胞と発現しないものとの間の相互作用を含む脊椎動
物発達にも含まれる（Wolpert, L. Philos Trans R Lond B Biol Sci (1998) 35
3 (1370): 871-857; Kengaku等, Science (1998) 280(5367': 1274-1277; Cohen
等, Nat. Genet. (1997) 16(3): 283-288; Johnson等, Development (1997) 124
(11): 2245-2254; Laufer等, Nature (1997) 386(6623）: 366-373; Rodriguez-
Esteban等, Nature (1997) 386(6623): 360-366参照）。従って、フリンジタン
パク質は、発生におけるその役割並びにセレート、特にセレートのシグナル伝達
能力を調節するその能力の両方について興味深い。また興味深いのは、発生及び
／又はセレート様分子の調節において役割を持つ新規なポリペプチドである。特
に興味深いのは、フリンジに相同性を持つ新規なポリペプチドである。 ７３．ＰＲＯ１４１８ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１４１８ポリペプチド
と命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 ７４．ＰＲＯ１４７２ ブチロフィリンは、哺乳類の乳の脂肪球膜に結合した全タンパク質の４０％以
上を構成している乳糖タンパク質である。ブチロフィリンｍＲＮＡの発現は、妊
娠終期での乳脂肪の生成の開始と相関しており、乳汁分泌期を通して維持されて
いることが示されている。ブチロフィリンはウシ、マウス及びヒトにおいて同定
されており(Taylor等, Biochim. Biophys. Acta 1306:1-4(1996)、Ishii等, Bio
chim. Biophys. Acta 1245:285-292(1995)、Mather等, J. Dairy Sci. 76:3832-
3850(1993)、Sato等, J. Biochem., 117(1): 147-157 (!995)及びBanghart等, J
. Biol. Chem. 273:4171-4179(1998)を参照)、脂肪グロブリン膜内に取り込まれ
るＩ型膜貫通タンパク質である。ブチロフィリンは、キサンチンデヒドロゲナー
ゼ／オキシダーゼ及び授乳の間の尖端表面からの乳脂肪小球の発芽と放出におい
て機能する他のタンパク質との複合体の集合体に対する主要な足場としての役割
を果たしうることが示唆されている(Banghart等, 上掲)。ブチロフィリンは、哺
乳類の乳生成において明らかに重要な役割を担っているので、新規なブチロフィ
リン相同体の同定にはかなりの関心がある。ブチロフィリンファミリーのメンバ
ーは、Tazi-Ahnini等, Immunogenetics, 47(1): 55-63 (1997); Davey等, Gene,
199(1-2): 57-62 (1997); 及びMather及びJack, J. Dairy Sci., 76(12): 3832
-3850 (1993)に更に記載されている。

【００２６】 ７５．ＰＲＯ１４６１ プロテアーゼは、消化、タンパク質活性化及び不活性化、ペプチドホルモンの
変調、タンパク質及び酵素の物理的特性の変更を含む、哺乳類及び非哺乳類生物
における多数の生物学的プロセスに関与している酵素タンパク質である。セリン
プロテアーゼは種々のセリン含有タンパク質に対する特異的活性を示す酵素の大
きな部類を含む。トリプシンは、膵臓で合成され小腸に分泌されるが、摂取した
タンパク質をチド結合を加水分解する良好に特徴付けられたセリンプロテアーゼ
である。トリプシン様タンパク質が、細胞表面タンパク質であると特徴付けられ
ている（Farley等, Biochim Biophys Acta (1993) 1173(3): 350-352; 及びLeyt
us等, Biochemistry (1988) 27(3): 1067-1074参照）。これらのトリプシン様タ
ンパク質は、可溶性及び活性プロテアーゼに成熟する膜結合前駆体として合成さ
れる（Yamaoka等, J. Biol. Chem. (1998) 273(19): 11895-11901）。 これらの代謝及び他の酵素プロセスにおける重要性により、新規な天然のトリ
プシン様プロテアーゼを同定するために産業上及び学術上の両方の努力が現在な
されている。これらの努力の多くは、新規なレセプタータンパク質についてのコ
ード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスクリーニング
に集中している。 ７６．ＰＲＯ１４１０ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１４１０ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載す
る。 ７７．ＰＲＯ１５６８ テトラスパニン(又はテトラスパン)ファミリーのタンパク質は成長して、様々
な種からの約２０の既知の遺伝子を包含する。テトラスパニンは４つの膜貫通ド
メイン膜結合分子であり、例えば、ＣＤ８１、ＣＤ８２、ＣＤ９、ＣＤ６３、Ｃ
Ｄ３７及びＣＤ５３。これらのタンパク質の多くは、系統特異的タンパク質、イ
ンテグリン、及び他のトランスパニン(transpanins)を含む他の分子との無差別
な結合の識別力を有する。機能の点で、それらは細胞活性化及び増殖、接着及び
運動性、分化及び癌化といった多様なプロセスに関与している。或る研究は、こ
れらの機能が全てそれらが「分子促進剤」、グルーピング特的細胞表面タンパク
質として作用し、よって機能的シグナル伝達複合体の形成及び安定化を向上させ
る可能性に関係していることを提唱している。Maecker等, FASEB, 11(6): 428-4
2 (1997)。他の研究は、それらが細胞モルホロジー、細胞-ＥＣＭ接着及び細胞
シグナル伝達の変化の原因であると結論付けた。Skubitz等, J. Immunology, 15
7: 3617-3626 (1996)。よって、このファミリーの新規なメンバーは興味の対象
である。

【００２７】 ７８．ＰＲＯ１５７０ プロテアーゼは、消化、タンパク質活性化及び不活性化、ペプチドホルモンの
変調、タンパク質及び酵素の物理的特性の変更を含む、哺乳類及び非哺乳類生物
における多数の生物学的プロセスに関与している酵素タンパク質である。セリン
プロテアーゼは種々のセリン含有タンパク質に対する特異的活性を示す酵素の大
きな部類を含む。トリプシンは、膵臓で合成され小腸に分泌されるが、摂取した
タンパク質をチド結合を加水分解する良好に特徴付けられたセリンプロテアーゼ
である。トリプシン様タンパク質が、細胞表面タンパク質であると特徴付けられ
ている（Farley等, Biochim Biophys Acta (1993) 1173(3): 350-352; 及びLeyt
us等, Biochemistry (1988) 27(3): 1067-1074参照）。これらのトリプシン様タ
ンパク質の幾つかは、可溶性及び活性プロテアーゼに成熟する膜結合前駆体とし
て合成される（Yamaoka等, J. Biol. Chem. (1998) 273(19): 11895-11901）。 特に興味深いのは、ヒト結腸癌由来セリンプロテアーゼＳＰ５９、ＳＰ６０及
びＳＰ６７であり、それらは付随する疾患状態及びこれらのタンパク質に関連す
る疾患の治療で用いられる特異的な阻害剤又はモジュレータのスクリーニングに
有用である。日本国特許J 09149790-Aにおいて、ＳＰ６０が同定され、登録番号P_W22986及び233アミノ酸
を持つと報告された。 ７９．ＰＲＯ１３１７ セマホリンファミリーの糖タンパク質は神経系の発達、特に軸索誘導において
重要な役割を担う。セマホリンはヒト免疫系で同定され、Ｂ細胞シグナル伝達を
含む機能的役割を担うと考えられている（Hall等, Proc. Natl. Acad. Sci. (19
96) 93(21): 11780-50）。ヒトのセマホリン遺伝子は、神経系免疫疾患の診断で
有用であると1998年6月16日発行の日本国特許J10155490-Aに開示されている。セ
マホリンファミリーの更なるメンバーの同定は興味の対象である。 ８０．ＰＲＯ１７８０ 代謝疾患又は障害に含まれる酵素タンパク質は特に興味深い。糖の脂肪可溶性
化学物質への酵素的付加は、それらの水中への可溶性を向上させ、それらの排出
を促進する重要なプロセスである。哺乳動物では、グルクロン酸は代謝産物及び
脂肪-可溶性化学物質が体内の毒性レベルに達するのを防止するのに用いられる
主要な糖である。この反応を行うＵＤＰグルクロノシルトランスフェラーゼは、
動物、植物及び細菌に見られるＵＤＰグリコシルトランスフェラーゼのスーパー
ファミリーの一部である。肝臓において、ＵＤＰ-グルクロノシルトランスフェ
ラーゼはビリルビンと複合体形成する。ＵＤＰ-グルクロノシルトランスフェラ
ーゼ活性に影響を与えて非複合高ビリルビン血症をもたらす多くの状態がある。
これらの状態は、クリーグラー・ナジャー症候群（Jurgen等, Biochem. J. (199
6) 314: 477-483参照）及びギルバート症候群などの遺伝子疾患、並びにルーシ
ー-ドリスコール症候群などの獲得状態を含む。従って、グルクロノシルトラン
スフェラーゼファミリーの新規なメンバーの同定は興味の対象である（Tukey等,
J. Biol. Chem. (1993) 268(20): 15260-6; 及びWO9212987-A参照）。

【００２８】 ８１．ＰＲＯ１４８６ 小脳は、セレベリンと呼ばれるヘキサデカペプチドを含み、それはヒトからチ
キンへの系統で保存されている。３つの独立したオーバーラップするｃＤＮＡク
ローンがヒト小脳ライブラリ単離され、それはセレベリン配列をコードする。最
も長いクローンは一般にプレセレベリン又はセレベリン前駆体と呼ばれる１９３
アミノ酸のタンパク質をコードする。このタンパク質は、ヒト補体成分Ｃ１ｑの
Ｂ鎖の球形ドメインに有意な類似性を有する。関連性の領域は、両タンパク質の
カルボキシル末端に位置する約１４５アミノ酸に渡って伸びる。Ｃ１ｑＢ鎖とは
異なり、プレセレベリンのアミノ末端にコラーゲン様モチーフは存在しない。セ
レベリンは、多くの神経ペプチド前駆体に見られる古典的二塩基アミノ酸タンパ
ク質分解メカノズムによってプレセレベリンから遊離しないと考えられている。
セレベリン前駆体はシナプス性生理学に関連している。Urade等, PNAS, USA, 83
(3): 1069-1073 (1991)。従って、セレベリン、その前駆体、及び関連分子、特
にセレベリンと配列同一性を持つものは興味の対象である。 ８２．ＰＲＯ１４３３ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１４３３ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載す
る。

【００２９】 ８３．ＰＲＯ１４９０ 酵素タンパク質は、食物の消化、高分子の生合成、化学エネルギーの制御され
た放出及び利用、及び生命維持に必要な他のプロセスに含まれる化学反応で重要
な役割を担う。アシルトランスフェラーゼは、部位をアシル化する酵素である。
例えば、アシル-グリセロール-ホスフェートアシルトランスフェラーゼは、基質
としてリソホスファチジン酸に作用できる。リソホスファチジン酸はホスファチ
ジン酸に変換され、よって膜中に見られるホスファチジルエタノールアミンの形
成で役割を担う。さらに、１-アシル-ｓｎ-グリセロール-３-ホスフェートアシ
ルトランスフェラーゼは（ＬＰＡＡＴ）は、中程度の長さの脂肪アシル-コエン
ザイムＡ基質に優先的な酵素タンパク質である。Knutson等, Plant Physiol., 1
09: 999-1006 (1995)参照。よって、アシルトランスフェラーゼは、アシル化に
必要な分子の生合成で重要な役割を担う。 ここで我々は、ここにＰＲＯ１４９０ポリペプチドと命名する、１-アシル-ｓ
ｎ-グリセロール-３-ホスフェートアシルトランスフェラーゼタンパク質と相同
性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載する。 ８４．ＰＲＯ１４８２ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１４８２ポリペプチド
と命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 ８５．ＰＲＯ１４４６ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１４４４６ポリペプチ
ドと命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。

【００３０】 ８６．ＰＲＯ１５５８ メチルトランスフェラーゼ酵素はドナー分子からアクセプタ分子へのメチル基
に移動を触媒する。メチルトランスフェラーゼ酵素は、例えば、原核生物の原形
質膜及び真核生物細胞の内ミトコンドリア膜での電子輸送鎖を含む多くの異なる
生物学的プロセスにおいて極めて重要な役割を担う（例えば、Barkovich等, J.
Biol. Chem. 272: 9182-9188 (1997), Dibrov等, J. Biol. Chem. 272: 9175-91
81 (1997), Lee等, J. Bacteriol., 179: 1748-1754 (1997),及びMarbiois等, A
rch. Biochem. Biophys. 313: 83-88 (1994)参照）。メチルトランスフェラーゼ
酵素は、ともに呼吸電子伝達鎖のイソプレノイドキノン成分に必要とされるユビ
キノン（コエンザイムＱ）及びメナキノン（ビタミンＫ２）の生合成に必須であ
ることが示されている。メチルトランスフェラーゼ酵素の明らかな重要性が与え
られたので、メチルトランスフェラーゼの新規な相同体の同定は非常に興味深い
。ここで我々は、ここにＰＲＯ１５５８ポリペプチドと命名する、メチルトラン
スフェラーゼ酵素に相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについ
て記載する。 ８７．ＰＲＯ１６０４ 新規な成長因子の同定は、正常状態及び異常な状態の両方においてそれらが担
う細胞成長、増殖及び分化の誘発という役割のために特に興味深い。異常な組織
（例えば腫瘍）で過剰又は過小発現される成長因子の同定は、診断用具及び治療
薬の開発を導くこともある。成長因子は肝癌由来の細胞系から単離された。肝癌
由来の成長因子はマウス（1997年12月9日発行の日本国特許J09313185-A）及びヒ
ト（1994年12月20日発行の日本国特許J06343470-A）の組織から単離された。ヒ
ト肝癌由来細胞系から単離した肝癌由来成長因子は、幾つかの腫瘍由来細胞系、
並びに正常組織において偏在的に発現されることが見出された（Nakamura等, J.
Biol. Chem. (1994) 269(40): 25143-9）。成長因子は、繊維芽細胞にとって分
裂促進的な新規なヘパリン結合性タンパク質であると決定された。

【００３１】 ８８．ＰＲＯ１４９１ ニューロン細胞体は通常は他の細胞のように丸い。しかし、これらの細胞はま
た「プロセッセス(processes)」とも呼ばれる、そこから成長してシナプス結合
を形成する構造を有する。これらのプロセッセスの幾つかは細胞体からの情報を
；ときには長距離に渡って運ぶ。これらの長く薄いプロセッセスは軸索である。
軸索は薄く静的な管である。他のプロセッセスは細胞体へ、又は細胞体へ及び細
胞体からの情報を運ぶ。これらの短く通常は厚いプロセッセスは樹状突起と呼ば
れる。軸索及び樹状突起の両方が神経突起と呼ばれる。 ニューロンの発達及び成長段階の間、神経突起が成長円錐によって形成される
。成長円錐は神経突起の成長している先端である。成長円錐は平たく運動性が高
い。そこに新たな物質が添加され軸索のさらなる伸長が始まる。成長円錐が対照
を徐行する制御では軸索が策定され、よってそれが存在する。 成長円錐は幾つかの特定可能な部分を持つ。前縁から突出及び縮退する薄く平
らなベール様のプロセッセスは膜状仮足と呼ばれる。前縁から突出及び縮退する
針様プロセッセスは微小突起又は糸状仮足と呼ばれる。これらは、成長円錐の前
縁を前方に押すことに含まれる構造である。 成長円錐のそれらの適切な標的への正確な航路決定は、それらがそれらの直近
環境にある航路決定の合図を認識し反映する必要がある。これらの合図の幾つか
は或る領域への伸長を促進し、他はその他への伸長を封じる。インビトロでの神
経突起成長を促進する良く特徴付けされた分子は、細胞外マトリクス分子ラミニ
ン及びニューロン細胞表面分子Ｌ１／Ｇ４／８Ｄ９を含む。神経突起伸長を促進
するこれらの分子は、一般的に体内に広く分布している。ラミニン免疫活性は発
達中の中枢及び末梢神経系に合理的に拡がっている。同様に、Ｌ１／Ｇ４／８Ｄ
９は発達中の中枢神経系、特に長く突出した軸索におけるニューロンプロセッセ
スに広範に存在する。従って、公知の成長促進分子が、成長円錐が可能な経路間
で決定する自己特異的選択において重要な役割を担うか否かは不明である。それ
にも関わらず、それらの機能は、成長円錐が伸長しより特異的な航路決定の合図
に応答する一般的に許容される環境を提供すると考えられる。 これらのより特異的な航路決定の合図の中では、特定の成長円錐の運動性を阻
害する分子である。成長円錐は、異なる型の他の神経突起と接触した際にそれら
の運動性モルホロジーを失い前進をやめる（挫折する）ことが観察された。イン
ビトロでのテリトリー形成は、インビボでの選択的束状化を導くプロセスの出現
を意味しうる。幾つかの成長円錐は、特定の軸索経路、又は発達中の胚における
軸索の常同性配列に沿って徐行することが観察された。特異的な運動性阻害効果
は、幾つかの代替的経路の何れが成長円錐を伸長させるかを決定する。成長円錐
は、それらの挫折を誘発しない軸索で好ましく成長し、それをするものを避ける
ことが予想される。 例えば、交感成長円錐は網膜神経突起と接触すると阻害又は挫折させられるこ
とが観察された。同様に、網膜神経突起の成長円錐は交感神経突起と接触すると
挫折するであろう。このような細胞活性は、成長に関する特異的な合図を伝達す
る分子により特異的成長阻害の合図に特異的に反応するレセプターの存在を通し
て達成される。合図は、細胞表面、特に軸索表面に存在すると考えられている。 神経損傷が起きた場合、損傷した軸索又は樹状突起と置き換わる神経突起が無
いため修復が妨害され又は起こりえない。伸長している神経突起が損傷、断裂又
は破壊された場合、それに置き換わるために新たな神経突起が細胞体から成長す
ることはできない。神経突起成長を阻害する分子の存在は、神経突起再生におけ
る困難さの原因であると考えられる。コラプシン(collapsin)は、成長円錐伸長
を変調させる分子の活性を変えるように機能するタンパク質である。 ここで我々は、ここにＰＲＯ１４９１ポリペプチドと命名する、コラプシンタ
ンパク質と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載す
る。

【００３２】 ８９．ＰＲＯ１４３１ 細胞間シグナルの伝達は、分化、運動性及び分裂といった細胞プロセスに重大
である。このようなシグナル伝達は、タンパク質間の複合体相互作用の形態の細
胞を通して起こると考えられる。このようなタンパク質−タンパク質相互作用は
、シグナル伝達タンパク質内のモジュラードメインに媒介されることが多い。そ
の結果、シグナル伝達は現在、組み合わされた分子、及びその組み合わせの組成
物がシグナルを決定する系としてモデル化されている。 Ｓｒｃ相同ドメイン（例えば、ＳＨ２及びＳＨ３）は、シグナル伝達に含まれ
るタンパク質の配列類似性の領域で見られる２つのドメインである。発癌性チロ
シンキナーゼＳｒｃに関する初期の研究がＳＨ２ドメインを同定した。次いで、
ＳＨ２及びＳＨ３ドメインは多くの多様なタンパク質で見出されたので、それら
は構造モチーフの最も通常な型となった。ＳＨ２及びＳＨ３ドメインは、それら
を含むタンパク質を独立して折り畳むモジュラーであり、それらの二次構造は空
間的に互いに接近したＮ-及びＣ-末端を配し、一のタンパク質から次のものへ種
々の（Ｎ-からＣ-末端のいずれかの）位置に出現する（Cohen等, Cell, 80: 237
-348, 1995）。 ＳＨ２又はＳＨ３を突然変異させた初期の研究は、おｋれら２つのドメインが
機能にとって重要であることを示したが、ＲＡＳ-ＧＡＰ等のシグナル伝達タン
パク質の無関係ファミリーのクローニング、及びこれらのドメインの性質のモジ
ュラーが明らかになるＣｒｋ発癌遺伝子までであった。これら後者の実験は、Ｒ
ＡＳ-ＧＡＰ及びＣｒｋがリガンド刺激時にレセプターチロシンキナーゼに強く
結合することを示した。追跡研究は、この結合のメカニズムがＳＨ２ドメインを
介すること、及びレセプター自己リン酸化が必要であることを示した。これらの
発見は、レセプターチロシンキナーゼの活性化が細胞間ドメインの結合態様を変
化させる手段と見られ、レセプター−ＳＨ２含有タンパク質相互作用がシグナル
伝達カスケードを開始させることを意味する。 ＳＨ３ドメインはＳＨ２で意図されるものより一般的な機能を有する。ＳＨ３
結合タンパク質が、バクテリオファージ発現ライブラリを標識ＳＨ３ドメインで
スクリーニングすることにより単離された。これらの実験の結果は、ＳＨ３ドメ
インが短いプロリンリッチなポリペプチド、特にモチーフＰｘｘＰに結合するこ
とを示した。本特許出願が準備された時点での知識を基にすると、同定されたＳ
Ｈ３結合部位の全てがプロリンリッチである特性を有している。ＳＨ３ドメイン
の結合は、ＳＨ２ドメインで生じたようなリン酸化などの結合部位の共有結合的
修飾に無関係である。その結果、ＳＨ３−リガンド相互作用は通常構成的であり
誘導的ではないが、例外も存在する。一般的に、ＳＨ３ドメインは、中間的親和
性相互作用を介するタンパク質複合体の組立の手段としてより、シグナル「スイ
ッチ」として作用する可能性は低い。また、このような中程度親和性相互作用は
、ＳＨ３媒介相互作用が比較的短い時間であり、結合パートナーの濃度変化に応
じて改造されることを意味する。 ＳＨ２及びＳＨ３ドメインの結合特性の解析により、シグナル伝達をブロック
する化合物の提案が導かれた。ＳＨ２及びＳｈ３ドメインの標的タンパク質の配
列に基づくペプチドミメティックなリガンドは、構成的に活性化されたチロシン
キナーゼに依存する増殖性疾患の治療のための新たなリード化合物を代表する（
例えば、慢性骨髄性及び急性白血病におけるＢＣＲ／ＡＢＬ又は乳癌及び卵巣癌
におけるＨＥＲ-２／Ｎｅｕ）。

【００３３】 ９０．ＰＲＯ１５６３ 細胞性ディスインテグリン及びメタロプロテイナーゼ（ＡＤＡＭｓ）は、ヘビ
毒メタロプロテイナーゼ及びディスインテグリンのものと配列類似性を持つ遺伝
子のフェミリーである。ＡＤＡＭＴＳ-１遺伝子はトロンボスポンジン（ＴＳＰ
）Ｉ型モチーフを持つ点について新型のＡＤＡＭタンパク質をコードし、その発
現は炎症プロセスを伴う（Kuno等, J. Biol. Chem. 273: 13912-13917 (1998),
Kuno等, Genomics 46: 466-471 (1997)及びKuno等, J. Biol. Chem. 272: 556-5
62 (1997)）。ＡＤＡＭＴＳ-１遺伝子の発現は、腎臓及び心臓においてリポ多糖
のインビボ投与により誘発され、炎症反応において果たしうる役割を示唆してい
る。この点において、ＡＤＡＭＴＳ-１タンパク質は、種々の炎症プロセス及び
癌悪液質の進行に置いて役割を果たしうることが示唆された（Kuno等, 1998, 上
掲）。ここで我々は、ここにＰＲＯ１５６３ポリペプチドと命名する、ＡＤＡＭ
ＴＳ-１タンパク質と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づけにつ
いて記載する。 ９１．ＰＲＯ１５６５ コンドロモジュリン(chondromodulin)は、軟骨細胞の成長及び分化を相乗的に
刺激する軟骨生成マトリクス成分である（Suzuki, Connect. Tissue Res. 35: 3
03-307 (1996)）。より詳細には、コンドロモジュリン-Ｉは、血管内皮細胞の増
殖及び管形成を阻害するように作用し、それにより軟骨成長を刺激し、軟骨の初
期段階の骨による置換を阻害する用に機能する。コンドロモジュリン-ＩＩは、
コンドロモジュリン-Ｉのように血管新生を阻害はできないが、破骨細胞分化及
び軟骨成長を刺激するようにも機能する。このように、これら２つのポリペプチ
ドは、軟骨及び軟骨内骨構造の形成の調節に必須である。コンドロモジュリンタ
ンパク質によって担われる極めて重要は生理学的役割が与えられたので、えらの
タンパク質と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴付けにはかなりの
関心がある。我々は、ここでＰＲＯ１５６５と命名する、コンドロモジュリン-
Ｉに対して相同性を有する新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについてここ
に記載する。

【００３４】 ９２．ＰＲＯ１５７１ クロストリジウム・パーフリンゲンス・エンテロトキシン(ＣＰＥ)は、Ｃ．パ
ーフリンゲンスＡ型の食中毒の症状を起こす毒性因子であると考えられており、
また他のヒト及び獣医学的病気に関連している可能性もある(McClane, Toxicon.
34: 1335-1343 (1996))。ＣＰＥはクロストリジウム・パーフリンゲンスエンテ
ロトキシンレセプター(ＣＰＥ-Ｒ)と称される約５０ｋＤの細胞表面レセプター
タンパク質に結合し、細胞表面上に約９０,０００ｋＤの複合体を形成すること
により、その有害な細胞機能を発揮する。ＣＰＥ-Ｒタンパク質をコードするｃ
ＤＮＡはヒト及びマウスの両方において同定され、特徴づけられている(Katahir
a等, J. Cell. Biol. 136: 1239-1247 (1997)及びKatahira等, J. Biol. Chem.
272: 26652-26658 (1997))。ＣＰＥ毒素は哺乳類宿主の種々の病気の原因である
ことが報告されており、これらの病気はＣＰＥ-ＲにＣＰＥ毒素が結合すること
により開始されるので、新規なＣＰＥ-Ｒ相同体の同定にはかなりの関心がある
。我々は、ここでＰＲＯ１５７１と命名する、ＣＰＥ-Ｒに対して相同性を有す
る新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについてここに記載する。 ９３．ＰＲＯ１５７２ クロストリジウム・パーフリンゲンス・エンテロトキシンは、２つの構造的に
関連する膜タンパク質をインビボの機能的レセプターとして利用する。クロスト
リジウム・パーフリンゲンスエンテロトキシンレセプター(ＣＰＥ-Ｒ)と相同性
を示す人及びマウスｃＤＮＡをKatahira等, J. Cell. Biol. 136: 1239-1247 (1
997)及びKatahira等, J. Biol. Chem. 272: 26652-26658 (1997)に記載されてい
るようにクローニングした。それらは、２つのグループ、ベロ細胞ＣＰＥレセプ
ター相同体及びラットアンドロゲン退薬アポトーシスタンパク質（ＲＶＰ１）に
分類された。よって、これらのレセプターは関連分子のように興味深い。特に興
味深いのは、これらのレセプター及び関連分子を、これらのレセプターのモジュ
レータの同定で使用することである。 また興味深いのは、クラウジン(Claudin)ファミリーのメンバー及びそれに関
連する分子である。クラウジンは密着体に位置する完全な膜タンパク質でありオ
クルジン(occludin)と配列類似性を持たない。Furuse等, J. Cell Biol., 141(7
): 1539-50 (1998)。

【００３５】 ９４．ＰＲＯ１５７３ クロストリジウム・パーフリンゲンス・エンテロトキシンは、２つの構造的に
関連する膜タンパク質をインビボの機能的レセプターとして利用する。クロスト
リジウム・パーフリンゲンスエンテロトキシンレセプター(ＣＰＥ-Ｒ)と相同性
を示す人及びマウスｃＤＮＡをKatahira等, J. Cell. Biol. 136: 1239-1247 (1
997)及びKatahira等, J. Biol. Chem. 272: 26652-26658 (1997)に記載されてい
るようにクローニングした。それらは、２つのグループ、ベロ細胞ＣＰＥレセプ
ター相同体及びラットアンドロゲン退薬アポトーシスタンパク質（ＲＶＰ１）に
分類された。よって、これらのレセプターは関連分子のように興味深い。特に興
味深いのは、これらのレセプター及び関連分子を、これらのレセプターのモジュ
レータの同定で使用することである。 また興味深いのは、腹側前立腺．１タンパク質（ＲＶＰ．１）であり、それは
去勢後の退行しているラット前立腺において転写的に誘発される。このタンパク
質は、Peacock等, Genomics, 46(3): 443-9 (1997)に更に記載されている。 ９５．ＰＲＯ１４８８ クロストリジウム・パーフリンゲンス・エンテロトキシンは、２つの構造的に
関連する膜タンパク質をインビボの機能的レセプターとして利用する。クロスト
リジウム・パーフリンゲンスエンテロトキシンレセプター(ＣＰＥ-Ｒ)と相同性
を示す人及びマウスｃＤＮＡをKatahira等, J. Cell. Biol. 136: 1239-1247 (1
997)及びKatahira等, J. Biol. Chem. 272: 26652-26658 (1997)に記載されてい
るようにクローニングした。それらは、２つのグループ、ベロ細胞ＣＰＥレセプ
ター相同体及びラットアンドロゲン退薬アポトーシスタンパク質（ＲＶＰ１）に
分類された。よって、これらのレセプターは関連分子のように興味深い。特に興
味深いのは、これらのレセプター及び関連分子を、これらのレセプターのモジュ
レータの同定で使用することである。 新規な天然のレセプタータンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術
上の両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパ
ク質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリ
のスクリーニングに集中している。 ９６．ＰＲＯ１４８９ クロストリジウム・パーフリンゲンス・エンテロトキシン(ＣＰＥ)は、Ｃ．パ
ーフリンゲンスＡ型の食中毒の症状を起こす毒性因子であると考えられており、
また他のヒト及び獣医学的病気に関連している可能性もある(McClane, Toxicon.
34: 1335-1343 (1996))。ＣＰＥはクロストリジウム・パーフリンゲンスエンテ
ロトキシンレセプター(ＣＰＥ-Ｒ)と称される約５０ｋＤの細胞表面レセプター
タンパク質に結合し、細胞表面上に約９０,０００ｋＤの複合体を形成すること
により、その有害な細胞機能を発揮する。ＣＰＥ-Ｒタンパク質をコードするｃ
ＤＮＡはヒト及びマウスの両方において同定され、特徴づけられている(Katahir
a等, J. Cell. Biol. 136: 1239-1247 (1997)及びKatahira等, J. Biol. Chem.
272: 26652-26658 (1997))。ＣＰＥ毒素は哺乳類宿主の種々の病気の原因である
ことが報告されており、これらの病気はＣＰＥ-ＲにＣＰＥ毒素が結合すること
により開始されるので、新規なＣＰＥ-Ｒ相同体の同定にはかなりの関心がある
。我々は、ここでＰＲＯ１４８９と命名する、ＣＰＥ-Ｒに対して相同性を有す
る新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについてここに記載する。

【００３６】 ９７．ＰＲＯ１４７４ トリの卵白は４つの機構的クラス全てに属するプロテイナーゼのタンパク質阻
害剤の豊富な供給源である。オボムコイド及びオボインヒビターは多ドメインの
カザール型阻害剤であり、各ドメインはセリンプロテイナーゼに対する実際の又
は推定の反応部位を持つ。シスタチンはシステインプロテイナーゼ阻害剤である
が、オボスタチンは４つの機構的クラス全てのプロテイナーゼを阻害する。これ
らの阻害剤に着いての概説は、Saxena及びTayyab, Cell Mol. Life Sci., 53(1)
: 13-23 (1997)を参照。プロテイナーゼのタンパク質阻害剤の新規なメンバー、
特にオボムコイドなどの公知の阻害剤と配列同一性を持つものは興味の対象であ
る。 セリンプロテアーゼ阻害剤は一般的に興味の対象である。ニューロプシンなど
のセリンプロテアーゼは、細胞外マトリクス修飾及び細胞遊走を伴うことが示さ
れた。一般的には、Chen等, Neurosci., 7(2): 5088-5097 (1995)及びChen等, J
. Histochem. Cytochem., 46: 313-320 (1998)を参照。他のセリンプロテアーゼ
、エナメルマトリクスセリンプロテイナーゼは、歯の有機物質の分解に関連する
。Smith等, J. Dent. Res., 77(2): 377-386 (1998), Overall及びLimeback, Bi
ochem J., 256(3): 965-972 (1988), 及びMoradian-Oldak, Connect. Tissue Re
s., 35(1-4): 231-238 (1996)。よって、これらのプロテイナーゼの阻害剤は、
これらのメカニズムが制御を必要とする場合に興味深い。 ９８．ＰＲＯ１５０８ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１５０８ポリペプチド
と命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 ９９．ＰＲＯ１５５５ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１５５５ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通ポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載す
る。

【００３７】 １００．ＰＲＯ１４８５ リゾチームは分泌タンパク質であり、或る種の微生物のムコペプチド細胞壁構
造で起こるＮ-アセチルムラミン酸とＮ-アセチルグルコサミンとの［ベータ］１
,４-グルコシド結合を主に加水分解する。リゾチームは動物及び植物に広く分布
している。それは、哺乳動物分泌及び唾液、涙、乳、頚管粘液、白血球、腎臓な
どを含む組織で見出された。リゾチームファミリーのタンパク質の新規なメンバ
ーの同定は、代謝機能及び機能不全でリゾチームが担う様々な役割により興味の
対象である。リゾチームの異常レベルは種々の疾患状態に含まれる。リゾチーム
は抗-微生物、鎮痛、及び抗侵害特性を持つと報告されている。リゾチームのさ
らなる特徴及び可能な用途は、米国特許第5,618,712号に記載されている。 特に興味深いのはリゾチームＣであり、それは発酵食品の微生物からの滋養物
を回収することを必要とする生物の胃において消化酵素として採用される。リゾ
チームＣ及び関連タンパク質の歴史はQasba及びKumar, Crit. Rev. Biochem. Mo
l. Biol., 32(4): 255-306 (1997); Irwin, EXS, 75: 347-361 (1996)に更に記
載されている。 １０１．ＰＲＯ１５６４ グリコシル化は翻訳後タンパク質修飾の通常で複雑な形態である。存在する独
特な構造の多くが知られ、その数は増加しているが、殆どは一連の通常の合成中
間体から生じたもので、それらの末端グリコシルトランスフェラーゼにおいて相
違し、オリゴ糖アクセプター及び存在するタンパク質の特徴の両方を認識する。
ＵＤＰ-Ｎ-アセチル-アルファ-Ｄ-ガラクトサミン：ポリペプチドＮ-アセチルガ
ラクトサミニルトランスフェラーゼは、Ｎ-アセチルガラクトサミンのアミノ酸
のヒドロキシル基への付加によりタンパク質中のセリン及びスレオニンアミノ酸
に特異的なＯ-グリコシル化を開始する酵素タンパク質である。 多くの重要な生物学的及び生理学的事象がグリコシル化によって調節されるので
、公知のグリコシル化タンパク質と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び
特徴付けなかなりの興味がある。ここで我々は、ここにＰＲＯ１５６４ポリペプ
チドと命名する、Ｎ-アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼタンパク質
と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載する。 １０２．ＰＲＯ１７５５ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１７５５ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する
。

【００３８】 １０３．ＰＲＯ１７５７ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１７５７ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する
。 １０４．ＰＲＯ１７５８ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１７５８ポリペプチド
と命名する、新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 １０５．ＰＲＯ１５７５ タンパク質ジスルフィドイソメラーゼ(ＰＤＩ)は、ヒト血清アルブミン（ＨＳ
Ａ）においてジスルフィド結合の形成を促進する酵素である。従って、ＰＤＩは
ヒト血清アルブミンの全体構造の形成を補助する。ＰＤＩとヒト血清アルブミン
との同時発現は、ＨＳＡ構造不安定化細胞性プロテアーゼによる分解の機会を減
らすことによりＨＳＡの分泌を増加させる。ＰＤＩとＨＳＡの同時発現は、原核
生物の小胞体における局在化を向上させた（Hayano等, EP-50941-A (1992)）。
ＰＤＩ及びヒトのプロリル４-ヒドロキシラーゼのベータ-ユニットは、同じ遺伝
子の産物であることが示された（Pihlajaniemi等, EMBO J., 6: 643-49 (1987)
）。さらに、ＰＤＩのＣＧＨＣ含有活性部位配列は多くの管腔小胞体タンパク質
、Ｅｒｐ７２で見出された（Mazzarella等, J. Biol. Chem., 2: 1094-1101 (19
90)）。 新規な天然のレセプタータンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術
上の両方の努力が現在なされている。努力の多くは、新規なレセプタータンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。 １０６．ＰＲＯ１７８７ 多重新規ＭＰＺ（Ｐ０）点突然変異が、散発性ドゥジュリーヌ‐ソッタ（ＤＤ
Ｓ）ケースで特定された。Warner等, Hum. Mutat., 10(1): 21-4 (1997)。ＤＤ
Ｓは乳児期に発病する重篤な脱髄末梢神経疾患であり、ＰＭＰ２２又はＭＰＺの
いずれかの変異を伴う。さらに、 シャルコー‐マリー‐ツース病を持つスペイン祖先及び圧力麻痺依存性の遺伝的
神経疾患の患者におけるＭＰＺ、ＰＭＰ２２及びＣｘ３２遺伝子の突然変異的分
析が報告されている。Bort等, Hum. Genet., 99(6): 746-54 (1997)。ミエリン
糖タンパク質Ｐ０は、他の研究においても報告されている（Blanquet-Grossard
等, Clin. Genet., 48(6): 281-3 (1995), Hayasaka等, Nat. Genet., 5(1): 31
04 (1993) 及びSaavedra等, J. Mol. Evol., 29(2): 149-56 (!989)）。よって
、ミエリンｐ０ファミリーに属するタンパク質は興味の対象である。

【００３９】 １０７．ＰＲＯ１７８１ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１７８１ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する
。 １０８．ＰＲＯ１５５６ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１５５６ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する
。 １０９．ＰＲＯ１７５９ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１７５９ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する
。 １１０．ＰＲＯ１７６０ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１７６０と命名する、
新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。

【００４０】 １１１．ＰＲＯ１５６１ ホスホリパーゼＡ２（ＰＬＡ２）は、リン脂質の２-アシルエステル結合を加
水分解するタンパク質であり、その例はサイトゾルＰＬＡ２分泌ＰＬＡ２を含み
、それらは明確に区別できる。サイトゾルＰＬＡ２（ｃＰＬＡ２）は、２-位が
エステル化されたアラキドン酸を含むリン脂質を選択的に加水分解することが知
られている。これらの重要な生物学的活性が与えられたので、ホスホリパーゼＡ
２タンパク質と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴付けはかなり興
味がある。ここで我々は、ここにＰＲＯ１５６１と命名する、ホスホリパーゼＡ
２と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づけについて記載する。 １１２．ＰＲＯ１５６７ 結腸特異的遺伝子（ＣＳＧ）及びそれらの発現産物は、発行された国際出願WO
9639419に記載されている。それらは結腸癌及び結腸癌転移の診断マーカーとし
て有用であり、潜在的製薬及び診断薬のスクリーニングにも使用できる。ＣＳＧ
ファミリーの新規なメンバーの同定は興味の対象である。 １１３．ＰＲＯ１６９３ インシュリン様成長因子は、成長促進及びインシュリン様活性の両方を有する
。ヒトにおいて良好に特徴付けされた血漿ＩＧＦ結合タンパク質が２つある。よ
り大きなタンパク質は、殆どは１２５〜１５０ｋＤの複合体として循環している
５３Ｋの酸-不安定性タンパク質でＩＧＦ-Ｉ又はＩＧＦ-ＩＩを構成すると考え
られるもの、結合タンパク質自身及び約１００ｋＤの分子量を持つ酸-不安定性
の非ＩＧＦ結合タンパク質である。より小さなタンパク質は、非還元形態で２８
Ｋ、還元状態で３４Ｋの見かけの分子量を持つ。これらのＩＧＦ結合タンパク質
は、インシュリン様又は成長因子タンパク質によって担われる生理学的活性にお
いて重要な役割を果たすことが示された。このように、インシュリン様成長因子
結合タンパク質と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴付けはかなり
興味がある。ここで我々は、ここにＰＲＯ１６９３と命名する、インシュリン様
成長因子結合タンパク質と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づけ
について記載する。 １１４．ＰＲＯ１７８４ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１７８４ポリペプ
チドと命名する、新規な膜貫通タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する
。 １１５．ＰＲＯ１６０５ Ｎ-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼタンパク質は、哺乳類生物に
おいて様々な重要な生物学的機能を与える酵素ファミリーを含む。例として、Ｕ
ＤＰ-Ｎ-アセチルグルコサミン：アルファ-３-Ｄ-マンノシドビート-１,２-Ｎ-
アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼＩは、高級-マンノース-Ｎ-グリカ
ンのハイブリッド及び複合Ｎ-グリカンへの変換に必須の第１段階を触媒する酵
素タンパク質である（Sarkar等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88: 234-238 (1
991)）。Ｎ-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ酵素の明らかな重要性
が与えられたので、Ｎ-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼタンパク質
と相同性を有する新規なポリペプチドの同定及び特徴付けは非常に興味深い。こ
こで我々は、ここにＰＲＯ１６０５ポリペプチドと命名する、Ｎ-アセチルグル
コサミニルトランスフェラーゼタンパク質と相同性を持つ新規なポリペプチドの
同定及び特徴づけについて記載する。

【００４１】 １１６．ＰＲＯ１７８８ タンパク質-タンパク質相互作用はレセプター及び抗原複合体及びシグナル伝
達機構に関連するものを含む。タンパク質-タンパク質相互作用の基となる構造
的及び機能的機構についてよく知られているように、タンパク質-タンパク質相
互作用は、タンパク質-タンパク質相互作用の特定の結果を調節するように更に
容易に操作することができる。従って、タンパク質-タンパク質相互作用の基と
なる機構は科学及び医学界にとって興味深い。 ロイシンリッチ反復を含む全てのタンパク質はタンパク質-タンパク質相互作
用に関与していると考えられている。ロイシンリッチ反復は多様な機能を持つ多
くのタンパク質と細胞位置に存在する短い配列モチーフである。リボ核酸インヒ
ビタータンパク質の結晶構造から、ロイシンリッチ反復はベータ-アルファ構造
単位に対応することが明らかになった。これらの単位は、一面が溶媒に暴露され
た平行なベータシートを形成するように配置され、タンパク質は珍しい非球状の
形状を獲得する。これらの二つの特徴はロイシンリッチ反復を含むタンパク質の
タンパク質結合機能の原因であることが示されている。Kobe及びDeisenhofer, T
rends Biochem.Sci., 19(10):415-421 (Oct.1994)を参照されたい。 個体発生の間にコラーゲン原線維を配向し指令する組織オーガナイザーとなり
、創傷治癒、組織修復、及び腫瘍ストローマ形成のような病理プロセスに関与す
るロイシンリッチプロテオグリカンについて研究が報告されている。Iozzo, R.V
., Crit.Rev.Biochem.Mol.Biol., 32(2):141-174 (1997)。創傷治癒、組織修復
におけるロイシンリッチタンパク質の関与を示す他の研究は、De La Salle, C.
等, Vouv.Rev.Fr.Hematol. (Germany),37(4):215-222 (1995)であり、出血疾患
ベルナール-スーリエ症候群に伴う複合体におけるロイシンリッチモチーフの突
然変異を報告しており、Chlemetson,K.J., Thromb. Haemost. (Germany),74(1):
111-116 (July 1995)は、血小板がロイシンリッチ反復を有していることを報告
しており、La Jolla Cancer Research FoundationのRuoslahti, E.I.等のWO9110
727-Aは、トランスフォーミング成長因子βに結合するデコリンが癌の治療、創
傷治癒及び瘢痕化に関与していることを報告している。結合組織、皮膚及び骨の
ような組織の再成長に関連する創傷治癒及び付随する治療法において；ヒトと動
物における体成長を促進することで；及び他の成長関連プロセスを刺激する点で
有用であることにおいて、この群のタンパク質に機能が関連しているのはインス
リン様成長因子(ＩＧＦ)である。ＩＧＦの酸不安定サブユニット(ＡＬＳ)はまた
ＩＧＦの半減期を増大させインビボのＩＧＦ複合体の一部である点で興味深い。
Ollendorff, V., 等, Cell Growth Differ., 5(2): 213-219 (1994年2月)は、Ｇ
ＡＲＰ遺伝子を同定し、それはヒトのＧＰ Ｉｂアルファ及びＧＰ Ｖ血小板タン
パク質と、及びショウジョウバエのカオプチン(Chaoptin)、Ｔｏｌｌ、及び子ネ
クチン接着分子と構造的類似性を持つロイシンリッチ反復含有タンパク質をコー
ドする。 ロイシンリッチ反復を有することが報告されている他のタンパク質は、アルツ
ハイマー病のような神経変性疾患、パーキンソン病のような神経損傷の治療にお
いて、及び癌の診断に対して有用であることが報告されているＳＬＩＴタンパク
質である。エール大学のArtavanistsakonas,S.及びRothberg,J.M.のWO9210518-A
1を参照。特に興味深いのはＬＩＧ-１、すなわちマウス脳のグリア細胞中に特異
的に発現され、ロイシンリッチ反復及び免疫グロブリン様ドメインを有する膜糖
タンパク質である。Suzuki等,J.Biol.Chem.(U.S.),271(37):22522 (1996)。ロイ
シンリッチ反復を有するタンパク質の生物学的機能を報告している他の研究には
：Tayar, N.等, Mol.Cell Endocrinol., (Ireland), 125(1-2):65-70 (Dec.1996
)(ゴナドトロピンレセプター関連)；Miura,Y.等,Nippon Rinsho (Japan), 54(7)
:1784-1789 (July 1996)(アポトーシス関連)；Harris,P.C.等, J.Am.Soc.Nephro
l., 6(4):1125-1133 (Oct.1995)(腎疾患関連)；及びAlmeida, A., 等, Oncogene
16(23): 2997-3002 (June 1998)（悪性神経膠腫関連）が含まれる。

【００４２】 １１７．ＰＲＯ１８０１ インターロイキン-１０（ＩＬ-１０）は多面的な免疫抑制サイトカインであり
、骨髄及びリンパ細胞の機能の重要なレギュレータとして関連している。ＩＬ-
１０が、例えばＩＬ-１、ＩＬ-６、ＩＦＮ-及びＴＮＦ-を含む種々の炎症性サイ
トカインの合成活性化の強力なインヒビターとして機能することが示された（Ge
sser等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94: 14620-14625 (1997)）。さらに、Ｉ
Ｌ-１０はマクロファージの付属的活性の幾つかを強く阻害し、それによりマク
ロファージ、Ｔ細胞及びＮＫ細胞のエフェクター機能の強力なサプレッサとして
機能することが示された（Kuhn等, Cell 75: 263-274 (1993)）。さらに、ＩＬ-
１０はＢ細胞、肥満細胞及び胸腺細胞分化の調節と強く関係している。 ＩＬ-１０は２つの別の実験系から独立に同定された。第１に、マウスＩＬ-１
０をコードするｃＤＮＡクローンが、サイトカイン合成阻害因子の発現に基づい
て同定され（Moore等, Science 248: 1230-1234 (1990)）、ヒトＩＬ-１０対応
ｃＤＮＡが続いてマウスＩＬ-１０ｃＤＮＡでの交差ハイブリッド形成によって
同定された（Viera等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 1172-1176 (1991)）。
さらにＩＬ-１０は、活性胸腺を同時刺激するように機能するＢ細胞由来のメデ
ィエータとして独立に同定された（Suda等, Cell Immunol., 129: 228 (1990)）
。 最近、ＩＬ-１０関連サイトカインファミリーのメンバーである新規なサイト
カインポリペプチドが同定され特徴付けられた。この新規な分泌サイトカインは
ＩＬ-１９と命名され、約２０．４ｋＤの分子量を持つ１７７アミノ酸のポリペ
プチドである（1998年3月5日発行のWO 98/08870参照）。ＩＬ-１９は活性化単球
によって特異的に発現され、ＩＬ-１９の増加及び／又は減少したレベルは、サ
イトカイン生産の増加又は低下したレベルと関係する一又は複数の生理学的疾患
と関連する（WO 98/08870参照）。特に、ＩＬ-１９は、免疫系の細胞による炎症
性サイトカインの合成を阻害できると示唆された。 種々のサイトカインポリペプチド、より詳細にはＩＬ-１０及び潜在的にＩＬ-
１９などの免疫抑制サイトカインの明らかな重要性が与えられたので、ＩＬ-１
０及び／又はＩＬ-１９と相同性を持つ新規なサイトカインポリペプチドの同定
及び特徴付け歯かなり興味深い。ここで我々は、ここにＰＲＯ８０１ポリペプチ
ドと命名する、ＩＬ-１９と相同性を持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴づ
けについて記載する。

【００４３】 １１８．ＵＣＰ４ 非結合タンパク質又は「ＵＣＰｓ」は、代謝プロセスにおいて役割を担うと考
えられており、文献に報告されている。ＵＣＰはクマなどの冬眠動物の褐色脂肪
細胞で最初に見出され記載された。ＵＣＰはそのような冬眠を助け、他の寒冷気
候適応動物は、それらの身体の休眠代謝速度を上げることにより寒冷気候でも中
心体温を維持する。ヒトは比較的少ない褐色脂肪組織を持つので、ＵＣＰは最初
ヒト代謝では副次的な役割を担うと考えられた。 幾つかの異なるヒト非結合タンパク質が現在までに記載されている［一般的に
は、Gura, Science, 280: 1369-1370 (1998)参照］。ＵＣＰ１と呼ばれるヒト非
結合タンパク質はNicholls等によって同定された。Nicholls等は、褐色脂肪細胞
ミトコンドリアの内膜が非常にタンパク質透過性であり、実験者はミトコンドリ
ア膜で観察されたＵＣＰ１と呼ばれるタンパク質透過性を追跡した。Nicholls等
は、ＵＣＰ１が、組織因子のような透過性により、食物源からなされる多数のＡ
ＴＰを減らし、身体代謝を上昇させて熱を発生させると報告した［Nichols等, P
hysiol. Rev., 64: 1-64 (1984)］。 後にＵＣＰ１は褐色脂肪組織のみで発現されることが見出された［Bouillaud
等, Proc. Natl. Acad. Sci., 82: 445-448 (1985); Jacobsson等, J. Biol. Ch
em., 260: 16250-16254 (1985)］。遺伝子マッピング研究により、ヒトＵＣＰ１
遺伝子は染色体４に位置することが示された［Cassard等, J. Cell. Biochem.,
43: 255-264 (1990)］。 ＵＣＰＨ又はＵＣＰ２と呼ばれる他のヒトＵＣＰも記載されている。［Gimeno
等, Diaberes, 46: 900-906 (1997); Fleury等, Nat. genet., 15: 269-272 (19
97); Boss等, FEBS Letters, 408-: 39-42 (1997); またWolf, Nutr. Rev., 55:
178-179 (1997)も参照］。Fleury等は、ＵＣＰ２タンパク質がＵＣＰ１と５９
％のアミノ酸配列同一性を有し、ＵＣＰ２は高インシュリン血症及び肥満と関連
するヒト染色体１１の領域にマッピングされることを教示した［Fleury等, 上掲
］。また、ＵＣＰ２は、脳及び筋肉などの種々の成人組織及び脂肪細胞で発現さ
れることも報告された［Gimeno等, 上掲, 及びFleury等, 上掲］。 第３のヒトＵＣＰであるＵＣＰ３は、Boss, 上掲; Vidal-Puig等, Biochem. B
iophys. Res. Comm., 235: 79-82 (1997); solanes等, J. Biol. Chem., 272: 2
5433-25436 (1997); 及び Gong等, J. Biol. Chem., 272: 24129-24132 (1997)
に記載された［英国特許第9716886も参照］。Solanes等は、ＵＣＰ１及びＵＣＰ
２とは異なり、ＵＣＰ３は主にヒト骨格筋で発現され、ＵＣＰ３遺伝子は及び染
色体１１にＵＣＰ２に隣接してマッピングされることを報告した。Gong等は、Ｕ
ＣＰ３発現が甲状腺ホルモン、ベータ３-アンドレン性アゴニスト及びレプチン
といった公知の発熱性刺激によって調節できることを記載している［Gong等, 上
掲］。

【００４４】 １１９．ＰＲＯ１９３ 新規な天然の膜貫通タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の
両方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な膜貫通タンパク
質についてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリの
スクリーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１９３と命名する
、新規な膜貫通タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 １２０．ＰＲＯ１１３０ ヒト２−１９タンパク質等のポリペプチドはサイトカインとして機能する。サ
イトカインは、分化、増殖又は免疫細胞の機能を刺激又は阻害する低分子量タン
パク質である。サイトカインタンパク質は、細胞間メッセンジャーとして作用し
、複数の生理学的効果を持つことが多い。インビボでの免疫機構の生理学的重油
性が与えられたので、免疫系への影響に含まれる新規で天然のタンパク質の同定
のための努力が現在なされている。我々は、ヒト２−１９タンパク質と配列類似
性を持つ新規なポリペプチドの同定についてここに記載する。 １２１．ＰＲＯ１３３５ 脱炭酸酵素は、二酸化炭素及び水から（又はそれらへの）炭酸の合成（及び脱
水）を触媒することにより哺乳動物血液系における二酸化炭素の輸送及び放出を
目的とする酵素タンパク質である。よって、脱炭酸酵素の作用は哺乳動物におけ
る種々の重要な生理学的反応に必要である。このように、脱炭酸酵素と相同性を
持つ新規なポリペプチドの同定及び特徴付けはかなり興味がある。ここで我々は
、ここでＰＲＯ１３３５と命名される、脱炭酸酵素と相同性を持つ新規なポリペ
プチドの同定及び特徴付けについて記載する。

【００４５】 １２２．ＰＲＯ１３２９ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１３２９と命名する、
新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。 １２３．ＰＲＯ１５５０ 新規な天然の分泌タンパク質を同定し特徴づけるために産業上及び学術上の両
方の努力が現在なされている。これらの努力の多くは、新規な分泌タンパク質に
ついてのコード化配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリのスク
リーニングに集中している。ここで我々は、ここにＰＲＯ１５５０と命名する、
新規な分泌タンパク質の同定及び特徴づけについて記載する。

【００４６】 (発明の概要) １． ＰＲＯ１５６０ 本出願において「ＰＲＯ１５６０」と命名され、テトラスパンファミリーの新
規なメンバーであると考えられている新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡ
クローン（ＤＮＡ１９９０２−１６６９）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５６０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２(配列番号：４)のアミノ酸残
基１又は約４３から約２４５の配列を有するＰＲＯ１５６０ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１(配列番号：３)の残基約１６７から約７７
５の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５６０ポリペプチ
ドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド形成は
緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５４のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ１９９０２−１６６９)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５４のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ１９９０２−１６６９）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２(配列番号：４)のアミノ酸
残基１又は約４３から約２４５の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離さ
れた核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２(配列番号
：４)のアミノ酸残基約１又は約４３から約２４５の配列を有するＰＲＯ１５６
０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチドを、好ましくは少なくとも約１０
０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【００４７】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５６０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ２（配列番号：４）の配列においてアミノ
酸位置１からアミノ酸位置約４２まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメ
インは、ＰＲＯ１５６０アミノ酸配列（Ｆｉｇ２、配列番号：４）のアミノ酸位
置約１９−４２、６１−８３、９２−１１４及び２０９−２３０にあるものとし
て仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２(配列番号：４)の残基１又は約４３
から約２４５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５６０ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５６０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５６０ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ２(配列番号：４)の残基１又は約
４３から約２４５を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２(配列番号：４)のアミノ酸残基１又は約４
３から約２４５の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは
少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同
一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６０ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２(配列番号：４)の残基１又は約４３か
ら約２４５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配
列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６０ポリペプチドに関する。

【００４８】 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２(配列番号：４)のアミノ酸残基１又は
約４３から約２４５の配列、又は抗−ＰＲＯ１５６０抗体に対する結合部位を提
供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６０ポリペプチ
ドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１５６０断片は、天然ＰＲＯ１５６０ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
(配列番号：４)のアミノ酸残基約１又は約４３から約２４５の配列を有するＰＲ
Ｏ１５６０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５６０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５６０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５６０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５６０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５６０ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。 ２． ＰＲＯ４４４ 本出願において「ＰＲＯ４４４」と命名された新規な分泌ポリペプチドをコー
ドするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ２６８４６−１３９３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ４４４ポリペプチドをコードするＤＮＡを含
んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ４(配列番号：６)のアミノ酸残
基約１又は約１７から約１１７の配列を有するＰＲＯ４４４ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【００４９】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３(配列番号：５)の残基約６５６から約９５
８の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ４４４ポリペプチド
をコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド形成は緊
縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ２６８４６−１３９７)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０６のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ２６８４６−１３９７）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４(配列番号：６)のアミノ酸
残基約１又は約１７から約１１７の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離
された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ４(配列番号
：６)のアミノ酸残基約１又は約１７から約１１７の配列を有するＰＲＯ４４４
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約１０ヌクレオチド、より好ましくは少なくとも約２０
ヌクレオチド、最も好ましくは約４０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子
に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ４４４ポリペプチドをコードするＤＮＡを含
む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ４(配列番号：６)のアミノ酸位置１からア
ミノ酸位置約１６まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４(配列番号：６)の残基１又は約１７
から約１１７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核
酸分子に関する。

【００５０】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ４４４ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約２
０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、よ
り好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約４
０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ４４４ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ４４４ポリペプチドを提
供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ４(配列番号：６)の残基１又は約１
７から約１１７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４(配列番号：６)のアミノ酸残基１又は約１
７から約１１７の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは
少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同
一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ４４４ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ４(配列番号：６)の残基１又は約１７か
ら約１１７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配
列を含んでなる、単離されたＰＲＯ４４４ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ４(配列番号：６)のアミノ酸残基１
又は約１７から約１１７の配列、又は抗-ＰＲＯ４４４抗体に対する結合部位を
提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ４４４ポリペプチ
ドに関する。好ましくは、ＰＲＯ４４４断片は、天然ＰＲＯ４４４ポリペプチド
の質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ４
(配列番号：６)のアミノ酸残基約１又は約１７から約１１７の配列を有するＰＲ
Ｏ４４４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。

【００５１】 ３． ＰＲＯ１０１８ 本出願において「ＰＲＯ１０１８」と命名された、新規な膜貫通ドメインをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５６１０７−１４１５）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１０１８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ６(配列番号：８)のアミノ酸残
基約１又は約２５から約１８９の配列を有するＰＲＯ１０１８ポリペプチドをコ
ードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくと
も約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好
ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％
の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５(配列番号：７)のヌクレオチド約１２９又
は約２０１から約６９５の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲ
Ｏ１０１８ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは
、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５６１０７−１４１５)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０５のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５６１０７−１４１５)にコードされる同じ成熟ポリペプチド
をコードするＤＮＡを含んでなる。 またさらなる態様では、本発明は（ａ）Ｆｉｇ６２(配列番号：８)のアミノ酸
残基１又は約２５から約１８９の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでな
る単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ６(配列番号
：８)のアミノ酸残基１又は約２５から約１８９の配列を有するＰＲＯ１０１８
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも１０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する
。

【００５２】 特定の態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１０１８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供するか、又はそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ６（配列番号：８）の配列においてアミノ
酸位置約１からアミノ酸位置約２４まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ド
メインは、ＰＲＯ１０１８アミノ酸配列（Ｆｉｇ６、配列番号：８）のアミノ酸
位置約８６からアミノ酸位置約１０３及びアミノ酸位置約６０からアミノ酸位置
約７５まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ６(配列番号：８)の残基１又は約２５
から約１８９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核
酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１０１８ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ５（配列番号：７）に示すヌクレオチド配列
から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１０１８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１０１８ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ６(配列番号：８)の残基１又は約
２５から約１８９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ６(配列番号：８)のアミノ酸残基１又は約２
８から約１８９の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは
少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同
一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１０１８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ６(配列番号：８)の残基１又は約２５か
ら約１８９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配
列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１０１８ポリペプチドに関する。

【００５３】 またさらなる他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ６(配列番号：８)のアミノ酸残
基１又は約２５から約１８９の配列、又は抗-ＰＲＯ１０１８抗体に対する結合
部位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１０１８ポ
リペプチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１０１８断片は、天然ＰＲＯ１０１８
ポリペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ６
(配列番号：８)のアミノ酸残基約１又は約２５から約１８９の配列を有するＰＲ
Ｏ１０１８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 ４． ＰＲＯ１７７３ 本出願において「ＰＲＯ１７７３」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、レチノールデヒドロゲナーゼプロテインをコードする核酸と相同性を有する
、ｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５６４０６−１７０４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１７７３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ８(配列番号：１０)のアミノ酸
残基約１又は約１８から約３１９の配列を有するＰＲＯ１７７３ポリペプチドを
コードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なく
とも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より
好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５
％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７(配列番号：９)のヌクレオチド約１１１又
は約１６２から約１０６７の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰ
ＲＯ１７７３ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましく
は、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５６４０６−１７０４)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７８のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５６４０６−１７０４）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。

【００５４】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ８(配列番号：１０)のアミノ
酸残基１又は約１８から約３１９の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離
された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ８(配列番号
：１０)のアミノ酸残基１又は約１８から約３１９の配列を有するＰＲＯ１７７
３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも５２５ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関
する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１７７３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ８（配列番号：１０）の配列においてアミ
ノ酸位置約１からアミノ酸位置約１７まで伸びると仮に同定されている。膜貫通
ドメインは、ＰＲＯ１７７３アミノ酸配列（Ｆｉｇ８、配列番号：１０）のアミ
ノ酸位置約１３６からアミノ酸位置約１５２まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ８(配列番号：１０)の残基１又は約１
８から約３１９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された
核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１７７３ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ７（配列番号：９）に示すヌクレオチド配
列から誘導されうる。

【００５５】 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１７７３ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１７７３ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ８(配列番号：１０)の残基１又は
約１８から約３１９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８(配列番号：１０)のアミノ酸残基１又は約
１８から約３１９の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましく
は少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列
同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７７３ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ８(配列番号：１０)の残基１又は約１８
から約３１９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７７３ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８(配列番号：１０)のアミノ酸残基１又
は約１８から約３１９の配列、又は抗−ＰＲＯ１７７３抗体に対する結合部位を
提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７７３ポリペプ
チドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１７７３断片は、天然ＰＲＯ１７７３ポリペ
プチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ８
(配列番号：１０)のアミノ酸残基約１又は約１８から約３１９の配列を有するＰ
ＲＯ１７７３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ
分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）
又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも
約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も
好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮ
Ａ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（
ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチ
ドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１７７３ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１７７３抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１７７３ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１７７３ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。

【００５６】 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１７７３ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。 ５． ＰＲＯ１４７７ 本出願において「ＰＲＯ１４７７」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、マンノシダーゼプロテインをコードする核酸と相同性を有する、ｃＤＮＡク
ローン（ＤＮＡ５６５２９−１６４７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４４７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１０(配列番号：１２)のアミノ
酸残基約１から約６９９の配列を有するＰＲＯ１４７７ポリペプチドをコードす
るＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約８
０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましく
は少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列
同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９(配列番号：１１)のヌクレオチド約２３か
ら約２１１９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４７７
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２９３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５６５２９−１６４７)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２９３のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５６５２９−１６４７）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１０(配列番号：１２)のアミ
ノ酸残基１から約６９９の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは
少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同
一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１０(配列番
号：１２)のアミノ酸残基１から約６９９の配列を有するＰＲＯ１４７７ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、緊縮
性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製造さ
れた、少なくとも５４０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【００５７】 特別な態様では、本発明は、及び／又は開始メチオニンを持っているか持って
いないＰＲＯ１４７７ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分
子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は不活性化された変異体
を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。膜貫通ドメイ
ンは、ＰＲＯ１４７７アミノ酸配列（Ｆｉｇ１０、配列番号：１２）のアミノ酸
位置約２１からアミノ酸位置約４０、及びアミノ酸位置約８４からアミノ酸位置
約１０５まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１０(配列番号：１２)の残基１から約
６９９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分子
に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４７７ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ９（配列番号：１１）に示すヌクレオチド
配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４７７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４７７ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１０(配列番号：１２)の残基１か
ら約６９９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０(配列番号：１２)のアミノ酸残基１から
約６９９の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んで
なる、単離されたＰＲＯ１４７７ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０(配列番号：１２)の残基１から約６
９９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１４７７ポリペプチドに関する。

【００５８】 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０(配列番号：１２)のアミノ酸残基１
から約６９９の配列、又は抗−ＰＲＯ１４７７抗体に対する結合部位を提供する
のに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４７７ポリペプチドに関
する。好ましくは、ＰＲＯ１４７７断片は、天然ＰＲＯ１４７７ポリペプチドの
質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
０(配列番号：１２)のアミノ酸残基約１から約６９９の配列を有するＰＲＯ１４
７７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子を
含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ）
細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提供
する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４７７ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗−ＰＲＯ１４７７抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４７７ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４７７ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４７７ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。 ６． ＰＲＯ１４７８ ガラクトシルトランスフェラーゼと配列同一性を有し、本出願において「ＰＲ
Ｏ１４７８」と命名された新規なポリペプチドをコードする、ｃＤＮＡクローン
（ＤＮＡ５６５３１−１６４８）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４７８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１２(配列番号：１７)のアミノ
酸残基約１から約３２７の配列を有するＰＲＯ１４７８ポリペプチドをコードす
るＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約８
０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましく
は少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列
同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【００５９】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１(配列番号：１６)の残基約７７から約１
０５７の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４７８ポリペ
プチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド形
成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５６５３１−１６４８)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８６のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５６５３１−１６４８）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１２(配列番号：１７)のアミ
ノ酸残基約１から約３２７の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ましく
は少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列
同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された
核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１２(配列番
号：１７)のアミノ酸残基約１から約３２７の配列を有するＰＲＯ１４７８ポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、緊
縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製造
された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌクレ
オチドを有する単離された核酸分子に関する。 特定の態様では、本発明は、可溶性形態のＰＲＯ１４７８ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡを含む単離された核酸分子、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は不
活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的で
ある。膜貫通ドメイン（ＩＩ型）は、ＰＲＯ１４７８アミノ酸配列（Ｆｉｇ１２
、配列番号：１７）のアミノ酸位置約２９からアミノ酸位置約４９まで伸びると
仮に同定されている。よって、ここでは、アミノ酸１−２８を持っているか持っ
ていないアミノ酸５０−３２７を含むペプチド、並びにこのようなペプチドをコ
ードする核酸を特に具体化する。

【００６０】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１２(配列番号：１７)の残基１から約
３２７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分子
に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４７８ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４７８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４７８ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１２(配列番号：１７)の残基１か
ら約３２７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２(配列番号：１７)のアミノ酸残基１から
約３２７の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んで
なる、単離されたＰＲＯ１４７８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２(配列番号：１７)の残基１から約３
２７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１４７８ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２(配列番号：１７)のアミノ酸残基１
から約３２７の配列、又は抗−ＰＲＯ１４７８抗体に対する結合部位を提供する
のに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４７８ポリペプチドに関
する。好ましくは、ＰＲＯ１４７８断片は、天然ＰＲＯ１４７８ポリペプチドの
質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
２(配列番号：１７)のアミノ酸残基約１から約３２７の配列を有するＰＲＯ１４
７８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子を
含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ）
細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提供
する。

【００６１】 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４７８ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗−ＰＲＯ１４７８抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４７８ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４７８ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４７８ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。 ７． ＰＲＯ８３１ 本出願において「ＰＲＯ８３１」と命名された新規な分泌ポリペプチドをコー
ドするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５６８６２−１３４３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ８３１ポリペプチドをコードするＤＮＡを含
んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１４(配列番号：２２)のアミノ
酸残基約１又は約１６から約７３の配列を有するＰＲＯ８３１ポリペプチドをコ
ードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくと
も約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好
ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％
の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３(配列番号：２１)のヌクレオチド約４０
又は約８５から約２５８の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲ
Ｏ８３１ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、
ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７４のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５６８６２−１３４３)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７４のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５６８６２−１３４３）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。

【００６２】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１４(配列番号：２２)のアミ
ノ酸残基１又は約１６から約７３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離
された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１４(配列番
号：２２)のアミノ酸残基１又は約１６から約７３の配列を有するＰＲＯ８３１
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約４７０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関
する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ８３１ポリペプチドをコードするＤＮＡを含
む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１４(配列番号：２２)のアミノ酸位置約１
からアミノ酸位置約１５まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１４(配列番号：２２)の残基１又は約
１６から約７３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された
核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ８３１ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約２
０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、よ
り好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約４
０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１３（配列番号：２１）に示すヌクレオチド配
列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ８３１ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ８３１ポリペプチドを提
供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１４(配列番号：２２)の残基１又は
約１６から約７３を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【００６３】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４(配列番号：２２)のアミノ酸残基１又は
約１６から約７３の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましく
は少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列
同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ８３１ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４(配列番号：２２)の残基１又は約１
６から約７３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ８３１ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４(配列番号：２２)のアミノ酸残基１
又は約１６から約７３の配列、又は抗−ＰＲＯ８３１抗体に対する結合部位を提
供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ８３１ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ８３１断片は、天然ＰＲＯ８３１ポリペプチドの
質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
４(配列番号：２２)のアミノ酸残基約１又は約１６から約７３の配列を有するＰ
ＲＯ８３１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 ８． ＰＲＯ１１１３ ロイシンリッチ反復タンパク質と配列同一性を有し、本出願において「ＰＲＯ
１１１３」と命名された新規なポリペプチドをコードする、ｃＤＮＡクローン（
ＤＮＡ５７２５４−１４７７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１１１３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１６(配列番号：２４)のアミノ
酸残基約１から約６１６の配列を有するＰＲＯ１１１３ポリペプチドをコードす
るＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約８
０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましく
は少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列
同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【００６４】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５(配列番号：２３)の残基約２１４から約
２０６１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１１１３ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５７２５４−１４７７)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８９のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５７２５４−１４７７)にコードされるのと同じ成熟ポリ
ペプチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１６(配列番号：２４)のアミ
ノ酸残基約１から約６１６の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ましく
は少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列
同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核酸分
子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１６(配列番
号：２４)のアミノ酸残基約１から約６１６の配列を有するＰＲＯ１１１３ポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、緊
縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製造
された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌクレ
オチドを有する単離された核酸分子に関する。 特定の態様では、本発明は、ＰＲＯ１１１３ポリペプチドをコードするＤＮＡ
を含む単離された核酸分子を、その可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体として提供するか、又はそのようなコード化核酸分子に相
補的である。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１１１３アミノ酸配列（Ｆｉｇ１６、配
列番号：２４）のアミノ酸位置約１３からアミノ酸位置約４０まで伸びると仮に
同定されている。しかして、ここにまた提供されるものは、配列番号：２４のア
ミノ酸４１−６１６と、場合によっては１−１２を含むペプチド、及びこれをコ
ードする核酸である。

【００６５】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１６(配列番号：２４)の残基１から約
６１６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分子
に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１１１３ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１１１３ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１１１３ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１６(配列番号：２４)の残基１か
ら６１６を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６(配列番号：２４)のアミノ酸残基１から
約６１６の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んで
なる、単離されたＰＲＯ１１１３ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６(配列番号：２４)の残基１から約６
１６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１１１３ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６(配列番号：２４)のアミノ酸残
基１から約６１６の配列、又は抗−ＰＲＯ１１１３抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１１１３ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１１１３断片は、天然ＰＲＯ１１１３ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
６(配列番号：２４)のアミノ酸残基約１から約６１６の配列を有するＰＲＯ１１
１３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子を
含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ）
細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提供
する。

【００６６】 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１１１３ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１１１３抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１１１３ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１１１３ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１１１３ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。 ９． ＰＲＯ１１９４ 本出願において「ＰＲＯ１１９４」と命名された新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５７８４１−１５２２）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１１９４ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１８(配列番号：２９)のアミノ
酸残基１又は約２２から約８１の配列を有するＰＲＯ１１９４ポリペプチドをコ
ードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくと
も約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好
ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％
の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７(配列番号：２８)の残基約７２から約２
５１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１１９４ポリペプ
チドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド形成
は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５７８４１−１５２２)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５８のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５７８４１−１５２２）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。

【００６７】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１８(配列番号：２９)のアミ
ノ酸残基約２２から約８１の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ましく
は少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列
同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された
核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１８(配列番
号：２９)のアミノ酸残基約２２から約８１の配列を有するＰＲＯ１１９４ポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、緊
縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製造
された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌクレ
オチドを有する単離された核酸分子に関する。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１８(配列番号：２９)の残基２２から
約８１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分子
に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１１９４ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１１９４ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１１９４ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１８(配列番号：２９)の残基２２
から約８１を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８(配列番号：２９)のアミノ酸残基２２か
ら約８１の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んで
なる、単離されたＰＲＯ１１９４ポリペプチドに関する。

【００６８】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８(配列番号：２９)の残基２２から約
８１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１１９４ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８(配列番号：２９)のアミノ酸残基２
２から約８１の配列、又は抗−ＰＲＯ１１９４抗体に対する結合部位を提供する
のに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１１９４ポリペプチドに関
する。好ましくは、ＰＲＯ１１９４断片は、天然ＰＲＯ１１９４ポリペプチドの
質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
８(配列番号：２９)のアミノ酸残基約２２から約８１の配列を有するＰＲＯ１１
９４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子を
含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ）
細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提供
する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１１９４ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗−ＰＲＯ１１９４抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１１９４ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１１９４ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１１９４ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。 １０． ＰＲＯ１１１０ 本出願において「ＰＲＯ１１１０」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する骨髄球性アップレギュレーションタンパク質をコードする核酸に対して相同
性を有する、ｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５８７２７−１４７４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１１１０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２０(配列番号：３１)のアミノ
酸残基約１から約３２２の配列を有するＰＲＯ１１１０ポリペプチドをコードす
るＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約８
０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましく
は少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列
同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【００６９】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９(配列番号：３０)のヌクレオチド約１３
１から約１０９６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１１
１０ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイ
ブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５８７２７−１４７４)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７１のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５８７２７−１４７４）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２０(配列番号：３１)のアミ
ノ酸残基１から約３２２の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは
少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同
一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２０(配列番
号：３１)のアミノ酸残基１から約３２２の配列を有するＰＲＯ１１１０ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、緊縮
性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製造さ
れた、少なくとも１０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、開始メチオニンを持っているか持っていないＰＲ
Ｏ１１１０ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子、及びそ
の可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は不活性化された変異体を提供し、
あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。膜貫通ドメインは、ＰＲ
Ｏ１１１０アミノ酸配列（Ｆｉｇ２０、配列番号：３１）のアミノ酸位置約４１
からアミノ酸位置約６０、アミノ酸位置約６６からアミノ酸位置約８５、アミノ
酸位置約１０１からアミノ酸位置約１２０、アミノ酸位置約１３７からアミノ酸
位置約１５３、アミノ酸位置約１７１からアミノ酸位置約１９２、アミノ酸位置
約２０５からアミノ酸位置約２２６、アミノ酸位置約２３５からアミノ酸位置約
２５５、及びアミノ酸位置約２９４からアミノ酸位置約３１２まで伸びると仮に
同定されている。

【００７０】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２０(配列番号：３１)の残基１から約
３２２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分子
に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１１１０ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１９（配列番号：３０）に示すヌクレオチド
配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１１１０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１１１０ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ２０(配列番号：３１)の残基１か
ら約３２２を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０(配列番号：３１)のアミノ酸残基１から
約３２２の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んで
なる、単離されたＰＲＯ１１１０ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０(配列番号：３１)の残基１から約３
２２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１１１０ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０(配列番号：３１)のアミノ酸残基１
から約３２２の配列、又は抗−ＰＲＯ１１１０抗体に対する結合部位を提供する
のに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１１１０ポリペプチドに関
する。好ましくは、ＰＲＯ１１１０断片は、天然ＰＲＯ１１１０ポリペプチドの
質的な生物学的活性を保持している。

【００７１】 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
０(配列番号：３１)のアミノ酸残基約１から約３２２の配列を有するＰＲＯ１１
１０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子を
含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ）
細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提供
する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１１１０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗−ＰＲＯ１１１０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１１１０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１１１０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１１１０ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 １１． ＰＲＯ１３７８ 本出願において「ＰＲＯ１３７８」と命名された新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５８７３０−１６０７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３７８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２２(配列番号：３３)のアミノ
酸残基１又は約１６から約３３５の配列を有するＰＲＯ１３７８ポリペプチドを
コードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なく
とも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より
好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５
％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１(配列番号：３２)の残基約１３６５から
約２３６９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３７８ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５８７３０−１６０７)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２１のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５８７３０−１６０７）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。

【００７２】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２２(配列番号：３３)のアミ
ノ酸残基１又は約１６から約３３５の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、
好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０
％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離され
た核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２２(配列番
号：３３)のアミノ酸残基約１６から約３３５の配列を有するＰＲＯ１３７８ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも約２０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約５０ヌクレ
オチド、より好ましくは約１００ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関
する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列を持っているか持っていな
いＰＲＯ１３７８ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子を
提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグナルペプチ
ドは、Ｆｉｇ２２(配列番号：３３)のアミノ酸位置１からアミノ酸位置約１５ま
で伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２２(配列番号：３３)の残基１６から
約３３５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分
子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３７８ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。

【００７３】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３７８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３７８ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ２２(配列番号：３３)の残基１６
から３３５を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２(配列番号：３３)のアミノ酸残基１６か
ら約３３５の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯ１３７８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２(配列番号：３３)の残基１６から３
３５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１３７８ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２(配列番号：３３)のアミノ酸残
基１６から約３３５の配列、又は抗-ＰＲＯ１３７８抗体に対する結合部位を提
供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３７８ポリペプチ
ドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１３７８断片は、天然ＰＲＯ１３７８ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
２(配列番号：３３)のアミノ酸残基約１６から約３３５の配列を有するＰＲＯ１
３７８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。 １２． ＰＲＯ１４８１ 本出願において「ＰＲＯ１４８１」と命名された新規なポリペプチドをコード
するｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５８７３２−１６５０）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４８１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。

【００７４】 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２４(配列番号：４１)のアミノ
酸残基１又は約２４から約３３４の配列を有するＰＲＯ１４８１ポリペプチドを
コードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なく
とも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より
好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５
％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３(配列番号：４０)の残基約８８から約１
３２１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４８１ポリペ
プチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド形
成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２９０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５８７３２−１６５０)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２９０のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５８７３２−１６５０)にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含んでなる。 またさらなる態様では、本発明は（ａ）Ｆｉｇ２４(配列番号：４１)のアミノ
酸残基約２４から約３３４の配列に対して少なくとも８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離さ
れた核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２４(配列番
号：４１)のアミノ酸残基約２４から約３３４の配列を有するＰＲＯ１４８１ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌク
レオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４８１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失、切
端又は不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に
相補的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ２４（配列番号：４１）の配列にお
いてアミノ酸位置１からアミノ酸位置約２３まで伸びると仮に同定されている。
膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１４８１アミノ酸配列（Ｆｉｇ２４、配列番号：４１
）のアミノ酸位置約２３５からアミノ酸位置約２６２まで伸びると仮に同定され
ている。

【００７５】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４(配列番号：４１)の残基２４から約３３
４のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましくは
少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティブ
、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチドをコー
ドするＤＮＡをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４８１ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４８１ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４８１ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ２４(配列番号：４１)の残基２４
から３３４を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４(配列番号：４１)のアミノ酸残基２４か
ら約３３４の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯ１４８１ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４(配列番号：４１)の残基２４から３
３４のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１４８１ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４(配列番号：４１)のアミノ酸残基２
４から約３３４の配列、又は抗−ＰＲＯ１４８１抗体に対する結合部位を提供す
るのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８１ポリペプチドに
関する。好ましくは、１４８１断片は、天然ＰＲＯ１４８１ポリペプチドの質的
な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
４(配列番号：４１)のアミノ酸残基約２４から約３３４の配列を有するＰＲＯ１
４８１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。

【００７６】 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４８１ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４８１抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４８１ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４８１ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４８１ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 １３． ＰＲＯ１１８９ 本出願において「ＰＲＯ１１８９」と命名され、Ｅ２５と相同性を有する新規
なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５８８２８−１５１９）
が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１１８９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２６(配列番号：４３)のアミノ
酸残基約１から約２６３の配列を有するＰＲＯ１１８９ポリペプチドをコードす
るＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約８
０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましく
は少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列
同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２５(配列番号：４２)の残基約７９から約８
６７の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１１８９ポリペプ
チドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド形成
は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５８８２８−１５１９)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７２のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５８８２８−１５１９）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。

【００７７】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２６(配列番号：４３)のアミ
ノ酸残基約１から約２６３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ましく
は少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列
同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる単離さ
れた核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２６(配列番
号：４３)のアミノ酸残基約１から約２６３の配列を有するＰＲＯ１１８９ポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、緊
縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製造
された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌクレ
オチドを有する単離された核酸分子に関する。 特定の態様では、その膜貫通ドメインが欠失又は不活性化したＰＲＯ１１８９
ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子を提供し、あるいは
そのようなコード化核酸分子に相補的である。膜貫通ドメインははＰＲＯ１１８
９アミノ酸配列（Ｆｉｇ２６、配列番号：４３)のアミノ酸位置約５３からアミ
ノ酸位置約７５まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２６(配列番号：４３)の残基１から約
２６３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分子
に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１１８９ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１１８９ポリペプチドを提供する。

【００７８】 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１１８９ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ２６(配列番号：４３)の残基１か
ら約２６３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２６(配列番号：４３)のアミノ酸残基１から
約２６３の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んで
なる、単離されたＰＲＯ１１８９ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２６(配列番号：４３)の残基１から約２
６３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１１８９ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２６(配列番号：４３)のアミノ酸残
基１から約２６３の配列、又は抗-ＰＲＯ１１８９抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１１８９ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１１８９断片は、天然ＰＲＯ１１８９ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
６(配列番号：４３)のアミノ酸残基約１から約２６３の配列を有するＰＲＯ１１
８９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子を
含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ）
細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提供
する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１１８９ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１１８９抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１１８９ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１１８９ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１１８９ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。

【００７９】 １４． ＰＲＯ１４１５ 本出願において「ＰＲＯ１４１５」と命名された新規なポリペプチドをコード
するｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５８８５２−１６３７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４１５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２８(配列番号：５０)のアミノ
酸残基約１又約２６から約２８３の配列を有するＰＲＯ１４１５ポリペプチドを
コードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なく
とも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より
好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５
％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２７(配列番号：４９)のヌクレオチド約１４
８又は約２２３から約９９６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含む
ＰＲＯ１４１５ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好まし
くは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５８８５２−１６３７)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７１のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５８８５２−１６３７）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２８(配列番号：５０)のアミ
ノ酸残基１又は約２６から約２８３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、
好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０
％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでな
る単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２８(配列番
号：５０)のアミノ酸残基１又は約２６から約２８３の配列を有するＰＲＯ１４
１５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に
対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配
列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少
なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することに
より製造された、少なくとも１００ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に
関する。

【００８０】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４１５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ２８（配列番号：５０）の配列においてア
ミノ酸位置約１からアミノ酸位置約２５まで伸びると仮に同定されている。膜貫
通ドメインは、ＰＲＯ１４１５アミノ酸配列（Ｆｉｇ２８、配列番号：５０）の
アミノ酸位置約９４からアミノ酸位置約１１８まで伸びると仮に同定されている
。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２８(配列番号：５０)の残基１又は約
２６から約２８３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離され
た核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４１５ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ２７（配列番号：４９）に示すヌクレオチド
配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４１５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４１５ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ２８(配列番号：５０)の残基１又
は約２６から約２８３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２８(配列番号：５０)のアミノ酸残基１又は
約２６から約２８３の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配
列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４１５ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２８(配列番号：５０)の残基１又は約２
６から約２８３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４１５ポリペプチドに関する。

【００８１】 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２８(配列番号：５０)のアミノ酸残
基１又は約２６から約２８３の配列、又は抗-ＰＲＯ１４１５抗体に対する結合
部位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４１５ポ
リペプチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１４１５断片は、天然ＰＲＯ１４１５
ポリペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
８(配列番号：５０)のアミノ酸残基約１又は約２６から約２８３の配列を有する
ＰＲＯ１４１５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮ
Ａ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ
）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくと
も約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最
も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験Ｄ
ＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして
（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプ
チドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４１５ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４１５抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４１５ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４１５ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４１５ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 １５． ＰＲＯ１４１１ 本出願において「ＰＲＯ１４１１」と命名された新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５９２１２−１６２７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４１１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ３０(配列番号：５２)のアミノ
酸残基１又は約２２から約４４０の配列を有するＰＲＯ１４１１ポリペプチドを
コードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なく
とも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より
好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５
％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２９(配列番号：５１)の残基約２４７から約
１５０３の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４１１ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。

【００８２】 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５９２１２−１６２７)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４５のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５９２１２−１６２７）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ３０(配列番号：５２)のアミ
ノ酸残基約２２から約４４０の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核酸
分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ３０(配列番
号：５２)のアミノ酸残基約２２から約４４０の配列を有するＰＲＯ１４１１ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌク
レオチドを有する単離された核酸分子に関する。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ３０(配列番号：５２)の残基２２から
約４４０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分
子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４１１ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。

【００８３】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４１１ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４１１ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ３０(配列番号：５２)の残基２２
から４４０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３０(配列番号：５２)のアミノ酸残基２２か
ら約４４０の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯ１４１１ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ３０(配列番号：５２)の残基２２から４
４０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１４１１ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ３０(配列番号：５２)のアミノ酸残
基２２から約４４０の配列、又は抗-ＰＲＯ１４１１抗体に対する結合部位を提
供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４１１ポリペプチ
ドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１４１１断片は、天然ＰＲＯ１４１１ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ３
０(配列番号：５２)のアミノ酸残基約２２から約４４０の配列を有するＰＲＯ１
４１１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４１１ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４１１抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４１１ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４１１ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４１１ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。

【００８４】 １６． ＰＲＯ１２９５ 本出願において「ＰＲＯ１２９５」と命名された新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５９２１８−１５５９）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２９５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ３２(配列番号：５４)のアミノ
酸残基１又は約１９から約２８０の配列を有するＰＲＯ１２９５ポリペプチドを
コードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なく
とも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より
好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５
％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３１(配列番号：５３)の残基約２６１から約
１０４６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１２９５ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５９２１８−１５５９)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８７のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５９２１８−１５５９）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ３２(配列番号：５４)のアミ
ノ酸残基約１９から約２８０の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核酸
分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ３２(配列番
号：５４)のアミノ酸残基約１９から約２８０の配列を有するＰＲＯ１２９５ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌク
レオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【００８５】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ３２(配列番号：５４)の残基１９から
約２８０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分
子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２９５ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２９５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２９５ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ３２(配列番号：５４)の残基１９
から２８０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３２(配列番号：５４)のアミノ酸残基１９か
ら約２８０の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯ１２９５ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ３２(配列番号：５４)の残基１９から２
８０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１２９５ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ３２(配列番号：５４)のアミノ酸残
基１９から約２８０の配列、又は抗-ＰＲＯ１２９５抗体に対する結合部位を提
供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２９５ポリペプチ
ドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１２９５断片は、天然ＰＲＯ１２９５ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ３
２(配列番号：５４)のアミノ酸残基約１９から約２８０の配列を有するＰＲＯ１
２９５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。

【００８６】 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２９５ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２９５抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２９５ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２９５ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２９５ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 １７． ＰＲＯ１３５９ 本出願において「ＰＲＯ１３５９」ポリペプチドと命名され、シアリルトラン
スフェラーゼ（sialytransferases）と配列同一性を有する新規なポリペプチド
をコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５９２１９−１６１３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３５９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ３４(配列番号：５６)のアミノ
酸残基１又は約３２から約２９９の配列を有するＰＲＯ１３５９ポリペプチドを
コードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なく
とも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より
好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５
％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３３(配列番号：５５）の残基約２７７から
約１０８０の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３５９ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２０ヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５９２１９−１６１３)にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２０のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５９２１９−１６１３）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。

【００８７】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ３４(配列番号：５６)のアミ
ノ酸残基約３２から約２９９の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核酸
分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ３４(配列番
号：５６)のアミノ酸残基約３２から約２９９の配列を有するＰＲＯ１３５９ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌク
レオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特定の態様では、本発明は、ＰＲＯ１３５９ポリペプチドをコードするＤＮＡ
を含む単離された核酸分子を、その可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。膜貫通ドメイン（ＩＩ型）は、ＰＲＯ１３５９アミノ酸配列（Ｆｉｇ３
４、配列番号：５６）のアミノ酸位置約９からアミノ酸位置約３１まで伸びると
仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ３４(配列番号：５６)の残基３２から
約２９９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分
子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３５９ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。

【００８８】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３５９ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３５９ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ３４(配列番号：５６)の残基３２
から２９９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３４(配列番号：５６)のアミノ酸残基３２か
ら約２９９の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯ１３５９ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ３４(配列番号：５６)の残基３２から約
２９９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１３５９ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３４(配列番号：５６)のアミノ酸残基３
２から約２９９の配列、又は抗−ＰＲＯ１３５９抗体に対する結合部位を提供す
るのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３５９ポリペプチドに
関する。好ましくは、ＰＲＯ１３５９断片は、天然ＰＲＯ１３５９ポリペプチド
の質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ３
４(配列番号：５６)のアミノ酸残基約３２から約２９９の配列を有するＰＲＯ１
３５９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３５９ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３５９抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３５９ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３５９ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。

【００８９】 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３５９ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 １８． ＰＲＯ１１９０ ＣＤＯタンパク質と相同性を有し、本出願において「ＰＲＯ１１９０」と命名
された新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５９５８６−
１５２０）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１１９０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ３６(配列番号：５８)のアミノ
酸残基約１から約１１１５の配列を有するＰＲＯ１１９０ポリペプチドをコード
するＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約
８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好まし
くは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配
列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３５(配列番号：５８)の残基約３４０から約
３６８４の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１１９０ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５９５８６−１５２０)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８８のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５９５８６−１５２０）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ３６(配列番号：５８)のアミ
ノ酸残基約１から約１１１５の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離され
た核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ３６(配列番
号：５８)のアミノ酸残基約１から約１１１５の配列を有するＰＲＯ１１９０ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌク
レオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【００９０】 特別な態様では、本発明は、ＰＲＯ１１９０ポリペプチドをコードするＤＮＡ
を含む単離された核酸分子で、その膜貫通ドメインの一又は複数が欠失又は不活
性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的であ
る。膜貫通ドメインは、Ｆｉｇ３６（配列番号：５８）に示すＰＲＯ１１９０ア
ミノ酸配列においてアミノ酸位置約１６からアミノ酸位置約３０、及びアミノ酸
位置約８５４からアミノ酸位置約８７９まで伸びると仮に同定されている 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ３６(配列番号：５８)の残基１から約
１１１５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分
子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１１９０ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１１９０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１１９０ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ３６(配列番号：５８)の残基１か
ら１１１５を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３６(配列番号：５８)のアミノ酸残基１から
約１１１５の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯ１１９０ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ３６(配列番号：５８)の残基１から１１
１５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１１９０ポリペプチドに関する。

【００９１】 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３６(配列番号：５８)のアミノ酸残基１
から約１１１５の配列、又は抗−ＰＲＯ１１９０抗体に対する結合部位を提供す
るのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１１９０ポリペプチドに
関する。好ましくは、ＰＲＯ１１９０断片は、天然ＰＲＯ１１９０ポリペプチド
の質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ３
６(配列番号：５８)のアミノ酸残基約１から約１１１５の配列を有するＰＲＯ１
１９０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１１９０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１１９０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１１９０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１１９０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１１９０ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 １９． ＰＲＯ１７７２ 本出願において「ＰＲＯ１７７２」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、ペプチダーゼ酵素をコードする核酸と相同性を有する、ｃＤＮＡクローン（
ＤＮＡ５９８１７−１７０３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１７７２ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ３８(配列番号：６３)のアミノ
酸残基約１又は約３７から約４８７の配列を有するＰＲＯ１７７２ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【００９２】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３７(配列番号：６２)のヌクレオチド約９３
又は約２０１から約１５５３の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含む
ＰＲＯ１７７２ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好まし
くは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ５９８１７−１７０３)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７０のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５９８１７−１７０３）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ３８(配列番号：６３)のアミ
ノ酸残基１又は約３７から約４８７の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、
好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０
％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単
離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ３８(配列番
号：６３)のアミノ酸残基１又は約３７から約４８７の配列を有するＰＲＯ１７
７２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に
対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配
列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少
なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することに
より製造された、少なくとも４１５ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に
関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１７７２ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ３８（配列番号：６３）の配列においてア
ミノ酸位置約１からアミノ酸位置約３６まで伸びると仮に同定されている。膜貫
通ドメインは、ＰＲＯ１７７２アミノ酸配列（Ｆｉｇ３８、配列番号：６３）の
アミノ酸位置約３１３からアミノ酸位置約３３１まで伸びると仮に同定されてい
る。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ３８(配列番号：６３)の残基１又は約
３７から約４８７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離され
た核酸分子に関する。

【００９３】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１７７２ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ３７（配列番号：６２）に示すヌクレオチド
配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１７７２ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１７７２ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ３８(配列番号：６３)の残基１又
は約３７から約４８７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３８(配列番号：６３)のアミノ酸残基１又は
約３７から約４８７の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配
列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７７２ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ３８(配列番号：６３)の残基１又は約３
７から約４８７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７７２ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３８(配列番号：６３)のアミノ酸残基１
又は約３７から約４８７の配列、又は抗−ＰＲＯ１７７２抗体に対する結合部位
を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７７２ポリペ
プチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１７７２断片は、天然ＰＲＯ１７７２ポリ
ペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ３
８(配列番号：６３)のアミノ酸残基約１又は約３７から約４８７の配列を有する
ＰＲＯ１７７２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮ
Ａ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ
）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくと
も約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最
も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験Ｄ
ＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして
（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプ
チドを提供する。

【００９４】 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１７７２ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１７７２抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１７７２ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１７７２ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１７７２ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ２０． ＰＲＯ１２４８ 本出願において「ＰＲＯ１２４８」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、ＰＵＴ−２をコードする核酸と相同性を有する、ｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ
６０２７８−１５３０）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２４８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ４０(配列番号：６８)のアミノ
酸残基約１又は約２１から約１８３の配列を有するＰＲＯ１２４８ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ３９(配列番号：６７)のヌクレオチド約１２
２又は約１８２から約６７０の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含む
ＰＲＯ１２４８ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好まし
くは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６０２７８−１５３０)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７０のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６０２７８−１５３０）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。

【００９５】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４０(配列番号：６８)のアミ
ノ酸残基１又は約２１から約１８３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、
好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０
％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単
離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ４０(配列番
号：６８)のアミノ酸残基１又は約２１から約１８３の配列を有するＰＲＯ１２
４８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に
対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配
列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少
なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することに
より製造された、少なくとも１０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関
する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１２４８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ４０（配列番号：６８）の配列においてア
ミノ酸位置約１からアミノ酸位置約２０まで伸びると仮に同定されている。膜貫
通ドメインは、ＰＲＯ１２４８アミノ酸配列（Ｆｉｇ４０、配列番号：６８）の
アミノ酸位置約９０からアミノ酸位置約１１２まで伸びると仮に同定されている
。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４０(配列番号：６８)の残基１又は約
２１から約１８３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離され
た核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２４８ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ３９（配列番号：６７）に示すヌクレオチド
配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２４８ポリペプチドを提供する。

【００９６】 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２４８ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ４０(配列番号：６８)の残基１又
は約２１から約１８３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４０(配列番号：６８)のアミノ酸残基１又は
約２１から約１８３の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配
列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２４８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ４０(配列番号：６８)の残基１又は約２
１から約１８３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２４８ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４０(配列番号：６８)のアミノ酸残基１
又は約２１から約１８３の配列、又は抗−ＰＲＯ１２４８抗体に対する結合部位
を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２４８ポリペ
プチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１２４８断片は、天然ＰＲＯ１２４８ポリ
ペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ４
０(配列番号：６８)のアミノ酸残基約１又は約２１から約１８３の配列を有する
ＰＲＯ１２４８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮ
Ａ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ
）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくと
も約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最
も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験Ｄ
ＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして
（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプ
チドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２４８ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２４８抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２４８ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２４８ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２４８ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。

【００９７】 ２１． ＰＲＯ１３１６ 本出願において「ＰＲＯ１３１６」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、Dickkopfと相同性を有する、ｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６０６０８−１５７
７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３１６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ４２(配列番号：７０)のアミノ
酸残基１又は約２６から約２５９の配列を有するＰＲＯ１３１６ポリペプチドを
コードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なく
とも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より
好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５
％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４１(配列番号：６９)の残基約２８１から約
９８７の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３１６ポリペ
プチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド形
成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３１２６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６０６０８−１５７７)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１２６のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６０６０８−１５７７）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４２(配列番号：７０)のアミ
ノ酸残基約２６から約２５９の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離され
た核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４１（配列番号：６９）の残基１
−４５４又は残基１０９５−３１３０のいずれかにスパンする領域と同一性を有
するＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイ
ブリッド形成する、少なくとも１５ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に
関する。また、少なくとも１５ヌクレオチドを有する単離された核酸分子は、（
ａ）Ｆｉｇ４１（配列番号：６９）の残基１−４５４又は残基１０９５−３１３
０のいずれかにスパンする領域と同一性を有するＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）
のＤＮＡ分子の補体に対して少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する。

【００９８】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３１６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ４２（配列番号：７０）の配列においてア
ミノ酸位置１からアミノ酸位置約２５まで伸びると仮に同定されている。Ｎ−グ
ルコシル化部位は５２位に同定され、カビＺｎ（２）−Ｃｙｓ（６）二核クラス
ターは９９位に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４２(配列番号：７０)の残基２６から
約２５９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分
子に関する。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３１６ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３１６ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ４２(配列番号：７０)の残基２６
から２５９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４２(配列番号：７０)のアミノ酸残基２６か
ら約２５９の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯ１３１６ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ４２(配列番号：７０)の残基２６から２
５９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１３１６ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４２(配列番号：７０)のアミノ酸残基２
６から約２５９の配列、又は抗−ＰＲＯ１３１６抗体に対する結合部位を提供す
るのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３１６ポリペプチドに
関する。好ましくは、ＰＲＯ１３１６断片は、天然ＰＲＯ１３１６ポリペプチド
の質的な生物学的活性を保持している。

【００９９】 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ４
２(配列番号：７０)のアミノ酸残基約２６から約２５９の配列を有するＰＲＯ１
３１６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３１６ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３１６抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３１６ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３１６ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３１６ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ２２． ＰＲＯ１１９７ 本出願において「ＰＲＯ１１９７」と命名された新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６０６１１−１５２４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１１９７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ４４(配列番号：７２)のアミノ
酸残基１又は約２５から約３６３の配列を有するＰＲＯ１１９７ポリペプチドを
コードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なく
とも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より
好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５
％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４３(配列番号：７１)の残基約３８３から約
１３９９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１１９７ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６０６１１−１５２４)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７５のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６０６１１−１５２４）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。

【０１００】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４４(配列番号：７２)のアミ
ノ酸残基約２５から約３６３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離され
た核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ４４(配列番
号：７２)のアミノ酸残基約２５から約３６３の配列を有するＰＲＯ１１９７ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌク
レオチドを有する単離された核酸分子に関する。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４４(配列番号：７２)の残基約２５か
ら約３６３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１１９７ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１１９７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１１９７ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ４４(配列番号：７２)の残基約２
５から約３６３を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０１０１】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４４(配列番号：７２)のアミノ酸残基２５か
ら約３６３の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯ１１９７ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ４４(配列番号：７２)の残基２５から３
６３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１１９７ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４４(配列番号：７２)のアミノ酸残基２
５から約３６３の配列、又は抗-ＰＲＯ１１９７抗体に対する結合部位を提供す
るのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１１９７ポリペプチドに
関する。好ましくは、ＰＲＯ１１９７断片は、天然ＰＲＯ１１９７ポリペプチド
の質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ４
４(配列番号：７２)のアミノ酸残基約２５から約３６３の配列を有するＰＲＯ１
１９７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１１９７ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１１９７抗体である。 ２３． ＰＲＯ１２９３ 本出願において「ＰＲＯ１２９３」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、免疫グロブリン重鎖可変領域タンパク質をコードする核酸と相同性を有する
、ｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６０６１８−１５５７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２９３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ４６(配列番号：７７)のアミノ
酸残基約１又は約２０から約３４１の配列を有するＰＲＯ１２９３ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【０１０２】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４５(配列番号：７６)のヌクレオチド約３７
又は約９４から約１０５９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰ
ＲＯ１２９３ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましく
は、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２９２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６０６１８−１５５７)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２９２のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６０６１８−１５５７）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４６(配列番号：７７)のアミ
ノ酸残基１又は約２０から約３４１の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、
好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０
％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単
離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ４６(配列番
号：７７)のアミノ酸残基１又は約２０から約３４１の配列を有するＰＲＯ１２
９３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に
対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配
列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少
なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することに
より製造された、少なくとも１００ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に
関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１２９３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ４６（配列番号：７７）の配列においてア
ミノ酸位置約１からアミノ酸位置約１９まで伸びると仮に同定されている。膜貫
通ドメインは、ＰＲＯ１２９３アミノ酸配列（Ｆｉｇ４６、配列番号：７７）の
アミノ酸位置約２３７からアミノ酸位置約２６２まで伸びると仮に同定されてい
る。

【０１０３】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４６(配列番号：７７)の残基１又は約
２０から約３４１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離され
た核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２９３ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ４５（配列番号：７６）に示すヌクレオチド
配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２９３ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２９３ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ４６(配列番号：７７)の残基１又
は約２０から約３４１を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４６(配列番号：７７)のアミノ酸残基１又は
約２０から約３４１の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配
列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２９３ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ４６(配列番号：７７)の残基１又は約２
０から約３４１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２９３ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４６(配列番号：７７)のアミノ酸残基１
又は約２０から約３４１の配列、又は抗−ＰＲＯ１２９３抗体に対する結合部位
を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２９３ポリペ
プチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１２９３断片は、天然ＰＲＯ１２９３ポリ
ペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ４
６(配列番号：７７)のアミノ酸残基約１又は約２０から約３４１の配列を有する
ＰＲＯ１２９３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮ
Ａ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ
）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくと
も約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最
も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験Ｄ
ＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして
（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプ
チドを提供する。

【０１０４】 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２９３ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２９３抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２９３ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２９３ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２９３ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ２４． ＰＲＯ１３８０ 本出願において「ＰＲＯ１３８０」と命名され、新規なマルチ−スパン膜貫通
ポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６０７４０−１６１５）が
同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３８０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ４８(配列番号：７９)のアミノ
酸残基約１から約４７０の配列を有するＰＲＯ１３８０ポリペプチドをコードす
るＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約８
０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましく
は少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列
同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４７(配列番号：７８)の残基約３６から約１
４６０の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３８０ポリペ
プチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド形
成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６０７４０−１６１５)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５６のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６０７４０−１６１５）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。

【０１０５】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４８(配列番号：７９)のアミ
ノ酸残基約１から約４７０の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ましく
は少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列
同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核酸分
子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ４８(配列番
号：７９)のアミノ酸残基約１から約４７０の配列を有するＰＲＯ１３８０ポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、緊
縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製造
された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌクレ
オチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、ＰＲＯ１３８０ポリペプチドをコードするＤＮＡ
を含む単離された核酸分子、及びその可溶性変異体（すなわち一又は複数の膜貫
通ドメインが欠失又は不活性化したもの）を提供し、あるいはそのようなコード
化核酸分子に相補的である。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１３８０アミノ酸配列（
Ｆｉｇ４８、配列番号：７９）の次のアミノ酸位置約：５０−７４、１０５−１
２７、１３５−１５３、１６３−１８３、２２８−２５２、３０５−３３０、及
び４４８−４７２にあると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ４８(配列番号：７９)の残基１から約
４７０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分子
に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３８０ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３８０ポリペプチドを提供する。

【０１０６】 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３８０ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ４８(配列番号：７９)の残基１か
ら４７０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４８(配列番号：７９)のアミノ酸残基１から
約４７０の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んで
なる、単離されたＰＲＯ１３８０ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ４８(配列番号：７９)の残基１から４７
０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましくは
少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティブ
、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯ１３８０ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４８(配列番号：７９)のアミノ酸残基１
から約４７０の配列、又は抗−ＰＲＯ１３８０抗体に対する結合部位を提供する
のに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３８０ポリペプチドに関
する。好ましくは、ＰＲＯ１３８０断片は、天然ＰＲＯ１３８０ポリペプチドの
質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ４
８(配列番号：７９)のアミノ酸残基約１から約４７０の配列を有するＰＲＯ１３
８０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子を
含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ）
細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提供
する。 ２５． ＰＲＯ１２６５ 本出願において「ＰＲＯ１２６５」と命名され、Ｆｉｇ１のポリペプチドと相
同性を有する新規なポリペプチドをコードする、ｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６０
７６４−１５３３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２６５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ５０(配列番号：８４)のアミノ
酸残基１又は約２２から約５６７の配列を有するＰＲＯ１２６５ポリペプチドを
コードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なく
とも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より
好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５
％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【０１０７】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ４９(配列番号：８３)の残基約１４２から約
１７７９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１２６５ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６０７６４−１５３３)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５２のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６０７６４−１５３３）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ５０(配列番号：８４)のアミ
ノ酸残基約２２から約５６７の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核酸
分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ５０(配列番
号：８４)のアミノ酸残基約２２から約５６７の配列を有するＰＲＯ１２６５ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは約１００ヌクレオチドを
有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１２６５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ５０（配列番号：８４）の配列において
アミノ酸位置１からアミノ酸位置約２１まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ５０(配列番号：８４)の残基２２から
約５６７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分
子に関する。

【０１０８】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２６５ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２６５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２６５ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ５０(配列番号：８４)の残基１又
は約２２から５６７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５０(配列番号：８４)のアミノ酸残基２２か
ら約５６７の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯ１２６５ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ５０(配列番号：８４)の残基２２から５
６７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１２６５ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５０(配列番号：８４)のアミノ酸残基２
２から約５６７の配列、又は抗−ＰＲＯ１２６５抗体に対する結合部位を提供す
るのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２６５ポリペプチドに
関する。好ましくは、ＰＲＯ１２６５断片は、天然ＰＲＯ１２６５ポリペプチド
の質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ５
０(配列番号：８４)のアミノ酸残基約２２から約５６７の配列を有するＰＲＯ１
２６５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。

【０１０９】 ２６． ＰＲＯ１２５０ 本出願において「ＰＲＯ１２５０」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、長鎖の脂肪酸ＣｏＡリガーゼをコードする核酸と相同性を有する、ｃＤＮＡ
クローン（ＤＮＡ６０７７５−１５３２）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２５０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ５２(配列番号：８６)のアミノ
酸残基約１から約７３９の配列を有するＰＲＯ１２５０ポリペプチドをコードす
るＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約８
０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましく
は少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列
同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５１(配列番号：８５)のヌクレオチド約７４
から約２２９０の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１２５
０ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６０７７５−１５３２)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７３のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６０７７５−１５３２）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ５２(配列番号：８６)のアミ
ノ酸残基１から約７３９の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは
少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同
一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ５２(配列番
号：８６)のアミノ酸残基１から約７３９の配列を有するＰＲＯ１２５０ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、緊縮
性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製造さ
れた、少なくとも１０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０１１０】 特別な態様では、本発明は、開始メチオニンを持っているか持っていないＰＲ
Ｏ１２５０ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子、及びそ
の可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は不活性化された変異体を提供し、
あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。ＩＩ型膜貫通ドメインは
、ＰＲＯ１２５０アミノ酸配列（Ｆｉｇ５２、配列番号：８６）のアミノ酸位置
約６１からアミノ酸位置約８０まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ５２(配列番号：８６)の残基１から約
７３９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分子
に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２５０ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ５１（配列番号：８５）に示すヌクレオチド
配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２５０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２５０ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ５２(配列番号：８６)の残基１か
ら約７３９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５２(配列番号：８６)のアミノ酸残基１から
約７３９の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んで
なる、単離されたＰＲＯ１２５０ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ５２(配列番号：８６)の残基１から約７
３９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１２５０ポリペプチドに関する。

【０１１１】 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５２(配列番号：８６)のアミノ酸残基１
から約７３９の配列、又は抗−ＰＲＯ１２５０抗体に対する結合部位を提供する
のに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２５０ポリペプチドに関
する。好ましくは、ＰＲＯ１２５０断片は、天然ＰＲＯ１２５０ポリペプチドの
質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ５
２(配列番号：８６)のアミノ酸残基約１から約７３９の配列を有するＰＲＯ１２
５０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子を
含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ）
細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提供
する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２５０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２５０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２５０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２５０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２５０ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ２７． ＰＲＯ１４７５ 本出願において「ＰＲＯ１４７５」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、Ｎ−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼをコードする核酸と相同性
を有する、ｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６１１８５−１６４６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４７５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ５４(配列番号：８８)のアミノ
酸残基約１から約６６０の配列を有するＰＲＯ１４７５ポリペプチドをコードす
るＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約８
０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましく
は少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列
同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【０１１２】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５３(配列番号：８７)のヌクレオチド約１３
０から約２１０９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４
７５ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイ
ブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６４のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６１１８５−１６４６)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６４のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６１１８５−１６４６）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ５４(配列番号：８８)のアミ
ノ酸残基１から約６６０の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは
少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同
一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ５４(配列番
号：８８)のアミノ酸残基１から約６６０の配列を有するＰＲＯ１４７５ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、緊縮
性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製造さ
れた、少なくとも１８０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、開始メチオニンを持っているか持っていないＰＲ
Ｏ１４７５ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子、及びそ
の可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は不活性化された変異体を提供し、
あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。膜貫通ドメインは、ＰＲ
Ｏ１４７５アミノ酸配列（Ｆｉｇ５４、配列番号：８８）のアミノ酸位置約３８
からアミノ酸位置約５５まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ５４(配列番号：８８)の残基１から約
６６０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチドを
コードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分子
に関する。

【０１１３】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４７５ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ５３（配列番号：８７）に示すヌクレオチド
配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４７５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４７５ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ５４(配列番号：８８)の残基１か
ら約６６０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５４(配列番号：８８)のアミノ酸残基１から
約６６０の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んで
なる、単離されたＰＲＯ１４７５ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ５４(配列番号：８８)の残基１から約６
６０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１４７５ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５４(配列番号：８８)のアミノ酸残基１
から約６６０の配列、又は抗−ＰＲＯ１４７５抗体に対する結合部位を提供する
のに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４７５ポリペプチドに関
する。好ましくは、ＰＲＯ１４７５断片は、天然ＰＲＯ１４７５ポリペプチドの
質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ５
４(配列番号：８８)のアミノ酸残基約１から約６６０の配列を有するＰＲＯ１４
７５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子を
含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ）
細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提供
する。

【０１１４】 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４７５ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４７５抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４７５ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４７５ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４７５ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ２８． ＰＲＯ１３７７ 本出願において「ＰＲＯ１３７７」と命名され、新規なマルチ−スパン膜貫通
ポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６１６０８−１６０６）が
同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３７７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ５６(配列番号：９５)のアミノ
酸残基約１又は約１９から約３０７の配列を有するＰＲＯ１３７７ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５５(配列番号：９４)の残基約２０３から約
１０６９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３７７ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６１６０８−１６０６)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３９のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６１６０８−１６０６）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ５６(配列番号：９５)のアミ
ノ酸残基約１９から約３０７の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核酸
分子に関する。

【０１１５】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ５６(配列番
号：９５)のアミノ酸残基約１９から約３０７の配列を有するＰＲＯ１３７７ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌク
レオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っておらず、その膜貫通ドメインの一又は複数が欠失又は不活
性化された、ＰＲＯ１３７７ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ５６（配列番号：９５）の配列においてアミノ酸位置１
からアミノ酸位置約１８まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、
ＰＲＯ１３７７アミノ酸配列（Ｆｉｇ５６、配列番号：９５）のアミノ酸位置約
３７−５６、１０６−１２２、２１１−２０、２４０−２６０、及び２８８−３
０４まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ５６(配列番号：９５)の残基１９から
約３０７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分
子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３７７ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３７７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３７７ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ５６(配列番号：９５)の残基１９
から３０７を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０１１６】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５６(配列番号：９５)のアミノ酸残基１９か
ら約３０７の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯ１３７７ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ５６(配列番号：９５)の残基１９から３
０７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１３７７ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５６(配列番号：９５)のアミノ酸残基１
９から約３０７の配列、又は抗−ＰＲＯ１３７７抗体に対する結合部位を提供す
るのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３７７ポリペプチドに
関する。好ましくは、ＰＲＯ１３７７断片は、天然ＰＲＯ１３７７ポリペプチド
の質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ５
６(配列番号：９５)のアミノ酸残基約１９から約３０７の配列を有するＰＲＯ１
３７７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。 ２９． ＰＲＯ１３２６ 本出願において「ＰＲＯ１３２６」と命名された新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６２８０８−１５２８）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３２６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ５８(配列番号：１００)のアミ
ノ酸残基１又は約３０から約４０１の配列を有するＰＲＯ１３２６ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【０１１７】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５７(配列番号：９９)の残基約１９９から約
１３１４の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３２６ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６２８０８−１５８２)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５８のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６２８０８−１５８２）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ５８(配列番号：１００)のア
ミノ酸残基約３０から約４０１の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ５８(配列番
号：１００)のアミノ酸残基約３０から約４０１の配列を有するＰＲＯ１３２６
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３２６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ５８(配列番号：１００)のアミノ酸位置
１からアミノ酸位置約２９まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ５８(配列番号：１００)の残基３０か
ら約４０１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。

【０１１８】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３２６ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３２６ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３２６ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ５８(配列番号：１００)の残基３
０から４０１を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５８(配列番号：１００)のアミノ酸残基３０
から約４０１の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１３２６ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ５８(配列番号：１００)の残基３０から
４０１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２６ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ５８(配列番号：１００)のアミノ酸
残基３０から約４０１の配列、又は抗-ＰＲＯ１３２６抗体に対する結合部位を
提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２６ポリペプ
チドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１３２６断片は、天然ＰＲＯ１３２６ポリペ
プチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ５
８(配列番号：１００)のアミノ酸残基約３０から約４０１の配列を有するＰＲＯ
１３２６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。

【０１１９】 ３０． ＰＲＯ１２４９ 本出願において「ＰＲＯ１２４９」と命名する新規な膜貫通ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６２８０９−１５３１）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２４９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ６０(配列番号：１０２)のアミ
ノ酸残基約１又は約１７から約１０８９の配列を有するＰＲＯ１２４９ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ５９(配列番号：１０１)のヌクレオチド約３
又は約５１から約３２６９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰ
ＲＯ１２４９ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましく
は、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６２８０９−１５３１)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３７のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６２８０９−１５３１)にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含んでなる。 またさらなる態様では、本発明は（ａ）Ｆｉｇ６０(配列番号：１０２)のアミ
ノ酸残基１又は約１７から約１０８９の配列に対して、少なくとも約８０％の配
列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なく
とも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を
有するポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含
んでなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ６０(配列番
号：１０２)のアミノ酸残基１又は約１７から約１０８９の配列を有するＰＲＯ
１２４９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも１０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子
に関する。

【０１２０】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１２４９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ６０（配列番号：１０２）のアミノ酸位置
約１からアミノ酸位置約１６まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメイン
は、ＰＲＯ１２４９アミノ酸配列（Ｆｉｇ６０、配列番号：１０２）のアミノ酸
位置約３１７からアミノ酸位置約３４１、アミノ酸位置約４５１からアミノ酸位
置約４７０、アミノ酸位置約４８１からアミノ酸位置約５００、アミノ酸位置約
５１０からアミノ酸位置約５２７、アミノ酸位置約５３８からアミノ酸位置約５
５５、アミノ酸位置約８３１からアミノ酸位置約８５０、アミノ酸位置約１０１
６からアミノ酸位置約１０３４、及びアミノ酸位置約１０５２からアミノ酸位置
約１０７０まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ６０(配列番号：１０２)の残基１又は
約１７から約１０８９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２４９ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ５９（配列番号：１０１）に示すヌクレオチ
ド配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２４９ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２４９ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ６０(配列番号：１０２)の残基１
又は約１７から約１０８９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ６０(配列番号：１０２)のアミノ酸残基１又
は約１７から約１０８９の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２４９ポリペプチドに関する。

【０１２１】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ６０(配列番号：１０２)の残基１又は約
１７から約１０８９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのア
ミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２４９ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ６０(配列番号：１０２)のアミノ酸
残基１又は約１７から約１０８９の配列、又は抗-ＰＲＯ１２４９抗体に対する
結合部位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２４
９ポリペプチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１２４９断片は、天然ＰＲＯ１２
４９ポリペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ６
０(配列番号：１０２)のアミノ酸残基約１又は約１７から約１０８９の配列を有
するＰＲＯ１２４９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。 提供する。 ３１． ＰＲＯ１３１５ 本出願において「ＰＲＯ１３１５」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、サイトカインレセプターファミリー−４タンパク質をコードする核酸と相同
性を有するｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６２８１５−１５７６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３１５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ６２(配列番号：１０４)のアミ
ノ酸残基約１又は約２９から約４４２の配列を有するＰＲＯ１３１５ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ６１(配列番号：１０３)のヌクレオチド約１
２１又は約２０５から約１４４６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを
含むＰＲＯ１３１５ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好
ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる
。

【０１２２】 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６２８１５−１５７６)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４７のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６２８１５−１５７６）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ６２(配列番号：１０４)のア
ミノ酸残基１又は約２９から約４４２の配列と少なくとも約８０％の配列同一性
、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９
０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポ
リペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ６２(配列番
号：１０４)のアミノ酸残基１又は約２９から約４４２の配列を有するＰＲＯ１
３１５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）
に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の
配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは
少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離すること
により製造された、少なくとも５００ヌクレオチドを有する単離された核酸分子
に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３１５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ６２（配列番号：１０４）の配列において
アミノ酸位置約１からアミノ酸位置約２８まで伸びると仮に同定されている。膜
貫通ドメインは、ＰＲＯ１３１５アミノ酸配列（Ｆｉｇ６２、配列番号：１０４
）のアミノ酸位置約１４０からアミノ酸位置約１６３まで伸びると仮に同定され
ている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ６２(配列番号：１０４)の残基１又は
約２９から約４４２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポ
リペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。

【０１２３】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３１５ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ６１（配列番号：１０３）に示すヌクレオチ
ド配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３１５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３１５ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ６２(配列番号：１０４)の残基１
又は約２９から約４４２を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ６２(配列番号：１０４)のアミノ酸残基１又
は約２９から約４４２の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３１５ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ６２(配列番号：１０４)の残基１又は約
２９から約４４２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３１５ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ６２(配列番号：１０４)のアミノ酸
残基１又は約２９から約４４２の配列、又は抗-ＰＲＯ１３１５抗体に対する結
合部位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３１５
ポリペプチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１３１５断片は、天然ＰＲＯ１３１
５ポリペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ６
２(配列番号：１０４)のアミノ酸残基約１又は約２９から約４４２の配列を有す
るＰＲＯ１３１５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３１５ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３１５抗体である。

【０１２４】 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３１５ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３１５ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３１５ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ３２． ＰＲＯ１５９９ 本出願において「ＰＲＯ１５９９」と命名され、ガランザイムＭと相同性を有
する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６２８４５−１
６８４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５９９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ６４(配列番号：１１１)のアミ
ノ酸残基約１又は約３１から約２８３の配列を有するＰＲＯ１５９９ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ６３(配列番号：１１０)の残基約１５９から
約９１７の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５９９ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３６１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６２８４５−１６８４)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３６１のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６２８４５−１６８４）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ６４(配列番号：１１１)のア
ミノ酸残基約３１から約２８３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。

【０１２５】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ６４(配列番
号：１１１)のアミノ酸残基約３１から約２８３の配列を有するＰＲＯ１５９９
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５９９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ６４（配列番号：１１１）の配列におい
てアミノ酸位置１からアミノ酸位置約３０まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ６４(配列番号：１１１)の残基３１か
ら約２８３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５９９ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５９９ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５９９ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ６４(配列番号：１１１)の残基３
１から２８３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ６４(配列番号：１１１)のアミノ酸残基３１
から約２８３の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１５９９ポリペプチドに関する。

【０１２６】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ６４(配列番号：１１１)の残基３１から
２８３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１５９９ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ６４(配列番号：１１１)のアミノ酸
残基３１から約２８３の配列、又は抗-ＰＲＯ１５９９抗体に対する結合部位を
提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５９９ポリペプ
チドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１５９９断片は、天然ＰＲＯ１５９９ポリペ
プチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ６
４(配列番号：１１１)のアミノ酸残基約３１から約２８３の配列を有するＰＲＯ
１５９９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５９９ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５９９抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５９９ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５９９ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５９９ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ３３． ＰＲＯ１４３０ 本出願において「ＰＲＯ１４３０」と命名され、レダクダーゼタンパク質と相
同性を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４８
４２−１６３２）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４３０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ６６(配列番号：１１６)のアミ
ノ酸残基約１又は約１８から約３３１の配列を有するＰＲＯ１４３０ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【０１２７】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ６５(配列番号：１１５)の残基約３３から約
１０７４の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４３０ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４８４２−１６３２)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７８のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４８４２−１６３２）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ６６(配列番号：１１６)のア
ミノ酸残基約１８から約３３１の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ６６(配列番
号：１１６)のアミノ酸残基約１８から約３３１の配列を有するＰＲＯ１４３０
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００を
有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列を持っているか持っていな
いＰＲＯ１４３０ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子を
提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグナルペプチ
ドは、Ｆｉｇ６６（配列番号：１１６）の配列においてアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約１７まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ６６(配列番号：１１６)の残基１８か
ら約３３１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。

【０１２８】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４３０ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４３０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４３０ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ６６(配列番号：１１６)の残基１
８から３３１を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ６６(配列番号：１１６)のアミノ酸残基１８
から約３３１の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１４３０ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ６６(配列番号：１１６)の残基１８から
約３３１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４３０ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ６６(配列番号：１１６)のアミノ酸
残基１８から約３３１の配列、又は抗-ＰＲＯ１４３０抗体に対する結合部位を
提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４３０ポリペプ
チドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１４３０断片は、天然ＰＲＯ１４３０ポリペ
プチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ６
６(配列番号：１１６)のアミノ酸残基約１８から約３３１の配列を有するＰＲＯ
１４３０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。

【０１２９】 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４３０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４３０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４３０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４３０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４３０ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ３４． ＰＲＯ１３７４ 本出願において「ＰＲＯ１３７４」と命名され、Ｐ４ＨＡと配列同一性を有す
る新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４８４９−１６
０４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３７４ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ６８(配列番号：１１８)のアミ
ノ酸残基１又は約２０から約５４４の配列を有するＰＲＯ１３７４ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ６７(配列番号：１１７)の残基約７８から約
１６５２の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３７４ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４８４９−１６０４)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６８のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４８４９−１６０４）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ６８(配列番号：１１８)のア
ミノ酸残基約２０から約５４４の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。

【０１３０】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ６８(配列番
号：１１８)のアミノ酸残基約２０から約５４４の配列を有するＰＲＯ１３７４
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ６８(配列番号：１１８)の残基２０か
ら約５４４のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３７４ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３７４ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３７４ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ６８(配列番号：１１８)の残基２
０から５４４を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ６８(配列番号：１１８)のアミノ酸残基２０
から約５４４の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１３７４ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ６８(配列番号：１１８)の残基２０から
５４４のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１３７４ポリペプチドに関する。

【０１３１】 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ６８(配列番号：１１８)のアミノ酸
残基２０から約５４４の配列、又は抗-ＰＲＯ１３７４抗体に対する結合部位を
提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３７４ポリペプ
チドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１３７４断片は、天然ＰＲＯ１３７４ポリペ
プチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ６
８(配列番号：１１８)のアミノ酸残基約２０から約５４４の配列を有するＰＲＯ
１３７４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３７４ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３７４抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３７４ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３７４ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３７４ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ３５． ＰＲＯ１３１１ 本出願において「ＰＲＯ１３１１」と命名され、新規なテトラスパンポリペプ
チドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４８６３−１５７３）が同定され
た。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３１１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ７０(配列番号：１２３)のアミ
ノ酸残基１又は約４５から約２９４の配列を有するＰＲＯ１３１１ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【０１３２】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ６９(配列番号：１２２)の残基約３２７から
約１０７６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３１１ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２５１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４８６３−１５７３)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２５１のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４８６３−１５７３）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ７０(配列番号：１２３)のア
ミノ酸残基約４５から約２９４の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ７０(配列番
号：１２３)のアミノ酸残基約４５から約２９４の配列を有するＰＲＯ１３１１
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００を
有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３１１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ７０（配列番号：１２３）の配列において
アミノ酸位置１からアミノ酸位置約４４まで伸びると仮に同定されている。４つ
の膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１３１１アミノ酸配列（Ｆｉｇ７０、配列番号：１
２３）のアミノ酸２２−４２、５７−８５、９４−１１６及び２３０−２５７ま
で伸びると仮に同定されている。

【０１３３】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ７０(配列番号：１２３)の残基４５か
ら約２９４のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３１１ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３１１ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３１１ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ７０(配列番号：１２３)の残基４
５から２９４を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７０(配列番号：１２３)のアミノ酸残基４５
から約２９４の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１３１１ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ７０(配列番号：１２３)の残基４５から
２９４のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１３１１ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７０(配列番号：１２３)のアミノ酸残基
４５から約２９４の配列、又は抗-ＰＲＯ１３１１抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３１１ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１３１１断片は、天然ＰＲＯ１３１１ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ７
０(配列番号：１２３)のアミノ酸残基約４５から約２９４の配列を有するＰＲＯ
１３１１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。

【０１３４】 ３６． ＰＲＯ１３５７ 本出願において「ＰＲＯ１３５７」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、von Ebner小唾液腺タンパク質をコードする核酸と相同性を有するｃＤＮＡ
クローン（ＤＮＡ６４８８１−１６０２）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３５７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ７２(配列番号：１２８)のアミ
ノ酸残基約１又は約２２から約４８４の配列を有するＰＲＯ１３５７ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７１(配列番号：１２７)のヌクレオチド約７
４又は約１３７から約１５２５の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含
むＰＲＯ１３５７ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ま
しくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４８８１−１６０２)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４０のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４８８１−１６０２）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ７２(配列番号：１２８)のア
ミノ酸残基１又は約２２から約４８４の配列と少なくとも約８０％の配列同一性
、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９
０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポ
リペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ７２(配列番
号：１２８)のアミノ酸残基１又は約２２から約４８４の配列を有するＰＲＯ１
３５７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）
に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の
配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは
少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離すること
により製造された、少なくとも４０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に
関する。

【０１３５】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３５７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ７２（配列番号：１２８）の配列におい
てアミノ酸位置約１からアミノ酸位置約２１まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ７２(配列番号：１２８)の残基１又は
約２２から約４８４のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポ
リペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３５７ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ７１（配列番号：１２７）に示すヌクレオチ
ド配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３５７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３５７ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ７２(配列番号：１２８)の残基１
又は約２２から約４８４を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７２(配列番号：１２８)のアミノ酸残基１又
は約２２から約４８４の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３５７ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ７２(配列番号：１２８)の残基１又は約
２２から約４８４のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３５７ポリペプチドに関する。

【０１３６】 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ７２(配列番号：１２８)のアミノ酸
残基１又は約２２から約４８４の配列、又は抗-ＰＲＯ１３５７抗体に対する結
合部位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３５７
ポリペプチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１３５７断片は、天然ＰＲＯ１３５
７ポリペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ７
２(配列番号：１２８)のアミノ酸残基約１又は約２２から約４８４の配列を有す
るＰＲＯ１３５７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３５７ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３５７抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３５７ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３５７ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３５７ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ３７． ＰＲＯ１２４４ 本出願において「ＰＲＯ１２４４」と命名され、移植関連タンパク質（Implan
tation-Associated Protein）と相同性を有する新規なポリペプチドをコードす
る、ｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４８８３−１５２６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２４４ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ７４(配列番号：１３０)のアミ
ノ酸残基１又は約３０から約３３５の配列を有するＰＲＯ１２４４ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【０１３７】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７３(配列番号：１２９)の残基約９６から約
１０１３の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１２４４ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２５３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４８８３−１５２６)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２５３のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４８８３−１５２６）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ７４(配列番号：１３０)のア
ミノ酸残基約３０から約３３５の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ７４(配列番
号：１３０)のアミノ酸残基約３０から約３３５の配列を有するＰＲＯ１２４４
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１２４４ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ７４（配列番号：１３０）の配列において
アミノ酸位置１からアミノ酸位置約２９まで伸びると仮に同定されている。膜貫
通ドメインは、ＰＲＯ１２４４アミノ酸配列の次のアミノ酸領域：１８３−２０
５、２１７−１３７、２７１−２８７、及び３０１−３２１にあると仮に同定さ
れている。

【０１３８】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ７４(配列番号：１３０)の残基３０か
ら約３３５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２４４ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２４４ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２４４ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ７４(配列番号：１３０)の残基３
０から３３５を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７４(配列番号：１３０)のアミノ酸残基３０
から約３３５の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１２４４ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ７４(配列番号：１３０)の残基３０から
３３５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１２４４ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ７
４(配列番号：１３０)のアミノ酸残基約３０から約３３５の配列を有するＰＲＯ
１２４４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２４４ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２４４抗体である。

【０１３９】 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２４４ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２４４ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２４４ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ３８． ＰＲＯ１２４６ 本出願において「ＰＲＯ１２４６」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、骨関連スルファターゼをコードする核酸と相同性を有するｃＤＮＡクローン
（ＤＮＡ６４８８５−１５２９）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２４６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ７６(配列番号：１３２)のアミ
ノ酸残基約１又は約１６から約５３６の配列を有するＰＲＯ１２４６ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７５(配列番号：１３１)のヌクレオチド約１
１９又は約１６４から約１７２６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを
含むＰＲＯ１２４６ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好
ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる
。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４８８５−１５２９)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５７のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４８８５−１５２９）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ７６(配列番号：１３２)のア
ミノ酸残基１又は約１６から約５３６の配列と少なくとも約８０％の配列同一性
、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９
０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポ
リペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離さ
れた核酸分子に関する。

【０１４０】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ７６(配列番
号：１３２)のアミノ酸残基１又は約１６から約５３６の配列を有するＰＲＯ１
２４６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）
に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の
配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは
少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離すること
により製造された、少なくとも１００ヌクレオチドを有する単離された核酸分子
に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１２４６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ７６（配列番号：１３２）の配列におい
てアミノ酸位置１からアミノ酸位置約１６まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ７６(配列番号：１３２)の残基１又は
約１６から約５３６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポ
リペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２４６ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ７５（配列番号：１３１）に示すヌクレオチ
ド配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２４６ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２４６ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ７６(配列番号：１３２)の残基１
又は約１６から約５３６を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７６(配列番号：１３２)のアミノ酸残基１又
は約１６から約５３６の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２４６ポリペプチドに関する。

【０１４１】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ７６(配列番号：１３２)の残基１又は１
６から約５３６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２４６ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７６(配列番号：１３２)のアミノ酸残基
１又は約１６から約５３６の配列、又は抗-ＰＲＯ１２４６抗体に対する結合部
位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２４６ポリ
ペプチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１２４６断片は、天然ＰＲＯ１２４６ポ
リペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ７
６(配列番号：１３２)のアミノ酸残基１又は約１６から約５３６の配列を有する
ＰＲＯ１２４６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮ
Ａ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ
）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくと
も約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最
も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験Ｄ
ＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして
（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプ
チドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２４６ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２４６抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２４６ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２４６ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２４６ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ３９． ＰＲＯ１３５６ 本出願において「ＰＲＯ１３５６」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、ウェルシュ菌エンテロトキシンレセプターをコードする核酸と相同性を有す
るｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４８８６−１６０１）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３５６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ７８(配列番号：１３４)のアミ
ノ酸残基約１又は約２５から約２３０の配列を有するＰＲＯ１３５６ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【０１４２】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７７(配列番号：１３３)のヌクレオチド約１
２２又は約１９４から約８１１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含
むＰＲＯ１３５６ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ま
しくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４８８６−１６０１)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４１のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４８８６−１６０１）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ７８(配列番号：１３４)のア
ミノ酸残基１又は約２５から約２３０の配列と少なくとも約８０％の配列同一性
、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９
０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポ
リペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ７８(配列番
号：１３４)のアミノ酸残基１又は約２５から約２３０の配列を有するＰＲＯ１
３５６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）
に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の
配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは
少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離すること
により製造された、少なくとも２０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に
関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３５６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ７８（配列番号：１３４）の配列において
アミノ酸位置１からアミノ酸位置約２４まで伸びると仮に同定されている。膜貫
通ドメインは、ＰＲＯ１３５６アミノ酸配列（Ｆｉｇ７８、配列番号：１３４）
のアミノ酸位置約８２からアミノ酸位置約１０２、アミノ酸位置約１１７からア
ミノ酸位置約１４０、及びアミノ酸位置約１６３からアミノ酸位置約１８２まで
伸びると仮に同定されている。

【０１４３】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ７８(配列番号：１３４)の残基１又は
約２５から約２３０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポ
リペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３５６ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ７７（配列番号：１３３）に示すヌクレオチ
ド配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３５６ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３５６ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ７８(配列番号：１３４)の残基１
又は約２５から約２３０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７８(配列番号：１３４)のアミノ酸残基１又
は約２５から約２３０の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３５６ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ７８(配列番号：１３４)の残基１又は約
２５から約２３０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３５６ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７８(配列番号：１３４)のアミノ酸残基
１又は約２５から約２３０の配列、又は抗-ＰＲＯ１３５６抗体に対する結合部
位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３５６ポリ
ペプチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１３５６断片は、天然ＰＲＯ１３５６ポ
リペプチドの質的な生物学的活性を保持している。

【０１４４】 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ７
８(配列番号：１３４)のアミノ酸残基約１又は約２５から約２３０の配列を有す
るＰＲＯ１３５６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３５６ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３５６抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３５６ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３５６ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３５６ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ４０． ＰＲＯ１２７５ 本出願において「ＰＲＯ１２７５」と命名された新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４８８８−１５４２）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２７５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ８０(配列番号：１３６)のアミ
ノ酸残基約２６から約１１９の配列を有するＰＲＯ１２７５ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ７９(配列番号：１３５)の残基約１１２から
約３９３の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１２７５ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４８８８−１５４２)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４９のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４８８８−１５４２）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。

【０１４５】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ８０(配列番号：１３６)のア
ミノ酸残基約２６から約１１９の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ８０(配列番
号：１３６)のアミノ酸残基約２６から約１１９の配列を有するＰＲＯ１２７５
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ８０(配列番号：１３６)の残基２６か
ら約１１９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２７５ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２７５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２７５ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ８０(配列番号：１３６)の残基２
６から１１９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８０(配列番号：１３６)のアミノ酸残基２６
から約１１９の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１２７５ポリペプチドに関する。

【０１４６】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ８０(配列番号：１３６)の残基２６から
１１９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１２７５ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８０(配列番号：１３６)のアミノ酸残基
２６から約１１９の配列、又は抗-ＰＲＯ１２７５抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２７５ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１２７５断片は、天然ＰＲＯ１２７５ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ８
０(配列番号：１３６)のアミノ酸残基約２５から約１１９の配列を有するＰＲＯ
１２７５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２７５ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２７５抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２７５ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２７５ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２７５ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ４１． ＰＲＯ１２７４ 本出願において「ＰＲＯ１２７４」と命名された新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４８８９−１５４１）が同定された。

【０１４７】 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２７４ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ８２(配列番号：１３８)のアミ
ノ酸残基１又は約２５から約１１０の配列を有するＰＲＯ１２７４ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８１(配列番号：１３７)の残基約９６から約
３５３の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１２７４ポリペ
プチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド形
成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２５０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４８８９−１５４１)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２５０のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４８８９−１５４１）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ８２(配列番号：１３８)のア
ミノ酸残基約２５から約１１０の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ８２(配列番
号：１３８)のアミノ酸残基約２５から約１１０の配列を有するＰＲＯ１２７４
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ８２(配列番号：１３８)の残基２５か
ら約１１０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。

【０１４８】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２７４ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２７４ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２７４ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ８２(配列番号：１３８)の残基２
５から１１０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８２(配列番号：１３８)のアミノ酸残基２５
から約１１０の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１２７４ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ８２(配列番号：１３８)の残基２５から
１１０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１２７４ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８２(配列番号：１３８)のアミノ酸残基
２５から約１１０の配列、又は抗-ＰＲＯ１２７４抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２７４ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１２７４断片は、天然ＰＲＯ１２７４ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ８
２(配列番号：１３８)のアミノ酸残基約２５から約１１０の配列を有するＰＲＯ
１２７４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。

【０１４９】 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２７４ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２７４抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２７４ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２７４ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２７４ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ４２． ＰＲＯ１４１２ 本出願において「ＰＲＯ１４１２」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４８９７−１６２８）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４１２ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ８４(配列番号：１４０)のアミ
ノ酸残基１又は約２９から約３１１の配列を有するＰＲＯ１４１２ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８３(配列番号：１３９)の残基約２２６から
約１０７４の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４１２ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２１６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４８９７−１６２８)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２１６のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４８９７−１６２８）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ８４(配列番号：１４０)のア
ミノ酸残基約２９から約３１１の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。

【０１５０】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ８４(配列番
号：１４０)のアミノ酸残基約２９から約３１１の配列を有するＰＲＯ１４１２
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４１２ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ８４（配列番号：１４０）の配列において
アミノ酸位置１からアミノ酸位置約２８まで伸びると仮に同定されている。膜貫
通ドメインは、ＰＲＯ１４１２アミノ酸配列（Ｆｉｇ８４、配列番号：１４０）
のアミノ酸位置約１９０からアミノ酸位置約２１６まで伸びると仮に同定されて
いる。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ８４(配列番号：１４０)の残基２９か
ら約３１１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４１２ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４１２ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４１２ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ８４(配列番号：１４０)の残基２
９から３１１を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０１５１】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８４(配列番号：１４０)のアミノ酸残基２９
から約３１１の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１４１２ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ８４(配列番号：１４０)の残基２９から
３１１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１４１２ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８４(配列番号：１４０)のアミノ酸残基
２９から約３１１の配列、又は抗-ＰＲＯ１４１２抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４１２ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１４１２断片は、天然ＰＲＯ１４１２ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ８
４(配列番号：１４０)のアミノ酸残基約２５から約３１１の配列を有するＰＲＯ
１４１２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 ４３． ＰＲＯ１５５７ 本出願において「ＰＲＯ１５５７」と命名され、コルジン（chordin）と相同
性を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４９０
２−１６６７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５５７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ８６(配列番号：１４２)のアミ
ノ酸残基１又は約２６から約４５１の配列を有するＰＲＯ１５５７ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【０１５２】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８５(配列番号：１４１)の残基約３６２から
約１６３９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５５７ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４９０２−１６６７)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１７のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４９０２−１６６７）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ８６(配列番号：１４２)のア
ミノ酸残基約２６から約４５１の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ８６(配列番
号：１４２)のアミノ酸残基約２６から約４５１の配列を有するＰＲＯ１５５７
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列を持っているか持っていな
いＰＲＯ１５５７ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子を
提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグナルペプチ
ドは、Ｆｉｇ８６（配列番号：１４２）の配列においてアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約２５まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ８６(配列番号：１４２)の残基２６か
ら約４５１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。

【０１５３】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５５７ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５５７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５５７ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ８６(配列番号：１４２)の残基２
６から４５１を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８６(配列番号：１４２)のアミノ酸残基２６
から約４５１の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１５５７ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ８６(配列番号：１４２)の残基２６から
４５１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５７ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８６(配列番号：１４２)のアミノ酸残基
２６から約４５１の配列、又は抗-ＰＲＯ１５５７抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５７ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１５５７断片は、天然ＰＲＯ１５５７ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ８
６(配列番号：１４２)のアミノ酸残基約２６から約４５１の配列を有するＰＲＯ
１５５７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。

【０１５４】 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５５７ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５５７抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５５７ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５５７ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５５７ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ４４． ＰＲＯ１２８６ 本出願において「ＰＲＯ１２８６」と命名された新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４９０３−１５５３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２８６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ８８(配列番号：１４４)のアミ
ノ酸残基１又は約１９から約９３の配列を有するＰＲＯ１２８６ポリペプチドを
コードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なく
とも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より
好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５
％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８７(配列番号：１４３)の残基約１４７から
約３７１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１２８６ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４９０３−１５５３)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２３のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４９０３−１５５３）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ８８(配列番号：１４４)のア
ミノ酸残基約１９から約９３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核酸
分子に関する。

【０１５５】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ８８(配列番
号：１４４)のアミノ酸残基約１９から約９３の配列を有するＰＲＯ１２８６ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌク
レオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１２８６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ８８（配列番号：１４４）の配列におい
てアミノ酸位置１からアミノ酸位置約１８まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ８８(配列番号：１４４)の残基１９か
ら約９３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチド
をコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸分
子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２８６ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２８６ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２８６ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ８８(配列番号：１４４)の残基１
９から９３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８８(配列番号：１４４)のアミノ酸残基１９
から約９３の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯ１２８６ポリペプチドに関する。

【０１５６】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ８８(配列番号：１４４)の残基１９から
９３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ましく
は少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジティ
ブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１２８６ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８８(配列番号：１４４)のアミノ酸残基
１９から約９３の配列、又は抗-ＰＲＯ１２８６抗体に対する結合部位を提供す
るのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２８６ポリペプチドに
関する。好ましくは、ＰＲＯ１２８６断片は、天然ＰＲＯ１２８６ポリペプチド
の質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ８
８(配列番号：１４４)のアミノ酸残基約１９から約９３の配列を有するＰＲＯ１
２８６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。 ４５． ＰＲＯ１２９４ 本出願において「ＰＲＯ１２９４」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、オルファクトメジン(olfactomedin)をコードする核酸と相同性を有する、ｃ
ＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４９０５−１５５８）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２９４ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ９０(配列番号：１４６)のアミ
ノ酸残基約１又は約２２から約４０６の配列を有するＰＲＯ１２９４ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ８９(配列番号：１４５)のヌクレオチド約１
１０又は約１７３から約１３２７の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを
含むＰＲＯ１２９４ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好
ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる
。

【０１５７】 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４９０５−１５８８)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３３のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４９０５−１５５８）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ９０(配列番号：１４６)のア
ミノ酸残基１又は約２２から約４０６の配列と少なくとも約８０％の配列同一性
、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９
０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポ
リペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ９０(配列番
号：１４６)のアミノ酸残基１又は約２２から約４０６の配列を有するＰＲＯ１
２９４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）
に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の
配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは
少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離すること
により製造された、少なくとも１０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に
関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１２９４ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ９０（配列番号：１４６）の配列におい
てアミノ酸位置約１からアミノ酸位置約２１まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ９０(配列番号：１４６)の残基１又は
約２２から約４０６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポ
リペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２９４ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ８９（配列番号：１４５）に示すヌクレオチ
ド配列から誘導されうる。

【０１５８】 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２９４ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２９４ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ９０(配列番号：１４６)の残基１
又は約２２から約４０６を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９０(配列番号：４６)のアミノ酸残基１又は
約２２から約４０６の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配
列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２９４ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ９０(配列番号：１４６)の残基１又は約
２２から約４０６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２９４ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９０(配列番号：１４６)のアミノ酸残基
１又は約２２から約４０６の配列、又は抗-ＰＲＯ１２９４抗体に対する結合部
位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２９４ポリ
ペプチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１２９４断片は、天然ＰＲＯ１２９４ポ
リペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ９
０(配列番号：１４６)のアミノ酸残基約１又は約２２から約４０６の配列を有す
るＰＲＯ１２９４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２９４ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２９４抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２９４ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２９４ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。

【０１５９】 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２９４ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ４６． ＰＲＯ１３４７ 本出願において「ＰＲＯ１３４７」と命名され、ブチロフィリンと配列同一性
を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４９５０
−１５９０）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３４７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ９２(配列番号：１４８)のアミ
ノ酸残基１又は約１８から約５００の配列を有するＰＲＯ１３４７ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９１(配列番号：１４７)の残基約２３４から
約１６８２の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３４７ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２４のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４９５０−１５９０)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２４のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４９５０−１５９０）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ９２(配列番号：１４８)のア
ミノ酸残基約１８から約５００の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。

【０１６０】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ９２(配列番
号：１４８)のアミノ酸残基約１８から約５００の配列を有するＰＲＯ１３４７
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特定の態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３４７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失（又
はその末端が切断されたもの）又は不活性化された変異体を提供し、あるいはそ
のようなコード化核酸分子に相補的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ９２（
配列番号：１４８）のアミノ酸位置１からアミノ酸位置約１７まで伸びると仮に
同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１３４７アミノ酸配列（Ｆｉｇ９２
、配列番号：１４８）のアミノ酸位置約２３９からアミノ酸位置約２５５まで伸
びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ９２(配列番号：１４８)の残基１８か
ら約５００のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３４７ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３４７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３４７ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ９２(配列番号：１４８)の残基１
８から約５００を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９２(配列番号：１４８)のアミノ酸残基１８
から約５００の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１３４７ポリペプチドに関する。

【０１６１】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ９２(配列番号：１４８)の残基１８から
５００のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１３４７ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ９２(配列番号：１４８)のアミノ酸
残基１８から約５００の配列、又は抗-ＰＲＯ１３４７抗体に対する結合部位を
提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３４７ポリペプ
チドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１３４７断片は、天然ＰＲＯ１３４７ポリペ
プチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ９
２(配列番号：１４８)のアミノ酸残基約１８から約５００の配列を有するＰＲＯ
１３４７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３４７ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３４７抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３４７ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３４７ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３４７ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ４７． ＰＲＯ１３０５ 本出願において「ＰＲＯ１３０５」と命名された新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６４９５２−１５６８）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３０５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。

【０１６２】 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ９４(配列番号：１５３)のアミ
ノ酸残基約１又は約２６から約２５８の配列を有するＰＲＯ１３０５ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９３(配列番号：１５２)のヌクレオチド約１
２６又は約２０１から約８９９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含
むＰＲＯ１３０５ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ま
しくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６４９５２−１５６８)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２２のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６４９５２−１５６８）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ９４(配列番号：１５３)のア
ミノ酸残基１又は約２６から約２５８の配列と少なくとも約８０％の配列同一性
、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９
０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポ
リペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離さ
れた核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ９４(配列番
号：１５３)のアミノ酸残基１又は約２６から約２５８の配列を有するＰＲＯ１
３０５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）
に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の
配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは
少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離すること
により製造された、少なくとも約１０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子
に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３０５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ９４（配列番号：１５３）の配列におい
てアミノ酸位置約１からアミノ酸位置約２５まで伸びると仮に同定されている。

【０１６３】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ９４(配列番号：１５３)の残基１又は
約２６から約２５８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポ
リペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３０５ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ９３（配列番号：１５２）に示すヌクレオチ
ド配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３０５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３０５ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ９４(配列番号：１５３)の残基１
又は約２６から約２５８を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９４(配列番号：１５３)のアミノ酸残基１又
は約２６から約２５８の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０５ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ９４(配列番号：１５３)の残基１又は約
２６から約２５８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０５ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９４(配列番号：１５３)のアミノ酸残基
１又は約２６から約２５８の配列、又は抗-ＰＲＯ１３０５抗体に対する結合部
位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０５ポリ
ペプチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１３０５断片は、天然ＰＲＯ１３０５ポ
リペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ９
４(配列番号：１５３)のアミノ酸残基約１又は約２６から約２５８の配列を有す
るＰＲＯ１３０５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。

【０１６４】 ４８． ＰＲＯ１２７３ 本出願において「ＰＲＯ１２７３」と命名され、リポカリンと配列同一性を有
する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６５４０２−１
５４０）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２７３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ９６(配列番号：１５８)のアミ
ノ酸残基１又は約２１から約１６３の配列を有するＰＲＯ１２７３ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９５(配列番号：１５７)の残基約８６から約
５１４の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１２７３ポリペ
プチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド形
成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２５２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６５４０２−１５４０)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２５２のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６５４０２−１５４０）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ９６(配列番号：１５８)のア
ミノ酸残基約２１から約１６３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。

【０１６５】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ９６(配列番
号：１５８)のアミノ酸残基約２１から約１６３の配列を有するＰＲＯ１２７３
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ９６(配列番号：１５８)の残基２１か
ら約１６３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２７３ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２７３ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２７３ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ９６(配列番号：１５８)の残基２
１から１６３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９６(配列番号：１５８)のアミノ酸残基２１
から約１６３の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１２７３ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ９６(配列番号：１５８)の残基２１から
１６３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１２７３ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９６(配列番号：１５８)のアミノ酸残基
２１から約１６３の配列、又は抗-ＰＲＯ１２７３抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２７３ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１２７３断片は、天然ＰＲＯ１２７３ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。

【０１６６】 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ９
６(配列番号：１５８)のアミノ酸残基約２１から約１６３の配列を有するＰＲＯ
１２７３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２７３ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２７３抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２７３ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２７３ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２７３ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ４９． ＰＲＯ１３０２ 本出願において「ＰＲＯ１３０２」と命名され、ＣＤ３３と配列同一性を有す
る新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６５４０３−１５
６５）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３０２ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ９８(配列番号：１６０)のアミ
ノ酸残基１又は約１６から約４６３の配列を有するＰＲＯ１３０２ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９７(配列番号：１５９)の残基約８８から約
１４３１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３０２ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。

【０１６７】 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６５４０３−１５６５)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３０のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６５４０３−１５６５）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ９８(配列番号：１６０)のア
ミノ酸残基約１６から約４６３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ９８(配列番
号：１６０)のアミノ酸残基約１６から約４６３の配列を有するＰＲＯ１３０２
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３０２ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失（又
は先端が切断された形態）又は不活性化された変異体を提供し、あるいはそのよ
うなコード化核酸分子に相補的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ９８（配列
番号：１６０）の配列においてアミノ酸位置１からアミノ酸位置約１５まで伸び
ると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１３０２アミノ酸配列（Ｆ
ｉｇ９８、配列番号：１６０）のアミノ酸位置約３５１からアミノ酸位置約３７
０まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ９８(配列番号：１６０)の残基１６か
ら約４６３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。

【０１６８】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３０２ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３０２ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３０２ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ９８(配列番号：１６０)の残基１
６から４６３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９８(配列番号：１６０)のアミノ酸残基１６
から約４６３の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１３０２ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ９８(配列番号：１６０)の残基１６から
４６３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０２ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９８(配列番号：１６０)のアミノ酸残基
１６から約４６３の配列、又は抗-ＰＲＯ１３０２抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０２ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１３０２断片は、天然ＰＲＯ１３０２ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ９
８(配列番号：１６０)のアミノ酸残基約１６から約４６３の配列を有するＰＲＯ
１３０２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。

【０１６９】 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３０２ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３０２抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３０２ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３０２ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３０２ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ５０． ＰＲＯ１２８３ 本出願において「ＰＲＯ１２８３」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードし、匂い物質結合タンパク質をコードする核酸と相同性を有する、ｃＤＮ
Ａクローン（ＤＮＡ６５４０４−１５５１）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２８３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１００(配列番号：１６２)のア
ミノ酸残基１又は約１８から約１７０の配列を有するＰＲＯ１２８３ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ９９(配列番号：１６１)のヌクレオチド約４
５又は約９６から約５５４の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰ
ＲＯ１２８３ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましく
は、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４４のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６５４０４−１５５１)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４４のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６５４０４−１５５１）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１００(配列番号：１６２)の
アミノ酸残基１又は約１８から約１７０の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離
された核酸分子に関する。

【０１７０】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１００(配列
番号：１６２)のアミノ酸残基１又は約１８から約１７０の配列を有するＰＲＯ
１２８３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも１０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子
に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１２８３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１００（配列番号：１６２）の配列にお
いてアミノ酸位置１からアミノ酸位置約１７まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１００(配列番号：１６２)の残基１又
は約１８から約１７０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２８３ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ９９（配列番号：１６１）に示すヌクレオチ
ド配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２８３ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２８３ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１００(配列番号：１６２)の残基
１又は約１８から約１７０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１００(配列番号：１６２)のアミノ酸残基１
又は約１８から約１７０の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２８３ポリペプチドに関する。

【０１７１】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１００(配列番号：１６２)の残基１又は
約１８から約１７０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのア
ミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２８３ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１００(配列番号：１６２)のアミノ酸残
基１又は約１８から約１７０の配列、又は抗-ＰＲＯ１２８３抗体に対する結合
部位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２８３ポ
リペプチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１２８３断片は、天然ＰＲＯ１２８３
ポリペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
００(配列番号：１６２)のアミノ酸残基約１又は約１８から約１７０の配列を有
するＰＲＯ１２８３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２８３ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２８３抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２８３ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２８３ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２８３ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ５１． ＰＲＯ１２７９ 本出願において「ＰＲＯ１２７９」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、ニューロプシンをコードする核酸と相同性を有する、ｃＤＮＡクローン（Ｄ
ＮＡ６５４０５−１５４７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２７９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。

【０１７２】 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１０２(配列番号：１７０)のア
ミノ酸残基約１又は約１９から約２５０の配列を有するＰＲＯ１２７９ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０１(配列番号：１６９)のヌクレオチド約
１０６又は約１６０から約８５５の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを
含むＰＲＯ１２７９ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好
ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる
。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６５４０５−１５４７)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７６のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６５４０５−１５４７）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１０２(配列番号：１７０)の
アミノ酸残基１又は約１９から約２５０の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離
された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１０２(配列
番号：１７０)のアミノ酸残基１又は約１９から約２５０の配列を有するＰＲＯ
１２７９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約１００ヌクレオチドを有する単離された核酸
分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１２７９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１０２（配列番号：１７０）の配列にお
いてアミノ酸位置約１からアミノ酸位置約１８まで伸びると仮に同定されている
。

【０１７３】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１０２(配列番号：１７０)の残基１又
は約１９から約２５０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２７９ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１０１（配列番号：１６９）に示すヌクレオ
チド配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２７９ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２７９ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１０２(配列番号：１７０)の残基
１又は約１９から約２５０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０２(配列番号：１７０)のアミノ酸残基１
又は約１９から約２５０の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２７９ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０２(配列番号：１７０)の残基１又は
約１９から約２５０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのア
ミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２７９ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０２(配列番号：１７０)のアミノ酸残
基１又は約１９から約２５０の配列、又は抗-ＰＲＯ１２７９抗体に対する結合
部位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２７９ポ
リペプチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１２７９断片は、天然ＰＲＯ１２７９
ポリペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
０２(配列番号：１７０)のアミノ酸残基約１又は約１９から約２５０の配列を有
するＰＲＯ１２７９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。

【０１７４】 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２７９ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２７９抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２７９ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２７９ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２７９ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ５２． ＰＲＯ１３０４ 本出願において「ＰＲＯ１３０４」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、ＦＫ５０６結合タンパク質をコードする核酸と相同性を有する、ｃＤＮＡク
ローン（ＤＮＡ６５４０６−１５６７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３０４ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１０４(配列番号：１８０)のア
ミノ酸残基約１から約２２２の配列を有するＰＲＯ１３０４ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０３(配列番号：１７９)のヌクレオチド約
２３から約６８８の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３
０４ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイ
ブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２１９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６５４０６−１５６７)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２１９のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６５４０６−１５６７）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。

【０１７５】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１０４(配列番号：１８０)の
アミノ酸残基１から約２２２の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核酸
分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１０４(配列
番号：１８０)のアミノ酸残基１から約２２２の配列を有するＰＲＯ１３０４ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも１０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、開始メチオニンを持っているか持っていないＰＲ
Ｏ１３０４ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子を提供し
、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１０４(配列番号：１８０)の残基１か
ら約２２２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３０４ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１０３（配列番号：１７９）に示すヌクレオ
チド配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３０４ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３０４ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１０４(配列番号：１８０)の残基
１から約２２２を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０１７６】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０４(配列番号：１８０)のアミノ酸残基１
から約２２２の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１３０４ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０４(配列番号：１８０)の残基１から
約２２２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０４ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０４(配列番号：１８０)のアミノ酸残
基１から約２２２の配列、又は抗-ＰＲＯ１３０４抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０４ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１３０４断片は、天然ＰＲＯ１３０４ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
０４(配列番号：１８０)のアミノ酸残基約１から約２２２の配列を有するＰＲＯ
１３０４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３０４ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３０４抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３０４ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３０４ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３０４ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。

【０１７７】 ５３． ＰＲＯ１３１７ ヒトＣＤ９７と相同性を共有する新規な分泌ポリペプチドをコードするｃＤＮ
Ａクローン（ＤＮＡ６５４０８−１５７８）が同定された。新規なポリペプチド
は本出願において「ＰＲＯ１３１７」と命名された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３１７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１０６(配列番号：１８９)のア
ミノ酸残基１又は約１９から約７４の配列を有するＰＲＯ１３１７ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、よ
り好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９
５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０５(配列番号：１８８)の残基約６０から
約２２７の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３１７ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２１７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６５４０８−１５７８)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２１７のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６５４０８−１５７８）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１０６(配列番号：１８９)の
アミノ酸残基約１９から約７４の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１０６(配列
番号：１８９)のアミノ酸残基約１９から約７４の配列を有するＰＲＯ１３１７
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０１７８】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３１７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１０６（配列番号：１８９）の配列にお
いてアミノ酸位置１からアミノ酸位置約１８まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１０６(配列番号：１８９)の残基１
９から約７４のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核
酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３１７ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３１７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３１７ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１０６(配列番号：１８９)の残基
１９から７４を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０６(配列番号：１８９)のアミノ酸残基１
９から約７４の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１３１７ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０６(配列番号：１８９)の残基１９か
ら７４のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１３１７ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０６(配列番号：１８９)のアミノ酸残
基１９から約７４の配列、又は抗-ＰＲＯ１３１７抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３１７ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１３１７断片は、天然ＰＲＯ１３１７ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。

【０１７９】 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
０６(配列番号：１８９)のアミノ酸残基約１９から約７４の配列を有するＰＲＯ
１３１７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 ５４． ＰＲＯ１３０３ 本出願において「ＰＲＯ１３０３」と命名され、ニューロプシンを含むプロテ
アーゼを配列同一性を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン
（ＤＮＡ６５４０９−１５６６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３０３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１０８(配列番号：１９４)のア
ミノ酸残基１又は約１８から約２４８の配列を有するＰＲＯ１３０３ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０７(配列番号：１９３)の残基約１７２か
ら約８６４の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３０３ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６５４０９−１５６６)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３２のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６５４０９−１５６６）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１０８(配列番号：１９４)の
アミノ酸残基約１８から約２４８の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された
核酸分子に関する。

【０１８０】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１０８(配列
番号：１９４)のアミノ酸残基約１８から約２４８の配列を有するＰＲＯ１３０
３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１０８(配列番号：１９４)の残基１８
から約２４８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核
酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３０３ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３０３ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３０３ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１０８(配列番号：１９４)の残基
１８から２４８を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０８(配列番号：１９４)のアミノ酸残基１
８から約２４８の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは
少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同
一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０３ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０８(配列番号：１９４)の残基１８か
ら２４８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０３ポリペプチドに関する。

【０１８１】 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０８(配列番号：１９４)のアミノ酸残
基１８から約２４８の配列、又は抗-ＰＲＯ１３０３抗体に対する結合部位を提
供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０３ポリペプチ
ドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１３０３断片は、天然ＰＲＯ１３０３ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
０８(配列番号：１９４)のアミノ酸残基約１８から約２４８の配列を有するＰＲ
Ｏ１３０３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３０３ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３０３抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３０３ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３０３ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３０３ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ５５． ＰＲＯ１３０６ 本出願において「ＰＲＯ１３０６」と命名され、ＡＩＴ１／ダインタイン（da
intain）と相同性を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（
ＤＮＡ６５４１０−１５６９）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３０６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１１０(配列番号：１９６)のア
ミノ酸残基約１から約１５０の配列を有するＰＲＯ１３０６ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【０１８２】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１０９(配列番号：１９５)の残基約１０６か
ら約５５５の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３０６ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６５４１０−１５６９)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３１のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６５４１０−１５６９）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１１０(配列番号：１９６)の
アミノ酸残基約１から約１５０の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１１０(配列
番号：１９６)のアミノ酸残基約１から約１５０の配列を有するＰＲＯ１３０６
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１１０(配列番号：１９６)の残基１か
ら約１５０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３０６ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。

【０１８３】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３０６ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３０６ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１１０(配列番号：１９６)の残基
１から１５０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１０(配列番号：１９６)のアミノ酸残基１
から約１５０の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１３０６ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１０(配列番号：１９６)の残基１から
１５０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０６ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１０(配列番号：１９６)のアミノ酸残
基１から約１５０の配列、又は抗-ＰＲＯ１３０６抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０６ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１３０６断片は、天然ＰＲＯ１３０６ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
１０(配列番号：１９６)のアミノ酸残基約１から約１５０の配列を有するＰＲＯ
１３０６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３０６ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３０６抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３０６ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３０６ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。

【０１８４】 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３０６ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ５６． ＰＲＯ１３３６ 本出願において「ＰＲＯ１３３６」と命名され、スリット（slit）と配列同一
性を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６５４２
３−１５９５）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３３６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１１２(配列番号：１９８)のア
ミノ酸残基１又は約２８から約１５２３の配列を有するＰＲＯ１３３６ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１１Ａ−Ｂ(配列番号：１９７)の残基約１
６４から約４６５１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１
３３６ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハ
イブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６５４２３−１５９５)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２７のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６５４２３−１５９５）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１１２(配列番号：１９８)の
アミノ酸残基約２８から約１５２３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、
好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０
％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリ
ペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離され
た核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１１２(配列
番号：１９８)のアミノ酸残基約２８から約１５２３の配列を有するＰＲＯ１３
３６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補
体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に
対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配
列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少
なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することに
より製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１０
０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０１８５】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１１２(配列番号：１９８)の残基２８
から約１５２３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された
核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３３６ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３３６ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３３６ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１１２(配列番号：１９８)の残基
２８から１５２３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１２(配列番号：１９８)のアミノ酸残基２
８から約１５２３の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましく
は少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列
同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３３６ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１２(配列番号：１９８)の残基２８か
ら１５２３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配
列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３３６ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１２(配列番号：１９８)のアミノ酸残
基２８から約１５２３の配列、又は抗-ＰＲＯ１３３６抗体に対する結合部位を
提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３３６ポリペプ
チドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１３３６断片は、天然ＰＲＯ１３３６ポリペ
プチドの質的な生物学的活性を保持している。

【０１８６】 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
１２(配列番号：１９８)のアミノ酸残基約２８から約１５２３の配列を有するＰ
ＲＯ１３３６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ
分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）
又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも
約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も
好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮ
Ａ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（
ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチ
ドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３３６ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３３６抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３３６ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３３６ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３３６ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ５７． ＰＲＯ１２７８ 本出願において「ＰＲＯ１２７８」と命名され、リゾチームＣと相同性を有す
る新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６３０４−１５
４６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２７８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１１４(配列番号：２０３)のア
ミノ酸残基１又は約２０から約１４８の配列を有するＰＲＯ１２７８ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１３(配列番号：２０２)の残基約１９８か
ら約５８４の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１２７８ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６６３０４−１５４６)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２１のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６３０４−１５４６）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。

【０１８７】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１１４(配列番号：２０３)の
アミノ酸残基約２０から約１４８の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された
核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１１４(配列
番号：２０３)のアミノ酸残基約２０から約１４８の配列を有するＰＲＯ１２７
８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１２７８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１１４（配列番号：２０３）の配列におい
てアミノ酸位置１からアミノ酸位置約１９まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１１４(配列番号：２０３)の残基２０
から約１４８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核
酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２７８ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。

【０１８８】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２７８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２７８ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１１４(配列番号：２０３)の残基
２０から１４８を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１４(配列番号：２０３)のアミノ酸残基２
０から約１４８の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは
少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同
一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１２７８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１４(配列番号：２０３)の残基２０か
ら１４８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２７８ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１４(配列番号：２０３)のアミノ酸残
基２０から約１４８の配列、又は抗-ＰＲＯ１２７８抗体に対する結合部位を提
供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２７８ポリペプチ
ドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１２７８断片は、天然ＰＲＯ１２７８ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
１４(配列番号：２０３)のアミノ酸残基約２０から約１４８の配列を有するＰＲ
Ｏ１２７８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２７８ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２７８抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２７８ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２７８ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。

【０１８９】 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２７８ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ５８． ＰＲＯ１２９８ 本出願において「ＰＲＯ１２９８」と命名され、グリコシルトランスフェラー
ゼと配列同一性を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（Ｄ
ＮＡ６６５１１−１５６３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２９８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１１６(配列番号：２１０)のア
ミノ酸残基１又は約１６から約３２３の配列を有するＰＲＯ１２９８ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１５(配列番号：２０９)の残基約１３９か
ら約１０６２の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１２９８
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６６５１１−１５６３)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２８のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６５１１−１５６３）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１１６(配列番号：２１０)の
アミノ酸残基約１６から約３２３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された
核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１１６(配列
番号：２１０)のアミノ酸残基約１６から約３２３の配列を有するＰＲＯ１２９
８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０１９０】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１１６(配列番号：２１０)の残基１６
から約３２３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核
酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２９８ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２９８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２９８ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１１６(配列番号：２１０)の残基
１６から３２３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１６(配列番号：２１０)のアミノ酸残基１
６から約３２３の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは
少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同
一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１２９８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１６(配列番号：２１０)の残基１６か
ら３２３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２９８ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１６(配列番号：２１０)のアミノ酸残
基１６から約３２３の配列、又は抗-ＰＲＯ１２９８抗体に対する結合部位を提
供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２９８ポリペプチ
ドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１２９８断片は、天然ＰＲＯ１２９８ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。

【０１９１】 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
１６(配列番号：２１０)のアミノ酸残基約１６から約３２３の配列を有するＰＲ
Ｏ１２９８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２９８ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２９８抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２９８ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２９８ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２９８ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ５９． ＰＲＯ１３０１ 本出願において「ＰＲＯ１３０１」と命名され、チトクロムＰ４５０と相同性
を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６５１２
−１５６４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３０１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１１８(配列番号：２１２)のア
ミノ酸残基１又は約１９から約４６２の配列を有するＰＲＯ１３０１ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１７(配列番号：２１１)の残基約９７から
約１４２８の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３０１ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２１８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６６５１２−１５６４)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２１８のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６５１２−１５６４）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。

【０１９２】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１１８(配列番号：２１２)の
アミノ酸残基約１９から約４６２の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された
核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１１８(配列
番号：２１２)のアミノ酸残基約１９から約４６２の配列を有するＰＲＯ１３０
１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３０１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１１８（配列番号：２１２）の配列におい
てアミノ酸位置１からアミノ酸位置約１８まで伸びると仮に同定されている。膜
貫通ドメインは、ＰＲＯ１３０１アミノ酸配列（Ｆｉｇ１１８、配列番号：２１
２）のアミノ酸位置約２７１からアミノ酸位置約２９０まで伸びると仮に同定さ
れている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１１８(配列番号：２１２)の残基１９
から約４６２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核
酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３０１ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。

【０１９３】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３０１ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３０１ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１１８(配列番号：２１２)の残基
１９から４６２を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１８(配列番号：２１２)のアミノ酸残基１
９から約４６２の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは
少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同
一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０１ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１８(配列番号：２１２)の残基１９か
ら４６２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０１ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１８(配列番号：２１２)のアミノ酸残
基１９から約４６２の配列、又は抗-ＰＲＯ１３０１抗体に対する結合部位を提
供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３０１ポリペプチ
ドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１３０１断片は、天然ＰＲＯ１３０１ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
１８(配列番号：２１２)のアミノ酸残基約１９から約４６２の配列を有するＰＲ
Ｏ１３０１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 ６０． ＰＲＯ１２６８ 本出願において「ＰＲＯ１２６８」と命名された新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６５１９−１５３５）が同定された。

【０１９４】 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２６８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１２０(配列番号：２１４)のア
ミノ酸残基約１から約１４０の配列を有するＰＲＯ１２６８ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１１９(配列番号：２１３)の残基約８９から
約５０８の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１２６８ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６６５１９−１５３５)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３６のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６５１９−１５３５）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１２０(配列番号：２１４)の
アミノ酸残基約１から約１４０の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された核
酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１２０(配列
番号：２１４)のアミノ酸残基約１から約１４０の配列を有するＰＲＯ１２６８
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、一又は複数のその可溶性、すなわち膜貫通ドメイ
ンが欠失又は不活性化された、ＰＲＯ１２６８ポリペプチドをコードするＤＮＡ
を含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相
補的である。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１２６８アミノ酸配列（Ｆｉｇ１２０、
配列番号：２１４）のアミノ酸約１２−２８（ＩＩ型）、５１−６６及び１０７
−１２４にあると仮に同定されている。

【０１９５】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１２０(配列番号：２１４)の残基１か
ら約１４０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核酸
分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２６８ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２６８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２６８ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１２０(配列番号：２１４)の残基
１から１４０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２０(配列番号：２１４)のアミノ酸残基１
から約１４０の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少
なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一
性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含
んでなる、単離されたＰＲＯ１２６８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２０(配列番号：２１４)の残基１から
１４０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１２６８ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２０(配列番号：２１４)のアミノ酸残
基１から約１４０の配列、又は抗-ＰＲＯ１２６８抗体に対する結合部位を提供
するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２６８ポリペプチド
に関する。好ましくは、ＰＲＯ１２６８断片は、天然ＰＲＯ１２６８ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
２０(配列番号：２１４)のアミノ酸残基約１から約１４０の配列を有するＰＲＯ
１２６８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。

【０１９６】 ６１． ＰＲＯ１２６９ 本出願において「ＰＲＯ１２６９」と命名され、顆粒細胞ペプチドＡと相同性
を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６５２０
−１５３６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１２６９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１２２(配列番号：２１６)のア
ミノ酸残基１又は約２１から約１９６の配列を有するＰＲＯ１２６９ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２１(配列番号：２１５)の残基約８６から
約６１３の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１２６９ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６６５２０−１５３６)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する
。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２６のヒトタンパ
ク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６５２０−１５３６）にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１２２(配列番号：２１６)の
アミノ酸残基約２１から約１９６の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ａ）のＤＮＡの補体を含んでなる単離された
核酸分子に関する。

【０１９７】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１２２(配列
番号：２１６)のアミノ酸残基約２１から約１９６の配列を有するＰＲＯ１２６
９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１２６９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子、及びその可溶性、すなわち膜貫通ドメインが欠失又は
不活性化された変異体を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的
である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１２２（配列番号：２１６）の配列におい
てアミノ酸位置１からアミノ酸位置約２０まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１２２(配列番号：２１６)の残基２１
から約１９６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離された核
酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１２６９ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１２６９ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１２６９ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１２２(配列番号：２１６)の残基
２１から１９６を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２２(配列番号：２１６)のアミノ酸残基２
１から約１９６の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは
少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同
一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１２６９ポリペプチドに関する。

【０１９８】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２２(配列番号：２１６)の残基２１か
ら１９６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２６９ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２２(配列番号：２１６)のアミノ酸残
基２１から約１９６の配列、又は抗-ＰＲＯ１２６９抗体に対する結合部位を提
供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１２６９ポリペプチ
ドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１２６９断片は、天然ＰＲＯ１２６９ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
２２(配列番号：２１６)のアミノ酸残基約２１から約１９６の配列を有するＰＲ
Ｏ１２６９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１２６９ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１２６９抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１２６９ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１２６９ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１２６９ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。 ６２． ＰＲＯ１３２７ 本出願において「ＰＲＯ１３２７」と命名され、新規なポリペプチドをコード
し、ニューレキソプリリン（neurexoplilin）をコードする核酸と相同性を有す
るｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６５２１−１５８３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３２７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１２４(配列番号：２１８)のア
ミノ酸残基約１又は約１５から約２５２の配列を有するＰＲＯ１３２７ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。

【０１９９】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２３(配列番号：２１７)のヌクレオチド約
５５又は約９７から約８１０の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含む
ＰＲＯ１３２７ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好まし
くは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ(ＤＮＡ６６５２１−１５８３)にコードされる同じ成熟ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の核酸分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。
好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２５のヒトタンパク
質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６５２１−１５８３）にコードされる同じ成熟ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１２４(配列番号：２１８)の
アミノ酸残基１又は約１５から約２５２の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含んでな
る単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１２４(配列
番号：２１８)のアミノ酸残基１又は約１５から約２５２の配列を有するＰＲＯ
１３２７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも２６０ヌクレオチドを有する単離された核酸分
子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３２７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１２４（配列番号：２１８）の配列にお
いてアミノ酸位置約１からアミノ酸位置約１４まで伸びると仮に同定されている
。

【０２００】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１２４(配列番号：２１８)の残基１又
は約１５から約２５２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡの補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３２７ポリペプチドコード化配列の断片に係る。このような核酸断片は、約
２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長、
より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から約
４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１２３（配列番号：２１７）に示すヌクレオ
チド配列から誘導されうる。 他の実施態様では、本発明は、上記において同定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３２７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３２７ポリペプチドを
提供し、それは或る種の実施態様では、Ｆｉｇ１２４(配列番号：２１８)の残基
１又は約１５から約２５２を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２４(配列番号：２１８)のアミノ酸残基１
又は約１５から約２５２の配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２７ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２４(配列番号：２１８)の残基１又は
約１５から約２５２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのア
ミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２７ポリペプチドに関する。 また他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２４(配列番号：２１８)のアミノ酸残
基１又は約１５から約２５２の配列、又は抗-ＰＲＯ１３２７抗体に対する結合
部位を提供するのに十分なその断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２７ポ
リペプチドに関する。好ましくは、ＰＲＯ１３２７断片は、天然ＰＲＯ１３２７
ポリペプチドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
２４(配列番号：２１８)のアミノ酸残基約１又は約１５から約２５２の配列を有
するＰＲＯ１３２７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３２７ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特定の実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３２７抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３２７ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３２７ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３２７ポリペプチド、又は上
記において特定されたアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担
体とともに含んでなる組成物に関する。

【０２０１】 ６３． ＰＲＯ１３８２ 本出願において「ＰＲＯ１３８２」と命名され、セレベリン(cerebellin)に相
同性を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６５
２６−１６１６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３８２ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１２６(配列番号：２２０)のア
ミノ酸残基１又は約２８から約２０１の配列を有するＰＲＯ１３８２ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２５（配列番号：２１９)の残基約４１８
から約９３９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３８２
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６５２６−１６１６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６５２６−１６１６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１２６(配列番号：２２０)の
アミノ酸残基約２８から約２０１の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１２６(配列
番号：２２０)のアミノ酸残基約２８から約２０１の配列を有するＰＲＯ１３８
２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは１００ヌクレオチド
を有する単離された核酸分子に関する。

【０２０２】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列を持っているか持っていな
いＰＲＯ１３８２ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子を
提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグナルペプチ
ドは、Ｆｉｇ１２６（配列番号：２２０）のアミノ酸位置１からアミノ酸位置約
２７まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１２６(配列番号：２２０)の残基２８
から約２０１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３８２ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３８２ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３８２ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１２６(配列番号：２２０)の残基２８か
ら２０１を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２６(配列番号：２２０)のアミノ酸残基２
８から約２０１に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３８２ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２６(配列番号：２２０)の残基２８か
ら２０１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３８２ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２６(配列番号：２２０)のアミノ
酸残基２８から約２０１の配列、又はその抗-ＰＲＯ１３８２抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３８２ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１３８２断片は、天然ＰＲＯ１３８２ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
２６(配列番号：２２０)のアミノ酸残基約２８から約２０１の配列を有するＰＲ
Ｏ１３８２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３８２ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３８２抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３８２ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３８２ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３８２ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２０３】 ６４． ＰＲＯ１３２８ 本出願において「ＰＲＯ１３２８」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６６５８−１５８４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３２８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１２８(配列番号：２２５)のア
ミノ酸残基約１又は約２０から約２５７の配列を有するＰＲＯ１３２８ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２７（配列番号：２２４)の残基約９又は
約６６から約７７９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１
３２８ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハ
イブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６５８−１５８４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６５８−１５８４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１２８(配列番号：２２５)の
アミノ酸残基１又は約２０から約２５７の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。

【０２０４】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１２８(配列
番号：２２５)のアミノ酸残基１又は約２０から約２５７の配列を有するＰＲＯ
１３２８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約４５７ヌクレオチドを有する単離された核酸
分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３２８ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１２８（配列番号：２２５）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約１９まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
３２８アミノ酸配列（Ｆｉｇ１２８、配列番号：２２５）のアミノ酸位置約３２
からアミノ酸位置約５１、アミノ酸位置約１１９からアミノ酸位置約１３８、ア
ミノ酸位置約１５２からアミノ酸位置約１６９、及びアミノ酸位置約２１６から
アミノ酸位置約２３５まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１２８(配列番号：２２５)の残基１又
は約２０から約２５７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３２８ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１２７(配列番号：２２４)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。

【０２０５】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３２８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３２８ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１２８(配列番号：２２５)の残基１又は
約２０から２５７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２８(配列番号：２２５)のアミノ酸残基１
又は約２０から約２５７に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２８ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２８(配列番号：２２５)の残基１又は
約２０から２５７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２８ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２８(配列番号：２２５)のアミノ
酸残基１又は約２０から約２５７の配列、又はその抗-ＰＲＯ１３２８抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２８ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１３２８断片は、天然ＰＲＯ１３２８ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
２８(配列番号：２２５)のアミノ酸残基１又は約２０から約２５７の配列を有す
るＰＲＯ１３２８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。

【０２０６】 ６５． ＰＲＯ１３２５ 本出願において「ＰＲＯ１３２５」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６６５９−１５９３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３２５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１３０(配列番号：２２７)のア
ミノ酸残基約１又は約１９から約８３２の配列を有するＰＲＯ１３２５ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１２９（配列番号：２２６)のヌクレオチド
約５１又は約１０５から約２５４６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡ
を含むＰＲＯ１３２５ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。
好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こ
る。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２６９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６５９−１５９３）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２６９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６５９−１５９３）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１３０(配列番号：２２７)の
アミノ酸残基１又は約１９から約８３２の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１３０(配列
番号：２２７)のアミノ酸残基１又は約１９から約８３２の配列を有するＰＲＯ
１３２５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約１００ヌクレオチドを有する単離された核酸
分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３２５ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１３０（配列番号：２２７）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約１８まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
３２５アミノ酸配列（Ｆｉｇ１３０、配列番号：２２７）のアミノ酸位置約２９
２からアミノ酸位置約３１７、アミノ酸位置約４５１からアミノ酸位置約４７０
、アミノ酸位置約５０１からアミノ酸位置約５２０、アミノ酸位置約６０７から
アミノ酸位置約６２７、及びアミノ酸位置約７５１からアミノ酸位置約７７０ま
で伸びるものとして仮に同定されている。

【０２０７】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１３０(配列番号：２２７)の残基１又
は約１９から約８３２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３２５ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１２９(配列番号：２２６)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３２５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３２５ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１３０(配列番号：２２７)の残基１又は
約１９から８３２を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３０(配列番号：２２７)のアミノ酸残基１
又は約１９から約８３２に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２５ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３０(配列番号：２２７)の残基１又は
約１９から８３２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２５ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３０(配列番号：２２７)のアミノ
酸残基１又は約１９から約８３２の配列、又はその抗-ＰＲＯ１３２５抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２５ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１３２５断片は、天然ＰＲＯ１３２５ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
３０(配列番号：２２７)のアミノ酸残基約１又は約１９から約８３２の配列を有
するＰＲＯ１３２５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。

【０２０８】 ６６． ＰＲＯ１３４０ 本出願において「ＰＲＯ１３４０」と命名され、Ｋｓｐ-カドヘリンに相同性
を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６６６３
−１５９８）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３４０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１３２(配列番号：２２９)のア
ミノ酸残基１又は約１９から約８０７の配列を有するＰＲＯ１３４０ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３１（配列番号：２２８)の残基約１８２
から約２５４８の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３４
０ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２６８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６６３−１５９８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２６８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６６３−１５９８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１３２(配列番号：２２９)の
アミノ酸残基約１９から約８０７の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１３２(配列
番号：２２９)のアミノ酸残基約１９から約８０７の配列を有するＰＲＯ１３４
０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２０９】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３４０ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１３２（配列番号：２２９）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約１８まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
３４０アミノ酸配列（Ｆｉｇ１３２、配列番号：２２９）のアミノ酸位置約７６
２からアミノ酸位置約７８４まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１３２(配列番号：２２９)の残基約１
９から約８０７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単
離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３４０ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１２７(配列番号：２２４)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。

【０２１０】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３４０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３４０ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１３２(配列番号：２２９)の残基約１９
から８０７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３２(配列番号：２２９)のアミノ酸残基約
１９から約８０７に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、
好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０
％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３４０ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３２(配列番号：２２９)の残基１９か
ら８０７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３４０ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３２(配列番号：２２９)のアミノ
酸残基１９から約８０７の配列、又はその抗-ＰＲＯ１３４０抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３４０ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１３４０断片は、天然ＰＲＯ１３４０ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
３２(配列番号：２２９)のアミノ酸残基約１９から約８０７の配列を有するＰＲ
Ｏ１３４０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３４０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３４０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３４０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３４０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３４０ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２１１】 ６７． ＰＲＯ１３３９ 本出願において「ＰＲＯ１３３９」と命名され、カルボキシペプシーゼと配列
同一性を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６
６６９−１５９７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３３９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１３４(配列番号：２３４)のア
ミノ酸残基１又は約１７から約４２１の配列を有するＰＲＯ１３３９ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３３（配列番号：２３３)の残基約５８か
ら約１２７１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３３９
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６６９−１５９７）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６６９−１５９７）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１３４(配列番号：２３４)の
アミノ酸残基約１７から約４２１の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１３４(配列
番号：２３４)のアミノ酸残基約１７から約４２１の配列を有するＰＲＯ１３３
９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは１００ヌクレオチド
を有する単離された核酸分子に関する。

【０２１２】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１３４(配列番号：２３４)の残基約１
７から約４２１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単
離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３３９ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３３９ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３３９ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１３４(配列番号：２３４)の残基１７か
ら４２１を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３４(配列番号：２３４)のアミノ酸残基１
７から約４２１に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３３９ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３４(配列番号：２３４)の残基１７か
ら４２１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３３９ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３４(配列番号：２３４)のアミノ
酸残基１７から約４２１の配列、又はその抗-ＰＲＯ１３３９抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３３９ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１３３９断片は、天然ＰＲＯ１３３９ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
３４(配列番号：２３４)のアミノ酸残基約１７から約４２１の配列を有するＰＲ
Ｏ１３３９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３３９ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３３９抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３３９ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３３９ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３３９ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２１３】 ６８． ＰＲＯ１３３７ 本出願において「ＰＲＯ１３３７」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６６７２−１５８６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３３７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１３６(配列番号：２３６)のア
ミノ酸残基約１又は約２１から約４１７の配列を有するＰＲＯ１３３７ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３５（配列番号：２３５)の残基約１２０
から約１３１０の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３３
７ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２６５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６７２−１５８６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２６５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６７２−１５８６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。

【０２１４】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１３６(配列番号：２３６)の
アミノ酸残基１又は約２１から約４１７の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１３６(配列
番号：２３６)のアミノ酸残基約２１から約４１７の配列を有するＰＲＯ１３３
７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは約１００ヌクレオチ
ドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３３７ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１３６（配列番号：２３６）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約２０まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１３６(配列番号：２３６)の残基１又
は２１から約４１７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含
む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３３７ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１２７(配列番号：２２４)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３３７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３３７ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１３６(配列番号：２３６)の残基１又は
２１から４１７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３６(配列番号：２３６)のアミノ酸残基２
１から約４１７に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３３７ポリペプチドに関する。

【０２１５】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３６(配列番号：２３６)の残基２１か
ら４１７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３３７ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３６(配列番号：２３６)のアミノ
酸残基２１から約４１７の配列、又はその抗-ＰＲＯ１３３７抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３３７ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１３３７断片は、天然ＰＲＯ１３３７ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
３６(配列番号：２３６)のアミノ酸残基約２１から約４１７の配列を有するＰＲ
Ｏ１３３７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３３７ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３３７抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３３７ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３３７ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３３７ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２１６】 ６９． ＰＲＯ１３４２ 本出願において「ＰＲＯ１３４２」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６６７４−１５９９）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３４２ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１３８(配列番号：２４３)のア
ミノ酸残基１又は約２１から約５９６の配列を有するＰＲＯ１３４２ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３７（配列番号：２４２)の残基約２９９
から約２０２６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３４
２ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６７４−１５９９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６７４−１５９９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１３８(配列番号：２４３)の
アミノ酸残基約２１から約５９６の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１３８(配列
番号：２４３)のアミノ酸残基約２１から約５９６の配列を有するＰＲＯ１３４
２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２１７】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３４２ポリペプチド、及びその可溶化（即
ち、膜貫通ドメイン欠失又は不活性化）変異体をコードするＤＮＡを含む単離さ
れた核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。
シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１３８（配列番号：２４３）のアミノ酸位置１から
アミノ酸位置約２０まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲ
Ｏ１３４２アミノ酸配列（Ｆｉｇ１３８、配列番号：２４３）のアミノ酸位置約
５１０からアミノ酸位置約５３２まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１３８(配列番号：２４３)の残基２１
から約５９６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３４２ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３４２ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３４２ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１３８(配列番号：２４３)の残基２１か
ら５９６を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３８(配列番号：２４３)のアミノ酸残基２
１から約５９６に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３４２ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３８(配列番号：２４３)の残基２１か
ら５９６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３４２ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３８(配列番号：２４３)のアミノ
酸残基２１から約５９６の配列、又はその抗-ＰＲＯ１３４２抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３４２ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１３４２断片は、天然ＰＲＯ１３４２ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
３８(配列番号：２４３)のアミノ酸残基約２１から約５９６の配列を有するＰＲ
Ｏ１３４２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。

【０２１８】 ７０． ＰＲＯ１３４３ 本出願において「ＰＲＯ１３４３」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６６７５−１５８７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３４３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１４０(配列番号：２４８)のア
ミノ酸残基約１又は約２６から約２４７の配列を有するＰＲＯ１３４３ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１３９（配列番号：２４７)の残基約７１又
は約１４６から約８１１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲ
Ｏ１３４３ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは
、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６７５−１５８７）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６７５−１５８７）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１４０(配列番号：２４８)の
アミノ酸残基１又は約２６から約２４７の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。

【０２１９】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１４０(配列
番号：２４８)のアミノ酸残基１又は約２６から約２４７の配列を有するＰＲＯ
１３４３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約１００ヌクレオチドを有する単離された核酸
分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３４３ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１４０（配列番号：２４８）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約２５まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１４０(配列番号：２４８)の残基１又
は約２６から約２４７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３４３ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１３９(配列番号：２４７)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。

【０２２０】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３４３ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３４３ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１４０(配列番号：２４８)の残基１又は
約２６から２４７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４０(配列番号：２４８)のアミノ酸残基１
又は約２６から約２４７に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３４３ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４０(配列番号：２４８)の残基１又は
約２６から２４７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３４３ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４０(配列番号：２４８)のアミノ
酸残基１又は約２６から約２４７の配列、又はその抗-ＰＲＯ１３４３抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３４３ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１３４３断片は、天然ＰＲＯ１３４３ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
４０(配列番号：２４８)のアミノ酸残基約１又は約２６から約２４７の配列を有
するＰＲＯ１３４３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。

【０２２１】 ７１． ＰＲＯ１４８０ 本出願において「ＰＲＯ１４８０」と命名され、セマホリンＣに相同性を有す
る新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６７９６２−１６
４９）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４８０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１４２(配列番号：２５３)のア
ミノ酸残基約１から約８３７の配列を有するＰＲＯ１４８０ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４１（配列番号：２５２)の残基約２４１
から約２７５１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４８
０ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２９１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６７９６２−１６４９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２９１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６７９６２−１６４９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１４２(配列番号：２５３)の
アミノ酸残基約１から約８３７の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる単
離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１４２(配列
番号：２５３)のアミノ酸残基約１から約８３７の配列を有するＰＲＯ１４８０
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２２２】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４８０ポリペプチド、及びその可溶化（即
ち、膜貫通ドメイン欠失又は不活性化）変異体をコードするＤＮＡを含む単離さ
れた核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。
シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１４２（配列番号：２５３）のアミノ酸位置２３か
らアミノ酸位置約４６（Ｉ型）及びアミノ酸位置約７１８からアミノ酸位置約７
３８まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１４２(配列番号：２５３)の残基１か
ら約８３７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４８０ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１２７(配列番号：２５２)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４８０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４８０ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１４２(配列番号：２５３)の残基１から
８３７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４２(配列番号：２５３)のアミノ酸残基１
から約８３７に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８０ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４２(配列番号：２５３)の残基１から
８３７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８０ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４２(配列番号：２５３)のアミノ
酸残基１から約８３７の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４８０抗体に結合するのに
十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８０ポリペプチドに関する。好
ましくは、このＰＲＯ１４８０断片は、天然ＰＲＯ１４８０ポリペプチドの質的
な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
４２(配列番号：２５３)のアミノ酸残基約１から約８３７の配列を有するＰＲＯ
１４８０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４８０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４８０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４８０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４８０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４８０ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２２３】 ７２． ＰＲＯ１４８７ 本出願において「ＰＲＯ１４８７」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６８８３６−１６５６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４８７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１４４(配列番号：２６０)のア
ミノ酸残基１又は約２４から約８０２の配列を有するＰＲＯ１４８７ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４３Ａ-Ｂ（配列番号：２５９)の残基約５
５８から約２８９４の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１
４８７ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハ
イブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８３６−１６５６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８３６−１６５６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１４４(配列番号：２６０)の
アミノ酸残基約２４から約８０２の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１４４(配列
番号：２６０)のアミノ酸残基約２４から約８０２の配列を有するＰＲＯ１４８
７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２２４】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４８７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１４４（配列番号：２６０）のアミノ酸
位置１からアミノ酸位置約２３まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１４４(配列番号：２６０)の残基２４
から約８０２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４８７ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４８７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４８７ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１４４(配列番号：２６０)の残基２４か
ら８０２を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４４(配列番号：２６０)のアミノ酸残基２
４から約８０２に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８７ポリペプチドに関する。

【０２２５】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４４(配列番号：２６０)の残基２４か
ら８０２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８７ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４４(配列番号：２６０)のアミノ
酸残基２４から約８０２の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４８７抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８７ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１４８７断片は、天然ＰＲＯ１４８７ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
４４(配列番号：２６０)のアミノ酸残基約２４から約８０２の配列を有するＰＲ
Ｏ１４８７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４８７ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４８７抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４８７ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４８７ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４８７ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２２６】 ７３． ＰＲＯ１４１８ 本出願において「ＰＲＯ１４１８」と命名され、新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６８８６４−１６２９）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４１８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１４６(配列番号：２６５)のア
ミノ酸残基約１又は約２０から約３５０の配列を有するＰＲＯ１４１８ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４５（配列番号：２６４)の残基約１９５
から約１１８７の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４１
８ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８６４−１６２９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８６４−１６２９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１４６(配列番号：２６５)の
アミノ酸残基約２０から約３５０の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１４６(配列
番号：２６５)のアミノ酸残基約２０から約３５０の配列を有するＰＲＯ１４１
８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２２７】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１４６(配列番号：２６５)の残基２０
から約３５０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４１８ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１４５(配列番号：２６４)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４１８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４１８ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１４６(配列番号：２６５)の残基２０か
ら３５０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４６(配列番号：２６５)のアミノ酸残基２
０から約３５０に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４１８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４６(配列番号：２６５)の残基２０か
ら３５０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４１８ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４６(配列番号：２６５)のアミノ
酸残基２０から約３５０の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４１８抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４１８ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１４１８断片は、天然ＰＲＯ１４１８ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
４６(配列番号：２６５)のアミノ酸残基１又は約２０から約３５０の配列を有す
るＰＲＯ１４１８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４１８ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４１８抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４１８ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４１８ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４１８ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２２８】 ７４． ＰＲＯ１４７２ 本出願において「ＰＲＯ１４７２」と命名され、ブチロフィリン(butyrophili
n)と配列同一性を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（Ｄ
ＮＡ６８８６６−１６４４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４７２ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１４８(配列番号：２６７)のア
ミノ酸残基約１又は約１８から約４６６の配列を有するＰＲＯ１４７２ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４７（配列番号：２６６)の残基約１８５
から約１５３１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４７
２ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８６６−１６４４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８６６−１６４４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１４８(配列番号：２６７)の
アミノ酸残基約１８から約４６６の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１４８(配列
番号：２６７)のアミノ酸残基約１８から約４６６の配列を有するＰＲＯ１４７
２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２２９】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４７２ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１４８（配列番号：２６７）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約１−１７まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲ
Ｏ１４７２アミノ酸配列（Ｆｉｇ１４８、配列番号：２６７）のアミノ酸位置約
１３１からアミノ酸位置約１５０、及びアミノ酸位置約２３５からアミノ酸位置
約２５９まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１４８(配列番号：２６７)の残基１８
から約４６６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４７２ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。

【０２３０】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４７２ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４７２ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１４８(配列番号：２６７)の残基１８か
ら４６６を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４８(配列番号：２６７)のアミノ酸残基１
８から約４６６に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４７２ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４８(配列番号：２６７)の残基１８か
ら４６６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４７２ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４８(配列番号：２６７)のアミノ
酸残基１８から約４６６の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４７２抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４７２ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１４７２断片は、天然ＰＲＯ１４７２ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
４８(配列番号：２６７)のアミノ酸残基約１８から約４６６の配列を有するＰＲ
Ｏ１４７２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４７２ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４７２抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４７２ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４７２ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４７２ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２３１】 ７５． ＰＲＯ１４６１ 本出願において「ＰＲＯ１４６１」と命名され、セリンプロテアーゼと相同性
を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６８８７１
−１６３８）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４６１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１５０(配列番号：２６９)のア
ミノ酸残基約１から約４２３の配列を有するＰＲＯ１４６１ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１４９（配列番号：２６８)の残基約３２か
ら約１３００の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４６１
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８７１−１６３８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８７１−１６３８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１５０(配列番号：２６９)の
アミノ酸残基約１から約４２３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる単
離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１５０(配列
番号：２６９)のアミノ酸残基約１から約４２３の配列を有するＰＲＯ１４６１
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２３２】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４６１ポリペプチド、及びその可溶化（即
ち、膜貫通ドメイン欠失又は不活性化）変異体をコードするＤＮＡを含む単離さ
れた核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。
ＩＩ型膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１４６１アミノ酸配列（Ｆｉｇ１５０、配列番
号：２６９）のアミノ酸位置約２１からアミノ酸位置約４０まで伸びるものとし
て仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１５０(配列番号：２６９)の残基１か
ら約４２３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４６１ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１４９(配列番号：２６８)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４６１ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４６１ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１５０(配列番号：２６９)の残基１から
４２３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５０(配列番号：２６９)のアミノ酸残基１
から約４２３に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４６１ポリペプチドに関する。

【０２３３】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５０(配列番号：２６９)の残基１から
４２３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１４６１ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５０(配列番号：２６９)のアミノ
酸残基１から約４２３の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４６１抗体に結合するのに
十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４６１ポリペプチドに関する。好
ましくは、このＰＲＯ１４６１断片は、天然ＰＲＯ１４６１ポリペプチドの質的
な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
５０(配列番号：２６９)のアミノ酸残基約１から約４２３の配列を有するＰＲＯ
１４６１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４６１ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４６１抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４６１ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４６１ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４６１ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２３４】 ７６． ＰＲＯ１４１０ 本出願において「ＰＲＯ１４１０」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６８８７４−１６２２）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４１０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１５２(配列番号：２７１)のア
ミノ酸残基約１又は約２１から約２３８の配列を有するＰＲＯ１４１０ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５１（配列番号：２７０)のヌクレオチド
約１５２又は約２１２から約８６５の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡ
を含むＰＲＯ１４１０ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。
好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こ
る。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８７４−１６２２）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８７４−１６２２）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１５２(配列番号：２７１)の
アミノ酸残基１又は約２１から約２３８の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１５２(配列
番号：２７１)のアミノ酸残基１又は約２１から約２３８の配列を有するＰＲＯ
１４１０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約１００ヌクレオチドを有する単離された核酸
分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４１０ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１５２（配列番号：２７１）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約２０まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
４１０アミノ酸配列（Ｆｉｇ１５２、配列番号：２７１）のアミノ酸位置約１９
４からアミノ酸位置約２２０まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１５２(配列番号：２７１)の残基１又
は約２１から約２３８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４１０ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１５１(配列番号：２７０)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。

【０２３５】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４１０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４１０ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１５２(配列番号：２７１)の残基１又は
約２１から２３８を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５２(配列番号：２７１)のアミノ酸残基１
又は約２１から約２３８に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４１０ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５２(配列番号：２７１)の残基１又は
約２１から２３８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４１０ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５２(配列番号：２７１)のアミノ
酸残基１又は約２１から約２３８の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４１０抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４１０ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１４１０断片は、天然ＰＲＯ１４１０ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
５２(配列番号：２７１)のアミノ酸残基約１又は約２１から約２３８の配列を有
するＰＲＯ１４１０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４１０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４１０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４１０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４１０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４１０ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２３６】 ７７． ＰＲＯ１５６８ 本出願において「ＰＲＯ１５６８」と命名され、テトラスパン(tetraspans)と
配列同一性を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ
６８８８０−１６７６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５６８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１５４(配列番号：２７３)のア
ミノ酸残基約１又は約３４から約３０５の配列を有するＰＲＯ１５６８ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５３（配列番号：２７２)の残基約３０７
から約１１２２の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５６
８ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８８０−１６７６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８８０−１６７６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１５４(配列番号：２７３)の
アミノ酸残基約３４から約３０５の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１５４(配列
番号：２７３)のアミノ酸残基約３４から約３０５の配列を有するＰＲＯ１５６
８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２３７】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５６８ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１５４（配列番号：２７３）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約３３まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
５６８アミノ酸配列（Ｆｉｇ１５４、配列番号：２７３）のおよそのアミノ酸１
２−３５、５７−８６、９４−１１４及び２２６−２４８まで伸びるものとして
仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１５４(配列番号：２７３)の残基３４
から約３０５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５６８ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１５３(配列番号：２７２)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５６８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５６８ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１５４(配列番号：２７３)の残基３４か
ら３０５を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０２３８】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５４(配列番号：２７３)のアミノ酸残基３
４から約３０５に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５４(配列番号：２７３)の残基３４か
ら約３０５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配
列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６８ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５４(配列番号：２７３)のアミノ
酸残基３４から３０５の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５６８抗体に結合するのに
十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６８ポリペプチドに関する。好
ましくは、このＰＲＯ１５６８断片は、天然ＰＲＯ１５６８ポリペプチドの質的
な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
５４(配列番号：２７３)のアミノ酸残基約３４から約３０５の配列を有するＰＲ
Ｏ１５６８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５６８ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５６８抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５６８ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５６８ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５６８ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２３９】 ７８． ＰＲＯ１５７０ 本出願において「ＰＲＯ１５７０」と命名され、ＳＰ６０と配列同一性を有す
る新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６８８８５−１６
７８）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５７０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１５６(配列番号：２７５)のア
ミノ酸残基約１から約４３２の配列を有するＰＲＯ１５７０ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５５（配列番号：２７４)の残基約２１０
から約１５０５の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５７
０ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８８５−１６７８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６８８８５−１６７８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１５６(配列番号：２７５)の
アミノ酸残基約１から約４３２の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる単
離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１５６(配列
番号：２７５)のアミノ酸残基約１から約４３２の配列を有するＰＲＯ１５７０
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 好ましい実施態様では、ここに提供されるプローブは、Ｆｉｇ１に特定するペ
プチドのアミノ末端からであり、配列番号：２７５のアミノ酸１−１９９として
定義される。 特別な態様では、本発明は、分泌された又は可溶化された形態の、即ち膜貫通
ドメイン欠失又は不活性化変異体のＰＲＯ１５７０ポリペプチドをコードするＤ
ＮＡを含む単離された核酸分子を提供する。

【０２４０】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１５６(配列番号：２７５)の残基１か
ら約４３２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５７０ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１５５(配列番号：２７４)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。好ましくは、プローブは、ここに提供されるアミノ末
端からである。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５７０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５７０ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１５６(配列番号：２７５)の残基１から
４３２を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５６(配列番号：２７５)のアミノ酸残基１
から約４３２に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７０ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５６(配列番号：２７５)の残基１から
４３２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７０ポリペプチドに関する。

【０２４１】 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５６(配列番号：２７５)のアミノ
酸残基１から約４３２の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５７０抗体に結合するのに
十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７０ポリペプチドに関する。好
ましくは、このＰＲＯ１５７０断片は、天然ＰＲＯ１５７０ポリペプチドの質的
な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
５６(配列番号：２７５)のアミノ酸残基約１から約４３２の配列を有するＰＲＯ
１５７０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５７０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５７０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５７０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５７０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５７０ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２４２】 ７９． ＰＲＯ１３１７ 本出願において「ＰＲＯ１３１７」と命名され、セマホリンＢに相同性を有す
る新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７１１６６−１６
８５）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３１７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１５８(配列番号：２７７)のア
ミノ酸残基１又は約３１から約７６１の配列を有するＰＲＯ１３１７ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５７（配列番号：２７６)の残基約１９５
から約２３８７の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３１
７ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１１６６−１６８５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１１６６−１６８５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１５８(配列番号：２７７)の
アミノ酸残基約３１から約７６１の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１５８(配列
番号：２７７)のアミノ酸残基約３１から約７６１の配列を有するＰＲＯ１３１
７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３１７ポリペプチド、及びその可溶化（即
ち、膜貫通ドメイン欠失又は不活性化）変異体をコードするＤＮＡを含む単離さ
れた核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。
シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１５８（配列番号：２７７）のアミノ酸位置１から
アミノ酸位置約３０まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲ
Ｏ１３１７アミノ酸配列（Ｆｉｇ１５８、配列番号：２７７）のおよそのアミノ
酸１３−３１、１３６−１５６、２２２−２４７、４７４−４９０、及び６８５
−７０４まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１５８(配列番号：２７７)の残基３１
から約７６１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。

【０２４３】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３１７ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３１７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３１７ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１５８(配列番号：２７７)の残基３１か
ら７６１を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５８(配列番号：２７７)のアミノ酸残基３
１から約７６１に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３１７ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５８(配列番号：２７７)の残基３１か
ら７６１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３１７ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５８(配列番号：２７７)のアミノ
酸残基３１から約７６１の配列、又はその抗-ＰＲＯ１３１７抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３１７ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１３１７断片は、天然ＰＲＯ１３１７ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
５８(配列番号：２７７)のアミノ酸残基約３１から約７６１の配列を有するＰＲ
Ｏ１３１７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３１７ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３１７抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３１７ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３１７ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３１７ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２４４】 ８０． ＰＲＯ１７８０ 本出願において「ＰＲＯ１７８０」と命名され、グルクロノシルトランスフェ
ラーゼと相同性を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（Ｄ
ＮＡ７１１６９−１７０９）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１７８０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１６０(配列番号：２８２)のア
ミノ酸残基１又は約２０から約５２３の配列を有するＰＲＯ１７８０ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１５９（配列番号：２８１)の残基約１２５
から約１６３６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１７８
０ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１１６９−１７０９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１１６９−１７０９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１６０(配列番号：２８２)の
アミノ酸残基約２０から約５２３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。

【０２４５】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１６０(配列
番号：２８２)のアミノ酸残基約２０から約５２３の配列を有するＰＲＯ１７８
０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１７８０ポリペプチド、及びその可溶化（即
ち、膜貫通ドメイン欠失又は不活性化）変異体をコードするＤＮＡを含む単離さ
れた核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。
シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１６０（配列番号：２８２）のアミノ酸位置１から
アミノ酸位置約１９まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲ
Ｏ１７８０アミノ酸配列（Ｆｉｇ１６０、配列番号：２８２）のアミノ酸位置約
４８３からアミノ酸位置約５０４まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１６０(配列番号：２８２)の残基２０
から約５２３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１７８０ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１７８０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１７８０ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１６０(配列番号：２８２)の残基２０か
ら５２３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６０(配列番号：２８２)のアミノ酸残基２
０から約５２３に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８０ポリペプチドに関する。

【０２４６】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６０(配列番号：２８２)の残基２０か
ら５２３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８０ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６０(配列番号：２８２)のアミノ
酸残基２０から約５２３の配列、又はその抗-ＰＲＯ１７８０抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８０ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１７８０断片は、天然ＰＲＯ１７８０ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
６０(配列番号：２８２)のアミノ酸残基１又は約２０から約５２３の配列を有す
るＰＲＯ１７８０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１７８０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１７８０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１７８０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１７８０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１７８０ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２４７】 ８１． ＰＲＯ１４８６ 本出願において「ＰＲＯ１４８６」と命名され、セレベリンと配列同一性を有
する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７１１８０−１
６５５）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４８６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１６２(配列番号：２８７)のア
ミノ酸残基約１又は約３３から約２０５の配列を有するＰＲＯ１４８６ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６１（配列番号：２８６)の残基約５６８
から約１０８６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４８
６ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１１８０−１６５５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１１８０−１６５５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１６２(配列番号：２８７)の
アミノ酸残基約３３から約２０５の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１６２(配列
番号：２８７)のアミノ酸残基約３３から約２０５の配列を有するＰＲＯ１４８
６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２４８】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１６２(配列番号：２８７)の残基約３
３から約２０５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単
離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４８６ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１６１(配列番号：２８６)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４８６ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４８６ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１６２(配列番号：２８７)の残基３３か
ら２０５を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６２(配列番号：２８７)のアミノ酸残基３
３から約２０５に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８６ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６２(配列番号：２８７)の残基３３か
ら２０５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８６ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６２(配列番号：２８７)のアミノ
酸残基３３から約２０５の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４８６抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８６ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１４８６断片は、天然ＰＲＯ１４８６ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
６２(配列番号：２８７)のアミノ酸残基約３３から約２０５の配列を有するＰＲ
Ｏ１４８６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４８６ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４８６抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４８６ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４８６ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４８６ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２４９】 ８２． ＰＲＯ１４３３ 本出願において「ＰＲＯ１４３３」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７１１８４−１６３４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４３３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１６４(配列番号：２９２)のア
ミノ酸残基約１から約３８８の配列を有するＰＲＯ１４３３ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６３（配列番号：２９１)のヌクレオチド
約１８５から約１３４８の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲ
Ｏ１４３３ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは
、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２６６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１１８４−１６３４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２６６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１１８４−１６３４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。

【０２５０】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１６４(配列番号：２９２)の
アミノ酸残基１から約３８８の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる単離
された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１６４(配列
番号：２９２)のアミノ酸残基１から約３８８の配列を有するＰＲＯ１４３３ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも約２５０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関す
る。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４３３ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。膜貫
通ドメインは、ＰＲＯ１４３３アミノ酸配列（Ｆｉｇ１６４、配列番号：２９２
）のアミノ酸位置約７６からアミノ酸位置約９７まで伸びるものとして仮に同定
されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１６４(配列番号：２９２)の残基１か
ら約３８８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４３３ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１６３(配列番号：２９１)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４３３ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４３３ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１６４(配列番号：２９２)の残基１から
約３８８を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０２５１】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６４(配列番号：２９２)のアミノ酸残基１
から約３８８に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４３３ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６４(配列番号：２９２)の残基１から
約３８８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４３３ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６４(配列番号：２９２)のアミノ
酸残基１又は１から約３８８の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４３３抗体に結合す
るのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４３３ポリペプチドに関す
る。好ましくは、このＰＲＯ１４３３断片は、天然ＰＲＯ１４３３ポリペプチド
の質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
６４(配列番号：２９２)のアミノ酸残基約１から約３８８の配列を有するＰＲＯ
１４３３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４３３ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４３３抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４３３ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４３３ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４３３ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２５２】 ８３． ＰＲＯ１４９０ 本出願において「ＰＲＯ１４９０」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する、１-アシル-ｓｎ-グリセロール-３-ホスフェートアシルトランスフェラー
ゼタンパク質をコードする核酸と相同性を有するｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７１
２１３−１６５９）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４９０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１６６(配列番号：２９７)のア
ミノ酸残基約１又は約２６から約３６８の配列を有するＰＲＯ１４９０ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６５（配列番号：２９６)のヌクレオチド
約２７２又は約３４７から約１３７５の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮ
Ａを含むＰＲＯ１４９０ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する
。好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起
こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１２１３−１６５９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１２１３−１６５９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１６６(配列番号：２９７)の
アミノ酸残基１又は約２６から約３６８の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１６６(配列
番号：２９７)のアミノ酸残基１又は約２６から約３６８の配列を有するＰＲＯ
１４９０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約２５８ヌクレオチドを有する単離された核酸
分子に関する。

【０２５３】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４９０ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１６６（配列番号：２９７）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約２５まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
４９０アミノ酸配列（Ｆｉｇ１６６、配列番号：２９７）のアミノ酸位置約３０
７からアミノ酸位置約３２３、及びアミノ酸位置約３３５からアミノ酸位置約３
５２まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１６６(配列番号：２９７)の残基１又
は約２６から約３６８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４９０ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１６５(配列番号：２９６)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４９０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４９０ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１６６(配列番号：２９７)の残基１又は
約２６から３６８を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６６(配列番号：２９７)のアミノ酸残基１
又は約２６から約３６８に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４９０ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６６(配列番号：２９７)の残基１又は
約２６から３６８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４９０ポリペプチドに関する。

【０２５４】 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６６(配列番号：２９７)のアミノ
酸残基１又は約２６から約３６８の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４９０抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４９０ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１４９０断片は、天然ＰＲＯ１４９０ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
６６(配列番号：２９７)のアミノ酸残基１又は約２６から約３６８の配列を有す
るＰＲＯ１４９０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４９０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４９０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４９０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４９０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４９０ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２５５】 ８４． ＰＲＯ１４８２ 本出願において「ＰＲＯ１４８２」と命名され、新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７１２３４−１６５１）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４８２ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１６８(配列番号：３０２)のア
ミノ酸残基約１又は約２９から約１４３の配列を有するＰＲＯ１４８２ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６７（配列番号：３０１)のヌクレオチド
約３３又は約１１７から約４６１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを
含むＰＲＯ１４８２ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好
ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる
。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１２３４−１６５１）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１２３４−１６５１）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１６８(配列番号：３０２)の
アミノ酸残基１又は約２９から約１４３の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１６８(配列
番号：３０２)のアミノ酸残基１又は約２９から約１４３の配列を有するＰＲＯ
１４８２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約２６０ヌクレオチドを有する単離された核酸
分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４８２ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１６８（配列番号：３０２）のアミノ酸
位置１からアミノ酸位置約２８まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１６８(配列番号：３０２)の残基１又
は約２９から約１４３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。

【０２５６】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４８２ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１６７(配列番号：３０１)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４８２ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４８２ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１６８(配列番号：３０２)の残基１又は
約２９から１４３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６８(配列番号：３０２)のアミノ酸残基１
又は約２９から約１４３に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８２ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６８(配列番号：３０２)の残基１又は
約２９から１４３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８２ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６８(配列番号：３０２)のアミノ
酸残基１又は約２９から約１４３の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４８２抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８２ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１４８２断片は、天然ＰＲＯ１４８２ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
６８(配列番号：３０２)のアミノ酸残基約１又は約２９から約１４３の配列を有
するＰＲＯ１４８２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４８２ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４８２抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４８２ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４８２ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４８２ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２５７】 ８５． ＰＲＯ１４４６ 本出願において「ＰＲＯ１４４６」と命名され、新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７１２７７−１６３６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４４６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１７０(配列番号：３０４)のア
ミノ酸残基約１又は約１６から約１０９の配列を有するＰＲＯ１４４６ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１６９（配列番号：３０３)の残基約１９７
から約４７８の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４４６
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１２７７−１６３６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１２７７−１６３６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１７０(配列番号：３０４)の
アミノ酸残基約１６から約１０９の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１７０(配列
番号：３０４)のアミノ酸残基約１６から約１０９の配列を有するＰＲＯ１４４
６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２５８】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１７０(配列番号：３０４)の残基１６
から約１０９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４４６ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４４６ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４４６ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１７０(配列番号：３０４)の残基１６か
ら１０９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７０(配列番号：３０４)のアミノ酸残基１
６から約１０９に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４４６ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７０(配列番号：３０４)の残基１６か
ら１０９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４４６ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７０(配列番号：３０４)のアミノ
酸残基１６から約１０９の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４４６抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４４６ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１４４６断片は、天然ＰＲＯ１４４６ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。

【０２５９】 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
７０(配列番号：３０４)のアミノ酸残基約１６から約１０９の配列を有するＰＲ
Ｏ１４４６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４４６ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４４６抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４４６ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４４６ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４４６ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２６０】 ８６． ＰＲＯ１５５８ 本出願において「ＰＲＯ１５５８」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する、メチルトランスフェラーゼ酵素をコードする核酸と相同性を有するｃＤＮ
Ａクローン（ＤＮＡ７１２８２−１６６８）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５５８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１７２(配列番号：３０６)のア
ミノ酸残基約１又は約２６から約２６２の配列を有するＰＲＯ１５５８ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７１（配列番号：３０５)のヌクレオチド
約８４又は約１５９から約８６９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを
含むＰＲＯ１５５８ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好
ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる
。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１２８２−１６６８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１２８２−１６６８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１７２(配列番号：３０６)の
アミノ酸残基１又は約２６から約２６２の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１７２(配列
番号：３０６)のアミノ酸残基１又は約２６から約２６２の配列を有するＰＲＯ
１５５８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも１００ヌクレオチドを有する単離された核酸分
子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５５８ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１７２（配列番号：３０６）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約２５まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
５５８アミノ酸配列（Ｆｉｇ１７２、配列番号：３０６）のアミノ酸位置約８か
らアミノ酸位置約３０、及びアミノ酸位置約１０９からアミノ酸位置約１３０ま
で伸びるものとして仮に同定されている。

【０２６１】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１７２(配列番号：３０６)の残基１又
は約２６から約２６２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５５８ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１７１(配列番号：３０５)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５５８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５５８ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１７２(配列番号：３０６)の残基１又は
約２６から２６２を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７２(配列番号：３０６)のアミノ酸残基１
又は約２６から約２６２に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５８ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７２(配列番号：３０６)の残基１又は
約２６から約２６２のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのア
ミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５８ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７２(配列番号：３０６)のアミノ
酸残基１又は約２６から約２６２の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５５８抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５８ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１５５８断片は、天然ＰＲＯ１５５８ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
７２(配列番号：３０６)のアミノ酸残基約１又は約２６から約２６２の配列を有
するＰＲＯ１５５８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５５８ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５５８抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５５８ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５５８ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５５８ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２６２】 ８７． ＰＲＯ１６０４ 本出願において「ＰＲＯ１６０４」と命名され、肝癌-由来成長因子（ＨＤＧ
Ｆ）に相同性を有する新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮ
Ａ７１２８６−１６８７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１６０４ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１７４(配列番号：３０８)のア
ミノ酸残基１又は約１４から約６７１の配列を有するＰＲＯ１６０４ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７３（配列番号：３０７)の残基約１０４
から約２０７７の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１６０
４ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１２８６−１６８７）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１２８６−１６８７）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。

【０２６３】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１７４(配列番号：３０８)の
アミノ酸残基約１４から約６７１の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１７４(配列
番号：３０８)のアミノ酸残基約１４から約６７１の配列を有するＰＲＯ１６０
４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列を持っているか持っていな
いＰＲＯ１６０４ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子を
提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグナルペプチ
ドは、Ｆｉｇ１７４（配列番号：３０８）のアミノ酸位置１からアミノ酸位置約
１３まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１７４(配列番号：３０８)の残基１４
から約６７１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１６０４ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１６０４ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１６０４ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１７４(配列番号：３０８)の残基１４か
ら６７１を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０２６４】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７４(配列番号：３０８)のアミノ酸残基１
４から約６７１に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１６０４ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７４(配列番号：３０８)の残基１４か
ら６７１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１６０４ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７４(配列番号：３０８)のアミノ
酸残基１４から約６７１の配列、又はその抗-ＰＲＯ１６０４抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１６０４ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１６０４断片は、天然ＰＲＯ１６０４ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
７４(配列番号：３０８)のアミノ酸残基約１４から約６７１の配列を有するＰＲ
Ｏ１６０４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１６０４ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１６０４抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１６０４ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１６０４ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１６０４ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２６５】 ８８． ＰＲＯ１４９１ 本出願において「ＰＲＯ１４９１」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する、コラプシン(collapsin)をコードする核酸と相同性を有するｃＤＮＡクロ
ーン（ＤＮＡ７１８８３−１６６０）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４９１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１７６(配列番号：３１０)のア
ミノ酸残基約１又は約３７から約７７７の配列を有するＰＲＯ１４９１ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７５（配列番号：３０９)のヌクレオチド
約１０７又は約２１５から約２４３７の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮ
Ａを含むＰＲＯ１４９１ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する
。好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起
こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１８８３−１６６０）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７１８８３−１６６０）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１７６(配列番号：３１０)の
アミノ酸残基１又は約３７から約７７７の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１７６(配列
番号：３１０)のアミノ酸残基１又は約３７から約７７７の配列を有するＰＲＯ
１４９１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約１,６７０ヌクレオチドを有する単離された
核酸分子に関する。

【０２６６】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４９１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１７６（配列番号：３１０）のアミノ酸
位置１からアミノ酸位置約３６まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１７６(配列番号：３１０)の残基１又
は約３７から約７７７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４９１ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１７５(配列番号：３０９)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４９１ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４９１ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１７６(配列番号：３１０)の残基１又は
約３７から約７７７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７６(配列番号：３１０)のアミノ酸残基１
又は約３７から約７７７に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４９１ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７６(配列番号：３１０)の残基１又は
約３７から約７７７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジテ
ィブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約
９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのア
ミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４９１ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７６(配列番号：３１０)のアミノ
酸残基１又は約３７から約７７７の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４９１抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４９１ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１４９１断片は、天然ＰＲＯ１４９１ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
７６(配列番号：３１０)のアミノ酸残基１又は約３７から約７７７の配列を有す
るＰＲＯ１４９１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４９１ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４９１抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４９１ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４９１ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４９１ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２６７】 ８９． ＰＲＯ１４３１ 本出願において「ＰＲＯ１４３１」と命名され、新規なポリペプチドをコード
するＳＨ３と相同性を持つドメインを有するｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７３４０
１−１６３３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４３１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１７８(配列番号：３１５)のア
ミノ酸残基約１から約３７０の配列を有するＰＲＯ１４３１ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７７（配列番号：３１４)の残基約１から
約１３３５及び約１５６０から約３９３４の核酸の補体にハイブリッド形成する
ＤＮＡを含むＰＲＯ１４３１ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関
する。好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下
で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３４０１−１６３３）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３４０１−１６３３）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。

【０２６８】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１７８(配列番号：３１５)の
アミノ酸残基約１から約３７０の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる単
離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１７８(配列
番号：３１５)のアミノ酸残基約１から約３７０の配列を有するＰＲＯ１４３１
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約１５ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関す
る。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１７８(配列番号：３１５)の残基１か
ら約３７０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４３１ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４３１ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１７８(配列番号：３１５)の残基１から
３７０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７８(配列番号：３１５)のアミノ酸残基１
から約３７０に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４３１ポリペプチドに関する。

【０２６９】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７８(配列番号：３１５)の残基１から
３７０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１４３１ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７８(配列番号：３１５)のアミノ
酸残基１から約３７０の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４３１抗体に結合するのに
十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４３１ポリペプチドに関する。好
ましくは、このＰＲＯ１４３１断片は、天然ＰＲＯ１４３１ポリペプチドの質的
な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
７８(配列番号：３１５)のアミノ酸残基約１から約３７０の配列を有するＰＲＯ
１４３１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４３１ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４３１抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４３１ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４３１ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４３１ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２７０】 ９０． ＰＲＯ１５６３ 本出願において「ＰＲＯ１５６３」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する、ＡＤＡＭＴＳ-１をコードする核酸と相同性を有するｃＤＮＡクローン（
ＤＮＡ７３４９２−１６７１）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５６３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１８０(配列番号：３１７)のア
ミノ酸残基約１又は約４９から約８３７の配列を有するＰＲＯ１５６３ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１７９Ａ-Ｂ（配列番号：３１６)のヌクレオ
チド約４１９又は約５６３から約２９２９の核酸の補体にハイブリッド形成する
ＤＮＡを含むＰＲＯ１５６３ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関
する。好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下
で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２４のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３４９２−１６７１）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２４のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３４９２−１６７１）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１８０(配列番号：３１７)の
アミノ酸残基１又は約４９から約８３７の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１８０(配列
番号：３１７)のアミノ酸残基１又は約４９から約８３７の配列を有するＰＲＯ
１５６３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約１００ヌクレオチドを有する単離された核酸
分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５６３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１８０（配列番号：３１７）のアミノ酸
位置１からアミノ酸位置約４８まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１８０(配列番号：３１７)の残基１又
は約４９から約８３７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。

【０２７１】 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５６３ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１７９Ａ-Ｂ(配列番号：３１６)に示すヌ
クレオチド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５６３ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５６３ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１８０(配列番号：３１７)の残基１又は
約４９から８３７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８０(配列番号：３１７)のアミノ酸残基１
又は約４９から約８３７に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６３ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８０(配列番号：３１７)の残基１又は
約４９から８３７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６３ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８０(配列番号：３１７)のアミノ
酸残基１又は約４９から約８３７の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５６３抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６３ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１５６３断片は、天然ＰＲＯ１５６３ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
８０(配列番号：３１７)のアミノ酸残基約１又は約４９から約８３７の配列を有
するＰＲＯ１５６３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５６３ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５６３抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５６３ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５６３ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５６３ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２７２】 ９１． ＰＲＯ１５６５ 本出願において「ＰＲＯ１５６５」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する、コンドロモジュリンタンパク質をコードする核酸と相同性を有するｃＤＮ
Ａクローン（ＤＮＡ７３７２７−１６７３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５６５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１８２(配列番号：３２２)のア
ミノ酸残基約１又は約４１から約３１７の配列を有するＰＲＯ１５６５ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８１（配列番号：３２１)のヌクレオチド
約５９又は約１７９から約１００９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡ
を含むＰＲＯ１５６５ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。
好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こ
る。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７２７−１６７３）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７２７−１６７３）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。

【０２７３】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１８２(配列番号：３２２)の
アミノ酸残基１又は約４１から約３１７の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１８２(配列
番号：３２２)のアミノ酸残基１又は約４１から約３１７の配列を有するＰＲＯ
１５６５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約４１０ヌクレオチドを有する単離された核酸
分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５６５ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１８２（配列番号：３２２）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約４０まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
５６５アミノ酸配列（Ｆｉｇ１８２、配列番号：３２２）のアミノ酸位置約２５
からアミノ酸位置約４７まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１８２(配列番号：３２２)の残基１又
は約４１から約３１７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５６５ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１８１(配列番号：３２１)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。

【０２７４】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５６５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５６５ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１８２(配列番号：３２２)の残基１又は
約４１から３１７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８２(配列番号：３２２)のアミノ酸残基１
又は約４１から約３１７に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６５ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８２(配列番号：３２２)の残基１又は
約４１から３１７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６５ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８２(配列番号：３２２)のアミノ
酸残基１又は約４１から約３１７の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５６５抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６５ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１５６５断片は、天然ＰＲＯ１５６５ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
８２(配列番号：３２２)のアミノ酸残基約１又は約４１から約３１７の配列を有
するＰＲＯ１５６５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５６５ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５６５抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５６５ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５６５ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５６５ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２７５】 ９２． ＰＲＯ１５７１ 本出願において「ＰＲＯ１５７１」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する、クロストリジウムパーフリンゲンエンテロトキシン(clustridium perfrin
gens enterotoxin)レセプター（ＣＰＥ-Ｒ）をコードする核酸と相同性を有する
ｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７３７３０−１６７９）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５７１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１８４(配列番号：３２４)のア
ミノ酸残基約１又は約２２から約２３９の配列を有するＰＲＯ１５７１ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８３（配列番号：３２３)のヌクレオチド
約９０又は約１５３から約８０６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを
含むＰＲＯ１５７１ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好
ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる
。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７３０−１６７９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７３０−１６７９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１８４(配列番号：３２４)の
アミノ酸残基１又は約２２から約２３９の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。

【０２７６】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１８４(配列
番号：３２４)のアミノ酸残基１又は約２２から約２３９の配列を有するＰＲＯ
１５７１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約９１０ヌクレオチドを有する単離された核酸
分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５７１ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１８４（配列番号：３２４）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約２１まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
５７１アミノ酸配列（Ｆｉｇ１８４、配列番号：３２４）のアミノ酸位置約８２
からアミノ酸位置約１０３、アミノ酸位置約１１５からアミノ酸位置約１４１、
及びアミノ酸位置約１６０からアミノ酸位置約１８２まで伸びるものとして仮に
同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１８４(配列番号：３２４)の残基１又
は約２２から約２３９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５７１ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１８３(配列番号：３２３)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５７１ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５７１ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１８４(配列番号：３２４)の残基１又は
約２２から２３９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８４(配列番号：３２４)のアミノ酸残基１
又は約２２から約２３９に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７１ポリペプチドに関する
。

【０２７７】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８４(配列番号：３２４)の残基１又は
約２２から２３９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７１ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８４(配列番号：３２４)のアミノ
酸残基１又は約２２から約２３９の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５７１抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７１ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１５７１断片は、天然ＰＲＯ１５７１ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
８４(配列番号：３２４)のアミノ酸残基約１又は約２２から約２３９の配列を有
するＰＲＯ１５７１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５７１ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５７１抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５７１ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５７１ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５７１ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２７８】 ９３． ＰＲＯ１５７２ 本出願において「ＰＲＯ１５７２」と命名され、ＣＰＥ-Ｒと配列同一性を持
つ新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７３７３４−１６
８０）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５７２ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１８６(配列番号：３２６)のア
ミノ酸残基約１又は約２４から約２６１の配列を有するＰＲＯ１５７２ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８５（配列番号：３２５)の残基約１５９
から約８７２の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５７２
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３６３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７３４−１６８０）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３６３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７３４−１６８０）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１８６(配列番号：３２６)の
アミノ酸残基約２４から約２６１の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１８６(配列
番号：３２６)のアミノ酸残基約２４から約２６１の配列を有するＰＲＯ１５７
２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約４５７ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に
関する。

【０２７９】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５７２ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１８６（配列番号：３２６）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約２３まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
５７２アミノ酸配列（Ｆｉｇ１８６、配列番号：３２６）のおよそのアミノ酸８
１−１００、１２１−１４１、及び１７３−１９４まで伸びるものとして仮に同
定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１８６(配列番号：３２６)の残基約２
４から約２６１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単
離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５７２ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５７２ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５７２ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１８６(配列番号：３２６)の残基２４か
ら２６１を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８６(配列番号：３２６)のアミノ酸残基２
４から約２６１に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７２ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８６(配列番号：３２６)の残基２４か
ら２６１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７２ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８６(配列番号：３２６)のアミノ
酸残基１又は２４から約２６１の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５７２抗体に結合
するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７２ポリペプチドに関
する。好ましくは、このＰＲＯ１５７２断片は、天然ＰＲＯ１５７２ポリペプチ
ドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
８６(配列番号：３２６)のアミノ酸残基１又は約２４から約２６１の配列を有す
るＰＲＯ１５７２ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５７２ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５７２抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５７２ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５７２ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５７２ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２８０】 ９４． ＰＲＯ１５７３ 本出願において「ＰＲＯ１５７３」と命名され、ＣＰＥ-Ｒと配列同一性を持
つ新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７３７３５−１６
８１）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５７３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１８８(配列番号：３２８)のア
ミノ酸残基１又は約１８から約２２５の配列を有するＰＲＯ１５７３ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８７（配列番号：３２７)の残基約１４８
から約７７１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５７３
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７３５−１６８１）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７３５−１６８１）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１８８(配列番号：３２８)の
アミノ酸残基約１８から約２２５の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１８８(配列
番号：３２８)のアミノ酸残基約１８から約２２５の配列を有するＰＲＯ１５７
３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２８１】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５７３ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ１８８（配列番号：３２８）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約１７まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
５７３アミノ酸配列（Ｆｉｇ１８８、配列番号：３２８）のおよそのアミノ酸８
２−１０１、１１８−１４５及び１６４−１８８まで伸びるものとして仮に同定
されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１８８(配列番号：３２８)の残基約１
８から約２２５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単
離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５７３ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５７３ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５７３ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１８８(配列番号：３２８)の残基１８か
ら２２５を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０２８２】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８８(配列番号：３２８)のアミノ酸残基約
１８から約２２５に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、
好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０
％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７３ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８８(配列番号：３２８)の残基約１８
から２２５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配
列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７３ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８８(配列番号：３２８)のアミノ
酸残基約１８から約２２５の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５７３抗体に結合する
のに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７３ポリペプチドに関する
。好ましくは、このＰＲＯ１５７３断片は、天然ＰＲＯ１５７３ポリペプチドの
質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
８８(配列番号：３２８)のアミノ酸残基約１８から約２２５の配列を有するＰＲ
Ｏ１５７３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５７３ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５７３抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５７３ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５７３ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５７３ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２８３】 ９５． ＰＲＯ１４８８ 本出願において「ＰＲＯ１４８８」と命名され、クロストリジウムパーフリン
ゲンエンテロトキシン(clustridium perfringens enterotoxin)レセプター（Ｃ
ＰＥ-Ｒ）と相同性を持つ新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（
ＤＮＡ７３７３６−１６５７）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４８８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１９０(配列番号：３３０)のア
ミノ酸残基約１から約２２０の配列を有するＰＲＯ１４８８ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１８９（配列番号：３２９)の残基約６から
約６６５の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４８８ポリ
ペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッド
形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７３６−１６５７）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７３６−１６５７）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１９０(配列番号：３３０)の
アミノ酸残基約１から約２２０の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる単
離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１９０(配列
番号：３３０)のアミノ酸残基約１から約２２０の配列を有するＰＲＯ１４８８
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２８４】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１４８８ポリペプチド、及びその可溶化（即
ち、膜貫通ドメイン欠失又は不活性化）変異体をコードするＤＮＡを含む単離さ
れた核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。
膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１４８８アミノ酸配列（Ｆｉｇ１９０、配列番号：３
３０）のおよそのアミノ酸８−３０、８２−１０２、１２１−１４０、及び１６
６−１８６まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１９０(配列番号：３３０)の残基１か
ら約２２０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４８８ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４８８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４８８ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１９０(配列番号：３３０)の残基１から
２２０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９０(配列番号：３３０)のアミノ酸残基１
から約２２０に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９０(配列番号：３３０)の残基１から
２２０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８８ポリペプチドに関する。

【０２８５】 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９０(配列番号：３３０)のアミノ
酸残基１から約２２０の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４８８抗体に結合するのに
十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８８ポリペプチドに関する。好
ましくは、このＰＲＯ１４８８断片は、天然ＰＲＯ１４８８ポリペプチドの質的
な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
９０(配列番号：３３０)のアミノ酸残基約１から約２２０の配列を有するＰＲＯ
１４８８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４８８ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４８８抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４８８ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４８８ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４８８ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２８６】 ９６． ＰＲＯ１４８９ 本出願において「ＰＲＯ１４８９」と命名され、新規なポリペプチドをコード
するクロストリジウムパーフリンゲンエンテロトキシンレセプター（ＣＰＥ-Ｒ
）と相同性を持つｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７３７３７−１６５８）が同定され
た。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４８９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１９２(配列番号：３３２)のア
ミノ酸残基約１から約１７３の配列を有するＰＲＯ１４８９ポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも
約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の
配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９１（配列番号：３３１)のヌクレオチド
約２６４から約７８２の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ
１４８９ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、
ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４１２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７３７−１６５８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４１２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７３７−１６５８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１９２(配列番号：３３２)の
アミノ酸残基１から約１７３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好まし
くは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配
列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる単離
された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１９２(配列
番号：３３２)のアミノ酸残基１から約１７３の配列を有するＰＲＯ１４８９ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、少なくとも約２５ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する
。 特別な態様では、本発明は、開始メチオニンを持っているか持っていないＰＲ
Ｏ１４８９ポリペプチド、及びその可溶化、即ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性
化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子を提供し、あるいはその
ようなコード化核酸分子に相補的である。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１４８９ア
ミノ酸配列（Ｆｉｇ１９２、配列番号：３３２）のアミノ酸位置約３１からアミ
ノ酸位置約５１、アミノ酸位置約７１からアミノ酸位置約９０、及びアミノ酸位
置約１１２からアミノ酸位置約１３３まで伸びるものとして仮に同定されている
。

【０２８７】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１９２(配列番号：３３２)の残基１か
ら約１７３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４８９ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ１９１(配列番号：３３１)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４８９ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４８９ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１９２(配列番号：３３２)の残基１から
１７３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９２(配列番号：３３２)のアミノ酸残基１
から約１７３に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８９ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９２(配列番号：３３２)の残基１から
１７３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８９ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９２(配列番号：３３２)のアミノ
酸残基１から約１７３の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４８９抗体に結合するのに
十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８９ポリペプチドに関する。好
ましくは、このＰＲＯ１４８９断片は、天然ＰＲＯ１４８９ポリペプチドの質的
な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
９２(配列番号：３３２)のアミノ酸残基１から約１７３の配列を有するＰＲＯ１
４８９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４８９ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４８９抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４８９ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４８９ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４８９ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２８８】 ９７． ＰＲＯ１４７４ 本出願において「ＰＲＯ１４７４」と命名され、オボムコイドと配列同一性を
持つ新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７３７３９−１
６４５）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４７４ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１９４(配列番号：３３４)のア
ミノ酸残基約１又は約２０から約８５の配列を有するＰＲＯ１４７４ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９３（配列番号：３３３)の残基約１０２
から約２９９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４７４
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７３９−１６４５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７３９−１６４５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１９４(配列番号：３３４)の
アミノ酸残基約２０から約８５の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる単
離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１９４(配列
番号：３３４)のアミノ酸残基約２０から約８５の配列を有するＰＲＯ１４７４
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と
、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対し
て、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同
一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なく
とも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより
製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００ヌ
クレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２８９】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１９４(配列番号：３３４)の残基約２
０から約８５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４７４ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４７４ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４７４ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１９４(配列番号：３３４)の残基２０か
ら８５を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９４(配列番号：３３４)のアミノ酸残基２
０から約８５に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４７４ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９４(配列番号：３３４)の残基２０か
ら８５のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１４７４ポリペプチドに関する。

【０２９０】 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９４(配列番号：３３４)のアミノ
酸残基１又は２０から約８５の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４７４抗体に結合す
るのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４７４ポリペプチドに関す
る。好ましくは、このＰＲＯ１４７４断片は、天然ＰＲＯ１４７４ポリペプチド
の質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
９４(配列番号：３３４)のアミノ酸残基約２０から約８５の配列を有するＰＲＯ
１４７４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は
（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８
５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ま
しくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分
子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉ
ｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを
提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４７４ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４７４抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４７４ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４７４ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４７４ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２９１】 ９８． ＰＲＯ１５０８ 本出願において「ＰＲＯ１５０８」と命名され、新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７３７４２−１６６２）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５０８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１９６(配列番号：３３６)のア
ミノ酸残基約１又は約３１から約１４８の配列を有するＰＲＯ１５０８ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９５（配列番号：３３５)の残基約１６０
から約５１３の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５０８
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７４２−１６６２）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１６のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７４２−１６６２）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１９６(配列番号：３３６)の
アミノ酸残基約３１から約１４８の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１９６(配列
番号：３３６)のアミノ酸残基約３１から約１４８の配列を有するＰＲＯ１５０
８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２９２】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５０８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１９６（配列番号：３３６）のアミノ酸
位置１からアミノ酸位置約３０まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１９６(配列番号：３３６)の残基３１
から約１４８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５０８ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５０８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５０８ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１９６(配列番号：３３６)の残基３１か
ら１４８を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９６(配列番号：３３６)のアミノ酸残基３
１から約１４８に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５０８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９６(配列番号：３３６)の残基約３１
から１４８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配
列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５０８ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９６(配列番号：３３６)のアミノ
酸残基３１から１４８の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５０８抗体に結合するのに
十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５０８ポリペプチドに関する。好
ましくは、このＰＲＯ１５０８断片は、天然ＰＲＯ１５０８ポリペプチドの質的
な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
９６(配列番号：３３６)のアミノ酸残基約３１から約１４８の配列を有するＰＲ
Ｏ１５０８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。

【０２９３】 ９９． ＰＲＯ１５５５ 本出願において「ＰＲＯ１５５５」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７３７４４−１６６５）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５５５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ１９８(配列番号：３３８)のア
ミノ酸残基約１又は約３２から約２４６の配列を有するＰＲＯ１５５５ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９７（配列番号：３３７)の残基約８３か
ら約８２７の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５５５ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７４４−１６６５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７４４−１６６５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１９８(配列番号：３３８)の
アミノ酸残基約３２から約２４６の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１９８(配列
番号：３３８)のアミノ酸残基約３２から約２４６の配列を有するＰＲＯ１５５
５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０２９４】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５５５ポリペプチド、及びその可溶化（即
ち、膜貫通ドメイン欠失又は不活性化）変異体をコードするＤＮＡを含む単離さ
れた核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。
シグナルペプチドは、Ｆｉｇ１９８（配列番号：３３８）のアミノ酸位置１から
アミノ酸位置約３１まで伸びると仮に同されている。２つの膜貫通ドメインが、
ＰＲＯ１５５５アミノ酸配列（Ｆｉｇ１９８、配列番号：３３８）のアミノ酸位
置約１からアミノ酸位置約３２、及びアミノ酸位置約１９５からアミノ酸位置約
２１７まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ１９８(配列番号：３３８)の残基３２
から約２４６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５５５ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５５５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５５５ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ１９８(配列番号：３３８)の残基３２か
ら２４６を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９８(配列番号：３３８)のアミノ酸残基３
２から約２４６に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５５ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９８(配列番号：３３８)の残基３２か
ら２４６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５５ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９８(配列番号：３３８)のアミノ
酸残基３２から約２４６の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５５５抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５５ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１５５５断片は、天然ＰＲＯ１５５５ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ１
９８(配列番号：３３８)のアミノ酸残基約３２から約２４６の配列を有するＰＲ
Ｏ１５５５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。

【０２９５】 １００． ＰＲＯ１４８５ 本出願において「ＰＲＯ１４８５」と命名され、リソザイム(lysozyme)、特に
リソザイムＣ前駆体と配列同一性を持つ新規なポリペプチドをコードするｃＤＮ
Ａクローン（ＤＮＡ７３７４６−１６５４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１４８５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２００(配列番号：３４０)のア
ミノ酸残基１又は約１９から約１４８の配列を有するＰＲＯ１４８５ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ１９９（配列番号：３３９)の残基約２０５
から約５９４の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１４８５
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４１１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７４６−１６５４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４１１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７４６−１６５４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。

【０２９６】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２００(配列番号：３４０)の
アミノ酸残基約１９から約１４８の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２００(配列
番号：３４０)のアミノ酸残基約１９から約１４８の配列を有するＰＲＯ１４８
５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２００(配列番号：３４０)の残基１９
から約１４８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１４８５ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１４８５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１４８５ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２００(配列番号：３４０)の残基１９か
ら１４８を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２００(配列番号：３４０)のアミノ酸残基１
９から約１４８に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８５ポリペプチドに関する。

【０２９７】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２００(配列番号：３４０)の残基１９か
ら１４８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８５ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２００(配列番号：３４０)のアミノ
酸残基１９から約１４８の配列、又はその抗-ＰＲＯ１４８５抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１４８５ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１４８５断片は、天然ＰＲＯ１４８５ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
００(配列番号：３４０)のアミノ酸残基約１９から約１４８の配列を有するＰＲ
Ｏ１４８５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１４８５ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１４８５抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１４８５ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１４８５ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１４８５ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０２９８】 １０１． ＰＲＯ１５６４ 本出願において「ＰＲＯ１５６４」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する、Ｎ-アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼをコードする核酸と相
同性を有するｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７３７６０−１６７２）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５６４ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２０２(配列番号：３４７)のア
ミノ酸残基約１又は約２９から約６３９の配列を有するＰＲＯ１５６４ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０１（配列番号：３４６)のヌクレオチド
約４６２又は約５４６から約２３７８の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮ
Ａを含むＰＲＯ１５６４ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する
。好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起
こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１４のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７６０−１６７２）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１４のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７３７６０−１６７２）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２０２(配列番号：３４７)の
アミノ酸残基１又は約２９から約６３９の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２０２(配列
番号：３４７)のアミノ酸残基１又は約２９から約６３９の配列を有するＰＲＯ
１５６４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約４５７ヌクレオチドを有する単離された核酸
分子に関する。

【０２９９】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５６４ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ２０２（配列番号：３４７）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約２８まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
５６４アミノ酸配列（Ｆｉｇ２０２、配列番号：３４７）のアミノ酸位置約１１
からアミノ酸位置約３６まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２０２(配列番号：３４７)の残基１又
は約２９から約６３９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５６４ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ２０１(配列番号：３４６)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５６４ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５６４ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２０２(配列番号：３４７)の残基１又は
約２９から６３９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０２(配列番号：３４７)のアミノ酸残基１
又は約２９から約６３９に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６４ポリペプチドに関する
。

【０３００】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０２(配列番号：３４７)の残基１又は
約２９から６３９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６４ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０２(配列番号：３４７)のアミノ
酸残基１又は約２９から約６３９の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５６４抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６４ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１５６４断片は、天然ＰＲＯ１５６４ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
０２(配列番号：３４７)のアミノ酸残基１又は約２９から約６３９の配列を有す
るＰＲＯ１５６４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５６４ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５６４抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５６４ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５６４ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５６４ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３０１】 １０２． ＰＲＯ１７５５ 本出願において「ＰＲＯ１７５５」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７６３９６−１６９８）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１７５５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２０４(配列番号：３５２)のア
ミノ酸残基約１又は約３２から約２７６の配列を有するＰＲＯ１７５５ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０３（配列番号：３５１)の残基約１５１
から約８８５の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１７５５
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６３９６−１６９８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６３９６−１６９８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２０４(配列番号：３５２)の
アミノ酸残基約３２から約２７６の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２０４(配列
番号：３５２)のアミノ酸残基約３２から約２７６の配列を有するＰＲＯ１７５
５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０３０２】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１７５５ポリペプチド、及びその可溶化（即
ち、膜貫通ドメイン欠失又は不活性化）変異体をコードするＤＮＡを含む単離さ
れた核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。
シグナルペプチドは、Ｆｉｇ２０４（配列番号：３５２）のアミノ酸位置１から
アミノ酸位置約３１まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲ
Ｏ１７５５アミノ酸配列（Ｆｉｇ２０４、配列番号：３５２）のアミノ酸位置約
１７８からアミノ酸位置約１９８まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２０４(配列番号：３５２)の残基３２
から約２７６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１７５５ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１７５５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１７５５ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２０４(配列番号：３５２)の残基３２か
ら２７６を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０４(配列番号：３５２)のアミノ酸残基３
２から約２７６に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７５５ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０４(配列番号：３５２)の残基３２か
ら２７６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７５５ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０４(配列番号：３５２)のアミノ
酸残基３２から約２７６の配列、又はその抗-ＰＲＯ１７５５抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７５５ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１７５５断片は、天然ＰＲＯ１７５５ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
０４(配列番号：３５２)のアミノ酸残基約３２から約２７６の配列を有するＰＲ
Ｏ１７５５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１７５５ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１７５５抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１７５５ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１７５５ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１７５５ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３０３】 １０３． ＰＲＯ１７５７ 本出願において「ＰＲＯ１７５７」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７６３９８−１６９９）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１７５７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２０６(配列番号：３５４)のア
ミノ酸残基約１又は約２０から約１２１の配列を有するＰＲＯ１７５７ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０５（配列番号：３５３)のヌクレオチド
約５９又は約１１６から約１２１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを
含むＰＲＯ１７５７ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好
ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる
。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７４のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６３９８−１６９９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７４のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６３９８−１６９９）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２０６(配列番号：３５４)の
アミノ酸残基１又は約２０から約１２１の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。

【０３０４】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２０６(配列
番号：３５４)のアミノ酸残基１又は約２０から約１２１の配列を有するＰＲＯ
１７５７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも１２５ヌクレオチドを有する単離された核酸分
子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１７５７ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ２０６（配列番号：３５４）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約１９まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
７５７アミノ酸配列（Ｆｉｇ２０６、配列番号：３５４）のアミノ酸位置約９１
からアミノ酸位置約１１０まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２０６(配列番号：３５４)の残基１又
は約２０から約１２１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１７５７ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ２０５(配列番号：３５３)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１７５７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１７５７ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２０６(配列番号：３５４)の残基１又は
約２０から１２１を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０３０５】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０６(配列番号：３５４)のアミノ酸残基１
又は約２０から約１２１に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７５７ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０６(配列番号：３５４)の残基１又は
約２０から１２１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７５７ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０６(配列番号：３５４)のアミノ
酸残基１又は約２０から約１２１の配列、又はその抗-ＰＲＯ１７５７抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７５７ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１７５７断片は、天然ＰＲＯ１７５７ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
０６(配列番号：３５４)のアミノ酸残基１又は約２０から約１２１の配列を有す
るＰＲＯ１７５７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１７５７ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１７５７抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１７５７ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１７５７ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１７５７ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３０６】 １０４． ＰＲＯ１７５８ 本出願において「ＰＲＯ１７５８」と命名され、新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７６３９９−１７００）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１７５８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２０８(配列番号：３５６)のア
ミノ酸残基１又は約１６から約１５７の配列を有するＰＲＯ１７５８ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０７（配列番号：３５５)の残基約１２３
から約５４８の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１７５８
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６３９９−１７００）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７２のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６３９９−１７００）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２０８(配列番号：３５６)の
アミノ酸残基約１６から約１５７の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２０８(配列
番号：３５６)のアミノ酸残基約１６から約１５７の配列を有するＰＲＯ１７５
８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０３０７】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列を持っているか持っていな
いＰＲＯ１７５８ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子を
提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグナルペプチ
ドは、Ｆｉｇ２０８（配列番号：３５６）のアミノ酸位置１からアミノ酸位置約
１５まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２０８(配列番号：３５６)の残基約１
６から約１５７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単
離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１７５８ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１７５８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１７５８ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２０８(配列番号：３５６)の残基１６か
ら１５７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０８(配列番号：３５６)のアミノ酸残基１
６から約１５７に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７５８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０８(配列番号：３５６)の残基１６か
ら１５７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７５８ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０８(配列番号：３５６)のアミノ
酸残基１６から約１５７の配列、又はその抗-ＰＲＯ１７５８抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７５８ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１７５８断片は、天然ＰＲＯ１７５８ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
０８(配列番号：３５６)のアミノ酸残基約１６から約１５７の配列を有するＰＲ
Ｏ１７５８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。

【０３０８】 １０５． ＰＲＯ１５７５ 本出願において「ＰＲＯ１５７５」と命名され、プロテインジスルフィドイソ
メラーゼと相同性を持つ新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（Ｄ
ＮＡ７６４０１−１６８３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５７５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２１０(配列番号：３５８)のア
ミノ酸残基１又は約２１から約２７３の配列を有するＰＲＯ１５７５ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２０９（配列番号：３５７)の残基約８２か
ら約８４０の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５７５ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３６０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６４０１−１６８３）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３６０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６４０１−１６８３）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２１０(配列番号：３５８)の
アミノ酸残基約２１から約２７３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２１０(配列
番号：３５８)のアミノ酸残基約２１から約２７３の配列を有するＰＲＯ１５７
５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０３０９】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５７５ポリペプチド、及びその可溶化（即
ち、膜貫通ドメイン欠失又は不活性化）変異体をコードするＤＮＡを含む単離さ
れた核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。
シグナルペプチドは、Ｆｉｇ２１０（配列番号：３５８）のアミノ酸位置１から
アミノ酸位置約２０まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲ
Ｏ１５７５アミノ酸配列（Ｆｉｇ２１０、配列番号：３５８）のアミノ酸位置約
１４３からアミノ酸位置約１６２まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２１０(配列番号：３５８)の残基２１
から約２７３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５７５ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５７５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５７５ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２１０(配列番号：３５８)の残基２１か
ら２７３を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０３１０】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１０(配列番号：３５８)のアミノ酸残基２
１から約２７３に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７５ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１０(配列番号：３５８)の残基２１か
ら２７３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７５ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１０(配列番号：３５８)のアミノ
酸残基２１から約２７３の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５７５抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５７５ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１５７５断片は、天然ＰＲＯ１５７５ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
１０(配列番号：３５８)のアミノ酸残基約２１から約２７３の配列を有するＰＲ
Ｏ１５７５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５７５ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５７５抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５７５ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５７５ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５７５ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３１１】 １０６． ＰＲＯ１７８７ 本出願において「ＰＲＯ１７８７」と命名され、ミエリンｐ０ち配列同一性を
持つ新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７６５１０−２
５０４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１７８７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２１２(配列番号：３６４)のア
ミノ酸残基１又は約３８から約２６９の配列を有するＰＲＯ１７８７ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１１（配列番号：３６３)の残基約２７４
から約９６９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１７８７
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５１０−２５０４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５１０−２５０４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２１２(配列番号：３６４)の
アミノ酸残基約３８から約２６９の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２１２(配列
番号：３６４)のアミノ酸残基約３８から約２６９の配列を有するＰＲＯ１７８
７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０３１２】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１７８７ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ２１２（配列番号：３６４）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約３７まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
７８７アミノ酸配列（Ｆｉｇ２１２、配列番号：３６４）のアミノ酸位置約１６
１からアミノ酸位置約１８３まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２１２(配列番号：３６４)の残基３８
から約２６９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１７８７ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１７８７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１７８７ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２１２(配列番号：３６４)の残基３８か
ら２６９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１２(配列番号：３６４)のアミノ酸残基３
８から約２６９に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８７ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１２(配列番号：３６４)の残基３８か
ら２６９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８７ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１２(配列番号：３６４)のアミノ
酸残基３８から約２６９の配列、又はその抗-ＰＲＯ１７８７抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８７ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１７８７断片は、天然ＰＲＯ１７８７ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
１２(配列番号：３６４)のアミノ酸残基約３８から約２６９の配列を有するＰＲ
Ｏ１７８７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１７８７ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１７８７抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１７８７ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１７８７ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１７８７ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３１３】 １０７． ＰＲＯ１７８１ 本出願において「ＰＲＯ１７８１」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７６５２２−２５００）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１７８１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２１４(配列番号：３６６)のア
ミノ酸残基１又は約２０から約３７３の配列を有するＰＲＯ１７８１ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１３（配列番号：３６５)の残基約７８か
ら約１１３９の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１７８１
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５２２−２５００）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５２２−２５００）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２１４(配列番号：３６６)の
アミノ酸残基約２０から約３７３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２１４(配列
番号：３６６)のアミノ酸残基約２０から約３７３の配列を有するＰＲＯ１７８
１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０３１４】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１７８１ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ２１４（配列番号：３６６）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約１９まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
７８１アミノ酸配列（Ｆｉｇ２１４、配列番号：３６６）のアミノ酸位置約３９
からアミノ酸位置約６０まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２１４(配列番号：３６６)の残基２０
から約３７３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１７８１ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１７８１ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１７８１ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２１４(配列番号：３６６)の残基２０か
ら３７３を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０３１５】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１４(配列番号：３６６)のアミノ酸残基２
０から約３７３に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８１ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１４(配列番号：３６６)の残基２０か
ら３７３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８１ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１４(配列番号：３６６)のアミノ
酸残基２０から約３７３の配列、又はその抗-ＰＲＯ１７８１抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８１ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１７８１断片は、天然ＰＲＯ１７８１ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
１４(配列番号：３６６)のアミノ酸残基約２０から約３７３の配列を有するＰＲ
Ｏ１７８１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。

【０３１６】 １０８． ＰＲＯ１５５６ 本出願において「ＰＲＯ１５５６」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７６５２９−１６６６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５５６ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２１６(配列番号：３７２)のア
ミノ酸残基１又は約２５から約２６９の配列を有するＰＲＯ１５５６ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１５（配列番号：３７１)の残基約１６０
から約８９１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５５６
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５２９−１６６６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５２９−１６６６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２１６(配列番号：３７２)の
アミノ酸残基約２５から約２６９の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２１６(配列
番号：３７２)のアミノ酸残基約２５から約２６９の配列を有するＰＲＯ１５５
６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０３１７】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５５６ポリペプチド、及びその可溶化（即
ち、膜貫通ドメイン欠失又は不活性化）変異体をコードするＤＮＡを含む単離さ
れた核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。
シグナルペプチドは、Ｆｉｇ２１６（配列番号：３７２）のアミノ酸位置１から
アミノ酸位置約２４まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲ
Ｏ１５５６アミノ酸配列（Ｆｉｇ２１６、配列番号：３７２）のアミノ酸位置約
１１からアミノ酸位置約２５、及びアミノ酸位置約２２６からアミノ酸位置約２
４３まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２１６(配列番号：３７２)の残基２５
から約２６９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５５６ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５５６ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５５６ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２１６(配列番号：３７２)の残基２５か
ら２６９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１６(配列番号：３７２)のアミノ酸残基２
５から約２６９に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５６ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１６(配列番号：３７２)の残基２５か
ら２６９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５６ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１６(配列番号：３７２)のアミノ
酸残基２５から約２６９の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５５６抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５６ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１５５６断片は、天然ＰＲＯ１５５６ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
１６(配列番号：３７２)のアミノ酸残基約２５から約２６９の配列を有するＰＲ
Ｏ１５５６ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５５６ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５５６抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５５６ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５５６ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５５６ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３１８】 １０９． ＰＲＯ１７５９ 本出願において「ＰＲＯ１７５９」と命名され、複数の膜貫通ドメインを持つ
新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７６５３１−１７０
１）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１７５９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２１８(配列番号：３７４)のア
ミノ酸残基１又は約１９から約４５０の配列を有するＰＲＯ１７５９ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１７（配列番号：３７３)の残基約１７９
から約１４７４の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１７５
９ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５３１−１７０１）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６５のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５３１−１７０１）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。

【０３１９】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２１８(配列番号：３７４)の
アミノ酸残基約１９から約４５０の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２１８(配列
番号：３７４)のアミノ酸残基約１９から約４５０の配列を有するＰＲＯ１７５
９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１７５９ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ２１８（配列番号：３７４）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約１８まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
７５９アミノ酸配列（Ｆｉｇ２１８、配列番号：３７４）のおよそのアミノ酸４
１−５５、７５−９４、１２７−１４３、１９１−２１３、２４９−２７０、２
７８−２９９、３１４−３３０、３４３−３５９、３７９−３９４、及び４１０
−４３０まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２１８(配列番号：３７４)の残基１９
から約４５０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１７５９ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。

【０３２０】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１７５９ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１７５９ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２１８(配列番号：３７４)の残基１９か
ら４５０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１８(配列番号：３７４)のアミノ酸残基１
９から約４５０に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７５９ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１８(配列番号：３７４)の残基１９か
ら４５０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７５９ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１８(配列番号：３７４)のアミノ
酸残基１９から約４５０の配列、又はその抗-ＰＲＯ１７５９抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７５９ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１７５９断片は、天然ＰＲＯ１７５９ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
１８(配列番号：３７４)のアミノ酸残基約１９から約４５０の配列を有するＰＲ
Ｏ１７５９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１７５９ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１７５９抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１７５９ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１７５９ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１７５９ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３２１】 １１０． ＰＲＯ１７６０ 本出願において「ＰＲＯ１７６０」と命名され、新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７６５３２−１７０２）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１７６０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２２０(配列番号：３７６)のア
ミノ酸残基約１又は約２１から約１８８の配列を有するＰＲＯ１７６０ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２１９（配列番号：３７５)の残基約１２０
から約６２３の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１７６０
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５３２−１７０２）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５３２−１７０２）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２２０(配列番号：３７６)の
アミノ酸残基約２１から約１８８の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２２０(配列
番号：３７６)のアミノ酸残基約２１から約１８８の配列を有するＰＲＯ１７６
０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０３２２】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２２０(配列番号：３７６)の残基２１
から約１８８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１７６０ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１７６０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１７６０ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２２０(配列番号：３７６)の残基２１か
ら１８８を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２０(配列番号：３７６)のアミノ酸残基２
１から約１８８に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７６０ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２０(配列番号：３７６)の残基２１か
ら１８８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７６０ポリペプチドに関する。

【０３２３】 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２０(配列番号：３７６)のアミノ
酸残基２１から約１８８の配列、又はその抗-ＰＲＯ１７６０抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７６０ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１７６０断片は、天然ＰＲＯ１７６０ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
２０(配列番号：３７６)のアミノ酸残基約２１から約１８８の配列を有するＰＲ
Ｏ１７６０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１７６０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１７６０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１７６０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１７６０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１７６０ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３２４】 １１１． ＰＲＯ１５６１ 本出願において「ＰＲＯ１５６１」と命名され、新規なポリペプチドをコード
するヒトホスホリパーゼＡ２プロテインをコードする核酸と相同性を有するｃＤ
ＮＡクローン（ＤＮＡ７６５３８−１６７０）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５６１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２２２(配列番号：３７８)のア
ミノ酸残基約１又は約１８から約１１６の配列を有するＰＲＯ１５６１ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２１（配列番号：３７７)のヌクレオチド
約２９又は約８０から約３７６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含
むＰＲＯ１５６１ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ま
しくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５３８−１６７０）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５３８−１６７０）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２２２(配列番号：３７８)の
アミノ酸残基１又は約１８から約１１６の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２２２(配列
番号：３７８)のアミノ酸残基１又は約１８から約１１６の配列を有するＰＲＯ
１５６１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも１００ヌクレオチドを有する単離された核酸分
子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５６１ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ２２２（配列番号：３７８）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約１７まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
５６１アミノ酸配列（Ｆｉｇ２２２、配列番号：３７８）のアミノ酸位置約１か
らアミノ酸位置約２４まで伸びるものとして仮に同定されている。

【０３２５】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２２２(配列番号：３７８)の残基１又
は約１８から約１１６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５６１ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ２２１(配列番号：３７７)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５６１ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５６１ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２２２(配列番号：３７８)の残基１又は
約１８から１１６を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２２(配列番号：３７８)のアミノ酸残基１
又は約１８から約１１６に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６１ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２２(配列番号：３７８)の残基１又は
約１８から１１６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６１ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２２(配列番号：３７８)のアミノ
酸残基１又は約１８から約１１６の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５６１抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６１ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１５６１断片は、天然ＰＲＯ１５６１ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
２２(配列番号：３７８)のアミノ酸残基１又は約１８から約１１６の配列を有す
るＰＲＯ１５６１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５６１ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５６１抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５６１ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５６１ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５６１ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３２６】 １１２． ＰＲＯ１５６７ 本出願において「ＰＲＯ１５６７」と命名され、結腸特異的遺伝子ＣＳＧ６の
発現産物と相同性を持つ新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（Ｄ
ＮＡ７６５４１−１６７５）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５６７ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２２４(配列番号：３８３)のア
ミノ酸残基１又は約２３から約１７８の配列を有するＰＲＯ１５６７ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２３（配列番号：３８２)の残基約１７５
から約６４２の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５６７
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５４１−１６７５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６５４１−１６７５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２２４(配列番号：３８３)の
アミノ酸残基約２３から約１７８の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２２４(配列
番号：３８３)のアミノ酸残基約２３から約１７８の配列を有するＰＲＯ１５６
７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０３２７】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列を持っているか持っていな
いＰＲＯ１５６７ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む単離された核酸分子を
提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグナルペプチ
ドは、Ｆｉｇ２２４（配列番号：３８３）のアミノ酸位置１からアミノ酸位置約
２２まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２２４(配列番号：３８３)の残基約２
３から約１７８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単
離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５６７ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５６７ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５６７ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２２４(配列番号：３８３)の残基２３か
ら１７８を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２４(配列番号：３８３)のアミノ酸残基２
３から約１７８に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６７ポリペプチドに関する。

【０３２８】 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２４(配列番号：３８３)の残基２３か
ら１７８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６７ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２４(配列番号：３８３)のアミノ
酸残基２３から約１７８の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５６７抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５６７ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１５６７断片は、天然ＰＲＯ１５６７ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
２４(配列番号：３８３)のアミノ酸残基約２３から約１７８の配列を有するＰＲ
Ｏ１５６７ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１５６７ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１５６７抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１５６７ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１５６７ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１５６７ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３２９】 １１３． ＰＲＯ１６９３ 本出願において「ＰＲＯ１６９３」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する、インシュリン様成長因子結合タンパク質をコードする核酸と相同性を有す
るｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７７３０１−１７０８）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１６９３ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２２６(配列番号：３８５)のア
ミノ酸残基約１又は約３４から約５１３の配列を有するＰＲＯ１６９３ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２５（配列番号：３８４)のヌクレオチド
約５０８又は６０７から約２０４６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡ
を含むＰＲＯ１６９３ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。
好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こ
る。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７７３０１−１７０８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０７のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７７３０１−１７０８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２２６(配列番号：３８５)の
アミノ酸残基１又は約３４から約５１３の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２２６(配列
番号：３８５)のアミノ酸残基１又は約３４から約５１３の配列を有するＰＲＯ
１６９３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも１７５ヌクレオチドを有する単離された核酸分
子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１６９３ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ２２６（配列番号：３８５）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約３３まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
６９３アミノ酸配列（Ｆｉｇ２２６、配列番号：３８５）のアミノ酸位置約４２
０からアミノ酸位置約４４２まで伸びるものとして仮に同定されている。

【０３３０】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２２６(配列番号：３８５)の残基１又
は約３４から約５１３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１６９３ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ２２５(配列番号：３８４)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１６９３ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１６９３ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２２６(配列番号：３８５)の残基１又は
約３４から５１３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２６(配列番号：３８５)のアミノ酸残基１
又は約３４から約５１３に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１６９３ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２６(配列番号：３８５)の残基１又は
約３４から５１３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１６９３ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２６(配列番号：３８５)のアミノ
酸残基１又は約３４から約５１３の配列、又はその抗-ＰＲＯ１６９３抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１６９３ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１６９３断片は、天然ＰＲＯ１６９３ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
２６(配列番号：３８５)のアミノ酸残基１又は約３４から約５１３の配列を有す
るＰＲＯ１６９３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１６９３ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１６９３抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１６９３ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１６９３ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１６９３ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３３１】 １１４． ＰＲＯ１７８４ 本出願において「ＰＲＯ１７８４」と命名され、新規な膜貫通ポリペプチドを
コードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７７３０３−２５０２）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１７８４ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２２８(配列番号：３９０)のア
ミノ酸残基１又は約３０から約１４６の配列を有するＰＲＯ１７８４ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２７（配列番号：３８９)の残基約１５５
から約５０５の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１７８４
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７７３０３−２５０２）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７７３０３−２５０２）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。

【０３３２】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２２８(配列番号：３９０)の
アミノ酸残基約３０から約１４６の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２２８(配列
番号：３９０)のアミノ酸残基約３０から約１４６の配列を有するＰＲＯ１７８
４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１７８４ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ２２８（配列番号：３９０）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約２９まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
７８４アミノ酸配列（Ｆｉｇ２２８、配列番号：３９０）のアミノ酸位置約５２
からアミノ酸位置約７０まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２２８(配列番号：３９０)の残基３０
から約１４６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１７８４ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。

【０３３３】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１７８４ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１７８４ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２２８(配列番号：３９０)の残基３０か
ら１４６を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２８(配列番号：３９０)のアミノ酸残基３
０から約１４６に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８４ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２８(配列番号：３９０)の残基３０か
ら１４６のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８４ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２８(配列番号：３９０)のアミノ
酸残基３０から約１４６の配列、又はその抗-ＰＲＯ１７８４抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８４ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１７８４断片は、天然ＰＲＯ１７８４ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
２８(配列番号：３９０)のアミノ酸残基約３０から約１４６の配列を有するＰＲ
Ｏ１７８４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１７８４ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１７８４抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１７８４ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１７８４ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１７８４ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３３４】 １１５． ＰＲＯ１６０５ 本出願において「ＰＲＯ１６０５」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する、グリコシルトランスフェラーゼタンパク質をコードする核酸と相同性を有
するｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７７６４８−１６８８）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１６０５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２３０(配列番号：３９５)のア
ミノ酸残基約１又は約２７から約１４０の配列を有するＰＲＯ１６０５ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２２９（配列番号：３９４)のヌクレオチド
約４２５又は約５０３から約８４４の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡ
を含むＰＲＯ１６０５ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。
好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こ
る。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７７６４８−１６８８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７７６４８−１６８８）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２３０(配列番号：３９５)の
アミノ酸残基１又は約２７から約１４０の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。

【０３３５】 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２３０(配列
番号：３９５)のアミノ酸残基１又は約２７から約１４０の配列を有するＰＲＯ
１６０５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約３８０ヌクレオチドを有する単離された核酸
分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１６０５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ２３０（配列番号：３９５）のアミノ酸
位置１からアミノ酸位置約２６まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２３０(配列番号：３９５)の残基１又
は約２７から約１４０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１６０５ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ２２９(配列番号：３９４)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１６０５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１６０５ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２３０(配列番号：３９５)の残基１又は
約２７から１４０を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３０(配列番号：３９５)のアミノ酸残基１
又は約２７から約１４０に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１６０５ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３０(配列番号：３９５)の残基１又は
約２７から１４０のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１６０５ポリペプチドに関する。

【０３３６】 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３０(配列番号：３９５)のアミノ
酸残基１又は約２７から約１４０の配列、又はその抗-ＰＲＯ１６０５抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１６０５ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１６０５断片は、天然ＰＲＯ１６０５ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
３０(配列番号：３９５)のアミノ酸残基１又は約２７から約１４０の配列を有す
るＰＲＯ１６０５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１６０５ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１６０５抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１６０５ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１６０５ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１６０５ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３３７】 １１６． ＰＲＯ１７８８ 本出願において「ＰＲＯ１７８８」と命名され、ロイシンリッチ反復タンパク
質と相同性を持つ新規なポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７
７６５２−２５０５）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１７８８ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２３２(配列番号：３９７)のア
ミノ酸残基１又は約１７から約３５３の配列を有するＰＲＯ１７８８ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３１（配列番号：３９６)の残基約１１２
から約１１２２の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１７８
８ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４８０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７７６５２−２５０５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４８０のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７７６５２−２５０５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２３２(配列番号：３９７)の
アミノ酸残基約１７から約３５３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２３２(配列
番号：３９７)のアミノ酸残基約１７から約３５３の配列を有するＰＲＯ１７８
８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０３３８】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１７８８ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ２３２（配列番号：３９７）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約１６まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
７８８アミノ酸配列（Ｆｉｇ２３２、配列番号：３９７）のアミノ酸位置約２１
５からアミノ酸位置約２３２、及びアミノ酸位置約２８７からアミノ酸位置約３
０４まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２３２(配列番号：３９７)の残基約１
７から約３５３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ
、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０
％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単
離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１７８８ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１７８８ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１７８８ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２３２(配列番号：３９７)の残基１７か
ら３５３を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３２(配列番号：３９７)のアミノ酸残基１
７から約３５３に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８８ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３２(配列番号：３９７)の残基１７か
ら３５３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８８ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３２(配列番号：３９７)のアミノ
酸残基１７から約３５３の配列、又はその抗-ＰＲＯ１７８８抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１７８８ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１７８８断片は、天然ＰＲＯ１７８８ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
３２(配列番号：３９７)のアミノ酸残基約１７から約３５３の配列を有するＰＲ
Ｏ１７８８ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１７８８ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１７８８抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１７８８ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１７８８ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１７８８ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３３９】 １１７． ＰＲＯ１８０１ 本出願において「ＰＲＯ１８０１」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する、ＩＬ-１９ポリペプチドをコードする核酸と相同性を有するｃＤＮＡクロ
ーン（ＤＮＡ８３５００−２５０６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１８０１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２３４(配列番号：４０２)のア
ミノ酸残基約１又は約４３から約２６１の配列を有するＰＲＯ１８０１ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３３（配列番号：４０１)のヌクレオチド
約１０９又は約２３５から約８９１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡ
を含むＰＲＯ１８０１ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。
好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こ
る。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３９１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ８３５００−２５０６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３９１のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ８３５００−２５０６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。

【０３４０】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２３４(配列番号：４０２)の
アミノ酸残基１又は約４３から約２６１の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２３４(配列
番号：４０２)のアミノ酸残基１又は約４３から約２６１の配列を有するＰＲＯ
１８０１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも約３０ヌクレオチド、通常は少なくとも約５０
ヌクレオチド、より通常には少なくとも約１００ヌクレオチド、一般的には少な
くとも約１５０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１８０１ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ２３４（配列番号：４０２）のアミノ酸
位置１からアミノ酸位置約４２まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２３４(配列番号：４０２)の残基１又
は約４３から約２６１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１８０１ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ２３３(配列番号：４０１)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１８０１ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１８０１ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２３４(配列番号：４０２)の残基１又は
約４３から２６１を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０３４１】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３４(配列番号：４０２)のアミノ酸残基１
又は約４３から約２６１に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１８０１ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３４(配列番号：４０２)の残基１又は
約４３から２６１のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１８０１ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３４(配列番号：４０２)のアミノ
酸残基１又は約４３から約２６１の配列、又はその抗-ＰＲＯ１８０１抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１８０１ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１８０１断片は、天然ＰＲＯ１８０１ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
３４(配列番号：４０２)のアミノ酸残基１又は約４３から約２６１の配列を有す
るＰＲＯ１８０１ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１８０１ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１８０１抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１８０１ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１８０１ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１８０１ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。 本発明の他の実施態様は、炎症性サイトカインを産生しうる細胞による炎症性
サイトカインの産生を阻害する方法に係り、この方法は、細胞をＰＲＯ１８０１
ポリペプチドに接触させる過程を含み、炎症性サイトカインの産生が阻害される
。細胞は、例えば、Ｔ細胞、ＮＫ細胞又はマクロファージであり、その産生が阻
害される炎症性サイトカインはＩＬ-１、ＩＬ-６、ＩＦＮ-又はＴＮＦ-でありう
る。 本発明のさらなる実施態様は、免疫抑制を必要とする個体の治療方法に係り、
この方法は、個体に免疫抑制量のＰＲＯ１８０１を投与する過程を含む。免疫抑
制を必要とする個体は、慢性関節リウマチ、重症筋無力症、インシュリン依存性
真性糖尿病、全身性エリテマトーデス、甲状腺炎又は大腸炎などの自己免疫疾患
、又は敗血性ショック、内毒素ショック又は免疫抑制が望まれる他の型の疾患に
罹患している。また、個体は組織移植を受けた又は受ける者でもよく、この方法
は組織移植の拒絶を阻害する。 他の実施態様は、本明細書を読むことにより明らかになるであろう。

【０３４２】 １１８． ＵＣＰ４ 本出願において「ＵＣＰ４」と命名され、新規なポリペプチドをコードする、
幾つかの公知のヒト非結合(uncoupling)タンパク質と或る程度の相同性を有する
ｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７７５６８−１６２６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＵＣＰ４ポリペプチドをコードするＤＮＡを含んで
なる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２３６(配列番号：４０６)のア
ミノ酸残基約１から約３２３の配列を有するＵＣＰ４ポリペプチドをコードする
ＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約８０
％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは
少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同
一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３５（配列番号：４０５)のヌクレオチド
約４０から約１０１１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＵＣＰ
４ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブ
リッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。

【０３４３】 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３１３４のヒトタン
パク質ｃＤＮＡにコードされる同じ成熟ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、
又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関する。好ましい実施態様では、核酸
は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１３４のヒトタンパク質ｃＤＮＡにコードされる同
じ成熟ポリペプチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２３６(配列番号：４０６)の
アミノ酸残基約１から約３２３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる単
離された核酸分子に関する。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２３６(配列番号：４０６)の残基１か
ら約３２３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとして用いるのに十分に長い、Ｕ
ＣＰ４コード化配列の断片に関する。好ましくは、このような核酸断片は、Ｆｉ
ｇ２３５(配列番号：４０５)の配列における少なくとも約２０から約８０の連続
した塩基を含有する。場合によっては、これらの断片はＦｉｇ２３６(配列番号
：４０６)の配列のＮ-末端又はＣ-末端を含んでいる。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＵＣＰ４ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＵＣＰ４ポリペプチドを提供し
、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２３６(配列番号：４０６)の残基１から３２３
を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３６(配列番号：４０６)のアミノ酸残基１
から約３２３に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＵＣＰ４ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３６(配列番号：４０６)の残基１から
３２３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＵＣＰ４ポリペプチドに関する。

【０３４４】 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３６(配列番号：４０６)のアミノ
酸残基１から約３２３の配列、又はその抗-ＵＣＰ４抗体に結合するのに十分な
断片を含んでなる、単離されたＵＣＰ４ポリペプチドに関する。好ましくは、こ
のＵＣＰ４断片は、天然ＵＣＰ４ポリペプチドの質的な生物学的活性を保持して
いる。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
３６(配列番号：４０６)のアミノ酸残基約１から約３２３の配列を有するＵＣＰ
４ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）
に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の
配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは
少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子を含
む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ）細
胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提供す
る。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＵＣＰ４ポリペプチドのアゴニスト及
びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタゴニス
トは抗-ＵＣＰ４抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＵＣＰ４ポリペプチドを候補分子と接
触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視することによ
る、天然ＵＣＰ４ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの同定方法に関
する。また本発明は、ＵＣＰ４を用いた治療方法及び診断方法も提供する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＵＣＰ４ポリペプチド、又は上記のア
ゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んでなる組
成物に関する。

【０３４５】 １１９． ＰＲＯ１９３ 本出願において「ＰＲＯ１９３」と命名され、新規な複数膜貫通ポリペプチド
をコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ２３３２２−１３９３）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１９３ポリペプチドをコードするＤＮＡを含
んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２３８(配列番号：４１０)のア
ミノ酸残基約１から約１５８の配列を有するＰＲＯ１９３ポリペプチドをコード
するＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約
８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好まし
くは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配
列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３７（配列番号：４０９)の残基約１３８
から約６１１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１９３ポ
リペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリッ
ド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３４００のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ２３３２２−１３９３）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４００のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ２３３２２−１３９３）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２３８(配列番号：４１０)の
アミノ酸残基約１から約１５８の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペプ
チドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる単
離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２３８(配列
番号：４１０)のアミノ酸残基約１から約１５８の配列を有するＰＲＯ１９３ポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体と、
緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することにより製
造された、単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、ＰＲＯ１９３ポリペプチドをその可溶化形態、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体でコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。膜貫
通ドメインは、ＰＲＯ１９３アミノ酸配列（Ｆｉｇ２３８、配列番号：４１０）
のおよそのアミノ位置２３−４２、６０−８０、９７−１１７及び１２８−１４
８まで伸びるものとして仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２３８(配列番号：４１０)の残基１か
ら約１５８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好
ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポ
ジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離さ
れた核酸分子に関する。

【０３４６】 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１９３ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１９３ポリペプチドを提
供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２３８(配列番号：４１０)の残基１から１
５８を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３８(配列番号：４１０)のアミノ酸残基１
から約１５８に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の
配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ酸
配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１９３ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３８(配列番号：４１０)の残基１から
１５８のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好まし
くは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジテ
ィブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列を
含んでなる、単離されたＰＲＯ１９３ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
３８(配列番号：４１０)のアミノ酸残基約１から約１５８の配列を有するＰＲＯ
１９３ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の
補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又は（
ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５
％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好まし
くは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ分子
を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉｉｉ
）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチドを提
供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１９３ポリペプチドのアゴニス
ト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタゴ
ニストは抗-ＰＲＯ１９３抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１９３ポリペプチドを候補分子
と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視すること
による、天然ＰＲＯ１９３ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの同定
方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１９３ポリペプチド、又は上記
のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んでな
る組成物に関する。

【０３４７】 １２０． ＰＲＯ１１３０ 本出願において「ＰＲＯ１１３０」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する、ヒト２−１９タンパク質をコードする核酸と相同性を有するｃＤＮＡクロ
ーン（ＤＮＡ５９８１４−１４８６）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１１３０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２４０(配列番号：４１５)のア
ミノ酸残基約１又は約１６から約２２４の配列を有するＰＲＯ１１３０ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２３９（配列番号：４１４)のヌクレオチド
約３１２又は約３５７から約９８３の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡ
を含むＰＲＯ１１３０ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。
好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こ
る。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５９８１４−１４８６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ５９８１４−１４８６）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２４０(配列番号：４１５)の
アミノ酸残基１又は約１６から約２２４の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２４０(配列
番号：４１５)のアミノ酸残基１又は約１６から約２２４の配列を有するＰＲＯ
１１３０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも１０ヌクレオチドを有する単離された核酸分子
に関する。

【０３４８】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１１３０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ２４０（配列番号：４１５）のアミノ酸
位置１からアミノ酸位置約１５まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２４０(配列番号：４１５)の残基１又
は約１６から約２２４のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１１３０ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ２３９(配列番号：４１４)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１１３０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１１３０ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２４０(配列番号：４１５)の残基１又は
約１６から２２４を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４０(配列番号：４１５)のアミノ酸残基１
又は約１６から約２２４に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１１３０ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４０(配列番号：４１５)の残基１又は
約１６から２２４のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１１３０ポリペプチドに関する。

【０３４９】 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４０(配列番号：４１５)のアミノ
酸残基１又は約１６から約２２４の配列、又はその抗-ＰＲＯ１１３０抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１１３０ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１１３０断片は、天然ＰＲＯ１１３０ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
４０(配列番号：４１５)のアミノ酸残基１又は約１６から約２２４の配列を有す
るＰＲＯ１１３０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤ
ＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（
ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なく
とも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、
最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験
ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そし
て（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペ
プチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１１３０ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１１３０抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１１３０ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１１３０ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１１３０ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３５０】 １２１． ＰＲＯ１３３５ 本出願において「ＰＲＯ１３３５」と命名され、新規なポリペプチドをコード
する、脱炭酸酵素をコードする核酸と相同性を有するｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ
６２８１２−１５９４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３３５ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２４２(配列番号：４２３)のア
ミノ酸残基約１又は約１６から約３３７の配列を有するＰＲＯ１３３５ポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、
少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４１（配列番号：４２２)のヌクレオチド
約２７１又は約３１６から約１２８１の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮ
Ａを含むＰＲＯ１３３５ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する
。好ましくは、ハイブリッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起
こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６２８１２−１５９４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４８のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６２８１２−１５９４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２４２(配列番号：４２３)の
アミノ酸残基１又は約１６から約３３７の配列と少なくとも約８０％の配列同一
性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する
ポリペプチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含ん
でなる単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２４２(配列
番号：４２３)のアミノ酸残基１又は約１６から約３３７の配列を有するＰＲＯ
１３３５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子
の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ
）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％
の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましく
は少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離するこ
とにより製造された、少なくとも１８０ヌクレオチドを有する単離された核酸分
子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３３５ポリペプチド、及びその可溶化、即
ち膜貫通ドメイン欠失又は不活性化変異体をコードするＤＮＡを含む単離された
核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補的である。シグ
ナルペプチドは、Ｆｉｇ２４２（配列番号：４２３）のアミノ酸位置１からアミ
ノ酸位置約１５まで伸びると仮に同定されている。膜貫通ドメインは、ＰＲＯ１
３３５アミノ酸配列（Ｆｉｇ２４２、配列番号：４２３）のアミノ酸位置約２９
１からアミノ酸位置約３１０まで伸びるものとして仮に同定されている。

【０３５１】 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２４２(配列番号：４２３)の残基１又
は約１６から約３３７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジ
ティブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも
約９０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアの
ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を
含む単離された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３３５ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長であり、Ｆｉｇ２４１(配列番号：４２２)に示すヌクレオ
チド配列から誘導される。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３３５ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３３５ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２４２(配列番号：４２３)の残基１又は
約１６から３３７を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４２(配列番号：４２３)のアミノ酸残基１
又は約１６から約３３７に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同
一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも
約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有す
るアミノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３３５ポリペプチドに関する
。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４２(配列番号：４２３)の残基１又は
約１６から３３７のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティ
ブ、好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９
０％ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミ
ノ酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３３５ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４２(配列番号：４２３)のアミノ
酸残基１又は約１６から約３３７の配列、又はその抗-ＰＲＯ１３３５抗体に結
合するのに十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３３５ポリペプチドに
関する。好ましくは、このＰＲＯ１３３５断片は、天然ＰＲＯ１３３５ポリペプ
チドの質的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
４２(配列番号：４２３)のアミノ酸残基約１又は約１６から約３３７の配列を有
するＰＲＯ１３３５ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）の
ＤＮＡ分子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が
（ａ）又は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少な
くとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性
、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試
験ＤＮＡ分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そ
して（ｉｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリ
ペプチドを提供する。 さらに他の実施態様では、本発明は天然ＰＲＯ１３３５ポリペプチドのアゴニ
スト及びアンタゴニストに関する。特別な実施態様では、アゴニスト又はアンタ
ゴニストは抗-ＰＲＯ１３３５抗体である。 さらなる実施態様では、本発明は、天然ＰＲＯ１３３５ポリペプチドを候補分
子と接触させ、前記ポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視するこ
とによる、天然ＰＲＯ１３３５ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストの
同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯ１３３５ポリペプチド、又は上
記のアゴニスト又はアンタゴニストを、製薬的に許容される担体とともに含んで
なる組成物に関する。

【０３５２】 １２２． ＰＲＯ１３２９ 本出願において「ＰＲＯ１３２９」と命名され、新規なポリペプチドをコード
するｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ６６６６０−１５８５）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１３２９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２４４(配列番号：４２９)のア
ミノ酸残基１又は約１７から約２０９の配列を有するＰＲＯ１３２９ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４３（配列番号：４２８)の残基約１３８
から約７１６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１３２９
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６６０−１５８５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７９のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ６６６６０−１５８５）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２４４(配列番号：４２９)の
アミノ酸残基約１７から約２０９の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２４４(配列
番号：４２９)のアミノ酸残基約１７から約２０９の配列を有するＰＲＯ１３２
９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。

【０３５３】 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１３２９ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ２４４（配列番号：４２９）のアミノ酸
位置１からアミノ酸位置約１６まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２４４(配列番号：４２９)の残基１７
から約２０９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１３２９ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１３２９ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１３２９ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２４４(配列番号：４２９)の残基１７か
ら２０９を含むアミノ酸配列を含んでいる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４４(配列番号：４２９)のアミノ酸残基１
７から約２０９に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２９ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４４(配列番号：４２９)の残基１７か
ら２０９のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２９ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４４(配列番号：４２９)のアミノ
酸残基１７から約２０９の配列、又はその抗-ＰＲＯ１３２９抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１３２９ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１３２９断片は、天然ＰＲＯ１３２９ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
４４(配列番号：４２９)のアミノ酸残基約１７から約２０９の配列を有するＰＲ
Ｏ１３２９ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。

【０３５４】 １２３． ＰＲＯ１５５０ 本出願において「ＰＲＯ１５５０」と命名され、新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７６３９３−１６６４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５５０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２４６(配列番号：４３１)のア
ミノ酸残基１又は約３１から約２４３の配列を有するＰＲＯ１５５０ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４５（配列番号：４３０)の残基約２２８
から約８６６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５５０
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６３９３−１６６４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６３９３−１６６４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。

【０３５５】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２４６(配列番号：４３１)の
アミノ酸残基約３１から約２４３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２４６(配列
番号：４３１)のアミノ酸残基約３１から約２４３の配列を有するＰＲＯ１５５
０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５５０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ２４６（配列番号：４３１）のアミノ酸
位置１からアミノ酸位置約３０まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２４６(配列番号：４３１)の残基３１
から約２４３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５５０ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５５０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５５０ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２４６(配列番号：４３１)の残基３１か
ら２４３を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【０３５６】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４６(配列番号：４３１)のアミノ酸残基３
１から約２４３に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５０ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４６(配列番号：４３１)の残基３１か
ら２４３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５０ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４６(配列番号：４３１)のアミノ
酸残基３１から約２４３の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５５０抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５０ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１５５０断片は、天然ＰＲＯ１５５０ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
４６(配列番号：４３１)のアミノ酸残基約３１から約２４３の配列を有するＰＲ
Ｏ１５５０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。

【０３５７】 １２４． さらなる実施態様 本発明の他の実施態様では、本発明はここに記載したポリペプチドの任意のも
のをコードするＤＮＡを含んでなるベクターを提供する。そのようなベクターを
含んでなる宿主細胞もまた提供される。例を挙げると、宿主細胞はＣＨＯ細胞、
大腸菌、又は酵母でありうる。ここに記載のポリペプチドの任意のものを生産す
るための方法が更に提供され、これは、所望のポリペプチドの発現に適した条件
下で宿主細胞を培養し、細胞培養から所望のポリペプチドを回収することを含ん
でなる。 他の実施態様では、本発明は、異種性ポリぺプチド又はアミノ酸配列に融合し
たここに記載のポリペプチドの任意のものを含んでなるキメラ分子を提供する。
そのようなキメラ分子の例は、免疫グロブリンのＦｃ領域又はエピトープタグ配
列に融合したここに記載のポリペプチドの任意のものが含まれる。 他の実施態様では、本発明は上述の又は下記のポリペプチドの任意のものに特
異的に結合する抗体を提供する。場合によっては、抗体はモノクローナル抗体、
ヒト化抗体、抗体断片又は一本鎖抗体である。 さらに他の実施態様では、本発明は、ゲノム及びｃＤＮＡヌクレオチド配列を
単離するために有用なオリゴヌクレオチドプローブを提供し、ここでこれらプロ
ーブは上述の又は下記のヌクレオチド配列の任意のものから誘導されうる。 他の実施態様では、本発明はＰＲＯポリペプチドをコードするヌクレオチド配
列を含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸分子は、（ａ）ここに開示された全長アミノ酸配
列、ここに開示されたシグナルペプチドを欠くアミノ酸配列、又はシグナルペプ
チド有無のここに開示した膜貫通タンパク質の細胞外ドメインを有するＰＲＯポ
リペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８１％の配列
同一性、更により好ましくは少なくとも約８２％の配列同一性、更により好まし
くは少なくとも約８３％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８４％
の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、更により
好ましくは少なくとも約８６％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約
８７％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８８％の配列同一性、更
により好ましくは少なくとも約８９％の配列同一性、更により好ましくは少なく
とも約９０％の酸配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９１％の配列同
一性、更により好ましくは少なくとも約９２％の配列同一性、更により好ましく
は少なくとも約９３％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９４％の
配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性、更により好
ましくは少なくとも約９６％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９
７％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９８％の配列同一性、更に
より好ましくは少なくとも約９９％の配列同一性を有しているヌクレオチド配列
を含んでなる。

【０３５８】 他の態様では、単離された核酸分子は、（ａ）ここに開示された全長ＰＲＯポ
リペプチドｃＤＮＡのコード化配列、ここに開示されたシグナルペプチドを欠く
ＰＲＯポリペプチドｃＤＮＡのコード化配列、又はシグナルペプチド有無のここ
に開示した膜貫通ＰＲＯポリペプチドの細胞外ドメインのコード化配列、又は（
ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８１％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８
２％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８３％の配列同一性、更に
より好ましくは少なくとも約８４％の配列同一性、更により好ましくは少なくと
も約８５％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８６％の配列同一性
、更により好ましくは少なくとも約８７％の配列同一性、更により好ましくは少
なくとも約８８％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８９％の配列
同一性、更により好ましくは少なくとも約９０％の酸配列同一性、更により好ま
しくは少なくとも約９１％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９２
％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９３％の配列同一性、更によ
り好ましくは少なくとも約９４％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも
約９５％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９６％の配列同一性、
更により好ましくは少なくとも約９７％の配列同一性、更により好ましくは少な
くとも約９８％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９９％の配列同
一性を有しているヌクレオチド配列を含んでなる。 さらなる態様では、本発明は、（ａ）ここに開示されたＡＴＴＣに寄託された
ヒトタンパク質ｃＤＮＡの任意のものによりコードされる同じ成熟ポリペプチド
をコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８１％の配列同一性、更
により好ましくは少なくとも約８２％の配列同一性、更により好ましくは少なく
とも約８３％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８４％の配列同一
性、更により好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、更により好ましくは
少なくとも約８６％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８７％の配
列同一性、更により好ましくは少なくとも約８８％の配列同一性、更により好ま
しくは少なくとも約８９％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９０
％の酸配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９１％の配列同一性、更に
より好ましくは少なくとも約９２％の配列同一性、更により好ましくは少なくと
も約９３％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９４％の配列同一性
、更により好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性、更により好ましくは少
なくとも約９６％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９７％の配列
同一性、更により好ましくは少なくとも約９８％の配列同一性、更により好まし
くは少なくとも約９９％の配列同一性を有しているヌクレオチド配列を含んでな
る単離された核酸分子に関する。 本発明の他の態様は、膜貫通ドメインが欠失されているか膜貫通ドメインが不
活性化されているＰＲＯポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含んでな
る単離された核酸分子を提供し、またはそのようなコード化ヌクレオチド配列に
相補的であり、ここでそのようなポリペプチドの膜貫通ドメインがここに開示さ
れる。従って、ここに記載されたＰＲＯポリペプチドの可溶性細胞外ドメインが
考慮される。

【０３５９】 他の実施態様は、例えばハイブリッド形成プローブとしての又は抗-ＰＲＯ抗
体に対する結合部位を含んでなるポリペプチドを場合によってはコードするＰＲ
Ｏポリペプチドの断片をコードするための用途が見出されるＰＲＯポリペプチド
コード配列の断片に関する。そのような核酸断片は通常少なくとも約２０のヌク
レオチド長さ、好ましくは少なくとも約３０のヌクレオチド長さ、より好ましく
は少なくとも約４０のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約５０
のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約６０のヌクレオチド長さ
、更により好ましくは少なくとも約７０のヌクレオチド長さ、更により好ましく
は少なくとも約８０のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約９０
のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約１００のヌクレオチド長
さ、更により好ましくは少なくとも約１１０のヌクレオチド長さ、更により好ま
しくは少なくとも約１２０のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも
約１３０のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約１４０のヌクレ
オチド長さ、更により好ましくは少なくとも約１５０のヌクレオチド長さ、更に
より好ましくは少なくとも約１６０のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少
なくとも約１７０のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約１８０
のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約１９０のヌクレオチド長
さ、更により好ましくは少なくとも約２００のヌクレオチド長さ、更により好ま
しくは少なくとも約２５０のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも
約３００のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約３５０のヌクレ
オチド長さ、更により好ましくは少なくとも約４００のヌクレオチド長さ、更に
より好ましくは少なくとも約４５０のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少
なくとも約５００のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約６００
のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも約７００のヌクレオチド長
さ、更により好ましくは少なくとも約８００のヌクレオチド長さ、更により好ま
しくは少なくとも約９００のヌクレオチド長さ、更により好ましくは少なくとも
約１０００のヌクレオチド長さであり、ここで、「約」という用語は、その参照
長さのプラス又はマイナス１０％の参照ヌクレオチド配列長さを意味する。ＰＲ
Ｏポリペプチドコード化ヌクレオチド配列の新規な断片は、多くのよく知られた
配列アラインメントプログラムの任意のものを使用してＰＲＯポリペプチドコー
ドヌクレオチド配列を他の既知のヌクレオチド配列にアラインメントさせ、どの
ＰＲＯポリペプチドコード化ヌクレオチド配列断片が新規であるかを決定するこ
とにより常套的に決定することができることに留意される。そのようなＰＲＯポ
リペプチドコード化ヌクレオチド配列の全てがここで考慮される。また考慮され
るものは、これらのヌクレオチド分子断片によりコードされるＰＲＯポリペプチ
ド断片、好ましくは抗-ＰＲＯ抗体に対する結合部位を含んでなるＰＲＯポリペ
プチド断片である。 他の実施態様では、本発明は上記において特定した単離核酸配列の任意のもの
によりコードされる単離されたＰＲＯポリペプチドを提供する。

【０３６０】 ある態様では、本発明は、ここに開示された全長アミノ酸配列、ここに開示さ
れたシグナルペプチドを欠く全長アミノ酸配列、又はシグナルペプチド有無のこ
こに開示した膜貫通タンパク質の細胞外ドメインを有するＰＲＯポリペプチドに
対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８１％の配
列同一性、更により好ましくは少なくとも約８２％の配列同一性、更により好ま
しくは少なくとも約８３％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８４
％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、更によ
り好ましくは少なくとも約８６％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも
約８７％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８８％の配列同一性、
更により好ましくは少なくとも約８９％の配列同一性、更により好ましくは少な
くとも約９０％の酸配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９１％の配列
同一性、更により好ましくは少なくとも約９２％の配列同一性、更により好まし
くは少なくとも約９３％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９４％
の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性、更により
好ましくは少なくとも約９６％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約
９７％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９８％の配列同一性、更
により好ましくは少なくとも約９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含ん
でなる、単離されたＰＲＯポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、ここに開示されたＡＴＴＣに寄託されたヒトタ
ンパク質ｃＤＮＡの任意のものによりコードされるアミノ酸配列に対して、少な
くとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８１％の配列同一性、更
により好ましくは少なくとも約８２％の配列同一性、更により好ましくは少なく
とも約８３％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８４％の配列同一
性、更により好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、更により好ましくは
少なくとも約８６％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約８７％の配
列同一性、更により好ましくは少なくとも約８８％の配列同一性、更により好ま
しくは少なくとも約８９％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９０
％の酸配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９１％の配列同一性、更に
より好ましくは少なくとも約９２％の配列同一性、更により好ましくは少なくと
も約９３％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９４％の配列同一性
、更により好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性、更により好ましくは少
なくとも約９６％の配列同一性、更により好ましくは少なくとも約９７％の配列
同一性、更により好ましくは少なくとも約９８％の配列同一性、更により好まし
くは少なくとも約９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる単離さ
れたＰＲＯポリペプチドに関する。

【０３６１】 さらなる態様では、本発明は、ここに開示された全長アミノ酸配列、ここに開
示されたシグナルペプチドを欠く全長アミノ酸配列、又はシグナルペプチド有無
のここに開示された膜貫通タンパク質の細胞外ドメインを有するＰＲＯポリペプ
チドのアミノ酸配列と比較したとき、少なくとも約８０％のポジティブ、好まし
くは少なくとも約８１％のポジティブ、より好ましくは少なくとも約８２％のポ
ジティブ、更により好ましくは少なくとも約８３％のポジティブ、更により好ま
しくは少なくとも約８４％のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約８５
％のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約８６％のポジティブ、更によ
り好ましくは少なくとも約８７％のポジティブ、更により好ましくは少なくとも
約８８％のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約８９％のポジティブ、
更により好ましくは少なくとも約９０％のポジティブ、更により好ましくは少な
くとも約９１％のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約９２％のポジテ
ィブ、更により好ましくは少なくとも約９３％のポジティブ、更により好ましく
は少なくとも約９４％のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約９５％の
ポジティブ、更により好ましくは少なくとも約９６％のポジティブ、更により好
ましくは少なくとも約９７％のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約９
８％のポジティブ、更により好ましくは少なくとも約９９％のポジティブのスコ
アを示すアミノ酸配列を含んでなる単離されたＰＲＯポリペプチドに関する。 特定の態様では、本発明は、Ｎ末端シグナル配列及び／又は開始メチオニンを
持たない単離されたＰＲＯポリペプチドを提供し、それは上述したそのようなア
ミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列によりコードされる。これを生産する
方法もまたここに記載され、ここで、これらの方法はＰＲＯポリペプチドの発現
に適した条件下で適当なコード化核酸分子を含むベクターを含んでなる宿主細胞
を培養し、細胞培地からＰＲＯポリペプチドを回収することを含んでなる。

【０３６２】 本発明の他の態様は、膜貫通ドメインが欠失されたか膜貫通ドメインが不活性
化された単離されたＰＲＯポリペプチドを提供する。これを生産する方法もまた
ここに記載され、ここで、これらの方法はＰＲＯポリペプチドの発現に適した条
件下で適当なコード化核酸分子を含むベクターを含んでなる宿主細胞を培養し、
細胞培地からＰＲＯポリペプチドを回収することを含んでなる。 さらに他の実施態様では、本発明は、ここで特定した天然ＰＲＯポリペプチド
のアゴニスト及びアンタゴニストに関する。 さらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯポリペプチドを候補分子と接触させ
、前記ＰＲＯポリペプチドによって媒介される生物学的活性を監視することを含
んでなる、ＰＲＯ ポリペプチドに対するアゴニスト又はアンタゴニストの同定方法に関する。 またさらなる実施態様では、本発明は、ＰＲＯポリペプチド、又はここに記載
のアゴニスト又はアンタゴニスト、又は抗-ＰＲＯ抗体を担体とともに含んでな
る物質の組成物に関する。場合によっては、担体は製薬的に許容される担体であ
る。 本発明の他の実施態様は、上述のＰＲＯポリペプチド、そのアゴニスト又はア
ンタゴニスト又は抗-ＰＲＯ抗体に応答性である症状の治療に有用な医薬の調製
のための、ＰＲＯポリペプチド、またはそのアゴニスト又はアンタゴニスト又は
抗-ＰＲＯ抗体の使用に関する。

【０３６３】 （好適な実施態様の詳細な説明） Ｉ．定義 ここで使用される際の「ＰＲＯポリペプチド」及び「ＰＲＯ」又は「ＵＣＰ］
という用語は、直後に数値符号がある場合に種々のポリペプチドを指し、完全な
符号（例えば、ＰＲＯ／数字）は、ここに記載する特定のポリペプチド配列を意
味する。ここで使用される「ＰＲＯ／数字ポリペプチド」及び「ＰＲＯ／数字」
であって、「数字」がここで使用される実際の数値符号として与えられる用語は
、天然配列ポリペプチド及び変異体（ここで更に詳細に定義する）を含む。ここ
に記載されるＰＲＯポリペプチドは、ヒト組織型又は他の供給源といった種々の
供給源から単離してもよく、組換え又は合成方法によって調製してもよい。 「天然配列ＰＲＯポリペプチド」又は「ＵＣＰ」は、天然由来の対応するＰＲ
Ｏポリペプチドと同一のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含んでいる。この
ような天然配列ＰＲＯポリペプチドは、自然から単離することもできるし、組換
え又は合成手段により生産することもできる。「天然配列ＰＲＯポリペプチド」
という用語には、特に、特定のＰＲＯポリペプチドの自然に生じる切断又は分泌
形態(例えば、細胞外ドメイン配列)、自然に生じる変異形態(例えば、選択的に
スプライシングされた形態)及びそのポリペプチドの自然に生じる対立遺伝子変
異体が含まれる。本発明の種々の実施態様において、天然配列ＰＲＯポリペプチ
ドは、添付の図面に示される全長アミノ酸配列を含む成熟又は全長天然配列ポリ
ペプチドである。開始及び停止コドンは、図において太字又は下線で示した。し
かし、添付の図面に開示したＰＲＯポリペプチドは、図面におけるアミノ酸１と
してここに命名されるメチオニン残基で始まるように示されているが、図面にお
けるアミノ酸位置１の上流又は下流に位置する他のメチオニン残基をＰＲＯポリ
ペプチドの開始アミノ酸残基として用いることも考えられるし可能でもある。 ＰＲＯポリペプチド「細胞外ドメイン」又は「ＥＣＤ」は、膜貫通及び細胞質
ドメインを実質的に有しないＰＲＯポリペプチドの形態を意味する。通常、ＰＲ
ＯポリペプチドＥＣＤは、それらの膜貫通及び／又は細胞質ドメインを１％未満
、好ましくはそのようなドメインを０．５％未満しか持たない。本発明のＰＲＯ
ポリペプチドについて同定された任意の膜貫通ドメインは、疎水性ドメインのそ
の型を同定するために当該分野において日常的に使用される基準に従い同定され
ることが理解されるであろう。膜貫通ドメインの厳密な境界は変わり得るが、最
初に同定されたドメインのいずれかの末端から約５アミノ酸を越えない可能性が
高い。従って、ＰＲＯポリペプチド細胞外ドメインは、場合によっては、実施例
又は明細書で同定されるように膜貫通ドメイン及び／又は細胞外ドメインの境界
のいずれかの側から約５を越えないアミノ酸を含んでもよく、シグナルペプチド
を伴う又は伴わない、それらのポリペプチド及びそれらをコードする核酸は、本
発明で考慮される。

【０３６４】 ここに開示する種々のＰＲＯポリペプチドの「シグナルペプチド」の適切な位
置は、添付の図面に示す。しかし、注記するように、シグナルペプチドのＣ-末
端境界は変化しうるが、ここで最初に定義したようにシグナルペプチドＣ-末端
境界のいずれかの側で約５アミノ酸未満である可能性が最も高く、シグナルペプ
チドのＣ-末端境界は、そのような型のアミノ酸配列成分を同定するのに日常的
に使用される基準に従って同定しうる（例えば、Nielsen等, Prot. Eng. 10: 1-
6 (1997)及びvon Heinje等, Nucl. Acids. Res. 14: 4683-4690 (1986)）。さら
に、幾つかの場合には、分泌ポリペプチドからのシグナルペプチドの切断は完全
に均一ではなく、一以上の分泌種をもたらすことも認められる。シグナルペプチ
ドがここに定義されるシグナルペプチドのＣ-末端境界の何れかの側の約５アミ
ノ酸未満内で切断されるこれらの成熟ポリペプチド、及びそれらをコードするポ
リヌクレオチドは、本発明で考慮される。 「ＰＲＯポリペプチド変異体」とは、上記又は下記に定義されるように、ここ
に開示される全長天然配列ＰＲＯポリペプチド、ここに開示されたシグナルペプ
チドを欠く全長天然配列ＰＲＯポリペプチド配列、シグナルペプチド有無のここ
に開示されたＰＲＯの細胞外ドメイン又はここに開示された全長ＰＲＯポリペプ
チドの他の断片と、少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性を有する活性ＰＲ
Ｏポリペプチドを意味する。このようなＰＲＯポリペプチド変異体には、例えば
、全長天然アミノ酸配列のＮ-又はＣ-末端において一又は複数のアミノ酸残基が
付加、もしくは欠失されたＰＲＯポリペプチドが含まれる。通常、ＰＲＯポリペ
プチド変異体は、ここに開示される全長天然アミノ酸配列、ここに開示されたシ
グナルペプチドを欠く全長天然配列ＰＲＯポリペプチド配列、シグナルペプチド
有無のここに開示されたＰＲＯの細胞外ドメイン又はここに開示された全長ＰＲ
Ｏポリペプチドの他の断片と、少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性、好ま
しくは少なくとも約８１％のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約
８２％のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約８３％のアミノ酸配
列同一性、より好ましくは少なくとも約８４％のアミノ酸配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約８５％のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約
８６％のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約８７％のアミノ酸配
列同一性、より好ましくは少なくとも約８８％のアミノ酸配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約８９％のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９０％のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約９１％のアミノ酸配
列同一性、より好ましくは少なくとも約９２％のアミノ酸配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９３％のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９４％のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約９５％のアミノ酸配
列同一性、より好ましくは少なくとも約９６％のアミノ酸配列同一性、より好ま
しくは少なくとも約９７％のアミノ酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９８％のアミノ酸配列同一性、そして、より好ましくは少なくとも約９９％のア
ミノ酸配列同一性を有している。通常は、ＰＲＯ変異体ポリペプチドは、少なく
とも約１０アミノ酸長、より多くは少なくとも約２０アミノ酸長、より多くは少
なくとも約３０アミノ酸長、より多くは少なくとも約４０アミノ酸長、より多く
は少なくとも約５０アミノ酸長、より多くは少なくとも約６０アミノ酸長、より
多くは少なくとも約７０アミノ酸長、より多くは少なくとも約８０アミノ酸長、
より多くは少なくとも約９０アミノ酸長、より多くは少なくとも約１００アミノ
酸長、より多くは少なくとも約１５０アミノ酸長、より多くは少なくとも約２０
０アミノ酸長、より多くは少なくとも約３００アミノ酸長、又はそれ以上である
。

【０３６５】 ここに定義されるＰＲＯポリペプチドに対してここで同定されている「パーセ
ント(％)アミノ酸配列同一性」は、配列を整列させ、最大のパーセント配列同一
性を得るために必要ならば間隙を導入し、如何なる保存的置換も配列同一性の一
部と考えないとした、ＰＲＯポリペプチドのアミノ酸残基と同一である候補配列
中のアミノ酸残基のパーセントとして定義される。パーセントアミノ酸配列同一
性を決定する目的のためのアラインメントは、当業者の技量の範囲にある種々の
方法、例えばBLAST、BLAST-2、ALIGN又はMegalign(DNASTAR)ソフトウエアのよう
な公に入手可能なコンピュータソフトウエアを使用することにより達成可能であ
る。当業者であれば、比較される配列の全長に対して最大のアラインメントを達
成するために必要な任意のアルゴリズムを含む、アラインメントを測定するため
の適切なパラメータを決定することができる。しかし、ここでの目的のためには
、％アミノ酸配列同一性値は、WU-BLAST-2コンピュータプログラム（Altschul等
, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて計算される。殆どのW
U-BLAST-2検索パラメータは初期値に設定される。初期値に設定されない、即ち
調節可能なパラメータは以下の値に設定する：オーバーラップスパン＝１、オー
バーラップフラクション＝０．１２５、ワード閾値（Ｔ）＝１１、及びスコアリ
ングマトリクス＝BLOSUM62。ここでの目的のために、％アミノ酸配列同一性値は
、（ａ）天然ＰＲＯポリペプチドから誘導された配列を有する対象とするＰＲＯ
ポリペプチドのアミノ酸配列と、対象とする比較アミノ酸配列（即ち、対象とす
るＰＲＯポリペプチドが比較されるＰＲＯポリペプチド変異体であってもよい配
列）との間の、一致する同一アミノ酸残基の数を、（ｂ）対象とするＰＲＯポリ
ペプチドの残基の総数で除した商によって決定される。 特に断らない限り、ここで用いられる全ての％アミノ酸配列同一性値は、直上
のパラグラフに記載したようにしてWU-BLAST-2コンピュータプログラムを用いて
得られる。しかしながら、％アミノ酸配列同一性値は、以下に記載するように、
ALIGN-2プログラム用の完全なソースコードがＦｉｇ２４８Ａ−Ｑに与えられて
いる配列比較プログラムALIGN-2を用いても得られる。ALIGN-2配列比較コンピュ
ータプログラムはジェネンテク社によって作成され、Ｆｉｇ２４８Ａ−Ｑに示し
たソースコードは米国著作権事務所, Washington D.C., 20559に使用者用書類と
ともに提出され、米国著作権登録番号TXU510087の下で登録されている。ALIGN-2
はジェネンテク社、South San Francisco, Californiaから好適に入手可能であ
り、またＦｉｇ２４８Ａ−Ｑに与えたソースコードからコンパイルしてもよい。
ALIGN-2プログラムは、UNIXオペレーティングシステム、好ましくはデジタルUNI
X V4.0Dでの使用のためにコンパイルされる。全ての配列比較パラメータは、ALI
GN-2プログラムによって設定され変動しない。

【０３６６】 アミノ酸配列比較にALIGN-2が用いれれる状況では、与えられたアミノ酸配列
Ａの、与えられたアミノ酸配列Ｂとの、又はそれに対する％アミノ酸配列同一性
（あるいは、与えられたアミノ酸配列Ｂと、又はそれに対して或る程度の％アミ
ノ酸配列同一性を持つ又は含む与えられたアミノ酸配列Ａと言うこともできる）
は次のように計算される： 分率Ｘ／Ｙの１００倍 ここで、Ｘは配列アラインメントプログラムALIGN-2のＡ及びＢのアラインメン
トによって同一であると一致したスコアのアミノ酸残基の数であり、ＹはＢの全
アミノ酸残基数である。アミノ酸配列Ａの長さがアミノ酸配列Ｂの長さと異なる
場合、ＡのＢに対する％アミノ酸配列同一性は、ＢのＡに対する％アミノ酸配列
同一性とは異なることは理解されるであろう。この方法を用いた％アミノ酸配列
同一性の計算の例として、Ｆｉｇ２４７Ａ−Ｂは、「比較タンパク質」と称され
るアミノ酸配列の「ＰＲＯ」と称されるアミノ酸配列に対する％アミノ酸配列同
一性の計算方法を示す。 また、％アミノ酸配列同一性は、配列比較プログラムNCBI-BLAST2（Altschul
等, Nucleic Acids Res. 25: 3389-3402 (1997)）を用いて決定してもよい。NCB
I-BLAST2配列比較プログラムは、http://ww.ncbi.nlm.nih.govからダウンロード
できる。NCBI-BLAST2は幾つかの検索パラメータを使用し、それら検索パラメー
タの全ては初期値に設定され、例えば、unmask＝可、鎖＝全て、予測される発生
＝１０、最小低複合長＝１５／５、マルチパスｅ-値＝０．０１、マルチパスの
定数＝２５、最終ギャップアラインメントのドロップオフ＝２５、及びスコアリ
ングマトリクス＝BLOSUM62を含む。 アミノ酸配列比較にNCBI-BLAST2が用いれれる状況では、与えられたアミノ酸
配列Ａの、与えられたアミノ酸配列Ｂとの、又はそれに対する％アミノ酸配列同
一性（あるいは、与えられたアミノ酸配列Ｂと、又はそれに対して或る程度の％
アミノ酸配列同一性を持つ又は含む与えられたアミノ酸配列Ａと言うこともでき
る）は次のように計算される： 分率Ｘ／Ｙの１００倍 ここで、Ｘは配列アラインメントプログラムNCBI-BLAST2のＡ及びＢのアライン
メントによって同一であると一致したスコアのアミノ酸残基の数であり、ＹはＢ
の全アミノ酸残基数である。アミノ酸配列Ａの長さがアミノ酸配列Ｂの長さと異
なる場合、ＡのＢに対する％アミノ酸配列同一性は、ＢのＡに対する％アミノ酸
配列同一性とは異なることは理解されるであろう。

【０３６７】 「ＰＲＯ変異体ポリヌクレオチド」又は「ＰＲＯ変異体核酸配列」とは、下記
に定義されるように、活性ＰＲＯポリペプチドをコードする核酸分子であり、こ
こに開示する全長天然配列ＰＲＯポリペプチド配列、ここに開示するシグナルペ
プチドを欠いた全長天然配列ＰＲＯポリペプチド配列、シグナルペプチド有無の
ここに開示するＰＲＯポリペプチドの細胞外ドメイン、又はここに開示する全長
ＰＲＯポリペプチド配列の他の任意の断片をコードする核酸配列と少なくとも８
０％の配列同一性を有する。通常は、ＰＲＯ変異体ポリペプチドヌクレオチドは
、ここに開示する全長天然配列ＰＲＯポリペプチド配列、ここに開示するシグナ
ルペプチドを欠いた全長天然配列ＰＲＯポリペプチド配列、シグナルペプチド有
無のここに開示するＰＲＯポリペプチドの細胞外ドメイン、又はここに開示する
全長ＰＲＯポリペプチドの他の任意の断片をコードする核酸配列と、少なくとも
約８０％の核酸配列同一性、好ましくは少なくとも約８１％の核酸配列同一性、
より好ましくは少なくとも約８２％の核酸配列同一性、より好ましくは少なくと
も約８３％の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約８４％の核酸配列同
一性、より好ましくは少なくとも約８５％の核酸配列同一性、より好ましくは少
なくとも約８６％の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約８７％の核酸
配列同一性、より好ましくは少なくとも約８８％の核酸配列同一性、より好まし
くは少なくとも約８９％の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約９１％の核酸配列同一性、より
好ましくは少なくとも約９２％の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約
９３％の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約９４％の核酸配列同一性
、より好ましくは少なくとも約９５％の核酸配列同一性、より好ましくは少なく
とも約９６％の核酸配列同一性、より好ましくは少なくとも約９７％の核酸配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９８％の核酸配列同一性、そして、より好
ましくは少なくとも約９９％の核酸配列同一性を有している。変異体は、天然ヌ
クレオチド配列を含まない。 通常は、ＰＲＯ変異体ポリヌクレオチドは、少なくとも約３０ヌクレオチド長
、より多くは少なくとも約６０ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約９０ヌ
クレオチド長、より多くは少なくとも約１２０ヌクレオチド長、より多くは少な
くとも約１５０ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約１８０ヌクレオチド長
、より多くは少なくとも約２１０ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約２４
０ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約２７０ヌクレオチド長、より多くは
少なくとも約３００ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約４５０ヌクレオチ
ド長、より多くは少なくとも約６００ヌクレオチド長、より多くは少なくとも約
９００ヌクレオチド長、又はそれ以上である。

【０３６８】 ここで同定されるＰＲＯコード化核酸配列に対する「パーセント(％)核酸配列
同一性」は、配列を整列させ、最大のパーセント配列同一性を得るために必要な
らば間隙を導入し、ＰＲＯ配列のヌクレオチドと同一である候補配列中のヌクレ
オチドのパーセントとして定義される。パーセント核酸配列同一性を決定する目
的のためのアラインメントは、当業者の知る範囲にある種々の方法、例えばBLAS
T、BLAST-2、ALIGN又はMegalign(DNASTAR)ソフトウエアのような公に入手可能な
コンピュータソフトウエアを使用することにより達成可能である。しかし、ここ
での目的のために、％核酸配列同一性の値はWU-BLAST-2コンピュータプログラム
（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて計算さ
れる。殆どのWU-BLAST-2検索パラメータは初期値に設定される。初期値に設定さ
れない、即ち調節可能なパラメータは以下の値に設定する：オーバーラップスパ
ン＝１、オーバーラップフラクション＝０．１２５、ワード閾値（Ｔ）＝１１、
及びスコアリングマトリクス＝BLOSUM62。ここでの目的のために、％核酸配列同
一性の値は、（ａ）天然配列ＰＲＯポリペプチド-コード化核酸分子から誘導さ
れた配列を有する対象とするＰＲＯポリペプチド-コード化核酸分子の核酸配列
と、対象とする核酸分子（即ち、対象とするＰＲＯポリペプチド-コード化核酸
が比較される変異体ＰＲＯポリヌクレオチドであってもよい配列）との間の、WU
-BLAST-2で決定した一致する同一ヌクレオチドの数を、（ｂ）対象とするＰＲＯ
ポリペプチド-コード化核酸分子のヌクレオチド総数で除した商によって決定さ
れる。例えば、「核酸配列Ｂと少なくとも８０％の核酸配列同一性を持つ核酸配
列を含む単離した核酸配列」という記載において、核酸配列Ａは対象とする比較
核酸配列であり、核酸配列Ｂは対象とするＰＲＯポリペプチドコード化核酸配列
である。

【０３６９】 特に断らない限り、ここで用いられる全ての％核酸配列同一性値は、直上のパ
ラグラフに記載したようにしてWU-BLAST-2コンピュータプログラムを用いて得ら
れる。しかしながら、％核酸配列同一性値は、以下に記載するように、ALIGN-2
プログラム用の完全なソースコードがＦｉｇ２４８Ａ−Ｑに与えられている配列
比較プログラムALIGN-2を用いても得られる。ALIGN-2配列比較コンピュータプロ
グラムはジェネンテク社によって作成され、Ｆｉｇ２４８Ａ−Ｑに示したソース
コードは米国著作権事務所, Washington D.C., 20559に使用者用書類とともに提
出され、米国著作権登録番号TXU510087の下で登録されている。ALIGN-2プログラ
ムはジェネンテク社、South San Francisco, Californiaから好適に入手可能で
あり、またＦｉｇ２４８Ａ−Ｑに与えたソースコードからコンパイルしてもよい
。ALIGN-2プログラムは、UNIXオペレーティングシステム、好ましくはデジタルU
NIX V4.0Dでの使用のためにコンパイルされる。全ての配列比較パラメータは、A
LIGN-2プログラムによって設定され変動しない。 核酸配列比較にALIGN-2が用いれれる状況では、与えられた核酸配列Ｃの、与
えられた核酸配列Ｄとの、又はそれに対する％核酸配列同一性（あるいは、与え
られた核酸配列Ｄと、又はそれに対して或る程度の％核酸配列同一性を持つ又は
含む与えられた核酸配列Ｃと言うこともできる）は次のように計算される： 分率Ｗ／Ｚの１００倍 ここで、Ｗは配列アラインメントプログラムALIGN-2のＣ及びＤのアラインメン
トによって同一であると一致したスコアのヌクレオチドの数であり、ＺはＤの全
ヌクレオチド数である。核酸配列Ｃの長さが核酸配列Ｄの長さと異なる場合、Ｃ
のＤに対する％核酸配列同一性は、ＤのＣに対する％核酸配列同一性とは異なる
ことは理解されるであろう。％核酸配列同一性の計算の例として、Ｆｉｇ２４７
Ｃ−Ｄは、「比較ＤＮＡ」と称される核酸配列の「ＰＲＯ-ＤＮＡ」と称される
核酸配列に対する％核酸配列同一性の計算方法を示す。 また、％核酸配列同一性は、配列比較プログラムNCBI-BLAST2（Altschul等, N
ucleic Acids Res. 25: 3389-3402 (1997)）を用いて決定してもよい。NCBI-BLA
ST2配列比較プログラムは、http://www.ncbi.nlm.nih.govからダウンロードでき
る。NCBI-BLAST2は幾つかの検索パラメータを使用し、それら検索パラメータの
全ては初期値に設定され、例えば、unmask＝可、鎖＝全て、予測される発生＝１
０、最小低複合長＝１５／５、マルチパスｅ-値＝０．０１、マルチパスの定数
＝２５、最終ギャップアラインメントのドロップオフ＝２５、及びスコアリング
マトリクス＝BLOSUM62を含む。 核酸配列比較にNCBI-BLAST2が用いれれる状況では、与えられた核酸配列Ｃの
、与えられた核酸配列Ｄとの、又はそれに対する％核酸配列同一性（あるいは、
与えられた核酸配列Ｄと、又はそれに対して或る程度の％核酸配列同一性を持つ
又は含む与えられた核酸配列Ｃと言うこともできる）は次のように計算される： 分率Ｗ／Ｚの１００倍 ここで、Ｗは配列アラインメントプログラムNCBI-BLAST2のＣ及びＤのアライン
メントによって同一であると一致したスコアの核酸残基の数であり、ＺはＤの全
核酸残基数である。核酸配列Ｃの長さが核酸配列Ｄの長さと異なる場合、ＣのＤ
に対する％核酸配列同一性は、ＤのＣに対する％核酸配列同一性とは異なること
は理解されるであろう。 他の実施態様では、ＰＲＯ変異体ポリペプチドヌクレオチドは、活性ＰＲＯポ
リペプチドをコードし、好ましくは緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で、
ここに開示する全長ＰＲＯポリペプチドをコードするヌクレオチド配列にハイブ
リッド形成する核酸分子である。ＰＲＯ変異体ポリペプチドは、ＰＲＯ変異体ポ
リヌクレオチドにコードされるものであってもよい。

【０３７０】 「陽性（ポジティブ）」という用語は、上記のように実施された配列比較の中
で、比較された配列において同一ではないが類似の特性を有している残基（例え
ば、保存的置換の結果として、下記の表１参照）を含む。ここでの目的のために
、陽性の％値は、（ａ）天然ＰＲＯポリペプチドから誘導された配列を有する対
象とするＰＲＯポリペプチドのアミノ酸配列と、対象とする比較アミノ酸配列（
即ち、ＰＲＯポリペプチド配列が比較されるアミノ酸配列）との間の、WU-BLAST
-2のBLOSUM62マトリクス内でポジティブな値が付けられたアミノ酸残基の数を、
（ｂ）対象とするＰＲＯポリペプチドのアミノ酸残基の総数で除した商によって
決定される。 特に断らない限り、陽性の％値は、直上のパラグラフに記載したようにして計
算される。WU-BLAST-2コンピュータプログラムを用いて得られる。しかしながら
、ALIGN-2及びNCBI-BLAST2について上記したように実施されるアミノ酸配列同一
性には、同一のみならず類似した特性をもつ配列におけるアミノ酸残基を含む。
対象とするアミノ酸残基に対して陽性とされたアミノ酸残基は、対象とするアミ
ノ酸残基と同一であるか、又は対象とするアミノ酸残基の好ましい置換（下記の
表１に定義）であるものである。 ALIGN-2又はNCBI-BLAST2を用いたアミノ酸配列比較では、与えられたアミノ酸
配列Ａの、与えられたアミノ酸配列Ｂとの、又はそれに対する陽性の％値（ある
いは、与えられたアミノ酸配列Ｂと、又はそれに対して或る程度の％アミノ酸配
列同一性を持つ又は含む与えられたアミノ酸配列Ａと言うこともできる）は次の
ように計算される： 分率Ｘ／Ｙの１００倍 ここで、Ｘは配列アラインメントプログラムALIGN-2又はNCBI-BLAST2のＡ及びＢ
のアラインメントによって陽性であるとされたスコアのアミノ酸残基の数であり
、ＹはＢの全アミノ酸残基数である。アミノ酸配列Ａの長さがアミノ酸配列Ｂの
長さと等しくない場合、ＡのＢに対する％陽性は、ＢのＡに対する％陽性とは異
なることが理解されるであろう。

【０３７１】 「単離された」とは、ここで開示された種々のポリペプチドを記述するために
使用するときは、その自然環境の成分から同定され分離され及び／又は回収され
たポリペプチドを意味する。その自然環境の汚染成分とは、そのポリペプチドの
診断又は治療への使用を典型的には妨害する物質であり、酵素、ホルモン、及び
他のタンパク質様又は非タンパク質様溶質が含まれる。好ましい実施態様におい
て、ポリペプチドは、(１)スピニングカップシークエネーターを使用することに
より、少なくとも１５残基のＮ末端あるいは内部アミノ酸配列を得るのに充分な
ほど、あるいは、(２)クーマシーブルーあるいは好ましくは銀染色を用いた非還
元あるいは還元条件下でのＳＤＳ-ＰＡＧＥによる均一性まで精製される。単離
されたポリペプチドには、ＰＲＯポリペプチドの自然環境の少なくとも１つの成
分が存在しないため、組換え細胞内のインサイツのタンパク質が含まれる。しか
しながら、通常は、単離されたポリペプチドは少なくとも１つの精製工程により
調製される。 「単離された」ＰＲＯポリペプチドコード化核酸は、同定され、ＰＲＯポリペ
プチドをコードする核酸の天然源に通常付随している少なくとも１つの汚染核酸
分子から分離された核酸分子である。単離されたＰＲＯポリペプチドコード化核
酸分子は、天然に見出される形態あるいは設定以外のものである。ゆえに、単離
されたＰＲＯポリペプチドコード化核酸分子は、天然の細胞中に存在するＰＲＯ
ポリペプチドコード化核酸分子とは区別される。しかし、単離されたＰＲＯポリ
ペプチドコード化核酸分子は、例えば、核酸分子が天然細胞のものとは異なった
染色体位置にあるＰＲＯポリペプチドを通常発現する細胞に含まれるＰＲＯポリ
ペプチド核酸分子を含む。 「コントロール配列」という表現は、特定の宿主生物において作用可能に結合
したコード配列を発現するために必要なＤＮＡ配列を指す。例えば原核生物に好
適なコントロール配列は、プロモーター、場合によってはオペレータ配列、及び
リボソーム結合部位を含む。真核生物の細胞は、プロモーター、ポリアデニル化
シグナル及びエンハンサーを利用することが知られている。 核酸は、他の核酸配列と機能的な関係にあるときに「作用可能に結合し」てい
る。例えば、プレ配列あるいは分泌リーダーのＤＮＡは、ポリペプチドの分泌に
参画するプレタンパク質として発現されているなら、そのポリペプチドのＤＮＡ
に作用可能に結合している；プロモーター又はエンハンサーは、配列の転写に影
響を及ぼすならば、コード配列に作用可能に結合している；又はリボソーム結合
部位は、もしそれが翻訳を容易にするような位置にあるなら、コード配列と作用
可能に結合している。一般的に、「作用可能に結合している」とは、結合したＤ
ＮＡ配列が近接しており、分泌リーダーの場合には近接していて読みフェーズに
あることを意味する。しかし、エンハンサーは必ずしも近接している必要はない
。結合は簡便な制限部位でのライゲーションにより達成される。そのような部位
が存在しない場合は、従来の手法に従って、合成オリゴヌクレオチドアダプター
あるいはリンカーが使用される。

【０３７２】 「抗体」という用語は最も広い意味において使用され、例えば、単一の抗-Ｐ
ＲＯポリペプチドモノクローナル抗体(アゴニスト、アンタゴニスト、及び中和
抗体を含む)、多エピトープ特異性を持つ抗-ＰＲＯ抗体組成物、一本鎖抗-ＰＲ
Ｏ抗体、及び抗-ＰＲＯ抗体の断片を包含している（下記参照）。ここで使用さ
れる「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に均一な抗体の集団、すなわ
ち、構成する個々の抗体が、少量存在しうる自然に生じる可能性のある突然変異
を除いて同一である集団から得られる抗体を称する。 ハイブリッド形成反応の「緊縮性」は、当業者によって容易に決定され、一般
的にプローブ長、洗浄温度、及び塩濃度に依存する経験的な計算である。一般に
、プローブが長くなると適切なアニーリングのための温度が高くなり、プローブ
が短くなると温度は低くなる。ハイブリッド形成は、一般的に、相補的鎖がその
融点に近いがそれより低い環境に存在する場合における変性ＤＮＡの再アニール
する能力に依存する。プローブとハイブリッド形成可能な配列との間の所望の相
同性の程度が高くなると、使用できる相対温度が高くなる。その結果、より高い
相対温度は、反応条件をより緊縮性にするが、低い温度は緊縮性を低下させる。
さらに、緊縮性は塩濃度に逆比例する。ハイブリッド形成反応の緊縮性の更なる
詳細及び説明は、Ausubel等, Current Protocols in Molecular Biology, Wiley
Interscience Publishers, (1995)を参照のこと。 ここで定義される「緊縮性条件」又は「高度の緊縮性条件」は、（１）洗浄の
ために低イオン強度及び高温度、例えば、５０℃において０．０１５Ｍの塩化ナ
トリウム／０．００１５Ｍのクエン酸ナトリウム／０．１％のドデシル硫酸ナト
リウムを用いるもの；（２）ハイブリッド形成中にホルムアミド等の変性剤、例
えば、４２℃において５０％（v/v）ホルムアミドと０．１％ウシ血清アルブミ
ン／０．１％フィコール／０．１％のポリビニルピロリドン／５０ｍＭのｐＨ６
．５のリン酸ナトリウムバッファー、及び７５０ｍＭの塩化ナトリウム、７５ｍ
Ｍクエン酸ナトリウムを用いるもの；（３）４２℃における５０％ホルムアミド
、５ｘＳＳＣ（０．７５ＭのＮａＣｌ、０．０７５Ｍのクエン酸ナトリウム）、
５０ｍＭのリン酸ナトリウム（ｐＨ６．８）、０．１％のピロリン酸ナトリウム
、５ｘデンハード液、超音波処理サケ精子ＤＮＡ（５０μｇ／ｍｌ）、０．１％
ＳＤＳ、及び１０％のデキストラン硫酸と、４２℃における０．２ｘＳＳＣ（塩
化ナトリウム／クエン酸ナトリウム）中の洗浄及び５５℃での５０％ホルムアミ
ド、次いで５５℃におけるＥＤＴＡを含む０．１ｘＳＳＣからなる高緊縮性洗浄
を用いるものによって同定される。 「中程度の緊縮性条件」は、Sambrook等, Molecular Cloning: A Laboratory
Manual (New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989に記載されて
いるように同定され、上記の緊縮性より低い洗浄溶液及びハイブリッド形成条件
（例えば、温度、イオン強度及び％ＳＤＳ）の使用を含む。中程度の緊縮性条件
は、２０％ホルムアミド、５ｘＳＳＣ（１５０ｍＭのＮａＣｌ、１５ｍＭのクエ
ン酸三ナトリウム）、５０ｍＭリン酸ナトリウム（ｐＨ７．６）、５ｘデンハー
ド液、１０％デキストラン硫酸、及び２０ｍｇ／ｍＬの変性剪断サケ精子ＤＮＡ
を含む溶液中の３７℃での終夜インキュベーション、次いで１ｘＳＳＣ中３７−
５０℃でのフィルターの洗浄といった条件である。当業者であれば、プローブ長
などの因子に適合させる必要に応じて、どのようにして温度、イオン強度等を調
節するかを認識するであろう。

【０３７３】 「エピトープタグ」なる用語は、ここで用いられるときは、「タグポリペプチ
ド」に融合したＰＲＯポリペプチド、又はそれらのドメイン配列を含んでなるキ
メラポリペプチドを指す。タグポリペプチドは、その抗体が産生され得るエピト
ープ、又は幾つかの他の試薬によって同定できるエピトープを提供するに十分な
数の残基を有しているが、その長さは対象とするＰＲＯポリペプチドの活性を阻
害しないよう充分に短い。また、タグポリペプチドは、好ましくは、抗体が他の
エピトープと実質的に交差反応をしないようにかなり独特である。適切なタグポ
リペプチドは、一般に、少なくとも６のアミノ酸残基、通常は約８〜約５０のア
ミノ酸残基(好ましくは約１０〜約２０の残基)を有する。 ここで用いられる「イムノアドヘシン」なる用語は、異種タンパク質（「アド
ヘシン」）の結合特異性と免疫グロブリン定常ドメインとを結合した抗体様分子
を指す。構造的には、イムノアドヘシンは、所望の結合特異性を持ち、抗体の抗
原認識及び結合部位以外である（即ち「異種の」）アミノ酸配列と、免疫グロブ
リン定常ドメイン配列との融合物を含む。イムノアドヘシン分子のアドへシン部
分は、典型的には少なくともレセプター又はリガンドの結合部位を含む隣接アミ
ノ酸配列である。イムノアドヘシンの免疫グロブリン定常ドメイン配列は、Ｉｇ
Ｇ-１、ＩｇＧ-２、ＩｇＧ-３又はＩｇＧ-４サブタイプ、ＩｇＡ（ＩｇＡ-１及
びＩｇＡ-２を含む）、ＩｇＥ、ＩｇＤ又はＩｇＭなどの任意の免疫グロブリン
から得ることができる。 ここで意図している「活性な」及び「活性」とは、天然又は天然発生ＰＲＯポ
リペプチドの生物学的及び／又は免疫学的活性を保持するＰＲＯの形態を意味し
、「生物学的」活性とは、天然又は天然発生ＰＲＯによって生ずる（阻害性又は
刺激性の）生物学的機能であって、天然又は天然発生ＰＲＯが有する抗原性エピ
トープに対して抗体を生成する能力を除くものを意味し、「免疫学的」活性とは
、天然又は天然発生ＰＲＯが有する抗原性エピトープに対して抗体を生成する能
力を意味する。 「アンタゴニスト」なる用語は最も広い意味で用いられ、ここに開示した天然
ＰＲＯポリペプチドの生物学的活性を阻止、阻害、又は中和する任意の分子を指
す。同様に「アゴニスト」なる用語は最も広い意味で用いられ、ここに開示した
天然ＰＲＯポリペプチドの生物学的活性を模倣する任意の分子を指す。好適なア
ゴニスト又はアンタゴニスト分子は特に、アゴニスト又はアンタゴニスト抗体又
は抗体断片、天然ＰＲＯポリペプチドの断片又はアミノ酸配列変異体、ペプチド
、有機小分子、などを含む。ＰＲＯポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニス
トの同定方法は、ＰＲＯポリペプチドを候補アンタゴニスト又はアゴニストと接
触させ、ＰＲＯポリペプチドに通常付随する一又は複数の生物学的活性の変化を
測定することを含みうる。

【０３７４】 ここで使用される「治療」とは、治癒的処置、予防的療法及び防止的療法の両
方を意味し、患者は標的とする病理学的状態又はしっかんを防止又は低下（減少
）させられる。治療が必要なものとは、既に疾患に罹っているもの、並びに疾患
に罹りやすいもの又は疾患が防止されているものを含む。 「慢性」投与とは、急性様式とは異なり連続的な様式での薬剤を投与し、初期
の治療効果（活性）を長時間に渡って維持することを意味する。「間欠」投与と
は、中断無く連続的になされるのではなく、むしろ本質的に周期的になされる処
理である。 治療の対象のための「哺乳動物」は、ヒト、家庭及び農業用動物、動物園、ス
ポーツ、又はペット動物、例えばイヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ヒツジ、ブタ、ウサ
ギなどを含む哺乳類に分類される任意の動物を意味する。好ましくは、哺乳動物
はヒトである。 一又は複数の治療薬と「組み合わせた」投与とは、同時（同時期）及び任意の
順序での連続した投与を含む。 ここで用いられる「担体」は、製薬的に許容されうる担体、賦形剤、又は安定
化剤を含み、用いられる用量及び濃度でそれらに暴露される細胞又は哺乳動物に
対して非毒性である。生理学的に許容されうる担体は、水性ｐＨ緩衝溶液である
ことが多い。生理学的に許容されうる担体の例は、リン酸塩、クエン酸塩、及び
他の有機酸塩のバッファー；アスコルビン酸を含む酸化防止剤；低分子量（約１
０残基未満）ポリペプチド；タンパク質、例えば血清アルブミン、ゼラチン、又
は免疫グロブリン；疎水性ポリマー、例えばポリビニルピロリドン；アミノ酸、
例えばグリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン又はリシン；グルコー
ス、マンノース又はデキストランを含む単糖類、二糖類、及び他の炭水化物；Ｅ
ＤＴＡ等のキレート剤；マンニトール又は祖ルビトール等の糖アルコール；ナト
リウム等の塩形成対イオン；及び／又は非イオン性界面活性剤、例えばTWEEN(商
品名)、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、及びPLURONICS(商品名)を含む。

【０３７５】 「抗体断片」は、無傷の抗体の一部、好ましくは無傷の抗体の抗原結合又は可
変領域を含む。抗体断片の例は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ(ａｂ')_２、及びＦｖ断
片；ダイアボディ(disbodies)；直鎖状抗体（Zapata等, Protein Eng. 8(10): 1
057-1062 [1995]）；一本鎖抗体分子；及び抗体断片から形成された多重特異性
抗体を含む。 抗体のパパイン消化は、「Ｆａｂ」断片と呼ばれる２つの同一の抗体結合断片
を生成し、その各々は単一の抗原結合部位を持ち、残りは容易に結晶化する能力
を反映して「Ｆｃ」断片と命名される。ペプシン処理はＦ(ａｂ')_２断片を生じ
、それは２つの抗原結合部位を持ち、抗原を交差結合することができる。 「Ｆｖ」は、完全な抗原認識及び結合部位を含む最小の抗体断片である。この
領域は、密接に非共有結合した１本の重鎖と１本の軽鎖の可変領域の二量体から
なる。この配置において各ドメインの３つのＣＤＲが相互作用してＶＨ−ＶＬに
量体の表面に抗原結合部位を決定する。正しくは、６つのＣＤＲｓが抗体にたい
する抗原結合特異性を持つ。しかしながら、単一の可変ドメイン（又は抗原に特
異的な３つのＣＤＲのみを含んでなるＦｖの半分）でさえ、結合部位全体よりは
低い親和性であるが、抗原を認識し結合する能力を持つ。 またＦａｂ断片は、軽鎖の定常ドメイン及び重鎖の第１の定常ドメイン（ＣＨ
１）も含む。Ｆａｂ断片は、抗体ヒンジ領域からの一又は複数のシステインを含
む重鎖ＣＨ１ドメインのカルボキシ末端に幾つかの残基が付加されていることに
よりＦａｂ断片と相違する。ここで、Ｆａｂ'-ＳＨは、定常ドメインのシステイ
ン残基が遊離のチオール基を持つＦａｂ’を表す。Ｆ(ａｂ')_２抗体断片は、最
初はＦａｂ’断片の対として生成され、それらの間にヒンジシステインを有する
。抗体断片の他の化学的結合も知られている。 任意の脊椎動物種からの抗体（免疫グロブリン）の「軽鎖」は、それらの定常
ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパ及びラムダと呼ばれる二つの明らか
に異なる型の一方に分類される。 それらの重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に依存して、免疫グロブリンは異
なるクラスに分類できる。免疫グロブリンの五つの主要なクラス：ＩｇＡ、Ｉｇ
Ｄ、ＩｇＥ、ＩｇＧ及びＩｇＭがあり、それらの幾つかは更にサブクラス（アイ
ソタイプ）、例えばＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３，ＩｇＧ４、ＩｇＡ及びＩｇ
Ａ２に分類される。

【０３７６】 「一本鎖Ｆｖ」又は「ｓＦｖ」抗体断片は、抗体のＶＨ及びＶＬドメインを含
む抗体断片を含み、これらのドメインは単一のポリペプチド鎖に存在する。好ま
しくは、ＦｖポリペプチドはＶＨ及びＶＬドメイン間にポリペプチドリンカーを
更に含み、それはｓＦＶが抗原結合に望まれる構造を形成するのを可能にする。
ｓｃＦｖの概説については、The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol
. 113, Rosenburg及びMoore編, Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (199
4)のPluckthunを参照のこと。 用語「ダイアボディ(diabodies)」は、二つの抗原結合部位を持つ小型の抗体
断片を指し、その断片は同じポリペプチド鎖（ＶＨ−ＶＬ）内で軽鎖可変ドメイ
ン（ＶＬ）に結合した重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む。同じ鎖の二つのドメイ
ン間に対形成するには短すぎるリンカーを用いることにより、ドメインは強制的
に他の鎖の相補的ドメインと対形成して二つの抗原結合部位を生成する。ダイア
ボディは、例えば、EP 404,097; WO 93/11161; 及びHollinger等, Proc. Natl.
Acad. Sci. USA, 90: 6444-6448 (1993)により十分に記載されている。 「単離された」抗体は、その自然環境の成分から同定され分離及び／又は回収
されたものである。その自然環境の汚染成分とは、その抗体の診断又は治療への
使用を妨害する物質であり、酵素、ホルモン、及び他のタンパク質様又は非タン
パク質様溶質が含まれる。好ましい実施態様において、抗体は、（１）ローリ法
(Lowry method)で測定した場合９５％を越える抗体、最も好ましくは９９重量％
を越えるまで、(２)スピニングカップシークエネーターを使用することにより、
少なくとも１５残基のＮ末端あるいは内部アミノ酸配列を得るのに充分なほど、
あるいは、(３)クーマシーブルーあるいは好ましくは銀染色を用いた非還元ある
いは還元条件下でのＳＤＳ-ＰＡＧＥによる均一性まで精製される。単離された
抗体には、抗体の自然環境の少なくとも１つの成分が存在しないため、組換え細
胞内のインサイツの抗体が含まれる。しかしながら、通常は、単離された抗体は
少なくとも１つの精製工程により調製される。 「標識」なる語は、ここで用いられる場合、抗体に直接又は間接的に抱合して
「標識」抗体を生成する検出可能な化合物又は組成物を意味する。標識は、それ
自身検出可能でもよく（例えば、放射性標識又は蛍光標識）、又は酵素標識の場
合、検出可能な基質化合物又は組成物の化学変換を触媒してもよい。 「固相」とは、本発明の抗体がそれに付着することのできる非水性マトリクス
を意味する。ここに意図する固相の例は、部分的又は全体的に、ガラス（例えば
、孔制御ガラス）、多糖類（例えばアガロース）、ポリアクリルアミド、ポリス
チレン、ポリビニルアルコール及びシリコーンから形成されたものを含む。或る
種の実施態様では、内容に応じて、固相はアッセイプレートのウェルを構成する
ことができ；その他では精製カラム（例えばアフィニティクロマトグラフィーカ
ラム）とすることもできる。また、この用語は、米国特許第4,275,149号に記載
されたような、別個の粒子の不連続な固相も包含する。 「リポソーム」は、種々の型の脂質、リン脂質及び／又は界面活性剤からなる
小型の小胞であり、哺乳動物への薬物（ＰＲＯポリペプチド又はその抗体など）
の輸送に有用である。リポソームの成分は、通常は生体膜の脂質配列に類似する
二層形式に配列させる。 「小分子」とは、ここで、約５００ダルトン未満の分子量を持つと定義される
。

【０３７７】 ＩＩ. 本発明の組成物と方法 本発明は、本出願でＰＲＯポリペプチドと命名されるポリペプチドをコードす
る新規に同定され単離された核酸配列を提供する。特に下記の実施例でさらに詳
細に説明するように、種々のＰＲＯポリペプチドをコードするｃＤＮＡが同定さ
れ単離された。別々の発現ラウンドで生成されたタンパク質には異なるＰＲＯ番
号が与えられるが、ＵＮＱ番号は全ての与えられたＤＮＡ及びコード化タンパク
質に独特であり、変わることはないことを記しておく。しかしながら、単純化の
ために、本明細書において、ここに開示した全長天然核酸分子にコードされるタ
ンパク質並びに上記のＰＲＯの定義に含まれるさらなる天然相同体及び変異体は
、それらの起源又は調製形式に関わらず、「ＰＲＯ／番号」で呼称する。 下記の実施例に開示するように、種々のｃＤＮＡクローンがＡＴＣＣに寄託さ
れている。これらのクローンの正確なヌクレオチド配列は、この分野で日常的な
方法を用いて寄託されたクローンを配列決定することにより容易に決定すること
ができる。予測されるアミノ酸配列は、ヌクレオチド配列から常套的技量を用い
て決定できる。ここに記載したＰＲＯポリペプチド及びコード化核酸について、
本出願人は、現時点で入手可能な配列情報と最も良く一致するリーディングフレ
ームであると考えられるものを同定した。

【０３７８】 全長ＰＲＯポリペプチド １．ＰＲＯ１５６０ WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配
列ＰＲＯ１５６０（Ｆｉｇ２及び配列番号：４に示す）が、ここで本発明の発見
の後に同定されたＴｓｐａｎ-６と或る程度のアミノ酸配列同一性を有する。従
って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１５６０が新規に同定されたテトラ
スパンファミリーのメンバーであると考えられている。 ２．ＰＲＯ４４４ ＤＮＡ２６８４６−１３９７は、分泌タンパク質をコードするヌクレオチドを
選択する捕捉技術を用いてヒト胎児肺ライブラリから単離した。よってＤＮＡ２
６８４６−１３９７は分泌因子をコードする。知りうる限り、ＤＮＡ２６８４６
−１３９７配列はＰＲＯ４４４と称される新規な因子をコードする。WU-BLAST2
配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質
と有意な配列同一性が無いことが明らかになった。 ３．ＰＲＯ１０１８ ＤＮＡ５６１０７−１４１５は、分泌タンパク質をコードするヌクレオチドを
選択する捕捉技術を用いてヒト卵巣組織ライブラリから単離した。知りうる限り
、ＤＮＡ５６１０７−１４１５配列はＰＲＯ１０１８と称される新規な因子をコ
ードする。WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任
意の公知のタンパク質と有意な配列同一性が無いことが明らかになった。 ４．ＰＲＯ１７７３ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１７
７３（Ｆｉｇ８及び配列番号：１０に示す）が、ラッタスノルベジカス（ROH2_R
TA）のレチノールデヒドロゲナーゼＩＩ型タンパク質の一部と或る程度のアミノ
酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示され
るＰＲＯ１７７３が新規に同定されたレチノールデヒドロゲナーゼタンパク質フ
ァミリーのメンバーであり、それらのタンパク質ファミリーに典型的な活性を有
すると考えられている。

【０３７９】 ５．ＰＲＯ１４７７ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
７７（Ｆｉｇ１０及び配列番号：１２に示す）が、マンノシル-オリゴサッカリ
ド１,２-アルファ-マンノシダーゼタンパク質（A54408）と或る程度のアミノ酸
配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示される
ＰＲＯ１４７７が新規に同定されたマンノシダーゼタンパク質ファミリーのメン
バーであり、マンノシダーゼタンパク質ファミリーに典型的な活性を有すると考
えられている。 ６．ＰＲＯ１４７８ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
７８（Ｆｉｇ１２及び配列番号：１７に示す）が、ガラクトシルトランスフェラ
ーゼと或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在
では、本出願で開示されるＰＲＯ１４７８が新規に同定されたガラクトシルトラ
ンスフェラーゼファミリーのメンバーであり、このファミリーの他のメンバーと
少なくとも１つの共通するメカニズムを有すると考えられている。 ７．ＰＲＯ８３１ ＤＮＡ５６８６２−１３４３は、分泌タンパク質をコードするヌクレオチドを
選択する捕捉技術を用いてヒト子宮ライブラリから単離した。よってＤＮＡ５６
８６２−１３４３は分泌因子をコードする。知りうる限り、ＤＮＡ５６８６２−
１３４３配列は、ここでＰＲＯ８３１と称される新規な因子をコードし；WU-BLA
ST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパ
ク質と有意な配列同一性が無いことが明らかになった。

【０３８０】 ８．ＰＲＯ１１１３ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１１
１３（Ｆｉｇ１６及び配列番号：２４に示す）が、LIG-1及びSLITと或る程度の
アミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開
示されるＰＲＯ１１１３が新規に同定されたロイシンリッチ反復ファミリーのメ
ンバーであり、このファミリーに典型的なタンパク質−タンパク質相互作用活性
を有すると考えられている。 ９．ＰＲＯ１１９４ 知りうる限り、ＤＮＡ５７８４１−１５２２配列は、ここでＰＲＯ１１９４と
称される新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプ
ログラムを用いて、公知のタンパク質と限られた配列同一性を持つことが明らか
になった。 １０．ＰＲＯ１１１０ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１１
１０（Ｆｉｇ２０及び配列番号：３１に示す）が、マウス骨髄のアップレギュレ
ートされたタンパク質と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出され
た。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１１１０が新規に同定された
骨髄アップレギュレートタンパク質ファミリーのメンバーであり、このファミリ
ーに典型的な活性を有すると考えられている。 １１．ＰＲＯ１３７８ ＤＮＡ５８７３０−１６０７は、分泌タンパク質をコードするヌクレオチドを
選択する捕捉技術を用いて骨髄ライブラリから単離した。よってＤＮＡ５８７３
０−１６０７は分泌因子をコードする。知りうる限り、ＤＮＡ５８７３０−１６
０７配列は、ここでＰＲＯ１３７８と称される新規な因子をコードする。WU-BLA
ST2配列アラインメントコンピュータプログラムにより、ＰＲＯ１３７８と公知
のタンパク質との間に幾分の配列同一性があることが明らかになった。しかし、
これらは有意ではないと決定された。 １２．ＰＲＯ１４８１ 知りうる限り、ＤＮＡ５８７３２−１６５０配列は、ここでＰＲＯ１４８１と
称される新規な因子をコードする。WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータ
プログラムを用いて、公知のタンパク質と幾分のみの配列同一性を持つことが明
らかになった。

【０３８１】 １３．ＰＲＯ１１８９ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１１
８９（Ｆｉｇ２６及び配列番号：４３に示す）が、Dayhoffデータベースで「MUS
E25A_1」と称されるＥ２５タンパク質のアミノ酸配列と或る程度のアミノ酸配列
同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲ
Ｏ１１８９が新規に同定されたＥ２５タンパク質ファミリーのメンバーであり、
このファミリーに典型的な特性を有すると考えられている。 １４．ＰＲＯ１４１５ ＤＮＡ５８８５２−１６３７は、分泌タンパク質をコードするヌクレオチドを
選択する捕捉技術を用いてヒト前立腺ライブラリから単離した。知りうる限り、
ＤＮＡ５８８５２−１６３７配列は、ここでＰＲＯ１４１５と称される新規な因
子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて
、任意の公知のタンパク質と有意な配列同一性が無いことが明らかになった。 １５．ＰＲＯ１４１１ 知りうる限り、ＤＮＡ５９２１２−１６２７配列は、ここでＰＲＯ１４１１と
称される新規な因子をコードする。しかしながら、WU-BLAST2配列アラインメン
トコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質と幾分の配列同一性を持
つことが明らかになった。 １６．ＰＲＯ１２９５ 知りうる限り、ＤＮＡ５９２１８−１５５９配列は、ここでＰＲＯ１２９５と
称される新規な因子をコードする。WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータ
プログラムを用いて、公知のタンパク質と幾分のみの配列同一性を持つことが明
らかになった。

【０３８２】 １７．ＰＲＯ１３５９ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
５９（Ｆｉｇ３４及び配列番号：５６に示す）が、Ｎ-アセチルガラクトサミン
アルファ-２、６-シアリルトランスフェラーゼと或る程度のアミノ酸配列同一性
を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１３
５９が新規に同定されたシアリルトランスフェラーゼファミリーのメンバーであ
り、このファミリーに典型的な特性を有すると考えられている。 １８．ＰＲＯ１１９０ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１１
９０（Ｆｉｇ３６及び配列番号：５８に示す）が、ラット及びヒトのＣＤ０と或
る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本
出願で開示されるＰＲＯ１１９０が新規に同定されたＣＤ０ファミリーのメンバ
ーであり、ＣＤ０ファミリーに典型的な細胞接着活性を有すると考えられている
。 １９．ＰＲＯ１７７２ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１７
７２（Ｆｉｇ３８及び配列番号：６３に示す）が、ミクロソームのジペプチダー
ゼタンパク質(P_R13857)と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出さ
れた。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１７７２が新規に同定され
たペプチダーゼタンパク質ファミリーのメンバーであり、このファミリーに典型
的な活性を有すると考えられている。 ２０．ＰＲＯ１２４８ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
４８（Ｆｉｇ４０及び配列番号：６８に示す）が、ＰＵＴ-２タンパク質(AF0261
98_5)とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本
出願で開示されるＰＲＯ１２４８が新規なＰＵＴ-２相同体であり、ＰＵＴ-２タ
ンパク質に典型的な活性を有すると考えられている。 ２１．ＰＲＯ１３１６ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
１６（Ｆｉｇ４２及び配列番号：７０に示す）が、マウスのｄｉｃｋｋｏｐｆと
或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、
本出願で開示されるＰＲＯ１３１６が新規に同定されたｄｉｃｋｋｏｐｆファミ
リーのメンバーであり、シュペーマン形成体及び／又はＷｎｔアンタゴニズムか
らのヘッドインダクションを起こす能力を有すると考えられている。

【０３８３】 ２２．ＰＲＯ１１９７ 知りうる限り、ＤＮＡ６０６１１−１５２４配列は、ここでＰＲＯ１１９７と
称される新規な因子をコードする。WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータ
プログラムを用いて、実施例において更に記載するように、公知のタンパク質と
幾分のみの配列同一性を持つことが明らかになった。 ２３．ＰＲＯ１２９３ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
９３（Ｆｉｇ４６及び配列番号：７７に示す）が、ヒトＩｇ重鎖Ｖ領域タンパク
質（HSVCD54_1）と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。
従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１２９３が新規に同定されたタン
パク質のＩｇスーパーファミリーのメンバー及びそれらの断片であり、このファ
ミリーに典型的な活性を有すると考えられている。 ２４．ＰＲＯ１３８０ ＤＮＡ６０７４０−１６１５クローンは、ヒト網膜ライブラリから単離した。
知りうる限り、ＤＮＡ６０７４０−１６１５配列は、ここでＰＲＯ１３８０と称
される新規なマルチスパンの膜貫通ポリペプチドをコードする。WU-BLAST2配列
アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質と幾
分の配列同一性が明らかになった。 ２５．ＰＲＯ１２６５ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
６５（Ｆｉｇ５０及び配列番号：８４に示す）が、Dayhoffデータベース（バー
ジョン35.45 SwissProt 35）で「MMU70429_1」と称されるＦＩＧ１ポリペプチド
と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では
、本出願で開示されるＰＲＯ１２６５が新規に同定されたＦＩＧ１ファミリーの
メンバーであり、インターロイキン-４による活性化を含むＦＩＧ１ポリペプチ
ドに典型的な活性を有すると考えられている。 ２６．ＰＲＯ１２５０ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
５０（Ｆｉｇ５２及び配列番号：８６に示す）が、ヒト長鎖ＣｏＡリガーゼタン
パク質（LCFB_HUMAN）と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出され
た。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１２５０が新規に同定された
長鎖ＣｏＡリガーゼ相同体であり、長鎖ＣｏＡリガーゼの典型的な活性を有する
と考えられている。

【０３８４】 ２７．ＰＲＯ１４７５ WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配
列ＰＲＯ１４７５（Ｆｉｇ５４及び配列番号：８８に示す）が、マウスアルファ
-３-Ｄ-マンノシドビート-１,２-Ｎ-アセチルグルコサミニルトランスフェラー
ゼＩタンパク質と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従
って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１４７５が新規に同定されたＮ-グ
ルコサミニルトランスファラーゼタンパク質ファミリーのメンバーであり、この
タンパクファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。 ２８．ＰＲＯ１３７７ ここに記載するように、WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを、ＰＲＯ
１３７７アミノ酸配列と公知のタンパク質のアミノ酸配列との配列同一性を決定
するのに用いた。幾分の配列同一性は見られたが、それらは有意ではないと決定
された。従って、知りうる限りは、ＤＮＡ６１６０８配列は、ここでＰＲＯ１３
７７と命名される新規な膜貫通タンパク質をコードする。 ２９．ＰＲＯ１３２６ ＤＮＡ６２８０８−１５８２クローンは分泌因子をコードすると考えられてい
る。知りうる限り、ＤＮＡ６２８０８−１５８２配列は、ここでＰＲＯ１３２６
と称される新規因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプ
ログラムを用いて、公知のタンパク質との配列同一性が明らかになったが、有意
ではないと決定された。 ３０．ＰＲＯ１２４９ ＤＮＡ６２８０９−１５３１クローンは、分泌タンパク質をコードするヌクレ
オチドを選択する捕捉技術を用いてヒト結腸腫瘍組織ライブラリから単離した。
知りうる限り、ＤＮＡ６２８０９−１５３１配列は、ここでＰＲＯ１２４９と称
される新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプロ
グラムを用いて、任意の公知のタンパク質と配列同一性が無いことが明らかにな
った。 ３１．ＰＲＯ１３１５ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
１５（Ｆｉｇ６２及び配列番号：１０４に示す）が、ｍｕｓ筋のクラスＩＩサイ
トカインレセプター４タンパク質（MMU53696_1）と或る程度のアミノ酸配列同一
性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１
３１５が新規に同定されたサイトカインレセプタータンパク質ファミリーのメン
バーであり、このタンパクファミリーに典型的な活性を有すると考えられている
。

【０３８５】 ３２．ＰＲＯ１５９９ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
９９（Ｆｉｇ６４及び配列番号：１１１に示す）が、Dayhoff配列「CFAD_PIG」
と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では
、本出願で開示されるＰＲＯ１５９９が新規に同定されたグランザイムＭファミ
リーのメンバーであり、グランザイムＭファミリーに典型的な活性又は特性を有
すると考えられている。 ３３．ＰＲＯ１４３０ WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、全長天然配
列ＰＲＯ１４３０（Ｆｉｇ６６及び配列番号：１１６に示す）が、前立腺特異的
レダクターゼ（Dayhoffデータベースで「P_W03198」と称される）と或る程度の
アミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開
示されるＰＲＯ１４３０が新規に同定されたレダクターゼファミリーのメンバー
であり、レダクターゼファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。 ３４．ＰＲＯ１３７４ 知りうる限り、ＤＮＡ６４８４９−１６０４配列は、ここでＰＲＯ１３７４と
称される新規因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプロ
グラムを用いて、Ｐ４ＨＡのヒトアルファサブユニットなどの公知のタンパク質
との幾分の配列同一性が明らかになった。従って、ＰＲＯ１３７４はＰ４ＨＡと
関連し、一又は複数のメカニズムを共有すると考えられる。 ３５．ＰＲＯ１３１１ ＤＮＡ６４８６３−１５７３クローンはヒト動脈内皮細胞から単離され、ここ
でＰＲＯ１３１１と命名される新規な膜貫通ポリペプチドをコードすると考えら
れている。WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、公
知のタンパク質との幾分の配列同一性が明らかになったが、有意ではないと決定
された。 ３６．ＰＲＯ１３５７ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
５７（Ｆｉｇ７２及び配列番号：１２８に示す）が、ｍｕｓ筋のフォン・エブナ
ー・マイナー唾液腺タンパク質（MMU46068_1）と或る程度のアミノ酸配列同一性
を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１３
５７が新規に同定されたフォン・エブナー・マイナー唾液腺タンパク質相同体で
あると考えられている。

【０３８６】 ３７．ＰＲＯ１２４４ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
４４（Ｆｉｇ７４及び配列番号：１３０に示す）が、Dayhoffデータベース（バ
ージョン35.45 SwissProt 35）で「AF008554_1」と称される公知の移植関連タン
パク質と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現
在では、本出願で開示されるＰＲＯ１２４４が新規に同定された移植関連タンパ
ク質ファミリーのメンバーであり、これらのタンパク質ファミリーに典型的な接
着活性を有すると考えられている。 ３８．ＰＲＯ１２４６ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
４６（Ｆｉｇ７６及び配列番号：１３２に示す）が、マウス骨関連スルファター
ゼ前駆タンパク質（P_R51355）と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが
見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１２４６が新規に同
定された骨関連スルファターゼ相同体であり、骨関連スルファターゼに典型的な
活性を有すると考えられている。 ３９．ＰＲＯ１３５６ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
５６（Ｆｉｇ７８及び配列番号：１３４に示す）が、ｍｕｓ筋のＣＰＥレセプタ
ータンパク質（AB000713_1）と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見
出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１３５６が新規に同定
されたＣＰＥレセプターファミリーのメンバーであり、このファミリーに典型的
な活性を有すると考えられている。 ４０．ＰＲＯ１２７５ 知りうる限り、ＤＮＡ６４８８８−１５４２配列は、ここでＰＲＯ１２７５と
称される新規因子をコードする。WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプ
ログラムを用いて、公知のタンパク質との幾分の配列同一性が明らかになった。

【０３８７】 ４１．ＰＲＯ１２７４ 知りうる限り、ＤＮＡ６４８８９−１５４１配列は、ここでＰＲＯ１２７４と
称される新規因子をコードする。WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプ
ログラムを用いて、公知のタンパク質との幾分の配列同一性が明らかになった。 ４２．ＰＲＯ１４１２ ＤＮＡ６４８９７−１６２８クローンは分泌因子であると考えられている。知
りうる限り、ＤＮＡ６４８９７−１６２８配列は、ここでＰＲＯ１４１２と称さ
れる新規因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラ
ムを用いて、公知のタンパク質との配列同一性が明らかになったが、有意ではな
いと決定された。 ４３．ＰＲＯ１５５７ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
５７（Ｆｉｇ８６及び配列番号：１４２に示す）が、DayhoffデータベースでAF0
34606_1と称される舞踏病タンパク質と或る程度のアミノ酸配列同一性を有する
ことが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１５５７が新
規に同定された舞踏病ファミリーのメンバーであり、舞踏病ファミリーに典型的
な活性を有すると考えられている。 ４４．ＰＲＯ１２８６ ＤＮＡ６４９０３−１５５３クローンは、分泌タンパク質をコードするヌクレ
オチドを選択する技術を用いて同定した。知りうる限り、ＤＮＡ６４９０３配列
は、ここでＰＲＯ１２８６と称される新規な分泌因子をコードする。WU-BLAST2
配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、任意の公知のタンパク質
との幾分の配列同一性が明らかになった；しかし有意ではないと決定された。 ４５．ＰＲＯ１２９４ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
９４（Ｆｉｇ９０及び配列番号：１４６に示す）が、ラットのニューロンオルフ
ァクトメジン関連ＥＲ局在化タンパク質と或る程度のアミノ酸配列同一性を有す
ることが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１２９４が
新規に同定されたオルファクトメジン相同体であり、このタンパク質に典型的な
活性を有すると考えられている。 ４６．ＰＲＯ１３４７ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
４７（Ｆｉｇ９２及び配列番号：１４８に示す）が、ブチロフィリンと或る程度
のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。さらに、ブチロフィリンに典
型的なように、配列のおよそ中程に膜貫通ドメインがある。従って、現在では、
本出願で開示されるＰＲＯ１３４７が新規に同定されたブチロフィリンファミリ
ーのメンバーであり、泌乳中の乳脂粒子の出芽及び放出において役割を果たすと
考えられている。

【０３８８】 ４７．ＰＲＯ１３０５ ＤＮＡ６４９５２−１５６８クローンは、分泌タンパク質をコードするヌクレ
オチドを選択する捕捉技術を用いてヒト胎児腎臓ライブラリから単離した。よっ
て、 ＤＮＡ６４９５２−１５６８クローンは分泌因子をコードする。知りうる
限り、ＤＮＡ６４９５２−１５６８配列は、ここでＰＲＯ１３０５と称される新
規な分泌因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラ
ムを用いて、任意の公知のタンパク質との配列同一性が無いことが明らかになっ
た。 ４８．ＰＲＯ１２７３ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
７３（Ｆｉｇ９６及び配列番号：１５８に示す）が、リポカリン前駆体と或る程
度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。さらに、Ｆｉｇ９６はＰＲ
Ｏ１２７３がリポカリンに保存されたモチーフを有することを示す。従って、現
在では、本出願で開示されるＰＲＯ１２７３が新規に同定されたリポカリンファ
ミリーのメンバーであり、リポカリンと少なくとも１つのメカニズムを共有する
と考えられている。 ４９．ＰＲＯ１３０２ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
０２（Ｆｉｇ９８及び配列番号：１６０に示す）が、ＣＤ３３Ｌ１及びＣＤ３３
Ｌ２と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在
では、本出願で開示されるＰＲＯ１３０２が新規に同定されたシアロアドヘシン
ファミリーのメンバーであり、このファミリーに典型的な特徴を有すると考えら
れている。特に、ＰＲＯ１３０２は癌、炎症、造血、神経成長及び／又は免疫に
含まれる。 ５０．ＰＲＯ１２８３ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
８３（Ｆｉｇ１００及び配列番号：１６２に示す）が、ラットの匂い物質タンパ
ク質相同体ＯＢＰ-ＩＩ前駆体（A404464）と或る程度のアミノ酸配列同一性を有
することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１２８３
が新規な匂い物質タンパク質であり、匂い物質関連タンパク質に典型的な活性を
有すると考えられている。

【０３８９】 ５１．ＰＲＯ１２７９ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
７９（Ｆｉｇ１０２及び配列番号：１７０に示す）が、マウスのニューロプシン
タンパク質（I56559）と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出され
た。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１２７９が新規に同定された
ニューロプシン相同体であり、ニューロプシンタンパク質に典型的な活性を有す
ると考えられている。 ５２．ＰＲＯ１３０４ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
０４（Ｆｉｇ１０４及び配列番号：１８０に示す）が、ｍｕｓ筋のＦＫ-５０６
タンパク質（AF040252_1）と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出
された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１３０４が新規に同定さ
れたＦＫ５０６結合タンパク質ファミリーのメンバーであり、このファミリーに
典型的な活性を有すると考えられている。 ５３．ＰＲＯ１３１７ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
１７（Ｆｉｇ１０６及び配列番号：１８９に示す）が、ヒトＣＤ９７タンパク質
と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では
、本出願で開示されるＰＲＯ１３１７が白血球活性化に含まれうる白血球抗原で
あると考えられている。 ５４．ＰＲＯ１３０３ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
０３（Ｆｉｇ１０８及び配列番号：１９４に示す）が、ニューロプシンと或る程
度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願
で開示されるＰＲＯ１３０３が新規に同定されたセリンプロテアーゼファミリー
のメンバーであり、このファミリーに典型的な異化活性を有すると考えられてい
る。

【０３９０】 ５５．ＰＲＯ１３０６ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
０６（Ｆｉｇ１１０及び配列番号：１９６に示す）が、Dayhoff配列番号AIF1_HU
MANと或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在
では、本出願で開示されるＰＲＯ１３０６が新規に同定されたＡＩＦ１／ダイン
テインファミリーのメンバーであり、ＡＩＦ１／ダインテインに典型的な活性及
び特性を有すると考えられている。 ５６．ＰＲＯ１３３６ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
３６（Ｆｉｇ１１２及び配列番号：１９８に示す）が、ｓｌｉｔと或る程度のア
ミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示
されるＰＲＯ１３３６が新規に同定されたＥＧＦ反復ファミリーのメンバーであ
り、タンパク質相互作用媒介活性を有すると考えられている。 ５７．ＰＲＯ１２７８ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
７８（Ｆｉｇ１１４及び配列番号：２０３に示す）が、Dayhoffデータベースで
「LYC1_ANAPL」と称されるリソザイムｃ-１前駆体と或る程度のアミノ酸配列同
一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ
１２７８が新規に同定されたリソザイムファミリーのメンバーであり、リソザイ
ムファミリーに典型的な加水分解及び他の活性を有すると考えられている。 ５８．ＰＲＯ１２９８ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
９８（Ｆｉｇ１１６及び配列番号：２１０に示す）が、グリコシルトランスフェ
ラーゼａｌｇ２と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従
って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１２９８が新規に同定されたグリコ
シルトランスフェラーゼファミリーのメンバーであり、このファミリーのメンバ
ーと少なくとも１つのメカニズムを共有すると考えられている。

【０３９１】 ５９．ＰＲＯ１３０１ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
０１（Ｆｉｇ１１８及び配列番号：２１２に示す）が、チトクロムＰ４５０タン
パク質と一致するアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在
では、本出願で開示されるＰＲＯ１３０１が新規に同定されたチトクロムＰ４５
０ファミリーのメンバーであり、チトクロムＰ４５０ファミリーに典型的なモノ
オキシゲナーゼ活性を有すると考えられている。 ６０．ＰＲＯ１２６８ 知りうる限り、ＤＮＡ６６５１９−１５３５配列は、ここでＰＲＯ１２６８と
称される新規な膜貫通ポリペプチド因子をコードする。WU-BLAST2配列アライン
メントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質と限られた配列同一
性が明らかになった、しかし有意ではないと決定された。 ６１．ＰＲＯ１２６９ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１２
６９（Ｆｉｇ１２２及び配列番号：２１６に示す）が、Dayhoffデータベース（
バージョン35.45 SwissProt 35）で「P_W23722」と称されるウシ顆粒球ペプチド
Ａ前駆体と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、
現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１２６９が新規に同定された顆粒球Ａペプ
チドファミリーのメンバーであり、このペプチドファミリーに典型的な微生物活
性を有すると考えられている。 ６２．ＰＲＯ１３２７ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
２７（Ｆｉｇ１２４及び配列番号：２１８に示す）が、ラットのニューレキソフ
ィリン-１反（NPH1_RAT）と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出
された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１３２７が新規に同定さ
れたニューレキソフィリンタンパク質ファミリーのメンバーであり、このタンパ
ク質ファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。

【０３９２】 ６３．ＰＲＯ１３８２ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
８２（Ｆｉｇ１２６及び配列番号：２２０に示す）が、Dayhoffデータベースで
「CERL_RAT」と称される公知のセレベリン様糖タンパク質のアミノ酸配列と或る
程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出
願で開示されるＰＲＯ１３８２が新規に同定された神経ペプチドのセレベリンフ
ァミリーのメンバーであり、セレベリンに典型的な活性及び特性を有すると考え
られている。 ６４．ＰＲＯ１３２８ ＤＮＡ６６６５８−１５８４クローンは、分泌タンパク質をコードするヌクレ
オチドを選択する捕捉技術を用いてヒト疾患前立腺組織ライブラリから単離した
。知りうる限り、ＤＮＡ６６６５８−１５８４配列は、ここでＰＲＯ１３２８と
称される新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプ
ログラムを用いて、任意の公知のタンパク質との有意な配列同一性が無いことが
明らかになった。 ６５．ＰＲＯ１３２５ ＤＮＡ６６６５９−１５９３クローンは、タンパク質をコードするヌクレオチ
ド配列を選択する捕捉技術を用いてヒト胸腺組織ライブラリから単離した。知り
うる限り、ＤＮＡ６６６５９−１５９３配列は、ここでＰＲＯ１３２５と称され
る新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラ
ムを用いて、任意の公知のタンパク質との配列同一性が無いことが明らかになっ
た。 ６６．ＰＲＯ１３４０ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
４０（Ｆｉｇ１３２及び配列番号：２２９に示す）が、Dayhoff配列番号I46536
と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では
、本出願で開示されるＰＲＯ１３４０が新規に同定されたカドヘリンファミリー
のメンバーであり、カドヘリンファミリーに典型的な活性及び特性を有すると考
えられている。 ６７．ＰＲＯ１３３９ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
３９（Ｆｉｇ１３４及び配列番号：２３４に示す）が、ヒト膵臓カルボキシペプ
チダーゼ及びカルボキシペプチダーゼａ１と或る程度のアミノ酸配列同一性を有
することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１３３９
が新規に同定されたカルボキシペプチダーゼファミリーのメンバーであり、カル
ボキシペプチダーゼ活性を有すると考えられている。

【０３９３】 ６８．ＰＲＯ１３３７ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
３７（Ｆｉｇ１３６及び配列番号：２３６に示す）が、Dayhoffデータベースで
「THBG_HUMAN」と定義されるヒトＴＢＧと或る程度のアミノ酸配列同一性を有す
ることが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１３３７が
新規に同定されたＴＢＧファミリーのメンバーであり、胸腺ホルモン輸送応力そ
の他を有すると考えられている。 ６９．ＰＲＯ１３４２ ＤＮＡ６６６７４−１５９９クローンは、ヒト食道組織から単離した。下記で
更に詳細に説明するように、WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログ
ラムを用いて、任意の公知のタンパク質との幾分の配列同一性が明らかになった
。ＤＮＡ６６６７４−１５９９クローンは、新規な膜貫通ポリペプチドをコード
することがわかった。 ７０．ＰＲＯ１３４３ ＤＮＡ６６６７５−１５８７クローンは、分泌タンパク質をコードするヌクレ
オチドを選択する捕捉技術を用いてヒト平滑筋細胞組織ライブラリから単離した
。よって、ＤＮＡ６６６７５−１５８７クローンは分泌因子をコードする。知り
うる限り、ＤＮＡ６６６７５−１５８７配列は、ここでＰＲＯ１３４３と称され
る新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラ
ムを用いて、任意の公知のタンパク質との有意な配列同一性が無いことが明らか
になった。 ７１．ＰＲＯ１４８０ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
８０（Ｆｉｇ１４２及び配列番号：２５３に示す）が、Dayhoff配列番号I48746
と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では
、本出願で開示されるＰＲＯ１４８０が新規に同定されたセマホリンＣファミリ
ーのメンバーであると考えられている。

【０３９４】 ７２．ＰＲＯ１４８７ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
８７（Ｆｉｇ１４４及び配列番号：２６０に示す）が、DayhoffデータベースでG
GU82088_1と称されるラジカルフリンジタンパク質と或る程度のアミノ酸配列同
一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ
１４８７が新規に同定されたフリンジファミリーのメンバーであり、フリンジフ
ァミリーに典型的な活性を有すると考えられている。 ７３．ＰＲＯ１４１８ 知りうる限り、ＤＮＡ６８８６４−１６２９配列は、ここでＰＲＯ１４１８と
称される新規因子をコードする。WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプ
ログラムを用いると、公知のタンパク質との配列同一性は最小であった。 ７４．ＰＲＯ１４７２ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
７２（Ｆｉｇ１４８及び配列番号：２６７に示す）が、ブチロフィリンと或る程
度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願
で開示されるＰＲＯ１４７２が新規に同定されたブチロフィリンファミリーのメ
ンバーであり、泌乳に関連していると考えられている。 ７５．ＰＲＯ１４６１ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
６１（Ｆｉｇ１５０及び配列番号：２６９に示す）が、Dayhoffデータベースで
「P_R89435」と定義されるトリプシン様酵素と或る程度のアミノ酸配列同一性を
有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１４６
１が新規に同定されたセリンプロテアーゼファミリーのメンバーであり、セリン
プロテアーゼ活性を有する、特に他のトリプシン様酵素に典型的な酵素活性を有
すると考えられている。また、ＰＲＯ１４６１アミノ酸配列と他のトリプシン様
酵素及びDayhoffデータベースのセリンプロテアーゼの間に相同性が存在するこ
とも見出された。

【０３９５】 ７６．ＰＲＯ１４１０ ＤＮＡ６８８７４−１６２２クローンは、分泌タンパク質をコードするヌクレ
オチドを選択する捕捉技術を用いてヒト脳髄膜腫組織ライブラリから単離した。
知りうる限り、ＤＮＡ６８８７４−１６２２配列は、ここでＰＲＯ１４１０と称
される新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプロ
グラムを用いて、任意の公知のタンパク質との有意な配列同一性が無いことが明
らかになった。 ７７．ＰＲＯ１５６８ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
６８（Ｆｉｇ１５４及び配列番号：２７３に示す）が、テトラスパン５及びテト
ラスパン４と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って
、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１５６８が新規に同定されたテトラスパ
ニンファミリーのメンバーであり、このファミリーに典型的な分子促進活性を有
すると考えられている。 ７８．ＰＲＯ１５７０ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
７０（Ｆｉｇ１５６及び配列番号：２７５に示す）が、ＳＰ６０と或る程度のア
ミノ酸配列同一性を有することが見出されたが、最初はタンパク質の最初の１９
９アミノ酸（又はアミノ末端）が同一であり、ここに提示される。従って、現在
では、本出願で開示されるＰＲＯ１５７０が新規に同定されたセリンプロテアー
ゼファミリーのメンバーであり、癌に含まれると考えられている。 ７９．ＰＲＯ１３１７ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
１７（Ｆｉｇ１５８及び配列番号：２７７に示す）が、Dayhoffデータベースで
「I48745」と称される公知のセマホリンＢタンパク質と或る程度のアミノ酸配列
同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲ
Ｏ１３１７が新規に同定されたセマホリン糖タンパク質ファミリーのメンバーで
あり、セマホリンに典型的な活性又は特性を有すると考えられている。

【０３９６】 ８０．ＰＲＯ１７８０ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１７
８０（Ｆｉｇ１６０及び配列番号：２８２に示す）が、Dayhoffデータベースで
「UDA2_RABIT」と称される公知のグルクロノシルトランスフェラーゼと或る程度
のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で
開示されるＰＲＯ１７８０が新規に同定されたグルクロノシルトランスフェラー
ゼファミリーのメンバーであり、グルクロノシルトランスフェラーゼファミリー
に典型的な酵素活性及び他の特性を有すると考えられている。 ８１．ＰＲＯ１４８６ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
８６（Ｆｉｇ１６２及び配列番号：２８７に示す）が、セレベリン１前駆体と或
る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本
出願で開示されるＰＲＯ１４８６が新規に同定されたセレベリンファミリーのメ
ンバーであり、セレベリンと少なくとも１つのメカニズムを共有すると考えられ
ている。 ８２．ＰＲＯ１４３３ ＤＮＡ７１１８４−１６３４クローンは、タンパク質をコードするヌクレオチ
ド配列を選択する捕捉技術を用いてヒト副腎組織ライブラリから単離した。知り
うる限り、ＤＮＡ７１１８４−１６３４配列は、ここでＰＲＯ１４３３と称され
る新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラ
ムを用いて、任意の公知のタンパク質との有意な配列同一性が無いことが明らか
になった。 ８３．ＰＲＯ１４９０ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
９０（Ｆｉｇ１６６及び配列番号：２９７に示す）が、１-アシル-ｓｎ-グリセ
ロール-３-ホスフェートアシルトランスフェラーゼタンパク質（S60478）の一部
と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では
、本出願で開示されるＰＲＯ１４９０が新規に同定されたアシルトランスフェラ
ーゼタンパク質ファミリーのメンバーであり、１-アシル-ｓｎ-グリセロール-３
-ホスフェートアシルトランスフェラーゼタンパク質に典型的な活性を有すると
考えられている。 ８４．ＰＲＯ１４８２ ＤＮＡ７１２３４−１６５１クローンは、分泌タンパク質をコードするヌクレ
オチド配列を選択する捕捉技術を用いてヒト副腎ライブラリから単離した。よっ
て、ＤＮＡ７１２３４−１６５１クローンは分泌因子をコードする。知りうる限
り、ＤＮＡ７１２３４−１６５１配列は、ここでＰＲＯ１４８２と称される新規
な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用
いて、任意の公知のタンパク質との配列同一性が無いことが明らかになった。

【０３９７】 ８５．ＰＲＯ１４４６ 知りうる限り、ＤＮＡ７１２７７−１６３６配列は、ここでＰＲＯ１４４６と
称される新規な因子をコードする。WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータ
プログラムを用いて、公知のタンパク質との最小の配列同一性が明らかになった
。 ８６．ＰＲＯ１５５８ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
５８（Ｆｉｇ１７２及び配列番号：３０６に示す）が、メチルトランスフェラー
ゼタンパク質（CAMT_EUCGU）と有意なアミノ酸配列同一性を有することが見出さ
れた。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１５５８が新規に同定され
たメチルトランスフェラーゼタンパク質ファミリーのメンバーであり、このタン
パク質ファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。 ８７．ＰＲＯ１６０４ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１６
０４（Ｆｉｇ１７４及び配列番号：３０８に示す）が、DayhoffデータベースでP
_W37483と称されるマウス肝臓癌由来の細胞成長因子と或る程度のアミノ酸配列
同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲ
Ｏ１６０４が新規に同定されたＨＤＧＦファミリーのメンバーであり、他のＨＤ
ＧＦに典型的な成長因子活性を有すると考えられている。 ８８．ＰＲＯ１４９１ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
９１（Ｆｉｇ１７６及び配列番号：３１０に示す）が、ニワトリのコラプシン-
２タンパク質（GGU28240_1）の一部と或る程度のアミノ酸配列同一性を有するこ
とが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１４９１が新規
に同定されたコラプシンタンパク質ファミリーのメンバーであり、このタンパク
質ファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。 ８９．ＰＲＯ１４３１ 全長天然配列ＰＲＯ１４３１［Ｆｉｇ１７８（配列番号：３１５）に示す］が
、ＳＨ３ドメイン含有タンパク質SH17_HUMAnと有意なアミノ酸配列同一性を有す
ることが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１４３１が
新規に同定されたＳＨ３ドメインを有するタンパク質のメンバーであり、シグナ
ル伝達特性を有すると考えられている。

【０３９８】 ９０．ＰＲＯ１５６３ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
６３（Ｆｉｇ１８０及び配列番号：３１７に示す）が、マウスＡＤＡＭＳ-１タ
ンパク質（AB001735_1）の一部と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが
見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１５６３が新規に同
定されたＡＤＡＭタンパク質ファミリーのメンバーであり、このタンパク質ファ
ミリーに典型的な活性を有すると考えられている。 ９１．ＰＲＯ１５６５ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
６５（Ｆｉｇ１８２及び配列番号：３２２に示す）が、ラッタスノルベジカスの
コンドロモジュリン-Ｉタンパク質（AF051425_1）の一部と或る程度のアミノ酸
配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示される
ＰＲＯ１５６５が新規に同定されたコンドロモジュリンタンパク質ファミリーの
メンバーであり、このタンパク質ファミリーに典型的な活性を有すると考えられ
ている。 ９２．ＰＲＯ１５７１ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
７１（Ｆｉｇ１８４及び配列番号：３２４に示す）が、ヒトクロストリジウムパ
ーフリンゲンスエンテロトキシンレセプタータンパク質（AB000712_1）の一部と
或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、
本出願で開示されるＰＲＯ１５７１が新規に同定されたＣＰＥ-Ｒ相同体であり
、ＣＰＥ-Ｒタンパク質に典型的な活性を有すると考えられている。 ９３．ＰＲＯ１５７２ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
７２（Ｆｉｇ１８６及び配列番号：３２６に示す）が、ＣＰＥ-Ｒと或る程度の
アミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開
示されるＰＲＯ１５７２がＣＰＥ-Ｒと関連し、少なくとも１つのメカニズムを
共有すると考えられている。 ９４．ＰＲＯ１５７３ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
７３（Ｆｉｇ１８８及び配列番号：３２８に示す）が、ＣＰＥ-Ｒと或る程度の
アミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開
示されるＰＲＯ１５７３がＣＰＥ-Ｒと関連し、少なくとも１つのメカニズムを
共有すると考えられている。

【０３９９】 ９５．ＰＲＯ１４８８ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
８８（Ｆｉｇ１９０及び配列番号：３３０に示す）が、Dayhoffデータベースで
「AB000712_1」と称される公知のＣＰＥ-Ｒと或る程度のアミノ酸配列同一性を
有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１４８
８が新たに同定されたＣＰＥ-Ｒファミリーのメンバーであり、ＣＰＥ-Ｒファミ
リーに典型的な結合活性を有すると考えられている。 ９６．ＰＲＯ１４８９ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
８９（Ｆｉｇ１９２及び配列番号：３３２に示す）が、オナガザルのクロストリ
ジウムパーフリンゲンスエンテロトキシンレセプター（D88492_1）と或る程度の
アミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開
示されるＰＲＯ１４８９が新規に同定されたクロストリジウムパーフリンゲンス
エンテロトキシンレセプター相同体であり、クロストリジウムパーフリンゲンス
エンテロトキシンレセプタータンパク質に典型的な活性を有すると考えられてい
る。 ９７．ＰＲＯ１４７４ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
７４（Ｆｉｇ１９４及び配列番号：３３４に示す）が、オボムコイドと或る程度
のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で
開示されるＰＲＯ１４７４が新たに同定されたカザルセリンプロテアーゼインヒ
ビターファミリーのメンバーであり、このファミリーに典型的な結合活性を有す
ると考えられている。 ９８．ＰＲＯ１５０８ ＤＮＡ７３７４２−１５０８クローンは、ヒト疾患軟骨組織ライブラリから単
離した。知りうる限り、ＤＮＡ７３７４２−１５０８配列は、ここでＰＲＯ１５
０８と称される新規な因子をコードする；しかし、WU-BLAST2配列アラインメン
トコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質との幾分の配列同一性が
明らかになった。 ９９．ＰＲＯ１５５５ ＤＮＡ７３７４４−１６６５クローンは、ヒト組織ライブラリから単離した。
知りうる限り、ＤＮＡ７３７４４−１６６５配列は、ここでＰＲＯ１５５５と称
される新規な膜貫通タンパク質をコードする。WU-BLAST2配列アラインメントコ
ンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質との幾分の配列同一性が明ら
かになった。

【０４００】 １００．ＰＲＯ１４８５ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１４
８５（Ｆｉｇ２００及び配列番号：３４０に示す）が、リソザイムＣ前駆体ペプ
チドと或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在
では、本出願で開示されるＰＲＯ１４８５が新たに同定されたリソザイムファミ
リーのメンバーであり、少なくとも１つの同様のメカニズムを共有すると考えら
れている。 １０１．ＰＲＯ１５６４ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
６４（Ｆｉｇ２０２及び配列番号：３４７に示す）が、マウスポリペプチドGalN
AcトランスフェラーゼＴ４タンパク質（MMU73819_1）の一部と或る程度のアミノ
酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示され
るＰＲＯ１５６４が新たに同定されたＮ-アセチルガラクトサミニルトランスフ
ェラーゼタンパク質ファミリーのメンバーであり、このタンパク質ファミリーに
典型的な結合活性を有すると考えられている。 １０２．ＰＲＯ１７５５ 知りうる限り、ＤＮＡ７６３９６−１６９８配列は、ここでＰＲＯ１７５５と
称される新規な膜貫通タンパク質をコードする。しかし、WU-BLAST2配列アライ
ンメントコンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質との幾分の配列同
一性が明らかになった。 １０３．ＰＲＯ１７５７ ＤＮＡ７６３９８−１６９９クローンは、タンパク質をコードするヌクレオチ
ド配列を選択する捕捉技術を用いてヒト精巣組織ライブラリから単離した。知り
うる限り、ＤＮＡ７６３９８−１６９９配列は、ここでＰＲＯ１７５７と称され
る新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラ
ムを用いて、公知のタンパク質との有意な配列同一性が無いことが明らかになっ
た。 １０４．ＰＲＯ１７５８ ＤＮＡ７６３９９−１７００クローンは、無脳症から妊娠１７週で死亡した胎
児から得たヒト胸腺組織から誘導されたライブラリから単離した。ＤＮＡ７６３
９９−１７００クローンは、ここでＰＲＯ１７５８と称される新規な分泌因子を
コードする。WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムを用いて、
ＰＲＯ１７５８とDayhoff配列番号AC005328_2との間の有意な配列同一性が明ら
かになった。

【０４０１】 １０５．ＰＲＯ１５７５ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
７５（Ｆｉｇ２１０及び配列番号：３５８に示す）が、Dayhoff配列番号A12005_
1と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在で
は、本出願で開示されるＰＲＯ１５７５が新たに同定されたプロテインジスルフ
ィドイソメラーゼファミリーのメンバーであり、ジスルフィドイソメラーゼファ
ミリーに典型的な活性及び特性を有すると考えられている。 １０６．ＰＲＯ１７８７ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１７
８７（Ｆｉｇ２１２及び配列番号：３６４に示す）が、ミエリンｐ０の様々な種
と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では
、本出願で開示されるＰＲＯ１７８７が新たに同定されたミエリンｐ０ファミリ
ーのメンバーであり、少なくとも１つの類似のメカニズムを共有すると考えられ
ている。ＰＲＯ１７８７のモジュレータは、神経障害、遺伝性歯科疾患などのミ
エリンｐ０関連疾患の治療に使用できる。 １０７．ＰＲＯ１７８１ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、ＰＲＯ１７８１アミノ酸
配列（配列番号：３６６）と公知のタンパク質のアミノ酸配列との間に幾分の配
列同一性が見出されたが、有意ではないことがわかった。従って、知りうる限り
、ＤＮＡ７６５２２−２５００配列は新規なタンパク質をコードする。 １０８．ＰＲＯ１５５６ ＤＮＡ７６５２９−１６６６クローンは、乳癌組織ライブラリから単離した。
知りうる限り、ＤＮＡ７６５２９−１６６６配列は、ここでＰＲＯ１５５６と称
される新規な膜貫通タンパク質をコードする。WU-BLAST2配列アラインメントコ
ンピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質との幾分の配列同一性が明ら
かになった。 １０９．ＰＲＯ１７５９ 知りうる限り、ＤＮＡ７６５３１−１７０１配列は、ここでＰＲＯ１７５９と
称される新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプ
ログラムを用いて、公知のタンパク質との限られた配列同一性が明らかになった
。

【０４０２】 １１０．ＰＲＯ１７６０ 知りうる限り、ＤＮＡ７６５３２−１７０２配列は、ここでＰＲＯ１７６０と
称される新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプ
ログラムを用いて、公知のタンパク質との限られた配列同一性が明らかになった
。 １１１．ＰＲＯ１５６１ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
６１（Ｆｉｇ２２２及び配列番号：３７８に示す）が、ヒトのホスホリパーゼＡ
２タンパク質（P_R63053）の一部と或る程度のアミノ酸配列同一性を有すること
が見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１５６１が新たに
同定されたホスホリパーゼＡ２タンパク質ファミリーのメンバーであり、このタ
ンパク質ファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。 １１２．ＰＲＯ１５６７ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１５
６７（Ｆｉｇ２２４及び配列番号：３８３に示す）が、DayhoffデータベースでP
_W06549と定義されたヒトの結腸特異的遺伝子ＣＳＧ６ポリペプチドと或る程度
のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で
開示されるＰＲＯ１５６７が新たに同定されたＣＳＧ発現産物であり、このタン
パク質に典型的な特性を有すると考えられている。 １１３．ＰＲＯ１６９３ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１６
９３（Ｆｉｇ２２６及び配列番号：３８５に示す）が、マウスのインシュリン様
成長因子結合タンパク質（ALS_MOUSE）の一部と或る程度のアミノ酸配列同一性
を有することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１６
９３が新たに同定されたインシュリン様成長因子結合タンパク質ファミリーのメ
ンバーであり、このタンパク質ファミリーに典型的な活性を有すると考えられて
いる。 １１４．ＰＲＯ１７８４ 知りうる限り、ＤＮＡ７７３０３−２５０２配列は、ここでＰＲＯ１７８４と
称される新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプ
ログラムを用いて、公知のタンパク質との幾分の配列同一性が明らかになった。
１１５．ＰＲＯ１６０５ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１６
０５（Ｆｉｇ２３０及び配列番号：３９５に示す）が、ヒトのアルファ-１,３-
マンノシル糖タンパク質β-１,６-ｎ-アセチルトランスフェラーゼタンパク質（
GNT5_HUMAN）の一部と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された
。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１６０５が新たに同定されたグ
リコシルトランスフェラーゼタンパク質ファミリーのメンバーであり、このタン
パク質ファミリーに典型的な活性を有すると考えられている。

【０４０３】 １１６．ＰＲＯ１７８８ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１７
８８（Ｆｉｇ２３２及び配列番号：３９７に示す）が、Dayhoff配列「GARP_HUMA
N」、１１ｑ１４染色体領域に位置する遺伝子にコードされるロイシンリッチ反
復含有タンパク質と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。
従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１７８８が新たに同定されたロイ
シンリッチ含有ファミリーのメンバーであり、ロイシンリッチ反復含有ファミリ
ーに典型的な活性又は特性を有すると考えられている。 １１７．ＰＲＯ１８０１ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１８
０１（Ｆｉｇ２３４及び配列番号：４０２に示す）が、ＩＬ-１９（P_W37935）
の一部と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現
在では、本出願で開示されるＰＲＯ１８０１が新たに同定されたＩＬ-１０-関連
サイトカインファミリーのメンバーであり、このサイトカインファミリーに典型
的な活性を有すると考えられている。 １１８．ＵＣＰ４ Megaling DNASTARコンピュータプログラム（及び製造者によって設定されたこ
のソフトウェアのアルゴリズム及びパラメータ）（Oxford Molecular Group, In
c.）を用いて、全長天然配列ＵＣＰ４（Ｆｉｇ２３６及び配列番号：４０６に示
す）が、ＵＣＰ３、ＵＣＰ２及びＵＣＰ１と或る程度のアミノ酸配列同一性を有
することが見出された。従って、現在では、本出願で開示されるＵＣＰ４が新た
に同定されたヒト非結合タンパク質ファミリーのメンバーであり、このタンパク
質ファミリーに典型的な活性及び／又は特性、例えばミトコンドリア膜ポテンシ
ャルに影響を与えることにより代謝速度を向上又は抑制する能力を有すると考え
られている。 １１９．ＰＲＯ１９３ 本発明は、奔出癌でＰＲＯ１９３と命名されるポリペプチドをコードする新規
に同定され単離されたヌクレオチド配列を提供する。特に、下記の実施例で更に
詳細に開示するように、本出願人はＰＲＯ１９３ポリペプチドをコードするｃＤ
ＮＡを同定し単離下。ＰＲＯ１９３コード化クローンはヒト網膜ライブラリから
単離された。

【０４０４】 １２０．ＰＲＯ１１３０ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１１
３０（Ｆｉｇ２４０及び配列番号：４１５に示す）が、ヒト２−１９タンパク質
とアミノ酸配列同一性を有することが見出された。従って、現在では、本出願で
開示されるＰＲＯ１１３０が新たに同定された２−１９タンパク質相同体である
と考えられている。 １２１．ＰＲＯ１３３５ WU-BLAST2配列アラインメントプログラムを用いて、全長天然配列ＰＲＯ１３
３５（Ｆｉｇ２４２及び配列番号：４２３に示す）が、ヒト脱炭酸酵素前駆タン
パク質（AF037335_1）と或る程度のアミノ酸配列同一性を有することが見出され
た。従って、現在では、本出願で開示されるＰＲＯ１３３５が新たに同定された
脱炭酸酵素タンパク質ファミリーのメンバーであり、このファミリーに典型的な
活性を有すると考えられている。 １２２．ＰＲＯ１３２９ ＤＮＡ６６６６０−１５８５クローンは、分泌因子をコードすると考えられて
いる。知りうる限り、ＤＮＡ６６６６０−１５８５配列は、ここでＰＲＯ１３２
９と称される新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコンピュー
タプログラムを用いて、公知のタンパク質との配列同一性が明らかになったが、
有意ではないと決定された。 １２３．ＰＲＯ１５５０ ＤＮＡ７６３９３−１６６４クローンは、減算したヒト乳癌組織ライブラリか
ら単離した。知りうる限り、ＤＮＡ７６３９３−１６６４配列は、ここでＰＲＯ
１５５０と称される新規な因子をコードし；WU-BLAST2配列アラインメントコン
ピュータプログラムを用いて、公知のタンパク質との配列同一性が明らかになっ
たが、有意ではないと決定された。

【０４０５】 Ｂ．ＰＲＯ変異体 ここに記載した全長天然配列ＰＲＯポリペプチドに加えて、ＰＲＯ変異体も調
製できると考えられる。ＰＲＯ変異体は、ＰＲＯポリペプチドＤＮＡに適当なヌ
クレオチド変化を導入することにより、あるいは所望のＰＲＯポリペプチドを合
成することにより調製できる。当業者は、グリコシル化部位の数又は位置の変化
あるいは膜固着特性の変化などのアミノ酸変化がＰＲＯポリペプチドの翻訳後プ
ロセスを変えうることを理解するであろう。 天然全長配列ＰＲＯ又はここに記載したＰＲＯポリペプチドの種々のドメイン
における変異は、例えば、米国特許第5,364,934号に記載されている保存的及び
非保存的変異についての任意の技術及び指針を用いてなすことができる。変異は
、結果として天然配列ＰＲＯと比較してＰＲＯポリペプチドのアミノ酸配列が変
化するＰＲＯポリペプチドをコードする一又は複数のコドンの置換、欠失又は挿
入であってよい。場合によっては、変異は少なくとも１つのアミノ酸のＰＲＯポ
リペプチドの一又は複数のドメインの任意の他のアミノ酸による置換である。い
ずれのアミノ酸残基が所望の活性に悪影響を与えることなく挿入、置換又は欠失
されるかの指針は、ＰＲＯポリペプチドの配列を相同性の知られたタンパク質分
子の配列と比較し、相同性の高い領域内でなされるアミノ酸配列変化を最小にす
ることによって見出される。アミノ酸置換は、一のアミノ酸の類似した構造及び
／又は化学特性を持つ他のアミノ酸での置換、例えばロイシンのセリンでの置換
、即ち保存的アミノ酸置換の結果とすることができる。挿入及び欠失は、場合に
よっては１から５のアミノ酸の範囲内とすることができる。許容される変異は、
配列においてアミノ酸の挿入、欠失又は置換を系統的に作成し、得られた変異体
を下記の実施例に記載するインビトロアッセイの任意のもので活性について試験
することにより決定される。

【０４０６】 ＰＲＯポリペプチド断片がここに提供される。このような断片は、例えば、全
長天然タンパク質と比較した際に、Ｎ-末端又はＣ-末端で切断されてもよく、又
は内部残基を欠いていてもよい。或る種の断片は、ＰＲＯポリペプチドの所望の
生物学的活性に必須ではないアミノ酸残基を欠いている。 ＰＲＯ断片は、多くの従来技術の任意のものによって調製してよい。所望のペ
プチド断片は化学合成してもよい。代替的方法は、酵素的消化、例えば特定のア
ミノ酸残基によって決定される部位のタンパク質を切断することが知られた酵素
でタンパク質を処理することにより、あるいは適当な制限酵素でＤＮＡを消化し
て所望の断片を単離することによるＰＲＯ断片の生成を含む。さらに他の好適な
技術は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）により、所望のポリペプチド断片をコ
ードするＤＮＡ断片を単離し増幅することを含む。ＤＮＡ断片の所望の末端を決
定するオリゴヌクレオチドは、ＰＣＲの５’及び３’プライマーで用いられる。
好ましくは、ＰＲＯポリペプチド断片は、ここに開示した天然ＰＲＯポリペプチ
ドと少なくとも１つの生物学的及び／又は免疫学的活性を共有する。 特別の実施態様では、対象とする保存的置換を、好ましい置換を先頭にして表
１に示す。このような置換が生物学的活性の変化をもたらす場合、表１に例示的
置換と名前を付けた又は以下にアミノ酸分類でさらに記載するように、より置換
的な変化が導入され生成物がスクリーニングされる。

【０４０７】 表１ 元の残基 例示的置換 好ましい置換 Ala(A) val; Leu; ile val Arg(R) lys; gln; asn lys Asn(N) gln; his; lys; arg gln Asp(D) glu glu Cys(C) ser ser Gln(Q) asn ans Gln(E) asp asp Gly(G) pro; ala ala His(H) asn; gln; lys; arg arg Ile(I) leu; val; met; ala; phe; ノルロイシン leu Leu(L) ノルロイシン; ile; val; met; ala; phe ile Lys(K) arg; gln; asn arg Met(M) leu; phe; ile leu Phe(F) leu; val; ile; ala; tyr leu Pro(P) ala ala Ser(S) thr thr Thr(T) ser ser Trp(W) tyr; phe tyr Tyr(Y) trp; phe; thr; ser phe Val(V) ile; leu; met; phe; ala; ノルロイシン leu

【０４０８】 ＰＲＯポリペプチドの機能及び免疫学的同一性の置換的修飾は、（ａ）置換領
域のポリペプチド骨格の構造、例えばシート又は螺旋配置、（ｂ）標的部位の電
荷又は疎水性、又は（ｃ）側鎖の嵩を維持しながら、それらの効果において実質
的に異なる置換基を選択することにより達成される。天然発生残基は共通の側鎖
特性に基づいてグループに分けることができる： （１）疎水性：ノルロイシン, met, ala, val, leu, ile; （２）中性の親水性：cys, ser, thr; （３）酸性：asp, glu; （４）塩基性：asn, gln, his, lys, arg; （５）鎖配向に影響する残基：gly, pro; 及び （６）芳香族：trp, tyr, phe。 非保存的置換は、これらの分類の一つのメンバーを他の分類に交換することを
必要とするであろう。また、そのように置換された残基は、保存的置換部位、好
ましくは残された（非保存）部位に導入されうる。 変異は、オリゴヌクレオチド媒介（部位特異的）突然変異誘発、アラニンスキ
ャンニング、及びＰＣＲ突然変異誘発［Carter等, Nucl. Acids Res., 13: 4331
(1986); Zoller等, Nucl. Acids Res., 10: 6487 (1987)］、カセット突然変異
誘発［Wells等, Gene, 34: 315 (1985)］、制限的選択突然変異誘発［Wells等,
Philos. Trans. R. Soc. London SerA, 317: 415 (1986)］等のこの分野で知ら
れた方法を用いてなすことができ、又は他の知られた技術をクローニングしたＤ
ＮＡに実施してＰＲＯ変異体ＤＮＡを作成することもできる。 また、隣接配列に沿って一又は複数のアミノ酸を同定するのにスキャンニング
アミノ酸分析を用いることができる。好ましいスキャンニングアミノ酸は比較的
小さく、中性のアミノ酸である。そのようなアミノ酸は、アラニン、グリシン、
セリン、及びシステインを含む。アラニンは、ベータ炭素を越える側鎖を排除し
変異体の主鎖構造を変化させにくいので、この群の中で典型的に好ましいスキャ
ンニングアミノ酸である［Cuningham及びWells, Science, 244: 1081-1085 (198
9)］。また、アラニンは最もありふれたアミノ酸であるため典型的には好ましい
。さらに、それは埋もれた及び露出した位置の両方に見られることが多い［Crei
ghton, The Proteins, (W.H. Freeman & Co., N.Y.); Chothia, J. Mol. Bi
ol., 150: 1 (1976)］。アラニン置換が十分な量の変異体を生じない場合は、ア
イソテリック(isoteric)アミノ酸を用いることができる。

【０４０９】 Ｃ．ＰＲＯの修飾 ＰＲＯポリペプチドの共有結合的修飾は本発明の範囲内に含まれる。共有結合
的修飾の一型は、ＰＲＯポリペプチドの標的とするアミノ酸残基を、ＰＲＯポリ
ペプチドの選択された側鎖又はＮ又はＣ末端残基と反応できる有機誘導体化試薬
と反応させることである。二官能性試薬での誘導体化が、例えばＰＲＯを水不溶
性支持体マトリクスあるいは抗-ＰＲＯ抗体の精製方法又はその逆で用いるため
の表面に架橋させるのに有用である。通常用いられる架橋剤は、例えば、１，１
-ビス（ジアゾアセチル）-２-フェニルエタン、グルタルアルデヒド、Ｎ-ヒドロ
キシスクシンイミドエステル、例えば４-アジドサリチル酸、３，３’-ジチオビ
ス（スクシンイミジルプロピオネート）等のジスクシンイミジルエステルを含む
ホモ二官能性イミドエステル、ビス-Ｎ-マレイミド-１，８-オクタン等の二官能
性マレイミド、及びメチル-３-[(ｐ-アジドフェニル)-ジチオ］プロピオイミダ
ート等の試薬を含む。 他の修飾は、グルタミニル及びアスパラギニル残基の各々対応するグルタミル
及びアスパルチルへの脱アミノ化、プロリン及びリシンのヒドロキシル化、セリ
ル又はトレオニル残基のヒドロキシル基のリン酸化、リシン、アルギニン、及び
ヒスチジン側鎖のα-アミノ基のメチル化[T.E. Creighton, Proteins: Structur
e and Molecular Properties, W.H. Freeman & Co., San Francisco, p
p.79-86 (1983)]、Ｎ末端アミンのアセチル化、及び任意のＣ末端カルボキシル
基のアミド化を含む。

【０４１０】 本発明の範囲内に含まれるＰＲＯポリペプチドの共有結合的修飾の他の型は、
ポリペプチドの天然グリコシル化パターンの変更を含む。「天然グリコシル化パ
ターンの変更」とは、ここで意図されるのは、天然配列ＰＲＯに見られる１又は
複数の炭水化物部分の欠失（存在するグリコシル化部位の除去又は化学的及び／
又は酵素的手段によるグリコシル化の削除のいずれかによる）、及び／又は天然
配列ＰＲＯに存在しない１又は複数のグリコシル化部位の付加を意味する。さら
に、この文節は、存在する種々の炭水化物部分の性質及び特性の変化を含む、天
然タンパク質のグリコシル化における定性的変化を含む。 ＰＲＯポリペプチドへのグリコシル化部位の付加はアミノ酸配列の変更を伴っ
てもよい。この変更は、例えば、１又は複数のセリン又はトレオニン残基の天然
配列ＰＲＯ（Ｏ-結合グリコシル化部位）への付加、又は置換によってなされて
もよい。ＰＲＯアミノ酸配列は、場合によっては、ＤＮＡレベルでの変化、特に
、ＰＲＯポリペプチドをコードするＤＮＡを予め選択された塩基において変異さ
せ、所望のアミノ酸に翻訳されるコドンを生成させることを通して変更されても
よい。

【０４１１】 ＰＲＯポリペプチド上に炭水化物部分の数を増加させる他の手段は、グリコシ
ドのポリペプチドへの化学的又は酵素的結合による。このような方法は、この技
術分野において、例えば、1987年9月11日に発行されたWO 87/05330、及びAplin
及びWriston, CRC Crit. Rev. Biochem., pp. 259-306 (1981)に記載されている
。 ＰＲＯポリペプチド上に存在する炭水化物部分の除去は、化学的又は酵素的に
、あるいはグルコシル化の標的として提示されたアミノ酸残基をコードするコド
ンの変異的置換によってなすことができる。化学的脱グリコシル化技術は、この
分野で知られており、例えば、Hakimuddin等, Arch. Biochem. Biophys., 259:5
2 (1987)により、及びEdge等, Anal. Biochem., 118: 131 (1981)により記載さ
れている。ポリペプチド上の炭水化物部分の酵素的切断は、Thotakura等, Meth.
Enzymol. 138:350 (1987)に記載されているように、種々のエンド及びエキソグ
リコシダーゼを用いることにより達成される。 本発明のＰＲＯの共有結合的修飾の他の型は、ＰＲＯポリぺプチドの、種々の
非タンパク質様ポリマー、例えばポリエチレングリコール、ポリプロピレングリ
コール、又はポリオキシアルキレンの一つへの、米国特許第4,640,835号；第4,4
96,689号；第4,301,144号；第4,670,417号；第4,791,192号又は第4,179,337号に
記載された方法での結合を含む。

【０４１２】 また、本発明のＰＲＯポリペプチドは、他の異種ポリペプチド又はアミノ酸配
列に融合したＰＲＯポリペプチドを含むキメラ分子を形成する方法で修飾しても
よい。 一実施態様では、このようなキメラ分子は、抗タグ抗体が選択的に結合できる
エピトープを提供するタグポリペプチドとＰＲＯポリペプチドとの融合を含む。
エピトープタグは、一般的にはＰＲＯポリペプチドのアミノ又はカルボキシル末
端に位置する。このようなＰＲＯポリペプチドのエピトープタグ形態の存在は、
タグポリペプチドに対する抗体を用いて検出することができる。また、エピトー
プタグの提供は、抗タグ抗体又はエピトープタグに結合する他の型の親和性マト
リクスを用いたアフィニティ精製によってＰＲＯポリペプチドを容易に精製でき
るようにする。種々のタグポリペプチド及びそれら各々の抗体はこの分野で良く
知られている。例としては、ポリ−ヒスチジン（poly-his）又はポリ−ヒスチジ
ン−グリシン（poly-his-gly）タグ；flu HAタグポリペプチド及びその抗体１２
ＣＡ５［Field等, Mol. Cell. Biol., 8:2159-2165 (1988)］；c-mycタグ及びそ
れに対する８Ｆ９、３Ｃ７、６Ｅ１０、Ｇ４、Ｂ７及び９Ｅ１０抗体［Evan等,
Molecular and Cellular Biology, 5:3610-3616 (1985)］；及び単純ヘルペスウ
イルス糖タンパク質Ｄ（gD）タグ及びその抗体［Paborsky等, Protein Engineer
ing, 3(6):547-553 (1990)］を含む。他のタグポリペプチドは、フラッグペプチ
ド［Hopp等, BioTechnology, 6:1204-1210 (1988)］；ＫＴ３エピトープペプチ
ド［Martin等, Science, 255:192-194 (1992)］；α-チューブリンエピトープペ
プチド［Skinner等, J. Biol. Chem., 266:15163-15166 (1991)］；及びＴ７遺
伝子１０タンパク質ペプチドタグ［Lutz-Freyermuth等, Proc. Natl. Acad. Sci
. USA, 87:6393-6397 (1990)］を含む。 それに換わる実施態様では、キメラ分子はＰＲＯの免疫グロブリン又は免疫グ
ロブリンの特定領域との融合体を含んでもよい。キメラ分子の二価形態（「イム
ノアドヘシン」とも呼ばれる）については、そのような融合体はＩｇＧ分子のＦ
ｃ領域であり得る。Ｉｇ融合体は、好ましくはＩｇ分子内の少なくとも１つの可
変領域に換えてＰＲＯポリペプチドの可溶化（膜貫通ドメイン欠失又は不活性化
）形態を含む。特に好ましい実施態様では、免疫グロブリン融合体は、ＩｇＧ分
子のヒンジ、ＣＨ２及びＣＨ３、又はヒンジ、ＣＨ１、ＣＨ２及びＣＨ３領域を
含む。免疫グロブリン融合体の製造については、1995年6月27日発行の米国特許
第5,428,130号を参照のこと。

【０４１３】 Ｄ．ＰＲＯの調製 以下の説明は、主として、ＰＲＯ核酸を含むベクターで形質転換又は形質移入
された細胞を培養することによりＰＲＯを生産する方法に関する。もちろん、当
該分野においてよく知られている他の方法を用いてＰＲＯを調製することができ
ると考えられる。例えば、ＰＲＯ配列、又はその一部は、固相技術を用いた直接
ペプチド合成によって生産してもよい［例えば、Stewart等, Solid-Phase Pepti
de Synthesis, W.H. Freeman Co., San Francisco, CA (1969)；Merrifield, J.
Am. Chem. Soc., 85:2149-2154 (1963)参照］。手動技術又は自動によるインビ
トロタンパク質合成を行ってもよい。自動合成は、例えば、アプライド・バイオ
システムズ・ペプチド合成機（Foster City, CA）を用いて、製造者の指示によ
り実施してもよい。ＰＲＯの種々の部分は、別々に化学的に合成され、化学的又
は酵素的方法を用いて結合させて全長ＰＲＯを生産してもよい。

【０４１４】 １．ＰＲＯをコードするＤＮＡの単離 ＰＲＯをコードするＤＮＡは、ＰＲＯｍＲＮＡを保有していてそれを検出可能
なレベルで発現すると考えられる組織から調製されたｃＤＮＡライブラリから得
ることができる。従って、ヒトＰＲＯＤＮＡは、実施例に記載されるように、ヒ
トの組織から調製されたｃＤＮＡライブラリから簡便に得ることができる。また
ＰＲＯ-コード化遺伝子は、ゲノムライブラリから又は公知の合成方法（例えば
、自動化核酸合成）により得ることもできる。 ライブラリは、対象となる遺伝子あるいはその遺伝子によりコードされるタン
パク質を同定するために設計されたプローブ(ＰＲＯに対する抗体又は少なくと
も約２０−８０塩基のオリゴヌクレオチド等)によってスクリーニングできる。
選択されたプローブによるｃＤＮＡ又はゲノムライブラリのスクリーニングは、
例えばSambrook等, Molecular Cloning: A Laboratory Manual(New York: Cold
Spring Harbor Laboratory Press, 1989)に記載されている標準的な手順を使用
して実施することができる。所望のＰＲＯポリペプチドをコードする遺伝子を単
離する他の方法はＰＣＲ法を使用するものである［Sambrook等,上掲；Dieffenba
ch等, PCR Primer：A Laboratory Manual(Cold Spring Harbor Laboratory Pres
s, 1995)］。

【０４１５】 下記の実施例には、ｃＤＮＡライブラリのスクリーニング技術を記載している
。プローブとして選択されたオリゴヌクレオチド配列は、充分な長さで、疑陽性
が最小化されるよう充分に明瞭でなければならない。オリゴヌクレオチドは、ス
クリーニングされるライブラリ内のＤＮＡとのハイブリッド形成時に検出可能で
あるように標識されていることが好ましい。標識化の方法は当該分野において良
く知られており、^３２Ｐ標識されたＡＴＰのような放射線標識、ビオチン化ある
いは酵素標識の使用が含まれる。中程度の厳密性及び高度の厳密性を含むハイブ
リッド形成条件は、上掲のSambrook等に与えられている。 このようなライブラリースクリーニング法において同定された配列は、Genban
k等の公共データベース又は個人の配列データベースに寄託され公衆に利用可能
とされている周知の配列と比較及びアラインメントすることができる。分子の決
定された領域内又は全長に渡っての（アミノ酸又は核酸レベルのいずれかでの）
配列同一性は、この分野で知られた、そしてここに記載した方法を用いて決定す
ることができる。 タンパク質コード化配列を有する核酸は、初めてここで開示された推定アミノ
酸配列を使用し、また必要ならば、ｃＤＮＡに逆転写されなかったｍＲＮＡの生
成中間体及び先駆物質を検出する上掲のSambrook等に記述されているような従来
のプライマー伸展法を使用し、選択されたｃＤＮＡ又はゲノムライブラリをスク
リーニングすることにより得られる。

【０４１６】 ２．宿主細胞の選択及び形質転換 宿主細胞を、ここに記載したＰＲＯ生産のための発現又はクローニングベクタ
ーで形質移入又は形質転換し、プロモーターを誘導し、形質転換体を選択し、又
は所望の配列をコードする遺伝子を増幅するために適当に変性された常套的栄養
培地で培養する。培養条件、例えば培地、温度、ｐＨ等々は、過度の実験をする
ことなく当業者が選ぶことができる。 一般に、細胞培養の生産性を最大にする
ための原理、プロトコール、及び実用技術は、Mammalian Cell Biotechnology:
a Practical Approach, M.Butler編 (IRL Press, 1991)及びSambrook等, 上掲に
見出すことができる。 原核生物細胞形質移入及び真核生物細胞形質移入の方法、例えば、ＣａＣｌ_２ 、ＣａＰＯ_４、リポソーム媒介及びエレクトロポレーションは当業者に知られて
いる。用いられる宿主細胞に応じて、その細胞に対して適した標準的な方法を用
いて形質転換はなされる。前掲のSambrook等に記載された塩化カルシウムを用い
るカルシウム処理又はエレクトロポレーションが、一般的に原核生物に対して用
いられる。アグロバクテリウム・トゥメファシエンスによる感染が、Shaw等, Ge
ne, 23:315 (1983)及び1989年6月29日公開のWO 89/05859に記載されているよう
に、或る種の植物細胞の形質転換に用いられる。このような細胞壁のない哺乳動
物の細胞に対しては、Graham及びvan der Eb, Virology, 52:456-457 (1978)の
リン酸カルシウム沈降法が好ましい。哺乳動物細胞の宿主系形質転換の一般的な
態様は米国特許第4,399,216号に記載されている。酵母菌中への形質転換は、典
型的には、Van solingen等, J. Bact., 130:946 (1977)及びHsiao等, Proc. Nat
l. Acad. Sci. USA, 76:3829 (1979)の方法に従って実施される。しかしながら
、ＤＮＡを細胞中に導入する他の方法、例えば、核マイクロインジェクション、
エレクトロポレーション、無傷の細胞、又はポリカチオン、例えばポリブレン、
ポリオルニチン等を用いる細菌プロトプラスト融合もまた用いることもできる。
哺乳動物細胞を形質転換するための種々の技術については、Keown等, Methods i
n Enzymology, 185:527-537 (1990)及び Mansour等, Nature, 336:348-352 (198
8)を参照のこと。

【０４１７】 ここに記載のベクターにＤＮＡをクローニングあるいは発現するために適切な
宿主細胞は、原核生物、酵母菌、又は高等真核生物細胞である。適切な原核生物
は、限定するものではないが、真正細菌、例えばグラム陰性又はグラム陽性生物
体、例えば大腸菌のような腸内細菌科を含む。種々の大腸菌株が公衆に利用可能
であり、例えば、大腸菌Ｋ１２株ＭＭ２９４（ATCC31,446）；大腸菌Ｘ１７７６
（ATCC31,537）；大腸菌株Ｗ３１１０（ATCC27,325）及びＫ５７７２（ATCC53,6
35）である。他の好ましい原核動物宿主細胞は、大腸菌、例えば、E. coli、エ
ンテロバクター、エルビニア(Erwinia)、クレブシエラ(Klebsiella)、プロテウ
ス(Proteus)、サルモネラ、例えば、ネズミチフス菌、セラチア、例えば、セラ
チアマルセサンス(Serratia marcescans) 、及び赤痢菌、並びに桿菌、例えばバ
シリスブチリス(B. subtilis)及びバシリリチェニフォルミス(B. licheniformis
)（例えば、1989年4月12日発行のDD 266,710に記載されたバシリリチェニフォル
ミス４１Ｐ）、シュードモナス、例えば緑膿筋及びストレプトマイセスなどの腸
内細菌科を含む。これらの例は限定ではなく例示である。株Ｗ３１１０は、組換
えＤＮＡ生産発行のための共通の宿主株であるので一つの特に好ましい宿主又は
親宿主である。好ましくは、宿主細胞は最小量のタンパク質分解酵素を分泌する
。例えば、株Ｗ３１１０は、細胞に外来のタンパク質をコードする遺伝子におけ
る遺伝子変異をするように修飾してもよく、そのような宿主の例としては、完全
な遺伝子型ｔｏｎＡを有する大腸菌Ｗ３１１０株１Ａ２；完全な遺伝子型ｔｏｎ
Ａ ｐｔｒ３を有する大腸菌Ｗ３１１０株９Ｅ４；完全な遺伝子型ｔｏｎＡ ｐ
ｒｔ３ ｐｈｏＡ Ｅ１５ (ａｒｇＦ-ｌａｃ)１６９ ｄｅｇＰ ｏｍｐＴｋ
ａｎを有する大腸菌Ｗ３１１０株２７Ｃ７（ATCC 55,244）；完全な遺伝子型ｔ
ｏｎＡ ｐｔｒ３ ｐｈｏＡ Ｅ１５ (ａｌｇＦ-ｌａｃ)１６９ ｄｅｇＰ
ｏｍｐＴ ｒｂｓ７ｉｌｖＧｋａｎを有する大腸菌Ｗ３１１０株３７Ｄ６；非カ
ナマイシン耐性ｄｅｇＰ欠失変異を持つ３７Ｄ６株である大腸菌Ｗ３１１０株４
０Ｂ４；及び1990年8月7日発行の米国特許第4,946,783号に開示された変異周辺
質プロテアーゼを有する大腸菌株を含む。あるいは、クローニングのインビトロ
法、例えばＰＣＲ又は他の核酸ポリメラーゼポリメラーゼ反応が好ましい。

【０４１８】 原核生物に加えて、糸状菌又は酵母菌のような真核微生物は、ＰＲＯポリペプ
チドコード化ベクターのための適切なクローニング又は発現宿主である。サッカ
ロミセス・セレヴィシアは、通常用いられる下等真核生物宿主微生物である。他
に、シゾサッカロミセスプロンブ(Schizosaccharomyces prombe)（Beach及びNur
se, Nature, 290: 140 [1981]; 1985年5月2日発行のEP 139,383）；クルベロミ
セスホスツ(Kluveromyces hosts)（米国特許第4,943,529号; Fleer等, Bio/Tech
nology, 9: 968-975 (1991)）、例えばケーラクチス(K. lactis)（MW98-8C, CBS
683, CBS4574; Louvencourt等, J. Bacteriol. 737 [1983]）、ケーフラギリス(
K. fragilis)（ATCC 12,424）、ケーブルガリクス(K. bulgaricus)（ATCC 16,04
5）、ケーウィケラミイ(K. wickeramii)（ATCC 24,178）、ケーワルチイ(K. wal
tii)（ATCC 56,500）、ケードロソフィラルム(K. drosophilarum)（ATCC 36,906
; Van den Berg等, Bio/Technology, 8: 135 (1990)）、ケーテモトレランス(K.
themotolerans)及びケーマルキシアナス(K. marxianus)；ヤロウィア(yarrowia
)（EP 402,226）；ピッチャパストリス(Pichia pastoris)（EP 183,070; Sheekr
ishna等, J. Basic Microbiol, 28: 265-278 [1988]）；カンジダ；トリコデル
マレーシア(reesia)（EP 244,234）；アカパンカビ（Case等, Proc. Natl. Acad
. Sci. USA, 76: 5259-5263 [1979]）；シュワニオマイセス(schwanniomyces)、
例えばシュワニオマイセスオクシデンタリス(occidentalis)（1990年10月31日発
行のEP 394,538）；及び糸状真菌、例えば、ニューロスポラ、ペニシリウム、ト
リポクラジウム(Tolypocladium)（1991年1月10日発行のWO 91/00357）；及びコ
ウジ菌、例えば偽巣性コウジ菌（Ballance等, Biochem. Biophys. Res. Commun.
, 112: 284-289 [1983]; Tilburn等, Gene, 26: 205-221 [1983]; Yelton等, Pr
oc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 1470-1474 [1984]）及びクロカビ（Kelly及びH
ynes, EMBO J., 4: 475-479 [1985]）が含まれる。ここで好ましいメチロトロピ
ック(methylotropic)酵母は、これらに限られないが、ハンセヌラ(Hansenula)、
カンジダ、クロエケラ(Kloeckera)、ピチア(Pichia)、サッカロミセス、トルロ
プシス(Torulopsis)、及びロドトルラ(Rhodotorula)からなる属から選択される
メタノールで成長可能な酵母を含む。この酵母の分類の例示である特定の種のリ
ストは、C. Anthony, The Biochemistry of Methylotrophs, 269 (1982)に記載
されている。

【０４１９】 グリコシル化ＰＲＯの発現に適切な宿主細胞は、多細胞生物から誘導される。
無脊椎動物細胞の例としては、ショウジョウバエＳ２及びスポドスペラＳｆ９等
の昆虫細胞並びに植物細胞が含まれる。有用な哺乳動物宿主株化細胞の例は、チ
ャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）及びＣＯＳ細胞を含む。より詳細な例は、
ＳＶ４０によって形質転換されたサル腎臓ＣＶ１株 (COS-7, ATCC CRL 1651);ヒ
ト胚腎臓株（293又は懸濁培養での増殖のためにサブクローン化された293細胞、
Graham等, J. Gen Virol., 36:59 (1977)）;チャイニーズハムスター卵巣細胞／
-ＤＨＦＲ(CHO, Urlaub及びChasin, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 77:4216 (19
80));マウスのセルトリ細胞（TM4, Mather, Biol. Reprod., 23:243-251 (1980)
）ヒト肺細胞 (W138, ATCC CCL 75); ヒト肝細胞 (Hep G2, HB 8065); 及びマウ
ス乳房腫瘍細胞 (MMT 060562, ATTC CCL51)を含む。適切な宿主細胞の選択は、
この分野の技術常識内にある。

【０４２０】 ３．複製可能なベクターの選択及び使用 ＰＲＯをコードする核酸(例えば、ｃＤＮＡ又はゲノムＤＮＡ)は、クローニン
グ(ＤＮＡの増幅)又は発現のために複製可能なベクター内に挿入される。様々な
ベクターが公的に入手可能である。ベクターは、例えば、プラスミド、コスミド
、ウイルス粒子、又はファージの形態とすることができる。適切な核酸配列が、
種々の手法によってベクターに挿入される。一般に、ＤＮＡはこの分野で周知の
技術を用いて適当な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入される。ベクター成分と
しては、一般に、これらに制限されるものではないが、一又は複数のシグナル配
列、複製開始点、一又は複数のマーカー遺伝子、エンハンサーエレメント、プロ
モーター、及び転写終結配列を含む。これらの成分の一又は複数を含む適当なベ
クターの作成には、当業者に知られた標準的なライゲーション技術を用いる。 ＰＲＯは直接的に組換え手法によって生産されるだけではなく、シグナル配列
あるいは成熟タンパク質あるいはポリペプチドのＮ-末端に特異的切断部位を有
する他のポリペプチドである異種性ポリペプチドとの融合ペプチドとしても生産
される。一般に、シグナル配列はベクターの成分であるか、ベクターに挿入され
るＰＲＯ-コード化ＤＮＡの一部である。シグナル配列は、例えばアルカリホス
ファターゼ、ペニシリナーゼ、ｌｐｐあるいは熱安定性エンテロトキシンIIリー
ダーの群から選択される原核生物シグナル配列であってよい。酵母の分泌に関し
ては、シグナル配列は、酵母インベルターゼリーダー、アルファ因子リーダー(
酵母菌属(Saccharomyces)及びクルイベロマイシス(Kluyveromyces)α因子リーダ
ーを含み、後者は米国特許第5,010,182号に記載されている)、又は酸ホスフォタ
ーゼリーダー、白体(C.albicans)グルコアミラーゼリーダー(1990年4月4日発行
のEP362179)、又は1990年11月15日に公開されたWO 90/13646に記載されているシ
グナルであり得る。哺乳動物細胞の発現においては、哺乳動物シグナル配列は、
同一あるいは関連ある種の分泌ポリペプチド由来のシグナル配列並びにウイルス
分泌リーダーのようなタンパク質の直接分泌に使用してもよい。

【０４２１】 発現及びクローニングベクターは共に一又は複数の選択された宿主細胞におい
てベクターの複製を可能にする核酸配列を含む。そのような配列は多くの細菌、
酵母及びウイルスに対してよく知られている。プラスミドｐＢＲ３２２に由来す
る複製開始点は大部分のグラム陰性細菌に好適であり、２μプラスミド開始点は
酵母に適しており、様々なウイルス開始点(ＳＶ４０、ポリオーマ、アデノウイ
ルス、ＶＳＶ又はＢＰＶ)は哺乳動物細胞におけるクローニングベクターに有用
である。 発現及びクローニングベクターは、典型的には、選べるマーカーとも称される
選択遺伝子を含む。典型的な選択遺伝子は、(a)アンピシリン、ネオマイシン、
メトトレキセートあるいはテトラサイクリンのような抗生物質あるいは他の毒素
に耐性を与え、(b)栄養要求性欠陥を補い、又は(c)例えばバシリに対する遺伝子
コードＤ-アラニンラセマーゼのような、複合培地から得られない重要な栄養素
を供給するタンパク質をコードする。

【０４２２】 哺乳動物細胞に適切な選べるマーカーの例は、ＤＨＦＲあるいはチミジンキナ
ーゼのように、ＰＲＯ-コード化核酸を取り込むことのできる細胞成分を同定す
ることのできるものである。野生型ＤＨＦＲを用いた場合の好適な宿主細胞は、
Urlaub 等により, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 77:4216 (1980)に記載されて
いるようにして調製され増殖されたＤＨＦＲ活性に欠陥のあるＣＨＯ株化細胞で
ある。酵母菌中での使用に好適な選択遺伝子は酵母プラスミドＹＲｐ７に存在す
るｔｒｐ１遺伝子である［Stinchcomb等, Nature, 282：39(1979)；Kingman等,
Gene, 7：141(1979)；Tschemper等, Gene, 10：157(1980)］。ｔｒｐ１遺伝子は
、例えば、ＡＴＣＣ番号４４０７６あるいはＰＥＰ４-１のようなトリプトファ
ン内で成長する能力を欠く酵母菌の突然変異株に対する選択マーカーを提供する
［Jones, Genetics, 85:12 (1977)］。 発現及びクローニングベクターは、通常、ＰＲＯ-コード化核酸配列に作用可
能に結合し、ｍＲＮＡ合成を制御するプロモーターを含む。種々の可能な宿主細
胞により認識される好適なプロモーターが知られている。原核生物宿主での使用
に好適なプロモーターはβ-ラクタマーゼ及びラクトースプロモーター系［Cahng
等, Nature, 275:615 (1978)； Goeddel等, Nature, 281:544 (1979)］、アルカ
リホスファターゼ、トリプトファン(trp)プロモーター系［Goeddel, Nucleic Ac
ids Res., 8:4057 (1980); EP 36,776］、及びハイブリッドプロモーター、例え
ばｔａｃプロモーター［deBoer 等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 80:21-25 (1
983)］を含む。細菌系で使用するプロモータもまたＰＲＯをコードするＤＮＡと
作用可能に結合したシャイン・ダルガーノ(S.D.)配列を有する。

【０４２３】 酵母宿主と共に用いて好適なプロモーター配列の例としては、３-ホスホグリ
セラートキナーゼ［Hitzeman 等, J. Biol. Chem., 255:2073 (1980)］又は他の
糖分解酵素［Hess 等, J. Adv. Enzyme Reg., 7:149 (1968)；Holland, Biochem
istry, 17：4900(1987)］、例えばエノラーゼ、グリセルアルデヒド-３-リン酸
デヒドロゲナーゼ、ヘキソキナーゼ、ピルビン酸デカルボキシラーゼ、ホスホフ
ルクトキナーゼ、グルコース-６-リン酸イソメラーゼ、３-ホスホグリセレート
ムターゼ、ピルビン酸キナーゼ、トリオセリン酸イソメラーゼ、ホスホグルコー
スイソメラーゼ、及びグルコキナーゼが含まれる。 他の酵母プロモーターとしては、成長条件によって転写が制御される付加的効
果を有する誘発的プロモーターであり、アルコールデヒドロゲナーゼ２、イソチ
トクロムＣ、酸ホスファターゼ、窒素代謝と関連する分解性酵素、メタロチオネ
イン、グリセルアルデヒド-３-リン酸デヒドロゲナーゼ、及びマルトース及びガ
ラクトースの利用を支配する酵素のプロモーター領域がある。酵母菌での発現に
好適に用いられるベクターとプロモータはEP 73,657に更に記載されている。 哺乳動物の宿主細胞におけるベクターからのＰＲＯ転写は、例えば、ポリオー
マウィルス、伝染性上皮腫ウィルス(1989年7月5日公開のUK 2,211,504)、アデノ
ウィルス(例えばアデノウィルス２)、ウシ乳頭腫ウィルス、トリ肉腫ウィルス、
サイトメガロウィルス、レトロウィルス、Ｂ型肝炎ウィルス及びサルウィルス４
０(SV40)のようなウィルスのゲノムから得られるプロモーター、異種性哺乳動物
プロモーター、例えばアクチンプロモーター又は免疫グロブリンプロモーター、
及び熱衝撃プロモーターから得られるプロモーターによって、このようなプロモ
ーターが宿主細胞系に適合し得る限り制御される。

【０４２４】 より高等の真核生物による所望のＰＲＯをコードするＤＮＡの転写は、ベクタ
ー中にエンハンサー配列を挿入することによって増強され得る。エンハンサーは
、通常は約１０から３００塩基対で、プロモーターに作用してその転写を増強す
るＤＮＡのシス作動要素である。哺乳動物遺伝子由来の多くのエンハンサー配列
が現在知られている(グロビン、エラスターゼ、アルブミン、α-フェトプロテイ
ン及びインスリン)。しかしながら、典型的には、真核細胞ウィルス由来のエン
ハンサーが用いられるであろう。例としては、複製起点の後期側のＳＶ４０エン
ハンサー(１００−２７０塩基対)、サイトメガロウィルス初期プロモーターエン
ハンサー、複製起点の後期側のポリオーマエンハンサー及びアデノウィルスエン
ハンサーが含まれる。エンハンサーは、ＰＲＯコード化配列の５’又は３’位で
ベクター中にスプライシングされ得るが、好ましくはプロモーターから５’位に
位置している。 また真核生物宿主細胞(酵母、真菌、昆虫、植物、動物、ヒト、又は他の多細
胞生物由来の有核細胞)に用いられる発現ベクターは、転写の終結及びｍＲＮＡ
の安定化に必要な配列も含む。このような配列は、真核生物又はウィルスのＤＮ
Ａ又はｃＤＮＡの通常は５’、時には３’の非翻訳領域から取得できる。これら
の領域は、ＰＲＯをコードするｍＲＮＡの非翻訳部分にポリアデニル化断片とし
て転写されるヌクレオチドセグメントを含む。 組換え脊椎動物細胞培養でのＰＲＯの合成に適応化するのに適切な他の方法、
ベクター及び宿主細胞は、Gething等, Nature, 293:620-625 (1981); Mantei等,
Nature, 281:40-46 (1979); EP 117,060; 及びEP 117,058に記載されている。

【０４２５】 ４．遺伝子増幅／発現の検出 遺伝子の増幅及び／又は発現は、ここで提供された配列に基づき、適切に標識
されたプローブを用い、例えば、従来よりのサザンブロット法、ｍＲＮＡの転写
を定量化するノーザンブロット法［Thomas, Proc. Natl. Acad. Sci. USA,77:52
01-5205 (1980)］、ドットブロット法(ＤＮＡ分析)、又はインサイツハイブリッ
ド形成法によって、直接的に試料中で測定することができる。あるいは、ＤＮＡ
二本鎖、ＲＮＡ二本鎖及びＤＮＡ−ＲＮＡハイブリッド二本鎖又はＤＮＡ-タン
パク二本鎖を含む、特異的二本鎖を認識することができる抗体を用いることもで
きる。次いで、抗体を標識し、アッセイを実施することができ、ここで二本鎖は
表面に結合しており、その結果二本鎖の表面での形成の時点でその二本鎖に結合
した抗体の存在を検出することができる。 あるいは、遺伝子の発現は、遺伝子産物の発現を直接的に定量する免疫学的な
方法、例えば細胞又は組織切片の免疫組織化学的染色及び細胞培養又は体液のア
ッセイによって、測定することもできる。試料液の免疫組織化学的染色及び／又
はアッセイに有用な抗体は、モノクローナルでもポリクローナルでもよく、任意
の哺乳動物で調製することができる。簡便には、抗体は、天然配列ＰＲＯポリペ
プチドに対して、又はここで提供されるＤＮＡ配列をベースとした合成ペプチド
に対して、又はＰＲＯＤＮＡに融合し特異的抗体エピトープをコードする外因性
配列に対して調製され得る。

【０４２６】 ５．ポリペプチドの精製 ＰＲＯの形態は、培地又は宿主細胞の溶菌液から回収することができる。膜結
合性であるならば、適切な洗浄液(例えばトリトン-Ｘ１００)又は酵素的切断を
用いて膜から引き離すことができる。ＰＲＯの発現に用いられる細胞は、凍結融
解サイクル、超音波処理、機械的破壊、又は細胞溶解剤などの種々の化学的又は
物理的手段によって破壊することができる。 ＰＲＯを、組換え細胞タンパク又はポリペプチドから精製することが望ましい
。適切な精製手順の例である次の手順により精製される：すなわち、イオン交換
カラムでの分画；エタノール沈殿；逆相ＨＰＬＣ；シリカ又はカチオン交換樹脂
、例えばＤＥＡＥによるクロマトグラフィー；クロマトフォーカシング；ＳＤＳ
-ＰＡＧＥ；硫酸アンモニウム沈殿；例えばセファデックスＧ-７５を用いるゲル
濾過;ＩｇＧのような汚染物を除くプロテインＡセファロースカラム；及びＰＲ
Ｏポリペプチドのエピトープタグ形態を結合させる金属キレート化カラムである
。この分野で知られ、例えば、Deutcher, Methodes in Enzymology, 182 (1990)
；Scopes, Protein Purification: Principles and Practice, Springer-Verlag
, New York (1982)に記載された多くのタンパク質精製方法を用いることができ
る。選ばれる精製過程は、例えば、用いられる生産方法及び特に生産される特定
のＰＲＯの性質に依存する。

【０４２７】 ６．ＰＲＯの用途 ＰＲＯをコードする核酸配列（又はそれらの補体）は、ハイブリッド形成プロ
ーブとしての使用を含む分子生物学の分野において、染色体及び遺伝子マッピン
グにおいて、及びアンチセンスＲＮＡ及びＤＮＡの生成において種々の用途を有
している。また、ＰＲＯ核酸も、ここに記載される組換え技術によるＰＲＯポリ
ペプチドの調製に有用であろう。 全長天然配列ＰＲＯ遺伝子又はその一部は、全長ＰＲＯｃＤＮＡの単離又はこ
こに開示したＰＲＯ配列に対して所望の配列同一性を持つ更に他の遺伝子（例え
ば、ＰＲＯの天然発生変異体又は他の種からのＰＲＯをコードするもの）の単離
のためのｃＤＮＡライブラリ用のハイブリッド形成プローブとして使用できる。
場合によっては、プローブの長さは約２０〜約５０塩基である。ハイブリッド形
成プローブは、少なくとも部分的に全長天然ヌクレオチド配列の新規な領域から
誘導してもよく、それらの領域は、過度の実験をすることなく、天然配列ＰＲＯ
のプロモーター、エンハンサー成分及びイントロンを含むゲノム配列から誘導さ
れ得る。例えば、スクリーニング法は、ＰＲＯポリペプチド遺伝子のコード化領
域を周知のＤＮＡ配列を用いて単離して約４０塩基の選択されたプローブを合成
することを含む。ハイブリッド形成プローブは、^３２Ｐ又は^３５Ｓ等の放射性ヌ
クレオチド、又はアビディン／ビオチン結合系を介してプローブに結合したアル
カリホスファターゼ等の酵素標識を含む種々の標識で標識されうる。本発明のＰ
ＲＯポリペプチド遺伝子に相補的な配列を有する標識されたプローブは、ヒトｃ
ＤＮＡ、ゲノムＤＮＡ又はｍＲＮＡのライブラリーをスクリーニングし、そのラ
イブラリーの何れのメンバーがプローブにハイブッド形成するかを決定するのに
使用できる。ハイブリッド形成技術は、以下の実施例において更に詳細に記載す
る。

【０４２８】 本出願で開示する任意のＥＳＴはプローブと同様に、ここに記載した方法で用
いることができる。 ＰＲＯ核酸の他の有用な断片は、標的ＰＲＯｍＲＮＡ（センス）又はＰＲＯＤ
ＮＡ（アンチセンス）配列に結合できる一本鎖核酸配列（ＲＮＡ又はＤＮＡのい
ずれか）を含むアンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドを含む、アンチセン
ス又はセンスオリゴヌクレオチドは、本発明によると、ＰＲＯＤＮＡのコード化
領域の断片を含む。このような断片は、一般的には少なくとも約１４ヌクレオチ
ド、好ましくは約１４から３０ヌクレオチドを含む。与えられたタンパク質をコ
ードするｃＤＮＡ配列に基づく、アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドを
制御する可能性は、例えば、Stein及びCohen（CancerRes. 48: 2659: 1988）及
び van der Krol等（BioTechniques 6: 958, 1988）に記載されている。 アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドの標的核酸配列への結合は二重鎖
の形成をもたらし、それは、二重鎖の分解の促進、転写又は翻訳の期外停止を含
む幾つかの方法の一つ、又は他の方法により、標的配列の転写又は翻訳を阻止す
る。よって、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＰＲＯタンパク質の発現を阻
止するのに用いられる。アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドは、修飾糖
−ホスホジエステル骨格（又は他の糖結合、WO 91/06629に記載のもの等）を有
するオリゴヌクレオチドをさらに含み、そのような糖結合は内因性ヌクレアーゼ
耐性である。そのような耐性糖結合を持つオリゴヌクレオチドは、インビボで安
定であるが（即ち、酵素分解に耐えうるが）、標的ヌクレオチド配列に結合でき
る配列特異性は保持している。

【０４２９】 センス又はアンチセンスオリゴヌクレオチドの他の例は、WO 90/10048に記載
されているもののような、有機部分、及びオリゴヌクレオチドの標的核酸配列へ
の親和性を向上させる他の部分、例えばポリ-(Ｌ-リジン)に共有結合したオリゴ
ヌクレオチドを含む。さらにまた、エリプチシン等の挿入剤、アルキル化剤又は
金属作体をセンス又はアンチセンスオリゴヌクレオチドに結合させ、アンチセン
ス又はセンスオリゴヌクレオチドの標的ヌクレオチド配列への結合特異性を改変
してもよい。 アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドは、例えば、ＣａＰＯ_４-媒介Ｄ
ＮＡ形質移入、エレクトロポレーションを含む任意の遺伝子転換方法により、又
はエプスタイン-バーウイルスなどの遺伝子転換ベクターを用いることにより、
標的核酸配列を含む細胞に導入される。好ましい方法では、アンチセンス又はセ
ンスオリゴヌクレオチドは、適切なレトロウイルスベクターに挿入される。標的
核酸配列を含む細胞は、インビボ又はエキソビボで組換えレトロウイルスベクタ
ーに接触させる。好適なレトロウイルスベクターは、これらに限られないが、マ
ウスレトロウイルスＭ-ＭｕＬＶから誘導されるもの、Ｎ２（Ｍ-ＭｕＬＶから誘
導されたレトロウイルス）、又はＤＣＴ５Ａ、ＤＣＴ５Ｂ及びＤＣＴ５Ｃと命名
されたダブルコピーベクター（WO 90/13641参照）を含む。

【０４３０】 また、センス又はアンチセンスオリゴヌクレオチドは、WO 91/04753に記載さ
れているように、リガンド結合分子との複合体の形成により標的配列を含む細胞
に導入してもよい。適切なリガンド結合分子は、これらに限られないが、細胞表
面レセプター、成長因子、他のサイトカイン、又は細胞表面レセプターに結合す
る他のリガンドを含む。好ましくは、リガンド結合分子の複合体形成は、リガン
ド結合分子がその対応する分子又はレセプターに結合する、あるいはセンス又は
アンチセンスオリゴヌクレオチド又はその複合体の細胞への侵入を阻止する能力
を実質的に阻害しない。 あるいは、センス又はアンチセンスオリゴヌクレオチドは、WO 90/10448に記
載されたように、オリゴヌクレオチド−脂質複合体の形成により標的核酸配列を
含む細胞に導入してもよい。センス又はアンチセンスオリゴヌクレオチド−脂質
複合体は、好ましくは内因性リパーゼにより細胞内で分解される。

【０４３１】 また、プローブは、ＰＣＲ技術に用いて、密接に関連したＰＲＯコード化配列
の同定のための配列のプールを作成することができる。 また、ＰＲＯをコードする核酸配列は、そのＰＲＯをコードする遺伝子のマッ
ピングのため、及び遺伝子疾患を持つ個体の遺伝子分析のためのハイブリッド形
成プローブの作成にも用いることができる。ここに提供される核酸配列は、イン
サイツハイブリッド形成、既知の染色体マーカーに対する結合分析、及びライブ
ラリーでのハイブリッド形成スクリーニング等の周知の技術を用いて、染色体及
び染色体の特定領域にマッピングすることができる。 ＰＲＯのコード化配列が他のタンパク質に結合するタンパク質をコードする場
合（例えば、ＰＲＯがレセプターである場合）、ＰＲＯは、そのリガンドを同定
するアッセイに用いることができる。このような方法により、レセプター／リガ
ンド結合性相互作用の阻害剤を同定することができる。このような結合性相互作
用に含まれるタンパク質も、ペプチド又は小分子阻害剤又は結合性相互作用のア
ゴニストのスクリーニングに用いることができる。また、レセプターＰＲＯは関
連するリガンドの単離にも使用できる。スクリーニングアッセイは、天然ＰＲＯ
又はＰＲＯのレセプターの生物学的活性に似たリード化合物の発見のために設計
される。このようなスクリーニングアッセイは、化学的ライブラリーの高スルー
プットスクリーニングにも用いられ、小分子候補薬剤の同定に特に適したものと
する。考慮される小分子は、合成有機又は無機化合物を含む。アッセイは、この
分野で良く知られ特徴付けられているタンパク質−タンパク質結合アッセイ、生
物学的スクリーニングアッセイ、免疫検定及び細胞ベースのアッセイを含む種々
の型式で実施される。

【０４３２】 また、ＰＲＯ又はその任意の修飾型をコードする核酸は、トランスジェニック
動物又は「ノックアウト」動物を産生するのにも使用でき、これらは治療的に有
用な試薬の開発やスクリーニングに有用である。トランスジェニック動物(例え
ばマウス又はラット)とは、出生前、例えば胚段階で、その動物又はその動物の
祖先に導入された導入遺伝子を含む細胞を有する動物である。導入遺伝子とは、
トランスジェニック動物が発生する細胞のゲノムに組み込まれたＤＮＡである。
一実施形態では、ＰＲＯをコードするｃＤＮＡは、確立された技術によりＰＲＯ
をコードするゲノムＤＮＡをクローン化するために使用することができ、ゲノム
配列を、ＰＲＯをコードするＤＮＡを発現する細胞を有するトランスジェニック
動物を産生するために使用することができる。トランスジェニック動物、特にマ
ウス又はラット等の特定の動物を産生する方法は当該分野において常套的になっ
ており、例えば米国特許第4,736,866号や第4,870,009号に記述されている。典型
的には、特定の細胞を組織特異的エンハンサーでのＰＲＯ導入遺伝子の導入の標
的にする。胚段階で動物の生殖系列に導入されたＰＲＯコード化導入遺伝子のコ
ピーを含むトランスジェニック動物はＰＲＯをコードするＤＮＡの増大した発現
の影響を調べるために使用できる。このような動物は、例えばその過剰発現を伴
う病理学的状態に対して保護をもたらすと思われる試薬のテスター動物として使
用できる。本発明のこの態様においては、動物を試薬で治療し、導入遺伝子を有
する未治療の動物に比べ病理学的状態の発症率が低ければ、病理学的状態に対す
る治療的処置の可能性が示される。

【０４３３】 あるいは、ＰＲＯの非ヒト相同体は、動物の胚性細胞に導入されたＰＲＯをコ
ードする変更ゲノムＤＮＡと、ＰＲＯをコードする内在性遺伝子との間の相同的
組換えによって、ＰＲＯをコードする欠陥又は変更遺伝子を有するＰＲＯ「ノッ
クアウト」動物を作成するために使用できる。例えば、ＰＲＯをコードするｃＤ
ＮＡは、確立された技術に従い、ＰＲＯをコードするゲノムＤＮＡのクローニン
グに使用できる。ＰＲＯをコードするゲノムＤＮＡの一部を欠失したり、組み込
みを監視するために使用する選択可能なマーカーをコードする遺伝子等の他の遺
伝子で置換することができる。典型的には、ベクターは無変化のフランキングＤ
ＮＡ(５’と３’末端の両方)を数キロベース含む［例えば、相同的組換えベクタ
ーについてはThomas及びCapecchi, Cell, 51:503(1987)を参照のこと］。ベクタ
ーは胚性幹細胞に(例えばエレクトロポレーションによって)導入し、導入された
ＤＮＡが内在性ＤＮＡと相同的に組換えられた細胞が選択される［例えば、Li等
, Cell, 69:915(1992)参照］。選択された細胞は次に動物(例えばマウス又はラ
ット)の胚盤胞内に注入されて集合キメラを形成する［例えば、Bradley, Terato
carcinomas and Embryonic Stem Cells: A Practical Approach, E. J. Roberts
on, ed. (IRL, Oxford, 1987), pp. 113-152参照］。その後、キメラ性胚を適切
な偽妊娠の雌性乳母に移植し、期間をおいて「ノックアウト」動物をつくり出す
。胚細胞に相同的に組換えられたＤＮＡを有する子孫は標準的な技術により同定
され、それらを利用して動物の全細胞が相同的に組換えられたＤＮＡを含む動物
を繁殖させることができる。ノックアウト動物は、ＰＲＯポリペプチドが不在で
あることによるある種の病理的状態及びその病理的状態の進行に対する防御能力
によって特徴付けられる。

【０４３４】 また、ＰＲＯポリペプチドをコードする核酸は遺伝子治療にも使用できる。遺
伝子治療用途においては、例えば欠陥遺伝子を置換するため、治療的有効量の遺
伝子産物のインビボ合成を達成するために遺伝子が導入される。「遺伝子治療」
とは、１回の処理により継続的効果が達成される従来の遺伝子治療と、治療的に
有効なＤＮＡ又はｍＲＮＡの１回又は繰り返し投与を含む遺伝子治療薬の投与の
両方を含む。アンチセンスＲＮＡ及びＤＮＡは、ある種の遺伝子のインビボ発現
を阻止する治療薬として用いることができる。短いアンチセンスオリゴヌクレオ
チドを、細胞膜による制限された取り込みに起因する低い細胞内濃度にもかかわ
らず、それが阻害剤として作用する細胞中に移入できることは既に示されている
（Zamecnik等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83: 4143-4146 [1986]）。オリゴ
ヌクレオチドは、それらの負に荷電したリン酸ジエステル基を非荷電基で置換す
ることによって取り込みを促進するように修飾してもよい。 生存可能な細胞に核酸を導入するための種々の技術が存在する。これらの技術
は、核酸が培養細胞にインビトロで、あるいは意図する宿主の細胞においてイン
ビボで移入されるかに応じて変わる。核酸を哺乳動物細胞にインビトロで移入す
るのに適した方法は、リポソーム、エレクトロポレーション、マイクロインジェ
クション、細胞融合、ＤＥＡＥ-デキストラン、リン酸カルシウム沈殿法などを
含む。現在好ましいインビボ遺伝子移入技術は、ウイルス（典型的にはレトロウ
イルス）ベクターでの形質移入及びウイルス被覆タンパク質-リポソーム媒介形
質移入である（Dzau等, Trends, in Biotechnology 11, 205-219）。幾つかの状
況では、核酸供給源を、細胞表面膜タンパク質又は標的細胞に特異的な抗体、標
的細胞上のレセプターに対するリガンド等の標的細胞を標的化する薬剤とともに
提供するのが望ましい。リポソームを用いる場合、エンドサイトーシスを伴って
細胞表面膜タンパク質に結合するタンパク質、例えば、特定の細胞型向性のカプ
シドタンパク質又はその断片、サイクルにおいて内部移行を受けるタンパク質に
対する抗体、細胞内局在化を標的とし細胞内半減期を向上させるタンパク質が、
標的化及び／又は取り込みの促進のために用いられる。レセプター媒介エンドサ
イトーシスは、例えば、Wu等, J. Biol. Chem. 262, 4429-2232 (1987); 及びWa
gner等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 3410-3414 (1990)によって記述され
ている。遺伝子作成及び遺伝子治療のプロトコールの概説については、Anderson
等, Science 256, 808-813 (1992)を参照のこと。

【０４３５】 ここに記載したＰＲＯポリペプチドは、タンパク質電気泳動目的の分子量マー
カーとして用いてもよい。 ここに記載したＰＲＯポリペプチド又はその断片をコードする核酸分子は染色
体同定に有用である。この点において、実際の配列に基づく染色体マーキング試
薬は殆ど利用可能ではないため、新規な染色体マーカーの同定の必要性が存在し
ている。本発明の各ＰＲＯ核酸分子は染色体マーカーとして使用できる。 また本発明のＰＲＯポリペプチド及び核酸分子は組織タイピングに使用でき、
本発明のＰＲＯポリペプチドは一方の組織で他方に比較して異なる発現をする。
ＰＲＯ核酸分子は、ＰＣＲ、ノーザン分析、サザン分析及びウェスタン分析のプ
ローブ生成のための用途が見出されるであろう。 ここに記載したＰＲＯポリペプチドは治療薬として用いてもよい。本発明のＰ
ＲＯポリペプチドは、製薬的に有用な組成物を調製するのに知られた方法に従っ
て製剤され、それにより、このＰＲＯ生成物は製薬的に許容される担体媒体と混
合される。 治療用製剤は、凍結乾燥された製剤又は水性溶液の形態で、任意的な製薬上許容
可能なキャリア、賦形剤又は安定剤と、所望の精製度を有する活性成分とを混合
することにより(Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th edition, A. Oso
l, Ed., [1980])、調製され保管される。許容される担体、賦形剤又は安定剤は
、用いる投与量及び濃度ではレシピエントに対して無毒性であり、リン酸、クエ
ン酸及び他の有機酸等の緩衝液；アスコルビン酸を含む抗酸化剤；低分子量(残
基数１０個未満)ポリペプチド；血清アルブミン、ゼラチン又は免疫グロブリン
等のタンパク質；ポリビニルピロリドン等の親水性重合体；グリシン、グルタミ
ン、アスパラギン、アルギニン又はリシン等のアミノ酸；グルコース、マンノー
ス又はデキストリン等の単糖類、二糖類又は他の炭水化物、ＥＤＴＡ等のキレー
ト剤、マンニトール又はソルビトール等の糖類、ナトリウム等の塩形成対イオン
；及び／又はＴＷＥＥＮ(商品名)、ＰＬＵＲＯＮＩＣＳ(商品名)又はポリエチレ
ングリコール(ＰＥＧ)等の非イオン性界面活性剤を含む。

【０４３６】 インビボ投与に使用される製剤は滅菌されていなくてはならない。これは、凍
結乾燥及び再構成の前又は後に、滅菌フィルター膜を通す濾過により容易に達成
される。 ここで、本発明の製薬組成物は一般に、無菌のアクセスポートを具備する容器
、例えば、皮下注射針で貫通可能なストッパーを持つ静脈内バッグ又はバイアル
内に配される。 投与経路は周知の方法、例えば、静脈内、腹膜内、脳内、筋肉内、眼内、動脈
内又は病巣内経路での注射又は注入、局所投与、又は徐放系による。 本発明の製薬組成物の用量及び望ましい薬物濃度は、意図する特定の用途に応
じて変化する。適切な用量又は投与経路の決定は、通常の内科医の技量の範囲内
である。動物実験は、ヒト治療のための有効量の決定についての信頼できるガイ
ダンスを提供する。有効量の種間スケーリングは、Toxicokinetics and New Dru
g Development, Yacobi等, 編, Pergamon Press, New York 1989, pp. 42-96のM
ordenti, J. 及びchappell, W. 「The use of interspecies scaling in toxico
kinetics」に記載された原理に従って実施できる。

【０４３７】 ＰＲＯポリペプチド又はそのアゴニスト又はアンタゴニストのインビボ投与が
用いられる場合、正常な投与量は、投与経路に応じて、哺乳動物の体重当たり１
日に約１０ｎｇ／ｋｇから１００ｍｇ／ｋｇまで、好ましくは約１μｇ／ｋｇ／
日から１０ｍｇ／ｋｇ／日である。特定の用量及び輸送方法の指針は文献に与え
られている；例えば、米国特許第4,657,760号、第5,206,344号、又は第5,225,21
2号参照。異なる製剤が異なる治療用化合物及び異なる疾患に有効であること、
例えば一つの器官又な組織を標的とする投与には他の器官又は組織とは異なる方
式で輸送することは必要であることが予想される。 ＰＲＯポリペプチドの投与を必要とする任意の疾患又は疾病の治療に適した放
出特性を持つ製剤でＰＲＯポリペプチドの持続放出が望まれる場合、ＰＲＯポリ
ペプチドのマイクロカプセル化が考えられる。持続放出のための組換えタンパク
質のマイクロカプセル化は、ヒト成長ホルモン（ｒｈＧＨ）、インターフェロン
（ｒｈＩＦＮ）、インターロイキン-２、及びＭＮｒｇｐ１２０で成功裏に実施
されている。Johnson等, Nat. Med., 2: 795-799 (1996); Yasuda, Biomed. The
r., 27: 1221-1223 (1993); Hora等, Bio/Technology, 8: 755-758 (1990); Cle
land, 「Design and Production of Single Immunization Vaccines Using Poly
actide Polyglycolide Microsphere Systems」Vaccine Design: The Subunit an
d Adjuvant Approach, Powell 及び Newman編, (Plenum Press: New York, 1995
), p. 439-462; WO 97/03692, WO 96/40072, WO 96/07399; 及び米国特許第5,56
4,010号。

【０４３８】 これらのタンパク質の持続放出製剤は、ポリ-乳酸-コグリコール酸（ＰＬＧＡ
）ポリマーを用い、その生体適合性及び広範囲の生分解特性に基づいて開発され
た。ＰＬＧＡの分解生成物である乳酸及びグリコール酸は、ヒト身体内で即座に
クリアされる。さらに、このポリマーの分解性は、分子量及び組成に依存して数
ヶ月から数年まで調節できる。Lewis, 「Controlled release of bioactive age
nts from lactide/glycolide polymer」: M. Chasin及び R. Langer (編), Biod
egradable Polymers as Drug Delivery Systems (Marcel Dekker: New York, 19
90), pp. 1-41。 本発明は、ＰＲＯポリペプチドに類似する（アゴニスト）又はＰＲＯポリペプ
チドの効果を阻害する（アンタゴニスト）ものを同定するための化合物のスクリ
ーニング方法も包含する。アンタゴニスト候補薬のスクリーニングアッセイは、
ここに同定した遺伝子にコードされるＰＲＯポリペプチドと結合又は複合体形成
する化合物、又は他にコード化ポリペプチドお他の細胞性タンパク質との相互作
用を阻害する化合物を同定するために設計される。このようなスクリーニングア
ッセイは、それを特に小分子候補薬の同定に適したものにする、化学的ライブラ
リの高スループットスクリーニングに適用可能なアッセイを含む。 このアッセイは、タンパク質−タンパク質結合アッセイ、生化学的スクリーニ
ングアッセイ、イムノアッセイ、及び細胞ベースのアッセイで、この分野で知ら
れたものを含む種々の方式で実施される。 アンタゴニストについての全てのアッセイは、それらが候補薬をここで同定さ
れた核酸にコードされるＰＲＯポリペプチドと、これら２つの成分が相互作用す
るのに十分な条件下及び時間で接触させることを必要とすることにおいて共通す
る。

【０４３９】 結合アッセイにおいて、相互作用は結合であり、形成された複合体は単離され
るか、又は反応混合物中で検出される。特別な実施態様では、ここに同定された
遺伝子にコードされるＰＲＯポリペプチド又は候補薬が、共有又は非共有結合に
より固相、例えばミクロタイタープレートに固定化される。非共有結合は、一般
的に固体表面をポリペプチドの溶液で被覆し乾燥させることにより達成される。
あるいは、固定化されるＰＲＯポリペプチドに特異的な固定化抗体、例えばモノ
クローナル抗体を、それを固体表面に固着させるために用いることができる。ア
ッセイは、固定化成分、例えば固着成分を含む被覆表面に、検出可能な標識で標
識されていてもよい非固定化成分を添加することにより実施される。反応が完了
したとき、未反応成分を例えば洗浄により除去し、固体表面に固着した複合体を
検出する。最初の非固定化成分が検出可能な標識を有している場合、表面に固定
化された標識の検出は複合体形成が起こったことを示す。最初の非固定化成分が
標識を持たない場合は、複合体形成は、例えば、固定化された複合体に特異的に
結合する標識抗体によって検出できる。 候補化合物が相互作用するがここに同定した遺伝子にコードされる特定のＰＲ
Ｏポリペプチに結合しない場合、そのポリペプチドとの相互作用は、タンパク質
−タンパク質相互作用を検出するために良く知られた方法によってアッセイする
ことができる。そのようなアッセイは、架橋、同時免疫沈降、及び勾配又はクロ
マトグラフィカラムを通す同時精製などの伝統的な手法を含む。さらに、タンパ
ク質−タンパク質相互作用は、Fields及び共同研究者等［Fiels及びSong, Natur
e(London) 340, 245-246 (1989); Chien等, Proc.Natl. Acad. Sci. USA 88, 95
78-9582 (1991)］に記載された酵母菌ベースの遺伝子系を用いることにより、Ch
evray及びNathans［Proc.Natl. Acad. Sci. USA 89, 5789-5793 (1991)］に開示
されている酵母菌ベースの系を用いて監視することができる。酵母菌ＧＡＬ４な
どの多くの転写活性化剤は、２つの物理的に別個のモジュラードメインからなり
、一方はＤＮＡ結合ドメインとして作用し、他方は転写活性化ドメインとして機
能する。以前の文献に記載された酵母菌発現系（一般に「２-ハイブリッド系」
と呼ばれる）は、この特性の長所を利用して、２つのハイブリッドタンパク質を
用い、一方では標的タンパク質がＧＡＬ４のＤＮＡ結合ドメインに融合し、他方
では、候補となる活性化タンパク質が活性化ドメインに融合している。ＧＡＬ１
-ｌａｃＺリポーター遺伝子のＧＡＬ４活性化プロモーターの制御下での発現は
、タンパク質-タンパク質相互作用を介したＧＡＬ４活性の再構成に依存する。
相互作用するポリペプチドを含むコロニーは、β-ガラクトシダーゼに対する色
素生産性物質で検出される。２-ハイブリッド技術を用いた２つの特定なタンパ
ク質間のタンパク質-タンパク質相互作用を同定するための完全なキット（MATCH
MAKER(商品名)）は、Clontechから商業的に入手可能である。この系は、特定の
タンパク質相互作用に含まれるタンパク質ドメインのマッピング、並びにこの相
互作用にとって重要なアミノ酸残基の特定にも拡張することができる。

【０４４０】 ここで同定されたＰＲＯポリペプチドをコードする遺伝子と細胞内又は細胞外
成分との相互作用を阻害する化合物は、次のように試験できる：通常は反応混合
物は、遺伝子産物と細胞外又は細胞内成分を、それら２つの生成物が相互作用及
び結合する条件下及び時間で含むように調製される。候補化合物が結合を阻害す
る能力を試験するために、反応は試験化合物の不存在及び存在下で実施される。
さらに、プラシーボを第３の反応混合物に添加してポジティブ対照を提供しても
よい。混合物中に存在する試験化合物と細胞内又は細胞外成分との結合（複合体
形成）は上記のように監視される。試験化合物を含有する反応混合物ではなく対
照反応における複合体の形成は、試験化合物が試験化合物とその結合パートナー
との相互作用を阻害することを示す。 アンタゴニストを検定するために、ＰＲＯポリペプチドを特定の活性について
スクリーニングする化合物とともに添加してよく、ＰＲＯポリペプチド存在下で
の対象とする活性を阻害する化合物の能力が化合物がＰＲＯポリペプチドのアン
タゴニストであることを示す。あるいは、アンタゴニストは、ＰＲＯポリペプチ
ド及び膜結合ＰＲＯポリペプチドレセプター又は組換えレセプターを持つ潜在的
アンタゴニストを、競合的阻害アッセイに適した条件下で結合させることにより
検出してもよい。ＰＲＯポリペプチドは、放射活性等で標識でき、レセプターに
結合したＰＲＯポリペプチドの数を潜在的アンタゴニストの有効性を決定するの
に使用できる。レセプターをコードする遺伝子は、当業者に知られた多くの方法
、例えばリガンドパンニング及びＦＡＣＳソートにより同定できる。Coligan等,
Current Protocols in Immun., 1(2): Chapter 5 (1991)。好ましくは、発現ク
ローニングが用いられ、ポリアデニル化ＲＮＡがＰＲＯポリペプチドに反応性の
細胞から調製され、このＲＮＡから生成されたｃＤＮＡライブラリがプールに分
配され、ＣＯＳ細胞又はＰＲＯポリペプチド反応性でない他の細胞の形質移入に
使用される。スライドガラスで成長させた形質移入細胞を標識したＰＲＯポリペ
プチドに暴露する。ＰＲＯポリペプチドは、ヨウ素化又は部位特異的タンパク質
キナーゼの認識部位の包含を含む種々の手段で標識できる。固定及びインキュベ
ーションの後、スライドにオートラジオグラフィ分析を施す。ポジティブプール
を同定し、相互作用サブプール化及び再スクリーニング工程を用いてサブプール
を調製して再形質移入し、結果的に推定レセプターをコードする単一のクローン
を生成する。

【０４４１】 レセプター同定の代替的方法として、標識下ＰＲＯポリペプチドをレセプター
分子を発現する細胞膜又は抽出調製物に光親和性結合させることができる。架橋
材料はＰＡＧＥに溶解させ、Ｘ線フィルムに暴露する。レセプターを含む標識複
合体を励起し、ペプチド断片に分離し、タンパク質マイクロ配列決定を施すこと
ができる。マイクロ配列決定から得たアミノ酸配列は、推定レセプターをコード
する遺伝子を同定するｃＤＮＡライブラリをスクリーニングする分解性オリゴヌ
クレオチドプローブの組の設計に用いられる。 アンタゴニストの他の検定では、レセプターを発現する哺乳動物細胞又は膜調
製物を、候補化合物の存在下で標識ＰＲＯポリペプチドとともにインキュベート
する。次いで、この相互作用を促進又は阻止する化合物の能力を測定する。 潜在的なアンタゴニストのより特別な例は、免疫グロブリンとＰＲＯポリペプ
チドとの融合体に結合するオリゴヌクレオチド、特に、限られないが、ポリペプ
チド-及びモノクローナル抗体及び抗体断片、一本鎖抗体、抗-イディオタイプ抗
体、及びこれらの抗体又は断片のキメラ又はヒト化形態、並びにヒト抗体及び抗
体断片を含む抗体を含んでいる。あるいは、潜在的アンタゴニストは、密接に関
連したタンパク質、例えば、レセプターを認識するが効果を与えず、従ってＰＲ
Ｏポリペプチドの作用を競合的に阻害するＰＲＯポリペプチドの変異形態であっ
てもよい。 他の潜在的なＰＲＯポリペプチドアンタゴニストは、アンチセンス技術を用い
て調製されたアンチセンスＲＮＡ又はＤＮＡ作成物であり、例えば、アンチセン
スＲＮＡ又はＤＮＡは、標的ｍＲＮＡにハイブリッド形成してタンパク質翻訳を
妨害することによりｍＲＮＡの翻訳を直接阻止するように作用する。アンチセン
ス技術は、トリプルへリックス形成又はアンチセンスＤＮＡ又はＲＮＡを通して
遺伝子発現を制御するのに使用でき、それらの方法はともに、ポリペプチドヌク
レオチドのＤＮＡ又はＲＮＡへの結合に基づく。例えば、ここでの成熟ＰＲＯポ
リペプチドをコードするポリペプチドヌクレオチド配列の５’コード化部分は、
約１０から４０塩基対長のアンチセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドの設計に使用
される。ＤＮＡオリゴヌクレオチドは、転写に含まれる遺伝子の領域に相補的で
あるように設計され（トリプルへリックス−Lee等, Nucl, Acid Res., 6: 3073
(1979); Cooney等, Science, 241: 456 (1988); Dervan等, Science, 251: 1360
(1991)参照）、それによりＰＲＯポリペプチドの転写及び生成を防止する。ア
ンチセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドはインビボでｍＲＮＡにハイブリッド形成
してｍＲＮＡ分子のＰＲＯポリペプチドへの翻訳を阻止する（アンチセンス−Ok
ano, Neurochem., 56: 560 (1991); Oligodeoxynucleotides as Antisense Inhi
bitors of Gene Expression (SRS Press: Boca Raton, FL, 1988)）。上記のオ
リゴヌクレオチドは、細胞に輸送され、アンチセンスＲＮＡ又はＤＮＡをインビ
ボで発現させて、ＰＲＯポリペプチドの生産を阻害することもできる。アンチセ
ンスＤＮＡが用いられる場合、翻訳開始部位、例えば標的遺伝子ヌクレオチド配
列の−１０から＋１０位置の間から誘導されるオリゴデオキシリボヌクレオチド
が好ましい。

【０４４２】 潜在的アンタゴニストは、ＰＲＯポリペプチドの活性部位、レセプター結合部
位、又は成長因子又は他の関連結合部位に結合し、それによりＰＲＯポリペプチ
ドの正常な生物学的活性を阻止する小分子を含む。小分子の例は、これらに限ら
れないが、小型ペプチド又はペプチド様分子、好ましくは可溶性ペプチド、及び
合成非ペプチド有機又は無機化合物を含む。 リボザイムは、ＲＮＡの特異的切断を触媒できる酵素的ＲＮＡ分子である。リ
ボザイムは、相補的標的ＲＮＡへの配列特異的ハイブリッド形成、次いでヌクレ
オチド鎖切断的切断により作用する。潜在的ＲＮＡ標的内の特異的リボザイム切
断部位は、既知の技術で同定できる。更なる詳細は、例えば、Rossi, Current B
iology 4: 469-471 (1994)及びＰＣＴ公報、番号WO 97/33551（1997年9月18日発
行）を参照。 転写阻害に用いられるトリプルヘリックス形成における核酸分子は一本鎖でデ
オキシヌクレオチドからなる。これらのオリゴヌクレオチドの基本組成は、フー
グスチン塩基対則を介するトリプルヘリックス形成を促進するように設計され、
それは一般に二重鎖の一方の鎖上のプリン又はピリミジンのサイズ変更可能な伸
展を必要とする。さらなる詳細は、例えば、ＰＣＴ公報、番号WO 97/33551, 上
掲を参照。 これらの小分子は、上記で議論したスクリーニングアッセイの一又は複数の任
意のものにより及び／又は当業者に良く知られた他の任意のスクリーニング技術
により同定できる。

【０４４３】 Ｆ．抗-ＰＲＯ抗体 本発明は、さらに抗-ＰＲＯ抗体を提供するものである。抗体の例としては、
ポリクローナル、モノクローナル、ヒト化、二重特異性及びヘテロ抱合体抗体が
含まれる。 １．ポリクローナル抗体 抗-ＰＲＯ抗体はポリクローナル抗体を含む。ポリクローナル抗体の調製方法
は当業者に知られている。哺乳動物においてポリクローナル抗体は、例えば免疫
化剤、及び所望するのであればアジュバントを、一又は複数回注射することで発
生させることができる。典型的には、免疫化剤及び／又はアジュバントを複数回
皮下又は腹腔内注射により、哺乳動物に注射する。免疫化剤は、ＰＲＯポリペプ
チド又はその融合タンパク質を含みうる。免疫化剤を免疫化された哺乳動物にお
いて免疫原性が知られているタンパク質に抱合させるのが有用である。このよう
な免疫原タンパク質の例は、これらに限られないが、キーホールリンペットヘモ
シアニン、血清アルブミン、ウシサイログロブリン及び大豆トリプシンインヒビ
ターが含まれる。使用され得るアジュバントの例には、フロイント完全アジュバ
ント及びＭＰＬ-ＴＤＭアジュバント(モノホスホリル脂質Ａ、合成トレハロース
ジコリノミコラート)が含まれる。免疫化プロトコールは、過度の実験なく当業
者により選択されるであろう。

【０４４４】 ２．モノクローナル抗体 あるいは、抗-ＰＲＯ抗体はモノクローナル抗体であってもよい。モノクロー
ナル抗体は、Kohler及びMilstein, Nature, 256:495 (1975)に記載されているよ
うなハイブリドーマ法を使用することで調製することができる。ハイブリドーマ
法では、マウス、ハムスター又は他の適切な宿主動物を典型的には免疫化剤によ
り免疫化することで、免疫化剤に特異的に結合する抗体を生成するかあるいは生
成可能なリンパ球を誘発する。また、リンパ球をインビトロで免疫化することも
できる。 免疫化剤は、典型的には対象とするＰＲＯポリペプチド又はその融合タンパク
質を含む。一般にヒト由来の細胞が望まれる場合には末梢血リンパ球(「ＰＢＬ
」)が使用され、あるいは非ヒト哺乳動物源が望まれている場合は、脾臓細胞又
はリンパ節細胞が使用される。次いで、ポリエチレングリコール等の適当な融合
剤を用いてリンパ球を不死化株化細胞と融合させ、ハイブリドーマ細胞を形成す
る［Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, Academic Pre
ss, (1986) pp. 59-103］。不死化株化細胞は、通常は、形質転換した哺乳動物
細胞、特に齧歯動物、ウシ、及びヒト由来の骨髄腫細胞である。通常、ラット又
はマウスの骨髄腫株化細胞が使用される。ハイブリドーマ細胞は、好ましくは、
未融合の不死化細胞の生存又は成長を阻害する一又は複数の物質を含有する適切
な培地で培養される。例えば、親細胞が、酵素のヒポキサンチングアニンホスホ
リボシルトランスフェラーゼ(HGPRT又はHPRT)を欠いていると、ハイブリドーマ
の培地は、典型的には、ヒポキサチン、アミノプチリン及びチミジンを含み(「
ＨＡＴ培地」)、この物質がＨＧＰＲＴ欠乏性細胞の増殖を阻止する。 好ましい不死化株化細胞は、効率的に融合し、選択された抗体生成細胞による
安定した高レベルの抗体発現を支援し、ＨＡＴ培地のような培地に対して感受性
である。より好ましい不死化株化細胞はマウス骨髄腫株であり、これは例えばカ
リフォルニア州サンディエゴのSalk Institute Cell Distribution Centerやメ
リーランド州ロックビルのアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクションより
入手可能である。ヒトモノクローナル抗体を生成するためのヒト骨髄腫及びマウ
ス-ヒト異種骨髄腫株化細胞も開示されている［Kozbor, J. Immunol., 133:3001
(1984)、Brodeur等, Monoclonal Antibody Production Techniques and Applic
ations, Marcel Dekker, Inc., New York, (1987) pp. 51-63］。 次いでハイブリドーマ細胞が培養される培養培地を、ＰＲＯに対するモノクロ
ーナル抗体の存在について検定する。好ましくは、ハイブリドーマ細胞によって
生成されたモノクローナル抗体の結合特異性は免疫沈降又はラジオイムノアッセ
イ(ＲＩＡ)や酵素結合免疫測定法(ＥＬＩＳＡ)等のインビトロ結合検定法によっ
て測定する。このような技術及びアッセイは、当該分野において公知である。モ
ノクローナル抗体の結合親和性は、例えばMunson及びPollard, Anal. Biochem.,
107:220 (1980)によるスキャッチャード分析法によって測定することができる
。 所望のハイブリドーマ細胞が同定された後、クローンを制限希釈工程によりサ
ブクローニングし、標準的な方法で成長させることができる［Goding, 上掲］。
この目的のための適当な培地には、例えば、ダルベッコの改変イーグル培地及び
ＲＰＭＩ-１６４０倍地が含まれる。あるいは、ハイブリドーマ細胞は哺乳動物
においてインビボで腹水として成長させることもできる。 サブクローンによって分泌されたモノクローナル抗体は、例えばプロテインＡ
−セファロース法、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー法、ゲル電気泳
動法、透析法又はアフィニティークロマトグラフィー等の従来の免疫グロブリン
精製方法によって培養培地又は腹水液から単離又は精製される。 また、モノクローナル抗体は、組換えＤＮＡ法、例えば米国特許第4,816,567
号に記載された方法により作成することができる。本発明のモノクローナル抗体
をコードするＤＮＡは、常套的な方法を用いて(例えば、マウス抗体の重鎖及び
軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合可能なオリゴヌクレオチドプローブを使
用して)、容易に単離し配列決定することができる。本発明のハイブリドーマ細
胞はそのようなＤＮＡの好ましい供給源となる。ひとたび単離されたら、ＤＮＡ
は発現ベクター内に配することができ、これが宿主細胞、例えばサルＣＯＳ細胞
、チャイニーズハムスター卵巣(ＣＨＯ)細胞、あるいは免疫グロブリンタンパク
質を生成等しない骨髄腫細胞内に形質移入され、組換え宿主細胞内でモノクロー
ナル抗体の合成をすることができる。また、ＤＮＡは、例えば相同マウス配列に
換えてヒト重鎖及び軽鎖定常ドメインのコード配列を置換することにより［米国
特許第4,816,567号；Morrison等, 上掲］、又は免疫グロブリンコード配列に非
免疫グロブリンポリペプチドのコード配列の一部又は全部を共有結合することに
より修飾することができる。このような非免疫グロブリンポリペプチドは、本発
明の抗体の定常ドメインに置換でき、あるいは本発明の抗体の１つの抗原結合部
位の可変ドメインに置換でき、キメラ性二価抗体を生成する。 抗体は一価抗体であってもよい。一価抗体の調製方法は当該分野においてよく
知られてる。例えば、一つの方法は免疫グロブリン軽鎖と修飾重鎖の組換え発現
を含む。重鎖は一般的に、重鎖の架橋を防止するようにＦｃ領域の任意の点で切
断される。あるいは、関連するシステイン残基を他のアミノ酸残基で置換するか
欠失させて架橋を防止する。 一価抗体の調製にはインビトロ法がまた適している。抗体の消化による、その
断片、特にＦａｂ断片の生成は、当該分野において知られている慣用的技術を使
用して達成できる。

【０４４５】 ３．ヒト及びヒト化抗体 本発明の抗-ＰＲＯ抗体は、さらにヒト化抗体又はヒト抗体を含む。非ヒト(例
えばマウス)抗体のヒト化形とは、キメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖あ
るいはその断片(例えばＦｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ'、Ｆ(ａｂ')_２あるいは抗体の他
の抗原結合サブ配列)であって、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小配列を含
むものである。ヒト化抗体はレシピエントの相補性決定領域(ＣＤＲ)の残基が、
マウス、ラット又はウサギのような所望の特異性、親和性及び能力を有する非ヒ
ト種(ドナー抗体)のＣＤＲの残基によって置換されたヒト免疫グロブリン(レシ
ピエント抗体)を含む。幾つかの例では、ヒト免疫グロブリンのＦｖフレームワ
ーク残基は、対応する非ヒト残基によって置換されている。また、ヒト化抗体は
、レシピエント抗体にも、移入されたＣＤＲもしくはフレームワーク配列にも見
出されない残基を含んでいてもよい。一般に、ヒト化抗体は、全てあるいはほと
んど全てのＣＤＲ領域が非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、全てあるいはほ
とんど全てのＦＲ領域がヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものである、少
なくとも１つ、典型的には２つの可変ドメインの実質的に全てを含む。ヒト化抗
体は、最適には免疫グロブリン定常領域(Ｆｃ)、典型的にはヒトの免疫グロブリ
ンの定常領域の少なくとも一部を含んでなる［Jones等, Nature, 321:522-525 (
1986); Riechmann等, Nature, 332:323-329 (1988); 及びPresta, Curr. Op Str
uct. Biol., 2:593-596 (1992)］。 非ヒト抗体をヒト化する方法はこの分野でよく知られている。一般的に、ヒト
化抗体には非ヒト由来の一又は複数のアミノ酸残基が導入される。これら非ヒト
アミノ酸残基は、しばしば、典型的には「移入」可変ドメインから得られる「移
入」残基と称される。ヒト化は基本的に齧歯動物のＣＤＲ又はＣＤＲ配列でヒト
抗体の該当する配列を置換することによりウィンター(winter)及び共同研究者［
Jones等, Nature, 321:522-525 (1986)；Riechmann等, Nature, 332:323-327 (1
988)；Verhoeyen等, Science, 239:1534-1536 (1988)］の方法に従って、齧歯類
ＣＤＲ又はＣＤＲ配列をヒト抗体の対応する配列に置換することにより実施され
る。よって、このような「ヒト化」抗体は、無傷のヒト可変ドメインより実質的
に少ない分が非ヒト種由来の対応する配列で置換されたキメラ抗体(米国特許第4
,816,567号)である。実際には、ヒト化抗体は典型的には幾つかのＣＤＲ残基及
び場合によっては幾つかのＦＲ残基が齧歯類抗体の類似する部位からの残基によ
って置換されたヒト抗体である。 また、ヒト抗体は、ファージ表示ライブラリ［Hoogenboom及びWinter, J. Mol
. Biol., 227:381 (1992)；Marks等, J. Mol. Biol., 222:581 (1991)］を含む
この分野で知られた種々の方法を用いて作成することもできる。また、Cole等及
びBoerner等の方法も、ヒトモノクローナル抗体の調製に利用することができる
［Cole等, Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss. p.77(1
985)及びBoerner等, J. Immunol., 147(1)：86-95(1991) ］。同様に、ヒト抗体
はヒト免疫グロブリン座位をトランスジェニック動物、例えば内在性免疫グロブ
リン遺伝子は部分的又は完全に不活性化されたマウスに導入することにより産生
することができる。投与の際に、遺伝子再配列、組立、及び抗体レパートリーを
含むあらゆる観点においてヒトに見られるものに非常に類似しているヒト抗体の
生産が観察される。このアプローチは、例えば米国特許第5,545,807号；同第5,5
45,806号；同第5,569,825号；同第5,625,126号；同第5,633,425号；同第5,661,0
16号、及び次の科学文献：Marks等, Bio/Technology 10, 779-783 (1992); Lonb
erg等, Nature 368 856-859 (1994); Morrison, Nature 368, 812-13 (1994); F
ishwild等, Nature Biotechnology 14, 845-51 (1996); Neuberger, Nature Bio
technology 14, 826 (1996); Lonberg及びHuszar, Intern. Rev. Immunol. 13 6
5-93 (1995)に記載されている。

【０４４６】 ４．二重特異性抗体 二重特異性抗体は、少なくとも２つの異なる抗原に対して結合特異性を有する
モノクローナル抗体、好ましくはヒトもしくはヒト化抗体である。本発明の場合
において、結合特異性の一方はＰＲＯに対してであり、他方は任意の他の抗原、
好ましくは細胞表面タンパク質又はレセプター又はレセプターサブユニットに対
してである。 二重特異性抗体を作成する方法は当該技術分野において周知である。伝統的に
は、二重特異性抗体の組換え生産は、二つの重鎖が異なる特異性を持つ二つの免
疫グロブリン重鎖／軽鎖対の同時発現に基づく［Milstein及びCuello, Nature,
305:537-539 (1983)］。免疫グロブリンの重鎖と軽鎖を無作為に取り揃えるため
、これらハイブリドーマ(クアドローマ)は１０種の異なる抗体分子の潜在的混合
物を生成し、その内一種のみが正しい二重特異性構造を有する。正しい分子の精
製は、アフィニティークロマトグラフィー工程によって通常達成される。同様の
手順が1993年5月13日公開のWO 93/08829、及びTraunecker等, EMBO J.,10:3655-
3656 (1991)に開示されている。 所望の結合特異性(抗体-抗原結合部位)を有する抗体可変ドメインを免疫グロ
ブリン定常ドメイン配列に融合できる。融合は、好ましくは少なくともヒンジ部
、ＣＨ２及びＣＨ３領域の一部を含む免疫グロブリン重鎖定常ドメインとのもの
である。少なくとも一つの融合には軽鎖結合に必要な部位を含む第一の重鎖定常
領域(ＣＨ１)が存在することが望ましい。免疫グロブリン重鎖融合をコードする
ＤＮＡ、及び望むのであれば免疫グロブリン軽鎖を、別々の発現ベクターに挿入
し、適当な宿主生物に同時形質移入する。二重特異性抗体を作成するための更な
る詳細については、例えばSuresh等, Methods in Enzymology, 121:210(1986)を
参照されたい。

【０４４７】 WO 96/27011に記載された他の方法によれば、一対の抗体分子間の界面を操作
して組換え細胞培養から回収される異種二量体の割合を最大にすることができる
。好適な界面は抗体定常ドメインのＣＨ３領域の少なくとも一部を含む。この方
法では、第１抗体分子の界面からの一又は複数の小さいアミノ酸側鎖がより大き
な側鎖(例えばチロシン又はトリプトファン)と置き換えられる。大きな側鎖と同
じ又は類似のサイズの相補的「キャビティ」を、大きなアミノ酸側鎖を小さいも
の(例えばアラニン又はスレオニン)と置き換えることにより第２の抗体分子の界
面に作り出す。これにより、ホモダイマーのような不要の他の最終産物に対して
ヘテロダイマーの収量を増大させるメカニズムが提供される。 二重特異性抗体は、全長抗体又は抗体断片（例えば、Ｆ(ａｂ')_２二重特異性
抗体）として調製できる。抗体断片から二重特異性抗体を産生する技術もまた文
献に記載されている。例えば、化学結合を使用して二重特異性抗体を調製するこ
とができる。Brennan等, Science, 229:81 (1985) は無傷の抗体をタンパク分解
性に切断してＦ(ａｂ')_２断片を産生する手順を記述している。これらの断片は
、ジチオール錯体形成剤亜砒酸ナトリウムの存在下で還元して近接ジチオールを
安定化させ、分子間ジスルフィド形成を防止する。産生されたＦａｂ'断片はつ
いでチオニトロベンゾアート(ＴＮＢ)誘導体に転換される。Ｆａｂ'-ＴＮＢ誘導
体の一つをついでメルカプトエチルアミンでの還元によりＦａｂ'-チオールに再
転換し、他のＦａｂ'-ＴＮＢ誘導体の等モル量と混合して二重特異性抗体を形成
する。作られた二重特異性抗体は酵素の選択的固定化用の薬剤として使用するこ
とができる。 大腸菌からＦａｂ'フラグメントを直接回収でき、これは化学的に結合して二
重特異性抗体を形成することができる。Shalaby等, J. Exp. Med., 175:217-225
(1992)は完全にヒト化された二重特異性抗体Ｆ(ａｂ')_２分子の製造を記述して
いる。各Ｆａｂ'フラグメントは大腸菌から別個に分泌され、インビトロで定方
向化学共役を受けて二重特異性抗体を形成する。このようにして形成された二重
特異性抗体は、正常なヒトＴ細胞及びＥｒｂＢ２レセプターを過剰発現する細胞
に結合可能で、ヒト乳房腫瘍標的に対するヒト細胞障害性リンパ球の細胞溶解活
性の誘因となる。

【０４４８】 組換え細胞培養から直接的に二重特異性抗体断片を作成し分離する様々な方法
もまた記述されている。例えば、二重特異性抗体はロイシンジッパーを使用して
生産されている。Kostelnyら, J.Immunol. 148(5):1547-1553 (1992)。Ｆｏｓ及
びＪｕｎタンパク質からのロイシンジッパーペプチドを遺伝子融合により二つの
異なった抗体のＦａｂ'部分に結合させる。抗体ホモダイマーをヒンジ領域で還
元してモノマーを形成し、ついで再酸化して抗体ヘテロダイマーを形成する。こ
の方法はまた抗体ホモダイマーの生産に対して使用することができる。Hollinge
rら, Proc.Natl.Acad.Sci. USA, 90:6444-6448 (1993)により記述された「ダイ
アボディ」技術は二重特異性抗体断片を作成する別のメカニズムを提供した。断
片は、同一鎖上の２つのドメイン間の対形成を可能にするには十分に短いリンカ
ーにより軽鎖可変ドメイン(Ｖ_Ｌ)に重鎖可変ドメイン(Ｖ_Ｈ)を結合してなる。従
って、一つの断片のＶ_Ｈ及びＶ_Ｌドメインは他の断片の相補的Ｖ_Ｌ及びＶ_Ｈドメ
インと強制的に対形成させられ、２つの抗原結合部位を形成する。単鎖Ｆｖ(ｓ
Ｆｖ)ダイマーの使用により二重特異性抗体断片を製造する他の方策もまた報告
されている。Gruberら, J.Immunol. 152:5368 (1994)を参照されたい。 二価より多い抗体も考えられる。例えば、三重特異性抗体を調製することがで
きる。Tuttら J.Immunol. 147:60(1991)。 例示的な二重特異性抗体は、ここに与えられたＰＲＯポリペプチドの２つの異
なるエピトープに結合しうる。あるいは、抗-ＰＲＯポリペプチドのアームは、
特定のＰＲＯポリペプチド発現細胞に細胞防御メカニズムを集中させるように、
Ｔ細胞レセプター分子(例えばＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ２８、又はＢ７)等の白血球
上のトリガー分子又はＦｃγＲＩ(ＣＤ６４)、ＦｃγＲＩＩ(ＣＤ３２)及びＦｃ
γＲＩＩＩ(ＣＤ１６)等のＩｇＧ(Ｆｃ．Ｒ)に対するＦｃレセプターに結合する
アームと結合しうる。また、二重特異性抗体は特定のＰＲＯポリペプチドを発現
する細胞に細胞毒性薬を局在化させるためにも使用されうる。これらの抗体はＰ
ＲＯ結合アーム及び細胞毒性薬又は放射性キレート化剤、例えばＥＯＴＵＢＥ、
ＤＰＴＡ、ＤＯＴＡ、又はＴＥＴＡと結合するアームを有する。興味の対象とな
る他の二重特異性抗体はＰＲＯポリペプチドに結合し、そしてさらに組織因子（
ＴＦ）に結合する。

【０４４９】 ５．ヘテロ抱合体抗体 ヘテロ抱合抗体もまた本発明の範囲に入る。ヘテロ抱合抗体は、２つの共有結
合した抗体からなる。このような抗体は、例えば、免疫系細胞を不要な細胞に対
してターゲティングさせるため［米国特許第4,676,980号］及びＨＩＶ感染の治
療のために［WO 91/00360; WO 92/200373; EP 03089］提案されている。この抗
体は、架橋剤に関連したものを含む合成タンパク化学における既知の方法を使用
して、インビトロで調製することができると考えられる。例えば、ジスルフィド
交換反応を使用するか又はチオエーテル結合を形成することにより、免疫毒素を
作成することができる。この目的に対して好適な試薬の例には、イミノチオレー
ト及びメチル-４-メルカプトブチリミデート、及び例えば米国特許第4,6767,980
号に開示されているものが含まれる。 ６．エフェクター機能の加工 本発明の抗体をエフェクター機能について改変し、例えば癌治療における抗体
の有効性を向上させるのが望ましい。例えば、システイン残基をＦｃ領域に導入
し、それにより、この領域に鎖間ジスルフィド結合を形成させるようにしてもよ
い。そのようにして生成された同種二量体抗体は、向上した内部移行能力及び／
又は増加した補体媒介細胞殺傷及び抗体-依存性細胞性細胞毒性（ＡＤＣＣ）を
有しうる。Caron等, J. Exp. Med. 176: 1191-1195 (1992)及びShopes, B. J. I
mmunol. 148: 2918-2922 (1992)参照。向上した抗腫瘍活性を持つ同種二量体抗
体はまた、Wolff等, Cancer research 53: 2560-2565 (1993)に記載されたよう
な異種二官能性架橋を用いても調製しうる。あるいは、抗体は、２つのＦｃ領域
を有するように加工して、それにより補体溶解及びＡＤＣＣ能力を向上させるこ
ともできる。Stevenson等, Anti-Cancer Drug Design 3: 219-230 (1989)参照。 ７．免疫複合体 本発明はまた、化学治療薬、毒素（例えば、細菌、真菌、植物又は動物由来の
酵素活性毒素、又はその断片）などの細胞毒性薬、あるいは放射性同位体（即ち
、放射性抱合）に抱合された抗体を含む免疫複合体にも関する。 このような免疫複合体の生成に有用な化学治療薬は上記した。用いることので
きる酵素活性毒素及びその断片は、ジフテリアＡ鎖、ジフテリア毒素の非結合活
性断片、（緑膿菌からの）外毒素Ａ鎖、リシンＡ鎖、アブリンＡ鎖、モデクシン
(modeccin)Ａ鎖、アルファ-サルシン、アレウリテス・フォーディ(Aleurites fo
rdii)タンパク質、ジアンチン(dianthin)タンパク質、フィトラカ・アメリカー
ナ(Phytolaca americana)タンパク質（ＰＡＰＩ、ＰＡＰＩＩ、及びＰＡＰ-Ｓ）
、モモルディカ・チャランチア(momordica charantia)インヒビター、クルシン(
curcin)、クロチン(crotin)、サパオナリア・オフィシナリス(sapaonaria ofici
nalis)インヒビター、ゲロニン(gelonin)、ミトゲリン(mitogellin)、レストリ
クトシン(restrictocin)、フェノマイシン(phenomycin)、エノマイシン(enomyci
n)及びトリコテセン(tricothecene)を含む。様々な放射性ヌクレオチドが放射性
抱合抗体の生成に利用可能である。例として、^２１２Ｂｉ、^１３１Ｉ、^１３１Ｉ
ｎ、^９０Ｙ及び^１８６Ｒｅを含む。抗体及び細胞毒性薬の複合体は、種々の二官
能性タンパク質カップリング剤、例えば、Ｎ-スクシンイミジル-３-(２-ピリジ
ルジチオール)プロピオネート（ＳＰＤＰ）、イミノチオラン（ＩＴ）、イミド
エステルの二官能性誘導体（ジメチルアジピミデートＨＣＬ等）、活性エステル
（ジスクシンイミジルスベレート等）、アルデヒド（グルタルアルデヒド等）、
ビス-アジド化合物（ビス(ｐ-アジドベンゾイル)ヘキサンジアミン等）、ビス-
ジアゾニウム誘導体（ビス-(ｐ-ジアゾニウムベンゾイル)-エチレンジアミン等
）、ジイソシアネート（トリエン２，６-ジイソシアネート等）、及びビス-活性
フッ素化合物（１，５-ジフルオロ-２，４-ジニトロベンゼン等）を用いて作成
できる。例えば、リシン免疫毒素は、Vitetta等, Science 238: 1098 (1987)に
記載されたように調製することができる。カーボン-１４-標識１--イソチオシア
ナトベンジル-３-メチルジエチレントリアミン五酢酸（ＭＸ-ＤＴＰＡ）は、放
射性ヌクレオチドの抗体への抱合のためのキレート剤の例である。WO 94/11026
参照。 他の実施態様では、腫瘍の予備標的化で使用するために、抗体は「レセプター
」（ストレプトアビジン等）に抱合されてもよく、抗体-レセプター複合体は患
者に投与され、次いで清澄化剤を用いて未結合複合体を循環から除去し、次に細
胞毒性薬（例えば、放射性ヌクレオチド等）に抱合された「リガンド」（アビジ
ン等）を投与する。

【０４５０】 ８．免疫リポソーム また、ここに開示する抗体は、免疫リポソームとして調製してもよい。抗体を
含むリポソームは、Epstein等, Proc. Natl. acad. Sci. USA, 82: 3688 (1985)
; Hwang等, Proc. natl. Acad. Sci. USA, 77: 4030 (1980); 及び米国特許第4,
485,045号及び第4,544,545号に記載されたような、この分野で知られた方法で調
製される。向上した循環時間を持つリポソームは、米国特許第5,013,556号に開
示されている。 特に有用なリポソームは、ホスファチジルコリン、コレステロール及びＰＥＧ
-誘導ホスファチジルエタノールアミン（ＰＥＧ-ＰＥ）を含む脂質組成物での逆
相蒸発法によって生成される。リポソームは、所定サイズのフィルターを通して
押し出され、所望の径を有するリポソームが生成される。本発明の抗体のＦａｂ
’断片は、Martin等, J. Biol. Chem. 257: 286-288 (1982)に記載されているよ
うに、ジスルフィド交換反応を介してリポソームに抱合され得る。化学治療薬（
ドキソルビシン等）は、場合によってはリポソーム内に包含される。Gabizon等, J. National Cancer Inst. 81(19) 1484 (1989)参照。

【０４５１】 ９．抗体の製薬組成物 ここで同定されるＰＲＯポリペプチドに特異的に結合する抗体、並びに上記に
開示したスクリーニングアッセイで同定された他の分子は、種々の疾患の治療の
ために、製薬組成物の形態で投与することができる。 ＰＲＯポリペプチドが細胞内であり、全抗体が阻害剤として用いられる場合、
内在化抗体が好ましい。しかし、リポフェクション又はリポソームも抗体、又は
抗体断片を細胞に導入するのに使用できる。抗体断片が用いられる場合、標的タ
ンパク質の結合ドメインに特異的に結合する最小阻害断片が好ましい。例えば、
抗体の可変領域配列に基づいて、標的タンパク質配列に結合する能力を保持した
ペプチド分子が設計できる。このようなペプチドは、化学的に合成でき、又は組
換えＤＮＡ技術によって生成できる。例えば、Marasco等, Proc. Natl. Acad. S
ci. USA 90, 7889-7893 (1993)参照。 ここでの製剤は、治療すべき特定の徴候に必要な場合に１以上の活性化合物、
好ましくは互いに悪影響を及ぼさない相補的活性を持つものも含んでよい。ある
いは、又はそれに加えて、組成物は、細胞毒性薬、サイトカイン又は成長阻害剤
を含んでもよい。これらの分子は、適切には、意図する目的に有効な量の組み合
わせで存在する。 また、活性成分は、例えばコアセルベーション技術により又は界面重合により
調製されたマイクロカプセル、例えば、各々ヒドロキシメチルセルロース又はゼ
ラチン-マイクロカプセル及びポリ（メタクリル酸メチル）マイクロカプセル中
、コロイド状薬物送達系（例えば、リポソーム、アルブミン小球、マイクロエマ
ルション、ナノ粒子及びナノカプセル）中、又はマイクロエマルション中に包括
されていてもよい。これらの技術は、Remington's Pharmaceutical Science, 上
掲に開示されている。 インビボ投与に使用される製剤は無菌でなけらばならない。これは、滅菌濾過
膜を通した濾過により容易に達成される。 徐放性製剤を調製してもよい。徐放性製剤の好適な例は、抗体を含有する固体
疎水性ポリマーの半透性マトリクスを含み、このマトリクスは成形された物品、
例えばフィルム、又はマイクロカプセルの形状である。除放性マトリクスの例は
、ポリエステルヒドロゲル（例えば、ポリ(２-ヒドロキシエチル-メタクリレー
ト)又はポリ(ビニルアルコール））、ポリアクチド（米国特許第3,773,919号）
、Ｌ-グルタミン酸及びγ-エチル-Ｌ-グルタメート、非分解性エチレン-酢酸ビ
ニル、LUPRON DEPOT(商品名)（乳酸-グリコール酸コポリマーと酢酸リュープロ
リドの注射可能な小球）などの分解性乳酸-グリコール酸コポリマー、ポリ-(Ｄ)
-３-ヒドロキシブチル酸を含む。エチレン-酢酸ビニル及び乳酸-グリコール酸な
どのポリマーは分子を１００日に渡って放出することができるが、ある種のヒド
ロゲルはより短時間でタンパク質を放出してしまう。カプセル化された抗体が身
体内に長時間残ると、それらは３７℃の水分に露出されることにより変性又は凝
集し、その結果、生物学的活性の低下及び起こりうる免疫原性の変化をもたらす
。合理的な方法は、含まれる機構に依存する安定化について工夫することができ
る。例えば、凝集機構がチオ−ジスルフィド交換を通した分子間Ｓ−Ｓ結合形成
であると発見された場合、安定化はスルフヒドリル残基の修飾、酸性溶液からの
凍結乾燥、水分含有量の制御、適切な添加剤の付加、及び特異的ポリマーマトリ
クス組成物の開発によって達成されうる。

【０４５２】 Ｇ．抗-ＰＲＯ抗体の用途 本発明の抗-ＰＲＯ抗体は様々な有用性を有している。例えば、抗-ＰＲＯ抗体
は、ＰＲＯの診断アッセイ、例えばその特定細胞、組織、又は血清での発現の検
出に用いられる。競合的結合アッセイ、直接又は間接サンドウィッチアッセイ及
び不均一又は均一相で行われる免疫沈降アッセイ［Zola, Monoclonal Antibodie
s: A Manual of Techniques, CRC Press, Inc. (1987) pp. 147-158］等のこの
分野で知られた種々の診断アッセイ技術が使用される。診断アッセイで用いられ
る抗体は、検出可能な部位で標識される。検出可能な部位は、直接又は間接に、
検出可能なシグナルを発生しなければならない。例えば、検出可能な部位は、^３ Ｈ、^１４Ｃ、^３２Ｐ、^３５Ｓ又は^１２５Ｉ等の放射性同位体、フルオレセインイ
ソチオシアネート、ローダミン又はルシフェリン等の蛍光又は化学発光化合物、
あるいはアルカリホスファターゼ、ベータ-ガラクトシダーゼ又はセイヨウワサ
ビペルオキシダーゼ等の酵素であってよい。抗体に検出可能な部位を抱合させる
ためにこの分野で知られた任意の方法が用いられ、それにはHunter等 Nature, 1
44:945 (1962)；David等, Biochemistry, 13: 1014 (1974)；Pain等, J. Immuno
l. Meth., 40:219 (1981) ;及びNygren, J. Histochem. and Cytochem., 30:407
(1982)に記載された方法が含まれる。 また、抗-ＰＲＯ抗体は組換え細胞培養又は天然供給源からのＰＲＯのアフィ
ニティー精製にも有用である。この方法においては、ＰＲＯに対する抗体を、当
該分野でよく知られている方法を使用して、セファデックス樹脂や濾紙のような
適当な支持体に固定化する。次に、固定化された抗体を、精製するＰＲＯを含む
試料と接触させた後、固定化された抗体に結合したＰＲＯ以外の試料中の物質を
実質的に全て除去する適当な溶媒で支持体を洗浄する。最後に、ＰＲＯを抗体か
ら脱離させる他の適当な溶媒で支持体を洗浄する。 以下の実施例は例示するためにのみ提供されるものであって、本発明の範囲を
決して限定することを意図するものではない。 本明細書で引用した全ての特許及び参考文献の全体を、出典明示によりここに
取り込む。

【０４５３】 （実施例） 実施例で言及されている全ての市販試薬は、特に示さない限りは製造者の使用
説明に従い使用した。ＡＴＣＣ登録番号により以下の実施例及び明細書全体を通
して特定されている細胞の供給源はアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクシ
ョン、マナッサス、ＶＡである。 実施例１：新規なポリペプチド及びそれをコードするｃＤＮＡを同定するための
細胞外ドメイン相同性スクリーニング Swiss-Prot公的データベースからの約９５０の既知の分泌タンパク質からの細
胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列（あれば、分泌シグナル配列を含む）を、ＥＳＴデ
ータベースの検索に使用した。ＥＳＴデータベースは、公的データベース（例え
ば、Dayhoff、GenBank）及び企業のデータベース（例えば、LIFESEQ(商品名)、I
ncyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む。検索は、コンピュータプログ
ラムBLAST又はBLAST-2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (19
96)）を用いて、ＥＣＤタンパク質配列のＥＳＴ配列の６フレーム翻訳との比較
として実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場
合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, U
niversity of Washington, Seattle, WA）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列
に構築した。 この細胞外ドメイン相同性スクリーニングを用いて、phrapを用いて他の同定
されたＥＳＴ配列に対してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。さらに、得られ
たコンセンサスＤＮＡ配列を、しばしば（常にではない）BLAST又はBLAST-2及び
phrapの繰り返しサイクルを用いて伸長し、コンセンサス配列を上で議論したＥ
ＳＴ配列の供給源を用いて可能な限り伸長させた。 上記のように得られたコンセンサス配列に基づいて、次いでオリゴヌクレオチ
ドを合成し、ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定する
ため、及びＰＲＯポリペプチドの全長コード化配列のクローンを単離するプロー
ブとして用いるために使用した。正方向及び逆方向ＰＣＲプライマーは一般的に
２０から３０ヌクレオチドの範囲であり、しばしば約１００−１０００ｂｐ長の
ＰＣＲ産物を与えるために設計される。プローブ配列は、典型的に４０−５５ｂ
ｐ長である。或る場合には、コンセンサス配列が約１−１．５ｋｂｐより大きい
ときに付加的なオリゴヌクレオチドが合成される。全長クローンについて幾つか
のライブラリをスクリーニングするために、ライブラリからのＤＮＡを、Ausube
l等, Current Protocols in Molecular Biology, のように、ＰＣＲプライマー
対でのＰＣＲによりスクリーニングした。ポジティブライブラリを、次いで、プ
ローブオリゴヌクレオチド及びプライマー対の一方を用いて対象とする遺伝子を
コードするクローンの単離するのに使用した。 ｃＤＮＡクローンの単離に用いたｃＤＮＡライブラリは、Invitrogen, San Di
ego, CAからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法によって作成した。ｃＤ
ＮＡは、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴでプライムし、平滑末端でＳａｌＩヘミ
キナーゼアダプターに結合させ、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサ
イズ分類し、そして適切なクローニングベクター（ｐＲＫ５Ｂ又はｐＲＫ５Ｄ等
；ｐＲＫ５ＢはＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Holmes等,
Science, 253: 1278-1280 (1991)参照）に、独特のＸｈｏＩ及びＮｏｔＩ部位に
おいて、所定の方向でクローニングした。

【０４５４】 実施例２：アミラーゼスクリーニングによるｃＤＮＡクローンの単離 １．オリゴｄＴプライムｃＤＮＡライブラリの調製 ｍＲＮＡを対象とするヒト組織からInvitrogen, San Diego, CAからの試薬及
びプロトコールを用いて単離した（Fast Track 2）。このＲＮＡを、Life Techn
ologies, Gaithersburg, MD (Super Script Plasmid System)からの試薬及びプ
ロトコールを用いるベクターｐＲＫ５ＤにおけるオリゴｄＴプライムしたｃＤＮ
Ａの生成に使用した。この方法において、二本鎖ｃＤＮＡは１０００ｂｐを越え
るサイズ分類し、ＳａｌＩ／ＮｏｔＩ結合ｃＤＮＡをＸｈｏＩ／ＮｏｔＩ切断ベ
クターにクローニングした。ｐＲＫ５Ｄを、ｓｐ６転写開始部位、それに続くＳ
ｆｉＩ制限酵素部位、さらにＸｈｏＩ／ＮｏｔＩｃＤＮＡクローニング部位を持
つベクターにクローニングした。 ２．ランダムプライムｃＤＮＡライブラリの調製 一次ｃＤＮＡクローンの５’末端を好ましく表現するために二次ｃＤＮＡライ
ブラリを作成した。Ｓｐ６ＲＮＡを（上記の）一次ライブラリから生成し、この
ＲＮＡを、ベクターｐＳＳＴ-ＡＭＹ．０におけるLife Technologies (上で参照
したSuper Script Plasmid System)からの試薬及びプロトコールを用いたランダ
ムプライムしたｃＤＮＡライブラリの生成に使用した。この方法において、二本
鎖ｃＤＮＡを５００−１０００ｂｐにサイズ分類し、平滑末端でＮｏｔＩアダプ
ターに結合させ、ＳｆｉＩ部位で切断し、そしてＳｆｉＩ／ＮｏｔＩ切断ベクタ
ーにクローニングした。ｐＳＳＴ-ＡＭＹ．０は、ｃＤＮＡクローニング部位の
前に酵母アルコールデヒドロゲナーゼプロモータ、及びクローニング部位の後に
マウスアミラーゼ配列（分泌シグナルを持たない成熟配列）に次いで酵母アルコ
ールデヒドロゲナーゼ転写終結区を有するクローニングベクターである。即ち、
アミラーゼ配列でフレームに融合するこのベクターにクローニングされたｃＤＮ
Ａは、適当に形質移入された酵母コロニーからのアミラーゼの分泌を導くであろ
う。 ３．形質転換及び検出 上記２パラグラフに記載したライブラリからのＤＮＡを氷上で冷却し、それに
エレクトロコンピテントＤＨ１０Ｂ細菌（Life Technoligies、２０ｍｌ）を添
加した。細菌及びベクターの混合物は、次いで製造者に推奨されているように電
気穿孔した。次いで、ＳＯＣ培地（Life Technplogies、１ｍｌ）を添加し、こ
の混合物を３７℃で３０分間インキュベートした。形質転換体は、次いでアンピ
シリンを含む２０標準１５０ｍｍＬＢプレートに蒔き、１６時間インキュベート
した（３７℃）。ポジティブコロニーをプレートから廃棄し、細菌ペレットから
標準的な方法、例えばＣｓＣｌ-勾配を用いてＤＮＡを単離した。精製ＤＮＡは
、次いで以下の酵母プロトコールにのせた。 酵母方法は３つの範疇に分けられる：（１）酵母のプラスミド／ｃＤＮＡ結合
ベクターでの形質転換；（２）アミラーゼを分泌する酵母クローンの検出及び単
離；及び（３）酵母コロニーから直接的な挿入物のＰＣＲ増幅及び配列決定及び
さらなる分析のためのＤＮＡの精製。

【０４５５】 用いた酵母菌株はＨＤ５６-５Ａ（ATCC-90785）であった。この株は以下の遺
伝子型：ＭＡＴアルファ、ｕｒａ３-５２、ｌｅｕ２-３、ｌｅｕ２-１１２、ｈ
ｉｓ３-１１、ｈｉｓ３-１５、ＭＡＬ^＋、ＳＵＣ^＋、ＧＡＬ^＋を有する。好まし
くは、不完全な翻訳後経路を持つ酵母変異体を用いることができる。このような
変異体は、ｓｅｃ７１、ｓｅｃ７２、ｓｅｃ６２に転位不全対立遺伝子を持つが
、切断されたｓｅｃ７１が最も好ましい。あるいは、これらの遺伝子の正常な操
作を阻害するアンタゴニスト（アンチセンスヌクレオチド及び／又はリガンドを
含む）、この翻訳後経路に含まれる他のタンパク質（例えば、ＳＥＣ６１ｐ、Ｓ
ＥＣ７２ｐ、ＳＥＣ６２ｐ、ＳＥＣ６３ｐ、ＴＤＪ１ｐ又はＳＳＡ１ｐ-４ｐ）
又はこれらのタンパク質の複合体形成も、アミラーゼ発現酵母と組み合わせて好
ましく用いられる。 形質転換は、Gietz等, Nucl. Acid. Res., 20: 1425 (1992)に概略が記された
プロトコールに基づいて実施された。形質転換細胞は、次いで寒天からＹＥＰＤ
複合培地ブロス（１００ｍｌ）に播種し、３０℃で終夜成長させた。ＹＥＰＤブ
ロスは、Kaiser等, Methods in Yeast Genetics, Cold Spring Harbor Press, C
old Spring Harbor, NY, p. 207 (1994)に記載されているように調製した。終夜
培地は、次いで新鮮なＹＥＰＤブロス（５００ｍｌ）中におよそ２ｘ１０^６細胞
／ｍｌ（約ＯＤ_６００＝０．１）に希釈し、１ｘ１０^７細胞／ｍｌ（約ＯＤ_{６０ ０} ＝０．４−０．５）まで再成長させた。 次いで細胞を収穫し、5,000rpmで５分間のSorval GS3 ローターのＧＳ３ロー
ターボトルに移し、上清を捨て、次いで無菌水に再懸濁することにより形質転換
のために調製し、そして５０ｍｌのファルコン管内で、Beckman GS-6KR遠心機に
おいて3,500rpmで再度遠心分離した。上清を捨て、細胞をＬｉＡｃ／ＴＥ（10ml
, 10mMのトリス-HCl, 1mMのEDTA pH7.5, 100mMのＬｉ_２ＯＯＣＣＨ_３）で続けて洗 浄し、ＬｉＡｃ／ＴＥ（2.5ml）中に再懸濁させた。 形質転換は、マイクロチューブ内で、調製した細胞（100μl）を新鮮な変性一
本鎖サケ精子ＤＮＡ（Lofstrand Labs, Gaitherburg, MD）及び形質転換ＤＮＡ
（1μg vol.＜10μl）と混合することにより起こした。混合物はボルテックスに
より簡単に混合し、次いで40%ＰＥＧ／ＴＥ（600μl, 40%のポリエチレングリコ
ール-４０００, 10mMのトリス-HCl, 1mMのEDTA, 100mMのLi₂OOCCH₃, pH 7.5）を添 加した。この混合物を緩く撹拌し、３０℃で撹拌しながら３０分間インキュベー
トした。次いで細胞に４２℃で１５分間熱衝撃を与え、反応容器をミクロチュー
ブ内で12,000rpmで5-10秒間遠心分離し、デカント及びＴＥ（500μl, 10mMのトリス -HCl, 1mMのEDTA pH 7.5）への再懸濁に次いで遠心分離した。次いで、細胞をＴ Ｅ（1ml）中に希釈し、アリコート（200μl）を150mm成長プレート（ＶＷＲ）に
予め調製した選択培地に拡げた。 あるいは、複数の少量反応ではなく、形質転換を１回の大規模反応で実施した
が、試薬の量はしかるべくスケールアップした。 用いた選択培地は、Kaiser等, Methods in Yeast Genetics, Cold Spring Har
bor press, Cold Spring Harbor, NY, p. 208-210 (1994)に記載されているよう
に調製したウラシルを欠く合成完全デキストロース寒天（ＳＣＤ-Ｕｒａ）であ
った。形質転換体は３０℃で２−３日成長させた。 アミラーゼを分泌するコロニーの検出は、選択成長培地における赤色デンプン
の包含により実施した。Biely等, Anal. Biochem., 172: 176-179 (1988)に記載
された方法に従って、デンプンを赤色染料（反応性 Red-120, Sigma）に結合さ
せた。結合したデンプンをＳＣＤ-Ｕｒａ寒天プレートに最終濃度0.15%（w/v）
で導入し、リン酸カリウムでｐＨ７．０に緩衝した（最終濃度50-100mM）。 ポジティブコロニーを拾って新鮮な選択培地（150mmプレート）に画線し、良
好に単離され同定可能な単一コロニーを得た。アミラーゼ分泌についてポジティ
ブな良好に単離されたコロニーは、緩衝ＳＣＤ-Ｕｒａ寒天への赤色団分の直接
導入により検出した。ポジティブコロニーは、デンプンを分解して、ポジティブ
コロニーの周囲に直接目視できる暈を形成する能力により決定した。

【０４５６】 ４．ＰＣＲ増幅によるＤＮＡの単離 ポジティブコロニーが単離された場合、その一部を楊枝で拾い、９６ウェルプ
レートにおいて無菌水（30μl）に希釈した。この時点で、ポジティブコロニー
は凍結して次の分析のために保存するか、即座に増幅するかのいずれかである。
細胞のアリコート（5μl）を、0.5μlのKlentaq（Clontech, Palo Alto, CA）;
4.0μlの10mM dNTP（Perkin Elmer-Cetus）; 2.5μlのKentaqバッファー(Clonte
ch); 0.25μlの正方向オリゴ１；0.25μlの逆方向オリゴ２；12.5μlの蒸留水を
含有する25μl容量におけるＰＣＲ反応のテンプレートとして使用した。正方向
オリゴヌクレオチド１の配列は： 5'- TGTAAAACGACGGCCAGTTAAATAGACCTGCAATTATTAATCT -3' （配列番号：1）であった。 逆方向オリゴヌクレオチド２の配列は： 5'- CAGGAAACAGCTATGACCACCTGCACACCTGCAAATCCATT-3' （配列番号：2）であった。 次いで、ＰＣＲは以下の通り実施した： ａ． 変性 92℃、5分間 ｂ．次の３サイクル： 変性 92℃、30秒間 アニール 59℃、30秒間 伸長 72℃、60秒間 ｃ．次の３サイクル： 変性 92℃、30秒間 アニール 57℃、30秒間 伸長 72℃、60秒間 ｄ．次の２５サイクル：変性 92℃、30秒間 アニール 55℃、30秒間 伸長 72℃、60秒間 ｅ． 保持 4℃ 下線を施した領域は、各々ＡＤＨプロモーター領域及びアミラーゼ領域にアニ
ーリングされ、挿入物が存在しない場合はベクターｐＳＳＴ-ＡＭＹ．０からの
３０７ｂｐ領域を増幅する。典型的には、これらのオリゴヌクレオチドの５’末
端の最初の１８ヌクレオチドは、配列プライマーのアニーリング部位を含んでい
た。即ち、空のベクターからのＰＣＲ反応の全生成物は３４３ｂｐであった。し
かしながら、シグナル配列融合ｃＤＮＡは、かなり長いヌクレオチド配列をもた
らした。 ＰＣＲに続いて、反応のアリコート（5μl）を、上掲のSambrook等に記載され
たように1%アガロースゲル中でトリス-ボレート-ＥＤＴＡ（ＴＢＥ）緩衝系を用
いたアガロースゲル電気泳動により試験した。４００ｂｐより大きな単一で強い
ＰＣＲ産物をもたらすクローンを、96 Qiaquick PCR 清浄化カラム（Qiagen Inc
., Chatsworth, CA）での精製の後にＤＮＡ配列によりさらに分析した。

【０４５７】 実施例３：シグナルアルゴリズム分析を用いたｃＤＮＡクローンの単離 種々のポリペプチド-コード化核酸配列は、ジェネンテク，インク（South San
Francisco, CA）によって開発された独自の配列発見アルゴリズムを、公的（例
えば、GenBank）及び／又は私的（LIFESEQ(登録商標), Incyte Pharmaceuticals
, Inc., Palo Alto, CA）データベースからのＥＳＴｓ並びに集団化及び組み立
てられたＥＳＴ断片に適用することにより同定した。シグナル配列アルゴリズム
は、考慮している配列又は配列断片の５'-末端の第１の、場合によっては第２の
メチオニンコドン（ＡＴＧ）を取り囲むＤＮＡヌクレオチドの文字に基づく分泌
シグナルスコアを計算する。第１のＡＴＧに続くヌクレオチドは、停止コドンを
持たない少なくとも３５の不明瞭でないアミノ酸をコードしなければならない。
第１のＡＴＧが必要なアミノ酸を有する場合、第２のものは試験しない。何れも
要件を満たさない場合、候補配列にスコアをつけなかった。ＥＳＴ配列が真正の
シグナル配列を含むか否かを決定するために、ＡＴＧコドンを取り囲むＤＮＡ及
び対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られた７つのセン
サー（評価パラメータ）の組を用いてスコアをつけた。このアルゴリズムの使用
により、多くのポリペプチド-コード化核酸配列の同定がなされた。 実施例４：ヒトＰＲＯ１５６０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ１７４０
９と命名する。ＤＮＡ１７４０９コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲによ
り対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１
５６０の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために
、オリゴヌクレオチドを合成した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＤＮＡ１９９０２−
１６６９の全長ＤＮＡ配列（Ｆｉｇ１、配列番号：３）及びＰＲＯ１５６０の誘
導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ１９９０２−１６６９の全コード配列をＦｉｇ１（配列番号：３）に示
す。クローンＤＮＡ１９９０２−１６６９は、単一のオープンリーディングフレ
ームを含み、ヌクレオチド位置４１−４３に見かけの翻訳開始部位を持ち、そし
てヌクレオチド位置７７６−７７８の見かけの停止コドンで終端する。予測され
るポリペプチド前駆体は２４５アミノ酸長である。シグナルペプチド、膜貫通ド
メイン、Ｎ-グリコシル化部位、Ｎ-ミリストイル化部位、チロシンキナーゼリン
酸化部位、及び膜リポタンパク脂質付着部位がまたＦｉｇ２に示される。クロー
ンＤＮＡ１９９０２−１６６９はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３
４５４が付与された。Ｆｉｇ２に示した全長ＰＲＯ１５６０タンパク質は約２７
，５６３ダルトンの推定分子量及び約８．３６のｐＩを有する。 Ｆｉｇ２（配列番号：４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アライ
ンメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45
SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５６０アミノ酸配列と以下のDayhoff配
列：AF053453_1, AF053454_1, A15_HUMAN, AF054840_1, CD63_HUMAN, AF065389_
1, AF054838_1, AF089749_1, P_R27525及びP_R86834との間の配列同一性が明ら
かになった。

【０４５８】 実施例５：ヒトＰＲＯ４４４をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例２に記載したように、アミラーゼスクリーニングにおいて単離さ
れたｃＤＮＡ配列をＤＮＡ１３１２１と命名した。この配列に基づいてプローブ
を作成し、上記実施例２のパラグラフ１に記載したようにして調製したヒト胎児
肺ライブラリ（ＬＩＢ２５）のスクリーニングに使用した。クローニングベクタ
ーはｐＲＫ５Ｂであり（ｐＲＫ５ＢはＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆
体である；Holmes等, Science, 253: 1278-1280 (1991)を参照）、切断されたｃ
ＤＮＡサイズは２８００ｂｐ未満であった。 全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み
、ヌクレオチド位置６０８−６１０に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置９５９−９６１の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ３；配列番号：５
）。予測されるポリペプチド前駆体は１１７アミノ酸長であり、約１２，６９２
の計算された分子量及び約７．５０の見積もられたｐＩを有する。Ｆｉｇ４（配
列番号：６）に示した全長ＰＲＯ４４４配列の分析は、アミノ酸１から約アミノ
酸１６にシグナルペプチドの存在を証明した。Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バ
ージョン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ４４４アミノ酸配列と以下
のDayhoff配列：CEF44D12_8, P_R88452, YNE1_CAEEL, A47312, AF009957_1,及び A_06133_1との間の相同性が証明された。クローンＤＮＡ２６８４６−１３９７
は１９９８年１０月２７日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０
６が付された。

【０４５９】 実施例６：ヒトＰＲＯ１０１８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 天然ヒトＰＲＯ１０１８ポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ
５６１０７−１４１５）を、一次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優勢に示すヒト
卵巣腫瘍ｃＤＮＡライブラリにおいて、酵母スクリーニングを使用して同定した
。用いた酵母スクリーニングは、ここでＤＮＡ４１０００と命名される単一のＥ
ＳＴクローンを同定した。次いでＤＮＡ４１０００配列を、公的ＥＳＴデータベ
ース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴデータベース（LIFESEQ(商品名)、In
cyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々のＥＳＴデータベースと比
較して、相同性ＥＳＴ配列を同定した。比較は、コンピュータプログラムBLAST
又はBLAST2［Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)］を用
いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合
もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, Uni
versity of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮ
Ａ配列を構築した。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ４４４４９と命名す
る。ＤＮＡ４４４４９配列に基づくオリゴヌクレオチドプライマーをついで合成
し、ヒト卵巣腫瘍ｃＤＮＡライブラリをスクリーニングしてＦｉｇ５に示したＤ
ＮＡ５６１０７−１４１５クローンを同定した。 Ｆｉｇ５に示した全長ＤＮＡ５６１０７−１４１５クローンは単一のオープン
リーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置１２９−１３１に見かけの翻訳
開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置６９６−６９８の停止コドンで終端す
る（Ｆｉｇ５）。予測されるポリペプチド前駆体は１８９アミノ酸長である（Ｆ
ｉｇ６）。Ｆｉｇ６（配列番号：８）に示した全長ＰＲＯ１０１８配列の分析は
、以下のものの存在を証明した：約アミノ酸１からアミノ酸２４のシグナルペプ
チド、約アミノ酸８６からアミノ酸１０３及び約アミノ酸６０から約アミノ酸７
５の膜貫通ドメイン、及び約アミノ酸４４から約アミノ酸８４のＧ-プロテイン
結合レセプタータンパク質と相同性を持つアミノ酸配列ブロック。クローンＤＮ
Ａ５６１０７−１４１５は１９９８年１０月２７日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴ
ＣＣ寄託番号２０３４０５が付与されている。 Ｆｉｇ６（配列番号：８）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列アライ
ンメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 SwissPro
t 35）の分析により、ＰＲＯ１０１８アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：CEB03
99_4, S59764, YHDT_HAEIN及びAE000675_3との間の有意な相同性が証明された。 実施例７：ヒトＰＲＯ１７７３をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ４９７９
７と命名する。ＤＮＡ４９７９７コンセンサス配列とIncyteのＥＳＴクローン５
０９４３４内に含まれるＥＳＴ配列との間の観察された相同性に基づいて、Incy
teのＥＳＴクローン５０９４３４を購入しその挿入断片を得て配列決定した。そ
の配列はここではＦｉｇ７に示しＤＮＡ５６４０６−１７０４と命名する。 ＤＮＡ５６４０６−１７０４の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ７（配列番号：９
）に示す。クローンＤＮＡ５６４０６−１７０４は、単一のオープンリーディン
グフレームを含み、ヌクレオチド位置１１１−１１３に見かけの翻訳開始部位を
持ち、そしてヌクレオチド位置１０６８−１０７０の見かけの停止コドンで終端
する（Ｆｉｇ７）。予測されるポリペプチド前駆体は３１９アミノ酸長である（
Ｆｉｇ８）。Ｆｉｇ８に示した全長ＰＲＯ１７７３タンパク質は約３５，２２７
ダルトンの推定分子量及び約８．９７のｐＩを有する。Ｆｉｇ８（配列番号：１
０）に示された全長ＰＲＯ１７７３の分析により次のものの存在が証明される：
約アミノ酸１から約アミノ酸１７のシグナルペプチド、約アミノ酸１３６から約
アミノ酸１５２の膜貫通ドメイン、約アミノ酸１６１から約アミノ酸１６４、約
アミノ酸１８７から約アミノ酸１９０及び約アミノ酸２５３から約アミノ酸２５
６の潜在的なＮ-グリコシル化部位、約アミノ酸３９から約アミノ酸４２のグリ
コサミノグリカン付着部位及び約アミノ酸３６から約アミノ酸４１、約アミノ酸
４２から約アミノ酸４７、約アミノ酸１０８から約アミノ酸１１３、約アミノ酸
１６６から約アミノ酸１７１、約アミノ酸１９８から約アミノ酸２０３及び約ア
ミノ酸２０７から約アミノ酸２１２の潜在的なＮ-ミリストイル化部位である。
クローンＤＮＡ５６４０６−１７０４は１９９８年１１月１７日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７８が付与された。 Ｆｉｇ８（配列番号：１０）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラ
インメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.4
5 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１７７３のアミノ酸配列と以下のDayhof
f配列：ROH2_RAT, ROH3_RAT, AF030513_1, ROH1_RAT, AF056194_1, AF057034_1,
P_W18337, P_W18328, BDH_HUMAN及びBDH_RATとの間の有意な相同性が証明され
た。

【０４６０】 実施例８：ヒトＰＲＯ１４７７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴ配列に対してコン
センサスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５２
６４１と命名する。ＤＮＡ５２６４１コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲ
により対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲ
Ｏ２４０の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するため
に、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー 5'-CGCCAGAAGGGCGTGATTGACGTC-3'（配列番号：13） 逆方向ＰＣＲプライマー 5'-CCATCCTTCTTCCCAGACAGGCCG-3'（配列番号：14） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つＤＮＡ５２６４１配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ 5'-GAAGCCTGTGTCCAGGTCCTTCAGTGAGTGGTTTGGCCTCGGTC-3'（配列番号：15） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ２４０遺伝子をコードするクローンを単離す
るのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト胎児肝臓組
織から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１４７７の全
長ＤＮＡ配列（ここではＤＮＡ５６５２９−１６４７と命名[Ｆｉｇ９、配列番
号：１１]）；及びＰＲＯ１４７７の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ５６５２９−１６４７の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ９（配列番号：１
１）に示す。クローンＤＮＡ５６５２９−１６４７は、単一のオープンリーディ
ングフレームを含み、ヌクレオチド位置２３−２５に見かけの翻訳開始部位を持
ち、そしてヌクレオチド位置２１２０−２１２２の見かけの停止コドンで終端す
る（Ｆｉｇ９）。予測されるポリペプチド前駆体は６９９アミノ酸長である（Ｆ
ｉｇ１０）。Ｆｉｇ１０に示した全長ＰＲＯ２４０タンパク質は約７９，５５３
ダルトンの推定分子量及び約７．８３のｐＩを有する。Ｆｉｇ１０（配列番号：
１２）に示された全長ＰＲＯ１４７７の分析により次のものの存在が証明される
：約アミノ酸２１から約アミノ酸４０及び約アミノ酸８４から約アミノ酸１０５
の膜貫通ドメインである。クローンＤＮＡ５６５２９−１６４７は１９９８年９
月２９日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２９３が付与された。 Ｆｉｇ１０（配列番号：１２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35
.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４７７のアミノ酸配列と以下のDayh
off配列：CELT03G11_1, CEZC410_4, A54408, SSMAN9MAN_1, GEN12643, GEN12642
, AF027156_1, P_W46900, SPAC23A1_4及びDMC86E4_5との間の有意な相同性が証
明された。

【０４６１】 実施例９：ヒトＰＲＯ１４７８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここで「ＤＮＡ５２７
１９」と命名する。ＤＮＡ５２７１９コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲ
により対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲ
Ｏ１４７８の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するた
めに、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー 5' GCGAACGCTTCGAGGAGTCCTGG3'（配列番号：18） 逆方向ＰＣＲプライマー 5' GCAGTGCGGGAAGCCACATGGTAC3'（配列番号：19） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つＤＮＡ５２７１９配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ 5' CTTCCTGAGCAGGAAGAAGATCCGGCACCACATCTACGTGCTCAAC3'（配列番号：20） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１４７８遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト胎児肝臓
組織から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１４７８の全
長ＤＮＡ配列及びＰＲＯ１４７８の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１４７８の全コード配列をＦｉｇ１１（配列番号：１６）に示す。クロ
ーンＤＮＡ５６５３１−１６４８は、単一のオープンリーディングフレームを含
み配列番号：１６のヌクレオチド位置７７−７９に見かけの翻訳開始部位を持ち
、そしてヌクレオチド位置１０５８−１０６０の見かけの停止コドンで終端する
。予測されるポリペプチド前駆体は３２７アミノ酸長である。ＩＩ型膜貫通配列
は配列番号：１７の約アミノ酸２９−４９にあると考えられ、Ｎ-グリコシル化
部位は配列番号：１７の約アミノ酸１５４−１５７にあると考えられる。クロー
ンＤＮＡ５６５３１−１６４８はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３
２８６が付与された。Ｆｉｇ１２に示した全長ＰＲＯ１４７８タンパク質は約３
７，４０６ダルトンの推定分子量及び約９．３のｐＩを有する。 Ｆｉｇ１２（配列番号：１７）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35
.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４７８のアミノ酸配列と以下のDayh
off配列：YNJ4_CAEEL, P_R55706, A38781_1, NALS_MOUSE, HUMHGT_1, AF048687_
1, CEWO2B12_11, YO9F_MYCTU, FOJO_DROME,及びGO1936との間の配列同一性が明
らかにされた。

【０４６２】 実施例１０：ヒトＰＲＯ８３１をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載した企業のシグナル配列発見アルゴリズムを適用してＤ
ＮＡ５６８６２−１３４３を同定した。上述のシグナル配列アルゴリズムの使用
により、IncyteデータベースからのＩｎｃｙｔｅＥＳＴクラスター番号２５５０
７と命名されるＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴ
クラスター配列を、公的データベース（例えば、GenBank）及び独自に開発した
ＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo
Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在
する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST
2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施し
た。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又
はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of
Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得ら
れたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５５７１４と命名する。 ＤＮＡ５５７１４配列とＭｅｒｃｋのＥＳＴクローン番号ＡＡ０９９４４５に
含まれるＥＳＴ配列との間の観察された配列相同性に鑑みて、ＭｅｒｃｋＥＳＴ
クローン番号ＡＡ０９９４４５を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。
このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ１３に示し、ここでＤＮＡ５６８６２−１３
４３と命名する。 クローンＤＮＡ５６８６２−１３４３は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置４０−４２に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置２５９−２６１の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１３）。予測さ
れるポリペプチド前駆体は７３アミノ酸長である（Ｆｉｇ１４）。Ｆｉｇ１４に
示す全長ＰＲＯ８３１タンパク質は、約７，８７９の推定分子量及び約７．２１
のｐＩを有する。Ｆｉｇ１４（配列番号：２２）に示した全長ＰＲＯ８３１配列
の分析は、以下のものの存在を明らかにした：約アミノ酸１から約アミノ酸１５
のシグナルペプチド及び約アミノ酸３から約アミノ酸１８の成長因子及びサイト
カインレセプターファミリータンパク質と相同性を有するアミノ酸配列ブロック
である。クローンＤＮＡ５６８６２−１３４３は１９９８年９月１日にＡＴＣＣ
に寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７４が付与されている。 Ｆｉｇ１４（配列番号：２２）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列ア
ラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Swis
sProt 35）の分析により、ＰＲＯ８３１アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：P_W
30724, HUMPPA_1, AF022238_1, 4HHB_C, P_R39727, P_R39728, TRYT_MERUN, GRP
5_HUMAN, AB010266_3及びHSBCL3S2_1との間の有意な相同性が証明された。

【０４６３】 実施例１１：ヒトＰＲＯ１１１３をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここで「ＤＮＡ３４０
２５」と命名する。ＤＮＡ３４０２５コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲ
により対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲ
Ｏ１１１３の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するた
めに、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー 5' GAGGACTCACCAATCTGGTTCGGC3'（配列番号：25）；
及び 逆方向ＰＣＲプライマー 5' AACTGGAAAGGAAGGCTGTCTCCC3'（配列番号：26） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレ
オチド配列を持つコンセンサスＤＮＡ３４０２５配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ 5' GTAAAGGAGAAGAACATCACGGTACGGGATACCAGGTGTGTTTATCCTAA3'（配列番号：27） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１１１３遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト胎児腎臓
から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１１１３の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ５７２５４−１４７７とここで命名[Ｆｉｇ１５、配列番
号：２３]）；及びＰＲＯ１１１３の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１１１３の全コード配列をＦｉｇ１５（配列番号：２３）に示す。クロ
ーンＤＮＡ５７２５４−１４７７は、単一のオープンリーディングフレームを含
み配列番号：２３のヌクレオチド位置２１４−２１６に見かけの翻訳開始部位を
持ち、そしてヌクレオチド位置２０６２−２０６４の見かけの停止コドンで終端
する。予測されるポリペプチド前駆体は６１６アミノ酸長である。膜貫通ドメイ
ン（ＩＩ型）は配列番号：２４の約アミノ酸１３−４０にあると考えられる。Ｎ
-グリコシル化部位及びＮ-ミリストイル化部位はＦｉｇ１６に示される。クロー
ンＤＮＡ５７２５４−１４７７はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３
２８９が付与された。Ｆｉｇ１６に示した全長ＰＲＯ１１１３タンパク質は約６
８，２４３ダルトンの推定分子量及び約８．６６のｐＩを有する。 Ｆｉｇ１６（配列番号：２４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35
.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１１１３のアミノ酸配列と以下のDayh
off配列（データはここに取り込む）：D86983_1, A58532, SLIT_DROME, AB00786
5_1, AC004142_1, CELT21D12_8, AB003184_1, DMU42767_1, MUSLRRP_1及びGPCR_
LYMSTとの間の配列同一性が明らかにされた。

【０４６４】 実施例１２：ヒトＰＲＯ１１９４をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデ
ータベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳ
Ｔクラスター配列を、公的データベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴ
ＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto,
CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相
同性を同定した。ＥＳＴの一又は複数はヒト松果体ライブラリから取り出された
。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Metho
ds in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質
をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較
物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle
, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得ら
れたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６５１１と命名する。 ＤＮＡ５６５１１配列とＭｅｒｃｋのＥＳＴＡＡ０６９５６８に含まれるＥＳ
Ｔ配列との間の配列相同性に鑑みて、このＥＳＴを含むクローン３８２７３６を
購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉ
ｇ１７に示し、ここでＤＮＡ５７８４１−１５２２と命名する。 Ｆｉｇ１７に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含
み、ヌクレオチド位置９−１１に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオ
チド位置２５２−２５４の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１７；配列番号：２８
）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ１８、配列番号：２９）は８１アミ
ノ酸長である。シグナルペプチドは配列番号：２９の約アミノ酸１−２１にある
。ＰＲＯ１１９４は約９，２２３の推定分子量及び約１０．４７の推定ｐＩを有
する。クローンＤＮＡ５７８４１−１５２２は１９９８年１１月３日にＡＴＣＣ
に寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５８が付与されている。 Ｆｉｇ１８（配列番号：２９）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列ア
ラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Swis
sProt 35）の分析により、ＰＲＯ１１９４アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：P
T17_YEAST, RR2_CHLVU, CEK12F2_1, S22452, S76705, AF031898_7, A4_DROME, A
F038931_1, E49905, 及びGSPL_AERHYとの間の配列同一性が明らかにされた。

【０４６５】 実施例１３：ヒトＰＲＯ１１１０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 天然ヒトＰＲＯ１１１０ポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ
５８７２７−１４７４）を、一次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優勢に示すヒト
胎児腎臓ｃＤＮＡライブラリにおいて、酵母スクリーニングを使用して同定した
。用いた酵母スクリーニングは、ここでＤＮＡ４５５６６と命名される単一のＥ
ＳＴクローンを同定した。次いでＤＮＡ４５５６６配列を、公的ＥＳＴデータベ
ース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴデータベース（LIFESEQ(商品名)、In
cyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々のＥＳＴデータベースと比
較して、相同性ＥＳＴ配列を同定した。比較は、コンピュータプログラムBLAST
又はBLAST2［Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)］を用
いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合
もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, Uni
versity of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮ
Ａ配列を構築した。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ４６９６５と命名す
る。ＤＮＡ４６９６５配列に基づくオリゴヌクレオチドプライマーをついで合成
し、ヒトＳＫ−Ｌｕ−１腺ガンｃＤＮＡライブラリ（ＬＩＢ２４７）をスクリー
ニングするのに用いて、Ｆｉｇ１９に示したＤＮＡ５８７２７−１４７４クロー
ンを同定した。 Ｆｉｇ１９に示した全長ＤＮＡ５８７２７−１４７４クローンは単一のオープ
ンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置１３１−１３３に見かけの翻
訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１０９７−１０９９の停止コドンで
終端する（Ｆｉｇ１９）。予測されるポリペプチド前駆体は３２２アミノ酸長で
ある（Ｆｉｇ２０）。Ｆｉｇ２０に示した全長ＰＲＯ１１１０タンパク質は約３
５，２７４ダルトンの推定分子量及び約８．５７のｐＩを有する。Ｆｉｇ２０（
配列番号：３１）に示された全長ＰＲＯ１１１０の分析により次のものの存在が
証明される：約アミノ酸４１から約アミノ酸６０、約アミノ酸６６から約アミノ
酸８５、約アミノ酸１０１から約アミノ酸１２０、約アミノ酸１３７から約アミ
ノ酸１５３、約アミノ酸１７１から約アミノ酸１９２、約アミノ酸２０５から約
アミノ酸２２６、約アミノ酸２３５から約アミノ酸２５５及び約アミノ酸２９４
から約アミノ酸３１２の膜貫通ドメイン、約アミノ酸６から約アミノ酸６９のＮ
-グリコシル化部位、及び約アミノ酸１８から約アミノ酸２１のグリコサミノグ
リカン付着部位。クローンＤＮＡ５８７２７−１４７４は１９９８年９月１日に
ＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７１が付与された。 Ｆｉｇ２０（配列番号：３１）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列ア
ラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Swis
sProt 35）の分析により、ＰＲＯ１１１０アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：M
MMYELUPR_1, P_R99799, MAL_HUMAN, P_P80929, RNMALGENE_1, S68406, PLLP_RAT
, MMMALPROT_1, I38891及びS55622との間の有意な相同性が証明された。

【０４６６】 実施例１４：ヒトＰＲＯ１３７８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 ここでＤＮＡ５１９４１と呼ばれる最初のＤＮＡ配列を、一次ｃＤＮＡクロー
ンの５’末端を優勢に示すヒト骨髄ｃＤＮＡライブラリにおいて、酵母スクリー
ニングを使用して同定した。ＤＮＡ５１９４１配列に基づいて、次のオリゴヌク
レオチドを合成し、骨髄ｃＤＮＡライブラリからＰＲＯ１３７７に対する全長コ
ード配列のクローンを単離するプローブとして用いた：TGTCCTTTGTCCCAGACTTCTG
TCC（配列番号：34）；CTGGATGCTAATGTGTCCAGTAAATGATCCCCTTATCCCGTCGCGATGCT
（配列番号：35）；TTCCACTCAATGAGGTGAGCCACTC（配列番号36）；GGCGAGCCCTAAC
TATCCAGGAG（配列番号37）；GGAGATCGCTGCGCTGGCCAGGTCCTCCCTGCATGGTAT（配列
番号38）；及びCTGCTGCAAAGCGAGCCTCTTG（配列番号39）。 Ｆｉｇ２１に示した全長ＤＮＡ５８７３０−１６０７クローンは単一のオープ
ンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置１３６５−１３６７に見かけ
の翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置２３７０−２３７２の停止コド
ンで終端する（Ｆｉｇ２１；配列番号：３２）。予測されるポリペプチド前駆体
（Ｆｉｇ２２、配列番号：３３）は３３５アミノ酸長で、約アミノ酸１−１５に
シグナルペプチド配列を持つ。ＰＲＯ１３７８は約３６，１０８ダルトンの算定
分子量及び約４．５１の推定ｐＩを有する。 Ｆｉｇ２２（配列番号：３３）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列ア
ラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Swis
sProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３７８アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：I
CAL_RABIT, SP2_HUMAN, SHPSPRBB_1, SP23_HUMAN, P_W08158, 及びP_W08150との
間のいくらかの相同性が明らかにされた。 クローンＤＮＡ５８７３０−１６０７は１９９８年９月１５日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２１が付与された。 実施例１５：ヒトＰＲＯ１４８１をコードするｃＤＮＡクローンの単離 ここでＤＮＡ５３２５４と呼ばれる最初のＤＮＡ配列を、一次ｃＤＮＡクロー
ンの５’末端を優勢に示すヒト胎児腎臓ｃＤＮＡライブラリにおいて、酵母スク
リーニングを使用して同定した。ＤＮＡ５３２５４配列に基づいて、オリゴヌク
レオチドを合成し、ヒト胎児腎臓ｃＤＮＡライブラリからＰＲＯ１４８１に対す
る全長コード配列のクローンを単離するプローブ（又はプライマー）として用い
た。 Ｆｉｇ２３に示した全長ＤＮＡ５８７３２−１６５０クローンは単一のオープ
ンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置３２０−３２２に見かけの翻
訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１３２２−１３２４の停止コドンで
終端する（Ｆｉｇ２３；配列番号：４０）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆ
ｉｇ２４、配列番号：４１）は３３４アミノ酸長である。シグナル配列は配列番
号：４１の約アミノ酸１−２３にあり、膜貫通ドメインは約アミノ酸２３５−２
６２にある。Ｎ-グリコシル化部位はＦｉｇ２４に示される。ＰＲＯ１４８１は
約３６，２９４ダルトンの算定分子量及び約４．９８の推定ｐＩを有する。クロ
ーンＤＮＡ５８７３２−１６５０はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０
３２９０が付与された。 Ｆｉｇ２４（配列番号：４１）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列ア
ラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Swis
sProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４８１アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：Y
N23_YEAST, S67770, H36857, YLU2_PICAN, GEN12881, CVY15035_28, YM96_YEAST
, ESC1_SCHP0, CELZK783_1及びS59310との間の配列同一性が明らかにされた。

【０４６７】 実施例１６：ヒトＰＲＯ１１８９をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例２に記載したアミラーゼスクリーニングで単離したｃＤＮＡ配列
を、ここでＤＮＡ４１７８４と命名する。次いでＤＮＡ４１７８４配列を、公的
ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース
（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発
現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。相
同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods i
n Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。公知のタンパク質をコ
ードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は
、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Wa
shington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られた
コンセンサス配列を、ここでＤＮＡ４５４９９と命名する。 ＤＮＡ４５４９９配列に基づいてオリゴヌクレオチドプローブを作成し、上記
実施例２のパラグラフ１に記載したように調製したヒト骨髄ライブラリのスクリ
ーニングに使用した。クローニングベクターはｐＲＫ５Ｂであり（ｐＲＫ５Ｂは
ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Holmes等, Science, 253:
1278-1280 (1991)）、切断されたｃＤＮＡサイズは２８００ｂｐ未満であった。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（45499.f1）：5'-GAAAGACACGACACAGCAGCTTGC-3'（配列
番号：44） 正方向ＰＣＲプライマー（45499.f2）：5'-GGGAACTGCTATCTGATGCC-3'（配列番号
：45） 正方向ＰＣＲプライマー（45499.f3）：5'-CAGGATCTCCTCTTGCAGTCTGCAGC-3'（配
列番号：46） 逆方向ＰＣＲプライマー（45499.r1）：5'-CTTCTCGAACCACATAAGTTTGAGGCAG-3'（
配列番号：47） 逆方向ＰＣＲプライマー（45499.r2）：5'-CACGATTCCCTCCACAGCAACTGGG-3'（配
列番号：48） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレ
オチド配列を持つＤＮＡ４５４９９配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ（45499.p1）： 5'-CGCCTTACCGCGCAGCCCGAAGATTCACTATGGTGAAAATCGCCTTCAAT-3'（配列番号：49） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１１８９遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。 全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み
、ヌクレオチド位置７９−８１に見かけの翻訳開始部位を持ち、ヌクレオチド位
置８６８−８７０に停止コドンを有する（Ｆｉｇ２５；配列番号：４２）。予測
されるポリペプチド前駆体は２６３アミノ酸長であり、約２９，７４１ダルトン
の計算された分子量及び約５．７４の推定ｐＩを有する。更なる特徴には約アミ
ノ酸５３−７５のＩＩ型膜貫通ドメイン及び約アミノ酸１６６−１６９の潜在的
Ｎ-グリコシル化部位が含まれる。 Ｆｉｇ２６（配列番号：４３）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列ア
ラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Swis
sProt 35）の分析により、ＰＲＯ１１８９アミノ酸配列とDayhoff配列MUSE25A_1
とHS696H22_1との間の有意な相同性が証明された。また、ある程度の相同性がＰ
ＲＯ１１８９アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：AF017985_1, CBRG01D9_2, I79
662, 及びCHPDRBAG_1との間に明らかにされた。 クローンＤＮＡ５８８２８−１５１９はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番
号２０３１７２が付与された。

【０４６８】 実施例１７：ヒトＰＲＯ１４１５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Ｉｎｃｙ
ｔｅのＥＳＴクラスター配列番号１５０９１８と命名された、Ｉｎｃｙｔｅデー
タベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴ
クラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥ
ＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Al
to, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在す
る相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2
（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施し
た。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又
はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of
Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構
築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５５７２０と命名
する。 ＤＮＡ５５７２０配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン番号４０８１４７６に
含まれるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、ＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクロー
ン番号４０８１４７６を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤ
ＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ２７に示し、ここでＤＮＡ５８８５２−１６３７と命
名する。 クローンＤＮＡ５８８５２−１６３７は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置１４８−１５０に見かけの翻訳開始部位を持ち、そし
てヌクレオチド位置９９７−９９９の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ２７）。予
測されるポリペプチド前駆体は２８３アミノ酸長である（Ｆｉｇ２８）。Ｆｉｇ
２８に示した全長ＰＲＯ１４１５タンパク質は約２９，１９１の推定分子量及び
約４．５２のｐＩを有する。Ｆｉｇ２８（配列番号：５０）に示された全長ＰＲ
Ｏ１４１５の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１から約アミ
ノ酸２５のシグナルペプチド、約アミノ酸９４から約アミノ酸１１８の膜貫通ド
メイン及び約アミノ酸１８から約アミノ酸２３、約アミノ酸４０から約アミノ酸
４５、約アミノ酸４６から約アミノ酸５１、約アミノ酸１４５から約アミノ酸１
５０、約アミノ酸１９２から約アミノ酸１９７、約アミノ酸１９３から約アミノ
酸１９８、約アミノ酸２１１から約アミノ酸２１６、約アミノ酸２３８から約ア
ミノ酸２４３及び約アミノ酸２４２から約アミノ酸２４７の潜在的なＮ-ミリス
トイル化部位。クローンＤＮＡ５８８５２−１６３７は１９９８年９月２２日に
ＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７１が付与された。 Ｆｉｇ２８（配列番号：５０）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35
.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４１５のアミノ酸配列と以下のDayh
off配列：HSU66616_1, P_W24017, A38219, CD30_HUMAN, HSU78971_1, P_W22214,
NFM_HUMAN, ADH1_ASPFL, PAU93274_5及びCENB_MOUSEとの間の有意な相同性が証
明された。

【０４６９】 実施例１８：ヒトＰＲＯ１４１１をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Ｉｎｃｙ
ｔｅデータベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこ
のＥＳＴクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び
企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals
、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較し
て、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST
又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用
いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合
もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, Uni
versity of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮ
Ａ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６０
１３と命名する。 ＤＮＡ５６０１３配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴ１４４４２２５に含まれるＥＳ
Ｔ配列との間の配列相同性に鑑みて、このＥＳＴを含むクローンを購入し、ｃＤ
ＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ２９に示し
、ここでＤＮＡ５９２１２−１６２７と命名する。 Ｆｉｇ２９に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含
み、ヌクレオチド位置１８４−１８６に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置１５０４−１５０６の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ２９；配列
番号：５１）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ３０、配列番号：５２）
は４４０アミノ酸長である。シグナルペプチドは配列番号：５２の約アミノ酸１
−２１にあり、細胞付着部位は約アミノ酸３０１−３０３にある。ＰＲＯ１４１
１は約４２，２０８ダルトンの算定分子量及び約６．３６の推定ｐＩを有する。
クローンＤＮＡ５９２１２−１６２７は１９９８年９月９日にＡＴＣＣに寄託さ
れ、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４５が付与された。 Ｆｉｇ３０（配列番号：５２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35
.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４１１のアミノ酸配列と以下のDayh
off配列：MTV023_19, P_R05307, P_W26348, P_P82962, AF000949_1, EBN1_EBV,
P_R95107, GRP2_PHAVU, P_R81318, 及びS74439_1との間の配列同一性が明らかに
された。

【０４７０】 実施例１９：ヒトＰＲＯ１２９５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Ｉｎｃｙ
ｔｅデータベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこ
のＥＳＴクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び
企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals
、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較し
て、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST
又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用
いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合
もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, Uni
versity of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮ
Ａ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６２
６２と命名する。 ＤＮＡ５６２６２配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴ３７４３３３４に含まれるＥＳ
Ｔとの間の配列相同性に鑑みて、このＥＳＴを含むクローンを購入し、ｃＤＮＡ
挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ３１に示し、こ
こでＤＮＡ５９２１８−１５５９と命名する。 Ｆｉｇ３１に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含
み、ヌクレオチド位置２０７−２０９に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置１０４７−１０４９の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ３１；配列
番号：５３）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ３２、配列番号：５４）
は２８０アミノ酸長である。シグナルペプチドは配列番号：５４の約アミノ酸１
−１８にある。標的シグナル及びＮ-グリコシル化部位がまたＦｉｇ５４に示さ
れる。ＰＲＯ１２９５は約３０，１６３ダルトンの算定分子量及び約６．８７の
推定ｐＩを有する。クローンＤＮＡ５９２１８−１５５９は１９９８年９月２９
日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８７が付与された。 Ｆｉｇ３２（配列番号：５４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35
.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２９５のアミノ酸配列と以下のDayh
off配列：AB011099_1, ILVE_MYCTU, ATTECR_2, AF010496_27, P_R15346, S37191
, PER_DROMS, L2MU_ADECC及びP_W34238との間の配列同一性が明らかにされた。

【０４７１】 実施例２０：ヒトＰＲＯ１３５９をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Ｉｎｃｙ
ｔｅデータベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこ
のＥＳＴクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び
企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals
、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較し
て、存在する相同性を同定した。ＥＳＴの一又は複数はＳ字結腸組織ライブラリ
から取り出された。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（A
ltschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。
既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそ
れ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Was
hington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築し
た。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６２６３と命名する
。 ＤＮＡ５６２６３配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴ１９３１４１８との間の配列相
同性に鑑みて、このＥＳＴを含むクローンを購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列
決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ３３に示し、ここでＤＮＡ５９２
１９−１６１３と命名する。 Ｆｉｇ３３に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含
み、ヌクレオチド位置１８４−１８６に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置１０８１−１０８３の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ３３；配列
番号：５５）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ３４、配列番号：５６）
は２９９アミノ酸長である。膜貫通ドメインは配列番号：５６の約アミノ酸９−
３１にある。Ｎ-グリコシル化部位は配列番号：５６の約アミノ酸６４−６７及
び１１５−１１８にある。ＰＲＯ１３５９は約３４，２９１ダルトンの算定分子
量及び約９．８７の推定ｐＩを有する。クローンＤＮＡ５９２１９−１６１３は
１９９８年９月１５日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２０が
付与された。 Ｆｉｇ３４（配列番号：５６）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35
.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３５９のアミノ酸配列と以下のDayh
off配列（データをここに取り込む）：GEM14384, P_R78622, A23699_1, P_R6524
4, A54898, AF059321_1, RNU55938_1, BTRNAST6_1, P_R75199及びP_R63216との
間の配列同一性が明らかにされた。

【０４７２】 実施例２１：ヒトＰＲＯ１１９０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載した方法により、ここで「ＤＮＡ５３９４３」と命名され
る単一のＭｅｒｃｋ／Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ大学ＥＳＴ配列、ＥＳＴ番号AA3398
02の同定が可能になった。ＤＮＡ５３９４３配列に基づいて、１）ＰＣＲにより
対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１１
９０の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、
オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（53943.f1）GGGAAACACAGCAGTCATTGCCTGC（配列番号：5
9） 逆方向ＰＣＲプライマー（53943.r1）GCACACGTAGCCTGTCGCTGGAGC（配列番号：60
） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ５３９４３配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：（53943.p1）CACCCCAAAGCCCAGGTCCGGTACAGCGTCAAAC
AAGAGTGG（配列番号：61） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１１９０遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト骨髄から単
離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１１９０の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ５９５８６−１５２０とここで命名[Ｆｉｇ３５、配列番
号：５７]）；及びＰＲＯ１１９０の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１１９０の全コード配列をＦｉｇ３５（配列番号：５７）に示す。クロ
ーンＤＮＡ５９５８６−１５２０は、単一のオープンリーディングフレームを含
み、ヌクレオチド位置３４０−３４２に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置３６８５−３６８７に見かけの停止コドンを持つ。予測されるポ
リペプチド前駆体は１１１５アミノ酸長である。Ｆｉｇ３６に示す全長ＰＲＯ１
１９０タンパク質は約１２１，１８８ダルトンの推定分子量及び約７．０７のｐ
Ｉを有する。ＰＲＯ１１９０タンパク質の他の特徴は：アミノ酸１６−３０及び
８５４−８７９の二つの膜貫通ドメイン；アミノ酸１０５１−１０６０のチトク
ロムＰ４５０システインヘム鉄リガンドシグネチャー；及びアミノ酸６５−６８
、７６−７９、９８−１０１、１８９−１９２、２７５−２７８、５１８−５２
１、７２６−７２９、及び７６０−７６３の潜在的なＮ-グリコシル化部位を含
む。クローンＤＮＡ５９５８６−１５２０は１９９８年９月２９日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８８が付与された。 Ｆｉｇ３６（配列番号：５８）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35
.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１１９０のアミノ酸配列と以下のDayh
off配列（データはここに取り込む）：AF004840_1, AF004841_1, AF026465_1, H
SU72391_1, P_R13144, AX01_HUMAN, GEN13349, I58164, D87212_1, A53449, 及
びD86983_1,及びKIAA0230との間の相同性が明らかにされた。

【０４７３】 実施例２２：ヒトＰＲＯ１７７２をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐ方法を
使用して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここでＤＮ
Ａ４５１２０と命名した。ＤＮＡ４５１２０コンセンサス配列に基づいて、１）
ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２
）ＰＲＯ１７７２の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用
するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（45120.f1）5'-CCTTCACCTGCAGTACACCATGGGC-3'（配列
番号：64） 逆方向ＰＣＲプライマー（45120.r1）5'-GTCACACACAGCTCTGGCAGCTGAG-3'（配列
番号：65） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４５１２０配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：（45120.p1）5'-CCAAGTTCAGACACCACATGTACACCAACGT
CAGCGGATTGACAAGC-3'（配列番号：66） ｃＤＮＡライブラリの作成に対するＲＮＡはヒト骨髄組織から単離された。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１７７２の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ５９８１７−１７０３とここで命名[Ｆｉｇ３７、配列番
号：６２]）；及びＰＲＯ１７７２の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ５９８１７−１７０３の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ３７（配列番号：
６２）に示す。クローンＤＮＡ５９８１７−１７０３は、単一のオープンリーデ
ィングフレームを含み、ヌクレオチド位置９３−９５に見かけの翻訳開始部位を
持ち、そしてヌクレオチド位置１５５４−１５５６の見かけの停止コドンで終端
する（Ｆｉｇ３７）。予測されるポリペプチド前駆体は４８７アミノ酸長である
（Ｆｉｇ３８）。Ｆｉｇ３８に示す全長ＰＲＯ１７７２タンパク質は約５３，５
６９ダルトンの推定分子量及び約７．６８のｐＩを有する。Ｆｉｇ３８（配列番
号：６３）に示す全長ＰＲＯ１７７２配列の分析により次のものの存在が証明さ
れる：約アミノ酸１から約アミノ酸３６のシグナルペプチド、約アミノ酸３１３
から約アミノ酸３３１の膜貫通ドメイン、約アミノ酸１１９から約アミノ酸１２
２、約アミノ酸１８４から約アミノ酸１８７、約アミノ酸２４３から約アミノ酸
２４６及び約アミノ酸３３３から約アミノ酸３３６の潜在的なＮ-グリコシル化
部位、約アミノ酸４１から約アミノ酸４６、約アミノ酸５９から約アミノ酸６４
、約アミノ酸７３から約アミノ酸７８、約アミノ酸１３３から約アミノ酸１３８
、約アミノ酸１８２から約アミノ酸１８７、約アミノ酸１９４から約アミノ酸１
９９、約アミノ酸３２４から約アミノ酸３２９、約アミノ酸３５４から約アミノ
酸３５９、約アミノ酸３５７から約アミノ酸３６２、約アミノ酸３９４から約ア
ミノ酸３９９、約アミノ酸４２７から約アミノ酸４３２及び約アミノ酸４７２か
ら約アミノ酸４７７の潜在的なＮ-ミリストイル化部位及び約アミノ酸１３６か
ら約アミノ酸１４６の原核膜リポタンパク質脂質付着部位。クローンＤＮＡ５９
８１７−１７０３は１９９８年１１月１７日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄
託番号２０３４７０が付与された。 Ｆｉｇ３８（配列番号：６３）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35
.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１７７２のアミノ酸配列と以下のDayh
off配列（データはここに取り込む）：P_R30823, MDP1_PIG, MDP1_HUMAN, P_R13
857, P_R53920, MDP1_MOUSE, P_R30822, JC4222, CELF52C6_2及びMYV027_13との
間の有意な相同性が証明された。

【０４７４】 実施例２３：ヒトＰＲＯ１２４８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Ｉｎｃｙ
ｔｅＥＳＴクラスター配列番号７４９４と命名されたＩｎｃｙｔｅデータベース
からのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスタ
ー配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮ
Ａデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）
を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性
を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschu
l等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知の
タンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上
を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washingto
n, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そ
こから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６０５６と命名する。 ＤＮＡ５６０５６配列とＭｅｒｃｋのＥＳＴクローン番号ＡＡ４０４４４１内
に含まれるＥＳＴとの間の配列相同性に鑑みて、ＭｅｒｃｋのＥＳＴクローン番
号ＡＡ４０４４４１を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮ
Ａ挿入物の配列をＦｉｇ３９に示し、ここでＤＮＡ６０２７８−１５３０と命名
する。 クローンＤＮＡ６０２７８−１５３０は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置１２２−１２４に見かけの翻訳開始部位を持ち、そし
てヌクレオチド位置６７１−６７３の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ４０）。予
測されるポリペプチド前駆体は１８３アミノ酸長である（Ｆｉｇ４０）。Ｆｉｇ
４０に示す全長ＰＲＯ１２４８タンパク質は約２０，５７４ダルトンの推定分子
量及び約６．６０のｐＩを有する。Ｆｉｇ４０（配列番号：６８）に示す全長Ｐ
ＲＯ１２４８配列の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１から
約アミノ酸２０のシグナルペプチド、約アミノ酸９０から約アミノ酸１１２の膜
貫通ドメイン及び約アミノ酸２１から約アミノ酸２４、約アミノ酸３８から約ア
ミノ酸４１及び約アミノ酸４７から約アミノ酸５０の潜在的なＮ-グリコシル化
部位。クローンＤＮＡ６０２７８−１５３０は１９９８年９月１日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７０が付与された。 Ｆｉｇ４０（配列番号：６８）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35
.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２４８のアミノ酸配列と以下のDayh
off配列：AF026198_5, CELR12C12_5, PN0563, S64541_1, PN0564, P_R44881及び
XLU78189_1との間の有意な相同性が証明された。

【０４７５】 実施例２４：ヒトＰＲＯ１３１６をコードするｃＤＮＡクローンの単離 分泌配列を含むことが知られている公的に利用できるシグナル配列をあれば含
む細胞外ドメイン（ＥＣＤ）を、様々な公的に利用できるＥＳＴ（発現配列タグ
）データベース（GenBank、Merck/Wash.U）の検索に使用した。検索は、コンピ
ュータプログラムBLAST又はBLAST2［Altschul等, Methods in Enzymology 266:
460-480 (1996)］を用いてＥＳＴ配列の６フレーム翻訳に対するＥＣＤタンパク
質配列の比較として実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７
０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（P
hil Green, University of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコ
ンセンサスＤＮＡ配列を構築した。 上記の検索の結果、分泌タンパク質Ｄｋｋ−１と相同性を示したＷ５５９７９
と命名されたＥＳＴが同定された。ＥＳＴＷ５５９７９に対応するクローン（ク
ローンＮｂＨＨ１９Ｗ）をMerck/Washington大学から購入し、ｃＤＮＡ挿入断片
を得てその全体を配列決定した。 購入したクローンによりコード化された全長ＰＲＯ１３１６（ＤＮＡ６０６０
８−１５７７を命名）に対応する核酸配列をＦｉｇ４１（配列番号：６９）に示
す。ＤＮＡ６０６０８−１５７７は単一のオープンリーディングフレームを含み
、ヌクレオチド位置２１１−２１３に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置９８８−９９０に停止コドンを持つ（Ｆｉｇ４２；配列番号：７０
）。予測されるポリペプチド前駆体は２５９アミノ酸長である。非常に興味のあ
る更なる領域は、シグナルペプチド（２１１−２８３）、Ｎ-グリコシル化部位
（３６４−３６６）、及びＺｎ(２)−Ｃｙｓ(６)二核クラスタードメイン（５０
５−６５５）をコードするヌクレオチド残基を含む。クローンＤＮＡ６０６０８
−１５７７はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１２６が付与されて
いる。Ｆｉｇ４２に示される全長ＰＲＯ１３１６は約２８，４４７の推定分子量
及び約９．４８のｐＩを有する。 全長配列の（ＡＬＩＧＮコンピュータプログラムを使用して）ＢＬＡＳＴ及び
ＦａｓｔＡ配列アラインメント分析に基づいて、ＰＲＯ１３１６は、ｄｉｃｋｋ
ｏｐｆファミリーのタンパク質と有意なアミノ酸配列同一性を示す。また、ＤＮ
Ａ６０６０８は、AF030433_1, LFE4_CHICK, COL_RABIT, YQI6_CAEEL, ITB6_HUMA
N, CONO_LYMST, S41033, D63483_1, D86864_1及びAB001978_1との間の相同性が
明らかになった。

【０４７６】 実施例２５：ヒトＰＲＯ１１９７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 ここでＤＮＡ５６２６７と呼ばれる最初のＤＮＡ配列を、一次ｃＤＮＡクロー
ンの５’末端を優勢に示すヒトＳＫ−Ｌｕ−１腺ガンｃＤＮＡライブラリにおい
て、酵母スクリーニングを使用して同定した。ＤＮＡ５６２６７を用いて、ヒト
乳ガンｃＤＮＡライブラリからＰＲＯ１１９７に対する全長コード配列のクロー
ンを単離するプローブとして用いるためのオリゴヌクレオチドを合成した。 配列番号：７３：5' AATTCATGGCAAATATTTCCCTTCCC3'（前方向）； 配列番号：７４：5' TGGTAAACTGGCCCAAACTCGG3'（逆方向）； 配列番号：７５：5' TTAAAGTCATCCGTCCTTGGCTCAGGATTTGGAGAGCTTGCACCACCAAA3
'（プローブ）。 Ｆｉｇ４３に示した全長ＤＮＡ６０６１１−１５２４クローンは単一のオープ
ンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置３１１−３１３に見かけの翻
訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１４００−１４０２の停止コドンで
終端する（Ｆｉｇ４３；配列番号：７１）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆ
ｉｇ４４、配列番号：７２）は３６３アミノ酸長である。シグナルペプチドは配
列番号：７２の約アミノ酸１−２４にある。ＰＲＯ１１９７は約３８，８２５ダ
ルトンの算定分子量及び約９．８８の推定ｐＩを有する。クローンＤＮＡ６０６
１１−１５２４はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７５が付与さ
れた。 Ｆｉｇ４４（配列番号：７２）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列ア
ラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Swis
sProt 35）の分析により、ＰＲＯ１１９７アミノ酸配列と以下のDayhoff配列（
ここに取り込まれるデータベースからの情報）：Y144_HUMAN, I47141 (胃粘素,
粘素はAnn.NY Acad.Sci., 140(2):804-834(1967)に記載されている), AMYH_YEAS
T, CELK06A9_3, CELZK783_1, HKR1_YEAST, AB003521_1, D87895_1, S61993及びY
M96_YEASTとの間の配列同一性が明らかにされた。

【０４７７】 実施例２６：ヒトＰＲＯ１２９３をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteＥ
ＳＴクラスター配列番号１１５２０４と命名したIncyteデータベースからのＥＳ
Ｔクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、
公的データベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（L
IFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現
配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同
体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in
Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコー
ドせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、
プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Wash
ington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコ
ンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６５２２と命名する。 ＤＮＡ５６５２２配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン番号２９６６１１９に
含まれるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、ＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクロー
ン番号２９６６１１９を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤ
ＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ４５に示し、ここでＤＮＡ６０６１８−１５５７と命
名する。 クローンＤＮＡ６０６１８−１５５７は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置３７−３９に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置１０６０−１０６２の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ４５）。予
測されるポリペプチド前駆体は３４１アミノ酸長である（Ｆｉｇ４６）。Ｆｉｇ
４６に示された全長ＰＲＯ１２９３は約３８，０７０ダルトンの算定分子量及び
約６．８８の推定ｐＩを有する。Ｆｉｇ４６（配列番号：７７）に示される全長
ＰＲＯ１２９３配列の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１か
ら約アミノ酸１９のシグナルペプチド、約アミノ酸２３７から約アミノ酸２６２
の膜貫通ドメイン、約アミノ酸２０５から約アミノ酸２０８の潜在的なグリコシ
ル化部位、約アミノ酸１５１から約アミノ酸１５２の細胞付着配列及び約アミノ
酸１１５から約アミノ酸１４０のコプロポルフィリノゲンＩＩＩ酸化酵素タンパ
ク質と相同性を有するアミノ酸配列ブロック。クローンＤＮＡ６０６１８−１５
５７は１９９８年９月２９日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２
９２が付与されている。 Ｆｉｇ４６（配列番号：７７）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列ア
ラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Swis
sProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２９３アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：H
SVCD54_1, A33_HUMAN, AF009220_1, HSU82279_1, AF004230_1, P_R13272, AF004
231_1, AF043644_1, S44125 及びHSIGGHC85_1との間の有意な相同性が証明され
た。

【０４７８】 実施例２７：ヒトＰＲＯ１３８０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例２に記載したアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたｃＤ
ＮＡ配列をここでＤＮＡ４５７７６と命名する。ＤＮＡ４５７７６配列に基づい
て、オリゴヌクレオチドプローブを産生し、上述の実施例２の第１段落に記載し
たヒト網膜ライブラリをスクリーニングするために使用した。クローニングベク
ターはｐＲＫ５Ｂであり（ｐＲＫ５ＢはＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前
駆体である；Holmes等, Science 253:1278-1280 (1991)を参照されたい）、切断
されたｃＤＮＡサイズは２８００ｂｐ未満であった。 ＰＣＲプライマー（正方向及び逆方向）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（45776.f1）5'-TTTTGCGGTCACCATTGTCTGC-3'（配列番号
：80）及び 逆方向ＰＣＲプライマー（45776.r1）5'-CGTAGGTGACACAGAAGCCCAGG-3'（配列番
号：81）。 さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオ
チド配列： ハイブリッド形成プローブ（45776.p1）： 5'-TACGGCATGACCGGCTCCTTTCCTATGAGGAACTCCCAGGCACTGATAT-3'（配列番号：82）
を持つＤＮＡ４５７７６配列から作成した。 全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために
、ライブラリからのＤＮＡを、上で同定したＰＣＲプライマー対でのＰＣＲ増幅
によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴ
ヌクレオチド及びＰＣＲプライマーの一方を用いてＰＲＯ１３８０遺伝子をコー
ドするクローンを単離するために使用した。 ヌクレオチド位置３６−３８に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位
置１４６１−１４６３に停止シグナルを有する単一の読み取り枠を含む全長クロ
ーンが同定された（Ｆｉｇ４７；配列番号：７８）。予測されたポリペプチド前
駆体は４７０アミノ酸長であり、約５１，７１５ダルトンの算定分子量と約７．
８６の推定ｐＩを有する。更なる特徴は約アミノ酸５０−７４、１０５−１２７
、１３５−１５３、１６３−１８３、２２８−２５２、３０５−３３０、及び４
４８−４７２の膜貫通ドメイン；約アミノ酸１４−１７及び８４−８７の潜在的
なN-グリコシル化部位；及び約アミノ酸６０−６８のジヒドロ葉酸還元酵素シグ
ネチャーを含む。 Ｆｉｇ４８（配列番号：７９）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用してのＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５
．４５SwissProt３５）の解析により、ＰＲＯ１３８０アミノ酸配列と次のＤａ
ｙｈｏｆｆ配列、HSU81375_1, CEZK809_6, CEK02E11_1, AF034102_1, JC4196, C
EF36H2_2, P_R92315, YAC2_YEAST, F1707_13, 及びCEF44D12_3の間の相同性が証
明された。 クローンＤＮＡ６０７４０−１６１５は１９９８年１１月３日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５６が付されている。

【０４７９】 実施例２８：ヒトＰＲＯ１２６５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ＥＳＴク
ラスター番号８６９９５と命名したＬＩＦＥＳＥＱデータベースからのＥＳＴク
ラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公的
データベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFES
EQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列
タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検
索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzy
mology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせ
ず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プロ
グラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washingt
on）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。構築に使用したＥＳＴの
一又は複数は炎症性ヒトアデノイド組織から単離されたＲＮＡから調製されたｃ
ＤＮＡライブラリから取り出された。そこから得られたコンセンサス配列を、こ
こでＤＮＡ５５７１７と命名する。 ＤＮＡ５５７１７配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴ番号２０９６５に含まれるＥＳ
Ｔ配列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン番号２０９６５を購入し、
ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ４９に
示し、ここでＤＮＡ６０７６４と命名する。 Ｆｉｇ４９に示された全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置７９−８１に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置１７８０−１７８２に見いだされる停止コドンで終端する（Ｆｉｇ
４９；配列番号：８３）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ５０、配列番
号：８４）は５６７アミノ酸長である。ＰＲＯ１２６５は約６２，８８１ダルト
ンの算定分子量及び約８．９７の推定ｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸
１−２１のシグナルペプチド；約アミノ酸５４−５７、１３４−１３７、２２０
−２２３、及び５５９−５６２の潜在的なＮ-グリコシル化部位；及び約アミノ
酸６１−８０のＤ-アミノ酸オキシダーゼタンパク質とアミノ酸配列同一性を有
する領域を含む。 Ｆｉｇ５０（配列番号：８４）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列ア
ラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Swis
sProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２６５アミノ酸配列と以下のDayhoff配列番
号MMU70429_1との間の有意な配列同一性が明らかにされた。配列相同性はまたＦ
ｉｇ５０（配列番号：８４）に示した全長配列と次の更なるDayhoff配列：BC542
A_1, E69899, S76290, MTV014_14, A0FB_HUMAN, ZMJ002204_1, S45812_1, DBRNA
PD_1, 及びCRT1_SOYBNとの間に配列相同性が見いだされた。 クローンＤＮＡ６０７６４−１５３３は１９９８年１１月１０日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５２が付与された。

【０４８０】 実施例２９：ヒトＰＲＯ１２５０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteＥ
ＳＴクラスター配列番号５６５２３と命名したIncyteデータベースからのＥＳＴ
クラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公
的データベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（Lif
eseq(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配
列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体
検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in En
zymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコード
せず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プ
ログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washin
gton）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコン
センサス配列を、ここでＤＮＡ５６１０３と命名する。 ＤＮＡ５６１０３配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン番号３３７１７８４に
含まれるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、IncyteＥＳＴクローン番号３
３７１７８４を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入
物の配列をＦｉｇ５１に示し、ここでＤＮＡ６０７７５−１５３２と命名する。 クローンＤＮＡ６０７７５−１５３２は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置７４−７６に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置２２９１−２２９３の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ５１）。予
測されるポリペプチド前駆体は７３９アミノ酸長である（Ｆｉｇ５２）。Ｆｉｇ
５２に示した全長ＰＲＯ１２５０は約８２，２６３ダルトンの推定分子量及び約
７．５５のｐＩを有する。Ｆｉｇ５２（配列番号：８６）に示された全長ＰＲＯ
１２５０の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸６１から約アミ
ノ酸８０のＩＩ型膜貫通ドメイン、約アミノ酸３１４から約アミノ酸３２５の推
定ＡＭＰ-結合ドメインシグネイチャー配列、及び約アミノ酸１０２から約アミ
ノ酸１０５、約アミノ酸５８８から約アミノ酸５９１及び約アミノ酸６１９から
約アミノ酸６２２の潜在的なＮ-グリコシル化部位。クローンＤＮＡ６０７７５
−１５３２は１９９８年９月１日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０
３１７３が付与された。 Ｆｉｇ５２（配列番号：８６）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35
.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２５０のアミノ酸配列と以下のDayh
off配列：LCFB_HUMAN, S56508_1, BNAMPBP2_1, BNACS7_1, CELT08B1_6, CELC46F
4_2, AF008206_6, CELR07C3_11, LMU70253_2及びAF008206_7との間の有意な相同
性が証明された。

【０４８１】 実施例３０：ヒトＰＲＯ１４７５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ４５６３
９と命名する。ＤＮＡ４５６３９コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲによ
り対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１
４７５の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために
、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（45639.f1） 5'-GATGGCAAAACGTGTGTTTGACACG-3'（配
列番号：89） 正方向ＰＣＲプライマー（45639.f2） 5'-CCTCAACCAGGCCACGGGCCAC-3'（配列番
号：90） 逆方向ＰＣＲプライマー（45639.r1） 5'-CCCAGGCAGAGATGCAGTACAGGC-3'（配列
番号：91） 逆方向ＰＣＲプライマー（45639.r2） 5'-CCTCCAGTAGGTGGATGGATTGGCTC-3'（配
列番号：92） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４５６３９配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ（45639.p1） 5'-CTCACCTCATGAGGATGAGGCCATGGTGCTATTCCTCAACATGGTAG-3'（配列番号：93） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１４７５遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト胎児脳組
織から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１４７５の全
長ＤＮＡ配列（ここではＤＮＡ６１１８５−１６４６と命名[Ｆｉｇ５３、配列
番号：８７]）；及びＰＲＯ１４７５の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ６１１８５−１６４６の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ５３（配列番号：
８７）に示す。クローンＤＮＡ６１１８５−１６４６は、単一のオープンリーデ
ィングフレームを含み、ヌクレオチド位置１３０−１３２に見かけの翻訳開始部
位を持ち、そしてヌクレオチド位置２１１０−２１１２の見かけの停止コドンで
終端する（Ｆｉｇ５３）。予測されるポリペプチド前駆体は６６０アミノ酸長で
ある（Ｆｉｇ５４）。Ｆｉｇ５４に示した全長ＰＲＯ１４７５タンパク質は約７
５，２２０ダルトンの推定分子量及び約６．７６のｐＩを有する。Ｆｉｇ５４（
配列番号：８８）に示された全長ＰＲＯ１４７５の分析により次のものの存在が
証明される：約アミノ酸３８から約アミノ酸５５の膜貫通ドメイン及び約アミノ
酸２２９から約アミノ酸６６０のマウスＧＮＴ１に対する相同性領域。クローン
ＤＮＡ６１１８５−１６４６は１９９８年１１月１７日にＡＴＣＣに寄託され、
ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６４が付与された。 Ｆｉｇ５４（配列番号：８８）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列ア
ラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35
.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４７５のアミノ酸配列と以下のDayh
off配列：GNT1_MOUSE, CGU65792_1, CGU65791_1, P_R24781, CELF48E3_1, G786_
HUMAN, P_W06547, GNT1_CAEEL, 219_HUMAN及びEF07_MOUSEとの間の有意な相同性
が証明された。

【０４８２】 実施例３１：ヒトＰＲＯ１３７７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 ここでＤＮＡ４６８９２と呼ばれる最初のＤＮＡ配列を、一次ｃＤＮＡクロー
ンの５’末端を優勢に示すヒト臍静脈内皮細胞ｃＤＮＡライブラリにおいて、酵
母スクリーニングを使用して同定した。ＤＮＡ４６８９２配列に基づいて、次の
オリゴヌクレオチドを合成し、ヒト胎児腎臓ｃＤＮＡライブラリからＰＲＯ１３
７７に対する全長コード配列のクローンを単離するプローブとして用いた：GTTG
TGGGTGAATAAAGGAGGGCAG（配列番号：96）；CTGTGCTCATGTTCATGGACAACTG（配列番
号：97）；及びGGATGATTTCATCTCCATTAGCCTGCTGTCTCTGGCTATGTTGGTGGGAT（配列番
号98）。 Ｆｉｇ５５に示した全長ＤＮＡ６１６０８−１６０６クローンは単一のオープ
ンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置１４９−１５１に見かけの翻
訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１０７０−１０７２の停止コドンで
終端する（Ｆｉｇ５５；配列番号：９４）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆ
ｉｇ５６、配列番号：９５）は３０７アミノ酸長である。ＰＲＯ１３７７は約３
２，２５１ダルトンの算定分子量及び約６．６２の推定ｐＩを有する。更なる特
徴は、約アミノ酸１−１８のシグナルペプチド；約アミノ酸２９−３２及び２４
１−２４４の潜在的なＮ-グリコシル化部位、及び約アミノ酸３７−５６、１０
６−１２２、２１１−２３０、２４０−２６０、及び２８８−３０４の膜貫通ド
メインを含む。 Ｆｉｇ５６（配列番号：９５）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列ア
ラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Swis
sProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３７７アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：C
ET01D3_6, CET28F3_4, CEF26D10_3, S66962, ATX2_YEAST, CEH13N06_8, S49959,
YIC3_YEAST, G02273, 及びP_W35557との間のいくらかの相同性が明らかにされ
た。 クローンＤＮＡ６１６０８−１６０６はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番
号２０３２３９が付与された。 実施例３２：ヒトＰＲＯ１３２６をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ＥＳＴク
ラスター番号５９３６６と命名され、ここで「ＤＮＡ１０２９５」とも呼ばれる
ＬＩＦＥＳＥＱデータベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった
。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公的データベース（例えば、GenBank）
及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceutic
als、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較
して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAS
T又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用
いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合
もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, Uni
versity of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮ
Ａ配列を構築した。ＥＳＴの一又は複数は有棘細胞ガンを持つ男性の陰茎から取
り除かれた腫瘍組織から単離されたＲＮＡから取り出された。そこから得られた
コンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６２５７と命名する。 ＤＮＡ５６２５７配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴ番号１４５０８７８に含まれる
ＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン番号１４５０８７８を
購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得てその全体を配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の
配列をＦｉｇ５７に示し、ここでＤＮＡ６２８０８−１５８２と命名する。 Ｆｉｇ５７に示された全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置１１２−１１４に見かけの翻訳開始部位を持ち、そして
ヌクレオチド位置１３１５−１３１７に見いだされる停止コドンで終端する（Ｆ
ｉｇ５７；配列番号：９９）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ５８、配
列番号：１００）は４０１アミノ酸長である。ＰＲＯ１３２６の他の特徴は、約
アミノ酸１−２９のシグナル配列；約アミノ酸１２９−１６６のリボソームタン
パク質Ｓ３Ａｅ相同領域；及び約アミノ酸１０９−１１２、１４４−１４７及び
３９８−４０１の潜在的なＮ-グリコシル化部位を含む。ＰＲＯ１３２６は約４
５，３３３ダルトンの算定分子量及び約４．９５の推定ｐＩを有す る。 クローンＤＮＡ６２８０８−１５８２は１９９８年１０月２０日にＡＴＣ
Ｃに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５８が付与された。 Ｆｉｇ５８（配列番号：１００）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列
アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Sw
issProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３２６アミノ酸配列と以下のDayhoff配列
：AC004013_1, HROMHCEMB_1, CEF47A4_2, A45592, MYSP_HUMAN, NFU43192_1, ON
GMBWMZ_1, CELC25A11_2, CELC25A11_1及びA42184との間のある程度の相同性が明
らかにされた。

【０４８３】 実施例３３：ヒトＰＲＯ１２４９をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteＥ
ＳＴクラスター番号１２２６０５と命名したIncyteデータベースからのＥＳＴク
ラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公的
データベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（Lifes
eq(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列
タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検
索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzy
mology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせ
ず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プロ
グラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washingt
on）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセ
ンサス配列を、ここでＤＮＡ５６０６０と命名する。 ＤＮＡ５６０６０配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン番号２６３０７７０に
含まれるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、IncyteＥＳＴクローン番号２
６３０７７０を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入
物の配列をＦｉｇ５９に示し、ここでＤＮＡ６２８０９−１５３１と命名する。 クローンＤＮＡ６２８０９−１５３１は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置３−５に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレ
オチド位置３２７０−３２７２の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ５９）。予測さ
れるポリペプチド前駆体は１０８９アミノ酸長である（Ｆｉｇ６０）。Ｆｉｇ６
０に示した全長ＰＲＯ１２４９は約１１８，６９９ダルトンの推定分子量及び約
８．４９のｐＩを有する。Ｆｉｇ６０（配列番号：１０２）に示された全長ＰＲ
Ｏ１２４９の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１から約アミ
ノ酸１６のシグナルペプチド、約アミノ酸位置３１７から約アミノ酸位置３４１
、約アミノ酸位置４５１から約アミノ酸位置４７０、約アミノ酸位置４８１から
約アミノ酸位置５００、約アミノ酸位置５１０から約アミノ酸位置５２７、約ア
ミノ酸位置５３８から約アミノ酸位置５５５、約アミノ酸位置８３１から約アミ
ノ酸位置８５０、約アミノ酸位置１０１６から約アミノ酸位置１０３４及び約ア
ミノ酸位置１０５２から約アミノ酸位置１０７０の膜貫通ドメイン、約アミノ酸
８４３から約アミノ酸８６４のロイシンジッパーパターン配列及び約アミノ酸３
７から約アミノ酸４０及び約アミノ酸２６８から約アミノ酸２７１の潜在的なＮ
-グリコシル化部位。クローンＤＮＡ６２８０９−１５３１は１９９８年９月９
日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３７が付与された。 Ｆｉｇ６０（配列番号：１０２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列
アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２４９のアミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列：AC004472_3, AB004539_7, S64782, S62432, YJG2_YEAST, CELC27A12
_8, YKQ5_YEAST, AB009505_3, SPBC24E9_8及びAF060218_4との間の有意な相同性
が証明された。

【０４８４】 実施例３４：ヒトＰＲＯ１３１５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ４５６３
９と命名する。ＤＮＡ３５９２５コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲによ
り対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１
３１５の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために
、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（35925.f1） 5'-CGCTGCTGCTGTTGCTCCTGG-3'（配列番
号：105） 正方向ＰＣＲプライマー（35925.f2） 5'-CAGTGTGCCAGGACTTTG-3'（配列番号：
106） 逆方向ＰＣＲプライマー（35925.r1） 5'-AGTCGCAGGCAGCGTTGG-3'（配列番号：
107） 逆方向ＰＣＲプライマー（35925.r2） 5'-CTCCTCCGAGTCTGTGTGCTCCTGC-3'（配
列番号：108） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ３５９２５配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ（35925.p1） 5'- GGACGGGCAGTTCCCTGTGTCTCTGGTGGTTTGCCTAAACCTGCAAACAT-3'（配列番号：109
） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３１５遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト胎児脳組
織から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３１５の全
長ＤＮＡ配列（ここではＤＮＡ６２８１５−１５７６と命名[Ｆｉｇ６１、配列
番号：１０３]）；及びＰＲＯ１３１５の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ６２８１５−１５７６の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ６１（配列番号：
１０３）に示す。クローンＤＮＡ６２８１５−１５７６は、単一のオープンリー
ディングフレームを含み、ヌクレオチド位置１２１−１２３に見かけの翻訳開始
部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１４４７−１４４９の見かけの停止コドン
で終端する（Ｆｉｇ６１）。予測されるポリペプチド前駆体は４４２アミノ酸長
である（Ｆｉｇ６２）。Ｆｉｇ６２に示した全長ＰＲＯ１３１５タンパク質は約
４９，９３２ダルトンの推定分子量及び約４．５５のｐＩを有する。Ｆｉｇ６２
（配列番号：１０４）に示された全長ＰＲＯ１３１５の分析により次のものの存
在が証明される：約アミノ酸１から約アミノ酸２８のシグナルペプチド、約アミ
ノ酸１４０から約アミノ酸１６３の膜貫通ドメイン、及び約アミノ酸７１から約
アミノ酸７４、約アミノ酸８０から約アミノ酸８３、約アミノ酸８９から約アミ
ノ酸９２、約アミノ酸２０４から約アミノ酸２０７、及び約アミノ酸４２３から
約アミノ酸４２６の潜在的なＮ-グリコシル化部位。クローンＤＮＡ６２８１５
−１５７６は１９９８年９月９日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０
３２４７が付与された。 Ｆｉｇ６２（配列番号：１０４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列
アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３１５のアミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列：MMU53696 _1, NVY08571_2, B64560, STMSLPE_1, P_R80508, P_W19258, A55817, GEN14043,
AE000768_7及びRNMUCASGP5_1pSMCとの間の有意な相同性が証明された。

【０４８５】 実施例３５：ヒトＰＲＯ１５９９をコードするｃＤＮＡクローンの単離 既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０又はそれ以上を持つIncyte
ＥＳＴ番号１４９１３６０を実施例１に記載した方法を使用して対象配列として
同定した。ＥＳＴ番号１４９１３６０のヌクレオチド配列とその相補配列をここ
で「ＤＮＡ３７１９２」と命名する。ＤＮＡ３７１９２配列に基づいて、１）Ｐ
ＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）
ＰＲＯ１５９９の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用す
るために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー：GACGTCTGCAACAGCTCCTGGAAG （37192.f1；配列番号：1
12） 逆方向ＰＣＲプライマー：CGAGAAGGAAACGAGGCCGTGAG （37192.r1；配列番号：11
3） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ３７１９２配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：TGACACTTACCATGCTCTGCACCCGCAGTGGGGACAGCCACAGA
（配列番号：114） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１５９９遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト胎児肝臓組
織から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１５９９の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ６２８４５−１６８４とここで命名[Ｆｉｇ６３、配列番
号：１１０]）；及びＰＲＯ１５９９の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１５９９の全コード配列をＦｉｇ６３（配列番号：１１０）に示す。ク
ローンＤＮＡ６２８４５−１６８４は、単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置６９−７１に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置９１８−９２０に見かけの停止コドンを持つ。予測されるポリペプ
チド前駆体は２８３アミノ酸長である。Ｆｉｇ６４に示す全長ＰＲＯ１５９９タ
ンパク質は約３０，３５０ダルトンの推定分子量及び約９．６６のｐＩを有する
。ＰＲＯ１５９９タンパク質の他の特徴は：アミノ酸１−３０のシグナルペプチ
ド、アミノ酸１２９−１３２及び１８９−１９２の潜在的なN-グリコシル化部位
；約アミノ酸２６３−２４１の潜在的なｃＡＭＰ及びｃＧＭＰ依存性プロテイン
キナーゼリン酸化部位；約アミノ酸２８−３３、５５−６０、１７４−１７９、
及び２３６−２４１の潜在的なＮ-ミリストイル化部位；約アミノ酸１４４−１
４７の潜在的なアミド化部位；及び約アミノ酸７０−７５のセリンプロテアーゼ
、トリプシンファミリー、ヒスチジン活性部位を含む。 Ｆｉｇ６４（配列番号：１１１）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列
アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５９９のアミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列：CFAD_PIGとの間の有意な相同性が明らかにされた。相同性はＰＲＯ
１５９９アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：CFAD_HUMAN; P_R05421; P_R55757;
P_R05772; GRAM_HUMAN; MUSLMET_1; P_P80335; P_R55758; A42048_1及びP_W053
83との間にも発見された。 クローンＤＮＡ６２８４５−１６８４は１９９８年１０月２０日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３６１が付与された。

【０４８６】 実施例３６：ヒトＰＲＯ１４３０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 ＤＮＡ４９４３３とここで命名されたＤＮＡ配列を上記の実施例１に記載され
ているようにして得た。アセンブリーから対象のＥＳＴであるとして同定された
MerckＥＳＴ番号Ｔ４９４６９を購入し、ｃＤＮＡ挿入断片を得て、その全体を
配列決定した。 上述のクローンのＤＮＡ配列決定により、ここで「ＤＮＡ６４８４２−１６３
２」（配列番号：１１５）と命名される、ＰＲＯ１４３０に対する全長ＤＮＡ配
列と、ＰＲＯ１４３０に対する誘導タンパク質配列（配列番号：１１６）が得ら
れた。クローンＤＮＡ６４８４２−１６３２は、単一のオープンリーディングフ
レームを含み、ヌクレオチド位置８２−８４に見かけの翻訳開始部位を持ち、そ
してヌクレオチド位置１０７５−１０７７に見かけの停止コドンを持つ。Ｆｉｇ
６６に示す全長ＰＲＯ１４３０タンパク質は約３５，９３２ダルトンの推定分子
量及び約８．４５のｐＩを有する。予想されたポリペプチド前駆体は３３１アミ
ノ酸長である。更なる他の特徴は、約アミノ酸１−１７のシグナルペプチド；約
アミノ酸１７１−１７４の潜在的なN-グリコシル化部位；約アミノ酸２９−５１
、１１６−１２６、１８０−２１７、及び２２２−２３０の短鎖アルコール脱水
素酵素ファミリータンパク質を含む。 Ｆｉｇ６６（配列番号：１１６）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列
アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４３０のアミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列番号P_W03198との間の有意な相同性が明らかにされた。相同性はＰＲ
Ｏ１４３０アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：MTV030_10, MTV037_2, A40116_1
, S42651, CEC15H11_6, SPCC736_13, SCU43704_1, S19842, OXIR_STRAT, 及びOX
IR_STRLIとの間にも発見された。 クローンＤＮＡ６４８４２−１６３２はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番
号２０３２７８が付与された。

【０４８７】 実施例３７：ヒトＰＲＯ１３７４をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐ方法を
使用して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここでＤＮ
Ａ４７３５７と命名した。ＤＮＡ４７３５７コンセンサス配列に基づいて、１）
ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２
）ＰＲＯ１３７４の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用
するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー：5' CGGGACAGGAGACCCAGAAAGGG3'（配列番号：119） 逆方向ＰＣＲプライマー：5' GGCCAAGTGATCCAAGGCATCTTC3'（配列番号：120） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４７３５７配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：5' CTGCGGGACCTGACTAGATTCTACGACAAGGTACTTTCTTTGC
ATGGGG 3'（配列番号：121） 全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために
、ライブラリからのＤＮＡを、上で同定したＰＣＲプライマー対でのＰＣＲ増幅
によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴ
ヌクレオチド及びＰＣＲプライマーの一方を用いてＰＲＯ１３７４遺伝子をコー
ドするクローンを単離するために使用した。 ｃＤＮＡライブラリの作成に対す
るＲＮＡはヒト骨髄組織から単離された。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３７４の全
長ＤＮＡ配列及びＰＲＯ１３７４の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ１３７４の全コード配列をＦｉｇ６７（配列番号：１１７）に示す。ク
ローンＤＮＡ６４８４９−１６０４は、単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置２０−２２に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置１６５３−１６５５の見かけの停止コドンを持つ（配列番号：１１
７）。予測されるポリペプチド前駆体は５４４アミノ酸長である。シグナルペプ
チド、N-グリコシル化部位、ロイシンジッパーパターン及びリボ核酸レダクター
ゼ小サブユニットシグネチャーのおよその位置がＦｉｇ６８に示される。クロー
ンＤＮＡ６４８４９−１６０４はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３
４６８が付与された。Ｆｉｇ６８に示す全長ＰＲＯ１３７４タンパク質は約６１
，１２６ダルトンの推定分子量及び約６．４のｐＩを有する。 Ｆｉｇ６８（配列番号：１１８）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列
アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３７４のアミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列（データはここに取り込む）：CEF35G2_4, P_W37046, S44204, CET28D
6_1, CET20B3_6, CELC14E2_3, CUAL_CHICK, ATM7J2_3, S74997及びHIVH5994R8_1
との間の有意な相同性が証明された。

【０４８８】 実施例３８：ヒトＰＲＯ１３１１をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例２に記載したアミラーゼスクリーニングで単離したｃＤＮＡ配列
を、ここでＤＮＡ３７７２１と命名する。次いでＤＮＡ３７７２１配列を、公的
データベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFES
EQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列
タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検
索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzy
mology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせ
ず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プロ
グラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washingt
on）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセ
ンサス配列を、ここでＤＮＡ４８６１６と命名する。 ＤＮＡ４８６１６配列に基づいてオリゴヌクレオチドプローブを作成し、上記
実施例２のパラグラフ１に記載したように調製したヒト骨髄ライブラリのスクリ
ーニングに使用した。クローニングベクターはｐＲＫ５Ｂであり（ｐＲＫ５Ｂは
ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Holmes等, Science, 253:
1278-1280 (1991)）、切断されたｃＤＮＡサイズは２８００ｂｐ未満であった。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（48616.f1）：5'-ATCATCTATTCCACCGTGTTCTGGC-3'（配
列番号：124） 逆方向ＰＣＲプライマー（48616.r1）：5'-GGGAACTGCTATCTGATGCC-3'（配列番号
：125） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレ
オチド配列を持つＤＮＡ４５４９９配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ（48616.p1）： 5'- CCTGTCTGTGGGCATCTATGCAGAGGTTGAGCGGCAGAAATATAAAACCC-3'（配列番号：126
） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３１１遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。 全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み
、ヌクレオチド位置１９５−１９７に見かけの翻訳開始部位を持ち、ヌクレオチ
ド位置１０７７−１０７９に停止コドンを有する（Ｆｉｇ６９；配列番号：１２
２）。予測されるポリペプチド前駆体は２９４アミノ酸長であり、約３３，２１
１ダルトンの計算された分子量及び約５．３５の推定ｐＩを有する。更なる特徴
には約アミノ酸１−４４のシグナル配列、約アミノ酸２２−４２、５７−８５、
９４−１１６、及び２３０−２５７の可能な膜貫通ドメイン、約アミノ酸１１８
−１２１、１８９９−１９２及び２３０−２３３の潜在的なＮ-グリコシル化部
位、約アミノ酸３−１１及び１２９−１３６の潜在的なチロシンキナーゼリン酸
化部位、約アミノ酸８０−８５、１０９−１１４、１８０−１８５、２１８−２
２３、２４８−２５３、２７６−２８１、２８５−２９０及び２８７−２９２の
Ｎ-ミリストイル化部位及び約アミノ酸３−５の細胞付着配列が含まれる。 Ｆｉｇ７０（配列番号：１２３）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列
アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Sw
issProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３１１アミノ酸配列と以下のDayhoff配列
：AF065389_1, AF053455_1, CD63_HUMAN, A15_HUMAN, AF043906_1, C151_HUMAN,
AF053453_1, AF054838_1, P_R91446, 及びCD82_HUMANとの間の有意な相同性が
証明された。 クローンＤＮＡ６４８６３−１５７３は１９９８年９月９日にＡＴＣＣに寄託
され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２５１が付与された。

【０４８９】 実施例３９：ヒトＰＲＯ１３５７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Ｉｎｃｙ
ｔｅのＥＳＴクラスター配列番号６９５３７と命名された、Ｉｎｃｙｔｅデータ
ベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴク
ラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳ
ＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto
, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する
相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（A
ltschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。
既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそ
れ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Was
hington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築し
た。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６０３４と命名する
。 ＤＮＡ５６０３４配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン番号９３６２３９に含
まれるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、ＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン
番号６３６２３９を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ
挿入物の配列をＦｉｇ７１に示し、ここでＤＮＡ６４８８１−１６０２と命名す
る。 クローンＤＮＡ６４８８１−１６０２は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置７４−７６に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置１５２６−１５２８の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ７１）。予
測されるポリペプチド前駆体は４８４アミノ酸長である（Ｆｉｇ７２）。Ｆｉｇ
７２に示した全長ＰＲＯ１３５７タンパク質は約５２，４６８の推定分子量及び
約７．１４のｐＩを有する。Ｆｉｇ７２（配列番号：１２８）に示された全長Ｐ
ＲＯ１３５７の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１から約ア
ミノ酸２１のシグナルペプチド、約アミノ酸４８から約アミノ酸５１、約アミノ
酸２６４から約アミノ酸２６７及び約アミノ酸４０１から約アミノ酸４０４の潜
在的なＮ-グリコシル化部位、約アミノ酸４１２から約アミノ酸４１５のグリコ
サミノグリカン付着部位及び約アミノ酸４０７から約アミノ酸４５７のタンパク
質のＬＢＰ／ＢＰＩ／ＣＥＴＰファミリーに対して相同性を持つアミノ酸配列ブ
ロック。クローンＤＮＡ６４８８１−１６０２は１９９８年９月９日にＡＴＣＣ
に寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４０が付与された。 Ｆｉｇ７２（配列番号：１２８）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列
アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３５７のアミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列：MMU46068_1, S17447, MMU1_1, BPI_RABIT, P_W16808, P_R21844, PS
P_MOUSE, HSLBPEX1_1及びBTU79413_1との間の有意な相同性が証明された。

【０４９０】 実施例４０：ヒトＰＲＯ１２４４をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ＥＳＴク
ラスター番号７８７４と命名したＬＩＦＥＳＥＱデータベースからのＥＳＴクラ
スター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公的デ
ータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ
(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列タ
グ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。ＥＳＴの一
又は複数は海綿体の組織から作成したライブラリから取り出した。相同体検索は
、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymolo
gy 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、
BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラ
ム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington）
で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。構築に使用したＥＳＴの一又
は複数は炎症性ヒトアデノイド組織から単離されたＲＮＡから調製されたｃＤＮ
Ａライブラリから取り出された。そこから得られたコンセンサス配列を、ここで
ＤＮＡ５６０１１と命名する。 ＤＮＡ５６０１１配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴ番号３２０２３４９に含まれる
ＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン番号３２０２３４９を
購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉ
ｇ７３（配列番号：１２９）に示し、ここでＤＮＡ６４８８３−１５２６と命名
する。 Ｆｉｇ７３に示された全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置９−１１に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレ
オチド位置１０１４−１０１６に見いだされる停止コドンで終端する（Ｆｉｇ７
３；配列番号：１２９）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ７４、配列番
号：１３０）は３３５アミノ酸長である。ＰＲＯ１２４４は約３８，０３７ダル
トンの算定分子量及び約９．８７の推定ｐＩを有する。他の特徴は、約アミノ酸
１−２９のシグナルペプチド；約アミノ酸１８３−２０５、２１７−２３７、２
７１−２８７、及び３０１−３２１の膜貫通ドメイン；約アミノ酸１−７４、及
び２１５−２１８の潜在的なＮ-グリコシル化部位；及び約アミノ酸１５０−１
５２の細胞付着配列を含む。 Ｆｉｇ７４（配列番号：１３０）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列
アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Sw
issProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２４４アミノ酸配列と以下のDayhoff配列
番号：AF008554_1, P_485334, G02297, HUMN33S11_1, HUMN33S10_1, Y013_CAEE
L, GEN13255, S49758, E70107及びERP5_MEDSAとの間の相同性が明らかにされた
。 クローンＤＮＡ６４８８３−１５２６は１９９８年９月９日にＡＴＣＣに寄託
され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２５３が付与された。

【０４９１】 実施例４１：ヒトＰＲＯ１２４６をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Ｉｎｃｙ
ｔｅのＥＳＴクラスター配列番号５６８５３と命名された、Ｉｎｃｙｔｅデータ
ベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴク
ラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳ
ＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto
, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する
相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（A
ltschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。
既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそ
れ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Was
hington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築し
た。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６０２１と命名する
。 ＤＮＡ５６０２１配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン番号２４８１３４５に
含まれるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、ＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクロー
ン番号２４８１３４５を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤ
ＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ７５に示し、ここでＤＮＡ６４８８５−１５２９と命
名する。 クローンＤＮＡ６４８８５−１５２９は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置１１９−１２１に見かけの翻訳開始部位を持ち、そし
てヌクレオチド位置１７２７−１７２９の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ７５）
。予測されるポリペプチド前駆体は５３６アミノ酸長である（Ｆｉｇ７６）。Ｆ
ｉｇ７６に示した全長ＰＲＯ１２４６タンパク質は約６１，４５０の推定分子量
及び約９.１７のｐＩを有する。Ｆｉｇ７６（配列番号：１３２）に示された全
長ＰＲＯ１２４６の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１から
約アミノ酸１５のシグナルペプチド、約アミノ酸１０８から約アミノ酸１１１、
約アミノ酸１６６から約アミノ酸１６９、約アミノ酸１９３から約アミノ酸１９
６、約アミノ酸２６２から約アミノ酸２６５、約アミノ酸３７５から約アミノ酸
３７８、約アミノ酸４１３から約アミノ酸４１６及び約アミノ酸４９８から約ア
ミノ酸５０１の潜在的なＮ-グリコシル化部位及び約アミノ酸２８６から約アミ
ノ酸３１５、約アミノ酸３５９から約アミノ酸３６９及び約アミノ酸７８から約
アミノ酸９７のスルファターゼタンパク質に対して相同性を持つアミノ酸配列ブ
ロック。クローンＤＮＡ６４８８５−１５２９は１９９８年１１月３日にＡＴＣ
Ｃに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５７が付与された。 Ｆｉｇ７６（配列番号：１３２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列
アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２４６のアミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列：P_R51355, CELK09C4_1, BCU44852_1, IDS_HUMAN, G65169, E64903,
ARSA_HUMAN, GL6S_HUMAN, HSARSF_1及びGEN12648との間の有意な相同性が証明さ
れた。

【０４９２】 実施例４２：ヒトＰＲＯ１３５６をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Ｉｎｃｙ
ｔｅのＥＳＴクラスター配列番号４４７２５と命名された、Ｉｎｃｙｔｅデータ
ベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴク
ラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳ
ＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto
, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する
相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（A
ltschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。
既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそ
れ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Was
hington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築し
た。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６０２３と命名する
。 ＤＮＡ５６０２３配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン番号４０７１７４６に
含まれるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、ＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクロー
ン番号４０７１７４６を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤ
ＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ７７に示し、ここでＤＮＡ６４８８６−１６０１と命
名する。 クローンＤＮＡ６４８８６−１６０１は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置１２２−１２４に見かけの翻訳開始部位を持ち、そし
てヌクレオチド位置８１２−８１４の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ７７）。予
測されるポリペプチド前駆体は２３０アミノ酸長である（Ｆｉｇ７８）。Ｆｉｇ
７８に示した全長ＰＲＯ１３５６タンパク質は約２４，５４９の推定分子量及び
約８.５６のｐＩを有する。Ｆｉｇ７８（配列番号：１３４）に示された全長Ｐ
ＲＯ１３５６の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１から約ア
ミノ酸２４のシグナルペプチド、約アミノ酸８２から約アミノ酸１０２、約アミ
ノ酸１１７から約アミノ酸１４０及び約アミノ酸１６３から約アミノ酸１８２の
膜貫通ドメイン、約アミノ酸１９０から約アミノ酸１９３の潜在的なＮ-グリコ
シル化部位及び約アミノ酸４６から約アミノ酸５９のタンパク質のＰＭＰ−２２
／ＥＭＰ／ＭＰ２０ファミリーに対して相同性を持つアミノ酸配列ブロック。ク
ローンＤＮＡ６４８８６−１６０１は１９９８年９月９日にＡＴＣＣに寄託され
、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４１が付与された。 Ｆｉｇ７８（配列番号：１３４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列
アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３５６のアミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列：AB00014_1, AB000712_1, A39484, AF000959_1, AF035814_1, HSU899
16_1, MMU19582_1, P_R30059, HUAC004125_1及びPM22_RATとの間の有意な相同性
が証明された。

【０４９３】 実施例４３：ヒトＰＲＯ１２７５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 ここでＤＮＡ５７７００と命名した新規な分泌分子をIncyteの（LIFESEQ(商品
名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）企業のデータベース及びGenBan
kの公的データベースに対するBLASTに使用した。ポジティブクローンを同定し、
seqextプログラムによりアセンブリファイルを生成するために使用した。検索は
、ＥＳＴ配列の６フレーム翻訳とのＥＣＤタンパク質配列の比較としてコンピュ
ータプログラムBLAST又はBLAST2［Altschul等, Methods in Enzymology 266: 46
0-480 (1996)］を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコ
ア７０（又は９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「ph
rap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington）で集団
化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。 コンセンサスＤＮＡ配列をBLASTとphrapの繰り返しサイクルを使用して他のＥ
ＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここで「ＤＮＡ５９５７２
」と命名する。 ＤＮＡ５９５７２コンセンサス配列とアセンブリにおいて同定された配列との
関連に基づいて、アセンブリにおける配列の一つを含むクローン（Incyteクロー
ン２０２６５８１）の一つを購入し配列決定した。Incyteクローン２０２６５８
１は表皮乳房ケラチノサイトからのＲＮＡから作成されたライブラリから得られ
たものである。 ＰＲＯ１２７５の全コード配列をＦｉｇ７９（配列番号：１３５）に示す。ク
ローンＤＮＡ６４８８８−１５４２は、単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置３７−３９に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置３９４−３９６（配列番号：１３５）に見かけの停止コドンを持つ
。予測されるポリペプチド前駆体は１１９アミノ酸長である。シグナルペプチド
は約アミノ酸１−２５（配列番号：１３６）である。シグナルペプチドは配列番
号：１３６の約アミノ酸１−２５にある。クローンＤＮＡ６４８８８−１５４２
はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４９が付与された。Ｆｉｇ７
９に示す全長ＰＲＯ１２７５タンパク質は約１３，２４８ダルトンの推定分子量
及び約７.７８のｐＩを有する。 Ｆｉｇ８０（配列番号：１３６）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列
アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Sw
issProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２７５アミノ酸配列と以下のDayhoff配列
（ここに取り込まれるデータベースからの情報）：B48151(Mst98Cb), D86424_1(
高硫黄ケラチンタンパク質), P_R79964(結合組織成長因子), CHRD_RAT(コーディ
ン(chordin)), MT_DREPO(メタロチオネイン), PL05_PLETR(プレクトキシン(plec
toxins)), P_R25156(Ｉｇ抗原), S73732_1(VLDP), AF025440_1(0IP4)及びP_R327
57(IGF-II)との間の配列同一性が明らかにされた。

【０４９４】 実施例４４：ヒトＰＲＯ１２７４をコードするｃＤＮＡクローンの単離 ここでＤＮＡ５７７００と命名した新規な分泌分子をIncyteの（LIFESEQ(商品
名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）企業のデータベース及びGenBan
kの公的データベースに対するBLASTに使用した。ポジティブクローンを同定し、
seqextプログラムによりアセンブリファイルを生成するために使用した。検索は
、ＥＳＴ配列の６フレーム翻訳とのＥＣＤタンパク質配列の比較としてコンピュ
ータプログラムBLAST又はBLAST2［Altschul等, Methods in Enzymology 266: 46
0-480 (1996)］を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコ
ア７０（又は９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「ph
rap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington）で集団
化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。 コンセンサスＤＮＡ配列をBLASTとphrapの繰り返しサイクルを使用して他のＥ
ＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここで「ＤＮＡ５９５７３
」と命名する。 ＤＮＡ５９５７３コンセンサス配列とアセンブリにおいて同定された配列との
関連に基づいて、アセンブリにおける配列の一つを含むクローン（Incyteクロー
ン２６２３９９２）の一つを購入し配列決定した。Incyteクローン２６２３９９
２は表皮乳房ケラチノサイトからのＲＮＡから作成されたライブラリから得られ
たものである。 ＰＲＯ１２７４の全コード配列をＦｉｇ８１（配列番号：１３７）に示す。ク
ローンＤＮＡ６４８８９−１５４１は、単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置２４−２６に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置３５４−３５６（配列番号：１３７）に見かけの停止コドンを持つ
。予測されるポリペプチド前駆体は１１０アミノ酸長である。シグナルペプチド
は配列番号：１３８の約アミノ酸１−２４である。インスリンファミリーのタン
パク質における保存領域及びＮ-グリコシル化部位はＦｉｇ８２に示している。
クローンＤＮＡ６４８８９−１５４１はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号
２０３２５０が付与された。Ｆｉｇ８２に示す全長ＰＲＯ１２７４タンパク質は
約１２，３６３ダルトンの推定分子量及び約８.３１のｐＩを有する。 Ｆｉｇ８２（配列番号：１３８）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列
アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Sw
issProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２７４アミノ酸配列と以下のDayhoff配列
（ここに取り込まれるデータベースからの情報）：CEW05B2_9, AF016922_1(イン
スリン様成長因子１), B48151, A53640, BTIGF2REC_1(インスリン様成長因子２)
, HSNF1GEN12_1, TXA3_RADMA(ニューロトキシン３), CXM1_CONGE, P_P61301, TX
A4_RADMA(ニューロトキシン４)との間の配列同一性が明らかにされた。

【０４９５】 実施例４５：ヒトＰＲＯ１４１２をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Ｉｎｃｙ
ｔｅのＥＳＴクラスター配列番号１０１３６８と命名され、ここで「ＤＮＡ１０
６４３」とも呼ばれる、ＩｎｃｙｔｅデータベースからのＥＳＴクラスター配列
の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公的ＥＳＴデータ
ベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商
品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（
ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、
コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymology
266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BL
ASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム
「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington）で
集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。ＥＳＴの一又は複数は、男子胎
児から取り除かれた前立腺ストローマの線維芽細胞から単離されたＲＮＡから取
り出された。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５８７５４と
命名する。 ＤＮＡ５８７５４配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン番号３５９７３８５に
含まれるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、ＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクロー
ン番号３５９７３８５を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤ
ＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ８３に示し、ここでＤＮＡ６４８９７−１６２８と命
名する。 Ｆｉｇ８３に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含
み、ヌクレオチド位置１４２−１４４に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置１０７５−１０７７の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ８３；配列
番号：１３９）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ８４、配列番号：１４
０）は３１１アミノ酸長である。ＰＲＯ１４１２の他の特徴は：約アミノ酸１−
２８のシグナルペプチド；約アミノ酸１９０−２１６の膜貫通ドメイン；約アミ
ノ酸４９−５２、９１−９４、１０８−１１１、１２８−１３１、１３５−１３
８及び１９０−１９３の潜在的なＮ-グリコシル化部位；約アミノ酸６２−６９
のチロシンキナーゼリン酸化部位；及び約アミノ酸１８３−２２４のリソソーム
関連膜糖タンパク質複製ドメインを含む。ＰＲＯ１４１２は約３３，９０８ダル
トンの算定分子量及び約６．８７の推定ｐＩを有する。クローンＤＮＡ６４８９
７−１６２８は１９９８年９月１５日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号
２０３２１６が付与された。 Ｆｉｇ８４（配列番号：１４０）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列
アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Sw
issProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４１２アミノ酸配列と以下のDayhoff配列
番号：I50116, AF035963_1, NCA2_RAT, I61783, P_W07682, MMHC135G15_3, S214
61, MMIGL2_1, ONHIGMV9A_1及びMMU70448_1との間の有意な配列同一性が明らか
にされた。

【０４９６】 実施例４６：ヒトＰＲＯ１５５７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、「ＤＮＡ
５８７６３」と命名された、GenentechデータベースからのＥＳＴクラスター配
列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴ配列を、上記に挙げられたＥＳＴデ
ータベースを含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在
する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST
2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施し
た。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又
はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of
Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構
築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５８７６３と命名
する。 ＤＮＡ５８７６３配列とＥＳＴクローン番号２２６７４０３に含まれるＥＳＴ
配列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン番号２２６７４０３を購入し
、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ８５
に示し、ここでＤＮＡ６４９０２−１６６７と命名する。 Ｆｉｇ８５に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを含
み、ヌクレオチド位置２８７−２８９に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置１６４０−１６４２の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ８５；配列
番号：１４１）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ８６、配列番号：１４
２）は４５１アミノ酸長である。ＰＲＯ１５５７は約４９，６７５ダルトンの算
定分子量及び約７.１５の推定ｐＩを有する。更なる特徴は：約アミノ酸１−２
５のシグナルペプチド；約アミノ酸１１４−１１７の潜在的なＮ-グリコシル化
部位；約アミノ酸３８８−４１の潜在的なｃＡＭＰ及びｃＧＭＰ依存性プロテイ
ンキナーゼリン酸化部位；約アミノ酸５４−４９、６６−７１、１４６−１５１
、及び３６７−３７２の潜在的なＮ-ミリストイル化部位；約アミノ酸３６−３
９及び２０５−２０８の潜在的なアミノ化部位；及び約アミノ酸１５１−２５８
のＡＴＰ／ＧＴＰ結合部位モチーフＡ（Ｐ-ループ）を含む。 Ｆｉｇ８６（配列番号：１４２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列
アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５５７のアミノ酸配列とDayhoff
配列：AF03460との間の有意な相同性が明らかにされた。相同性はまたＰＲＯ１
５５７のアミノ酸配列と以下のDayhoff配列：P_W31559, AF031230_1, SOG_DROME
, CA11_MOUSE, P_R41320, CHRD_RAT, P_W40288, NEL_CHICK, 及びHSMUC5B_1との
間にも発見された。 クローンＤＮＡ６４９０２−１６６７は１９９８年１０月６日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１７が付与された。

【０４９７】 実施例４７：ヒトＰＲＯ１２８６をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ＥＳＴク
ラスター番号８６８０９と命名したＬＩＦＥＳＥＱデータベースからのＥＳＴク
ラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公的
データベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFES
EQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列
タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検
索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzy
mology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせ
ず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プロ
グラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washingt
on）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。アセンブリ中のＥＳＴは
腫瘍、株化細胞、又は病変組織から同定されたものを含んでいた。ＥＳＴの一又
は複数は病変大腸組織から単離されたＲＮＡから作成されたｃＤＮＡライブラリ
から得られた。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５８８２２
と命名する。 ＤＮＡ５８８２２配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴ番号１６９５４３４に含まれる
ＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン番号１６９５４３４を
購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉ
ｇ８７に示し、ここでＤＮＡ６４９０３−１５５３と命名する。（配列番号：１
４３） Ｆｉｇ８７に示された全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置９３−９５に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置３７２−３７４に見いだされる停止コドンで終端する（Ｆｉｇ８７
；配列番号：１４３）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ８８、配列番号
：１４４）は約アミノ酸１−１８のシグナル配列で９３アミノ酸長で、シグナル
配列が約アミノ酸１−１８にある。ＰＲＯ１２８６は約１０，１１１ダルトンの
算定分子量及び約９.７０の推定ｐＩを有する。 Ｆｉｇ８８（配列番号：１４４）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列
アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Sw
issProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２８６アミノ酸配列と以下のDayhoff配列
：SR5C_ARATH, CELC17H12_11, MCPD_ENTAE, JQ2283, INVO_LEMCA, P_R07309, AD
EVBCAGN_4, AF020947_1, CELT23H2_1, 及びMDH_STRARとの間のいくらかの相同性
が明らかにされた。 クローンＤＮＡ６４９０３−１５５３は１９９８年９月１５日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２３が付与された。

【０４９８】 実施例４８：ヒトＰＲＯ１２９４をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ＥＳＴク
ラスター番号１０５５９と命名したＬＩＦＥＳＥＱデータベースからのＥＳＴク
ラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公的
データベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFES
EQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列
タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検
索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzy
mology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせ
ず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プロ
グラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washingt
on）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセ
ンサス配列を、ここでＤＮＡ５７２０３と命名する。 ＤＮＡ５７２０３配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴ番号３０３７７６３に含まれる
ＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン番号３０３７７６３を
購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉ
ｇ８９に示し、ここでＤＮＡ６４９０５−１５５８と命名する。 クローンＤＮＡ６４９０５−１５５８は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置１１０−１１２に見かけの翻訳開始部位を持ち、そし
てヌクレオチド位置１３２８−１３３０の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ８９）
。予測されるポリペプチド前駆体は４０６アミノ酸長である（Ｆｉｇ９０）。Ｆ
ｉｇ９０に示した全長ＰＲＯ１２９４タンパク質は約４６,０３８の推定分子量
及び約６.５０のｐＩを有する。Ｆｉｇ９０（配列番号：１４６）に示された全
長ＰＲＯ１２９４の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１から
約アミノ酸２１のシグナルペプチド及び約アミノ酸１７７から約アミノ酸１８０
及び約アミノ酸２４８から約アミノ酸２５１の潜在的なＮ-グリコシル化部位。
クローンＤＮＡ６４９０５−１５５８は１９９８年９月１５日にＡＴＣＣに寄託
され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３３が付与された。 Ｆｉｇ９０（配列番号：１４６）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列
アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２９４のアミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列：I73636, AF028740_1, AB006686S3_1, P_R98225, RNU78105_1, CELC4
8E7_4, CEF11C3_3, SCP1_MESAU, TPM3_HUMAN及びCELK05B2_3との間の有意な相同
性が証明された。

【０４９９】 実施例４９：ヒトＰＲＯ１３４７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐ方法を
使用して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここでＤＮ
Ａ４７３７３と命名した。ＤＮＡ４７３７３コンセンサス配列に基づいて、１）
ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２
）ＰＲＯ１３４７の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用
するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー5'GCGTGGTCCACCTCTACAGGGACG3'（配列番号：149） 逆方向ＰＣＲプライマー5'GGAACTGACCCAGTGCTGACACC3'（配列番号：150） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４７３７３配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ： 5'GCAGATGCCACAGTATCAAGGCAGGACAAA ACTGGTGAAG GATTC3'（配列番号：151） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３４７遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリの作成に対するＲＮＡはヒト骨髄組織か
ら単離された。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３４７の全
長ＤＮＡ配列及びＰＲＯ１３４７の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１３４７の全配列をＦｉｇ９１（配列番号：１４７）に示す。クローン
ＤＮＡ６４９５０−１５９０は、単一のオープンリーディングフレームを含み、
ヌクレオチド位置１８３−１８５に見かけの翻訳開始部位及びヌクレオチド位置
１６８３−１６８５の見かけの停止コドンを持つ（配列番号：１４７）。予測さ
れるポリペプチド前駆体は５００アミノ酸長である。シグナルペプチドは約アミ
ノ酸１−１７であり、膜貫通ドメインは約アミノ酸２３９−２５５（配列番号：
１４８）である。クローンＤＮＡ６４９５０−１５９０はＡＴＣＣに寄託され、
ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２４が付与された。Ｆｉｇ９２に示す全長ＰＲＯ１３
４７タンパク質は約５６,７４８ダルトンの推定分子量及び約８.５のｐＩを有す
る。 Ｆｉｇ９２（配列番号：１４８）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列
アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３４７のアミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列：BUTY_HUMAN, AF033107_1, HSU90142_1, HSU90144_1, HSB73_1, HS11
1M5_2, R052_HUMAN, AF018080_1, HSAJ03147_4, 及びMOG_MOUSEとの間の配列同
一性が明らかにされた。

【０５００】 実施例５０：ヒトＰＲＯ１３０５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐ方法を
使用して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここでＤＮ
Ａ３８１０３と命名した。ＤＮＡ３８１０３コンセンサス配列に基づいて、１）
ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２
）ＰＲＯ１３０５の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用
するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（38103.f1）5'-AACTGCTCTGTGGTTGGAAGCCTG-3'（配列番
号：154） 逆方向ＰＣＲプライマー（38103.r1）5'-CAGTCACATGGCTGACAGACCCAC-3'（配列番
号：155） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ３８１０３配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ（38103.p1)： 5'-AGGTTATCAGGGGCTTCACTGTGAAACCTGCAAAGAGG-3'（配列番号：156） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３０５遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリの作成に対するＲＮＡはヒト骨髄組織か
ら単離された。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３０５の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ６４９５２−１５６８とここで命名[Ｆｉｇ９３、配列番
号：１５２]）；及びＰＲＯ１３０５の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ６４９５２−１５６８の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ９３（配列番号：
１５２）に示す。クローンＤＮＡ６４９５２−１５６８は、単一のオープンリー
ディングフレームを含み、ヌクレオチド位置１２６−１２８に見かけの翻訳開始
部位を持ち、そしてヌクレオチド位置９００−９０２の見かけの停止コドンで終
端する（Ｆｉｇ９３）。予測されるポリペプチド前駆体は２５８アミノ酸長であ
る（Ｆｉｇ９４）。Ｆｉｇ９４に示す全長ＰＲＯ１３０５タンパク質は約２５,
７１６ダルトンの推定分子量及び約８.１３のｐＩを有する。Ｆｉｇ９４（配列
番号：１５３）に示す全長ＰＲＯ１３０５配列の分析により次のものの存在が証
明される：約アミノ酸１から約アミノ酸２５のシグナルペプチド、約アミノ酸３
０から約アミノ酸３３、約アミノ酸１７２から約アミノ酸１７５、約アミノ酸１
９５から約アミノ酸１９８、約アミノ酸２０８から約アミノ酸２１１及び約アミ
ノ酸２３５から約アミノ酸２３８の潜在的なＮ-グリコシル化部位及び約アミノ
酸２１４から約アミノ酸２２５のＥＧＦ−様システインパターンシグネチャー配
列。クローンＤＮＡ６４９５２−１５６８は１９９８年９月１５日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２２が付与された。 Ｆｉｇ９４（配列番号：１５３）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列
アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３０５のアミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列（データはここに取り込む）：CET22A_3, LMA2_MOUSE, AF055580_1, A
F016903_1, LMB2_MOUSE, P_R71730, LMB3_MOUSE, LMG1_HUMAN, LMG1_DROME及びL
MA5_MOUSEとの間の有意な相同性が証明された。しかして、ＰＲＯ１３０５ポリ
ペプチドはラミニンに対して相同性を示し、ラミニン相同体でありうる。

【０５０１】 実施例５１：ヒトＤＮＡ１２７３をコードするｃＤＮＡクローンの単離 発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Phar
maceuticals、Palo Alto, CA）を検索しＥＳＴを同定した。この配列を公的デー
タベースとIncyteのデータベースに対してブラストした。検索は、コンピュータ
プログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-48
0 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７
０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（P
hil Green, University of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコ
ンセンサスＤＮＡ配列を構築した。 コンセンサスＤＮＡ配列をBLASTとphrapの繰り返しサイクルを使用して他のＥ
ＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここで「ＤＮＡ６０７４７
」と命名する。ＤＮＡ６０７４７コンセンサス配列と整列された配列のアセンブ
リ内の配列との関連に基づいて、Incyteクローン３５４１１０５を購入し全体を
配列決定した。このIncyteクローンは精嚢組織から単離されたＲＮＡから作成さ
れたライブラリから得られたものである。 ＰＲＯ１２７３の全コード配列をＦｉｇ９５（配列番号：１５７）に示す。ク
ローンＤＮＡ６５４０２−１５４０は、単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置２６−２８に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置５１５−５１７（配列番号：１５７）に見かけの停止コドンを持つ
。予測されるポリペプチド前駆体は１６３アミノ酸長である。シグナルペプチド
は配列番号：１５８の約アミノ酸１−２０にあり、リポカリン(lipocalins)中の
保存領域は約アミノ酸２５−３６にある。クローンＤＮＡ６５４０２−１５４０
はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２５２が付与された。Ｆｉｇ９
６に示す全長ＰＲＯ１２７３タンパク質は約１８,０４５ダルトンの推定分子量
及び約４.８７のｐＩを有する。 Ｆｉｇ９６（配列番号：１５８）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列
アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Sw
issProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２７３アミノ酸配列と以下のDayhoff配列
（ここに取り込まれるデータベースからの情報）：PGHD_FELCA(プロスタグラン
ジン-h2d-イソメラーゼ前駆体), S57748(プロスタグランジンD合成酵素前駆体),
LIPO_BUFMA(リポカリン前駆体), S52354, QSP_CHICK, ECP19_1, LACB_CAPHI, O
LFA_RANPI, D87752_1, 及びLACB_BOVINとの間の配列同一性が明らかにされた。

【０５０２】 実施例５２：ヒトＰＲＯ１３０２をコードするｃＤＮＡクローンの単離 ＰＲＯ１３０２をコードするコンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載
したようなｐｈｒａｐ方法を使用して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコ
ンセンサス配列をここで「ＤＮＡ２８７４２」と命名した。ＤＮＡ２８７４２コ
ンセンサス配列、コンセンサス配列が誘導されたアセンブリ及びここに提供され
た他の情報と発見に基づいて、Incyteクローン番号３３４４９２６（病変脾臓組
織ライブラリから）を購入し全体を配列決定した。配列決定により、ＰＲＯ１３
０２の全長ＤＮＡ配列とＰＲＯ１３０２に対する誘導タンパク質が提供された。 ＰＲＯ１３０２の全コード配列をＦｉｇ９７（配列番号：１５９）に示す。ク
ローンＤＮＡ６５４０３−１５６５は、単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置４３−４５に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置１４３２−１４３５（配列番号：１５９）に見かけの停止コドンを
持つ。予測されるポリペプチド前駆体は４６３アミノ酸長である。シグナルペプ
チドは配列番号：１６０の約アミノ酸１−１５にあり、膜貫通配列は約アミノ酸
３５１−３７０にある。クローンＤＮＡ６５４０３−１５６５はＡＴＣＣに寄託
され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３０が付与された。Ｆｉｇ９８に示す全長ＰＲ
Ｏ１３０２タンパク質は約５０,０８２ダルトンの推定分子量及び約７.３のｐＩ
を有する。 Ｆｉｇ９８（配列番号：１６０）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列
アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Sw
issProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３０２アミノ酸配列と以下のDayhoff配列
（ここに取り込まれるデータベースからの情報）：D86358_1, D86359_1, S71403
_1, MAG_HUMAN, JH0593, MMSIAL2_1, C22A_HUMAN, PGBM_HUMAN, PGBM_HUMAN, LA
CH_DROME, 及びKMLS_HUMANとの間の配列同一性が明らかにされた。 実施例５３：ヒトＰＲＯ１２８３をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ２８７５
３と命名する。ＤＮＡ２８７５３コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲによ
り対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１
２８３の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために
、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（28753.f1） 5'-GGAGATGAAGACCCTGTTCCTG-3'（配列番
号：163） 正方向ＰＣＲプライマー（28753.f11） 5'-GGAGATGAAGACCCTGTTCCTGGGTG-3'（
配列番号：164） 逆方向ＰＣＲプライマー（28753.r1） 5'-GTCCTCCGGAAAGTCCTTATC-3'（配列番
号：165） 逆方向ＰＣＲプライマー（28753.r11） 5'-GCCTAGTGTTCGGGAACGCAGCTTC-3'（配
列番号：166） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ２８７５３配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ（28753.p1） 5'-CAGGGACCTGGTACGTGAAGGCCATGGTGGTCGATAAGGACTTTCCGGAG-3'（配列番号：167
） ハイブリッド形成プローブ（28753.p11） 5'-CTGTCCTTCACCCTGGAGGAGGAGGATATCACAGGGACCTGGTAC-3'（配列番号：168） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１２８３遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト胎児脳組
織から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１２８３の全
長ＤＮＡ配列（ここではＤＮＡ６５４０４−１５５１と命名[Ｆｉｇ９９、配列
番号：１６１]）；及びＰＲＯ１２８３の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ６５４０４−１５５１の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ９９（配列番号：
１６１）に示す。クローンＤＮＡ６５４０４−１５５１は、単一のオープンリー
ディングフレームを含み、ヌクレオチド位置４５−４７に見かけの翻訳開始部位
を持ち、そしてヌクレオチド位置５５５−５５７の見かけの停止コドンで終端す
る（Ｆｉｇ９９）。予測されるポリペプチド前駆体は１７０アミノ酸長である（
Ｆｉｇ１００）。Ｆｉｇ１００に示した全長ＰＲＯ１２８３タンパク質は約１９
,４５７ダルトンの推定分子量及び約９.１０のｐＩを有する。Ｆｉｇ１００（配
列番号：１６２）に示された全長ＰＲＯ１２８３の分析により次のものの存在が
証明される：約アミノ酸1から約アミノ酸１７のシグナルペプチド。クローンＤ
ＮＡ６５４０４−１５５１は１９９８年９月９日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣ
Ｃ寄託番号２０３２４４が付与された。 Ｆｉｇ１００（配列番号：１６２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２８３のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：A40464, VEGP_HUMAN, ALL1_CANFA, LALP_TRIVU, S51803, XELPDS_
1, LIPO_BUFMA, S52354, QSP_CHICK及びERBP_RATとの間の有意な相同性が証明さ
れた。

【０５０３】 実施例５４：ヒトＰＲＯ１２７９をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ３０８５
６と命名する。ＤＮＡ３０８５６コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲによ
り対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１
２７９の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために
、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（30856.f1） 5'-GGCTGCGGGACTGGAAGTCATCGGG-3'（配
列番号：171） 正方向ＰＣＲプライマー（30856.f11） 5'-CTCCAGGCCATGAGGATTCTGCAG-3'（配
列番号：172） 正方向ＰＣＲプライマー（30856.f12） 5'-CCTCTGGTCTGTAACCAG-3'（配列番号
：173） 逆方向ＰＣＲプライマー（30856.r1） 5'-TCTGTGATGTTGCCGGGGTAGGCG-3'（配列
番号：174） 逆方向ＰＣＲプライマー（30856.r11） 5'-CGTGTAGACACCAGGCTTTCGGGTG-3'（配
列番号：175） 逆方向ＰＣＲプライマー（30856.r12） 5'-CCCTTGATGATCCTGGTC-3'（配列番号
：176） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ３０８５６配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ（30856.p1） 5'-AGGCCATGAGGATTCTGCAGTTAATCCTGCTTGCTCTGGCAACAGGGCTT-3'（配列番号：177
） ハイブリッド形成プローブ（30856.p11） 5'-GAGAGACCAGGATCATCAAGGGGTTCGAGTGCAAGCCTCACTC-3'（配列番号：178） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１２７９遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト胎児脳組
織から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１２７９の全
長ＤＮＡ配列（ここではＤＮＡ６５４０５−１５４７と命名[Ｆｉｇ１０１、配
列番号：１６９]）；及びＰＲＯ１２７９の誘導タンパク質配列が得られた。

【０５０４】 ＤＮＡ６５４０５−１５４７の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ１０１（配列番号
：１６９）に示す。クローンＤＮＡ６５４０５−１５４７は、単一のオープンリ
ーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置１０６−１０８に見かけの翻訳開
始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置８５６−８５８の見かけの停止コドンで
終端する（Ｆｉｇ１０１）。予測されるポリペプチド前駆体は２５０アミノ酸長
である（Ｆｉｇ１０２）。Ｆｉｇ１０２に示した全長ＰＲＯ１２７９タンパク質
は約２７,４６６ダルトンの推定分子量及び約８.８７のｐＩを有する。Ｆｉｇ１
０２（配列番号：１７０）に示された全長ＰＲＯ１２７９の分析により次のもの
の存在が証明される：約アミノ酸1から約アミノ酸１８のシグナルペプチド、約
アミノ酸５８から約アミノ酸６３のセリンプロテアーゼ、トリプシンファミリー
ヒスチジン活性部位、約アミノ酸９９から約アミノ酸１０２、約アミノ酸1６５
から約アミノ酸１６８、約アミノ酸1８１から約アミノ酸１８４及び約アミノ酸
２１０から約アミノ酸２１３の潜在的なＮ-グリコシル化部位、約アミノ酸１４
５から約アミノ酸１４８、約アミノ酸のグリコサミノグリカン付着部位、約アミ
ノ酸１９７から約アミノ酸２０９及び約アミノ酸４７から約アミノ酸６４のクリ
ングルドメインタンパク質に存在するアミノ酸ブロック、約アミノ酸１９９から
約アミノ酸２０９、約アミノ酸４７から約アミノ酸６４及び約アミノ酸２２０か
ら約アミノ酸２４３のセリンプロテアーゼ、トリプシンファミリー、ヒスチジン
タンパク質と相同性を持つアミノ酸配列ブロック、及び約アミノ酸２２２から約
アミノ酸２４９及び約アミノ酸１８９から約アミノ酸２２２のアップルドメイン
タンパク質に対して相同性を持つアミノ酸配列ブロック。クローンＤＮＡ６５４
０５−１５４７は１９９８年１１月１７日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託
番号２０３４７６が付与された。 Ｆｉｇ１０２（配列番号：１７０）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２７９のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：I56559, S55066, KLK7_RAT, KLK7_RAT, KLK1_RAT, LKLB_RAT, KLK
3_MOUSE, KLK8_RAT, AF013988_1, D78203_1及びHSU62801_1との間の有意な相同
性が証明された。 また、ＤＮＡ６５４０５−１５４７はIncyteＥＳＴクローン番号２７２３６４
６を購入し、クローンの挿入断片を配列決定することにより得られ、Ｆｉｇ１０
１（配列番号：１６９）に示すＤＮＡ６５４０５−１５４７配列をもたらす。

【０５０５】 実施例５５：ヒトＰＲＯ１３０４をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ３５７４
５と命名する。ＤＮＡ３５７４５コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲによ
り対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１
３０４の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために
、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー(35745.f1) 5'-GTGTTCTGCTGGAGCCGATGCC-3'（配列番号
：181） 正方向ＰＣＲプライマー(35745.f2) 5'-GACATGGACAATGACAGG-3'（配列番号：18
2） 正方向ＰＣＲプライマー(35745.f3) 5'-CCTTTCAGGATGTAGGAG-3'（配列番号：18
3） 正方向ＰＣＲプライマー(35745.f4) 5'-GATGTCTGCCACCCCAAG-3'（配列番号：18
4） 逆方向ＰＣＲプライマー(35745.r1) 5'-GCATCCTGATATGACTTGTCACGTGGC-3'（配
列番号：185） 逆方向ＰＣＲプライマー(35745.r2) 5'-TACAAGAGGGAAGAGGAGTTGCAC-3'（配列番
号：186） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つＤＮＡ３５７４５配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ(35745.p1) 5'-GCCCATTATGACGGCTACCTGGCTAAAGACGGCTCGAAATTCTACTGCAG-3'（配列番号：187
） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３０４遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト卵巣組織
から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３０４の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ６５４０６−１５６７[Ｆｉｇ１０３、配列番号：１７９]
と命名）及びＰＲＯ１３０４の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ６５４０６−１５６７の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ１０３（配列番号
：１７９）に示す。クローンＤＮＡ６５４０６−１５６７は、単一のオープンリ
ーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置２３−２５に見かけの翻訳開始部
位を持ち、そしてヌクレオチド位置６８９−６９１の見かけの停止コドンで終端
する（Ｆｉｇ１０３）。予測されるポリペプチド前駆体は２２２アミノ酸長であ
る（Ｆｉｇ１０４）。Ｆｉｇ１０４に示した全長ＰＲＯ１３０４タンパク質は約
２５，７９４ダルトンの推定分子量及び約６．２４のｐＩを有する。Ｆｉｇ１０
４（配列番号：１８０）に示された全長ＰＲＯ１３０４配列の分析により次のも
のの存在が証明される：約アミノ酸２１９から約アミノ酸２２２の小胞体標的配
列、約アミノ酸４５から約アミノ酸４８の潜在的なＮ-グリコシル化部位、約ア
ミノ酸８７から約アミノ酸１２３及び約アミノ酸1２９から約アミノ酸１４２の
ＦＫＢＰ-型ペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼ相同性ブロック及
び約アミノ酸２０２から約アミノ酸２１４及び約アミノ酸１９５から約アミノ酸
２１４のＥＦハンドカルシウム結合ドメインタンパク質相同性ブロック。 Ｆｉｇ１０４（配列番号：１８０）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３０４のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：AF040252_1, P_R28980, S71238, CELC05C8_1, VFU52045_1, S7514
4, FKB3_BOVIN, CELC50F2_6, CELB0511_12及びP_R41781との間の有意な相同性が
明らかにされた。 ＤＮＡ６５４０６−１５６７をまたIncyteＥＳＴクローン番号２８１３５７７
の挿入断片を単離し配列決定することにより得た。

【０５０６】 実施例５６：ヒトＰＲＯ１３１７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例１に記載した方法を使用して、IncyteＥＳＴ番号３３５９８を既
知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０又はそれ以上を持つ対象配列と
して同定した。IncyteＥＳＴ番号３３５９８の配列をここで「ＤＮＡ３６９５８
」と命名する。ＤＮＡ３６９５８配列に基づいて、１）ＰＣＲにより対象とする
配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１３１７の全長
コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌク
レオチドを合成した。 次のものはＤＮＡ３６９５８配列に基づいて合成することができる好適なＰＣ
Ｒプライマー（正及び逆）である： 正方向ＰＣＲプライマー： AGGGACCATTGCTTCTTCCAGGCC(36958.f1；配列番号：19
0） 逆方向ＰＣＲプライマー： CGTTACATGTCTCCAAGGGGAATG(36958.r1；配列番号：19
1） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ３６９５８配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：CCTGTGCTAAGTGCCCCCCAAATGCTTCCT GTGTCAATAACACTC
ACTGC(36958.p1；配列番号：192） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３１７遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、対象配列を含
む組織、例えば末梢血、特に高い白血球数（例え過好酸性症）を持つ患者から取
った血液から単離することができる。 ここでＤＮＡ６５４０８−１５７８（Ｆｉｇ１０５、配列番号：１８８）と命
名されたＰＲＯ１３１７の全長ＤＮＡ配列をIncyteＥＳＴ番号３３５９５８を購
入し、ｃＤＮＡ挿入断片を得て、その全体を配列決定することにより得た。末梢
血球から単離されたＲＮＡを使用して作成されたライブラリから由来するIncyte
クローン番号３３５９５８は過好酸 ＰＲＯ１３１７の全コード化配列をＦｉｇ１０５（配列番号：１８８）に示す
。クローンＤＮＡ６５４０８−１５７８は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、ヌクレオチド位置６−８に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置２２８−２３０に見かけの停止コドンを持つ。予測されるポリペプ
チド前駆体は７４アミノ酸長である。Ｆｉｇ１０６に示した全長ＰＲＯ１３１７
タンパク質は約７，８３１ダルトンの推定分子量及び約９．０８のｐＩを有する
。更なる特徴は、約アミノ酸１−１８のシグナルペプチド、約アミノ酸３４−３
７及び３９−４２の潜在的なＮ-グリコシル化部位、及び約アミノ酸７２−７４
の微小体Ｃ末端標的シグナルを含む。 Ｆｉｇ１０６（配列番号：１８９）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３１７のアミノ酸配列とCD97_H
UMANと命名されたＤａｙｈｏｆｆ配列の間の有意な相同性が明らかにされた。ま
た、ＰＲＯ１３１７アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：GEN12618, CELZK783_1,
G156_PARPR, GIAVSPE_1, AF040387_1, S78059, I50617, XLSEK1_1, 及びNEL2_R
ATとの間にある程度の相同性が見いだされた。 クローンＤＮＡ６５４０８−１５７８は１９９８年９月１５日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２１７が付与された。

【０５０７】 実施例５７：ヒトＰＲＯ１３０３をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここで「ＤＮＡ４７３
４７」と命名する。ＤＮＡ４７３４７コンセンサス配列とＤＮＡ４７３４７が取
り出されるアセンブリ内のIncyteＥＳＴとのその相同性に基づいて、Incyteクロ
ーン１４３０３０５（回腸組織ライブラリから）を購入し全体を配列決定した。
それによってＰＲＯ１３０３をコードする配列を特定した。 ＰＲＯ１３０３の全コード化配列はＦｉｇ１０７（配列番号：１９３）に示さ
れる。クローンＤＮＡ６５４０９−１５６６は、単一のオープンリーディングフ
レームを含み、ヌクレオチド位置１２１−１２３に見かけの翻訳開始部位を持ち
、そしてヌクレオチド位置８６５−８６７に見かけの停止コドンを持つ。予測さ
れるポリペプチド前駆体は２４８アミノ酸長である。シグナルペプチドは配列番
号：１９４の約アミノ酸１−１７にある。Ｎ-グリコシル化部位、活性及び保存
領域及びドメインが更にＦｉｇ１９４に示される。クローンＤＮＡ６５４０９−
１５６６はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３２が付与された。
Ｆｉｇ１０８に示した全長ＰＲＯ１３０３タンパク質は約２６，７３４ダルトン
の推定分子量及び約７．９のｐＩを有する。 Ｆｉｇ１０８（配列番号：１９４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３０３のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列（ここにデータを取り込む）：AB009849_1, P_W08475, AF024605_1,
A42048_1, TRY3_RAT, MMAE00066414, TRY1_RAT, MMAE000663_4, MMAE000665_2,
及びMMAE00066412との間の配列同一性が明らかにされた。

【０５０８】 実施例５８：ヒトＰＲＯ１３０６をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例１に記載した方法を使用して、ここでＤＮＡ５９１８とも呼ばれ
るIncyteＥＳＴ番号２４４９２８２を、既知のタンパク質をコードせず、BLAST
スコア７０又はそれ以上を持つ対象配列として同定した。ＤＮＡ５９１８配列か
ら、コンセンサス配列をBLAST及びプログラム「phrap」（Phil Green, Universi
ty of Washington, Seattle, Washington）を使用して構築した。このコンセン
サス配列をここで「ＤＮＡ４７３９９」と命名する。ＤＮＡ４７３９９コンセン
サス配列に基づいて、１）ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラ
リを同定するため、及び２）ＰＲＯ１３０６の全長コード化配列のクローンを単
離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 Ｆｉｇ１０９（配列番号：１９５）に示したＰＲＯ１３０６の全コード化配列
は、IncyteＥＳＴ番号２４４９２８２を購入し、ｃＤＮＡ挿入断片を得て、その
全体を並列決定することにより得られた。クローンＤＮＡ６５４１０−１５６９
は、単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置１０６−１
０８に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置５５６−５５８に
見かけの停止コドンを持つ。予測されるポリペプチド前駆体は１５０アミノ酸長
である。Ｆｉｇ１１０に示した全長ＰＲＯ１３０６タンパク質は約１７，０６８
ダルトンの推定分子量、約７．２９のｐＩ、及び約アミノ酸１３１−１３４の潜
在的なＮ-グリコシル化部位を有する。 Ｆｉｇ１１０（配列番号：１９６）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３０６のアミノ酸配列とDayhof
f配列AIF1_HUMANの間の有意な相同性が明らかにされた。ＰＲＯ１３０６アミノ
酸配列と以下のDayhoff配列：JC4902, BAR1_RAT, AF020281_1, HSU95213_1, TCH
3_ARATH, LEY14765_1, CATR_NAEGR, S35185, 及びAF065247_1との間にも相同性
が示された。 クローンＤＮＡ６５４１０−１５６９は１９９８年９月１５日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３１が付与された。

【０５０９】 実施例５９：ヒトＰＲＯ１３３６をコードするｃＤＮＡクローンの単離 ＥＳＴ配列を同定し、企業のGenentechデータベースに入った。ＥＳＴを様々
なＥＳＴデータベースに対してブラストした。ＥＳＴデータベースは、公的ＥＳ
Ｔデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴデータベース（LIFESEQ(
商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）、及びGenentechの企業の
ＥＳＴを含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2［Altsc
hul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)］を用いて、ＥＳＴ配列の
６フレーム翻訳とのＥＣＤタンパク質配列の比較として実施した。既知のタンパ
ク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ
比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Sea
ttle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。 ＰＲＯ１３３６をコードしているコンセンサスＤＮＡ配列をphrapを使用して
他の整列されたＥＳＴ配列（アセンブリを形成）に対して構築した。このコンセ
ンサス配列をここで「ＤＮＡ４３３１９」と命名する。ＤＮＡ４３３１９コンセ
ンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブ
ラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１３３６の全長コード化配列のクローンを
単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー：5'ATGGAGATTCCTGCCAACTTGCCG3'(配列番号：199）；及
び 逆方向ＰＣＲプライマー：5'TTGTTGGCATTGAGGAGGAGCAGC3'(配列番号：200）。 さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４３３１９配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：5'GAGGGCATCGTCGAAATACGCCTAGAACAGAACTCCATCAAAGC
CATCCC3'(配列番号：201） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３３６遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト胎児肺組織
から単離された。 上述のようにして単離されたクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３３
６に対する全長ＤＮＡ配列（ここでＤＮＡ６５４２３−１５９５［Ｆｉｇ１１１
Ａ−Ｂ、配列番号：１９８］）とＰＲＯ１３３６の誘導タンパク質が得られた。 ＰＲＯ１３３６の全コード化配列をＦｉｇ１１１Ａ−Ｂ（配列番号：１９８）
に示す。クローンＤＮＡ６５４２３−１５９５は、単一のオープンリーディング
フレームを含み、配列番号：１９８のヌクレオチド位置８３−８５に見かけの翻
訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置４６５２−４６５４に見かけの停止
コドンを持つ。予測されるポリペプチド前駆体は１５２３アミノ酸長である。シ
グナルペプチド（アミノ酸１−２７）、アスパラギン酸及びアスパラギンヒドロ
キシル化部位、ＥＧＦ-様ドメインシステインパターンシグネチャー領域、ロイ
シンジッパーパターン領域、免疫グロブリン及び主要組織適合複合体中に保存さ
れた領域、及びＮ-グリコシル化部位はＦｉｇ１１２に示される。クローンＤＮ
Ａ６５４２３−１５９５はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２７
が付与された。Ｆｉｇ１１２に示した全長ＰＲＯ１３３６タンパク質は約１６７
，７１５ダルトンの推定分子量及び約８．０６のｐＩを有する。 Ｆｉｇ１１２（配列番号：１９８）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３３６のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列（ここにデータを取り込む）：SLIT_DROME, CEF40E10_1, LCU58977_
1, AF029779_1, FBP1_STRPU, NOTC_XENLA, AC004663_1, XELXDEL_1, P_W05835及
びHSU77720_1との間の配列同一性が明らかにされた。

【０５１０】 実施例６０：ヒトＰＲＯ１２７８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐ方法を
使用して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここで「Co
nsen５２３０」と命名した。また、Consen５２３０コンセンサス配列をBLAST及
びphrapの繰り返しサイクルを用いて伸長し、コンセンサス配列を上で議論した
ＥＳＴ配列の供給源を用いて可能な限り伸長させた。伸長されたコンセンサス配
列をここで「ＤＮＡ４４８０１」と命名する。ＤＮＡ４４８０１コンセンサス配
列に基づいて、１）ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同
定するため、及び２）ＰＲＯ１２７８の全長コード化配列のクローンを単離する
プローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー：GCAGGCTTTGAGGATGAAGGCTGC（44801.f1；配列番号：20
4）及びCTCATTGGCTGCCTGGTCACAGGC（44801.f2；配列番号：205） 逆方向ＰＣＲプライマー：CCAGTCGGACAGGTCTCTCCCCTC（44801.r1；配列番号：20
6）及びTCAGTGACCAAGGCTGAGCAGGCG（44801.r2；配列番号：207） また、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４４８０１配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：CTACACTCGTTGCAAACTGGCAAAAATATTCTCGAGGGCTGGCCTG
G（44801.p1；配列番号：208） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１２７８遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト精巣から
単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１２７８の全
長ＤＮＡ配列（ここでＤＮＡ６６３０４−１５４６と命名［Ｆｉｇ１１３、配列
番号：２０２］）及びＰＲＯ１２７８の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１２７８の全コード化配列をＦｉｇ１１３（配列番号：２０２）に示す
。クローンＤＮＡ６６３０４−１５４６は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、ヌクレオチド位置１４１−１４３に見かけの翻訳開始部位を持ち、そ
してヌクレオチド位置５８５−５８７に見かけの停止コドンを持つ。予測される
ポリペプチド前駆体は１４８アミノ酸長である。Ｆｉｇ１１４に示した全長ＰＲ
Ｏ１２７８タンパク質は約１６，６２３ダルトンの推定分子量及び約８．４７の
ｐＩを有する。更なる特徴は約アミノ酸１−１９のシグナルペプチド配列；約ア
ミノ酸５８−６１の潜在的なＮ-グリコシル化部位；約アミノ酸９４−１１２の
α-ラクトアルブミン／リゾチームＣシグネチャー；及び約アミノ酸３５−５９
、６７−５９及び１１２−１３３のα-ラクトアルブミン／リゾチームＣとの相
同配列を含む。 Ｆｉｇ１１４（配列番号：２０３）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２７８のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：LYC1_ANAPL, LYC3_ANAPL, 及びLYC_HUMANとの間の有意な相同性が
明らかにされた。 クローンＤＮＡ６６３０４−１５４６は１９９８年１０月６日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２１が付与された。

【０５１１】 実施例６１：ヒトＰＲＯ１２９８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデ
ータベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳ
Ｔクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業の
ＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo
Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在
する相同性を同定した。ＥＳＴの一又は複数は病変前立腺組織ライブラリから取
り出された。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschu
l等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知の
タンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上
を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washingto
n, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そ
こから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６３８９と命名する。 ＤＮＡ５６３８９配列とコンセンサス配列が取り出されたアセンブリ内のIncy
teＥＳＴ内に含まれるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、Incyteクローン
３３５５７１７を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿
入物の配列をＦｉｇ１１５に示し、ここでＤＮＡ６６５１１−１５６３と命名す
る。 Ｆｉｇ１１５に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置９４−９６に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置１０６３−１０６５の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１１５；配列
番号：２０９）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ１１６、配列番号：２
１０）は３２３アミノ酸長である。シグナルペプチドは配列番号：２１０の約ア
ミノ酸１−１５にある。ＰＲＯ１２９８は約３７，０１７の算定分子量及び約８
．８３の推定ｐＩを有する。クローンＤＮＡ６６５１１−１５６３は１９９８年
９月１５日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２８が付与されて
いる。 Ｆｉｇ１１６（配列番号：２１０）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配
列アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45
SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２９８アミノ酸配列と以下のDayhoff配
列（データをここに取り込む）：ALG2_YEAST, CAPM_STAAU, C69098, C69255, SU
S2_MAIZE, A69143, S74778, AB009527_13, AF050103_2及びBBA224769_1との間の
配列同一性が明らかにされた。

【０５１２】 実施例６２：ヒトＰＲＯ１３０１をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで「
ＤＮＡ１０５９１」とも呼ばれるIncyteクラスター番号９３４９２と命名された
、IncyteデータベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次い
でこのＥＳＴクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）
及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceutic
als、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較
して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAS
T又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用
いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合
もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, Uni
versity of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮ
Ａ配列を構築した。ＥＳＴの一又は複数は腺ガンの男性から取り除いた肺組織か
ら単離されたＲＮＡから作成されたｃＤＮＡライブラリから取り出された。そこ
から得られたコンセンサス配列を、ここで「ＤＮＡ５７７２５」と命名する。 ＤＮＡ５７７２５配列とＥＳＴ番号３３９５９８４内に含まれるＥＳＴ配列と
の間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン３３９５９８４を購入し、ｃＤＮＡ
挿入物を得てその全体を配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ１１
７に示し、ここでＤＮＡ６６５１２−１５６４と命名する。 Ｆｉｇ１１７に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置４３−４５に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置１４２９−１４３１の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１１７；配列
番号：２１１）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ１１８、配列番号：２
１２）は４６２アミノ酸長である。ＰＲＯ１３０１タンパク質の他の特徴は、約
アミノ酸１−１８のシグナル配列；約アミノ酸２７１−２９０の膜貫通ドメイン
；及び約アミノ酸９４−９７、２１７−２２０及び２４６−２４９の潜在的なＮ
-グリコシル化部位を含む。ＰＲＯ１３０１は約５２，４３２の算定分子量及び
約６．１４の推定ｐＩを有する。クローンＤＮＡ６６５１２−１５６４は１９９
８年９月１５日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２１８が付与さ
れている。 Ｆｉｇ１１８（配列番号：２１２）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配
列アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45
SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３０１アミノ酸配列と以下のDayhoff配
列：PSU29243_1, A69975, ATAC00448418, D78607_1, CEB0331_1, HUMCYTIIIA_1,
AF014800_1, CELT13C5_4, CELC45H4_14, 及びCEC54E10_1との間のある程度の相
同性が明らかにされた。

【０５１３】 実施例６３：ヒトＰＲＯ１２６８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ＥＳＴ番
号８８７９と命名された、LIFESEQ(商品名)データベースからのＥＳＴクラスタ
ー配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公的ＥＳＴ
データベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFES
EQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列
タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検
索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzy
mology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせ
ず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プロ
グラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washingt
on）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。ＥＳＴの一又は複数は大
脳髄膜病巣から取り出されたヒト脳腫瘍組織から作成されたｃＤＮＡライブラリ
から取り出された。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６２
５８と命名する。 ＤＮＡ５６２５８配列とIncyteＥＳＴ番号２９４４５４１内に含まれるＥＳＴ
配列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン２９４４５４１を購入し、ｃ
ＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ１１９に
示し、ここでＤＮＡ６６５１９−１５３５と命名する。 Ｆｉｇ１１９に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置８９−９１に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置５０９−５１１の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１１９；配列番号
：２１３）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ１２０、配列番号：２１４
）は１４０アミノ酸長である。ＰＲＯ１２６８は約１５，５０３の算定分子量及
び約６．６４の推定ｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸１２−２８のＩＩ
型膜貫通ドメイン；約アミノ酸５１−６６及び１０７−１２４のＩ型膜貫通ドメ
イン；約アミノ酸７９−８２の潜在的なＮ-グリコシル化部位、及び約アミノ酸
５９−９９のＧプロテイン結合レセプターと相同性を有する領域を含む。 Ｆｉｇ１２０（配列番号：２１４）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配
列アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45
SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２６８アミノ酸配列と以下のDayhoff配
列番号CEF39B2_9との間のある程度の相同性が明らかにされた。しかし、パーセ
ント配列同一性は有意ではないと決定された。 クローンＤＮＡ６６５１９−１５３５は１９９８年９月１５日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３６が付与されている。

【０５１４】 実施例６４：ヒトＰＲＯ１２６９をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ＥＳＴク
ラスター番号１０１９２０と命名された、LIFESEQ(商品名)データベースからの
ＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列
を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデー
タベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む
種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定
した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, M
ethods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパ
ク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ
比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Sea
ttle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから
得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６５０９と命名する。 ＤＮＡ５６５０９配列とＥＳＴ番号１０３１５７内に含まれるＥＳＴ配列との
間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン番号１０３１５７を購入し、ｃＤＮＡ
挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ１２１に示し、
ここでＤＮＡ６６５２０−１５３６と命名する。 Ｆｉｇ１２１に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置２６−２９に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置６１４−６１６に見いだされた停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１２
１；配列番号：２１５）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ１２２、配列
番号：２１５）は１９６アミノ酸長であり、シグナルペプチドは約アミノ酸１−
２０にある。約アミノ酸１１２−１１５には潜在的なN-グリコシル化部位がある
。ＰＲＯ１２６９は約２１，７３１の算定分子量及び約８．９７の推定ｐＩを有
する。 Ｆｉｇ１２２（配列番号：２１６）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配
列アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45
SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１２６９アミノ酸配列と以下のDayhoff配
列番号P_W23722のアミノ酸配列との間の有意な相同性が明らかにされた。また、
配列相同性はＰＲＯ１２６９アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：MMTAG7_1, MTV
026_16, NAAA_BPT3, S75616_1, 及びNCP_PIGとの間に見いだされた。 クローンＤＮＡ６６５２０−１５３６は１９９８年９月１５日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２６が付与されている。

【０５１５】 実施例６５：ヒトＰＲＯ１３２７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteＥ
ＳＴクラスター配列番号１７３４１０と命名された、Incyteデータベースからの
ＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列
を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデー
タベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む
種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定
した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, M
ethods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパ
ク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ
比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Sea
ttle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから
得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６５２０と命名する。 ＤＮＡ５６５２０配列とIncyteＥＳＴクローン番号３
４５１７６０内に含まれるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、IncyteＥＳ
Ｔクローン番号３４５１７６０を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。
このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ１２３に示し、ここでＤＮＡ６６５２１−１
５８３と命名する。 クローンＤＮＡ６６５２１−１５８３は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置５５−５７に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置８１１−８１３の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１２３）。予測
されるポリペプチド前駆体は２５２アミノ酸長である（Ｆｉｇ１２４）。Ｆｉｇ
１２４に示された全長ＰＲＯ１３２７は約２８，１２７の推定分子量及び約８．
９１のｐＩを有する。Ｆｉｇ１２４（配列番号：２１８）に示された全長ＰＲＯ
１３２７の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１から約アミノ
酸１４のシグナルペプチド、約アミノ酸６２から約アミノ酸１６５、約アミノ酸
１２７から約アミノ酸１３０、約アミノ酸１３７から約アミノ酸１４０及び約ア
ミノ酸１４３から約アミノ酸１４６の潜在的なＮ-グリコシル化部位及び約アミ
ノ酸６１から約アミノ酸７１の２-オキソ酸デヒドロゲナーゼアシルトランスフ
ェラーゼ相同性ブロック。クローンＤＮＡ６６５２１−１５８３は１９９８年９
月１５日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２５が付与された。 Ｆｉｇ１２４（配列番号：２１８）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３２７のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：NPH1_RAT, NPH2_MOUSE, OTU_DROME, D40750, BB61_RABIT, P_R238
73, P_W09673, CAGHMGPA_1, HUMPRP11_1及びS670958_1との間の有意な相同性が
証明された。

【０５１６】 実施例６６：ヒトＰＲＯ１３８２をコードするｃＤＮＡクローンの単離 既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０又はそれ以上を持つ対象配
列としてIncyteＥＳＴ番号２７１９を実施例１に記載した方法を使用して同定し
た。ＥＳＴ番号２７１９のヌクレオチド配列とその相補配列をここで「ＤＮＡ４
２８４２」と命名する。ＤＮＡ４２８４２配列に基づいて、１）ＰＣＲにより対
象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１３８
２の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オ
リゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー ACGGCTCACCATGGGCTCCG（42842.f1；配列番号：221） 逆方向ＰＣＲプライマー AGGAAGAGGAGCCCTTGGAGTCCG（42842.r1；配列番号：222
） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４２８４２配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ CGTGCTGGAGGGCAAGTGTCTGGTGGTGTG CGACTCGAAC（4284
2.p1；配列番号：223） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３８２遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト乳ガンから
単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３８２の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ６６５２６−１６１６とここで命名[Ｆｉｇ１２５、配列
番号：２１９]）；及びＰＲＯ１３８２の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１３８２の全コード化配列をＦｉｇ１２５（配列番号：２１９）に示す
。クローンＤＮＡ６６５２６−１６１６は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、ヌクレオチド位置３３７−３３９に見かけの翻訳開始部位を持ち、そ
してヌクレオチド位置９４０−９４２に見かけの停止コドンを持つ。予測される
ポリペプチド前駆体は２０１アミノ酸長である。Ｆｉｇ１２６に示す全長ＰＲＯ
１３８２タンパク質は約２１，８０８ダルトンの推定分子量及び約９．０４のｐ
Ｉを有する。更なる特徴は、約アミノ酸１−２７のシグナルペプチド；約アミノ
酸２９−３２及び８８−９１の潜在的なN-グリコシル化部位；約アミノ酸２９−
３２及び８８−９１の潜在的なＮ-グリコシル化部位；及び約アミノ酸９２−１
２６、１５９−１７８、及び１９１−２００のＣ１ｑタンパク質と相同性の領域
を含む。 Ｆｉｇ１２６（配列番号：２２０）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３８２のアミノ酸配列とDayhof
f配列番号CERL_RATの間に有意な相同性が明らかにされた。相同性はまたＰＲＯ
１３８２アミノ酸配列と次のDayhoff配列：CERB_HUMAN, S76975_1, A41752, HUM
C1QB2_1, A57131, CA1A_HUMAN, ACR3_MOUSE, 及びCOLE_LEPMAとの間で明らかに
された。 クローンＤＮＡ６６５２６−１６１６はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番
号２０３２４６が付与された。

【０５１７】 実施例６７：ヒトＰＲＯ１３２８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteＥ
ＳＴクラスター配列番号４０６７１と命名された、IncyteデータベースからのＥ
ＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を
、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータ
ベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種
々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定し
た。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Met
hods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク
質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比
較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seatt
le, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得
られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６７４９と命名する。 ＤＮＡ５６７４９配列とIncyteＥＳＴクローン番号４１
１１１９２内に含まれるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、IncyteＥＳＴ
クローン番号４１１１１９２を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。こ
のｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ１２７に示し、ここでＤＮＡ６６６５８−１５
８４と命名する。 クローンＤＮＡ６６６５８−１５８４は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置９−１１に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置７８０−７８２の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１２７）。予測さ
れるポリペプチド前駆体は２５７アミノ酸長である（Ｆｉｇ１２８）。Ｆｉｇ１
２８に示された全長ＰＲＯ１３２８は約２８，４７２の推定分子量及び約９．３
３のｐＩを有する。Ｆｉｇ１２８（配列番号：２２５）に示された全長ＰＲＯ１
３２８の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１から約アミノ酸
１９のシグナルペプチド、約アミノ酸３２から約アミノ酸５１、約アミノ酸１１
９から約アミノ酸１３８、約アミノ酸１５２から約アミノ酸１６９及び約アミノ
酸２１６から約アミノ酸２３５の膜貫通ドメイン、約アミノ酸１２０から約アミ
ノ酸１２３のグリコサミノグリカン付着部位及び約アミノ酸３１から約アミノ酸
６５のナトリウム／神経伝達物質共輸送体ファミリータンパク質相同性ブロック
。クローンＤＮＡ６６６５８−１５８４は１９９８年９月１５日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２９が付与された。 Ｆｉｇ１２８（配列番号：２２５）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３２８のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：CEVF36H2L_2, TIP2_TOBAC, AB009466_16, ATU39485_1, P_R60153,
P_R77082, S73351, C69392, LEU95008_1及びE64667との間の有意な相同性が証
明された。

【０５１８】 実施例６８：ヒトＰＲＯ１３２５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteＥ
ＳＴクラスター配列番号１３９５２４と命名された、Incyteデータベースからの
ＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列
を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデー
タベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む
種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定
した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, M
ethods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパ
ク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ
比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Sea
ttle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから
得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６１１５と命名する。 ＤＮＡ５６１１５配列とIncyteＥＳＴクローン番号３
７４４０７９内に含まれるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、IncyteＥＳ
Ｔクローン番号３７４４０７９を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。
このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ１２９に示し、ここでＤＮＡ６６６５９−１
５９３と命名する。 クローンＤＮＡ６６６５９−１５９３は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置５１−５３に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置２５４７−２５４９の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１２９）。
予測されるポリペプチド前駆体は８３２アミノ酸長である（Ｆｉｇ１３０）。Ｆ
ｉｇ１３０に示された全長ＰＲＯ１３２５タンパク質は約９４，４５４の推定分
子量及び約６．９４のｐＩを有する。Ｆｉｇ１３０（配列番号：２２７）に示さ
れた全長ＰＲＯ１３２５の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸
１から約アミノ酸１８のシグナルペプチド、約アミノ酸２９２から約アミノ酸３
１７、約アミノ酸４５１から約アミノ酸４７０、約アミノ酸５０１から約アミノ
酸５２０、約アミノ酸６０７から約アミノ酸６２７、及び約アミノ酸７５１から
約アミノ酸７７０の膜貫通ドメイン、約アミノ酸４９７から約アミノ酸５１８の
ロイシンジッパーパターン配列及び約アミノ酸２７から約アミノ酸３０、約アミ
ノ酸５４から約アミノ酸５７、約アミノ酸６０から約アミノ酸６３、約アミノ酸
位置１２３から約アミノ酸位置１２６、約アミノ酸位置１４１から約アミノ位置
１４４、約アミノ酸位置１６５から約アミノ酸位置１６８、約アミノ酸位置３６
４から約アミノ酸位置３６７、約アミノ酸位置４７６から約アミノ酸位置４７９
、約アミノ酸位置４９６から約アミノ酸位置４９９、約アミノ酸位置５７２から
約アミノ酸位置５７５、約アミノ酸位置６０３から約アミノ酸位置６０６及び約
アミノ酸位置６９９から約アミノ酸位置７０２の潜在的なＮ-グリコシル化部位
。クローンＤＮＡ６６６５９−１５９３は１９９８年９月２２日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２６９が付与された。 Ｆｉｇ１３０（配列番号：２２７）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３２５のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：CELR04E5_1, CELZK721_5, CELC30E1_5, CELC30E1_6, CELC30E1_2,
CEY37H2C_1, CELC30E1_7, CELT07H8_7及びE64006との間の有意な相同性が証明
された。

【０５１９】 実施例６９：ヒトＰＲＯ１３４０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０又はそれ以上を持つ対象配
列としてIncyteＥＳＴ番号８７８９０６を実施例１に記載した方法を使用して同
定した。ＥＳＴ番号８７８９０６のヌクレオチド配列とその相補配列をここで「
ＤＮＡ４２８０９」と命名する。ＤＮＡ４２８０９配列に基づいて、１）ＰＣＲ
により対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲ
Ｏ１３４０の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するた
めに、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー TCCAGGTGGACCCCACTTCAGG（42809.f1；配列番号：270）
逆方向ＰＣＲプライマー GGGAGGCTTATAGGCCCAATCTGG（42809.r1；配列番号：271
） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレ
オチド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４２８０９配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ GGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATC
AATGA（42809.p1；配列番号：272） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３４０遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト胎児腎臓組
織から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３４０の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ６６６６３−１５９８とここで命名[Ｆｉｇ１３１、配列
番号：２２８]）；及びＰＲＯ１３４０の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１３４０の全コード化配列をＦｉｇ１３１（配列番号：２２８）に示す
。クローンＤＮＡ６６６６３−１５９８は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、ヌクレオチド位置１２８−１３０に見かけの翻訳開始部位を持ち、そ
してヌクレオチド位置２５４９−２５５１に見かけの停止コドンを持つ。予測さ
れるポリペプチド前駆体は８０７アミノ酸長である。Ｆｉｇ１３２に示す全長Ｐ
ＲＯ１３４０タンパク質は約８７，６１４ダルトンの推定分子量及び約４．８３
のｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸１−１８のシグナルペプチド；約ア
ミノ酸７６２−７８４膜貫通ドメイン；約アミノ酸４９２−４９４の細胞付着配
列；約アミノ酸５１７−５２０、６０２−６０５及び７００−７０３の潜在的な
N-グリコシル化部位；及び約アミノ酸３０７−３５１、３２４−３４８、６７−
１０３、９７−１４１及び１１４−１３８のカドヘリン細胞外反復ドメインを含
む。 Ｆｉｇ１３２（配列番号：２２９）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３４０のアミノ酸配列とDayhof
f配列番号I46536の間に有意な相同性が明らかにされた。相同性はまたＰＲＯ１
３４０アミノ酸配列と次のDayhoff配列：S55396, RATPDRPT_1, CADD_CHICK, CAD
1_CHICK, CADB_CHICK, I50180, CAD4_CHICK, G02878, 及びDSC1_MOUSEとの間で
明らかにされた。 クローンＤＮＡ６６６６３−１５９８はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番
号２０３２６８が付与された。

【０５２０】 実施例７０：ヒトＰＲＯ１３３９をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐ方法を
使用して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここで「Ｄ
ＮＡ４０６５２」と命名した。コンセンサス配列アセンブリ内にはIncyteＥＳＴ
２４７９３９４があった。コンセンサス配列とここに提供された他の発見と情報
に基づいて、IncyteＥＳＴ２４７９３９４を含むクローンを購買し全体を配列決
定した。配列決定により、ＰＲＯ１３３９をコードする配列を含むＦｉｇ１３３
に示した核酸配列が得られた。 クローンＤＮＡ６６６６９−１５９７は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、配列番号：２３３のヌクレオチド位置９−１１に見かけの翻訳開始部
位を持ち、そしてヌクレオチド位置１２７２−１２７４に見かけの停止コドンを
持つ。予測されるポリペプチド前駆体は４２１アミノ酸長である。シグナルペプ
チドは配列番号：２３４の約アミノ酸１−１６にある。亜鉛カルボキシペプチダ
ーゼ内に保存された領域とＮ-グリコシル化部位はＦｉｇ１３４に示される。ク
ローンＤＮＡ６６６６９−１５９７はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２
０３２７２が付与された。Ｆｉｇ１３４に示す全長ＰＲＯ１３３９タンパク質は
約４７，３５１ダルトンの推定分子量及び約６．６１のｐＩを有する。 Ｆｉｇ１３４（配列番号：２３４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３３９のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列（データはここに取り込む）：P_W01505, CBP1_HUMAN, HSA224866_1
, P_R90293, YHT2_YEAST, CEF02D8_4, CEW01A8_6, P_W36815, HSU83411_1及びCB
PN_HUMANとの間の配列同一性が明らかにされた。

【０５２１】 実施例７１：ヒトＰＲＯ１３３７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例１に記載した方法を使用して、単一のIncyteＥＳＴを同定し（Ｅ
ＳＴ番号１７４７５４６）、またここで「ＤＮＡ４４１７」と称される。コンセ
ンサス配列を構築するために、BLAST及びphrapの繰り返しサイクルを用いて伸長
し、ＤＮＡ４４１７配列を、上で議論したＥＳＴ配列の供給源を用いて可能な限
り伸長させた。コンセンサス配列はここで「ＤＮＡ４５６６９」と命名した。Ｄ
ＮＡ４５６６９コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲにより対象とする配列
を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１３３７の全長コー
ド化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオ
チドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー： CAACCATGCAAGGACAGGGCAGG（45669.f1；配列番号：23
7）及びCTTTGCTGTTGGCCTCTGTGCTCCCAACCATGCAAGGACAGGGCAGG（45669.f2；配列番
号：238） 逆方向ＰＣＲプライマー：TGACTCGGGGTCTCCAAAACCAGC（45669.r1；配列番号：23
9）及びGGTATAGGCGGAAGGCAAAGTCGG（45669.r2；配列番号：240） また、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４５６６９配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：GGCATCTTACCTTTATGGAGTACTCTTTGC TGTTGGCCTCTGTGC
TCC（45669.p1；配列番号：241） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３３７遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト組織から
単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３３７の全
長ＤＮＡ配列（ここでＤＮＡ６６６７２−１５８６と命名［Ｆｉｇ１３５、配列
番号：２３５］）及びＰＲＯ１３３７の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１３３７の全コード化配列をＦｉｇ１３５（配列番号：２３５）に示す
。クローンＤＮＡ６６６７２−１５８６は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、ヌクレオチド位置６０−６２に見かけの翻訳開始部位を持ち、そして
ヌクレオチド位置１３１１−１３１３に見かけの停止コドンを持つ。予測される
ポリペプチド前駆体は４１７アミノ酸長である。Ｆｉｇ１３６に示した全長ＰＲ
Ｏ１３３７タンパク質は約４６，４９３ダルトンの推定分子量及び約９．７９の
ｐＩを有する。 Ｆｉｇ１３６（配列番号：２３６）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３３７のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列THBG_HUMANとの間の有意な相同性が明らかにされた。相同性はまた
ＰＲＯ１３３７アミノ酸配列と次のDayhoff配列：KAIN_HUMAN, HSACT1_1, IPSP_
HUMAN, G02081, HAMHPP_1, CPI6_RAT, S31507, AB000547_1, 及びKBP_MOUSEの間
に見いだされた。 クローンＤＮＡ６６６７２−１５８６は１９９８年９月２２日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２６５が付与された。

【０５２２】 実施例７２：ヒトＰＲＯ１３４２をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例２に記載したアミラーゼスクリーニングで単離したｃＤＮＡ配列
を、ここでＤＮＡ４３２０３と命名する。次いでＤＮＡ４３２０３配列を、公的
ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース
（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発
現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。相
同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods i
n Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。公知のタンパク質をコ
ードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は
、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Wa
shington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られた
コンセンサス配列を、ここで「ＤＮＡ４８３６０」と命名する。 ＤＮＡ４８３６０配列に基づいてオリゴヌクレオチドプローブを作成し、上記
実施例２のパラグラフ１に記載したようにして調製したヒト食道組織ライブラリ
のスクリーニングに使用した。クローニングベクターはｐＲＫ５Ｂであり（ｐＲ
Ｋ５ＢはＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Holmes等, Scienc
e, 253: 1278-1280 (1991)）、切断されたｃＤＮＡサイズは２８００ｂｐ未満で
あった。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー：5'-GAAGCACCAGCCTTTATCTCTTCACC-3'（48360.f1；配列
番号：244） 逆方向ＰＣＲプライマー：5'-GTCAGAGTTGGTGGCTGTGCTAGC-3'（48360.r1；配列番
号：245） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレ
オチド配列を持つＤＮＡ４８３６０配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ： 5'GGACCCAGGCATCTTGCTTTCCAGCCACAAAGAGACAGATGAAGATGC3'（48360.p1；配列番号
：246） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３４２遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。 全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み
、ヌクレオチド位置２３９−２４１に見かけの翻訳開始部位を持ち、ヌクレオチ
ド位置２０２７−２０２９に停止シグナルを有する（Ｆｉｇ１３７；配列番号：
２４２）。予測されるポリペプチド前駆体は５９６アミノ酸長であり、約５７，
１７３ダルトンの算定分子量及び約４．８２の推定ｐＩを有する。更なる特徴に
は、約アミノ酸１−２０のシグナル配列；約アミノ酸５１０−５３２の膜貫通ド
メイン；約アミノ酸２５−２８の潜在的なＮ-グリコシル化部位；約アミノ酸３
２５−３２８のグリコサミノグリカン付着部位；及び約アミノ酸２８４−３３７
、４０４−４５７、２５４−３０７、３５９−４１２、１９４−２４７、２３９
−２９２、２９９−３５２、１３４−１８７、３１４−３６７、及び１６４−２
１７の細菌氷-核形成タンパク質八量体反復が含まれる。 Ｆｉｇ１３８（配列番号：２４３）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配
列アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45
SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３４２アミノ酸配列と以下のDayhoff配
列：CELZC178_2, LMSAP2GN_1, D88734_, AMYH_YEAST, MMDSPPG_1, VGLX_HSVEB,
S52714, CELF59A6_5, CELK06A9_3, 及びYM96_YEASTとの間のある程度の相同性が
証明された。 クローンＤＮＡ６６６７４−１５９９は１９９８年９月２２日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８１が付与された。

【０５２３】 実施例７３：ヒトＰＲＯ１３４３をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例２に記載したアミラーゼスクリーニングで単離したｃＤＮＡ配列
は、WU-BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムにより、如何なる既
知のヒトコード核酸に対しても有意な配列同一性を有していないことが分かった
。このｃＤＮＡ配列をここでＤＮＡ４８９２１と命名する。ＤＮＡ４８９２１分
子の配列からプローブを産生し、上記のパラグラフ１に記載したようにして調製
されたヒト平滑筋細胞組織ライブラリをスクリーニングするために使用した。ク
ローニングベクターはｐＲＫ５Ｂであり（ｐＲＫ５ＢはＳｆｉＩ部位を含まない
ｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Holmes等, Science, 253: 1278-1280 (1991)）、切
断されたｃＤＮＡサイズは２８００ｂｐ未満であった。 用いたオリゴヌクレオチドプローブは次の通りであった： 正方向ＰＣＲプライマー（48921.f1）5'-CAATATGCATCTTGCACGTCTGG-3'（配列番
号：249） 逆方向ＰＣＲプライマー（48921.r1）5'-AAGCTTCTCTGCTTCCTTTCCTGC-3'（配列番
号：250） ハイブリッド形成プローブ（48921.p1） 5'-TGACCCCATTGAGAAGGTCATTGAAGGGATCAACCGAGGGCTG-3'（配列番号：251） 全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み
、ヌクレオチド位置７１−７３に見かけの翻訳開始部位を持ち、ヌクレオチド位
置８１２−８１４に停止シグナルを有する（Ｆｉｇ１３９；配列番号：２４７）
。予測されるポリペプチド前駆体は２４７アミノ酸長であり、約２５，３３５ダ
ルトンの算定分子量及び約７．０の推定ｐＩを有する。Ｆｉｇ１４０（配列番号
：２４８）に示された全長ＰＲＯ１３４３の分析により次のものの存在が証明さ
れる：約アミノ酸１から約アミノ酸２５のシグナルペプチド及び約アミノ酸３５
から約アミノ酸２２５のサーカムスポロゾイト(circumsporozoite)反復。クロー
ンＤＮＡ６６６７５−１５８７は１９９８年９月２２日にＡＴＣＣに寄託され、
ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８２が付与された。 Ｆｉｇ１４０（配列番号：２４８）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配
列アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45
SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３４３アミノ酸配列と以下のDayhoff配
列：CSP_PLACC, CEF25H8_2, U88974_40, BNAMRNAA_1, B0B0PC3_1, S58135, AF06
1832_1, BHU52040_1, HUMPROFILE_1及びMTV023_14との間の有意な相同性が証明
された。 また、ＤＮＡ４８９２１配列と相同性を有するIncyteＥＳＴクローン（Incyte
ＥＳＴクローン番号４７０１１４８）を得て、挿入断片を配列決定し、それによ
ってＦｉｇ１３９に示されたＤＮＡ６６６７５−１５８７配列を生じた。

【０５２４】 実施例７４：ヒトＰＲＯ１４８０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例１に記載した方法を使用して、IncyteＥＳＴ番号５５０４１５及
び１６２８８４７を既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０又はそれ
以上を持つ対象配列として同定した。これらの配列をプログラム「phrap」（Phi
l Green, University of Washington, Seattle, Washington）で集団化し、コン
センサスＤＮＡ配列に構築した。このコンセンサス配列をここで「ＤＮＡ１３９
５」と命名する。また、「ＤＮＡ１３９５」コンセンサス配列をBLAST及びphrap
の繰り返しサイクルを用いて伸長し、コンセンサス配列を、上で議論したＥＳＴ
配列の供給源を用いて可能な限り伸長させた。伸長されたコンセンサス配列はこ
こで「ＤＮＡ４０６４２」と命名した。ＤＮＡ４０６４２コンセンサス配列に基
づいて、１）ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定する
ため、及び２）ＰＲＯ１４８０の全長コード化配列のクローンを単離するプロー
ブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー：AGCCCGTGCAGAATCTGCTCCTGG(40642.f1；配列番号：254
） 逆方向ＰＣＲプライマー：TGAAGCCAGGGCAGCGTCCTCTGG(40642.r1；配列番号：255
）；GTACAGGCTGCAGTTGGC(40642.r2；配列番号：256） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４０６４２配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：AGAAGCCATGTGAGCAAGTCCAGTTCCAGCCCAACACAGTG(4064
2.p1；配列番号：257）；GAGCTGCAGATCTTCTCATC GGGACAGCCCGTGCAGAATCTGCTC(40
642.p2；配列番号：258）。 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１４８０遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト胎児腎臓組
織から単離された。 上述のようにして単離されたクローンのＤＮＡ配列決定により、ここでＤＮＡ
６７９６２−１６４９［Ｆｉｇ１４１、配列番号：２５２］と命名されたＰＲＯ
１４８０の全長ＤＮＡ配列；及びＰＲＯ１４８０の誘導タンパク質配列が得られ
た。 ＰＲＯ１４８０の全コード化配列をＦｉｇ１４１（配列番号：２５２）に示す
。クローンＤＮＡ６７９６２−１６４９は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、ヌクレオチド位置２４１−２４３に見かけの翻訳開始部位を持ち、そ
してヌクレオチド位置２７５２−２７５４に見かけの停止コドンを持つ。予測さ
れるポリペプチド前駆体は８３７アミノ酸長である。Ｆｉｇ１４２に示した全長
ＰＲＯ１４８０タンパク質は約９２，７５０ダルトンの推定分子量及び約７．０
４のｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸２３−４６（ＩＩ型）及び７１８
−７３８の膜貫通ドメイン；約アミノ酸６９−７２、９６−９９、１６５−１６
８、４１０−４１３、５２５−５２８、及び６３０−６３３の潜在的なＮ-グリ
コシル化部位；及び約アミノ酸１２−３３のロイシンジッパーパターンを含む。 Ｆｉｇ１４２（配列番号：２５３）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４８０のアミノ酸配列とDayhof
f配列I48746の間の有意な相同性が明らかにされた。相同性はまたＰＲＯ１４８
０アミノ酸配列と次のDayhoff配列：S66498; P_W17658; MMU69535_1; HSU60800_
1; I48745; A49069; I48747; GGU28240_1;及びAF022946_1との間にも示された。 クローンＤＮＡ６７９６２−１６４９はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番
号２０３２９１が付与された。

【０５２５】 実施例７５：ヒトＰＲＯ１４８７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例１に記載したようにして、「ＤＮＡ８２０８」とここで呼ばれる
単一のMerckＥＳＴ、HSC2ID011を、既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコ
ア７０又はそれ以上を持つ対象配列として同定した。ＤＮＡ８２０８配列をBLAS
T及びphrapの繰り返しサイクルを用いて伸長し、配列を、上で議論したＥＳＴ配
列の供給源を用いて可能な限り伸長させた。得られたコンセンサス配列はここで
「ＤＮＡ６８８３６」と命名した。ＤＮＡ６８８３６コンセンサス配列に基づい
て、１）ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため
、及び２）ＰＲＯ１４８７の全長コード化配列のクローンを単離するプローブと
して使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー：GTGCCACTACGGGGTGTGGACGAC(54209.f1；配列番号：261
）及び 逆方向ＰＣＲプライマー：TCCCATTTCTTCCGTGGTGCCCAG(54209.r1；配列番号：262
） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレ
オチド配列を持つコンセンサスＤＮＡ６８８３６配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：CCAGAAGAAGTCCTTCATGA TGCTCAAGTACATGCACGACCACTA
C(54209.p1；配列番号：263） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１４８７遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト胎児腎臓組
織から単離された。 上述のようにして単離されたクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１４８
０の全長ＤＮＡ配列（ここでＤＮＡ６８８３６−１６５６（Ｆｉｇ１４３Ａ−Ｂ
、配列番号：２５９）と命名）；及びＰＲＯ１４８７の誘導タンパク質配列（Ｆ
ｉｇ１４４；配列番号：２６０）が得られた。 ＰＲＯ１４８７の全コード化配列をＦｉｇ１４３Ａ−Ｂ（配列番号：２５９）
に示す。クローンＤＮＡ６８８３６−１６５６は、単一のオープンリーディング
フレームを含み、ヌクレオチド位置４８９−４９１に見かけの翻訳開始部位を持
ち、そしてヌクレオチド位置２８９５−２８９７に見かけの停止コドンを持つ。
予測されるポリペプチド前駆体は８０２アミノ酸長である。Ｆｉｇ１４４に示し
た全長ＰＲＯ１４８７タンパク質は約９１，８１２ダルトンの推定分子量及び約
９．５２のｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸１−２３のシグナルペプチ
ド；約アミノ酸１８９−１９２、６２３−６２６、及び７９６−７９９の潜在的
なＮ-グリコシル化部位；及び約アミノ酸６２−６４の細胞付着配列を含む。 Ｆｉｇ１４４（配列番号：２６０）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４８７のアミノ酸配列と次のDa
yhoff配列：CET24D1_1, S44860, CELC02H6_1, CEC38H2_3, CELC17A2_5, CET09E1
1_10, CEE03H4_3, CELT22B11_3, GGU82088_1, 及びCEF56H6_1の間の有意な相同
性が明らかにされた。 クローンＤＮＡ６８８３６−１６５６は１９９８年１１月３日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５５が付与された。

【０５２６】 実施例７６：ヒトＰＲＯ１４１８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデ
ータベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳ
Ｔクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業の
ＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo
Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在
する相同性を同定した。ＥＳＴの一又は複数は胎盤組織ライブラリから取り出さ
れた。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, M
ethods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパ
ク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ
比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Sea
ttle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから
得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５８８４５と命名する。 ＤＮＡ５８８４５配列とIncyteクローン１３０６０２６内に含まれるＥＳＴ配
列との間の配列相同性に鑑みて、そのクローンを購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て
配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ１４５に示し、ここでＤＮＡ
６８８６４−１６２９と命名する。 Ｆｉｇ１４５に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置１３８−１４０に見かけの翻訳開始部位を持ち、そして
ヌクレオチド位置１１８８−１１９０の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１４５；
配列番号：２６４）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ１４６、配列番号
：２６５）は３５０アミノ酸長で、シグナルペプチドは配列番号：２６５の約ア
ミノ酸１−１９にある。ＰＲＯ１４１８は約３９，００３の算定分子量及び約５
．５９の推定ｐＩを有する。クローンＤＮＡ６８８６４−１６２９は１９９８年
９月２２日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７６が付与された
。 Ｆｉｇ１４６（配列番号：２６５）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４１８のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列（ここにデータを取り込む）：AGA1_HAEIN(免疫グロブリンａ１プロ
テアーゼ前駆体), P_W03740, CELT23E7_1, SSN6_YEAST, MMPININ_1, AB00993_1,
P_R52601, S22624, A10377_1及びMUA1_XENLAとの間の配列同一性が証明された
。

【０５２７】 実施例７７：ヒトＰＲＯ１４７２をコードするｃＤＮＡクローンの単離 Incyte配列を同定し、それがデータベースの他のタンパク質と相同性を有して
いるかどうかを決定するためにコンピュータに入力した。ＥＳＴデータベースは
、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）、及び企業のＥＳＴデータベー
ス（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含んでいた
。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2［Altschul等, Metho
ds in Enzymology 266: 460-480 (1996)］を用いてＥＳＴ配列の６フレーム翻訳
とのＥＣＤタンパク質配列の比較として実施した。既知のタンパク質をコードせ
ず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プロ
グラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washingt
on）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。 ＰＲＯ１４７２をコードするコンセンサスＤＮＡ配列をphrapを使用して他の
ＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列を、ここで「ＤＮＡ６２８
２４」と命名する。ＤＮＡ６２８２４コンセンサス配列とここで提供された他の
発見と情報に基づいて、アセンブリに見いだされた（十二指腸組織ライブラリか
らの）ＥＳＴ１５７９８４３を含むIncyteクローンを購入し全体の配列決定を行
った。 配列決定によりＦｉｇ１４７（配列番号：２６６）に示されたＰＲＯ１４７２
の全コード化配列が得られた。クローンＤＮＡ６８８６６−１６４４は単一のオ
ープンリーディングフレームを含み、配列番号：２６６のヌクレオチド位置１３
４−１３６に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１５３２−
１５３４に見かけの停止コドンを持つ。予測されるポリペプチド前駆体は４６６
アミノ酸長である。Ｆｉｇ１４８に示されるように、シグナルペプチドは配列番
号：２６７の約アミノ酸１−１７にあり、膜貫通ドメインは約アミノ酸１３１−
１５０及び２３５−２５９にある。クローンＤＮＡ６８８６６−１６４４はＡＴ
ＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８３が付与された。Ｆｉｇ１４８に
示された全長ＰＲＯ１４７２タンパク質は約５２，２７９の推定分子量及び約６
．１６のｐＩを有する Ｆｉｇ１４８（配列番号：２６７）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４７２のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列（ここにデータを取り込む）：BUTY_HUMAN, HS45P21_1, HS45P21_3,
HS45P21_5, HS45P21_4, HSU90142_1, HSU90546_1, AF033107_1, MMHC135G15_7
及びHSB73_1との間の配列同一性が証明された。

【０５２８】 実施例７８：ヒトＰＲＯ１４６１をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ここで「
ＤＮＡ１０７４７」とも呼ばれるIncyteＥＳＴクラスター番号１５９１０３と命
名された、LIFESEQ(商品名)データベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が
可能となった。次いでＤＮＡ１０７４７配列を、公的ＥＳＴデータベース（例え
ば、GenBank）及びLIFESEQ(商品名)データベースを含む種々のＥＳＴデータベー
スと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログ
ラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (199
6)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９
０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Gr
een, University of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセン
サスＤＮＡ配列を構築した。ＥＳＴの一又は複数は膵臓腫瘍組織から作成された
ライブラリから取り出された。そこから得られたコンセンサス配列を、ここで「
ＤＮＡ５９５５３」と命名する。 ＤＮＡ５９５５３配列とIncyteＥＳＴ番号２９４４５４１内に含まれるＥＳＴ
配列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローンを購入し、ｃＤＮＡ挿入物を
得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ１４９に示し、ここでＤ
ＮＡ６８８７１−１６３８と命名する。 Ｆｉｇ１４９に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置３２−３４に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置１３０１−１３０３に見いだされる停止コドンで終端する（Ｆｉｇ
１４９；配列番号：２６８）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ１５０、
配列番号：２６９）は４２３アミノ酸長である。ＰＲＯ１４６１は約４７，６９
６の算定分子量及び約８．９６の推定ｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸
２１−４０のＩＩ型膜貫通ドメイン；約アミノ酸３５９−３６６のＡＴＰ／ＧＴ
Ｐ結合部位モチーフＡ（Ｐ-ループ）；約アミノ酸２２８−２３３のトリプシン
ファミリーヒスチジン活性部位；約アミノ酸１７９−１８４、２１３−２１８、
３１７−３２２、及び３６０−３６５の潜在的なＮ-ミリストイル化部位；及び
約アミノ酸７５−７８、１６６−１６９及び２２３−２２６のＮ-グリコシル化
部位を含む。 Ｆｉｇ１５０（配列番号：２６９）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４６１のアミノ酸配列とDayhof
f配列番号P_R89435の間の有意な相同性が明らかにされた。相同性はまたＰＲＯ
１４６１アミノ酸配列と次の更なるDayhoff配列：AB002134_1, P_R89430, P_W22
987, HEPS_MOUSE, ENTK_HUMAN, P_W22986, KAL_MOUSE, ACR0_PIG, p_R57283, 及
びTRY7_ANGAとの間に存在することが分かった。 クローンＤＮＡ６８８７１−６８８７１は１９９８年９月２２日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８０が付与された。

【０５２９】 実施例７９：ヒトＰＲＯ１４１０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteＥ
ＳＴクラスター配列番号９８５０２と命名された、IncyteデータベースからのＥ
ＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を
、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータ
ベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種
々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定し
た。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Met
hods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク
質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比
較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seatt
le, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得
られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６４５１と命名する。 ＤＮＡ５６４５１配列とIncyteＥＳＴクローン番号１２５７０４６内に含まれ
るＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、IncyteＥＳＴクローン１２５０４６
を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦ
ｉｇ１５１に示し、ここでＤＮＡ６８８７４−１６２２と命名する。 クローンＤＮＡ６８８７４−１６２２は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置１５２−１５４に見かけの翻訳開始部位を持ち、そし
てヌクレオチド位置８６６−８６８の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１５１）。
予測されるポリペプチド前駆体は２３８アミノ酸長（Ｆｉｇ１５２）である。Ｆ
ｉｇ１５２に示された全長ＰＲＯ１４１０タンパク質は約２５，２６２の推定分
子量及び約６．４４のｐＩを有する。Ｆｉｇ１５２（配列番号：２７１）に示さ
れた全長ＰＲＯ１４１０配列の分析により次のものの存在が証明された：約アミ
ノ酸１から約アミノ酸２０のシグナルペプチド；約アミノ酸１９４から約アミノ
酸２２０の膜貫通ドメイン及び約アミノ酸１３２から約アミノ酸１３５の潜在的
なＮ-グリコシル化部位。クローンＤＮＡ６８８７４−１６２２は１９９８年９
月２２日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７７が付与された。 Ｆｉｇ１５２（配列番号：２７１）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４１０のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：I48652, P_R76466, HSMHC3W36A_2, EPB4_HUMAN, P_R14256, EPA8_
MOUSE, P_R77285, P_W13569, AF000560_1, 及びASF1_HELANとの間の有意な相同
性が証明された。 実施例８０：ヒトＰＲＯ１５６８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立ててアセンブリを形成した。該コンセンサス配列をここ
で「ＤＮＡ５４２０８」と命名する。ＤＮＡ５４２０８コンセンサス配列、ここ
に提供されたアセンブリ及び他の情報及び発見に基づいて、アセンブリ内のＥＳ
Ｔを含むクローンを注文し配列決定した。ＥＳＴはIncyte３０８９４９０である
。全体の配列決定によりＦｉｇ１５３に示した配列が得られた。 ＰＲＯ１５６８の全コード化配列はＦｉｇ１５３（配列番号：２７２）に含ま
れる。クローンＤＮＡ６８８８０−１６７６は単一のオープンリーディングフレ
ームを含み、配列番号：２７２のヌクレオチド位置２０８−２１０に見かけの翻
訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１１２３−１１２５に見かけの停止
コドンを持つ。予測されるポリペプチド前駆体は３０５アミノ酸長である。シグ
ナルペプチド、膜貫通領域、Ｎ-ミリストイル化部位及びアミド化部位はまたＦ
ｉｇ１５４に示した。クローンＤＮＡ６８８８０−１６７６はＡＴＣＣに寄託さ
れ、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１９が付与された。Ｆｉｇ１５４に示した全長Ｐ
ＲＯ１５６８タンパク質は約３５，３８３ダルトンの推定分子量及び約５．９９
のｐＩを有する。 Ｆｉｇ１５４（配列番号：２７３）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５６８のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列（ここに取り込む）：AF089749_1, AF054841_1, NAG2_HUMAN, CD63_
HUMAN, CD82_HUMAN, P_W05732, P_R86834, A15_HUMAn, P_W27333及びCD37_HUMAN
との間の配列同一性が明らかにされた。

【０５３０】 実施例８１：ヒトＰＲＯ１５７０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してＰＲＯ１
５７０をコードするコンセンサスＤＮＡ配列を組み立ててアセンブリを形成した
。このコンセンサス配列をここで「ＤＮＡ６５４１５」と命名する。ＤＮＡ６５
４１５コンセンサス配列と、ここに提供された他の情報と発見に基づいて、Incy
teＥＳＴ３２３２２８５を含むクローン（子宮／大腸ガン組織ライブラリ）を購
入し、全体を配列決定し、配列番号：２７４が得られた。 ＰＲＯ１５７０の全コード化配列はＦｉｇ１５５（配列番号：２７４）に含ま
れる。クローンＤＮＡ６８８８５−１６７８は単一のオープンリーディングフレ
ームを含み、配列番号：２７４のヌクレオチド位置２１０−２１２に見かけの翻
訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１５０６−１５０８に見かけの停止
コドンを持つ。予測されるポリペプチド前駆体は４３２アミノ酸長である。Ｆｉ
ｇ２７５は多数のモチーフを示す。クローンＤＮＡ６８８８５−１６７８はＡＴ
ＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１１が付与された。Ｆｉｇ１５６に
示した全長ＰＲＯ１５７０タンパク質は約４７，６４４ダルトンの推定分子量及
び約５．１８のｐＩを有する。 Ｆｉｇ１５６（配列番号：２７５）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５７０のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列（ここに取り込む）：P_W22986, TMS2_HUMAN, HEPS_HUMAN, P_R8943
5, AB002134_1, KAL_MOUSE, ACRO_HUMAN, GEN12917, AF045649_1, 及びP_W34285
との間の配列同一性が明らかにされた。

【０５３１】 実施例８２：ヒトＰＲＯ１３１７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐを使用
して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここで「Consen
８８６５」と命名した。また、Consen８８６５コンセンサス配列をBLAST及びphr
apの繰り返しサイクルを用いて伸長し、コンセンサス配列を上で議論したＥＳＴ
配列の供給源を用いて可能な限り伸長させた。伸長されたコンセンサス配列をこ
こで「ＤＮＡ６３３３４」と命名する。ＤＮＡ６３３３４コンセンサス配列に基
づいて、１）ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定する
ため、及び２）ＰＲＯ１３１７の全長コード化配列のクローンを単離するプロー
ブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー：CTGCTGGTGAAATCTGGCGTGGAG（63334.f1；配列番号：27
8）；及び 逆方向ＰＣＲプライマー：GTCTGGTCCTGGCTGTCCACCCAG（63334.r1；配列番号：27
9）。 また、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ６３３３４配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：CATCTTGTCATGTACCTGGGAACCACCACA GGGTCGCTCCACAAG
（63334.p1；配列番号：280） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３１７遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト海馬組織
から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３１７の全
長ＤＮＡ配列（ここでＤＮＡ７１１６６−１６８５と命名［Ｆｉｇ１５７、配列
番号：２７６］）及びＰＲＯ１３１７の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１３１７の全コード化配列をＦｉｇ１５７（配列番号：２７６）に示す
。クローンＤＮＡ７１１６６−１６８５は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、ヌクレオチド位置１０５−１０７に見かけの翻訳開始部位を持ち、そ
してヌクレオチド位置２３８８−２３９０に見かけの停止コドンを持つ。予測さ
れるポリペプチド前駆体は７６１アミノ酸長であり、約８３，５７４ダルトンの
推定分子量及び約６．７８のｐＩを有する。 Ｆｉｇ１５８（配列番号：２７７）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３１７のアミノ酸配列とDayhof
f配列番号I48745との間の有意な相同性が明らかにされた。相同性がまたＰＲＯ
１３１７アミノ酸配列と次のDayhoff配列：I48746, GEN13418, P_W58540, P_217
657, MUSC1_1, P_471380, U73167_5, HSU33920_1, 及びGG828240_1との間で明ら
かにされた。 クローンＤＮＡ７１１６６−１６８５は１９９８年１０月２０日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５５が付与された。

【０５３２】 実施例８３：ヒトＰＲＯ１７８０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 ＤＮＡ６３８３７.init配列を、上記実施例１に記載したようにして得て、BLA
STとプログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle）
の繰り返しサイクルを使用して拡張し、上で検討したＥＳＴ配列の供給源を使用
してできるだけ多くコンセンサス配列を拡張させた。拡張させたコンセンサス配
列をここで「ＤＮＡ６３８３７」と命名した。ＤＮＡ６３８３７コンセンサス配
列に基づいて、１）ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同
定するため、及び２）ＰＲＯ１７８０の全長コード化配列のクローンを単離する
プローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー：TGCCTTTGCTCACCTACCCCAAGG（63837.f1；配列番号：28
3） 逆方向ＰＣＲプライマー：TCAGGCTGGTCTCCAAAGAGAGGG（63837.r1；配列番号：28
4）。 また、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ６３８３７配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ： CCCAAAGATGTCCACCTGGCTGCAAATGTGAAAATTGTGGACTGG（63837.p1；配列番号：285） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１７８０遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト胎児腎臓
から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１７８０の全
長ＤＮＡ配列（ここでＤＮＡ７１１６９−１７０９と命名［Ｆｉｇ１５９、配列
番号：２８１］）及びＰＲＯ１７８０の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１７８０の全コード化配列をＦｉｇ１５９（配列番号：２８１）に示す
。クローンＤＮＡ７１１６９−１７０９は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、ヌクレオチド位置６８−７０に見かけの翻訳開始部位を持ち、そして
ヌクレオチド位置１６３７−１６３９に見かけの停止コドンを持つ。予測される
ポリペプチド前駆体は５２３アミノ酸長である。Ｆｉｇ１６０に示した全長ＰＲ
Ｏ１７８０タンパク質は約５９，５８１ダルトンの推定分子量及び約８．６８の
ｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸１−１９のシグナルペプチド；約アミ
ノ酸４８３−５０４の膜貫通ドメイン；約アミノ酸６８−７４及び４２５−４３
３のチロシンリン酸化部位；約アミノ酸１６−２１、３０１−２０６、３７０−
３７５、及び４９４−４９９のＮ-ミリストイル化部位；及び約アミノ酸４９３
−５１４のロイシンジッパーパターンを含む。 Ｆｉｇ１６０（配列番号：２８２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１７８０のアミノ酸配列とDayhof
f配列：UDA2_RABIT, CGT_HUMAN, UD11_HUMAN, P_R26153, UDB1_RAT, HSU59209_1
, AB010872_1, UDB5_MOUSE, UDB8_HUMAN, 及びUD14_HUMANとの間の有意な相同性
が明らかにされた。 クローンＤＮＡ７１１６９−１７０９は１９９８年１１月１７日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６７が付与された。

【０５３３】 実施例８４：ヒトＰＲＯ１４８６をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例１に記載したようにphrapを使用してコンセンサスＤＮＡ配列を
他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここで「ＤＮＡ４８
８９７」と命名した。ＤＮＡ４８８９７コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣ
Ｒにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）Ｐ
ＲＯ１４８６の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用する
ために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー：5'AGGCAGCCACCAGCTCTGTGCTAC3'(配列番号：288）；及
び 逆方向ＰＣＲプライマー：5'CAGAGAGGGAAGATGAGGAAGCCAGAG3'（配列番号：289） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレ
オチド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４８８９７配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：5'CTGTGCTACTGCCCTTGGAC CCTGGGGACCGAGTGTCTCTGC3
'(配列番号：290）。 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１４８６遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト腺ガン株化
細胞から単離された。 上述のようにして単離されたクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１４８
６の全長ＤＮＡ配列及びＰＲＯ１４８６の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１４８６の全コード化配列をＦｉｇ１６１（配列番号：２８６）に示す
。クローンＤＮＡ７１１８０−１６５５は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、配列番号：２８６のヌクレオチド位置４７２−４７４に見かけの翻訳
開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１０８７−１０８９に見かけの停止コ
ドンを持つ。予測されるポリペプチド前駆体は２０５アミノ酸長である。シグナ
ルペプチドは配列番号：２８７の約アミノ酸１−３２にある。Ｃ１ｑのものに類
似の領域とＮ-グリコシル化部位はＦｉｇ１６２に示されるように位置している
。クローンＤＮＡ７１１８０−１６５５はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番
号２０３４０３が付与された。Ｆｉｇ１６２に示した全長ＰＲＯ１４８６タンパ
ク質は約２１，５２１ダルトンの推定分子量及び約７．０７のｐＩを有する。 Ｆｉｇ１６２（配列番号：２８７）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４８６のアミノ酸配列と次のDa
yhoff配列：CERB_HUMAN, CERL_RAT, GEN11893, P_R22263, CA18_HUMAN, C1QC_HU
MAN, AF054891_1, A57131, HUMC1Qb2_1, ACR3_MOUSEの間の配列同一性が明らか
にされた。

【０５３４】 実施例８５：ヒトＰＲＯ１４３３をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例１に記載したようにphrapを使用してコンセンサスＤＮＡ配列を
他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここでＤＮＡ４５２
３０と命名した。ＤＮＡ４５２３０コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲに
より対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ
１４３３の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するため
に、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（45230.f1）：5'-GCTGACCTGGTTCCCATCTACTCC-3'(配列
番号：293） 逆方向ＰＣＲプライマー（45230.r1）：5'-CCCACAGACACCCATGACACTTCC-3'（配列
番号：294） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレ
オチド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４５２３０配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ（45230.p1）：5'-AAGAATGAATTGTACAAAGC AGGTGATCTT
CGAGGAGGGCTCCTGGGGCC-3'(配列番号：295）。 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１４３３遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト副腎組織か
ら単離された。 上述のようにして単離されたクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１４３
３の全長ＤＮＡ配列（ここでＤＮＡ７１１８４−１６３４[Ｆｉｇ１６３、配列
番号：２９１]と命名）；及びＰＲＯ１４３３の誘導タンパク質配列が得られた
。 ＤＮＡ７１１８４−１６３４の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ１６３（配列番号
：２９１）に示す。クローンＤＮＡ７１１８４−１６３４は、単一のオープンリ
ーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置１８５−１８７に見かけの翻訳開
始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１３４９−１３５１の見かけの停止コド
ンで終端する（Ｆｉｇ１６３）。予測されるポリペプチド前駆体は３８８アミノ
酸長である（Ｆｉｇ１６４）。Ｆｉｇ１６４に示した全長ＰＲＯ１４３３タンパ
ク質は約４３，８３１ダルトンの推定分子量及び約９．６４のｐＩを有する。Ｆ
ｉｇ１６４（配列番号：２９２）に示された全長ＰＲＯ１４３３の分析により次
のものの存在が証明される：約アミノ酸７６から約アミノ酸９７の膜貫通ドメイ
ン；約アミノ酸６０から約アミノ酸６３、約アミノ酸１７３から約アミノ酸１７
６及び約アミノ酸２２８から約アミノ酸２３１の潜在的なＮ-グリコシル化部位
及び約アミノ酸１０から約アミノ酸１５、約アミノ酸４１から約アミノ酸４６、
約アミノ酸８４から約アミノ酸８９、約アミノ酸１２０から約アミノ酸１２５、
約アミノ酸１６９から約アミノ酸１７４、約アミノ酸２２９から約アミノ酸２３
４、約アミノ酸２４０から約アミノ酸２４５、約アミノ酸３１８から約アミノ酸
３２３及び約アミノ酸３７８から約アミノ酸３８３の潜在的なＮ-ミリストイル
化部位。クローンＤＮＡ７１１８４−１６３４は１９９８年９月２２日にＡＴＣ
Ｃに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２６６が付与された。 Ｆｉｇ１６４（配列番号：２９２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４３３のアミノ酸配列と次のDa
yhoff配列：CELW01A11_4, CEF59A1_4, S67138, MTV050_3, S75135及びS12411の
間の有意な相同性が証明された。

【０５３５】 実施例８６：ヒトＰＲＯ１４９０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐ方法を
使用して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここでＤＮ
Ａ６７００６と命名した。ＤＮＡ６７００６コンセンサス配列に基づいて、１）
ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２
）ＰＲＯ１４９０の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用
するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（67006.f1）5'-CTTCCTCTGTGGGTGGACCATGTG-3'（配列番
号：298） 逆方向ＰＣＲプライマー（67006.r1）5'-GCCACCTCCATGCTAACGCGG-3'（配列番号
：299） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ６７００６配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：（67006.p1）5'-CCAAGGTCCTCGCTAAGAAGGAGCTGCTCTA
CGTGCCCCTCATCG-3'（配列番号：300） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１４９０遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト副腎組織
から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１４９０の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ７１２１３−１６５９とここで命名[Ｆｉｇ１６５、配列
番号：２９６]）；及びＰＲＯ１４９０の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ７１２１３−１６５９の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ１６５（配列番号
：２９６）に示す。クローンＤＮＡ７１２１３−１６５９は、単一のオープンリ
ーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置２７２−２７４に見かけの翻訳開
始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１３７６−１３７８の見かけの停止コド
ンで終端する（Ｆｉｇ１６５）。予測されるポリペプチド前駆体は３６８アミノ
酸長である（Ｆｉｇ１６６）。Ｆｉｇ１６６に示す全長ＰＲＯ１４９０タンパク
質は約４２，５５０ダルトンの推定分子量及び約９．１１のｐＩを有する。Ｆｉ
ｇ１６６（配列番号：２９７）に示す全長ＰＲＯ１４９０配列の分析により次の
ものの存在が証明される：約アミノ酸１から約アミノ酸２５のシグナルペプチド
、約アミノ酸３０７から約アミノ酸３２３及び約アミノ酸３３５から約アミノ酸
３５２の膜貫通ドメイン及び約アミノ酸１６０から約アミノ酸１６８及び約アミ
ノ酸１６１から約アミノ酸１６８のチロシンキナーゼリン酸化部位。クローンＤ
ＮＡ７１２１３−１６５９は１９９８年１０月２７日にＡＴＣＣに寄託され、Ａ
ＴＣＣ寄託番号２０３４０１が付与された。 Ｆｉｇ１６６（配列番号：２９７）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４９０のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：A52744_1, S60478, P_R99249, P_R59712, YBP2_YEAST, S54641, C
ELT05H4_15, CELF28B3_1, CELZK40_1及びYIHG_ECOLIとの間の有意な相同性が証
明された。

【０５３６】 実施例８７：ヒトＰＲＯ１４８２をコードするｃＤＮＡクローンの単離 天然のヒトＰＲＯ１４８２ポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮ
Ａ７１２３４−１６５１）を、一次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優勢に示すヒ
ト胎児副腎ｃＤＮＡライブラリにおいて、酵母スクリーニングを使用して同定し
た。 Ｆｉｇ１６７に示した全長ＤＮＡ７１２３４−１６５１クローンは単一のオー
プンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置３３−３５に見かけの翻訳
開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置４６２−４６４の停止コドンで終端す
る（Ｆｉｇ１６７）。予測されるポリペプチド前駆体は１４３アミノ酸長である
（Ｆｉｇ１６８）。Ｆｉｇ１６８に示した全長ＰＲＯ１４８２は約１５，６２４
ダルトンの推定分子量及び約９．５８のｐＩを有する。Ｆｉｇ１６８（配列番号
：３０２）に示す全長ＰＲＯ１４８２配列の分析により次のものの存在が証明さ
れる：約アミノ酸１から約アミノ酸２８のシグナルペプチド。クローンＤＮＡ７
１２３４−１６５１は１９９８年１０月２７日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ
寄託番号２０３４０２が付与された。 Ｆｉｇ１６８（配列番号：３０２）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配
列アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45
SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４８２アミノ酸配列と以下のDayhoff配
列：A18267_3との間の優位な相同性が証明された。

【０５３７】 実施例８８：ヒトＰＲＯ１４４６をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデ
ータベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳ
Ｔクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業の
ＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo
Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在
する相同性を同定した。ＥＳＴの一又は複数は膵島細胞ライブラリから取り出さ
れた。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, M
ethods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパ
ク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ
比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Sea
ttle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから
得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６５１４と命名する。 ＤＮＡ５６５１４配列とIncyteＥＳＴクローン番号２３８０３４４内に含まれ
るＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、このＥＳＴを含むクローンを購入し
、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ１６
９に示し、ここでＤＮＡ７１２７７−１６３６と命名する。 Ｆｉｇ１６９に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置１５２−１５４に見かけの翻訳開始部位を持ち、そして
ヌクレオチド位置４７９−４８１の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１６９；配列
番号：３０３）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ１７０；配列番号：３
０４）は１０９アミノ酸長で、シグナルペプチドは配列番号：３０４の約アミノ
酸１−１５にある。ＰＲＯ１４４６は約１１，８２２の算定分子量及び約８．６
３の推定ｐＩを有する。クローンＤＮＡ７１２７７−１６３６は１９９８年９月
２２日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８５が付与された。 Ｆｉｇ１７０（配列番号：３０４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４４６のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列（ここにデータを取り込む）：P53_CANFA, P53_FELCA, LRP1_HSV1F,
OSU57338_1, S75842, P_P93722, AF002189_1, B70408, S54309及びS53365との
間の配列同一性が明らかにされた。このリスト中の最初のものはKraegel等, Can
cer Lett., 92(2)*181-186 (1995)に更に記載されている。

【０５３８】 実施例８９：ヒトＰＲＯ１５５８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteＥ
ＳＴクラスター配列番号８６３９０と命名された、IncyteデータベースからのＥ
ＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を
、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータ
ベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種
々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定し
た。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Met
hods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク
質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比
較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seatt
le, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得
られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５８８４２と命名する。 ＤＮＡ５８８４２配列とIncyteＥＳＴクローン番号３７４６９６４内に含まれ
るＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、IncyteＥＳＴクローン番号３７４６
９６４を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配
列をＦｉｇ１７１に示し、ここでＤＮＡ７１２８２−１６６８と命名する。 クローンＤＮＡ７１２８２−１６６８は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置８４−８６に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置８７０−８７２の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１７１）。予測
されるポリペプチド前駆体は２６２アミノ酸長である（Ｆｉｇ１７２）。Ｆｉｇ
１７２に示した全長ＰＲＯ１５５８タンパク質は約２８，８０９の推定分子量及
び約８．８０のｐＩを有する。Ｆｉｇ１７２（配列番号：３０６）に示された全
長ＰＲＯ１５５８の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１から
約アミノ酸２５のシグナルペプチド、約アミノ酸８から約アミノ酸３０及び約ア
ミノ酸１０９から約アミノ酸１３０の膜貫通ドメイン、約アミノ酸１９０から約
アミノ酸１９３の潜在的なＮ-グリコシル化部位、約アミノ酸２３８から約アミ
ノ酸２４６のチロシキナーゼリン酸化部位、約アミノ酸２２から約アミノ酸２７
、約アミノ酸２８から約アミノ酸３３、約アミノ酸１１０から約アミノ酸１１５
、約アミノ酸２０５から約アミノ酸２１０及び約アミノ酸２５５から約アミノ酸
２６０のＮ-ミリストイル化部位及び約アミノ酸３１から約アミノ酸３４及び約
アミノ酸３９から約アミノ酸４２のアミド化部位。クローンＤＮＡ７１２８２−
１６６８は１９９８年１０月６日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０
３３１２が付与された。 Ｆｉｇ１７２（配列番号：３０６）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５５８のアミノ酸配列と次のDa
yhoff配列：AF075724_2, MXU24657_3, CAMT_EUCGU, MSU20736_1, P_R29515, B70
431, JC4004, CEY32B12A_3, CELF53B3_2及びP_R13543の間の有意な相同性が証明
された。

【０５３９】 実施例９０：ヒトＰＲＯ１６０４をコードするｃＤＮＡクローンの単離 発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Phar
maceuticals、Palo Alto, CA）を検索した。IncyteＥＳＴ番号３５５０４４０が
ＨＤＧＦと相同性を有するとして同定された。ついで、ＥＳＴ番号３５５０４４
０を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及びLIFESEQ(商品名)データ
ベースを含む様々なＥＳＴデータベースと比較して、相同性ＥＳＴ配列を同定し
た。検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2［Altschul等, Methods i
n Enzymology 266: 460-480 (1996)］を用いて実施した。既知のタンパク質をコ
ードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は
、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Wa
shington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られた
コンセンサス配列を、ここで「ＤＮＡ６７２３７」と命名する。 ＤＮＡ６７２３７配列とLIFESEQデータベースからのＥＳＴ番号３３６７０６
０との間の配列相同性に鑑みて、IncyteＥＳＴ番号３３６７０６０を含むクロー
ン購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定し、Ｆｉｇ１７３（配列番号：３０７
）に示されるＰＲＯ１６０４の全コード化配列を得た。 クローンＤＮＡ７１２８６−１６８７は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置６５−６７に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置２０７８−２０８０の停止コドンで終端する。予測されるポリペ
プチド前駆体は６７１アミノ酸長である。Ｆｉｇ１７４に示した全長ＰＲＯ１６
０４タンパク質は約７４，３１７の推定分子量及び約７．６２のｐＩを有する。
更なる特徴は、約アミノ酸１−１３のシグナルペプチド；約アミノ酸１５６−１
５９、１７１−１７４、及び４５１−４５４のｃＡＭＰ及びｃＧＭＰ依存性プロ
テインキナーゼリン酸化部位；及び約アミノ酸６６１−６６３の細胞付着配列を
含む。 Ｆｉｇ１７４（配列番号：３０８）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１６０４のアミノ酸配列とDayhof
f配列番号P_W37483との間の有意な相同性が明らかにされた。相同性はまたＰＲ
Ｏ１６０４アミノ酸配列と次のDayhoff配列：AF063020_1, P_R66727, P_W37482,
JC5661, CEC25A1_11, CEU33058_1, I38073, MST2_DROHY, 及びHSATRX36_1の間
にも示された。 クローンＤＮＡ７１２８６−１６８７は１９９８年１０月２０日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５７が付与された。

【０５４０】 実施例９１：ヒトＰＲＯ１４９１をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐ方法を
使用して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここでＤＮ
Ａ６７２０２と命名した。ＤＮＡ６７２０２コンセンサス配列に基づいて、１）
ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２
）ＰＲＯ１４９１の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用
するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（67202.f1）5'-CAACGCAGCCGTGATAAACAAGTGG-3'（配列
番号：311） 逆方向ＰＣＲプライマー（67202.r1）5'-GCTTGGACATGTACCAGGCCGTGG-3'（配列番
号：312） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ６７２０２配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：（67202.p1）5'-GGCCAGACTGATTTGCTCAATTCCTGGAAGT
GATGGGGCAGATAC-3'（配列番号：313） ｃＤＮＡライブラリの作成に対するＲＮＡはヒト大動脈内皮細胞組織から単離
された。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１４９１の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ７１８８３−１６６０とここで命名[Ｆｉｇ１７５、配列
番号：３０９]）；及びＰＲＯ１４９１の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ７１８８３−１６６０の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ１７５（配列番号
：３０９）に示す。クローンＤＮＡ７１８８３−１６６０は、単一のオープンリ
ーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置１０７−１０９に見かけの翻訳開
始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置２４３８−２４４０の見かけの停止コド
ンで終端する（Ｆｉｇ１７５）。予測されるポリペプチド前駆体は７７７アミノ
酸長である（Ｆｉｇ１７６）。Ｆｉｇ１７６に示す全長ＰＲＯ１４９１タンパク
質は約８９，６５１ダルトンの推定分子量及び約７．９７のｐＩを有する。Ｆｉ
ｇ１７６（配列番号：３１０）に示す全長ＰＲＯ１４９１配列の分析により次の
ものの存在が証明される：約アミノ酸１から約アミノ酸３６のシグナルペプチド
、約アミノ酸１３９から約アミノ酸１４２、約アミノ酸６０７から約アミノ酸６
１０及び約アミノ酸７２４から約アミノ酸７２７の潜在的なＮ-グリコシル化部
位、約アミノ酸５７１から約アミノ酸５７６のチロシンキナーゼリン酸化部位及
び約アミノ酸３２から約アミノ酸３７のグラム陽性球菌表面タンパク質アンカー
ヘキサペプチド配列。クローンＤＮＡ７１８８３−１６６０は１９９８年１１月
１７日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７５が付与された。 Ｆｉｇ１７６（配列番号：３１０）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４９１のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：GGU28240_1, MUSC1_1, D49423, MMSEMH_1, AB002329_1, AF022947
_1, HSU33920_1, HUMLUCA19_1, G01856及びAF022946_1との間の有意な相同性が
証明された。

【０５４１】 実施例９２：ヒトＰＲＯ１４３１をコードするｃＤＮＡクローンの単離 発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Phar
maceuticals、Palo Alto, CA）を検索して、ＳＨ３と相同性を示したＥＳＴ（成
人脳幹組織から単離）を同定した（１３７０１４１、ＤＮＡ６６５０５）。ｃＤ
ＮＡライブラリの作成のためのＲＮＡはヒト骨髄から単離した。単離されたＥＳ
Ｔに対応する全長ｃＤＮＡをｐＲＫ５中でのインビトロクローニング法（ＤＮＡ
７３４０１−１６３３）を使用して単離した。 ヒトＰＲＯ１４３１をコードするｃＤＮＡクローンを単離するために使用した
ｃＤＮＡライブラリは、Invitrogen, San Diego, CAからのもののような商業的
に入手できる試薬を使用する標準的な方法により作成した。ｃＤＮＡは、Ｎｏｔ
Ｉ部位を含むオリゴｄＴでプライムし、平滑末端でＳａｌＩヘミキナーゼアダプ
ターに結合させ、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動で適当にサイズ分類し、そし
て適切なクローニングベクター（ｐＲＫＢ又はｐＲＫ５Ｄ等；ｐＲＫ５ＢはＳｆ
ｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Holmes等, Science, 253: 1278
-1280 (1991)参照）に、独特のＸｈｏＩ及びＮｏｔＩ部位において、所定の方向
でクローニングした。 ｃＤＮＡクローンは全体を配列決定した。ＤＮＡ７３４０１−１６３３（配列
番号：３１４）の全ヌクレオチド配列はＦｉｇ１７７に示される。クローンＤＮ
Ａ７３４０１−１６３３は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレ
オチド位置６３０−６３２に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド
位置１７４０−１７４２に停止コドンを持つ。ＤＮＡ７３４０１−１６３３によ
りコードされる予測ポリペプチド前駆体は３７０アミノ酸長である。クローンＤ
ＮＡ７３４０１（ＤＮＡ７３４０１−１６３３と命名）はＡＴＣＣに寄託され、
ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７３が付与された。 全長配列の（ALIGNコンピュータプログラムを使用する）配列アラインメント
分析法に基づいて、ＰＲＯ１４３１は、SH3P17として知られているタンパク質を
含むSH3であるSH17_HUMANと有意なアミノ酸配列同一性を示す。更なる有意な同
一性は、D89164_1, AF032118_1, EXLP_TOBAC, YHR4_YEAST, S46992, RATP130CAS
_2, AF043259_1, RATP130CAS_1及びMYSC_ACACAとも見いだされた。

【０５４２】 実施例９３：ヒトＰＲＯ１５６３をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐ方法を
使用して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここでＤＮ
Ａ６７１９１と命名した。ＤＮＡ６７１９１コンセンサス配列に基づいて、１）
ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２
）ＰＲＯ１５６３の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用
するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（67191.f1）5'-CCCTGAAGCTGCCAGATGGCTCC-3'（配列番
号：318） 逆方向ＰＣＲプライマー（67191.r1）5'-CTGTGCTCTTCGGTGCAGCCAGTC-3'（配列番
号：319） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ６７１９１配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：（67191.p1）5'-CCACAGATGTGGTACTGCCTGGGGCAGTCAG
CTTGCGCTACAG-3'（配列番号：320） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１５６３遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト骨髄組織
から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１５６３の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ７３４９２−１６７１とここで命名[Ｆｉｇ１７９Ａ−Ｂ
、配列番号：３１６]）；及びＰＲＯ１５６３の誘導タンパク質配列が得られた
。 ＤＮＡ７３４９２−１６７１の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ１７９Ａ−Ｂ（配
列番号：３１６）に示す。クローンＤＮＡ７３４９２−１６７１は、単一のオー
プンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置４１９−４２１に見かけの
翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置２９３０−２９３２の見かけの停
止コドンで終端する（Ｆｉｇ１７９Ａ−Ｂ）。予測されるポリペプチド前駆体は
８３７アミノ酸長である（Ｆｉｇ１８０）。Ｆｉｇ１８０に示す全長ＰＲＯ１５
６３タンパク質は約９０，１６７ダルトンの推定分子量及び約８．３９のｐＩを
有する。Ｆｉｇ１８０（配列番号：３１７）に示す全長ＰＲＯ１５６３配列の分
析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１から約アミノ酸４８のシグ
ナルペプチド、約アミノ酸６から約アミノ酸７１の潜在的なＮ-グリコシル化部
位、約アミノ酸１８８から約アミノ酸１９１及び約アミノ酸７７２から約アミノ
酸７７５のグリコサミノグリカン付着部位、約アミノ酸１８２から約アミノ酸１
８５のｃＡＭＰ及びｃＧＭＰ依存性プロテインキナーゼリン酸化部位；約アミノ
酸７３０から約アミノ酸７３６のチロシンキナーゼリン酸化部位、約アミノ酸５
から約アミノ酸１０、約アミノ酸１９から約アミノ酸２４、約アミノ酸１２１か
ら約アミノ酸１２６、約アミノ酸１２５から約アミノ酸１３０、約アミノ酸１３
０から約アミノ酸１３５、約アミノ酸１４７から約アミノ酸１５２、約アミノ酸
１６７から約アミノ酸１７２、約アミノ酸１６８から約アミノ酸１７３、約アミ
ノ酸１７４から約アミノ酸１７９、約アミノ酸３２３から約アミノ酸３２８、約
アミノ酸３５２ら約アミノ酸３５７、約アミノ酸５３９から約アミノ酸５４４、
約アミノ酸５５５から約アミノ酸５６０、約アミノ酸５７７から約アミノ酸５８
２、約アミノ酸６７９から約アミノ酸６８４、約アミノ酸６８２から約アミノ酸
６８７、及び約アミノ酸７６３から約アミノ酸７６８の潜在的なＮ-ミリストイ
ル化部位、約アミノ酸５６０から約アミノ酸５６３及び約アミノ酸８３４から約
アミノ酸８３７のアミド化部位、約アミノ酸１７から約アミノ酸３８及び約アミ
ノ酸２４から約アミノ酸４５のロイシンジッパーパターン配列及び約アミノ酸３
５８から約アミノ酸３６７の中性亜鉛メタロペプチダーゼ、亜鉛結合領域シグネ
チャー配列。クローンＤＮＡ７３４９２−１６７１は１９９８年１０月６日にＡ
ＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２４が付与された。 Ｆｉｇ１８０（配列番号：３１７）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５６３のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：AB014588_1, D67076_1, AB001735_1, P_W47028, AB002364_1, P_W
47029, GEN13695, P_R40823, AF005665_1及びDISA_TRIGAとの間の有意な相同性
が証明された。

【０５４３】 実施例９４：ヒトＰＲＯ１５６５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐ方法を
使用して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここでＤＮ
Ａ６７１８３と命名した。ＤＮＡ６７１８３コンセンサス配列とIncyteＥＳＴク
ローン番号２５１０３２０内に含まれるＥＳＴ配列との間の観察された相同性に
基づいて、IncyteＥＳＴクローン番号２５１０３２を購入し、その挿入断片を得
て配列決定した。その挿入断片配列はＦｉｇ１８１に示され、ここでＤＮＡ７３
７２７−１６７３（配列番号：３２１）と命名される。 ＤＮＡ７３７２７−１６７３の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ１８１（配列番号
：３２１）に示す。クローンＤＮＡ７３７２７−１６７３は、単一のオープンリ
ーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置５９−６１に見かけの翻訳開始部
位を持ち、そしてヌクレオチド位置１０１０−１０１２の見かけの停止コドンで
終端する（Ｆｉｇ１８１）。予測されるポリペプチド前駆体は３１７アミノ酸長
である（Ｆｉｇ１８２）。Ｆｉｇ１８２に示す全長ＰＲＯ１５６５タンパク質は
約３７，１３０ダルトンの推定分子量及び約５．１８のｐＩを有する。Ｆｉｇ１
８２（配列番号：３２２）に示す全長ＰＲＯ１５６５配列の分析により次のもの
の存在が証明される：約アミノ酸１から約アミノ酸４０のシグナルペプチド、約
アミノ酸２５から約アミノ酸４７の潜在的なＩＩ型膜貫通ドメイン、約アミノ酸
９４ら約アミノ酸９７及び約アミノ酸１８０から約アミノ酸１８３の潜在的なＮ
-グリコシル化部位、約アミノ酸９２から約アミノ酸９５、約アミノ酸７０から
約アミノ酸７３、約アミノ酸８５から約アミノ酸８８、約アミノ酸１３３から約
アミノ酸１３６、約アミノ酸１４８から約アミノ酸１５１、約アミノ酸１９２か
ら約アミノ酸１９５及び約アミノ酸２３９から約アミノ酸２４２のグリコサミノ
グリカン付着部位、約アミノ酸３３から約アミノ酸３８、約アミノ酸９５から約
アミノ酸１００、約アミノ酸１１６から約アミノ酸１２１、約アミノ酸２１５か
ら約アミノ酸２２０及び約アミノ酸２７２から約アミノ酸２７７の潜在的なＮ-
ミリストイル化部位、約アミノ酸３１５から約アミノ酸３１７の微小体Ｃ末端標
的シグナル配列及び約アミノ酸９から約アミノ酸１４のチトクロムＣファミリー
ヘム結合部位シグネチャー配列。クローンＤＮＡ７３７２７−１６７３は１９９
８年１１月３日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４５９が付与さ
れた。 Ｆｉｇ１８２（配列番号：３２２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５６５アミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列：AF051425_1, P_R65488, GRPE_STAAU, RNU31330_1, ACCD_BRANA, D50
558_1, HUMAMYAB3_1, P_W34452及びP_P50629との間の有意な相同性が証明された
。

【０５４４】 実施例９５：ヒトＰＲＯ１５７１をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐ方法を
使用して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここでＤＮ
Ａ６９５５９と命名した。ＤＮＡ６９５５９コンセンサス配列とIncyteＥＳＴク
ローン番号３１４０７６０内に含まれるＥＳＴ配列との間の観察された相同性に
基づいて、IncyteＥＳＴクローン番号３２４０７６０を購入し、その挿入断片を
得て配列決定した。その挿入断片配列はＦｉｇ１８３に示され、ここでＤＮＡ７
３７３０−１６７９と命名される。 クローンＤＮＡ７３７３０−１６７９は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、ヌクレオチド位置９０−９２に見かけの翻訳開始部位を持ち、そして
ヌクレオチド位置８０７−８０９の見かけの停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１８
３）。予測されるポリペプチド前駆体は２３９アミノ酸長である（Ｆｉｇ１８４
）。Ｆｉｇ１８４に示す全長ＰＲＯ１５７１タンパク質は約２５，６９９ダルト
ンの推定分子量及び約８．９９のｐＩを有する。Ｆｉｇ１８４（配列番号：３２
４）に示す全長ＰＲＯ１５７１配列の分析により次のものの存在が証明される：
約アミノ酸１から約アミノ酸２１のシグナルペプチド及び約アミノ酸８２から約
アミノ酸１０３、約アミノ酸１１５から約アミノ酸１４１及び約アミノ酸１６０
から約アミノ酸１８２の膜貫通ドメイン。クローンＤＮＡ７３７３０−１６７９
は１９９８年１０月６日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２０
が付与された。 Ｆｉｇ１８４（配列番号：３２４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５７１アミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列：AF072128_1, AB000712_1, AB000714_1, AF007189_1, AF000959_1, A
F068863_1, P_W15288, PM22_HUMAN, P_R30056及びLSU46824_1との間の有意な相
同性が証明された。 実施例９６：ヒトＰＲＯ１５７２をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載した方法を使用してコンセンサス配列を得た。 該コンセンサス配列はここで「ＤＮＡ６９５６０」と命名される。ＤＮＡ６９
５６０コンセンサス配列とここに提供した他の情報に基づいて、アセンブリから
他のＥＳＴを含む ＰＲＯ１５７３の全コード化配列はＦｉｇ１８５（配列番号
：３２５）に示される。クローンＤＮＡ７３７３４−１６８０は、単一のオープ
ンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置９０−９２に見かけの翻訳開
始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置８７３−８７５に見かけの停止コドンを
持つ。予測されるポリペプチド前駆体は２６１アミノ酸長である。シグナルペプ
チドは配列番号：３２６の約アミノ酸１−２３にあり、膜貫通ドメインは約８１
−１００、１２１−１４１、及び１７３−１９４にある。膜貫通ドメインの一又
は複数は欠失されるか不活性化されうる。Ｎ-グリコシル化部位、Ｎ-ミリストイ
ル化部位、チロシンキナーゼリン酸化部位及び原核生物膜リポタンパク質脂質付
着部位はＦｉｇ１８６に示される。クローンＤＮＡ７３７３４−１６８０はＡＴ
ＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３６３が付与された。Ｆｉｇ１８６に
示す全長ＰＲＯ１５７２タンパク質は約２７，８５６ダルトンの推定分子量及び
約８．５のｐＩを有する。 Ｆｉｇ１８６（配列番号：３２６）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５７２アミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列（ここに取り込む）：AF072127_1, HSU89916_1, AB000713_1, AB00071
4_1, AB000712_1, AF000959_1, AF072128_1, AF068863_1, P_W29881, 及びP_W58
869との間の配列同一性が明らかにされた。

【０５４５】 実施例９７：ヒトＰＲＯ１５７３をコードするｃＤＮＡクローンの単離 ＥＳＴ３６２８９９０をIncyteデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Phar
maceuticals、Palo Alto, CA）において同定し、データベース中の他の配列との
比較において伸展してアセンブリを形成した。アラインメント検索を、コンピュ
ータプログラムBLAST又はBLAST2［Altschul等, Methods in Enzymology 266: 46
0-480 (1996)］を用いてＥＳＴ配列の６フレーム翻訳とのＥＣＤタンパク質配列
の比較として実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９
０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Gr
een, University of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセン
サスＤＮＡ配列を構築した。コンセンサス配列をここで「ＤＮＡ６９５６１」と
命名する。 ＤＮＡ６９５６１コンセンサス配列とここに提供された他の情報と発見に基づ
いて、アセンブリからの他のＥＳＴ（IncyteＤＮＡ３７５２６５７）を含むクロ
ーンを購入し、配列決定した。このクローンは乳房腫瘍組織ライブラリからのも
のであった。 ＰＲＯ１５７３の全コード化配列はＦｉｇ１８７（配列番号：３２７）に含ま
れる。クローンＤＮＡ７３７３５−１６８１は単一のオープンリーディングフレ
ームを含み、ヌクレオチド位置９７−９９に見かけの翻訳開始部位を持ち、そし
てヌクレオチド位置７７２−７７４に見かけの停止コドンを持つ。予測されるポ
リペプチド前駆体は２２５アミノ酸長である。シグナルペプチドは配列番号：３
２８の約アミノ酸１−１７にあり、膜貫通ドメインは約アミノ酸８２−１０１、
１１８−１４５、及び１６４−１８８にある。膜貫通ドメインの一又は複数は欠
失されるか不活性化されうる。リン酸化部位、アミド化部位、及びＮ-ミリスト
イル化部位はＦｉｇ１８８に示される。クローンＤＮＡ７３７３５−１６８１は
ＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５６が付与された。Ｆｉｇ１８
８に示す全長ＰＲＯ１５７３タンパク質は約２４，８４５ダルトンの推定分子量
及び約９．０７のｐＩを有する。 Ｆｉｇ１８８（配列番号：３２８）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５７３のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列（ここに取り込む）：AF007189_1, AB000714_1, AB000713_1, AB000
712_1, A39484, AF000959_1, AF072127_, AF072128_1, AF68863_1及びAF077739_
1との間の配列同一性が明らかにされた。

【０５４６】 実施例９８：ヒトＰＲＯ１４８８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Phar
maceuticals、Palo Alto, CA）を検索してＥＳＴ番号３６３９１１２Ｈ１をＣＰ
Ｅ-Ｒと相同性を有するものとして同定した。ＥＳＴ番号３６３９１１２Ｈ１は
ここで「ＤＮＡ６９５６２」と命名される。ＥＳＴクローン３６３９１１２Ｈ１
は、パトー症候群で死亡した２０週齢の胎児の肺組織ライブラリから取り出され
たもので、購入され、ｃＤＮＡ挿入断片が得られ、その全体が配列決定された。
ＰＲＯ１４８８の全ヌクレオチド配列はＦｉｇ１８９（配列番号：３２９）に含
まれ、ここでＤＮＡ７３７３６−１６５７と命名される。ＤＮＡ７３７３６−１
６５７は単一のオープンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置６−８
に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置６６６−６６８に見か
けの停止コドンを持つ（Ｆｉｇ１８９；配列番号：３２９）。予測されるポリペ
プチド前駆体は２２０アミノ酸長である。 Ｆｉｇ１９０に示す全長ＰＲＯ１４８８タンパク質は約２３，２９２ダルトン
の推定分子量及び約８．４３のｐＩを有する。４つの膜貫通ドメインが約アミノ
酸位置８−３０、８２−１０２、１２１−１４０、及び１６６−１８６に位置し
ているものと同定されている。 Ｆｉｇ１９０（配列番号：３３０）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４８８のアミノ酸配列とDayhof
f配列AB000712_1の間の有意な相同性が明らかにされた。相同性はまたＰＲＯ１
４８８アミノ酸配列と次のDayhoff配列：AB000714_1, AF007189_1, AF000959_1,
P_W63697, MMU82758_1, AF072127_1, AF072128_1, HSU89916_1, AF068863_1, C
EAF000418_1, 及びAF077739_1との間にも見いだされた。 クローンＤＮＡ７３７３６−１６５７は１９９８年１１月１７日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６６が付与された。 実施例９９：ヒトＰＲＯ１４８９をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したｐｈｒａｐを使用してコンセンサス配列を他のＥＳＴ
配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここでＤＮＡ６９５６３と命名
する。ＤＮＡ６９５６３コンセンサス配列とIncyteＥＳＴクローン番号３３７６
６０８内に含まれるＥＳＴ配列との間の観察された配列類似性を基にして、Incy
teＥＳＴクローン番号３３７６６０８を購入し、その挿入断片を得て、配列決定
した。その挿入断片をここでＤＮＡ７３７３７−１６５８と命名する。 ＤＮＡ７３７３７−１６５８の全ヌクレオチド配列はＦｉｇ１９１（配列番号
：３３１）に示される。クローンＤＮＡ７３７３７−１６５８は、単一のオープ
ンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置２６４−２６６に見かけの翻
訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置７８３−７８５の見かけの停止コド
ンで終端する（Ｆｉｇ１９１）。予測されるポリペプチド前駆体は１７３アミノ
酸長である（Ｆｉｇ１９２）。Ｆｉｇ１９２に示した全長ＰＲＯ１４８９タンパ
ク質は約１８，９３８ダルトンの推定分子量及び約９．９９のｐＩを有する。Ｆ
ｉｇ１９２（配列番号：３３２）に示す全長ＰＲＯ１４８９配列の分析により次
のものの存在が証明される：約アミノ酸３１から約アミノ酸５１、約アミノ酸７
１から約アミノ酸９０及び約アミノ酸１１２から約アミノ酸１３３の膜貫通ドメ
イン及び約アミノ酸１６１から約アミノ酸１６４の潜在的なＮ-グリコシル化部
位。クローンＤＮＡ７３７３７−１６５８は１９９８年１０月２７日にＡＴＣＣ
に寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４１２が付与された。 Ｆｉｇ１９２（配列番号：３３２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４８９アミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列：AF007189_1, AB000712_1, AF000959_1, MMU82758_1, AF035814_1, A
F072127_1, AF072128_1, HSU89916_1, AF068863_1及びPPU50051_1との間の有意
な相同性が証明された。

【０５４７】 実施例１００：ヒトＰＲＯ１４７４をコードするｃＤＮＡクローンの単離 発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Phar
maceuticals、Palo Alto, CA）を検索して、あるＥＳＴを同定した。このＥＳＴ
は膵臓分泌トリプシンインヒビターと相同性を示した。 このＥＳＴを含んでいたクローンをIncyteから購入し（それは子宮頸組織ライ
ブラリからのものであった）、全体を配列決定して、ＰＲＯ１４７４をコードす
る配列番号：３３３の核酸を明らかにした。 ＰＲＯ１４７４の全ヌクレオチド配列はＦｉｇ１９３（配列番号：３３３）に
示される。クローンＤＮＡ７３７３９−１６４５は、単一のオープンリーディン
グフレームを含み、ヌクレオチド位置４５−４７に見かけの翻訳開始部位を持ち
、そしてヌクレオチド位置３００−３０２に見かけの停止コドンを持つ（Ｆｉｇ
１９３；配列番号：３３３）。予測されるポリペプチド前駆体は８５アミノ酸長
である。Ｆｉｇ１９４に示されるように、Kasalセリンプロテアーゼインヒビタ
ーファミリーシグネチャーは配列番号：３３４の約アミノ酸４５で始まる。また
Ｆｉｇ１９４には（配列番号：３３４の約アミノ酸３２に始まる）インテグリン
α鎖に保存された領域が示されている。クローンＤＮＡ７３７３９−１６４５は
ＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７０が付与された。Ｆｉｇ１９
４に示される全長ＰＲＯ１４７４タンパク質は約９，２３２ダルトンの分子量及
び約７．９４のｐＩを有する。 Ｆｉｇ１９４（配列番号：３３４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４７４アミノ酸配列と以下のDa
yhoff配列：IOVO_FRAER, IOVO_FRAAF, IOVO_FRACO, IOVO_CYRMO, IOVO_STRCA, H
61492, C61589, IOVO_POLPL, D61589, 及びIOVO_TURMEとの間の配列同一性が明
らかにされた。

【０５４８】 実施例１０１：ヒトＰＲＯ１５０８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Ｉｎｃｙ
ｔｅのクラスター番号３４５２３と命名され、ここで「ＤＮＡ１００４７」と呼
ばれる、LIFESEQ(商品名)データベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可
能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例
えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incy
te Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）デ
ータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュー
タプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-
480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア
７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」
（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington）で集団化し
てコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、
ここで「ＤＮＡ５５７２３」と命名する。 ＤＮＡ５５７２３配列とIncyteＥＳＴ番号２９８９０６４に含まれる配列との
間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン２９８９０６４を購入し、ｃＤＮＡ挿
入物を得てその全体を配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ１９５
に示し、ここで「ＤＮＡ７３７４２−１６６２」と命名する。 Ｆｉｇ１９５に示される全長クローンは単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置７０−７２に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置５１４−５１６の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１９５；配列番
号：３３５）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ１９６；配列番号：３３
５）は１４８アミノ酸長である。ＰＲＯ１５０８タンパク質の他の特徴は、約ア
ミノ酸１−３０のシグナル配列；約アミノ酸９６−１０３のチロシンキナーゼリ
ン酸化化モチーフ；及び約アミノ酸２７−３２、２８−３３、及び１４０−１４
５のＮ-ミリストイル化部位を含む。ＰＲＯ１５０８は約１７，１８３の算定分
子量及び約８．７７の推定ｐＩを有する。クローンＤＮＡ７３７４２−１６６２
は１９９８年１０月６日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１６
が付与された。 Ｆｉｇ１９６（配列番号：３３６）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５０８のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：HSAJ3728_1; P_R74962; P_R74941; AF053074_1; F69515; S20706;
RPB1_PLAFD; A20587_1; A51861_1; 及びS75947との間のある程度の相同性が明
らかにされた。

【０５４９】 実施例１０２：ヒトＰＲＯ１５５５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ＥＳＴク
ラスター番号５２１と命名され、ここで「ＤＮＡ１０３１６」とも呼ばれる、LI
FESEQ(商品名)データベースからのＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった
。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenB
ank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmac
euticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベース
と比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラ
ムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)
）を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０
の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Gree
n, University of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサ
スＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここで「ＤＮ
Ａ５５３７４」と命名する。 ＤＮＡ５６３７４配列とIncyteＥＳＴ番号２８５５７６９に含まれる配列との
間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴ番号２８５５７６９を購入し、ｃＤＮＡ挿入物
を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ１９７に示し、ここで
ＤＮＡ７３７４４−１６６５と命名する。 Ｆｉｇ１９７に示される全長クローンは単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置９０−９２に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置８２８−８３０の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ１９７；配列番
号：３３７）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ１９８；配列番号：３３
８）は２４６アミノ酸長である。ＰＲＯ１５５５は約２６，２６１の算定分子量
及び約５．６５の推定ｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸１−３１のシグ
ナルペプチド；約アミノ酸１１−３１及び１９５−２１７の膜貫通ドメイン；約
アミノ酸１１１−１１４の潜在的なN-グリコシル化部位；約アミノ酸２−５、９
８−１０１、及び１９１−１９４の潜在的なカゼインキナーゼＩＩリン酸化部位
；及び約アミノ酸１４６−１５１及び１９２−１９７の潜在的なＮ-ミリストイ
ル化部位を含む。 Ｆｉｇ１９８（配列番号：３３８）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５５５のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：YKA4_CAEEL, AB014541_1, HVSX99518_2, SSU63019_1, GEN14286,
MMU68267_1, XP2_XENLA, ICP4_HSV11, P_W40200, 及びAE001360_1との間のある
程度の相同性が明らかにされた。 クローンＤＮＡ７３７４４−１６６５は１９９８年１０月６日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２２が付与された。

【０５５０】 実施例１０３：ヒトＰＲＯ１４８５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴ配列に対してコン
センサスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここで「ＤＮＡ４
４７９１」と命名する。ＤＮＡ４４７９１コンセンサス配列に基づいて、１）Ｐ
ＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）
ＰＲＯ１４８５の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用す
るために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（２つの正方向及び２つの逆方向）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー１：5'CCCTCCAAGGATGACAAAGGCGC3'（配列番号：341）； 正方向ＰＣＲプライマー２：5'GGTCAGCAGCTTTCTTGCCCTAAATCAGG3'（配列番号：3
42）； 逆方向ＰＣＲプライマー１：5'ATCTCAGGCGGCATCCTGTCAGCC3'（配列番号：343）
；及び 逆方向ＰＣＲプライマー２：5'GTGGATGCCTGCAAGAAGGTTGGG3'（配列番号：344）
。 さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４４７９１配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ： 5'AGCTTTCTTGCCCTAAATCAGGCCAGCCTCATCAGTCGCTGTGAC3'（配列番号：345） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１４８５遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト精巣から単
離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１４８５の全
長ＤＮＡ配列（ここではＤＮＡ７３７４６−１６５４と命名[Ｆｉｇ１９９、配
列番号：３３９]）；及びＰＲＯ１４８５の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１４８５の全コード化配列をＦｉｇ１９９（配列番号：３３９）に示す
。クローンＤＮＡ７３７４６−１６５４は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、配列番号：３３９のヌクレオチド位置１５１−１５３に見かけの翻訳
開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置５９５−５９７の見かけの停止コドン
で終端する。予測されるポリペプチド前駆体は１４８アミノ酸長である。シグナ
ルペプチドは配列番号：３４０の約アミノ酸１−１８にある。リゾチームＣシグ
ネチャー、CAAXボックス、及びＮ-グリコシル化部位がＦｉｇ２００に示されて
いる。クローンＤＮＡ７３７４６−１６５４はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄
託番号２０３４１１が付与された。Ｆｉｇ２００に示した全長ＰＲＯ１４８５タ
ンパク質は約１６，８９６ダルトンの推定分子量及び約６．０５のｐＩを有する
。 Ｆｉｇ２００（配列番号：３４０）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１４８５のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：LYC_PHACO, P_R76684, 2HFL_Y, JC2144, JC5544, JC5555, JC5369
, LYC2_PIG, P_R12113, 及びJC5380との間の配列同一性が明らかにされた。

【０５５１】 実施例１０４：ヒトＰＲＯ１５６４をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴ配列に対してコン
センサスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ６７
２１３と命名する。ＤＮＡ６７２１３コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲ
により対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲ
Ｏ１５６４の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するた
めに、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正方向及び逆方向）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー(67213.f1) 5'-GGAGAGGTGGTGGCCATGGACAG-3'（配列番
号：348） 逆方向ＰＣＲプライマー(67213.r1) 5'-CTGTCACTGCAAGGAGCCAACACC-3'（配列番
号：349）。 さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ６７２１３配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ： 5'-TATGTCGCTGCGAGGTGGTGAAAACCTCGAACTGTCTTTCAAGGC-3'（配列番号：350） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１５６４遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト精巣から単
離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１５６４の全
長ＤＮＡ配列（ここではＤＮＡ７３７６０−１６７２と命名[Ｆｉｇ２０１、配
列番号：３４６]）；及びＰＲＯ１５６４の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ７３７６０−１６７２の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ２０１（配列番号
：３４６）に示す。クローンＤＮＡ７３７６０−１６７２は、単一のオープンリ
ーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置４６２−４６４に見かけの翻訳開
始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置２３７９−２３８１の見かけの停止コド
ンで終端する（Ｆｉｇ２０１）。予測されるポリペプチド前駆体は６３９アミノ
酸長である（Ｆｉｇ２０２）。Ｆｉｇ２０２に示した全長ＰＲＯ１５６４タンパ
ク質は約７３，０６３ダルトンの推定分子量及び約６．８４のｐＩを有する。Ｆ
ｉｇ２０２（配列番号：３４７）に示された全長ＰＲＯ１５６４の分析により次
のものの存在が証明される：約アミノ酸１から約アミノ酸２８のシグナルペプチ
ド、約アミノ酸１１から約アミノ酸３６の膜貫通ドメイン、約アミノ酸１０７か
ら約アミノ酸１１０及び約アミノ酸５７４から約アミノ酸５７７の潜在的なＮ-
グリコシル化部位、約アミノ酸５０から約アミノ酸５７のチロシンキナーゼリン
酸化部位、約アミノ酸１５８から約アミノ酸１６３、約アミノ酸２３６から約ア
ミノ酸２４１、約アミノ酸２６２から約アミノ酸２６７、約アミノ酸２７０から
約アミノ酸２７５、約アミノ酸３８０から約アミノ酸３８５及び約アミノ酸５１
３から約アミノ酸５１８のＮ-ミリストイル化部位、約アミノ酸１１０から約ア
ミノ酸１１３のアミド化部位及び約アミノ酸１５から約アミノ酸２５の原核膜リ
ポタンパク質脂質付着部位。クローンＤＮＡ７３７６０−１６７２は１９９８年
１０月６日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１４が付与された
。 Ｆｉｇ２０２（配列番号：３４７）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５６４のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：MMU73819_1, HSY08564_1, P_W34470, P_R66402, PAGT_HUMAN, CEG
LY5B_1, CEGLY6A_1, CEGLY6B_1, AP000006_308及びE69322との間の有意な相同性
が証明された。

【０５５２】 実施例１０５：ヒトＰＲＯ１７５５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ＥＳＴク
ラスター番号１４１８７２と命名される、LIFESEQ(商品名)データベースからの
ＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列
を、上に挙げたデータベースからの様々なＥＳＴと比較して、存在する相同性を
同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul
等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知の
タンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上
を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washingto
n, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そ
こから得られたコンセンサス配列を、ここで「ＤＮＡ５５７３１」と命名する。 ＤＮＡ５５７３１配列とIncyteＥＳＴ番号２５７３２３に含まれる配列との間
の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローンを購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決
定した。Incyteクローン２５７３２３は、早期の発達段階で関係したニューロン
前駆体に特徴的な性質を示すヒト奇形ガン腫から取り出したｈＮＴ２株化細胞（
Stratageneライブラリ番号STR9372310）から単離したＲＮＡを使用して作成した
ライブラリから取り出されたものである。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ２
０３に示し、ここで「ＤＮＡ７６３９６−１６９８」と命名する。あるいは、Ｄ
ＮＡ７６３９６−１６９８はオリゴヌクレオチドプローブとプライマーを調製し
適切なライブラリ（例えばSTR9372310）から配列を単離することにより得ること
ができる。 Ｆｉｇ２０３に示される全長クローンは単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置５８−６０に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置８８６−８８８の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ２０３；配列番
号：３５１）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ２０４、配列番号：３５
２）は２７６アミノ酸長である。ＰＲＯ１７５５は約２９，４２６の算定分子量
及び約９．４０の推定ｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸１−３１のシグ
ナルペプチド配列；約アミノ酸１７８−１９８の膜貫通ドメイン；約アミノ酸２
１０−２１３のｃＡＭＰ及びｃＧＭＰ依存性プロテインキナーゼリン酸化部位；
約アミノ酸１１７−１２２、１５４−１４９、及び２１４−２１９の潜在的なＮ
-ミリストイル化部位；及び約アミノ酸１４９−１５１の細胞付着配列を含む。 Ｆｉｇ２０４（配列番号：３５２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１７５５のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：APG-BRANA, P_R37743, NAU88587_1, YHL1_EBV, P_W31855, CET10B
10_4, AF039404_1, PRP1_HUMAN, AF038575_1, 及びAF053091_1との間のある程度
の相同性が明らかにされた。 クローンＤＮＡ７６３９６−１６９８は１９９８年１１月１７日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７１が付与された。

【０５５３】 実施例１０６：ヒトＰＲＯ１７５７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteＥ
ＳＴクローン番号２００７９４７、２０１４９６２及び１９１２０３４と命名さ
れた、Incyteデータベースからの３つのＥＳＴ配列の同定が可能となった。次い
でこれらＥＳＴクラスター配列を、プログラム「phrap」（Phil Green, Univers
ity of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配
列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６０５４
と命名する。 ＤＮＡ５６０５４配列とIncyteＥＳＴ番号２００７９４７に含まれる配列との
間の配列相同性に鑑みて、IncyteＥＳＴクローン番号２００７９４７を購入し、
ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ２０５
に示し、ここでＤＮＡ７６３９８−１６９９と命名する。 クローンＤＮＡ７６３９８−１６９９は単一のオープンリーディングフレーム
を含み、ヌクレオチド位置５９−６１に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌ
クレオチド位置４２２−４２４の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ２０５）。予測
されるポリペプチド前駆体は１２１アミノ酸長である（Ｆｉｇ２０６）。Ｆｉｇ
２０６に示した全長ＰＲＯ１７５７タンパク質は約１２，０７３の推定分子量及
び約４．１１のｐＩを有する。Ｆｉｇ２０６（配列番号：３５４）に示された全
長ＰＲＯ１７５７の分析により次のものの存在が証明される：約アミノ酸１から
約アミノ酸１９のシグナルペプチド、約アミノ酸９１から約アミノ酸１１０の膜
貫通ドメイン、約アミノ酸４４から約アミノ酸４７のグリコサミノグリカン付着
部位、約アミノ酸１１６から約アミノ酸１１９のｃＡＭＰ及びｃＧＭＰ依存性プ
ロテインキナーゼリン酸化部位及び約アミノ酸９１から約アミノ酸９６の潜在的
なＮ-ミリストイル化部位。クローンＤＮＡ７６３９８−１６９９は１９９８年
１１月１７日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７４が付与され
た。 Ｆｉｇ２０６（配列番号：３５４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１７５７のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：JQ0964, COLL_HSVS7, HSU70136_1, AF003473_1, D89728_1, MTF1_
MOUSE, AF029777_1, HSU88153_1及びP_W05321との間の有意な相同性が証明され
た。

【０５５４】 実施例１０７：ヒトＰＲＯ１７５８をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteＥ
ＳＴクローン番号２０９２６と命名された、LIFESEQ(商品名)データベースから
のＥＳＴクラスター配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配
列を、上に挙げたデータベースからの様々な配列タグ（ＥＳＴ）と比較して、存
在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLA
ST2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施
した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）
又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University
of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を
構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６２６０と命
名する。 ＤＮＡ５６２６０配列とLIFESEQ(商品名)データベースのＥＳＴ番号２９３６
３３０に含まれる配列との間の配列相同性に鑑みて、無脳症で死亡した胎児の胸
腺組織から作成したライブラリからの由来であるＥＳＴクローンを購入し、ｃＤ
ＮＡ挿入断片を得て配列決定をした。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ２０７
に示し、ここでＤＮＡ７６３９９−１７００と命名する。 Ｆｉｇ２０７に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置７８−８０に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置５４９−５５１の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ２０７；配列番号
：３５５）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ２０８；配列番号：３５６
）は１５７アミノ酸長である。ＰＲＯ１７５８は約１７，６８１の算定分子量及
び約７．６５の推定ｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸１−１５のシグナ
ルペプチド；約アミノ酸２４−２７の潜在的なＮ-グリコシル化部位；約アミノ
酸２７−３０のｃＡＭＰ及びｃＧＭＰ依存性プロテインキナーゼリン酸化部位；
約アミノ酸６０−６３のカゼインキナーゼＩＩリン酸化部位；約アミノ酸１７−
２２、５０−５５、１２９−１３４、及び１３３−１３８の潜在的なＮ-ミリス
トイル化部位；約アミノ酸１５３−１５５の細胞付着配列；及び約アミノ酸１８
−２３のチトクロムｃファミリーヘム結合部位シグネチャーを含む。 Ｆｉｇ２０８（配列番号：３５６）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１７５８のアミノ酸配列とDayhof
f配列番号AC005328_2との間の有意な相同性が明らかにされた。相同性はまたＰ
ＲＯ１７５８アミノ酸配列とDayhoff配列番号CELC46F2_1との間にも見いだされ
た。 クローンＤＮＡ７６３９９−１７００は１９９８年１１月１７日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７２が付与された。

【０５５５】 実施例１０８：ヒトＰＲＯ１５７５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 コンセンサスＤＮＡ配列を、上記実施例１に記載したようなｐｈｒａｐを使用
して他のＥＳＴ配列に対して構築した。このコンセンサス配列をここで「ＤＮＡ
３５６９９」と命名した。ＤＮＡ３５６９９コンセンサス配列に基づいて、１）
ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２
）ＰＲＯ１５７５の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用
するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー：CCAGCAGTGCCCATACTCCATAGC（35699.f1；配列番号：35
9）；TGACGAGTGGGATACACTGC（35699.f2；配列番号：360） 逆方向ＰＣＲプライマー：GCTCTACGGAAACTTCTGCTGTGG（35699.r1；配列番号：36
1） また、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ３５６９９配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：ATTCCCAGGCGTGTCATTTGGGATCAGCACTGATTCTGAGGTTCTG
ACAC（35699.p1；配列番号：362） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１５７５遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト膵臓組織か
ら単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１５７５の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ７６４０１−１６８３とここで命名[Ｆｉｇ２０９、配列
番号：３５７]）；及びＰＲＯ１５７５の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１５７５の全コード化配列をＦｉｇ２０９（配列番号：３５７）に示す
。クローンＤＮＡ７６４０１−１６８３３は、単一のオープンリーディングフレ
ームを含み、ヌクレオチド位置２２−２４に見かけの翻訳開始部位を持ち、そし
てヌクレオチド位置８４１−８４３に見かけの停止コドンを持つ。予測されるポ
リペプチド前駆体は２７３アミノ酸長である。Ｆｉｇ２１０に示す全長ＰＲＯ１
５７５タンパク質は約３０，４８０ダルトンの推定分子量及び約４．６０のｐＩ
を有する。更なる特徴は、約アミノ酸１−２０のシグナルペプチド；約アミノ酸
１４３−１６２の膜貫通ドメイン；約アミノ酸１００−１０３の潜在的なＮ-グ
リコシル化部位；及び約アミノ酸８４−８９、１０３−１０８、１５４−１５９
、及び２０１−２０６の潜在的なＮ-ミリストイル化部位を含む。 Ｆｉｇ２１０（配列番号：３５８）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５７５のアミノ酸配列とDayhof
f配列番号A12005_1との間の有意な相同性が明らかにされた。相同性はまたＰＲ
Ｏ１５７５アミノ酸配列と次の更なるDayhoff配列：P_P80615; P_R25297; P_R51
696; A47300; PDI_DROME; P_R49829; P_R63807; DMALPADAP_1; 及びDRZNF6_1と
の間にも見いだされた。 クローンＤＮＡ７６４０１−１６８３は１９９８年１０月２０日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３６０が付与された。

【０５５６】 実施例１０９：ヒトＰＲＯ１７８７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立ててアセンブリを形成した。このコンセンサス配列をこ
こで「ＤＮＡ４５１２３」と命名する。アセンブリにおいて同定されたIncyteＥ
ＳＴ３６１８５４９とのＤＮＡ４５１２３の相同性、並びにここで提供された他
の発見及び情報に基づいて、このＥＳＴを含むクローンを購入し配列決定した。
クローンのＤＮＡ配列決定によりＰＲＯ１７８７の全長ＤＮＡ配列とＰＲＯ１７
８７の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１７８７の全コード化配列はＦｉｇ２１１（配列番号：３６３）に含ま
れる。クローンＤＮＡ７６５１０−２５０４は単一のオープンリーディングフレ
ームを含み、配列番号：３６３のヌクレオチド位置１６３−１６５に見かけの翻
訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置９７０−９７２に見かけの停止コド
ンを持つ。シグナルペプチド、膜貫通領域、Ｎ-グリコシル化部位、Ｎ-ミリスト
イル化部位及びキナーゼリン酸化部位のおよその位置はＦｉｇ２１２に示される
。予測されるポリペプチド前駆体は２６９アミノ酸長である。クローンＤＮＡ７
６５１０−２５０４はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７７が付
与された。Ｆｉｇ２１２に示した全長ＰＲＯ１７８７タンパク質は約２９，０８
２ダルトンの推定分子量及び約９．０２のｐＩを有する。 Ｆｉｇ２１２（配列番号：３６４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１７８７のアミノ酸配列と次のDa
yhoff配列：MYP_RAT, MYPO_HUMAN, MYPO_BOVIN, GEN12838, HSSCN2B2_1, AF0077
83_1, HSU90716_1, P_W42015. XLU43330_1及びAF060231_1との間の配列同一性が
明らかにされた。 実施例１１０：ヒトＰＲＯ１７８１をコードするｃＤＮＡクローンの単離 ここでＤＮＡ５８０７０及びＤＮＡ５６３４０と呼ばれる最初のＤＮＡ配列を
、一次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優勢に示すヒトＳＫ−Ｌｕ−１腺ガン株化
細胞ｃＤＮＡライブラリにおいて、酵母スクリーニングを使用して同定した。コ
ンピュータプログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Sea
ttle, Washington）を使用してこれらの配列を集団化してコンセンサスＤＮＡ配
列を構築した。該コンセンサス配列をここで「ＤＮＡ５９５７５」と命名する。 ＤＮＡ５９５７５コンセンサス配列に基づいて、次のオリゴヌクレオチドを合
成し、ＰＲＯ１７８１に対する全長コード配列のクローンを単離するプローブと
して用いた：TGGAAAAGAAGTCTGGTCAGAAGGTTTAGG（配列番号：367）、CATTTGGCTTC
ATTCTCCTGCTCTG（配列番号：368）、AAAACCTCAGAACAACTCATTTTGCACC（配列番号3
69）及びGTCTCACCATGGTTGCTCTTGCCAAATTGTGGGAAGCAGGG（配列番号370）。 Ｆｉｇ２１３に示した全長ＤＮＡ７６５２２−２５００クローンは単一のオー
プンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置２１−２３に見かけの翻訳
開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１１４１−１１４３の停止コドンで終
端する（Ｆｉｇ２１３；配列番号：３６５）。予測されるポリペプチド前駆体（
Ｆｉｇ２１４、配列番号：３６６は３７３アミノ酸長である。ＰＲＯ１７８１は
約４１，２２１ダルトンの算定分子量及び約８．５４の推定ｐＩを有する。更な
る特徴は、約アミノ酸１−１９の可能なシグナルペプチド；約アミノ酸３９−６
０の膜貫通ドメイン；約アミノ酸２２８−２３６のチロシンリン酸化部位；約ア
ミノ酸１６−２１、１７−２２、４３−４８、４５−５０、４７−５２、４９−
５４、５３−５８、５８−６３、５９−６４、６２−６７、１２６−１３１、及
び１４２−１４７の潜在的なＮ-ミリストイル化部位；約アミノ酸２２−２５及
び２８０−２８３のアミド化部位；及び約アミノ酸１２−２２の真核膜リポタン
パク質脂質付着部位を含む。 Ｆｉｇ２１４（配列番号：３６６）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配
列アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45
SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１７８１アミノ酸配列と次のDayhoff配列
：CEY4510D_5, AP000001_146, P_R10676, DAC_STRSQ, CEC40H5_5, P_R35204, KP
U58495_1, KPN16781_1, AF010403_1, 及びAF056116_14との間のいくらかの相同
性が明らかにされた。 クローンＤＮＡ７６５２２−２５００は１９９８年１１月１７日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６９が付与された。

【０５５７】 実施例１１１：ヒトＰＲＯ１５５６をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、LIFESEQ(
商品名)データベースから、ＥＳＴクラスター番号１０３１５８と命名され、こ
こで「ＤＮＡ１０３９８」とも呼ばれるＥＳＴクラスター配列を同定した。次い
でこのＥＳＴクラスター配列を、公的データベース（例えば、GenBank）及び企
業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、P
alo Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、
存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はB
LAST2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実
施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある
）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, Universit
y of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列
を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５６４１７と
命名する。 ＤＮＡ５６４１７配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴ番号９５９３３２に含まれる配
列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴ番号９５９３３２を購入し、ｃＤＮＡ挿
入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ２１５に示し、こ
こでＤＮＡ７６５２９−１６６６と命名する。 Ｆｉｇ２１５に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置８５−８７に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置８９２−８９４の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ２１５；配列番号
：３７１）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ２１６、配列番号：３７２
）は２６９アミノ酸長である。ＰＲＯ１５５６は約２８，００４ダルトンの算定
分子量及び約５．８０の推定ｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸１−２４
のシグナルペプチド；約アミノ酸１１−２５及び２２６−２４３の膜貫通ドメイ
ン；約アミノ酸１８２−１８５の潜在的なＮ-グリコシル化部位、約アミノ酸７
０−７３の潜在的なｃＡＭＰ-及びｃＧＭＰ-依存性プロテインキナーゼリン酸化
部位；及び約アミノ酸２９−３４、３５−３９、１１７−１２２、１２１−１２
６、１２５−１３０、１５４−１５９、１６６−１７１、２４１−２４６、２４
６−２５１、２４７−２５２、２４９−２５４、２５０−２５５、２５１−２５
６、２５２−２５７、２５３−２５８、２５４−２５９、２５５−２６０、２５
６−２６１、２５７−２６２、及び２５９−２６４の潜在的なＮ-ミリストイル
化部位を含む。 Ｆｉｇ２１６（配列番号：３７２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５５６のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：T8F5_4, R23B_MOUSE, CANS_HUMAN, P_W41640, DSU51091_1, TP2B_
CHICK, DVU20660_1, S43296, P_R23962, 及びBRN1_HUMANとの間のある程度の相
同性が明らかにされた。 クローンＤＮＡ７６５２９−１６６６は１９９８年１０月６日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１５が付与された。

【０５５８】 実施例１１２：ヒトＰＲＯ１７５９をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデ
ータベースから、ＤＮＡ１０５７１と命名したＥＳＴクラスター配列を同定した
。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公的データベース（例えば、GenBank）
及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceutic
als、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較
して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAS
T又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用
いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合
もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, Uni
versity of Washington, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮ
Ａ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５７３
１３と命名する。 ＤＮＡ５７３１３配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン２４３４２５５に含ま
れる配列との間の配列相同性に鑑みて、このＥＳＴを含むクローンを購入し、ｃ
ＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ２１７に
示し、ここでＤＮＡ７６５３１−１７０１と命名する。 Ｆｉｇ２１７に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置１２５−１２７に見かけの翻訳開始部位を持ち、そして
ヌクレオチド位置１４７５−１４７７の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ２１７；
配列番号：３７３）。シグナルペプチドと膜貫通ドメインのおよその位置はＦｉ
ｇ２１８に示される一方、Ｎ-ミリストイル化部位、脂質付着部位、アミド化部
位及びキナーゼリン酸化部位はＦｉｇ２１８に示される。予測されるポリペプチ
ド前駆体（Ｆｉｇ２１８、配列番号：３７４）は４５０アミノ酸長である。ＰＲ
Ｏ１７５９は約４９，７６５ダルトンの算定分子量及び約８．１４の推定ｐＩを
有する。クローンＤＮＡ７６５３１−１７０１は１９９８年１１月１７日にＡＴ
ＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６５が付与された。 Ｆｉｇ２１８（配列番号：３７４）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１７５９のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：OPDE_PSEAE, TH11_TRYBB, S67684, RGT2_YEAST, S68362, ATSUGTR
PR_1, P_W17836 (特許出願WO9715668-A2), F69587, A48076, 及びA45611との間
の配列同一性が明らかにされた。

【０５５９】 実施例１１３：ヒトＰＲＯ１７６０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、Incyteデ
ータベースからＥＳＴクラスター配列を同定した。次いでこのＥＳＴクラスター
配列を、公的データベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータ
ベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種
々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定し
た。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Met
hods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク
質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比
較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seatt
le, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得
られたコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ５８７９８と命名する。 ＤＮＡ５８７９８配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン３３５８７４５に含ま
れる配列との間の配列相同性に鑑みて、このＥＳＴを含むクローンを購入し、ｃ
ＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ２１９に
示し、ここでＤＮＡ７６５３２−１７０２と命名する。 Ｆｉｇ２１９に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置６０−６２に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置６２４−６２６の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ２１９；配列番号
：３７５）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ２２０、配列番号：３７６
）は１８８アミノ酸長である。モチーフは更にＦｉｇ２２０に示される。ＰＲＯ
１７６０は約２１，０４２ダルトンの算定分子量及び約５．３６の推定ｐＩを有
する。クローンＤＮＡ７６５３２−１７０２は１９９８年１１月１７日にＡＴＣ
Ｃに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７３が付与された。 Ｆｉｇ２２０（配列番号：３７６）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１７６０のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：CELT07F12_2, T22J18_16, ATF1C12_3, APE3_YEAST, P_W22471, SA
U56908_1, SCPA_STRPY, ATAC00423817, SAPURCLUS_2 及びAF041468_9との間の配
列同一性が明らかにされた。

【０５６０】 実施例１１４：ヒトＰＲＯ１５６１をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列をここでＤＮＡ４０６３０
と命名する。ＤＮＡ４０６３０コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲにより
対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１５
６１の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、
オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正方向及び逆方向）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（40630.f1）5'-CTGCCTCCACTGCTCTGTGCTGGG-3'（配列番
号：379）及び 逆方向ＰＣＲプライマー（40630.r1）5'-CAGAGCAGTGGATGTTCCCCTGGG-3'（配列番
号：380）。 更に、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチ
ド配列： ハイブリッド形成プローブ（40630.p1）： 5'-CTGAACAAGATGGTCAAGCAAGTGACTGGGAAAATGCCCATCCTC-3'（配列番号：381） を持つＤＮＡ４０６３０配列から作成した。 全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために
、ライブラリからのＤＮＡを、上で同定したＰＣＲプライマー対でのＰＣＲ増幅
によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴ
ヌクレオチド及びＰＣＲプライマーの一方を用いてＰＲＯ１５６１遺伝子をコー
ドするクローンを単離するために使用した。ｃＤＮＡライブラリの作成のための
ＲＮＡはヒト乳房腫瘍組織から単離された。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１５６１の全
長ＤＮＡ配列（ここではＤＮＡ７６５３８−１６７０と命名[Ｆｉｇ２２１、配
列番号：３７７]）；及びＰＲＯ１５６１の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ７６５３８−１６７０の全ヌクレオチド配列はＦｉｇ２２１に示される
（配列番号：３７７）。クローンＤＮＡ７６５３８−１６７０は単一のオープン
リーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置２９−３１に見かけの翻訳開始
部位を持ち、そしてヌクレオチド位置３７７−３７９の停止コドンで終端する（
Ｆｉｇ２２１）。予測されるポリペプチド前駆体は１１６アミノ酸長である（Ｆ
ｉｇ２２２）。Ｆｉｇ２２２に示した全長ＰＲＯ１５６１タンパク質は約１２，
９１０ダルトンの推定分子量及び約６．４１のｐＩを有する。Ｆｉｇ２２２（配
列番号：３７８）に示された全長ＰＲＯ１５６１の分析により次のものの存在が
証明される：約アミノ酸１から約アミノ酸１７のシグナルペプチド、約アミノ酸
１から約アミノ酸２４の膜貫通ドメイン、約アミノ酸８６から約アミノ酸８９の
潜在的なＮ-グリコシル化部位、約アミノ酸２０から約アミノ酸２５及び約アミ
ノ酸４５から約アミノ酸５０の潜在的なＮ-ミリストイル化部位及び約アミノ酸
６３から約アミノ酸７０のホスホリパーゼＡ２ヒスチジン活性部位。クローンＤ
ＮＡ７６５３８−１６７０は１９９８年１０月６日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴ
ＣＣ寄託番号２０３３１３が付されている。 Ｆｉｇ２２２（配列番号：３７８）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用してのＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
３５．４５SwissProt３５）の解析により、ＰＲＯ１５６１アミノ酸配列と次の
Ｄａｙｈｏｆｆ配列：P_R63053, P_R25416, P_R63055, P_P93363, P_R63046, PA
2A_VIPAA, P_W58476, GEN13747, PA2X_HUMAN及びPA2A_CR0DUの間の有意な相同性
が証明された。 上記に加えて、配列相同性検索により、ＤＮＡ４０６３０コンセンサス配列と
IncyteＥＳＴクローン番号１９２１０９２の間に有意な相同性が証明された。そ
して、IncyteＥＳＴクローン番号１９２１０９２を購入し、挿入断片を得て配列
決定し、それによってＦｉｇ２２１に示したＤＮＡ７６５３８−１６７０配列を
得た（配列番号：３７７）。

【０５６１】 実施例１１５：ヒトＰＲＯ１５６７をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例２に記載したアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたｃＤ
ＮＡ配列をここでＤＮＡ４７５８０と命名する。ついで、ＤＮＡ４７５８０配列
を、公的データベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベー
ス（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む様々な
発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して存在する相同性を同定した。相
同性検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods i
n Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコ
ードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は
、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Wa
shington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られた
コンセンサス配列を、ここで「ＤＮＡ５７２４６」と命名する。 ＤＮＡ５７２４６配列とLIFESEQ(商品名)データベースからのＥＳＴ番号１７
９３９９６の間の配列相同性に基づいて、前立腺腫瘍組織から作成したライブラ
リから由来するＥＳＴ番号１７９３９９６を含むクローンを購入しそのｃＤＮＡ
挿入断片を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入断片の配列はここではＦｉｇ２
２３（配列番号：３８２）に示しここでＤＮＡ７６５４１−１６７５と命名する
。 ヌクレオチド位置１０９−１１１に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチ
ド位置６４３−６４５に停止シグナルを有する単一の読み取り枠を含む全長クロ
ーンが同定された（Ｆｉｇ２２３；配列番号：３８２）。予測されたポリペプチ
ド前駆体は１７８アミノ酸長であり、約１９，６００ダルトンの算定分子量と約
５．８９の推定ｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸１−２２のシグナルペ
プチド；約アミノ酸１６７−１７０の潜在的なＮ-グリコシル化部位；約アミノ
酸１０７−１０９のプロテインキナーゼＣリン酸化部位；及び約アミノ酸４６−
５１、７２−７７、及び１２０−１２５の潜在的なN-ミリストイル化部位を含む
。 Ｆｉｇ２２４（配列番号：３８３）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用してのＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
３５．４５SwissProt３５）の解析により、ＰＲＯ１７８４アミノ酸配列とＤａ
ｙｈｏｆｆ配列「P_W06549」と命名されたヒト大腸特異的遺伝子ＣＳＧ６ポリペ
プチドとの間の有意な配列相同性が証明された。ＰＲＯ１５６７アミノ酸配列と
次のＤａｙｈｏｆｆ配列：HUAC002301_1, P_246880, A49685, SPBP_RAT, S42924
, SPBP_MOUSE, I52115, MMU03711_1, 及びAF041468_31の間にもまた相同性が見
いだされた。 クローンＤＮＡ７６５４１−１６７５は１９９８年１０月２７日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０９が付されている。

【０５６２】 実施例１１６：ヒトＰＲＯ１６９３をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列をここでＤＮＡ３８２５１
と命名する。ＤＮＡ３８２５１コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲにより
対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１６
９３の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために、
オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正方向及び逆方向）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（38251.f1）5'-CTGGGATCTGAACAGTTTCGGGGC-3'（配列番
号：386）及び 逆方向ＰＣＲプライマー（38251.r1）5'-GGTCCCCAGGACATGGTCTGTCCC-3'（配列番
号：387）。 更に、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオチ
ド配列： ハイブリッド形成プローブ（38251.p1）： 5'-GCTGAGTTTACATTTACGGTCTAACTCCCTGAGAACCATCCCTGTGCG-3'（配列番号：388） を持つＤＮＡ３８２５１配列から作成した。 全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために
、ライブラリからのＤＮＡを、上で同定したＰＣＲプライマー対でのＰＣＲ増幅
によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴ
ヌクレオチド及びＰＣＲプライマーの一方を用いてＰＲＯ１６９３遺伝子をコー
ドするクローンを単離するために使用した。ｃＤＮＡライブラリの作成のための
ＲＮＡはヒト胎児腎臓組織から単離された。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１６９３の全
長ＤＮＡ配列（ここではＤＮＡ７７３０１−１７０８と命名[Ｆｉｇ２２５、配
列番号：３８４]）；及びＰＲＯ１６９３の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ７７３０１−１７０８の全ヌクレオチド配列はＦｉｇ２２５に示される
（配列番号：３８４）。クローンＤＮＡ７７３０１−１７０８は単一のオープン
リーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置５０８−５１０に見かけの翻訳
開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置２０４７−２０４９の停止コドンで終
端する（Ｆｉｇ２２５）。予測されるポリペプチド前駆体は５１３アミノ酸長で
ある（Ｆｉｇ２２６）。Ｆｉｇ２２６に示した全長ＰＲＯ１６９３タンパク質は
約５８，２６６ダルトンの推定分子量及び約９．８４のｐＩを有する。Ｆｉｇ２
２６（配列番号：３８５）に示された全長ＰＲＯ１６９３の分析により次のもの
の存在が証明される：約アミノ酸１から約アミノ酸３３のシグナルペプチド、約
アミノ酸４２０から約アミノ酸４４２の膜貫通ドメイン、約アミノ酸１２６から
約アミノ酸１２９、約アミノ酸３５７から約アミノ酸３６０、約アミノ酸４９６
から約アミノ酸４９９及び約アミノ酸５０４から約アミノ酸５０７の潜在的なＮ
-グリコシル化部位、約アミノ酸４６５から約アミノ酸４６８のｃＡＭＰ-及びｃ
ＧＭＰ-依存性プロテインキナーゼリン酸化部位及び約アミノ酸１１から約アミ
ノ酸１６、約アミノ酸３３から約アミノ酸３８、約アミノ酸２４５から約アミノ
酸２５０、約アミノ酸３３２から約アミノ酸３３７、約アミノ酸４９７から約ア
ミノ酸５０２及び約アミノ酸５０７から約アミノ酸５１２の潜在的なＮ-ミリス
トイル化部位。クローンＤＮＡ７７３０１−１７０８は１９９８年１０月２７日
にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０７が付されている。 Ｆｉｇ２２６（配列番号：３８５）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用してのＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
３５．４５SwissProt３５）の解析により、ＰＲＯ１７８４アミノ酸配列と次の
Ｄａｙｈｏｆｆ配列：AB007876_1, ALS_MOUSE, HSCHONO3_1, P_R85889, AF06200
6_1, AB014462_1, A58532, MUSLRRPA_1, AB007865_1及びAF030435_1の間の有意
な相同性が証明された。

【０５６３】 実施例１１７：ヒトＰＲＯ１７８４をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例２に記載したアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたｃＤ
ＮＡ配列をここでＤＮＡ４３８６２と命名する。ＤＮＡ４３８６２配列に基づい
て、オリゴヌクレオチドプローブを産生し、上述の実施例２の第１段落に記載し
たヒト胎児腎臓ライブラリをスクリーニングするために使用した。クローニング
ベクターはｐＲＫ５Ｂであり（ｐＲＫ５ＢはＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄ
の前駆体である；Holmes等, Science 253:1278-1280 (1991)を参照されたい）、
切断されたｃＤＮＡサイズは２８００ｂｐ未満であった。 ＰＣＲプライマー（正方向及び逆方向）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（f1）5'-CTTTTCAGTGTCACCTCAGCGATCTC-3'（配列番号：
391）及び 逆方向ＰＣＲプライマー（r1）5'-CCAAAACATGGAGCAGGAACAGG-3'（配列番号：392
）。 さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、次のヌクレオ
チド配列： ハイブリッド形成プローブ（p1）： 5'-CCAGTTGGTGCTCTCGGACCTACCATGCGAAGAAGATGAAATGTGTG-3'（配列番号：393） を持つＤＮＡ４３８６２配列から作成した。 全長クローンの供給源に対して数種のライブラリをスクリーニングするために
、ライブラリからのＤＮＡを、上で同定したＰＣＲプライマー対でのＰＣＲ増幅
によりスクリーニングした。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴ
ヌクレオチド及びＰＣＲプライマーの一方を用いてＰＲＯ１７８４遺伝子をコー
ドするクローンを単離するために使用した。 ヌクレオチド位置６８−７０に見かけの翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド位
置５０６−５０８に停止シグナルを有する単一の読み取り枠を含む全長クローン
が同定された（Ｆｉｇ２２７；配列番号：３８９）。予測されたポリペプチド前
駆体は１４６アミノ酸長であり、約１６，１１６ダルトンの算定分子量と約４．
９９の推定ｐＩを有する。シグナルペプチド、膜貫通ドメイン及びN-ミリストイ
ル化部位のおよその位置はＦｉｇ２２８に示す。クローンＤＮＡ７７３０３−２
５０２はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７９が付されている。 Ｆｉｇ２２８（配列番号：３９０）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用してのＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン
３５．４５SwissProt３５）の解析により、ＰＲＯ１７８４アミノ酸配列と次の
Ｄａｙｈｏｆｆ配列：RNU87224_1, RNAF000114_1, P_W31947, S18038, AE001300
_8, AF039833_1, P_W39833_1, P_W39788, HSU872231, NTU06712_1, 及びP_W3194
6の間の配列同一性が証明された。

【０５６４】 実施例１１８：ヒトＰＲＯ１６０５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 天然ヒトＰＲＯ１６０５ポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ
７７６４８−１６８８）を、一次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優勢に示すヒト
胎児腎臓ｃＤＮＡライブラリにおいて、酵母スクリーニングを使用して同定した
。 Ｆｉｇ２２９に示した全長ＤＮＡ７７６４８−１６８８クローンは単一のオー
プンリーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置４２５−４２７に見かけの
翻訳開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置８４５−８４７の停止コドンで終
端する（Ｆｉｇ２２９）。予測されるポリペプチド前駆体は１４０アミノ酸長で
ある（Ｆｉｇ２３０）。Ｆｉｇ２３０に示したＰＲＯ１６０５タンパク質は約１
５，６６８ダルトンの推定分子量及び約１０．１４のｐＩを有する。Ｆｉｇ２３
０（配列番号：３９５）に示した全長ＰＲＯ１６０５配列の分析は、以下のもの
の存在を証明した：約アミノ酸１から約アミノ酸２６のシグナルペプチド。クロ
ーンＤＮＡ７７６４８−１６８８は１９９８年１０月２７日にＡＴＣＣに寄託さ
れ、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０８が付与されている。 Ｆｉｇ２３０（配列番号：３９５）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配
列アラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45
SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１６０５アミノ酸配列と以下のDayhoff配
列：GNT5_HUMAN, P_R48975, P_W22519, MM26SPR0T_1, HSU86782_1, CH60_LEPIN,
HMCT_HELPY, F65126, HIU08875_1及びP_R41724との間の有意な相同性が証明さ
れた。

【０５６５】 実施例１１９：ヒトＰＲＯ１７８８０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 Swiss-Prot公的データベースからの約９５０の既知の分泌タンパク質から（あ
れば分泌死すなる配列を含む）細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列を用いてＥＳＴデ
ータベースを検索した。ＥＳＴデータベースは公的データベース（例えば、GenB
ank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmac
euticals、Palo Alto, CA）を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLA
ST又はBLAST2[Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)]を用
いて、ＥＳＴ配列の６フレーム翻訳とのＥＣＤタンパク質配列の比較として実施
した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０又はそれ以上を持つ興
味ある配列としてIncyteクローン番号２９６８３０４を同定した。Incyteクロー
ン番号２９６８３０４のヌクレオチド配列はここで「ＤＮＡ６６１２」と命名す
る。 また、ＤＮＡ６６１２配列を、BLAST及びphrap（Phil Green, University of
Washington, Seattle, Washington）の繰り返しサイクルを用いて伸長し、該配
列を上で検討したＥＳＴ配列の供給源を用いて可能な限り伸長させた。伸長した
コンセンサス配列はここで「ＤＮＡ４９６４８」と命名した。ＤＮＡ４９６４８
コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡ
ライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１７８８の全長コード化配列のクロ
ーンを単離するプローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した
。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した：： 正方向ＰＣＲプライマー CCCTGCCAGCCGAGAGCTTCACC（49648.f1；配列番号：398
） 逆方向ＰＣＲプライマー GGTTGGTGCCCGAAAGGTCCAGC（49648.r1；配列番号：399
） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４９６４８配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ：CAACCCCAAGCTTAACTGGGCAGGAGCTGA GGTGTTTTCAGGCC
（49648.p1配列番号：400） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１７８８遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト胎児腎臓
組織から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１７８８の全
長ＤＮＡ配列（ここではＤＮＡ７７６５２−２５０５と命名[Ｆｉｇ２３１、配
列番号：３９６]）；及びＰＲＯ１７８８の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１７８８の全コード化配列はＦｉｇ２３１（配列番号：３９６）に示す
。クローンＤＮＡ７７６５２−２５０５は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、ヌクレオチド位置６４−６６に見かけの翻訳開始部位を持ち、そして
ヌクレオチド位置１１２３−１１２５に見かけの停止コドンを持つ。予測される
ポリペプチド前駆体は３５３アミノ酸長である。Ｆｉｇ２３２に示した全長ＰＲ
Ｏ１７８８タンパク質は約３７，８４７ダルトンの推定分子量及び約６．８０の
ｐＩを有する。ＰＲＯ１７８８の更なる特徴は、約アミノ酸１−１６のシグナル
ペプチド；約アミノ酸２１５−２３２及び２８７−３０４の膜貫通ドメイン；約
アミノ酸７４−７７及び１３７−１４０の潜在的なＮ-グリコシル化部位；約ア
ミノ酸４５−４８のグリコサミノグリカン付着部位；約アミノ酸１３−１８、３
２−３７、８８−９３、２１４−２１９、及び２２３−２２８のＮ-ミリストイ
ル化部位；及び約アミノ酸２８４−３０５のロイシンジッパーパターンを含む。 Ｆｉｇ２３２（配列番号：３９７）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１７８８のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：AF030435_1; AF062006_1; DMTARTAN_1; GARP_HUMAN; S42799; P_R
71294; HSU88879_1; DROWHEELER_1; A58532; 及びAF068920_1との間の有意な相
同性が明らかにされた。 クローンＤＮＡ７７６５２−２５０５は１９９８年１１月１７日にＡＴＣＣに
寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４８０が付与された。

【０５６６】 実施例１２０：ヒトＰＲＯ１８０１をコードするｃＤＮＡクローンの単離 企業の発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incyt
e Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を検索して、ＩＬ-１９タンパク質に対し
て相同性を示すＥＳＴを同定した。このＥＳＴ配列はIncyteＥＳＴクローン番号
８１９５９２であり、ここでＤＮＡ７９２９３と命名する。ＤＮＡ７９２９３配
列に基づいて、１）ＰＣＲにより対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同
定するため、及び２）ＰＲＯ１８０１の全長コード化配列のクローンを単離する
プローブとして使用するために、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した：： 正方向ＰＣＲプライマー 5'-CTCCTGTGGTCTCCAGATTTCAGGCCTA-3'（配列番号：403
）；及び 逆方向ＰＣＲプライマー 5'-AGTCCTCCTTAAGATTCTGATGTCAA-3'（配列番号：404）
。 ｃＤＮＡライブラリの作成のためのＲＮＡはヒト胎児腎臓組織から単離された
。ｃＤＮＡクローンの単離に用いたｃＤＮＡライブラリは、Invitrogen, San Di
ego, CAからのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法によって作成した。ｃＤ
ＮＡは、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴでプライムし、平滑末端でＳａｌＩヘミ
キナーゼアダプターに結合させ、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサ
イズ分類し、そして適切なクローニングベクター（ｐＲＫＢ又はｐＲＫ５Ｄ等；
ｐＲＫ５ＢはＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Holmes等, Sc
ience, 253: 1278-1280 (1991)参照）に、独特のＸｈｏＩ及びＮｏｔＩ部位にお
いて、所定の方向でクローニングした。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１８０１の全
長ＤＮＡ配列[ここではＤＮＡ８３５００−２５０６と命名]（Ｆｉｇ２３３、配
列番号：４０１）；及びＰＲＯ１８０１の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ８３５００−２５０６の全ヌクレオチド配列はＦｉｇ２３３に示される
（配列番号：４０１）。クローンＤＮＡ８３５００−２５０６は単一のオープン
リーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置１０９−１１１に見かけの翻訳
開始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置８９２−８９４の停止コドンで終端す
る（Ｆｉｇ２３３）。予測されるポリペプチド前駆体は２６１アミノ酸長である
（Ｆｉｇ２３４）。Ｆｉｇ２３４に示した全長ＰＲＯ１８０１タンパク質は約２
９，６６７ダルトンの推定分子量及び約８．７６のｐＩを有する。Ｆｉｇ２３４
（配列番号：４０２）に示された全長ＰＲＯ１８０１の分析により次のものの存
在が証明される：約アミノ酸１から約アミノ酸４２のシグナルペプチド、約アミ
ノ酸１９２から約アミノ酸１９５及び約アミノ酸２２５から約アミノ酸２２８の
ｃＡＭＰ-及びｃＧＭＰ-依存性プロテインキナーゼリン酸化部位及び約アミノ酸
４２から約アミノ酸４７、約アミノ酸４６から約アミノ酸５１及び約アミノ酸１
３６から約アミノ酸１４１の潜在的なＮ-ミリストイル化部位。クローンＤＮＡ
８３５００−２５０６は１９９８年１０月２９日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣ
Ｃ寄託番号２０３３９１が付与された。 Ｆｉｇ２３４（配列番号：４０２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１８０１のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：P_W37935, HGS_B477, P_R32277, IL10_MACFA, P_W46585, P_W4658
5, P_R39714, P_R71471, P_R10159, IL10_RAT 及びP_W57201との間の有意な相同
性が証明された。

【０５６７】 実施例１２１：ヒトＵＣＰ４をコードするｃＤＮＡクローンの単離 公的ＥＳＴデータベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータ
ベース（LIFESEQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含むＥ
ＳＴデータベースについてヒトＵＣＰ３と相同性を有する配列を検索した。検索
は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymo
logy 266: 460-480 (1996)）を用いてＵＣＰ３タンパク質のＥＳＴ配列の６フレ
ーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコ
ア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラムAssemble
LIGN及びMacVector（Oxford Molecular Group，Inc.）で集団化してコンセンサ
スＤＮＡ配列に構築した。 AsemnlLIGNソフトウェアを用いて他のＥＳＴ配列に対してＤＮＡ配列（「from
DNA」）を構築した。また、fromDNA配列を、BLAST及びAssemblLIGNの繰り返しサ
イクルを用いて伸長し、該配列を上で検討したＥＳＴ配列の供給源を用いて可能
な限り伸長させた。このコンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを合
成し、ＰＣＲによりＵＣＰ４に対する全長コード化配列のクローンを単離した。
正方向及び逆方向ＰＣＲプライマーは一般的に２０から３０ヌクレオチドの範囲
であり、しばしば約１００−１０００ｂｐ長のＰＣＲ産物を与えるように設計さ
れる。プローブ配列は、典型的に４０−５５ｂｐ長である。或る場合には、コン
センサス配列が約１−１．５ｋｂｐより大きいときに付加的なオリゴヌクレオチ
ドが合成される。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した：： 正方向ＰＣＲプライマー CGCGGATCCCGTTATCGTCTTGCGCTACTGC （配列番号：407） 逆方向ＰＣＲプライマー GCGGAATTCTTAAAATGGACTGACTCCACTCATC（配列番号：408
）。 ｃＤＮＡライブラリの作成のためのＲＮＡは脳組織から単離された。ｃＤＮＡ
クローンの単離に用いたｃＤＮＡライブラリは、Invitrogen, San Diego, CAか
らのもの等の市販試薬を用いて標準的な方法によって作成した。ｃＤＮＡは、Ｎ
ｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴでプライムし、平滑末端でＳａｌＩヘミキナーゼア
ダプターに結合させ、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動でおよそのサイズ分類し
、そして適切なクローニングベクター（ｐＲＫＢ又はｐＲＫ５Ｄ等；ｐＲＫ５Ｂ
はＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Holmes等, Science, 253
: 1278-1280 (1991)参照）に、独特のＸｈｏＩ及びＮｏｔＩ部位において、所定
の方向でクローニングした。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＵＣＰ４の全長ＤＮ
Ａ配列[ここではＤＮＡ７７５６８−１６２６と命名]（Ｆｉｇ２３５、配列番号
：４０５）及びＵＣＰ４の誘導タンパク質配列が得られた。 ＵＣＰ４の全コード化配列はＦｉｇ２３５に示される（配列番号：４０５）。
クローンＤＮＡ７７５６８−１６２６は単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置２７−２９に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置９９６−９９８に見かけの停止コドンを持つ（Ｆｉｇ２３５；配列
番号：４０５参照）。予測されるポリペプチド前駆体は３２３アミノ酸長である
。ＵＣＰ４は膜結合タンパク質であり、少なくとも６つの膜貫通領域を含むと今
は信じられている。ＵＣＰ４アミノ酸配列におけるこれらの推定膜貫通領域はＦ
ｉｇ２３６に示されている。ｐｃＤＮＡ３ベクター（Invitrogen）に含まれるク
ローンＤＮＡ７７５６８−１６２６はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２
０３１３４が付与されている。ＵＣＰ４ポリペプチドは寄託されたＡＴＴＣＣ２
０３１３４ベクターのｃＤＮＡ挿入断片によりコード化された分子を発現させる
ことにより得られ又は得られうる。ベクターのＢａｍＨＩ及びＥｃｏＲＩ制限酵
素での消化によりおよそ９７２プラス３４ｂｐの挿入物が得られる。Ｆｉｇ２３
６に示された全長ＵＣＰ４タンパク質は約３６，０６１の推定分子量及び約９．
２８の推定ｐＩを有する。

【０５６８】 実施例１２２：ヒトＰＲＯ１９３をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲに
より対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ
１９３の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために
、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した：： 正方向ＰＣＲプライマー 5'-GTTTGAGGAAGCTGGGATAC-3'（配列番号：411）；及び 逆方向ＰＣＲプライマー 5'-CCAAACTCGAGCACCTGTTC-3'（配列番号：412）。 さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサス配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ 5'-ATGGCAGGCTTCCTAGATAATTTTCGTTGGCCAGAATGTG-3'（配列番号：413） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１９３遺伝子をコードするクローンを単離す
るのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト網膜組織（
ＬＩＢ９４）から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１９３の全長
ＤＮＡ配列[ここではＤＮＡ２３３２２−１３９３と命名]（配列番号：４０９）
及びＰＲＯ１９３の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ２３３２２−１３９３の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ２３７（配列番号
：４０９）に示す。クローンＤＮＡ２３３２２−１３９３は、単一のオープンリ
ーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置１３８−１４０に見かけの翻訳開
始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置６１２−６１４の見かけの停止コドンで
終端する（Ｆｉｇ２３７）。予測されるポリペプチド前駆体は１５８アミノ酸長
である（Ｆｉｇ２３８）。Ｆｉｇ２３８に示した全長ＰＲＯ１９３タンパク質は
約１７，９３６ダルトンの推定分子量及び約５．３２のｐＩを有する。クローン
ＤＮＡ２３３２２−１３９３はＡＴＣＣに寄託された。配列に関しては、寄託さ
れたクローンは正しい配列を含むことが理解され、ここに提示される配列は既知
の配列決定法に基づく。 配列番号：４１０のアミノ酸配列を更に分析すると、膜貫通ドメインは配列番
号：４１０の約アミノ酸２３−４２、６０−８０、９７−１１７及び１２８−１
４８にある。細胞付着配列は配列番号：４１０の約アミノ酸８１−８３にある。
ペルオキシダーゼ近位ヘム-リガンドドメインは配列番号：４１０の約アミノ酸
８１−８３にある。対応するヌクレオチドはここに提供される配列が与えられる
と常套的に決定することができる。

【０５６９】 実施例１２３：ヒトＰＲＯ１１３０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ３４３６
０と命名する。ＤＮＡ３４３６０コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲによ
り対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１
１３０の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために
、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した：： 正方向ＰＣＲプライマー（34360.f1） 5'-GCCATAGTCACGACATGGATG-3'（配列番号
：416） 正方向ＰＣＲプライマー（34360.f2） 5'-GGATGGCCAGAGCTGCTG-3'（配列番号：4
17） 正方向ＰＣＲプライマー（34360.f3） 5'-AAAGTACAAGTGTGGCCTCATCAAGC-3'（配
列番号：418） 逆方向ＰＣＲプライマー（34360.r1） 5'-TCTGACTCCTAAGTCAGGCAGGAG-3'（配列
番号：419） 逆方向ＰＣＲプライマー（34360.r2） 5'-ATTCTCTCCACAGACAGCTGGTTC-3'（配列
番号：420） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ３４３６０配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ（34360.p1） 5'-GTACAAGTGTGGCCTCATCAAGCCCTGCCCAGCCAACTACTTTGCG-3'（配列番号：421） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１１３０遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト大動脈内
皮細胞組織から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１１３０の全
長ＤＮＡ配列（ここではＤＮＡ５９８１４−１４８６と命名[Ｆｉｇ２３９、配
列番号：４１４]）；及びＰＲＯ１１３０の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ５９８１４−１４８６の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ２３９（配列番号
：４１４）に示す。クローンＤＮＡ５９８１４−１４８６は、単一のオープンリ
ーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置３１２−３１４に見かけの翻訳開
始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置９８４−９８６の見かけの停止コドンで
終端する（Ｆｉｇ２３９）。予測されるポリペプチド前駆体は２２４アミノ酸長
である（Ｆｉｇ２４０）。Ｆｉｇ２４０に示した全長ＰＲＯ１１３０タンパク質
は約２４，９６３ダルトンの推定分子量及び約９．６４のｐＩを有する。Ｆｉｇ
２４０（配列番号：４１５）に示された全長ＰＲＯ１１３０の分析により次のも
のの存在が証明される：約アミノ酸１から約アミノ酸１５のシグナルペプチド、
約アミノ酸１８４から約アミノ酸１９１のＡＴＰ／ＧＴＰ-結合部位モチーフＡ
及び約アミノ酸１０７から約アミノ酸１１０の潜在的なＮ-グリコシル化部位。
クローンＤＮＡ５９８１４−１４８６は１９９８年１０月２０日にＡＴＣＣに寄
託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５９が付与された。 Ｆｉｇ２４０（配列番号：４１５）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１１３０のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：P_W06547, 216_HUMAN, D87120_1, MMU72677_1, LAU04889_1, 及び
D69319との間の有意な相同性が証明された。

【０５７０】 実施例１２４：ヒトＰＲＯ１３３５をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記実施例１に記載したように、phrapを用いて他のＥＳＴに対してコンセン
サスＤＮＡ配列を組み立てた。このコンセンサス配列を、ここでＤＮＡ３５７２
７と命名する。ＤＮＡ３５７２７コンセンサス配列に基づいて、１）ＰＣＲによ
り対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲＯ１
３３５の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するために
、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した：： 正方向ＰＣＲプライマー（35727.f1） 5'-GTAAAGTCGCTGGCCAGC-3'（配列番号：
424） 正方向ＰＣＲプライマー（35727.f2） 5'-CCCGATCTGCCTGCTGTA-3'（配列番号：
425） 逆方向ＰＣＲプライマー（35727.r1） 5'-CTGCACTGTATGGCCATTATTGTG-3'（配列
番号：426） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレオ
チド配列を持つコンセンサスＤＮＡ３５７２７配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ（35727.p1） 5'-CAGAAACCCATGATACCCTACTGAACACCGAATCCCCTGGAAGCC-3'（配列番号：427） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３３５遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡは、ヒト網膜組織
から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３３５の全
長ＤＮＡ配列（ここではＤＮＡ６２８１２−１５９４と命名[Ｆｉｇ２４１、配
列番号：４２２]）；及びＰＲＯ１３３５の誘導タンパク質配列が得られた。 ＤＮＡ６２８１２−１５９４の全ヌクレオチド配列をＦｉｇ２４１（配列番号
：４２２）に示す。クローンＤＮＡ６２８１２−１５９４は、単一のオープンリ
ーディングフレームを含み、ヌクレオチド位置２７１−２７３に見かけの翻訳開
始部位を持ち、そしてヌクレオチド位置１２８２−１２８４の停止コドンで終端
する（Ｆｉｇ２４１）。予測されるポリペプチド前駆体は３３７アミノ酸長であ
る（Ｆｉｇ２４２）。Ｆｉｇ２４２に示した全長ＰＲＯ１３３５タンパク質は約
３７，６６８ダルトンの推定分子量及び約６．２７のｐＩを有する。Ｆｉｇ２４
２（配列番号：４２３）に示された全長ＰＲＯ１３３５の分析により次のものの
存在が証明される：約アミノ酸１から約アミノ酸１５のシグナルペプチド、約ア
ミノ酸２９１から約アミノ酸３１０の膜貫通ドメイン、約アミノ酸２１３から約
アミノ酸２１６の潜在的なＮ-グリコシル化部位及び約アミノ酸１９７から約ア
ミノ酸２４５、約アミノ酸１０４から約アミノ酸１４０及び約アミノ酸２２から
約アミノ酸６９の真核生物型脱炭酸酵素タンパク質と相同性を有するアミノ酸配
列ブロック。クローンＤＮＡ６２８１２−１５９４は１９９８年９月９日にＡＴ
ＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２４８が付与された。 Ｆｉｇ２４２（配列番号：４２３）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３３５のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：AF037335_1, I38013, PTPG_MOUSE, CAH2_HUMAN, 1CAC, CAH7_HUMA
N, CAH3_HUMAN, CAH1_HUMAN, CAH5_HUMAN及びP_R41746との間の有意な相同性が
証明された。

【０５７１】 実施例１２５：ヒトＰＲＯ１３２９をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、IncyteＥ
ＳＴクラスター配列番号１６７５４４と命名され、ここで「ＤＮＡ１０６８０」
とも呼ばれるLIFESEQ（商品名）データベースからのＥＳＴクラスター配列の同
定が可能となった。次いでこのＥＳＴクラスター配列を、公的データベース（例
えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFESEQ(商品名)、Incy
te Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）デ
ータベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検索は、コンピュー
タプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzymology 266: 460-
480 (1996)）を用いて実施した。既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア
７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プログラム「phrap」
（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washington）で集団化し
てコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。ＥＳＴの一又は複数は関節リウマチを持
つ女性の肘から取り除いた滑膜組織から単離されたＲＮＡから作成されたｃＤＮ
Ａライブラリから取り出された。そこから得られたコンセンサス配列を、ここで
「ＤＮＡ５８８３６」と命名する。 ＤＮＡ５８８３６配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン番号３６８７７４に含
まれる配列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン番号３６８７７４を購
入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦｉｇ
２４３に示し、ここでＤＮＡ６６６６０−１５８５と命名する。 Ｆｉｇ２４３に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置９０−９２に見かけの翻訳開始部位を持ち、そしてヌク
レオチド位置７１７−７１９の停止コドンで終端する（Ｆｉｇ２４３；配列番号
：４２８）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ２４４、配列番号：４２９
）は２０９アミノ酸長であり、シグナル配列は約アミノ酸１−１６にある。ＰＲ
Ｏ１３２９は約２１，５８８ダルトンの算定分子量及び約５．５０の推定ｐＩを
有する。クローンＤＮＡ６６６６０−１５８５は１９９８年９月２２日にＡＴＣ
Ｃに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７９が付与された。 Ｆｉｇ２４４（配列番号：４２９）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３２９のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：CELK06A9_3, PROA_XANCP, CXU21300_4, MTV037_17, SYN1_RAT, I5
6542, S60743, BN0LE3_1, AB001573_1, 及びP_P80671との間のある程度の相同性
が明らかにされた。

【０５７２】 実施例１２６：ヒトＰＲＯ１５５０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ＣＥＬＴ
１５Ｂ７＿１２と命名され、ここで「ＤＮＡ１００２２」とも呼ばれるＭｅｒｃ
ｋデータベースからのＥＳＴ配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴ配列
を、公的及び企業のＥＳＴデータベース（例えば、GenBank及びLIFESEQ(商品名)
）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同
性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altsc
hul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知
のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以
上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washing
ton, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。
そこから得られたコンセンサス配列を、ここで「ＤＮＡ５５７０８」と命名する
。 ＤＮＡ５５７０８配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン番号３４１１６５９に
含まれる配列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン３４１１６５９を購
入し、ｃＤＮＡ挿入物を得てその全体を配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配
列をＦｉｇ２４５に示し、ここで「ＤＮＡ７６３９３−１６６４」と命名する。 Ｆｉｇ２４５に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置１３８−１４０に見かけの翻訳開始部位を持ち、そして
ヌクレオチド位置８６７−８６９に見いだされる停止コドンで終端する（Ｆｉｇ
２４５；配列番号：４３０）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ２４６、
配列番号：４３１）は２４３アミノ酸長である。ＰＲＯ１５５０タンパク質の他
の特徴は、約アミノ酸１−３０のシグナル配列；約アミノ酸１９５−２１７の疎
水性ドメイン；及び約アミノ酸１８６−１８９の潜在的なＮ-グリコシル化部位
を含む。ＰＲＯ１５５０は約２６，２６６ダルトンの算定分子量及び約８．４３
の推定ｐＩを有する。クローンＤＮＡ７６３９３−１６６４は１９９８年１０月
６日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２３が付与された。 Ｆｉｇ２４６（配列番号：４３１）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５５０のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：CELF59E12_11; CA24_ASCSU; AF018082_1; CA13_BOVIN; CA54_HUMA
N; CA34_HUMAN; HUMCOL7A1X_1; P_W09643; AF053538_1; 及びHSEMCXIV2_1との間
のある程度の相同性が明らかにされた。

【０５７３】 実施例１２７：ハイブリッド形成プローブとしてのＰＲＯの使用 以下の方法は、ＰＲＯをコードする核酸配列のハイブリッド形成プローブとし
ての使用を記載する。 ここに開示する全長又は成熟ＰＲＯのコード化配列を含むＤＮＡは、ヒト組織
ｃＤＮＡライブラリ又はヒト組織ゲノムライブラリにおける同種ＤＮＡ類（ＰＲ
Ｏポリペプチドの天然発生変異体をコードするものなど）のスクリーニングのた
めのプローブとして用いられる。 いずれかのライブラリＤＮＡを含むフィルターのハイブリッド形成及び洗浄は
、以下の高い緊縮条件で実施した。放射性標識ＰＲＯ-誘導プローブのフィルタ
ーへのハイブリッド形成は、50%ホルムアミド、5xＳＳＣ、0.1%ＳＤＳ、0.1%ピ
ロリン酸ナトリウム、50mMリン酸ナトリウム、pH6.8、2xデンハード液、及び10%
デキストラン硫酸の溶液中で、42℃において20時間行った。フィルターの洗浄は
、0.1xＳＳＣ及び0.1%ＳＤＳの水溶液中、42℃で行った。 次いで、全長天然配列ＰＲＯをコードするＤＮＡと所望の配列同一性を有する
ＤＮＡは、この分野で知られた標準的な方法を用いて同定できる。

【０５７４】 実施例１２８：大腸菌におけるＰＲＯの発現 この実施例は、大腸菌における組み換え発現による所望のＰＲＯの非グリコシ
ル化形態の調製を例示する。 ＰＲＯをコードするＤＮＡ配列は、選択されたＰＣＲプライマーを用いて最初
に増幅した。プライマーは、選択された発現ベクターの制限酵素部位に対応する
制限酵素部位を持たなければならない。種々の発現ベクターを用いることができ
る。好適なベクターの例は、ｐＢＲ３２２（大腸菌から誘導されたもの；Boliva
r等, Gene, 2:95 (1977)を参照）であり、アンピシリン及びテトラサイクリン耐
性についての遺伝子を含む。ベクターは、制限酵素で消化され、脱リン酸化され
る。ＰＣＲ増幅した配列は、次いで、ベクターに結合させる。ベクターは、好ま
しくは抗生物質耐性遺伝子、ｔｒｐプロモーター、ｐｏｌｙｈｉｓリーダー（最
初の６つのＳＴＩＩコドン、ｐｏｌｙｈｉｓ配列、及びエンテロキナーゼ切断部
位を含む）、ＰＲＯコード化領域、ラムダ転写終結区、及びａｒｇＵ遺伝子を含
む。 ライゲーション混合物は、次いで、上掲のSambrook等に記載された方法を用い
た選択した大腸菌株の形質転換に使用される。形質転換体は、それらのＬＢプレ
ートで成長する能力により同定され、次いで抗生物質耐性クローンが選択される
。プラスミドＤＮＡが単離され、制限分析及びＤＮＡ配列分析で確認される。 選択されたクローンは、抗生物質を添加したＬＢブロスなどの液体培地で終夜
成長させることができる。終夜培養は、続いて大規模培養の播種に用いられる。
次に細胞を最適光学密度まで成長させ、その間に発現プロモーターが作動する。 更に数時間の培養の後、細胞を採集して遠心分離できる。遠心分離で得られた
細胞ペレットは、この分野で知られた種々の試薬を用いて可溶化され、次いで可
溶化ＰＲＯタンパク質を金属キレート化カラムを用いてタンパク質を緊密に結合
させる条件下で精製することができる。 以下の手法を用いて、大腸菌においてポリＨｉｓタグ形態でＰＲＯを発現させ
てもよい。ＰＲＯをコードするＤＮＡを選択したＰＣＲプライマーを用いて最初
に増幅する。プライマーは、選択された発現ベクターの制限酵素部位に対応する
制限酵素部位、及び効率的で信頼性のある翻訳開始、金属キレートカラムでの迅
速な精製、及びエンテロキナーゼでのタンパク質分解的除去を与える他の有用な
配列を含む。次いでＰＣＲ増幅された、ポリ-Ｈｉｓタグ配列を発現ベクターに
結合させ、それを株５２（W3110 fuhA(tonA) lon galE rpoHts(htpRts) clpP(la
cIq)）に基づく大腸菌宿主の形質転換に使用した。形質転換体は、最初に50mg/m
lのカルベニシリンを含有するＬＢ中、30℃で振盪しながら3-5のＯ．Ｄ．６００
に達するまで成長させた。ついで培養をＣＲＡＰ培地（3.57gの（ＮＨ_４）_２Ｓ
Ｏ_４、0.71gのクエン酸ナトリウム・2H2O、1.07gのＫＣｌ、5.36gのDifco酵母抽
出物、500mL水中の5.36gのShefield hycase SF、並びに110mMのＭＰＯＳ、pH7.3
、0.55%（w/v）のグルコース及び７ｍMのＭｇＳＯ_４の混合で調製）中に50-100
倍希釈し、30℃で振盪させながら約20-30時間成長させた。試料を取り出してＳ
ＤＳ-ＰＡＧＥにより発現を確認し、バルク培養を遠心分離して細胞をペレット
化した。細胞ペレットを精製及び再折りたたみまで凍結させた。

【０５７５】 0.5から1Lの発酵（6-10gペレット）からの大腸菌ペーストを、7Mのグアニジン
、20mMのトリス、pH8バッファー中で10容量（w/v）で再懸濁させた。固体硫酸ナ
トリウム及びテトラチオン酸ナトリウムを添加して最終濃度を各々0.1M及び0.02
Mとし、溶液を4℃で終夜撹拌した。この工程により、亜硫酸によりブロックされ
た全てのシステイン残基を持つ変性タンパク質がもたらされた。溶液をBeckman
Ultracentrifuge中で40,000rpmで30分間遠心分離した。上清を金属キレートカラ
ムバッファー（6Mのグアニジン、20mMのトリス、pH7.4）の3-5容量で希釈し、0.
22ミクロンフィルターを通して濾過して透明化した。透明化抽出物を、金属キレ
ートカラムバッファーで平衡化させた5mlのQiagen Ni-NTA金属キレートカラムに
充填した。カラムを50mMのイミダゾール（Calbiochem, Utrol grade）を含む添
加バッファー、pH7.4で洗浄した。タンパク質を250mMのイミダゾールを含有する
バッファーで溶離した。所望のタンパク質を含有する画分をプールし、4℃で保
存した。タンパク質濃度は、そのアミノ酸配列に基づいて計算した吸光係数を用
いて280nmにおけるその吸収により見積もった。 試料を、20mMのトリス、pH8.6、0.3MのＮａＣｌ、2.5Mの尿素、5ｍＭのシステ
イン、20mMのグリシン及び1mMのＥＤＴＡからなる新たに調製した再折りたたみ
バッファー中に徐々に希釈することによりタンパク質を再折りたたみさせた。リ
フォールディング容量は、最終的なタンパク質濃度が50〜100マイクログラム/ml
となるように選択した。リフォールディング溶液を4℃で12-36時間ゆっくり撹拌
した。リフォールディング反応はＴＦＡを最終濃度0.4%（約３のｐＨ）で添加す
ることにより停止させた。タンパク質をさらに精製する前に、溶液を0.22ミクロ
ンフィルターを通して濾過し、アセトニトリルを最終濃度2-10%になるまで添加
した。再折りたたみされたタンパク質を、Poros R1/H逆相カラムで、0.1%ＴＦＡ
の移動バッファーと10〜80%のアセトニトリル勾配での溶離を用いてクロマトグ
ラフにかけた。A280吸収を持つ画分のアリコートをＳＤＳポリアクリルアミドゲ
ルで分析し、相同な再折りたたみされたタンパク質を含有する画分をプールした
。一般的に、殆どのタンパク質の正しく再折りたたみされた種は、これらの種が
最もコンパクトであり、その疎水性内面が逆相樹脂との相互作用から遮蔽されて
いるので、アセトニトリルの最低濃度で溶離される。凝集した種は通常、より高
いアセトニトリル濃度で溶離される。タンパク質の誤って折りたたまれた形態を
所望の形態から除くのに加えて、逆相工程は試料からエンドトキシンも除去する
。 所望の折りたたまれたＰＲＯポリペプチドを含有する画分をプールし、溶液に
向けた窒素の弱い気流を用いてアセトニトリルを除去した。タンパク質を、透析
又は調製バッファーで平衡化したG25 Superfine（Pharmacia）樹脂でのゲル濾過
及び滅菌濾過により、0.14Mの塩化ナトリウム及び4%のマンニトールを含む20mM
のＨｅｐｅｓ、pH6.8に処方した。 ここに開示した多くのＰＲＯポリペプチドが上記のようにして成功裏に発現さ
れた。

【０５７６】 実施例１２９：哺乳動物細胞でのＰＲＯの発現 この実施例は、哺乳動物細胞における組み換え発現による潜在的にグリコシル
化した形態のＰＲＯの調製を例示する。 発現ベクターとしてベクターｐＲＫ５（1989年3月15日公開のEP 307,247参照
）を用いた。場合によっては、ＰＲＯＤＮＡを選択した制限酵素を持つｐＲＫ５
に結合させ、上掲のSambrook等に記載されたようなライゲーション方法を用いて
ＰＲＯＤＮＡを挿入させる。得られたベクターは、ｐＲＫ５−ＰＲＯと呼ばれる
。 一実施態様では、選択された宿主細胞は２９３細胞とすることができる。ヒト
２９３細胞（ATCC CCL 1573）は、ウシ胎児血清及び場合によっては滋養成分及
び／又は抗生物質を添加したＤＭＥＭなどの培地中で組織培養プレートにおいて
成長させて集密化した。約10μｇのｐＲＫ５−ＰＲＯポリペプチドＤＮＡを約1
μgのＶＡ ＲＮＡ遺伝子コード化ＤＮＡ［Thimmappaya等, Cell, 31:543 (1982
))］と混合し、500μlの1mMトリス-ＨＣｌ、0.1mMＥＤＴＡ、0.227MＣａＣｌ_２
に溶解させた。この混合物に、滴状の、500μl の50mMＨＥＰＥＳ（pH7.35）、280mMのＮａＣｌ、1.5mMのＮａＰＯ_４を添加し、
25℃で10分間析出物を形成させた。析出物を懸濁し、２９３細胞に加えて37℃で
約4時間定着させた。培地を吸引し、2mlのＰＢＳ中20%グリセロールを30秒間添
加した。２９３細胞は、次いで無血清培地で洗浄し、新鮮な培地を添加し、細胞
を約5日間インキュベートした。 形質移入の約24時間後、培地を除去し、培地（のみ）又は200μCi/ml^３５Ｓ−
システイン及び200μCi/ml^３５Ｓ−メチオニンを含む培地で置換した。12時間の
インキュベーションの後、条件培地を回収し、スピンフィルターで濃縮し、15%
ＳＤＳゲルに添加した。処理したゲルを乾燥させ、ＰＲＯポリペプチドの存在を
現す選択された時間にわたってフィルムにさらした。形質転換した細胞を含む培
地に、更なるインキュベーションを施し（無血清培地で）、培地を選択されたバ
イオアッセイで試験した。 これに換わる技術において、ＰＲＯは、Somparyac等, Proc. Natl. Acad. Sci
., 12:7575 (1981)に記載されたデキストラン硫酸法を用いて２９３細胞に一過
的に導入される。２９３細胞は、スピナーフラスコ内で最大密度まで成長させ、
700μｇのｐＲＫ５−ＰＲＯＤＮＡを添加する。細胞は、まずスピナーフラスコ
から遠心分離によって濃縮し、ＰＢＳで洗浄した。ＤＮＡ−デキストラン沈殿物
を細胞ペレット上で4時間インキュベートした。細胞を20%グリセロールで90秒間
処理し、組織培地で洗浄し、組織培地、5μg/mlウシインシュリン及び0.1μg/ml
ウシトランスフェリンを含むスピナーフラスコに再度導入した。約4日後に、条
件培地を遠心分離して濾過し、細胞及び細胞片を除去した。次いで発現されたＰ
ＲＯを含む試料を濃縮し、透析及び／又はカラムクロマトグラフィー等の選択し
た方法によって精製した。 他の実施態様では、ＰＲＯをＣＨＯ細胞で発現させることができる。ｐＲＫ５
−ＰＲＯは、ＣａＰＯ_４又はＤＥＡＥ−デキストランなどの公知の試薬を用いて
ＣＨＯ細胞に形質移入することができる。上記したように、細胞培地をインキュ
ベートし、培地を培養培地（のみ）又は^３５Ｓ-メチオニン等の放射性標識を含
む培地に置換することができる。ＰＲＯポリペプチドの存在を同定した後、培地
を無血清培地に置換してもよい。好ましくは、培地を約6日間インキュベートし
、次いで条件培地を収集する。次いで、発現されたＰＲＯを含む培地を濃縮して
、任意の選択した方法によって精製することができる。 また、エピトープタグＰＲＯは、宿主ＣＨＯ細胞において発現させてもよい。
ＰＲＯはｐＲＫ５ベクターからサブクローニングしてもよい。サブクローン挿入
物は、ＰＣＲを施してバキュロウイルス発現ベクター中のポリ-ｈｉｓタグ等の
選択されたエピトープタグを持つ枠に融合できる。ポリ-ｈｉｓタグＰＲＯ挿入
物は、次いで、安定なクローンの選択のためのＤＨＦＲ等の選択マーカーを含む
ＳＶ４０誘導ベクターにサブクローニングできる。最後に、ＣＨＯ細胞をＳＶ４
０誘導ベクターで（上記のように）形質移入した。発現を確認するために、上記
のように標識化を行ってもよい。発現されたポリ-ｈｉｓタグＰＲＯを含む培地
は、次いで濃縮し、Ｎｉ^２＋−キレートアフィニティクロマトグラフィー等の選
択された方法により精製できる。 またＰＲＯは、一過性発現法によりＣＨＯ及び／又はＣＯＳ細胞で、他の安定
な発現方法によりＣＨＯ細胞で発現させてもよい。

【０５７７】 ＣＨＯ細胞における安定な発現は以下の方法を用いて実施された。タンパク質
は、それぞれのタンパク質の可溶化形態のコード化配列（例えば、細胞外ドメイ
ン）がＩｇＧ１のヒンジ、ＣＨ２及びＣＨ２ドメインを含む定常領域配列に融合
したＩｇＧ作成物（イムノアドヘシン）、又はポリ-Ｈｉｓタグ形態として発現
された。 ＰＣＲ増幅に続いて、対応するＤＮＡを、Ausubel等, Current Protocols of
Molecular Biology, Unit 3.26, John Wiley and Sons (1997)に記載されたよう
な標準的技術を用いてＣＨＯ発現ベクターにサブクローニングした。ＣＨＯ発現
ベクターは、対象とするＤＮＡの５’及び３’に適合する制限部位を有し、ｃＤ
ＮＡの便利なシャトル化ができるように作成される。ベクターは、Lucas等, Nuc
l. Acids res. 24: 9, 1774-1779 (1996)に記載されたようにＣＨＯ細胞での発
現を用い、対象とするｃＤＮＡ及びジヒドロフォレートレダクターゼ（ＤＨＦＲ
）の発現の制御にＳＶ４０初期プロモーター／エンハンサーを用いる。ＤＨＦＲ
発現は、形質移入に続くプラスミドの安定な維持のための選択を可能にする。 所望のプラスミドＤＮＡの12マイクログラムを、市販の形質移入試薬Superfec
t(登録商標)(Quiagen), Dosper(登録商標)及びFugene(登録商標)（Boehringer M
annheim）約一千万のＣＨＯ細胞に導入する。細胞は、上掲のLucas等に記載され
ているように成長させた。約3x10^−７細胞を、下記のような更なる成長及び生産
のためにアンプル中で凍結させた。 プラスミドＤＮＡを含むアンプルを水槽に配して解凍し、ボルテックスにより
混合した。内容物を10mLの媒質を含む遠心管にピペットして、1000rpmで５分間
遠心分離した。上清を吸引して細胞を10mLの選択培地（0.2μm濾過ＰＳ２０、5%
の0.2μm透析濾過ウシ胎児血清を添加）中に懸濁させた。次いで細胞を90mLの選
択培地を含む100mlスピナーに分ける。1-2日後、細胞を150mLの選択培地を満た
した250mLスピナーに移し、37℃でインキュベートする。さらに2-3日後、250mL
、500mL及び2000mLのスピナーを3x10^５細胞/mLで播種した。細胞培地を遠心分離
により新鮮培地に交換し、生産培地に再懸濁させた。任意の適切なＣＨＯ培地を
用いてもよいが、実際には1992年6月16日に発行された米国特許第5,122,469号に
記載された生産培地を使用した。3Lの生産スピナーを1.2ｘ10^６細胞/mLで播種し
た。0日目に、細胞数とｐＨを測定した。1日目に、スピナーをサンプルし、濾過
空気での散布を実施した。2日目に、スピナーをサンプルし、温度を33℃に変え
、500g/Lのグルコース及び0.6mLの10%消泡剤（例えば35%ポリジメチルシロキサ
ンエマルション、Dow Corning 365 Medical Grade Emulsion）の30mLとした。生
産を通して、ｐＨは7.2近傍に調節し維持した。10日後、又は生存率が70%を下回
るまで、細胞培地を遠心分離で回収して0.22μmフィルターを通して濾過した。
濾過物は、4℃で貯蔵するか、即座に精製用カラムに充填した。

【０５７８】 ポリ-Ｈｉｓタグ作成物について、タンパク質はNi-NTAカラム(Qiagen)を用い
て精製した。精製の前に、イミダゾールを条件培地に5mMの濃度まで添加した。
条件培地を、0.3MのＮａＣｌ及び5mMイミダゾールを含む20mMのＨｅｐｅｓ, pH7
.4バッファーで平衡化した6mlのNi-NTAカラムに4-5ml/分の流速で4℃においてポ
ンプ供給した。充填後、カラムをさらに平衡バッファーで洗浄し、タンパク質を
0.25Mイミダゾールを含む平衡バッファーで溶離した。高度に精製されたタンパ
ク質は、続いて10mMのＨｅｐｅｓ、0.14MのＮａＣｌ及び4%のマンニトールを含
む貯蔵バッファー中で25mlのG25 Superfine（Pharmacia）を用いて脱塩し、-80
℃で貯蔵した。 イムノアドヘシン（Ｆｃ含有）作成物を以下のようにして条件培地から精製し
た。条件培地を、20mMのリン酸ナトリウムバッファー, pH6.8で平衡化した5mlの
プロテインＡカラム（Pharmacia）に汲み上げた。充填後、カラムを平衡バッフ
ァーで強く洗浄した後、100mMのクエン酸, pH3.5で溶離した。溶離したタンパク
質は、1mlの画分を275μlの1Mトリスバッファー, pH9を含む管に回収することに
より即座に中性化した。高度に精製されたタンパク質は、続いてポリ-Ｈｉｓタ
グタンパク質について上記した貯蔵バッファー中で脱塩した。均一性はＳＤＳポ
リアクリルアミドゲルで試験し、エドマン(Edman)分解によりＮ-末端アミノ酸配
列決定した。 ここに開示したＰＲＯポリペプチドの多くが上記のようにして成功裏に発現さ
れた。

【０５７９】 実施例１３０：酵母菌でのＰＲＯの発現 以下の方法は、酵母菌中でのＰＲＯの組換え発現を記載する。 第１に、ＡＤＨ２／ＧＡＰＤＨプロモーターからのＰＲＯの細胞内生産又は分
泌のための酵母菌発現ベクターを作成する。ＰＲＯをコードするＤＮＡ及びプロ
モーターを選択したプラスミドの適当な制限酵素部位に挿入してＰＲＯの細胞内
発現を指示する。分泌のために、ＰＲＯをコードするＤＮＡを選択したプラスミ
ドに、ＡＤＨ２／ＧＡＰＤＨプロモーターをコードするＤＮＡ、天然ＰＲＯシグ
ナルペプチド又は他の哺乳動物シグナルペプチド、又は、例えば酵母菌アルファ
因子又はインベルターゼ分泌シグナル／リーダー配列、及び（必要ならば）ＰＲ
Ｏの発現のためのリンカー配列とともにクローニングすることができる。 酵母菌株ＡＢ１１０等の酵母菌は、次いで上記の発現プラスミドで形質転換し
、選択された発酵培地中で培養できる。形質転換した酵母菌上清は、10%トリク
ロロ酢酸での沈降及びＳＤＳ−ＰＡＧＥによる分離で分析し、次いでクマシーブ
ルー染色でゲルの染色をすることができる。 続いて組換えＰＲＯは、発酵培地から遠心分離により酵母菌細胞を除去し、次
いで選択されたカートリッジフィルターを用いて培地を濃縮することによって単
離及び精製できる。ＰＲＯを含む濃縮物は、選択されたカラムクロマトグラフィ
ー樹脂を用いてさらに精製してもよい。 ここに開示したＰＲＯポリペプチドの多くが上記のようにして成功裏に発現さ
れた。

【０５８０】 実施例１３１：バキュロウイルス感染昆虫細胞でのＰＲＯの発現 以下の方法は、バキュロウイルス感染昆虫細胞中におけるＰＲＯの組換え発現
を記載する。 ＰＲＯコードする配列を、バキュロウイルス発現ベクターに含まれるエピトー
プタグの上流に融合させた。このようなエピトープタグは、ポリ-ｈｉｓタグ及
び免疫グロブリンタグ（ＩｇＧのＦｃ領域など）を含む。ｐＶＬ１３９３（Navo
gen）などの市販されているプラスミドから誘導されるプラスミドを含む種々の
プラスミドを用いることができる。簡単には、ＰＲＯ又はＰＲＯコード化配列の
所定部分、例えば膜貫通タンパク質の細胞外ドメインをコードする配列又はタン
パク質が細胞外である場合の成熟タンパク質をコードする配列などが、５’及び
３’領域に相補的なプライマーでのＰＣＲにより増幅される。５’プライマーは
、隣接する（選択された）制限酵素部位を包含していてもよい。生産物は、次い
で、選択された制限酵素で消化され、発現ベクターにサブクローニングされる。 組換えバキュロウイルスは、上記のプラスミド及びBaculoGold(商品名)ウイル
スＤＮＡ（Pharmingen）を、Spodoptera frugiperda（「Ｓｆ９」）細胞（ATCC
CRL 1711）中にリポフェクチン（GIBCO-BRLから市販）を用いて同時形質移入す
ることにより作成される。28℃で4-5日インキュベートした後、放出されたウイ
ルスを回収し、更なる増幅に用いた。ウイルス感染及びタンパク質発現は、O'Re
illey等, Baculovirus expression vectors: A laboratory Manual, Oxford: Ox
ford University Press (1994)に記載されているように実施した。 次に、発現されたポリ-ｈｉｓタグＰＲＯは、例えばＮｉ^２＋−キレートアフ
ィニティクロマトグラフィーにより次のように精製される。抽出は、Rupert等,
Nature, 362:175-179 (1993)に記載されているように、ウイルス感染した組み換
えＳｆ９細胞から調製した。簡単には、Ｓｆ９細胞を洗浄し、超音波処理用バッ
ファー（25mMのＨｅｐｅｓ、pH7.9；12.5mMのＭｇＣｌ_２；0.1mM ＥＤＴＡ；10
%グリセロール；0.1%のＮＰ−４０；0.4MのＫＣｌ）中に再懸濁し、氷上で2回20
秒間超音波処理した。超音波処理物を遠心分離で透明化し、上清を負荷バッファ
ー（50mMリン酸塩、300mMのＮａＣｌ、10%グリセロール、pH7.8）で50倍希釈し
、0.45μmフィルターで濾過した。Ｎｉ^２＋−ＮＴＡアガロースカラム（Qiagen
から市販）を5mLの総容積で調製し、25mLの水で洗浄し、25mLの負荷バッファー
で平衡させた。濾過した細胞抽出物は、毎分0.5mLでカラムに負荷した。カラム
を、分画回収が始まる点であるＡ_２８０のベースラインまで負荷バッファーで洗
浄した。次に、カラムを、結合タンパク質を非特異的に溶離する二次洗浄バッフ
ァー（50mMリン酸塩；300mMのＮａＣｌ、10%グリセロール、pH6.0）で洗浄した
。Ａ_２８０のベースラインに再度到達した後、カラムを二次洗浄バッファー中で
0から500mMイミダゾール勾配で展開した。1mLの分画を回収し、ＳＤＳ−ＰＡＧ
Ｅ及び銀染色又はアルカリホスファターゼ（Qiagen）に複合したＮｉ^２＋−ＮＴ
Ａでのウェスタンブロットで分析した。溶離したＨｉｓ１０−タグＰＲＯを含む
画分をプールして負荷バッファーで透析した。 あるいは、ＩｇＧタグ（又はＦｃタグ）ＰＲＯの精製は、例えば、プロテイン
Ａ又はプロテインＧカラムクロマトグラフィーを含む公知のクロマトグラフィー
技術を用いて実施できる。 ここに開示したＰＲＯポリペプチドの多くが上記のようにして成功裏に発現さ
れた。

【０５８１】 実施例１３２：ＰＲＯに結合する抗体の調製 この実施例は、ＰＲＯに特異的に結合できるモノクローナル抗体の調製を例示
する。 モノクローナル抗体の生産のための技術は、この分野で知られており、例えば
、上掲のGodingに記載されている。用いられ得る免疫原は、精製ＰＲＯ、ＰＲＯ
を含む融合タンパク質、細胞表面に組換えＰＲＯを発現する細胞を含む。免疫原
の選択は、当業者が過度の実験をすることなくなすことができる。 Ｂａｌｂ／ｃ等のマウスを、完全フロイントアジュバントに乳化して皮下又は
腹腔内に1-100マイクログラムで注入したＰＲＯ免疫原で免疫化する。あるいは
、免疫原をＭＰＬ−ＴＤＭアジュバント（Ribi Immunochemical Researh, Hamil
ton, MT）に乳化し、動物の後足蹠に注入してもよい。免疫化したマウスは、次
いで10から12日後に、選択したアジュバント中に乳化した付加的免疫源で追加免
疫する。その後、数週間、マウスをさらなる免疫化注射で追加免疫する。抗ＰＲ
Ｏ抗体の検出のためのＥＬＩＳＡアッセイで試験するために、レトロオービタル
出血からの血清試料をマウスから周期的に採取してもよい。 適当な抗体力価が検出された後、抗体に「ポジティブ（陽性）」な動物に、Ｐ
ＲＯ静脈内注射の最後の注入をすることができる。3から4日後、マウスを屠殺し
、脾臓細胞を取り出した。次いで脾臓細胞を（35%ポリエチレングリコールを用
いて）、ＡＣＴＴから番号ＣＲＬ１５９７で入手可能なＰ３Ｘ６３ＡｇＵ．１等
の選択されたマウス骨髄腫株化細胞に融合させた。融合によりハイブリドーマ細
胞が生成され、次いで、ＨＡＴ（ヒポキサンチン、アミノプテリン、及びチミジ
ン）培地を含む96ウェル組織培養プレートに蒔き、非融合細胞、骨髄腫ハイブリ
ッド、及び脾臓細胞ハイブリッドの増殖を阻害した。 ハイブリドーマ細胞は、ＰＲＯに対する反応性についてのＥＬＩＳＡでスクリ
ーニングされる。ＰＲＯに対する所望のモノクローナル抗体を分泌する「ポジテ
ィブ（陽性）」ハイブリドーマ細胞の決定は、技術常識の範囲内である。 陽性ハイブリドーマ細胞を同系のＢａｌｂ／ｃマウスに腹腔内注入し、抗ＰＲ
Ｏモノクローナル抗体を含む腹水を生成させる。あるいは、ハイブリドーマ細胞
を、組織培養フラスコ又はローラーボトルで成長させることもできる。腹水中に
生成されたモノクローナル抗体の精製は、硫酸アンモニウム沈降、それに続くゲ
ル排除クロマトグラフィ−を用いて行うことができる。あるいは、抗体のプロテ
インＡ又はプロテインＧへの親和性に基づくアフィニティクロマトグラフィーを
用いることもできる。

【０５８２】 実施例１３３：特異的抗体を用いたＰＲＯポリペプチドの精製 天然又は組換えＰＲＯポリペプチドは、この分野の種々の標準的なタンパク質
精製方法によって精製できる。例えば、プロ-ＰＲＯポリペプチド、成熟ポリペ
プチド、又はプレ-ＰＲＯポリペプチドは、対象とするＰＲＯポリペプチドに特
異的な抗体を用いた免疫親和性クロマトグラフィーによって精製される。一般に
、免疫親和性カラムは抗ＰＲＯポリペプチド抗体を活性化クロマトグラフィー樹
脂に共有結合させて作成される。 ポリクローナル免疫グロブリンは、硫酸アンモニウムでの沈殿又は固定化プロ
テインＡ（Pharmacia LKB Biotechnology, Piscataway, N.J.）での精製のいず
れかにより免疫血清から調製される。同様に、モノクローナル抗体は、硫酸アン
モニウム沈殿又は固定化プロテインＡでのクロマトグラフィーによりマウス腹水
液から調製される。部分的に精製された免疫グロブリンは、ＣｎＢｒ-活性化セ
ファロース(商品名)（Pharmacia LKB Biotechnology）等のクロマトグラフィー
樹脂に共有結合される。抗体が樹脂に結合され、樹脂がブロックされ、誘導体樹
脂は製造者の指示に従って洗浄される。 このような免疫親和性カラムは、可溶化形態のＰＲＯポリペプチドを含有する
細胞からの画分を調製することによるＰＲＯポリペプチドの精製において利用さ
れる。この調製物は、洗浄剤の添加又はこの分野で公知の方法により微分遠心分
離を介して得られる全細胞又は細胞成分画分の可溶化により誘導される。あるい
は、シグナル配列を含む可溶化ＰＲＯポリペプチドは、細胞が成長する培地中に
有用な量で分泌される。 可溶化ＰＲＯポリペプチド含有調製物は、免疫親和性カラムを通され、カラム
はＰＲＯポリペプチドの好ましい吸着をさせる条件下（例えば、洗浄剤存在下の
高イオン強度バッファー）で洗浄される。次いで、カラムは、抗体／ＰＲＯポリ
ペプチド結合を分解する条件下（例えば、約2-3といった低ｐＨ、高濃度の尿素
又はチオシアン酸イオン等のカオトロープ）で溶離され、ＰＲＯポリペプチドが
回収される。 実施例１３４：薬剤スクリーニング 本発明は、ＰＲＯポリペプチド又はその結合断片を種々の薬剤スクリーニング
技術において使用することによる化合物のスクリーニングに特に有用である。そ
のような試験に用いられるＰＲＯポリペプチド又は断片は、溶液中の自由状態で
も、固体支持体に固定されても、細胞表面に担持されていても、細胞内に位置し
ていてもよい。薬剤スクリーニングの１つの方法は、ＰＲＯポリペプチド又は断
片を発現する組換え核酸で安定に形質移入される真核生物又は原核生物宿主細胞
を利用する。薬剤は、そのような形質移入細胞に対して、競合的結合アッセイに
おいてスクリーニングされる。そのような細胞は、生存可能又は固定化形態のい
ずれかにおいて、標準的な結合アッセイに使用できる。例えば、ＰＲＯポリペプ
チド又は断片と試験される試薬の間での複合体の形成を測定してよい。あるいは
、試験する試薬によって生ずるＰＲＯポリペプチドとその標的細胞との間の複合
体形成における減少を試験することもできる しかして、本発明は、ＰＲＯポリペプチド関連疾患又は障害に影響を与えうる
薬剤又は任意の他の試薬のスクリーニング方法を提供する。これらの方法は、そ
の試薬をＰＲＯポリペプチド又は断片に接触させ、(I)試薬とＰＲＯポリペプチ
ド又は断片との間の複合体の存在について、又は(ii)ＰＲＯポリペプチド又は断
片と細胞との間の複合体の存在について検定することを含む。これらの競合結合
アッセイでは、ＰＲＯポリペプチド又は断片が典型的には標識される。適切なイ
ンキュベーションの後、自由なＰＲＯポリペプチド又は断片を結合形態のものか
ら分離し、自由又は未複合の標識の量が、特定の試薬がＰＲＯポリペプチドに結
合する又はＰＲＯポリペプチド／細胞複合体を阻害する能力の尺度となる。 薬剤スクリーニングのための他の技術は、ポリペプチドに対して適当な結合親
和性を持つ化合物についての高スループットスクリーニングを提供し、1984年9
月13日に公開されたWO 84/03564に詳細に記載されている。簡単に述べれば、多
数の異なる小型ペプチド試験化合物が、プラスチックピン等の固体支持体又は幾
つかの他の表面上で合成される。ＰＲＯポリペプチドに適用すると、ペプチド試
験化合物はＰＲＯポリペプチドと反応して洗浄される。結合したＰＲＯポリペプ
チドはこの分野で良く知られた方法により検出される。精製したＰＲＯポリペプ
チドは、上記の薬剤スクリーニング技術に使用するためにプレート上に直接被覆
することもできる。さらに、非中和抗体は、ペプチドを捕捉し、それを固体支持
体上に固定化するのに使用できる。 また、本発明は、ＰＲＯポリペプチドに結合可能な中和抗体がＰＲＯポリペプ
チド又はその断片について試験化合物と特異的に競合する競合薬剤スクリーニン
グアッセイも考慮する。この方法において、抗体は、ＰＲＯポリペプチドで、一
又は複数の抗原決定基を持つ任意のペプチドの存在を検出するのに使用できる。

【０５８３】 実施例１３５：合理的薬剤設計 合理的薬剤設計の目的は、対象とする生物学的活性ポリペプチド（例えば、Ｐ
ＲＯポリペプチド）又はそれらが相互作用する小分子、例えばアゴニスト、アン
タゴニスト、又はインヒビターの構造的類似物を製造することである。これらの
例の任意のものが、ＰＲＯポリペプチドのより活性で安定な形態又はインビボで
ＰＲＯポリペプチドに機能を促進又は阻害する薬剤の創作に使用できる（参考、
Hodgson, Bio/Technology, 9: 19-21 (1991)）。 １つの方法において、ＰＲＯポリペプチド、又はＰＲＯポリペプチド-インヒ
ビター複合体の三次元構造が、ｘ線結晶学により、コンピュータモデル化により
、最も典型的には２つの方法の組み合わせにより決定される。分子の構造を解明
し活性部位を決定するためには、ＰＲＯポリペプチドの形状及び電荷の両方が確
認されなければならない。数は少ないが、ＰＲＯポリペプチドの構造に関する有
用な情報が相同タンパク質の構造に基づいたモデル化によって得られることもあ
る。両方の場合において、関連する構造情報は、類似ＰＲＯポリペプチド様分子
の設計又は効果的なインヒビターの同定に使用される。合理的な薬剤設計の有用
な例は、Braxton及びWells, Biochemistry, 31: 7796-7801 (1992)に示されてい
るような向上した活性又は安定性を持つ分子、又はAthauda等, J. Biochem., 11
3: 742-746 (1993)に示されているような天然ペプチドのインヒビター、アゴニ
スト、又はアンタゴニストとして作用する分子を含む。 また、上記のような機能アッセイによって選択された標的特異的な抗体を単離
しその結晶構造を解明することもできる。この方法は、原理的には、それに続く
薬剤設計が基礎をおくことのできるファーマコア(pharmacore)を生成する。機能
的な薬理学的に活性な抗体に対する抗-イディオタイプ抗体（抗-ids）を生成す
ることにより、タンパク質結晶学をバイパスすることができる。鏡像の鏡像とし
て、抗-idsの結合部位は最初のレセプターの類似物であると予測できる。抗-id
は、次いで、化学的又は生物学的に製造したペプチドのバンクからペプチドを同
定及び単離するのに使用できる。単離されたペプチドは、ファーマコアとして機
能するであろう。 本発明により、十分な量のＰＲＯポリペプチドがＸ線結晶学などの分析実験を
実施するために入手可能である。さらに、ここに提供したＰＲＯポリペプチドア
ミノ酸配列の知識は、ｘ線結晶学に換える、又はそれに加えるコンピュータモデ
ル化技術で用いられる知識を提供する。

【０５８４】 材料の寄託 次の材料をアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション, 10801 ユニバー
シティ ブルバード，マナッサス，ヴァージニア20110-2209，米国(ATCC)に寄託
した： 表２ 材料 ATCC寄託番号 寄託日 DNA19902-1669 ATCC 203454 1998年11月3日 DNA26846-1397 ATCC 203406 1998年10月27日 DNA56107-1415 ATCC 203405 1998年10月27日 DNA56406-1704 ATCC 203478 1998年11月17日 DNA56529-1647 ATCC 203293 1998年9月29日 DNA56531-1648 ATCC 203286 1998年9月29日 DNA56862-1343 ATCC 203174 1998年9月1日 DNA57254-1477 ATCC 203289 1998年9月29日 DNA57841-1522 ATCC 203458 1998年11月3日 DNA58727-1474 ATCC 203171 1998年9月1日 DNA58730-1607 ATCC 203221 1998年9月15日 DNA58732-1650 ATCC 203290 1998年9月29日 DNA58828-1519 ATCC 203172 1998年9月1日 DNA58852-1637 ATCC 203271 1997年9月22日 DNA59212-1627 ATCC 203245 1998年9月9日 DNA59218-1559 ATCC 203287 1998年9月29日 DNA59219-1613 ATCC 203220 1998年9月15日 DNA59586-1520 ATCC 203288 1998年9月29日 DNA59817-1703 ATCC 203470 1998年11月17日 DNA60278-1530 ATCC 203170 1998年9月1日 DNA60608-1577 ATCC 203126 1998年8月18日 DNA60611-1524 ATCC 203175 1998年9月1日 DNA60618-1557 ATCC 203292 1998年9月29日 DNA60740-1615 ATCC 203456 1998年11月3日 DNA60764-1533 ATCC 203452 1998年11月10日 DNA60775-1532 ATCC 203173 1998年9月1日 DNA61185-1646 ATCC 203464 1998年11月17日 DNA61608-1606 ATCC 203239 1998年9月9日 DNA62808-1326 ATCC 203358 1998年10月20日 DNA62809-1531 ATCC 203237 1998年9月9日 DNA62815-1578 ATCC 203247 1998年9月9日 DNA62845-1684 ATCC 203361 1998年10月20日 DNA64842-1632 ATCC 203278 1998年9月22日 DNA64849-1604 ATCC 203468 1998年11月17日 DNA64863-1573 ATCC 203251 1998年9月9日 DNA64881-1602 ATCC 203240 1998年9月9日 DNA64883-1526 ATCC 203253 1998年9月9日 DNA64885-1529 ATCC 203457 1998年11月3日 DNA64886-1601 ATCC 203241 1998年9月9日 DNA64888-1542 ATCC 203249 1998年9月9日 DNA64889-1541 ATCC 203250 1998年9月9日 DNA64897-1628 ATCC 203216 1998年9月15日 DNA64902-1667 ATCC 203317 1998年10月6日 DNA64903-1553 ATCC 203223 1998年9月15日 DNA64905-1558 ATCC 203233 1998年9月15日 DNA64950-1590 ATCC 203224 1998年9月15日 DNA64952-1568 ATCC 203222 1998年9月15日 DNA65402-1540 ATCC 203252 1998年9月9日 DNA65403-1565 ATCC 203230 1998年9月15日 DNA65404-1551 ATCC 203244 1998年9月9日 DNA65405-1547 ATCC 203476 1998年11月17日 DNA65406-1567 ATCC 203219 1998年9月15日 DNA65408-1578 ATCC 203217 1998年9月15日 DNA65409-1566 ATCC 203232 1998年9月15日 DNA65410-1569 ATCC 203231 1998年9月15日 DNA65423-1595 ATCC 203227 1998年9月15日 DNA66304-1546 ATCC 203321 1998年10月6日 DNA66511-1411 ATCC 203228 1998年9月15日 DNA66512-1564 ATCC 203218 1998年9月15日 DNA66519-1535 ATCC 203236 1998年9月15日 DNA66520-1536 ATCC 203226 1998年9月15日 DNA66521-1583 ATCC 203225 1998年9月15日 DNA66526-1616 ATCC 203246 1998年9月9日 DNA66658-1584 ATCC 203229 1998年9月15日 DNA66659-1593 ATCC 203269 1998年9月22日 DNA66663-1598 ATCC 203268 1998年9月22日 DNA66669-1597 ATCC 203272 1998年9月22日 DNA66672-1586 ATCC 203265 1998年9月22日 DNA66674-1599 ATCC 203281 1998年9月22日 DNA66675-1587 ATCC 203282 1998年9月22日 DNA67962-1649 ATCC 203291 1998年9月29日 DNA68836-1656 ATCC 203455 1998年11月3日 DNA68864-1629 ATCC 203276 1998年9月22日 DNA68866-1644 ATCC 203283 1998年9月22日 DNA68871-1638 ATCC 203280 1998年9月22日 DNA68874-1622 ATCC 203277 1998年9月22日 DNA68880-1676 ATCC 203319 1998年10月6日 DNA68885-1570 ATCC 203311 1998年10月6日 DNA71166-1685 ATCC 203355 1998年10月20日 DNA71169-1709 ATCC 203467 1998年11月17日 DNA71180-1655 ATCC 203403 1998年10月27日 DNA71184-1634 ATCC 203266 1998年9月22日 DNA71213-1659 ATCC 203401 1998年10月27日 DNA71234-1651 ATCC 203402 1998年10月27日 DNA71277-1636 ATCC 203285 1998年9月22日 DNA71282-1668 ATCC 203312 1998年10月6日 DNA71286-1604 ATCC 203357 1998年10月20日 DNA71883-1660 ATCC 203475 1998年11月17日 DNA73401-1633 ATCC 203273 1998年9月22日 DNA73492-1671 ATCC 203324 1998年10月6日 DNA73727-1673 ATCC 203459 1998年11月3日 DNA73730-1679 ATCC 203320 1998年10月6日 DNA73734-1680 ATCC 203363 1998年10月20日 DNA73735-1681 ATCC 203356 1998年10月20日 DNA73736-1657 ATCC 203466 1998年11月17日 DNA73737-1658 ATCC 203412 1998年10月27日 DNA73739-1645 ATCC 203270 1998年9月22日 DNA73742-1662 ATCC 203316 1998年10月6日 DNA73744-1665 ATCC 203322 1998年10月6日 DNA73746-1654 ATCC 203411 1998年10月27日 DNA73760-1672 ATCC 203314 1998年10月6日 DNA76396-1698 ATCC 203417 1998年11月17日 DNA76398-1699 ATCC 203474 1998年11月17日 DNA76399-1700 ATCC 203472 1998年11月17日 DNA76401-1683 ATCC 203360 1998年10月20日 DNA76510-2504 ATCC 203477 1998年11月17日 DNA76522-2500 ATCC 203469 1998年11月17日 DNA76529-1666 ATCC 203315 1998年10月6日 DNA76531-1701 ATCC 203465 1998年11月17日 DNA76532-1702 ATCC 203473 1998年11月17日 DNA76538-1670 ATCC 203313 1998年10月6日 DNA76541-1675 ATCC 203409 1998年10月27日 DNA77301-1708 ATCC 203407 1998年10月27日 DNA77303-2502 ATCC 203479 1998年11月17日 DNA77648-1688 ATCC 203408 1998年10月27日 DNA77652-2505 ATCC 203480 1998年11月17日 DNA83500-2506 ATCC 203391 1998年10月29日 DNA77568-1626 ATCC 203134 1998年8月18日 DNA23322-1393 ATCC 203400 1998年10月27日 DNA59814-1486 ATCC 203359 1998年10月20日 DNA62812-1594 ATCC 203248 1998年9月9日 DNA66660-1585 ATCC 203279 1998年9月22日 DNA76393-1664 ATCC 203323 1998年10月6日

【０５８５】 これらの寄託は、特許手続き上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペス
ト条約及びその規則(ブダペスト条約)の規定に従って行われた。これは、寄託の
日付から３０年間、寄託の生存可能な培養が維持されることを保証するものであ
る。寄託物はブダペスト条約の条項に従い、またジェネンテク社とＡＴＣＣとの
間の合意に従い、ＡＴＣＣから入手することができ、これは、どれが最初であろ
うとも、関連した米国特許の発行時又は任意の米国又は外国特許出願の公開時に
、寄託培養物の後代を永久かつ非制限的に入手可能とすることを保証し、米国特
許法第１２２条及びそれに従う特許庁長官規則(特に参照番号８８６ＯＧ６３８
の３７ＣＦＲ第１．１４条を含む)に従って権利を有すると米国特許庁長官が決
定した者に子孫を入手可能とすることを保証するものである。 本出願の譲受人は、寄託した培養物が、適切な条件下で培養されていた場合に
死亡もしくは損失又は破壊されたならば、材料は通知時に同一の他のものと即座
に取り替えることに同意する。寄託物質の入手可能性は、特許法に従いあらゆる
政府の権限下で認められた権利に違反して、本発明を実施するライセンスである
とみなされるものではない。 上記の文書による明細書は、当業者に本発明を実施できるようにするために十
分であると考えられる。寄託した態様は、本発明のある側面の一つの説明として
意図されており、機能的に等価なあらゆる作成物がこの発明の範囲内にあるため
、寄託された作成物により、本発明の範囲が限定されるものではない。ここでの
物質の寄託は、ここに含まれる文書による説明が、そのベストモードを含む、本
発明の任意の側面の実施を可能にするために不十分であることを認めるものでは
ないし、それが表す特定の例証に対して請求の範囲を制限するものと解釈される
ものでもない。実際、ここに示し記載したものに加えて、本発明を様々に改変す
ることは、前記の記載から当業者にとっては明らかなものであり、添付の請求の
範囲内に入るものである。

【図面の簡単な説明】

【Ｆｉｇ１】 天然配列ＰＲＯ１５６０（ＵＮＱ７６７）ｃＤＮＡのヌクレ
オチド配列（配列番号：３）を示す。配列番号：３は、ここで「ＤＮＡ１９９０
２−１６６９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下
線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２】 Ｆｉｇ１に示した配列番号：３のコード化配列から誘導され
たアミノ酸配列（配列番号：４）を示す。

【Ｆｉｇ３】 天然配列ＰＲＯ４４４（ＵＮＱ３２８）ｃＤＮＡのヌクレオ
チド配列（配列番号：５）を示す。配列番号：５は、ここで「ＤＮＡ２６８４６
−１３９７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線
フォントで示した。

【Ｆｉｇ４】 Ｆｉｇ３に示した配列番号：５のコード化配列から誘導され
たアミノ酸配列（配列番号：６）を示す。

【Ｆｉｇ５】 天然配列ＰＲＯ１０１８（ＵＮＱ５０１）ｃＤＮＡのヌクレ
オチド配列（配列番号：７）を示す。配列番号：７は、ここで「ＤＮＡ５６１０
７−１４１５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下
線フォントで示した。

【Ｆｉｇ６】 Ｆｉｇ５に示した配列番号：７のコード化配列から誘導され
たアミノ酸配列（配列番号：８）を示す。

【Ｆｉｇ７】 天然配列ＰＲＯ１７７３（ＵＮＱ８３５）ｃＤＮＡのヌクレ
オチド配列（配列番号：９）を示す。配列番号：９は、ここで「ＤＮＡ５６４０
６−１７０４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下
線フォントで示した。

【Ｆｉｇ８】 Ｆｉｇ７に示した配列番号：９のコード化配列から誘導され
たアミノ酸配列（配列番号：１０）を示す。

【Ｆｉｇ９】 天然配列ＰＲＯ１４７７（ＵＮＱ７４７）ｃＤＮＡのヌクレ
オチド配列（配列番号：１１）を示す。配列番号：１１は、ここで「ＤＮＡ５６
５２９−１６４７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及
び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１０】 Ｆｉｇ９に示した配列番号：１１のコード化配列から誘導
されたアミノ酸配列（配列番号：１２）を示す。

【Ｆｉｇ１１】 天然配列ＰＲＯ１４７８（ＵＮＱ７４８）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１６）を示す。配列番号：１６は、ここで「ＤＮＡ５
６５３１−１６４８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１２】 Ｆｉｇ１１に示した配列番号：１６のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：１７）を示す。

【Ｆｉｇ１３】 天然配列ＰＲＯ８３１（ＵＮＱ４７１）ｃＤＮＡのヌクレ
オチド配列（配列番号：２１）を示す。配列番号：２１は、ここで「ＤＮＡ５６
８６２−１３４３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及
び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１４】 Ｆｉｇ１３に示した配列番号：２１のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：２２）を示す。

【Ｆｉｇ１５】 天然配列ＰＲＯ１１１３（ＵＮＱ５５６）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：２３）を示す。配列番号：２３は、ここで「ＤＮＡ５
７２５４−１４７７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１６】 Ｆｉｇ１５に示した配列番号：２３のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：２４）を示す。

【Ｆｉｇ１７】 天然配列ＰＲＯ１１９４（ＵＮＱ６０７）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：２８）を示す。配列番号：２８は、ここで「ＤＮＡ５
７８４１−１５２２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１８】 Ｆｉｇ１７に示した配列番号：２８のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：２９）を示す。

【Ｆｉｇ１９】 天然配列ＰＲＯ１１１０（ＵＮＱ５５３）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：３０）を示す。配列番号：３０は、ここで「ＤＮＡ５
８７２７−１４７４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２０】 Ｆｉｇ１９に示した配列番号：３０のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：３１）を示す。

【Ｆｉｇ２１】 天然配列ＰＲＯ１３７８（ＵＮＱ７１５）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：３２）を示す。配列番号：３２は、ここで「ＤＮＡ５
８７３０−１６０７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２２】 Ｆｉｇ２１に示した配列番号：３２のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：３３）を示す。

【Ｆｉｇ２３】 天然配列ＰＲＯ１４８１（ＵＮＱ７５０）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：４０）を示す。配列番号：４０は、ここで「ＤＮＡ５
８７３２−１６５０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２４】 Ｆｉｇ２３に示した配列番号：４０のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：４１）を示す。

【Ｆｉｇ２５】 天然配列ＰＲＯ１１８９（ＵＮＱ６０３）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：４２）を示す。配列番号：４２は、ここで「ＤＮＡ５
８８２８−１５１９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２６】 Ｆｉｇ２５に示した配列番号：４２のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：４３）を示す。

【Ｆｉｇ２７】 天然配列ＰＲＯ１４１５（ＵＮＱ７３１）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：４９）を示す。配列番号：４９は、ここで「ＤＮＡ５
８８５２−１６３７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２８】 Ｆｉｇ２７に示した配列番号：４９のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：５０）を示す。

【Ｆｉｇ２９】 天然配列ＰＲＯ１４１１（ＵＮＱ７２９）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：５１）を示す。配列番号：５１は、ここで「ＤＮＡ５
９２１２−１６２７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ３０】 Ｆｉｇ２９に示した配列番号：５１のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：５２）を示す。

【Ｆｉｇ３１】 天然配列ＰＲＯ１２９５（ＵＮＱ６６４）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：５３）を示す。配列番号：５３は、ここで「ＤＮＡ５
９２１８−１５５９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ３２】 Ｆｉｇ３１に示した配列番号：５３のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：５４）を示す。

【Ｆｉｇ３３】 天然配列ＰＲＯ１３５９（ＵＮＱ７０８）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：５５）を示す。配列番号：５５は、ここで「ＤＮＡ５
９２１９−１６１３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ３４】 Ｆｉｇ３３に示した配列番号：５５のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：５６）を示す。

【Ｆｉｇ３５】 天然配列ＰＲＯ１１９０（ＵＮＱ６０４）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：５７）を示す。配列番号：５７は、ここで「ＤＮＡ５
９５８６−１５２０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ３６】 Ｆｉｇ３５に示した配列番号：５７のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：５８）を示す。

【Ｆｉｇ３７】 天然配列ＰＲＯ１７７２（ＵＮＱ８３４）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：６２）を示す。配列番号：６２は、ここで「ＤＮＡ５
９８１７−１７０３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ３８】 Ｆｉｇ３７に示した配列番号：６２のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：６３）を示す。

【Ｆｉｇ３９】 天然配列ＰＲＯ１２４８（ＵＮＱ６３１）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：６７）を示す。配列番号：６７は、ここで「ＤＮＡ６
０２７８−１５３０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ４０】 Ｆｉｇ３９に示した配列番号：６７のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：６８）を示す。

【Ｆｉｇ４１】 天然配列ＰＲＯ１３１６（ＵＮＱ６８２）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：６９）を示す。配列番号：６９は、ここで「ＤＮＡ６
０６０８−１５７７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ４２】 Ｆｉｇ４１に示した配列番号：６９のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：７０）を示す。

【Ｆｉｇ４３】 天然配列ＰＲＯ１１９７（ＵＮＱ６１０）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：７１）を示す。配列番号：７１は、ここで「ＤＮＡ６
０６１１−１５２４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ４４】 Ｆｉｇ４３に示した配列番号：７１のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：７２）を示す。

【Ｆｉｇ４５】 天然配列ＰＲＯ１２９３（ＵＮＱ６６２）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：７６）を示す。配列番号：７６は、ここで「ＤＮＡ６
０６１８−１５５７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ４６】 Ｆｉｇ４５に示した配列番号：７６のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：７７）を示す。

【Ｆｉｇ４７】 天然配列ＰＲＯ１３８０（ＵＮＱ７１７）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：７８）を示す。配列番号：７８は、ここで「ＤＮＡ６
０７４０−１６１５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ４８】 Ｆｉｇ４７に示した配列番号：７８のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：７９）を示す。

【Ｆｉｇ４９】 天然配列ＰＲＯ１２６５（ＵＮＱ６３６）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：８３）を示す。配列番号：８３は、ここで「ＤＮＡ６
０７６４−１５３３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ５０】 Ｆｉｇ４９に示した配列番号：８３のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：８４）を示す。

【Ｆｉｇ５１】 天然配列ＰＲＯ１２５０（ＵＮＱ６３３）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：８５）を示す。配列番号：８５は、ここで「ＤＮＡ６
０７７５−１５３２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ５２】 Ｆｉｇ５１に示した配列番号：８５のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：８６）を示す。

【Ｆｉｇ５３】 天然配列ＰＲＯ１４７５（ＵＮＱ７４６）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：８７）を示す。配列番号：８７は、ここで「ＤＮＡ６
１１８５−１６４６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ５４】 Ｆｉｇ５３に示した配列番号：８７のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：８８）を示す。

【Ｆｉｇ５５】 天然配列ＰＲＯ１３７７（ＵＮＱ７１４）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：９４）を示す。配列番号：９４は、ここで「ＤＮＡ６
１６０８−１６０６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ５６】 Ｆｉｇ５５に示した配列番号：９４のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：９５）を示す。

【Ｆｉｇ５７】 天然配列ＰＲＯ１３２６（ＵＮＱ６８６）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：９９）を示す。配列番号：９９は、ここで「ＤＮＡ６
２８０８−１５８２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ５８】 Ｆｉｇ５７に示した配列番号：９９のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：１００）を示す。

【Ｆｉｇ５９】 天然配列ＰＲＯ１２４９（ＵＮＱ６３２）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１０１）を示す。配列番号：１０１は、ここで「ＤＮ
Ａ６２８０９−１５３１」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ６０】 Ｆｉｇ５９に示した配列番号：１０１のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１０２）を示す。

【Ｆｉｇ６１】 天然配列ＰＲＯ１３１５（ＵＮＱ６８１）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１０３）を示す。配列番号：１０３は、ここで「ＤＮ
Ａ６２８１５−１５７８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ６２】 Ｆｉｇ６１に示した配列番号：１０３のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１０４）を示す。

【Ｆｉｇ６３】 天然配列ＰＲＯ１５４９（ＵＮＱ７８２）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１１０）を示す。配列番号：１１０は、ここで「ＤＮ
Ａ６２８４５−１６８４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ６４】 Ｆｉｇ６３に示した配列番号：１１０のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１１１）を示す。

【Ｆｉｇ６５】 天然配列ＰＲＯ１４３０（ＵＮＱ７３６）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１１５）を示す。配列番号：１１５は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８４２−１６３２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ６６】 Ｆｉｇ６５に示した配列番号：１１５のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１１６）を示す。

【Ｆｉｇ６７】 天然配列ＰＲＯ１３７４（ＵＮＱ７１１）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１１７）を示す。配列番号：１０７は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８４９−１６０４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ６８】 Ｆｉｇ６７に示した配列番号：１１７のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１１８）を示す。

【Ｆｉｇ６９】 天然配列ＰＲＯ１３１１（ＵＮＱ６７７）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１２２）を示す。配列番号：１２２は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８６３−１５７３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ７０】 Ｆｉｇ６９に示した配列番号：１２２のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１２３）を示す。

【Ｆｉｇ７１】 天然配列ＰＲＯ１３５７（ＵＮＱ７０６）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１２７）を示す。配列番号：１２７は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８８１−１６０２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ７２】 Ｆｉｇ７１に示した配列番号：１２７のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１２８）を示す。

【Ｆｉｇ７３】 天然配列ＰＲＯ１２４４（ＵＮＱ６２８）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１２９）を示す。配列番号：１２９は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８８３−１５２６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ７４】 Ｆｉｇ７３に示した配列番号：１２９のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１３０）を示す。

【Ｆｉｇ７５】 天然配列ＰＲＯ１２４６（ＵＮＱ６３０）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１３１）を示す。配列番号：１３１は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８８５−１５２９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ７６】 Ｆｉｇ７５に示した配列番号：１３１のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１３２）を示す。

【Ｆｉｇ７７】 天然配列ＰＲＯ１３５６（ＵＮＱ７０５）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１３３）を示す。配列番号：１３３は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８８６−１６０１」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ７８】 Ｆｉｇ７７に示した配列番号：１３３のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１３４）を示す。

【Ｆｉｇ７９】 天然配列ＰＲＯ１２７５（ＵＮＱ６４５）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１３５）を示す。配列番号：１３５は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８８８−１５４２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ８０】 Ｆｉｇ７９に示した配列番号：１３５のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１３６）を示す。

【Ｆｉｇ８１】 天然配列ＰＲＯ１２７４（ＵＮＱ６４４）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１３７）を示す。配列番号：１３７は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８８９−１５４２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ８２】 Ｆｉｇ８０に示した配列番号：１３７のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１３８）を示す。

【Ｆｉｇ８３】 天然配列ＰＲＯ１４１２（ＵＮＱ７３０）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１３９）を示す。配列番号：１３９は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８９７−１６２８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ８４】 Ｆｉｇ８３に示した配列番号：１３９のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１４０）を示す。

【Ｆｉｇ８５】 天然配列ＰＲＯ１５５７（ＵＮＱ７６５）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１４１）を示す。配列番号：１４１は、ここで「ＤＮ
Ａ６４９０２−１６６７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ８６】 Ｆｉｇ８５に示した配列番号：１４１のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１４２）を示す。

【Ｆｉｇ８７】 天然配列ＰＲＯ１２８６（ＵＮＱ６５５）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１４３）を示す。配列番号：１４３は、ここで「ＤＮ
Ａ６４９０３−１６６７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ８８】 Ｆｉｇ８７に示した配列番号：１４３のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１４４）を示す。

【Ｆｉｇ８９】 天然配列ＰＲＯ１２９４（ＵＮＱ６６３）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１４５）を示す。配列番号：１４５は、ここで「ＤＮ
Ａ６４９０５−１５５８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ９０】 Ｆｉｇ８９に示した配列番号：１４５のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１４６）を示す。

【Ｆｉｇ９１】 天然配列ＰＲＯ１３４７（ＵＮＱ７０２）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１４７）を示す。配列番号：１４７は、ここで「ＤＮ
Ａ６４９５０−１５９０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ９２】 Ｆｉｇ９１に示した配列番号：１４７のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１４８）を示す。

【Ｆｉｇ９３】 天然配列ＰＲＯ１３０５（ＵＮＱ６７１）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１５２）を示す。配列番号：１５２は、ここで「ＤＮ
Ａ６４９５２−１５６８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ９４】 Ｆｉｇ９３に示した配列番号：１５２のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１５３）を示す。

【Ｆｉｇ９５】 天然配列ＰＲＯ１２７３（ＵＮＱ６４３）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１５７）を示す。配列番号：１５７は、ここで「ＤＮ
Ａ６５４０２−１５４０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ９６】 Ｆｉｇ９５に示した配列番号：１５７のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１５８）を示す。

【Ｆｉｇ９７】 天然配列ＰＲＯ１３０２（ＵＮＱ６６８）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１５９）を示す。配列番号：１５９は、ここで「ＤＮ
Ａ６５４０３−１５６５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ９８】 Ｆｉｇ９７に示した配列番号：１５９のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１６０）を示す。

【Ｆｉｇ９９】 天然配列ＰＲＯ１２８３（ＵＮＱ６５３）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１６１）を示す。配列番号：１６１は、ここで「ＤＮ
Ａ６５４０４−１５５１」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１００】 Ｆｉｇ９９に示した配列番号：１６１のコード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１６２）を示す。

【Ｆｉｇ１０１】 天然配列ＰＲＯ１２７９（ＵＮＱ６４９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：１６９）を示す。配列番号：１６９は、ここで「Ｄ
ＮＡ６５４０５−１５４７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１０２】 Ｆｉｇ１０１に示した配列番号：１６９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１７０）を示す。

【Ｆｉｇ１０３】 天然配列ＰＲＯ１３０４（ＵＮＱ６７０）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：１７９）を示す。配列番号：１７９は、ここで「Ｄ
ＮＡ６５４０６−１５６７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１０４】 Ｆｉｇ１０３に示した配列番号：１７９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１８０）を示す。

【Ｆｉｇ１０５】 天然配列ＰＲＯ１３１７（ＵＮＱ６８３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：１８８）を示す。配列番号：１８８は、ここで「Ｄ
ＮＡ６５４０８−１５７８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１０６】 Ｆｉｇ１０５に示した配列番号：１８８のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１８９）を示す。

【Ｆｉｇ１０７】 天然配列ＰＲＯ１３０３（ＵＮＱ６６９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：１９３）を示す。配列番号：１９３は、ここで「Ｄ
ＮＡ６５４０９−１５６６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１０８】 Ｆｉｇ１０７に示した配列番号：１９３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１９４）を示す。

【Ｆｉｇ１０９】 天然配列ＰＲＯ１３０６（ＵＮＱ６７２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：１９５）を示す。配列番号：１９５は、ここで「Ｄ
ＮＡ６５４１０−１５６９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１１０】 Ｆｉｇ１０９に示した配列番号：１９５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１９６）を示す。

【Ｆｉｇ１１１Ａ-Ｂ】 天然配列ＰＲＯ１３３６（ＵＮＱ６４９）ｃＤＮ
Ａのヌクレオチド配列（配列番号：１９７）を示す。配列番号：１９７は、ここ
で「ＤＮＡ６５４２３−１５９５」と命名されるクローンである。開始及び停止
コドンは太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１１２】 Ｆｉｇ１１１Ａ-Ｂに示した配列番号：１９７のコード
化配列から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１９８）を示す。

【Ｆｉｇ１１３】 天然配列ＰＲＯ１２７８（ＵＮＱ６４８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２０２）を示す。配列番号：２０２は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６３０４−１５４６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１１４】 Ｆｉｇ１１３に示した配列番号：２０２のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２０３）を示す。

【Ｆｉｇ１１５】 天然配列ＰＲＯ１２９８（ＵＮＱ６６６）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２０９）を示す。配列番号：２０９は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６５１１−１５６３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１１６】 Ｆｉｇ１１５に示した配列番号：２０９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２１０）を示す。

【Ｆｉｇ１１７】 天然配列ＰＲＯ１３０１（ＵＮＱ６６７）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２１１）を示す。配列番号：２１１は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６５１２−１５６４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１１８】 Ｆｉｇ１１７に示した配列番号：２１１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２１２）を示す。

【Ｆｉｇ１１９】 天然配列ＰＲＯ１２６８（ＵＮＱ６３８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２１３）を示す。配列番号：２１３は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６５１９−１５３５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１２０】 Ｆｉｇ１１９に示した配列番号：２１３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２１４）を示す。

【Ｆｉｇ１２１】 天然配列ＰＲＯ１２６９（ＵＮＱ６３９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２１５）を示す。配列番号：２１５は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６５２０−１５３６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１２２】 Ｆｉｇ１２１に示した配列番号：２１５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２１６）を示す。

【Ｆｉｇ１２３】 天然配列ＰＲＯ１３２７（ＵＮＱ６８７）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２１７）を示す。配列番号：２１７は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６５２１−１５８３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１２４】 Ｆｉｇ１２３に示した配列番号：２１７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２１８）を示す。

【Ｆｉｇ１２５】 天然配列ＰＲＯ１３８２（ＵＮＱ７１８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２１９）を示す。配列番号：２１９は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６５２６−１６１６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１２６】 Ｆｉｇ１２５に示した配列番号：２１９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２２０）を示す。

【Ｆｉｇ１２７】 天然配列ＰＲＯ１３２８（ＵＮＱ６８８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２２４）を示す。配列番号：２２４は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６５８−１５８４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１２８】 Ｆｉｇ１２７に示した配列番号：２２４のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２２５）を示す。

【Ｆｉｇ１２９】 天然配列ＰＲＯ１３２５（ＵＮＱ６８５）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２２６）を示す。配列番号：２２６は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６５９−１５９３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１３０】 Ｆｉｇ１２９に示した配列番号：２２６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２２７）を示す。

【Ｆｉｇ１３１】 天然配列ＰＲＯ１３４０（ＵＮＱ６９５）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２２８）を示す。配列番号：２２８は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６６３−１５９８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１３２】 Ｆｉｇ１３１に示した配列番号：２２８のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２２９）を示す。

【Ｆｉｇ１３３】 天然配列ＰＲＯ１３３９（ＵＮＱ６９４）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２３３）を示す。配列番号：２３３は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６６９−１５９７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１３４】 Ｆｉｇ１３３に示した配列番号：２３３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２３４）を示す。

【Ｆｉｇ１３５】 天然配列ＰＲＯ１３３７（ＵＮＱ６９２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２３５）を示す。配列番号：２３５は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６７２−１５８６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１３６】 Ｆｉｇ１３５に示した配列番号：２３５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２３６）を示す。

【Ｆｉｇ１３７】 天然配列ＰＲＯ１３４２（ＵＮＱ６９７）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２４２）を示す。配列番号：２４２は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６７４−１５９９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１３８】 Ｆｉｇ１３７に示した配列番号：２４２のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２４３）を示す。

【Ｆｉｇ１３９】 天然配列ＰＲＯ１３４３（ＵＮＱ６９８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２４７）を示す。配列番号：２４７は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６７５−１５８７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１４０】 Ｆｉｇ１３９に示した配列番号：２４７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２４８）を示す。

【Ｆｉｇ１４１】 天然配列ＰＲＯ１４８０（ＵＮＱ７４９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２５２）を示す。配列番号：２５２は、ここで「Ｄ
ＮＡ６７９６２−１６４９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１４２】 Ｆｉｇ１４１に示した配列番号：２５２のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２５３）を示す。

【Ｆｉｇ１４３Ａ-Ｂ】 天然配列ＰＲＯ１４８７（ＵＮＱ７５６）ｃＤＮ
Ａのヌクレオチド配列（配列番号：２５９）を示す。配列番号：２５９は、ここ
で「ＤＮＡ６８８３６−１６５６」と命名されるクローンである。開始及び停止
コドンは太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１４４】 Ｆｉｇ１４３Ａ-Ｂに示した配列番号：２５９のコード
化配列から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２６０）を示す。

【Ｆｉｇ１４５】 天然配列ＰＲＯ１４１８（ＵＮＱ７３２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２６４）を示す。配列番号：２６４は、ここで「Ｄ
ＮＡ６８８６４−１６２９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１４６】 Ｆｉｇ１４５に示した配列番号：２６４のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２６５）を示す。

【Ｆｉｇ１４７】 天然配列ＰＲＯ１４７２（ＵＮＱ７４４）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２６６）を示す。配列番号：２６６は、ここで「Ｄ
ＮＡ６８８６６−１６４４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１４８】 Ｆｉｇ１４７に示した配列番号：２６６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２６６）を示す。

【Ｆｉｇ１４９】 天然配列ＰＲＯ１４６１（ＵＮＱ７４２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２６８）を示す。配列番号：２６８は、ここで「Ｄ
ＮＡ６８８７１−１６３８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１５０】 Ｆｉｇ１４９に示した配列番号：２６８のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２６９）を示す。

【Ｆｉｇ１５１】 天然配列ＰＲＯ１４１０（ＵＮＱ７２８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２７０）を示す。配列番号：２７０は、ここで「Ｄ
ＮＡ６８８７４−１６２２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１５２】 Ｆｉｇ１５１に示した配列番号：２７０のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２７１）を示す。

【Ｆｉｇ１５３】 天然配列ＰＲＯ１５６８（ＵＮＱ７７４）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２７２）を示す。配列番号：２７２は、ここで「Ｄ
ＮＡ６８８８０−１６７６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１５４】 Ｆｉｇ１５３に示した配列番号：２７２のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２７３）を示す。

【Ｆｉｇ１５５】 天然配列ＰＲＯ１５７０（ＵＮＱ７７６）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２７４）を示す。配列番号：２７４は、ここで「Ｄ
ＮＡ６８８８５−１６７８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１５６】 Ｆｉｇ１５５に示した配列番号：２７４のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２７５）を示す。

【Ｆｉｇ１５７】 天然配列ＰＲＯ１３１７（ＵＮＱ７８３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２７６）を示す。配列番号：２７６は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１１６６−１６８５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１５８】 Ｆｉｇ１５７に示した配列番号：２７６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２７７）を示す。

【Ｆｉｇ１５９】 天然配列ＰＲＯ１７８０（ＵＮＱ８４２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２８１）を示す。配列番号：２８１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１１６９−１７０９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１６０】 Ｆｉｇ１５９に示した配列番号：２８１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２８２）を示す。

【Ｆｉｇ１６１】 天然配列ＰＲＯ１４８６（ＵＮＱ７５５）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２８６）を示す。配列番号：２８６は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１１８０−１６５５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１６２】 Ｆｉｇ１６１に示した配列番号：２８６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２８７）を示す。

【Ｆｉｇ１６３】 天然配列ＰＲＯ１４３３（ＵＮＱ７３８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２９１）を示す。配列番号：２９１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１１８４−１６３４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１６４】 Ｆｉｇ１６３に示した配列番号：２９１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２９２）を示す。

【Ｆｉｇ１６５】 天然配列ＰＲＯ１４９０（ＵＮＱ７５９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２９６）を示す。配列番号：２９６は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１２１３−１６５９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１６６】 Ｆｉｇ１６５に示した配列番号：２９６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２９７）を示す。

【Ｆｉｇ１６７】 天然配列ＰＲＯ１４８２（ＵＮＱ７５１）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３０１）を示す。配列番号：３０１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１２３４−１６５１」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１６８】 Ｆｉｇ１６７に示した配列番号：３０１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３０２）を示す。

【Ｆｉｇ１６９】 天然配列ＰＲＯ１４４６（ＵＮＱ７４０）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３０３）を示す。配列番号：３０３は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１２７７−１６３６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１７０】 Ｆｉｇ１６９に示した配列番号：３０３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３０４）を示す。

【Ｆｉｇ１７１】 天然配列ＰＲＯ１５５８（ＵＮＱ７６６）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３０５）を示す。配列番号：３０５は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１２８２−１６６８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１７２】 Ｆｉｇ１７１に示した配列番号：３０５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３０６）を示す。

【Ｆｉｇ１７３】 天然配列ＰＲＯ１６０４（ＵＮＱ７８５）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３０７）を示す。配列番号：３０７は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１２８６−１６８７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１７４】 Ｆｉｇ１７３に示した配列番号：３０７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３０８）を示す。

【Ｆｉｇ１７５】 天然配列ＰＲＯ１４９１（ＵＮＱ７６０）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３０９）を示す。配列番号：３０９は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１８８３−１６６０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１７６】 Ｆｉｇ１７５に示した配列番号：３０９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３１０）を示す。

【Ｆｉｇ１７７】 天然配列ＰＲＯ１４３１（ＵＮＱ７３７）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３１４）を示す。配列番号：３１４は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３４０１−１６３３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１７８】 Ｆｉｇ１７７に示した配列番号：３１４のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３１５）を示す。

【Ｆｉｇ１７９Ａ-Ｂ】 天然配列ＰＲＯ１５６３（ＵＮＱ７６９）ｃＤＮ
Ａのヌクレオチド配列（配列番号：３１６）を示す。配列番号：３１６は、ここ
で「ＤＮＡ７３７９２−１６７１」と命名されるクローンである。開始及び停止
コドンは太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１８０】 Ｆｉｇ１７９Ａ-Ｂ３に示した配列番号：３１６のコー
ド化配列から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３１７）を示す。

【Ｆｉｇ１８１】 天然配列ＰＲＯ１５６５（ＵＮＱ７７１）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３２１）を示す。配列番号：３２１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７２７−１６７３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１８２】 Ｆｉｇ１８１に示した配列番号：３２１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３２２）を示す。

【Ｆｉｇ１８３】 天然配列ＰＲＯ１５７１（ＵＮＱ７７７）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３２３）を示す。配列番号：３２３は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７３０−１６７９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１８４】 Ｆｉｇ１８３に示した配列番号：３２３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３２４）を示す。

【Ｆｉｇ１８５】 天然配列ＰＲＯ１５７２（ＵＮＱ７７８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３２５）を示す。配列番号：３２５は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７３４−１６８０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１８６】 Ｆｉｇ１８５に示した配列番号：３２５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３２６）を示す。

【Ｆｉｇ１８７】 天然配列ＰＲＯ１５７３（ＵＮＱ７７９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３２７）を示す。配列番号：３２７は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７３５−１６８１」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１８８】 Ｆｉｇ１８７に示した配列番号：３２７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３２８）を示す。

【Ｆｉｇ１８９】 天然配列ＰＲＯ１４８８（ＵＮＱ７５７）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３２９）を示す。配列番号：３２９は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７３６−１６５７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１９０】 Ｆｉｇ１８９に示した配列番号：３２９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３３０）を示す。

【Ｆｉｇ１９１】 天然配列ＰＲＯ１４８９（ＵＮＱ７５８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３３１）を示す。配列番号：３３１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７３７−１６５８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１９２】 Ｆｉｇ１９１に示した配列番号：３３１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３３２）を示す。

【Ｆｉｇ１９３】 天然配列ＰＲＯ１４７４（ＵＮＱ７４５）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３３３）を示す。配列番号：３３３は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７３９−１６４５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１９４】 Ｆｉｇ１９３に示した配列番号：３３３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３３４）を示す。

【Ｆｉｇ１９５】 天然配列ＰＲＯ１５０８（ＵＮＱ７６１）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３３５）を示す。配列番号：３３５は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７４２−１６６２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１９６】 Ｆｉｇ１９５に示した配列番号：３３５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３３６）を示す。

【Ｆｉｇ１９７】 天然配列ＰＲＯ１５５５（ＵＮＱ７６３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３３７）を示す。配列番号：３３７は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７４４−１６６５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１９８】 Ｆｉｇ１９７に示した配列番号：３３７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３３８）を示す。

【Ｆｉｇ１９９】 天然配列ＰＲＯ１４８５（ＵＮＱ７５４）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３３９）を示す。配列番号：３３９は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７４６−１６５４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２００】 Ｆｉｇ１９９に示した配列番号：３３９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３４０）を示す。

【Ｆｉｇ２０１】 天然配列ＰＲＯ１５６４（ＵＮＱ７７０）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３４６）を示す。配列番号：３４６は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７６０−１６７２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２０２】 Ｆｉｇ２０１に示した配列番号：３４６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３４７）を示す。

【Ｆｉｇ２０３】 天然配列ＰＲＯ１７５５（ＵＮＱ８２８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３５１）を示す。配列番号：３５１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６３９６−１６９８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２０４】 Ｆｉｇ２０３に示した配列番号：３５１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３５２）を示す。

【Ｆｉｇ２０５】 天然配列ＰＲＯ１７５７（ＵＮＱ８３０）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３５３）を示す。配列番号：３５３は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６３９８−１６９９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２０６】 Ｆｉｇ２０５に示した配列番号：３５３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３５４）を示す。

【Ｆｉｇ２０７】 天然配列ＰＲＯ１７５８（ＵＮＱ８３１）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３５５）を示す。配列番号：３５５は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６３９９−１７００」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２０８】 Ｆｉｇ２０７に示した配列番号：３５５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３５６）を示す。

【Ｆｉｇ２０９】 天然配列ＰＲＯ１５７５（ＵＮＱ７８１）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３５７）を示す。配列番号：３５７は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６４０１−１６８３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２１０】 Ｆｉｇ２０９に示した配列番号：３５７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３５８）を示す。

【Ｆｉｇ２１１】 天然配列ＰＲＯ１７８７（ＵＮＱ８４９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３６３）を示す。配列番号：３６３は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５１０−２５０４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２１２】 Ｆｉｇ２１１に示した配列番号：３６３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３６４）を示す。

【Ｆｉｇ２１３】 天然配列ＰＲＯ１７８１（ＵＮＱ８４３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３６５）を示す。配列番号：３６５は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５２２−２５００」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２１４】 Ｆｉｇ２１３に示した配列番号：３６５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３６６）を示す。

【Ｆｉｇ２１５】 天然配列ＰＲＯ１５５６（ＵＮＱ７６４）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３７１）を示す。配列番号：３７１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５２９−１６６６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２１６】 Ｆｉｇ２１５に示した配列番号：３７１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３７２）を示す。

【Ｆｉｇ２１７】 天然配列ＰＲＯ１７５９（ＵＮＱ８３２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３７３）を示す。配列番号：３７３は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５３１−１７０１」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２１８】 Ｆｉｇ２１７に示した配列番号：３７３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３７４）を示す。

【Ｆｉｇ２１９】 天然配列ＰＲＯ１７６０（ＵＮＱ８３３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３７５）を示す。配列番号：３７５は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５３２−１７０２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２２０】 Ｆｉｇ２１９に示した配列番号：３７５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３７６）を示す。

【Ｆｉｇ２２１】 天然配列ＰＲＯ１５６１（ＵＮＱ７６８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３７７）を示す。配列番号：３７７は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５３８−１６７０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２２２】 Ｆｉｇ２２１に示した配列番号：３７７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３７８）を示す。

【Ｆｉｇ２２３】 天然配列ＰＲＯ１５６７（ＵＮＱ７７３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３８２）を示す。配列番号：３８２は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５４１−１６７５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２２４】 Ｆｉｇ２２３に示した配列番号：３８２のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３８３）を示す。

【Ｆｉｇ２２５】 天然配列ＰＲＯ１６９３（ＵＮＱ８０３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３８４）を示す。配列番号：３８４は、ここで「Ｄ
ＮＡ７７３０１−１６９３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２２６】 Ｆｉｇ２２５に示した配列番号：３８４のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３８５）を示す。

【Ｆｉｇ２２７】 天然配列ＰＲＯ１７８４（ＵＮＱ８４６）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３８９）を示す。配列番号：３８９は、ここで「Ｄ
ＮＡ７７３０３−２５０２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２２８】 Ｆｉｇ２２７に示した配列番号：３８９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３９０）を示す。

【Ｆｉｇ２２９】 天然配列ＰＲＯ１６０５（ＵＮＱ７８６）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３９４）を示す。配列番号：３９４は、ここで「Ｄ
ＮＡ７７６４８−１６８８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２３０】 Ｆｉｇ２２９に示した配列番号：３９４のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３９５）を示す。

【Ｆｉｇ２３１】 天然配列ＰＲＯ１７８８（ＵＮＱ８５０）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３９６）を示す。配列番号：３９６は、ここで「Ｄ
ＮＡ７７６５２−２５０５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２３２】 Ｆｉｇ２３１に示した配列番号：３９６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３９７）を示す。

【Ｆｉｇ２３３】 天然配列ＰＲＯ１８０１（ＵＮＱ８５２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：４０１）を示す。配列番号：４０１は、ここで「Ｄ
ＮＡ８３５００−２５０６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２３４】 Ｆｉｇ２３３に示した配列番号：４０１コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４０２）を示す。

【Ｆｉｇ２３５】 天然配列ＵＣＰ４ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番
号：４０５）を示す。配列番号：４０５は、ここで「ＤＮＡ７７５６８−１６２
６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線フォント
で示した。

【Ｆｉｇ２３６】 Ｆｉｇ２３５に示した配列番号：４０５コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４０６）を示す。

【Ｆｉｇ２３７】 天然配列ＰＲＯ１９３ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配
列番号：４０９）を示す。配列番号：４０９は、ここで「ＤＮＡ２３３２２−１
３９３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線フォ
ントで示した。

【Ｆｉｇ２３８】 Ｆｉｇ２３７に示した配列番号：４０９コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４１０）を示す。

【Ｆｉｇ２３９】 天然配列ＰＲＯ１１３０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（
配列番号：４１４）を示す。配列番号：４１４は、ここで「ＤＮＡ５９８１４−
１４８６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線フ
ォントで示した。

【Ｆｉｇ２４０】 Ｆｉｇ２３９に示した配列番号：４１４コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４１５）を示す。

【Ｆｉｇ２４１】 天然配列ＰＲＯ１３３５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（
配列番号：４２２）を示す。配列番号：４２２は、ここで「ＤＮＡ６２８１２−
１５９４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線フ
ォントで示した。

【Ｆｉｇ２４２】 Ｆｉｇ２４１に示した配列番号：４２２コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４２３）を示す。

【Ｆｉｇ２４３】 天然配列ＰＲＯ１３２９ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（
配列番号：４２８）を示す。配列番号：４２８は、ここで「ＤＮＡ６６６６０−
１５８５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線フ
ォントで示した。

【Ｆｉｇ２４４】 Ｆｉｇ２４３に示した配列番号：４２８コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４２９）を示す。

【Ｆｉｇ２４５】 天然配列ＰＲＯ１５５０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（
配列番号：４３０）を示す。配列番号：４３０は、ここで「ＤＮＡ７６３９３−
１６６４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線フ
ォントで示した。

【Ｆｉｇ２４６】 Ｆｉｇ２４５に示した配列番号：４３０コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４３１）を示す。

【Ｆｉｇ２４７Ａ−Ｄ】 ALIGN-2配列アラインメントコンピュータプログ
ラムを用いた％アミノ酸配列同一性（Fig２７４Ａ−Ｂ）及び％核酸配列同一性
（Fig２４７Ｃ−Ｄ）を決定するために下記の方法を使用した仮説的例示を示し
、「ＰＲＯ」は対象とする仮説的ＰＥＡＣＨポリペプチドのアミノ酸配列を示し
、「比較タンパク質」は対象とする「ＰＲＯ」ポリペプチドが比較されるポリペ
プチドのアミノ酸配列を示し、「ＰＲＯ-ＤＮＡ」は対象とする仮説的ＰＥＡＣ
Ｈコード化核酸配列を示し、「比較ＤＮＡ」は対象とする「ＰＲＯ-ＤＮＡ」核
酸分子が比較される核酸分子のヌクレオチド配列を示し、「Ｘ」、「Ｙ」及び「
Ｚ」は各々異なる仮説的アミノ酸残基を示し、「Ｎ」、「Ｌ」及び「Ｖ」は各々
異なる仮説的ヌクレオチドを示す。

【Ｆｉｇ２４８Ａ−Ｄ】 ALIGN-2配列比較コンピュータプログラムの完全
なソースコードを提供する。このソースコードは、UNIX（登録商標）オペレーシ
ョンシステムでの使用のために日常的にコンパイルされ、ALIGN-2配列比較コン
ピュータプログラムを与える。

【手続補正書】特許協力条約第３４条補正の翻訳文提出書

【提出日】平成１２年６月１４日（２０００．６．１４）

【手続補正１】

【補正対象書類名】明細書

【補正対象項目名】特許請求の範囲

【補正方法】変更

【補正の内容】

【特許請求の範囲】

【手続補正２】

【補正対象書類名】明細書

【補正対象項目名】０３５４

【補正方法】変更

【補正の内容】

【０３５４】 １２３． ＰＲＯ１５５０ 本出願において「ＰＲＯ１５５０」と命名され、新規な分泌ポリペプチドをコ
ードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７６３９３−１６６４）が同定された。 一実施態様では、本発明はＰＲＯ１５５０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含んでなる単離された核酸分子を提供する。 一態様では、単離された核酸は、（ａ）Ｆｉｇ２４６(配列番号：２３２)のア
ミノ酸残基１又は約３１から約２４３の配列を有するＰＲＯ１５５０ポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して、少
なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、
より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約
９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる。 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４５（配列番号：２３１)の残基約２２８
から約８６６の核酸の補体にハイブリッド形成するＤＮＡを含むＰＲＯ１５５０
ポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。好ましくは、ハイブリ
ッド形成は緊縮性ハイブリッド形成及び洗浄条件下で起こる。 さらなる態様では、本発明は（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６３９３−１６６４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体に対して
、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列同一
性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少なくと
も約９５％の配列同一性を有するＤＮＡを含んでなる単離された核酸分子に関す
る。好ましい実施態様では、核酸は、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２３のヒトタン
パク質ｃＤＮＡ（ＤＮＡ７６３９３−１６６４）にコードされる同じ成熟ポリペ
プチドをコードするＤＮＡを含む。

【手続補正３】

【補正対象書類名】明細書

【補正対象項目名】０３５５

【補正方法】変更

【補正の内容】

【０３５５】 またさらなる態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２４６(配列番号：２３２)の
アミノ酸残基約３１から約２４３の配列と少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するポリペ
プチドをコードするＤＮＡ、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含んでなる
単離された核酸分子に関する。 さらなる態様では、本発明は、試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２４６(配列
番号：２３２)のアミノ酸残基約３１から約２４３の配列を有するＰＲＯ１５５
０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体
と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、ＤＮＡ分子が（ａ）又は（ｂ）に対
して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約８５％の配列
同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好ましくは少な
くとも約９５％の配列同一性を有する場合に試験ＤＮＡ分子を単離することによ
り製造された、少なくとも約５０ヌクレオチド、好ましくは少なくとも約１００
ヌクレオチドを有する単離された核酸分子に関する。 特別な態様では、本発明は、Ｎ-末端シグナル配列及び／又は開始メチオニン
を持っているか持っていないＰＲＯ１５５０ポリペプチドをコードするＤＮＡを
含む単離された核酸分子を提供し、あるいはそのようなコード化核酸分子に相補
的である。シグナルペプチドは、Ｆｉｇ２４６（配列番号：２３２）のアミノ酸
位置１からアミノ酸位置約３０まで伸びると仮に同定されている。 他の態様では、本発明は、（ａ）Ｆｉｇ２４６(配列番号：２３２)の残基３１
から約２４３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、
好ましくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％
ポジティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのポリペプ
チドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の補体を含む単離
された核酸分子に関する。 他の実施態様は、ハイブリッド形成プローブとしての用途が見いだされるＰＲ
Ｏ１５５０ポリペプチドコード化配列の断片に関する。このような核酸断片は、
約２０から約８０ヌクレオチド長、好ましくは約２０から約６０ヌクレオチド長
、より好ましくは約２０から約５０ヌクレオチド長、最も好ましくは約２０から
約４０ヌクレオチド長である。 他の実施態様では、本発明は、上記において特定された任意の単離された核酸
配列にコードされる単離されたＰＲＯ１５５０ポリペプチドを提供する。 特別な態様では、本発明は単離された天然配列ＰＲＯ１５５０ポリペプチドを
提供し、それは一実施態様では、Ｆｉｇ２４６(配列番号：２３２)の残基３１か
ら２４３を含むアミノ酸配列を含んでいる。

【手続補正４】

【補正対象書類名】明細書

【補正対象項目名】０３５６

【補正方法】変更

【補正の内容】

【０３５６】 他の態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４６(配列番号：２３２)のアミノ酸残基３
１から約２４３に含まれる配列に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好
ましくは少なくとも約８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％
の配列同一性、最も好ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有するアミノ
酸配列を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５０ポリペプチドに関する。 さらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４６(配列番号：２３２)の残基３１か
ら２４３のアミノ酸配列と比較したときに少なくとも約８０％ポジティブ、好ま
しくは少なくとも約８５％ポジティブ、より好ましくは少なくとも約９０％ポジ
ティブ、最も好ましくは少なくとも約９５％ポジティブのスコアのアミノ酸配列
を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５０ポリペプチドに関する。 またさらなる態様では、本発明は、Ｆｉｇ２４６(配列番号：２３２)のアミノ
酸残基３１から約２４３の配列、又はその抗-ＰＲＯ１５５０抗体に結合するの
に十分な断片を含んでなる、単離されたＰＲＯ１５５０ポリペプチドに関する。
好ましくは、このＰＲＯ１５５０断片は、天然ＰＲＯ１５５０ポリペプチドの質
的な生物学的活性を保持している。 またさらなる態様では、本発明は、（ｉ）試験ＤＮＡ分子を、（ａ）Ｆｉｇ２
４６(配列番号：４３１)のアミノ酸残基約３１から約２４３の配列を有するＰＲ
Ｏ１５５０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、又は（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分
子の補体と、緊縮性条件下でハイブリッド形成させ、試験ＤＮＡ分子が（ａ）又
は（ｂ）に対して、少なくとも約８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも約
８５％の配列同一性、より好ましくは少なくとも約９０％の配列同一性、最も好
ましくは少なくとも約９５％の配列同一性を有する場合は、（ｉｉ）試験ＤＮＡ
分子を含む宿主細胞をポリペプチドの発現に適した条件下で培養し、そして（ｉ
ｉｉ）細胞培地からポリペプチドを回収することにより製造されたポリペプチド
を提供する。

【手続補正５】

【補正対象書類名】明細書

【補正対象項目名】０４６７

【補正方法】変更

【補正の内容】

【０４６７】 実施例１６：ヒトＰＲＯ１１８９をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例２に記載したアミラーゼスクリーニングで単離したｃＤＮＡ配列
を、ここでＤＮＡ４１７８４と命名する。次いでＤＮＡ４１７８４配列を、公的
データベース（例えば、GenBank）及び企業のＥＳＴＤＮＡデータベース（LIFES
EQ(商品名)、Incyte Pharmaceuticals、Palo Alto, CA）を含む種々の発現配列
タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同性を同定した。相同体検
索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altschul等, Methods in Enzy
mology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。公知のタンパク質をコードせ
ず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以上を持つ比較物は、プロ
グラム「phrap」（Phil Green, University of Washington, Seattle, Washingt
on）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセ
ンサス配列を、ここでＤＮＡ４５４９９と命名する。 ＤＮＡ４５４９９配列に基づいてオリゴヌクレオチドプローブを作成し、上記
実施例２のパラグラフ１に記載したように調製したヒト骨髄ライブラリのスクリ
ーニングに使用した。クローニングベクターはｐＲＫ５Ｂであり（ｐＲＫ５Ｂは
ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Holmes等, Science, 253:
1278-1280 (1991)）、切断されたｃＤＮＡサイズは２８００ｂｐ未満であった。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー（45499.f1）：5'-GAAAGACACGACACAGCAGCTTGC-3'（配列
番号：44） 正方向ＰＣＲプライマー（45499.f2）：5'-GGGAACTGCTATCTGATGCC-3'（配列番号
：45） 正方向ＰＣＲプライマー（45499.f3）：5'-CAGGATCTCCTCTTGCAGTCTGCAGC-3'（配
列番号：46） 逆方向ＰＣＲプライマー（45499.r1）：5'-CTTCTCGAACCACATAAGTTTGAGGCAG-3'（
配列番号：47） 逆方向ＰＣＲプライマー（45499.r2）：5'-CACGATTCCCTCCACAGCAACTGGG-3'（配
列番号：48） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレ
オチド配列を持つＤＮＡ４５４９９配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ（45499.p1）： 5'-CGCCTTACCGCGCAGCCCGAAGATTCACTATGGTGAAAATCGCCTTCAAT-3'（配列番号：230
） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１１８９遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。 全長クローンが同定され、それは単一のオープンリーディングフレームを含み
、ヌクレオチド位置７９−８１に見かけの翻訳開始部位を持ち、ヌクレオチド位
置８６８−８７０に停止コドンを有する（Ｆｉｇ２５；配列番号：４２）。予測
されるポリペプチド前駆体は２６３アミノ酸長であり、約２９，７４１ダルトン
の計算された分子量及び約５．７４の推定ｐＩを有する。更なる特徴には約アミ
ノ酸５３−７５のＩＩ型膜貫通ドメイン及び約アミノ酸１６６−１６９の潜在的
Ｎ-グリコシル化部位が含まれる。 Ｆｉｇ２６（配列番号：４３）に示した全長配列のＷＵ-ＢＬＡＳＴ-２配列ア
ラインメント分析を用いたＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン35.45 Swis
sProt 35）の分析により、ＰＲＯ１１８９アミノ酸配列と以下のDayhoff配列：F
017985_1, CBRG01D9_2, I79662, 及びCHPDRBAG_1との間の有意な相同性が証明さ
れた。 クローンＤＮＡ５８８２８−１５１９はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番
号２０３１７２が付与された。

【手続補正６】

【補正対象書類名】明細書

【補正対象項目名】０５１９

【補正方法】変更

【補正の内容】

【０５１９】 実施例６９：ヒトＰＲＯ１３４０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 既知のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０又はそれ以上を持つ対象配
列としてIncyteＥＳＴ番号８７８９０６を実施例１に記載した方法を使用して同
定した。ＥＳＴ番号８７８９０６のヌクレオチド配列とその相補配列をここで「
ＤＮＡ４２８０９」と命名する。ＤＮＡ４２８０９配列に基づいて、１）ＰＣＲ
により対象とする配列を含むｃＤＮＡライブラリを同定するため、及び２）ＰＲ
Ｏ１３４０の全長コード化配列のクローンを単離するプローブとして使用するた
めに、オリゴヌクレオチドを合成した。 ＰＣＲプライマー（正及び逆）を合成した： 正方向ＰＣＲプライマー TCCAGGTGGACCCCACTTCAGG（42809.f1；配列番号：430）
逆方向ＰＣＲプライマー GGGAGGCTTATAGGCCCAATCTGG（42809.r1；配列番号：431 ） さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリッド形成プローブは、以下のヌクレ
オチド配列を持つコンセンサスＤＮＡ４２８０９配列から作成した。 ハイブリッド形成プローブ GGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATC
AATGA（42809.p1；配列番号：432） 全長クローンの供給源について幾つかのライブラリをスクリーニングするため
に、ライブラリからのＤＮＡを上で同定したＰＣＲプライマー対でＰＣＲ増幅し
た。次いで、ポジティブライブラリを、プローブオリゴヌクレオチド及びＰＣＲ
プライマー対の一方を用いてＰＲＯ１３４０遺伝子をコードするクローンを単離
するのに使用した。ｃＤＮＡライブラリー作成のためのＲＮＡはヒト胎児腎臓組
織から単離した。 上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３４０の全
長ＤＮＡ配列（ＤＮＡ６６６６３−１５９８とここで命名[Ｆｉｇ１３１、配列
番号：２２８]）；及びＰＲＯ１３４０の誘導タンパク質配列が得られた。 ＰＲＯ１３４０の全コード化配列をＦｉｇ１３１（配列番号：２２８）に示す
。クローンＤＮＡ６６６６３−１５９８は、単一のオープンリーディングフレー
ムを含み、ヌクレオチド位置１２８−１３０に見かけの翻訳開始部位を持ち、そ
してヌクレオチド位置２５４９−２５５１に見かけの停止コドンを持つ。予測さ
れるポリペプチド前駆体は８０７アミノ酸長である。Ｆｉｇ１３２に示す全長Ｐ
ＲＯ１３４０タンパク質は約８７，６１４ダルトンの推定分子量及び約４．８３
のｐＩを有する。更なる特徴は、約アミノ酸１−１８のシグナルペプチド；約ア
ミノ酸７６２−７８４膜貫通ドメイン；約アミノ酸４９２−４９４の細胞付着配
列；約アミノ酸５１７−５２０、６０２−６０５及び７００−７０３の潜在的な
N-グリコシル化部位；及び約アミノ酸３０７−３５１、３２４−３４８、６７−
１０３、９７−１４１及び１１４−１３８のカドヘリン細胞外反復ドメインを含
む。 Ｆｉｇ１３２（配列番号：２２９）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１３４０のアミノ酸配列とDayhof
f配列番号I46536の間に有意な相同性が明らかにされた。相同性はまたＰＲＯ１
３４０アミノ酸配列と次のDayhoff配列：S55396, RATPDRPT_1, CADD_CHICK, CAD
1_CHICK, CADB_CHICK, I50180, CAD4_CHICK, G02878, 及びDSC1_MOUSEとの間で
明らかにされた。 クローンＤＮＡ６６６６３−１５９８はＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番
号２０３２６８が付与された。

【手続補正７】

【補正対象書類名】明細書

【補正対象項目名】０５７２

【補正方法】変更

【補正の内容】

【０５７２】 実施例１２６：ヒトＰＲＯ１５５０をコードするｃＤＮＡクローンの単離 上記の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムの使用により、ＣＥＬＴ
１５Ｂ７＿１２と命名され、ここで「ＤＮＡ１００２２」とも呼ばれるＭｅｒｃ
ｋデータベースからのＥＳＴ配列の同定が可能となった。次いでこのＥＳＴ配列
を、公的及び企業のＥＳＴデータベース（例えば、GenBank及びLIFESEQ(商品名)
）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較して、存在する相同
性を同定した。相同体検索は、コンピュータプログラムBLAST又はBLAST2（Altsc
hul等, Methods in Enzymology 266: 460-480 (1996)）を用いて実施した。既知
のタンパク質をコードせず、BLASTスコア７０（９０の場合もある）又はそれ以
上を持つ比較物は、プログラム「phrap」（Phil Green, University of Washing
ton, Seattle, Washington）で集団化してコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。
そこから得られたコンセンサス配列を、ここで「ＤＮＡ５５７０８」と命名する
。 ＤＮＡ５５７０８配列とＩｎｃｙｔｅのＥＳＴクローン番号３４１１６５９に
含まれる配列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン番号３４１１６５９
を購入し、ｃＤＮＡ挿入物を得て配列決定した。このｃＤＮＡ挿入物の配列をＦ
ｉｇ２４５に示し、ここで「ＤＮＡ７６３９３−１６６４」と命名する。 Ｆｉｇ２４５に示した全長クローンは単一のオープンリーディングフレームを
含み、ヌクレオチド位置１３８−１４０に見かけの翻訳開始部位を持ち、そして
ヌクレオチド位置８６７−８６９に見いだされる停止コドンで終端する（Ｆｉｇ
２４５；配列番号：２３１）。予測されるポリペプチド前駆体（Ｆｉｇ２４６、
配列番号：２３２）は２４３アミノ酸長である。ＰＲＯ１５５０タンパク質の他
の特徴は、約アミノ酸１−３０のシグナル配列；約アミノ酸１９５−２１７の疎
水性ドメイン；及び約アミノ酸１８６−１８９の潜在的なＮ-グリコシル化部位
を含む。ＰＲＯ１５５０は約２６，２６６ダルトンの算定分子量及び約８．４３
の推定ｐＩを有する。クローンＤＮＡ７６３９３−１６６４は１９９８年１０月
６日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３２３が付与された。 Ｆｉｇ２４６（配列番号：２３２）に示した全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配
列アラインメント分析法を使用しての、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョ
ン35.45 SwissProt 35）の分析により、ＰＲＯ１５５０のアミノ酸配列と以下の
Dayhoff配列：CELF59E12_11; CA24_ASCSU; AF018082_1; CA13_BOVIN; CA54_HUMA
N; CA34_HUMAN; HUMCOL7A1X_1; P_W09643; AF053538_1; 及びHSEMCXIV2_1との間
のある程度の相同性が明らかにされた。

【手続補正８】

【補正対象書類名】明細書

【補正対象項目名】図面の簡単な説明

【補正方法】変更

【補正の内容】

【図面の簡単な説明】

【Ｆｉｇ１】 天然配列ＰＲＯ１５６０（ＵＮＱ７６７）ｃＤＮＡのヌクレ
オチド配列（配列番号：３）を示す。配列番号：３は、ここで「ＤＮＡ１９９０
２−１６６９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下
線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２】 Ｆｉｇ１に示した配列番号：３のコード化配列から誘導され
たアミノ酸配列（配列番号：４）を示す。

【Ｆｉｇ３】 天然配列ＰＲＯ４４４（ＵＮＱ３２８）ｃＤＮＡのヌクレオ
チド配列（配列番号：５）を示す。配列番号：５は、ここで「ＤＮＡ２６８４６
−１３９７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線
フォントで示した。

【Ｆｉｇ４】 Ｆｉｇ３に示した配列番号：５のコード化配列から誘導され
たアミノ酸配列（配列番号：６）を示す。

【Ｆｉｇ５】 天然配列ＰＲＯ１０１８（ＵＮＱ５０１）ｃＤＮＡのヌクレ
オチド配列（配列番号：７）を示す。配列番号：７は、ここで「ＤＮＡ５６１０
７−１４１５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下
線フォントで示した。

【Ｆｉｇ６】 Ｆｉｇ５に示した配列番号：７のコード化配列から誘導され
たアミノ酸配列（配列番号：８）を示す。

【Ｆｉｇ７】 天然配列ＰＲＯ１７７３（ＵＮＱ８３５）ｃＤＮＡのヌクレ
オチド配列（配列番号：９）を示す。配列番号：９は、ここで「ＤＮＡ５６４０
６−１７０４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下
線フォントで示した。

【Ｆｉｇ８】 Ｆｉｇ７に示した配列番号：９のコード化配列から誘導され
たアミノ酸配列（配列番号：１０）を示す。

【Ｆｉｇ９】 天然配列ＰＲＯ１４７７（ＵＮＱ７４７）ｃＤＮＡのヌクレ
オチド配列（配列番号：１１）を示す。配列番号：１１は、ここで「ＤＮＡ５６
５２９−１６４７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及
び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１０】 Ｆｉｇ９に示した配列番号：１１のコード化配列から誘導
されたアミノ酸配列（配列番号：１２）を示す。

【Ｆｉｇ１１】 天然配列ＰＲＯ１４７８（ＵＮＱ７４８）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１６）を示す。配列番号：１６は、ここで「ＤＮＡ５
６５３１−１６４８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１２】 Ｆｉｇ１１に示した配列番号：１６のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：１７）を示す。

【Ｆｉｇ１３】 天然配列ＰＲＯ８３１（ＵＮＱ４７１）ｃＤＮＡのヌクレ
オチド配列（配列番号：２１）を示す。配列番号：２１は、ここで「ＤＮＡ５６
８６２−１３４３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及
び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１４】 Ｆｉｇ１３に示した配列番号：２１のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：２２）を示す。

【Ｆｉｇ１５】 天然配列ＰＲＯ１１１３（ＵＮＱ５５６）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：２３）を示す。配列番号：２３は、ここで「ＤＮＡ５
７２５４−１４７７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１６】 Ｆｉｇ１５に示した配列番号：２３のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：２４）を示す。

【Ｆｉｇ１７】 天然配列ＰＲＯ１１９４（ＵＮＱ６０７）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：２８）を示す。配列番号：２８は、ここで「ＤＮＡ５
７８４１−１５２２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１８】 Ｆｉｇ１７に示した配列番号：２８のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：２９）を示す。

【Ｆｉｇ１９】 天然配列ＰＲＯ１１１０（ＵＮＱ５５３）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：３０）を示す。配列番号：３０は、ここで「ＤＮＡ５
８７２７−１４７４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２０】 Ｆｉｇ１９に示した配列番号：３０のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：３１）を示す。

【Ｆｉｇ２１】 天然配列ＰＲＯ１３７８（ＵＮＱ７１５）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：３２）を示す。配列番号：３２は、ここで「ＤＮＡ５
８７３０−１６０７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２２】 Ｆｉｇ２１に示した配列番号：３２のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：３３）を示す。

【Ｆｉｇ２３】 天然配列ＰＲＯ１４８１（ＵＮＱ７５０）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：４０）を示す。配列番号：４０は、ここで「ＤＮＡ５
８７３２−１６５０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２４】 Ｆｉｇ２３に示した配列番号：４０のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：４１）を示す。

【Ｆｉｇ２５】 天然配列ＰＲＯ１１８９（ＵＮＱ６０３）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：４２）を示す。配列番号：４２は、ここで「ＤＮＡ５
８８２８−１５１９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２６】 Ｆｉｇ２５に示した配列番号：４２のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：４３）を示す。

【Ｆｉｇ２７】 天然配列ＰＲＯ１４１５（ＵＮＱ７３１）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：４９）を示す。配列番号：４９は、ここで「ＤＮＡ５
８８５２−１６３７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２８】 Ｆｉｇ２７に示した配列番号：４９のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：５０）を示す。

【Ｆｉｇ２９】 天然配列ＰＲＯ１４１１（ＵＮＱ７２９）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：５１）を示す。配列番号：５１は、ここで「ＤＮＡ５
９２１２−１６２７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ３０】 Ｆｉｇ２９に示した配列番号：５１のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：５２）を示す。

【Ｆｉｇ３１】 天然配列ＰＲＯ１２９５（ＵＮＱ６６４）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：５３）を示す。配列番号：５３は、ここで「ＤＮＡ５
９２１８−１５５９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ３２】 Ｆｉｇ３１に示した配列番号：５３のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：５４）を示す。

【Ｆｉｇ３３】 天然配列ＰＲＯ１３５９（ＵＮＱ７０８）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：５５）を示す。配列番号：５５は、ここで「ＤＮＡ５
９２１９−１６１３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ３４】 Ｆｉｇ３３に示した配列番号：５５のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：５６）を示す。

【Ｆｉｇ３５】 天然配列ＰＲＯ１１９０（ＵＮＱ６０４）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：５７）を示す。配列番号：５７は、ここで「ＤＮＡ５
９５８６−１５２０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ３６】 Ｆｉｇ３５に示した配列番号：５７のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：５８）を示す。

【Ｆｉｇ３７】 天然配列ＰＲＯ１７７２（ＵＮＱ８３４）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：６２）を示す。配列番号：６２は、ここで「ＤＮＡ５
９８１７−１７０３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ３８】 Ｆｉｇ３７に示した配列番号：６２のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：６３）を示す。

【Ｆｉｇ３９】 天然配列ＰＲＯ１２４８（ＵＮＱ６３１）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：６７）を示す。配列番号：６７は、ここで「ＤＮＡ６
０２７８−１５３０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ４０】 Ｆｉｇ３９に示した配列番号：６７のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：６８）を示す。

【Ｆｉｇ４１】 天然配列ＰＲＯ１３１６（ＵＮＱ６８２）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：６９）を示す。配列番号：６９は、ここで「ＤＮＡ６
０６０８−１５７７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ４２】 Ｆｉｇ４１に示した配列番号：６９のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：７０）を示す。

【Ｆｉｇ４３】 天然配列ＰＲＯ１１９７（ＵＮＱ６１０）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：７１）を示す。配列番号：７１は、ここで「ＤＮＡ６
０６１１−１５２４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ４４】 Ｆｉｇ４３に示した配列番号：７１のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：７２）を示す。

【Ｆｉｇ４５】 天然配列ＰＲＯ１２９３（ＵＮＱ６６２）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：７６）を示す。配列番号：７６は、ここで「ＤＮＡ６
０６１８−１５５７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ４６】 Ｆｉｇ４５に示した配列番号：７６のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：７７）を示す。

【Ｆｉｇ４７】 天然配列ＰＲＯ１３８０（ＵＮＱ７１７）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：７８）を示す。配列番号：７８は、ここで「ＤＮＡ６
０７４０−１６１５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ４８】 Ｆｉｇ４７に示した配列番号：７８のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：７９）を示す。

【Ｆｉｇ４９】 天然配列ＰＲＯ１２６５（ＵＮＱ６３６）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：８３）を示す。配列番号：８３は、ここで「ＤＮＡ６
０７６４−１５３３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ５０】 Ｆｉｇ４９に示した配列番号：８３のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：８４）を示す。

【Ｆｉｇ５１】 天然配列ＰＲＯ１２５０（ＵＮＱ６３３）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：８５）を示す。配列番号：８５は、ここで「ＤＮＡ６
０７７５−１５３２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ５２】 Ｆｉｇ５１に示した配列番号：８５のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：８６）を示す。

【Ｆｉｇ５３】 天然配列ＰＲＯ１４７５（ＵＮＱ７４６）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：８７）を示す。配列番号：８７は、ここで「ＤＮＡ６
１１８５−１６４６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ５４】 Ｆｉｇ５３に示した配列番号：８７のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：８８）を示す。

【Ｆｉｇ５５】 天然配列ＰＲＯ１３７７（ＵＮＱ７１４）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：９４）を示す。配列番号：９４は、ここで「ＤＮＡ６
１６０８−１６０６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ５６】 Ｆｉｇ５５に示した配列番号：９４のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：９５）を示す。

【Ｆｉｇ５７】 天然配列ＰＲＯ１３２６（ＵＮＱ６８６）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：９９）を示す。配列番号：９９は、ここで「ＤＮＡ６
２８０８−１５８２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字
及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ５８】 Ｆｉｇ５７に示した配列番号：９９のコード化配列から誘
導されたアミノ酸配列（配列番号：１００）を示す。

【Ｆｉｇ５９】 天然配列ＰＲＯ１２４９（ＵＮＱ６３２）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１０１）を示す。配列番号：１０１は、ここで「ＤＮ
Ａ６２８０９−１５３１」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ６０】 Ｆｉｇ５９に示した配列番号：１０１のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１０２）を示す。

【Ｆｉｇ６１】 天然配列ＰＲＯ１３１５（ＵＮＱ６８１）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１０３）を示す。配列番号：１０３は、ここで「ＤＮ
Ａ６２８１５−１５７８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ６２】 Ｆｉｇ６１に示した配列番号：１０３のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１０４）を示す。

【Ｆｉｇ６３】 天然配列ＰＲＯ１５４９（ＵＮＱ７８２）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１１０）を示す。配列番号：１１０は、ここで「ＤＮ
Ａ６２８４５−１６８４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ６４】 Ｆｉｇ６３に示した配列番号：１１０のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１１１）を示す。

【Ｆｉｇ６５】 天然配列ＰＲＯ１４３０（ＵＮＱ７３６）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１１５）を示す。配列番号：１１５は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８４２−１６３２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ６６】 Ｆｉｇ６５に示した配列番号：１１５のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１１６）を示す。

【Ｆｉｇ６７】 天然配列ＰＲＯ１３７４（ＵＮＱ７１１）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１１７）を示す。配列番号：１０７は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８４９−１６０４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ６８】 Ｆｉｇ６７に示した配列番号：１１７のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１１８）を示す。

【Ｆｉｇ６９】 天然配列ＰＲＯ１３１１（ＵＮＱ６７７）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１２２）を示す。配列番号：１２２は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８６３−１５７３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ７０】 Ｆｉｇ６９に示した配列番号：１２２のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１２３）を示す。

【Ｆｉｇ７１】 天然配列ＰＲＯ１３５７（ＵＮＱ７０６）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１２７）を示す。配列番号：１２７は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８８１−１６０２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ７２】 Ｆｉｇ７１に示した配列番号：１２７のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１２８）を示す。

【Ｆｉｇ７３】 天然配列ＰＲＯ１２４４（ＵＮＱ６２８）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１２９）を示す。配列番号：１２９は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８８３−１５２６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ７４】 Ｆｉｇ７３に示した配列番号：１２９のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１３０）を示す。

【Ｆｉｇ７５】 天然配列ＰＲＯ１２４６（ＵＮＱ６３０）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１３１）を示す。配列番号：１３１は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８８５−１５２９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ７６】 Ｆｉｇ７５に示した配列番号：１３１のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１３２）を示す。

【Ｆｉｇ７７】 天然配列ＰＲＯ１３５６（ＵＮＱ７０５）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１３３）を示す。配列番号：１３３は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８８６−１６０１」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ７８】 Ｆｉｇ７７に示した配列番号：１３３のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１３４）を示す。

【Ｆｉｇ７９】 天然配列ＰＲＯ１２７５（ＵＮＱ６４５）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１３５）を示す。配列番号：１３５は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８８８−１５４２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ８０】 Ｆｉｇ７９に示した配列番号：１３５のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１３６）を示す。

【Ｆｉｇ８１】 天然配列ＰＲＯ１２７４（ＵＮＱ６４４）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１３７）を示す。配列番号：１３７は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８８９−１５４２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ８２】 Ｆｉｇ８０に示した配列番号：１３７のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１３８）を示す。

【Ｆｉｇ８３】 天然配列ＰＲＯ１４１２（ＵＮＱ７３０）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１３９）を示す。配列番号：１３９は、ここで「ＤＮ
Ａ６４８９７−１６２８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ８４】 Ｆｉｇ８３に示した配列番号：１３９のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１４０）を示す。

【Ｆｉｇ８５】 天然配列ＰＲＯ１５５７（ＵＮＱ７６５）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１４１）を示す。配列番号：１４１は、ここで「ＤＮ
Ａ６４９０２−１６６７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ８６】 Ｆｉｇ８５に示した配列番号：１４１のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１４２）を示す。

【Ｆｉｇ８７】 天然配列ＰＲＯ１２８６（ＵＮＱ６５５）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１４３）を示す。配列番号：１４３は、ここで「ＤＮ
Ａ６４９０３−１６６７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ８８】 Ｆｉｇ８７に示した配列番号：１４３のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１４４）を示す。

【Ｆｉｇ８９】 天然配列ＰＲＯ１２９４（ＵＮＱ６６３）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１４５）を示す。配列番号：１４５は、ここで「ＤＮ
Ａ６４９０５−１５５８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ９０】 Ｆｉｇ８９に示した配列番号：１４５のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１４６）を示す。

【Ｆｉｇ９１】 天然配列ＰＲＯ１３４７（ＵＮＱ７０２）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１４７）を示す。配列番号：１４７は、ここで「ＤＮ
Ａ６４９５０−１５９０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ９２】 Ｆｉｇ９１に示した配列番号：１４７のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１４８）を示す。

【Ｆｉｇ９３】 天然配列ＰＲＯ１３０５（ＵＮＱ６７１）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１５２）を示す。配列番号：１５２は、ここで「ＤＮ
Ａ６４９５２−１５６８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ９４】 Ｆｉｇ９３に示した配列番号：１５２のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１５３）を示す。

【Ｆｉｇ９５】 天然配列ＰＲＯ１２７３（ＵＮＱ６４３）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１５７）を示す。配列番号：１５７は、ここで「ＤＮ
Ａ６５４０２−１５４０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ９６】 Ｆｉｇ９５に示した配列番号：１５７のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１５８）を示す。

【Ｆｉｇ９７】 天然配列ＰＲＯ１３０２（ＵＮＱ６６８）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１５９）を示す。配列番号：１５９は、ここで「ＤＮ
Ａ６５４０３−１５６５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ９８】 Ｆｉｇ９７に示した配列番号：１５９のコード化配列から
誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１６０）を示す。

【Ｆｉｇ９９】 天然配列ＰＲＯ１２８３（ＵＮＱ６５３）ｃＤＮＡのヌク
レオチド配列（配列番号：１６１）を示す。配列番号：１６１は、ここで「ＤＮ
Ａ６５４０４−１５５１」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは
太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１００】 Ｆｉｇ９９に示した配列番号：１６１のコード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１６２）を示す。

【Ｆｉｇ１０１】 天然配列ＰＲＯ１２７９（ＵＮＱ６４９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：１６９）を示す。配列番号：１６９は、ここで「Ｄ
ＮＡ６５４０５−１５４７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１０２】 Ｆｉｇ１０１に示した配列番号：１６９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１７０）を示す。

【Ｆｉｇ１０３】 天然配列ＰＲＯ１３０４（ＵＮＱ６７０）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：１７９）を示す。配列番号：１７９は、ここで「Ｄ
ＮＡ６５４０６−１５６７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１０４】 Ｆｉｇ１０３に示した配列番号：１７９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１８０）を示す。

【Ｆｉｇ１０５】 天然配列ＰＲＯ１３１７（ＵＮＱ６８３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：１８８）を示す。配列番号：１８８は、ここで「Ｄ
ＮＡ６５４０８−１５７８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１０６】 Ｆｉｇ１０５に示した配列番号：１８８のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１８９）を示す。

【Ｆｉｇ１０７】 天然配列ＰＲＯ１３０３（ＵＮＱ６６９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：１９３）を示す。配列番号：１９３は、ここで「Ｄ
ＮＡ６５４０９−１５６６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１０８】 Ｆｉｇ１０７に示した配列番号：１９３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１９４）を示す。

【Ｆｉｇ１０９】 天然配列ＰＲＯ１３０６（ＵＮＱ６７２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：１９５）を示す。配列番号：１９５は、ここで「Ｄ
ＮＡ６５４１０−１５６９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１１０】 Ｆｉｇ１０９に示した配列番号：１９５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１９６）を示す。

【Ｆｉｇ１１１Ａ-Ｂ】 天然配列ＰＲＯ１３３６（ＵＮＱ６４９）ｃＤＮ
Ａのヌクレオチド配列（配列番号：１９７）を示す。配列番号：１９７は、ここ
で「ＤＮＡ６５４２３−１５９５」と命名されるクローンである。開始及び停止
コドンは太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１１２】 Ｆｉｇ１１１Ａ-Ｂに示した配列番号：１９７のコード
化配列から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：１９８）を示す。

【Ｆｉｇ１１３】 天然配列ＰＲＯ１２７８（ＵＮＱ６４８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２０２）を示す。配列番号：２０２は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６３０４−１５４６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１１４】 Ｆｉｇ１１３に示した配列番号：２０２のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２０３）を示す。

【Ｆｉｇ１１５】 天然配列ＰＲＯ１２９８（ＵＮＱ６６６）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２０９）を示す。配列番号：２０９は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６５１１−１５６３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１１６】 Ｆｉｇ１１５に示した配列番号：２０９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２１０）を示す。

【Ｆｉｇ１１７】 天然配列ＰＲＯ１３０１（ＵＮＱ６６７）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２１１）を示す。配列番号：２１１は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６５１２−１５６４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１１８】 Ｆｉｇ１１７に示した配列番号：２１１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２１２）を示す。

【Ｆｉｇ１１９】 天然配列ＰＲＯ１２６８（ＵＮＱ６３８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２１３）を示す。配列番号：２１３は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６５１９−１５３５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１２０】 Ｆｉｇ１１９に示した配列番号：２１３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２１４）を示す。

【Ｆｉｇ１２１】 天然配列ＰＲＯ１２６９（ＵＮＱ６３９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２１５）を示す。配列番号：２１５は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６５２０−１５３６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１２２】 Ｆｉｇ１２１に示した配列番号：２１５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２１６）を示す。

【Ｆｉｇ１２３】 天然配列ＰＲＯ１３２７（ＵＮＱ６８７）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２１７）を示す。配列番号：２１７は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６５２１−１５８３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１２４】 Ｆｉｇ１２３に示した配列番号：２１７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２１８）を示す。

【Ｆｉｇ１２５】 天然配列ＰＲＯ１３８２（ＵＮＱ７１８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２１９）を示す。配列番号：２１９は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６５２６−１６１６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１２６】 Ｆｉｇ１２５に示した配列番号：２１９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２２０）を示す。

【Ｆｉｇ１２７】 天然配列ＰＲＯ１３２８（ＵＮＱ６８８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２２４）を示す。配列番号：２２４は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６５８−１５８４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１２８】 Ｆｉｇ１２７に示した配列番号：２２４のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２２５）を示す。

【Ｆｉｇ１２９】 天然配列ＰＲＯ１３２５（ＵＮＱ６８５）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２２６）を示す。配列番号：２２６は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６５９−１５９３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１３０】 Ｆｉｇ１２９に示した配列番号：２２６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２２７）を示す。

【Ｆｉｇ１３１】 天然配列ＰＲＯ１３４０（ＵＮＱ６９５）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２２８）を示す。配列番号：２２８は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６６３−１５９８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１３２】 Ｆｉｇ１３１に示した配列番号：２２８のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２２９）を示す。

【Ｆｉｇ１３３】 天然配列ＰＲＯ１３３９（ＵＮＱ６９４）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２３３）を示す。配列番号：２３３は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６６９−１５９７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１３４】 Ｆｉｇ１３３に示した配列番号：２３３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２３４）を示す。

【Ｆｉｇ１３５】 天然配列ＰＲＯ１３３７（ＵＮＱ６９２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２３５）を示す。配列番号：２３５は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６７２−１５８６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１３６】 Ｆｉｇ１３５に示した配列番号：２３５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２３６）を示す。

【Ｆｉｇ１３７】 天然配列ＰＲＯ１３４２（ＵＮＱ６９７）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２４２）を示す。配列番号：２４２は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６７４−１５９９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１３８】 Ｆｉｇ１３７に示した配列番号：２４２のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２４３）を示す。

【Ｆｉｇ１３９】 天然配列ＰＲＯ１３４３（ＵＮＱ６９８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２４７）を示す。配列番号：２４７は、ここで「Ｄ
ＮＡ６６６７５−１５８７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１４０】 Ｆｉｇ１３９に示した配列番号：２４７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２４８）を示す。

【Ｆｉｇ１４１】 天然配列ＰＲＯ１４８０（ＵＮＱ７４９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２５２）を示す。配列番号：２５２は、ここで「Ｄ
ＮＡ６７９６２−１６４９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１４２】 Ｆｉｇ１４１に示した配列番号：２５２のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２５３）を示す。

【Ｆｉｇ１４３Ａ-Ｂ】 天然配列ＰＲＯ１４８７（ＵＮＱ７５６）ｃＤＮ
Ａのヌクレオチド配列（配列番号：２５９）を示す。配列番号：２５９は、ここ
で「ＤＮＡ６８８３６−１６５６」と命名されるクローンである。開始及び停止
コドンは太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１４４】 Ｆｉｇ１４３Ａ-Ｂに示した配列番号：２５９のコード
化配列から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２６０）を示す。

【Ｆｉｇ１４５】 天然配列ＰＲＯ１４１８（ＵＮＱ７３２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２６４）を示す。配列番号：２６４は、ここで「Ｄ
ＮＡ６８８６４−１６２９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１４６】 Ｆｉｇ１４５に示した配列番号：２６４のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２６５）を示す。

【Ｆｉｇ１４７】 天然配列ＰＲＯ１４７２（ＵＮＱ７４４）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２６６）を示す。配列番号：２６６は、ここで「Ｄ
ＮＡ６８８６６−１６４４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１４８】 Ｆｉｇ１４７に示した配列番号：２６６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２６６）を示す。

【Ｆｉｇ１４９】 天然配列ＰＲＯ１４６１（ＵＮＱ７４２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２６８）を示す。配列番号：２６８は、ここで「Ｄ
ＮＡ６８８７１−１６３８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１５０】 Ｆｉｇ１４９に示した配列番号：２６８のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２６９）を示す。

【Ｆｉｇ１５１】 天然配列ＰＲＯ１４１０（ＵＮＱ７２８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２７０）を示す。配列番号：２７０は、ここで「Ｄ
ＮＡ６８８７４−１６２２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１５２】 Ｆｉｇ１５１に示した配列番号：２７０のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２７１）を示す。

【Ｆｉｇ１５３】 天然配列ＰＲＯ１５６８（ＵＮＱ７７４）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２７２）を示す。配列番号：２７２は、ここで「Ｄ
ＮＡ６８８８０−１６７６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１５４】 Ｆｉｇ１５３に示した配列番号：２７２のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２７３）を示す。

【Ｆｉｇ１５５】 天然配列ＰＲＯ１５７０（ＵＮＱ７７６）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２７４）を示す。配列番号：２７４は、ここで「Ｄ
ＮＡ６８８８５−１６７８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１５６】 Ｆｉｇ１５５に示した配列番号：２７４のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２７５）を示す。

【Ｆｉｇ１５７】 天然配列ＰＲＯ１３１７（ＵＮＱ７８３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２７６）を示す。配列番号：２７６は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１１６６−１６８５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１５８】 Ｆｉｇ１５７に示した配列番号：２７６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２７７）を示す。

【Ｆｉｇ１５９】 天然配列ＰＲＯ１７８０（ＵＮＱ８４２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２８１）を示す。配列番号：２８１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１１６９−１７０９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１６０】 Ｆｉｇ１５９に示した配列番号：２８１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２８２）を示す。

【Ｆｉｇ１６１】 天然配列ＰＲＯ１４８６（ＵＮＱ７５５）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２８６）を示す。配列番号：２８６は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１１８０−１６５５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１６２】 Ｆｉｇ１６１に示した配列番号：２８６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２８７）を示す。

【Ｆｉｇ１６３】 天然配列ＰＲＯ１４３３（ＵＮＱ７３８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２９１）を示す。配列番号：２９１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１１８４−１６３４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１６４】 Ｆｉｇ１６３に示した配列番号：２９１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２９２）を示す。

【Ｆｉｇ１６５】 天然配列ＰＲＯ１４９０（ＵＮＱ７５９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：２９６）を示す。配列番号：２９６は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１２１３−１６５９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１６６】 Ｆｉｇ１６５に示した配列番号：２９６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２９７）を示す。

【Ｆｉｇ１６７】 天然配列ＰＲＯ１４８２（ＵＮＱ７５１）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３０１）を示す。配列番号：３０１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１２３４−１６５１」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１６８】 Ｆｉｇ１６７に示した配列番号：３０１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３０２）を示す。

【Ｆｉｇ１６９】 天然配列ＰＲＯ１４４６（ＵＮＱ７４０）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３０３）を示す。配列番号：３０３は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１２７７−１６３６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１７０】 Ｆｉｇ１６９に示した配列番号：３０３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３０４）を示す。

【Ｆｉｇ１７１】 天然配列ＰＲＯ１５５８（ＵＮＱ７６６）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３０５）を示す。配列番号：３０５は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１２８２−１６６８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１７２】 Ｆｉｇ１７１に示した配列番号：３０５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３０６）を示す。

【Ｆｉｇ１７３】 天然配列ＰＲＯ１６０４（ＵＮＱ７８５）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３０７）を示す。配列番号：３０７は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１２８６−１６８７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１７４】 Ｆｉｇ１７３に示した配列番号：３０７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３０８）を示す。

【Ｆｉｇ１７５】 天然配列ＰＲＯ１４９１（ＵＮＱ７６０）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３０９）を示す。配列番号：３０９は、ここで「Ｄ
ＮＡ７１８８３−１６６０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１７６】 Ｆｉｇ１７５に示した配列番号：３０９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３１０）を示す。

【Ｆｉｇ１７７】 天然配列ＰＲＯ１４３１（ＵＮＱ７３７）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３１４）を示す。配列番号：３１４は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３４０１−１６３３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１７８】 Ｆｉｇ１７７に示した配列番号：３１４のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３１５）を示す。

【Ｆｉｇ１７９Ａ-Ｂ】 天然配列ＰＲＯ１５６３（ＵＮＱ７６９）ｃＤＮ
Ａのヌクレオチド配列（配列番号：３１６）を示す。配列番号：３１６は、ここ
で「ＤＮＡ７３７９２−１６７１」と命名されるクローンである。開始及び停止
コドンは太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１８０】 Ｆｉｇ１７９Ａ-Ｂ３に示した配列番号：３１６のコー
ド化配列から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３１７）を示す。

【Ｆｉｇ１８１】 天然配列ＰＲＯ１５６５（ＵＮＱ７７１）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３２１）を示す。配列番号：３２１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７２７−１６７３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１８２】 Ｆｉｇ１８１に示した配列番号：３２１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３２２）を示す。

【Ｆｉｇ１８３】 天然配列ＰＲＯ１５７１（ＵＮＱ７７７）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３２３）を示す。配列番号：３２３は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７３０−１６７９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１８４】 Ｆｉｇ１８３に示した配列番号：３２３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３２４）を示す。

【Ｆｉｇ１８５】 天然配列ＰＲＯ１５７２（ＵＮＱ７７８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３２５）を示す。配列番号：３２５は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７３４−１６８０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１８６】 Ｆｉｇ１８５に示した配列番号：３２５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３２６）を示す。

【Ｆｉｇ１８７】 天然配列ＰＲＯ１５７３（ＵＮＱ７７９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３２７）を示す。配列番号：３２７は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７３５−１６８１」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１８８】 Ｆｉｇ１８７に示した配列番号：３２７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３２８）を示す。

【Ｆｉｇ１８９】 天然配列ＰＲＯ１４８８（ＵＮＱ７５７）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３２９）を示す。配列番号：３２９は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７３６−１６５７」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１９０】 Ｆｉｇ１８９に示した配列番号：３２９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３３０）を示す。

【Ｆｉｇ１９１】 天然配列ＰＲＯ１４８９（ＵＮＱ７５８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３３１）を示す。配列番号：３３１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７３７−１６５８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１９２】 Ｆｉｇ１９１に示した配列番号：３３１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３３２）を示す。

【Ｆｉｇ１９３】 天然配列ＰＲＯ１４７４（ＵＮＱ７４５）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３３３）を示す。配列番号：３３３は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７３９−１６４５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１９４】 Ｆｉｇ１９３に示した配列番号：３３３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３３４）を示す。

【Ｆｉｇ１９５】 天然配列ＰＲＯ１５０８（ＵＮＱ７６１）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３３５）を示す。配列番号：３３５は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７４２−１６６２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１９６】 Ｆｉｇ１９５に示した配列番号：３３５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３３６）を示す。

【Ｆｉｇ１９７】 天然配列ＰＲＯ１５５５（ＵＮＱ７６３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３３７）を示す。配列番号：３３７は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７４４−１６６５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ１９８】 Ｆｉｇ１９７に示した配列番号：３３７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３３８）を示す。

【Ｆｉｇ１９９】 天然配列ＰＲＯ１４８５（ＵＮＱ７５４）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３３９）を示す。配列番号：３３９は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７４６−１６５４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２００】 Ｆｉｇ１９９に示した配列番号：３３９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３４０）を示す。

【Ｆｉｇ２０１】 天然配列ＰＲＯ１５６４（ＵＮＱ７７０）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３４６）を示す。配列番号：３４６は、ここで「Ｄ
ＮＡ７３７６０−１６７２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２０２】 Ｆｉｇ２０１に示した配列番号：３４６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３４７）を示す。

【Ｆｉｇ２０３】 天然配列ＰＲＯ１７５５（ＵＮＱ８２８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３５１）を示す。配列番号：３５１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６３９６−１６９８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２０４】 Ｆｉｇ２０３に示した配列番号：３５１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３５２）を示す。

【Ｆｉｇ２０５】 天然配列ＰＲＯ１７５７（ＵＮＱ８３０）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３５３）を示す。配列番号：３５３は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６３９８−１６９９」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２０６】 Ｆｉｇ２０５に示した配列番号：３５３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３５４）を示す。

【Ｆｉｇ２０７】 天然配列ＰＲＯ１７５８（ＵＮＱ８３１）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３５５）を示す。配列番号：３５５は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６３９９−１７００」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２０８】 Ｆｉｇ２０７に示した配列番号：３５５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３５６）を示す。

【Ｆｉｇ２０９】 天然配列ＰＲＯ１５７５（ＵＮＱ７８１）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３５７）を示す。配列番号：３５７は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６４０１−１６８３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２１０】 Ｆｉｇ２０９に示した配列番号：３５７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３５８）を示す。

【Ｆｉｇ２１１】 天然配列ＰＲＯ１７８７（ＵＮＱ８４９）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３６３）を示す。配列番号：３６３は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５１０−２５０４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２１２】 Ｆｉｇ２１１に示した配列番号：３６３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３６４）を示す。

【Ｆｉｇ２１３】 天然配列ＰＲＯ１７８１（ＵＮＱ８４３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３６５）を示す。配列番号：３６５は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５２２−２５００」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２１４】 Ｆｉｇ２１３に示した配列番号：３６５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３６６）を示す。

【Ｆｉｇ２１５】 天然配列ＰＲＯ１５５６（ＵＮＱ７６４）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３７１）を示す。配列番号：３７１は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５２９−１６６６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２１６】 Ｆｉｇ２１５に示した配列番号：３７１のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３７２）を示す。

【Ｆｉｇ２１７】 天然配列ＰＲＯ１７５９（ＵＮＱ８３２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３７３）を示す。配列番号：３７３は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５３１−１７０１」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２１８】 Ｆｉｇ２１７に示した配列番号：３７３のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３７４）を示す。

【Ｆｉｇ２１９】 天然配列ＰＲＯ１７６０（ＵＮＱ８３３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３７５）を示す。配列番号：３７５は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５３２−１７０２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２２０】 Ｆｉｇ２１９に示した配列番号：３７５のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３７６）を示す。

【Ｆｉｇ２２１】 天然配列ＰＲＯ１５６１（ＵＮＱ７６８）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３７７）を示す。配列番号：３７７は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５３８−１６７０」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２２２】 Ｆｉｇ２２１に示した配列番号：３７７のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３７８）を示す。

【Ｆｉｇ２２３】 天然配列ＰＲＯ１５６７（ＵＮＱ７７３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３８２）を示す。配列番号：３８２は、ここで「Ｄ
ＮＡ７６５４１−１６７５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２２４】 Ｆｉｇ２２３に示した配列番号：３８２のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３８３）を示す。

【Ｆｉｇ２２５】 天然配列ＰＲＯ１６９３（ＵＮＱ８０３）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３８４）を示す。配列番号：３８４は、ここで「Ｄ
ＮＡ７７３０１−１６９３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２２６】 Ｆｉｇ２２５に示した配列番号：３８４のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３８５）を示す。

【Ｆｉｇ２２７】 天然配列ＰＲＯ１７８４（ＵＮＱ８４６）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３８９）を示す。配列番号：３８９は、ここで「Ｄ
ＮＡ７７３０３−２５０２」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２２８】 Ｆｉｇ２２７に示した配列番号：３８９のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３９０）を示す。

【Ｆｉｇ２２９】 天然配列ＰＲＯ１６０５（ＵＮＱ７８６）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３９４）を示す。配列番号：３９４は、ここで「Ｄ
ＮＡ７７６４８−１６８８」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２３０】 Ｆｉｇ２２９に示した配列番号：３９４のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３９５）を示す。

【Ｆｉｇ２３１】 天然配列ＰＲＯ１７８８（ＵＮＱ８５０）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：３９６）を示す。配列番号：３９６は、ここで「Ｄ
ＮＡ７７６５２−２５０５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２３２】 Ｆｉｇ２３１に示した配列番号：３９６のコード化配列
から誘導されたアミノ酸配列（配列番号：３９７）を示す。

【Ｆｉｇ２３３】 天然配列ＰＲＯ１８０１（ＵＮＱ８５２）ｃＤＮＡのヌ
クレオチド配列（配列番号：４０１）を示す。配列番号：４０１は、ここで「Ｄ
ＮＡ８３５００−２５０６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドン
は太字及び下線フォントで示した。

【Ｆｉｇ２３４】 Ｆｉｇ２３３に示した配列番号：４０１コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４０２）を示す。

【Ｆｉｇ２３５】 天然配列ＵＣＰ４ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番
号：４０５）を示す。配列番号：４０５は、ここで「ＤＮＡ７７５６８−１６２
６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線フォント
で示した。

【Ｆｉｇ２３６】 Ｆｉｇ２３５に示した配列番号：４０５コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４０６）を示す。

【Ｆｉｇ２３７】 天然配列ＰＲＯ１９３ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配
列番号：４０９）を示す。配列番号：４０９は、ここで「ＤＮＡ２３３２２−１
３９３」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線フォ
ントで示した。

【Ｆｉｇ２３８】 Ｆｉｇ２３７に示した配列番号：４０９コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４１０）を示す。

【Ｆｉｇ２３９】 天然配列ＰＲＯ１１３０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（
配列番号：４１４）を示す。配列番号：４１４は、ここで「ＤＮＡ５９８１４−
１４８６」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線フ
ォントで示した。

【Ｆｉｇ２４０】 Ｆｉｇ２３９に示した配列番号：４１４コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４１５）を示す。

【Ｆｉｇ２４１】 天然配列ＰＲＯ１３３５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（
配列番号：４２２）を示す。配列番号：４２２は、ここで「ＤＮＡ６２８１２−
１５９４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線フ
ォントで示した。

【Ｆｉｇ２４２】 Ｆｉｇ２４１に示した配列番号：４２２コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４２３）を示す。

【Ｆｉｇ２４３】 天然配列ＰＲＯ１３２９ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（
配列番号：４２８）を示す。配列番号：４２８は、ここで「ＤＮＡ６６６６０−
１５８５」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線フ
ォントで示した。

【Ｆｉｇ２４４】 Ｆｉｇ２４３に示した配列番号：４２８コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：４２９）を示す。

【Ｆｉｇ２４５】 天然配列ＰＲＯ１５５０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（
配列番号：２３１）を示す。配列番号：２３１は、ここで「ＤＮＡ７６３９３−
１６６４」と命名されるクローンである。開始及び停止コドンは太字及び下線フ
ォントで示した。

【Ｆｉｇ２４６】 Ｆｉｇ２４５に示した配列番号：２３１コード化配列か
ら誘導されたアミノ酸配列（配列番号：２３２）を示す。

【Ｆｉｇ２４７Ａ−Ｄ】 ALIGN-2配列アラインメントコンピュータプログ
ラムを用いた％アミノ酸配列同一性（Fig２７４Ａ−Ｂ）及び％核酸配列同一性
（Fig２４７Ｃ−Ｄ）を決定するために下記の方法を使用した仮説的例示を示し
、「ＰＲＯ」は対象とする仮説的ＰＥＡＣＨポリペプチドのアミノ酸配列を示し
、「比較タンパク質」は対象とする「ＰＲＯ」ポリペプチドが比較されるポリペ
プチドのアミノ酸配列を示し、「ＰＲＯ-ＤＮＡ」は対象とする仮説的ＰＥＡＣ
Ｈコード化核酸配列を示し、「比較ＤＮＡ」は対象とする「ＰＲＯ-ＤＮＡ」核
酸分子が比較される核酸分子のヌクレオチド配列を示し、「Ｘ」、「Ｙ」及び「
Ｚ」は各々異なる仮説的アミノ酸残基を示し、「Ｎ」、「Ｌ」及び「Ｖ」は各々
異なる仮説的ヌクレオチドを示す。

【Ｆｉｇ２４８Ａ−Ｄ】 ALIGN-2配列比較コンピュータプログラムの完全
なソースコードを提供する。このソースコードは、UNIXオペレーションシステム
での使用のために日常的にコンパイルされ、ALIGN-2配列比較コンピュータプロ
グラムを与える。

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.⁷ 識別記号 ＦＩ テーマコート゛(参考） Ａ６１Ｐ 25/00 １０１ Ａ６１Ｐ 43/00 １１１ 25/16 Ｃ０７Ｋ 14/47 25/28 16/18 35/00 19/00 43/00 １１１ Ｃ１２Ｎ 1/19 Ｃ０７Ｋ 14/47 1/21 16/18 Ｃ１２Ｐ 21/02 Ｃ 19/00 21/08 Ｃ１２Ｎ 1/19 Ｃ１２Ｒ 1:91 1/21 1:645 5/10 1:19 15/02 Ｃ１２Ｎ 15/00 ＺＮＡＡ Ｃ１２Ｐ 21/02 5/00 Ｂ // Ｃ１２Ｐ 21/08 15/00 Ｃ (Ｃ１２Ｐ 21/02 Ａ６１Ｋ 37/02 Ｃ１２Ｒ 1:91） 37/48 (Ｃ１２Ｐ 21/02 37/64 Ｃ１２Ｒ 1:645） (Ｃ１２Ｐ 21/02 Ｃ１２Ｒ 1:19） (31)優先権主張番号 ６０／１０６，９０５ (32)優先日 平成10年11月３日(1998．11．3) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９８，７４９ (32)優先日 平成10年９月１日(1998．9．1) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０６，９１９ (32)優先日 平成10年11月３日(1998．11．3) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０６，９３２ (32)優先日 平成10年11月３日(1998．11．3) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９８，７５０ (32)優先日 平成10年９月１日(1998．9．1) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０６，９３４ (32)優先日 平成10年11月３日(1998．11．3) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９８，８０３ (32)優先日 平成10年９月２日(1998．9．2) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０７，７８３ (32)優先日 平成10年11月10日(1998．11．10) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９８，８２１ (32)優先日 平成10年９月２日(1998．9．2) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，７７５ (32)優先日 平成10年11月17日(1998．11．17) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９８，８４３ (32)優先日 平成10年９月２日(1998．9．2) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，７７９ (32)優先日 平成10年11月17日(1998．11．17) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，５３６ (32)優先日 平成10年９月９日(1998．9．9) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，７８７ (32)優先日 平成10年11月17日(1998．11．17) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，５９６ (32)優先日 平成10年９月９日(1998．9．9) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，７８８ (32)優先日 平成10年11月17日(1998．11．17) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，５９８ (32)優先日 平成10年９月９日(1998．9．9) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，８０１ (32)優先日 平成10年11月17日(1998．11．17) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，６０２ (32)優先日 平成10年９月９日(1998．9．9) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，８０２ (32)優先日 平成10年11月17日(1998．11．17) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，６４２ (32)優先日 平成10年９月９日(1998．9．9) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，８０６ (32)優先日 平成10年11月17日(1998．11．17) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，７４１ (32)優先日 平成10年９月10日(1998．9．10) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，８０７ (32)優先日 平成10年11月17日(1998．11．17) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，７５４ (32)優先日 平成10年９月10日(1998．9．10) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，８６７ (32)優先日 平成10年11月17日(1998．11．17) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，７６３ (32)優先日 平成10年９月10日(1998．9．10) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，７９２ (32)優先日 平成10年９月10日(1998．9．10) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，９２５ (32)優先日 平成10年11月17日(1998．11．17) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，８４８ (32)優先日 平成10年11月18日(1998．11．18) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，８０８ (32)優先日 平成10年９月10日(1998．9．10) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，８４９ (32)優先日 平成10年11月18日(1998．11．18) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，８１２ (32)優先日 平成10年９月10日(1998．9．10) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，８５０ (32)優先日 平成10年11月18日(1998．11．18) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，８１５ (32)優先日 平成10年９月10日(1998．9．10) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，８５１ (32)優先日 平成10年11月18日(1998．11．18) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／０９９，８１６ (32)優先日 平成10年９月10日(1998．9．10) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，８５２ (32)優先日 平成10年11月18日(1998．11．18) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１００，３８５ (32)優先日 平成10年９月15日(1998．9．15) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，８５８ (32)優先日 平成10年11月18日(1998．11．18) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１００，３８８ (32)優先日 平成10年９月15日(1998．9．15) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１０８，９０４ (32)優先日 平成10年11月18日(1998．11．18) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１００，３９０ (32)優先日 平成10年９月15日(1998．9．15) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１００，５８４ (32)優先日 平成10年９月16日(1998．9．16) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１００，６２７ (32)優先日 平成10年９月16日(1998．9．16) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１００，６６１ (32)優先日 平成10年９月16日(1998．9．16) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ６０／１００，６６２ (32)優先日 平成10年９月16日(1998．9．16) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (81)指定国 ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＣＹ， ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＩ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，Ｉ Ｔ，ＬＵ，ＭＣ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ)，ＯＡ(ＢＦ，ＢＪ ，ＣＦ，ＣＧ，ＣＩ，ＣＭ，ＧＡ，ＧＮ，ＧＷ，ＭＬ， ＭＲ，ＮＥ，ＳＮ，ＴＤ，ＴＧ)，ＡＰ(ＧＨ，ＧＭ，Ｋ Ｅ，ＬＳ，ＭＷ，ＳＤ，ＳＬ，ＳＺ，ＵＧ，ＺＷ)，Ｅ Ａ(ＡＭ，ＡＺ，ＢＹ，ＫＧ，ＫＺ，ＭＤ，ＲＵ，ＴＪ ，ＴＭ)，ＡＥ，ＡＬ，ＡＭ，ＡＴ，ＡＵ，ＡＺ，ＢＡ ，ＢＢ，ＢＧ，ＢＲ，ＢＹ，ＣＡ，ＣＨ，ＣＮ，ＣＲ， ＣＵ，ＣＺ，ＤＥ，ＤＫ，ＥＥ，ＥＳ，ＦＩ，ＧＢ，Ｇ Ｄ，ＧＥ，ＧＨ，ＧＭ，ＨＲ，ＨＵ，ＩＤ，ＩＬ，ＩＮ ，ＩＳ，ＪＰ，ＫＥ，ＫＧ，ＫＰ，ＫＲ，ＫＺ，ＬＣ， ＬＫ，ＬＲ，ＬＳ，ＬＴ，ＬＵ，ＬＶ，ＭＤ，ＭＧ，Ｍ Ｋ，ＭＮ，ＭＷ，ＭＸ，ＮＯ，ＮＺ，ＰＬ，ＰＴ，ＲＯ ，ＲＵ，ＳＤ，ＳＥ，ＳＧ，ＳＩ，ＳＫ，ＳＬ，ＴＪ， ＴＭ，ＴＲ，ＴＴ，ＵＡ，ＵＧ，ＵＳ，ＵＺ，ＶＮ，Ｙ Ｕ，ＺＡ，ＺＷ (72)発明者 ゴッダード，オードリー アメリカ合衆国 カリフォルニア 94131， サンフランシスコ，コンゴ ストリート 110 (72)発明者 ガーニー，オースティン エル． アメリカ合衆国 カリフォルニア 94002， ベルモント，デビー レーン １ (72)発明者 スミス，ヴィクトリア アメリカ合衆国 カリフォルニア 94010， バーリンゲーム，ドゥワイト ロード 19 (72)発明者 ワタナベ，コリン， ケー． アメリカ合衆国 カリフォルニア 94556， モラガ，コーリス ドライブ 128 (72)発明者 ウッド，ウィリアム アイ． アメリカ合衆国 カルフォルニア 94010， ヒルスボロー，サウスダウン コート 35 Ｆターム(参考） 4B024 AA01 AA11 BA44 CA04 DA02 DA06 DA12 EA02 EA04 GA11 HA01 HA11 4B064 AG01 AG27 CA02 CA06 CA10 CA19 CA20 CC24 DA01 4B065 AA26X AA72X AA90X AA93Y AB01 CA24 CA44 CA46 4C084 AA01 AA06 AA07 AA13 BA01 CA53 CA56 CA59 DA01 DA12 DB52 DC01 DC32 NA14 ZA03 ZA16 ZB26 ZC20 4H045 AA10 AA11 AA20 AA30 BA10 CA40 DA76 EA20 EA50 FA72 FA74

Claims (27)

【特許請求の範囲】
1. 【請求項１】 Ｆｉｇ２（配列番号：４）、Ｆｉｇ４（配列番号：６）、Ｆ
   ｉｇ６（配列番号：８）、Ｆｉｇ８（配列番号：１０）、Ｆｉｇ１０（配列番号
   ：１２）、Ｆｉｇ１２（配列番号：１７）、Ｆｉｇ１４（配列番号：２２）、Ｆ
   ｉｇ１６（配列番号：２４）、Ｆｉｇ１８（配列番号：２９）、Ｆｉｇ２０（配
   列番号：３１）、Ｆｉｇ２２（配列番号：３３）、Ｆｉｇ２４（配列番号：４１
   ）、Ｆｉｇ２６（配列番号：４３）、Ｆｉｇ２８（配列番号：５０）、Ｆｉｇ３
   ０（配列番号：５２）、Ｆｉｇ３２（配列番号：５４）、Ｆｉｇ３４（配列番号
   ：５６）、Ｆｉｇ３６（配列番号：５８）、Ｆｉｇ３８（配列番号：６３）、Ｆ
   ｉｇ４０（配列番号：６８）、Ｆｉｇ４２（配列番号：７０）、Ｆｉｇ４４（配
   列番号：７２）、Ｆｉｇ４６（配列番号：７７）、Ｆｉｇ４８（配列番号：７９
   ）、Ｆｉｇ５０（配列番号：８４）、Ｆｉｇ５２（配列番号：８６）、Ｆｉｇ５
   ４（配列番号：８８）、Ｆｉｇ５６（配列番号：９５）、Ｆｉｇ５８（配列番号
   ：１００）、Ｆｉg６０（配列番号：１０２）、Ｆｉｇ６２（配列番号：１０４
   ）、Ｆｉｇ６４（配列番号：１１１）、Ｆｉｇ６６（配列番号：１１６）、Ｆｉ
   ｇ６８（配列番号：１１８）、Ｆｉｇ７０（配列番号：１２３）、Ｆｉｇ７２（
   配列番号：１２８）、Ｆｉｇ７４（配列番号：１３０）、Ｆｉｇ７６（配列番号
   ：１３２）、Ｆｉｇ７８（配列番号：１３４）、Ｆｉｇ８０（配列番号：１３６
   ）、Ｆｉｇ８２（配列番号：１３８）、Ｆｉｇ８４（配列番号：１４０）、Ｆｉ
   ｇ８６（配列番号：１４２）、Ｆｉｇ８８（配列番号：１４４）、Ｆｉｇ９０（
   配列番号：１４６）、Ｆｉｇ９２（配列番号：１４８）、Ｆｉｇ９４（配列番号
   ：１５３）、Ｆｉｇ９６（配列番号：１５８）、Ｆｉｇ９８（配列番号：１６０
   ）、Ｆｉｇ１００（配列番号：１６２）、Ｆｉｇ１０２（配列番号：１７０）、
   Ｆｉｇ１０４（配列番号：１８０）、Ｆｉｇ１０６（配列番号：１８９）、Ｆｉ
   ｇ１０８（配列番号：１９４）、Ｆｉｇ１１０（配列番号：１９６）、Ｆｉｇ１
   １２（配列番号：１９８）、Ｆｉｇ１１４（配列番号：２０３）、Ｆｉｇ１１６
   （配列番号：２１０）、Ｆｉｇ１１８（配列番号：２１２）、Ｆｉｇ１２０（配
   列番号：２１４）、Ｆｉｇ１２２（配列番号：２１６）、Ｆｉｇ１２４（配列番
   号：２１８）、Ｆｉｇ１２６（配列番号：２２０）、Ｆｉｇ１２８（配列番号：
   ２２５）、Ｆｉｇ１３０（配列番号：２２７）、Ｆｉｇ１３２（配列番号：２２
   ９）、Ｆｉｇ１３４（配列番号：２３４）、Ｆｉｇ１３６（配列番号：２３６）
   、Ｆｉｇ１３８（配列番号：２４３）、Ｆｉｇ１４０（配列番号：２４８）、Ｆ
   ｉｇ１４２（配列番号：２５３）、Ｆｉｇ１４４（配列番号：２６０）、Ｆｉｇ
   １４６（配列番号：２６５）、Ｆｉｇ１４８（配列番号：２６７）、Ｆｉｇ１５
   ０（配列番号：２６９）、Ｆｉｇ１５２（配列番号：２７１）、Ｆｉｇ１５４（
   配列番号：２７３）、Ｆｉｇ１５６（配列番号：２７５）、Ｆｉｇ１５８（配列
   番号：２７７）、Ｆｉｇ１６０（配列番号：２８２）、Ｆｉｇ１６２（配列番号
   ：２８７）、Ｆｉｇ１６４（配列番号：２９２）、Ｆｉｇ１６６（配列番号：２
   ９７）、Ｆｉｇ１６８（配列番号：３０２）、Ｆｉｇ１７０（配列番号：３０４
   ）、Ｆｉｇ１７２（配列番号：３０６）、Ｆｉｇ１７４（配列番号：３０８）、
   Ｆｉｇ１７６（配列番号：３１０）、Ｆｉｇ１７８（配列番号：３１５）、Ｆｉ
   ｇ１８０（配列番号：３１７）、Ｆｉｇ１８２（配列番号：３２２）、Ｆｉｇ１
   ８４（配列番号：３２４）、Ｆｉｇ１８６（配列番号：３２６）、Ｆｉｇ１８８
   （配列番号：３２８）、Ｆｉｇ１９０（配列番号：３３０）、Ｆｉｇ１９２（配
   列番号：３３２）、Ｆｉｇ１９４（配列番号：３３４）、Ｆｉｇ１９６（配列番
   号：３３６）、Ｆｉｇ１９８（配列番号：３３８）、Ｆｉｇ２００（配列番号：
   ３４０）、Ｆｉｇ２０２（配列番号：３４７）、Ｆｉｇ２０４（配列番号：３５
   ２）、Ｆｉｇ２０６（配列番号：３５４）、Ｆｉｇ２０８（配列番号：３５６）
   、Ｆｉｇ２１０（配列番号：３５８）、Ｆｉｇ２１２（配列番号：３６４）、Ｆ
   ｉｇ２１４（配列番号：３６６）、Ｆｉｇ２１６（配列番号：３７２）、Ｆｉｇ
   ２１８（配列番号：３７４）、Ｆｉｇ２２０（配列番号：３７６）、Ｆｉｇ２２
   ２（配列番号：３７８）、Ｆｉｇ２２４（配列番号：３８３）、Ｆｉｇ２２６（
   配列番号：３８５）、Ｆｉｇ２２８（配列番号：３９０）、Ｆｉｇ２３０（配列
   番号：３９５）、Ｆｉｇ２３２（配列番号：３９７）、Ｆｉｇ２３４（配列番号
   ：４０２）、Ｆｉｇ２３６（配列番号：４０６）、Ｆｉｇ２３８（配列番号：４
   １０）、Ｆｉｇ２４０（配列番号：４１５）、Ｆｉｇ２４２（配列番号：４２３
   ）、Ｆｉｇ２４４（配列番号：４２９）及びＦｉｇ２４６（配列番号：４３１）
   に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列を含んでなるポリ
   ペプチドをコードするヌクレオチド配列に対して少なくとも８０％の配列同一性
   を有する単離された核酸。
2. 【請求項２】 前記ヌクレオチド配列が、Ｆｉｇ１（配列番号：３）、Ｆｉ
   ｇ３（配列番号：５）、Ｆｉｇ５（配列番号：７）、Ｆｉｇ７（配列番号：９）
   、Ｆｉｇ９（配列番号：１１）、Ｆｉｇ１１（配列番号：１６）、Ｆｉｇ１３（
   配列番号：２１）、Ｆｉｇ１５（配列番号：２３）、Ｆｉｇ１７（配列番号：２
   ８）、Ｆｉｇ１９（配列番号：３０）、Ｆｉｇ２１（配列番号：３２）、Ｆｉｇ
   ２３（配列番号：４０）、Ｆｉｇ２５（配列番号：４２）、Ｆｉｇ２７（配列番
   号：４９）、Ｆｉｇ２９（配列番号：５１）、Ｆｉｇ３１（配列番号：５３）、
   Ｆｉｇ３３（配列番号：５５）、Ｆｉｇ３５（配列番号：５７）、Ｆｉｇ３７（
   配列番号：６２）、Ｆｉｇ３９（配列番号：６７）、Ｆｉｇ４１（配列番号：６
   ９）、Ｆｉｇ４３（配列番号：７１）、Ｆｉｇ４５（配列番号：７６）、Ｆｉｇ
   ４７（配列番号：７８）、Ｆｉｇ４９（配列番号：８３）、Ｆｉｇ５１（配列番
   号：８５）、Ｆｉｇ５３（配列番号：８７）、Ｆｉｇ５５（配列番号：９４）、
   Ｆｉｇ５７（配列番号：９９）、Ｆｉｇ５９（配列番号：１０１）、Ｆｉｇ６１
   （配列番号：１０３）、Ｆｉｇ６３（配列番号：１１０）、Ｆｉｇ６５（配列番
   号：１１５）、Ｆｉｇ６７（配列番号：１１７）、Ｆｉｇ６９（配列番号：１２
   ２）、Ｆｉｇ７１（配列番号：１２７）、Ｆｉｇ７３（配列番号：１２９）、Ｆ
   ｉｇ７５（配列番号：１３１）、Ｆｉｇ７７（配列番号：１３３）、Ｆｉg７９
   （配列番号：１３５）、Ｆｉｇ８１（配列番号：１３７）、Ｆｉｇ８３（配列番
   号：１３９）、Ｆｉｇ８５（配列番号：１４１）、Ｆｉｇ８７（配列番号：１４
   ３）、Ｆｉｇ８９（配列番号：１４５）、Ｆｉｇ９１（配列番号：１４７）、Ｆ
   ｉｇ９３（配列番号：１５２）、Ｆｉｇ９５（配列番号：１５７）、Ｆｉｇ９７
   （配列番号：１５９）、Ｆｉｇ９９（配列番号：１６１）、Ｆｉｇ１０１（配列
   番号：１６９）、Ｆｉｇ１０３（配列番号：１７９）、Ｆｉｇ１０５（配列番号
   ：１８８）、Ｆｉｇ１０７（配列番号：１９３）、Ｆｉｇ１０９（配列番号：１
   ９５）、Ｆｉｇ１１１（配列番号：１９７）、Ｆｉｇ１１３（配列番号：２０２
   ）、Ｆｉｇ１１５（配列番号：２０９）、Ｆｉｇ１１７（配列番号：２１１）、
   Ｆｉｇ１１９（配列番号：２１３）、Ｆｉｇ１２１（配列番号：２１５）、Ｆｉ
   ｇ１２３（配列番号：２１７）、Ｆｉｇ１２５（配列番号：２１９）、Ｆｉｇ１
   ２７（配列番号：２２４）、Ｆｉｇ１２９（配列番号：２２６）、Ｆｉｇ１３１
   （配列番号：２２８）、Ｆｉｇ１３３（配列番号：２３３）、Ｆｉｇ１３５（配
   列番号：２３５）、Ｆｉｇ１３７（配列番号：２４２）、Ｆｉｇ１３９（配列番
   号：２４７）、Ｆｉｇ１４１（配列番号：２５２）、Ｆｉｇ１４３（配列番号：
   ２５９）、Ｆｉｇ１４５（配列番号：２６４）、Ｆｉｇ１４７（配列番号：２６
   ６）、Ｆｉｇ１４９（配列番号：２６８）、Ｆｉｇ１５１（配列番号：２７０）
   、Ｆｉｇ１５３（配列番号：２７２）、Ｆｉｇ１５５（配列番号：２７４）、Ｆ
   ｉｇ１５７（配列番号：２７６）、Ｆｉｇ１５９（配列番号：２８１）、Ｆｉｇ
   １６１（配列番号：２８６）、Ｆｉｇ１６３（配列番号：２９１）、Ｆｉｇ１６
   ５（配列番号：２９６）、Ｆｉｇ１６７（配列番号：３０１）、Ｆｉｇ１６９（
   配列番号：３０３）、Ｆｉｇ１７１（配列番号：３０５）、Ｆｉｇ１７３（配列
   番号：３０７）、Ｆｉｇ１７５（配列番号：３０９）、Ｆｉｇ１７７（配列番号
   ：３１４）、Ｆｉｇ１７９（配列番号：３１６）、Ｆｉｇ１８１（配列番号：３
   ２１）、Ｆｉｇ１８３（配列番号：３２３）、Ｆｉｇ１８５（配列番号：３２５
   ）、Ｆｉｇ１８７（配列番号：３２７）、Ｆｉｇ１８９（配列番号：３２９）、
   Ｆｉｇ１９１（配列番号：３３１）、Ｆｉｇ１９３（配列番号：３３３）、Ｆｉ
   ｇ１９５（配列番号：３３５）、Ｆｉｇ１９７（配列番号：３３７）、Ｆｉｇ１
   ９９（配列番号：３３９）、Ｆｉｇ２０１（配列番号：３４６）、Ｆｉｇ２０３
   （配列番号：３５１）、Ｆｉｇ２０５（配列番号：３５３）、Ｆｉｇ２０７（配
   列番号：３５５）、Ｆｉｇ２０９（配列番号：３５７）、Ｆｉｇ２１１（配列番
   号：３６３）、Ｆｉｇ２１３（配列番号：３６５）、Ｆｉｇ２１５（配列番号：
   ３７１）、Ｆｉｇ２１７（配列番号：３７３）、Ｆｉｇ２１９（配列番号：３７
   ５）、Ｆｉｇ２２１（配列番号：３７７）、Ｆｉｇ２２３（配列番号：３８２）
   、Ｆｉｇ２２５（配列番号：３８４）、Ｆｉｇ２２７（配列番号：３８９）、Ｆ
   ｉｇ２２９（配列番号：３９４）、Ｆｉｇ２３１（配列番号：３９６）、Ｆｉｇ
   ２３３（配列番号：４０１）、Ｆｉｇ２３５（配列番号：４０５）、Ｆｉｇ２３
   ７（配列番号：４０９）、Ｆｉｇ２３９（配列番号：４１４）、Ｆｉｇ２４１（
   配列番号：４２２）、Ｆｉｇ２４２（配列番号：４２８）及びＦｉｇ２４５（配
   列番号：４３０）に示した配列からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含
   んでなる請求項１に記載の核酸。
3. 【請求項３】 前記ヌクレオチド配列が、Ｆｉｇ１（配列番号：３）、Ｆｉ
   ｇ３（配列番号：５）、Ｆｉｇ５（配列番号：７）、Ｆｉｇ７（配列番号：９）
   、Ｆｉｇ９（配列番号：１１）、Ｆｉｇ１１（配列番号：１６）、Ｆｉｇ１３（
   配列番号：２１）、Ｆｉｇ１５（配列番号：２３）、Ｆｉｇ１７（配列番号：２
   ８）、Ｆｉｇ１９（配列番号：３０）、Ｆｉｇ２１（配列番号：３２）、Ｆｉｇ
   ２３（配列番号：４０）、Ｆｉｇ２５（配列番号：４２）、Ｆｉｇ２７（配列番
   号：４９）、Ｆｉｇ２９（配列番号：５１）、Ｆｉｇ３１（配列番号：５３）、
   Ｆｉｇ３３（配列番号：５５）、Ｆｉｇ３５（配列番号：５７）、Ｆｉｇ３７（
   配列番号：６２）、Ｆｉｇ３９（配列番号：６７）、Ｆｉｇ４１（配列番号：６
   ９）、Ｆｉｇ４３（配列番号：７１）、Ｆｉｇ４５（配列番号：７６）、Ｆｉｇ
   ４７（配列番号：７８）、Ｆｉｇ４９（配列番号：８３）、Ｆｉｇ５１（配列番
   号：８５）、Ｆｉｇ５３（配列番号：８７）、Ｆｉｇ５５（配列番号：９４）、
   Ｆｉｇ５７（配列番号：９９）、Ｆｉｇ５９（配列番号：１０１）、Ｆｉｇ６１
   （配列番号：１０３）、Ｆｉｇ６３（配列番号：１１０）、Ｆｉｇ６５（配列番
   号：１１５）、Ｆｉｇ６７（配列番号：１１７）、Ｆｉｇ６９（配列番号：１２
   ２）、Ｆｉｇ７１（配列番号：１２７）、Ｆｉｇ７３（配列番号：１２９）、Ｆ
   ｉｇ７５（配列番号：１３１）、Ｆｉｇ７７（配列番号：１３３）、Ｆｉｇ７９
   （配列番号：１３５）、Ｆｉｇ８１（配列番号：１３７）、Ｆｉｇ８３（配列番
   号：１３９）、Ｆｉｇ８５（配列番号：１４１）、Ｆｉｇ８７（配列番号：１４
   ３）、Ｆｉg８９（配列番号：１４５）、Ｆｉｇ９１（配列番号：１４７）、Ｆ
   ｉｇ９３（配列番号：１５２）、Ｆｉｇ９５（配列番号：１５７）、Ｆｉｇ９７
   （配列番号：１５９）、Ｆｉｇ９９（配列番号：１６１）、Ｆｉｇ１０１（配列
   番号：１６９）、Ｆｉｇ１０３（配列番号：１７９）、Ｆｉｇ１０５（配列番号
   ：１８８）、Ｆｉｇ１０７（配列番号：１９３）、Ｆｉｇ１０９（配列番号：１
   ９５）、Ｆｉｇ１１１（配列番号：１９７）、Ｆｉｇ１１３（配列番号：２０２
   ）、Ｆｉｇ１１５（配列番号：２０９）、Ｆｉｇ１１７（配列番号：２１１）、
   Ｆｉｇ１１９（配列番号：２１３）、Ｆｉｇ１２１（配列番号：２１５）、Ｆｉ
   ｇ１２３（配列番号：２１７）、Ｆｉｇ１２５（配列番号：２１９）、Ｆｉｇ１
   ２７（配列番号：２２４）、Ｆｉｇ１２９（配列番号：２２６）、Ｆｉｇ１３１
   （配列番号：２２８）、Ｆｉｇ１３３（配列番号：２３３）、Ｆｉｇ１３５（配
   列番号：２３５）、Ｆｉｇ１３７（配列番号：２４２）、Ｆｉｇ１３９（配列番
   号：２４７）、Ｆｉｇ１４１（配列番号：２５２）、Ｆｉｇ１４３（配列番号：
   ２５９）、Ｆｉｇ１４５（配列番号：２６４）、Ｆｉｇ１４７（配列番号：２６
   ６）、Ｆｉｇ１４９（配列番号：２６８）、Ｆｉｇ１５１（配列番号：２７０）
   、Ｆｉｇ１５３（配列番号：２７２）、Ｆｉｇ１５５（配列番号：２７４）、Ｆ
   ｉｇ１５７（配列番号：２７６）、Ｆｉｇ１５９（配列番号：２８１）、Ｆｉｇ
   １６１（配列番号：２８６）、Ｆｉｇ１６３（配列番号：２９１）、Ｆｉｇ１６
   ５（配列番号：２９６）、Ｆｉｇ１６７（配列番号：３０１）、Ｆｉｇ１６９（
   配列番号：３０３）、Ｆｉｇ１７１（配列番号：３０５）、Ｆｉｇ１７３（配列
   番号：３０７）、Ｆｉｇ１７５（配列番号：３０９）、Ｆｉｇ１７７（配列番号
   ：３１４）、Ｆｉｇ１７９（配列番号：３１６）、Ｆｉｇ１８１（配列番号：３
   ２１）、Ｆｉｇ１８３（配列番号：３２３）、Ｆｉｇ１８５（配列番号：３２５
   ）、Ｆｉｇ１８７（配列番号：３２７）、Ｆｉｇ１８９（配列番号：３２９）、
   Ｆｉｇ１９１（配列番号：３３１）、Ｆｉｇ１９３（配列番号：３３３）、Ｆｉ
   ｇ１９５（配列番号：３３５）、Ｆｉｇ１９７（配列番号：３３７）、Ｆｉｇ１
   ９９（配列番号：３３９）、Ｆｉｇ２０１（配列番号：３４６）、Ｆｉｇ２０３
   （配列番号：３５１）、Ｆｉｇ２０５（配列番号：３５３）、Ｆｉｇ２０７（配
   列番号：３５５）、Ｆｉｇ２０９（配列番号：３５７）、Ｆｉｇ２１１（配列番
   号：３６３）、Ｆｉｇ２１３（配列番号：３６５）、Ｆｉｇ２１５（配列番号：
   ３７１）、Ｆｉｇ２１７（配列番号：３７３）、Ｆｉｇ２１９（配列番号：３７
   ５）、Ｆｉｇ２２１（配列番号：３７７）、Ｆｉｇ２２３（配列番号：３８２）
   、Ｆｉｇ２２５（配列番号：３８４）、Ｆｉｇ２２７（配列番号：３８９）、Ｆ
   ｉｇ２２９（配列番号：３９４）、Ｆｉｇ２３１（配列番号：３９６）、Ｆｉｇ
   ２３３（配列番号：４０１）、Ｆｉｇ２３５（配列番号：４０５）、Ｆｉｇ２３
   ７（配列番号：４０９）、Ｆｉｇ２３９（配列番号：４１４）、Ｆｉｇ２４１（
   配列番号：４２２）、Ｆｉｇ２４２（配列番号：４２８）又はＦｉｇ２４５（配
   列番号：４３０）に示した配列の全長コード化配列からなる群から選択されるヌ
   クレオチド配列を含んでなる請求項１に記載の核酸。
4. 【請求項４】 表２に示したＡＴＣＣ登録番号で寄託されたＤＮＡの全長コ
   ード化配列を含む単離された核酸。
5. 【請求項５】 請求項１に記載の核酸を含んでなるベクター。
6. 【請求項６】 当該ベクターで形質転換された宿主細胞に認識されるコント
   ロール配列に作用可能に結合した請求項５に記載のベクター。
7. 【請求項７】 請求項５に記載のベクターを含んでなる宿主細胞。
8. 【請求項８】 前記細胞がＣＨＯ細胞である請求項７に記載の宿主細胞。
9. 【請求項９】 前記細胞が大腸菌である請求項７に記載の宿主細胞。
10. 【請求項１０】 前記細胞が酵母細胞である請求項７に記載の宿主細胞。
11. 【請求項１１】 請求項７に記載の宿主細胞を、前記ＰＲＯポリペプチドの
    発現に適した条件下で培養し、細胞培養から前記ＰＲＯポリペプチドを回収する
    ことを含んでなるＰＲＯポリペプチドの製造方法。
12. 【請求項１２】 Ｆｉｇ２（配列番号：４）、Ｆｉｇ４（配列番号：６）、
    Ｆｉｇ６（配列番号：８）、Ｆｉｇ８（配列番号：１０）、Ｆｉｇ１０（配列番
    号：１２）、Ｆｉｇ１２（配列番号：１７）、Ｆｉｇ１４（配列番号：２２）、
    Ｆｉｇ１６（配列番号：２４）、Ｆｉｇ１８（配列番号：２９）、Ｆｉｇ２０（
    配列番号：３１）、Ｆｉｇ２２（配列番号：３３）、Ｆｉｇ２４（配列番号：４
    １）、Ｆｉｇ２６（配列番号：４３）、Ｆｉｇ２８（配列番号：５０）、Ｆｉｇ
    ３０（配列番号：５２）、Ｆｉｇ３２（配列番号：５４）、Ｆｉｇ３４（配列番
    号：５６）、Ｆｉｇ３６（配列番号：５８）、Ｆｉｇ３８（配列番号：６３）、
    Ｆｉｇ４０（配列番号：６８）、Ｆｉｇ４２（配列番号：７０）、Ｆｉｇ４４（
    配列番号：７２）、Ｆｉｇ４６（配列番号：７７）、Ｆｉｇ４８（配列番号：７
    ９）、Ｆｉｇ５０（配列番号：８４）、Ｆｉｇ５２（配列番号：８６）、Ｆｉｇ
    ５４（配列番号：８８）、Ｆｉｇ５６（配列番号：９５）、Ｆｉｇ５８（配列番
    号：１００）、Ｆｉg６０（配列番号：１０２）、Ｆｉｇ６２（配列番号：１０
    ４）、Ｆｉｇ６４（配列番号：１１１）、Ｆｉｇ６６（配列番号：１１６）、Ｆ
    ｉｇ６８（配列番号：１１８）、Ｆｉｇ７０（配列番号：１２３）、Ｆｉｇ７２
    （配列番号：１２８）、Ｆｉｇ７４（配列番号：１３０）、Ｆｉｇ７６（配列番
    号：１３２）、Ｆｉｇ７８（配列番号：１３４）、Ｆｉｇ８０（配列番号：１３
    ６）、Ｆｉｇ８２（配列番号：１３８）、Ｆｉｇ８４（配列番号：１４０）、Ｆ
    ｉｇ８６（配列番号：１４２）、Ｆｉｇ８８（配列番号：１４４）、Ｆｉｇ９０
    （配列番号：１４６）、Ｆｉｇ９２（配列番号：１４８）、Ｆｉｇ９４（配列番
    号：１５３）、Ｆｉｇ９６（配列番号：１５８）、Ｆｉｇ９８（配列番号：１６
    ０）、Ｆｉｇ１００（配列番号：１６２）、Ｆｉｇ１０２（配列番号：１７０）
    、Ｆｉｇ１０４（配列番号：１８０）、Ｆｉｇ１０６（配列番号：１８９）、Ｆ
    ｉｇ１０８（配列番号：１９４）、Ｆｉｇ１１０（配列番号：１９６）、Ｆｉｇ
    １１２（配列番号：１９８）、Ｆｉｇ１１４（配列番号：２０３）、Ｆｉｇ１１
    ６（配列番号：２１０）、Ｆｉｇ１１８（配列番号：２１２）、Ｆｉｇ１２０（
    配列番号：２１４）、Ｆｉｇ１２２（配列番号：２１６）、Ｆｉｇ１２４（配列
    番号：２１８）、Ｆｉｇ１２６（配列番号：２２０）、Ｆｉｇ１２８（配列番号
    ：２２５）、Ｆｉｇ１３０（配列番号：２２７）、Ｆｉｇ１３２（配列番号：２
    ２９）、Ｆｉｇ１３４（配列番号：２３４）、Ｆｉｇ１３６（配列番号：２３６
    ）、Ｆｉｇ１３８（配列番号：２４３）、Ｆｉｇ１４０（配列番号：２４８）、
    Ｆｉｇ１４２（配列番号：２５３）、Ｆｉｇ１４４（配列番号：２６０）、Ｆｉ
    ｇ１４６（配列番号：２６５）、Ｆｉｇ１４８（配列番号：２６７）、Ｆｉｇ１
    ５０（配列番号：２６９）、Ｆｉｇ１５２（配列番号：２７１）、Ｆｉｇ１５４
    （配列番号：２７３）、Ｆｉｇ１５６（配列番号：２７５）、Ｆｉｇ１５８（配
    列番号：２７７）、Ｆｉｇ１６０（配列番号：２８２）、Ｆｉｇ１６２（配列番
    号：２８７）、Ｆｉｇ１６４（配列番号：２９２）、Ｆｉｇ１６６（配列番号：
    ２９７）、Ｆｉｇ１６８（配列番号：３０２）、Ｆｉｇ１７０（配列番号：３０
    ４）、Ｆｉｇ１７２（配列番号：３０６）、Ｆｉｇ１７４（配列番号：３０８）
    、Ｆｉｇ１７６（配列番号：３１０）、Ｆｉｇ１７８（配列番号：３１５）、Ｆ
    ｉｇ１８０（配列番号：３１７）、Ｆｉｇ１８２（配列番号：３２２）、Ｆｉｇ
    １８４（配列番号：３２４）、Ｆｉｇ１８６（配列番号：３２６）、Ｆｉｇ１８
    ８（配列番号：３２８）、Ｆｉｇ１９０（配列番号：３３０）、Ｆｉｇ１９２（
    配列番号：３３２）、Ｆｉｇ１９４（配列番号：３３４）、Ｆｉｇ１９６（配列
    番号：３３６）、Ｆｉｇ１９８（配列番号：３３８）、Ｆｉｇ２００（配列番号
    ：３４０）、Ｆｉｇ２０２（配列番号：３４７）、Ｆｉｇ２０４（配列番号：３
    ５２）、Ｆｉｇ２０６（配列番号：３５４）、Ｆｉｇ２０８（配列番号：３５６
    ）、Ｆｉｇ２１０（配列番号：３５８）、Ｆｉｇ２１２（配列番号：３６４）、
    Ｆｉｇ２１４（配列番号：３６６）、Ｆｉｇ２１６（配列番号：３７２）、Ｆｉ
    ｇ２１８（配列番号：３７４）、Ｆｉｇ２２０（配列番号：３７６）、Ｆｉｇ２
    ２２（配列番号：３７８）、Ｆｉｇ２２４（配列番号：３８３）、Ｆｉｇ２２６
    （配列番号：３８５）、Ｆｉｇ２２８（配列番号：３９０）、Ｆｉｇ２３０（配
    列番号：３９５）、Ｆｉｇ２３２（配列番号：３９７）、Ｆｉｇ２３４（配列番
    号：４０２）、Ｆｉｇ２３６（配列番号：４０６）、Ｆｉｇ２３８（配列番号：
    ４１０）、Ｆｉｇ２４０（配列番号：４１５）、Ｆｉｇ２４２（配列番号：４２
    ３）、Ｆｉｇ２４４（配列番号：４２９）及びＦｉｇ２４６（配列番号：４３１
    ） に示したアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少な
    くとも８０％の配列同一性を有する単離されたＰＲＯポリペプチド。
13. 【請求項１３】 表２に示したＡＴＣＣ登録番号で寄託された核酸分子によ
    ってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも８０％の配列同一性を有する
    単離されたＰＲＯポリペプチド。
14. 【請求項１４】 異種アミノ酸配列に融合した請求項１２に記載のポリペプ
    チドを含んでなるキメラ分子。
15. 【請求項１５】 前記異種アミノ酸配列がエピトープタグ配列である請求項
    １４に記載のキメラ分子。
16. 【請求項１６】 前記異種アミノ酸配列が免疫グロブリンのＦｃ領域である
    請求項１４に記載のキメラ分子。
17. 【請求項１７】 請求項１２に記載のＰＲＯポリペプチドに特異的に結合す
    る抗体。
18. 【請求項１８】 前記抗体がモノクローナル抗体である請求項１７に記載の
    抗体。
19. 【請求項１９】 前記抗体がヒト化抗体である請求項１７に記載の抗体。
20. 【請求項２０】 前記抗体が抗体断片である請求項１７に記載の抗体。
21. 【請求項２１】 Ｆｉｇ１（配列番号：３）、Ｆｉｇ３（配列番号：５）、
    Ｆｉｇ５（配列番号：７）、Ｆｉｇ７（配列番号：９）、Ｆｉｇ９（配列番号：
    １１）、Ｆｉｇ１１（配列番号：１６）、Ｆｉｇ１３（配列番号：２１）、Ｆｉ
    ｇ１５（配列番号：２３）、Ｆｉｇ１７（配列番号：２８）、Ｆｉｇ１９（配列
    番号：３０）、Ｆｉｇ２１（配列番号：３２）、Ｆｉｇ２３（配列番号：４０）
    、Ｆｉｇ２５（配列番号：４２）、Ｆｉｇ２７（配列番号：４９）、Ｆｉｇ２９
    （配列番号：５１）、Ｆｉｇ３１（配列番号：５３）、Ｆｉｇ３３（配列番号：
    ５５）、Ｆｉｇ３５（配列番号：５７）、Ｆｉｇ３７（配列番号：６２）、Ｆｉ
    ｇ３９（配列番号：６７）、Ｆｉｇ４１（配列番号：６９）、Ｆｉｇ４３（配列
    番号：７１）、Ｆｉｇ４５（配列番号：７６）、Ｆｉｇ４７（配列番号：７８）
    、Ｆｉｇ４９（配列番号：８３）、Ｆｉｇ５１（配列番号：８５）、Ｆｉｇ５３
    （配列番号：８７）、Ｆｉｇ５５（配列番号：９４）、Ｆｉｇ５７（配列番号：
    ９９）、Ｆｉｇ５９（配列番号：１０１）、Ｆｉｇ６１（配列番号：１０３）、
    Ｆｉｇ６３（配列番号：１１０）、Ｆｉｇ６５（配列番号：１１５）、Ｆｉｇ６
    ７（配列番号：１１７）、Ｆｉｇ６９（配列番号：１２２）、Ｆｉｇ７１（配列
    番号：１２７）、Ｆｉｇ７３（配列番号：１２９）、Ｆｉｇ７５（配列番号：１
    ３１）、Ｆｉｇ７７（配列番号：１３３）、Ｆｉg７９（配列番号：１３５）、
    Ｆｉｇ８１（配列番号：１３７）、Ｆｉｇ８３（配列番号：１３９）、Ｆｉｇ８
    ５（配列番号：１４１）、Ｆｉｇ８７（配列番号：１４３）、Ｆｉｇ８９（配列
    番号：１４５）、Ｆｉｇ９１（配列番号：１４７）、Ｆｉｇ９３（配列番号：１
    ５２）、Ｆｉｇ９５（配列番号：１５７）、Ｆｉｇ９７（配列番号：１５９）、
    Ｆｉｇ９９（配列番号：１６１）、Ｆｉｇ１０１（配列番号：１６９）、Ｆｉｇ
    １０３（配列番号：１７９）、Ｆｉｇ１０５（配列番号：１８８）、Ｆｉｇ１０
    ７（配列番号：１９３）、Ｆｉｇ１０９（配列番号：１９５）、Ｆｉｇ１１１（
    配列番号：１９７）、Ｆｉｇ１１３（配列番号：２０２）、Ｆｉｇ１１５（配列
    番号：２０９）、Ｆｉｇ１１７（配列番号：２１１）、Ｆｉｇ１１９（配列番号
    ：２１３）、Ｆｉｇ１２１（配列番号：２１５）、Ｆｉｇ１２３（配列番号：２
    １７）、Ｆｉｇ１２５（配列番号：２１９）、Ｆｉｇ１２７（配列番号：２２４
    ）、Ｆｉｇ１２９（配列番号：２２６）、Ｆｉｇ１３１（配列番号：２２８）、
    Ｆｉｇ１３３（配列番号：２３３）、Ｆｉｇ１３５（配列番号：２３５）、Ｆｉ
    ｇ１３７（配列番号：２４２）、Ｆｉｇ１３９（配列番号：２４７）、Ｆｉｇ１
    ４１（配列番号：２５２）、Ｆｉｇ１４３（配列番号：２５９）、Ｆｉｇ１４５
    （配列番号：２６４）、Ｆｉｇ１４７（配列番号：２６６）、Ｆｉｇ１４９（配
    列番号：２６８）、Ｆｉｇ１５１（配列番号：２７０）、Ｆｉｇ１５３（配列番
    号：２７２）、Ｆｉｇ１５５（配列番号：２７４）、Ｆｉｇ１５７（配列番号：
    ２７６）、Ｆｉｇ１５９（配列番号：２８１）、Ｆｉｇ１６１（配列番号：２８
    ６）、Ｆｉｇ１６３（配列番号：２９１）、Ｆｉｇ１６５（配列番号：２９６）
    、Ｆｉｇ１６７（配列番号：３０１）、Ｆｉｇ１６９（配列番号：３０３）、Ｆ
    ｉｇ１７１（配列番号：３０５）、Ｆｉｇ１７３（配列番号：３０７）、Ｆｉｇ
    １７５（配列番号：３０９）、Ｆｉｇ１７７（配列番号：３１４）、Ｆｉｇ１７
    ９（配列番号：３１６）、Ｆｉｇ１８１（配列番号：３２１）、Ｆｉｇ１８３（
    配列番号：３２３）、Ｆｉｇ１８５（配列番号：３２５）、Ｆｉｇ１８７（配列
    番号：３２７）、Ｆｉｇ１８９（配列番号：３２９）、Ｆｉｇ１９１（配列番号
    ：３３１）、Ｆｉｇ１９３（配列番号：３３３）、Ｆｉｇ１９５（配列番号：３
    ３５）、Ｆｉｇ１９７（配列番号：３３７）、Ｆｉｇ１９９（配列番号：３３９
    ）、Ｆｉｇ２０１（配列番号：３４６）、Ｆｉｇ２０３（配列番号：３５１）、
    Ｆｉｇ２０５（配列番号：３５３）、Ｆｉｇ２０７（配列番号：３５５）、Ｆｉ
    ｇ２０９（配列番号：３５７）、Ｆｉｇ２１１（配列番号：３６３）、Ｆｉｇ２
    １３（配列番号：３６５）、Ｆｉｇ２１５（配列番号：３７１）、Ｆｉｇ２１７
    （配列番号：３７３）、Ｆｉｇ２１９（配列番号：３７５）、Ｆｉｇ２２１（配
    列番号：３７７）、Ｆｉｇ２２３（配列番号：３８２）、Ｆｉｇ２２５（配列番
    号：３８４）、Ｆｉｇ２２７（配列番号：３８９）、Ｆｉｇ２２９（配列番号：
    ３９４）、Ｆｉｇ２３１（配列番号：３９６）、Ｆｉｇ２３３（配列番号：４０
    １）、Ｆｉｇ２３５（配列番号：４０５）、Ｆｉｇ２３７（配列番号：４０９）
    、Ｆｉｇ２３９（配列番号：４１４）、Ｆｉｇ２４１（配列番号：４２２）、Ｆ
    ｉｇ２４２（配列番号：４２８）及びＦｉｇ２４５（配列番号：４３０）に示し
    たものからなる群から選択される核酸配列に対して少なくとも８０％の配列同一
    性を有する単離された核酸。
22. 【請求項２２】 Ｆｉｇ１（配列番号：３）、Ｆｉｇ３（配列番号：５）、
    Ｆｉｇ５（配列番号：７）、Ｆｉｇ７（配列番号：９）、Ｆｉｇ９（配列番号：
    １１）、Ｆｉｇ１１（配列番号：１６）、Ｆｉｇ１３（配列番号：２１）、Ｆｉ
    ｇ１５（配列番号：２３）、Ｆｉｇ１７（配列番号：２８）、Ｆｉｇ１９（配列
    番号：３０）、Ｆｉｇ２１（配列番号：３２）、Ｆｉｇ２３（配列番号：４０）
    、Ｆｉｇ２５（配列番号：４２）、Ｆｉｇ２７（配列番号：４９）、Ｆｉｇ２９
    （配列番号：５１）、Ｆｉｇ３１（配列番号：５３）、Ｆｉｇ３３（配列番号：
    ５５）、Ｆｉｇ３５（配列番号：５７）、Ｆｉｇ３７（配列番号：６２）、Ｆｉ
    ｇ３９（配列番号：６７）、Ｆｉｇ４１（配列番号：６９）、Ｆｉｇ４３（配列
    番号：７１）、Ｆｉｇ４５（配列番号：７６）、Ｆｉｇ４７（配列番号：７８）
    、Ｆｉｇ４９（配列番号：８３）、Ｆｉｇ５１（配列番号：８５）、Ｆｉｇ５３
    （配列番号：８７）、Ｆｉｇ５５（配列番号：９４）、Ｆｉｇ５７（配列番号：
    ９９）、Ｆｉｇ５９（配列番号：１０１）、Ｆｉｇ６１（配列番号：１０３）、
    Ｆｉｇ６３（配列番号：１１０）、Ｆｉｇ６５（配列番号：１１５）、Ｆｉｇ６
    ７（配列番号：１１７）、Ｆｉｇ６９（配列番号：１２２）、Ｆｉｇ７１（配列
    番号：１２７）、Ｆｉｇ７３（配列番号：１２９）、Ｆｉｇ７５（配列番号：１
    ３１）、Ｆｉｇ７７（配列番号：１３３）、Ｆｉｇ７９（配列番号：１３５）、
    Ｆｉｇ８１（配列番号：１３７）、Ｆｉｇ８３（配列番号：１３９）、Ｆｉｇ８
    ５（配列番号：１４１）、Ｆｉｇ８７（配列番号：１４３）、Ｆｉg８９（配列
    番号：１４５）、Ｆｉｇ９１（配列番号：１４７）、Ｆｉｇ９３（配列番号：１
    ５２）、Ｆｉｇ９５（配列番号：１５７）、Ｆｉｇ９７（配列番号：１５９）、
    Ｆｉｇ９９（配列番号：１６１）、Ｆｉｇ１０１（配列番号：１６９）、Ｆｉｇ
    １０３（配列番号：１７９）、Ｆｉｇ１０５（配列番号：１８８）、Ｆｉｇ１０
    ７（配列番号：１９３）、Ｆｉｇ１０９（配列番号：１９５）、Ｆｉｇ１１１（
    配列番号：１９７）、Ｆｉｇ１１３（配列番号：２０２）、Ｆｉｇ１１５（配列
    番号：２０９）、Ｆｉｇ１１７（配列番号：２１１）、Ｆｉｇ１１９（配列番号
    ：２１３）、Ｆｉｇ１２１（配列番号：２１５）、Ｆｉｇ１２３（配列番号：２
    １７）、Ｆｉｇ１２５（配列番号：２１９）、Ｆｉｇ１２７（配列番号：２２４
    ）、Ｆｉｇ１２９（配列番号：２２６）、Ｆｉｇ１３１（配列番号：２２８）、
    Ｆｉｇ１３３（配列番号：２３３）、Ｆｉｇ１３５（配列番号：２３５）、Ｆｉ
    ｇ１３７（配列番号：２４２）、Ｆｉｇ１３９（配列番号：２４７）、Ｆｉｇ１
    ４１（配列番号：２５２）、Ｆｉｇ１４３（配列番号：２５９）、Ｆｉｇ１４５
    （配列番号：２６４）、Ｆｉｇ１４７（配列番号：２６６）、Ｆｉｇ１４９（配
    列番号：２６８）、Ｆｉｇ１５１（配列番号：２７０）、Ｆｉｇ１５３（配列番
    号：２７２）、Ｆｉｇ１５５（配列番号：２７４）、Ｆｉｇ１５７（配列番号：
    ２７６）、Ｆｉｇ１５９（配列番号：２８１）、Ｆｉｇ１６１（配列番号：２８
    ６）、Ｆｉｇ１６３（配列番号：２９１）、Ｆｉｇ１６５（配列番号：２９６）
    、Ｆｉｇ１６７（配列番号：３０１）、Ｆｉｇ１６９（配列番号：３０３）、Ｆ
    ｉｇ１７１（配列番号：３０５）、Ｆｉｇ１７３（配列番号：３０７）、Ｆｉｇ
    １７５（配列番号：３０９）、Ｆｉｇ１７７（配列番号：３１４）、Ｆｉｇ１７
    ９（配列番号：３１６）、Ｆｉｇ１８１（配列番号：３２１）、Ｆｉｇ１８３（
    配列番号：３２３）、Ｆｉｇ１８５（配列番号：３２５）、Ｆｉｇ１８７（配列
    番号：３２７）、Ｆｉｇ１８９（配列番号：３２９）、Ｆｉｇ１９１（配列番号
    ：３３１）、Ｆｉｇ１９３（配列番号：３３３）、Ｆｉｇ１９５（配列番号：３
    ３５）、Ｆｉｇ１９７（配列番号：３３７）、Ｆｉｇ１９９（配列番号：３３９
    ）、Ｆｉｇ２０１（配列番号：３４６）、Ｆｉｇ２０３（配列番号：３５１）、
    Ｆｉｇ２０５（配列番号：３５３）、Ｆｉｇ２０７（配列番号：３５５）、Ｆｉ
    ｇ２０９（配列番号：３５７）、Ｆｉｇ２１１（配列番号：３６３）、Ｆｉｇ２
    １３（配列番号：３６５）、Ｆｉｇ２１５（配列番号：３７１）、Ｆｉｇ２１７
    （配列番号：３７３）、Ｆｉｇ２１９（配列番号：３７５）、Ｆｉｇ２２１（配
    列番号：３７７）、Ｆｉｇ２２３（配列番号：３８２）、Ｆｉｇ２２５（配列番
    号：３８４）、Ｆｉｇ２２７（配列番号：３８９）、Ｆｉｇ２２９（配列番号：
    ３９４）、Ｆｉｇ２３１（配列番号：３９６）、Ｆｉｇ２３３（配列番号：４０
    １）、Ｆｉｇ２３５（配列番号：４０５）、Ｆｉｇ２３７（配列番号：４０９）
    、Ｆｉｇ２３９（配列番号：４１４）、Ｆｉｇ２４１（配列番号：４２２）、Ｆ
    ｉｇ２４２（配列番号：４２８）又はＦｉｇ２４５（配列番号：４３０）に示し
    たものからなる群から選択されるヌクレオチド配列の全長コード化配列に対して
    少なくとも８０％の配列同一性を有する単離された核酸。
23. 【請求項２３】 ＰＲＯポリペプチドの単離された細胞外ドメイン。
24. 【請求項２４】 関連するシグナルペプチドを欠く単離されたＰＲＯポリペ
    プチド。
25. 【請求項２５】 ＰＲＯポリペプチドの細胞外ドメインに対して少なくとも
    約８０％のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド。
26. 【請求項２６】 関連するシグナルペプチドを欠くＰＲＯポリペプチドに対
    して少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性を有する単離されたポリペプチド
    。
27. 【請求項２７】 請求項２３ないし２６のいずれか１項のポリペプチドをコ
    ードする単離された核酸。