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JP2002534078A - 植物における器官の重量の改変、稔性の制御ならびに無性生殖の増強のための方法 - Google Patents

植物における器官の重量の改変、稔性の制御ならびに無性生殖の増強のための方法

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JP2002534078A
JP2002534078A JP2000592392A JP2000592392A JP2002534078A JP 2002534078 A JP2002534078 A JP 2002534078A JP 2000592392 A JP2000592392 A JP 2000592392A JP 2000592392 A JP2000592392 A JP 2000592392A JP 2002534078 A JP2002534078 A JP 2002534078A
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JP
Japan
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ant
nucleic acid
plant
seq
expression
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2000592392A
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English (en)
Inventor
ロバート エル. フィッシャー,
ユキコ ミズカミ,
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
University of California
Original Assignee
University of California
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by University of California filed Critical University of California
Publication of JP2002534078A publication Critical patent/JP2002534078A/ja
Pending legal-status Critical Current

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Abstract

(57)【要約】 本発明は、植物の生長および細胞の増殖の調節を介して、植物における器官の重量の改変、稔性の制御ならびに無性生殖の増強のための方法を提供する。詳細には、ANT活性を調節する工程および改変された細胞数によって植物を選択する工程を包含する植物における生長および細胞の増殖を調節する方法を提供する。本発明の方法は、植物プロモーターに結合したANT核酸を含む組み換え発現カセットを含むトランスジェニック植物を産生する工程を含む。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 (関連出願の引用) 本出願は、米国特許出願第09/227,421号(1999年1月8日出願
、これは、本明細書中に参考として援用される)に関連する。
【0002】 (発明の分野) 本発明は、植物遺伝子工学に関する。詳細には、これは、植物生長および細胞
増殖の調節を通じて、植物における器官の重量の改変、稔性の制御ならびに無性
生殖の増強のための方法に関連する。
【0003】 (発明の背景) 植物における器官重量/大きさおよび稔性の制御は、商業的農業において意義
のある目標である。植物シュート栄養器官および/または構造(例えば、葉、茎
、および塊茎)、根、花、および花器(例えば、苞葉、萼片、花弁、雄蕊、心皮
、葯)、胚珠(卵細胞および中心細胞を含む)、種子(接合子、胚、内乳、およ
び種皮を含む)、果実(成熟子房)、および実生が、多数の農学的に重要な作物
の収穫産物である。従って、遺伝子制御を通じてこれらの器官/構造物の大きさ
/重量を操作できることが、重要な農業上のツールとなる。同様に、植物におけ
る不稔性の導入は、経済的に望ましいところまで、植物受粉および生殖を制限す
ることにおいて有用である。例えば、雄性不稔性植物は、雑種強勢が収量を増大
させる作物において、しばしば望ましい。
【0004】 固有の植物器官の大きさは、環境シグナル(例えば生長条件)によって大きく
改変され得るが、遺伝的に決定される。一般に、より大きな器官は、より多くの
数の細胞からなる。植物発達の間、細胞移動も細胞死も主要な役割を演じないの
で、植物器官における細胞数は、細胞増殖に依存する。細胞増殖の正確な調節は
また、植物を稔性にする生殖器官の適切な発達のために必要である。いくつかの
基礎研究が、植物器官発達および稔性に関与する遺伝子を同定したが、細胞増殖
の遺伝的制御またはその器官形成(植物における器官の大きさ/重量の制御およ
び稔性を含む)に対する関連についてはほとんど知られていない。従って、器官
形成を制御する遺伝子と細胞増殖を制御する遺伝子との間の関係を理解すること
が、重要な目標である。相当量の基礎研究が、酵母および動物において細胞周期
を制御する成分(例えば、サイクリン依存キナーゼ、サイクリン、およびそのイ
ンヒビター)および機構(例えば、リン酸化による調節、ユビキチン媒介タンパ
ク質分解)は、高等植物において保存されていることを示した(Burssen
sら、Plant Physiol.Biochem.36:9−19(199
8))。
【0005】 Arabidopsisにおいて、発達中の花は、胚珠を含む。Arabid
opsisにおける野生型胚珠の発達が、広範に分析されてきた(Robins
on−Beersら、Plant Cell 4:1237−1249(199
2);Modrusanら、Plant Cell 6:333−349(19
94)およびSchneitzら、Plant J.7:731:749(19
95))。胚珠の発達に影響を与える種々の変異が同定されており(Kluch
erら、Plant Cell 8:137−153(1996);Ellio
ttら、Plant Cell.8:155−168(1996);Baker
ら、Genetics.145:1109−1124(1997);Robin
son−Beersら、Plant Cell.4:1237−1249(19
92);Modrusanら、Plant Cell.6:333−349(1
994);Ray、A.ら、Proc Natl Acad Sci USA.
91:5761−5765(1994);Langら、Genetics 13
7:1101−1110(1994);Leon−Kloosterziel、
Plant Cell.6:385−392(1994);Gaiserら、P
lant Cell 7:333−345(1995))、そしてそれらのいく
つかは、細胞分裂のパターンに特に影響を与えることが見出されている(Sch
neitzら、Development.124:1367−1376(199
7))。もちろん、いくつかの遺伝子がクローニングされている;AINTEG
UMENTA(ANT)(Klucherら、Plant Cell.8:13
7−153(1996);Elliottら、Plant Cell.8:15
5−168(1996))、AGAMOUS(Yanofskyら、Natur
e.346:35−39(1990);Bowmanら、Plant Cell
.3:749−758(1991))、SUPERMAN(Sakaiら、Na
ture.376:199−203(1995))。これらの遺伝子は、発現さ
れ、そして発達中の胚珠においてのみならず、種々の発達中の器官においてもま
た機能するので、これらの変異および遺伝子の分析は、植物発達の間の細胞増殖
の制御について遺伝的情報を提供した。
【0006】 作物種の操作にとって重要である別の形質は、無性手段(特に、不稔性植物ま
たは雑種植物の栄養繁殖、および形質転換細胞からの植物の再生)を通じて植物
を再生または繁殖させることができることである。無性生殖は、細胞または組織
からの植物の再生、不定シュートおよび不定根を誘導することによる挿穂からの
植物の繁殖、および体細胞胚を形成することによるアポミクシスを含む。無性生
殖は、所望の形質を有する植物の遺伝的クローンが容易に生成され得るという利
点を有する。しかし、全ての植物が、不定シュートまたは不定根を生成し得るわ
けではなく、細胞または組織から植物体に再生し得るわけでもない。
【0007】 植物細胞増殖の遺伝的制御を規定する近年の進歩にも関わらず、細胞増殖を制
御することを通じた、農学的に重要な形質(例えば、器官の重量/大きさ、稔性
、無性生殖など)をもたらす遺伝子の同定および分析においては、進歩がほとん
ど報告されていない。このような遺伝子の特徴づけは、種々の望ましい形質を有
する植物の遺伝子工学を可能にする。本発明は、これら必要性のおよび他の必要
性に取り組む。
【0008】 (発明の要旨) 本発明は、植物においてANT活性を調節することにより、細胞増殖、従って
植物における細胞数を調節するための方法を提供する。代表的には、この方法は
、植物においてANTの発現を調節する工程、および大きさ/重量、稔性、また
はその両方が改変された植物について選択する工程を包含する。いくつかの好ま
しい実施形態では、ANT活性が増大され、そして増大された細胞増殖、従って
増大された細胞数を有する植物が選択される。ANT発現を調節するための1つ
の方法は、植物に、プロモーターに作動可能に連結された異種ANT核酸を含む
発現カセットを導入することによる。用いられ得る可能なANT核酸の例は、配
列番号1および配列番号4に少なくとも50%同一である核酸を含む。他の例は
、配列番号2または配列番号5のいずれかに少なくとも60%同一であるポリペ
プチドをコードする核酸を含む。
【0009】 本発明はまた、細胞増殖、従って植物における不定器官の生成を調節するため
の方法を提供する。代表的には、この方法は、植物においてANTの活性または
発現を増加させる工程、および不定シュート、不定器官、または不定構造物(例
えば胚)を有する植物について選択する工程を包含する。ANT発現を調節する
ための1つの方法は、植物に、プロモーターに作動可能に連結された異種ANT
核酸を含む発現カセットを導入することによる。用いられ得る可能なANT核酸
の例は、配列番号1および配列番号4に少なくとも50%同一である核酸を含む
。他の例は、配列番号2または配列番号5のいずれかに少なくとも60%同一で
あるポリペプチドをコードする核酸を含む。
【0010】 本発明はまた、無性手段を通じて植物を再生する方法を提供する。代表的には
、この方法は、植物においてANTの活性または発現を増加させる工程、および
植物細胞または組織から再生された植物を選択する工程を包含する。ANT発現
を調節するための1つの方法は、植物に、プロモーターに作動可能に連結された
異種ANT核酸を含む発現カセットを導入することによる。用いられ得る可能な
ANT核酸の例は、配列番号1および配列番号4に少なくとも50%同一である
核酸を含む。他の例は、配列番号2または配列番号5のいずれかに少なくとも6
0%同一であるポリペプチドをコードする核酸を含む。種々の実施形態では、こ
の植物は、不定根、体細胞胚、または挿穂から生じる。
【0011】 本発明の別の実施形態では、異種遺伝子は、植物に異種ポリヌクレオチドに作
動可能に連結されたANTプロモーターを含む発現カセットを導入することより
、植物の分裂組織において発現される。本発明の好ましい実施形態では、このA
NTプロモーターは配列番号3に示される。
【0012】 本発明はまた、配列番号4に特異的にハイブリダイズするANT核酸を含む単
離された核酸分子を提供する。これは、Brassica napusから単離
される。
【0013】 種々の植物プロモーターが、本発明の方法において使用され得る。このプロモ
ーターは、構成的、誘導可能、または器官、組織もしくは細胞に特異的であり得
る。いくつかの実施形態では、ANT遺伝子からのプロモーター(例えば、配列
番号3)が用いられる。本発明のANT核酸の発現は、植物における任意の所望
の器官、組織もしくは細胞に指向され得る。本発明のいくつかの好ましい実施形
態では、このプロモーターは、シュート栄養器官/構造物(例えば、葉、茎、お
よび塊茎)においてANT核酸の発現を指向させる。他の好ましい実施形態では
、このプロモーターは、花もしくは花器/構造物(例えば、苞葉、萼片、花弁、
雄蕊、心皮、葯および胚珠においてANT核酸の発現を指向させる。異なる実施
形態では、このプロモーターは、種子(例えば、胚、内乳、および種皮)または
果実においてANT核酸の発現を指向させる。
【0014】 (定義) 句「核酸配列」とは、5’末端から3’末端へと読まれる、デオキシリボヌク
レオチド塩基またはリボヌクレオチド塩基の、一本鎖ポリマーまたは二本鎖ポリ
マーをいう。この句は、染色体DNA、自己複製プラスミド、DNAまたはRN
Aの感染性ポリマー、および主に構造的役割を果たすDNAまたはRNAを含む
【0015】 用語「プロモーター」とは、転写の開始から上流および/または下流に位置し
、そして転写を開始するためのRNAポリメラーゼおよび他のタンパク質の認識
および結合に関与する、領域または配列をいう。「植物プロモーター」とは、植
物細胞における転写を開始し得る、プロモーターである。
【0016】 用語「植物」とは、植物全体、シュート栄養器官および/または構造(例えば
、葉、茎および塊茎)、根、花および花器(例えば、苞葉、萼片、花弁、雄蕊、
心皮、葯)、胚珠(卵細胞および中心細胞を含む)、種子(接合子、胚、内胚葉
、および種皮を含む)、果実(例えば、成熟子房)、実生、植物組織(例えば、
維管束組織、基本組織など)、細胞(例えば、孔辺細胞、卵細胞、突起様構造な
ど)ならびにその後代を含む。本発明の方法において使用され得る植物の種類は
、形質転換技術を受けやすい高等植物および下等植物の種類とほぼ同じ程度の広
さであり、そのようなものとしては、被子植物(単子葉植物および双子葉植物)
、裸子植物、シダ類、および多細胞藻類が挙げられる。この種類は、種々の倍数
レベル(異数性、多倍数性、二倍体、半数体および半接合体を含む)の植物を含
む。
【0017】 「ANT活性またはANT遺伝子の発現の増加または増強」とは、ANT活性
の増強された変化をいう。このような増加された活性または発現の例を以下に挙
げる。ANT活性またはANT遺伝子の発現は、野生型の非トランスジェニック
コントロール植物のレベルを超えて増加する(すなわち、ANT活性またはAN
T遺伝子の発現の量が増加する)。ANT活性またはANT遺伝子の発現は、そ
れが通常には野生型の非トランスジェニックコントロール動物において検出され
ない、器官、組織または細胞においてである(すなわち、ANT活性またはAN
T遺伝子の発現の空間的分布が増加する)。ANTの活性または発現は、ANT
活性またはANT遺伝子の発現が、野生型の非トランスジェニックコントロール
よりも長い期間、器官、組織または細胞に存在する(すなわち、ANT活性また
はANT遺伝子の発現の持続期間が増加する)場合に、増加する。
【0018】 本明細書中で使用される場合、用語「無性生殖」とは、受精を伴わない、植物
細胞からのシュート、根または植物全体の形成をいう。この植物全体の形成が体
性の胚を介して進行する場合、この無性生殖は、アポミクシスと呼ばれ得る。
【0019】 用語「不定器官」および「不定シュート」とは、それぞれ、その通常の部位以
外の場所にて生じる、器官(例えば、幹、葉、または根)およびシュートをいう
。例えば、葉の葉腋以外の部位にて、幹上に発達する根、または幹上に生じるシ
ュート芽である。不定器官または不定シュートはまた、インビトロにてカルス組
織にて生じ得る。次いで、このような不定器官または不定シュートは、当業者に
周知の方法を使用して、植物全体を再生するための使用され得る。
【0020】 ポリヌクレオチド配列は、それが外来の種に由来する場合に、生物または第2
のポリヌクレオチド配列に対して「異種」であるか、または同じ種に由来する場
合に、そのもとの形態から改変されている。例えば、異種コード配列に作動可能
に連結されたプロモーターとは、そのプロモーターが、由来した種と異なる種由
来のコード配列をいい、または同じ種由来の場合は、そのプロモーターと天然で
結合しないコード配列(例えば、異なる生態型または変種由来の、遺伝子操作さ
れたコード配列または対立遺伝子)をいう。
【0021】 個々の植物に対して「外因性」であるポリヌクレオチドは、有性交配以外の任
意の手段によって、その植物に導入されたポリヌクレオチドである。これが達成
され得る手段の例を以下に記載する。これらとしては、Agrobacteri
um媒介性形質転換、微粒子銃(biolistic)法、エレクトロポレーシ
ョンなどが、挙げられる。外因性核酸を含むこのような植物は、本明細書中で、
1(例えば、真空浸潤によりArabidopsisにおいて)世代トランス
ジェニック植物またはR0(形質転換細胞からインビトロで再生した植物につい
て)世代トランスジェニック植物と呼ばれる。有性交配または自家受粉により生
じるトランスジェニック植物は、このような植物の後代である。
【0022】 本発明の「ANT核酸」または「ANTポリヌクレオチド配列」は、例えば、
Klucherら、Plant Cell 8:137〜153(1996)お
よびElliottら、Plant Cell.8:155〜168(1996
)(また、GenBank登録番号U40256および同U41339を参照の
こと)に記載されるようなポリペプチド(配列番号2)をコードする、部分配列
または全長ポリヌクレオチド配列(配列番号1)およびその相補体である。配列
番号5をコードする配列番号4は、Brassica由来の別の「ANT核酸」
を示す。本発明のANT遺伝子産物は、AP2ドメインの存在によって特徴付け
られる。このドメインは、AP2において最初に同定され、このモチーフは、両
親媒性α−へリックスを形成する能力および/またはDNAを結合する能力を有
する、非常に保存されたコア領域を有する、約60〜70アミノ酸残基の領域に
より特徴付けられる(Jofukuら、Plant Cell 6:1211〜
1225(1994);Ohme−TakagiおよびShinshi、Pla
nt Cell 7:173〜182(1995))。全長ANTタンパク質は
、2つのAP2ドメイン(配列番号2のアミノ酸281〜357および383〜
451)およびリンカー領域(アミノ酸358〜382)を含み、そして他のA
P2ドメインタンパク質に対する相同性は、この領域に限定されている。本発明
のANTポリヌクレオチドは、代表的には、長さが少なくとも約30〜40ヌク
レオチド〜約2500ヌクレオチド、通常は長さが約3000ヌクレオチド未満
の、コード配列を含む。通常、本発明のANT核酸は、長さが約100〜約50
00ヌクレオチド、しばしば約500〜約3000ヌクレオチドである。
【0023】 導入遺伝子の発現および内因性遺伝子の阻害(例えば、アンチセンスまたはコ
サプレッションによる)の両方の場合において、当業者は、挿入されるポリヌク
レオチド配列が同一である必要はないが、その配列が由来した遺伝子の配列と単
に「実質的に同一」であり得ることを認識する。以下に説明されるように、これ
らの実質的に同一の改変体は、用語、ANT核酸によって、特に包含される。
【0024】 挿入されたポリヌクレオチド配列が転写されそして翻訳されて、機能的ポリペ
プチドになる場合、当業者は、コドンの縮重に起因して、多数のポリヌクレオチ
ド配列が同じポリペプチドをコードすることを認識する。これらの改変体は、用
語「ANT核酸」、「ANTポリヌクレオチド」およびこれらの等価物により特
に包含される。さらに、これらの用語は、ANTポリヌクレオチド配列と実質的
に同一であり(下記のように決定される)、そしてANTポリペプチドの機能を
保持するタンパク質(例えば、ANTポリペプチド中のアミノ酸の保存的置換か
ら生じる)をコードする、全長配列を特に包含する。
【0025】 用語「改変された稔性」とは、不稔性の誘導を含む、生殖能力のいかなる一過
性または永続性の改変、ならびに花の発達の開始(例えば、開花時期)の改変を
も含む。不稔性は、特に、花粉の発達の破壊、裂開の破壊(すなわち、雄性不稔
性)、胚珠の発達の破壊(すなわち、雌性不稔性)、あるいは雄性器官/雌性器
官(例えば、柱頭柔突起、隔膜の輸送組織(transmitting tis
sue))の異常な発達により生じる受粉/受精プロセスの破壊によって、生じ
得る。開花時期は、植物が花組織を開始および生成する場合の発達時間または段
階である。
【0026】 2つの核酸配列またはポリペプチドは、それぞれ、その2つの配列中のヌクレ
オチドの配列またはアミノ酸残基の配列が、下記のように最大の一致について整
列された場合に同じである場合に、「同一」であると言われる。用語「同一」ま
たは「同一性」パーセントとは、2つ以上の核酸配列またはポリペプチド配列の
文脈においては、同じである2つ以上の配列または部分配列をいうか、あるいは
以下の配列比較アルゴリズムのうちの1つを使用するかまたは手作業での整列お
よび視認によって測定される場合に、比較ウィンドウにわたって最大の一致につ
いて比較および整列された場合に、特定のパーセンテージの同じアミノ酸残基ま
たはヌクレオチドを有する2つ以上の配列または部分配列をいう。配列同一性の
パーセンテージが、タンパク質またはペプチドに関して使用される場合、アミノ
酸残基が類似の化学的特性(例えば、電荷または疎水性)を有する他のアミノ酸
残基に変えて置換され、従ってその分子の機能的特性が変化しない場合に、同一
でない残基位置が、しばしば保存的アミノ酸置換により異なることが認識される
。配列が保存的置換で異なる場合、配列同一性パーセントは、その置換の保存的
性質を補正するためにより高く調整され得る。この調整を行うための手段は、当
業者に周知である。代表的には、この手段は、完全な不一致ではなく部分的不一
致として、保存的置換をスコアリングし、それによって配列同一性のパーセンテ
ージを増加させる工程を包含する。従って、例えば、同一のアミノ酸がスコア1
を与えられ、そして非保存的置換がスコア0を与えられる場合、保存的置換は、
0と1との間のスコアを与えられる。保存的置換のスコアリングは、例えば、M
eyersおよびMiller、Computer Applic.Biol.
Sci.4:11〜17(1988)のアルゴリズムに従って、計算され、この
アルゴリズムは、例えば、プログラムPC/GENE(Intelligene
tics、Mountain View、California、USA)にて
実行される。
【0027】 句「実質的に同一」とは、2つの核酸またはポリペプチドの文脈においては、
参照配列と少なくとも25%の配列同一性を有する配列または部分配列をいう。
あるいは、同一性パーセントは、25%〜100%の任意の整数であり得る。最
も好ましい実施形態としては、本明細書中に記載されるプログラム(好ましくは
、下記のような標準的パラメーターを使用するBLAST)を使用して参照配列
と比較した場合に、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、
少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、
少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、
少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、
または少なくとも99%が挙げられる。この定義はまた、試験配列が参照配列と
実質的同一性を有する場合に、その試験配列の相補性もいう。
【0028】 配列比較のために、代表的には、1つの配列が、参照配列として働き、試験配
列がその配列に対して比較される。配列比較アルゴリズムを使用する場合、試験
配列および参照配列がコンピューターに入力され、部分配列一致が必要な場合指
定され、そして配列アルゴリズムプログラムパラメーターが指定される。デフォ
ールトプログラムパラメーターが使用され得るし、あるいは代わりにパラメータ
ーが指定され得る。次いで、この配列比較アルゴリズムによって、参照配列と比
較した試験配列についての配列同一性パーセントが、そのプログラムパラメータ
ーに基づいて算出される。
【0029】 「比較ウィンドウ」とは、本明細書中で使用される場合、20〜60、通常約
50〜約200、より通常約100〜約150からなる群より選択される連続位
置の数のうちのいずれか1つのセグメントに対する言及を含み、その中で、配列
が、同数の連続位置の参照配列に対して、その2つの配列が最適に整列された後
に、比較され得る。比較のための配列の整列方法は、当該分野で周知である。比
較のための配列の最適な整列は、例えば、SmithおよびWaterman、
Adv.Appl.Math.2:482(1981)の局所相同性アルゴリズ
ム、NeedlemanおよびWunsch、J.Mol.Biol.48:4
43(1970)の相同性整列アルゴリズム、PearsonおよびLipma
n、Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA 85:2444(19
88)の類似性検索の方法、これらのアルゴリズムのコンピューターによる実行
(Wisconsin Genetics Software Package
、Genetics Computer Group、575 Science
Dr.Madison、WIにおける、GAP、BESTFIT、FASTA
およびTFASTA)、あるいは手作業による整列および視認によって、実行さ
れ得る。
【0030】 有用なアルゴリズムの1つの例は、PILEUPである。PILEUPは、関
連性および配列同一性パーセントを示すために、進行性の対合整列を使用して、
一群の関連配列から多重配列整列を作製する。PILEUPはまた、その整列を
作製するために使用されたクラスタリングの関連性を示す、ツリーまたは樹状図
もプロットする。PILEUPは、FengおよびDoolittle、J.M
ol.Evol.35:351〜360(1987)の進行性整列方法の単純版
を使用する。使用される方法は、HigginsおよびSharp、CABIO
S 5:151〜153(1989)により記載される方法と類似する。このプ
ログラムは、300個までの配列を整列し得、最大長は各々5,000ヌクレオ
チドまたは5,000アミノ酸である。多重整列手順は、その最も類似する2つ
の配列の対合整列で始まり、2つの整列された配列のクラスターを生じる。次い
で、このクラスターは、整列された配列のうちのその次に最も関連する配列また
はクラスターと整列される。2つの配列クラスターが、2つの個別の配列の対合
整列の単純な伸長によって、整列される。その最終整列が、一連の進行性対合整
列によって達成される。このプログラムは、特定の配列および配列比較の領域に
ついてのそれらのアミノ酸座標またはヌクレオチド座標を指定すること、および
このプログラムのパラメーターを指定することによって、実行される。例えば、
参照配列が、以下のパラメーターを使用して、配列同一性パーセント関連性を決
定するために他の試験配列に比較され得る:default gap weig
ht(3.00)、default gap length weight(0
.10)、およびweighted end gap。
【0031】 配列同一性パーセントおよび配列類似性パーセントを決定するために適切なア
ルゴリズムの別の例は、BLASTアルゴリズムであり、これは、Altsch
ulら、J.Mol.Biol.215:403〜410(1990)に記載さ
れる。BLAST分析を実施するためのソフトウェアは、National C
enter for Biotechnology Information(
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)を介して公に利
用可能である。このアルゴリズムは、高スコアリング配列対(HSP)を照会配
列中の長さWの短いワード(word)を同定することによって最初に同定する
工程を包含し、この照会配列は、データベース配列中の同じ長さのワードと整列
された場合に、いくらか正の値の閾値スコアTを一致するかまたはこのTを満た
すかのいずれかである。Tは、隣接ワードスコア閾値と呼ばれる(Altsch
ulら、前出)。これらの最初の隣接ワードヒットは、それらを含むより長いH
SPを見出す検索を開始するための種として作用する。このワードヒットは、累
積整列スコアが増加され得る限り、各配列に沿って両方向に伸長される。各方向
でのワードヒットの伸長は、以下の場合に停止する:累積整列スコアが、その最
大達成値から量Xの分下がる場合;1つ以上の負のスコアリング残基整列の蓄積
に起因して累積スコアが0以下になる場合;またはいずれかの配列の末端に到達
する場合。BLASTアルゴリズムパラメーターW、TおよびXは、その整列の
感度および速度を決定する。このBLASTプログラムは、デフォルトとして、
wordlength(W)=11、BLOSUM62 scoring ma
trix(HenikoffおよびHenikoff、Proc.Natl.A
cad.Sci.USA 89:10915(1989))alignment
s(B)=50、expectation(E)=10、M=5、N=4、およ
び両方の鎖の比較を使用する。
【0032】 BLASTアルゴリズムはまた、2つの配列間の類似性の統計学的分析を実施
する(例えば、KarlinおよびAltschul、Proc.Nat’l.
Acad.Sci.USA 90:5873〜5787(1993)を参照のこ
と)。このBLASTアルゴリズムにより提供される類似性の1つの尺度は、最
小合計確率(P(N))であり、これは、2つのヌクレオチド配列またはアミノ
酸配列間の一致が偶然生じる確率の指標を提供する。例えば、核酸は、参照核酸
に対する試験核酸の比較における最小合計確率が、約0.01未満、より好まし
くは約10-5未満、そして最も好ましくは約10-20未満である場合に、その参
照配列に類似するとみなされる。
【0033】 「保存的に改変された改変体」は、アミノ酸配列および核酸配列の両方に適用
される。特定の核酸配列に関して、保存的に改変された改変体とは、同一のアミ
ノ酸配列または本質的に同一のアミノ酸配列をコードする核酸をいうか、あるい
はその核酸がアミノ酸配列をコードしない場合は本質的に同一の配列をいう。遺
伝コードの縮重が原因で、多数の機能的に同一の核酸が、所定の任意のタンパク
質をコードする。例えば、コドンGCA、GCC、GCGおよびGCUはすべて
、アミノ酸アラニンをコードする。従って、アラニンがあるコドンにより特定さ
れるどの位置でも、そのコドンは、記載される対応するコドンのいずれかに、コ
ードされるポリペプチドを変化させることなく変化され得る。このような核酸の
バリエーションは、「サイレントなバリエーション」であり、これは、保存的に
改変されたバリエーションの1つの種類である。ポリペプチドをコードする本明
細書中のあらゆる核酸配列は、その核酸のすべての可能なサイレントなバリエー
ションもまた記載している。当業者は、核酸中の各コドン(通常はメチオニンに
ついてのみのコドンであるAUGは除く)が、機能的に同一の分子を生じるよう
に改変され得ることを認識する。従って、ポリペプチドをコードする核酸のサイ
レントなバリエーション各々が、記載される配列各々に内包されている。
【0034】 アミノ酸配列に関して、核酸配列、ペプチド配列、ポリペプチド配列またはタ
ンパク質配列における、コードされる配列中の1つのアミノ酸または低いパーセ
ンテージのアミノ酸を変更する個々の置換が、「保存的に改変された改変体」で
あり、この改変体において、その変更が、化学的に類似するアミノ酸によるアミ
ノ酸の置換を生じることを、当業者は認識する。機能的に類似のアミノ酸を提供
する保存的置換の表は、当該分野で周知である。
【0035】 以下の6つのグループ各々は、互いの保存的な置換であるアミノ酸を含む: 1)アラニン(A)、セリン(S)、スレオニン(T); 2)アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E); 3)アスパラギン(N)、グルタミン(Q); 4)アルギニン(R)、リジン(K); 5)イソロイシン(I)、ロイシン(L)、メチオニン(M)、バリン(V)
;および 6)フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)、トリプトファン(W)。 (例えば、Creighton、Proteins(1984)を参照のこと)
【0036】 2つの核酸配列またはポリペプチドが実質的に同一であるという指標は、第1
の核酸によりコードされるポリペプチドが、第2の核酸によりコードされるポリ
ペプチドに対して惹起される抗体と免疫学的に交差反応性であることである。従
って、ポリペプチドは、第2のポリペプチドに対して、例えば、その2つのペプ
チドが保存的置換によってのみ異なる場合、代表的には実質的に同一である。2
つの核酸配列が実質的に同一であるという別の指標は、その2つの分子またはそ
の成分が、下記のようなストリンジェントな条件下で互いにハイブリダイズする
ことである。
【0037】 句「選択的(または特異的)にハイブリダイズする」とは、特定のヌクレオチ
ド配列に対してのみ、その配列が複合混合物(例えば、全細胞DNAまたはRN
AあるいはライブラリーDNAまたはライブラリーRNA)中に存在する場合に
、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で分子が結合、二重鎖形成
、またはハイブリダイズすることをいう。
【0038】 句「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」とは、プロープが、代
表的には核酸の複合混合物中のその標的部分配列にハイブリダイズするが、他の
配列にはハイブリダイズしない条件をいう。ストリンジェントな条件は、配列依
存性であり、そして異なる環境では異なる。より長い配列は、より高温で特異的
にハイブリダイズする。核酸のハイブリダイゼーションに対する広範な指針は、
Tijssen、Techniques in Biochemistry a
nd Molecular Biology−−Hybridization
with Nucleic Probes「Overview of prin
ciples of hybridization and the stra
tegy of nucleic acid assays」(1993)に見
出される。一般的に、非常にストリンジェントな条件は、規定されたイオン強度
、pHで、特定の配列についての熱融解温度(Tm)よりも約5〜10℃低いよ
うに選択される。低いストリンジェンシー条件は、一般的に、そのTmより約1
5〜30℃低いように選択される。このTmは、標的に相補的なプローブのうち
の50%が、平衡状態で標的配列にハイブリダイズする(規定されたイオン強度
、pH、および核酸濃度の下での)温度である(標的配列が過剰に存在する場合
、Tmにて、プローブのうちの50%が平衡状態にある)。ストリンジェントな
条件は、pH7.0〜8.3にて、塩濃度が、約1.0Mナトリウムイオン未満
、代表的には約0.01〜1.0Mナトリウムイオン濃度(または他の塩)、そ
して温度が、短いプローブ(例えば、10〜50ヌクレオチド)については少な
くとも約30℃、そして長いプローブ(例えば、50ヌクレオチドを超える)に
ついては少なくとも約60℃である。ストリンジェントな条件はまた、ホルムア
ミドのような不安定化剤の添加によっても達成され得る。選択的ハイブリダイゼ
ーションまたは特異的ハイブリダイゼーションについて、ポジティブなシグナル
は、バックグラウンドの少なくとも2倍、好ましくはバックグラウンドのハイブ
リダイゼーションの10倍である。
【0039】 ストリンジェントな条件下で互いにハイブリダイズしない核酸は、それらの核
酸がコードするポリペプチドが実質的に同一である場合は、依然として実質的に
同一である。このようなことは、例えば、1コピーの核酸が、遺伝コードにより
許容される最大のコドンの縮重を使用して作製される場合に生じる。このような
場合、それらの核酸は、代表的には、中程度にストリンジェントなハイブリダイ
ゼーション条件下でハイブリダイズする。
【0040】 本発明において、本発明のANT核酸を含むゲノムDNAまたはcDNAは、
本明細書中に開示される核酸配列を使用して、ストリンジェントな条件下での標
準的サザンブロットにおいて同定され得る。この開示の目的のために、このよう
なハイブリダイゼーションに適切なストリンジェントな条件は、37℃にて40
%ホルムアミド、1M NaCl、1% SDSの緩衝液中でのハイブリダイゼ
ーション、そして少なくとも約50℃、通常は約55℃〜約60℃の温度にて、
0.2×SSC中での20分間にわたる少なくとも1回の洗浄、あるいは等価な
条件を含む条件である。ポジティブなハイブリダイゼーションは、少なくともバ
ックグラウンドの2倍である。当業者は、代替のハイブリダイゼーション条件お
よび洗浄条件が、類似のストリンジェンシーの条件を提供するために利用され得
ることを認識する。
【0041】 2つのポリヌクレオチドが実質的に同一であるさらなる指標は、1対のオリゴ
ヌクレオチドプライマーにより増幅されたその参照配列が、次にストリンジェン
トなハイブリダイゼーション条件下でプローブとして使用され得て、cDNAラ
イブラリーまたはゲノムライブラリーから試験配列が単離され得る場合か、ある
いは例えば、RNAゲルまたはDNAゲルのブロットハイブリダイゼーション分
析において試験配列が同定され得る場合である。
【0042】 (好ましい実施形態の説明) 本発明は、細胞増殖の制御に関し、従って植物におけるANT活性を調節する
ことによる植物中の細胞数の制御に関する。例えば、本発明は、ANT遺伝子構
築物を使用して、植物シュートの栄養器官および/または構造(例えば、葉、茎
、および塊茎)、根、花、および花器(例えば、苞葉、萼片、花弁、雄蕊、心皮
、葯)、胚珠(卵細胞および中心細胞を含む)、種子(接合子、胚、内乳、およ
び種皮を含む)、果実(成熟子房)、および実生の、細胞の数および大きさ/重
量を制御することを通して、植物のバイオマスを操作するための分子ストラテジ
ーを提供する。従って、ANT発現を調節することによって、増加したバイオマ
スまたは減少したバイオマスを有するトランスジェニック植物が産生され得る。
さらに、雄性または雌性の生殖器官において遺伝子の発現を調節することは、細
胞増殖のパターンの改変を通して不稔性に導き得る。従って、雄性または雌性の
不稔性のトランスジェニック植物が、適切な組織におけるANT遺伝子発現を増
強または阻害することによって産生され得る。なお他の実施形態において、不定
器官、不定シュート、または不定構造(例えば、体細胞胚)の形成が、本発明の
この方法を使用して制御され得る。従って、植物の無性生殖の効率(特に、所望
の形質を有する不稔性植物または雑種植物の繁殖および形質転換された組織から
のトランスジェニック植物の再生)が改善され得る。
【0043】 ANT遺伝子産物は、転写因子として機能しているらしい(Verganiら
、FEBS Letters.400:243−246(1997))ので、当
業者は、改変されたANT活性に付随する所望の表現型が、ANT調節された遺
伝子の発現または活性を調節することによって得られ得ることを認識する。AN
Tの発現または活性を増加または減少するために記載される方法のいずれかが、
この目的のために使用され得る。
【0044】 (ANT活性またはANT遺伝子発現の増加) 当該分野で周知の多数の手段のいずれかが、植物中のANT活性を増加させる
ために使用され得る。増強された発現は、例えば、無性生殖を誘導もしくは増強
するために、または所望の植物器官中で器官の大きさ/重量を増加するために有
用である。任意の器官(例えば、植物シュートの栄養器官および/または構造(
例えば、葉、茎、および塊茎)、根、花、および花器(例えば、苞葉、萼片、花
弁、雄蕊、心皮、葯)、胚珠(卵細胞および中心細胞を含む)、種子(接合子、
胚、内乳、および種皮を含む)、果実、および実生)が標的化され得る。ANT
活性を改変する有益な効果は、細胞増殖の増加の直接的な結果を必要とはしない
。例えば、増加した葉の大きさ/重量は、光合成の増加をもたらし、これは、次
には収量の増加をもたらす。同様に、根の重量/大きさの増加は、栄養の取り込
みおよび収量の増加をもたらす。茎および小花柄の厚さの増加は、破損(例えば
、穀物および果実における破損)に起因する損失を減少するために使用され得る
【0045】 ANT活性またはANT発現の増加はまた、雄性または雌性の不稔性植物を産
生するために使用され得る。雄性または雌性の不稔性は、特に、商業的に有利な
卓越した形質を有する雑種の多様性の産生において、農学および園芸学のために
重要である。雄性または雌性の不稔性は、親の植物における自己の花粉の混在を
妨害することによって、育種者が容易に雑種の多様性を作製することを可能にす
る。従って、例えば、発達している葯におけるANT発現を標的化することは、
雄性の不稔性を引き起こすが、雌性の器官を破壊せず、従って植物を雌性稔性に
する。裂開の妨害はまた、市販の切り花のために所望される。例えば、授粉は、
花の老化をもたらし、花粉粒はまた、アレルギー性であり得、そしていくつかの
植物(例えば、ユリ)において、染みを引き起こし得る。
【0046】 トランスジェニック植物におけるANT遺伝子の発現はまた、雌性不稔性を引
き起こし得る。胚珠においてANT遺伝子を構成的に発現する植物は、不稔性で
ある大きな成熟胚珠を産生する。従って、ANT機能を制御することを介する雌
性不稔性を導入することは、植物の老化を遅らせ得、そして植物の収量ならびに
穀物および園芸学的に重要な植物の品質を改善し得る。あるいは、雌性不稔性は
、ANT活性またはANT遺伝子発現を阻害する方法について以下に記載された
方法を使用して、減少したANT発現から得られ得る。
【0047】 (ANT遺伝子発現の増加) 本明細書中に記載されるように調製された単離された配列は、当業者に周知の
方法を使用して、特定のANT核酸の発現を導入するために使用されて、内因性
の遺伝子発現を増加し得る。適切な構築物の調製およびそれらを植物に導入する
ための手段は、以下に記載される。
【0048】 当業者は、本発明の遺伝子によってコードされるポリペプチドが、他のタンパ
ク質と同様に、異なる機能を行う異なるドメインを有することを理解する。従っ
て、その遺伝子配列は、そのタンパク質の所望の機能的ドメインが発現される限
りは、全長である必要はない。ANTポリペプチド(AP2ドメイン、核局在化
シグナル、および転写活性化ドメインを含む)の顕著な特徴は、上記のElli
otら、またはKlucherらにおいて議論される。
【0049】 改変されたタンパク質鎖はまた、当業者に周知であり、そして以下に詳細に記
載される種々の組換えDNA技術を利用して、容易に設計され得る。例えば、そ
の鎖は、アミノ酸置換、付加、欠失などによって、一次構造レベルで、天然に存
在する配列から変化され得る。これらの修飾は、最終的な改変タンパク質鎖を産
生するために多数の組み合わせにおいて使用され得る。
【0050】 (内因性ANT遺伝子の改変) 植物遺伝子への遺伝的変異の導入および所望の形質を有する植物の選択のため
の方法は、周知である。例えば、種子または他の植物材料は、標準的な技術に従
って、変異原性の化学物質で処理され得る。このような化学物質には以下が含ま
れるが、これらに限定されない:ジエチルサルフェート、エチレンイミン、エチ
ルメタンスルホネート、およびN−ニトロソ−N−エチルウレア。あるいは、X
線またはγ線のような線源からの電離放射線が使用され得る。
【0051】 あるいは、相同組換えが、インビボでANT遺伝子を特異的に標的化すること
によって標的化された遺伝子改変を誘導するために使用され得る(一般的には、
GrewalおよびKlar、Genetics 146:1221−1238
(1997)およびXuら、Genes Dev.10:2411−2422(
1996)を参照のこと)。相同組換えは、植物において実証されている(Pu
chtaら、Experientia 50:277−284(1994)、S
wobodaら、EMBO J.13:484−489(1994);Offr
ingaら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:7346
−7350(1993);およびKempinら、Nature 389:80
2−803(1997))。
【0052】 本発明の遺伝子に相同組換え技術を適用する際に、ANT遺伝子配列(5’上
流、3’下流、および遺伝子内領域を含む)の選択された部分における変異(例
えば、本明細書中に開示されるもの)が、インビトロで作製され、次いで、標準
的な技術を使用して所望の植物に導入される。相同組換えの効率は、使用される
ベクターに依存することが公知であるので、Mountfordら、Proc.
Natl.Acad.Sci.USA 91:4303−4307(1994)
;およびVaulontら、Transgenic Res.4:247−25
5(1995)によって記載されるようなジシストロン性遺伝子標的ベクターの
使用は、簡便に使用されて、トランスジェニック植物中の改変されたANT遺伝
子発現について選択する効率を増大させる。変異された遺伝子は、相同組換えお
よび標的化された野生型遺伝子の置換がトランスジェニック植物細胞中で起こり
、ANT活性の抑制を生じるような方法で、標的野生型遺伝子と相互作用する。
【0053】 あるいは、末端の二重ヘアピンキャップを有する二重鎖コンホメーションにお
けるRNA残基およびDNA残基の連続するストレッチからなるオリゴヌクレオ
チドが使用され得る。RNA/DNA配列は、標的ANT遺伝子の配列と整列す
るように設計され、そして所望のヌクレオチド変化を含むように設計される。染
色体外Ti−DNAプラスミドへのキメラオリゴヌクレオチドの導入は、少数の
形質転換された植物細胞においてキメラ分子によって方向付けられる効率的かつ
特異的なANT遺伝子の転換を生じる。この方法は、Cole−Strauss
ら、Science 273:1386−1389(1996)およびYoon
ら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93:2071−207
6(1996)において記載される。
【0054】 (ANT活性を増加させるための他の手段) ANT発現を増加させるための1つの方法は、「活性化変異誘発」(例えば、
Hiyashiら、Science 258:1350−1353(1992)
を参照のこと)を使用することである。この方法において、内因性ANT遺伝子
は、内因性ANT遺伝子の、上流の強力な/構成的プロモーターを含むT−DN
A配列の挿入によって、構成的に、異所的に、または過剰に発現されるように改
変され得る。以下に説明するように、ANTを過剰発現するトランスジェニック
植物の調製はまた、ANT発現を増加させるために使用され得る。内因性ANT
遺伝子の活性化変異誘発は、トランスジェニック植物中でのトランスジェニック
ANT核酸の過剰発現と同じ効果を与える。あるいは、ANT活性のエンハンサ
ーをコードする内因性遺伝子または内因性遺伝子の発現は、類似の様式で、T−
DNA配列の挿入によって発現されるように改変され得、そしてANT活性が増
加され得る。
【0055】 ANT発現を増加させる別のストラテジーは、改変されたANT導入遺伝子を
発現することによる、ANTの優性過剰活性(hyperactive)変異体
の使用であり得る。例えば、ANT活性の負の調節因子との相互作用に重要であ
る欠損ドメインを有する改変されたANTの発現を用いて、優性過剰活性ANT
タンパク質を作製し得る。あるいは、負の調節因子と相互作用するドメインのみ
を有する短縮型ANTタンパク質の発現は、負の調節因子の効果を滴定様式で阻
害(titrate)し得、それにより、内因性ANT活性を増加させ得る。過
剰活性標的遺伝子に対する優性変異体の使用は、Mizukamiら,Plan
t Cell 8:831−845(1996)に記載される。
【0056】 (ANT活性または遺伝子発現の阻害) 上記で説明したように、ANT活性は、多数の植物プロセスを、細胞増殖の調
節を通して制御する際に重要である。ANT遺伝子発現活性の阻害は、例えば、
植物の器官の大きさ/重量を減少させるため、または雌性不稔性を植物において
誘導するために用いられ得る。特に、内因性遺伝子発現を阻害する、ANT核酸
の標的化された発現(例えば、アンチセンスまたはコサプレッション(co−s
uppression))を用いて、胚珠の発達を初期段階で阻害し得、従って
雌性不稔性を誘導し得る。それゆえ、トランスジェニック植物の寿命は、延長さ
れ得る。なぜなら、受精(種子形成)は、植物または器官の老化プロセスを活性
化および加速し得るからである。
【0057】 ANT遺伝子機能の阻害はまた、栄養増殖を短縮化し、早期開花をもたらすた
めに用いられ得る。開花期を制御する方法は、所望により収穫期を最適化するた
めに、農業において極めて有用である。それゆえ、植物におけるANT遺伝子の
機能を調節することにより、開花期を制御することが可能である。例えば、稔性
植物生長の加速は、ANTアンチセンスRNAを栄養発達の間に発現させて、早
期開花を達成することによって得られ得る。次いで、ANT導入遺伝子の発現は
、生殖発生の間、遮断されて、稔性植物を獲得し得る。
【0058】 (ANT遺伝子発現の阻害) 本明細書中に開示される核酸配列を用いて、ANTまたは関連の遺伝子の発現
を植物中で阻害するための多数の方法において有用な核酸を設計し得る。例えば
、アンチセンス技術は、便利に用いられ得る。これを達成するために、所望の遺
伝子由来の核酸セグメントをクローニングし、そしてアンチセンス鎖のRNAが
転写されるように、プロモーターに作動可能に連結する。次いで、この構築物が
植物中に形質転換され、そしてこのアンチセンス鎖のRNAが生成される。植物
細胞では、アンチセンス抑制は、以下を含む全てのレベルの遺伝子調節にて作用
し得ることが示唆されている:(RNA翻訳の抑制(Bourque,Plan
t Sci.(Limerick) 105:125−149(1995);P
antopoulos,Progress in Nucleic Acid
Research and Molecular Biology,第48巻,
Cohn,W.E.およびK.Moldave(編)Academic Pre
ss,Inc.:San Diego,California,USA;Lon
don,England,UK.181−238頁;Heiserら,Plan
t Sci.(Shannon)127:61−69(1997)を参照のこと
)および目的のタンパク質をコードするmRNAの蓄積を防止すること(Bau
lcombe,Plant Mol.Bio.32:79−88(1996);
PrinsおよびGoldbach,Arch.Viral 141:2259
−2276(1996);Metzlaffら,Cell 88:845−85
4(1997),Sheehyら,Proc.Nat.Acad.Sci.US
A,85:8805−8809(1988)およびHiattら,米国特許第4
,801,340号を参照のこと)。
【0059】 導入されるべき核酸セグメントは一般に、抑制されるべき内因性ANT遺伝子
の少なくとも一部に実質的に同一である。しかし、この配列は、発現を阻害する
ためには完全に同一である必要はない。本発明のベクターは、阻害効果が、標的
遺伝子に対して同一性または実質的同一性を示す遺伝子ファミリー内の他の遺伝
子に適用されるように設計され得る。
【0060】 アンチセンス抑制については、導入された配列はまた、一次転写産物または完
全にプロセシングされたmRNAのいずれと比較しても、完全な長さである必要
はない。一般に、より高い同一性を用いて、より短い配列の使用を補い得る。さ
らに、導入された配列は、同じイントロンおよびエキソンのパターンを有する必
要はなく、非コードセグメントの同一性は、同等に有効であり得る。通常、約3
0ヌクレオチドまたは約40ヌクレオチドと、ほぼ全長のヌクレオチドとの間の
配列が用いられるべきであるが、少なくとも約100ヌクレオチドの配列が好ま
しく、少なくとも約200ヌクレオチドの配列がより好ましく、そして約500
ヌクレオチド〜約3500ヌクレオチドの配列が特に好ましい。
【0061】 多数の遺伝子領域が、ANT遺伝子発現を抑制するために標的化され得る。標
的としては、例えば、コード領域、イントロン、エキソン/イントロン連結部由
来の配列、5’非翻訳領域または3’非翻訳領域などが挙げられ得る。
【0062】 別の周知の抑制方法は、センスコサプレッションである。センス配向に配置さ
れた核酸の導入は、標的遺伝子の転写をブロックする有効な手段であることが近
年示された。内因性遺伝子の発現を調節するためのこの方法の例(Assaad
ら,Plant Mol.Bio.22:1067−1085(1993);F
lavell Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:349
0−3496(1994);Stamら,Annals Bot.79:3−1
2(1997);Napoliら,The Plant Cell 2:279
−289(1990);ならびに米国特許第5,034,323号、同第5,2
31,020号および同第5,283,184号を参照のこと)。
【0063】 導入された配列が、コード配列自体は含まないが、内因性配列の一次転写物中
に存在する配列に相同なイントロン配列または非翻訳配列のみを含む場合、抑制
効果が生じ得る。導入された配列は一般に、抑制されることが意図される内因性
配列に対して実質的に同一である。この最少の同一性は代表的に、約65%より
も高いが、より高い同一性は、内因性配列の発現のより有効な抑制を発揮し得る
。約80%を超える実質的に高い同一性が好ましいが、約95%〜完全な同一性
が最も好ましい。アンチセンス調節についてと同様に、この効果は、同一性また
は実質的同一性を示す類似の遺伝子ファミリー内の任意の他のタンパク質に適用
させるべきである。
【0064】 コサプレッションについて、完全未満の同一性を必要とする、導入された配列
はまた、一次転写産物または完全にプロセシングされたmRNAのいずれかと比
較して、全長である必要はない。これは、過剰発現物(overexpress
er)であるいくつかの植物の同時生成を回避するために好適であり得る。全長
よりも短い配列における、より高い同一性は、より長い、同一性がより低い配列
を補う。さらに、導入された配列は、同じイントロンパターンまたはエキソンパ
ターンを有する必要はなく、そして非コードセグメントの同一性は、等しく有効
である。通常、アンチセンス調節について上記で示された大きさの範囲の配列が
用いられる。さらに、アンチセンス調節について示された同じ遺伝子領域が、コ
サプレッション技術を用いて標的化され得る。
【0065】 オリゴヌクレオチドに基づく三重らせん形成もまた、ANT遺伝子発現を破壊
するために用いられ得る。三重鎖DNAは、DNAの転写および複製を阻害し得
、部位特異的変異を作製し得、DNAを切断し得、そして相同組換えを誘導し得
る(例えば、HavreおよびGlazer,J.Virology 67:7
324−7331(1993);Scanlonら,FASEB J 9:12
88−1296(1995);Giovannangeliら,Biochem
istry 35:10539−10548(1996);ChanおよびGl
azer,J.Mol.Medicine(Berlin)75:267−28
2(1997)を参照のこと)。三重らせんDNAを用いて、アンチセンス調節
について同定された同じ配列を標的化し得る。
【0066】 触媒RNA分子すなわちリボザイムはまた、ANT遺伝子の発現を阻害するた
めに用いられ得る。実質的に任意の標的RNAと特異的に対合し、そして特定の
位置でホスホジエステル骨格を切断し、それにより、標的RNAを機能的に不活
化する、リボザイムを設計することが可能である。この切断を実施する際に、こ
のリボザイムは、それ自体改変されず、従って、他の分子を再利用および切断し
得、このリボザイムを真の酵素とする。アンチセンスRNA内にリボザイム配列
を含むことは、アンチセンスRNAにRNA切断活性を付与し、それにより、構
築物の活性を増加させる。従って、リボザイムを用いて、アンチセンス調節につ
いて同定した同じ配列を標的化し得る。
【0067】 多数のクラスのリボザイムが同定された。1つのクラスのリボザイムは、植物
中で自己切断および複製し得る、多数の小さな環状RNAに由来する。このRN
Aは、単独で(ウイロイドRNA)またはヘルパーウイルス(サテライトRNA
)を伴ってのいずれかで複製する。例としては、アボカドサンブロッチ(avo
cado sunblotch)ウイロイド由来のRNA、ならびにタバコ輪紋
ウイルス、ルツェルン一過性条斑(lucerne transient st
reak)ウイルス、ベルベットタバコ斑紋(velvet tobacco
mottle)ウイルス、ナスノディフォルム斑紋(solanum nodi
florum mottle)ウイルスおよびサブタレニアン・クローバー斑紋
(subterranean clover mottle)ウイルス由来のサ
テライトRNAが挙げられる。標的RNA特異的リボザイムの設計および使用は
、ZhaoおよびPick,Nature 365:448−451(1993
);EasthamおよびAhlering,J.Urology 156:1
186−1188(1996);SokolおよびMurray,Transg
enic Res.5:363−371(1996);Sunら,Mol.Bi
otechnology 7:241−251(1997);ならびにHase
loffら,Nature,334:585−591(1988)に記載される
【0068】 (内因性ANT遺伝子の改変) 上記の遺伝的変異を導入するための方法を用いて、ANT発現が減少した植物
について選択もまたし得る。
【0069】 (ANT活性を阻害するための他の手段) ANT活性は、ANT細胞特異的遺伝子発現に必要とされるタンパク質を除去
することによって調節され得る。従って、調節タンパク質および/またはANT
遺伝子発現を制御する配列の発現は、本明細書に記載される方法を用いて調節さ
れ得る。
【0070】 別のストラテジーは、ANTタンパク質がそれ自体または他のタンパク質と相
互作用する能力を阻害することである。これは、例えば、ANTに特異的な抗体
を用いて達成され得る。この方法では、ANT特異的抗体の細胞特異的発現を用
いて、抗体:抗原認識を通して機能的ドメインを不活化する(Huppら,Ce
ll 83:237−245(1995)を参照のこと)。ANT相互作用タン
パク質の活性の妨害は、類似の様式で適用され得る。あるいは、ANTのドミナ
ントネガティブ変異体を、短縮型ANTタンパク質をコードする導入遺伝子を発
現させることによって調製し得る。トランスジェニック植物中の標的遺伝子を不
活化するためのドミナントネガティブ変異体の使用は、Mizukamiら,P
lant Cell 8:831−845(1996)に記載される。
【0071】 (ANT核酸の単離) 一般に、以下の組換えDNA技術における命名法および実験手順は、周知のも
のであり、そして当該分野で一般に用いられる。標準技術は、クローニング、D
NAおよびRNAの単離、増幅および精製に用いられる。一般に、DNAリガー
ゼ、DNAポリメラーゼ、制限エンドヌクレアーゼなどを含む酵素反応は、製造
業者の仕様書に従って行われる。これらの技術および種々の他の技術は一般に、
Sambrookら,Molecular Cloning−A Labora
tory Manual,Cold Spring Harbor Labor
atory,Cold Spring Harbor,New York(19
89)またはCurrent Protocols in Molecular
Biology 第1巻〜第3巻,John Wiley & Sons,I
nc.(1994−1998)に従って行われる。
【0072】 ANT核酸の単離は、多数の技術によって達成され得る。例えば、本明細書に
開示される配列に基づくオリゴヌクレオチドプローブを用いて、cDNAライブ
ラリーまたはゲノムDNAライブラリーにおける所望の遺伝子を同定し得る。ゲ
ノムライブラリーを構築するために、ゲノムDNAの大きなセグメントを、例え
ば、制限エンドヌクレアーゼを用いるランダム断片化によって作製し、そしてベ
クターDNAと連結してコンカテマーを形成し、このコンカテマーを適切なベク
ター中にパッケージングし得る。cDNAライブラリーを調製するために、mR
NAを所望の器官(例えば、花)から単離し、そしてANT遺伝子転写物を含む
cDNAライブラリーをこのmRNAから調製する。あるいは、cDNAは、A
NT遺伝子またはホモログが発現される他の組織から抽出されたmRNAから調
製され得る。
【0073】 次いで、cDNAライブラリーまたはゲノムライブラリーは、本明細書に開示
されるクローニングされたANT遺伝子の配列に基づくプローブを用いてスクリ
ーニングされ得る。プローブを用いて、ゲノムDNA配列またはcDNA配列と
ハイブリダイズさせて、同じ植物種または異なる植物種において相同遺伝子を単
離し得る。あるいは、ANTポリペプチドに対して惹起した抗体を用いて、mR
NA発現ライブラリーをスクリーニングし得る。
【0074】 あるいは、目的の核酸は、増幅技術を用いて核酸サンプルから増幅され得る。
例えば、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)技術を用いて、ANT遺伝子の配列を
、ゲノムDNA、cDNA、ゲノムライブラリーまたはcDNAライブラリーか
ら直接増幅し得る。PCRおよび他のインビトロ増幅方法もまた、例えば、発現
されるべきタンパク質をコードする核酸配列をクローニングするため、サンプル
中の所望のmRNAの存在を検出するためのプローブとして用いる核酸を作製す
るため、核酸配列決定または他の目的のために有用であり得る。PCRの一般的
な概説については、PCR Protocols:A Guide to Me
thods and Applications.(Innis,M,Gelf
and,D.,Sninsky,J.およびWhite,T.編),Acade
mic Press,San Diego(1990)を参照のこと。ANT配
列を植物組織から同定するために適切なプライマーおよびプローブは、本明細書
に提供される配列(例えば、配列番号4)とKlucherら,およびElli
otら,前出に提供される配列との比較から作製される。
【0075】 ポリヌクレオチドはまた、技術文献に記載されるような周知の技術によって合
成され得る。例えば、Carruthersら,Cold Spring Ha
rbor Symp.Quant.Biol.47:411−418(1982
)およびAdamsら,J.Am.Chem.Soc.105:661(198
3)を参照のこと。次いで、二本鎖DNAフラグメントは、相補鎖を合成し、そ
してこれらの鎖を適切な条件下で一緒にアニーリングすること、または適切なプ
ライマー配列とともにDNAポリメラーゼを用いて相補鎖を付加することのいず
れかによって、入手され得る。最も5’末端および最も3’末端では、Arab
idopsis ANTヌクレオチド配列は、Brassica ANTヌクレ
オチド配列に非常に類似するが他のArabidopsis AP2ドメイン含
有遺伝子には類似しないので、配列番号6、配列番号7または配列番号8に示す
ヌクレオチド配列を有するプライマーを用いて、RT−PCRによって、異なる
種におけるANTオーソログをスクリーニング/単離し得る。
【0076】 (組換えベクターの調製) 単離された配列を上記の技術において用いるために、植物細胞の形質転換に適
切な組換えDNAベクターが調製される。広範な種々の高等植物種を形質転換す
るための技術は周知であり、そして技術文献および科学文献に記載されている。
例えば、Weisingら,Ann.Rev.Genet.22:421−47
7(1988)を参照のこと。所望のポリペプチドをコードするDNA配列(例
えば、全長タンパク質をコードするcDNA配列)は好ましくは、形質転換され
た植物の意図される組織におけるこの遺伝子からの配列の転写を指向する、転写
開始調節配列および翻訳開始調節配列と合わされる。
【0077】 例えば、過剰発現については、再生植物の全ての組織におけるこの遺伝子の発
現を指向する、植物プロモーターフラグメントが用いられ得る。このようなプロ
モーターは、本明細書中で「構成的」プロモーターと呼ばれ、そして大部分の環
境条件下および発達または細胞分化の状態の下で活性である。構成的プロモータ
ーの例としては、カリフラワーモザイクウイルス(CaimV)35S転写開始
領域、Agrobacterium tumafaciensのT−DNA由来
の1’プロモーターまたは2’プロモーター、および当業者に公知の種々の植物
遺伝子由来の他の転写開始領域が挙げられる。このような遺伝子としては、例え
ば、以下が挙げられる:Arabidopsis由来のACT11(Huang
ら,Plant Mol.Biol.33:125−139(1996))、A
rabidopsis由来のCat3(GenBank番号U43147,Zh
ongら,Mol.Gen.Genet.251:196−203(1996)
)、Brassica napus由来のステアロイル−アシルキャリアタンパ
ク質デサチュラーゼをコードする遺伝子(Genbank番号X74782,S
olocombeら,Plant Physiol.104:1167−117
6(1994))、トウモロコシ由来のGPc1(GenBank番号X155
96,Martinezら,J.MoL Biol 208:551−565(
1989))、およびトウモロコシ由来のGpc2(GenBank番号U45
855,Manjunathら,Plant Afol.Biol.33:97
−112(1997))。
【0078】 あるいは、植物プロモーターは、特定の組織、器官または細胞型におけるAN
T核酸の発現を指向し得る(すなわち、組織特異的プロモーター)か、またはさ
もなければ、より正確な環境制御または発達制御下にあり得る(すなわち、誘導
性プロモーター)。誘導性プロモーターによる転写をもたらし得る環境条件の例
としては、嫌気条件、温度上昇、光の存在または化学物質/ホルモンの噴霧が挙
げられる。当業者は、組織特異的プロモーターが、標的組織以外の組織において
、作動可能に連結された配列の発現を駆動し得ることを認識する。従って、本明
細書中で使用される場合、組織特異的プロモーターは、標的の組織または細胞型
において発現を優先的に駆動するが、他の組織においてもいくらかの発現をもた
らし得る、プロモーターである。
【0079】 多数の組織特異的プロモーターがまた、本発明において用いられ得る。例えば
、花、胚珠または葯(特に、タペータム)において核酸の発現を指向するプロモ
ーターは、不稔性が所望される方法において有用である。胚珠における発現を指
向するプロモーターの例は、Reiserら,Cell 83:735−742
(1995)(GenBank番号U39944)に記載されるBEL1遺伝子
由来のプロモーターである。タペータム特異的プロモーターの例としては、タバ
コ由来のTA29(Marianiら,Nature,347:737−41,
(1990))、ならびにBrassica由来のA6およびA9(Paulら
,Plant Mol.Biol.,19:611−22,(1992),Hi
rdら,Plant Journal 4:1023−1033(1993))
が挙げられる。Twellら(Mol.Gen.Genet.,217:240
−45,(1991))によって単離されたプロモーターのような葯特異的プロ
モーターもまた、用いられ得る。
【0080】 雄性不稔性を導入するために、例えば、第2および第3の花器(花弁および雄
蕊)特異的AP3プロモーター(Dayら,Development 121:
2887,1995)が用いられ得る。心皮特異的AGL1(Flanagan
およびMa,Plant J.10:343,1993)またはAGL5(Sa
vidgeら,Plant Cell 7:721,1995)プロモーターは
、雌性不稔性のみを誘導するために適用され得る。花被器官の増加をなおも有す
る、不稔性植物は、ANT遺伝子をAGプロモーター(Sieburthおよび
Meyerowitz,Plant Cell 9:355,1997)を通し
て構成的に発現することによって入手され得る。AGプロモーターは、生殖器官
原基ならびに発達中の雄性器官および雌性器官においてのみ活性である。
【0081】 花原基において花発達の初期および発達中の花被器官に発現されるAP1プロ
モーター(Gustafson−Brownら,Cell 76:131,19
94)を用いて、花被器官が広がった、稔性の花が生成され得る。空中の栄養器
官の生物量を増加させるために、光合成器官特異的プロモーター(例えば、RB
CSプロモーター(Khoudiら,Gene 197:343,1997))
が用いられ得る。根の生物量は、根特異的ANR1プロモーター(Zhangお
よびForde,Science,279:407,1998)の制御下で構成
的なANT発現によって増加し得る。種子の大きさ/重量(農業的に重要な形質
)を増加させるために、種子特異的プロモーター(例えば、LECプロモーター
(Lotanら,Cell 93:1195(1998))、胚形成後期に豊富
なプロモーター(Westら,Plant Cell 6:173(1994)
)、β−コングルチニンα−サブユニットプロモーター(Westら)、レクチ
ンプロモーター(Goldbergら,Science 266:605(19
94))またはKunitzトリプシンインヒビター3プロモーター(Gold
bergら))が用いられ得る。任意の強力な、構成的プロモーター(CaMV
35Sプロモーター)は、総植物生物量を増加させるために用いられ得る。
【0082】 適切なポリペプチド発現が所望される場合、コード領域の3’末端のポリアデ
ニル化領域が含まれるべきである。ポリアデニル化領域は、天然の遺伝子、種々
の他の植物遺伝子またはT−DNAに由来し得る。
【0083】 本発明の遺伝子由来の配列(例えば、プロモーターまたはコード領域)を含む
ベクターは代表的に、選択可能な表現型を植物細胞に付与するマーカー遺伝子を
含む。例えば、このマーカーは、殺生物剤(biocide)耐性、特に抗生物
質耐性(例えば、カナマイシン、G418、ブレオマイシン、ハイグロマイシン
に対する耐性)または除草剤耐性(例えば、クロロスルホンまたはBastaに
対する耐性)をコードし得る。
【0084】 本発明はまた、ANT遺伝子(配列番号3)由来のプロモーター配列を提供し
、これらは、所望の組織におけるANTコード配列または異種配列の発現を指向
するために用いられ得る。ANTは、植物全体の分裂組織細胞(meriste
matic cell)において発現される。それゆえ、本発明のANTプロモ
ーター配列は、側根、葉原基、発達中の葉、花原基、花器原基、発達中の花器、
胚珠原基、発達中の胚珠、発達中の胚および維管束系の分裂組織細胞に発現を標
的化するために有用である。発現が未成熟器官内のこれらの細胞に標的化され得
る遺伝子としては、若い、感受性器官における病原体および昆虫に対する耐性を
増加させるための以下が挙げられる:病害耐性遺伝子(例えば、Arabido
psis NPR1遺伝子(Caoら,Cell 88:57,1997))な
らびにジャガイモの線虫耐性遺伝子座Gro1およびPhytophthora
infestans耐性遺伝子座R7(Leisterら,Nature G
enetics 14:421,1996)。
【0085】 ANTプロモーターは発生中の胚において後期に発現されるので、貯蔵油、タ
ンパク質または澱粉の生合成についての調節因子または重要な酵素をコードする
いくつかの遺伝子(例えば、BiP(Hatanoら,Plant and C
ell Physiology 38:344,1997))は、ANTプロモ
ーターの制御によって発現され得る。
【0086】 (トランスジェニック植物の生成) 本発明のDNA構築物は、所望の植物宿主のゲノム内に、種々の従来技術によ
って導入され得る。例えば、DNA構築物は、植物細胞のゲノムDNA内に植物
細胞プロトプラストのエレクトロポレーションおよびマイクロインジェクション
のような技術を用いて直接導入され得るか、またはDNA構築物は、バリスティ
ック(ballistic)法(例えば、DNA粒子ボンバードメント)を用い
て植物組織へと直接導入され得る。
【0087】 マイクロインジェクション技術は当該分野で公知であり、そして科学文献およ
び特許文献に充分に記載されている。ポリエチレングリコール沈殿を用いたDN
A構築物の導入は、Paszkowskiら,Embo J.3:2717−2
722(1984)に記載される。エレクトロポレーション技術は、Fromm
ら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:5824(198
5)に記載される。バリスティック形質転換技術は、Kleinら,Natur
e 327:70−73(1987)に記載される。
【0088】 あるいは、DNA構築物は、適切なT−DNA隣接領域と組み合わせられ得、
そして従来のAgrobacterium tumefaciens宿主ベクタ
ー内に導入され得る。Agrobacterium tumefaciens宿
主のビルレンス機能は、細胞がこの細菌に感染される場合に、構築物および隣接
マーカーの植物細胞DNAへの挿入を指向する。Agrobacterium
tumefaciens媒介形質転換技術(安全化(disarming)およ
びバイナリーベクターの使用を含む)は、科学文献に十分に記載される。例えば
、Horschら、Science 233:496−498(1984)、お
よびFraleyら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 80:
4803(1983)およびGene Transfer to Plants
,Potrykus編(Springer−Verlag,Berlin 19
95)を参照のこと。
【0089】 任意の上記形質転換技術によって誘導される形質転換された植物細胞を培養し
、形質転換された遺伝子型および従って所望の表現型(例えば、種子重量の増加
)を有する植物全体を再生し得る。このような再生技術は、組織培養増殖培地に
おける特定の植物ホルモンの操作に依存し、この操作は、代表的に、所望のヌク
レオチド配列と共に導入された殺生物剤マーカーおよび/または除草剤マーカー
に依存する。培養プロトプラストからの植物再生は、Evansら、Proto
plasts Isolation and Culture,Handboo
k of Plant Cell Culture,124〜176頁,Mac
Millilan Publishing Company,New York
,1983;およびBinding,Regeneration of Pla
nts,Plant Protoplasts,21〜73頁,CRC Pre
ss,Boca Raton,1985に記載される。再生はまた、植物カルス
、外植片、器官、またはそれらの部分からも得られ得る。このような再生技術は
、Kleeら、Ann.Rev.of Plant Phys.38:467−
486(1987)に一般的に記載される。
【0090】 本発明の核酸を使用して、実質的に任意の植物に所望の特性を付与し得る。従
って、本発明は、以下の属からの種を含む、広範な植物に対する用途を有する:
Anacardium、Arachis、Asparagus、Atropa、
Avena、Brassica、Chlamydomonas、Chlorel
la、Citrus、Citrullus、Capsicum、Cartham
us、Cocos、Coffea、Cucumis、Cucurbita、Cy
rtomium、Daucus、Elaeis、Fragaria、Glyci
ne、Gossypium、Helianthus、Heterocallis
、Hordeum、Hyoscyamus、Lactuca、Laminari
a、Linum、Lolium、Lupinus、Lycopersicon、
Macrocystis、Malus、Manihot、Majorana、M
edicago、Nereocystis、Nicotiana、Olea、O
ryza、Osmunda、Panieum、Pannesetum、Pers
ea、Phasolus、Pistachia、Pisum、Pyrus、Po
lypodium、Prunus、Pteridium、Raphanus、R
icinus、Secale、Senecio、Sinapis、Solanu
m、Sorghum、Theobromus、Trigonella、Trit
icum、Vicia、Vitis、VignaおよびZea。
【0091】 当業者は、発現カセットがトランスジェニック植物に安定に組み込まれ、そし
て作動可能であることが確認された後に、有性交雑によって他の植物に導入され
得ることを認識する。任意の多くの標準的な育種技術が、交雑される種に依存し
て使用され得る。
【0092】 公知の手段を使用して、当業者は、トランスジェニック植物中のANT mR
NAまたはANTタンパク質の増加または減少を検出することによって、本発明
の植物についてスクリーニングし得る。mRNAまたはタンパク質を検出および
定量するための方法は、当該分野で周知である。本発明の植物はまた、所望の表
現型を検出することによって同定され得る。例えば、器官または植物の生物量の
増加は、周知技術に従って検出され得る。雄性または雌性の不稔性は、生存可能
な花粉および/または種子を発育させ能力について試験することによって同定さ
れ得る。
【0093】 以下の実施例は、限定目的でなく、例示目的で提供される。
【0094】 (実施例1) 本実施例は、ANT発現の増加が、Arabidopsisにおける、細胞数
ならびに根、葉、花器、胚珠および種子の大きさ/重量を増加することを示す。
【0095】 ANTコードヌクレオチド配列の開始コドンの直前にBamHI部位を有する
ANT cDNAを、合成オリゴヌクレオチドプライマーを使用して、PCRに
よって作製した。このANT核酸(配列番号1の268位のCから2148位の
Tまで(1881ヌクレオチド))を、構成的35Sプロモーター下の、プラス
ミドベクターpMON530(Rogersら、Meth.Enzymol.1
53:253,1987)のBglII部位で連結した。そしてCaMV35S
プロモーターに対してセンス方向にあるANT cDNA挿入物(35S::A
NT)を有する組換えプラスミドDNAを、選択した。Agrobacteri
um細胞を、この組換えプラスミドDNAを用いて形質転換し、そしてArab
idopsis植物(Col−0生態型)での真空浸潤によるAgrobact
erium媒介植物形質転換のために使用した。T1種子を、真空浸潤後約3週
間の形質転換した植物から収集し、そしてカナマイシンを含むMSプレート上に
プレートして、T1トランスジェニック実生についてスクリーニングした。
【0096】 T1種子は、非常に大きい種子を含み、これらは、これらが規定の大きさのメ
ッシュを通過しないので区別された。これらの種子の大部分は、この35S::
ANT導入遺伝子を有し、カナマイシン耐性であった。この表現型は、ベクター
のみのコントロールでは観察されなかった。
【0097】 複数のT1実生は、ベクターのみのコントロールトランスジェニック実生より
大きかった。これらが発生するにつれて、T1植物は、高度に分枝した根系を生
成し、この根系は、ベクターのみのコントロールよりも大きい重量を有する。さ
らに、この植物は、ベクターのみのコントロールと比較した場合に、拡大した葉
、花器および胚珠を有した。例えば、T1系統の花および葉の平均生物量は、ベ
クターのみのコントロールの花および葉の平均生物量の、それぞれ、約3倍およ
び2.5倍であった。DIC顕微鏡法および走査電子顕微鏡法は、T1植物のこ
の拡大した器官の表現型が、器官の細胞数の増加に起因することを示した。さら
に、T1植物は、不稔性であった。予備実験は、葯が花粉(これは、形態学的に
正常である)を飛散させず、そして胚珠が、雌性配偶体を圧縮/置換(disp
lace)する珠心細胞の数の増加によって、異常に大きいかったことを示唆す
る。
【0098】 不稔性が、ホモ接合性トランスジェニック系統を生成および増殖することを困
難にするために、本発明者らは、Aoyama,およびChua Plant
J.11:605−612(1997)ならびにMcNellisら、Plan
t J.14:247−257(1998)に記載のような化学誘導系を使用し
て、異所性のANT転写を調節した。この系は、キメラ転写因子遺伝子(35S
::GVG)を利用し、これは、35Sプロモーター、酵母転写因子GAL4の
DNA結合ドメイン、トランス活性化ドメイン、およびグルココルチコイドレセ
プター(GR)のレセプタードメインからなる。ANT遺伝子を、GVG転写因
子の結合部位を含むプロモーターから下流に挿入した(UAS::ANT)。こ
の35S::GVG/UAS::ANT構築物を、野生型Arabidopsi
sに導入し、そして稔性トランスジェニック系統を、上記のように一般的に得た
【0099】 トランスジェニックT2植物を、MS寒天プレート上で発芽させ、そして化学
誘導物質デキサメタゾン(DEX)を含むか、または含まないプレートに移した
。このDEXは、GVG転写因子を結合および活性化する合成グルココルチコイ
ドホルモンである。DEXでの処理後に拡大葉の表現型を提示する、複数のトラ
ンスジェニック系統を得た。器官の大きさ/重量の増加は、細胞数の増加に起因
する。DEXは、35S::GVG/UASベクターのみを含むコントロールト
ランスジェニック植物に対して効果を有さなかった。まとめて考えると、これら
の結果は、異所性のANT発現が、細胞数を増加することによって器官の大きさ
/重量を増加することを示唆する。
【0100】 (実施例2) 本実施例は、Arabidopsisに観察された表現型と実質的に同じ表現
型変化が、タバコにおいて観察されたことを示す。
【0101】 構成的35Sプロモーターの制御下でANT cDNAを発現するタバコトラ
ンスジェニック植物を生成するために、上記の組換えプラスミドDNAを、Ag
robacterium媒介タバコカルス形質転換のために使用した。タバコカ
ルスを、カルス誘導プレート上に配置した滅菌したタバコの葉(SR1変種)か
ら誘導し、次いで、上記組換えDNAを保有するAgrobacterium細
胞と共に、3日間共存培養した。細菌細胞を洗い流した後、葉のカルスを、カナ
マイシンおよびカルベニシリンを含有する、シュート誘導性寒天プレート上に配
置し、形質転換されたシュートを生成した。これらのR0シュートを、根誘導性
寒天プレートに移し、次いで、根の再生後に土壌に移植した。[一文削除] ANT遺伝子が、CaMV 35Sプロモーターの制御下で構成的に発現され
るR0植物は、より大きな葉(ベクターのみのコントロールトランスジェニック
植物の葉の約1.5倍)、比較的大きな花(ベクターのみのコントロールトラン
スジェニック植物より約1.7倍大きい重量)、およびArabidopsis
で観察されたような不稔性を生じた。この不稔性は、主に、Arabidops
isトランスジェニック葯に見られたような、葯の裂開の不全によって引き起こ
される。いくつかのR0植物は、それらの閉じられた葯中に機能的な花粉粒を生
成し、そして葯から切開された花粉粒を手を使って自家受粉させることによって
種子(R1種子)を生成した。これらのR1種子は、ベクターのみのコントロール
植物由来の種子の重量の約1.5倍の重量を有した。
【0102】 (実施例3) 本実施例は、ArabidopsisおよびタバコにおけるANT導入遺伝子
による内因性遺伝子活性をコサプレッションすることによる、植物器官の大きさ
/重量の減少および開花の改変を記載する。
【0103】 上記のArabidopsis T1系統は、器官の大きさ/重量および器官
細胞数の減少を示す系統を含んだ。これらの植物は、機能損失ant変異体であ
るので、完全または部分的に雌性不稔性であった。これらの系統において、AN
T mRNAの発現は、大きく減少され、これは、内因性ANT遺伝子のコサプ
レッション、およびANT cDNAのコサプレッションが、これらの系統にお
いて生じたことを示唆する。部分的に不稔性のT1系統から、T1親植物における
表現型と同じコサプレッションされた表現型について分離した、トランスジェニ
ックT2植物が得られた。器官の大きさ/重量の減少はまた、コサプレッション
されたR0タバコ植物においても観察された。
【0104】 複数のコサプレッションされた系統はまた、早期の開花を示した。これらの系
統の植物は、ロゼット葉の数の減少および抽だい前の日数の減少を示す。早期開
花の表現型は、機能損失ant変異体において観察されなかったので、ANT導
入遺伝子によるコサプレッションはまた、それ自体でまたはANTと共に開花時
間を調節する、他の未知のANT関連遺伝子に影響し得る。類似の結果がまた、
コサプレッションされたトランスジェニックタバコ植物においても観察された。
【0105】 (実施例4) 本実施例は、ANT機能の損失が、細胞数を減少することによって成熟器官の
大きさを減少することを示す。
【0106】 ANT mRNAは、葉に蓄積したので(Elliott,R.C.ら(19
96)Plant Cell 8:155−168)、本発明者らは、栄養性シ
ュート発生に対する機能損失ant変異の影響を試験した。ant−1植物とコ
ントロールの野生型植物との間で、葉原基の開始のタイミングまたは葉原基の数
に差異はなかったが(示さず)、成熟ant−1の葉の幅および長さは、対応す
る野生型の葉の幅および長さと比較して、両方とも減少した。ant変異体花器
は、大きさの減少が見出されているので(Klucher,K.M.ら(199
6)Plant Cell 8:137−153;Elliott,R.C.ら
(1996)Plant Cell 8:155−168)、これらの観察は、
ANT機能の損失が、シュート発生を通して器官のを減少することを実証する。
【0107】 器官の大きさにおける変化は、細胞の大きさまたは細胞数、あるいは両方にお
ける改変を反映し得る。なぜant−1器官がより小さいのかを理解するために
、本発明者らは、成熟ant−1器官における細胞の大きさおよび細胞数を試験
し、そしてこれらを野生型コントロールの細胞の大きさおよび細胞数と比較した
。花弁表皮の遠位部分を最初に観察した。なぜなら、それは、二倍体であり、か
つ大きさおよび形状が均一である細胞を有するからである。本発明者らは、an
t−1器官が、野生型よりも、単位面積あたりおよび器官あたりの細胞数がより
少ないが、しかし、ant−1細胞は、正常よりもはるかに大きいことを見出し
た。実質的に同じ表現型が、全てのant−1の花器および葉の表皮ならびに皮
下細胞層において観察された。従って、ant−1器官の大きさの全身的減少は
、細胞数の減少に関連するが、細胞の大きさの減少には関連しない。
【0108】 ant変異体は、花器の数を減少するので、ANTは、器官原基のパターン形
成および器官生長に関連し得ることが示唆された。この可能性を評価するために
、本発明者らは、SEM下で発生中の野生型花芽およびant−1花芽における
萼片原基のパターンを観察した。花段階(floral stage)4(Sm
yth,D.R.ら(1990)Plant Cell 2:755−767)
の終わりまで、4つの全ての萼片原基は、発生中の野生型花芽の周辺で開始され
た。対応する段階でのant−1花芽において、開始された器官原基は、ant
−1花芽においては通常に配置されたが、花器の数は減少した(示さず)。従っ
て、ANTは、発生中の花芽における花器原基の位置を制御する役割をほとんど
有さないようである。
【0109】 (実施例5) 本実施例は、Brassica napus(カノーラ)由来のANTオーソ
ログ(ortholog)の単離を示す。
【0110】 Brassica cDNAの核酸配列およびコードされるタンパク質は、そ
れぞれ、配列番号4および配列番号5に示される。
【0111】 この核酸を調製するために、総RNAを、Colasantiら(Cell.
93:593−603(1998))に記載されるようにTRIZOLを使用し
て、Brassica napus(カノーラ)実生の若いシュート頂端から単
離した。cDNAを逆転写によって作製し、そして高忠実度の耐熱性DNAポリ
メラーゼPFUおよびオリゴヌクレオチドプライマーを使用するPCRによって
増幅させた。これらのプライマーは、それぞれ、Arabidopsis AN
Tヌクレオチド配列の開始コドン、および終止コドンの下流の逆平行ヌクレオチ
ド配列を有した。PCR産物をE.coliベクター内にサブクローニングし、
そして内部ANTヌクレオチド配列を有する異なるオリゴヌクレオチドプライマ
ーのセットを使用するPCRによってスクリーニングした。選択された組換えプ
ラスミドクローンの挿入されたBrassica DNAのヌクレオチド配列を
決定して、そして確認のためにArabidopsis ANTヌクレオチド配
列と比較した。Brassica ANT(BANT)遺伝子は、それぞれ、A
rabidopsis ANT遺伝子に対して、それらのコード領域においてヌ
クレオチドレベルで85.5%の同一性を共有し、そしてBANTポリペプチド
配列は、ANTポリペプチド配列に対して83.7%同一であった。
【0112】 (実施例6) 本実施例は、分裂組織細胞において異種遺伝子を発現させるための、ANT
5’上流ヌクレオチド配列(プロモーター)の使用を示す。
【0113】 正しく配向されたANTプロモーターを含むHindIII−BglIIフラ
グメントを、pBI101プラスミドベクターDNA(CLONTECH)内に
、HindIIIおよびBamHI部位で挿入した。これらの部位は、GUS(
β−グルクロニダーゼ)遺伝子の開始コドンの直前に位置される。同じフラグメ
ントをまた、プラスミドpBIN m−gfp5−ER(Haseloffら、
Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.94:2122−212
7、(1997))に、HindIII−BamHI部位に挿入した。この部位
は、GFP(グリーン蛍光タンパク質)遺伝子の開始コドンの直前に位置される
。Arabidopsis野生型植物を、Agrobacterium媒介真空
浸潤方法を使用して、これらの組換えプラスミドで形質転換した。複数のT1
統、およびそれらのその後の世代は、予測されるように、植物発生の間を通して
分裂組織細胞においてGUS活性またはGFP発現を示した。これは、ANTプ
ロモーターが、分裂組織細胞において異種遺伝子を発現させるために有用である
ことを示す。
【0114】 (実施例7) 本実施例は、Arabidopsis植物においてANT遺伝子発現を増加さ
せることによる、サイクリンD3(CYCD3)遺伝子発現の活性化を示す。
【0115】 細胞増殖は、細胞周期調節遺伝子(例えば、サイクリンおよびcdks(Na
smyth,Trends Genet.,12:405−412(1996)
;Morgan,Nature,374:131−134,1995;およびB
urssensら、Plant Physiol.Biochem.,36:9
−19(1998))の活性によって直接的に制御される。ANT遺伝子発現が
、CaMV 35Sプロモーターによって制御されるT1トランスジェニック系
統由来の器官は、増加した細胞数、従って増加された細胞増殖活性を有したので
、T1植物の若い器官および成熟器官におけるサイクリン遺伝子の発現を、定量
的RT−PCR分析によって測定した。若い発生中の器官において、細胞増殖は
、35S::ANT植物およびコントロール植物の両方で観察されたが、両者の
間のサイクリン遺伝子の発現レベルの差異は、有意ではなかった。しかし、成熟
器官において、CYCD3(Arabidopsis細胞周期のG1/S進入に
ついての重要な調節因子をコードする(Soniら、Plant Cell.7
:85−103(1995);Fuerstら、Plant Physiol.
112:1023−1033(1996))のmRNA蓄積は、コントロールで
はもはや検出されないが、これは、35S::ANT系統において検出された。
これらの結果は、35S::ANT系統とコントロール系統との間で、器官発生
の初期段階では生長の差異は検出されなかったが;コントロール植物の器官が成
熟し、そして細胞増殖を停止した場合に、同じ齢の35S::ANT植物の器官
の細胞は、増殖を継続し、そして結果として拡大された器官を生じるという観察
と一致する。
【0116】 この結果は、構成的ANT活性の増加は、細胞周期調節因子遺伝子の発現を調
節し、そして発生中の器官において細胞増殖を継続的に活性化することによって
、その細胞周期機構を直接的および/または間接的に制御することを実証する。
これはまた、細胞周期機構に関連する特定の遺伝子が、ANT転写因子遺伝子(
Klucherら、およびElliotら)の標的であることを示す。まとめて
考慮すると、これらの結果は、これらのANT標的遺伝子の発現の調節が、植物
における器官の大きさ/重量および稔性を調節し得ることを示唆する。
【0117】 (実施例8) 本実施例は、Brassica napus(カノーラ)由来のANTオーソ
ログ(ortholog)であるBANTの異所性発現がArabidopsi
sにおける器官の重量/大きさを増加することを示す。
【0118】 配列番号4に示される核酸配列を有するアブラナ属のANT(BANT)cD
NAを、センス方向で構成的35Sプロモーター下で、プラスミドベクターpM
ON530 (Rogersら、Method.Ezymol.153:253
、1987)に挿入した。組換えプラスミドDNAを、アグロバクテリウム形質
転換のために使用し、そして35S::BANTプラスミドDNAで形質転換さ
れたアグロバクテリウム細胞を、Arabidopsis植物(Col−0生態
型)を用いる吸引浸潤(vacuum infiltration)によるアグ
ロバクテリウム媒介性植物形質転換のために使用した。T1種子を、吸引浸潤の
約3週間後に収集し、そしてT1トランスジェニック実生のスクリーニングのた
めのカナマイシンを含むMS寒天プレート上に植えた。
【0119】 35S::BANT導入遺伝子を異所性に発現するT1植物は、上記の35S
::ANTトランスジェニック植物において見られるように、複数の器官の過形
成を示した(実施例1)。すなわち、葉器および花器は、コントロール器官より
せいぜい3倍大きかった。これらのトランスジェニック植物は、実質的に雄性不
稔性であり、そしてしばしば同様に雌性不稔性であった。しかし、いくつかの植
物は、手による受粉による野生型花粉粒の受精の際に、種子を産生し、そしてT 2 種子は、増加した重量/大きさを示した。カナマイシン耐性T2実生は、T1
物と同一の表現型を示す植物に発生し、このことは、ANTの異所性発現の影響
が遺伝性であることを示唆した。
【0120】 (実施例9) この実施例は、増加したANT発現が、Arabidopsis植物における
無性生殖、ならびに不定シュート、器官および胚の形成を誘導することを示す。
【0121】 完全に成熟した茎または器官(例えば、葉)を、ANTを異所性に発現するT 1 植物から切り出し、そして植物ホルモンを全く含まない水中またはMS寒天プ
レート上に配置した。約2週間のインキュベーションの後、不定根の形成を、茎
または葉の切断表面において観察した。時折、不定根もまた、葉の表面から生じ
た。この不定根の形成は、コントロールの茎または同様に処理された葉において
は、全く観察されなかった。
【0122】 ANTを異所性に発現する完全に成熟したT1植物由来の切除された花序(花
を有する)茎を、10日間、植物ホルモンを含まないMS寒天プレート上に配置
した。不定根の形成を、茎の切断表面において観察したが、老化した花芽(fl
oral bud)においては、不定シュート形成を観察した。これらのシュー
トは、最終的に、同様に根を生じ、起源の植物と同様のトランスジェニック形質
(拡大した器官の大きさ/重量)を示す完全な植物に発生した。コントロールの
花序の茎は、同一の条件下において無性生殖の活性を全く示さなかった。
【0123】 同様の無性生殖は、発生中の35S::ANTトランスジェニック種子より切
除された胚において観察された。魚雷段階(torpedo−stage)後期
からほとんど成熟した胚を、発生している緑色種子から切除し、そして50μg
/mlカナマイシンを含有する植物ホルモンを含まないMS寒天培地上で生長さ
せた。これらの胚は、実生に発生したが、いくつかの細胞は、二次胚または不定
根を再生し、これらはまた完全な植物に発生した。コントロール胚は、同一の条
件下において無性生殖の繁殖をしなかった。
【0124】 (結論) 高等植物において、内因性器官の大きさは、遺伝的に決定されるが、環境因子
によって大きく影響され得る。器官の大きさは、細胞の数および大きさを反映す
る。器官の総細胞数は、分裂能を有する未分化の分裂組織細胞の増殖によって決
定される。シュートの発生の間、側方の器官は、頂端分裂組織または側方分裂組
織から、原基として開始する。器官原基内のほとんどの細胞は、分裂性であり、
そして増殖するが、器官の発生の際に、細胞は、分裂能を失い、そして細胞周期
から抜け出る。従って、細胞の分裂能の維持は、総細胞数を規定し、それによっ
て植物器官の大きさを規定することによって、器官生長および細胞増殖を媒介す
る鍵となる機序である。しかし、分裂能の分子的性質および分裂能を制御する発
生の調節因子は、十分に理解されていない。
【0125】 Arabidopsis ANT遺伝子は、植物系においてのみ見出されてい
るAP−2ドメインファミリーの転写因子をコードする。ANT mRNAは、
全ての側方根器官の原基中に蓄積し、そして器官発生の際に減少する。このこと
は、ANTは、器官生長において一般的な機能を有し得ることを示唆する。葉原
基および未分化の生長中の葉におけるANT発現と一致して、ant−1の機能
喪失変異の全ての成熟した葉が、対応する野生型の葉と比較して、大きさが減少
したことが、見出された。ant−1花器もまた、正常より小さかったので、A
NTは、胚以降のシュート発生を通じた器官生長に必要とされる可能性が高い。
器官の大きさは、細胞の大きさ、細胞数、またはその両方の影響を受け得る。a
nt−1器官が、野生型よりも、単位面積あたりおよび1器官あたりより少ない
細胞を有するが、ant−1細胞は、正常よりもかなり大きかったことが見出さ
れた。このことは、ant−1器官の大きさの全身的な減少は、細胞数の減少の
結果であるが、細胞の大きさの減少の結果ではないことを実証する。従って、A
NT機能は、植物器官の内因性細胞数を達成するために必要である。
【0126】 本願明細書において記載される実験は、異所性のANT発現が、Arabid
opsis植物の器官形態形成と協調する器官生長を増強することによる、器官
の大きさおよび器官重量の増加のために十分であることを実証する。完全に成熟
した35S::ANT花弁内の分化した細胞は、野生型花弁内の細胞と同一の大
きさであった。同様に、花弁以外のコントロール器官と35S::ANT器官と
の間で、表皮における明らかな細胞の大きさの差異は検出されなかった。従って
、細胞の大きさではなく、細胞数の増加は、拡大した35S::ANT器官の主
な原因である。植物を短期間の日数、連続する照射条件、そして貧栄養培地また
は富栄養培地において生長させた場合、類似の機能の喪失および獲得の器官の大
きさに対する影響を観察した。従って、ANT機能は、外部の生長シグナルの認
識と独立しているようである。最終的な器官の大きさに対する驚くべき効果とは
対照的に、異所性のANT発現は、頂端分裂組織および側方分裂組織の大きさも
構造も改変せず、また器官の原基の大きさも数も変化しなかった。ANT機能の
喪失は、花器の数を減少したが、開始した器官原基は、ant−1花芽において
正常に配置され、そして正常な大きさとなった。従って、ANTは、器官原基の
大きさを決定せず、そして頂端分裂組織および側方分裂組織の構成を制御するこ
とによって器官原基数に影響することもないようである。
【0127】 ANTは、いかにして器官形成の間に細胞数を制御するのであろうか?一般に
、植物器官の生長は、細胞移動も細胞死も含まない;従って、器官細胞数は、発
生している器官の分裂組織細胞の増殖に本質的に依存する。ANTは、発生して
いる器官の分裂組織細胞において発現するので、器官形成の間の細胞増殖を調節
し、それによって成熟器官の総細胞数を決定し得る。この考えを試験するために
、コントロール器官およびant−1器官における細胞増殖の程度を、発生中の
花弁および完全に成熟した花弁の両方の細胞数および細胞の大きさを測定するこ
とによって試験した。中花段階(mid−floral stage)9の間、
野生型花弁の向軸性の表皮細胞は分化せず、そして頻繁に分裂した。一方、an
t−1花弁は、単位面積あたりおよび1器官あたり、正常よりも少ない未分化細
胞を有した。細胞数のこの減少は、段階15における完全に分化したant−1
花弁においてよりより明白となった。従って、器官形成を通じて(特に成熟前の
後期発生段階の間)、ant−1花弁において、正常よりも少ない細胞分裂が存
在する。ant−1花弁における細胞分裂を伴わない細胞生長が生じ、非常に大
きな細胞を生じた。
【0128】 これらの結果は、ANTが正常な程度の細胞増殖に必要であるが、細胞成長に
は主として必要ではないことを示唆する。どのようにしてANTが細胞増殖の程
度を調節するのか理解するために、本発明者らは、いかにして異所性ANT発現
が花弁発生の間に器官の大きさ、細胞の大きさ、および細胞数に影響するのか研
究した。ant−1花弁の細胞数に対する初期の効果とは対照的に、段階9にお
ける35S::ANT花弁の細胞数および細胞の大きさは、正常であった。この
ことは、異所性のANT発現は、初期段階の間の発生中の花弁の細胞生長または
細胞増殖の頻度を増加しないことを実証し、そして、増加したANT活性は、内
因性細胞周期時間を改変しないことを示唆する。しかし、段階15までに、完全
に成熟した35S::ANT花弁の総細胞数は、コントロールの約2.5倍に達
し、このことは、段階9の後においてのみでさえも、器官成熟前にさらなる細胞
分裂が35S::ANT花弁において生じたことを示す。成熟35S::ANT
花弁における細胞の大きさは正常であるので、余分な細胞分裂は、細胞生長と協
調しなければならない。従って、異所性ANT発現は、内因性の細胞周期時間を
改変することなく、花弁細胞を正常よりも長い期間増殖させるようである。類似
の結果は、35S::ANTのロゼット葉とコントロール実生の増殖を比較した
場合に得られた。発芽の16日後(16DAG)、35S::ANTおよびコン
トロール実生の両方が、同数のロゼット葉を有し、そして全ての35S::AN
T実生の葉は、対応するコントロール葉と同一の大きさであった。しかし、35
S::ANT葉は、対応するコントロール葉が生長を止める時点を越えて生長し
続け、最終的に正常より大きな葉を生じた。この観察は、細胞生長と協調する長
期の細胞増殖が、35S::ANT植物における過形成を生じるという仮説を支
持する。合わせて考えると、これらの観察は、ANTが器官形成の間の細胞の分
裂能を維持することによって、細胞増殖の期間を調節することを示唆する。本明
細書において表される結果はまた、ほとんどの細胞が分裂性である組織における
CycD3発現に対してANTが影響しないことを示唆する。類似の結果は、C
ycB1b(Cyc1bAt)(有糸分裂サイクリン遺伝子)のmRNAレベル
の比較において得られた。従って、ANTは、細胞の分裂能を維持し、そして結
果として細胞周期調節因子の発現を維持する。
【0129】 ANT機能と分裂能の維持とを結びつける別の驚くべき知見は、Arabid
opsis 35S::ANT器官において見出される新生物である。すなわち
、未分化細胞の塊(すなわち、カルス)が、外因性の植物ホルモン処理を行わず
に、35S::ANT植物の創傷または老化表面、あるいは完全に分化した35
S::ANT器官の剥離した末端から生成された。これらのカルスは、しばしば
、器官(例えば、根、葉またはシュート)に分化した。この新生物は、一貫して
35S::ANT器官において観察されたが、同一の方法で処理されたコントロ
ール器官においては、決して見られなかった。分化した植物組織が、植物ホルモ
ン処理後に、カルスを誘導し得ることは、十分に確立されている。通常静止状態
である分化した細胞中の異所性ANT発現は、分裂能を維持し、そして細胞周期
への再進入についてのその植物ホルモン依存性を減少する。
【0130】 本明細書において示される知見は、ANTが器官形成の間に器官生長および細
胞増殖期間に影響する内因性の器官の大きさの調節因子であることを実証する。
植物器官の大きさの調節におけるANT作用の提唱されたモデルにおいて、発生
生長シグナルは、器官形成の間にANTを正に調節する生長調節因子を活性化す
る。ANTは、細胞の分裂能を維持するように機能し、それによって細胞周期お
よび細胞生長の調節因子の発現を調節する。結果として、ANTは、発生してい
る器官の細胞生長と共役した細胞増殖を持続する。従って、異所性発現したAN
Tは、細胞の分裂能の異常な保持を生じ、過形成および新生物を生じる。一方、
ANTの欠損は、細胞増殖および器官生長の早熟な終結を生じる。植物および動
物の系において、生長シグナル伝達経路および細胞周期機構は、多くの共通の因
子を共有するようである。そうであるにもかかわらず、強固な細胞壁に囲まれた
、植物生命体および植物細胞の不動である性状のために、植物生長および細胞増
殖のいくつかの局面は、動物のものとは異なった方法において調節および協調さ
れているようである。従って、ANTが植物特異的調節因子であり、そしてAN
Tの上流調節因子および下流標的の同定は、植物が、いかにして独自に器官の大
きさを制御するパターン形成をともなう細胞増殖を協調するのかを明らかにし得
る。表現型の植物種間の多様性についての遺伝的基礎は、オーソログ調節遺伝子
の構造または発現における小さな変化であり得ることが示唆されている。従って
、ANTおよびそのオーソログの構造および発現パターンにおける差異は、少な
くとも部分的に、高等植物の器官の大きさにおける種間の多様性の原因である機
構であり得る。結局、異所性ANT発現による器官重量の増加は、農業において
重要な植物の収量の新しい改善方法であり得る。
【0131】 上記の実施例は、本発明の説明のために提供されたが、本発明の範囲を限定し
ない。本発明のほかのバリエーションは、当業者にとって容易に明らかであり、
そして添付の特許請求の範囲に含まれる。本明細書において引用される全ての刊
行物、特許、および特許出願は、本明細書によって、全ての目的のために参考と
して援用される。
【0132】
【表1】
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SL,SZ,TZ,UG,ZW ),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU, TJ,TM),AE,AL,AM,AT,AU,AZ, BA,BB,BG,BR,BY,CA,CH,CN,C R,CU,CZ,DE,DK,DM,EE,ES,FI ,GB,GD,GE,GH,GM,HR,HU,ID, IL,IN,IS,JP,KE,KG,KP,KR,K Z,LC,LK,LR,LS,LT,LU,LV,MA ,MD,MG,MK,MN,MW,MX,NO,NZ, PL,PT,RO,RU,SD,SE,SG,SI,S K,SL,TJ,TM,TR,TT,TZ,UA,UG ,UZ,VN,YU,ZA,ZW (72)発明者 ミズカミ, ユキコ アメリカ合衆国 カリフォルニア 94708, ケンジントン, レイク ドライブ 214 Fターム(参考) 2B030 AA02 AB03 AD07 CA06 CA17 CA19 CB02 CD03 CD07 CD10 CD13 CD17 CG01 HA01 4B024 AA08 BA80 CA04 DA01 4B065 AA88X AA88Y AB01 CA53

Claims (89)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 植物における生長および細胞の増殖を調節する方法であって
    、該方法が、 ANT活性を調節する工程;および 改変された細胞数によって植物を選択する工程 を包含する、方法。
  2. 【請求項2】 請求項1に記載の方法であって、改変された大きさ、重量ま
    たは稔性によって植物を選択する工程を包含し;そして前記調節された細胞の増
    殖が、改変された植物の大きさ、重量または稔性と関連する、方法。
  3. 【請求項3】 請求項1に記載の方法であって、増加した細胞数によって植
    物を選択する工程を包含し、そして前記ANT活性を増加させる、方法。
  4. 【請求項4】 植物器官の大きさまたは重量を増加させる、請求項3に記載
    の方法。
  5. 【請求項5】 稔性を減少させる、請求項3に記載の方法。
  6. 【請求項6】 ANT活性を増加させる工程がANT発現を増加させる工程
    を包含する、請求項3に記載の方法。
  7. 【請求項7】 請求項3に記載の方法であって、ANT発現を増加させる工
    程が、異種ANT核酸に作動可能に連結された植物プロモーターを含む発現カセ
    ットを前記植物に導入することを包含する、方法。
  8. 【請求項8】 前記ANT核酸が配列番号1と少なくとも50%同一である
    、請求項7に記載の方法。
  9. 【請求項9】 前記ANT核酸が配列番号1である、請求項8に記載の方法
  10. 【請求項10】 前記ANT核酸が、配列番号2と少なくとも60%同一で
    あるポリペプチドをコードする、請求項7に記載の方法。
  11. 【請求項11】 前記ANT核酸が、配列番号2と同一のポリペプチドをコ
    ードする、請求項10に記載の方法。
  12. 【請求項12】 前記ANT核酸が配列番号4と少なくとも50%同一であ
    る、請求項7に記載の方法。
  13. 【請求項13】 前記ANT核酸が配列番号4である、請求項12に記載の
    方法。
  14. 【請求項14】 前記ANT核酸が、配列番号5と少なくとも60%同一で
    あるポリペプチドをコードする、請求項7に記載の方法。
  15. 【請求項15】 前記ANT核酸が、配列番号5と同一であるポリペプチド
    をコードする、請求項14に記載の方法。
  16. 【請求項16】 前記ANT活性をシュート栄養器官において増加させる、
    請求項3に記載の方法。
  17. 【請求項17】 前記ANT活性を根において増加させる、請求項3に記載
    の方法。
  18. 【請求項18】 前記ANT活性を花器において増加させる、請求項3に記
    載の方法。
  19. 【請求項19】 前記ANT活性を胚珠において増加させる、請求項3に記
    載の方法。
  20. 【請求項20】 前記ANT活性を体細胞胚において増加させる、請求項3
    に記載の方法。
  21. 【請求項21】 前記ANT活性を種子において増加させる、請求項3に記
    載の方法。
  22. 【請求項22】 前記ANT活性を果実において増加させる、請求項3に記
    載の方法。
  23. 【請求項23】 請求項1に記載の方法であって、減少した細胞数の植物を
    選択する工程を包含し、そして前記ANT活性を減少させる、方法。
  24. 【請求項24】 前記ANT活性を減少させる工程がANTの発現を減少さ
    せることを包含する、請求項23に記載の方法。
  25. 【請求項25】 請求項24に記載の方法であって、ANTの発現を減少さ
    せる工程が、異種ANT核酸に作動可能に連結された植物プロモーターを含む発
    現カセットを前記植物に導入することを包含する、方法。
  26. 【請求項26】 前記ANT核酸が配列番号1と少なくとも50%同一であ
    る、請求項25に記載の方法。
  27. 【請求項27】 前記ANT核酸が配列番号1である、請求項26に記載の
    方法。
  28. 【請求項28】 前記ANT核酸が、配列番号2と少なくとも60%同一で
    あるポリペプチドをコードする、請求項25に記載の方法。
  29. 【請求項29】 前記ANT核酸が、配列番号2と同一であるポリペプチド
    をコードする、請求項28に記載の方法。
  30. 【請求項30】 前記ANT核酸が配列番号4と少なくとも50%同一であ
    る、請求項25に記載に方法。
  31. 【請求項31】 前記ANT核酸が配列番号4である、請求項30に記載の
    方法。
  32. 【請求項32】 前記ANT核酸が、配列番号5と少なくとも60%同一で
    あるポリペプチドをコードする、請求項25に記載の方法。
  33. 【請求項33】 前記ANT核酸が、配列番号5と同一であるポリペプチド
    をコードする、請求項32に記載の方法。
  34. 【請求項34】 前記ANT活性をシュート栄養器官において減少させる、
    請求項23に記載の方法。
  35. 【請求項35】 前記ANT活性を根において減少させる、請求項23に記
    載の方法。
  36. 【請求項36】 前記ANT活性を花器において減少させる、請求項23に
    記載の方法。
  37. 【請求項37】 前記ANT活性を種子において減少させる、請求項23に
    記載の方法。
  38. 【請求項38】 前記ANT活性を体細胞胚において減少させる、請求項2
    3に記載の方法。
  39. 【請求項39】 前記ANT活性を果実において減少させる、請求項23に
    記載の方法。
  40. 【請求項40】 前記植物プロモーターが構成的プロモーターである、請求
    項7または25に記載の方法。
  41. 【請求項41】 前記植物プロモーターが誘導性プロモーターである、請求
    項7または25に記載の方法。
  42. 【請求項42】 前記植物プロモーターが組織特異的プロモーターである、
    請求項7または25に記載の方法。
  43. 【請求項43】 請求項42に記載の方法であって、改変されたシュート栄
    養器官の大きさまたは重量によって植物を選択する工程を包含し、そして前記プ
    ロモーターがシュート栄養器官における前記ANT核酸の発現を指向する、方法
  44. 【請求項44】 請求項42に記載の方法であって、改変された根の大きさ
    または重量によって植物を選択する工程を包含しそして前記プロモーターが根に
    おける前記ANT核酸の発現を指向する、方法。
  45. 【請求項45】 請求項42に記載の方法であって、不稔性である植物を選
    択する工程かあるいは改変された花器の大きさまたは重量によって植物を選択す
    る工程を包含し、そして前記プロモーターが花器における前記ANT核酸の発現
    を指向する、方法。
  46. 【請求項46】 請求項42に記載の方法であって、雌性不稔性である植物
    を選択する工程かあるいは改変された胚珠の大きさまたは重量によって植物を選
    択する工程を包含し、そして前記プロモーターが胚珠における前記ANT核酸の
    発現を指向する、方法。
  47. 【請求項47】 請求項42に記載の方法であって、雄性不稔性である植物
    を選択する工程、改変された葯の大きさまたは重量によって植物を選択する工程
    あるいは裂開しない葯によって植物を確認する工程を包含し、そして前記プロモ
    ーターが葯における前記ANT核酸の発現を指向する、方法。
  48. 【請求項48】 請求項42に記載の方法であって、改変された種子の大き
    さまたは重量によって植物を選択する工程を包含し、そして前記プロモーターが
    種における前記ANT核酸の発現を指向する、方法。
  49. 【請求項49】 請求項42に記載の方法であって、前記プロモーターが体
    細胞胚における前記ANT核酸の発現を指向する、方法。
  50. 【請求項50】 請求項42に記載の方法であって、改変された果実の大き
    さまたは重量によって植物を選択する工程を包含し、そして前記プロモーターが
    果実における前記ANT核酸の発現を指向する、方法。
  51. 【請求項51】 前記植物プロモーターがANT遺伝子由来である、請求項
    7または25に記載の方法。
  52. 【請求項52】 前記プロモーターが配列番号3に示される通りである、請
    求項51に記載の方法。
  53. 【請求項53】 前記細胞の増殖が無性生殖と関連する、請求項3に記載の
    方法。
  54. 【請求項54】 前記ANT活性を増加させる工程がANT発現を増加させ
    ることを包含する、請求項53に記載の方法。
  55. 【請求項55】 請求項53に記載の方法であって、ANT発現を増加させ
    る工程が、異種ANT核酸に作動可能に連結された植物プロモーターを含む発現
    カセットを前記植物に導入することを包含する、方法。
  56. 【請求項56】 前記ANT核酸が配列番号1と少なくとも50%同一であ
    る、請求項55に記載の方法。
  57. 【請求項57】 前記ANT核酸が配列番号1である、請求項56に記載の
    方法。
  58. 【請求項58】 前記ANT核酸が、配列番号2と少なくとも60%同一で
    あるポリペプチドをコードする、請求項55に記載の方法。
  59. 【請求項59】 前記ANT核酸が、配列番号2と同一であるポリペプチド
    をコードする、請求項58に記載の方法。
  60. 【請求項60】 前記ANT核酸が配列番号4と少なくとも50%同一であ
    る、請求項55に記載の方法。
  61. 【請求項61】 前記ANT核酸が配列番号4である請求項60に記載の方
    法。
  62. 【請求項62】 前記ANT核酸が、配列番号5と少なくとも60%同一で
    あるポリペプチドをコードする、請求項55に記載の方法。
  63. 【請求項63】 前記ANT核酸が、配列番号5と同一であるポリペプチド
    をコードする、請求項62に記載の方法。
  64. 【請求項64】 前記植物がカルス組織において生じる、請求項53に記載
    の方法。
  65. 【請求項65】 前記植物が不定シュートより生じる、請求項64に記載の
    方法。
  66. 【請求項66】 前記植物が体細胞胚より生じる、請求項53に記載の方法
  67. 【請求項67】 前記植物が挿穂より生じる、請求項53に記載の方法。
  68. 【請求項68】 前記方法が不定器官によって植物を選択する工程を包含す
    る、請求項3に記載の方法。
  69. 【請求項69】 前記ANT活性を増加させる工程がANT発現を増加させ
    ることを包含する、請求項68に記載の方法。
  70. 【請求項70】 請求項69に記載の方法であって、ANTの発現を増加さ
    せる工程が、異種ANT核酸に作動可能に連結された植物プロモーターを含む発
    現カセットを前記植物に導入することを包含する、方法。
  71. 【請求項71】 前記ANT核酸が配列番号1と少なくとも50%同一であ
    る、請求項69に記載の方法。
  72. 【請求項72】 前記ANT核酸が配列番号1である、請求項71に記載の
    方法。
  73. 【請求項73】 前記ANT核酸が、配列番号2と少なくとも60%同一で
    あるポリペプチドをコードする、請求項69に記載の方法。
  74. 【請求項74】 前記ANT核酸が、配列番号と同一であるポリペプチドを
    コードする、請求項73に記載の方法。
  75. 【請求項75】 前記ANT核酸が配列番号4と少なくとも50%同一であ
    る、請求項69に記載の方法。
  76. 【請求項76】 前記ANT核酸が配列番号4である、請求項75に記載の
    方法。
  77. 【請求項77】 前記ANT核酸が、配列番号5と少なくとも60%同一で
    あるポリペプチドをコードする、請求項69に記載の方法。
  78. 【請求項78】 前記ANT核酸が配列番号5と同一であるポリペプチドを
    コードする、請求項77に記載の方法。
  79. 【請求項79】 前記植物がカルス組織において生じる、請求項68に記載
    の方法。
  80. 【請求項80】 植物の分裂組織細胞における異種核酸の発現を指向する方
    法であって、異種ポリヌクレオチドに作動可能に連結されたANTプロモーター
    を含む発現カセットを該植物に導入する工程を包含する、方法。
  81. 【請求項81】 前記プロモーターが配列番号3に記載される、請求項80
    に記載の方法。
  82. 【請求項82】 配列番号3と少なくとも80%同一であるANTプロモー
    ター配列を含む、単離された核酸分子。
  83. 【請求項83】 前記ANTプロモーター配列に作動可能に連結された異種
    ポリヌクレオチドをさらに含む、請求項82に記載の単離された核酸分子。
  84. 【請求項84】 前記ANTプロモーター配列が配列番号3に示される通り
    である、請求項82に記載の単離された核酸分子。
  85. 【請求項85】 配列番号4と少なくとも50%同一であるANT核酸配列
    を含む単離された核酸分子であって、該ANT核酸配列が配列番号1ではない、
    単離された核酸分子。
  86. 【請求項86】 請求項85に記載された単離された核酸分子であって、前
    記ANT核酸配列が配列番号6、配列番号7および配列番号8からなる群より選
    択される配列を有するプライマーによって増幅され得る、核酸分子。
  87. 【請求項87】 前記ANT核酸配列が配列番号4に示される通りである、
    請求項85に記載の単離された核酸分子。
  88. 【請求項88】 請求項85に記載の単離された核酸分子であって、前記A
    NT核酸配列がAP2ドメイン内で配列番号5と少なくとも約90%同一である
    配列を有するポリペプチドをコードするか、または全体の領域において配列番号
    5と少なくとも約60%同一である配列を有するポリペプチドをコードする、核
    酸分子。
  89. 【請求項89】 配列番号5に示される通りのポリペプチドをコードするA
    NT核酸配列を含む、単離された核酸分子。
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