JP2001511645A - ヒトC5a様受容体 - Google Patents
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Abstract
(57)【要約】
本発明は、ヒトC5a様受容体(HCOR)及びHCORを同定しコードするポリヌクレオチドを提供する。また本発明は、HCORをコードする核酸配列を含む遺伝子組換え発現ベクター及び宿主細胞と、HCORの製造方法とを提供する。また本発明は、HCORに特異的に結合するアゴニスト、抗体、又はアンタゴニストと、HCORの発現が関係する疾病の予防及び治療におけるそれらの使用方法を提供する。更に本発明は、HCORの発現が関係する疾病の治療のための、HCORをコードするポリヌクレオチドに対するアンチセンス分子の使用方法を提供する。また本発明は、該ポリヌクレオチド又はその断片若しくは相補配列及びHCORに特異的に結合する抗体を利用する診断検査方法を提供する。
Description
【発明の詳細な説明】
ヒトC5a様受容体技術分野
本発明は、新規なヒトC5a様受容体の核酸及びアミノ酸配列、及び炎症が関
係する疾病及び状態の診断、予防、及び治療におけるこれらの配列の使用に関す
るものである。背景技術
炎症は、細胞の損傷に対する迅速で非特異的、且つ複雑な反応である。この炎
症プロセスは、様々な因子によって誘導される細胞への障害によって発生し得る
。初めの細胞性及び生化学的反応は、マスト細胞の顆粒にみられる成分から始ま
り、血管拡張や血管透過性の上昇を伴う。これらの局所的変化によって、細胞、
血小板、及び血漿タンパク質が血管から損傷組織に移動できるようになる。この
細胞及び血漿タンパク質は、受容体が媒介するプロセスを介して作用することに
より、その後の炎症反応の刺激及び調節を行い、且つ免疫系の成分と相互作用す
る。
刺激を受けた細胞は様々な因子を放出するが、この中には血管透過性を維持す
る血管作用性アミンや、様々なタイプの白血球を誘因する走化因子が含まれてい
る。これらの細胞は、細胞の受容体と結合したり、炎症性及び免疫系の別の成分
を動員する因子を産生する。組織に浸潤する血漿タンパク質は、キニン、凝固、
及び補体系の成分である。これらのタンパク質は、不活性の状態で発生し、抗原
−抗体複合体により活性化され得る。この細胞及び血漿タンパク質系は、それら
を産生する因子と共に、微生物を殺したり、損傷組織の除去、及び組織の修復や
再生のための領域を準備するために必要な生理学的反応を誘導する。
補体系の活性化成分は、殆どの炎症反応プロセスに関与する。詳述すると、補
体C1〜C5はケモタキシンとして作用し、C6〜C9はオプ
シシンとして作用し、C3〜C5はマスト細胞の脱顆粒を誘導するアナフィラト
キシンとして作用する。これらの分子は、Gタンパク質によりホスホリパーゼC
が共役する細胞表面受容体の活性化を介して生物学的反応を媒介する。これらの
炎症メディエーターの中で最も強力なC5aは、C5a受容体と結合して、好中
球、好酸球、好塩基球、マクロファージ、及び単球の走化作用を誘発する。更に
C5aは、脱顆粒、スーパーオキシドの生成、脈管構造透過性を誘導し、その作
用は、プロスタグランジン及び循環する白血球により強化される。これに対し、
RANTES、IL−8、ヒスタミン、及びブラジキニンのような他の炎症メデ
ィエーターは血管透過性を有するが、走化性は有していないことがあり得、走化
作用を誘発するものでも、ごく僅かな種類の細胞のタイプしか誘引しない(Gera
rd,N.及びGerard,C.(1991)Nature 349:614-617;Boulay,F.等(1991)Biochemistry
30:2993-2999)。
ヒトC5a受容体はクローン化され、Gタンパク質共役7回膜貫通ファミリー
のメンバーとして特性化された。この受容体を刺激すると、炎症反応及び組織修
復に必要であるが、組織損傷やアレルギー反応及び不適切な免疫学的反応も引き
起こす多面的な作用が生ずる(Gerard N.and Gerard,C.前出;Gerard,C.及びGer
ard,N.(1994)Annu Rev Immunol 12:755-808)。
補体による組織損傷は、脳の脱髄及び神経変性、アレルギー反応、喘息及び成
人呼吸窮迫症候群、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、腎炎、及びクロー
ン病のような自己免疫疾患、虚血後心筋炎及び壊死、皮膚病、肺血症性ショック
と関連を有する。更に、組織損傷を伴う補体の活性化は心臓バイパス法を実施す
る際に必要な体外循環及び血液透析、癌の炎症性合併症であることがわかった(
Wang,Y.等(1996)Proc Natl Acad Sci 93:8563-8568;Gasque,P.等(1995)J Immuno
l 155:4882-
4889;Rabinovici,R.等(1992)J Immunol 149:1744-1750;Belmont,H.等(1994)Arth
rit Rheum 37:376-383;Elmgreen,J.等(1983)Acta Med Scand 214:403-407;Weism
an H.等(1990)Science 249:146-151;Liu,Z.等(1995)J Clin Invest 95:1539-154
4;Rinder,C.等(1995)J Clin Invest 96:1564-1572)。
ヒトC5a受容体に関連するタンパク質の発見、及びそれらをコードするポリヌ
クレオチドは、炎症が関係する疾病の診断及び治療において役立つ新たな物質を
提供することにより当分野における必要性を満たすものである。発明の開示
本発明は、ヒトC5a受容体(GI 115262)に類似性を有することを特徴とす
る、新規なヒトC5a様受容体(以下HCORと称する)を提供する。
従って本発明は、配列番号:1に示すアミノ酸配列を有する実質的に精製され
たHCORを提供する。
本発明の或る態様は、HCORをコードする単離され実質的に精製されたポリ
ヌクレオチドを提供する。特定の態様では、このポリヌクレオチドは配列番号:
2のヌクレオチド配列である。
また本発明は、配列番号:2の相補配列又はその変異体を含むポリヌクレオチ
ド配列に関するものである。更に本発明は、配列番号:2の配列と厳密な条件の
下でハイブリダイズするポリヌクレオチド配列を提供する。
更に本発明は、該ポリペプチドをコードする核酸配列、オリゴヌクレオチド、
ペプチド核酸(PNA)、その断片、一部分、若しくはアンチセンス分子、及び
HCORをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクター及び宿主細胞を提供
する。また本発明は、実質的に精製されたH
CORを含む医薬品組成物、及び炎症の予防又は治療のためのこの組成物の使用
方法を提供する。また本発明は、HCORのアゴニスト、アンタゴニスト、及び
抗体を提供する。図面の簡単な説明
第1A図、第1B図、第1C図、及び第1D図は、HCORのアミノ酸配列(
配列番号:1)及び核酸配列(配列番号:2)を示す。配列のアライメントは、
MacDNASIS PROTMソフトウエア(Hitachi Software Engineering CO.,Ltd.,San B
runo,CA)を用いて作成した。
第2A図及び第2B図は、HCOR(配列番号:1)とヒトC5a受容体(GI
115262;配列番号:3)との間のアミノ酸配列アライメントを示す。この配列
のアライメントは、DNASTARTMソフトウエアのマルチシーケンスアライメントプ
ログラム(DNASTAR Inc,Madison WI)を用いて作成した。
第3A図及び第3B図はそれぞれ、HCOR(配列番号:1)とヒトC5a受
容体(GI 115262;配列番号:3)の疎水性プロット(MacDNASIS PROソフトウエ
アを用いて作成)を示す。X軸は正の方向にアミノ酸の位置を表し、Y軸は負の
方向に疎水性のレベルを表す。発明の実施の形態
本発明のタンパク質、核酸配列、及び方法について説明する前に、本発明は、
ここに開示した特定の方法論、プロトコル、細胞系、ベクター、及び試薬に限定
されず、実施形態を変更し得るものと理解されたい。また、ここで用いられる用
語法は、特定の実施例のみを説明する目的で用いられたものであり、請求の範囲
のみによって限定されるものである本発明の範囲を限定することを意図したもの
ではないということも理解されたい。
本明細書及び請求の範囲において、単数を表す「1つの」及び「その」
と形容された表現(または数を表す表現を付していない場合)は、前後関係でそ
うでないことが明らかである場合以外は、複数の意味も含んでいることに注意し
なければならない。従って、例えば「宿主細胞」なる表記が表すものには、複数
のそのような宿主細胞が含まれ、「抗体」なる表記は、1またはそれ以上の抗体
及び当業者に周知のその等価物等も表している。
本明細書における全ての科学技術専門用語は、別の意味で定義されていない場
合には、本発明の属する技術分野の専門家に一般に理解されるのと同じ意味を有
する。ここに説明したものと類似のまたは等価な方法や材料を本発明の実施や試
験において用いることができるが、好適な方法、装置、及び材料はここに説明さ
れている。本明細書に記載された全ての文献は、本発明の関連において用いられ
得る文献で報告された細胞系、ベクター、及び方法論を説明し開示する目的で引
用されたものであり、この引用により本明細書と一体にされる。
定義
本明細書において「核酸配列」は、一本鎖か二本鎖の、センス鎖又はアンチセ
ンス鎖である、ゲノム起源又は合成起源のDNA、RNAや、オリゴヌクレオチ
ド、ヌクレオチド、又はポリヌクレオチド、及びその断片又は一部分である。同
様に、本明細書において「アミノ酸配列」は、自然発生の分子または合成分子の
、オリゴペプチド、ペプチド、ポリペプチド若しくはタンパク質配列及びその断
片又は一部分である。
ここでは「アミノ酸配列」は、自然発生タンパク質分子のアミノ酸配列を指す
ものとして説明されているが、「アミノ酸配列」や類似の用語、例えば「ポリペ
プチド」又は「タンパク質」は、アミノ酸配列を、説明されるタンパク質分子に
関連する完全で元のままのアミノ酸配列に限定
する意味で用いられてるのではない。
本明細書において「ペプチド核酸」は、リジンのようなアミノ酸残基及びアミ
ノ基が加えられたオリゴマーを含む分子である。これらの小分子は抗遺伝子剤と
も称され、それに対して相補的な核酸の鎖に結合することにより転写物の伸長を
停止させる(Nielsen,P.E.等(1993)Anticancer Drug Des.8:53-63)。
本明細書において、HCORは、任意の種、特にウシ、ヒツジ、ブタ、マウス
、ウマ、及び好ましくはヒトを含む哺乳類から得られる、天然の、合成の、半合
成の、又は組換え体の何れかを起源とする実質的に精製されたHCORのアミノ
酸配列である。
本明細書において「コンセンサス」は、再度シークエンシングされて不要な塩
基が分離された核酸配列か、XL-PCRTM(Perkin Elmer,Norwalk,CT)を用いて5
’方向及び/または3’方向に延長されて、再度シークエンシングされた核酸配
列か、GELVIEWTM Fragment Assembly system(GCG,Madison WI)を用いて2以上
のインサイト社クローンの重複した配列を元に組み合わせて構成された核酸配列
か、若しくは延長と組み合わせの双方によって形成された核酸配列の何れかであ
る。
本明細書においてHCORの「変異体」は、1又は2箇所以上のアミノ酸が変
異したアミノ酸配列である。この変異体は「保存的」変化を含むものであり得、
この保存的変化においては、例えばロイシンをイソロイシンで置き換える場合の
ように置換されるアミノ酸が類似な構造的及び化学的特性を有する。稀に、変異
体が「非保存的」に変化する場合もあり、この非保存的変化では例えばグリシン
がトリプトファンで置換される。類似した小変化には、アミノ酸の欠失か挿入、
若しくはその両方も含まれる。例えばDNASTARソフトウエアのような良く知られ
たコン
ピュータプログラムを用いて、生物学的或いは免疫学的活性を損なわずに置換、
挿入、又は除去できるアミノ酸が何れかということ、及びそのようなアミノ酸が
いくつかということを決定することができる。
本明細書において「欠失」は、1または2以上のヌクレオチド若しくはアミノ
酸残基が欠ける、ヌクレオチド配列またはアミノ酸配列における変化である。
本明細書において「挿入」或いは「付加」は、自然発生の分子と比較して、そ
れぞれ1または2以上のヌクレオチド、アミノ酸残基が加わるような、ヌクレオ
チド配列或いはアミノ酸配列の変化を指す。
本明細書において「置換」は、それぞれ1または2以上のヌクレオチド或いは
アミノ酸を、異なるヌクレオチド或いはアミノ酸に置換することによって生ずる
変化である。
本明細書において、用語「生物学的に活性」は、自然発生の分子の構造的機能
、調節機能、又は生化学的機能を有するタンパク質である。同様に「免疫学的に
活性」は、天然の、組換え体の、又は合成のHCOR、若しくはその任意のオリ
ゴペプチドが適当な動物や細胞における特定の免疫応答を誘発し、特定の抗体に
結合する能力である。
本明細書において、用語「アゴニスト」は、HCORに結合したとき、HCO
Rの活性を変調するようなHCORの変化を生じさせる分子である。アゴニスト
には、HCORに結合するタンパク質、核酸、糖質や、任意の他の分子が含まれ
得る。
本明細書において、用語「アンタゴニスト」または「インヒビター」は、HC
ORに結合したとき、HCORの活性を阻害する分子である。アンタゴニスト及
びインヒビターには、HCORに結合するタンパク質、核酸、糖質や、任意の他
の分子が含まれ得る。
本明細書において、用語「変調」は、HCORの生物学的活性の変化
又は変質である。変調は、タンパク質活性の上昇や低下、結合特性の変化、又は
HCORの生物学的、機能的、免疫学的特性の他の変化であり得る。
本明細書において、用語「擬似物」は、HCORまたはその一部分の構造の知
識からその構造を知ることができ、そのようなものとして、C5a受容体様分子
の作用の一部または全てに影響を与え得る分子である。
本明細書において、用語「誘導体」は、HCORをコードする核酸又はコード
されたHCORを化学的に修飾したものを意味する。このような修飾の例には、
水素からアルキル基、アシル基、又はアミノ基への置換がある。核酸誘導体は、
未修飾HCORの必須の生物学的特性を保持しているポリペプチドをコードする
。
本明細書において、用語「実質的に精製」は、天然の環境から取り除かれ、天
然にはそれが結合して存在する他の構成要素から単離又は分離されて、その構成
要素が60%以上、好ましくは75%以上、最も好ましくは90%以上除去され
た核酸配列又はアミノ酸配列である。
本明細書において「増幅」は、核酸配列の更なる複製物を生成することであり
、通常は当業者に周知のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)技術を用いて行われる(D
ieffenbach,C.W.及びG.S.Dveksler(1995)PCR Primer.a Laboratory Manual,Cold
Spring Harbor Press,Plainview,NY)。
本明細書において、用語「ハイブリダイゼーション(ハイブリッド形成)」は
、核酸の鎖が塩基対合を介して相補鎖と結合する過程である。
本明細書において、用語「ハイブリダイゼーション複合体」は、相補的なG塩
基とC塩基の間及び相補的なA塩基とT塩基の間での水素結合の形成によって、
2つの核酸配列で形成された複合体である。これらの水素結合は、塩基スタッキ
ング相互作用(base stacking interaction)
により更に安定化され得る。この2つの相補的核酸配列は水素結合して、逆平行
構造をなす。ハイブリダイゼーション複合体は、溶液中で形成されるか(例えば
C0t又はR0t解析)、或いは核酸は溶液中に存在する一方の核酸と、固定支持
体(例えばin situハイブリダイゼーションのために細胞が固定されるメンブラ
ン、フィルタ、ピン、またはスライドガラス)に固定化された他方の核酸との間
で形成され得る。
本明細書において、用語「相補的」または「相補性」は、許容的な塩及び温度
の条件の下での塩基対によるポリヌクレオチド同士の自然の結合である。例えば
、配列「A−G−T」は相補的配列「T−C−A」に結合する。2つの二本鎖分
子間の相補性は、核酸の幾つかのみが結合している「部分的」なものであるか、
若しくは一本鎖分子間に完全な相補性が存在する場合は完全に相補的であり得る
。核酸鎖同士の相補性の程度は、核酸鎖同士のハイブリダイゼーションの効率及
び強度に有意な影響を与える。このことは、核酸鎖同士の結合によって左右され
る増幅反応において特に重要である。
本明細書において、用語「相同性」は、相補性の程度である。部分的な相同性
と、完全な相同性(即ち同一性)の場合があり得る。部分的に相補的な配列は、
同一の配列が標的の核酸とハイブリダイズするのを少なくとも部分的に阻害する
ものであり、これを機能的な用語「実質的に相同な」を用いて表す。完全に相補
的な配列と標的配列とのハイブリダイゼーションの阻害は、低い厳密性の条件の
下で、ハイブリダイゼーションアッセイ(サザンブロット法またはノーザンブロ
ット法、溶液ハイブリダイゼーション等)を用いて検定することができる。実質
的に相同な配列またはプローブは、低い厳密性の条件の下で標的の配列と、完全
に相同な配列またはプローブとの結合(即ちハイブリッド形成)について競合し
、それを阻害する。これは、低い厳密性の条件が、非特異的な
結合を許容するようなものであると言っているのではない。低い厳密性の条件で
は、2つの配列の相互の結合が特異的(即ち選択的)相互作用であることが必要
である。非特異的結合が存在しないことは、部分的な程度の相補性(即ち約30
%未満の同一性)を有していない第2の標的配列を用いることにより試験できる
。非特異的結合が存在しない場合、プローブは第2の非相補的標的配列とハイブ
リダイズしない。
周知のように、多数の等価な条件を用いて、低い厳密性条件か高い厳密性条件
の何れかを含むようにすることができる。例えば配列の長さ及び性質(DNA、
RNA、塩基構成)、標的の性質(DNA、RNA、塩基構成、溶液中に存在す
るか或いは固定化されているか等)、及び塩や他の成分の濃度(例えばホルムア
ミド、デキストラン硫酸、及び/またはポリエチレングリコールの有無)のよう
な要素を考慮してハイブリダイゼーション溶液を変え、上に列挙した条件とは異
なるが等価である低い厳密性または高い厳密性の何れかの条件を作り出すことが
できる。
本明細書において、用語「厳密な条件」は、約(Tm−5)℃(プローブの融
解温度(Tm)より5℃下)からTmの約20〜25℃下まで範囲で生ずる「厳
密性」である。当業者には理解されるように、ハイブリダイゼーションの厳密性
は、同一のポリヌクレオチド配列の同定や検出のためであるか、或いは近縁なポ
リヌクレオチド配列の同定や検出のためであるかによって変えることができる。
本明細書において用語「アンチセンス」は、特定のDNAまたはRNA配列に
対して相補的なヌクレオチド配列である。「アンチセンス鎖」は、「センス」鎖
に対して相補的な核酸鎖の意味で用いられる。アンチセンス分子は、相補的鎖の
合成が可能なウイルスプロモータに、目的の遺伝子を逆方向に結合することによ
る合成を含む任意の方法で作り出すことができる。この転写された鎖は、一度細
胞内に導入されると、細胞
によって作られた天然の配列と結合して二重鎖を形成する。次にこれらの二重鎖
は更なる転写や翻訳を阻害する。このようにして、変異体の表現型を作り出すこ
とができる。「ネガティブ」なる表現はアンチセンス鎖の意味で時折用いられ、
「ポジティブ」はセンス鎖の意味で用いられることがある。
本明細書において、(「所与のタンパク質の一部分」と用いられるような)タ
ンパク質に関連する用語「一部分」は、そのタンパク質の断片である。この断片
のサイズは4つのアミノ酸残基から、(全アミノ酸配列−1)個のアミノ酸の範
囲に亘る。従って、「配列番号:1のアミノ酸配列の少なくとも一部分を含む」
タンパク質は、完全長ヒトHCORとその断片を含む。
本明細書の定義では、「形質転換」は、外来DNAが入り込みレシピエント細
胞を変化させるプロセスを意味する。このプロセスは、よく知られた種々の方法
を用いた天然または人工の条件の下で生じ得る。形質転換は、外来核酸配列を原
核細胞または真核細胞の宿主細胞に導入するための任意の既知の方法に基づいて
いる。この方法は形質転換される宿主細胞によって選択され、以下のものに限定
されないが、ウイルス感染、電気穿孔法、リポフェクション、及び微粒子銃を用
いる方法が含まれ得る。このように「形質転換された」細胞は、その中で挿入さ
れたDNAが自律的に複製するプラスミドとして、或いは宿主の染色体の一部と
して複製が可能な安定的に形質転換された細胞を含む。またこのような細胞は、
限られた時間だけ導入されたDNAの一過性の発現をする細胞も含む。
本明細書において、用語「抗原決定基」は、特定の抗体と接触する分子の一部
分(即ちエピトープ)である。タンパク質またはタンパク質の断片を用いてホス
トの動物を免疫すると、このタンパク質の種々の領域
が、該タンパク質上の所定の領域または三次元構造に特異的に結合する抗体の産
生を誘発し得る。これらの領域または構造を抗原決定基と称する。抗原決定基は
、抗体への結合について、そのままの抗原(即ち免疫応答を引き出すために用い
られる免疫原)と競合し得る。
本明細書において、用語「特異的結合」または「特異的に結合する」は、抗体
及びタンパク質またはペプチドの相互作用が、タンパク質上の特定の構造(即ち
抗原決定基またはエピトープ)の存在に左右されることを意味している。つまり
、この抗体はタンパク質全体ではなく、特定のタンパク質構造を認識して結合す
る。例えば、抗体がエピトープ「A」に対して特異的である場合、標識した「A
」及びその抗体を含む反応において、エピトープA(つまり結合していない、無
標識のA)を含むタンパク質が存在すると、抗体に結合した標識Aの量が低下す
る。
本明細書において、用語「サンプル」は、その最も広い意味で用いられる。H
CORをコードする核酸またはその断片を含む疑いのある生物学的サンプルは、
細胞、細胞から単離された染色体(例えば中期染色体の展開物)、(溶液中の、
または例えばサザンブロット解析用に固体支持体に結合した)ゲノムのDNA、
(溶液中の、または例えばノーザンブロット解析用に固体支持体に結合した)R
NA、(溶液中の、または固体支持体に結合した)cDNA、細胞や組織からの
抽出物、その他を含み得る。
本明細書において、「ポリヌクレオチドの発現と相関性を有する」なる表現は
、ノーザン解析ハイブリダイゼーションアッセイにより、配列番号:2に類似な
リボ核酸の存在が検出されることが、サンプル内のHCORをコードするmRN
Aの存在を表しており、従って該タンパク質をコードする遺伝子からの転写物の
発現と相関性を有しているということを表している。
本明細書において、配列番号:2のポリヌクレオチドにおける「変異」は、ハ
イブリダイゼーションアッセイを用いて検出され得る欠失、挿入、及び点変異を
含む、HCORをコードするポリヌクレオチドの配列における変化を含む。この
定義に含まれる変異は、(例えば、配列番号:2とハイブリダイズし得る制限断
片長の多形性のパターンの変化による)HCORをコードするゲノムのDNA配
列に対する変異の検出、(例えばアレル特異的オリゴヌクレオチドプローブを用
いる)ゲノムDNAのサンプルと配列番号:2の選択された断片とがハイブリダ
イズ不可能であること、及び(例えば中期染色体展開物との蛍光in situハイブ
リダイゼーション(FISH)を用いた)HCORをコードするポリヌクレオチド配
列に対する正常な遺伝子座以外の遺伝子座とのハイブリッド形成のような、不適
当な或いは予期していないハイブリダイゼーションによって検出される。
本明細書において、用語「抗体」は、そのままの抗体分子及び、例えば抗原決
定基と結合し得るFa、F(ab')2、及びFvのようなその断片である。HCORポリ
ペプチドに結合する抗体は、そのままのポリペプチド、或いは免疫化する抗原と
しての目的の小型のペプチドを含む断片を用いて調製することができる。動物を
免疫するのに用いられるポリペプチドまたはペプチドは、翻訳されたcDNAま
たは化学的合成物を起源とするものであり得、必要ならば担体タンパク質と結合
することができる。ペプチドに化学的に結合する通常用いられる担体には、ウシ
血清アルブミン及びサイログロブリンが含まれる。次にこの結合したペプチドを
用いて動物(例えばマウス、ラット、またはウサギ)を免疫する。
本明細書において、用語「ヒト化抗体」は、元の結合能力をそのまま保持しつ
つ、ヒトの抗体により近づけるために非抗体結合領域においてアミノ酸を置換し
た抗体分子である。
発明
本発明は、新規なヒトC5a様受容体(HCOR)の発見、HCORをコード
するポリヌクレオチド、及び補体の活性化が関係する疾病の診断、予防、又は治
療のためのこれらの物質の使用に基づくものである。
本発明のヒトHCORをコードする核酸は、胸腺組織cDNAライブラリー(
THYMNOT02)を起源とするインサイト社クローンNo.346874においてアミノ酸
配列アライメントのコンピュータ検索によって初めに同定された。コンセンサス
配列の配列番号:2は、インサイト社クローンNo.346874(THYMNOT02)の核
酸配列の延長によって構成されたものである。
或る実施例では、本発明は、第1A図、第1B図、第1C図、及び第1D図に
示すような配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチドを包含する。HCO
Rは319個のアミノ酸からなる長さを有し、ヒトC5a受容体(GI 115626;
配列番号:3)と化学的及び構造的相同性を有する。詳述すると、HCORとヒ
トC5a受容体(GI 115626)は25%の配列同一性を共有している。HCOR
とヒトC5a受容体(GI115626)はGタンパク質共役受容体サインモチーフ(G-pro
tein-coupled receptor signature motif)を有しており、これはHCORのL(
100番)〜L(116番)の領域と、ヒトC5a受容体(GI 115626)のY(121番)
〜V(138番)領域において認められる。疎水性プロット第3A図及び第3B図
に示すように、HCORとヒトC5a受容体は共にGタンパク質共役受容体ファ
ミリーの特徴である7つの高度に疎水性のドメインを有する。
また本発明はHCOR変異体を包含する。好適なHCOR変異体は、HCOR
アミノ酸配列(配列番号:1)と80%以上、好ましくは90%
以上のアミノ酸配列同一性を有するものである。最も好適なHCOR変異体は、
配列番号:1と95%以上のアミノ酸配列同一性を有するものである。
また本発明は、HCORをコードするポリヌクレオチドを包含する。従ってH
CORのアミノ酸配列をコードする任意の核酸配列を用いて、HCORを発現す
る組換え分子をつくり出すことができる。特定の実施例では、本発明は、第1A
図、第1B図、第1C図、及び第1D図に示すような配列番号:2の核酸配列を
含むポリヌクレオチドを包含する。
当業者には理解されるように、遺伝暗号の縮重の結果、任意の既知の自然発生
遺伝子のヌクレオチド配列と最小限の相同性しか有していないものも含めて、多
種のHCORコーディングヌクレオチド配列が作り出され得る。本発明は、可能
なコドン選択に基づく組み合わせを選択することにより作り出され得る、全ての
可能な核酸配列の変異をその範囲に含んでいる。それらの組み合わせは、自然発
生のHCORのヌクレオチド配列に適用されるような標準的なトリプレット遺伝
暗号に基づいて作り出されるものであり、このような全ての変異は、ここに具体
的に示されたものと考えられたい。
HCOR及びその変異体をコードするヌクレオチド配列は、適切に選択された
厳密性の条件の下で自然発生配列のヌクレオチド配列とハイブリッド形成可能な
ものであるのが好ましいが、実質的に異なるコドンの使用頻度を有するHCOR
又はその変異体をコードするヌクレオチド配列を作り出すことは有益であり得る
。コドン選択は、特定のコドンが宿主によって使用される頻度に従って、特定の
原核細胞又は真核細胞の発現宿主におけるペプチド発現の発生率を高めるように
選択することができる。HCOR及びその誘導体をコードするヌクレオチド配列
を、コードされるアミノ酸配列を変えないように実質的に変更する理由は、例え
ば自然発生配列から作り出される転写物より長い半減期のような、より望ましい
特性を有するRNA転写物を作り出すためである。
本発明の範囲には、HCOR又はその誘導体をコードするDNA配列又はその
一部の、完全な合成ケミストリによる作製も含まれる。作製したこの合成遺伝子
を、この出願時点において周知の試薬を用いて任意の入手可能なDNAベクター
及び細胞系に挿入することができる。更に、合成ケミストリを用いてHCORを
コードする配列又はその任意の一部分に突然変異を誘発させることができる。
また本発明の範囲に含まれるものとして、種々の厳密性の条件の下で請求項に
記載のヌクレオチド配列、特に配列番号:2のヌクレオチド配列とハイブリダイ
ズし得るポリヌクレオチド配列がある。ハイブリダイゼーション条件は、Wahl,G
.M.及びS.L.Berger(1987;Methods Enzymol.152:399-407)及びKimmel,A.R.(1987
;Methods in Enzymol.152:507-511)に記載されているように、核酸結合複合体ま
たはプローブの融解温度(Tm)に基づいており、規定の厳密性において用いら
れ得る。
本発明の範囲に含まれるHCORをコードする変異核酸配列は、異なるヌクレ
オチド残基の欠失、挿入並びに置換を含み、結果的に同一の、または機能的に等
価のHCORポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとなるものである。コ
ードされたタンパク質も、サイレント変化を生ずるアミノ酸残基の欠失、挿入並
びに置換を含み、結果的に機能的に等価なHCORとなる。意図的な(delibera
te)アミノ酸置換は、HCORの生物学的活性が保持される限りにおいて、残基
の極性、電荷、溶解度、疎水性、親水性並びにまた両親媒性についての類似性に
基づいてなされ得る。例えば負に荷電したアミノ酸にはアスパラギン酸及びグル
タミン酸が含まれ、正に荷電したアミノ酸にはリジン及びアルギニンが
含まれ、近い親水性値を持つ荷電していない極性頭基を有するアミノ酸には、ロ
イシン、イソロイシン、バリン、グリシン、アラニン、アスパラギン、グルタミ
ン、セリン、スレオニン、フェニルアラニン並びにチロシンが含まれる。
更に本発明の範囲に含まれるものとして、HCORのアレルがある。ここで用
いる「アレル」或いは「アレル配列」とは、HCORの対立形である。アレルは
変異、すなわち核酸配列の変化によって生じ、一般に変異したmRNA或いはポ
リペプチドを生成するが、そのmRNA或いはポリペプチドの構造或いは機能は
、変わる場合もあれば変わらない場合もある。遺伝子によっては、アレル形が存
在しないもの、1つ存在するもの、或いは多数存在するものがある。一般にアレ
ルを生じる変異はアミノ酸の自然な欠失、付加並びに置換に起因する。このタイ
プの変化はそれぞれ単独で、或いは他の変化と同時に、与えられた配列内で1又
は2回以上生じ得る。
当業者が一般に利用可能な周知のDNA配列決定のための方法が、本発明の実
施において用いられ得る。この方法では酵素、例えばDNAポ
Cleveland OH)、Taqポリメラーゼ(Perkin Elmer)、熱安定性T7ポリメラーゼ
(Amersham,Chicago IL)、或いはGibco BRL(Gaithersburg MD)Methods社から市
販されているELONGASE増幅システムのような校正エキソヌクレアーゼと組換え体
ポリメラーゼとの組み合わせのような酵素を使用する。この処理は、Hamilton M
icro Lab2200(Hamilton,Reno,NV)、Peltier Thermal Cycler(PTC200;MJ Res
erch,Watertown MA)並びにABI377 DNAシーケンサ(Perkin Elmer)のような装
置を用いて自動化するのが好ましい。
HCORをコードする核酸配列は、部分的なヌクレオチド配列と、プ
ロモーター及び調節エレメントのような上流配列を検出するための当業者には周
知の様々な方法とを用いて伸長させることができる。例えば、用いることができ
る或る方法、即ち「制限部位」PCR法では、汎用プライマーを用いて既知の座
位に隣接する未知の配列を得る(Sarkar,G.(1993)PCR Methods Applic 2:318-32
2)。詳述すると、まずゲノムDNAを、既知の領域に対して特異的なプライマ
ー及びリンカー配列に対するプライマーの存在下で増幅する。増幅された配列を
、その同じリンカープライマー及び最初のプライマーの内部に含まれる別の特異
的プライマーを用いてPCRの2巡目にかける。PCRの各回の生成物を、適切
なRNAポリメラーゼを用いて転写させ、逆転写酵素を用いて配列決定する。
逆PCR法を用いて、既知領域に基づく多様なプライマーを利用した配列の増
幅、または伸長を行うことができる(Triglia,T.等(1988)Nucleic Acids Res
16:8186)。プライマーは、OLIGO 4.06(National Biosciences社,Plymouth MN
)や別の適切なプログラムを用いて、長さが22〜30ヌクレオチドで、50%
以上のGC含量を有し、かつ約68〜72℃の温度で標的配列にアニールするよ
うに設計される。この方法ではいくつかの制限酵素を用いて遺伝子の既知領域の
適当な断片を作り出す。次にこの断片を分子内ライゲーションにより環状にし、
PCR用の鋳型として使用する。
使用できる別の方法はキャプチャPCR法であり、この方法ではヒト及び酵母
菌人工染色体DNA内の既知の配列に隣接するDNA断片をPCR増幅する(La
gerstrom,M.等(1991)PCR Methods Applic 1:111-119)。この方法では、PC
R処理の前に、DNA分子の未知の部分に、複数の制限酵素による消化及びライ
ゲーションによって組換え二本鎖配列を配置しておいてもよい。
未知の配列を得るために用いることができる別の方法は、Parker,J.D.等の方
法(1991;Nucleic Acids Res 19:3055-3060)である。更に、PCR、ネスト化
プライマー、PromoterFinderTMライブラリーを用いて、ゲノムDNA内歩行を行
うことができる(Clontech,Palo Alto CA)。このプロセスは、ライブラリーを
スクリーニングする必要がなく、イントロン/エクソン接合部を探し出すのに有
用である。
完全長cDNAをスクリーニングするときに好適なライブラリーは、サイズ選
択された、より大きなcDNAを含むライブラリーである。またランダムプライ
ミングした(rondom primed)ライブラリーは、遺伝子の5’及び上流領域を含
む配列をより多く含むという点で好適である。ランダムプライミングしたライブ
ラリーは、オリゴd(T)ライブラリーで完全長cDNAが得られない場合に特
に有用である。またゲノムライブラリーは、5’及び3’非翻訳領域への配列の
伸長のために役立ち得る。
配列決定やPCRの産物のヌクレオチド配列をサイズ分析したり確認するため
には、市販のキャピラリー電気泳動システムを用いることができる。詳述すると
、キャピラリーシークエンシングでは、電気泳動による分離のための流動性ポリ
マー、レーザーで活性化される4つの異なる蛍光色素(各ヌクレオチドに対して
1つ)を使用し、CCDカメラにより放射線の波長の検出を行う。出力/光強度
は適切なソフトウエア(例えばPerkin elmer製のGenotyperTM及びSequence Navi
gatorTM)を用いて電気信号に変換され、サンプルの負荷からコンピュータ解析
及び電子データ表示までの全過程がコンピュータ制御される。キャピラリー電気
泳動法は、特定のサンプル内に限られた量だけ存在するDNA小片の配列決定に
特に適している。
本発明の別の実施例では、HCOR、融合タンパク質或いはその機能
的等価物をコードするポリヌクレオチド配列を、適切な宿主細胞内でのHCOR
の発現を誘導する組換えDNA分子において用いることができる。遺伝暗号固有
の縮重のために、同一か機能的に等価なアミノ酸配列を実質的にコードする他の
DNA配列も、HCORのクローニングや発現のために用いることができる。
当業者には理解できるように、非自然発生コドンを有するHCORコードディ
ングヌクレオチド配列を作り出すことは有益であり得る。特定の原核細胞或いは
真核細胞の宿主において選好されるコドンを選択して、例えば、HCOR発現率
を増大させたり、或いは自然発生配列から生成された転写物より長い半減期のよ
うな望ましい特性を有する組換えRNA転写物を生成することができる。
本発明のヌクレオチド配列は、様々な目的、例えば、以下のものに限定はしな
いが遺伝子産物のクローニング、プロセシング及び/又は発現を変えるようにH
CORをコードする配列を改変するために既知の方法を用いて組換えることがで
きる。無作為断片によるDNA再編成や遺伝子断片のPCR再会合及び合成オリ
ゴヌクレオチドを用いて、ヌクレオチド配列を組換えることができる。例えば、
特定部位突然変異誘発のような当業者には周知の技術を用いて突然変異を誘発さ
せることによって、新しい制限部位の挿入、グリコシル化パターンの変更、コド
ン選好の変化、スプライスバリアントの生成等をもたらすことができる。
本発明の別の実施例では、そのままのHCORコーディング配列、変異HCO
Rコーディング配列、又は組換えHCORコーディング配列を異種の配列に結合
して、融合タンパク質をコードする配列にする。例えば、HCOR活性のインヒ
ビターをペプチドライブラリーからスクリーニングする場合、市販の抗体により
認識される異なるペプチドを発現するキメラHCORタンパク質をコードするこ
とが役立つ。融合タンパク
質はHCOR配列と異種のタンパク質配列との間の位置に切断部位を有するよう
に設計することもでき、これによってHCORを切断して、ヘテロの部分から分
けて精製することが可能となる。
本発明の別の実施例では、当業者によく知られた化学的方法(Caruthers.M.H.
等(1980)Nuc Acids Res Symp Ser7:215-223;Horn,T.等(1980)Nucl.Acids Res
Symp.Ser.225-232参照)を用いて、HCORコーディング配列の全体、或いはそ
の一部を合成することができる。別法では、化学的方法を用いてタンパク質自体
を作り出して、HCORアミノ酸配列の全体或いはその一部を合成することがで
きる。例えば、種々の固相技術(Roberge,J.Y.等(1995)Science 269:202-204)
でペプチド合成を行うことができ、合成の自動化は、例えばABI 431Aペプチドシ
ンセサイザ(Perkin Elmer)を用いることにより達成することができる。
この新たに合成されたペプチドは、分離用高速液体クロマトグラフィにより実
質的に精製することができる(例えばCreighton T.(1983)Proteins Structure And Molecular Principles
,WH Freeman and Co.,NY参照)。合成されたペプチ
ドの構成は、アミノ酸解析或いはシークエンシングにより確認することができる
(例えばエドマン分解法;Creighton,上述)。さらにHCORのアミノ酸配列
或いはその任意の部分を、その直接の合成の際の改変することにより、及び/又
は化学的方法を用いた他のタンパク質或いはその任意の部分に由来する配列との
結合することによって変異体ポリペプチドを作ることができる。
生物学的に活性なHCORを発現させるために、HCORコーディングヌクレ
オチド配列或いはその機能的等価物を、適切な発現ベクター、すなわち挿入され
たコーディング配列の転写及び翻訳に必要な要素を含むベクターに挿入する。
HCORコーディング配列及び適切な転写や翻訳の調節領域を含む発現ベクタ
ーを作製するために当業者に周知の方法が用いられる。これらの方法には、in v
itro組換えDNA技術、合成技術、並びにin vivo組換え技術、又は遺伝子組換
え技術が含まれる。このような技術は、Sambrook,J.等(1989)Molecular Cloning ,A Laboratory Manual
,Cold Spring Harbor Press,Planview NY及びAusubel,F.M
.等Current Protocol in Molecular Biology,John Wiley & Sons,New York NYに
記載されている。
種々の発現ベクター/宿主系を、HCORコーディング配列を保持し、かつ発
現するために利用することができる。このようなものには、以下のものに限定は
されないが、組換えバクテリオファージ、プラスミド或いはコスミドDNA発現
ベクターで形質転換した細菌のような微生物や、酵母菌発現ベクターで形質転換
した酵母菌や、ウイルス発現ベクター(例えばバキュロウイルス)を感染させた昆
虫細胞系や、ウイルス発現ベクター(例えばカリフラワーモザイクウイルスCaMV
、タバコモザイクウイルスTMV)をトランスフェクトした、或いは細菌の発現ベ
クター(例えばTi、或いはpBR322プラスミド)で形質転換した植物細胞系や、或
いは動物細胞系が含まれる。
これらの系の「調節領域」或いは「制御配列」は、転写及び翻訳を実行するた
めに宿主細胞のタンパク質と相互作用するベクターの非翻訳領域、即ちエンハン
サー、プロモーター及び3’非翻訳領域である。このようなエレメントの、強さ
及び特異性は様々であり得る。利用されるベクター及び宿主に応じて、構成的及
び誘導的プロモーターを含む任意の数の適切な転写及び翻訳エレメントを用いる
ことができる。例えば、細
(Stratagene,LaJolla CA)のハイブリツドlacZプロモーター及び
ptrp-lacハイブリッド等のような誘導的プロモーターを用いることができる。バ
キュロウイルスポリヘドリンプロモーターは昆虫細胞において用いることができ
る。植物細胞のゲノムに由来するプロモーター或いはエンハンサ(例えば熱ショ
ック遺伝子,RUBISCO及び貯蔵タンパク質遺伝子)、若しくは植物ウイルスに由来
するプロモーター或いはエンハンサ(例えばウイルス性プロモータ或いはリーダ
ー配列)を、ベクターにクローン化してもよい。哺乳動物細胞では、哺乳類遺伝
子或いは哺乳類ウイルス由来のプロモーターが最適である。HCORをコードす
る配列の多数の複製を含む株細胞を作る必要がある場合には、SV40或いはEBVに
基づくベクターを適切な選択マーカーと共に用いる。
細菌系では、HCORの用途に応じて多数の発現ベクターを選択することがで
きる。例えば抗体誘発のために大量のHCORが必要とされる場合は、容易に精
製される融合タンパク質を高レベルで発現できるベクターが望ましい。そのよう
なベクターには、以下のものに限定はしない
(Stratagene)(このベクターでは、HCORをコードする配列を、アミノ末端
メチオニン及び後続のβ−ガラクトシダーゼの7残基の配列を備えたフレーム内
においてベクターに結合してハイブリッドタンパク質を生成できる)や、pINベ
クター(Van Heeke,G.及びS.M.Schuster(1989)J.Biol.Chem.264:5503-5509)
等が含まれる。またpGEXベクター(Promage、Madison WI)も、グルタチオンS
−トランスファーゼ(GST)を有する融合タンパク質として異種ポリペプチドを
発現するため用いることができる。一般に、そのような融合タンパク質は可溶性
であり、グルタチオンアガロースビーズへ吸着させた後、遊離グルタチオンの存
在下で溶出させることにより溶解した細胞から容易に精製できる。その系におい
て生成されたタンパク質は、ヘパリン、トロンビン或
いはXA因子プロテアーゼ切断部位を含めて、目的のクローン化ポリペプチドを
GST部分から随意に放出させることができるように設計される。
酵母菌、サッカロミセスセレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)では、α因
子、アルコールオキシダーゼ及びPGHのような構成的或いは誘導的プロモーター
を含む多数のベクターを用いることができる。その概要を知るには、Ausubel等
(前出)及びGrant等(1987)Methods Enzymol 153:516-544を参照されたい。
植物発現ベクターを用いる場合には、HCORをコードする配列の発現は、多
数のプロモーターの何れかで促進される。例えばCaMVの35S及び19Sプロモーター
のようなウイルスのプロモーターを、単独で、或いはTMV(Takamatsu,N.等(198
7)EMBO J 6:307-311)由来のオメガリーダー配列と共に用いることができる。
別法として、RUBISCOの小サブユニット、或いは熱ショックプロモーターのよう
な植物プロモーターが用いてもよい(Coruzzi,G.等(1984)EMBO J 3:1671-1680
);Broglie,R.等(1984)Science 224:838-843;及びWinter,J.等(1991)Resul
ts Probl.Cell Differ.17:85-105)。これらの構成は、直接のDNA形質転換
或いは病原体によるトランスフェクションにより植物細胞内に導入できる。この
ような技術の種々の一般に入手可能な文献に記載されている(Hobbs,S.又はMurry
,L.E.McGraw Hill Yearbook of Science and Technology(1992)McGraw Hill N
Y,pp191-196を参照されたい)。
HCORの発現のために用いることができる別の発現系は昆虫系である。その
ような系の一つでは、Spodoptera frugiperda細胞或いはTrichoplusiaの幼虫に
おいて外来遺伝子を発現するためのベクターとして、Autographa californica核
多角体病ウイルス(AcNPV)が用いられる。HCORをコードする配列は、ポリ
ヘドリン遺伝子のようなウイル
スの非必須領域にクローニングされ、ポリヘドリンプロモーターの制御下に置か
れ得る。HCORコーディング配列の挿入が成功すると、ポリヘドリン遺伝子が
不活性になり、コートタンパク質膜が欠如した変異体ウイルスが生成される。次
に、この変異体ウイルスを用いて、S.frugiperda細胞或いはTrichoplusiaの幼虫
へ感染させ、その中でHCORが発現される(Engelhard,E.K.等(1994)Proc.N
atl.Acad.Sci.91:3224-3227)。
哺乳類宿主細胞では、多数のウイルス性発現系を利用することができる。発現
ベクターとしてアデノウイルスが用いられる場合には、HCORをコードする配
列は、後期プロモータ及び三連リーダー配列からなるアデノウイルス転写物/翻
訳物複合体内に結合され得る。ウイルスのゲノムの非必須E1又はE3領域へ挿入す
ることにより、感染した宿主細胞でHCORを発現できる生ウイルスになる(Lo
gan,J.及びShenk,T.(1984)Proc.Natl.Acad.Sci.81:3655-3659)。さらに、哺
乳類宿主細胞内の発現を増加させるためにラウス肉腫ウイルス(RSV)エンハン
サのような転写エンハンサを用いることができる。
また、HCOR配列の効率的な翻訳のためには、特定の開始シグナルも必要で
ある。これらのシグナルには、ATG開始コドン及び隣接する配列が含まれる。H
COR及びその開始コドン及び上流配列が適切な発現ベクター内に挿入される場
合には、翻訳制御シグナルを加える必要はない。しかしながらコーディング配列
又はその一部のみが挿入される場合には、ATG開始コドンを含む外来の翻訳制御
シグナルを与えなければならない。さらに、全インサートの転写が確実に行われ
るようにするために、開始コドンは正しい読み枠に存在しなければならない。外
来転写エレメント及び開始コドンは、自然及び合成両方の様々な起源に由来する
ものであり得る。発現の効率は、その細胞系に適切なエンハンサーを含
めることにより高めることができる(Scharf,D.等(1994)Results Probl.Cell Dif
fer.20:125-162)。
さらに宿主細胞株は、挿入された配列の発現を調節したり、発現したタンパク
質を望ましい形にプロセシングする能力で選択される。このようなポリペプチド
の修飾には、以下のものに限定はしないが、アセチル化、カルボキシル化、グリ
コシル化、リン酸化、脂質化(lipidation)並びにアシル化が含まれる。またタ
ンパク質の「プレプロ」部分を切り離す翻訳後プロセシングも、正しい挿入、折
り畳み、及び/又は機能の発揮のために重要である。CHO、HeLa、MDCK、293、WI
38等のような異なる宿主細胞は、そのような翻訳後の活動のための特定の細胞装
置及び特徴的な機構を有しており、導入される異種タンパク質の修飾やプロセシ
ングが確実に行われるように選択され得る。
長期間にわたって変異体タンパク質の高収率の産生を確保するためには安定し
た発現が望ましい。例えば、ウイルスの複製起源や内在性発現エレメント及び選
択マーカー遺伝子を含む発現ベクターを用いて、HCORを安定的に発現する株
細胞を形質転換し得る。ベクターの導入の後、細胞を、選択培地に切り替える前
に濃縮培地内で1〜2日間増殖させる。選択マーカーの目的は、選択のための耐
性を与え、その存在によって導入された配列をうまく発現する細胞を増殖、回収
できるようにすることである。安定的に形質転換された細胞の耐性凝集塊は、そ
の細胞型に適した組織培養技術を用いて増殖することができる。
形質転換された株細胞を回収するために任意の数の選択系を用いることができ
る。選択系には、以下のものに限定はしないが、単純ヘルペスウイルスチミジン
キナーゼ(tk)(Wigler,M.等(1977)Cell 11:223-32)及びアデニンホスホリ
ボシルトランスフェラーゼ(aprt)(Lowy,I.等(1980)Cell 22:817-23)遺伝子
が含まれ、それぞれtk及びaprt細
胞において用いられる。また代謝拮抗物質、抗生物質或いは除草剤への耐性を選
択の基礎として用いることができる。例えばdhfrはメトトレキセートに対する耐
性を与え(Wigler,M.等(1980)Natl Acad Sci 77:3567)、nptはアミノ配糖体のネ
オマイシン及びG-418に対する耐性を与え(Colberre-Garapin,F.等(1981)J Mo
l Biol 150:1)、als或いはpatはクロルスルフロン(chlorsulfuron)、ホスフ
ィノトリシンアセチルトランスフェラーゼ(phosphinotricin acetyltransferas
e)に対する耐性を与える(Murry,前出)。さらに選択に利用できる遺伝子とし
て、例えば細胞がトリプトファンの代わりにインドールを利用できるようにする
trpB、細胞がヒスチジンの代わりにヒスチノール(histinol)を利用できるよう
にするhisDが文献に記載されている(Hartman,S.C.及びR.C.Mulligan(1988)Pr
oc.Natl.Acad.Sci.85:8047-51)。最近になって、形質転換体を特定するためば
かりではなく、特定ベクター系による一過性の或いは安定的なタンパク質発現の
量を定量するために広く用いられる、例えばアントシアニン、β−グルクロニダ
ーゼ及びその基質、GUS、及びルシフェラーゼ及びその基質、ルシフェリンのよ
うな可視マーカーがよく利用されるようになった(Rhodes,C.A.等(1995)Methods
Mol.Biol.55:121-131)。
マーカー遺伝子発現の存在/不存在によって目的の遺伝子の存在も示されるが
、その存在及び発現は確認すべきである。例えばHCORをコードする配列がマ
ーカー遺伝子配列内に挿入された場合は、HCORをコードする配列を含む組換
え体細胞をマーカー遺伝子の機能の存在により確認できる。別法では、マーカー
遺伝子をHCORをコードする配列と直列に配置して、両者が単一プロモータの
制御下となるようにすることができる。誘導に応じてのマーカー遺伝子の発現、
つまり選択は、通常直列に配置された配列の発現をも同時に示すことになる。
この他当業者には周知の様々な方法により、HCORのコーディング配列を含
みHCORを発現する宿主細胞を識別できる。このような方法には、以下のもの
に限定はしないが、DNA-DNA或いはDNA-RNAハイブリダイゼーション及び、核酸及
びタンパク質を検出及び/又は定量するための膜ベース、溶液ベース或いはチッ
プベースの技術を含むタンパク質バイオアッセイ或いはイムノアッセイが含まれ
る。
HCORをコードする配列のプローブ、一部、或いは断片を用いるDNA-DNA又
はDNA-RNAハイブリダイゼーション若しくは増幅により、HCORポリヌクレオ
チド配列の存在を検出することができる。核酸増幅に基づくアッセイでは、HC
ORをコードするDNA或いはRNAを含む形質転換体を検出するために、核酸配列に
基づくオリゴヌクレオチド或いはオリゴマーを用いる。本明細書において「オリ
ゴヌクレオチド」或いは「オリゴマー」とは、プローブ或いは、PCRで増幅さ
れるセグメントであるアンプリマーとして用いることができる核酸配列であって
、長さが約10ヌクレオチド以上、最大60ヌクレオチド程度、好適には15〜
30ヌクレオチド、より好適には20〜25ヌクレオチドであるものを指す。
このタンパク質に特異的なポリクローナル抗体及びモノクローナル抗体のいず
れかを用いてHCORポリペプチドの発現を検出し、測定するための種々のプロ
トコルが当業者には周知である。このようなプロトコルの例には、酵素結合免疫
検定法(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)及び蛍光表示式細胞分取器法(FACS
)を含まれる。HCORポリペプチド上で2つの非干渉なエピトープに対して反
応するモノクローナル抗体を利用する二部位モノクローナルベースイムノアッセ
イ(two-site,monoclonal-based immunoassay)が好適であるが、競合的結合ア
ッセイも用いられる。これらアッセイの並びに他のアッセイは、他の文献、
Hampton,R.等(1990;Serological Methods,a Laboratory Manual,APS Press,St.
Paul MN)及びMaddox,D.E.等(1983,J.Exp.Med.158:1211-1216)に記載されてい
る。
さらに多くの標識及び結合技術が当業者には周知であり、種々の核酸及びアミ
ノ酸のアッセイにおいて用いることができる。近縁な配列を検出するための、標
識されたハイブリダイゼーションプローブやPCRプローブを作成するための手
段には、オリゴ標識、ニックトランスレーション法、末端標識、或いは標識ヌク
レオチドを用いるPCR増幅などが含まれる。別法としては、HCORコーディ
ング配列、或いはその任意の部分を、mRNAプローブの作成のためのベクター
にクローン化する。そのようなベクターは当分野では周知で、市販されており、
例えばT7、T3、或いはSP6のような適切なRNAポリメラーゼ及び標識されたヌ
クレオチドを加えることにより、in vitroでRNAプローブを合成するために用
いることができる。これらの方法は、種々の市販のキット(Pharmacia Upjohn(
Kalamazoo,MI);Promega(Madison WI);及びU.S.Biochemical Corp.(Clevel
and OH))を用いて実行することができる。適切なリポーター分子、すなわち標
識には、放射性核種、酵素、フルオレセント(蛍光剤)、化学発光剤或いは色素
剤や、基質、補助因子、インヒビター、磁気粒子等が含まれる。
HCORをコードするヌクレオチド配列で形質転換された宿主細胞を、コード
されたタンパク質を細胞培地で発現させ、そこから回収するのに適した条件下で
培養することができる。組換え体細胞により生成されるタンパク質は、用いられ
る配列及び/またはベクターに応じて、細胞内に分泌、つまり細胞内に含まれる
ようにすることができる。当業者には理解されるように、HCORをコードする
ポリヌクレオチドを含む発現ベクターを、原核細胞か真核細胞の細胞膜を通して
のHCOR分泌を誘
導するシグナル配列を含むように設計することができる。他の組換え体作製物で
は、HCORをコードする配列を、可溶性タンパク質の精製を容易にするポリペ
プチドドメインをコードするヌクレオチド配列に結合することができる。そのよ
うな精製を容易にするドメインには、以下のものに限定はしないが、固定化金属
上での精製を可能にするヒスチジントリプトファンモジュールのような金属キレ
ートペプチド、固定化免疫グロブリン上での精製を可能にするプロテインAドメ
イン、並びにFLAGS伸長/アフィニティ精製システムにおいて用いられるドメイ
ン(Immunex Corp.,Seattle WA)が含まれる。精製ドメインとHCORの間にX
A因子或いはエンテロキナーゼ(Invitrogen,San Diego CA)に対して特異的な
配列のような切断可能なリンカー配列を含めるのは精製を促進するのに役立つ。
HCORをコードする配列とともに、6個のヒスチジン残基、それに続くチオレ
ドキシン及びエンテロキナーゼ切断部位をコードする核酸配列を含むこのような
発現ベクターの1つは、融合タンパク質を発現する。ヒスチジン残基がIMIAC(Po
rath,J等(1992;Protein Exp.Purif.3:263-281)に記載のような固定化金属イオン
アフィニティクロマトグラフィー)精製を促進するとともに、エンテロキナーゼ
切断部位が融合タンパク質からのHCORの精製のための手段となる。融合タン
パク質を含むベクターについての解説は、Kroll,D.J.等(1993;DNA Cell Biol.1
2:441-453)に記載されている。
組換え体の産生に加えて、HCORの断片を、固層技術を用いた直接のペプチ
ド合成で形成することもできる(Merrifield J.(1963)J.Am.Chem.Soc.85:2149-2
154参照)。in vitroタンパク質合成は手作業で行えるが、自動化することもで
きる。自動的な合成は、例えば、Applied Biosystem 431Aペプチドシンセサイザ
(Perkin Elmer)を用いて行うことができる。HCORの種々の断片を個別に化
学的に合成し、化学的
方法を用いて結合して完全長分子を作り出してもよい。
治療
HCOR(配列番号:1)とヒトC5a受容体(配列番号:3)との間の化学
的及び構造的相同性に基づき、HCORは炎症において一定の役割を果たしてい
ると考えられる。
従って、或る実施例では、炎症反応が低下した患者において炎症反応を誘導す
るために、HCOR又はその断片若しくは誘導体を投与し得る。炎症反応の減少
は、以下に限定されないが、補体不全症、免疫不全症、及び創傷治癒の障害を含
む種々の状態の結果生じ得る。
別の実施例では、上述のような何れかの状態の治療のために炎症反応を誘導す
るために、HCOR又はその断片若しくは誘導体を発現し得るベクターを患者に
投与することもできる。
別の実施例では、炎症の予防のために、HCORのアンタゴニスト又はインヒ
ビターを患者に投与し得る。炎症のタイプには、以下に限定されないが、脳の脱
髄及び神経変性;アレルギー反応、喘息及び成人呼吸窮迫症候群、関節リウマチ
、全身性エリテマトーデス、腎炎のような自己免疫疾患;及びクローン病;虚血
後心筋炎及び壊死、皮膚病;敗血症性ショック、及び癌、血液透析及び体外循環
、感染症及び外傷の炎症性合併症が含まれ得る。或る態様では、HCORに特異
的な抗体をアンタゴニストとして直接的に用いたり、或いはHCORを発現する
細胞又は組織に薬物を送達するためのターゲティング又はデリバリー機構として
間接的に用いることができる。
別の実施例では、上述の炎症性疾患の何れかによって生ずる炎症の治療又は予
防のために、HCORをコードするポリヌクレオチドのアンチセンスを発現する
ベクターを患者に投与し得る。
他の実施例では、上述のような治療用のタンパク質、アンタゴニスト、抗体、
アゴニスト、アンチセンス配列又はベクターの何れかを、他の適切な薬物と組み
合わせて投与することができる。当業者であれば、併用療法において使用するた
めの適切な薬剤を、従来の薬学の原理に基づいて選択することができよう。治療
薬を組み合わせることにより、上述の種々の疾患の治療又は予防についての相乗
作用を与え得る。この方法を用いることにより、より低い投与量の各薬剤で同じ
治療効果を達成することができ、これにより副作用を低下させることができる。
HCORのアンタゴニスト又はインヒビターは、周知の方法を用いて製造する
ことができる。詳述すると、精製されたHCORを用いて、抗体を製造したり、
薬物のライブラリーからHCORに特異的に結合するものを選別することができ
る。
抗体は当分野において周知の方法を用いて生成することができる。このような
抗体には、以下のものに限定されないが、ポリクローナル抗体、モノクローナル
抗体、キメラ抗体、一本鎖抗体、Fabフラグメント、及びFab発現ライブラリーに
より生成されたフラグメントが含まれる。中和抗体(即ち二量体形成を阻害する
抗体)は治療的使用には特に好適である。
抗体を産生するため、HCOR或いは免疫学的特性を保持するその任意の一部
、断片或いはオリゴペプチドを注射することによって、ヤギ、ウサギ、ラット、
マウス等を含む種々の宿主を免疫することができる。宿主の種に応じて、種々の
アジュバントを免疫学的反応を増強するために用いることができる。そのような
アジュバントには、以下のものに限定はしないが、フロイントのアジュバント、
水酸化アルミニウムのような無機質ゲルアジュバント、リゾレシチンのような界
面活性物質アジュバント、プルロニックポリオールアジュバント、ポリアニオン
アジュバ
ント、ペプチドアジュバント、油性乳剤アジュバント、キーホールリンペットヘ
モシニアンアジュバント並びにジニトロフェノールアジュバントが含まれる。B
CG(カルメット‐ゲラン杆菌)及びコリネバクテリウム−パルヴム(Coryneba
cterium parvum)は有用なヒトアジュバントである。
好ましくは、HCORに対する特異的抗体を誘発するために用いられるペプチ
ドは、5個以上のアミノ酸、より好ましくは10個以上のアミノ酸からなるアミ
ノ酸配列を有し得る。また好ましくは、これらの配列は、自然タンパク質のアミ
ノ酸配列の一部と同一であり、小形の自然発生の分子の全アミノ酸配列を含んで
いてもよい。HCORアミノ酸の短いストレッチを、キーホールリンペットヘモ
シアニン及びキメラ分子に対して産生された抗体のような他のタンパク質の配列
に融合してもよい。
HCORのモノクローナル抗体は、培地内の連続株細胞によって抗体分子を産
生する任意の技術を用いて調製できる。このような技術には、以下のものに限定
はしないが、ハイブリドーマ技術、ヒトB細胞ハイブリドーマ技術、及びEBV
−ハイブリドーマ技術(Kohler,G.等(1975)Nature 256:495-497;Kozbor,D.等(1
983)Immunol Methods 81:31-42;Cote,R.J.等(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.80:202
6-2030;Cole,S.P.等(1984)Mol.Cell Biol.62:109-120)が含まれる。
さらに、適切な抗原特異性並びに生物活性を有する分子を得るための「キメラ
抗体」の産生、即ちヒト抗体遺伝子へのマウス抗体遺伝子の結合のために開発さ
れた技術が用いられる(Morrison,S.L.等(1984)Proc.Natl.Acad.Sci.81:6851-68
55;Neuberger,M.S.等(1984)Nature 312:604-608;Takeda,S.等(1985)Natur
e 314:452-454)。別法として、一本鎖抗体の生成のための周知技術を適用して
、HCOR特異的一本鎖抗体を作り出すことができる。近縁な特異性を有するが
、イディオ
タイプの構成が異なる抗体は、無作為の免疫グロブリン組み合わせライブラリー
からの鎖再編成(chain shuffling)により生成することができる(Burton D.R.
(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.88:11120-3)。
また抗体は、リンパ球集団でのin vivo産生を誘導することにより、或いは文
献(Orlandi,R.等(1989),Proc.Natl.Acad.Sci.86:3833-3837;Winter,G.等1991,
Nature 349:293-299)に開示されているような高度に特異的な結合試薬のパネル
や組換え免疫グロブリンライブラリーをスクリーニングすることによっても生成
することができる。
HCORに対する特異結合部位を含む抗体フラグメントも生成することができ
る。このようなフラグメントには例えば、限定はしないが、抗体分子のペプシン
による消化で生成することができるF(ab’)2フラグメントや、F(ab’)2フラグメ
ントのジスルフィド架橋を減らすことにより生成することができるFabフラグメ
ントが含まれる。別法として、所望の特異性を有するモノクローナルFabフラグ
メントを迅速かつ容易に同定できるように、Fab発現ライブラリーを作製しても
よい(Huse,W.D.等(1989)Science 256:1275-1281)。
所望の特異性を有する抗体を同定するための選別のために種々のイムノアッセ
イを用いることができる。確立された特異性を有するモノクローナル抗体或いは
ポリクローナル抗体のいずれかを用いる競合的結合アッセイ或いは免疫放射線測
定法の種々のプロトコルが当分野ではよく知られている。このようなイムノアッ
セイでは、HCORとその特異的抗体との複合体の形成、並びに複合体形成の測
定が行われる。特定のHCORタンパク質上の2つの互いに非干渉なエピトープ
に対して反応するモノクローナル抗体を用いる二部位モノクローナルベースイム
ノアッセイが好適であるが、競合的結合アッセイも用いられる(Maddox,前出)
。
本発明の別の実施例では、HCORをコードするポリヌクレオチド、
またはその任意の断片やアンチセンス配列を、治療目的で用いることができる。
或る態様では、このタンパク質の合成を阻害することが望ましいような状況にお
いて、HCORをコードするポリヌクレオチドに対するアンチセンスを用いるこ
とができる。詳述すると、HCORをコードするポリヌクレオチドに対するアン
チセンス配列で細胞を形質転換することができる。従って、アンチセンス配列を
用いて、HCOR関連の組織損傷を予防したり、遺伝子機能の調節を達成するこ
とができる。このような技術は現在周知となっており、センス又はアンチセンス
オリゴマー、若しくはより大きな断片を、HCORコーディング配列のコード領
域や調節領域の種々の位置から設計することができる。
レトロウイルス、アデノウイルス、ヘルペス或いはワクシニアウイルスに由来
する発現ベクター、或いは種々の細菌性プラスミドに由来する発現ベクターは、
標的の器官、組織、または細胞群へのヌクレオチド配列の送達のために用いられ
る。当業者によく知られた方法を用いて、HCORをコードする配列のアンチセ
ンスを発現する組換えベクターを作り出すことができる。これらの技術はSambro
ok等(上記)及びAusubel等(上記)に記載されている。
所望のHCOR断片を高レベルで発現する発現ベクターを細胞または組織にト
ランスフェクトすることにより、HCORをコードする遺伝子の機能を停止させ
ることができる。このような作製物は、翻訳不可能なセンス配列或いはアンチセ
ンス配列で細胞に導入するために用いることができいる。このようなベクターは
、DNAへ組み込まれない場合ですら、全ての複製物が内在性ヌクレアーゼによ
り分解されるまで、RNA分子を転写し続ける。このような一過性の発現は、非
複製ベクターでも1ヶ月以上、適当な複製エレメントがベクター系の一部である
場合には更に長い期間継続し得る。
上述のように、HCORをコードする配列の制御領域、即ちプロモータ、エン
ハンサ或いはイントロンに対するアンチセンス分子、DNA、RNAまたはPN
Aを設計することにより遺伝子発現を改変することができる。転写開始部位、例
えばリーダー配列の+10〜−10領域の間に由来するオリゴヌクレオチドが好
適である。また、転写産物がリボソームへの結合するのを防止することによりm
RNAの翻訳を阻止するアンチセンス分子も設計される。同様に、「三重らせん
」塩基対合法を用いて阻害を達成することができる。三重らせん対合は、二重ら
せんが十分にほどけないことでポリメラーゼ、転写因子、或いは調節分子が結合
できないようにする。三重らせんDNAを用いた最近の治療法は、文献(Gee,J.
E.等(1994)於Huber,B.E.及びB.I.Carr,Molecular and Immunologic Approaches
,Futura Publishing Co,Mt Kisco NY)に記載されている。
リボザイムはRNAの特異的切断を触媒することができる酵素性RNA分子で
ある。リボザイムの作用機序では、相補的標的RNAへのリボザイム分子の配列
特異的ハイブリダイゼーションが行われ、その後エンドヌクレアーゼによる切断
(endonucleolytic cleavage)がなされる。発明の範囲内には、HCORのエン
ドヌクレアーゼによる切断を特異的かつ効果的に触媒し得る人工合成のハンマー
ヘッド型リボザイム分子も含まれている。
任意のRNA標的可能部分内の特異的なリボザイム切断部位を、初めに、配列
GUA、GUU並びにGUCが後続するリボザイム切断部位に対する標的分子を調べるこ
とによって同定する。一度同定されると、切断部位を含む標的遺伝子の領域に対
応する15〜20個のリボヌクレオチドの間の短いRNA配列を、そのオリゴヌ
クレオチドの機能を停止させる2次構造の特徴について評価することが可能とな
る。候補の標的部分
の適切性も、リボヌクレアーゼ保護アッセイを用いて相補的なオリゴヌクレオチ
ドとのハイブリッド形成に対する接触性をアッセイすることにより評価すること
ができる。
本発明のアンチセンス分子及びリボザイムは、RNA分子を合成するのための
当分野で周知の方法により調製することができる。これらの技術には、固相ホス
ホラミダイト(phosphoramidite)化学合成のようなオリゴヌクレオチドの化学
的合成技術が含まれる。この他、RNA分子を、HCORをコードするDNA配
列のin vivo及びin vitro転写により生成することができる。このようなDNA
配列は、T7或いはSP6のような適切なRNAポリメラーゼプロモーターを有
する多種のベクターに組み込むことができる。更に別の方法として、構成的に或
いは誘導的にアンチセンスRNAを合成するアンチセンスcDNA作成物を、株
細胞、細胞或いは組織内に導入することができる。
RNA分子は細胞内安定性を高め及び半減期を長くするために修飾することが
できる。可能な修飾には、限定はしないが、その分子の5’末端か3’末端、或
いはその両方へのフランキング配列の付加や、分子のバックボーン内においてホ
スホジエステラーゼ結合ではなくホスホロチオネート(phosphorothioate)或い
は2’O−メチルを使用することが含まれる。このコンセプトは、PNA生成固
有のものであり、内在性エンドヌクレアーゼにより容易に認識されないアデニン
、グアニン、シチジン、チミン、及びウリジンの、アセチル−、メチル−、チオ
−形態、及び類似の改変形態とともに、イノシン、キュエオシン(queosine)、
及びワイブトシン(Wybutosine)のような従来あまり用いられなかった塩基を含
めることによって、これら全ての分子に拡張することができる。
細胞或いは組織内にベクターを導入するための方法には、上述の方法が含まれ
、これらの方法は、in vivo、in vitro、及びex vivoの使用に対
しても同様に適切なものである。ex vivo治療法の場合には、患者から採取され
た幹細胞にベクターを導入し、自家移植用のクローンとして増殖して同じ患者に
戻す方法がある。またトランスフェクションによるデリバリー、リポソームによ
るデリバリーは、当分野でよく知られている。
上述の治療法の任意のものは、例えばイヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ウサギ、サル
、及び最も好ましくはヒトのような哺乳類を含む、任意の適切な被験体に適用す
ることができる。
本発明の更に別の実施例は、上述の治療効果のいずれかを発揮させるべく、薬
学的に許容される担体とともに医薬品組成物を投与することに関連する。このよ
うな医薬品組成物は、HCOR、HCORに対する抗体、HCORの擬似物、ア
ゴニスト、アンタゴニスト、又はインヒビターからなるものであり得る。この医
薬品組成物は、単体で、或いは例えば安定剤のような1種以上の他の薬剤と組み
合わせて、任意の無菌の生体適合性製薬用担体に含めて投与される。このような
担体には、限定はしないが、生理食塩水、緩衝食塩水、ブドウ糖或いは水が含ま
れる。これらの分子は、患者に対して、単体で、或いは他の薬品やホルモンと結
合して、賦形剤或いは製薬学的に許容される担体と混合される他の医薬品組成物
に含めて投与され得る。本発明の或る実施例では、製薬学的に許容される担体と
は、製薬学的に不活性なものである。
本発明で用いられる医薬品組成物の投与経路には、以下の経路に限定されない
が、経口投与、静脈内投与、筋肉内投与、動脈内投与、髄内投与、くも膜下内投
与、心室内投与、経皮投与、皮下投与、腹腔内投与、鼻腔内投与、経腸投与、局
所投与、舌下投与、或いは直腸内投与が含まれ得る。
活性成分に加えて、これらの薬品組成物は、薬学的に用いられ得る調合物内へ
の活性化合物の処理を容易にする賦形剤及び補助剤を含む適切
な製薬学的に許容される担体を含み得る。調合或いは投与に関する技術の詳細は
、“Remington's Pharmaceutical Sciences”(Maack Publishing Co,Easton PA)
の最新版において見ることができる。
経口投与用の医薬品組成物は、当分野でよく知られる製薬学的に許容される担
体を用いて適切な剤形に製剤される。このような担体により、薬品組成物は、治
療を受ける患者による経口及び鼻腔摂取のための、錠剤、丸剤、カプセル剤、液
体剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー剤、懸濁液或いは類似の製剤として処方さ
れる。
経口投与するための製剤は、活性化合物と固形の賦形剤とを結合することによ
って得ることができるが、所望に応じて、必要なら適切な補助剤を添加した後、
得られた混合物を粉砕し、顆粒の混合物を処理して、錠剤或いは糖衣剤核を得る
ことができる。適切な賦形剤は、ラクトース、スクロース、マンニトール或いは
ソルビトールを含む砂糖のような糖質或いはタンパク質充填剤、とうもろこし、
小麦、米、じゃがいも等からのでんぷん、メチルセルロース、ヒドロキシプロピ
ルメチルセルロース或いはカルボキシルメチルセルロースナトリウムのようなセ
ルロース、アラビアゴム或いはトラガカントのようなゴム、並びにゼラチン或い
はコラーゲンのようなタンパク質である。必要ならば、架橋結合したポリビニル
ピロリドン、寒天、アルギン酸ナトリウムのようなアルギン酸或いはアルギン酸
ナトリウムや、その塩のような、崩壊剤或いは可溶化剤が加えられる。
糖衣剤核は、濃縮砂糖溶液のような適切な錠皮を与えられるが、溶液はアラビ
アゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カルボポルゲル剤、ポリエチレングリ
コール並びにまた二酸化チタン、ラッカー溶液及び適切な有機溶剤或いは溶剤混
合物が含み得る。錠剤の識別のため、すなわち活性化合物の量、すなわち投与量
を特徴付けるために染料或いは色素
が錠剤或いは糖衣錠皮に加えられてもよい。
経口投与可能な製剤は、ゼラチンからなるプッシュフィットカプセル及びゼラ
チンからなる柔らかい、密封されたカプセル、並びにグリセロール或いはソルビ
トールのような錠皮を含む。プッシュフィットカプセルは、ラクトース或いはで
んぷんのような充填剤或いは結合剤、タルク或いはステアリン酸マグネシウムの
ような潤滑剤、並びに付加的には安定剤と混合された活性処方組成物を含み得る
。柔らかいカプセルでは、活性化合物は、安定剤があるなしにかかわらず、脂肪
油、液体パラフィン、液体ポリエチレングリコールのような適切な液体に溶解或
いは懸濁される。
非経口投与用の製剤は、水溶性の活性化台物の水溶液を含む。注射用として、
本発明の薬品組成物を水溶液、好適にはハンクの溶液、リンゲル溶液或いは生理
緩衝食塩水のような生理学的に適台性の緩衝液に入れて製剤することができる。
水性の注入懸濁剤は、カルボキシルメチルセルロースナトリウム、ソルビトール
或いはデキストランのような懸濁剤の粘性を高める物質を含み得る。更に、活性
成分の懸濁液は、適切な油性注入懸濁剤として調製される。適切な親油性の溶媒
或いは媒介物は、胡麻油のような脂肪油や、オレイン酸エチル、トリグリセリド
或いはリポソームのような合成脂肪酸エステルを含む。また懸濁剤は、所望に応
じて、それにより溶解度を増加し、非常に濃縮された溶液の調製ができるように
なる適切な安定剤或いは薬剤を含んでもよい。
局所的投与または経鼻粘膜投与用には、浸透される特定の障壁に対して適切な
浸透剤を用いて調合が行われる。このような浸透剤は、一般に周知である。
本発明の薬品組成物は周知の方法、例えば従来の混合処理、溶解処理、顆粒化
処理、糖衣形成処理、研和処理、乳化処理、封入処理(entrapping)
処理或いは凍結乾燥処理により製造される。
この医薬品組成物は塩類として提供されることもあり、限定はしないが、塩酸
、硫酸、酢酸、乳酸、酒石酸、リンゴ酸、コハク酸等を含む、多くの酸とともに
形成することができる。塩は、対応する遊離塩基形態である水性或いはプロトニ
ック溶剤において、より可溶性が高くなる傾向がある。他の場合には、好適な製
剤は、1mM〜50mMのヒスチジン、0.1%〜2%のショ糖、使用前に緩衝
剤と結合させたpH範囲4.5〜5.5にある2%〜7%のマンニトールにおけ
る凍結乾燥粉末である。
製薬学的に許容される担体内に製剤された本発明の化合物を含む組成物は、調
製された後、適切な容器内に入れて、さらに提示した疾病状態の治療のためにラ
ベル付けすることができる。HCORの投与の場合、このようなラベルには、投
与の量、頻度、方法が表示される。
本発明において使用するために適切な医薬品組成物は、活性成分を所望の目的
を達成するための有効量含む組成物である。有効量の決定は、当業者の能力の範
囲内で十分行うことができる。
任意の化合物について、治療的有効量は、初めに、新生物細胞、或いは通常マ
ウス、ウサギ、イヌ、ブタのような動物モデルの何れかの細胞培地のアッセイか
ら推定される。次いで、このような情報を用いて、ヒトにおける有効量や投与経
路を決定することができる。
治療的有効量とは、症状や状態を改善するタンパク質、その抗体、アンタゴニ
スト、またはインヒビターの量である。そのような化合物の毒性及び治療的有効
性は、例えばLD50(個体群の50%の致死投与量)及びED50(個体群の
50%における治療的有効量、50%有効量)を決定するための、細胞培地或い
は実験動物における標準的な製薬学的方法により決定することができる。毒性と
治療有効性との間の投与量比
は治療指数であり、LD50/ED50の比として表すことができる。大きな治
療指数を示す医薬品組成物が好ましい。これらの細胞培地のアッセイ及び付加的
な動物研究から得られるデータは、ヒトへの使用に対する投与量の範囲を決める
際に用いることができる。そのような化合物の投与量は、毒性がほとんど或いは
全くなく、ED50を達成する循環濃度の範囲内にあることが望ましい。投与量
は、用いられる剤形、患者の感受性並びに投与経路に応じてこの範囲内で変化す
る。
正確な投与量は治療されるべき患者を考慮して個々の医師により選択される。
投与量及び投薬量は、十分なレベルの活性成分を与え、かつ所定の効果を維持す
るために調節される。考慮すべき付加的な要因は、疾患状態の重症度、または患
者の年齢、体重並びに性別、食事、投与の時間及び頻度、併用する薬剤、反応感
受性、並びに治療への耐性/反応を含む。長期的に作用する薬品組成物は3〜4
日毎に、1週間毎に、或いは半減期及び特定の処方のクリアランス速度に応じて
2週間に1度投与してもよい。
通常の投与量は0.1〜100,000μgの範囲にあって、全投与量は最大約
1gであり、投与経路に応じて変わってくる。特定の投与量或いは送達の方法に
関する手引きは、当分野の実施者が通常入手できる文献において見出すことがで
きる。当業者なれば、ヌクレオチドに対しては、タンパク質やインヒビター用の
剤形とは異なる剤形を採用するであろう。同様に、ポリヌクレオチドまたはポリ
ペプチドの送達方式は、特定の細胞、状態、位置等によって決まってくる。
診断
別の実施例において、HCORに特異的な抗体は、HCORの発現を特徴とす
る状態や疾病の診断や、HCORで治療を受けている患者のモ
ニタリングのためのアッセイにおいて役立つ。診断目的で有用な抗体は、上述の
治療用のものと同じように調製することができる。HCORの診断的測定法には
、ヒトの体液、細胞或いは組織の抽出物においてHCORを検出するために抗体
或いは標識を利用する方法が含まれる。本発明のポリペプチド及び抗体は、修飾
したものでも、修飾なしでも用いることができ、共有結合、或いは非共有結合か
のいずれかでリポーター分子と結合することにより標識することができる。種々
のリポーター分子が周知となっており、その幾つかについては上記した。
例えばELISA(酵素結合免疫測定法)、RIA(ラジオイムノアッセイ)並びにFA
CS(蛍光表示式細胞分取器法)を含む、HCORを測定するための種々のプロト
コルが当分野では周知であり、これによってHCOR発現の変化や異常を診断す
るための基礎が得られる。HCORの発現の正常値、つまり標準値は、哺乳類、
好ましくはヒトの正常被験者から得られる体液或いは細胞抽出物とHCORに対
する抗体とを、複合体形成に適した条件の下で結合することによって得ることが
できる。標準の複合体形成量は、種々の方法、好ましくは測光手段を用いること
により定量することができる。被験者、対照標準、及び生検組織からの患部組織
サンプルにおいて発現されたHCORの量を、標準値と比較する。標準値と被験
者の値との偏差で、疾病診断のパラメータが確立される。
本発明の別の実施例では、HCORをコードするポリヌクレオチドを、診断目
的で用いることができる。使用できるポリヌクレオチドには、オリゴヌクレオチ
ド配列、アンチセンスRNA及びDNA分子、及びペプチド核酸(PNA)が含
まれる。このポリヌクレオチドは、HCORの発現が疾病と相関性を有する生検
組織における遺伝子発現を検出し、定量するために用いられる。診断的測定は、
HCORが存在、不存在、及び過剰発現の何れの状態にあるかを区別したり、治
療的介入の際にHC
ORレベルの調節をモニタリングするのに役立つ。
或る態様では、HCORまたは近縁な分子をコードする、ゲノム配列を含むポ
リヌクレオチド配列を検出できるハイブリダイゼーションプローブ或いはPCR
プローブを用いて、HCORをコードする核酸配列を同定することができる。そ
して、そのプローブの特異性、即ち、そのプローブが非常に高度な保存領域(例
えば5’調節領域における10個の独特のヌクレオチド)と、保存的である度合
いの低い領域(例えば特に3’領域におけるシステイン残基の間の領域)の何れ
に由来するのかということ、及びハイブリダイゼーション或いは増幅の(高い、
中程度の或いは低い)厳密性によって、そのプローブが自然発生HCORのみを
同定するものであるか、或いはアレル配列や近縁な配列も同定するものであるか
ということが決まってくる。
プローブは、近縁なインヒビターをコードする配列を検出するためにも用いる
ことができ、好ましくは、これらのHCORをコードする任意の配列から得られ
るヌクレオチドを少なくとも50%含むべきである。本発明のハイブリダイゼー
ションプローブは、配列番号:2のヌクレオチド配列か、自然発生HCORのイ
ントロン、プロモータ、及びエンハンサーエレメントを含むゲノムの配列に由来
するものであり得る。
HCORをコードするDNAに対して特異的なハイブリダイゼーションプロー
ブの作製のための他の手段には、HCORやHCOR誘導体をコードする核酸配
列を、mRNAプローブ生成のためのベクターにクローン化する方法がある。こ
のようなベクターは周知で市販されており、適切なRNAポリメラーゼや適切な
放射性標識ヌクレオチドを付加することにより、in vitroでのRNAプローブを
合成のために用いることができる。ハイブリダイゼーションプローブは種々のリ
ポータ分子により標識することができ、この標識には、32Pや35Sのような放射
性核種、
アビジン/ビオチン結合系によりプローブに結合するアルカリホスファターゼの
ような酵素標識等が含まれる。
HCORをコードするポリヌクレオチド配列を、HCORの発現が関係する状
態又は疾病の診断のために用いることができる。このような状態又は疾病の例に
は、脳の脱髄及び神経変性;アレルギー反応、喘息及び成人呼吸窮迫症候群、関
節リウマチ、全身性エリテマトーデス、腎炎のような自己免疫疾患;及びクロー
ン病;虚血後心筋炎及び壊死;皮膚病;敗血症性ショック、及び癌、血液透析及
び体外循環の炎症性合併症;及び微生物を殺したり、損傷組織の除去、及び組織
の修復又は再生のための領域を準備するために必要な炎症反応が含まれる。HC
ORをコードするポリヌクレオチド配列は、HCOR発現の変化を検出するため
の生検組織や体液を試験するための、サザンブロット法或いはノーザンブロット
法、ドットブロット法或いは他の膜ベース技術、PCR技術、ディップスティッ
ク試験法(試験紙法)、ピン或いはチップ技術及びELISAアッセイにおいて用いる
ことができる。このような定性的或いは定量的試験方法は当分野ではよく知られ
ている。
特定の態様では、種々の癌、特に上述の癌の活性化または誘導を検出するアッ
セイにおいてHCORをコードするヌクレオチド配列が役立ち得る。HCORを
コードするヌクレオチド配列を標準的な方法で標識し、ハイブリダイゼーション
複合体の形成に適した条件の下で患者の体液や組織サンプルに加える。適切なイ
ンキュベーション時間の経過後、このサンプルを洗浄しシグナルを定量して、標
準値を比較する。生検サンプルまたは抽出サンプルにおけるシグナルの量が、比
較できる対照サンプルのシグナル量と有意に異なっている場合、このヌクレオチ
ド配列はサンプルのヌクレオチド配列とハイブリダイズしており、サンプルにお
けるHCORをコードするヌクレオチド配列のレベルの変化が存在するこ
とは、関連疾患の存在を示している。このようなアッセイは、動物実験、臨床試
験、または個々の患者の治療のモニタリングにおける特定の治療措置の効果を評
価するために用いることもできる。
HCORの発現が関係する疾病の診断の基礎を得るために、正常な、或いは標
準の発現プロフィールを確立する。この標準プロフィールは、動物或いはヒト何
れかの正常な被験者から得られる体液或いは細胞抽出物を、ハイブリダイゼーシ
ョン或いは増幅に適切な条件下で、HCORをコードする配列又はその一部分と
結合することにより確立される。標準のハイブリッド形成量は、既知の量の実質
的に精製されたHCORが用いられる同一の実験で得られる値と、正常被験者に
対して得られる値とを比較することにより定量することができる。正常なサンプ
ルから得られた標準値は、疾病の症状を示す患者からのサンプルから得られる値
と比較することができる。標準値と被験者値との偏差を用いて疾病の存在を確認
する。
ひとたび疾患が確認され、治療プロトコルが開始されると、患者での発現レベ
ルが正常な患者において観察されるレベルに近づき始めたか否かを評価するため
に、このようなアッセイが定期的に繰り返される。継続的なアッセイから得られ
る結果を用いて、数日間或いは数ヶ月の期間にわたる治療効果を知ることができ
る。
癌については、患者の生検組織において転写物が比較的少ない量存在すること
が疾病の発生の素因を示し、つまり実際の臨床的症状が現れる前に疾病を検出す
る手段となり得る。この型のより確定的な診断により、医療従事者が予防的処置
を講じたり、より早期に積極的な治療を開始することが可能となり、疾病の発生
や更なる進行を予防することができるようになり得る。
HCORをコードするオリゴヌクレオチドの別の診断目的の使用では、
PCRを使用することがある。このようなオリゴマーは一般には化学的に合成す
るが、酵素を用いて作製したり、或いは組換え体を起源として作り出すこともで
きる。オリゴマーは、特定の遺伝子或いは状態を識別するために最適な条件下で
用いられる2つのヌクレオチド配列、即ちセンス方向(5’→3’)のヌクレオ
チド及びアンチセンス方向(3’←5’)のヌクレオチドからなる。同一の2つ
のオリゴマー、入れ子オリゴマーの組、或いはオリゴマーの縮重プールでさえ、
近縁なDNAまたはRNA配列の検出や定量のためのより厳密性の低い条件の下
であっても用いることができる。
さらにHCORの発現を定量するための方法には、放射性標識(radiolabelin
g)或いはビオチン標識ヌクレオチドの利用、コントロールの核酸の同時増幅(c
oamplification)の利用、並びに実験結果を補完して引かれた標準的なグラフ曲
線の利用も含まれる(Melby,P.C.等1993 J.Immunol Methods,159:235-44;Dupla
a,C.等(1993)Anal.Biochem.229-236)。多数のサンプルの定量は、ELISA形式の
連続アッセイを実行することにより一層迅速に行うことができる。このアッセイ
では目的のオリゴマーが様々な希釈溶液中に存在し、分光光度計を用いる分析或
いは比色分析反応により迅速に定量することができる。
本発明の別の実施例では、HCORをコードする核酸配列を用いて、自然発生
のゲノム配列マッピングのためのハイブリダイゼーションプローブを生成するこ
とができる。この配列を、よく知られた技術を用いて特定の染色体或いはその染
色体の特定領域に対してマッピングすることができる。このような技術には、FI
SH、FACSや人工染色体作製物の使用、例えば酵母菌人工染色体、細菌性人工染色
体の細菌性P1作製物、Price,C.M.(1993)Blood Rev.7:127-34及びTrask,B.J.(1
991)Trends Ganet 7:149-154に概要が示されている単染色体cDNAライブラリ
ー
の使用が含まれる。
FISH(Verma等(1988)Human Chromosomes:A Manual of Basic Technioue,Per
gamon Press,New York,NY”に記載)は、他の染色体マッピング技術及び遺伝子
地図データと関係を有し得る。遺伝子地図データの例は、1994 Genome Issue of
Science(265:1981f)に見ることができる。物理的染色体地図上でのHCORを
コードする配列の位置と、特定の疾病(または特定の疾病の素因)との相関関係
を助けとして、ある遺伝病が関係するDNAの領域の限界決定ができる。本発明
のヌクレオチド配列を用いて、正常者とキャリアまたは患者との遺伝子配列の違
いを検出することができる。
染色体調製物のin situハイブリダイゼーション及び確定された染色体マーカ
ーを用いる連鎖解析のような物理的地図作成技術は、遺伝子地図を延長するため
に大変重要である。多くの場合、特定のヒト染色体の数或いは腕が未知であって
も、マウスのような別の哺乳類種の染色体上の遺伝子配置から、関連するマーカ
ーがわかる。新しい配列は、物理的マッピングにより染色体のアーム、或いはそ
の一部へ割当てることができる。これは位置クローニング或いは他の遺伝子発見
技術を用いて疾患遺伝子を調査する研究者に貴重な情報を提供する。ひとたび毛
細血管拡張性運動失調(AT)のような疾患或いは症候群が、特定のゲノム領域へ
、例えばATならば11q22-23(Gatti,R.A.等(1988)Nature 336:577-580)へ、遺伝子
連鎖によって粗い局所化がなされれば、その領域にマッピングされる任意の配列
は、さらなる研究のための関連する遺伝子、或いは調節遺伝子ということになる
。本発明のヌクレオチド配列は、正常者とキャリアまたは患者との間の、転座、
逆位等による染色体位置の違いを検出するために用いることもできる。
本発明の別の実施例では、HCORや、その触媒作用性または免疫原
性フラグメント或いはオリゴペプチドを、種々の薬物スクリーニング技術におい
て治療用化合物のスクリーニングのために用いることができる。そのような試験
において用いられるフラグメントは、溶液に遊離した形態か、固体支持体へ付着
したものか、細胞表面へ付着したものか、或いは細胞内に存在するものであり得
る。HCORと試験される薬剤との結合複合体形成が測定され得る。
HCORポリペプチドへの適切な結合親和性を有する化合物の高スループット
スクリーニングのために用いることができる別の薬物スクリーニング技術が、公
開されたPCT出願WO84/03564に詳細に記載されている。この方法をHCORに適
用する場合には、多数の異なる小形ペプチドの試験用化合物を、プラスチックピ
ン或いは他の表面のような固体基質上で合成する。ポリペプチド試験用化合物を
HCOR又はその断片と反応させ、洗浄する。次いで結合HCORを当分野で周
知の方法により検出する。また、前述の薬物スクリーニング技術において使用す
るために、精製HCORをプレート上に直接コーティングすることもできる。こ
の他、ペプチドを捕捉し固体支持体上にペプチドを固定するために非中和抗体を
用いることができる。
別の実施例では、HCORに結合し得る中和抗体が、HCORとの結合につい
て試験化合物と特異的に競合する競合的薬物スクリーニングアッセイを使用する
ことができる。このように、抗体を用いて、1または2以上のHCORと共通の
エピトープを有する任意のペプチドの存在を検出することができる。
更に別の実施例では、ここに開示するHCORをコードするヌクレオチド配列
は、その新技術が、以下に限らないが、例えばトリプレット遺伝暗号及び特異的
塩基対合相互作用のような特性を含む、現在周知のヌクレオチド配列の特性に基
づく技術であれば、まだ開発されていない分
子生物学的技術においても用いることができる。
以下に示す本発明の実施例は、単なる例示であって、本発明をこの実施例に限
定しようとするものではない。実施例
1 THYMNOT02 cDNAライブラリーの作製
THYMNOT02c DNAライブラリーは、Keystone Skin Bank,International Inst
itute for the Advancement of Medicine(Exton PA)から得られた胸腺組織(l
ot#93-122)から作製された。冷凍組織を、乳鉢と乳棒ですりつぶしてグアニジ
ウムイソチオシアネートを含むバッファに即座に溶解した。この溶解産物を、p
H8.0のフェノールクロロホルムで二回抽出し、Beckman L81-70M Ultracentrifu
geにおいてBeckman SW28 rotor(Beckman Instruments)を用いて、5.7Mの
塩化セシウムクッションを通して遠心分離にかけた。得られたRNAを0.3M
の酢酸ナトリウム及び2.5倍量のエタノールを用いて沈殿させ、水に再懸濁し
、37℃でDNアーゼ処理した。このRNAを、Qiagen Oligotex kit(QIAGEN,
Inc.,Chatsworth,CA)を用いて単離し、cDNAライブラリーの作製に用いた。
第1鎖のcDNA合成は、XhoI制限部位も含むオリゴd(T)プライマー/リンカ
ーを用いて行った。第2鎖の合成はDNAポリメラーゼI、大腸菌リガーゼ及び
RNアーゼHの組み合わせを用いて行い、その後平滑末端化されたcDNAにEc
oRIアダプターを付加した。EcoRIを付加した二本鎖のcDNAをXhoI制限酵素で
消化し、Sepharose CL4Bカラム(Cat.#275105-01,Pharmacia)で分画化し、1000
bpを越えるサイズのcDNAを得た。サイズ選択されたcDNAを、pBluescrip
tTMファ
(Stratagene)に挿入し、大腸菌株XL1-BlueMRFTM(Stratagene)の細胞に入れ
て形質転換させた。
ファージミドに組みこまれた個々のcDNAクローンは、in vivo切除プロセ
スにより得た。pBluescript及びそれと同時形質転換されたf1ヘルパーファー
ジの双方に由来する酵素が、DNAにニックを入れ、新たなDNA合成を開始さ
せ、cDNAインサートが含まれた小形で一本鎖の環状ファージミドDNA分子
を作りだした。このファージミドDNAは放出されて、精製され、新たな宿主細
胞(SOLR,Stratagene)に再感染させるのに用いられた。
2 cDNAクローンの単離及び配列決定
プラスミドDNAは細胞から放出され、Miniprep Kit(Catalog #77468,Advan
ced Genetic Technologies Corporation,Gaithersburg MD)を用いて精製した。
このキットは96穴ブロックからなり、960回の精製のための試薬を備えたも
のである。以下の変更点を除いてその推奨プロトコルを採用した。(1)96個
のウェルのそれぞれには、25mg/Lのカルベニンシン及び0.4%のグリセ
ロールと共に滅菌terrific broth(Catalog# 22711,LIFE TECHNOLOGIESTM,Gaith
ersburg,MD)の1mlのみを充填する。(2)ウェルへの植菌の後、細菌を24
時間培養し、60mlの溶解バッファと共に溶解する。
(3)Beckman GS-6Rを用いた2900rpmで5分間の遠心分離過程を実行し
た後、ブロックの内容物を一次濾板(primary filter plate)に加える。(4)
イソプロパノールをTRISバッファに加えるオプションのステップはルーチンで行
わなかった。プロトコルの最終ステップの後、サンプルを保管のためBeckman9
6穴ブロックに移送した。
このcDNAの配列決定は、4つのPeltier Thermal Cyclers(PTC200,MJ Res
earch,Watertown,MA)及びApplied Biosystems
377 DNA Sequencing Systems(Perkin Elmer)と組み合わせてHamilton Micro L
ab 2200(Hamilton,Reno,NV)を用いてSanger F.及びCoulsonの方法(1975,J.Mo
l.Biol.94:441f)により行い、読み枠を決定した。
3 cDNAクローン及びそれらの類推されるタンパク質の相同性検索
Applied Biosystems社で開発された検索アルゴリズムを、INHERIT 670TM配列
解析システムに組み込んで用いて、各cDNAの配列をGenBankの配列と比較し
た。このアルゴリズムでは、Pattern Specification Language(TRW社、LosAnge
les CA)を用いて相同な領域を決定した。配列の比較をどのように行うかを決定
する3つのパラメータは、ウィンドウサイズ、ウィンドウオフセット、及び誤差
許容度であった。これら3つのパラメータの組を用いて、対象の配列と相同な領
域を含む配列をDNAデータベースから検索し、適切な配列には、初期値ととも
にスコアが付けられた。次に、これらの相同な領域をドットマトリクスホモロジ
ーブロット法を用いて検定し、相同な領域と偶然の一致とを区別した。相同性検
索の結果は、Smith-Waterman alignmentsを用いて表示した。
ペプチド及びタンパク質配列の相同性は、INHERIT 670配列解析システムをD
NA配列の相同性検索で用いたのと同様に用いて確かめた。Pattern Specificat
ion Language及びパラメータウィンドウを用いて、タンパク質データベースから
相同性領域を含む配列を検索し、その結果には初期値とともにスコアが付けられ
た。ドットマトリクスホモロジーブロット法を用いて検定し、有意な相同性を有
する領域と偶然の一致とを区別した。
BLASTは、Basic Local Alignment Search Tool(Altschul SF(1993)J Mol Evo
l36:290-300;Altschul,SF等(1990)J Mol Biol215:403-410)の略
称であり、これを用いて局部的な配列アライメントを検索した。BLASTはヌクレ
オチド及びアミノ酸配列の両方のアライメントを作成して配列類似性を求める。
そのアライメントの局所性のために、BLASTは厳密な一致、すなわちホモログを
求める際に特に有効である。BLASTは間隙を含まない一致を求めるのに役立つ。B
LASTアルゴリズム出力の基本的な単位は、High-scoring Segment Pair(HSP)で
ある。
HSPは2つの配列フラグメントからなり、両フラグメントは任意ではあるが、
そのアライメントが局所的に最大となっている等しい長さものであり、そのアラ
イメントスコアはユーザにより設定された閾値すなわちカットオフスコアを満足
、即ち、カットオフスコアを超えている。
BLASTアプローチは問い合わせ配列とデータベース配列との間のHSPを見つけ出す
ものであり、見出された任意の一致の統計的有意性を評価し、そのユーザが設定
した有意性の閾値を満足する一致のみを報告するものである。パラメータEはデ
ータベース配列一致を知らせるための統計的に有意な閾値を確定するパラメータ
である。Eは全データベース検索の情況においてHSP(或いはHSPの組)生起の予
測頻度の上限として解釈される。その一致がEを満足する任意のデータベース配
列がプログラム出力において報告される。
4 ノーザン法による解析
ノーザン解析は、標識されたヌクレオチド配列と特定の細胞型または組織に由
来するRNAが結合したメンブランとのハイブリッド形成を伴う、遺伝子の転写
物の存在を検出するために用いられる実験技術である(Sambrook等、上述)。
BLAST(Altschul,S.F.1993及び1990,上述)を用いる類似のコンピュータ技術
で、GenBankまたはLIFESEQTMデータベース(Incyte,PaloAlto CA)のようなデー
タベースにおける同一のまたは近縁な分子を検
索した。この解析は、多くの膜ベースのハイブリダイゼーションより非常に短時
間で行うことができる。更に、コンピュータ検索の感度を変更して、ある一致が
正確な一致か、相同的であるかの分類を決定することができる。
検索の基準値は、積スコアであり、これは以下の式で定義されるものである。
(配列の一致(%)×最大BLASTスコア(%))/100
この積スコアでは、2つの配列間の類似性の程度、及び配列の長さの一致の双方
が考慮されている。例えば、積スコアが40の場合は、一致は誤差が1〜2%の
範囲で正確であり、スコアが70の場合は正確に一致している。相同な分子は、
通常積スコアとして15〜40を示すものを選択することにより同定されるが、
スコアの低いものは近縁関係にある分子として同定される。
検索の結果は、完全長配列、又はその部分が存在するライブラリー、配列の存
在量(abundance)、及びパーセント存在量(percent abundance)のリストとし
て報告される。存在量は、特定の転写物の検出回数を直接反映し、パーセント存
在量は、存在量をライブラリー内で検出された配列の総数で除したものである。
5 HCORをコードする配列の完全長又は調節エレメントを回復するまでの伸
長
完全長HCORコード化核酸配列(配列番号:2)を用いて、部分的ヌクレオ
チド配列を完全長まで伸長させるための、或いはゲノムライブラリーから5’ま
たは3’配列を得るためのオリゴヌクレオチドプライマーを設計することができ
る。一方のプライマーはアンチセンス方向(XLR)の延長を開始するために合成
され、他方のプライマーはセンス方向(XLF)に配列を延長するために合成さ
れる。これらのプライマー
により、周知のHCOR配列を「外側に」延長し、対象の制御領域の新しい未知
のヌクレオチド配列を含むアンプリコンを生成できるようにな
Plymouth MN)、或いは他の適切なプログラムを用いて、長さが22〜30ヌク
レオチドで50%以上のGC含量を有し、かつ約68〜72℃の温度で標的配列
にアニールするように設計することができる。アピン構造及びプライマー−プラ
イマー二量体化を生じるような任意のヌクレオチドのストレッチの延長は回避さ
れる。
元の選択されたcDNAライブラリーか、ヒトゲノムライブラリーを用いて配
列を延長する。後者のライブラリーは、5’上流配列を得るために最も役立つ。
必要なら、既知領域をさらに延長するために追加のプライマーの組が設計される
。
XL-PCRキット(Perkin Elmer)の説明書の指示に従って、酵素と反応混合物と
を完全に混合することにより、高い忠実度の増幅が得られる。
40pmolの各プライマーと、推奨された濃度のキットの他の全ての成分とから増
幅を開始する場合、PCRはPeltier Thermal Cycler(PTC200;M.J.Reserch,Wa
tertown MA)を用いて、以下のパラメータで実行される。
ステップ1 94℃で1分間(初期変性)
ステップ2 65℃で1分間
ステップ3 68℃で6分間
ステップ4 94℃で15秒間
ステップ5 65℃で1分間
ステップ6 68℃で7分間
ステップ7 ステップ4〜6をさらに15サイクル反復
ステップ8 94℃で15秒間
ステップ9 65℃で1分間
ステップ10 68℃で7分15秒間
ステップ11 ステップ8〜10を12サイクル反復
ステップ12 72℃で8分間
ステップ13 4℃(その温度を保持)
反応混合物の5〜10μlのアリコットを、低濃度(約0.6〜0.8%)ア
ガロースミニゲル上での電気泳動で解析して、反応物が配列を延長することに成
功したか否かを決定する。最も大きな生成物或いはバンドを選択して、ゲルから
切り出した。さらなる精製には、QIAQuickTM(QIAGEN Inc.,Chatsworth,CA)の
ような市販のゲル抽出法を用いる。
DNA回収の後、クレノウ酵素を用いて一本鎖ヌクレオチドの延び出しを切り取
り、再結合及びクローニングを容易にする平滑末端を作った。
エタノール沈殿の後、生成物を13μlのリゲーション緩衝液内に再溶解し、
1μlのT4−DNAリガーゼ(15単位)及び1μlのT4ポリヌクレオチド
キナーゼを加えて、その混合物を室温で2〜3時間、或いは16℃で一昼夜イン
キュベートする。コンピテントな大腸菌細胞(40μlの適切な溶媒内にある)
を、3μlのリゲーション混合物を用いて形質転換し、80μlのSOC培地(
Sembrook等、上記)で培養する。37℃で1時間のインキュベーションの後、全
ての形質転換混合物を、2xCarbを含むLuria Bertani(LB)寒天(Sembrook等、
上記)上にのせる。後日、いくつかのコロニーを各プレートから無作為に選択し
、適切な市販の無菌の96穴マイクロタイタープレートの個々のウェル内に入れ
られた150μlの液状LB/2xCarb培地で培養する。さらに後日、5μlの各一
昼夜の培養物を非無菌96穴プレート内に移し、水で1:10に希釈した後、そ
れぞれ5μlのサンプルをPCRアレイに移す。
PCR増幅のため、4単位のrTthDNAポリメラーゼを含む18μlの濃
縮PCR反応混合物(3.3x)、ベクタープライマー、並びに延長反応に用い
られる遺伝子特異的プライマーの一方或いは両方を各ウェルに加える。増幅は以
下の条件に従って行う。
ステップ1 94℃で60秒間
ステップ2 94℃で20秒間
ステップ3 55℃で30秒間
ステップ4 72℃で90秒間
ステップ5 ステップ2〜4をさらに29サイクル反復
ステップ6 72℃で180秒間
ステップ7 4℃(そのまま保持)
PCR反応物のアリコットを、分子量マーカーと共にアガロースゲル上で移動
させる。PCR生成物のサイズを元の部分的なcDNAと比較して、適切なクロ
ーンを選択し、プラスミドに結合して、配列決定を行う。
6 ハイブリダイゼーションプローブの標識及び使用
配列番号:2の配列に基づくハイブリダイゼーションプローブを用いて、cD
NA、mRNA並びにゲノムDNAをスクリーニングする。約20の塩基対から
なるオリゴヌクレオチドの標識について特に記すが、大きなcDNAフラグメン
トの場合でも概ね同じ手順を用いる。オリゴヌクレオチドをOLIGO4.06(Nationa
l Bioscience)のような最新式のソフトウェアを用いてデザインし、50pmo
lの各オリゴマーと、250mCiの[γ‐32P]アデノシン三リン酸(Amersham
)及びT4ポ
せて用いて標識する。標識されたオリゴヌクレオチドを、SephadexG-25超精細樹
脂カラム(Pharmacia)を用いて精製する。毎分107カウ
ントのセンス及びアンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれを含む部分を、エ
ンドヌクレアーゼAseI,Bgl II,EcoRI,Pst I,Xba1或いは
的な膜ベースのハイブリダイゼーション解析において用いる。
各消化物からのDNAを、0.7%アガロースゲル上で分画化して、ナイロン
膜(Nytran Plus,Schleicher & Schuell,Durham NH)にトランスファーする。ハ
イブリダイゼーションは40℃で16時間かけて行う。非特異的シグナルを取り
除くため、ブロットを、0.1xクエン酸ナトリウム食塩水及び0.5%ドデシ
ル硫酸ナトリウムまで段階的に厳密性が増す条件下で、室温にて順次洗浄する。
XOMAT ARTMフィルム(Kodak,Rochester,NY)を、Phosphoimager cassette(Mole
cular Dynamics,Sunnyvale,CA)においてブロットに数時間露光した後、ハイブリ
ダイゼーションパターンを視覚的に比較する。
7 アンチセンス分子
HCORをコードする配列或いはその任意の一部分は、自然発生の配列のin v
ivoまたはin vitro発現を阻害するために用られる。約20塩基対からなるアン
チセンスオリゴヌクレオチドの使用について特に記すが、より大きなcDNAフ
ラグメントの場合でも概ね同じ方法を用いることができる。第1A図、第1B図
、第1C図、及び第1D図に示すようなHCORをコードする配列に基づくオリ
ゴヌクレオチド用いて、自然発生HCORの発現を阻害することができる。相補
的なオリゴヌクレオチドを、第1A図、第1B図、第1C図、及び第1D図に示
す最も独特な5’配列から設計し、これを用いてプロモーターが結合するのを阻
害することにより転写を抑制したり、リボソームが転写物に結合するのを阻害し
てHCOR転写物の翻訳を抑制することができる。配列番号:2の5’配列の適
切な部分を用いることにより、効果的なアンチセンス
オリゴヌクレオチドが、第1A図、第1B図、第1C図、及び第1D図に示すポ
リペプチドのシグナル配列または5’コーディング配列に翻訳される領域全体に
わたる15〜20個のヌクレオチドを含むようになる。
8 HCORの発現
HCORの発現は、cDNAを適切なベクター内にサブクローニングし、その
ベクターを宿主細胞にトランスフェクトすることによって行われる。この場合、
前にcDNAライブラリーの作製の際に用いたクローニング用のpSportベクター
を用いて、大腸菌においてHCORを発現させる。クローニング部位の上流には
、β−ガラクトシダーゼに対するプロモータが存在し、その後ろにはアミノ基末
端Met及びβ−ガラクトシダーゼの7残基が存在する。後続のこれら8つの残基
は、転写に役立つバクテリオファージプロモーターであり、多くの独特の切断部
位を含むリンカーである。
単離されたトランスフェクト菌株を、IPTGを用いて標準的な方法で誘導し、初
めのβガラクトシダーゼの7残基、約5〜15残基のリンカー、及び完全長HC
ORからなる融合タンパク質を作り出す。このシグナル配列は菌培地へのHCO
Rの分泌を誘導し、この培地は後の活性のアッセイにおいて直接用いることがで
きる。
9 HCOR活性の確認
HCORの活性は、ホスファチジルイノシトール特異的ホスホリパーゼC(P
LC)のリガンド刺激による活性化によって評価する。COS細胞(ATCC)に、
HCOR発現プラスミドとGタンパク質α16サブユニットをコードするプラスミ
ドとを同時トランスフェクトする。C5aリガンド(Sigma)による活性化の後
、内生COS細胞PLCのGタンパク質α16刺激によるHCORのシグナリング
を測定し、対照標準値と比較する。このアッセイのため、トランスフェクト細胞
を、10μCi
/ml[3H]イノシトール及び10%胎仔ウシ血清を含む、イノシトールを含
まないDMEMと共に24時間インキュベートする。次にこの培養液を、イノシ
トールを含まないDMEMに置き換えて、10mMのLiCl、0〜150nM
のC5a及びこの細胞を37℃で30分間インキュベートする。4mg/mlの
フィチン酸を含む等量の10%HClO4を加えることによりこの反応を終了させ、
0又は−20℃で30分間インキュベートする。イノシトールリン酸をDowex-1
(Bio-Rad)上でのクロマトグラフィーにより精製し、液体シンチレーションカ
ウンタを用いて定量し、対照値と比較する(Gerard,N.(1995)J Biol Chem 270:1
8077-18082)。
10 HCOR特異的抗体の産生
標準的なプロトコルを用いたウサギの免疫化及び抗体の産生には、PAGE電
気泳動法(Sambrook前出)を用いて実質的に精製されたHCORを用いる。配列
番号:2から類推されるアミノ酸配列をDNAStarソフトウエア(DNASTAR社)を用
いて解析して免疫抗原性の高い領域を決定し、対応するオリゴペプチドを当業者
には周知の手段により合成して、当業者に周知の方法で抗体を産生するために用
いる。C末端付近の、或いは隣接する親水性領域内のエピトープのような、適切
なエピトープを選択するための解析法は、Ausubel等(上記)の論文他に記載さ
れている。
通常、約15残基の長さを有するオリゴペプチドを、Applied Biosystemsのペ
プチドシンセサイザModel 431Aを用いてfmoc法のケミストリにより合成し、
M−マレイミドベンゾイル−N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(MBS:
Ausubel等、上記)を用いた反応によりキーホールリンペットヘモシニアン(K
LH、Sigma,St.Louis,MO)に結合する。フロイントの完全アジュバントにおい
てオリゴペプ
チド−KLH複合体を用いてウサギを免疫する。得られた抗血清の抗ペプチド活
性を検査するには、例えばペプチドをプラスチックに結合し、1%BSAを用いて
ブロックし、ウサギ抗血清と反応させて洗浄し、さらに放射性ヨウ素標識された
ヤギ抗ウサギIgGと反応させる。
11 特異的抗体を用いる自然発生HCORの精製
自然発生HCOR或いは組換えHCORは、HCORに特異的な抗体を用いる
イムノアフィニティークロマトグラフィにより精製することができる。イムノア
フィニティーカラムは、CnBr-activated Sepharose(Pharmacia Biotech社)の
ような活性化クロマトグラフレジンとHCOR抗体とを共有結合させることによ
り構築される。結合後、そのレジンを使用説明書の指示に従って、ブロックし洗
浄する。
HCORを含む培地をイムノアフィニティーカラムに通し、そのカラムをHC
ORを優先的に吸着できる条件下で(例えば界面活性剤の存在下において高イオ
ン強度バッファで)洗浄する。このカラムを、抗体/HCOR結合を切るような
条件下(例えばpH2〜3のバッファ、或いは高濃度の尿素またはチオシアン酸
塩イオンのようなカオトロピックイオン)で溶出させ、HCORを回収する。
12 HCORと相互作用する分子の同定
HCOR又は生物学的に活性なその断片を、125Iボルトンハンター試薬(Bol
ton,A.E.及びW.M.Hunter(1973)Biochem.J.133:529-38)で標識する。マルチウェ
ルプレートに予め配列しておいた候補の分子を、標識したHCORとともにイン
キュベートし、洗浄して、標識HCOR複合体を有する任意のウェルをアッセイ
する。異なる濃度のHCORを用いて得られたデータを用いて、候補の分子とH
CORの会合、親和性、数の数値を計算する。
上記のすべての刊行物及び特許明細書は、本明細書と一体に参照されたい。本
発明の記載した方法及びシステムの種々の改変は、本発明の範囲及び精神から逸
脱しないことは当業者には明らかであろう。本発明は特に好適な実施例に関連し
て記載されているが、本発明の請求の範囲は、そのような特定の実施例に不当に
制限されるべきではないことを理解されたい。実際には、本発明を実施するため
に記載された方法の種々の改変は、分子生物学或いは関連する分野の専門家には
明らかなように、請求の範囲内に含まれるものである。
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考)
C07K 14/705 C07K 16/28
14/72 C12N 1/19
16/28 1/21
C12N 1/19 C12Q 1/68 A
1/21 G01N 33/53 M
5/10 33/566
C12Q 1/68 C12N 15/00 ZNAA
G01N 33/53 5/00 A
33/566 A61K 37/02
(81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE,
DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L
U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF
,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,
SN,TD,TG),AP(GH,GM,KE,LS,M
W,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM,AZ,BY
,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM),AT,AU
,BR,CA,CH,CN,DE,DK,ES,FI,
GB,IL,JP,KR,MX,NO,NZ,RU,S
E,SG,US
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.配列番号:1のアミノ酸配列又はその断片を含む実質的に精製されたヒトC 5a様タンパク質(HCOR)。 2.請求項1のヒトC5a様タンパク質をコードする単離され精製されたポリヌ クレオチド配列。 3.請求項2のポリヌクレオチド配列と厳密な条件の下でハイブリダイズするポ リヌクレオチド配列。 4.請求項2のポリヌクレオチド配列を含むハイブリダイゼーションプローブ。 5.配列番号:2の配列又はその変異体を含む単離され精製されたポリヌクレオ チド配列。 6.請求項2のポリヌクレオチド配列又はその変異体に相補的なポリヌクレオチ ド配列。 7.請求項6のポリヌクレオチド配列を含むハイブリダイゼーションプローブ。 8.請求項2のポリヌクレオチド配列を含む発現ベクター。 9.請求項8のベクターを含む宿主細胞。 10.配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチドの製造方法であって、 (a)該ポリペプチドの発現に適した条件の下で請求項9の宿主細胞を培養す る過程と、 (b)前記宿主細胞の培地から該ポリペプチドを回収する過程とを含むことを 特徴とする配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチドの製造方法。 11.配列番号:1のアミノ酸配列を有する実質的に精製されたヒトC5a様タ ンパク質を適切な製薬用担体と共に含む医薬品組成物。 12.請求項1のポリペプチドに特異的に結合する精製された抗体。 13.請求項1のポリペプチドに特異的に結合し、その活性を変調する精製され たアゴニスト。 14.請求項1のポリペプチドに特異的に結合し、その活性を変調する精製され たアンタゴニスト。 15.炎症の治療方法であって、 そのような治療が必要な患者に、請求項14の医薬品組成物を有効量投与する過 程を含む炎症の治療方法。 16.生物学的サンプルにおけるヒトC5a様タンパク質をコードするポリヌク レオチドの検出方法であって、 (a)請求項6のポリヌクレオチドと、生物学的サンプルの核酸材料とをハイ ブリダイズさせ、ハイブリダイゼーション複合体を形成する過程と、 (b)前記ハイブリダイゼーション複合体を検出する過程とを含むことを特徴 とし、 前記複合体の存在が、前記生物学的サンプルにおけるヒトC5a様タンパク質 をコードするポリヌクレオチドの存在と相関性を有することを特徴とする生物学 的サンプルにおけるヒトC5a様タンパク質をコードするポリヌクレオチドの検 出方法。 17.配列番号:1の配列と95%以上の配列同一性を有する単離されたアミノ 酸配列。
Applications Claiming Priority (3)
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