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JP2000501623A - Aspartic protease - Google Patents

Aspartic protease

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JP2000501623A
JP2000501623A JP10513354A JP51335498A JP2000501623A JP 2000501623 A JP2000501623 A JP 2000501623A JP 10513354 A JP10513354 A JP 10513354A JP 51335498 A JP51335498 A JP 51335498A JP 2000501623 A JP2000501623 A JP 2000501623A
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JP
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seq
polynucleotide
sequence
dna
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Pending
Application number
JP10513354A
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Japanese (ja)
Inventor
ポウェル,デビッド
ケイ,ジョン
ヒル,ジェフリー
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SmithKline Beecham Ltd
Original Assignee
SmithKline Beecham Ltd
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Publication date
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Pending legal-status Critical Current

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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
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    • C12N9/6421Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
    • C12N9/6478Aspartic endopeptidases (3.4.23)
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Abstract

(57)【要約】 本発明は、新たに同定されたポリヌクレオチド、該ポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、該ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの使用、ならびに該ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの生産に関する。さらに特定すると、本発明のポリペプチドは新規なアスパラギン酸プロテアーゼであると考えられる。本発明はまた、かかるポリペプチドの作用を阻害することに関する。   (57) [Summary] The present invention relates to newly identified polynucleotides, polypeptides encoded by the polynucleotides, uses of the polynucleotides and polypeptides, and production of the polynucleotides and polypeptides. More specifically, the polypeptides of the present invention are believed to be novel aspartic proteases. The invention also relates to inhibiting the action of such polypeptides.

Description

【発明の詳細な説明】 アスパラギン酸プロテアーゼ 本発明は、新たに同定されたポリヌクレオチド、該ポリヌクレオチドによりコ ードされるポリペプチド、該ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの使用、なら びに該ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの生産に関する。さらに特定すると 、本発明のポリペプチドは新規なアスパラギン酸プロテアーゼであると想定され る。本発明はまた、該ポリペプチドの作用を阻害することに関する。 現在、5種類のヒトアスパラギン酸プロテアーゼ、すなわち、ペプシン、ガス トリシン、カテプシンD、カテプシンEおよびレニンが知られており、これらは 様々な機能を有する。ペプシンとガストリシンは胃の中の栄養プロセスに関与し ており、カテプシンDはほぼ全ての細胞型におけるタンパク質の代謝回転に係わ りがあり、そしてレニンは前駆体アンギオテンシノーゲンからのアンギオテンシ ンの生成という高度に特異的な機能を有している。カテプシンEの正確な役割は 今のところ確認されていないが、それがいくつかの上皮細胞型に存在しているこ とは抗原プロセシングにおける役割を示唆している。カテプシンEはまた、ある 種の炎症状態、例えば胃のヘリコバクター・ピロリ(Helicobacter pylori)感染 に関与している可能性がある。 新規なアスパラギン酸プロテアーゼは細胞外機能をもっている可能性がある。 アスパラギン酸プロテアーゼを必要とすると考えられるが、関与する正確な酵素 がまだ同定されていないプロセスは目下数多く存在する。関係があるとされる重 要な機能はエンドセリンおよびプロ-オピオメラノコルチン・プロホルモンのプ ロセシングである。アスパラギン酸プロテアーゼは血清アミロイドAタンパク質 のプロセシングにも関与していると考えられる。 アスパラギン酸プロテアーゼは、ペプチド結合の加水分解切断に必要とされる アスパラギン酸(Asp)残基対ゆえに、そのように呼ばれている。触媒Asp残基は通 常-Hyd-Hyd-Asp-Thr-Gly-活性部位モチーフ配列(ここでHydは任意の疎水性アミ ノ酸である)内に位置している。真核生物のアスパラギン酸プロテアーゼは普通 このような配列を2つ保有しており、これらの配列は酵素の活性部位に互い に隣接して存在していることが結晶学により明らかにされた。これら。酵素のも う一つの高度に保存された部分はβ-ヘアピンループ構造(「flap」とも言う) を含み、この構造は活性部位の上にあり、基質の結合を支援している可能性があ る。 1996年10月22〜27日に開催された第VII回アスパラギン酸プロテアーゼ国際会 議でのプレゼンテーションにおいて、Okalahoma Medical Research Foundation のTangらによって新規なアスパラギン酸プロテアーゼが発表された。 本発明の一態様によると、配列番号1または配列番号15に示したアミノ酸配 列を含んでなる新規ポリペプチドまたはその断片、類似体もしくは誘導体が提供 される。本発明のポリペプチドはヒト由来のものである。このポリペプチドはア スパラギン酸プロテアーゼであると考えられる。 本発明のポリペプチドには、さらに、配列番号1または15に含まれるアミノ 酸配列をもつポリペプチド、および配列番号1または15のアミノ酸配列のいず れかに対して、その全長にわたり、少なくとも80%、好ましくは少なくとも90% 、より好ましくは95%、さらにより好ましくは少なくとも97〜99%の同一性を有 するアミノ酸配列を含むポリペプチドが含まれる。また、配列番号1または15 のアミノ酸配列のいずれかに対して、その全長にわたり、少なくとも80%、好ま しくは少なくとも90%、より好ましくは95%、さらにより好ましくは少なくとも 97〜99%の同一性を有するアミノ酸配列をもつポリペプチドも含まれる。本発明 のポリペプチドには、さらに、配列番号2または16のヌクレオチド配列に対し て、その全長にわたり、少なくとも80%の同一性を有するポリヌクレオチドによ りコードされるアミノ酸配列を含むポリペプチドも含まれる。 これらのポリペプチドは「成熟」タンパク質の形であっても、融合タンパク質 のような、より大きいタンパク質の一部であってもよい。しばしば、追加のアミ ノ酸配列を含めることが有利であり、このようなアミノ酸配列としては、分泌す なわちリーダー配列、プロ配列、多重ヒスチジン残基のような精製に役立つ配列 、または組換え体生産の際の安定性を確保する付加的配列などがある。 また、ポリペプチドの断片も本発明に含まれる。こうした断片は全体的に前記 ポリペプチドのアミノ酸配列の一部と同一であるが、全部とは同一でないアミノ 酸配列を有するポリペプチドである。このような断片は「フリースタンディング 」(free-standing)であっても、より大きいポリペプチド内に含まれていてもよ く、つまりその大きいポリペプチドの一部または一領域、最も好ましくは一つの 連続領域、をその断片が構成していてもよい。本発明のポリペプチド断片の代表 的な例として、およその見当でアミノ酸番号1−20、21−40、41−60、61−80、 81−100、および101から配列番号1または15のポリペプチドの末端までの断片 が挙げられる。ここで、「およそ」とは、上記の範囲の一端または両端で数個、 5個、4個、3個、2個または1個のアミノ酸が増えたり減ったりした範囲を含 むものである。 好適な断片としては、例えば、アミノ末端を含む一連の残基もしくはカルボキ シル末端を含む一連の残基の欠失、またはアミノ末端を含むものとカルボキシル 末端を含むものとの二連の残基の欠失を除外すれば、配列番号1または15のア ミノ酸配列を有する末端切断型(truncation)ポリペプチドが含まれる。また、α ヘリックスとαヘリックス形成領域、βシートとβシート形成領域、ターンとタ ーン形成領域、コイルとコイル形成領域、親水性領域、疎水性領域、α両親媒性 領域、β両親媒性領域、可変性領域、表面形成領域、基質結合領域、および高抗 原指数領域を含む断片のような、構造的または機能的特性により特徴づけられる 断片も好適である。その他の好適な断片は生物学的に活性な断片である。生物学 的に活性な断片は、同様の活性をもつ断片、その活性が増加した断片、または望 ましくない活性が減少した断片を含めて、生物学的活性例えばアスパラギン酸プ ロテアーゼ活性を媒介するものである。さらに、動物、特にヒトにおいて抗原性 または免疫原性がある断片も含まれる。 これらのポリペプチド断片はどれも、抗原活性を含めた前駆体ポリペプチドの 生物学的活性を保持することが好ましい。特定された配列および断片の変異型も 本発明の一部を構成する。好適な変異型は同類アミノ酸置換により対象物と異な るもの、すなわち、ある残基が同様の性質をもつ他の残基で置換されているもの である。典型的なこうした置換は、Ala,Val,LeuおよびIleの間;SerとThrの間 ;酸性残基AspとGluの間;AsnとGlnの間;塩基性残基LysとArgの間;または芳香 族残基PheとTyrの間で起こる。特に、数個、5〜10個、1〜5個ま たは1〜2個のアミノ酸が任意の組合せで置換、欠失または付加されている変異 型が好適である。 本発明のポリペプチドは任意の適当な方法で製造することができる。このよう なポリペプチドには、単離された天然のポリペプチド、組換え的に生産されたポ リペプチド、合成的に製造されたポリペプチド、またはこれらの方法の組合せに より製造されたポリペプチドが含まれる。このようなポリペプチドの製造手段は 当業界でよく理解されている。 本発明の他の態様によると、前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド (DNAまたはRNA)が提供される。 本発明の好ましい態様では、配列番号1または配列番号15のアミノ酸配列を 有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが提供される。 特に、本発明は、配列番号2または配列番号16に示したDNA配列を有する ポリヌクレオチドを提供する。本発明はさらに、配列番号2または配列番号16 に示したDNA配列を含む、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを提供 する。 本発明のポリヌクレオチドには、さらに、配列番号1または配列番号15のポ リペプチドをコードするヌクレオチド配列に対して、その全長にわたり、少なく とも80%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%の同一性 を有するヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド、および配列番号2または配 列番号16のヌクレオチド配列に対して、その全長にわたり、少なくとも80%、 好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%の同一性を有するヌ クレオチド配列を含むポリヌクレオチドが含まれる。さらに、少なくとも97%の 同一性をもつものが一層好ましく、少なくとも98〜99%の同一性をもつものがよ り一層好ましく、少なくとも99%の同一性をもつものが最も好ましい。 配列番号2および配列番号16のcDNAに対して広範な同一性部分を示すc DNA分子(EST)がさまざまな源から作製されたヒト由来のcDNAライブ ラリーにおいて同定された。これらのESTは配列番号3〜14に示される。 配列番号: ライブラリー: 配列番号3(EST 176432) Raji細胞、シクロヘキサミド処理した 配列番号4(EST 424772) ヒトB細胞リンパ腫 配列番号5(EST 443275) 胸部リンパ節cDNAライブラリー 配列番号6(EST 567394) Raji細胞、シクロヘキサミド処理した 配列番号7(EST 685578) ヒト活性化単球 配列番号8(EST 928138) 胎児肝臓、サブトラクションII 配列番号9(EST 947785) 胸部リンパ節cDNAライブラリー 配列番号10(EST 1000163) 脊髄 配列番号11(EST 1218021) 脾臓、慢性リンパ性白血病 配列番号12(EST 1320439) ヒト扁桃腺、lib2 配列番号13(EST 716478) cd34枯渇バッフィーコート臍帯血 配列番号14(EST 857644) ヒト成人精巣、ラージインサート したがって、更なる態様において、本発明は、配列番号3〜14から選択され る1以上の部分的DNA配列により特徴づけられるアスパラギン酸プロテアーゼ をコードするポリヌクレオチドを提供する。 配列番号2および配列番号16のポリヌクレオチドは構造的にアスパラギン酸 プロテアーゼファミリーと関係がある。配列番号2および配列番号16はそれぞ れ1376個および1347個のヌクレオチドを有する。第1(すなわちN末端)の活性 部位モチーフは-Ala-Phe-Asp-Thr-Gly-であると考えられ、少なくとも2つのE ST(配列番号11および12)により、それぞれの場合に同一のDNA配列(- GCC-TTT-GAC-ACT-GGC-)でコードされている。第2(すなわちC末端)の活性部 位モチーフは-Ile-Leu-Asp-Thr-Gly-であると考えられ、少なくとも1つのES T(配列番号13)により(DNA配列-ATC-CTG-GAT-ACA-GGC-で)コードされ ている。この酵素の保存されたflap領域は-Tyr-Gly-Thr-Gly-であると考えられ 、すべての場合に同一のDNA配列(-TAT-GGA-ACT-GGG-)を有する少なくとも 4つのEST(配列番号9、10、5および12)によりコードされている。配 列番号1および配列番号15の配列は、新規なアスパラギン酸プロテアーゼの成 熟型の全長を含み、さらにプロ部分(またはプロセグメント)を含有する約60ア ミノ酸を含むと想定される。配列番号1中に開始Met残基も同定され、ヌクレオ チド26からORFが開始する。簡便なblast配列解析からは、配列番号15のポ リ ペプチドはニワトリ由来のプレプロカテプシンDに対して最も高い相同性を示す ことが示される。しかしながら、配列番号1および配列番号15のポリペプチド は、機能的なレベルでは、N末端活性部位モチーフをコードする配列の直前にあ るカテプシンE特異的グリコシル化部位(-Asn-Phe-Thr-)の存在ゆえにカテプシ ンEに最も類似していると思われる。このポリペプチドと関連したESTが多く の細胞型に広く分布していることにより、コードされたポリペプチドは(カテプ シンEとカテプシンDに類似した)非特異的加水分解機能をもつことが示唆され る。 本発明のポリヌクレオチドはRNAの形であっても、DNAの形であってもよ く、DNAにはcDNA、ゲノムDNAおよび合成DNAが含まれる。このDN Aは二本鎖または一本鎖であり得、一本鎖の場合はコード鎖であっても非コード (アンチセンス)鎖であってもよい。本発明のポリペプチドをコードするコード 配列は、配列番号2または配列番号16に示されるコード配列と同一であっても 、遺伝子コードの重複性または縮重のため、配列番号2または配列番号16のD NAと同じポリペプチドをコードする異なるコード配列であってもよい。 本発明は、配列番号1または配列番号15のアミノ酸配列をもつポリペプチド の断片、類似体および誘導体をコードする前記ポリヌクレオチドの変異体を包含 する。ポリヌクレオチド変異体はポリヌクレオチドの天然に存在するアレル変異 体または天然に存在しない変異体であり得る。 かくして、本発明は、配列番号1または配列番号15に示したポリペプチドと 同じポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、ならびに該ポリペプチドの断 片、誘導体または類似体をコードする前記ポリヌクレオチドの変異体を包含する 。このようなヌクレオチド変異体には欠失変異体、置換変異体、および付加また は挿入変異体が含まれる。 本発明のポリヌクレオチドは配列番号2または配列番号16のコード配列の天 然のアレル変異体であるコード配列をもっていてもよい。当技術分野で知られて いるように、アレル変異体はコードされるポリペプチドの機能を実質的に変えな い1個以上のヌクレオチドの置換、欠失または付加を有するポリヌクレオチド配 列の別の形態である。 配列番号1または配列番号15のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド は、該ポリペプチドのコード配列のみ、該ポリペプチドのコード配列とリーダー もしくは分泌配列またはプロタンパク質配列のような付加的コード配列、および 該ポリペプチドのコード配列(および場合により付加的コード配列)と成熟ポリ ペプチドのコード配列の5'および/または3'側の非コード配列やイントロンの ような非コード配列を含むことができる。 こうして、「ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド」は、該ポリペプチ ドのコード配列のみを含むポリヌクレオチドばかりでなく、付加的コード配列お よび/または非コード配列を含むポリヌクレオチドをも包含する。 本発明は、したがって、該ポリペプチドのコード配列が宿主細胞からのポリペ プチドの発現および分泌に役立つポリヌクレオチド配列(例えば、宿主細胞から のポリペプチドの輸送を制御する分泌配列として機能するリーダー配列)に同じ リーディングフレームで融合されたポリヌクレオチドを含む。リーダー配列をも つポリペプチドはプレタンパク質であり、このリーダー配列が宿主細胞によって 切断されると成熟型のポリペプチドが生成する。こうしたポリヌクレオチドはま た、成熟タンパク質に5'アミノ酸残基が付加されているプロタンパク質をコー ドすることもできる。プロ配列をもつ成熟タンパク質はプロタンパク質であり、 該タンパク質の不活性型である。このプロ配列が切断されると、活性な成熟タン パク質となる。 かくして、例えば、本発明のポリヌクレオチドは成熟タンパク質、プロ配列を もつタンパク質、またはプロ配列とプレ配列(リーダー配列)の両方をもつタン パク質をコードし得る。 本発明のポリヌクレオチドはまた、本発明のポリペプチドの精製を可能にする マーカー配列に同じリーディングフレームで融合されたコード配列を有していて もよい。このマーカー配列はpQE-9ベクターにより供給されるヘキサ-ヒスチ ジンタグであり得、細菌宿主の場合にはこのマーカーに融合された成熟ポリペプ チドの精製を可能にし、また、例えば、哺乳動物宿主(例:COS-7細胞)を用 いる場合のマーカー配列は赤血球凝集素(HA)タグであり得る。このHAタグ はインフルエンザ赤血球凝集素タンパク質から誘導されたエピトープに相当する (Wilson,I.ら,Cell,37:767(1984))。 本発明はさらに、配列間に少なくとも50%、好ましくは70%の同一性が存在す るとき上記配列にハイブリダイズするポリヌクレオチドに関する。本発明は特に 、ストリンジェント条件下で上記ポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌ クレオチドに関する。本明細書中で用いる「ストリンジェント条件」とは、配列 間に少なくとも95%、好ましくは少なくとも97%の同一性が存在するときだけハ イブリダイゼーションが起こる条件を指す。好ましい態様において、上記ポリヌ クレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドは、配列番号1または配列番 号15のポリペプチドと実質的に同じ生物学的機能または活性を保持しているポ リペプチドをコードする。 配列番号1または配列番号15のポリペプチドを言及するときの「断片」、「 誘導体」および「類似体」という用語は、かかるポリペプチドと本質的に同じ生 物学的機能または活性を保持しているポリペプチドを意味する。こうして、類似 体には、プロタンパク質部分の開裂により活性化されて成熟型の活性ポリペプチ ドを生成するプロタンパク質が含まれる。 本明細書中で用いる「同一性」という用語はヌクレオチド配列またはアミノ酸 配列の同一性の尺度である。一般に、最大級のマッチ(一致)が得られるように 配列をアライメントする。「同一性」それ自体は当技術分野で認識された意味を もち、発表された技法を使って計算することができる。例えば、COMPUTATIONALM OLECULAR BIOLOGY,Lesk,A.M.編,Oxford University Press,New York,1988 ; BIOCOMPUTING: INFORMATICS AND GENOME PROJECTS,Smith,D.W.編,Academi c Press,New York,1993; COMPUTER ANALYSIS OF SEQUENCE DATA,PARTI,Grif fin,A.M.and Griffin,H.G.編,Humana Press,New Jersey,1994; SEQUENCE ANALYSIS IN MOLECULAR BIOLOGY,von Heinje,G.,Academic Press,1987; お よびSEQUENCE ANALYSIS PRIMER,Gribskov,M.and Devereux,J.編,M Stockto n Press,New York,1991を参照のこと。2つのポリヌクレオチドまたはポリペ プチド配列間の同一性を決定する方法は多数存在していると同時に、「同一性」 なる用語は当業者には公知である(Carillo,H.and Lipton,D.,SIAM J Appli ed Math(1988)48:1073)。2つの配列間の同一性または類似性を 決定するために汎用される方法としては、Guide to Huge Computers,Martin J. Bishop編,Academic Press,San Diego,1994およびCarillo,H.and Lipton,D .,SIAM J Applied Math(1988)48:1073に記載される方法があるが、これらに 限らない。同一性および類似性の決定方法はコンピュータプログラムに体系化さ れている。2つの配列間の同一性および類似性を決定するための好適なコンピュ ータプログラム法としては、GCSプログラムパッケージ(Devereux,J.ら,Nuclei c Acids Research(1984)12(1):387)、BLASTP、BLASTN、FASTA(Atschul,S.F. ら,J Molec Biol(1990)215:403)があるが、これらに限らない。 一例として、配列番号2/16の基準ヌクレオチド配列に対して、例えば、少 なくとも95%の「同一性」を有するヌクレオチド配列をもつポリヌクレオチドと は、このポリヌクレオチドのヌクレオチド配列が配列番号2/16の基準ヌクレ オチド配列のそれぞれ100ヌクレオチドにつき最高で5つの点突然変異を含みう ることを除けば、基準配列と同一であることを意図している。言い換えると、基 準ヌクレオチド配列と少なくとも95%同一であるヌクレオチド配列を有するポリ ヌクレオチドを得るには、基準配列中のヌクレオチドの5%までを欠失させるか 、他のヌクレオチドで置換するか、または基準配列中の全ヌクレオチドの5%ま でのヌクレオチド数を基準配列に挿入すればよい。基準配列のこれらの突然変異 は、基準ヌクレオチド配列の5'もしくは3'末端位置、またはこれらの末端位置 の間のどこで起こってもよく、基準配列中のヌクレオチドの間に個々に、または 基準配列内に1以上の連続するグループとして配置することができる。 同様に、配列番号1/15の基準アミノ酸配列に対して、例えば、少なくとも 95%の「同一性」を有するアミノ酸配列をもつポリペプチドとは、このポリペプ チドのアミノ酸配列が基準アミノ酸配列のそれぞれ100アミノ酸につき最高で5 アミノ酸の変更を含みうることを除けば、基準配列と同一であることを意図して いる。言い換えると、基準アミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配 列を有するポリペプチドを得るには、基準配列中の5%までのアミノ酸残基を欠 失させるか、他のアミノ酸で置換するか、または基準配列中の全アミノ酸残基の 5%までのアミノ酸数を基準配列に挿入すればよい。基準配列のこれらの変更は 、基準アミノ酸配列のアミノもしくはカルボキシ末端位置、またはこれらの末端 位 置の間のどこで起こってもよく、基準配列中のアミノ酸残基の間に個々に、また は基準配列内に1以上の連続したグループとして配置することができる。 本発明のポリペプチドは組換え体ポリペプチド、天然ポリペプチドまたは合成 ポリペプチドであり得るが、組換え体ポリペプチドであることが好ましい。 配列番号1または配列番号15のポリペプチドの断片、誘導体または類似体は 、(i)1以上のアミノ酸残基が同類または非同類アミノ酸残基(好ましくは同類 アミノ酸残基)で置換されているもの(置換されたアミノ酸残基は遺伝子コード でコードされるものでも、コードされないものでもよい)、(ii)1以上のアミノ 酸残基が置換基を含んでいるもの、(iii)成熟ポリペプチドが、該ポリペプチド の半減期を延長する化合物(例えばポリエチレングリコール)のような他の化合 物と融合されているもの、または(iv)成熟ポリペプチドに付加的アミノ酸(例え ば、リーダーもしくは分泌配列、成熟ポリペプチドの精製に用いられる配列、ま たはプロタンパク質配列)が融合されているもの、であり得る。このような断片 、誘導体および類似体は本明細書の教示内容から当業者の技量の範囲内であると 考える。 本発明のポリペプチドおよびポリヌクレオチドは単離された形で取得すること が好ましく、均一になるまで精製することが有利である。 「単離された」という用語は、その物質がその元の環境(例えば、それが天然 に存在するものであれば自然環境)から分離されていることを意味する。例えば 、生存動物内に存在する天然のポリヌクレオチドまたはポリペプチドは単離され ていないが、天然系内の共存物質の一部または全部から分離されたポリヌクレオ チドまたはポリペプチドは単離されたものである。このようなポリヌクレオチド はベクターの一部であっても、かつ/また、このようなポリヌクレオチドまたは ポリペプチドは組成物の一部であってもよく、こうしたベクターまたは組成物は その自然環境の一部ではないという点でやはり単離されたものである。ポリペプ チドは精製形態であることが好ましい。精製形態とは、他のタンパク質汚染物質 に対して少なくとも80%、好ましくは90%、より好ましくは95%、最も好ましく は99%純化されていることを意味する。 本発明のDNAはまた、この酵素を発現できないまたは発現する動物を相同的 組換えまたは「ノックアウト」戦略(Kapecchi,Science,244:1288-1292(1989) )により開発することを可能にする。 本発明はさらに、本発明のポリヌクレオチドを含有するベクター、本発明のベ クターを用いて遺伝子工学的に作製された宿主細胞、および組換え法による本発 明のポリペプチドの産生に関する。 したがって、本発明のさらに他の態様によると、宿主において本発明のポリペ プチドをコードするポリヌクレオチドを発現させ、その発現産物を回収すること を含んでなる、組換え法による本発明のポリペプチドの産生方法が提供される。 あるいはまた、本発明のポリペプチドは慣用のペプチド合成機を使って合成によ り製造することもできる。 宿主細胞は、例えばクローニングベクターまたは発現ベクターであり得る本発 明のベクターを用いて遺伝子操作(形質導入、形質転換またはトランスフェクシ ョン)される。このベクターは例えばプラスミド、コスミド、ファージなどの形 であってよい。遺伝子操作された宿主細胞は、プロモーターの活性化、形質転換 体の選択または遺伝子の増幅のために適宜改良された慣用の栄養培地で培養する 。温度、pHなどの培養条件は、発現用に選択された宿主細胞に関して以前に用 いられた条件と同じであり、当業者には明らかだろう。 適当な発現ベクターとして、染色体、非染色体および合成DNA配列(例:SV 40の誘導体)、細菌プラスミド、ファージDNA、バキュロウイルス、酵母プラ スミド、プラスミドとファージDNAの組合せから誘導されたベクター、ウイル スDNA(例:ワクシニア、アデノウイルス、鶏痘ウイルス、仮性狂犬病ウイル ス)が挙げられる。しかし、宿主内で複製し生存できれば、他のベクターも使用 可能である。 適当なDNA配列をベクターに挿入するには、いろいろな方法を用いることが できる。一般には、当技術分野で公知の方法によりDNA配列を適当な制限エン ドヌクレアーゼ部位に挿入する。こうした方法および他の方法は当業者の技量の 範囲内であると考える。 発現ベクター中のDNA配列は、mRNAの合成を指令する適当な発現制御配 列(プロモーター)に機能的に連結される。このようなプロモーターの代表的な 例として、次のものを挙げることができる。すなわち、LTRまたはSV40プロモー ター、大腸菌のlacまたはtrp、ファージλPLプロモーター、および原核もしく は真核細胞またはそれらのウイルス中の遺伝子の発現を制御することが知られて いる他のプロモーターである。発現ベクターは翻訳開始のためのリボソーム結合 部位および転写ターミネーターをも含み、発現増幅用の適当な配列を含んでいて もよい。 さらに、発現ベクターは形質転換宿主細胞を選択するための表現型性質、例え ば、真核細胞培養物ではジヒドロ葉酸レダクターゼまたはネオマイシン耐性、大 腸菌ではテトラサイクリンまたはアンピシリン耐性、を付与する1以上の選択マ ーカー遺伝子を含むことが好ましい。 遺伝子はプロモーターとリボソーム結合部位(細菌による発現の場合)と、場 合によりオペレーター(これらをまとめて本明細書中では「制御」エレメントと いう)の制御下に配置され、その結果、この発現構築物を含むベクターで形質転 換された宿主細胞では所望のタンパク質をコードするDNA配列がRNAに転写 される。コード配列はシグナルペプチドまたはリーダー配列を含んでいても、含 んでいなくてもよい。本発明のタンパク質配列は、例えば大腸菌のtacプロモー ターまたはプロテインA遺伝子(spa)プロモーターおよびシグナル配列を用いて 発現させることができる。翻訳後プロセシングにおいて細菌宿主によりリーダー 配列が除去される。プロモーター領域はCAT(クロラムフェニコールトランスフェ ラーゼ)ベクターまたは選択マーカーをもつ他のベクターを用いて所望の遺伝子 から選択できる。2つの適当なベクターはPKK232-8とPCM7である。特に細菌プロ モーターの名を挙げると、lacI、lacZ、T3、T7、gpt、λPR、PLおよびtrpがあ る。真核細胞プロモーターとしては、CMV即時型、HSVチミジンキナーゼ、初期お よび後期SV40、レトロウイルス由来のLTRおよびマウス・メタロチオネイン-Iが ある。適当なベクターおよびプロモーターの選択は当業者の技量の範囲内である 。 制御配列のほかに、宿主細胞の増殖に対してタンパク質配列の発現を調節しう る調節配列を加えることが望ましいかもしれない。調節配列は当業者には公知で あり、例えば、調節化合物の存在を含む化学的または物理的刺激に応答して遺伝 子の発現を誘導または中止するものが含まれる。他のタイプの調節エレメント、 例えばエンハンサー配列がベクター中に存在してもよい。 発現ベクターは、特定のコード配列を適当な調節配列をもつベクター中に位置 づけるように構築され、制御配列に対するコード配列の位置づけおよび方向は、 コード配列が制御配列の「制御」下で転写される(すなわち、制御配列の位置で DNA分子に結合するRNAポリメラーゼがコード配列を転写する)ようなもの である。この目的を達成するためにはコード配列を修飾することが望ましいかも しれない。例えば、いくつかの場合には、コード配列が適切な方向で制御配列に 結合され得るように、すなわちリーディングフレームを維持するように、コード 配列を修飾することが必要である。制御配列と他の調節配列は、ベクター(例え ば上記のクローニングベクター)への挿入に先立って、コード配列に連結させて もよい。あるいはまた、制御配列と適切な制限部位をすでに含む発現ベクターに コード配列を直接クローン化することもできる。また、発現を高めるために、所 定の宿主細胞に適合するコドンの使用に変えるべくコード配列を修飾してもよい 。 一般的に、組換え発現ベクターは、複製起点と、宿主細胞の形質転換を可能に する選択マーカー(例えば、大腸菌のアンピシリン耐性遺伝子およびS.cerevis iaeのTRP1伝子)と、下流構造配列の転写を指令する高発現遺伝子由来のプロモ ーターを含むだろう。異種構造配列は翻訳開始および終止配列と、好ましくは細 胞周辺腔または細胞外培地への翻訳タンパク質の分泌を指令できるリーダー配列 とも、リーディングフレームを適切に合わせて組み立てられる。場合により、異 種配列は所望の特性(例えば、組換え発現産物の安定化または簡便な精製)を付 与するN末端同定ペプチドを含む融合タンパク質をコードしていてもよい。 上記のような適当なDNA配列と適当なプロモーターまたは制御配列を含有す るベクターを用いて適切な宿主を形質転換し、該宿主にタンパク質を発現させる ことができる。 クローニング用の組換えDNAベクターおよびそれらが形質転換しうる宿主細 胞の例として、バクテリオファージλ(大腸菌)、pBR322(大腸菌)、pACYC177 (大腸菌)、pKT230(グラム陰性菌)、pGV1106(グラム陰性菌)、pLAFR1(グ ラム陰性菌)、pME290(非大腸菌グラム陰性菌)、pHV14(大腸菌と枯草菌)、p BD9(枯草菌)、pIJ61(ストレプトミセス)、pUC6(ストレプトミセス)、YIp5 (サッカロミセス)、バキュロウイルス昆虫細胞系、YCp19(サッカロミセス) などがある。総論としては、“DNA Cloning”:Vols.I & II,Gloverら編,IRL Press Oxford(1985)(1987)およびT.Maniatisら,“Molecular Cloning”Cold Spring Harbor Laboratory(1982)を参照のこと。 ある場合には、宿主生物からのポリペプチドの分泌と、その後の分泌シグナル の開裂を引き起こす配列を加えることが望ましいかもしれない。 酵母発現ベクターも当技術分野で知られている。例えば、米国特許第4,446,23 5号、第4,443,539号、第4,430,428号を参照のこと。また、ヨーロッパ特許出願 第103,409号、第100,561号、第96,491号も参照のこと。pSV2neo(J.Mol.Appl.G enet.1:327-341に記載)は哺乳動物細胞において発現を指令するためにSV40後期 プロモーターを使用しており、pCDNA1から誘導されたベクターpCDNA1neo(Mol. Cell Biol.7:4125-29)は発現を指令するためにCMVプロモーターを使用してい る。これら2種類のベクターはいずれも、哺乳動物細胞における一過性の発現ま たは安定な(G418耐性を使用)発現のために使用される。昆虫細胞発現系(例え ばショウジョウバエ)も有用であり、例えば、PCT出願WO 90/06358およびWO 92/ 06212ならびにEP290,261-B1を参照のこと。 ポリペプチドは適当なプロモーターの制御下で宿主細胞において発現させるこ とができる。本発明のDNA構築物から誘導されたRNAを用いて前記タンパク 質を産生させるために無細胞翻訳系も使用し得る。原核および真核細胞宿主と共 に使用するのに適したクローニングおよび発現ベクターは、Sambrookら,Molecu lar Cloning: A Laboratory Manual,第2版,Cold Spring Harbor,N.Y.(1989 )に記載されており、その開示内容を参考としてここに組み入れる。 高等真核細胞による本発明のポリペプチドをコードするDNAの転写は、ベク ターにエンハンサー配列を挿入することで増大できる。エンハンサーはDNAの シス作用エレメントで、通常は約10〜300 bpであり、プロモーターに作用してそ の転写を増大させる。例を挙げると、bp 100から270までの複製起点の後期側のS V40エンハンサー、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製 起点の後期側のポリオーマエンハンサー、およびアデノウイルスエンハンサーな どがある。 更なる態様において、本発明は上記のベクターを含む宿主細胞に関する。この 宿主細胞は哺乳動物細胞のような高等真核細胞、または酵母細胞のような下等真 核細胞であり得、また、宿主細胞は細菌細胞のような原核細胞であってもよい。 適当な宿主の代表例として、次のものを挙げることができる。原核細胞としては 、例えば大腸菌、ストレプトミセス、サルモネラ・ティフィムリウム(Salmonell atyphimurium)などの細菌細胞、真核細胞としては、例えば酵母のような真菌細 胞、ショウジョウバエ(Drosophila)やスポドプテラ・フルギペルダ(Spodopteraf rugiperda)のような昆虫細胞、CHO、COSまたはBowesメラノーマのような哺乳動 物細胞、植物細胞などである。適当な宿主の選択は本明細書の教示内容から当業 者の技量の範囲内であると考える。 宿主細胞への構築物の導入は、リン酸カルシウムトランスフェクション、DEAE -デキストラン媒介トランスフェクション、エレクトロポレーションなどにより 行うことができる(Davis,L.,Dibner,M.,Battey,I.,Basic Methods in Mol ecular Biology(1986))。 適当な宿主株の形質転換および適当な細胞密度への宿主株の増殖後、所定のプ ロモーターを適切な手段(例えば、温度シフトまたは化学的誘導)で誘導し、細 胞を更なる時間培養する。 細胞を典型的には遠心分離により回収し、物理的または化学的手段で破壊し、 得られる粗製抽出物をその後の精製のために取っておく。 タンパク質の発現に使用した微生物細胞は、凍結−解凍サイクル、超音波処理 、機械的破壊または細胞溶解剤の使用を含めて、どのような方法でも破壊するこ とができ、かかる方法は当業者に公知である。 組換えタンパク質を発現させるために種々の哺乳動物細胞培養系も使用できる 。哺乳動物発現系の例として、Gluzman,Cell,23:175(1981)に記載されるサル 腎繊維芽細胞のCOS-7系、および適合性のベクターを発現することができる他の 細胞系、例えば、C127、3T3、CHO、HeLaおよびBHK細胞系がある。哺乳動物の発 現ベクターは複製起点、適当なプロモーターおよびエンハンサーを含み、さらに 必要なリボソーム結合部位、ポリアデニル化部位、スプライス供与および受容部 位、転写終止配列、および5'フランキング非翻訳配列も含むだろう。必要とさ れる非転写遺伝子エレメントを得るためにSV40スプライスおよびポリアデニル化 部位由来のDNA配列を用いてもよい。 選択した発現系および宿主に応じて、上記発現ベクターにより形質転換された 宿主細胞を目的のポリペプチドが発現される条件下で増殖させることで、本発明 のポリペプチドを産生させる。その後該ポリペプチドを宿主細胞から単離して精 製する。発現系が該ポリペプチドを増殖培地に分泌する場合は、その培地から該 ポリペプチドを直接精製することができる。ポリペプチドが分泌されない場合は 、それを細胞溶解物から単離するか、または細胞膜画分から回収する。ポリペプ チドが細胞表面に局在する場合は、全細胞または分離した膜を所望遺伝子産物の アッセイ可能な源として使用できる。大腸菌のような細菌宿主により発現された ポリペプチドは封入体からの分離および再生・復元を必要とするかもしれない。 適切な増殖条件および回収方法の選択は当業者の技量の範囲内である。 ポリペプチドを組換え細胞培養物から回収し精製するには、硫酸アンモニウム またはエタノール沈殿、酸抽出、アニオンまたはカチオン交換クロマトグラフィ ー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー 、アフィニティークロマトグラフィー、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィ ー、およびレクチンクロマトグラフィーを含む種々の方法を用いることができる 。成熟タンパク質の立体配置を完成させるために、必要に応じて、タンパク質再 生ステップを採用してもよい。最後に、最終精製ステップとして高性能液体クロ マトグラフィー(HPLC)を用いることができる。 組換え体の産生方法で用いた宿主に応じて、本発明のポリペプチドはグリコシ ル化体であったり、非グリコシル化体であったりする。また、本発明のポリペプ チドは最初のメチオニンアミノ酸残基を含んでいてもよい。 本発明のポリペプチドは同様の生物学的活性をもつ他の分子を同定する際にも 有用である。そのようなスクリーニングの例は、オリゴヌクレオチドプローブを 合成するためにまたはプローブそれ自体として既知のDNA配列を用いることに より、アスパラギン酸プロテアーゼ遺伝子のコード領域を単離することである。 本発明の遺伝子配列に相補的な配列をもつ標識オリゴヌクレオチドを用いて、ヒ トcDNA、ゲノムDNAまたはmRNAのライブラリーをスクリーニングして 、該プローブがライブラリーのどのメンバーとハイブリダイズするかを調べる。 本発明のポリペプチドは、しばしば「遺伝子治療」と称するポリペプチドのin vivo発現により本発明に従って使用することもできる。 こうして、例えば、患者由来の細胞を、ポリペプチドをコードするポリヌクレ オチド(DNAまたはRNA)を用いてex vivoで遺伝子工学的に操作し、その 後操作した細胞を該ポリペプチドで治療すべき患者に導入する。こうした方法は 当技術分野で公知である。例えば、本発明のポリペプチドをコードするRNAを 含むレトロウイルス粒子を使用することにより公知の方法で細胞を遺伝子工学的 に操作することができる。 同様に、ポリペプチドのin vivo発現のために、例えば当技術分野で公知の方 法により、細胞をin vivoで遺伝子工学的に操作することもできる。当技術分野 で知られているように、本発明のポリペプチドをコードするRNAを含むレトロ ウイルス粒子を産生するためのプロデューサー細胞を、細胞のin vivo遺伝子工 学的操作およびポリペプチドのin vivo発現のために患者に投与しうる。かかる 方法により本発明のポリペプチドを投与する方法および他の方法は、本発明の教 示から当業者には明らかだろう。例えば、細胞を遺伝子工学的に操作するための 発現ベヒクルはレトロウイルス以外のもの、例えばアデノウイルスであってもよ く、アデノウイルスを適当な送達ベヒクルと組み合わせた後にin vivoで細胞を 遺伝子操作するために使用することができる。 「組換え」ポリペプチドとは、組換えDNA法により産生されたポリペプチド 、すなわち、目的のポリペプチドをコードする外来DNA構築物により形質転換 された細胞から産生されたポリペプチドのことである。「合成」ポリペプチドは 化学合成により製造されたものである。 「レプリコン」は、in vivoで自律DNA複製単位として機能する、すなわち 、それ自身の制御下で複製する能力がある遺伝的エレメント(例:プラスミド、 染色体、ウイルス)である。 「ベクター」は、他のDNAセグメントと結合することができ、結合したセグ メントの複製を生じさせるような、プラスミド、ファージ、コスミドなどのレプ リコンである。 「二本鎖DNA分子」とは、二本鎖ヘリックス(弛緩およびスーパーコイルの 両方)の形をしたデオキシリボヌクレオチド(塩基アデニン、グアニン、チミン またはシトシン)のポリマー形態のことである。この用語はこの分子の一次およ び二次構造を指すにとどまり、それを特定の三次形態に限定することを意味しな い。したがって、この用語は、中でも、線状DNA分子(例:制限フラグメント )、ウイルス、プラスミドおよび染色体中に存在する二本鎖DNAを含む。特定 の二本鎖DNA分子の構造を記述するとき、本明細書では、DNAのセンス鎖に 沿って5'から3'の方向で示す慣例に従って配列を記載する。 特定のタンパク質のDNA「コード配列」または特定のタンパク質を「コード するヌクレオチド配列」は、適当な調節配列の制御下に配置したとき、ポリペプ チドに転写および翻訳されるDNA配列のことである。 「プロモーター配列」は、細胞内でRNAポリメラーゼと結合して下流(3' 方向)のコード配列の転写を開始させることができるDNA調節領域である。転 写開始部位(ヌクレアーゼS1を用いるマッピングにより簡便に規定される)およ びRNAポリメラーゼの結合に関与するタンパク質結合ドメイン(コンセンサス 配列)はプロモーター配列内に見いだせるだろう。真核細胞プロモーターはしば しば(いつもとは限らないが)「TATA」ボックスおよび「CAT」ボックスを含む だろう。 DNA「制御配列」とは、宿主細胞におけるコード配列の発現(すなわち、転 写および翻訳)をもたらすプロモーター配列、リボソーム結合部位、ポリアデニ ル化シグナル、転写終止配列、上流の調節ドメイン、エンハンサーなどをひとま とめにして指す用語である。 制御配列は、RNAポリメラーゼがプロモーター配列と結合してコード配列を mRNAに転写し、その後mRNAが該コード配列によりコードされるポリペプ チドに翻訳されるとき、細胞内でコード配列の「発現を指令する」。 「宿主細胞」は、外来DNA配列により形質転換もしくはトランスフェクショ ンされた細胞、または外来DNA配列による形質転換またはトランスフェクショ ンが可能な細胞である。 外来DNAが細胞膜の内側に導入されているとき、細胞は外来DNAにより「 形質転換」されている。外来DNAは細胞のゲノムを構成する染色体DNAに組 み込まれていても(共有結合で連結されていても)いなくてもよい。例えば、原 核細胞や酵母では、外来DNAがプラスミドのようなエピソームエレメント上に 保持されていてもよい。真核細胞に関して、安定に形質転換またはトランスフェ クションされた細胞とは、染色体の複製を通して娘細胞によって受け継がれるよ うに外来DNAが染色体に組み込まれている細胞のことである。この安定性は、 外来DNAを含有する娘細胞の集団からなる細胞系またはクローンを樹立する真 核細胞の能力により実証される。 「クローン」は有糸分裂により1個の細胞または共通の先祖から誘導された細 胞の集団である。「細胞系」は多くの世代にわたりin vitroで安定して増殖する ことができる初代細胞のクローンである。 2つのDNAまたはポリペプチド配列は、そのヌクレオチドまたはアミノ酸の 少なくとも約85%(好ましくは少なくとも約90%、最も好ましくは少なくとも約 95%)が該分子の一定の長さにわたり一致するとき、「実質的に相同」または「 実質的に同一」であり、これにはアレル変異体が含まれる。本明細書中で用いる 「実質的に相同」とは、特定のDNAまたはポリペプチド配列に対して同一性を 示す配列をも指す。実質的に相同なDNA配列は、特定の系のために規定された (例えばストリンジェントな)条件下でのサザンハイブリダイゼーション実験に より同定できる。適当なハイブリダイゼーション条件を規定することは当業者の 技量の範囲内である。例えば、“Current Protocols in Mol.Biol.”Vol.I & I I,Wiley Interscience,Ausbelら編(1992)を参照のこと。実質的に同一であ るタンパク質配列は、タンパク質加水分解消化、ゲル電気泳動およびミクロシー クエンシングにより同定できる。 「機能的に等しい」という用語は、対象タンパク質のアミノ酸配列がアスパラ ギン酸プロテアーゼと同じ種類の酵素活性を示すものであることを意味する。 DNA構築物の「異種」領域は、天然ではもう一方の分子と結合状態で存在し ない別のDNA分子内のまたは該別のDNA分子に結合された同定可能なDNA セグメントである。 本発明のポリペプチドは治療に使用することができる。したがって、更なる態 様において、本発明は、治療に用いるための配列番号1または配列番号15に示 したアミノ酸配列を有するポリペプチド、およびその断片、類似体または誘導体 を提供する。適切には、かかるポリペプチドは高血圧、炎症、喘息および心肺疾 患を含むがこれらに限らない機能障害または疾患を防止し、改善し、治療する上 である役割を果たし得るものである。 本発明のポリペプチドおよびポリヌクレオチドは適当な製剤学上の担体と共に 用いられる。このような組成物は治療に有効な量の活性薬剤および製剤学上許容 される担体または賦形剤を含有する。こうした担体として、食塩水、緩衝食塩水 、デキストロース、水、グリセロール、エタノール、およびこれらの組合せが含 まれるが、これらに限らない。製剤は投与様式に合わせるべきである。 本発明はまた、本発明の医薬組成物の1以上の成分を充填した1以上の容器を 含む医薬パックまたはキットを提供する。こうした容器には、医薬品または生物 学的製品の製造、使用または販売を規制する政府機関により定められた形式の通 知書(通知書はヒトに投与するための製造、使用または販売の政府機関による承 認を示す)を添付することができる。さらに、本発明のポリペプチドは他の治療 化合物と共に使用してもよい。 医薬組成物は簡便な方法で、例えば、経口、局所、静脈内、腹腔内、筋肉内、 皮下、鼻腔内または皮内経路で投与することができる。本発明のポリペプチドま たはポリヌクレオチドは特定の徴候を治療および/または予防するのに有効な量 で投与される。被験者に投与される活性薬剤の量および投薬レジメは、投与様式 、治療すべき症状の性質、医師の判断などの多くの要因に左右されるだろう。 本発明の配列は染色体の同定にも有用である。かかる配列は個々のヒト染色体 上の特定位置に特異的にターゲッティングし、該位置とハイブリダイズすること ができる。さらに、染色体上の特定部位を同定する必要性が目下存在している。 現在、実際の配列データ(反復多型)に基づく染色体マーキング試薬が染色体位 置を示すために利用可能である。本発明による染色体へのDNAのマッピングは 、こうした配列を疾病関連遺伝子と相関させるうえで重要な第一段階である。 簡単に説明すると、cDNAからPCRプライマー(好ましくは15〜25 bp) を作製することにより染色体に該配列をマップすることができる。cDNAのコ ンピュータ解析を用いて、ゲノムDNA中の2以上のエキソンにかからないプラ イマーを迅速に選択する。その後、これらのプライマーを、個々のヒト染色体を 含む体細胞ハイブリッドのPCRスクリーニングに使用する。プライマーに対応 するヒト遺伝子を含むハイブリッドのみが増幅断片をもたらすだろう。 体細胞ハイブリッドのPCRマッピングは特定のDNAを特定の染色体に割り 当てるための迅速な方法である。同一のオリゴヌクレオチドプライマーと共に本 発明を使用して、同様の方法で特定の染色体由来の断片のパネルまたは大きなゲ ノムクローンのプールを用いてサブ局在化が達成され得る。染色体にマップする ために同様に使用できる他のマッピング戦略としては、in situハイブリダイゼ ーション、標識フロー選別染色体を用いるプレスクリーニング、および染色体特 異的cDNAライブラリーを構築するためのハイブリダイゼーションによる予備 選択が含まれる。 1段階で正確な染色体位置を得るために、中期染色体領域へのcDNAクロー ンの蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)を用いることができる。この技 術は500または600塩基ほどの短いcDNAの場合にも使用可能である。しかし、 2,000 bpより大きいクローンは、簡便な検出にとって十分なシグナル強度で、唯 一の染色体位置に結合する可能性がより高い。FISHはクローン(該クローンから ESTが誘導された)の使用を必要とし、長ければ長いほど良い。例えば、2,00 0 bpが良好で、4,000がより良好である。良好な結果(合理的な時間のパーセン テージ)を得るためには、おそらく4,000より多くは必要でない。この技術に関 しては、Vermaら,Human Chromosomes: a Manual of Basic Techniques,Pergam on Press,New York(1988)を参照のこと。 正確な染色体位置に配列がマップされたら、この染色体上の該配列の物理的位 置を遺伝地図データと相関させることができる。この種のデータは例えばV.McKu sick,Mendelian Inheritance in Man(Johns Hopkins University Welch Medic al Libraryからオンラインで入手可能)中に見いだせる。その後、同一の染色体 領域にマップされた疾病と遺伝子との関係を連鎖解析(物理的に隣接した 遺伝子の共遺伝)により確認する。 次に、罹患個体と非罹患個体の間のcDNAまたはゲノム配列の差異を調べる 必要がある。突然変異が罹患個体の一部または全部に観察されるが、どの正常個 体にも観察されない場合は、その突然変異が疾病の原因である可能性がある。 物理的マッピングおよび遺伝的マッピングの技術の現在の分解能によると、疾 病と関連した染色体領域に正確に位置づけられたcDNAは、50〜500の可能な 原因遺伝子のうちの一つだろう(これを1メガベース(megabase)マッピング分解 能および1遺伝子/20kbと仮定する)。 罹患個体と非罹患個体の比較は、一般的には、最初に染色体の広がりから可視 的な、またはcDNA配列に基づくPCRにより検出可能な、欠失または転座と いった染色体の構造的変化を探し出すことを含む。最終的には、突然変異の存在 を確認し、突然変異と多型とを区別するために、いくつかの個体から得られた遺 伝子の完全な配列決定を必要とする。 本発明のポリペプチドまたはそれらを発現する細胞は、それらに対する抗体を 産生させるための免疫原として使用することができる。これらの抗体は、例えば 、ポリクローナルまたはモノクローナル抗体でありうる。本発明はまた、キメラ 抗体、単鎖抗体、ヒト化抗体、およびFabフラグメント、またはFab発現ライブラ リーの産物を含む。このような抗体およびフラグメントの作製には当技術分野で 知られた様々な方法を用いることができる。 本発明のポリペプチドに対する抗体は、動物に該ポリペプチドを直接注入する ことにより、または動物(好ましくはヒト以外)に該ポリペプチドを投与するこ とにより得ることができる。このようにして得られた抗体は該ポリペプチドそれ 自体と結合するだろう。この方法では、該ポリペプチドの断片をコードする配列 を用いたときでも、完全な天然ポリペプチドと結合する抗体を生成することがで きる。その後、かかる抗体を用いて、該ポリペプチドを発現している組織から該 ポリペプチドを単離することが可能である。 モノクローナル抗体を作製するには、連続細胞系の培養物から産生される抗体 を提供するどのような技術も使用できる。例を挙げると、ハイブリドーマ法(Koh ler and Milstein,1975,Nature,256:495-497)、トリオーマ法、ヒトB細 胞ハイブリドーマ法(Kozborら,1983,Immunology Today 4:72)、およびヒトモ ノクローナル抗体を作製するためのEBV-ハイブリドーマ法(Coleら,1985,in Mo noclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,Inc.,pp.77-96)が ある。 単鎖抗体の作製に関して記載された技術(米国特許第4,946,778号)は、本発 明の免疫原性ポリペプチド産物に対する単鎖抗体の作製にも応用できる。 本発明はさらに、該ポリペプチドを阻害する化合物を同定するための化合物ス クリーニング法を提供し、この方法は、単離したポリペプチドを試験化合物と接 触させ、試験化合物の不在下での代謝回転速度と比べた、酵素基質の代謝回転速 度を測定することを含んでなる。本発明はこれにより同定された化合物にも関係 する。 本発明はまた、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有す るトランスジェニック非ヒト動物を提供する。さらに、突然変異およびSAR( 構造/活性関係)評価のためのモデルとして、または薬物スクリーニングにおい て、前記のトランスジェニック動物を使用するための方法も提供する。 本発明はまた、本発明のポリペプチドの阻害剤分子、および該ポリペプチドの 機能を低減もしくは消失させる際のそれらの使用に関する。 阻害剤の例は抗体であり、いくつかの場合には、該ポリペプチドに結合するオ リゴヌクレオチドである。 阻害剤の例はアンチセンス技術を用いて作製したアンチセンス構築物である。 アンチセンス技術を用いると、三重らせんの形成またはアンチセンスDNAもし くはRNA(これらの方法は両方ともDNAまたはRNAへのポリヌクレオチド の結合に基づいている)により遺伝子の発現をコントロールすることができる。 例えば、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列の5'コード 部分は、長さが約10〜40塩基対のアンチセンスRNAオリゴヌクレオチドを設計 するために用いられる。DNAオリゴヌクレオチドは転写に関与する遺伝子の領 域に相補的となるように設計され(三重らせん − Leeら,Nucl.Acids Res. ,6:3073(1979); Cooneyら,Science,241:456(1988);およびDervanら,Science ,251:1360(1991)を参照のこと)、その結果転写とポリペプチドの産生 が妨げられる。アンチセンスRNAオリゴヌクレオチドはin vivoでmRNAに ハイブリダイズし、mRNA分子のポリペプチドへの翻訳をブロックする(Okano ,J.Neurochem.,56:560(1991); Oligodeoxynucleotides as Antisense Inhibi tors of Gene Expression,CRC Press,Boca Raton,FL(1988))。上記のオリゴ ヌクレオチドを細胞に送達してin vivoでアンチセンスRNAまたはDNAを発 現させ、それによりポリペプチドの産生を抑制することもできる。 阻害剤のもう一つの例は、ポリペプチドの触媒部位に結合して該部位を占有す る小分子であり、この小分子が触媒部位を基質に接近できないようにする結果、 正常な生物学的活性が妨害される。小分子の例として、小型のペプチドまたはペ プチド様分子が含まれるが、これらに限らない。 治療に用いるとき、本発明の阻害剤は標準的な製剤上の慣用手段に従って製剤 化される。 経口投与したときに活性である阻害剤は液剤、例えば、シロップ剤、懸濁剤ま たは乳濁剤、錠剤、カプセル剤およびロゼンジ剤として製剤化することができる 。 液体製剤は一般に、懸濁化剤、防腐剤、風味剤または着色剤を含むエタノール 、グリセリン、非水性溶媒(例えば、ポリエチレングリコール)、油、水などの 適当な液状担体中に懸濁または溶解した化合物またはその薬学的に許容される塩 の懸濁液または溶液からなる。 錠剤の形の組成物は、固体製剤を製造するのに通常用いられる適当な製剤学上 の担体を使って調製することができる。このような担体の例として、ステアリン 酸マグネシウム、デンプン、ラクトース、スクロースおよびセルロースが挙げら れる。 カプセル剤の形をした組成物は通常のカプセル化法を用いて調製することがで きる。例えば、活性成分を含有するペレットを標準的な担体を用いて調製し、そ の後硬質ゼラチンカプセルに該ペレットを充填するか、あるいはまた、分散体ま たは懸濁体を適当な製剤学上の担体(例えば、水性ガム、セルロース、シリケー ト、油)を用いて調製し、その後分散体または懸濁体を軟質ゼラチンカプセルに 充填する。 典型的な非経口組成物は、無菌の水性担体または非経口的に許容される油(例 えば、ポリエチレングリコール、ポリビニルピロリドン、レシチン、落花生油、 ゴマ油)中に溶解または懸濁した化合物もしくはその薬学的に許容される塩から なる。あるいはまた、この溶液を凍結乾燥して、投与直前に適当な溶剤で再調製 することもできる。 典型的な座剤は、この方法で投与したとき活性な式(I)の化合物またはその薬 学的に許容される塩を、結合剤および/または滑剤(例えば、重合グリコール、 ゼラチン、カカオ脂)、または他の低融点の植物もしくは合成ワックスまたは脂 肪と共に含有する。 組成物は錠剤やカプセル剤のような単位投薬形態であることが好ましい。 経口投与用の各投薬単位は、好ましくは1〜250 mg(非経口投与の場合は、好 ましくは0.1〜25 mg)の本発明の阻害剤を含有する。 成人患者の1日の投薬レジメは、例えば、経口用量が1〜500 mg、好ましくは 1〜250 mg、静脈内、皮下または筋肉内用量が0.1〜100 mg、好ましくは0.1〜25 mgの式(I)の化合物またはその薬学的に許容される塩(遊離塩基として計算)で あり得、該化合物は1日に1〜4回投与される。適当には、該化合物は連続治療 期間にわたって投与されるだろう。 本発明について以下の実施例を参考にしてさらに説明することにする。しかし 、本発明はこのような実施例に限定されないことを理解すべきである。すべての 部 または量は、他に特定されない限り、重量基準である。 以下の実施例を理解しやすくするために、いくつかの繁用される方法および/ または用語を説明する。 「プラスミド」は、先行する小文字および/またはその後の大文字および/ま たは数字で表される。本明細書中の出発プラスミドは市販されているか、制限な しに利用可能であるか、または公表された方法に従って入手可能なプラスミドか ら構築することができる。さらに、記載したものと同等のプラスミドは当技術分 野で知られており、当業者には明らかだろう。 「オリゴヌクレオチド」とは、化学的に合成できる一本鎖のポリデオキシヌク レオチドまたは2つの相補的なポリデオキシヌクレオチド鎖のことである。この ような合成オリゴヌクレオチドは5'リン酸をもたず、かくして、キナーゼの存 在下でATPを用いてリン酸基を付加することなしには他のオリゴヌクレオチド に連結されない。合成オリゴヌクレオチドは脱リン酸化されていない断片には連 結されるだろう。 「連結」とは、2つの二本鎖核酸断片の間にホスホジエステル結合を形成する 方法を指す(Maniatis,T.ら,Id.,p.146)。他に提示しない限り、連結反応は連 結すべきほぼ等モル量のDNA断片0.5μgあたり10単位のT4 DNAリガーゼ(リガ ーゼ)を用いて公知の緩衝液と条件下に行われる。配列データ 配列番号1 配列番号2 c/a = この位置はCまたはAのいずれかで、現在は不明 開始ATGに下線が引いてあり、停止コドンは不明 配列番号3(EST 176432) 配列番号4(EST 424772) 配列番号5(EST 443275) 配列番号6(EST 567394) 配列番号7(EST 685578) 配列番号8(EST 928138) 配列番号9(EST 947785) 配列番号10(EST 1000163) 配列番号11(EST 1218021) 配列番号12(EST 1320439) 配列番号13(EST 716478) 配列番号14(EST 857644) 配列番号15 446アミノ酸(+ 3個の追加の停止コドン) 配列番号16 DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION Aspartic protease The present invention relates to newly identified polynucleotides, polypeptides encoded by the polynucleotides, uses of the polynucleotides and polypeptides, and production of the polynucleotides and polypeptides. More specifically, it is envisioned that the polypeptides of the present invention are novel aspartic proteases. The invention also relates to inhibiting the action of the polypeptide. Currently, five human aspartic proteases are known, namely, pepsin, gastricin, cathepsin D, cathepsin E, and renin, which have various functions. Pepsin and gastricin are involved in nutrient processes in the stomach, cathepsin D is involved in protein turnover in almost all cell types, and renin is highly involved in the production of angiotensin from the precursor angiotensinogen. It has a specific function. The exact role of cathepsin E has not been confirmed so far, but its presence in several epithelial cell types suggests a role in antigen processing. Cathepsin E may also be involved in certain inflammatory conditions, for example, Helicobacter pylori infection of the stomach. New aspartic proteases may have extracellular functions. There are a number of processes that may require an aspartic protease but for which the exact enzyme involved has not yet been identified. An important function implicated is the processing of endothelin and pro-opiomelanocortin prohormone. It is thought that aspartic protease is also involved in the processing of serum amyloid A protein. Aspartic proteases are so named because of the aspartic acid (Asp) residue pair required for hydrolytic cleavage of the peptide bond. The catalytic Asp residue is usually located within the -Hyd-Hyd-Asp-Thr-Gly-active site motif sequence, where Hyd is any hydrophobic amino acid. Eukaryotic aspartic proteases usually carry two such sequences, and these sequences have been shown by crystallography to be located adjacent to each other at the active site of the enzyme. these. Another highly conserved portion of the enzyme contains a β-hairpin loop structure (also called “flap”), which is above the active site and may aid in substrate binding. A novel aspartic protease was presented by Tang et al. Of the Okalahoma Medical Research Foundation at a presentation at the VIIth International Aspartic Protease Conference on October 22-27, 1996. According to one aspect of the present invention, there is provided a novel polypeptide comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15, or a fragment, analog or derivative thereof. The polypeptide of the present invention is of human origin. This polypeptide is believed to be an aspartic protease. The polypeptide of the present invention further comprises a polypeptide having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 15, and at least 80%, preferably, at least 80% of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 15 over the entire length thereof. Include polypeptides comprising an amino acid sequence having at least 90%, more preferably 95%, even more preferably at least 97-99% identity. It also has at least 80%, preferably at least 90%, more preferably at least 95%, even more preferably at least 97-99% identity to either the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 15 over its entire length. Also included are polypeptides having the amino acid sequence. The polypeptide of the present invention further includes a polypeptide comprising an amino acid sequence encoded by a polynucleotide having at least 80% identity over its entire length to the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 or 16. These polypeptides may be in the form of the "mature" protein or may be part of a larger protein, such as a fusion protein. It is often advantageous to include additional amino acid sequences, such as secretory or leader sequences, prosequences, sequences useful for purification such as multiple histidine residues, or There are additional sequences to ensure stability. Also, fragments of the polypeptide are included in the present invention. Such a fragment is a polypeptide having an amino acid sequence that entirely is the same as part, but not all, of the amino acid sequence of the polypeptide. Such fragments may be "free-standing" or contained within a larger polypeptide, i.e., a portion or region of the larger polypeptide, most preferably one contiguous sequence. The region may be composed of fragments thereof. Representative examples of polypeptide fragments of the present invention include, for example, from about amino acid number 1-20, 21-40, 41-60, 61-80, 81-100, and 101 to SEQ ID NO: 1 or 15 And fragments up to the terminus. Here, “approximately” includes a range in which several, five, four, three, two, or one amino acid increases or decreases at one or both ends of the above range. Suitable fragments include, for example, deletions of a series of residues including the amino terminus or a series of residues including the carboxyl terminus, or deletion of a series of residues including the amino terminus and the carboxyl terminus. Excluding the loss, a truncation polypeptide having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 15 is included. In addition, α helix and α helix forming region, β sheet and β sheet forming region, turn and turn forming region, coil and coil forming region, hydrophilic region, hydrophobic region, α amphiphilic region, β amphiphilic region, Also suitable are fragments characterized by structural or functional properties, such as those that include variable regions, surface-forming regions, substrate binding regions, and high antigen index regions. Other suitable fragments are biologically active fragments. Biologically active fragments are those that mediate a biological activity, such as an aspartic protease activity, including fragments with similar activity, increased activity, or reduced undesirable activity. . Also included are fragments that are antigenic or immunogenic in animals, particularly humans. Preferably, all of these polypeptide fragments retain the biological activity of the precursor polypeptide, including antigenic activity. Variants of the specified sequences and fragments also form part of the invention. Preferred variants are those that differ from the subject by conservative amino acid substitutions, i.e., those that substitute a residue with another having similar properties. Typical such substitutions are between Ala, Val, Leu and Ile; between Ser and Thr; between the acidic residues Asp and Glu; between Asn and Gln; between the basic residues Lys and Arg; Occurs between group residues Phe and Tyr. In particular, a mutant in which several, 5 to 10, 1 to 5 or 1 to 2 amino acids are substituted, deleted or added in any combination is preferable. The polypeptide of the present invention can be produced by any appropriate method. Such polypeptides include isolated natural polypeptides, recombinantly produced polypeptides, synthetically produced polypeptides, or polypeptides produced by a combination of these methods. It is. Means for producing such polypeptides are well understood in the art. According to another aspect of the present invention, there is provided a polynucleotide (DNA or RNA) encoding the polypeptide. In a preferred embodiment of the present invention, there is provided a polynucleotide encoding a polypeptide having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15. In particular, the present invention provides a polynucleotide having the DNA sequence set forth in SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 16. The present invention further provides a polynucleotide encoding the polypeptide, comprising the DNA sequence shown in SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 16. The polynucleotide of the present invention may further comprise at least 80%, preferably at least 90%, more preferably at least 95%, over its entire length, of the nucleotide sequence encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15. At least 80%, preferably at least 90%, more preferably at least 95% identity over the entire length of a polynucleotide comprising a nucleotide sequence having identity and the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 16 And polynucleotides comprising the nucleotide sequence having the same. Further, those with at least 97% identity are more preferred, those with at least 98-99% identity are even more preferred, and those with at least 99% identity are most preferred. CDNA molecules (ESTs) exhibiting extensive identity to the cDNAs of SEQ ID NO: 2 and SEQ ID NO: 16 have been identified in human-derived cDNA libraries generated from various sources. These ESTs are shown in SEQ ID NOs: 3-14. SEQ ID NO: Library: SEQ ID NO: 3 (EST 176432) Raji cells, cyclohexamide treated SEQ ID NO: 4 (EST 424772) Human B cell lymphoma SEQ ID NO: 5 (EST 443275) Thoracic lymph node cDNA library SEQ ID NO: 6 (EST 567394) Raji cells, cyclohexamide treated SEQ ID NO: 7 (EST 685578) Human activated monocyte SEQ ID NO: 8 (EST 928138) Fetal liver, subtraction II SEQ ID NO: 9 (EST 947785) Thoracic lymph node cDNA library SEQ ID NO: 10 (EST 1000163) spinal cord SEQ ID NO: 11 (EST 1218021) spleen, chronic lymphocytic leukemia SEQ ID NO: 12 (EST 1320439) human tonsils, lib2 SEQ ID NO: 13 (EST 716478) cd34 depleted buffy coat cord blood SEQ ID NO: 14 (EST 857644) Human adult testis, large insert Accordingly, in a further aspect, the present invention relates to one or more partial DNAs selected from SEQ ID NOs: 3-14. Providing a polynucleotide encoding the aspartic protease characterized by columns. The polynucleotides of SEQ ID NO: 2 and SEQ ID NO: 16 are structurally related to the aspartic protease family. SEQ ID NO: 2 and SEQ ID NO: 16 have 1376 and 1347 nucleotides, respectively. The first (ie, N-terminal) active site motif is believed to be -Ala-Phe-Asp-Thr-Gly- and, due to at least two ESTs (SEQ ID NOs: 11 and 12), in each case the same DNA Encoded with the sequence (-GCC-TTT-GAC-ACT-GGC-). The second (ie, C-terminal) active site motif is believed to be -Ile-Leu-Asp-Thr-Gly-, and by at least one EST (SEQ ID NO: 13) (DNA sequence-ATC-CTG-GAT- ACA-GGC-). The conserved flap region of this enzyme is believed to be -Tyr-Gly-Thr-Gly-, and in all cases at least four ESTs (-TAT-GGA-ACT-GGG-) having the same DNA sequence (-TAT-GGA-ACT-GGG-) SEQ ID NOs: 9, 10, 5 and 12). The sequences of SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 15 are considered to include the full length of the mature form of the novel aspartic protease, plus about 60 amino acids containing the pro-portion (or pro-segment). The starting Met residue was also identified in SEQ ID NO: 1 and the ORF starts at nucleotide 26. Convenient blast sequence analysis shows that the polypeptide of SEQ ID NO: 15 shows the highest homology to chicken preprocathepsin D. However, at the functional level, the polypeptides of SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 15 have a cathepsin E-specific glycosylation site (-Asn-Phe-Thr-) immediately preceding the sequence encoding the N-terminal active site motif. It appears to be most similar to cathepsin E because of its presence. The wide distribution of the ESTs associated with this polypeptide in many cell types suggests that the encoded polypeptide has a non-specific hydrolytic function (similar to cathepsin E and D). . The polynucleotide of the present invention may be in the form of RNA or DNA, and DNA includes cDNA, genomic DNA and synthetic DNA. The DNA may be double-stranded or single-stranded, and if single stranded may be the coding strand or the non-coding (antisense) strand. The coding sequence encoding a polypeptide of the present invention may be identical to the coding sequence shown in SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 16 because of the redundancy or degeneracy of the genetic code. It may be a different coding sequence that encodes the same polypeptide as DNA. The present invention includes variants of the above polynucleotides that encode fragments, analogs and derivatives of the polypeptide having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15. A polynucleotide variant can be a naturally occurring allelic or non-naturally occurring variant of the polynucleotide. Thus, the present invention encompasses polynucleotides that encode the same polypeptide as the polypeptide set forth in SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15, as well as variants of the polynucleotide that encode fragments, derivatives or analogs of the polypeptide. I do. Such nucleotide variants include deletion variants, substitution variants, and addition or insertion variants. A polynucleotide of the invention may have a coding sequence that is a natural allelic variant of the coding sequence of SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 16. As is known in the art, an allelic variant is another form of a polynucleotide sequence having one or more nucleotide substitutions, deletions or additions that does not substantially alter the function of the encoded polypeptide. is there. The polynucleotide encoding the polypeptide of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15 comprises only the coding sequence of the polypeptide, the coding sequence of the polypeptide and an additional coding sequence such as a leader or secretory sequence or a proprotein sequence; It can include non-coding sequences such as non-coding sequences and introns 5 'and / or 3' to the coding sequence of the polypeptide (and optionally additional coding sequences) and the coding sequence of the mature polypeptide. Thus, "polynucleotide encoding a polypeptide" includes not only a polynucleotide comprising only the coding sequence of the polypeptide, but also a polynucleotide comprising additional coding and / or non-coding sequences. The invention therefore provides polynucleotide sequences whose coding sequence is useful for expression and secretion of the polypeptide from a host cell (eg, a leader sequence that functions as a secretory sequence that controls the transport of the polypeptide from the host cell). Comprises a polynucleotide fused in the same reading frame. A polypeptide having a leader sequence is a preprotein that, when cleaved by the host cell, produces a mature polypeptide. Such a polynucleotide can also encode a proprotein in which 5 'amino acid residues have been added to the mature protein. A mature protein having a prosequence is a proprotein and is an inactive form of the protein. Cleavage of this prosequence results in an active mature protein. Thus, for example, a polynucleotide of the invention may encode a mature protein, a protein having a prosequence, or a protein having both a prosequence and a presequence (leader sequence). A polynucleotide of the invention may also have the coding sequence fused in the same reading frame to a marker sequence that allows for purification of the polypeptide of the invention. The marker sequence may be a hexa-histidine tag supplied by the pQE-9 vector, which in the case of a bacterial host allows for purification of the mature polypeptide fused to the marker, and may include, for example, a mammalian host (eg, : COS-7 cells), the marker sequence may be a hemagglutinin (HA) tag. This HA tag corresponds to an epitope derived from the influenza hemagglutinin protein (Wilson, I. et al. Cell, 37: 767 (1984)). The present invention further relates to polynucleotides that hybridize to said sequences when there is at least 50%, preferably 70%, identity between the sequences. The invention particularly relates to polynucleotides that hybridize under stringent conditions to the above polynucleotides. As used herein, "stringent conditions" refers to conditions under which hybridization will occur only when there is at least 95%, preferably at least 97%, identity between the sequences. In a preferred embodiment, the polynucleotide that hybridizes to the above polynucleotide encodes a polypeptide that retains substantially the same biological function or activity as the polypeptide of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15. The terms "fragment,""derivative," and "analog" when referring to a polypeptide of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15 retain essentially the same biological function or activity as such polypeptide Means a polypeptide. Thus, analogs include proproteins that are activated by cleavage of the proprotein portion to produce a mature form of the active polypeptide. As used herein, the term "identity" is a measure of the identity of nucleotide or amino acid sequences. Generally, sequences are aligned so as to provide the greatest match. "Identity" per se has an art-recognized meaning and can be calculated using published techniques. For example, COMPUTATIONALM OLECULAR BIOLOGY, Lesk, A. M. Ed., Oxford University Press, New York, 1988; BIOCOMPUTING: INFORMATICS AND GENOME PROJECTS, Smith, D. W. Ed., Academic Press, New York, 1993; COMPUTER ANALYSIS OF SEQUENCE DATA, PARTI, Griffin, A. M. and Griffin, H. G. Ed., Humana Press, New Jersey, 1994; SEQUENCE ANALYSIS IN MOLECULAR BIOLOGY, von Heinje, G. Academic Press, 1987; and SEQUENCE ANALYSIS PRIMER, Gribskov, M.S. and Devereux, J. Ed., M Stockton Press, New York, 1991. While there are many ways to determine the identity between two polynucleotide or polypeptide sequences, the term "identity" is well known to those of skill in the art (Carillo, H. et al. and Lipton, D. , SIAM J Applied Math (1988) 48: 1073). Commonly used methods for determining the identity or similarity between two sequences include Guide to Huge Computers, Martin J. Bishop, Academic Press, San Diego, 1994 and Carillo, H .; and Lipton, D. , SIAM J Applied Math (1988) 48: 1073, but is not limited thereto. Methods for determining identity and similarity are codified in computer programs. Suitable computer programming methods for determining identity and similarity between two sequences include the GCS program package (Devereux, J .; Et al., Nucleic Acids Research (1984) 12 (1): 387), BLASTP, BLASTN, FASTA (Atschul, S. F. J Molec Biol (1990) 215: 403), but are not limited thereto. By way of example, a polynucleotide having a nucleotide sequence that has, for example, at least 95% "identity" to a reference nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2/16 is defined as a polynucleotide having a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2/16 It is intended to be identical to the reference sequence except that it can contain up to 5 point mutations for each 100 nucleotides of the reference nucleotide sequence. In other words, to obtain a polynucleotide having a nucleotide sequence that is at least 95% identical to the reference nucleotide sequence, up to 5% of the nucleotides in the reference sequence can be deleted, replaced with other nucleotides, or Up to 5% of the total number of nucleotides may be inserted into the reference sequence. These mutations of the reference sequence may occur at the 5 'or 3' terminal positions of the reference nucleotide sequence, or anywhere between these terminal positions, individually between nucleotides in the reference sequence or within the reference sequence. Can be arranged as one or more contiguous groups. Similarly, for example, a polypeptide having an amino acid sequence having "identity" of at least 95% with respect to the reference amino acid sequence of SEQ ID NO: 1/15 is defined as having an amino acid sequence of this polypeptide which is 100% It is intended to be identical to the reference sequence except that it can include up to 5 amino acid changes per amino acid. In other words, to obtain a polypeptide having an amino acid sequence that is at least 95% identical to the reference amino acid sequence, up to 5% of the amino acid residues in the reference sequence may be deleted, replaced with other amino acids, or The number of amino acids up to 5% of all amino acid residues in the reference sequence may be inserted into the reference sequence. These changes in the reference sequence may occur at the amino or carboxy terminal positions of the reference amino acid sequence, or anywhere between these terminal positions, individually between amino acid residues in the reference sequence, or within the reference sequence. It can be arranged as one or more consecutive groups. The polypeptide of the present invention can be a recombinant polypeptide, a natural polypeptide or a synthetic polypeptide, but is preferably a recombinant polypeptide. Fragments, derivatives or analogs of the polypeptides of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15 are those wherein (i) one or more amino acid residues are replaced with conservative or non-conservative amino acid residues (preferably conservative amino acid residues) (Substituted amino acid residues may or may not be encoded in the genetic code), (ii) one or more amino acid residues include a substituent, (iii) the mature polypeptide Those fused to other compounds, such as compounds that increase the half-life of the polypeptide (eg, polyethylene glycol), or (iv) additional amino acids (eg, leader or secretory sequence, mature polypeptide) to the mature polypeptide Or the sequence used for purification of the protein or the proprotein sequence). Such fragments, derivatives and analogs are considered to be within the skill of those in the art from the teachings herein. The polypeptides and polynucleotides of the present invention are preferably obtained in an isolated form, and are advantageously purified to homogeneity. The term "isolated" means that the substance has been separated from its original environment (eg, the natural environment if it occurs naturally). For example, a natural polynucleotide or polypeptide present in a living animal has not been isolated, but a polynucleotide or polypeptide isolated from some or all of the coexisting substances in the natural system has been isolated. is there. Such polynucleotides may be part of a vector, and / or such polynucleotides or polypeptides may be part of a composition, and such vectors or compositions may be part of their natural environment. It is also isolated in that it is not a part. Preferably, the polypeptide is in purified form. Purified form means at least 80%, preferably 90%, more preferably 95%, and most preferably 99%, purified relative to other protein contaminants. The DNA of the present invention also allows animals that cannot or do not express this enzyme to be developed by homologous recombination or "knockout" strategies (Kapecchi, Science, 244: 1288-1292 (1989)). The present invention further relates to a vector containing the polynucleotide of the present invention, a host cell genetically engineered using the vector of the present invention, and the production of the polypeptide of the present invention by a recombinant method. Thus, according to yet another aspect of the present invention, a recombinantly produced polypeptide of the present invention comprising expressing a polynucleotide encoding the polypeptide of the present invention in a host and recovering the expression product. A production method is provided. Alternatively, the polypeptide of the present invention can be produced synthetically using a conventional peptide synthesizer. The host cell is genetically engineered (transduced, transformed or transfected) with a vector of the invention, which can be, for example, a cloning vector or an expression vector. This vector may be in the form of, for example, a plasmid, cosmid, phage and the like. The genetically engineered host cells are cultured in a conventional nutrient medium, which is suitably modified for promoter activation, transformant selection, or gene amplification. Culture conditions, such as temperature, pH, etc., are the same as those previously used for the host cell selected for expression and will be apparent to those skilled in the art. Suitable expression vectors include chromosomal, non-chromosomal and synthetic DNA sequences (eg, SV40 derivatives), bacterial plasmids, phage DNA, baculovirus, yeast plasmids, vectors derived from combinations of plasmid and phage DNA, viral DNA ( Examples: vaccinia, adenovirus, fowlpox virus, pseudorabies virus). However, other vectors can be used as long as they can replicate and survive in the host. Various methods can be used to insert the appropriate DNA sequence into the vector. Generally, the DNA sequence is inserted into an appropriate restriction endonuclease site by methods known in the art. These and other methods are deemed to be within the skill of those in the art. The DNA sequence in the expression vector is operably linked to a suitable expression control sequence (promoter) that directs the synthesis of mRNA. The following can be mentioned as typical examples of such promoters. That is, LTR or SV40 promoter, E. coli lac or trp, phage λP L Promoters and other promoters known to control the expression of genes in prokaryotic or eukaryotic cells or their viruses. The expression vector also contains a ribosome binding site for translation initiation and a transcription terminator, and may contain appropriate sequences for expression amplification. In addition, the expression vector may have one or more selectable marker genes that confer phenotypic properties for selecting transformed host cells, for example, dihydrofolate reductase or neomycin resistance in eukaryotic cell culture, or tetracycline or ampicillin resistance in E. coli. It is preferred to include. The gene is placed under the control of a promoter, a ribosome binding site (for bacterial expression), and optionally an operator (collectively referred to herein as "regulatory" elements), and thus contains the expression construct. In a host cell transformed with the vector, a DNA sequence encoding the desired protein is transcribed into RNA. A coding sequence may or may not include a signal peptide or leader sequence. The protein sequences of the present invention can be expressed using, for example, the E. coli tac promoter or the protein A gene (spa) promoter and signal sequence. The leader sequence is removed by the bacterial host during post-translational processing. The promoter region can be selected from the desired gene using a CAT (chloramphenicol transferase) vector or other vector with a selectable marker. Two suitable vectors are PKK232-8 and PCM7. Particularly, bacterial promoters include lacI, lacZ, T3, T7, gpt, λP R , P L And trp. Eukaryotic promoters include CMV immediate early, HSV thymidine kinase, early and late SV40, LTRs from retrovirus and mouse metallothionein-I. Selection of the appropriate vector and promoter is within the skill of the art. In addition to regulatory sequences, it may be desirable to add regulatory sequences that can regulate the expression of the protein sequence against the growth of the host cell. Regulatory sequences are known to those of skill in the art, and include, for example, those that induce or discontinue gene expression in response to a chemical or physical stimulus, including the presence of a regulatory compound. Other types of regulatory elements, such as enhancer sequences, may be present in the vector. Expression vectors are constructed to position a particular coding sequence in a vector with the appropriate regulatory sequences, and the positioning and orientation of the coding sequence relative to the control sequences is such that the coding sequence is transcribed under "control" of the control sequences ( That is, the RNA polymerase that binds to the DNA molecule at the position of the control sequence transcribes the coding sequence). It may be desirable to modify the coding sequence to achieve this purpose. For example, in some cases, it is necessary to modify the coding sequence so that the coding sequence can be joined to the control sequence in the proper orientation, ie, maintain the reading frame. The control sequences and other regulatory sequences may be ligated to the coding sequence prior to insertion into a vector (eg, the cloning vector described above). Alternatively, the coding sequence can be cloned directly into an expression vector that already contains the control sequences and appropriate restriction sites. In addition, to enhance expression, the coding sequence may be modified to use codons compatible with the given host cell. Generally, recombinant expression vectors contain an origin of replication, a selectable marker that allows for the transformation of host cells (eg, the ampicillin resistance gene of E. coli and the TRP1 gene of S. cerevis iae), and the transcription of downstream structural sequences. Would include a promoter from a highly expressed gene. The heterologous structural sequence is assembled in proper reading frame with the translation initiation and termination sequence and, preferably, a leader sequence capable of directing secretion of the translated protein into the periplasmic space or extracellular medium. Optionally, the heterologous sequence may encode a fusion protein containing an N-terminal identifying peptide that confers the desired property (eg, stabilization or convenient purification of the recombinant expression product). An appropriate host can be transformed with a vector containing the appropriate DNA sequence and an appropriate promoter or control sequence as described above, and the protein can be expressed in the host. Examples of recombinant DNA vectors for cloning and host cells which can be transformed are bacteriophage λ (E. coli), pBR322 (E. coli), pACYC177 (E. coli), pKT230 (Gram negative bacteria), pGV1106 (Gram negative bacteria). , PLAFR1 (Gram-negative bacteria), pME290 (Non-E. Coli Gram-negative bacteria), pHV14 (Escherichia coli and Bacillus subtilis), pBD9 (Bacillus subtilis), pIJ61 (Streptomyces), pUC6 (Streptomyces), YIp5 (Saccharomyces), baculo A viral insect cell line, such as YCp19 (Saccharomyces). For a review, see “DNA Cloning”: Vols. I & II, edited by Glover et al., IRL Press Oxford (1985) (1987) and See Maniatis et al., "Molecular Cloning" Cold Spring Harbor Laboratory (1982). In some cases, it may be desirable to add a sequence that causes secretion of the polypeptide from the host organism and subsequent cleavage of the secretory signal. Yeast expression vectors are also known in the art. See, for example, U.S. Patent Nos. 4,446,235, 4,443,539, and 4,430,428. See also European Patent Applications 103,409, 100,561, 96,491. pSV2 neo (Described in J. Mol. Appl. Genet. 1: 327-341), which uses the SV40 late promoter to direct expression in mammalian cells and uses the vector pCDNA1 derived from pCDNA1. neo (Mol. Cell Biol. 7: 4125-29) use the CMV promoter to direct expression. Both of these two types of vectors are used for transient or stable (using G418 resistance) expression in mammalian cells. Insect cell expression systems (eg, Drosophila) are also useful; see, for example, PCT applications WO 90/06358 and WO 92/06212 and EP290,261-B1. The polypeptide can be expressed in a host cell under the control of a suitable promoter. Cell-free translation systems can also be used to produce the proteins using RNA derived from the DNA constructs of the present invention. Cloning and expression vectors suitable for use with prokaryotic and eukaryotic hosts are described in Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor, NJ. Y. (1989), the disclosure of which is incorporated herein by reference. Transcription of a DNA encoding a polypeptide of the present invention by higher eukaryotic cells can be increased by inserting an enhancer sequence into the vector. Enhancers are cis-acting elements of DNA, usually about 10-300 bp, that act on a promoter to increase its transcription. Examples include the SV40 enhancer on the late side of the replication origin from bp 100 to 270, the cytomegalovirus early promoter enhancer, the polyoma enhancer on the late side of the replication origin, and adenovirus enhancers. In a further aspect, the present invention relates to a host cell comprising the above-described vector. The host cell can be a higher eukaryotic cell, such as a mammalian cell, or a lower eukaryotic cell, such as a yeast cell, and the host cell can be a prokaryotic cell, such as a bacterial cell. The following may be mentioned as typical examples of suitable hosts. As prokaryotic cells, for example, Escherichia coli, Streptomyces, bacterial cells such as Salmonella atyphimurium, as eukaryotic cells, for example, fungal cells such as yeast, Drosophila (Drosophila) and Spodoptera frugiperda (Spodopteraf rugiperda) ), Mammalian cells such as CHO, COS or Bowes melanoma, plant cells and the like. The selection of a suitable host is considered to be within the skill of those in the art from the teachings herein. Introduction of the construct into host cells can be performed by calcium phosphate transfection, DEAE-dextran mediated transfection, electroporation, etc. (Davis, L. et al.). , Dibner, M. , Batty, I. , Basic Methods in Molecular Biology (1986)). After transformation of the appropriate host strain and propagation of the host strain to an appropriate cell density, the given promoter is induced by appropriate means (eg, temperature shift or chemical induction) and the cells are cultured for an additional hour. Cells are typically harvested by centrifugation, disrupted by physical or chemical means, and the resulting crude extract is saved for subsequent purification. The microbial cells used for protein expression can be disrupted by any method, including freeze-thaw cycling, sonication, mechanical disruption or the use of cell lysing agents, and such methods are known to those skilled in the art. It is. Various mammalian cell culture systems can also be used to express the recombinant protein. Examples of mammalian expression systems include the COS-7 line of monkey kidney fibroblasts described in Gluzman, Cell, 23: 175 (1981), and other cell lines that can express compatible vectors, such as , C127, 3T3, CHO, HeLa and BHK cell lines. Mammalian expression vectors will contain an origin of replication, a suitable promoter and enhancer, and will also contain necessary ribosome binding sites, polyadenylation sites, splice donor and acceptor sites, transcription termination sequences, and 5 'flanking untranslated sequences. . DNA sequences from the SV40 splice and polyadenylation sites may be used to obtain the required non-transcribed genetic elements. The polypeptide of the present invention is produced by growing a host cell transformed with the above-mentioned expression vector under the conditions under which the desired polypeptide is expressed, depending on the selected expression system and host. The polypeptide is then isolated from the host cell and purified. If the expression system secretes the polypeptide into a growth medium, the polypeptide can be purified directly from the medium. If the polypeptide is not secreted, it is isolated from the cell lysate or recovered from the cell membrane fraction. Where the polypeptide is localized on the cell surface, whole cells or discrete membranes can be used as an assayable source of the desired gene product. Polypeptides expressed by bacterial hosts such as E. coli may require isolation from inclusion bodies and regeneration / reconstitution. Selection of the appropriate growth conditions and recovery methods are within the skill of the art. Polypeptides can be recovered and purified from recombinant cell culture by ammonium sulfate or ethanol precipitation, acid extraction, anion or cation exchange chromatography, phosphocellulose chromatography, hydrophobic interaction chromatography, affinity chromatography, hydroxyapatite chromatography. Various methods can be used, including chromatography, and lectin chromatography. Optionally, a protein regeneration step may be employed to complete the configuration of the mature protein. Finally, high performance liquid chromatography (HPLC) can be used as a final purification step. Depending on the host used in the recombinant production method, the polypeptide of the present invention may be glycosylated or non-glycosylated. Also, the polypeptide of the present invention may include the first methionine amino acid residue. The polypeptides of the present invention are also useful in identifying other molecules with similar biological activity. An example of such a screen is to isolate the coding region of the aspartic protease gene, either by synthesizing an oligonucleotide probe or by using a DNA sequence known as the probe itself. Using a labeled oligonucleotide having a sequence complementary to the gene sequence of the present invention, a library of human cDNA, genomic DNA or mRNA is screened to determine with which member of the library the probe hybridizes. The polypeptides of the present invention can also be used according to the present invention by in vivo expression of the polypeptide, often referred to as "gene therapy". Thus, for example, cells from a patient are engineered ex vivo with a polynucleotide (DNA or RNA) encoding a polypeptide, and the engineered cells are then introduced into a patient to be treated with the polypeptide. I do. Such methods are known in the art. For example, cells can be genetically engineered by known methods by using retroviral particles containing RNA encoding the polypeptide of the present invention. Similarly, cells can be engineered in vivo for expression of a polypeptide in vivo, for example, by methods known in the art. As is known in the art, producer cells for producing retroviral particles containing RNA encoding a polypeptide of the present invention can be used to engineer cells in vivo and to express polypeptides in vivo. May be administered to patients. Methods of administering the polypeptides of the present invention and other methods by such methods will be apparent to those skilled in the art from the teachings of the present invention. For example, an expression vehicle for genetically engineering cells may be other than a retrovirus, such as an adenovirus, for genetically engineering cells in vivo after combining an adenovirus with a suitable delivery vehicle. Can be used for A “recombinant” polypeptide is a polypeptide produced by recombinant DNA methods, ie, a polypeptide produced from a cell transformed with a foreign DNA construct encoding a polypeptide of interest. "Synthetic" polypeptides are those produced by chemical synthesis. A "replicon" is a genetic element (eg, a plasmid, chromosome, virus) that functions as an autonomous DNA replication unit in vivo, ie, capable of replicating under its own control. A "vector" is a replicon, such as a plasmid, phage, cosmid, or the like, that can ligate to another DNA segment and cause replication of the ligated segment. "Double-stranded DNA molecule" refers to a polymeric form of deoxyribonucleotides (bases adenine, guanine, thymine or cytosine) in the form of a double-stranded helix (both relaxed and supercoiled). The term refers only to the primary and secondary structure of the molecule and is not meant to limit it to a particular tertiary form. Thus, the term includes, among others, linear DNA molecules (eg, restriction fragments), viruses, plasmids, and double-stranded DNA present in chromosomes. In describing the structure of a particular double-stranded DNA molecule, the sequences are described herein according to the convention shown in the 5 'to 3' direction along the sense strand of DNA. The DNA "coding sequence" of a particular protein or the "nucleotide sequence encoding a particular protein" refers to a DNA sequence that is transcribed and translated into a polypeptide when placed under the control of appropriate regulatory sequences. A "promoter sequence" is a DNA regulatory region capable of binding RNA polymerase in a cell and initiating transcription of a downstream (3 'direction) coding sequence. The transcription initiation site (conveniently defined by mapping with nuclease S1) and the protein binding domain (consensus sequence) involved in binding RNA polymerase will be found in the promoter sequence. Eukaryotic promoters will often (but not always) include a "TATA" box and a "CAT" box. A DNA "control sequence" is a collection of promoter sequences, ribosome binding sites, polyadenylation signals, transcription termination sequences, upstream regulatory domains, enhancers, and the like, that provide for the expression (ie, transcription and translation) of a coding sequence in a host cell. It is a term that points to. The control sequence directs “expression” of the coding sequence in the cell when the RNA polymerase binds to the promoter sequence and transcribes the coding sequence into mRNA, which is then translated into the polypeptide encoded by the coding sequence. ". A “host cell” is a cell that has been transformed or transfected with a foreign DNA sequence, or is capable of transformation or transfection with a foreign DNA sequence. A cell has been "transformed" by exogenous DNA when the exogenous DNA has been introduced inside the cell membrane. The foreign DNA may or may not be integrated (covalently linked) into the chromosomal DNA making up the genome of the cell. For example, in prokaryotes and yeast, foreign DNA may be retained on episomal elements such as plasmids. With respect to eukaryotic cells, a stably transformed or transfected cell is one in which foreign DNA has been integrated into the chromosome so that it may be inherited by daughter cells through chromosomal replication. This stability is demonstrated by the ability of eukaryotic cells to establish cell lines or clones consisting of a population of daughter cells containing foreign DNA. A "clone" is a population of cells derived from a single cell or a common ancestor by mitosis. A "cell line" is a clone of a primary cell that is capable of stable growth in vitro for many generations. Two DNA or polypeptide sequences are "substantially" when at least about 85% (preferably at least about 90%, most preferably at least about 95%) of their nucleotides or amino acids are matched over a length of the molecule. Are "homologous to" or "substantially identical" and include allelic variants. "Substantially homologous," as used herein, also refers to sequences that show identity to a particular DNA or polypeptide sequence. A substantially homologous DNA sequence can be identified by Southern hybridization experiments under conditions (eg, stringent) defined for the particular system. Defining appropriate hybridization conditions is within the skill of the art. For example, “Current Protocols in Mol. Biol. ”Vol. See I & II, Ed., Wiley Interscience, Ausbel et al. (1992). Protein sequences that are substantially identical can be identified by proteolytic digestion, gel electrophoresis, and microsequencing. The term "functionally equivalent" means that the amino acid sequence of the protein of interest exhibits the same type of enzymatic activity as the aspartic protease. A "heterologous" region of a DNA construct is an identifiable DNA segment within or attached to another DNA molecule that is not naturally associated with another molecule. The polypeptides of the present invention can be used for therapy. Thus, in a further aspect, the present invention provides a polypeptide having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15, and fragments, analogs or derivatives thereof, for use in therapy. Suitably, such polypeptides may play a role in preventing, ameliorating and treating dysfunctions or diseases including but not limited to hypertension, inflammation, asthma and cardiopulmonary disease. The polypeptides and polynucleotides of the present invention are used with suitable pharmaceutical carriers. Such compositions will contain a therapeutically effective amount of the active agent and a pharmaceutically acceptable carrier or excipient. Such carriers include, but are not limited to, saline, buffered saline, dextrose, water, glycerol, ethanol, and combinations thereof. The formulation should suit the mode of administration. The present invention also provides a pharmaceutical pack or kit comprising one or more containers filled with one or more components of the pharmaceutical composition of the present invention. Such containers include a notice in the form of a government agency that regulates the manufacture, use, or sale of pharmaceuticals or biological products, which is approved by a government agency for manufacture, use, or sale for human administration. ) Can be attached. Further, the polypeptides of the present invention may be used with other therapeutic compounds. The pharmaceutical compositions can be administered in a convenient manner, for example, orally, topically, intravenously, intraperitoneally, intramuscularly, subcutaneously, intranasally or intradermally. The polypeptide or polynucleotide of the invention is administered in an amount effective to treat and / or prevent a particular indication. The amount and dosage regimen of the active agent administered to a subject will depend on many factors, such as the mode of administration, the nature of the condition to be treated, the judgment of the practitioner, and the like. The sequences of the present invention are also useful for chromosome identification. Such sequences can be specifically targeted to and hybridized to specific locations on individual human chromosomes. In addition, there is an ongoing need to identify specific sites on chromosomes. Currently, chromosome marking reagents based on actual sequence data (repeated polymorphisms) are available to indicate chromosomal location. Mapping DNA to chromosomes according to the present invention is an important first step in correlating such sequences with disease-related genes. Briefly, the sequence can be mapped to a chromosome by generating PCR primers (preferably 15-25 bp) from the cDNA. Computer analysis of cDNA is used to quickly select primers that do not span more than one exon in genomic DNA. These primers are then used for PCR screening of somatic cell hybrids containing individual human chromosomes. Only those hybrids containing the human gene corresponding to the primer will yield an amplified fragment. PCR mapping of somatic cell hybrids is a rapid method for assigning specific DNA to specific chromosomes. Using the present invention with the same oligonucleotide primers, sublocalization can be achieved in a similar manner using a panel of fragments from a particular chromosome or a pool of large genomic clones. Other mapping strategies that can also be used to map to chromosomes include in situ hybridization, prescreening using labeled flow sorted chromosomes, and preselection by hybridization to construct chromosome-specific cDNA libraries. It is. Fluorescent in situ hybridization (FISH) of a cDNA clone to a metaphase chromosomal region can be used to obtain a precise chromosomal location in one step. This technique can be used for cDNAs as short as 500 or 600 bases. However, clones larger than 2,000 bp are more likely to bind to a unique chromosomal location with sufficient signal intensity for convenient detection. FISH requires the use of clones (from which the ESTs were derived), the longer the better. For example, 2,000 bp is better and 4,000 is better. Probably not more than 4,000 is needed to get good results (reasonable percentage of time). For a discussion of this technique, see Verma et al., Human Chromosomes: a Manual of Basic Techniques, Pergam on Press, New York (1988). Once a sequence has been mapped to a precise chromosomal location, the physical location of the sequence on this chromosome can be correlated with genetic map data. This kind of data is for example V. McKusick, found in Mendelian Inheritance in Man (available online at Johns Hopkins University Welch Medical Library). Thereafter, the relationship between the disease and the gene mapped to the same chromosomal region is confirmed by linkage analysis (co-inheritance of physically adjacent genes). Next, it is necessary to examine the differences in the cDNA or genomic sequence between affected and unaffected individuals. If the mutation is observed in some or all of the affected individuals but not in any normal individuals, then the mutation may be responsible for the disease. According to the current resolution of physical and genetic mapping techniques, a cDNA that is correctly located in a chromosomal region associated with a disease will be one of 50-500 possible causative genes (one of Assume megabase mapping resolution and 1 gene / 20 kb). Comparison of affected and unaffected individuals generally involves first looking for structural changes in the chromosome, such as deletions or translocations, that are visible from the chromosome spread or detectable by PCR based on the cDNA sequence. including. Ultimately, complete sequencing of genes from several individuals is required to confirm the presence of the mutation and distinguish between the mutation and the polymorphism. The polypeptides of the present invention or cells expressing them can be used as an immunogen to produce antibodies against them. These antibodies can be, for example, polyclonal or monoclonal antibodies. The invention also includes chimeric antibodies, single-chain antibodies, humanized antibodies, and Fab fragments, or the products of a Fab expression library. Various methods known in the art can be used for producing such antibodies and fragments. Antibodies to the polypeptide of the present invention can be obtained by directly injecting the polypeptide into an animal, or by administering the polypeptide to an animal (preferably other than a human). The antibody thus obtained will bind to the polypeptide itself. In this way, antibodies can be generated that bind to the complete native polypeptide, even when sequences encoding fragments of the polypeptide are used. Thereafter, using such an antibody, the polypeptide can be isolated from a tissue expressing the polypeptide. To make monoclonal antibodies, any technique which provides antibodies produced from continuous cell line cultures can be used. Examples include the hybridoma method (Kohler and Milstein, 1975, Nature, 256: 495-497), the trioma method, the human B-cell hybridoma method (Kozbor et al., 1983, Immunology Today 4:72), and human monoclonal antibodies. EBV-hybridoma method for production (Cole et al., 1985, in Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, Inc. , Pp. 77-96). The techniques described for generating single-chain antibodies (US Pat. No. 4,946,778) can also be applied to generate single-chain antibodies to the immunogenic polypeptide products of the invention. The invention further provides a compound screening method for identifying a compound that inhibits the polypeptide, the method comprising contacting the isolated polypeptide with a test compound and determining a turnover rate in the absence of the test compound. Measuring the rate of turnover of the enzyme substrate as compared to. The invention also relates to the compounds identified thereby. The present invention also provides a transgenic non-human animal containing a polynucleotide encoding the polypeptide of the present invention. Also provided are methods for using the transgenic animals described above as models for mutation and SAR (structure / activity relationship) evaluation or in drug screening. The invention also relates to inhibitor molecules of the polypeptides of the invention and their use in reducing or eliminating the function of the polypeptide. An example of an inhibitor is an antibody, and in some cases, an oligonucleotide that binds to the polypeptide. An example of an inhibitor is an antisense construct made using antisense technology. Using antisense technology, gene expression can be controlled by triple helix formation or antisense DNA or RNA, both of which methods are based on binding of the polynucleotide to DNA or RNA. For example, the 5 'coding portion of a polynucleotide sequence encoding a polypeptide of the invention can be used to design antisense RNA oligonucleotides about 10-40 base pairs in length. DNA oligonucleotides are designed to be complementary to the region of the gene involved in transcription (triple helix-Lee et al., Nucl. Acids Res. Sci., 6: 3073 (1979); Cooney et al., Science, 241: 456 (1988); and Dervan et al., Science, 251: 1360 (1991)), which prevents transcription and production of the polypeptide. Antisense RNA oligonucleotides hybridize to mRNA in vivo and block translation of the mRNA molecule into a polypeptide (Okano, J. et al. Neurochem. , 56: 560 (1991); Oligodeoxynucleotides as Antisense Inhibitors of Gene Expression, CRC Press, Boca Raton, FL (1988)). The oligonucleotides described above can also be delivered to cells to express antisense RNA or DNA in vivo, thereby suppressing polypeptide production. Another example of an inhibitor is a small molecule that binds to and occupies the catalytic site of a polypeptide, which renders the catalytic site inaccessible to the substrate, resulting in normal biological activity. Is disturbed. Examples of small molecules include, but are not limited to, small peptides or peptide-like molecules. When used in therapy, the inhibitors of the invention are formulated according to standard pharmaceutical practice. Inhibitors that are active when administered orally can be formulated as solutions, for example, syrups, suspensions or emulsions, tablets, capsules and lozenges. Liquid formulations generally are suspended or dissolved in a suitable liquid carrier such as ethanol, glycerin, non-aqueous solvents (eg, polyethylene glycol), oils, water and the like, including suspending agents, preservatives, flavoring or coloring agents. It consists of a suspension or solution of the compound or a pharmaceutically acceptable salt thereof. A composition in the form of a tablet can be prepared using any suitable pharmaceutical carrier (s) routinely used for preparing solid formulations. Examples of such carriers include magnesium stearate, starch, lactose, sucrose and cellulose. A composition in the form of a capsule can be prepared using routine encapsulation procedures. For example, a pellet containing the active ingredient may be prepared using a standard carrier and then filled into a hard gelatin capsule with the pellet, or alternatively, the dispersion or suspension may be prepared with a suitable pharmaceutical carrier (e.g., , Aqueous gums, celluloses, silicates, oils), and then the dispersion or suspension is filled into soft gelatin capsules. A typical parenteral composition is a compound or a pharmaceutical composition thereof dissolved or suspended in a sterile aqueous carrier or parenterally acceptable oil (eg, polyethylene glycol, polyvinylpyrrolidone, lecithin, peanut oil, sesame oil). Consisting of a salt acceptable to Alternatively, the solution can be lyophilized and reconstituted with a suitable solvent just prior to administration. A typical suppository is a compound of formula (I) or a pharmaceutically acceptable salt thereof, which is active when administered in this manner, with a binder and / or lubricant (eg, polymeric glycols, gelatin, cocoa butter), Or with other low melting point vegetable or synthetic waxes or fats. Preferably, the composition is in unit dosage form, such as a tablet or capsule. Each dosage unit for oral administration is preferably 1 to 250 mg (for parenteral administration, preferably 0.1 to 250 mg). 1-25 mg) of the inhibitor of the invention. The daily dosage regimen for adult patients may be, for example, an oral dose of 1-500 mg, preferably 1-250 mg, an intravenous, subcutaneous or intramuscular dose of 0. 1-100 mg, preferably 0. It may be 1 to 25 mg of a compound of formula (I) or a pharmaceutically acceptable salt thereof (calculated as the free base), wherein the compound is administered one to four times a day. Suitably, the compound will be administered over a continuous treatment period. The invention will be further described with reference to the following examples. However, it should be understood that the invention is not limited to such an embodiment. All parts or amounts are by weight unless otherwise specified. To facilitate understanding of the following examples, some commonly used methods and / or terms will be described. "Plasmids" are designated by a lower case letter preceded and / or followed by capital letters and / or numbers. The starting plasmids herein are commercially available, are available without limitation, or can be constructed from available plasmids according to published methods. In addition, plasmids equivalent to those described are known in the art and will be apparent to those skilled in the art. "Oligonucleotide" refers to a single-stranded polydeoxynucleotide or two complementary polydeoxynucleotide chains that can be chemically synthesized. Such synthetic oligonucleotides do not have a 5 'phosphate and thus are not ligated to other oligonucleotides without adding a phosphate group with ATP in the presence of a kinase. Synthetic oligonucleotides will be ligated to fragments that have not been dephosphorylated. "Ligation" refers to the method of forming a phosphodiester bond between two double-stranded nucleic acid fragments (Maniatis, T. et al. Id. , P. 146). Unless otherwise indicated, ligation reactions were performed with approximately equimolar amounts of DNA fragments to be ligated. The reaction is carried out using 10 units of T4 DNA ligase (ligase) per 5 μg under known buffer conditions. Sequence data SEQ ID NO: 1 SEQ ID NO: 2 c / a = This position is either C or A, now the unknown start ATG is underlined and the stop codon is unknown SEQ ID NO: 3 (EST 176432) SEQ ID NO: 4 (EST 424772) SEQ ID NO: 5 (EST 443275) SEQ ID NO: 6 (EST 567394) SEQ ID NO: 7 (EST 685578) SEQ ID NO: 8 (EST 928138) SEQ ID NO: 9 (EST 947785) SEQ ID NO: 10 (EST 1000163) SEQ ID NO: 11 (EST 1218021) SEQ ID NO: 12 (EST 1320439) SEQ ID NO: 13 (EST 716478) SEQ ID NO: 14 (EST 857644) SEQ ID NO: 15 446 amino acids (+3 additional stop codons) SEQ ID NO: 16

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61K 35/76 A61K 35/76 38/46 39/395 D 39/395 N 48/00 48/00 C07K 14/47 C07K 14/47 16/40 16/40 C12N 9/50 C12N 9/50 C12P 21/02 C C12P 21/02 C12Q 1/37 C12Q 1/37 A61K 37/54 (72)発明者 ポウェル,デビッド アメリカ合衆国 19426―0989 ペンシル バニア州,カレッジビル,ピー.オー.ボ ックス 5089,サウス カレッジビル ロ ード 1250,スミスクライン ビーチャム ファーマシューティカルズ (72)発明者 ケイ,ジョン イギリス国 シーエフ1 3ティーイー カーディフ,ユニバーシティー オブ ウ ェールズ (72)発明者 ヒル,ジェフリー イギリス国 シーエフ1 3ティーイー カーディフ,ユニバーシティー オブ ウ ェールズ──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) A61K 35/76 A61K 35/76 38/46 39/395 D 39/395 N 48/00 48/00 C07K 14 / 47 C07K 14/47 16/40 16/40 C12N 9/50 C12N 9/50 C12P 21/02 C C12P 21/02 C12Q 1/37 C12Q 1/37 A61K 37/54 (72) Inventor Powell, David United States of America 19426-0989 P. Collegeville, PA. Oh. Box 5089, South Collegeville Road 1250, Smith Kline Beechham Pharmaceuticals (72) Inventor Kay, John UK CEF1-3 TE Cardiff, University of Wales (72) Inventor Hill, Jeffrey CEF UK 13 TEE Cardiff, University of Wales

Claims (1)

【特許請求の範囲】 1.配列番号1または配列番号15のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたは該 ポリペプチドの断片、類似体もしくは誘導体をコードするヌクレオチド配列に対 して、その全長にわたり、少なくとも80%の同一性を有するヌクレオチド配列を 含んでなる単離されたポリヌクレオチド。 2.前記のヌクレオチド配列が配列番号2または配列番号16に含まれるヌクレ オチド配列を有する、請求項1に記載のポリヌクレオチド。 3.配列番号2または配列番号16のヌクレオチド配列に対して、その全長にわ たり、少なくとも80%の同一性を有するヌクレオチド配列を含んでなる単離され たポリヌクレオチド。 4.配列番号1のポリヌクレオチドである、請求項3に記載のポリヌクレオチド 。 5.前記のポリヌクレオチドがDNAである、請求項1〜4のいずれか1項に記 載のポリヌクレオチド。 6.前記のポリヌクレオチドがRNAである、請求項1〜4のいずれか1項に記 載のポリヌクレオチド。 7.前記のポリヌクレオチドがゲノムDNAである、請求項5に記載のポリヌク レオチド。 8.請求項2、4、5、6または7のいずれか1項に記載のDNAを含有するベ クター。 9.請求項8に記載のベクターで遺伝子工学的に操作された宿主細胞。 10.請求項9に記載の宿主細胞から前記DNAによりコードされるポリペプチド を発現させることを含んでなる、ポリペプチドの産生方法。 11.請求項8に記載のベクターで細胞を遺伝子工学的に操作することを含んでな る、ポリペプチドを発現できる細胞の作製方法。 12.請求項1〜7のいずれか1項に記載のポリヌクレオチドにハイブリダイズ可 能であり、配列番号1または配列番号15のポリペプチドと実質的に同じ生物学 的機能または活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。 13.配列番号1または配列番号15のアミノ酸配列に対して、その全長にわたり 、 少なくとも80%の同一性を有するポリペプチド、またはその断片、類似体もしく は誘導体。 14.配列番号1または配列番号15のアミノ酸配列を有するポリペプチド、また はその断片、類似体もしくは誘導体。 15.前記のポリペプチドが配列番号1または配列番号15のアミノ酸配列を有す る、請求項14に記載のポリペプチド。 16.単離された形である、請求項13、14または15に記載のポリペプチド。 17.治療に用いるための請求項13〜16のいずれか1項に記載のポリペプチド。 18.請求項13、14または15に記載のポリペプチドを阻害する化合物を同定するた めの化合物のスクリーニング法であって、単離されたポリペプチドを試験化合物 と接触させ、酵素基質の代謝回転速度を測定して、試験化合物の不在下での該代 謝回転速度と比較することを含んでなる方法。 19.請求項18に記載の方法により同定された化合物。 20.請求項13、14または15に記載のポリペプチドの阻害剤。 21.請求項13、14または15に記載のポリペプチドに対する抗体である、請求項20 に記載の阻害剤。 22.請求項1または12に記載のポリヌクレオチド、請求項13または14に記載のポ リペプチド、請求項19に記載の化合物、または請求項20に記載の阻害剤および製 剤学上許容される担体を含有する医薬組成物。 23.請求項13、14または15に記載のポリペプチドを阻害する必要がある患者の治 療方法であって、該患者に、治療に有効な量の請求項19に記載の化合物または請 求項20に記載の阻害剤を投与することを含んでなる方法。 24.治療に用いる医薬を製造するための請求項19に記載の化合物または請求項20 に記載の阻害剤の使用。[Claims] 1. A polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15, or A nucleotide sequence encoding a fragment, analog or derivative of a polypeptide. To obtain a nucleotide sequence having at least 80% identity over its entire length. An isolated polynucleotide comprising: 2. A nucleotide comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 16; The polynucleotide according to claim 1, which has an otide sequence. 3. For the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 16, Or a nucleotide sequence comprising at least 80% identity Polynucleotide. 4. The polynucleotide according to claim 3, which is the polynucleotide of SEQ ID NO: 1. . 5. 5. The method according to claim 1, wherein the polynucleotide is DNA. Polynucleotides listed. 6. 5. The method according to claim 1, wherein the polynucleotide is RNA. Polynucleotides listed. 7. The polynucleotide according to claim 5, wherein the polynucleotide is genomic DNA. Leotide. 8. A vector containing the DNA according to any one of claims 2, 4, 5, 6, and 7. Doctor. 9. A host cell genetically engineered with the vector of claim 8. Ten. A polypeptide encoded by the DNA from the host cell of claim 9. A method for producing a polypeptide, comprising expressing 11. 9. Manipulating cells with the vector of claim 8 by genetic engineering. A method for producing a cell capable of expressing a polypeptide. 12. Hybridizable to the polynucleotide according to any one of claims 1 to 7. And substantially the same biology as the polypeptide of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15 A polynucleotide encoding a polypeptide having a specific function or activity. 13. Over the entire length of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15 , Polypeptides having at least 80% identity, or fragments, analogs or Is a derivative. 14. A polypeptide having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15, Is a fragment, analog or derivative thereof. 15. The polypeptide has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 15 15. The polypeptide of claim 14, wherein 16. 16. The polypeptide according to claim 13, 14 or 15, which is in an isolated form. 17. 17. A polypeptide according to any one of claims 13 to 16 for use in therapy. 18. A method for identifying a compound that inhibits the polypeptide according to claim 13, 14, or 15. A method for screening a compound for isolating a polypeptide from a test compound. And measure the rate of turnover of the enzyme substrate to determine the rate in the absence of the test compound. A method comprising comparing with the rotation speed. 19. A compound identified by the method of claim 18. 20. An inhibitor of the polypeptide according to claim 13, 14 or 15. twenty one. 20.An antibody against the polypeptide according to claim 13, 14 or 15. The inhibitor according to any one of the above. twenty two. The polynucleotide according to claim 1 or 12, and the polynucleotide according to claim 13 or 14. A peptide, a compound according to claim 19, or an inhibitor and a product according to claim 20. A pharmaceutical composition comprising a pharmaceutically acceptable carrier. twenty three. Treatment of a patient in need of inhibiting the polypeptide according to claim 13, 14 or 15. 20. A method of treatment, wherein the patient is provided with a therapeutically effective amount of a compound or a therapeutic agent according to claim 19. 21. A method comprising administering the inhibitor of claim 20. twenty four. A compound according to claim 19 or claim 20 for producing a medicament for use in therapy. Use of the inhibitor according to the above.
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