[go: up one dir, main page]

HU218849B - Gazdaszervezetről gazdaszervezetre a környezetben csökkent terjedési képességgel rendelkező rekombináns bakulovirus és eljárás előállítására - Google Patents

Gazdaszervezetről gazdaszervezetre a környezetben csökkent terjedési képességgel rendelkező rekombináns bakulovirus és eljárás előállítására Download PDF

Info

Publication number
HU218849B
HU218849B HU9301581A HU9301581A HU218849B HU 218849 B HU218849 B HU 218849B HU 9301581 A HU9301581 A HU 9301581A HU 9301581 A HU9301581 A HU 9301581A HU 218849 B HU218849 B HU 218849B
Authority
HU
Hungary
Prior art keywords
virus
gene
insect
modified
viruses
Prior art date
Application number
HU9301581A
Other languages
English (en)
Other versions
HUT66586A (en
HU9301581D0 (en
Inventor
Lynn Ann Brennan
Original Assignee
American Cyanamid Co.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by American Cyanamid Co. filed Critical American Cyanamid Co.
Publication of HU9301581D0 publication Critical patent/HU9301581D0/hu
Publication of HUT66586A publication Critical patent/HUT66586A/hu
Publication of HU218849B publication Critical patent/HU218849B/hu

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86Viral vectors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K67/00Rearing or breeding animals, not otherwise provided for; New or modified breeds of animals
    • A01K67/30Rearing or breeding invertebrates
    • A01K67/34Insects
    • A01K67/35Silkworms
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01NPRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
    • A01N63/00Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing microorganisms, viruses, microbial fungi, animals or substances produced by, or obtained from, microorganisms, viruses, microbial fungi or animals, e.g. enzymes or fermentates
    • A01N63/40Viruses, e.g. bacteriophages
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011Details
    • C12N2710/14011Baculoviridae
    • C12N2710/14051Methods of production or purification of viral material
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011Details
    • C12N2710/14011Baculoviridae
    • C12N2710/14111Nucleopolyhedrovirus, e.g. autographa californica nucleopolyhedrovirus
    • C12N2710/14121Viruses as such, e.g. new isolates, mutants or their genomic sequences
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011Details
    • C12N2710/14011Baculoviridae
    • C12N2710/14111Nucleopolyhedrovirus, e.g. autographa californica nucleopolyhedrovirus
    • C12N2710/14141Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2710/14143Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Dentistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pest Control & Pesticides (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Agronomy & Crop Science (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Animal Husbandry (AREA)
  • Biodiversity & Conservation Biology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Description

A találmány tárgyát egy módosított genetikai elemmel rendelkező, nem fertőző bakulovírus képezi, melynek működése genetikai kiegészítéssel helyreállítható, és ezáltal újra a vírus rovarfertőző formája képződik. A találmány kiterjed továbbá egy heterológ gén inszertálására a vírusgenomba abból a célból, hogy a vírus egy rovarok leküzdését vagy rovarok módosítását biztosító anyagot termeljen a bioinszekticid hatás fokozása, valamint e kívánatos tulajdonságok genetikai stabilitása érdekében.
Leírásunkban a következő rövidítéseket alkalmaztuk:
A. cal. -Autographa californica
AcMNPV - Autographa californica nukleáris polihedrózis vírus bp - bázispár
ECV - extracelluláris vírus
GV - granulózis vírus kD - kilodalton
MOI - a fertőzés multiplicitása
NPV - nukleáris polihedrózis vírus
OB - zárványtest
OV - zárványvírus
PCR - polimeráz láncreakció
PDV - polihedron eredetű vírus
p. i. - fertőzést követően
PIB - polihedron zárványtest (lásd mint az OB)
5’ UTR - a géntranszkripció kezdőpontjától a proteinszintézis kezdő kodonját megelőző utolsó bázisig vagy bázispárig terjedő szakasznak megfelelő mRNS- vagy génszekvencia
3’ UTR - a proteinszintézis terminációs kodonját követő első bázistól vagy bázispártól az mRNS 3’-végén található, a gén által kódolt utolsó bázisig terjedő szakasznak megfelelő mRNS vagy génszekvencia (+)-szál - egy gén azon DNS-szála és az azt határoló szekvenciák, amelyek azonos információt hordoznak, mint az adott génből származó RNS (-)-szál - egy gén azon DNS-szála és az azt határoló szekvenciák, amelyek komplementerek a (+) szállal.
A találmány mindenfajta rovarvírusra vonatkozik, beleértve a DNS- és az RNS-vírusokat. A DNS-vírusokhoz tartoznak az entomopox vírusok (EPV) és a Baculoviridae vírusok, mint például a nukleáris polihedrózis vírusok (NPV), granulózis vírusok (GV) stb. Az RNSvírusokhoz tartoznak a togavírusok, flavivírusok, pikornavírusok, citoplazma polihedrózis vírusok (CPV) stb. Az Eubaculovirinae dupla szálú DNS-vírusok alcsaládja két nemzetséget foglal magában, az NPV-ket és GVket, melyek különösen alkalmasak rovarok biológiai leküzdésének céljára, mivel életciklusuk során zárványtesteket (OB-ket) képeznek.
Mostanáig több mint 400 bakulovírust azonosítottak gerinctelenekben. Az Autographa californica nukleáris polihedrózis vírus (AcMNPV) a Baculoviridae család egy jellemző vírusa, amely széles gazdaszervezet-spektrummal rendelkezik. Az AcMNPV-vírust eredetileg Autographa californica-ból, (A. cal.) a vetésibagoly-pilléből izolálták (amely kifejlett alakjában éjszakai molylepke), amely lucema-araszolóhemyóként ismert. Ez a vírus a pikkelyesszámyú rovarok rendjén belül 12 családot és több mint 30 fajt képes megfertőzni (lásd az irodalmi hivatkozást). Ezen a renden kívül nem ismert más faj, amelyben produktív fertőzést hozna létre.
A bakulovírusok bioinszekticidként való alkalmazása igen ígéretes. A mezőgazdaságban való elterjedt alkalmazásuk egyik fő akadálya a rovar megfertőzése és pusztulása közötti hosszú idő. Ez a késedelem néhány naptól néhány hétig terjedhet. Ezen idő alatt a rovar folytatja a táplálkozást, és a növény további károsodását okozza. Számos kutató megkísérelte ennek a hátránynak a kiküszöbölését oly módon, hogy egy heterológ gént inszertáltak a vírusgenomba annak érdekében, hogy egy rovarokat leküzdő vagy módosító anyag, mint például toxin (2., 3., 4. irodalmi hivatkozás), neuropeptid és hormon (5., 6. irodalmi hivatkozás) vagy enzim (7. irodalmi hivatkozás) expresszálódjon.
Bár a géntechnika megfelelő eszközt ad a kezünkbe a technikai akadályok leküzdésére annak érdekében, hogy bioinszekticidként alkalmazható vírusokat kereskedelmi forgalomba hozzunk, felmerült azonban, hogy széles körű alkalmazásuknak van egy második lehetséges akadálya is. Nevezetesen vannak olyan feltevések, melyek szerint ezeknek a genetikailag módosított vírusoknak a kibocsátása a környezetbe az ökoszisztémára nézve előre nem látható következményekkel járhat, mivel ezek a vírusok replikálódnak és terjednek (8., 9. irodalmi hivatkozás). Jelenleg minden, a rovarok biológiai szabályozása céljára előállított rekombináns rovarvírus kapcsán felvetődik ez a feltevés, mivel mindegyik képes rovarról rovarra terjedni. Szükség van tehát olyan rekombináns rovarspecifikus vírusokra, amelyek a környezetbe való kiszabadulásukat követően rovarról rovarra (gazdaszervezetről gazdaszervezetre) való csökkent átadódási képességgel rendelkeznek.
A bakulovírusok életciklusa, amint az az AcMNPV példáján látható, két szakaszból áll. Az életciklus egyegy szakaszát a vírus meghatározott formája képviseli, nevezetesen: nem zárványos extracelluláris (sejten kívüli) vírusrészecskék (ECV) és zárványos vírusrészecskék (OV) (10., 11. irodalmi hivatkozás). A sejten kívüli és zárványos vírusalakok ugyanazzal a genommal rendelkeznek, de különböző biológiai sajátságokat mutatnak. A vírus két alakjának érését vírusgének elkülönült csoportja irányítja, melyek közül néhány a két alaknál egyedi.
A természetben előforduló rovarfertőző formában sok viriont találunk kristályszerű proteinmátrixba ágyazva, amely zárványtestként (OB) ismeretes, és amelyet polihedron zárványtestként is említenek (PIB). A proteinszerű víruszárványokat tehát polihedronoknak nevezzük. A 29 kD molekulatömeggel rendelkező polihedron protein a víruszárványok fő víruskódolta szerkezeti fehérjéje (10., 12. irodalmi hivatkozás). (Hasonlóképpen a GV-k olyan OB-kat képeznek, amelyeket polihedrin helyett elsődlegesen granulin épít fel.)
A víruszárványok a természetes bakulovírus életciklusának fontos részét képezik, mivel a fogékony rovar2
HU 218 849 Β fajok közti horizontális (rovarról rovarra való) átvitel eszközéül szolgálnak. A környezetben egy (rendszerint lárva állapotú) fogékony rovar a vírus zárványos alakját fogyasztja el valamely fertőzött táplálékforrásból, például egy növényből. A kristályos zárványok a fogékony rovarok belében szétesnek, és fertőző vírusrészecskéket bocsátanak ki. Ezek a polihedron eredetű vírusok (PDV) megtámadják a középbél szöveteinek sejtjeit és ott replikálódnak (10. irodalmi hivatkozás).
Feltételezzük, hogy a vírusrészecskék endocitózis vagy fúzió útján kerülnek a sejtbe, és a vírus-DNS a mag pórusában vagy a magban csomagolódik ki. A vírusDNS replikációja 6 órán belül észlelhető. A fertőzést követő (p. i.) 10-12 óra elteltével az extracelluláris vírusoknak (ECV) a sejt felszínéből való kibújása révén egy másodlagos fertőzés teljed rá az egyéb rovarszövetekre. A vírus ECV alakja felelős a vírus sejtről sejtre való terjedéséért egy adott fertőzött rovaregyeden belül, és ugyancsak felelős a fertőzés átviteléért sejttenyészetben.
A fertőzési ciklus késői szakaszában (12 órával a fertőzést követően) polihedrin protein jelenik meg a fertőzött sejtekben. A polihedrin protein legkorábban a fertőzést követő 18-24 óra múlva áll össze a fertőzött sejt magjában, és a fehérjeszerű zárványokba vírusrészecskék ágyazódnak be. 4-5 nap alatt, a sejtek széteséséig nagy számban halmozódnak fel víruszárványok. Ezek a polihedronok nem játszanak aktív szerepet a fertőzés terjedésében a lárván belül. A vér-nyirok rendszerbe került ECV-k sokszorozódnak és szóródnak, ami a lárva pusztulásához vezet (10., 11., 12. irodalmi hivatkozás).
Amikor a fertőzött lárva elpusztul, polihedronok milliói maradnak a széteső szövetben, míg az ECV-k lebomlanak. Amikor más lárvák például a szennyezett növények vagy egyéb táplálék elfogyasztása révén találkoznak a polihedronokkal, a ciklus megismétlődik (10. irodalmi hivatkozás).
Összegezve, a vírus zárványos alakja felelős a rovar kezdeti, a bélen keresztül történő fertőződéséért, és ugyancsak felelős a vírus környezeti stabilitásáért. A PDV-k injektálással adagolva alapvetően nem fertőzők, azonban igen fertőzők szájon át bejutva. A vírus nemzárványos alakja (vagyis az ECV) felelős a másodlagos fertőzésért és a sejtről sejtre terjedő fertőzésért. Az ECV-k injektálással igen fertőzők sejttenyészetekre vagy belső rovarszövetekre, szájon át bejuttatva azonban alapvetően nem fertőzők.
Rovarokra toxikus idegen proteineket expresszáló rekombináns bakulovírusok alkalmazását elősegíti az a tény, hogy gerincesekre vagy növényekre ezek a vírusok nem kórokozók. Ezenkívül a bakulovírusok általában szűk gazdaszervezet-spektrummal rendelkeznek. Sok törzs kórokozó képessége egy vagy néhány rovarfajra korlátozódik.
A legszélesebb körben tanulmányozott bakulovírus az AcMNPV. Az AcMNPV-ről ismeretes, hogy 12 családot és több mint 30 fajt képes megfertőzni a Lepidoptera rovarrenden belül (1. irodalmi hivatkozás). Nem ismert ezen a renden kívül más faj, amelyben produktív fertőzést okozna. Mind a közvélemény, mind különböző hatóságok számára vita tárgya egy idegen DNS-szekvenciát tartalmazó AcMNPV-törzs kibocsátásának lehetséges következménye (8., 9. irodalmi hivatkozás). Ez arra a lehetőségre vonatkozik, hogy a módosított vírus átterjedhet más, nem célzott lepidopterákra. További mérlegelendő tényező ezeknek a vírusoknak a közismert környezeti stabilitása.
Szükség van tehát rovarról rovarra (gazdaszervezetről gazdaszervezetre) való csökkent terjedési képességgel rendelkező rekombináns rovarspecifikus vírusokra. Ezeknek a vírusoknak képeseknek kell lenniük egy rovar megfertőzésére, de rovarról rovarra való jelentősen csökkent terjedési képességgel kell rendelkezniük, így korlátozva a vírus fennmaradását a környezetben.
A találmány tárgyát tehát rovarról rovarra csökkent terjedési képességgel rendelkező, vagyis a környezetben gazdaszervezetről gazdaszervezetre csökkent átadódási képességgel rendelkező rekombináns rovarvírustörzsek előállítása és tenyésztése képezi. A Baculoviridae családba tartozó vírusok különösen alkalmasak ilyen törzsek konstrukciójára életciklusuk fentiekben ismertetett két szakasza következtében.
Ezen vírustörzseket úgy állítjuk elő, hogy először egy genetikai elemet módosítunk, ami a vírust rovarokra nézve fertőzésképtelenné teszi. Az e célra felhasznált genetikai elem nem korlátozódik a transz-működésű anyagokat kódoló génekre, mint például RNS-re vagy protein molekulákra, hanem ezek lehetnek c/'sz-működésű elemek vagy szabályozószekvenciák is, mint például a transzkripciós erősítőszekvenciák, promoterek, egyéb transzkripciós, transzlációs és genomiális replikációs szabályozóelemek és vírus-DNS (vagy -RNS) becsomagoló szekvenciák.
A módosítás formája lehet deléció, leolvasásikeret-eltolódás, inszertálás, újrarendeződés, pontmutáció vagy a génműködés megszakításának egyéb formája. A módosítás további formái olyan eljárások lehetnek, amelyek egy vírusfunkcióba avatkoznak be, mint például a transzkripció vagy a transzláció szupresszálása, egy „atiszensz”-RNS alkalmazása, egy további genetikai elem inszertálása és egy további szabályozóelem, mint például az élesztő 5’-irányú aktiválószekvencia (UASgal) inszertálása, melynek a működéséhez a GÁL 4 protein jelenléte szükséges.
Azt a célt, hogy a gazdaszervezetről gazdaszervezetre való terjedés képességének lényeges csökkentése mellett a rekombináns vírus fertőzőképességét helyreállítsuk, a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív termék vagy funkció kiegészítésével értük el.
A találmány tárgykörébe tartoznak a rekombináns rovarvírus rovarra fertőző formájának genetikai kiegészítéssel történő előállítására szolgáló eljárások, nevezetesen : (1) a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív terméket vagy működést szolgáltató DNS-fragmenssel traszfektált rovar eredetű szövettenyészetben való előállítás; (2) a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív terméket vagy működést szolgáltató DNS-fragmenssel stabilan transzformált rovar eredetű sejtvonalakban való előállítás; (3) a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív terméket vagy működést
HU 218 849 Β szolgáltató DNS-fragmenst tartalmazó transzgenikus rovarokban való előállítás.
A szolgáltatott terméktől vagy működéstől függően szükséges vagy kívánatos lehet heterológ vírus- vagy sejtpromoter alkalmazása a DNS-fragmens expresszálásának szabályozására. Ezt adagolási vagy időzítési megfontolások tehetik szükségessé.
Az (1) és (2) eljárásban alkalmazott rovarsejtek és a (3) eljárásban alkalmazott transzgenikus rovarok tehát „segítőként” (,,helper”-ként) működnek a vírus fertőzőképességének helyreállításában oly módon, hogy az így előállított vírusrészecskék (virionok) fertőzést okoznak, amikor a természetben a rovarok elfogyasztják azokat. A fertőzött lárvákban termelődött virionok, mivel azok nincsenek kiegészítve, defektívek és így a fertőzés nem terjed könnyen más rovarokra. Ezért ha vad típusú vírussal történő társfertőzés nem következik be, a rekombináns vírus életciklusa egyetlen fertőzéssel véget ér.
A találmány előnyös megvalósításában egy rovarokat leküzdő vagy módosító anyagot kódoló gént inszertáltunk a vírusgenomba. A gént a módosított vírusban a vírusgenom bármely megfelelő helyére inszertálhatjuk. Ilyen anyagok lehetnek toxinok, neuropeptidek és hormonok, valamint enzimek. Az így expresszált anyag fokozza a bioinszekticid hatást.
Pontosabban a gént a gazdaszervezetről gazdaszervezetre való csökkent átadódásért felelős módosított genetikai elem szomszédságába vagy közvetlenül abba inszertáljuk. A heterológ génnek a módosított genetikai elem helyének szomszédságába vagy közvetlenül a módosítás helyére történő inszertálása megelőzi vagy nagymértékben minimalizálja az olyan genetikai rekombináció lehetőségét, amely a vírus olyan alakját eredményezné, amely mind vad típusú fenotípussal, mind egy gazdaszervezetről gazdaszervezetre való átadódásra ható rovarokat leküzdő vagy módosító génnel rendelkezik.
A mellékelt 1. ábra az AcMNPV genomja ismert bakulovírus génjeinek lineáris térképét ábrázolja (13. irodalmi hivatkozás).
A 2. ábra a delta-p74-l plazmid konstrukciójának részletét mutatja, amely egy deléciót hordoz az AcMNPV-p74 génjében.
A 3. ábra az A4000 AcMNPV-törzs p74 génjében (delta-p74) létrehozott deléció részletét mutatja.
A 4. ábra a pMEV sorozatba tartozó expressziós vektor részletének restrikciós térképét ábrázolja, ahol jelöltük a promotert, a polilinkerszakaszt és a 3’-UTRegységet.
Rovarról rovarra történő csökkent terjedési képességgel rendelkező módosított rovarvírus előállítása oly mértékben meggyorsítja a fertőző vírus környezetből való eltűnésének sebességét, ami meghaladja a természetes abiotikus és biotikus lebomlási folyamatok által elérhetőt. A módosított vírus tehát nem marad fenn a környezetben.
A találmány szerinti megoldás mindenfajta rovarvírusra vonatkozik, beleértve DNS- és RNS-vírusokat. A DNS-vírusok lehetnek kettős szálú, burokkal rendelkező DNS-vírusok, mint például (család, azután faj) Entomopoxvirinae (fedelesszámyúak poxvírusa), Eubaculovirinae (Autographa califomica MNPV; Heliocoverpa zea SNPV), Nudibaculovirinae (Helicoverpa zea NOB), Ichnovírus (Campoletis sonorensis vírus) és Bracovírus (Cotesia melanoscela vírus) és kettős szálú, burok nélküli DNS-vírusok, mint például Iridovirinae (Chilo iridescent vírus) és egyszálú, burok nélküli DNS-vírusok, mint például Parvoviridae (Galleria densovírus).
Az RNS-vírusok lehetnek kettős szálú, burokkal rendelkező RNS-vírusok, mint például Togaviridae (Sindbis vírus), Bunyaviridae (répa levélfodrosodást okozó vírus) és Flaviviridae (Wesselbom vírus), ugyancsak idetartoznak a kettős szálú, burokkal nem rendelkező RNSvírusok, mint például a Reoviridae (Corriparta vírus) és Bimaviridae (Drosophila X vírus), és az egyszálú, burokkal nem rendelkező RNS-vírusok, mint például Picornaviridae (tücsökparalízis-vírus), Tetraviridae (Nudaurelia béta vírus), és Nodaviridae (gyászbogárvírus).
Az Eubaculovirinae dupla szálú DNS-vírusok alcsaládja két nemzetséget foglal magában, az NPV-ket és GV-ket, melyek különösen alkalmasak biológiai kontroll céljára, mivel életciklusuk során zárványtesteket képeznek. Az NPV-k közé tartozik például a Lymantria dispar NPV (cigány éjjeli lepke NPV), az Autoqrapha califomica MNPV, az Anagrapha falcifera NPV (zelleraraszoló NPV), a Spodoptera litturalis NPV, a Spodoptera frugiperda NPV, a Heliothis armigera NPV, a Mamestra brassicae NPV, a Choristoneura fumiferana NPV, a Trichoplusia ni NPV, a Helicoverpa zea NPV, a Rachiplusia ou NPV stb. A GV-k közé tartoznak például a Cydia pomonella GV (almamoly GV), a Pieris brassicae GV, a Trichoplusia ni GV, az Artogeia rapae GV, az Plodia interpunctella GV (indiai lisztmoly) stb. Az entomopox vírusok közé tartoznak például a Melolontha melonotha EPV, az Amsacta moorei EPV, a Locusta migratoria EPV, a Melanoplus sanquinipes EPV, a Schistocerca gregaria EPV, az Aedes aegypti EPV, a Chironomus luridus EPV stb.
A találmány tárgyát rovarok leküzdésére, különösen a Lepidoptera, Orthoptera, Diptera, Isoptera, Hymenoptera, Homoptera, Hemiptera és Coleoptera rendek leküzdése és mezőgazdasági termények, fák, cserjék, gyümölcsösök és dísznövények ezen rovarok támadásától való védelme képezi.
Bár a találmány szerinti megoldást az Autographa califomica NPV (AcMNPV) példáján szemléltetjük, érthető, hogy a találmányban ismertetett elvek a fent felsorolt rovarvírusok mindegyike esetében alkalmazhatók. Megfontolandó továbbá, hogy a találmány szerinti megoldás jól alkalmazható új, a szakirodalomban még nem azonosított és nem osztályozott rovarvírusok kifejlesztésében.
Az AcMNPV-vei való fertőzéskor kezdetben a vírus ECV-ként is ismeretes saijadzó (budded) alakja termelődik. Az ECV felelős a vírus sejtről sejtre való átviteléért egy adott fertőzött rovaron belül és sejttenyészetben való szaporodás közben. Az NPV-k esetében a fertőzési ciklus késői szakaszában a sejt megkezdi a PDV alak termelését, amely polihedron zárványtestnek (PIB) is nevezett kristályos zárványtestbe (OB) csomagolódik. (Hasonlóképpen a GV-k polihedrin helyett el4
HU 218 849 Β sősorban granulinból álló OB-ket képeznek.) A vírusnak ez a PDV alakja felelős a rovar kezdeti fertőzéséért a bélen keresztül, és ugyancsak felelős a vírus környezeti stabilitásáért.
A találmány szerint különösen előnyös egy olyan működés megváltoztatása, amely az intakt fertőző OB termelődésében játszik szerepet, és amely nincs hatással a vírus sarjadzó (budded) (ECV) alakjára.
Ilyen mutációkat kimutattak az AcMNPV-ben (14. idom. hiv.). Számos mutagenezises kísérletben azonosítottak olyan genetikai lokuszokat, melyek mutációja esetében saijadzó vírusok termelődnek, azonban intakt fertőző polihedronok nem. Az egyik legérdekesebb és legtöbb alkalmazási lehetőséget ígérő lokusz az AcMNPV genomjának „P” Hind III fragmensén található p74 gén (15. irodalmi hivatkozás). A p74 egy, a bakulovírus-fertőzés késői szakaszában és viszonylag kis mennyiségben termelődő protein (15. irodalmi hivatkozás).
A p74 gén megfelelőit azonosították más NPVkben is, beleértve a Choristoneura fumeiferana NPV-t (16. irodalmi hivatkozás), és az Orgyia pseudotsugata NPV-t (17. irodalmi hivatkozás). A p74 megfelelőjének a Nukleáris Polihedrózis Vírus nemzetség mindegyik tagjában jelen kell lennie. A NPV-k és a velük rokonságot mutató Granulózis Vírusok nemzetségének életciklusában található hasonlóságok alátámasztják annak a valószínűségét, hogy ezek a GV-k kódolnak egy, a p74-hez hasonló sajátságokat mutató gént.
A p74 gént és a szomszédos plO gént eltávolító nagyméretű deléciók olyan vírust eredményeznek, amelyek által termelt polihedront lárvákkal megetetve azokban nem okoz fertőzést. Mivel a csupán a plO génben létrehozott deléció olyan polihedron termelődéséhez vezet, amely szájon át bejuttatva fertőzést hoz létre, a fenti fenotípusért a p74 génben létrejött deléció tehető felelőssé (15. irodalmi hivatkozás).
Amint azt az 1. példában alább ismertetjük, a találmány tárgyát képezi egy (delta-p74-1-nek nevezett) transzfervektor előállítása, amely a vad típusú genommal rekombinálódva egyedül a p74 génben (delta-p74) hoz létre deléciót (3. ábra). Ezt a delta-p74-l transzfervektort hordozó E. coli HB101 törzset 1992. május 21-én letétbe helyeztük az American Type Culture Collection intézetnél (12301 Parlkawn Drive, Rockville, Maryland 20852, USA, ahol az ATCC 68988 nyilvántartási számot kapta. 1992. május 21-én ugyancsak letétbe helyeztük az American Type Culture Collection gyűjteményében egy A4000-nek nevezett AcMNPV törzs mintáit (amelyben a p74 gént delécióval megszakítottuk), és amelyet VR2373 nyilvántartási számmal láttak el.
Amint azt a 2. példában alább ismertetjük, igazoltuk, hogy a p74 gént kódoló DNS-szakasz deléciója okozza a lárvákkal megetetve nem fertőzőképes PIB-ek termelődését. Saijadzó vírusok termelődnek, és ezek a rovarhemocoelbe injektálva fertőzők.
Egy DNS-szakasz egyszerű deléciója nem az egyetlen módosítási lehetőség, amelyet a vírus egy adott genetikai eleme működésének megszüntetésére felhasználhatunk. Ebben a megvalósítási módban alkalmazható genetikai elem nem korlátozódik Zra/wz-működésű anyagokat kódoló génekre, mint például RNS-re vagy proteinmolekulákra, hanem magában foglal cisz-működésű elemeket vagy szabályozószekvenciákat is, mint például transzkripciós erősítőszekvenciákat, promotereket, egyéb transzkripciós transzlációs és genomiális replikáció-ellenőrző elemeket és vírus DNS (vagy RNS) becsomagoló szekvenciákat.
A módosítás formája ugyancsak lehet leolvasásikeret-eltolódás, inszertálás, újrarendeződés, pontmutáció vagy a génműködés megszakításának egyéb formája. A módosítás magában foglalhat leolvasásikeret-eltolódást, amely vagy túl korai proteinterminációt okoz, vagy megváltozott, nem működőképes protein keletkezéséhez vezet. Ugyancsak a találmány tárgykörébe tartozik egy terminációs kodon inszertálása a gén proteint kódoló szakaszába és a megfelelő szuppresszor tRNS-t kódoló gén beépítése a „helper” sejtvonalba.
A módosítás további formái olyan eljárásokat foglalnak magukban, amelyek egy vírusfunkcióba avatkoznak be, mint például a transzkripció vagy a transzláció szuppresszálása, egy „atiszensz” RNS alkalmazása, egy további genetikai elem inszertálása a vírusgenomba, és a kívánt szabályozóelem „in transz” szolgáltatása. Ennek az eljárásnak egy példája az élesztő GÁL 4 proteinfüggő, 5’-irányú aktiválószekvenciájának (UASgal) alkalmazása.
Az adott vírusgéntől 5’-irányban a GÁL 4 által szabályozható élesztő 5’-irányú aktiválószekvenciának a beiktatása a vírusgén transzkripcióját a GÁL 4 protein jelenlététől teszi függővé. A „helper” sejtvonal tartalmazza az alább ismertetett heterológ promoterek egyikének ellenőrzése alatt működő, GÁL 4-et kódoló szakaszt. A találmány tárgykörébe tartoznak egyéb lehetséges UAS elemek, így például az élesztő ivaros szaporodásitípus-rendszerében találhatók. Ugyancsak a találmány tárgykörébe tartoznak aktiválásukhoz egy protein kötődését igénylő szabályozószekvencia-elemek, mint például a szteroidreceptorok és ezek DNS-kötő helyei.
A találmány ugyancsak kiterjed a csupán meghatározott proteinek jelenlétében működő promoterek alkalmazására. Ennek egy példája a T7 bakteriofág T7 promotere, amely T7 specifikus RNS-polimerázt igényel a transzkripció megindításához. A T7 promotemek a p74 géntől 5’-irányban annak természetes promotere helyére történő beiktatása a vírusgén transzkripcióját a T7 RNS-polimeráz jelenlététől teszi függővé. Ennek a vírusnak a „helper” sejtvonala tartalmazza a T7 RNSpolimerázt egy heterológ promoter, mint például az ΙΕ-1 víruspromoter szabályozása alatt.
A p74 génen és annak funkcionális megfelelőin kívül vannak további génműködések, melyeknek a módosítása a rekombináns vírus korlátozásához vezet (lásd a 14. irodalmi hivatkozást). Különösen előnyösek az intakt, fertőzőképes OB-k termelődéséhez alapvetően szükséges működésekben szerepet játszó gének. Ezek példái közé sorolható egy, az ECV-k termelődéséről OB-k termelődésére való átkapcsolást szabályozó genetikai elem, a vírusrészecske közvetlen összeépüléséhez vagy -éréséhez szükséges funkciót kódoló genetikai
HU 218 849 Β elem és egy, a vírusrészecske strukturális fehérjéjét kódoló gén.
A találmány szerinti további módosított gének például FP (néhány polihedron) mutánsokat termelő gének, mint például a 25K gén (18. irodalmi hivatkozás), továbbá olyan gének, melyek működésének megszakítása a kívánt fenotípushoz vezet, mint például a késői és nagyon késői génműködésekre fajlagos vírustranszkripciós faktorok, a polihedronburok-proteinek (32-36,5 kD) génjei, a PDV protein génje, mely a középbélreceptorral lép kölcsönhatásba, és felelős a középbélsejtek kezdeti fertőzéséért, a PDV nukleokapszid összeépüléséért felelős gén vagy genetikai elem, a polihedron szerveződéséért felelős gén és egy GV-ben található „Viral Enhancing Factor” (19. irodalmi hivatkozás) (víruserősítő faktor) NPVben található funkcionális megfelelőjét kódoló gén.
Bár a polihedringén is módosítható, ennek az alkalmazási módnak jelentős gyakorlati korlátái lehetnek. A polihedringénnek a vírusreplikáció során elért magas transzkripció/transzláció rátája a vírusgenom magas szintű amplifikációjához kapcsolódva a fertőzött sejtben az összes megfesthető protein 50-75%-át kitevő polihedrinprotein-mennyiséget eredményez. Ez a nagy mennyiségű protein valószínűtlenné teszi, hogy a polihedringén korlátozott számú, víruson kívüli eredetű kópiája ellensúlyozni tudná a vírusban deletált polihedringént. Egy polihedrin-mínusz vírus kiegészítése elérhető lehet azonban olyan szabályozóelemek vagy -faktorok alkalmazásával, amelyeket elegendő kisebb menynyiségben szolgáltatni. Ilyen típusú módosítás lehet a vírus polihedringén olyan genetikai módosítása, hogy az egy szuppresszor tRNS-t tartalmazzon, vagy a polihedringén szabályozóelemeinek módosítása és a vírus szaporítása egy megfelelő „helper” sejtvonalban vagy rovartörzsben, amint azt fent ismertettük.
A polihedringénnel ellentétben úgy tűnik, hogy a p74 protein sokkal kisebb mennyiségben szükséges. Bár a gén a vírusfertőzés késői szakaszában íródik át, amikor a vírusgenom nagymértékben amplifikálódott, a p74-fajlagos mRNS szintje viszonylag alacsony. Lehetséges egy olyan p74 konstrukció előállítása, amely esetében korlátozott számú víruson kívüli eredetű kópia a vírus szájon át való fertőzőképességének helyreállításához elegendő p74 funkciót eredményez.
A találmány szerinti megoldást az AcMNPV példáján szemléltetjük. A p74 génnel azonos funkciót ellátó génnek mindegyik, a bakulovírusok NPV és GV csoportjához tartozó vírusban jelen kell lennie. Az AcMNPV-vei közeli rokonságban álló bakulovírusfajokban is lehetséges p74 génhomológok izolálása AcMNPV fragmensekkel csökkentett szigorúságú feltételek mellett végzett hibridizációval. Ez a megközelítés azért különösen előnyös, mivel a rendelkezésünkre álló adatok arra utalnak, hogy a p74 gén a legkonzervatívabb bakulovírusgének egyike (16. irodalmi hivatkozás). Távolabbi rokonságot mutató vírusok, például a GV-k esetén ez a megközelítés esetleg nem használható. A 14. példa egy azonosított AcMNPV génnel homológ funkciót kódoló gének azonosítására szolgáló másik megközelítési módot ismertet. Ebben a kísérletsorozatban egy ismert genetikai hibával rendelkező AcMNPV törzset kotranszfektáltunk az adott vírusgenom fragmenseivel. Az adott gént a hiba kiegészítése alapján azonosítottuk. Ezt a megközelítést sikeresen alkalmaztuk a Cydia pomonella granulosis vírusban az AcMNPV p35 apoptosis gátló génjével homológ működésű gén azonosítására (20. irodalmi hivatkozás).
Egyéb eljárások is alkalmazhatók további alapvető fontosságú késői génműködések azonosítására. Passarelli és Miller (21. irodalmi hivatkozás) a közelmúltban közöltek egy késői/nagyon késői gének transzkripciós faktorainak azonosítására szolgáló eljárást. Ebben az eljárásban, az AcMNPV vírusgenom ffagmenseit olyan konstrukciókkal kotranszfektálták, amelyekben a CAT gén expresszálását késői vagy nagyon késői víruspromoterek irányítják. Az AcMNPV genom azon ffagmenseit, amelyek a vírus késői/nagyon késői génjeinek normális transzkripciójában játszanak szerepet, a CAT-aktivitás háttérszínt fölé emelkedése alapján azonosították.
A genetikai kiegészítés technikájával, a módosított génműködés kiegészítésével a vírus rovarra fertőző formáját állítjuk elő. A módosított vírusnak ez a rovarra fertőző formája nem vihető át könnyen gazdaszervezetről gazdaszervezetre. A genetikai kiegészítés egy génnek arra a képességére vonatkozik, hogy amennyiben „in transz” jelen van, a mutáns fenotípust vad típusú fenotípussá változtatja.
A találmány tárgykörébe különböző, a rekombináns rovarvírus rovarra fertőző alakjának előállítására szolgáló eljárások tartoznak, nevezetesen: (1) a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív terméket vagy funkciót szolgáltató DNS-fragmenssel transzfektált rovar eredetű szövettenyészet sejtjeiben való előállítás; (2) a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív terméket vagy funkciót szolgáltató DNS-fragmenssel stabilan transzformált rovar eredetű sejtvonalakban való előállítás; (3) a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív terméket vagy funkciót szolgáltató, DNS-fragmenst tartalmazó transzgenikus rovarokban való előállítás. Az (1) vagy (2) eljárásban alkalmazott sejtvonalak pótolják a hiányzó funkciót és „helper” sejtvonalakként szolgálnak.
Például az AcMNPV-ben a p74 gént deletáltuk, amint azt a fentiekben ismertettük. A vad típusú p74 gén kiegészíti a módosított vírus hiányosságát az eljárásnak alábbiakban ismertetett három megvalósítási módja szerint: (1) a vírust a működőképes p74 extrakromoszomális kópiáit tartalmazó rovar eredetű sejtekben tenyésztjük. Ezek az extrakromoszomális kópiák lehetnek DPTS-fragmensek, a p74 gént tartalmazó plazmidok vagy olyan plazmidok, amelyek a sejtosztódás folyamán vagy vírusfertőzésre válaszképpen képesek replikálódni. (2) A vírust olyan rovar eredetű sejtvonalban tenyésztjük, amely a sejt genomjába stabilan beépülve tartalmazza a p74 gén egy vagy több működőképes kópiáját. (3) A vírust olyan transzgenikus rovarban tenyésztjük, amely a rovargenomban tartalmazza a p74 gén egy vagy több működőképes kópiáját.
Mindhárom eljárás esetében a működőképes p74 gén származhat AcMNPV-ből vagy származhat az
HU 218 849 Β
Eubaculoviridae család bármely más tagjából, amennyiben az visszaállítja a fertőzőképességet. A koncepció lényege, hogy a működőképes p74 gén „in transz” jelen van, és egy, a vad típusú fenotípust helyreállító diffuzibilis anyagot szolgáltat.
A vírus kiegészített formájának előállítására szolgáló egyik eljárás szerint a vírust a hiányzó funkciót pótló sejtvonalban tenyésztjük. A delta-p74 vírust például olyan sejtvonalban tenyésztjük, amely a p74 génterméket expresszálja. Az AcMNPV „P” Hind III fragmensét - elsődlegesen a delta-p74 gént, valamint az AcMNPV genom kis mennyiségű természetes határolószekvenciáit - tartalmazó plazmidot a delta-p74 vírussal kotranszfektálva átmenetileg elérhető a vírus fertőző formájának helyreállítása. Ennek az AC0028.3 nevezetű plazmidot tartalmazó E. coli HB101 törzsnek a mintáit, amely a p74 gént és az ismertetett határolószekvenciákat tartalmazza, 1992. május 21-én letétbe helyeztük az American Type Culture Collection intézetnél, ahol az ATCC 68987 nyilvántartási számot kapta. Mivel ennél a kotranszfektálási eljárásnál csupán a sejtek 0,1-5,0%-a tartalmazza mind a működőképes p74 gént, mind a delta-p74 vírusgenomot, ez a módszer eredendően nem hatékony.
„Helper” sejtvonal előállítására sokkal hatásosabb módszer a p74 gén egy kópiájának inszertálása a sejtbe oly módon, hogy a gén stabilan beépüljön a sejt genomjába (lásd a 6. példát). Ezt az eljárást alkalmazták nem bakulovírus eredetű gének Sf9 rovarsejtvonalba történő inszertálására (22. irodalmi hivatkozás). Az Sf9 rovar-sejtvonal (ATCC nyilvántartási szám CRL 1711) egy Spodoptera frugiperda 21 (SÍ21) származék. Az adott gén kópiáját tartalmazó plazmidot egy szelektálható markert tartalmazó plazmiddal kotranszfektáljuk.
A szelektálható marker egy olyan gén, melynek expresszálása lehetővé teszi a markergént, valamint a kívánt gént tartalmazó vektorral transzformált sejtek azonosítását. Szokásosan alkalmazott szelektálható markerek közé tartoznak például a timidinkináz (TK) és a hipoxantin-guanin-foszforibozil-transzferáz (HGPRT) gének és az antibiotikum rezisztenciát, például neomicin- és higromicinrezisztenciát átvivő gének.
A kiegészítő DNS-t a szelektálható markert tartalmazó DNS-hez képest 2-20-szoros moláris feleslegben alkalmaztuk. Ez a lehető legnagyobb mértékben megnöveli annak a valószínűségét, hogy a szelektálható markert expresszáló sejt tartalmazza a kérdéses gént is. A választott sejtvonalnak fogékonynak kell lennie az alkalmazott vírusra. Az AcMNPV előnyös alkalmazási módja esetén Sf9 vagy Sf21 sejteket használtunk. A transzfekciót követően a sejteket szelekciós körülmények mellett tenyésztettük, és a szelektálható markert expresszáló sejteket felszaporítottuk. Ezeket a sejteket arra nézve vizsgáltuk, hogy képesek-e kiegészíteni a delta-p74 vírusban található p74 deléciót.
Ezt az eljárást alkalmaztuk a fent ismertetett, a p74-et hordozó, AC0028.3 plazmid kópiáit tartalmazó Sf9 sejtvonalak izolálására. Az Sf9(28.3)CL-2 elnevezésű sejtvonal mintáit, amely a sejt genomjába stabilan beépülve tartalmazza az AC0028.3 plazmid kópiáit, 1993.
április 7-én letétbe helyeztük az American Type Culture Collection intézetnél, ahol az ATCC CRL 11322 nyilvántartási számon szerepel. Amint azt a 7. példában ismertetjük, igazoltuk, hogy a defektív, szájon át nem fertőzőképes delta-p74 vírus tenyésztése a fenti sejtvonalban szájon át fertőzőképes delta-p74 vírusokat eredményez.
A kiegészítés nem korlátozódik a vírus sejttenyészetben való szaporítására. A „helper” sejtvonalhoz hasonló módon előállíthatunk „helper” rovartörzset is. A Drosophila P elem transzformációja szokásos eljárás manapság, és hasonló rendszer bármely rovar esetében tervezhető. Ezenkívül rovarok vektor nélküli transzformációja végezhető emlősökben alkalmazott eljárásokhoz hasonló módon. A szükséges gént hordozó rovarok előállítására alkalmazható eljárások a preblasztoderma peték közvetlen injektálása (23. irodalmi hivatkozás) vagy ballisztikus transzformációja (24. irodalmi hivatkozás) fémszálakkal.
A viszonylag gyenge endogén p74 promoter elegendő a p74 géntermék termeléséhez. Előnyösebb lehet azonban a p74 gén működésének irányítására egy erősebb vagy egy korábbi promoter alkalmazása. Egy heterológ promoter használata fokozhatja a delta-p74 vírus kiegészítésének hatékonyságát. Bármely víruspromoter alkalmazható. Alkalmazható például a 6,9 K (bázikus protein) promoter, a DA26 promoter, a polihedrin promoter, a 35 K promoter, a plO promoter és az IE-1 promoter.
A 4. és 5. példában ismertetett heterológ promoterkonstrukciók alkalmazása egy további előnnyel rendelkezik. Ezekben a konstrukciókban eltávolítottuk csaknem az egész, az 1. példában ismertetett A4000-deltap74 vírus p74 génjében található, delécióig terjedő homológ 5’-irányú szekvenciákat. Ez nagymértékben csökkenti a delta-p74 vírus és a sejt genomjába beépült p74 szekvenciák közti rekombináció esélyét. Ez a homológ rekombináció másképp a p74 gén működésének és a vírus vad fenotípusának helyreállásához vezethet (lásd a 7. példát). További lépés a homológ rekombináció lehetőségének csökkentésére a delta-p74 vírus p74 génjében található deléció méretének növelése oly módon, hogy ne maradjon kódolószekvencia. Ez könnyen elvégezhető az 1. példában ismertetett eljárás módosításával.
A heterológ promoter nem korlátozódik víruspromoterekre. Sejtpromoterek ugyancsak megfelelnek. Sejt promoterek korlátlanul rendelkezésre állnak. Ilyen sejtpromoterek például a Bombyx móri aktinpromoter és a Drosophila melanogaster hsp 70 promoter. Az alkalmas promoterek a vírusfertőzés során közepestől nagy mennyiségig expresszálódnak a megfelelő rovarsejtekben. Ez a sajátosság nem korlátozza a promotereket rovarpromoterekre. Különböző gerinces, élesztő- vagy egyéb vírusosztályból származó promoterek is megfelelhetnek ezeknek az ismérveknek. A fent említett promoterek bármelyike szintén képes irányítani a szelektálható marker expresszióját.
A találmány további megvalósítási módja szerint a vírusgenomba egy rovarszabályozó vagy -módosító anyagot kódoló heterológ gént inszertálunk. Ez az anyag lehet például egy toxin, egy neuropeptid vagy egy hor7
HU 218 849 Β mon, vagy enzim. Előnyösen a heterológ gént közvetlenül a vírus módosított genetikai elemének helyére inszertáljuk, ami azt jelenti, hogy a genetikailag módosított vírus és egy felül fertőző, vad típusú vírus közti rekombináció a legtöbb esetben nem eredményezi vad típusú funkcióval és az inszertált heterológ génnel rendelkező vírus keletkezését. A találmány tárgykörébe tartozik a heterológ génnek a vírus módosított genetikai elemének szomszédságába történő inszertálása úgy, hogy a heterológ gén és a módosított genetikai elem szegregációja az utódvírusok kevesebb mint 10%-ában jön létre. Mindkét esetben megvalósul tehát a genetikailag módosított vírus korlátozása.
Az alkalmazható toxinok közé tartoznak az Androctonus australis skorpióból származó rovarspecifikus AalT toxin (25. irodalmi hivatkozás), a Pyemotes tritici atkafaj egy toxinja (2. irodalmi hivatkozás), a Bacilus thuringiensis aizawai alfajából (BTK) származó toxin (4. irodalmi hivatkozás), pókméregből izolált toxin (26. irodalmi hivatkozás) és a Bacilus thuringiensis CyrIVD (BTI) toxin (3. irodalmi hivatkozás). Az eljárásban alkalmazható neuropeptidek vagy hormonok közé tartoznak például az eclosion hormon (6. irodalmi hivatkozás), a prothoracicotrop hormon (PTTH), az adipokinetikus hormon, diuretikus hormon és a proktolin (5. irodalmi hivatkozás). Az alkalmazható enzimek egy példája a ,juvenile hormon”- észteráz (JHE) (7. irodalmi hivatkozás).
Egy defektív vagy deletált p74 génnel, valamint egy, a p74 génmódosítás helyére inszertált toxint kódoló heterológ génnel rendelkező rekombináns bakulovírus például olyan vírust eredményez, amely fokozottan hatásos a célrovar ellen, de a környezetben nem képes könnyen terjedni egyik rovarról a másikra.
A 11-12. példában alább ismertetettek szerint egy AcMNPV vírust izoláltunk, amelyben a DA26 víruspromoter ellenőrzése alatt álló AalT rovarspecifikus skorpiótoxint az A4000 delta-p74 vírus deléciójának helyére inszertáltuk. Ennek a vírusnak a mintáit 1993. április 7-én letétbe helyeztük az American Type Culture Collection intézetnél, ahol az ATCC VR 2405 nyilvántartási számon szerepel. Ennek a vírusnak a vad típusú Sf9 sejtekben való szaporítása (amint azt vártuk) szájon át bejuttatva nem fertőző PIB-ek termelődéséhez vezet. Abban az esetben, ha a vírust a fent ismertetett Sf9(28.3)CL-2 helper sejtvonalban szaporítjuk, szájon át fertőzőképes PIB-eket kapunk, és a fertőzött rovarok az AalT toxinra jellemző kontraktilis bénulás tüneteit mutatják (lásd alább a 12. példát).
Ennek a vírusnak a szaporítása működőképes p74 génterméket szolgáltató sejtvonalban vagy transzgenikus rovarban képessé teszi a vírust arra, hogy rovarokat bélen át fertőzzön meg. Mivel azonban a további kiegészítés hiányzik, a természetes rovarpopulációban csak szájon át történő fertőzésben defektív vírusok termelődnek. Egy társfertőzést létrehozó vad típusú vírus hiányában tehát a rekombináns vírus életciklusa ezzel az egyetlen fertőzéssel véget ér. Ez ellentétben áll a bakulovírusok alkalmazásának eddig közölt megközelítési módjaival (2), melyek szerint a fertőzött rovar pusztulását követően OB-k kerülnek a környezetbe, ahol azokat más rovarok megeszik, a vírus életciklusa ismétlődik, és létrejön a gazdaszervezetről gazdaszervezetre való terjedés.
A találmány szerinti legfontosabb megállapítás talán az, hogy a vírus módosított genetikai elemének szomszédságába vagy közvetlenül annak helyére a toxint, neuropeptidet, hormont vagy enzimet kódoló heterológ gén beiktatásával a genetikailag módosított vírus és egy vad típusú vírus közti homológ rekombináció csak az eredeti szülői genotípusokat állítja vissza.
Egy toxingén inszertálása a p74 deletált szakaszába például egy olyan vírushoz vezet, amely toxin-(-/fertőző OB-. Egy vad típusú (toxin-/fertőző OB+) vírussal történő rekombináció csak toxin+/fertőző OB-, valamint toxin-/fertőző OB+ utódokat eredményez. A homológ rekombináció toxin+/fertőző OB+ utódokat eredményező folyamata akadályozott, mivel a géndeletálást és -inszertálást ugyanazon a helyen végeztük el, ahelyett, hogy ezeket egymástól távol, a vírusgenom különböző lokuszaiban hoztuk volna létre. A toxingén ezért csupán a fertőző OB-k termelésére nézve defektív vírusokban található. A toxinért felelős heterológ gén továbbra is visszaszorul, és csökkent utódvírus-képzési képessége miatt a fertőző vírus sokkal gyorsabban eltűnik az ökoszisztémából, mint a vad típusú vírus.
A találmány szerinti megoldást a következő példákkal szemléltetjük. Ezek a példák csupán a találmány szemléltetésére szolgálnak, és semmilyen formában nem korlátozzák annak tárgykörét.
A példákban ismertetett eljárásokban a gyakorlatban szokásos molekuláris biológiai eljárásokat alkalmaztuk Sambrook és munkatársai szerint (27. irodalmi hivatkozás). Bakulovírusok tenyésztését és előállítását Summers és Smith által ismertetett szokásos eljárások szerint végeztük (28. irodalmi hivatkozás). A „megnevezett” AcMNPV ffagmensekre vonatkozó minden utalás az E2 AcMNPV törzs Summers és Smith által közölt fizikai térképén alapszik (28. irodalmi hivatkozás).
1. példa
A delta-p74-l transzfervektor és az A4000 rekombináns vírus előállítása
A delta-p74-l transzfervektort az Autographa califomica NPV E2 törzsből állítottuk elő a p74 génnek a bakulovírusgenom körülbelül 90. térképegységénél való deletálásával (lásd az 1. ábrát). A p74-et kódoló DNS-t tartalmazó BstEII „E” fragmenst az E2 törzsből származó vírus-DNS-ből tisztítottuk. Ezt a fragmenst a pSE280 plazmidvektor (Invitrogen, San Diego, CA) BstEII hasítási helyére szubklónoztuk. Ezt a kiónt LB10.2-nekneveztük. Az LB10.2-ből a p74 gén 5’-szakaszát, valamint 5’ határolószekvenciáit kódoló fragmenst a következő lépésekkel izoláltuk: Ncol enzimmel hasítottuk, ezt az Ncol hasítási helyet T4 DNSpolimerázzal tompa végűvé alakítottuk, Xhol-gyel hasítottuk, és a kapott fragmenst gélen tisztítottuk. Ezt a tompa végűvé alakított Ncol-Xhol fragmenst az LB9.6 plazmid tompa végűvé alakított Kpnl, valamint az Xhol hasítási helyei közé szubklónoztuk. Az LB9.6
HU 218 849 Β plazmid a Bluescript SK plazmid (Stratagene, La Jolla, CA) származéka, amelybe a HincII hasítási helyen egy polilinkert inszertáltak. A linker további egyedi restrikciós enzim hasítási helyeket tartalmaz, amelyek felhasználhatók heterológ gén inszertálására a p74 deletált szakaszába (lásd lent). A fent ismertetett 5’ határoló-, valamint 5’ p74 szekvenciákat tartalmazó plazmidot LB 11.12-nek neveztük. A p74 gén 3’ harmadát, valamint 3’ határolószekvenciáit tartalmazó HpalBamHI fragmensét izoláltuk, és az LB 11.12 plazmid EcoRV és BamHI hasítási helyei közé klónoztuk. A kapott klón a delta-p74-l transzfervektor (lásd a 2. ábrát). Ez a transzfervektor kódolja a 4750 bázispár (bp) 5’ határolószekvenciát, az 1-69. bázispárok közé eső p74 szekvenciát, a fent ismertetett plazmid polilinkerének 64 bázispárját, az 1287-től az 1937. bázispámál található terminációs kodonig terjedő p74 szekvenciákat, valamint 1796 bázispár 3’ határolószekvenciát (15. irodalmi hivatkozás). A 3. ábra részletesebben mutatja a p74 gén kódolószakaszában létrehozott deléciót. Ezt a transzfervektort használtuk ezután a szokásos kotranszfekciós eljárásokkal az A4000 vírustörzs előállítására (29. irodalmi hivatkozás). 2 χ 106 Sf9 sejtet oltottunk egy 60 mmes szövettenyésztő edénybe. Miután a sejtek letapadtak, a tápfolyadékot eltávolítottuk a sejtekről, és azt 10% borjúembrió-szérumot (FCS), valamint antibiotikumokat tartalmazó 0,75 ml Grace-féle tápfolyadékra cseréltük. 1 pg AcMNPV DNS-t és 2 pg delta-p74-l DNS-t adtunk 0,75 ml transzfekciós pufferhez (25 mmol/1 HEPES, pH 7,1; 140 mmol/1 NaCl; 125 mmol/1 CaCl2). A DNS-t ezután cseppenként a sejtekhez adtuk, és a sejteket 4 órán át 27 °C-on inkubáltuk. 4 óra elteltével a tápfolyadékot eltávolítottuk, és a sejteket óvatosan 10% FCS-t és antibiotikumokat tartalmazó friss TNMFH-val mostuk. Ezt követően a sejtek tápfolyadékát újra FCS-t és antibiotikumokat tartalmazó friss TNMFH-ra cseréltük. Az ECV-ket 4-5 nap múlva összegyűjtöttük, és különálló plakkokat izoláltunk a Summers és Smith által ismertetett plakkvizsgálati módszer szerint (28. irodalmi hivatkozás).
A különálló plakkokkal ezután olyan 48 rekeszes szövettenyésztő lemez egyes rekeszeit fertőztük, amelyet előzőleg 7,5 χ 104 Sf9 sejttel oltottunk be 0,5 ml friss TNMFH tápfolyadékban. 5 nap elteltével soronként, illetve oszloponként a rekeszekből 10-10 pl sarjadzó vírust tartalmazó felülúszót gyűjtöttünk. PCR reakciót állítottunk be 4 pl összegyűjtött felülúszó és a 3. ábrán látható A és C oligomerek felhasználásával. Mivel a C oligomer a deletált p74-re specifikus, ebben a reakcióban csak a rekombináns vírust tartalmazó ffagmenst sokszorosítjuk. A PCR reakciót a következőképp állítottuk össze: először 4 pl összegyűjtött felülúszót 1 órán át 55 °C-on 200 pg/ml Streptomyces griseus-ból származó nem specifikus proteázzal (Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN) emésztettünk 1 xA puffért [10 mmol/1 Tris (pH 8,3); 50 mmol/1 KCL-t; 0,1 pg/ml zselatint; 0,45% Nonidet™ P40-et (Shell Oil Co.); és 0,45% Tween™ 20-at (ICI Americas, Inc.)] tartalmazó 25 pl reakciós térfogatban. A nem specifikus proteázt ezt követően 12 percig tartó 95 °C-ra való hevítéssel inaktiváltuk: A PCR amplifikáció tartalmazza a proteázzal kezelt vírus összekeverését mindegyik ismertetett oligonukleotid primer 50 pmol mennyiségével a négy dNTP (dATP, dGTP, dCTP és dTTP) 200 pmol/1 mennyiségét, 1,5 mmol/1 MgCl2-t, lxA puffért és 1,25 egység AmpliTaq™ DNS-polimerázt (Perkin-Elmer/Cetus, Norwalk, CT) tartalmazó 50 pl reakciós térfogatban. A mintát a következő lépéseket tartalmazó 30 ciklusban sokszorosítottuk: 1 perc 94 °C (denaturálás), 1,5 perc 55 °C (a hőmérséklet csökkentésekor a primerek hozzákapcsolódása a komplementer DNS-szakaszhoz: „annealing”), és 2,5 perc 72 °C (extenzió). A 25. ciklust 72 °C-on 7 perces extenziós lépéssel rendelkező ciklus követte. A reakciós elegy 20 pl-jét 1,2% agarózgélen elektroforetizáltuk a rekombináns vírus jelenlétének igazolására. Mivel a mintákat soronként, illetve oszloponként gyűjtöttük össze, a rekombináns vírust egy pozitív sor és egy pozitív oszlop kereszteződésénél található rekesz alapján azonosítottuk.
2. példa
Az A4000fenotípusának kimutatása Heliothis virescens lárvákon végzett levéllemezpróbával Az A4000 vírustörzs fertőzőképességének vizsgálatára a szokásos levéllemezpróbát végeztük harmadik lárvaállapotban levő Heliothis virescens lárvákon, 1 pl (meghatározott mennyiségű PIB-et tartalmazó) csepptérfogatnyi vírust TÉT pufferben [50 mmol/1 Tris-HCl; pH 7,5; 10 mmol/1 EDTA; 0,1% Triton™ X-100 (Rohm és Haas, Philadelphia, PA)] egy 5 mm átmérőjű gyapotlevél-lemezhez adtunk megnedvesített szűrő-papír korongot (körülbelül 4 mm átmérő - 300 pl víz) tartalmazó különálló rekeszben. A csepp száradását követően egyetlen lárvát helyeztünk a rekeszbe, és a rekeszt lezártuk. A lárvákat egy éjszakán át hagytuk táplálkozni. A következő reggelen azokat a lárvákat, amelyek az egész levéllemezt megették, rovareledelt tartalmazó különálló rekeszekbe helyeztük át. Addig követtük a lárvák mortalitását, míg a túlélők bebábozódtak. Ezt az eljárást megismételtük az A1000 elnevezésű, vad típusú E2 AcMNPV vírustörzzsel, amelyet kontrollként alkalmaztunk. Két független kísérlet eredménye a következő volt:
Vírus Mennyiség (PlB-ek) Pusztulás/össz- lárvaszám
1. vizsgálat
A4000 2,5 xlO5 1/31
(delta-p74) 5xl04 0/32
5xl03 0/31
5x102 0/32
A1000 5x102 16/18
(vad típusú) 5xl0i 14/31
2. vizsgálat
A4000 5xl06 0/20
(delta-p74) 5x105 0/21
5xl04 0/24
5xl03 0/20
A1000 5x102 22/32
(vad típusú) 5xl0i 5/32
HU 218 849 Β
Ezek az eredmények azt mutatják, hogy a p74 géndeléciót tartalmazó vírusok az intakt p74 gént tartalmazó fertőző vírusnál még 10,000-szer nagyobb adagban sem fertőzők. Az A4000 esetében tapasztalt egyetlen lárva pusztulása nem tudható be a normális fertőzési folyamat következményének.
3. példa
Az A4000 kiegészítése a vírus nem fertőzőképes formájának előállítása céljából egy, az AcMNPV „P” HindllI fragmensének nem stabilan beépült kópiáját tartalmazó sejtvonalban való szaporítással Sf9 sejteket kotranszfektáltunk az 1. példában ismertetett szokásos eljárással. A transzfekcióban 1 pg genomiális A4000 vírus DNS-t használtunk 10-szeres moláris feleslegben levő AC0028.3 plazmid-DNS-sel vagy anélkül. Az AC0028.3 plazmid tartalmazza az AcMNPV „P” HindllI ffagmensét Bluescript K.S II (Stratagene, LaJolla, CA) HindllI hasítási helyére inszertálva. A „P” HindllI fragmenst a 2. ábra tetején az AcMNPV BstEII „E” fragmens részeként jelöltük. Ez a fragmens tartalmazza a teljes p74 kódolószekvenciát 221 bázis-pár 5’ és 56 bázispár 3’ határolószekvenciával együtt. A fertőző sejtekből 48 óra elteltével alacsony fordulatszámú centrifügálással polihedront gyűjtöttünk, majd azokat TET-pufferben szuszpendáltuk. A szuszpendált vírushoz 1% végkoncentrációban SDS-t adtunk. A sejt-DNS-t a minta gyors keverésével és pipettázásával összetördeltük. A sejt-DNS-t a PIB-ek SDS-t nem tartalmazó TET-pufferben végzett sorozatos mosásával, és ezt követően alacsony fordulatszámú centrifugálással távolítottak el. Végezetül a PIB-eket TET-pufferben szuszpendáltuk, és a vizsgálat céljára hemocitométerben számoltuk. A biopróbát a 2. példában ismertetettek szerint végeztük. A csupán A4000 DNS-sel transzformált Sf9 sejtekből nyert polihedronok 1 χ 105 PIB mennyiség mellett nem okozták a lárvák pusztulását. Az A4000 és ACOO28.3 DNS-sel kotranszfektált Sf9 sejtekből származó PIB-ek fertőzőképes vírus jelenlétének köszönhetően a lárvák pusztulását okozták. Tehát az A4000 vírus szaporítása (az AC0028.3 plazmid jelenlétének köszönhetően) működőképes p74 proteint termelő sejtekben rovarra fertőző A4000 vírus termelődéséhez vezet. Ez a vírus képes produktív fertőzést létrehozni lárvákban. Ezt az eredményt az elpusztult lárvákból összegyűjtött PIB-ek segítségével igazoltuk. A PIB-eket a következő eljárással gyűjtöttük: az elpusztult lárvákat egy olyan csészébe helyeztük, amelynek az alját eltávolítottuk és Nytex™-mel helyettesítettük (Tetko, Briarcliff Manor, N. Y.). Az elpusztult lárvákat TET-pufferrel mostuk (1 ml/lárva) és a PIB-eket tartalmazó átfolyó puffért összegyűjtöttük. Ezeket a PIB-eket 1% SDS-t tartalmazó TET-pufferben szuszpendáltuk, felkevertük, és alacsony fordulatszámon ülepítettük. A PIB-eket ezután néhányszor SDS-t nem tartalmazó TET-pufferrel mostuk. A PIB-ekből DNS-t állítottunk elő Summers és Smith eljárása szerint (28. irodalmi hivatkozás, a 35. oldalon ismertetett módon). A delta-p74 vírus jelenlétét ezekben az elpusztult lárvákban az 1. példában ismertetett oligomerek felhasználásával végzett PCR-amplifikációval igazoltuk.
4. példa
Heterológ promotert tartalmazó expressziós vektor előállítása
Heterológ promoterek alkalmazása a p74 gén expressziójának irányítására fokozhatja a delta-p74 vírus kiegészítésének hatékonyságát. Erre a célra alkalmazható alkalmas vektorok a következő elemeket tartalmazzák: (1) egy heterológ promotert a transzkripció szabályozására; (2) polilinkert, amely megkönnyíti az expresszálni kívánt DNS-szekvencia inszertálását; (3) egy 3’ UTR-t, amely az elsődlegesen átírt termék (mRNS) éréséhez és poliadenilációjához szükséges helyet biztosítja (lásd a 4. ábrát). Egy ilyen expressziós vektort, amely tartalmazta az AcMNPV DA26 gén promoterét, egy polilinkert és az AcMNPV 6,9 K. bázikus protein 3’ UTR-szekvenciáját, pMEVl-nek neveztünk. Egy AC0064.1-nek nevezett, meghatározott pMEVl izolátumot hordozó E. coli DH5-alfa törzs mintáját 1993. április 7-én letétbe helyeztük az American Type Culture Collection intézetnél, ahol az az ATCC 69275 nyilvántartási számon szerepel. További vektorok könnyen előállíthatók oly módon, hogy a pMEVl plazmidpromotert tartalmazó Pstl/Xbal ffagmensét az AcMNPV 6.9 K (pMEV2), a polihedrin (pMEV3), valamint a 35 K (pMEV4) vírusgének promotereit tartalmazó Pstl/Xbal enzimekkel hasított fragmensekkel helyettesítjük. Az ezeknek a vektoroknak az előállításánál felhasznált promoterfragmenseket klónozott vírus DNS PCR amplifikációjával állítottuk elő promoterspecifikus oligonukleotid primer párok segítségével. A printereket úgy terveztük meg, hogy az amplifikált promoterszakasz a következő általános szerkezettel rendelkezzék: (1) egy 22 bázispárból álló 5’-végi heteropolimer szintetikus szekvencia, amely a következő restrikciós endonukleázfelismerő helyeket tartalmazta: (a következő sorrendben) SstI, Sse8387I és Stul; (2) egy vírus-DNSszakasz, amely a gén domináló transzkripciós kezdőpontjától 5’-irányban a 100-350. bázispártól az 5’ UTR 3’-végéig (azaz a transzlációs kezdő kodon vonatkozásában a -1. pozícióig) terjedt; és (3) egy 23 bázispárból álló 3’-végi heteropolimerszakasz, amely a következő restrikciós endonukleázfelismerő helyeket tartalmazta: (a következő sorrendben) Esp3I és Xbal. Az Esp3I restrikciós felismerőhely helyzete és irányultsága olyan volt, hogy a hasítási helyek a (+) szálon a -5. és -4. pozíciók közé, a (-) szálon pedig a -1 és +1 pozíciók közé estek.
A 35 K promoterek előállításánál alkalmazott templát az AcMNPV „K” HindllI fragmense volt. A primer (+) szálának szekvenciája tartalmazta a következő restrikciós enzim hasítási helyekkel rendelkező, 22 bázispárból álló heteropolimerszekvenciát: SstI, Sse8387I és Stul; valamint tartalmazta a -399-től a -382. bázisig terjedő 35 K 5’ szekvenciát. A primer (-) szála tartalmazta a -21-től a -1. bázisig terjedő 35 K. 5’ szekvenciát, ezt követte a 23 bázispárból álló heteropolimerszakasz, amely a következő restrikciós enzim hasítási helyekkel rendelkezett: Esp3I és Xbal. Mindegyik amplifikációs reakcióhoz a megfelelő primerpár 50 pmol mennyiségét 250 pg templát-DNS-sel
HU 218 849 Β kevertük össze 50 μΐ reakciós keverékben [10 mmol/1 Tris-HCl (pH 8,3); 50 mmol/1 KC1; 1,5 mmol/1 MgCl2; 200 pmol/1 dNTP-k; 100 pg/ml zselatin; és 2,5 egység AmpliTaq™ DNS-polimeráz (Perkin-Elmer/Cetus, Norwalk. CT)]. A mintát 25 cikluson át amplifikáltuk [1,0 perc 94 °C (denaturáció); 1,5 perc 55 °C („annealing”); és 3,0 perc 72 °C (extenzió)]. Ugyanúgy, mint a többi reakció esetében az utolsó extenziós lépés 7 percig tartott.
Mindegyik reakciót EDTA (10 mmol/1 végkoncentrációig) és Sarkosyl (nátrium N-lauroil-szarkozin) (0,2% tömeg/térfogat végkoncentrációig) hozzáadásával állítottuk le. A terméket ezután egyszer kloroformmal, egyszer fenol:kloroform keverékével extraháltuk, és etanollal kicsaptuk. A DNS-mintákat a megfelelő pufferben oldottuk, és PstI (amely az Sse837I hasítási hely középső hat bázisát [CTGCA*G] ismeri fel) és Xbal enzimekkel emésztettük. Ezt követően mindegyik feltételezett promoterfragmenst 1,2%-os alacsony olvadáspontú agarózgélen gélelektroforézissel tisztítottuk, és egy pMEVl-ből származó 3,2 kb Pstl/Xbal vektorffagmenssel ligáltuk. Ez a fragmens tartalmazta a polilinkert, a pMEVl-ből származó 3’ UTR-t és Bluescript SK.+ leolvasási keretet. A kívánt rekombinánsokat restrikciós enzimvizsgálattal és DNS-szekvencia-meghatározással azonosítottuk. A gyakorlatban járatos személy ezt az eljárást bármely ismert szekvenciájú promoterszakasz, például az AcMNPV 6,9 K promoter, a polihedrinpromoter vagy sejtpromoterek, például a Drosophila melanogaster hsp 70 promoter esetében alkalmazhatja.
5. példa
Heterológ promoter-p74 kódolószakasz-konstrukciók előállítása
A p74 proteint kódoló szakaszát a megfelelő AC0028.3 szakasz PCR-amplifikációjával izoláltuk heterológ promotereket tartalmazó expressziós vektorba való inszertálás céljára (amint azt a 4. példában ismertettük). Az ennél a reakciónál alkalmazott 24 bázisból álló (+)-szál primer 5’-vége a p74 gén ATG transzlációs kezdőpontjánál van. A (-)-szál primer 29 bázisból áll, és tartalmazza a p74 szekvencia 3’-végi 20 bázisát a transzláció végét jelző TAA kodonnal bezárólag, és ezt egy további 9 bázisból álló, egy BamHI hasítási helyet tartalmazó szekvencia követi. A PCR reakciónál alkalmazott feltételek a következők voltak: összekevertünk 250 pmol AC0028.3-at a meghatározott oligonukleotid primerek mindegyikének 50 pmol mennyiségével a következő összetételű reakcióelegy 50 pl térfogatában: mindegyik dNTP (dATP, dGTP, dCTP és dTTP) 200 pmol/1 mennyiségben; 1,5 mmol/1 MgCl2; lxA puffer; és 1,25 egység AmpliTaq™ DNS-polimeráz (Perkin-Elmer Cetus, Norwalk. CT). A mintát 5 amplifikációs ciklusnak vetettük alá [mindegyik 1 perc 94 °C (denaturáció); 1,5 perc 45 °C („annealing”); és 3 perc 72 °C (extenzió)], amelyet 25 amplifikációs ciklus követett [mindegyik 1 perc 94 °C (denaturáció); 1,5 perc 55 °C („annealing”), és 2,5 perc 72 °C (extenzió)]. A ciklusokat egy 7 perces 72 °C-on végzett extenzió követte.
Tisztítást követően a reakciótermékeket DNS-polimeráz I Klenow fragmensével (27. irodalmi hivatkozás) kezeltük a négy dNTP jelenlétében, hogy a PCRtermékeket tompa végűvé tegyük. A p74 kódolószakaszának 3’-végét ezután BamHI enzimmel emésztettük, és a kapott fragmenst 1%-os alacsony olvadáspontú agarózgélen elektroforézissel tisztítottuk. Ez a fragmens ezután klónozható volt a 4. példában ismertetett expressziós vektorok bármelyikébe. A p74 gén inszertálására szolgáló expressziós vektor előállítása céljából mindegyik vektort Esp3I-gyel emésztettük, és az így kapott kinyúló 5’-végeket E. coli DNS-polimeráz I (Klenow-fragmens) segítségével a négy dNTP jelenlétében feltöltöttük. Ezután mindegyik terméket BamHI-gyel emésztettük. A vektort a szabaddá váló polilinkerffagmenstől 1%-os alacsony olvadáspontú agarózgélen végzett elektroforézissel elválasztottuk, és független reakciókban a p74-kódoló génszakaszhoz ligáltuk.
6. példa
A p74 gén működőképes kópiáját a sejtgenomba beépülve tartalmazó stabil Sf9 sejtvonalak izolálása Ebben a példában olyan Sf9 sejtek izolálását ismertetjük, melyek p74 géntartalmú konstrukciókat tartalmaznak a sejtgenomba stabilan beépülve [lásd Jarvis és munkatársai (22)]. Pontosabban egy AC0028.3 (ATCC 68987) elnevezésű plazmidot alkalmaztunk. Ez a plazmid tartalmazza az AcMNPV „P” HindlII fragmensét, amely a p74 gént, valamint kis mennyiségű természetes határolószekvenciát foglal magába. Először Sf9 sejteket kotranszfektáltunk 2 pg AC0028.3 plazmid-DNS és 1 pg IE-1 Neo plazmid DNS-keverékével (22). A transzfekciót követően a sejteket 2 órán át 28 °C-on inkubáltuk. Miután a sejteket teljes TNMFH tápfolyadékkal mostuk (27), ismét tápfolyadékot cseréltünk rajtuk, és 22 órán át 28 °C-on inkubáltuk őket. A sejteket ezután alacsony sűrűségben kioltottuk, hogy gyéren letapadt tenyészetet kapjunk, és a neomicin analóg G418-at (GIBCO-BRL, Grand Island, N. Y.) 0,5 mg/ml mennyiségben (aktív összetevőkre számítva) tartalmazó teljes TNMFH tápfolyadékot cseréltünk rajtuk. A sejteket ezt követően 28 °C-on inkubáltuk egy hétig. Egy hét elteltével a tápfolyadékot G418-at nem tartalmazó teljes TNMFH-ra cseréltük. Három különálló lemez mindegyikénél a következő eljárást alkalmaztuk. A túlélő sejteket összegyűjtöttük és felszaporítottuk. A három felszaporított sejtcsoport stabil sejtvonalakat alkotott, ezeket Sf9(28.3)CL-1-nek, Sf9(28.3)CL-2nek (ATCC CRL 11,322), és Sí9(28.3)CL-3-nak neveztük. Ezeket a keverék sejtcsoportokat tovább szaporítottuk, és PCR segítségével az 1. példában ismertetettek szerint vizsgáltuk a p74 gén jelenlétére a p74 (+) szálára specifikus oligomer (oligomer A) és az A4000 vírusban a p74 génből hiányzó szakaszra specifikus oligomer (oligomer B) (lásd 3. ábra) felhasználásával.
7. példa
Rovarra fertőző A4000 vírus előállítása a fenti sejtvonalakban való szaporítással, és fenotípusuk jellemzése
HU 218 849 Β
A 6. példa szerint izolált mindhárom sejtvonalat A4000 vírus 1-nél nagyobb MOI (multiplicity of infection) értékkel fertőztük. Vírustermelés elérhető 0,01-20 közötti MOI mennyiséggel. A fertőzött sejtekből a 3. példában ismertetett eljárással PIB-eket gyűjtöttünk. Szokásos levéllemezpróbát végeztünk (lásd a 2. példát). Az alábbiakban három független kísérlet eredményeit ismertetjük, ahol az A1000 vírus az AcMNPV vad típusú E2 törzse.
Vínis/sejtvonal Elpusztult
(Passzálás#) Adag (PIB-ek) Vizsgált szám Mortalitás (%)
1. vizsgálat
1x105 0/16 0
A4000/CL-l(P3) lxlO5 7/16 44
A4000/CL-2(P2) lxlO5 9/15 60
A4000/CL-3(P2) lxlO5 6/16 38
A1000/SÍ9 lxlO3 30/32 94
Kezeletlen 0 0/30 0
2. vizsgálat
lxlO5 0/15 0
A4000/CL-l(P3) lxlO5 1/15 6
A4000/CL-2(P2) lxlO5 4/16 25
A4000/CL-3(P2) lxlO5 6/16 38
A1000/SÍ9 1x10’ 21/28 75
Kezeletlen 0 0/32 0
3. vizsgálat
A4000/SÍ9 lxlO5 0/16 0
A4000/CL-l(P7) lxlO5 5/16 31
A4000/CL-2(P6) lxlO5 5/16 31
A4000/CL-3(P6) lxlO5 0/16 0
A4000/CL-3(P2) lxlO5 3/15 20
A1000/SÍ9 lxlO3 17/31 55
Kezeletlen 0 0/15 0
Amint a fenti adatokból látható, ha az AC0028.3 plazmiddal stabilan transzformált Sf9 sejteket A4000 vírussal fertőzzük, a kapott PIB-ek szájon át fertőzőképesek lesznek. Ezzel ellentétben az A4000 vírussal fertőzött szülői, nem transzformált Sf9 sejtekből származó PIB-ek nem okozzák a lárvák pusztulását. Ez azt jelenti, hogy az A4000 vírus szaporítása működőképes p74 proteint tartalmazó sejtekben (egy működőképes p74 génkonstrukció stabil beépülésének köszönhetően, lásd a 6. példát) rovarra fertőző A4000 vírusok termelődéséhez vezet. A komplementációs képesség elvesztésének oka a 6. passzálás után az Sf9(28.3)CL-3 sejtvonal esetében nem ismert.
Ezt követően DNS-t állítottunk elő [a 3. példában, valamint Summers és Smith (28) által a 35. oldalon ismertetettek szerint] a fenti 1. kísérlet során a kiegészítővírus által elpusztított húsz lárvából külön-külön összegyűjtött PIB-ekből. PCR-amplifikációt végeztünk az A, valamint C primerek felhasználásával a deltap74 vírus jelenlétének vizsgálatára, és az A, valamint B primerek felhasználásával a vad típusú vírus jelenlétének vizsgálatára (a primereket a 3. ábra mutatja). Az eredmények azt mutatták, hogy mind a húsz lárva fertőződött a delta-p74 vírussal. A delta-p74 vírusra jellemző pozitív jelen felül a húsz lárvából ötnél egy intakt p74 génre fajlagos erős PCR sávot is megfigyeltünk. Az 1. kísérletből származó 20 lárvából 18 esetben izolált PIB-ek felhasználásával levéllemez-vizsgálatot végeztünk (lásd a 2. példát). Mindegyik mintánál lárvánként 1 x 105 PIB-et és 32 lárvát használtunk. Csak az intakt p74 gén jelenlétére nézve pozitív jelet adó négy lárva esetében kaptunk háttérszínt feletti mortalitást. A csupán a deletált p74 gén jelenlétére nézve pozitív 14 vizsgált lárva egyikénél sem figyeltünk meg háttérszínt feletti lárva mortalitást.
Anélkül, hogy a magyarázatot az alábbi okokra korlátoznánk, ezeket az eredményeket két ok egyikére vezethetjük vissza. A közvetlenebb ok az lehetett, hogy a kiegészített vírus mintái vad típusú vírussal kontaminálódtak, vagy a kiindulóvizsgálatból (1. vizsgálatból) származó lárvák némelyike vad típusú vírust hordozott, és a delta-p74 vírussal való felül fertőzést követően az ezekből a lárvákból előállított PIB-készítményekben mind a vad típusú, mind a delta-p74 vírus jelen lehetett. Egy másik lehetséges magyarázat szerint a delta-p74 vírusnak a komplementáló sejtvonalban való tenyésztése során homológ rekombináció jött létre a vírus és a sejtgenomba beépült p74 szekvenciák között. Ha ez néhány esetben megtörtént, akkor a komplementált vírustól elpusztult lárvák közül néhány vad típusú vírust is tartalmazott. Ez a vad típusú vírus a második vizsgálati körben szájon át adagolva fertőző lehetett. A jelen konstrukciókban a deléciótól 5’-irányban 284 bázispár-, 3’-irányban 713 bázispár-azonosság található a delta-p74 vírus és a sejtgenomba beépült p74 szekvenciák között. Ha a második magyarázat helyes, akkor ez az eredmény a vírusban és a sejtvonalban található homológ szekvenciák mennyiségének csökkentésével, vagy ha szükséges, megszüntetésével elkerülhető.
8. példa
Λ p74 gén működőképes kópiáját stabilan a rovargenomba beépülve tartalmazó transzgenikus rovarok előállítása
Ebben a példában volffámrészecskék segítségével ballisztikus DNS-beviteli technikát alkalmaztunk transzgenikus rovartörzsek előállítására (24). Az 5. példában ismertetett egy-egy p74 konstrukcióhoz embrió-oltópufferben (0,1 mmol/1 nátrium-foszfát, pH 6,8; 5 mmol/1 KC1) oldott 20-100 pg DNS-t csaptunk ki 1,2 mm átmérőjű mosott volfrámrészecskékre (Bio-Rad, Richmond, CA). A kicsapási reakció össztérfogata 65 pl volt. A kicsapás után 50 pl felülúszót távolítottunk el. Az üledéket és 12-15 pl felülúszót erőteljesen elkevertük, mielőtt abból 8 pl-t makroprojektorra vittünk volna. Biolistics biorészecske-hordozó rendszert
HU 218 849 Β (DuPont, Wilmington, DE) alkalmaztunk choriontól megfosztott Trichoplusia ni embriók bombázására, mielőtt azok blasztodermává alakultak volna. Ez alatt az eljárás alatt az embriókat filterpapíron tartottuk. Az embriókat ezután kikelésig Series 700 halocarbonolaj (Halocarbon Products Corp., Hackensack, N. J.) alá helyeztük. Amikor a túlélő rovarok kikeltek, 25 rovarból álló csoportokat raktunk össze egy-egy ketrecbe. Ezekből a ketrecekből összegyűjtöttük a petéket, és az embriókból Roberts szerint (30) DNS-t állítottunk elő. PCR reakciót végeztünk (lásd az 1. példát) a 3. ábrán bemutatott A és B oligomerek felhasználásával, annak meghatározására, hogy melyik ketrecben keletkeztek a p74 gént tartalmazó peték. Miután a pozitív csoportokat azonosítottuk, az azokból származó petéket tápláltuk, és hagytuk kifejlett példányokká fejlődni. Kifejlett példányokat párosítottunk, és az általuk lerakott petékből izolált DNS-t újból PCR segítségével vizsgáltuk a p74 gén jelenlétére. Ezt az eljárást addig folytattuk, amíg a p74 génre nézve homozigóta molyvonalat sikerült előállítanunk.
9. példa
Rovarra fertőző A4000 vírus előállítása a fenti transzgenikus rovartörzsekben való szaporítással és a fenotípus jellemzése
Először 5 pl szövettenyésztő folyadékban lxlO5 A4000 sarjadzó vírust oltottunk vémyirokba kisszámú (10-20 db), negyedik lárvaállapotban levő transzgenikus Trichoplusia ni lárvának. Miután az A4000 vírus következtében a legtöbb lárva elpusztult (4-5 nap), a
3. példában ismertetettek szerint PIB-eket gyűjtöttünk. Ezeket a PIB-eket használtuk további amplifikációra. Az 5. példában ismertetett p74 génkonstrukciók egyikét tartalmazó harmadik lárvaállapotban levő transzgenikus Trichoplusia ni lárvákat 1 x 1,5 hüvelyk méretű négyszögből álló táplálékra helyeztük, melynek felületét 0,4 μΐ milliliterenként lxlO6 PIB-t tartalmazó A4000 vírussal fertőztük. Miután az A4000 vírus következtében a legtöbb lárva elpusztult (5-6 nap), a fentiekben ismertetettek szerint PIB-eket gyűjtöttünk. Ezeknek a PIB-eknek a mintáit törzsként TET-pufferben tároltuk, és a vírust a szokásos levéllemez biopróbával vizsgáltuk vad típusú második lárvaállapotban levő Trichopusia ni lárvákon. Az eredmények azt mutatták, hogy az A4000 vírusnak egy működőképes p74 gént tartalmazó transzgenikus rovarban való tenyésztése annak fertőzőképességét körülbelül a normális szintre állítja vissza. A kiegészített vírus által elpusztított lárvákból gyűjtött vírusok azonban szájon át való adagoláskor csökkent fertőzőképességgel rendelkeztek.
10. példa
Toxint kódoló gén inszertálása a delta-p74-l transzfervektorba, és az A4TxP-I rekombináns vírus izolálása
A Pyemotes tritici eredetű rovarspecifikus atkatoxint (TxP-I) kódoló DNS-fragmenst a Tox34 cDNSklónból izoláltuk (2). A teljes proteint kódoló gént, valamint némi 5’ és 3’ nem transzlálódó szakaszt tartalmazó EcoRI fragmenst klónoztunk az AcMNPV pVL 1393 vektorba (Invitrogen, San Diego, CA). Egy ebből a konstrukcióból származó EcoRV-HindlII (tompa végűvé alakított) fragmenst inszertáltunk a delta-p74-l transzfervektorba a deléción belül található AflII hasítási helyre (lásd a 2. ábrát). Ennek az LB15.9 nevezetű plazmidnak az 1. példában ismertetettek szerint A4000 vírusgenom DNS-sel Sf9 sejtekbe végzett kotranszfektálása olyan rekombináns vírust eredményez, amely kódolja a TxP-I gént, azonban nem képes szájon át lárvákat fertőzni. Ezen vírus sarjadzó formájának injektálása negyedik lárvaállapotban levő Heliothis virescens lárvák vér-nyirok rendszerébe azonban a TxP-I expressziója következtében kialakuló jellegzetes bénuláshoz vezet. Ezenkívül ennek a vírusnak a 3., 7. és 9. példákban ismertetett eljárások szerinti tenyésztése rovarra fertőző A4TxP-I vírusok termelődéséhez vezet. Ez a fertőző A4TxP-I vírus képes szájon át fertőzni lárvákat és bénulást kiváltani. A fertőzött lárvák által termelt vírusok azonban nem tartják meg rovarfertőző képességüket.
11. példa
Kodonoptimalizált AalT gént tartalmazó expreszsziós vektor előállítása
Az észak-afrikai Androctonus australis Hector skorpiómérgében található egy AalT nevezetű rovar-fajlagos toxin. Transzfervektort állítottunk elő az AalT génnek az AcMNPV polihedrinszakaszába való inszertálására. Ez az ACOO55.1 nevezetű vektor tartalmazza a pVL985 plazmid (30) BamHI hasítási helyére inszertált AalT gént, és egy Drosophila melanogaster kutikula génjelző peptidjéhez kötött, az érett AalT toxin számára kodonoptimalizált nukleotidszekvenciából áll. Ezt a transzfervektort tartalmazó HB101 E. coli törzs mintáit 1992. december 17-én letétbe helyeztük az American Type Culture Collection intézetnél, ahol az a 69166 nyilvántartási számot kapta.
Ennek a transzfervektomak a toxint kódoló szakaszát a 4. példában ismertetett expressziós vektorokba való további inszertálás céljából PCR segítségével visszanyertük. A reakciónál felhasznált (+)-szál primer egy 27 bázisból álló oligonukleotid volt, melynek 5’vége egybeesett az amplifikálandó kodonoptimalizált (AC0055.1-ben található) AalT gén ATG transzlációs kezdő kodonjával.
A (-)-szál primer az AC0055.1-ben az AalT gén 3’-végétől 5’-irányban körülbelül 35-40 bázisra található szakasszal hibridizált. A PCR reakciónál alkalmazott feltételek alapvetően azonosak voltak az 1. példában ismertetettekkel. Tisztítást követően a reakcióból származó termékeket az 5. példában leírtak szerint kezeltük, azzal a kivétellel, hogy a fragmenst 1,8%-os alacsony olvadáspontú agarózon tisztítottuk gélelektroforézissel.
A toxin inszertálására szolgáló expressziós vektor előállítása céljából mindegyik vektort Esp3I-vel emésztettük, és a kapott 5’-túlérő végeket mind a négy dNTP jelenlétében E. coli DNS-polimeráz I-gyel (Klenowfragmenssel) feltöltöttük. Ezután mindegyik készítményt BamHI enzimmel emésztettük. A vektort a sza13
HU 218 849 Β baddá tett polilinkerfragmenstől 1%-os alacsony olvadáspontú agarózgélen gélelektroforézissel elválasztottuk, majd egy független reakcióban az AalT-kódoló génffagmenshez ligáltuk.
12. példa
Az AalT toxinkódoló rekombináns A4001 vírus izolálása
Az inszertálás céljára használt A4000 vírus DNS előállítására a DNS-t egymást követően Sse8387I és Bsu36I emésztéssel linearizáltuk. Egy tipikus eljárás szerint 40 pg A4000 vírus DNS-t emésztettünk 2 órán keresztül 37 °C-on 100 egység Sse8387I enzimmel (Takara Biochemical, Inc., Berkeley, CA) 250 pl térfogatban (10 mmol/1 Tris-HCl, pH 7,5; 10 mmol/1 MgCl2; 1 mmol/1 dithiothreitol (DTT); 50 mmol/1 NaCl; és 0,01% BSA). A reakcióelegyet ezután 100 mmol/1 NaCl és 50 mmol/1 Tris-HCl koncentrációkra állítottuk be (pH 7,9), és a DNS-t 2 óráig 37 °C-on 100 egység Bsu36I enzimmel (New England Biolabs, Beverly, MA) emésztettük. A reakciót ezután SDS 1%-os (tömeg/térfogat), NaCl 0,3 mol/1 és EDTA 10 mmol/1 végkoncentrációig való hozzáadásával állítottuk le. Ezt követően a DNS-t egy 2 ml térfogatú Sephacryl-300-at (Pharmacia, Piscataway, N. J.) tartalmazó „poly-prep” oszlopon (BioRad Laboratories, Richmond, CA) kromatografáltuk, amelyet 10 mmol/1 Tris-HCl (pH 8,0), 1 mmol/1 EDTA, 0,1% SDS, és 0,3 mol/1 NaCl összetételű pufferrel ekvilibráltunk. Húsz, egyenként 150 pl térfogatú frakciót gyűjtöttünk. Mindegyik frakcióból 10 pl-t gélelektroforézissel vizsgáltunk a vírus-DNS-t tartalmazó frakciók azonosítására. Ezeket a frakciókat összegyűjtöttük, egy ízben fenol: kloroform eleggyel extraháltuk, majd a vírus-DNS-t etanollal kicsaptuk. A DNS-t TEpufferben [10 mmol/1 Tris-HCl (pH 8,0); 1 mmol/1 EDTA] 0,2-1 mg/ml koncentrációban szuszpendáltuk, és 4 °C-on tároltuk. Annak ellenőrzésére, hogy a vírusDNS-t teljesen linearizáltuk, egy mintát EcoRI enzimmel emésztettünk, és gélelektroforézissel vizsgáltunk. Az a vírus-DNS, amely egy 7 kb nagyságú EcoRI fragmenst tartalmazott, nem emésztődött teljesen Bsu36I és Sse8387I enzimekkel, és ezeket nem használtuk fel.
All. példában ismertetett AalT-tartalmú expreszsziós vektort Bsu36I és Sse8387I enzimekkel emésztettük. Húsz ng toxinkódoló fragmenst ligáltunk 0,5 pg Bsu36I/Sse8387I enzimekkel linearizált és tisztított AcMNPV A4000 DNS-sel 5 pl reakcióelegyben [25 mmol/1 Tris-HCl (pH 7,6); 5 mmol/1 MgCl2; 1 mmol/1 ATP; 1 mmol/1 DTT; 5% (tömeg/térfogat) polietilénglikol-8000; és 0,5 egység T4 DNS-ligáz (GIBCOBRL, Gaithersburg, MD)]. Egy éjszakán át 16 °C-on végzett inkubációt követően a teljes ligálási reakcióval Sf9 sejteket transzfektáltunk az 1, példában ismertetettek szerint.
A transzfektálás után 5 nappal eltávolítottuk a tápfolyadékot a transzfektált Sf9 sejtekről. A transzfektálásból származó felülúszóból tízszeres hígításokat készítettünk, és a 10 3, a 10~4 és a 10 5 hígításokból vett kétszer 1 ml térfogatú mennyiséggel 1,5 χ 106 sejtet fertőztünk 6 cm átmérőjű tenyésztőedényekben. A vírus hozzáadását követően egy órával a vírusinokulumot eltávolítottuk, és a sejteket agaróztartalmú táptalajjal rétegeztük felül, amint azt a megelőző példában ismertettük. Miután a plakkok teljesen kifejlődtek, azokkal 48 rekeszű lemez különálló rekeszeit oltottuk be, és a keletkező utódvírusokat PCR segítségével vizsgáltuk, (+)-szál printerként a 3. ábrán bemutatott A prímért, (-)-szál primerként all. példában ismertetett kutikula-AalT prímért használtuk.
Egy vagy két további plakktisztítási ciklust követően Pl törzseket készítettünk (28). Az AalT-tartalmú rekombináns vírust A4001-nek neveztük. Ennek a vírusnak a biológiai aktivitását az ECV-vel végzett injektálásos vizsgálattal állapítottuk meg. Az ECV-t a negyedik lárvaállapot közepén levő Heliothis virescens (dohányrügyhemyó) lárvákba oltottuk. Plakkvizsgálati módszerrel (28) meghatároztuk a vírus titerét, majd 0,5% (térfogat/térfogat) 5-ös számú vörös festékkel kiegészített TNMFH tápfolyadékban 2xl07, 2xl06 és 2xl05 plakképző egység/ml hígításokat készítettünk. A lárvákat szén-dioxiddal 2-5 percre elaltattuk, majd 26-os méretű tűvel felszerelt Hamilton-fecskendő segítségével 0,5 pl hígított vírussal beoltottuk. A tűt hosszanti irányban illesztettük be az utolsó két álláb között, majd az injektálást megelőzően két-három ízzel előretoltuk. A beoltás után a lárvákat megfigyeltük, hogy szivárog-e belőlük vörösre színeződött vér-nyirok, és ha a mintaveszteség nyilvánvaló volt, vagy annak gyanúja felmerült, a kísérletből kihagytuk azokat. A lárvákat ezután 27 °C-on tartottuk lefedett 4 cm2 területű etetőkamrákban (kamránként egy lárvát), és a morbiditást vagy mortalitást naponta egyszer szemmel ellenőriztük. Moribundnak (pozitív válasz) tekintettük az egyedet, ha miután a hátára fordítottuk, nem volt képes 0,5-2 percen belül eredeti helyzetbe kerülni.
Amikor H. virescens lárvákat a vírus 6 χ 103-1 χ 104 plakképző egységével oltottunk, az A4001 vírusfertőzésre reagáló lárvák kontraktilis bénulás tüneteit mutatták, és (talpraállási) válaszidejük az AalT-termelő rekombináns vírusra jellemző időre csökkent a vad típusú AcMNPV-vel összehasonlítva. Pontosabban a rekombináns vírus válaszidejének átlaga (RT50) az egyik biopróbában a vad típusú vírusra jellemző érték 50%-a (+/- 4%), a második bioesszében 52% (+/- 5%) volt. Ez az eredmény azt mutatja, hogy az AalT génnek és a kutikula jelzőszekvenciájának inszertálása az AcMNPV-be (A4001) biológiailag aktív toxinexpreszszálásán keresztül meggyorsítja a lárvák pusztulását.
A 2. példában ismertetett szokásos levéllemezpróbával csak a kisegítő Sf9(28.3)CL-2 sejtvonalban tenyésztett A4001 vírussal etetett lárvákban fejlődött ki az AalT toxinra jellemző kontraktilis bénulás. Ezzel szemben vad típusú Sf9 sejtekben tenyésztett, A4001 vírusokkal etetett lárvákban nem fejlődött ki kontraktilis bénulás.
13. példa
Az UASCAL-p74 transzfervektor és az A4UAS vírus előállítása
Ebben a példában egy fajlagos élesztő 3’ aktiválószekvenciát, UASGAL-t, és a minimális Drosophila
HU 218 849 Β melanogaster hsp 70 promotert (a -43-tól a -1. bázisig terjedően) inszertáltuk a p74 kódolószekvenciájától 3’-irányban a -1. pozícióba a vírusba. A GAL4 struktúrgént a pLA plazmidból (32) egy 2,9 kb nagyságú BamHI-HindlII fragmensként izoláltuk. Ezt a GAL4 fragmenst az 5. példában ismertetettek szerint heterológ promotert tartalmazó vektorok egyikébe inszertáltuk. A heterológ promoter-GAL4 konstrukció működőképes kópiáit tartalmazó stabil Sf9 sejteket izoláltunk a 6. példában leírtak szerint. Az UASGAL-p74 rekombináns vírus előállítása céljából egy UASGALp74 transzfervektort szerkesztettünk. A 17-hsp 70/lacZ konstrukciót (33) használtuk szubsztrátként a PCR-hez egy 175 bázispárból álló fragmens előállítására. Ezt a fragmenst egy, a nagy affinitású 17 bázisból álló GAL4 felismerőhelyet tartalmazó 29 bázispárból álló ismétlődő szekvencia négy példánya alkotja a minimális Drosophila melanogaster hsp 70 promoterhez (a -43-tól a -1. bázisig terjedően) kapcsolva. Olyan meghatározott primereket használtunk, amelyek az elkövetkező klónozási lépésekhez kívánt restrikciós hasítási helyeket adtak a fragmens 5’ (Smal) és 3’ (Esp 31 és Ndel) végeihez. Ezt a fragmenst inszertáltuk a deltap74 transzfervektorba (lásd a 4. ábrát) a p74 gén 5’-véghez legközelebb eső tompa véggé alakított HindlII, valamint a Ndel hasítási helyek közé. Ezt a plazmidklónt LB 17.8-nak neveztük. A p74 kódolófragmenst PCR amplifíkációval állítottuk elő az 5. példában ismertetett p74-specifikus (+)-szál primer, és (-)-szál printerként a Bluescript-specifikus T3 primer (Stratagene, La Jolla, CA) felhasználásával. Ezt a p74 fragmenst az előzőekben ismertetettek szerint DNSpolimeráz I Klenow-fragmensével kezeltük. A fragmens tisztítását követően azt Bell enzimmel emésztettük, amely a p74 gén 3’-vége közelében hasít. Az LB 17.8 plazmidot hasonló módon kezeltük Esp 31 emésztéssel, majd ennek a végnek Klenow-fragmenssel tompa véggé való alakításával. Miután a vektort tisztítottuk, azt szintén BclI-gyel emésztettük. Az előkészített vektort és a p74 génfragmenst ezután szokásos feltételek mellett ligáltuk. Ez a pUASGAL-p74-nek nevezett klón tartalmazta a hsp promoter irányítás alatt álló, de a GAL4 protein jelenlététől függő teljes p74 gént. Az A4UAS nevezetű rekombináns AcMNPV vírust az 1. példában ismertetettek szerint állítottuk elő. Kiegészített vírust ennek a rekombináns vírusnak a 6. példában ismertetett sejtvonalakban való tenyésztésével állítottunk elő. Elvégeztük a 2. példában leírt szokásos biopróbát, és az eredmények szerint az UASGAL-p74 szájon át adagolva nem fertőző rovarokra, amennyiben azonban ezt a vírust a GAL4 kiegészítő sejtvonalban tenyésztjük, rovarokra szájon át fertőzővé válik.
14. példa
Az AcMNPVp74 gén funkcionális analógjának izolálása granuzosis vírus genomjából Egy granulosis vírus szájon át való fertőzőképességéért felelős gént könnyen izolálhatunk a „marker reseue” technika alkalmazásával (21). Először egymást átfedő kozmid klónokból álló génkönyvtárat készítettünk a Trichoplusia ni granulosis vírus (TnGV) DNSből úgy, hogy a Sáli enzimmel részlegesen emésztett TnGV DNS-t a pVK102 kozmid vektorba (34) ligáltuk. A CpGV kozmid kiónok egyikéből 1 pg-t mennyiséget 1 pg AcMNPV A4000 vírus DNS-sel kotranszfektáltunk az 1. példában ismertetettek szerint. 5 nap múlva szokásos plakkvizsgálatot végeztünk (28). Miután a plakkok teljesen kifejlődtek, különálló plakkokkal 48 rekeszű szövettenyésztő lemez egyes rekeszeit fertőztük az 1. példában leírtak szerint eljárva. Az ezekből a rekeszekből származó utódvírusokat húszas csoportokba gyűjtöttük, és a 2. példában ismertetettek szerinti levéllemezpróbában harmadik lárvaállapotú Trichoplusia ni lárvákkal etettük. Amennyiben egy kozmid klón tartalmazza a p74 funkcionális analógját, az az A4000 vírust szájon át fertőzővé teszi. A fertőzőképesség helyreállításáért felelős meghatározott gént a pozitív kozmid klón plazmid szubklónjaival végzett kotranszfektálás és a fenti próba megismétlésével azonosítottuk.
Irodalomjegyzék
1. Granados, R. R., and Federici, B. A., The Biology ofBakuloviruses, I,99 (1986).
2. Tomalski, M. D. and Miller, L. K., Natúré, 352, 82-85 (1991).
3. Federici, B. A., In Vitro, 28, 50A (1992).
4. Martens, J. W. M., et al., App. & Envir. Microbiology, 56, Tlte-mO (1990).
5. Menn, J. J. and Borkovec, A. B., J. Actric. Food C/jotí., 37,271-278 (1989).
6. Eldridge, R., et al., Insect Biochem., 21, 341351 (1992).
7. Hammock, B. D., et al., Natúré, 344, 458-461 (1990).
8. Williamson, M„ Natúré, 353, 394 (1991).
9. Hammock, B., Natúré, 355,119 (1992).
10. Luckow, V. A. and Summers, M. D., Bio/Technology, 6,47-53 (1988).
11. Miller, L. Κ,,Αηη. Rév. Microbiol., 42,177-199 (1988).
12. Smith, G. E. and Summers, M. D., U.S. Patent Number 4,745,051.
13. Blissard, G. W. and Rohrmann, G. F., Ann. Rév. Entomol., 35,127-155 (1990).
14. Partington, S., et al., Virology, 175, 91-102 (1990).
15. Kuzio, J., et al., Virology, 173, 759-763 (1989).
16. Hill, J. E., et al., Biochimica et Biophysica Acta, 1172, 1-2(1993).
17. Leisy, D. I, et al., Virology, 153, 157-167 (1986).
18. Beames, B. and Summers, M. D., Virology, 168, 344-353 (1989).
19. Gallo, L. G., et al., J. Invertebrate Path., 58, 203-210(1991).
20. Crook, N. E., et al., J. Virology, 67, 2168-2174 (1993).
21. Passarelli, A. L. and Miller, L. K., J. Virology, 67, 2149-2158 (1993).
22. Jarvis, D. L., et al., Biotechnology, 8, 950-955 (1990).
HU 218 849 Β
23. Presnail, J. K. and Hoy, M. A., Proc. Natl. Acad. Sci., 89, 7732-7736 (1992).
24. Baldarelli, R. M. and Lengyel, J. A., Nucleic AcidsRes., 18, 5903-5904 (1991).
25. Zlotkin, E., et al., Toxicon, 9, 1-8. (1971).
26. Jackson, J. R. H. and Parks, T. N., United States Patent Number 4,925,664.
27. Sambrook, J., et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N. Y. (1989).
28. Summers, M. D. and Smith, G. E., A Manual Of Methods Fór bakulovirus Vectors And Insect Cell Culture Procedures, Dept. of Entomology, Texas Agricultural Experiment Station and Texas A & M University, College Station, Texas 77843-2475, Texas Agricultural Experiment Station Bulletin No. 1555 (1987).
29. Webb, N. R. and Summers, M. D., J. Methods Cell & Molec. Bioi., 2,173-188 (1990).
30. Roberts, D. B., ed., Drosophila: A Practical Approach, page 276, IRL Press, Oxford, England (1986).
31. Luckow, V. A. and Summers, M. D., Virology, 170,31-39 (1989).
32. Johnston, S. A., et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 83, 6553-6557 (1986).
33. Fischer, J. A., et al., Natúré, 332, 853-856 (1988).
34. Knauf, V. C. and Nester, E. W., Plasmid, 8, 45-54 (1982).

Claims (14)

  1. SZABADALMI IGÉNYPONTOK
    1. A környezetben gazdaszervezetről gazdaszervezetre csökkent terjedési képességgel rendelkező bakulovírus, amely a vírus egy genetikai elemének módosításával fertőzésképtelenné van téve, és fertőzőképessége a hiányzó vagy defektív termék vagy működés kiegészítésével helyreállítható, és a fertőzéssel képződő kiegészített vírus nem tartalmazza az említett termék vagy működés kódolására szolgáló genetikai elemet, és képes olyan szekunder fertőzést iniciálni, amely más, a gazdaszervezeten belüli rovarszövetekre átterjed.
  2. 2. Az 1. igénypont szerinti vírus, amely DNS-vírus az Eubaculovirinae vírusok vagy Nudibaculovirinae vírusok csoportjába tartozik.
  3. 3. A 2. igénypont szerinti vírus, amely egy Eubaculovirinae vírus, amelybe a nukleáris polihedrózis vírusok és a granulózis vírusok tartoznak.
  4. 4. Az 1. igénypont szerinti vírus, amelyben a genetikai elem módosítása a génműködés megszakításával vagy a vírusfunkció megzavarásával történt.
  5. 5. Az 1. igénypont szerinti vírus, amelynek a fertőzőképessége helyreállítható a vírusnak (a) a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív terméket vagy funkciót pótló DNS-fragmenssel transzfektált rovarsejtekben;
    (b) a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív terméket vagy funkciót pótló DNS-fragmenssel stabilan transzformált sejtvonalakban; vagy (c) a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív terméket vagy funkciót pótló DNS-fragmenst tartalmazó transzgenikus rovarokban történő tenyésztésével.
  6. 6. Az 5. igénypont szerinti vírus, amely a DNSfragmens expresszálásának irányítására heterológ promotert tartalmaz.
  7. 7. Az 1. igénypont szerinti vírus, amely egy rovarokat leküzdő vagy módosító anyagot kódoló heterológ gént is tartalmaz a vírusgenomba inszertálva.
  8. 8. A 7. igénypont szerinti vírus, amely rovarokat leküzdő vagy módosító anyagként toxint, neuropeptideket, hormonokat vagy enzimeket tartalmaz.
  9. 9. A 7. igénypont szerinti vírus, amelyben a heterológ gén (a) közvetlenül a vírus módosított genetikai elemének helyére; vagy (b) a vírus módosított genetikai elemének szomszédságába van inszertálva oly módon, hogy a heterológ gén és a módosított genetikai elem szegregációja az utódvírusok legfeljebb 10%-ában jön létre.
  10. 10. Eljárás a környezetben gazdaszervezetről gazdaszervezetre csökkent terjedési képességgel rendelkező bakulovirus előállítására, azzal jellemezve, hogy (1) a vírus egy genetikai elemének módosításával a vírust rovarokra fertőzésképtelenné, de olyan szekunder fertőzés iniciálására képessé tesszük, amely más rovarszövetekre átterjed; és (2) a vírus fertőzőképességét helyreállítjuk a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív termék vagy funkció időleges kiegészítésével, ahol a fertőzéssel létrejövő kiegészített vírus nem tartalmazza az említett termék vagy működés kódolására szolgáló genetikai elemet.
  11. 11. A 10. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a genetikai elem módosítását egy génfunkció megszakításával vagy egy vírusfunkció megzavarásával végezzük.
  12. 12. A 10. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a vírus fertőzőképességét a vírusnak (a) a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív terméket vagy funkciót pótló DNS-ffagmenssel transzfektált rovarsejtekben;
    (b) a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív terméket vagy funkciót pótló DNS-ffagmenssel stabilan transzformált sejtvonalakban; vagy (c) a módosított vírusból hiányzó vagy abban defektív terméket vagy funkciót pótló DNS-fragmenst tartalmazó transzgenikus rovarokban végzett tenyésztésével állítjuk helyre.
  13. 13. A 10. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy egy heterológ promotert is alkalmazunk.
  14. 14. A 10. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy egy, a vírusgenomba inszertált rovar szabályozó vagy módosító anyagot kódoló heterológ gént is alkalmazunk.
HU9301581A 1992-06-01 1993-05-28 Gazdaszervezetről gazdaszervezetre a környezetben csökkent terjedési képességgel rendelkező rekombináns bakulovirus és eljárás előállítására HU218849B (hu)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US89159892A 1992-06-01 1992-06-01

Publications (3)

Publication Number Publication Date
HU9301581D0 HU9301581D0 (en) 1993-10-28
HUT66586A HUT66586A (en) 1994-12-28
HU218849B true HU218849B (hu) 2000-12-28

Family

ID=25398502

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HU9301581A HU218849B (hu) 1992-06-01 1993-05-28 Gazdaszervezetről gazdaszervezetre a környezetben csökkent terjedési képességgel rendelkező rekombináns bakulovirus és eljárás előállítására

Country Status (20)

Country Link
EP (1) EP0572978B1 (hu)
JP (1) JPH0646843A (hu)
KR (1) KR100341542B1 (hu)
AR (1) AR248427A1 (hu)
AT (1) ATE239795T1 (hu)
AU (1) AU675939B2 (hu)
CA (1) CA2097389A1 (hu)
CZ (1) CZ103093A3 (hu)
DE (1) DE69332941D1 (hu)
FI (1) FI932479L (hu)
HU (1) HU218849B (hu)
IL (1) IL105849A0 (hu)
MX (1) MX9303261A (hu)
NO (1) NO931988L (hu)
NZ (1) NZ247737A (hu)
PL (1) PL171938B1 (hu)
SK (1) SK282444B6 (hu)
UA (1) UA42671C2 (hu)
ZA (1) ZA933829B (hu)
ZW (1) ZW6993A1 (hu)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB9106185D0 (en) * 1991-03-22 1991-05-08 Wellcome Found Biological control agents
JPH11500014A (ja) 1995-02-21 1999-01-06 キャンタブ ファーマシューティカルズ リサーチ リミティド ウイルス調製物、ベクター、免疫原、及びワクチン
US6355240B1 (en) * 1995-07-26 2002-03-12 Basf Aktiengellschaft Enhanced insecticidal insect virus through the expression of heterologous proteins with early promoters

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2008204A6 (es) * 1986-09-09 1989-07-16 Genetics Inst Metodos para producir cuerpos de inclusion polihedrica de composicion mezclada (pib),para coinfectar insectos huespedes y para producir proteinas heterologas en insectos.

Also Published As

Publication number Publication date
NZ247737A (en) 1995-10-26
PL299145A1 (en) 1994-02-07
ZW6993A1 (en) 1993-12-08
HUT66586A (en) 1994-12-28
FI932479A0 (fi) 1993-05-31
AR248427A1 (es) 1995-08-18
AU3991993A (en) 1993-12-02
SK282444B6 (sk) 2002-02-05
CA2097389A1 (en) 1993-12-02
EP0572978A1 (en) 1993-12-08
FI932479A7 (fi) 1993-12-02
JPH0646843A (ja) 1994-02-22
ATE239795T1 (de) 2003-05-15
UA42671C2 (uk) 2001-11-15
CZ103093A3 (en) 1994-01-19
KR100341542B1 (ko) 2002-11-18
KR940000580A (ko) 1994-01-03
HU9301581D0 (en) 1993-10-28
AU675939B2 (en) 1997-02-27
FI932479L (fi) 1993-12-02
EP0572978B1 (en) 2003-05-07
IL105849A0 (en) 1993-09-22
DE69332941D1 (de) 2003-06-12
MX9303261A (es) 1994-01-31
NO931988D0 (no) 1993-06-01
NO931988L (no) 1993-12-02
SK55293A3 (en) 1994-01-12
PL171938B1 (pl) 1997-07-31
ZA933829B (en) 1993-12-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US5266317A (en) Insect-specific paralytic neurotoxin genes for use in biological insect control: methods and compositions
US5858353A (en) Insect viruses, sequences, insecticidal compositions and methods
Popham et al. Genetic improvement ofHelicoverpa zeanuclear polyhedrosis virus as a biopesticide
Chen et al. Genetic engineering of Helicoverpa armigera single-nucleocapsid nucleopolyhedrovirus as an improved pesticide
AU1461701A (en) DSRNA as insect control agent
US6235278B1 (en) Biological insect control agents expressing insect-specific toxin genes, methods and compositions
AU753930B2 (en) Recombinant baculovirus-based insecticides
US6130074A (en) Recombinant insect virus with reduced capacity for host-to-host transmission in the environment and methods to produce said virus
AU743526B2 (en) Transgenic virus
HU218849B (hu) Gazdaszervezetről gazdaszervezetre a környezetben csökkent terjedési képességgel rendelkező rekombináns bakulovirus és eljárás előállítására
AU684799B2 (en) Gene insertion by direct ligation (in vitro)
Gutiérrez et al. The deletion of the pif gene improves the biosafety of the baculovirus-based technologies
US6355240B1 (en) Enhanced insecticidal insect virus through the expression of heterologous proteins with early promoters
Possee et al. Genetically engineered viral insecticides: New insecticides with improved phenotypes
Feng et al. Molecular modifications of baculoviruses for the control of forest insect pests
Vlak Genetic Engineering of
Retnakaran Qili Feng,* Basil M. Arif,* Subba R. Palli,✝ Sardar S. Sohi
MXPA00010981A (es) Insecticidas con base en basculovirus recombinantes

Legal Events

Date Code Title Description
HMM4 Cancellation of final prot. due to non-payment of fee