HK1203091B - Methods for diagnosis of lung cancer - Google Patents

Claims (11)

1. Procédé de détermination de la probabilité qu'une affection pulmonaire chez un sujet ne soit pas un cancer, comprenant les étapes consistant à :

   (a) mesurer le taux d'expression des protéines : ISLR (superfamille des immunoglobulines contenant une protéine à répétitions riche en leucine), GRP78 (protéine régulée par le glucose de 78 kDa), LRP1 (protéine 1 apparentée aux récepteurs des lipoprotéines de basse densité), ALDOA (fructose-bisphosphate aldolase A), FRIL (chaîne légère de la ferritine), LG3BP (protéine liant la galectine-3), TSP1 (thrombospondine 1), et COlA1 (chaîne alpha 1 du collagène de type XVIII), dans un échantillon biologique prélevé chez le sujet ;

   (b) calculer un score basé sur le taux d'expression de protéines dans l'échantillon biologique déterminé à l'étape (a) ; et

   (c) comparer le score de l'échantillon biologique à un score obtenu à partir d'une population de référence, la comparaison permettant de déterminer que l'affection pulmonaire n'est pas un cancer,

   dans lequel, si le score de l'échantillon biologique provenant du sujet est inférieur au score de la population de référence, l'affection pulmonaire n'est pas un cancer.
2. Procédé selon la revendication 1, dans lequel ledit sujet a un nodule pulmonaire, de préférence dans lequel ledit nodule pulmonaire a un diamètre inférieur ou égal à 3 cm, de préférence dans lequel ledit nodule pulmonaire a un diamètre de 0,8 cm à 2,0 cm.
3. Procédé selon la revendication 1, dans lequel ledit score est calculé au moyen d'un modèle de régression logistique appliqué aux mesures des protéines.
4. Procédé selon la revendication 1, dans lequel ledit score est donné par l'expression où Ǐ_i,s est l'intensité de transition i transformée logarithmiquement et normalisée dans ledit échantillon (s), β_i est le coefficient de régression logistique correspondant, α est une constante spécifique au panel, et N est le nombre total de transitions dans ledit panel.
5. Procédé selon la revendication 3, comprenant en outre la normalisation des mesures de protéines.
6. Procédé selon la revendication 5, dans lequel les mesures de protéines sont normalisées par une ou plusieurs protéines choisies dans le groupe constitué par les PEDF (facteur dérivé de l'épithélium pigmentaire), MASP1 (lectine sérine protéase 1 liant le mannane), GELS (gelsoline), LUM (lumicane), C163A (protéine M130 de type 1 riche en cystéine des récepteurs éboueurs), et PTPRJ (protéine tyrosine phosphatase êta de type récepteur).
7. Procédé selon la revendication 1, dans lequel ledit échantillon biologique est choisi dans le groupe constitué par un tissu, le sang, le plasma, le sérum, le sang total, l'urine, la salive, une sécrétion génitale, le liquide céphalorachidien, la sueur et les excréments.
8. Procédé selon la revendication 1, dans lequel la détermination de la probabilité que l'affection pulmonaire ne soit pas un cancer est déterminée par la sensibilité, la spécificité ou une valeur prédictive négative associée au score.
9. Procédé selon la revendication 1, dans lequel ledit score déterminé à l'étape (b) a une sensibilité d'au moins 80%.
10. Procédé selon la revendication 1, dans lequel l'étape de mesure se fait par spectrométrie de masse à suivi de réaction sélectionnée en utilisant un composé qui se lie spécifiquement à la protéine en cours de détection ou à une transition peptidique.
11. Procédé selon la revendication 10, dans lequel le composé qui se lie spécifiquement à la protéine en cours de mesure est un anticorps ou un aptamère.