HK1203091B - Methods for diagnosis of lung cancer - Google Patents
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- Verfahren zum Bestimmen der Wahrscheinlichkeit, dass ein Lungenzustand in einem Subjekt kein Krebs ist, das Folgendes beinhaltet:a) Messen des Proteinexpressionsniveaus von: ISLR (Immunglobulin-Superfamilie, die leucinreiches Wiederholungsprotein enthält), GRP78 (78kDa Glucosereguliertes Protein), LRP1 (auf Lipoproteinrezeptor niedriger Dichte bezogenes Protein 1), ALDOA (Fructose-Bisphosphat-Aldolase A), FRIL (Ferritin-Leichtkette), LG3BP (Galectin-3-Bindungsprotein), TSP1 (Thrombospondin-1) und COIA1 (Kollagen-alpha-1(XVIII)-Kette), von einer von dem Subjekt erhaltenen biologischen Probe;b) Berechnen eines Score auf der Basis der Proteinexpressionsniveaus von der in Schritt (a) ermittelten biologischen Probe; undc) Vergleichen des Score von der biologischen Probe mit einem von einer Referenzpopulation erhaltenen Score, wobei der Vergleich eine Feststellung ergibt, dass der Lungenzustand kein Krebs ist, wobei, wenn der Score von der biologischen Probe von dem Subjekt geringer ist als der Score von der Referenzpopulation, der Lungenzustand kein Krebs ist.
- Verfahren nach Anspruch 1, wobei das genannte Subjekt einen pulmonalen Knoten hat, wobei der genannte pulmonale Knoten vorzugsweise einen Durchmesser von gleich oder weniger als 3 cm hat, wobei der genannte pulmonale Knoten vorzugsweise einen Durchmesser von 0,8 cm bis 2,0 cm hat.
- Verfahren nach Anspruch 1, wobei der genannte Score von einem logistischen Regressionsmodell berechnet wird, das auf die Proteinmesswerte angewendet wird.
- Verfahren nach Anspruch 1, wobei der genannte Score ermittelt wird als wobei Ǐi,s eine logarithmisch transformierte und normalisierte Intensität von Übergang i in der genannten Probe (s) ist, ßi der entsprechende logistische Regressionskoeffizient ist, α eine panel-spezifische Konstante ist und N die Gesamtzahl von Übergängen in dem genannten Panel ist.
- Verfahren nach Anspruch 3, das ferner das Normalisieren der Proteinmesswerte beinhaltet.
- Verfahren nach Anspruch 5, wobei die Proteinmesswerte mit einem oder mehreren Proteinen normalisiert werden, ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus PEDF (Pigmentepithel-derivierter Faktor), MASP1 (Mannan-bindende Lectin-Serin-Protease 1), GELS (Gelsolin), LUM (Lumican), C163A (Scavenger-Rezeptor Cystein-reiches Protein M130 Typ 1) und PTPRJ (Rezeptor-Typ Tyrosin-Protein-Phosphatase Eta).
- Verfahren nach Anspruch 1, wobei die genannte biologische Probe ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Gewebe, Blut, Plasma, Serum, Vollblut, Urin, Speichel, Genitalsekret, Rückenmarksflüssigkeit, Schweiß und Exkremente.
- Verfahren nach Anspruch 1, wobei die Bestimmung der Wahrscheinlichkeit, dass der Lungenzustand kein Krebs ist, anhand von Empfindlichkeit, Spezifizität oder negativem Vorhersagewert in Verbindung mit dem Score erfolgt.
- Verfahren nach Anspruch 1, wobei der genannte, in Schritt (b) festgestellte Score eine Empfindlichkeit von wenigstens 80 % hat.
- Verfahren nach Anspruch 1, wobei der Messschritt durch gewählte Reaktionsüberwachung-Massenspektrometer unter Verwendung einer Verbindung erfolgt, die spezifisch das erkannte Protein oder einen Peptidübergang bindet.
- Verfahren nach Anspruch 10, wobei die Verbindung, die sich spezifisch an das gemessene Protein bindet, ein Antikörper oder ein Aptamer ist.
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Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| HK1203091A1 HK1203091A1 (en) | 2015-10-16 |
| HK1203091B true HK1203091B (en) | 2018-06-15 |
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