HK1168775B - Glucose-regulating polypeptides and methods of making and using same - Google Patents

Claims (15)

1. Acide nucléique isolé comprenant une séquence polynucléotidique qui code pour une protéine de fusion comprenant un peptide régulant le glucose (GP), où la séquence polynucléotidique (i) comprend une séquence qui s'hybride dans des conditions stringentes avec AE864 du Tableau 9 (SEQ ID NO: 243) ou Ex4-AE864 du Tableau 36 (SEQ ID NO: 897), ou le complément de celles-ci, et présente au moins 70 % d'identité de séquence, ou 80 %, ou 90 %, ou 95 %, ou 97 %, ou 98 %, ou 99 % à 100 % d'identité de séquence avec AE864 du Tableau 9 (SEQ ID NO: 243) ou Ex4-AE864 du Tableau 36 (SEQ ID NO: 897), ou le complément de celles-ci, et (ii) code pour une protéine de fusion comprenant (a) l'exendine-4 et possédant une séquence d'acides aminés exhibant au moins 95 % d'identité de séquence avec Ex4-AE864 du Tableau 36 (SEQ ID NO: 896) ou (b) le GLP-1 et possédant une séquence d'acides aminés exhibant au moins 95 % d'identité de séquence avec GLP1-AE864 du Tableau 36 (SEQ ID NO: 986) et qui conserve au moins une partie de l'activité biologique du GP natif.
2. Acide nucléique isolé selon la revendication 1, dans lequel le peptide régulant le glucose (GP) est au moins environ 90 % ou environ 95 % identique à une séquence d'acides aminés sélectionnée parmi l'exendine-4 du Tableau I (SEQ ID NO: 4) ou le hGLP-1 du Tableau 1 (SEQ ID NO: 6) ou le GLP-1 humain du Tableau 1 (SEQ ID NO: 8).
3. Acide nucléique isolé selon la revendication 1 ou la revendication 2, dans lequel ladite protéine de fusion, lorsqu'elle est administrée à un sujet en ayant besoin, permet d'obtenir un effet thérapeutique comparable au GP correspondant qui est dépourvu du XTEN en utilisant une quantité molaire autrement équivalente, même lorsque la protéine de fusion est administrée moins fréquemment à un sujet par comparaison au GP correspondant qui est dépourvu du XTEN.
4. Acide nucléique isolé selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, dans lequel la protéine de fusion comprend une séquence polypeptidique de GLP-1-AE864 du Tableau 36 (SEQ ID NO: 986).
5. Acide nucléique isolé selon la revendication 4, dans lequel la protéine de fusion comprend la séquence polypeptidique de Ex4-AE864 du Tableau 36 (SEQ ID NO: 896).
6. Acide nucléique isolé selon la revendication 1, dans lequel la séquence polynucléotidique comprend Ex4-AE864 du Tableau 36 (SEQ ID NO: 897).
7. Vecteur d'expression comprenant la séquence polynucléotidique selon l'une quelconque des revendications 1 à 6.
8. Protéine de fusion comprenant un GP qui est au moins 90 % ou environ 95 % identique à une séquence d'acides aminés sélectionnée parmi l'exendine-4 du Tableau 1 (SEQ ID NO: 4) ou le hGLP-1 du Tableau 1 (SEQ ID NO: 6) ou le GLP-1 humain du Tableau 1 (SEQ ID NO: 8), dans laquelle ledit GP est lié à un polypeptide recombinant étendu (XTEN) d'au moins environ 200 résidus d'acides aminés destinée à être utilisée dans un procédé de traitement d'une affection liée à un peptide régulant le glucose chez un sujet, le procédé comprenant

   (i) l'expression de la protéine de fusion à partir d'un polynucléotide comprenant une séquence qui s'hybride dans des conditions stringentes avec AE864 du Tableau 9 (SEQ ID NO: 243) ou le complément de celui-ci, et présente au moins 70 % d'identité de séquence, ou 80 %, ou 90 %, ou 95 %, ou 97 %, ou 98 %, ou 99 % à 100 % d'identité de séquence avec AE864 du Tableau 9 (SEQ ID NO: 243),

   (ii) l'administration au sujet d'une quantité thérapeutiquement efficace de la protéine de fusion, dans laquelle le XTEN est caractérisé en ce que :

   (a) la séquence du XTEN comprend au moins environ 200 acides aminés contigus qui exhibent au moins 90 %, ou environ 95 % d'identité de séquence avec la séquence d'acides aminés AE864 du Tableau 5 (SEQ ID NO: 199) ;

   (b) la séquence du XTEN est dépourvue d'un épitope de cellules T prédit lorsqu'elle est analysée par l'algorithme TEPITOPE, où la prédiction de l'algorithme TEPITOPE pour des épitopes au sein de la séquence du XTEN est basée sur un score de -9 ou plus ;

   (c) il possède un score de sous-séquence inférieur à 10 ; et

   (d) la somme des résidus glycine (G), alanine (A), sérine (S), thréonine (T), glutamate (E) et proline (P) constitue plus d'environ 90 % des résidus d'acides aminés totaux du XTEN.
9. Utilisation d'une protéine de fusion comprenant un GP qui est au moins 90 % ou environ 95 % identique à une séquence d'acides aminés sélectionnée parmi l'exendine-4 du Tableau 1 (SEQ ID NO: 4) ou le hGLP-1 du Tableau 1 (SEQ ID NO: 6) ou le GLP-1 humain du Tableau 1 (SEQ ID NO: 8), dans laquelle ledit GP est lié à un polypeptide recombinant étendu (XTEN) d'au moins environ 200 résidus d'acides aminés dans la préparation d'un médicament destiné au traitement d'une affection liée à un peptide régulant le glucose chez un sujet, l'utilisation comprenant

   (i) l'expression de la protéine de fusion à partir d'un polynucléotide comprenant une séquence qui s'hybride dans des conditions stringentes avec AE864 du Tableau 9 (SEQ ID NO: 243) ou le complément de celle-ci, et présente au moins 70 % d'identité de séquence, ou 80 %, ou 90 %, ou 95 %, ou 97 %, ou 98 %, ou 99 % à 100 % d'identité de séquence avec AE864 du Tableau 9 (SEQ ID NO: 243),

   (ii) l'administration au sujet d'une quantité thérapeutiquement efficace de la protéine de fusion, dans laquelle le XTEN est caractérisé en ce que :

   (a) la séquence du XTEN comprend au moins environ 200 acides aminés contigus qui exhibent au moins 90 %, ou environ 95 % d'identité de séquence avec la séquence d'acides aminés AE864 du Tableau 5 (SEQ ID NO: 199) ;

   (b) la séquence du XTEN est dépourvue d'un épitope de cellules T prédit lorsqu'elle est analysée par l'algorithme TEPITOPE, où la prédiction de l'algorithme TEPITOPE pour des épitopes au sein de la séquence du XTEN est basée sur un score de -9 ou plus ;

   (c) il possède un score de sous-séquence inférieur à 10 ; et

   (d) la somme des résidus glycine (G), alanine (A), sérine (S), thréonine (T), glutamate (E) et proline (P) constitue plus d'environ 90 % des résidus d'acides aminés totaux du XTEN.
10. Protéine de fusion pour une utilisation, ou utilisation, selon la revendication 8 ou la revendication 9, dans laquelle le GP est l'exendine-4 du Tableau 1 (SEQ ID NO: 4).
11. Protéine de fusion pour une utilisation, ou utilisation, selon la revendication 9 ou 10, dans laquelle :

    i) ladite administration entraîne une demi-vie terminale plus longue lorsqu'elle est administrée à un sujet par comparaison au peptide régulant le glucose correspondant qui est dépourvu du XTEN lorsqu'il est administré à un sujet à une dose molaire comparable ; et/ou

    ii) ladite protéine de fusion permet d'obtenir un effet thérapeutique comparable à un GP correspondant qui est dépourvu du XTEN en utilisant une quantité molaire autrement équivalente, même lorsque la protéine de fusion est administrée moins fréquemment à un sujet par comparaison au GP correspondant qui est dépourvu du XTEN.
12. Protéine de fusion pour une utilisation, ou utilisation, selon l'une quelconque des revendications 8-11, dans laquelle :

    i) la protéine de fusion est codée par un acide nucléique comprenant une séquence polynucléotidique comprenant une séquence qui s'hybride dans des conditions stringentes avec AE864 du Tableau 9 (SEQ ID NO: 243), ou le complément de celle-ci, et présente au moins 70 % d'identité de séquence, ou 80 %, ou 90 %, ou 95 %, ou 97 %, ou 98 %, ou 99 % à 100 % d'identité de séquence avec la séquence polynucléotidique Ex4-AE864 du Tableau 36 (SEQ ID NO: 897) ; et/ou

    ii) la quantité thérapeutiquement efficace entraîne un gain du temps passé dans une fenêtre thérapeutique établie pour la protéine de fusion d'au moins trois fois par comparaison au GP correspondant qui est dépourvu du XTEN, lorsque la protéine de fusion administrée et le GP correspondant qui est dépourvu du XTEN sont à une dose comparable ; et/ou

    iii) l'affection lié au peptide régulant le glucose est sélectionnée parmi le diabète juvénile, le diabète de type I, le diabète de type II, l'obésité, l'hypoglycémie aiguë, l'hyperglycémie aiguë, l'hypoglycémie nocturne, l'hyperglycémie chronique, des glucagonomes, des troubles sécrétoires des voies aériennes, l'arthrite, l'ostéoporose, une maladie du système nerveux central, la resténose, une maladie neurodégénérative, l'insuffisance rénale, l'insuffisance cardiaque congestive, le syndrome néphrotique, la cirrhose, l'oedème pulmonaire, l'hypertension, un accident vasculaire cérébral, le syndrome du côlon irritable, l'infarctus du myocarde, le syndrome coronarien aigu, des modifications cataboliques post-chirurgicales, le myocarde hibernant, la cardiomyopathie diabétique, une excrétion insuffisante du sodium urinaire, une concentration excessive du potassium urinaire, le syndrome des ovaires polykystiques, la détresse respiratoire, une néphropathie, la dysfonction systolique ventriculaire gauche, la diarrhée, le syndrome de dumping post-opératoire, la polyneuropathie de maladie critique (CIPN), la dyslipidémie, une lésion tissulaire d'un organe provoquée par une reperfusion de la circulation sanguine suite à une ischémie, et le syndrome des facteurs de risque des coronaropathies (CHDRF).
13. Procédé de production d'une protéine de fusion codée par l'acide nucléique selon l'une quelconque des revendications 1 à 6, comprenant :

    (a) la mise à disposition d'une cellule hôte comprenant l'acide nucléique selon la revendication 1 ou 2 ;

    (b) la mise en culture de la cellule hôte dans des conditions permettant l'expression de la protéine de fusion ; et

    (c) la récupération de la protéine de fusion.
14. Procédé selon la revendication 13, dans lequel

    i) la cellule hôte est une cellule procaryote ou eucaryote ; et

    ii) la protéine de fusion isolée est récupérée à partir du cytoplasme de la cellule hôte sous une forme essentiellement soluble.
15. Cellule hôte isolée comprenant l'acide nucléique selon l'une quelconque des revendications 1 à 6, ou le vecteur selon la revendication 7, où la cellule hôte est une cellule hôte procaryote ou eucaryote, où la cellule hôte procaryote est facultativement E. coli.