HK1168379B - Methods for isolating bacteria - Google Patents

Claims (14)

1. Procédé pour identifier ou isoler une bactérie produisant un métabolite choisi parmi les antibiotiques et les agents antifongiques, le procédé comprenant:

   a) la fourniture d'un échantillon comprenant des bactéries non caractérisées;

   b) la soumission de l'échantillon à au moins 3 traitements UV compris entre 0,5 et 400 mJ/cm², les irradiations étant effectuées à un intervalle compris entre 3 et 5 heures;

   c) l'identification ou l'isolement d'une bactérie vivante ou en croissance à partir dudit échantillon traité; et

   d) la sélection d'une bactérie de l'étape c) qui produit le métabolite.
2. Procédé selon la revendication 1, dans lequel l'échantillon est ou provient d'un échantillon environnemental, de préférence obtenu ou dérivé du sol, de l'eau, de sources chaudes, d'un environnement marin, de boue, de bois, de pierre, de mousse, d'extraits végétaux, de matériels biologiques, de lichen, de sédiments, de tourbières, de biofilms, d'effluents industriels, de gaz, de sable, d'huiles, d'eaux usées, de déjections animales ou humaines.
3. Procédé selon la revendication 1 ou 2, dans lequel ledit traitement comprend des irradiations répétées à des intervalles de 4 heures.
4. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, comprenant en outre une étape de sélection d'une bactérie Deinococcus.
5. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel l'étape b) est réalisée dans un milieu de culture solide.
6. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel, dans l'étape c), les colonies sont identifiées ou isolées.
7. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel les étapes c) et d) sont exécutées séquentiellement, dans n'importe quel ordre, ou simultanément.
8. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel l'étape d) comprend l'exposition de bactéries identifiées ou isolées à l'étape c), ou d'un extrait de celles-ci, à une ou plusieurs cellules indicatrices et la sélection d'une bactérie affectant la viabilité, la croissance, le métabolisme, la mobilité, l'expression de l'ARN, l'expression protéique, la sécrétion de protéines ou la production de virus d'au moins une desdites cellules indicatrices.
9. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel le procédé comprend une étape supplémentaire d'isolement ou de purification dudit métabolite.
10. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel le métabolite est un antibiotique.
11. Procédé selon la revendication 1, dans lequel le métabolite est un antibiotique et dans lequel l'étape d) comprend l'exposition de bactéries identifiées ou isolées à l'étape c), ou d'un extrait de celles-ci, à une souche bactérienne de référence et l'identification ou l'isolement d'une bactérie présentant une activité antibiotique.
12. Procédé selon la revendication 11, comprenant en outre une étape d'isolement ou de purification du composé antibiotique produit par ladite bactérie.
13. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, comprenant en outre une étape de sélection d'une bactérie qui est viable ou qui croît dans des conditions de culture sélectionnées, telles que des conditions de milieux, de nutriments, de température, de pH, de salinité, d'oxygénation, de co-culture, de bioréacteurs ou de source de carbone.
14. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, comprenant en outre une étape de modification biologique, génétique et/ou chimique, des bactéries identifiées ou isolées, ou de leur ADN, afin d'améliorer la viabilité, la croissance ou les fonctions de ladite bactérie.