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DE2048659C - Obtaining deoxyribonucleic acid and ribonucleic acid - Google Patents

Obtaining deoxyribonucleic acid and ribonucleic acid

Info

Publication number
DE2048659C
DE2048659C DE2048659C DE 2048659 C DE2048659 C DE 2048659C DE 2048659 C DE2048659 C DE 2048659C
Authority
DE
Germany
Prior art keywords
acid
ribonucleic acid
atcc
fermentation
deoxyribonucleic
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired
Application number
Other languages
German (de)
Inventor
Takeo; Tomita Fusao; Ito Saiga; Machida Suzuki (Japan)
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
KH Neochem Co Ltd
Original Assignee
Kyowa Hakko Kogyo Co Ltd
Publication date

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Description

bekannten Methoden sowohl infolge der beträchtlichen Beispielen näher erläutert:
Verluste an diesen Nucleinsäuren als auch infolge der
known methods explained in more detail both as a result of the considerable examples:
Loss of these nucleic acids as well as a result of the

Ar Wesenheit der Rückstände der zerstörten Zellen 35 B e i s ρ i e 1 1Ar essence of the residues of the destroyed cells 35 B e i s ρ i e 1 1

mehr oder weniger schwierig.more or less difficult.

Der Erfindung liegt die Aufgabe zugrunde, anzu- Arthrobacter simplex ATCC 15799 wurde in einemThe invention is based on the object to Arthrobacter simplex ATCC 15799 was in one

geben, wie Desoxyribonucleinsäure und Ribonuclein- Medium gezüchtet, welches Fleischextrakt (1 °/0), säure wirtschaftlicher und einfacher gewonnen werden Pepton (1 °/0), NaCl (0,5 %) und Glukose (2%) enthielt können. 40 und einen eingestellten pH-Wert von 7,2 (vor dergive how deoxyribonucleic acid and ribonucleic medium grown, which meat extract (1 ° / 0 ), acidic more economical and easier to obtain, peptone (1 ° / 0 ), NaCl (0.5%) and glucose (2%) contained. 40 and a set pH value of 7.2 (before the

Die Erfindung besteht in der Verwendung von durch Sterilisation) hatte. Das Züchten fand zur Gewinnung Züchten von Arthrobacter paraffineus ATCC 15590, einer Impfkultur in 24 Stunden unter Schütteln statt. Arthrobacter simplex ATCC15799, Arthrobacter Die Impfkultur wurde dann verwendet, um ein hydrocarboglutamicus ATCC 15583, Brevibacterium Medium (3,01) zu beimpfen, das Fleischextrakt (l°/0), ketoglutamicum ATCC 15587, Micrococcus ureae 45 Pepton (l°/0), NaCl (0,5 °/0) und Glukose (10 °/o) ent-ATCC 21288, Corynebacterium hydrocarboclastus hielt und ein eingestelltes pH von 7,2 (vor der Sterilisa-ATCC 15592, Pseudomonas fluorescens ATCC 948, tion) aufwies. Es wurden eine 5-1-üärflasche und ein Pseudomonas aeruginosa ATCC 15246, Aspergillus Volumenverhältnis von 10°/0 verwendet. Die Züchorycae ATCC 7252 oder Candida lipolitica ATCC 8861 tung wurde in 30 Stunden bei 300C unter Rühren in hierfür üblichen Nährmedien enthaltenden Fer- 50 (400 UpM) und Belüften (1 l/Min.) durchgeführt,
mentationsflüssigkeiten zur Gewinnung von Desoxy- Das Medium wurde mit Ammoniakwasser auf ein
The invention consists in the use of sterilization). The cultivation was carried out with shaking in order to obtain Arthrobacter paraffineus ATCC 15590, an inoculum culture, in 24 hours. Arthrobacter simplex ATCC15799, Arthrobacter The inoculum was then used to inoculate a hydrocarboglutamicus ATCC 15583, Brevibacterium Medium (3.01), the meat extract (l ° / 0 ), ketoglutamicum ATCC 15587, Micrococcus ureae 45 peptone (l ° / 0 ) , NaCl (0.5 ° / 0 ) and glucose (10%) ent-ATCC 21288, Corynebacterium hydrocarboclastus and had an adjusted pH of 7.2 (before the Sterilization-ATCC 15592, Pseudomonas fluorescens ATCC 948, tion) . A 5 liter bottle and a Pseudomonas aeruginosa ATCC 15246, Aspergillus volume ratio of 10 ° / 0 were used. The Züchorycae ATCC 7252 or Candida lipolitica ATCC 8861 tung was dissolved in 30 hours at 30 0 C with stirring in customary for this purpose nutrient media containing FER 50 (400 rpm) and aeration carried out (1 l / min.),
mentation liquids for the production of deoxy- The medium was diluted with ammonia water

ribonucleinsäure und Ribonucleinsäure. — Die oben- pH von 6,5 bis 7,5 eingestellt. Nach Beendigung der genannten Mikroorganismen sind in der »American Züchtung war die Glukose fast verbraucht.
Type Culture Collection« hinterlegt und für die öffent- Zu 11 der Fermentationsflüssigkeit, die nach Ent-
ribonucleic acid and ribonucleic acid. - The above- pH adjusted from 6.5 to 7.5. After the abovementioned microorganisms have ceased to exist in the »American breed, the glucose was almost used up.
Type Culture Collection «and for the public to 11 of the fermentation liquid, which is

lichkeit zugänglich. 55 fernung der Mikroorganismenzellen aus den Fermen-accessibility. 55 removal of the microorganism cells from the fermentation

Die durch die Erfindung erreichten Vorteile be- tationsmedien erhalten worden war, wurden etwa stehen darin, daß die Desoxyribonucleinsäure und 500 ml Phenol zugefügt, welches durch eine Natrium-Ribonucleinsäure aus den genannten Fermentations- chlorid (0,15 Mol) und Natriumeitrat (0,01 Mol) entlösungen nach Entfernung der Mikroorganismenzellen haltende Lösung gesättigt war. Die behandelte Lösung sehr leicht mit Hilfe bekannter Verfahren isoliert wer- 60 wurde geschüttelt und zentrifugiert. Danach wurde den können. Im Gegensatz zu den bekannten Ver- die anfallende obere Schicht gesammelt. Nach zweifahren werden keine Zellen zerstört. Darüber hinaus maliger Wiederholung wurden die oberen Schichten lassen sich die genannten Fermentationsflüssigkeiten vereinigt, wobei man eine wäßrige Lösung erhielt, auch billig herstellen, da für die Züchtung der ge- welcher 1 Äquivalent 95°/oiges Äthanol (oder Menannten Mikroorganismen preiswerte Kohlenwasser- 65 thanol) zugefügt wurde.The advantages achieved by the invention were obtained in the fact that the deoxyribonucleic acid and 500 ml of phenol were added, which was obtained by sodium ribonucleic acid from the fermentation chloride (0.15 mol) and sodium citrate (0.15 mol) mentioned. 01 mol) was saturated after removing the microorganism cell holding solution. The treated solution was very easily isolated using known methods and was shaken and centrifuged. After that it was able to. In contrast to the known methods, the accumulating upper layer is collected. After two drives, no cells are destroyed. In addition, repetitions were the top layers can be the fermentation liquids mentioned combined to give an aqueous solution, also manufactured at low cost, since low cost for culturing the overall wherein 1 equivalent of 95 ° / o sodium ethanol (or Menannten microorganisms hydrocarbons 65 ethanol) was added.

stoffe oder Kohlehydrate als Rohmaterialien für das Die erhaltenen faserförmigen Niederschläge wurdensubstances or carbohydrates as raw materials for the fibrous precipitates obtained were

Nährmedium eingesetzt werden können. Die Gewin- gewonnen und ergaben Roh-Desoxyribonucleinsäuren. nung der Desoxyribonucleinsäure und Ribonuclein- Diese wurden gereinigt, indem man sie zweimal derNutrient medium can be used. The profits won and yielded crude deoxyribonucleic acids. tion of deoxyribonucleic acid and ribonucleic acid- These have been purified by treating them twice

Ribonuclease-Behandlung und einer ähnlichen Phenol-Behandlung unterwarf. Man erhielt 0,7 g gereinigte Desoxyribonucleinsäure. Es wurde gefunden, daß das Molekulargewicht dieses Präparates größer als 5 · 10* war, wenn es mittels der Gradient-Saccharose-Zentrifugierungs-Dichte-Methode unter Verwendung von Desoxyribonucleinsäure von »Phagen« als Standard (modifizierte Methode von J. M a r m u r: J. MoL Biol. 3, S. 208,1961) bestimmt wurde.Ribonuclease treatment and similar phenol treatment. 0.7 g of purified was obtained Deoxyribonucleic acid. It has been found that the molecular weight of this preparation is greater than 5 x 10 * was when it was using the gradient sucrose centrifugation density method using deoxyribonucleic acid from "phages" as a standard (modified method by J. M a r m u r: J. MoL Biol. 3, pp. 208, 1961).

Nach Entfernung der faserartigen Niederschläge wurde der Fermentationsflüssigkeit 1 Äquivalent 95%iges Äthanol zugefügt, und die anfallenden Niederschläge wurden gesammelt und vereinigt, sie ergaben die Roh-Ribonucleinsäure. Diese wurde der Desoxyribonucleinsäure-Behandlung und der Phenol-Behandlung unterworfen. Es fielen 2,0 g gereinigte Ribonucleinsäure an. Um lösliche Ribonucleinsäure zu erhalten, wurde dieser Natriumchlorid (1 Mol) zugefügt und gerührt. Das Überstehende wurde gesammelt, und es wurde die_ zweifache Menge seines Volumens an ao 95%igem Äthanol zugesetzt. Die anfallenden Niederschläge wurden in Natriumchlorid (0,1 Mol) gelöst und weiter mit Isopropanol gefällt. Man erhielt 0,1 g lösliche Ribonucleinsäure.After removing the fibrous precipitates, the fermentation liquor became 1 equivalent 95% ethanol added, and the resulting precipitates were collected and combined to give the crude ribonucleic acid. This became the deoxyribonucleic acid treatment and subjected to phenol treatment. It fell 2.0 g of purified ribonucleic acid on. Sodium chloride (1 mol) was added to this to obtain soluble ribonucleic acid and touched. The supernatant was collected and twice its volume of ao 95% ethanol added. The resulting precipitates were dissolved in sodium chloride (0.1 mol) and further precipitated with isopropanol. 0.1 g of soluble ribonucleic acid was obtained.

»5 Beispiel 2 »5 Example 2

Micrococcus vreae ATCC 21288 wurde in einem Medium gezüchtet, welches Fleischextrakt (1%), Pepton (1%), NaCl (0,5%) und Sorbit (2%) enthielt und ein eingestelltes pH von 7.2 (vor der Sterilisation) aufwies. Die Züchtung wurde zwecks Erhalt einer Impfkultur innerhalb von 24 Stunden unter Schütteln ausgeführt. Man impfte die Impfkultur auf ein Medium (3,01), welches Fleischextrakt (1%), Pepton (1%), NaCl (0,5%) und Sorbit (10%) enthielt und ein eingestelltes pH von 7,2 (vor dem Sterilisieren) aufwies. Man verwendete eine 5-1-Gärflasche mit einem Volumenverhältnis von 10%. Die Züchtung wurde unter Rühren (400 UpM) und Belüften (1 l/Min.) in 48 Stunden bei 300C durchgeführt. Das Medium wurde mit Ammoniakwasser auf ein pH von 6,5 bis 7,5 eingestellt.Micrococcus vreae ATCC 21288 was grown in a medium containing meat extract (1%), peptone (1%), NaCl (0.5%) and sorbitol (2%) and had an adjusted pH of 7.2 (before sterilization). Cultivation was carried out with shaking within 24 hours to obtain an inoculum. The inoculum was inoculated on a medium (3.01) which contained meat extract (1%), peptone (1%), NaCl (0.5%) and sorbitol (10%) and an adjusted pH of 7.2 (pre sterilization). A 5-1 fermentation bottle with a volume ratio of 10% was used. The cultivation was carried out with stirring (400 rpm) and aeration (1 l / min.) At 30 ° C. for 48 hours. The medium was adjusted to pH 6.5 to 7.5 with ammonia water.

Die Fermentationsflüssigkeit wurde ähnlich der im Beispiel 1 beschriebenen Weise behandelt, und man erhielt aus 11 Fermentationslösung 0,5 g gereinigte Desoxyribonucleinsäure und 0,5 g rohe Ribonucleinsäure. The fermentation liquor was treated similarly to the manner described in Example 1, and one obtained 0.5 g of purified deoxyribonucleic acid and 0.5 g of crude ribonucleic acid from 11 fermentation solution.

Beispiel 3 .Example 3.

Pseudomonas fluorescens ATCC 948 wurde in 24 Stunden unter Schütteln in einem Impfmedium, ähnlich wie im Beispiel 2 beschrieben, gezüchtet. Man beimpfte dann damit ein Medium (3,01), welches KH8PO4 (0,2%),
Na,HPO4(0,2%),
MgSO4-7H4O (0,1%),
MnSO4-4H4O (0,002%),
FeSO4 -7H2O (0,2%),
ZnSO4-7 H4O (0,001%),
(NHJ4SO4 (0,5 %)v
CuCl1 · 4H4O (0,0003 %),
Pseudomonas fluorescens ATCC 948 was grown in an inoculation medium similar to that described in Example 2 for 24 hours with shaking. A medium (3.01) containing KH 8 PO 4 (0.2%),
Na, HPO 4 (0.2%),
MgSO 4 -7H 4 O (0.1%),
MnSO 4 -4H 4 O (0.002%),
FeSO 4 -7H 2 O (0.2%),
ZnSO 4 -7 H 4 O (0.001%),
(NHJ 4 SO 4 (0.5%) v
CuCl 1 · 4H 4 O (0.0003%),

Maisquellwasser (0,11V0), Hefeextrakt (0,1%) und a-Paraffin (ein Gemisch aus C18, C13, C14 und C15), —10%-v/v—enthielt, in einer 5-1-Gärflasche bei einem Volumenverhältnis von 10%.Corn steep liquor (0.1 1 V 0 ), yeast extract (0.1%) and α-paraffin (a mixture of C 18 , C 13 , C 14 and C 15 ), -10% -v / v -contained in one 5-1 fermentation bottle with a volume ratio of 10%.

Die Züchtung wurde ähnlich der in den Beispielen 1 und 2 beschriebenen Weise 72 Stunden bei 300C unter Rühren (600 UpM) und Belüften (3 l/Min.) durchgeführt. Das Medium wurde mit Ammoniakwasser auf ein pH von 7,0 bis 7,5 eingestellt.Cultivation was carried out in a similar way to the manner described in Examples 1 and 2 for 72 hours at 30 ° C. with stirring (600 rpm) and aeration (3 l / min.). The medium was adjusted to pH 7.0 to 7.5 with ammonia water.

Als die Züchtung abgeschlossen war, war das η-Paraffin vollständig verbraucht. Die Mikroorganismenzellen wurden aus dem Fermentationsmedium entfernt, und die Fermentationsflüssigkeit wurde ähnlich der im Beispiel 1 beschriebenen Weise behandelt. Man erhielt aus 11 Fermentationsflüssigkeit 1,0 g gereinigte Desoxyribonucleinsäure und 1,8 g rohe Ribonucleinsäure.When the cultivation was completed, the η-paraffin was completely consumed. The microorganism cells were removed from the fermentation medium and the fermentation liquor became similar the manner described in Example 1 treated. 1.0 g was obtained from 11 fermentation liquors purified deoxyribonucleic acid and 1.8 g of crude ribonucleic acid.

Beispiel 4Example 4

Aspergillus orycae ATCC 7252 wurde 96 Stunden bei 25° C ähnlich der im Beispiel 3 beschriebenen Weise gezüchtet unter Verwendung einer ähnlich der im Beispiel 3 beschriebenen Impfkultur und eines ähnlichen Mediums für die Fermentation.Aspergillus orycae ATCC 7252 was similar to that described in Example 3 at 25 ° C for 96 hours Wise grown using an inoculum similar to that described in Example 3 and one similar medium for fermentation.

Die Fermentationsflüssigkeit wurde ähnlich der im Be:spiel 1 beschriebenen Weise behandelt und ergab 0,4 g gereinigte Desoxyribonur'sinsäure und 0,7 g rohe Ribonucleinsäure.The fermentation liquid was similar to that in Be: treated in the manner described game 1 to give 0.4 g of purified Desoxyribonur'sinsäure and 0.7 g of crude ribonucleic acid.

Beispiel 5Example 5

Candida lipolitica ATCC 8861 wurde ähnlich der im Beispiel 3 beschriebenen Weise und unter Verwendung einer ähnlich der im Beispiel 3 beschriebenen Impfkultur gezüchtet.Candida lipolitica ATCC 8861 was prepared in a manner similar to that described in Example 3 and using a seed culture similar to that described in Example 3 was grown.

Das Medium für die Fermantation wurde ähnlich der im Beispiel 3 beschriebenen Weise hergestellt, wobei eine handelsübliche, nichtionische oberflächenaktive Substanz zugesetzt wurde.The medium for the Fermantation was prepared similarly to the manner described in Example 3, a commercial nonionic surfactant was added.

Die Züchtung wurde 96 Stunden bei 300C ausgeführt; die anfallende Fermentationsflüssigkeit wurde ähnlich der im Beispiel 1 beschriebenen Weise behandelt. Man erhielt aus 11 Fermentationsflüssigkeit 0,2 g einer gereinigten Desoxyribonucleinsäure und 0,7 g Roh-Ribonucleinsäure.The cultivation was carried out for 96 hours at 30 ° C .; the fermentation liquid obtained was treated similarly to the manner described in Example 1. 0.2 g of a purified deoxyribonucleic acid and 0.7 g of crude ribonucleic acid were obtained from 11 fermentation liquors.

Claims (1)

säure aus den genannten Fermentationslösungen ist Patentanspruch: kommerziell sehr gut durchführbar.acid from the fermentation solutions mentioned is patent claim: it is commercially feasible. Zur Herstellung der FennentationsflüssigkeitenFor the production of the separation fluids Verwendung von durch Züchten von Arthro- wird ein Nährmedium verwendet, welches einen bacter paraffineus ATCC15590, Arthrobacter 5 Kohlenwasserstcf oder ein Kohlehydrat als Hauptsimplex ATCC15799, Arthrobacter hydrocarbo- kohlenstoffquelle und eine Stickstoffquelle enthält, glutamicus ATCC15583, Brevibacterium keto- Als Kohlenwasserstoff können η-Paraffin oder n-Parafglutamicum ATCC15587, Micrococcus ureae fin enthaltende Kohlenwasserstoff-Fraktionen emge-ATCC 21288, Corynebacterium hydrocarboclastus setzt werden. Vorzugsweise sollen die n-Paraffine 10 bis ATCC15592, Pseudomonasfluorescens ATCC948, io 22, insbesondere 12 bis 18 C-Atome enthalten. Es ist Pseudomonas aeruginosa ATCC15246, Asper- jedoch auch möglich, andere Kohlenstoffquellen emgfllus orycae ATCC 7252 oder Candida lipolitica zusetzen, wie jede Art von durch den jeweils verwen-ATCC 8861 in hierfür üblichen Nährmedien er- deten Mikroorganismus assimilierbaren Kohlenwasserhaltenen Fennentationsflüssigkeiten zur Gewin- stoffen und Kohlehydraten, z. B. Glukose, Sorbit nung von Desoxyribonucleinsäure und Ribonu- 15 u. dgl., organischen Säuren oder Alkoholen, vorzugscleinsäure. weise C4- bis Cgo-Säuren oder Alkoholen u. dgl. AlsUsing by cultivating Arthro, a nutrient medium is used which contains a bacter paraffineus ATCC15590, Arthrobacter 5 hydrocarbon or a carbohydrate as the main simplex ATCC15799, Arthrobacter hydrocarbo carbon source and a nitrogen source, glutamicus ATCC15583, Brevibacterium keto-As a hydrocarbon or η can n-Parafglutamicum ATCC15587, Micrococcus ureae fin containing hydrocarbon fractions emge-ATCC 21288, Corynebacterium hydrocarboclastus. The n-paraffins should preferably contain 10 to ATCC15592, Pseudomonas fluorescens ATCC948, 10 22, in particular 12 to 18, carbon atoms. Pseudomonas aeruginosa ATCC15246, Asper- but also possible to add other carbon sources emgfllus orycae ATCC 7252 or Candida lipolitica, such as any type of microorganism, assimilable hydrocarbonaceous substances, and hydrocarbonaceous substances that are used in each case by the microorganism used for this purpose Carbohydrates, e.g. B. glucose, sorbitol, desoxyribonucleic acid and ribonucleic acid and the like, organic acids or alcohols, preferably small acid. wise C 4 - to Cgo acids or alcohols and the like Sticketoffquellen können sowohl anorganische als auch organische Stickstoffverbindungen eingesetzt werden. Auch andere anorganische Salze und Wuchs-Both inorganic and organic nitrogen compounds can be used as sources of nitrogen will. Other inorganic salts and growth ao stoffe werden dem Nährmedium zugesetzt. Das Nährmedium wird sterilisiert und anschließend mit einem der genannten Mikroorganismen beimpft. Man züchtet unter aeroben Bedingungen im allgemeinen bei 20 bis 6O0C, vorzugsweise bei 30 bis 42° C. Während derao substances are added to the nutrient medium. The nutrient medium is sterilized and then inoculated with one of the microorganisms mentioned. It is cultured under aerobic conditions in general at 20 to 6O 0 C, preferably at 30 to 42 ° C. During the Die Erfindung beschäftigt sich mit der Gewinnung 95 Züchtung wird zur Einstel'ung auf ein pH von 4 bis von Desoxyribonucleinsäute und Ribonucleinsäure. 10, vorzugsweise 6 bis 9, Harnstofflösung, Ammoniak-The invention is concerned with the production 95 breeding is used to adjust to a pH of 4 to of deoxyribonucleic acids and ribonucleic acid. 10, preferably 6 to 9, urea solution, ammonia Desoxyribonucleinsäure und Ribonucleinsäure sind wasser, Ammoniak oder Ammoniumcarbonatlösung bisher durch Extraktion aus Zellen von Mikroorganis- zugeführt. Die Fermentation ist im allgemeinen nach men — sowohl von höheren Tieren als auch von etwa 7 Tagen beendet. Es ist jedoch vorzuziehen, die höheren Pflanzen — erhalten worden, welche in ver- 30 Fermentation so lange fortzusetzen, bis die Bestimmung schic iener Weise zerstört worden sind. Jedoch sind der genannten Nucleinsäuren ein Maximum anzeigt,
die Extraktions- und Rückgewinnungsverfahren dieser Im folgenden wird die Erfindung an Hand von
Deoxyribonucleic acid and ribonucleic acid are water, ammonia or ammonium carbonate solution so far supplied by extraction from cells of microorganisms. The fermentation is generally over after men - both of higher animals and of about 7 days. It is preferable, however, to preserve the higher plants, which continue to ferment in various ways until the destiny has been destroyed in various ways. However, the nucleic acids mentioned indicate a maximum
the extraction and recovery processes of these. In the following, the invention is illustrated with reference to FIG

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