DE102009021614A1 - A method of treating a population of target and residual particles suspended in liquid droplets and apparatus for carrying out this method - Google Patents
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Abstract
Verfahren zum Behandeln einer Population von in Flüssigkeitströpfchen suspendierten, sich voneinander unterscheidenden, insbesondere biologischen Objekten aus Ziel- und Restpartikeln unter Verwendung mindestens eines Substrates mit einer digitalen mikrofluidischen Schaltung, die eine digitale mikrofluidische Tröpfchen-Bewegung ermöglicht, wobei Flüssigkeitströpfchen geeigneter Zusammensetzung aus Ziel- und Restpartikeln generiert werden, sowie jedes Flüssigkeitströpfchen in einer ersten Analyseposition auf das Vorhandensein mindestens eines Ziel- oder Restpartikels untersucht wird, wobei Flüssigkeitströpfchen ohne Zielpartikel nachfolgend über eine Restpartikelsenke von dem Substrat entfernt werden und Flüssigkeitströpfchen mit mindestens einem Zielpartikel oder einer vorgegebenen Mindestzahl an Zielpartikeln mittels des Substrates einer zweiten Behandlungsstufe zugeführt werden.A method of treating a population of target droplets and residual particles suspended in liquid droplets, differing in particular, from one another using at least one substrate having a digital microfluidic circuit enabling digital microfluidic droplet movement, liquid droplets of suitable target and pellet composition Residual particles are generated, and each liquid droplet is examined in a first analysis position for the presence of at least one target or residual particle, wherein liquid droplets without target particles are subsequently removed via a residual particle sink from the substrate and liquid droplets with at least one target particle or a predetermined minimum number of target particles by means of Substrates are fed to a second treatment stage.
Description
GEBIET DER ERFINDUNGFIELD OF THE INVENTION
Die Erfindung betrifft ein Verfahren mit den Merkmalen des Oberbegriffs von Anspruch 1 und eine entsprechende Vorrichtung gemäß Anspruch 12. Demnach ist vorgesehen, eine Population von in Flüssigkeitströpfchen suspendierten, sich von einander unterscheidenden, insbesondere biologischen Objekten aus Ziel- und Restpartikeln unter Verwendung mindestens eines Substrates mit einer digitalen mikrofluidischen Schaltung, die eine digitale mikrofluidische Tröpfchenbewegungen ermöglicht, zu behandeln.The The invention relates to a method having the features of the preamble of claim 1 and a corresponding device according to claim 12. Accordingly, it is envisaged a population of in liquid droplets suspended, differing from each other, in particular biological objects from target and residual particles using at least one substrate with a digital microfluidic Circuit showing a digital microfluidic droplet motion allows to treat.
TECHNOLOGISCHER HINTERGRUNDTECHNOLOGICAL BACKGROUND
Eine wesentliche Zielsetzung zum Behandeln von in Flüssigkeiten suspendierten Populationen sich voneinander unterscheidender, insbesondere biologischer Objek te aus Ziel- und Restpartikeln ist das Sortieren einer solchen Population in solche Objekte die erwünscht sind oder gesucht werden, um diese weiter zu verwenden (Zielpartikel) und solche, deren Weiterverwendung nicht im Fokus stehen (Restpartikel). Zu diesem Zweck werden seit fast 40 Jahren so genannte Fluss-Zytometer verwendet, die eine tröpfchenbasierte Sortierung mittels eines fadenförmigen vertikal gerichteten, kontrollierten Flüssigkeitsstromes nach dem so genannten Jet-in-air-Prinzip vornehmen. Der nach unten gerichtete Flüssigkeitsfaden wird mittels geeigneter Schwingungserreger in eine Perlenschnur kleinster Flüssigkeitströpfchen zerlegt nachdem der Flüssigkeitsfaden mit optischen Methoden daraufhin analysiert wurde, an welchen Stellen er ein interessierendes biologisches Objekt, wie eine Zelle enthält. Nachfolgend werden die Flüssigkeitströpfchen durch ein elektrisches Feld in die ein oder andere Richtung abgelenkt dies nach der Maßgabe, ob ein Flüssigkeitströpfchen eine gesuchte Zelle enthält oder nicht enthält. Auf diese Weise können gesuchte Zellen von nicht gesuchten Zellen getrennt gesammelt werden. Dieses Verfahren setzt voraus, dass nur eine äußerst geringe Zahl von Zellen, vorzugsweise nur eine Zelle in einem Tröpfchen vorliegt. Demzufolge müssen alle in der Flüssigkeit vorhandenen Zellen die Analyseposition einzeln durchlaufen. Dieses auch als FACS (Fluorecence-Activated Cell Sorting) bezeichnete Verfahren gestattet es z. B. menschliche Stammzellen aus Blutplasma zu gewinnen. Auf diese Weise konnten durch so genanntes Hochgeschwindigkeitssortieren in kommerziellen FACS-Geräten über 40.000 Zellen je Sekunde sortiert werden. Dabei fallen z. B. etwa 6.000 Stammzellen je Stunde an. Höheren Gewinnungsraten und Sortiergeschwindigkeiten sind bei dieser Methode physikalische Grenzen gesetzt, die – im Falle der Sortierung von Zellen – bei etwa 100.000 Zellen pro Sekunde vermutet werden. Außerdem lässt sich systembedingt massive Aerosol-Bildung nicht vermeiden.A essential objective for treating in liquids suspended populations differ from each other, in particular Biological objects from target and residual particles is sorting such a population in such objects as desired are or are searched for to use them (target particles) and those whose further use is not the focus (residual particles). For this purpose, so-called flow cytometers have been used for almost 40 years used a droplet-based sorting by means of a thread-shaped vertically directed, controlled Liquid flow according to the so-called jet-in-air principle make. The downwardly directed liquid thread becomes a string of pearls by means of suitable vibration exciters smallest liquid droplets decomposed after the liquid thread with optical methods then was analyzed in which places he is a biological of interest Object as containing a cell. Below are the Liquid droplets through an electric field deflected in one way or another this as per the requirement, whether a liquid droplet is a sought-after cell contains or does not contain. That way you can sought cells are collected separately from unwanted cells. This Procedure assumes that only a very small Number of cells, preferably only one cell in a droplet is present. Consequently, all in the liquid existing cells go through the analysis position individually. This also known as FACS (Fluorecence-Activated Cell Sorting) method allows it for. B. human stem cells from blood plasma to win. In this way, so-called high-speed sorting could be done in commercial FACS devices over 40,000 cells sorted per second. This fall z. B. about 6,000 stem cells per hour. Higher recovery rates and sorting speeds In this method physical limits are set which - in the Case of cell sorting - about 100,000 cells be suspected per second. In addition, can be Due to the system, massive aerosol formation can not be avoided.
Zur
Erzielung deutlich höherer Zellsortiergeschwindigkeiten
wurde daher vorgeschlagen (
Eine
alternative Zellsortierungsmethode zur Durchflusszytometrie beschreibt
die Veröffentlichung von
DARSTELLUNG DER ERFINDUNGPRESENTATION OF THE INVENTION
Davon ausgehend liegt der Erfindung die Aufgabe zugrunde, mittels eines gattungsgemäßen Verfahrens Populationen von in Flüssigkeitströpfchen suspendierten, sich von einander unterscheidenden, insbesondere biologischen Objekten aus Ziel- und Restpartikeln durch vergleichsweise wenige Prozessschritte zu behandeln. Dabei wird unter „Behandeln” im einfachsten Fall eine Sortierung in Ziel- und Restpartikel verstanden. Zur Lösung dieser Aufgabe wird ein Verfahren mit den Merkmalen des Anspruchs 1 und eine Vorrichtung mit den Merkmalen des Anspruchs 12 vorgeschlagen.From that Based on the invention, the object is based, by means of a generic method populations of in Liquid droplets suspended from differing, in particular biological objects from target and residual particles due to comparatively few process steps to treat. This is under "Treat" in the simplest Case a sorting in target and residual particles understood. To the solution This object is achieved by a method having the features of the claim 1 and a device with the features of claim 12 proposed.
Demnach ist hinsichtlich eines gattungsgemäßen Verfahrens vorgesehen, zunächst Flüssigkeitströpfchen geeigneter Zusammensetzung aus Ziel- und Restpartikeln zu generieren. Jedes generierte Flüssigkeitströpfchen wird in einer ersten Analyseposition auf das Vorhandensein mindestens eines Ziel- oder Restpartikels untersucht. Flüssigkeitströpfchen ohne Zielpartikel werden nachfolgend über eine Restpartikelsenke von dem Substrat entfernt. Flüssigkeitströpfchen mit mindestens einem Zielpartikel werden mittels des Substrats einer zweiten Behandlungsstufe zugeführt.Accordingly, it is provided with respect to a generic method, first liquid generate droplets of suitable composition of target and residual particles. Each generated liquid droplet is examined in a first analysis position for the presence of at least one target or residual particle. Liquid droplets without target particles are subsequently removed from the substrate via a residual particle sink. Liquid droplets with at least one target particle are fed by means of the substrate to a second treatment stage.
Zwar
können Tröpfchenbewegungen in gewissem Umfang
durch Schwerkrafteinfluss erreicht werden, doch ist vorzugsweise
eine digitale mikrofluidische Tröpfchenbewegung (DMF) in
der Weise vorgesehen, dass Potentiale zwischen Elektroden in einer
Reihe entlang der sich die Tröpfchen auf einer Oberfläche
des Substrates oder in einer Schicht des Substrates bewegen können
sollen, vorgesehen, wobei der Antrieb der Tröpfchen unter
anderem nach der Methode des Elektrowetting und/oder der Dielektroforese
erfolgen kann. Beim Elektrowetting werden Laplace Kräfte
durch nicht symmetrische Kontaktwinkel generiert. Bei der Dielektroforese
werden anziehende oder abstoßende Kräfte durch
Polarisationseffekte in unregelmäßigen elektrischen
Feldern hervorgerufen. Mittels DMF-Schaltkreisen ist es möglich, Flüssigkeitströpfchen
zu bilden, zu transportieren, zu unterteilen und zu verbinden. Diese
Hauptoperationen werden in der Veröffentlichung von
Durch die Erfindung wird es möglich, auf eine große Vielzahl von Analyseschritten zu verzichten, weil Flüssigkeitströpfchen, die eine Population von biologischen Objekten enthalten, von denen aber keines als Ziel- respektive Restpartikel betrachtet wird, sofort über die Restpartikelsenke samt der Flüssigkeit des betroffenen Flüssigkeitströpfchen aus dem Prozess ausgesondert werden. Anders als bei der Durchflusszytometrie, bei der jedes in der Flüssigkeit vorhandene biologische Ob jekt analysiert wird, also entsprechend viele Analyseschritte erforderlich sind, wird durch die Erfindung eine ganz erhebliche Verminderung der Analyseschritte erreicht. Dieser Vorteil wird ebenso gegenüber der oben beschriebenen Kaskadierungsmethode erzielt. Nur die mit Zielpartikeln befrachteten Flüssigkeitströpfchen werden einer weiteren Behandlungsstufe zugeführt. Dabei können Populationsgrößen von 2 bis 10.000 biologischen Objekte und ggf. auch noch mehr sowie auch nicht biologische Objekte in dem einzelnen Flüssigkeitströpfchen vorliegen.By The invention makes it possible on a large To dispense with a large number of analysis steps because liquid droplets, which contain a population of biological objects, of which but none is considered as target respectively remaining particles, immediately over the residual particle sink together with the fluid of the affected Liquid droplets separated from the process become. Unlike flow cytometry, where each in the biological object is analyzed is, so many analysis steps are required is by the invention a very significant reduction of the analysis steps reached. This advantage is also opposite to the above achieved cascading method described. Only those with target particles loaded liquid droplets become another Treatment stage supplied. This can be population sizes from 2 to 10,000 biological objects and possibly even more as well also non-biological objects in the single liquid droplet available.
Unter „biologischen Objekten”, für die das erfindungsgemäße Verfahren zum Einsatz kommt, zählen ganze Zellverbände, einzelne hochentwickelte Zellen, Zellbestandteile, Chromosomen und auch mikrobiologische Objekte, wie z. B. Viren. Die Erfindung ist aber nicht auf die Behandlung von mikrobiologischen Objekten beschränkt, sondern auch für nicht biologische Populationen von Ziel- und Restpartikeln anwendbar. Unter „Behandeln” von Populationen biologischer Objekte wird neben dem Trennen auch das Durchführen chemischer Reaktionen, das Färben, das Waschen, das Ausbleichen, das Hybridisieren und andere Behandlungsprozeduren an biologischen Objekten verstanden. Unter „Population” wird eine Mehrzahl von einander sich unterscheidenden Objekten verstanden.Under "biological Objects ", for the inventive Whole cell associations, single highly developed cells, cell components, chromosomes and also microbiological objects, such. B. viruses. The invention is but not limited to the treatment of microbiological objects, but also for non-biological populations of target and residual particles applicable. Under "Treat" by Populations of biological objects is next to the separating also the Performing chemical reactions, dyeing, washing, bleaching, hybridizing and other treatment procedures understood on biological objects. Under "Population" becomes a Understood a plurality of mutually different objects.
Es
ist nun auf verschiedene Weise möglich, die Erfindung auszuführen.
Gemäß einer ersten Ausführungsform werden
die in einer Flüssigkeit suspendierten biologischen Objekte,
wie z. B. gemischte Zellverbände, in einem Vorratsbehältnis
oder in einem Zwischenbehältnis so in Bewegung gehalten oder
aufbewahrt, dass sie nicht sedimentieren. Das Behältnis
weist an mindestens einer Seite eine Öffnung, vorzugsweise
eine Mehrzahl von voneinander beabstandeten Öffnungen oder
Ports auf, deren Größe und Form so gewählt
ist, dass an diesen Stellen aus dem Vorrat einzelne Flüssigkeitströpfchen
geeigneter Größe aus dem Gesamtvolumen abgezogen oder
herausgelöst werden können, wie es insbesondere
in der
In der Analyseposition wird festgestellt, ob das jeweilige Flüssigkeitströpfchen mindestens ein Zielpartikel oder eine minimale Zielpartikelkonzentration enthält. Bejahendenfalls wird dieses Flüssigkeitströpfchen entlang einer der Tröpfchen-Bewegungsbahnen auf dem Substrat in eine Weitergabeposition an einem Pfadende (Übergabepunkt) navigiert, an dem das Tröpfchen an eine weitere Behandlungsstufe abgegeben wird. Hierbei kann es sich um einen Zwischenbehälter handeln. Tröpfchen, die keine oder zu wenige Zielpartikel enthalten, werden in einen anderen Bewegungspfad gelenkt, als die Tröpfchen mit Zielpartikeln. An dem Ende des Pfades für nicht interessierende Tröpfchen wird das Tröpfchen an eine Tröpfchensenke übergeben. Hierbei kann es sich um einen Tröpfchenauffangbehälter handeln.In the analysis position it is determined whether the respective liquid droplet contains at least one target particle or a minimum target particle concentration. If so, this liquid droplet is navigated along one of the droplet trajectories on the substrate to a transfer position at a path end (transfer point) where the droplet is delivered to another treatment stage. This may be an intermediate container. Droplets that contain no or too few target particles are directed into a different path than the droplets of target particles. At the end of the path for non-interest droplets, the droplet is transferred to a droplet sink. This may be a droplet collector.
Wegen der Parallelisierung der Sortiervorgänge auf jedem Mikrochip kommt es bei zweidimensionaler Anordnung der die Tröpfchenbewegung hervorrufenden Elektroden zu Kreuzungen von Wegstrecken. Um hier Kollisionen von Ziel- und Restpartikeln zu vermeiden oder zumindest weitgehend auszuschließen, werden geeignete Sortieralgorithmen verwendet, die die Elektroden steuern. Wenn, wie bevorzugt, die Anzahl von biologischen Objekten in einem Flüssigkeitströpfchen derart gewählt wird, dass die Wahrscheinlichkeit des Vorhandenseins eines Zielpartikels in dem Tröpfchen sehr gering ist, können somit sehr viele Tröpfchen als Ganzes verworfen werden. Dies führt zum Einen zu einer Verringerung des Sortieraufwandes. Zum Anderen werden dadurch die Häufigkeiten potentieller Tröpfchenkollisionen an sich kreuzenden Bewegungspfaden gering gehalten und der Steuerungsaufwand für die Tröpfchenbewegung somit verringert.Because of the parallelization of sorting operations on each microchip it comes in two-dimensional arrangement of the droplet movement causing electrodes to intersections of routes. Around Here Avoid collisions of target and residual particles or at least are largely excluded, suitable sorting algorithms used, which control the electrodes. If, as preferred, the Number of biological objects in a liquid droplet is chosen such that the probability of existence of a target particle in which droplets are very small thus many droplets are discarded as a whole. This leads to a reduction in sorting costs. On the other hand, the frequencies become more potential Droplet collisions on intersecting motion paths kept low and the control effort for the droplet movement thus reduced.
In den Analysepositionen können beliebige Analysen durchgeführt werden, wie z. B. mittels Fotodetektoren, die markierte Objekte optisch, z. B. mittels Lichtstreuung und/oder Fluoreszenz (Fluoreszenz-Korrelationsspetroskopie, FCS) erkennen. Es können auch Widerstandsmessungen zur Partikelgrößenbestimmung, z. B. nach dem Coulter-Prinzip (der Coulter-Counter detektiert Änderungen in der elektrischen Leitfähigkeit einer durch eine Blende beobachteten, mikrobiologische Partikel enthaltenden Flüssigkeit) vorgenommen werden. Die Sortierung kann auch durch magnetische Aktivierung erfolgen.In Analysis analyzes can be performed in any way be such. B. by means of photodetectors, the marked objects optically, z. B. by light scattering and / or fluorescence (fluorescence correlation spectroscopy, Recognize FCS). It can also resistance measurements to Particle size determination, z. B. according to the Coulter principle (the Coulter counter detects changes in the electrical Conductivity of a microbiological observed through an aperture Particle-containing liquid) are made. The sorting can also be done by magnetic activation.
Die Architektur der DMF-Chips zur Behandlung der biologischen Objekte wird vorzugsweise modular ausgestaltet. Dies ermöglicht nicht nur einen hohen Grad an Parallelisierung der generierten Tröpfchen, sondern gestattet auch die Übergabe von Tröpfchen zwischen den Pfadenden benachbarter Module, so dass weitere Behandlungsschritte sich unmittelbar anschließen können. Einzelnen Modulen können unterschiedliche Aufgaben zugeordnet werden, etwa weil auf den vorangehenden Modulen gewisse Behandlungsschritte nicht oder nicht mehr Platz finden. Ebenso ist es möglich, Module zu verwenden, die dreidimensionale Bewegungspfade ermöglichen, so dass Flüssigkeitströpfchen in unterschiedlichen, insbesondere parallelen Ebenen behandelt und auch von einer Ebene in eine andere Ebene transportiert werden können.The Architecture of DMF chips for the treatment of biological objects is preferably designed modular. this makes possible not only a high degree of parallelization of the generated droplets, but also allows the transfer of droplets between the path ends of adjacent modules, allowing further treatment steps can connect directly. each Modules can be assigned different tasks, because because of the preceding modules certain treatment steps not or no longer find space. It is also possible Use modules that allow three-dimensional motion paths, so that liquid droplets in different, especially parallel levels and also from a level can be transported to another level.
Bei einer anderen Ausführungsform der Erfindung wird die Behandlung einer Population von in Flüssigkeitströpfchen suspendierten biologischen Objekten aus Ziel- und Restpartikeln stufenweise derart vorgenommen, dass Flüssigkeitströpfchen mit nicht interessierenden Populationen nach der Detektion auf direktem Wege und ohne Kreuzung mit Bewegungspfaden für interessierende Flüssigkeitströpfchen der Restpartikelsenke zugeführt werden. Hierbei kann eine einzige Restpartikelsenke für mehrere Tröpfchenports und entsprechend für mehrere Bewegungspfade auf dem Mikrochip verwendet werden. Vorzugsweise auf demselben Mikrochip findet danach eine Teilung der interessierenden Flüssigkeitströpfchen statt. Die Teiltröpfchen werden nachfolgend einzeln analysiert und nachfolgend in einer weiteren Restpartikelsenke gesammelt oder abgeführt, wenn sie nicht interessieren und der weiteren Behandlung zugeführt, wenn sie interessieren, also z. B. mindestens ein Zielpartikel enthalten. Die Tröpfchenteilung wird vorzugsweise auf demselben Mikrochip durchgeführt, auf dem sich auch die erste Restpartikelsenke befindet. Grundsätzlich ist es aber auch möglich, die interessierenden Flüssigkeitströpfchen zunächst an einen weiteren Mikrochip zu übergeben und danach erst weiter zu behandeln.at Another embodiment of the invention is the treatment a population of in liquid droplets suspended biological objects from target and residual particles gradually made such that liquid droplets with non-interest populations after detection on direct Paths and no intersection with paths of movement for those interested Liquid droplets of the residual particle sink supplied become. This can be a single residual particle sink for several dropletports and accordingly for several Motion paths are used on the microchip. Preferably on the same microchip will then find a division of the interested Liquid droplets take place. The partial droplets are analyzed individually below and subsequently in another Residual particle sink collected or discharged, if not Interested and fed to further treatment, though they are interested, so z. B. contain at least one target particle. The droplet separation is preferably carried out on the same microchip, on which the first residual particle sink is located. in principle but it is also possible, the liquid droplets of interest first to transfer to another microchip and then only continue to treat.
Die Teiltröpfchen können an sich auch auf dem Mikrochip, auf dem die Tröpfchenteilung stattgefunden hat, weiterbehandelt werden, d. h. insbesondere in einer zweiten Analyseposition auf das Vorliegen von Zielpartikeln hin analysiert werden. Vorzugsweise findet dieser zweite Analyseschritt auf veränderten Tröpfchen-Bewegungspfaden statt, nämlich solchen, bei denen die Elektroden und ggf. deren Abstände der geringeren Tröpfchengröße entsprechend kleiner sind. Das kann grundsätzlich auf demselben Mikrochip stattfinden, auf dem eine Tröpfchenteilung bereits stattgefunden hat. Bevorzugt wird für die Weiterbehandlung allerdings ein anderes Mikrochipmodul verwendet, dass die kleineren Elektroden aufweist. Durch diese Verkleinerung der Elektrodengröße ist eine (überlagerte) Kaskadierung erreichbar, insbesondere eine Verdopplung der Bewegungspfade von einem Modul zum nächsten. Auf diese Weise kann eine Vereinzelung von Zielpartikeln schrittweise erfolgen.The Partial droplets can also be on the microchip, on which the droplet separation took place, further treated be, d. H. especially in a second analysis position the presence of target particles. Preferably this second analysis step finds on altered droplet motion paths instead, namely those in which the electrodes and possibly their distances the smaller droplet size are correspondingly smaller. This can basically be done on the same microchip take place on which a droplet division already occurred Has. However, it is preferred for the further treatment another microchip module uses the smaller electrodes having. By this reduction of the electrode size a (superimposed) cascading is achievable, in particular a doubling of the movement paths from one module to the next. In this way, a separation of target particles can take place step by step.
Wenn die Tröpfchengröße aufgrund mehrfacher Tröpfchenteilung so gering wird, dass der Tröpfchentransport und/oder die in den Tröpfchen enthaltenden Zielpartikel unter der geringen Flüssigkeitsmenge leiden, können nach einer weiteren Ausführungsform der Erfindung partikelfreie Flüssigkeitströpfchen mit einem Partikelenthaltenden Flüssigkeitströpfchen vereint werden. Hierbei wird unter partikelfreiem Flüssigkeitströpfchen verstanden, dass in diesem Flüssigkeitströpfchen keine den Behandlungsvorgang oder das Behandlungsziel störenden Objekte vorliegen.If the droplet size due to multiple Droplet separation becomes so low that the droplet transport and / or the target particles contained in the droplets can suffer from the small amount of liquid According to a further embodiment of the invention, particle-free Liquid droplets with a particle containing Liquid droplets are combined. in this connection is under particle-free liquid droplets understood that in this liquid droplets no objects interfering with the treatment process or the treatment objective available.
Gemäß einer weiteren Ausführungsform der Erfindung können die Flüssigkeitströpfchen, insbesondere auf dem Mikrochip, gekühlt, aufgeheizt, oder begast werden, um optimale Bedingungen für die die Partikel mit dem Ziel zu schaffen, deren Veränderung oder Absterben während des Sortierens möglichst weitgehend zu vermeiden.According to a further embodiment of the invention, the liquid droplets, in particular on the microchip, cooled, heated, or be fumigated in order to create optimal conditions for the particles with the aim of avoiding their change or death during sorting as much as possible.
Weiter ist es möglich, Ziel- oder Restpartikel enthaltende Flüssigkeitströpfchen entlang einer „Warteschleife” zu bewegen und/oder sie in eine vorangehende Stufe zurück zu führen. So können bei sehr kleinen Probenvolumina mit nur geringer Anzahl an Zielpartikeln Mehrfachuntersuchungen durchgeführt und insbesondere der Verlust solcher Partikel vermieden oder in engen Grenzen gehalten bzw. verhindert werden, dass die Zielobjekte während der Behandlung sich verändern oder absterben.Further it is possible, liquid droplets containing target or residual particles move along a "holding pattern" and / or to bring her back to a previous stage. Thus, at very small sample volumes with only a small Number of target particles multiple studies performed and in particular the loss of such particles avoided or in Narrow limits are kept or prevented, that the target objects change or die during treatment.
Weiterhin kann es von Vorteil sein, die Tröpfchengröße, die Zahl an biologischen Objekten je Tröpfchen und Analyseeinstellungen in einer Vorsortierungsstufe zu definieren. So ist es möglich, anhand der prozentualen Verteilung der in der Gesamtpopulation vorhandenen interessierenden Zellen optimale Werte für die Tröpfchengröße und die Zellzahl/Tröpfchen in für das System vorgegebenen Grenzen definieren. Z. B. wählt man hohe Zellzahl/Tröpfchen bei geringen prozentualen Anteilen an interessierenden Zellen und einer gleichzeitig großen Gesamtpopulation und geringe Zellzahl/Tröpfchen bei hoher Konzentration an interessierenden Zellen.Farther it may be beneficial to measure the droplet size, the number of biological objects per droplet and analysis settings to define in a presorting stage. So it is possible based on the percentage distribution of those present in the total population cells of interest have optimal droplet size values and the cell number / droplets given in for the system Define boundaries. For example, one chooses high cell count / droplets at low percentages of cells of interest and a simultaneously large total population and low Cell count / droplets at high concentration of interest Cells.
Ebenso kann anhand der prozentualen Verteilung bestimmt werden, ab welchem späteren Teilungsschritt Detail-Analysen erfolgen sollen, z. B. ab ca. 10 Zellen/Tröpfchen.As well can be determined by the percentage distribution, from which later division step detailed analyzes are to take place, z. B. from about 10 cells / droplets.
Ferner kann man, insbesondere in der Vorsortierstufe, Sortiermodi wie Reinheit, Tolerierung von Verunreinigungen der Sortierung (z. B. tote Zellen wenn Zellen zwecks Weiterkultivierung sortiert werden oder Zelldebris), Zuordnung der Zellpopulationen und der angestrebten Zellzahlen zu Sammelgefäßen (Mischungen/Serien von gleichen oder ungleichen Zellzahlen) definieren. Je nach Startbeladung der einzelnen Tröpfchen werden diese nun in mehr oder weniger vielen Stufen analysiert, geteilt und vorsortiert. Tröpfchen ohne interessierende Zellen können früh aussortiert und dem Abfall zugeführt werden. Tröpfchen mit mindestens einer interessierenden Zelle können in Richtung Sammelgefäß navigiert werden. Sollte die Analyse, ob z. B. in einem Tröpfchen mindestens eine interessierende Zelle vorhanden ist, zweifelhaft sein, kann das System anhand der Voranalyse entscheiden, ob das Tröpfchen verworfen oder einem weiteren Teilungs- und Analysevorgang zugeführt wird.Further you can, especially in the presorting, sorting modes such as purity, Tolerating contamination of sorting (eg dead cells if cells are sorted for further cultivation or cell debris), Assignment of cell populations and the targeted cell numbers too Collection vessels (mixtures / series of the same or unequal cell numbers). Depending on the starting load of the individual droplets are now in more or less analyzed, divided and presorted droplet without cells of interest can be sorted out early and the waste. With droplets At least one cell of interest may be in the direction Collection vessel to be navigated. Should the analysis, whether z. In a droplet at least one of interest Cell is present, be doubtful, the system can be based on the Preliminary analysis will decide if the droplet is discarded or a further division and analysis process is supplied.
Während des Sortiervorgangs, wenn z. B. wegen zu hoher Zellkonzentration zu oft zweifelhafte Analyse-Ergebnisse vorliegen, können bestimmte Sortierparameter vom System auch selbstlernend weiter optimiert werden. In diesem Fall sollte die Zellzahl bei der ersten Generierung der Tröpfchen niedriger gewählt werden. Sollte bei der Vorsortierung festgestellt werden, dass sich in einem Tröpfchen mehrere Zellen befinden und dass diese zu der gleichen Zielpopulation gehören, kann dieses Tröpfchen ohne weitere Analyse und Teilung dem Ziel-Sammelgefäß zugeführt werden.While the sorting process, if z. B. because of high cell concentration too often dubious analysis results can be present certain sorting parameters from the system also self-learning be optimized. In this case, the cell number should be at the first Generation of droplets can be chosen lower. Should be found in the pre-sorting that is in one Droplets are located in multiple cells and that these are at the belonging to the same target population, this droplet can without further analysis and division fed to the target collection vessel become.
Wenn die Tröpfchen nach einigen Teilungen zu klein werden für die vorgegebenen Elektrodengröße, können diese Tröpfchen mit Tröpfchen ohne Zellen zusammengeführt werden. Wenn die Zellzahl/Tröpfchen in etwa auf Einzelzellniveau liegt, werden die Tröpfchen mit den ermittelten Zellen von Interesse in der Feinsortierstufe den Ziel-Sammelgefäßen zugeführt. Ebenso können Tröpfchen mit Zellen von Interesse direkt von der Feinsortierstufe, unter Umgehung der Sammelgefäße, zu speziellen Modulen navigiert werden.If the droplets become too small after a few divisions the predetermined electrode size, can these droplets are merged with droplets without cells become. When the cell count / droplet is approximately at single cell level lies, the droplets become with the determined cells of interest in fine sorting the target collection vessels fed. Likewise, droplets can Cells of interest directly from the fine sorting stage, bypassing the collection vessels, navigated to special modules become.
Für besondere Anwendungen kann das System mit Zusatzmodulen erweitert werden, wie Warteschleifen, Färben und waschen, Ausbleichen. Die Messung schwacher, spezifischer Fluoreszenz-Signale kann mittels Ausbleichung verbessert werden, indem das beständigere Autofluoreszenzsignal der Zellen ermittelt und von der anfangs ermittelten Summe aus Autofluoreszenz und spezifischer Fluoreszenz subtrahiert wird.For Special applications can be added to the system with additional modules such as holding patterns, dyeing and washing, fading. The measurement of weak, specific fluorescence signals can by means of Bleaching be improved by the more stable Autofluoreszenzsignal the cells and determined from the initially determined Sum subtracted from autofluorescence and specific fluorescence becomes.
Weiterhin sind weitere geeignete Module vorteilhaft, z. B. für Bildanalyse oder darauf aufbauende manuelle Sortierentscheidungen., für Zellassays an Zellpopulationen, Einzelzellen oder Zellkomponenten, für Zell-Fusionierung, für Polymerase-Kettenreaktion (PCR), für Genexpressions-Analyse (BioChip). Diese Module können sowohl bei den Vorsortierstufen als auch bei der Feinsortierung eingesetzt werden.Farther Further suitable modules are advantageous, for. For image analysis or manual sorting decisions based thereon., for Cell assays on cell populations, single cells or cell components, for cell fusion, for polymerase chain reaction (PCR), for gene expression analysis (BioChip). These modules Both in the Vorsortierstufen as well as in the Fine sorting can be used.
Die vorgenannten sowie die beanspruchten und in den Ausführungsbeispielen beschriebenen erfindungsgemäß zu verwendenden Bauteile unterliegen in ihrer Größe, Formgestaltung, Materialauswahl und technischen Konzeption keinen besonderen Ausnahmebedingungen, so dass die in dem Anwendungsgebiet bekannten Auswahlkriterien uneingeschränkt Anwendung finden können.The the aforementioned and the claimed and in the embodiments described to be used according to the invention Components are subject in size, shape design, Material selection and technical conception no special exceptions, so that the selection criteria known in the field of application unrestricted Application can be found.
Weitere Einzelheiten, Merkmale und Vorteile des Gegenstandes der Erfindung ergeben sich aus den Unteransprüchen, sowie aus der nachfolgenden Beschreibung der zugehörigen Zeichnungen, in der – beispielhaft – Ausführungsbeispiele von Sortiervorrichtungen dargestellt ist. Auch einzelne Merkmale der Ansprüche oder der Ausführungsformen können mit anderen Merkmalen anderer Ansprüche und Ausführungsformen kombiniert werden.Further Details, features and advantages of the subject matter of the invention emerge from the dependent claims, as well as from the following description the accompanying drawings, in the - exemplary - embodiments is shown by sorting devices. Also, individual features of Claims or embodiments may be with other features of other claims and embodiments be combined.
KURZBESCHREIBUNG DER FIGURENBRIEF DESCRIPTION OF THE FIGURES
In der Zeichnung zeigenIn show the drawing
DETAILLIERTE BESCHREIBUNG DER AUSFÜHRUNGSBEISPIELEDETAILED DESCRIPTION THE EMBODIMENTS
Gemäß dem
Ausführungsbeispiel nach
Zur
Tröpfchenbewegungen ist vorzugsweise eine digitale mikrofluidische
Tröpfchenbewegung (DMF) in der Weise vorgesehen, dass Potentiale
zwischen Elektroden
Nur die mit Zielpartikeln befrachteten Flüssigkeitströpfchen werden einer weiteren Behandlungsstufe zugeführt. Dabei können Populationsgrößen von 2 bis 10.000 Objekte und ggf. auch noch mehr sowie auch nicht biologische Objekte in dem einzelnen Flüssigkeitströpfchen vorliegen.Just the liquid droplets loaded with target particles are fed to another treatment stage. there can population sizes from 2 to 10,000 Objects and possibly even more as well as non-biological objects present in the single liquid droplet.
Gemäß einer
ersten Ausführungsform werden die in einer Flüssigkeit
suspendierten biologischen Objekte, wie z. B. gemischte Zellverbünde,
in einem Vorratsbehältnis (Behälter
In
den Analysepositionen
Um
Kollisionen von Ziel- und Restpartikeln zu vermeiden oder zumindest
weitgehend auszuschließen, werden geeignete Sortieralgorithmen
verwendet, die die Elektroden
Die
Betriebsweise dieser beispielhaften Anordnung ist die, dass aus
einem großen Reservoir (Behälter
Die nach unten gerichteten Pfeile und Punkte deuten an, dass sich weitere Sortiermodule anschließen können. Die nach rechts weisenden Punkte nebst Pfeil deuten an, dass sich auf demselben Mikrochip weitere Ports und Tröpfchen-Bewegungspfade befinden können, oder sich weitere Sortiermodule dieser Stufe anschließen können, die ihre Zellen enthalten Tröpfchen aus demselben oder einem parallel geschaltetem Reservoir beziehen können, um die Parallelisierung und damit die Sortierleistung erhöhen.The downward arrows and points indicate that more Can connect sorting modules. The right pointing points and arrow indicate that on the same Microchip further ports and droplet motion paths are located can, or join more sorting modules of this level they can contain droplets that contain their cells can refer to the same or a parallel-connected reservoir, to increase the parallelization and thus the sorting performance.
Die
Alternativ
zu den Ausführungsformen nach
Das
Detektionsprinzip wird in
Bei
einer anderen Ausführungsform der Erfindung nach
Der
zweite Analyseschritt findet bei dem dargestellten und insofern
bevorzugten Ausführungsbeispiel nach
Wenn die Tröpfchengröße aufgrund mehrfacher Tröpfchenteilung so gering wird, dass der Tröpfchentransport und/oder die in den Tröpfchen enthaltenden Zielpartikel unter der geringen Flüssigkeitsmenge leiden, können partikelfreie Flüssigkeitströpfchen F0 mit einem partikelenthaltenden Flüssigkeitströpfchen F vereint werden.If the droplet size due to multiple Droplet separation becomes so low that the droplet transport and / or the target particles contained in the droplets can suffer from the small amount of liquid particle-free liquid droplets F0 with a particle-containing liquid droplets F united become.
Die Flüssigkeitströpfchen können, insbesondere auf den Mikrochip, gekühlt, aufgeheizt, oder begast werden, um optimale Bedingungen für die Zielpartikel zu schaffen.The liquid droplets can, in particular on the microchip, cooled, heated, or fumigated to create optimal conditions for the target particles.
Weiter
ist es möglich, Ziel- oder Restpartikel enthaltende Flüssigkeitströpfchen
entlang einer „Warteschleife” zu bewegen oder
sie in eine vorangehende Stufe zurück zuführen.
Letzteres ist für die Feinsortierung auf Mikrochip
Die Architektur der DMF-Chips zur Behandlung der mikrobiologischen Objekte wird vorzugsweise modular ausgestaltet. Dies ermöglicht nicht nur einen hohen Grad an Parallelisierung der generierten Tröpfchen, sondern gestattet auch die Übergabe von Tröpfchen zwischen den Pfadenden benachbarter Module, so dass weitere Behandlungsschritte sich unmittelbar anschließen können. Einzelnen Modulen können unterschiedliche Aufgaben zugeordnet werden, etwa weil auf den vorangehenden Modulen gewisse Behandlungsschritte nicht oder nicht mehr Platz finden. Ebenso ist es möglich, Module zu verwenden, die dreidimensionale Bewegungspfade ermöglichen, so dass Flüssigkeitströpfchen in unterschiedlichen, insbesondere parallelen Ebenen behandelt und auch von einer Ebene in eine andere Ebene transportiert werden können.The Architecture of DMF chips for the treatment of microbiological objects is preferably designed modular. this makes possible not only a high degree of parallelization of the generated droplets, but also allows the transfer of droplets between the path ends of adjacent modules, allowing further treatment steps can connect directly. each Modules can be assigned different tasks, because because of the preceding modules certain treatment steps not or no longer find space. It is also possible Use modules that allow three-dimensional motion paths, so that liquid droplets in different, especially parallel levels and also from a level can be transported to another level.
- 22
- Behältercontainer
- 3A, B, ...3A, B, ...
- Portsports
- 44
- Zwischenbehälterintermediate container
- 1111
- Tröpfchen-QuellenDroplet sources
- 2020
- DMF-MikrochipDMF microchip
- 20A20A
- DMF-MikrochipDMF microchip
- 20B20B
- DMF-MikrochipDMF microchip
- 20C20C
- DMF-MikrochipDMF microchip
- 2121
- Tröpfchen-Bewegungs-EbeneDroplet motion level
- 2222
- Elektrodenelectrodes
- 22'22 '
- Elektrodenelectrodes
- 22''22 ''
- Elektrodenelectrodes
- 22A22A
- Tröpfchen-BewegungspfadeDroplet motion paths
- 22B22B
- Tröpfchen-BewegungspfadeDroplet motion paths
- 22C22C
- Tröpfchen-BewegungspfadeDroplet motion paths
- 22D22D
- Tröpfchen-BewegungspfadeDroplet motion paths
- 22E22E
- Tröpfchen-BewegungspfadeDroplet motion paths
- 22F22F
- Tröpfchen-BewegungspfadeDroplet motion paths
- 22G22G
- Tröpfchen-BewegungspfadeDroplet motion paths
- 22H22H
- Tröpfchen-BewegungspfadeDroplet motion paths
- 2323
- erstes Pfadendefirst path end
- 2424
- zweites Pfadendesecond path end
- 2525
- drittes Pfadendethird path end
- 30A30A
- erste Analysepositionfirst analysis position
- 30B30B
- zweite Analysepositionsecond analysis position
- 30C30C
- dritte Analysepositionthird analysis position
- 32A32A
- Tröpfchen-TeilungspositionDroplet dividing position
- 4040
- Tröpfchensenkedroplets sink
- 40'40 '
- Tröpfchensenkedroplets sink
- 40''40 ''
- Tröpfchensenkedroplets sink
- 40'''40 '' '
- Tröpfchensenkedroplets sink
- 4141
- Tröpfchen-AuffangbehälterDroplet collector
- 5050
- Tröpfchen-WeitergabepositionDroplets hand-over position
- 50'50 '
- Tröpfchen-WeitergabepositionDroplets hand-over position
- 50''50 ''
- Tröpfchen-WeitergabepositionDroplets hand-over position
- 50'''50 '' '
- Tröpfchen-WeitergabepositionDroplets hand-over position
- 6060
- Steuerungselektronikcontrol electronics
- AA
- Zielpartikeltarget particles
- BB
- Restpartikelresidual particles
- FF
- FlüssigkeitströfchenFlüssigkeitströfchen
- F1F1
- Teiltröpfchensubdroplets
- F2F2
- Teiltröpfchensubdroplets
- F0F0
- partikelfreie Flüssigkeitströpfchenparticle-free liquid droplets
ZITATE ENTHALTEN IN DER BESCHREIBUNGQUOTES INCLUDE IN THE DESCRIPTION
Diese Liste der vom Anmelder aufgeführten Dokumente wurde automatisiert erzeugt und ist ausschließlich zur besseren Information des Lesers aufgenommen. Die Liste ist nicht Bestandteil der deutschen Patent- bzw. Gebrauchsmusteranmeldung. Das DPMA übernimmt keinerlei Haftung für etwaige Fehler oder Auslassungen.This list The documents listed by the applicant have been automated generated and is solely for better information recorded by the reader. The list is not part of the German Patent or utility model application. The DPMA takes over no liability for any errors or omissions.
Zitierte PatentliteraturCited patent literature
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Zitierte Nicht-PatentliteraturCited non-patent literature
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- - Sung Kwon Cho et al „CREATING, TRANSPORTING, CUTTING, AND MERGING LIQUID DROPLETS BY ELECTROWETTING BASED ACTUATION FOR DIGITAL MICROFLUIDIC CIRCUITS” im Journal of Microelectrochemical Systems, Vol. 12, No. 1, Februar 2003, Seiten 70–80 [0007] Sung Kwon Cho et al "CREATING, TRANSPORTING, CUTTING, AND MERGING LIQUID DROPLETS BY ELECTROWETTING BASED ACTUATION FOR DIGITAL MICROFLUIDIC CIRCUITS" in Journal of Microelectrochemical Systems, Vol. 1, February 2003, pages 70-80 [0007]
- - Druckschrift „CREATING, TRANSPORTING, CUTTING, AND MERGING LIQUID DROPLETS BY ELECTROWETTING BASED ACTUATION FOR DIGITAL MICROFLUIDIC CIRCUITS (a. a. O.)” [0010] - "CREATING, TRANSPORTING, CUTTING, AND MERGING LIQUID DROPLETS BY ELECTROWETTING BASED ACTUATION FOR DIGITAL MICROFLUIDIC CIRCUITS (supra)" [0010]
Claims (15)
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