DE102008040838A1 - Dermal tissue state detecting method for e.g. human body, involves morphologically classifying spectrally classified results, determining evaluation results from morphologically classified results, and outputting evaluation results - Google Patents
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Abstract
Description
Die Erfindung betrifft ein Verfahren und eine Anordnung zur Erfassung und nachfolgender Auswertung von Hautgewebe, insbesondere zur Feststellung von Hautveränderungen.The The invention relates to a method and an arrangement for detection and subsequent evaluation of skin tissue, in particular for detection of skin changes.
Mit steigender Lebenserwartung und gleichzeitig zunehmender Belastung durch chemische und/oder physikalische Umwelteinflüsse steigt die Anzahl von Erkrankungen von menschlichem oder auch tierischem Körpergewebe. Ein typisches Beispiel dafür sind maligne, d. h. bösartige, Veränderungen der Haut, zu denen auch Melanome gehören.With increasing life expectancy and at the same time increasing burden by chemical and / or physical environmental influences the number of diseases of human or even animal body tissue increases. A typical example of this is malignant, d. H. malicious, Changes in the skin, which include melanoma.
Für die effektive Behandlung derartiger Gewebeveränderungen ist es von hoher Wichtigkeit, die Veränderungen bereits im Frühstadium zu diagnostizieren. Dies erfolgt nach dem derzeitigen, etablierten Stand der Technik durch eine rein visuelle Betrachtung von Verdachtsstellen durch einen qualifizierten Facharzt. Wenn sich dabei ein Gewebebereich als verdächtig erweist, wird Gewebe entnommen, als Mikroskopieprobe präpariert und, wiederum durch einen qualifizierten, erfahrenen Facharzt, histologisch analysiert. Dieser Prozess ist sowohl zeitaufwändig und teuer als auch für den Patienten belastend, da invasiv Gewebeproben entnommen werden. Der begutachtende Facharzt ist dabei gezwungen, einen Kompromiss zwischen der eine weitgehend sichere Diagnose ermöglichenden, aber teuren und das untersuchte Individuum belastenden Entnahme eines Gewebepräparates und der Gefahr, eine bösartige Veränderung von Gewebe zu übersehen, einzugehen. Dazu kommt, dass die visuelle in-vivo Diagnose stark von subjektiven Eindrücken abhängig ist, wie beispielsweise dem Farbeindruck, der nicht nur von Person zu Person, sondern auch von Tag zu Tag schwanken kann.For the effective treatment of such tissue changes it is of high importance, the changes already to diagnose at an early stage. This is done after the current, established state of the art by a purely visual Consideration of suspected sites by a qualified specialist. If a tissue area proves to be suspicious Tissue removed, prepared as a microscopy sample and, again by a qualified, experienced specialist, histologically analyzed. This process is both time consuming and expensive as well as stressful for the patient, being invasive Tissue samples are taken. The assessing specialist is present forced a compromise between the one largely secure Diagnose enabling, but expensive and the examined Individual burdening removal of a tissue preparation and the danger of a vicious change of To overlook tissue to enter. On top of that, the visual In vivo diagnosis strongly dependent on subjective impressions is, such as the color impression, not only of person to person, but also can vary from day to day.
Somit wäre ein technisches Gerät bzw. Verfahren, welches autark und rasch eine Erfassung von Daten von Gewebe in-vivo, d. h. am lebenden menschlichen oder tierischen Körper und ohne Entnahme einer Probe, sowie eine Aufbereitung der erfassten Daten außerhalb des Körpers und unabhängig von der Präsenz des Körpers und gegebenenfalls eine Auswertung der aufbereiteten Daten nach objektiven Kriterien vornehmen kann, von großem praktischem Interesse. Mit Hilfe derartiger Verfahren und Geräte wäre es möglich, beispielsweise auch bei niedergelassenen praktischen Ärzten bzw. Tierärzten, welche unter Umständen nicht die notwendigen Spezialkenntnisse und Erfahrung zur visuellen Gewebediagnostik besitzen, Reihenuntersuchungen z. B. im Rahmen routinemäßiger Vorsorgeuntersuchungen vorzunehmen. Patienten mit (potentiellen) Gewebeveränderungen könnten dann gezielt zu einem Spezialisten zur Diagnose weitergeleitet werden. Somit wäre ein effizientes „Screening" mit geringem Aufwand möglich, wodurch auch (noch) unauffällige Gewebeveränderungen in Frühstadien einer Erkrankung mit deutlich höherer Wahrscheinlichkeit als nach dem derzeitigen System erkannt und entsprechend behandelt werden können.Consequently would be a technical device or process, which autarkic and rapid acquisition of data from tissue in vivo, d. H. at the living human or animal body and without taking a sample, and a preparation of the recorded Data outside the body and independent from the presence of the body and, where appropriate an evaluation of the processed data according to objective criteria of great practical interest. With help such methods and devices it would be possible for example, also in private practitioners or veterinarians, which may not the necessary specialist knowledge and experience for visual tissue diagnostics own, screening for. B. in the context of routine To carry out check-ups. Patients with (potential) Tissue changes could then be targeted to one Specialists are forwarded for diagnosis. Thus would be an efficient "screening" with little effort possible, which also (still) inconspicuous tissue changes in early stages of a disease with significantly higher Probability as detected by the current system and accordingly can be treated.
Anforderungen an ein derartiges Verfahren bzw. Gerät wären, neben der Einhaltung allgemeiner medizinischer Vorschriften, beispielsweise bezüglich der Strahlenbelastung des Patienten etc. oder der Einhaltung von Hygienevorschriften, eine rasche, unkomplizierte Datenerfassung des Gewebes am lebenden, vorzugsweise wachen Individuum. Dazu ist es wünschenswert, die Messdaten innerhalb von vorzugsweise weniger als 60 s aufzunehmen, um Verfälschungen durch Bewegungen des Patienten zu verhindern. Eine nachfolgende Aufbereitung der erfassten Messdaten und ihre Auswertung, für die die Präsenz des Patienten nicht erforderlich ist, muss dabei in der Lage sein, (potentielle) Gewebeveränderungen mit möglichst hoher Sicherheit als solche zu erkennen (Vermeidung falsch-negativer Auswertungen). Gleichzeitig darf, auch aus Akzeptanzgründen, die Anzahl falsch-positiver Auswertungen nicht zu hoch sein. Zudem wäre es vorteilhaft, wenn das Messgerät nicht notwendigerweise durch einen Arzt bedient werden muss, sondern ähnlich Röntgen-Geräten, beispielsweise auch ein entsprechend geschulter medizinisch-technischer Assistent die Messung durchführen kann. Der Arzt kann sich dadurch auf die eigentliche Diagnose konzentrieren, wobei die automatisiert generierten, objektivierbaren Auswertungsergebnisse der erfindungsgemäßen Messung, Aufbereitung und Auswertung eine wesentliche Unterstützung darstellen.conditions to such a method or device would be, in addition to compliance with general medical regulations, for example concerning the radiation exposure of the patient etc. or compliance with health regulations, a quick, straightforward Data acquisition of the tissue on the living, preferably awake individual. For this it is desirable to have the measurement data within preferably to absorb less than 60 s, to distortions to prevent movement of the patient. A subsequent one Preparation of the recorded measurement data and their evaluation, for which does not require the patient's presence while being able to (potential) tissue changes with the highest possible degree of safety as such (avoidance false-negative evaluations). At the same time, also for reasons of acceptance, the number of false-positive evaluations should not be too high. moreover It would be beneficial if the meter was not necessarily be operated by a doctor, but similar X-ray devices, for example, a corresponding trained medical technician can perform the measurement. The doctor can thereby focus on the actual diagnosis, whereby the automatically generated, objectifiable evaluation results the measurement, processing and Evaluation constitute a substantial support.
Aus
der Literatur sind eine Reihe entsprechender Ansätze bekannt.
Die klassische Methode zur automatisierten Auswertung von Gewebeveränderungen
ist die Aufnahme mittels Kamera („Imaging"), gefolgt von einer
computergestützten Klassifikation nach allgemeinen Auswertungsregeln.
Dies kann für bösartige Hautveränderungen,
wie Melanome, beispielsweise durch eine elektronische Bildverarbeitung
nach der so genannten ABCD-Regel und/oder weiterer morphologischer
Parameter erfolgen, wie beispielsweise aus
Ergänzend zur computergestützten Klassifikation von RGB-Farbbildern ist die Anwendung derartiger morphologischer Klassifikations- und Auswertemodelle auch auf Bilder bei anderen Wellenlängen bekannt. Die Literatur erwähnt Ansätze, bei denen in-vivo Imaging von Gewebeveränderungen bei unterschiedlichsten Wellenlängen, vom Ultravioletten (UV) bis ins nahe Infrarot (NIR), durchgeführt wurde. Zusätzlich oder alternativ werden auch Fluoreszenzbilder ausgewertet. In allen Fällen werden Bilder bei bestimmten, mehr oder minder charakteristischen Wellenlängen aufgenommen, computergestützt ausgewertet und daraus Auswertungen über Art und/oder Umfang der Gewebeveränderung abgeleitet.additional for the computer-aided classification of RGB color images is the application of such morphological classification and Evaluation models also on images at other wavelengths known. The literature mentions approaches in which In vivo imaging of tissue changes in a wide variety of Wavelengths, from the ultraviolet (UV) to the near infrared (NIR). Additionally or alternatively also evaluated fluorescence images. In all cases will be Images at certain, more or less characteristic wavelengths recorded, computer-aided evaluated and from it evaluations over Type and / or extent of tissue change derived.
Problematisch ist dabei, dass bei Beleuchtung bei nur einer bzw. einigen wenigen Wellenlängen die Klassifikationsgenauigkeit, sowohl falsch-positive als auch falsch-negative Auswertungen betreffend, tendenziell unzureichend ist.Problematic is that when lighting with only one or a few Wavelengths the classification accuracy, both false-positive as well as false-negative evaluations tend to be insufficient is.
Als
Verbesserung hiezu wird in einer Reihe von Veröffentlichungen
(
Eine
grundlegend andere Herangehensweise beruht auf spektraler Klassifikation,
d. h. der Auswertung der spektralen Eigenschaften von Geweben. Diese
Methode beruht darauf, dass sich die spektralen Eigenschaften eines
Gewebes bei Veränderungen der Gewebehistologie in der Regel
signifikant ändern. Dies kann mit einer Farbänderung,
aber auch mit geänderten Absorptions-, Remissions- und/oder
Fluoreszenzcharakteristika im Ultravioletten und/oder (nahen) Infrarot
verbunden sein. Auch hierzu gibt es eine Reihe von vorbekannten
Publikationen, z. B.
Eine derartige Bewertung erfolgt auf Basis der Messung der spektralen Charakteristika und deren Vergleich, zumeist unter Verwendung statistischer Auswerteverfahren, mit bekannten Spektren gutartigen bzw. bösartigen Gewebes. Problematisch dabei ist, dass Gewebe in der Regel nicht homogen ist und sich gesundes Gewebe mit gutartig und/oder bösartig veränderten Gewebebereichen abwechselt. Dies führt, insbesondere im Frühstadium einer Veränderung, bei klassischen Punktmessungen oft zu Problemen bei der Bewertung, da innerhalb des erfassten Bereich eine geringe Anzahl an (bösartigen) veränderten Gewebebereichen einer Vielzahl gutartiger Gewebebereiche gegenüber steht. Für eine erfolgreiche Erkennung einer bösartigen Veränderung wäre es erforderlich, die Untersuchung mit sehr hoher örtlicher Auflösung durchzuführen, was mit Punktmesssonden schon aus zeitlichen Gründen an lebenden Objekten, d. h. Patienten, nicht praktikabel ist.A Such evaluation is based on the measurement of the spectral Characteristics and their comparison, mostly using statistical Evaluation method, with known spectra benign or malignant Tissue. The problem with this is that tissue usually does not is homogeneous and healthy tissue with benign and / or malignant changed tissue areas alternates. This leads to, especially in the early stages of a change, in classical point measurements often problems in the evaluation, there is a small number of (malicious) within the detected area altered tissue areas of a variety of benign tissue areas opposite. For a successful detection it would be a vicious change required, the investigation with very high local Resolution perform what with point probes even for temporal reasons on living objects, d. H. Patients, is not practical.
Alternativ
zum Versuch, Spektralcharakteristika bestimmten Veränderungen
der Gewebe zuzuweisen, wird in einer Reihe von Publikationen vorgeschlagen,
gezielt einzelne Substanzen in einem Gewebe zu erfassen und deren
Verteilung zu bestimmen. Ein derartiger Ansatz ist beispielsweise
aus der
All diesen Methoden gemein ist, dass die Anforderungen insbesondere bezüglich der Richtigkeit der Gewebebewertung zumeist nur eingeschränkt erfüllt werden. Bei enger Wahl der Bewertungsparameter werden undeutliche Gewebeveränderungen, wie sie für Frühstadien typisch sind, nur sehr unzuverlässig erkannt. Bei Wahl „weicherer" Parameter steigt zwar der Anteil richtig erkannter Gewebeveränderung, der Anteil an fälschlicherweise als bösartig klassifizierten Bereichen erreicht aber gleichzeitig rasch unzumutbare Maße. Zudem sind viele der bekannten Modelle nur sehr eingeschränkt auf Menschen beispielsweise einer anderen Hautfarbe übertragbar. Dies trifft insbesondere auf Bewertungsmodelle zu, die gezielt die Verteilung von Hautfarbstoffen, wie Melanin, auswerten. Insgesamt existiert somit keine wirklich und vollständig zufriedenstellende Lösung für die umfassende, flexibel einsetzbare und zuverlässige automatisierte in-vivo Bewertung von biologischen Geweben.Alles Common to these methods is that the requirements in particular for the correctness of the tissue assessment mostly only be met restricted. With a narrow choice of Evaluation parameters become indistinct tissue changes, as they are typical for early stages, only very unreliably recognized. When "softer" parameter is selected although the proportion of correctly recognized tissue change increases, the proportion of erroneously classified as malignant At the same time, areas quickly reach unacceptable levels. In addition, many of the known models are very limited applicable to people of a different skin color, for example. This applies in particular to valuation models that specifically target the Evaluation of skin colorants, such as melanin. All in all Thus, there is no really and completely satisfactory solution for the comprehensive, flexible and reliable automated in vivo evaluation of biological tissues.
Es ist demnach Aufgabe der Erfindung, ein Verfahren bzw. eine Anordnung bereitzustellen, das/die die eingangs gestellten Anforderungen erfüllt und die Nachteile des Standes der Technik überwindet oder zumindest lindert.It is therefore an object of the invention to provide a method or an arrangement that / the meets the requirements initially set and overcomes or at least alleviates the disadvantages of the prior art.
Die Aufgabe wird gelöst von einem Verfahren mit den kennzeichnenden Merkmalen des Anspruchs 1 sowie durch eine Anordnung mit den Merkmalen des Anspruchs 16.The Task is solved by a method with the characterizing Features of claim 1 and by an arrangement with the features of claim 16.
Erfindungsgemäß ist dabei vorgesehen, dass das Verfahren zur Status-Erfassung von Hautgewebe die folgenden Verfahrensschritte umfasst: in-vivo Erfassen von Rohbilddaten einer zu untersuchenden Gewebepartie; außerhalb des Körpers und unabhängig von der Präsenz des Körpers: spektrales Vorverarbeiten der Rohbilddaten, spektrales Klassifizieren der vorverarbeiteten Rohbilddaten, morphologisches Klassifizieren des spektralen Klassifikationsergebnisses, Ermitteln eines Auswertungsergebnisses aus der Klassifizierung, und Ausgeben des Auswertungsergebnisses an eine Benutzerschnittstelle.According to the invention provided that the method for status detection of skin tissue the the following method steps comprises: in-vivo acquisition of raw image data a tissue part to be examined; outside the body and regardless of the presence of the body: spectral preprocessing of the raw image data, spectral classification preprocessed raw image data, morphological classification the spectral classification result, determining an evaluation result from the classification, and outputting the evaluation result to a user interface.
Dadurch ist es insbesondere möglich, sowohl den spektralen als auch den morphologischen Informationsgehalt der aufgenommenen räumlich und spektral aufgelösten Messdaten koordiniert auszuwerten und somit signifikant verbesserte Richtigkeiten der Auswertung zu erreichen. Dadurch ist das erfindungsgemäße Verfahren nicht an bestimmte Gewebetypen und/oder spektral gut erfassbare Substanzen, wie beispielsweise Melanin, gebunden, sondern kann flexibel an bestimmte Anforderungen und auch unterschiedliche Gewebetypen angepasst werden.Thereby In particular, it is possible to use both the spectral and the spectral also the morphological information content of the recorded spatial and evaluated spectrally resolved measurement data coordinated and thus significantly improved correctness of the evaluation to reach. This is the process of the invention not to specific tissue types and / or spectrally well detectable Substances, such as melanin, bound but can be flexible to specific requirements and also different tissue types be adjusted.
Weitere Vorteile und vorteilhafte Weiterbildungen der Erfindung sind in den Unteransprüchen angegeben.Further Advantages and advantageous developments of the invention are in specified in the dependent claims.
Insbesondere ist von Vorteil, dass die Richtigkeit der Vorhersage einer Beurteilung signifikant verbessert werden kann, indem der zu untersuchende Gewebebereich zunächst mit optischer Strahlung in mindestens einem der Bereiche des Sichtbaren, des Ultravioletten und/oder des nahen Infrarots beleuchtet und die remittierte, d. h. (diffus) reflektierte und/oder durch Fluoreszenzeffekte emittierte Strahlung orts- und spektral aufgelöst erfasst wird. Diese Daten werden in Folge zunächst für jeden einzelnen Bildpunkt gemäß ihrer Spektralinformation klassifiziert, d. h. einer bestimmten (Gewebe-)Klasse zugewiesen. Auf das daraus resultierende Klassifikationsbild wird, vorzugsweise nach Durchführung eines Schrittes zur Bereinigung des Bildes von Artefakten, eine morphologische Klassifikation angewandt.Especially is beneficial to the accuracy of the prediction of a judgment can be significantly improved by the tissue area to be examined first with optical radiation in at least one of Areas of the visible, ultraviolet and / or near infrared lit and the remitted, d. H. (diffused) reflected and / or radiation emitted by fluorescence effects resolved spatially and spectrally is detected. This data will be used first for every single pixel according to their spectral information classified, d. H. assigned to a specific (tissue) class. The resulting classification image is, preferably after performing a step to clean up the image of artifacts, a morphological classification applied.
Die Datenauswertung kann wahlweise zur Auswertung räumlich und spektral aufgelöster Messdaten der von einem Gewebebereich diffus reflektierten Strahlung und/oder von emittierter Fluoreszenzstrahlung verwendet werden. Gleichfalls kann diese Vorgangsweise sowohl zur Auswertung kontinuierlicher Spektraldaten innerhalb eines oder mehrerer optischer Wellenlängenbereiche oder zur Auswertung diskreter Spektraldaten bei mehreren, typischerweise 5 bis 15 unterschiedlichen Wellenlängen aus einem oder mehreren Wellenlängenbereichen, insbesondere dem sichtbaren Licht, dem UV und/oder dem nahen Infrarot, verwendet werden.The Data analysis can optionally be spatially evaluated and spectrally resolved data from a tissue region diffused reflected radiation and / or used by emitted fluorescence radiation become. Likewise, this procedure can be used both for evaluation continuous spectral data within one or more optical Wavelength ranges or for the evaluation of discrete spectral data at several, typically 5 to 15 different wavelengths from one or more wavelength ranges, in particular the visible light, the UV and / or the near infrared become.
Vorzugsweise wird beim in-vivo Erfassen der Rohdaten die zu untersuchenden Gewebepartie von einer oder mehreren optischen Strahlungsquellen mit dem erforderlichen Wellenlängenbereich angepasster Strahlungscharakteristik beleuchtet, die von dem betrachteten Gewebebereich remittierte Strahlung über eine Optik und eine Schlitzblende in einen bildgebenden Spektrographen ausgeleitet, die remittierte Strahlung im Spektrographen spektral zerlegt, und die spektral zerlegten Daten auf einen Kamerachip mit an den optischen Wellenlängenbereich angepasster Empfindlichkeit projiziert.Preferably In the case of in vivo acquisition of the raw data, the tissue part to be examined becomes from one or more optical radiation sources with the required Wavelength range of adapted radiation characteristics illuminates the radiation remitted by the considered tissue area an optic and a slit diaphragm in an imaging spectrograph discharged, the remitted radiation in the spectrograph spectrally decomposed, and the spectrally decomposed data on a camera chip with sensitivity adapted to the optical wavelength range projected.
Durch lineares Verschieben der Messanordnung relativ zur Gewebeprobe kann das Verfahren zeilenweise wiederholt werden, wodurch eine schnelle und umfassende Abtastung der zu untersuchenden Gewebepartien möglich ist.By linear displacement of the measuring device relative to the tissue sample can the process is repeated line by line, creating a fast and comprehensive scanning of the tissue parts to be examined possible is.
In einer alternativen Ausführungsform wird die zu untersuchende Gewebepartie mit einer oder mehreren optischen Strahlungsquellen mit dem erforderlichen Wellenlängenbereich angepasster Strahlungscharakteristik beleuchtet und die von dem betrachteten Gewebebereich remittierte Strahlung über eine Optik und eine Wellenlängenselektion auf einen Kamerachip mit an den optischen Wellenlängenbereich angepasster Empfindlichkeit projiziert. Die Wellenselektion erfolgt dabei vorzugsweise mittels eines durchstimmbaren Filters oder einer Reihe diskreter Einzelfilter.In an alternative embodiment is to be examined Tissue particle with one or more optical radiation sources adapted to the required wavelength range Radiation characteristic illuminated and that of the considered Tissue area remitted radiation through an optic and a wavelength selection on a camera chip with the optical wavelength range adapted sensitivity projected. The wave selection is preferably carried out by means of a tunable filter or a series of discrete single filters.
Durch Durchstimmen des Transmissionsbereichs des durchstimmbaren Filters oder sequentielles Ein- und Ausschwenken der Einzelfilter werden in Folge eine Anzahl räumlich aufgelöster Bilder der bei der jeweiligen selektierten Wellenlänge von der betrachteten Gewebepartie remittierten Strahlung erhalten. Die Kombination dieser sequentiell aufgenommenen Spektralinformation liefert die Grundlage für die nachfolgende spektrale Klassifikation.By tuning the transmission range of the tunable filter or sequential swinging in and out of the individual filters, a number of spatially resolved images are generated in the jewei At the selected wavelength of the considered tissue part, the radiation received was remitted. The combination of this sequentially recorded spectral information provides the basis for the subsequent spectral classification.
In einer weiteren alternativen Ausführungsform wird die zu untersuchende Gewebepartie selektiv mit Strahlungsquellen mit schmalbandigem Emissionsverhalten oder einer breitbandigen Strahlungsquelle mit entsprechenden optischen Filtern zwischen Strahlungsquelle und zu untersuchender Gewebepartie, oder einer Kombination aus beidem, beleuchtet. Die von dem betrachteten Gewebebereich remittierte Strahlung wird über eine Optik auf einen Kamerachip mit an den optischen Wellenlängenbereich angepasster Empfindlichkeit projiziert.In Another alternative embodiment is the examining tissue section selectively with narrowband radiation sources Emission behavior or a broadband radiation source with appropriate optical filters between the radiation source and to be examined Tissue part, or a combination of both, illuminated. The Radiation remitted from the considered tissue area is transferred over an optic on a camera chip to the optical wavelength range adapted sensitivity projected.
Durch sequentielles Aktivieren und Deaktivieren der einzelnen Strahlungsquellen bzw. Ein- und Ausschwenken der Filter zwischen Strahlungsquelle und betrachteter Gewebepartie werden in Folge eine Anzahl räumlich aufgelöster Bilder der bei Beleuchtung mit der jeweiligen selektierten Wellenlänge von der betrachteten Gewebepartie remittierten Strahlung erhalten. Die Kombination dieser sequentiell aufgenommenen Spektralinformation liefert die Grundlage für die nachfolgende spektrale Klassifikation.By sequential activation and deactivation of the individual radiation sources or pivoting in and out of the filters between the radiation source and considered tissue part become a number spatially resolved images of the lighting with the respective selected wavelength from the considered tissue part received remitted radiation. The combination of these sequentially recorded spectral information provides the basis for the subsequent spectral classification.
Im Rahmen des spektralen Vorverarbeitens der Rohdaten können Inhomogenitäten der Beleuchtung und/oder Variationen der Empfindlichkeit oder des Dunkelstroms der einzelnen Pixel der Kamera ausgeglichen werden und aus Energie-Rohdaten der betrachteten Gewebestelle und denen eines konstanten Spektralstandards für jeden Bildpunkt Reflektionsspektren berechnet werden.in the Spectral pre-processing of the raw data can Inhomogeneities of lighting and / or variations of Sensitivity or dark current of each pixel of the camera and from raw energy data of the considered tissue site and those a constant spectral standard for each pixel Reflection spectra are calculated.
Vorzugsweise wird die spektrale Klassifikation durch eine Linear Discriminant Analysis (LDA) oder eine Quadratic Discriminant Analysis (QDA) oder durch ein multivariates Regressionsverfahren (Partial Least Squares Regression, PLSR) durchgeführt.Preferably is the spectral classification by a linear discriminant Analysis (LDA) or a Quadratic Discriminant Analysis (QDA) or by a multivariate regression method (partial least squares Regression, PLSR).
Vor der spektralen Klassifikation kann eine Reduktion der Dimensionalität der Daten enthalten sein, wobei die Spektralmerkmale der Spektraldaten vorzugsweise durch eine Principal Component Analysis (PCA) oder eine Independent Component Analysis (ICA) reduziert werden. Dadurch kann die Datenmenge reduziert und die Auswertung beschleunigt werden. In weiterer Folge kann man aus den Spektralmerkmalen einzelne bzw. mehrere Wellenlängen ableiten, die für eine Klassifikation vorteilhaft verwendet werden können.In front The spectral classification can be a reduction in dimensionality of the data, with the spectral characteristics of the spectral data preferably by a Principal Component Analysis (PCA) or an Independent Component Analysis (ICA). Thereby the amount of data can be reduced and the evaluation speeded up. Subsequently, one can use the spectral features individual or derive several wavelengths for a classification can be used advantageously.
Die Anzahl der Spektralmerkmale wird vorteilhaft auf fünf bis 15 Spektralmerkmale reduziert, welche in einem oder mehreren Spektralbereichen liegen können, so dass die automatisierte Beurteilung frei von unnötigen Informationen schnell und effizient erfolgen kann.The Number of spectral features will be beneficial to five to 15 spectral features reduced, which in one or more spectral ranges can lie, leaving the automated assessment free from unnecessary information to be done quickly and efficiently can.
Eine Artefaktkorrektur mittels computerbasierter Bildverarbeitungsalgorithmen ermöglicht die Entfernung von Artefakten aus Aufnahme und/oder Klassifikation, insbesondere Pixelfehler, Speckle-Noise oder Streulicht-Artefakte. Dies kann vorteilhafterweise durch Einsatz morphologischer Filter und Analyse zusammenhängender (Pixel-)Flächen der Klassifikationsbilder geschehen. Die Algorithmen hierfür zeichnen sich durch eine hohe Effizienz aus.A Artifact correction using computer-based image processing algorithms allows the removal of artifacts from recording and / or Classification, in particular pixel errors, speckle noise or scattered light artifacts. This can be done advantageously by using morphological filters and analysis of contiguous (pixel) surfaces the classification pictures happen. The algorithms for this are characterized by a high efficiency.
In einer bevorzugten Ausführungsform werden die Verfahrensschritte des spektralen Klassifizierens, der Artefaktkorrektur und gegebenenfalls Teilschritte des morphologischen Klassifizierens zu einem Verfahrensschritt zusammengefasst, vorzugsweise durch Anwendung einer Contextual Classification.In In a preferred embodiment, the method steps Spectral Classification, Artifact Correction and, if applicable Sub-steps of morphological classification to a process step summarized, preferably by applying a Contextual Classification.
Im Verfahrensschritt des morphologischen Klassifizierens werden die Klassifikationsbilder nach entsprechenden morphologischen Kriterien, insbesondere Textur, Homogenität und/oder Größe bestimmter Bereiche klassifiziert, wodurch die endgültige Einordnung und Auswertung erfolgen kann.in the Process step of the morphological classification are the Classification images according to corresponding morphological criteria, in particular texture, homogeneity and / or size classifies certain areas, thereby reducing the final Classification and evaluation can be done.
Das so ermittelte Auswertungsergebnis enthält vorteilhafterweise die Auswertung der betrachteten Gewebepartie sowie Informationen über die Lage und die geometrischen Abmessungen der Gewebeveränderungen, so dass beispielsweise bei einer Nachuntersuchung eine schnelle und einfache Wiederauffindung der Gewebepartie möglich ist.The thus determined evaluation result contains advantageously the evaluation of the examined tissue part as well as information about the location and geometric dimensions of the tissue changes, so that, for example, at a follow-up a fast and easy retrieval of the tissue part possible is.
Vorteilhafterweise umfasst der Verfahrensschritt des Ausgebens des Auswertungsergebnisses an eine Benutzerschnittstelle die Visualisierung der Auswertungsergebnisse und/oder die Speicherung in einem Datenspeicher, so dass in einfacher und übersichtlicher Weise die Daten für weitere Begutachtung zur Verfügung stehen.advantageously, The method step comprises outputting the evaluation result to a user interface, the visualization of the evaluation results and / or storage in a data store, so that in easier and clear the data for more Appraisal will be available.
Weitere Einzelheiten, Merkmale und Vorteile der erfindungsgemäßen Anordnungen ergeben sich aus der nachstehenden Beschreibung unter Bezugnahme auf die angeschlossenen Zeichnungen, in welchen auch bevorzugte Ausführungsformen dargestellt sind. Es zeigen:Further Details, features and advantages of the invention Arrangements will become apparent from the description below Reference to the accompanying drawings, in which also preferred Embodiments are shown. Show it:
Betrachtet
man zunächst das in
Bei
Messung kontinuierlicher Spektraldaten, beispielsweise mittels bildgebendem
Spektrographen, ist vor Durchführung einer spektralen Klassifikation
(bei
Alternativ
zur softwaremäßigen Reduktion kontinuierlicher
Spektralinformationen auf eine geringere Anzahl relevanter Komponenten
ist es bei manchen Gewebeveränderungen auch möglich,
diese Reduktion hardwaremäßig in das Messverfahren
zu implementieren. Dazu werden typischerweise zunächst
kontinuierliche Spektren in einem oder mehreren relevanten optischen
Spektralbereichen aufgenommen und diese offline einer entsprechenden
Analyse, beispielsweise wiederum mit PCA oder ICA unterzogen. Basierend
darauf ist es, entsprechend ausgeprägte spektrale Unterschiede
vorausgesetzt, möglich, eine Anzahl diskreter Wellenlängen
auszuwählen und gezielt bei diesen zu messen. Somit reduziert
sich der Umfang („Dimension") der Spektralinformation von
zumeist deutlich über 100 Wellenlängen auf typischerweise
fünf bis 15 Wellenlängen innerhalb eines oder
mehrerer Spektralbereiche. Somit kann bei derartigen Anordnungen
auf eine Dimensionsreduktion
Die
vorverarbeiteten und gegebenenfalls in ihrer spektralen Dimensionalität
reduzierten räumlich aufgelösten Spektraldaten
werden in der Folge wahlweise mit Hilfe eines statistischen Klassifikationsverfahrens, beispielsweise
LDA (Linear Discriminant Analysis) oder QDA (Quadratic Discriminant
Analysis) oder einem multivariaten Regressionsverfahren, beispielsweise
PLSR (Partial Least Squares Regression) ausgewertet (Punkt
Der Unterschied zwischen LDA und QDA besteht daran, dass für LDA für alle Klassen dieselbe Kovarianzmatrix Σ = Σi verwendet wird und sich daher lineare Entscheidungsgrenzen im Featurespace von x ergeben. Bei QDA werden für jede Klasse eigene Kovarianzmatrizen Si abgeschätzt, woraus sich Entscheidungsgrenzen aus Polynomen zweiter Ordnung ergeben [1].The difference between LDA and QDA is that for LDA, the same covariance matrix Σ = Σ i is used for all classes, resulting in linear decision boundaries in the feature space of x. In QDA, each covariance matrices S i are estimated for each class, which results in decision boundaries of second-order polynomials [1].
Bei
multivariaten Regressionsverfahren wird im allgemeinen nach einer
Koeffizientenmatrix K gesucht, die für die vorgegebenen
Werte in einem Vektor y die folgende Gleichung erfüllen:
Die Elemente von y entsprechen in diesem Fall den bekannten Klassenzugehörigkeiten der Trainingsdaten. Im Fall von PLSR wird dieses Gleichungssystem im Sinne von Partial Least Squares (kleinste Fehlerquadrate) gelöst [2]. Für ein unbekanntes Spektrum x kann über dieselbe Gleichung die Klassenzugehörigkeit bestimmt werden.The Elements of y in this case correspond to the known class memberships the training data. In the case of PLSR this equation system becomes solved in the sense of partial least squares [2]. For an unknown spectrum x can over same class of class membership.
Die
Klassen sind dabei anwendungsabhängig definierbar und können
beispielsweise „gesundes Gewebe"/"gutartig verändertes
Gewebe"/"bösartig verändertes Gewebe" umfassen,
aber auch unterschiedliche Klassen biologischen Gewebes etc. sowie,
insbesondere relevant bei Betrachtungen der Haut, beispielsweise auch
Haare. Das Ergebnis sind räumlich aufgelöste Klassifikationsbilder,
wie exemplarisch in
In
einem nächsten Schritt
- 1. Morphologisches Öffnen mit 3×3 Pixel Kernel und kreisförmiger Maske mit Radius 3 Pixel
- 2. Morphologisches Schließen mit 5×5 Pixel Kernel und kreisförmiger Maske mit Radius 5 Pixel
- 1. Morphological opening with 3 × 3 pixels kernel and circular mask with radius 3 pixels
- 2. Morphological closure with 5x5 pixels kernel and circular mask with radius 5 pixels
Eine Definition dieser Operationen kann in [3] nachgelesen werden. Die entsprechenden Artefakte werden dabei vorzugsweise aus dem Klassifikationsbild hinausgerechnet und die Klassenzuordnung der entsprechenden Bereiche aus den Klassifikationsergebnissen der benachbarten Pixel interpoliert.A Definition of these operations can be found in [3]. The corresponding artefacts are preferably from the classification image calculated and the class assignment of the corresponding areas interpolated from the classification results of the neighboring pixels.
Durch
Einsatz neuartiger statistischer Algorithmen für die Spektralklassifikation,
welche bei der spektralen Klassifikation auch das Umfeld des betreffenden
Pixels in die Wahrscheinlichkeitsbewertung der Klassenzuordnung
einbeziehen („Contextual Classifiers") ist es alternativ
zu einem getrennten Einsatz der Schritte
Auf
die durch Anwendung entsprechender Bildverarbeitungsalgorithmen
verbesserten und von Artefakten (weitgehend) befreiten Klassifikationsbilder
wird als letzten Schritt der erfindungsgemäß vorgeschlagenen
Auswertungskette eine computergestützte morphologische
Analyse
Aus
dem so erhaltenen, sowohl die volle spektrale als auch die enthaltenen
räumlichen Informationen der gemessenen Rohdaten berücksichtigenden
Klassifikationsergebnis kann nun gleichfalls automatisiert ein Auswertungsergebnis
Diese
Vorgangsweise ist anhand
In
Muttermal)
liefern, es ist aber eine Bösartigkeit (Melanom) nicht
völlig auszuschließen, beispielsweise im rechten
oberen Randbereich der Läsion. Erst durch nachfolgende
Anwendung der morphologischen Analysen
In
Die
Auswertungsergebnisse
Als Messanordnungen zur Aufnahme geeigneter spektral wie räumlich aufgelöster Messdaten kommt prinzipiell jede Anordnung in Frage, die derartigen Daten mit für den Anwendungsfall erforderlicher räumlicher wie spektraler Auflösung liefern kann. Für den praktischen Einsatz ist es vorteilhaft, sich Messanordnungen zu bedienen, die diese Daten innerhalb einer Zeitspanne von typischerweise maximal 60 s aufnehmen können, da sonst die Gefahr signifikanter Verfälschungen durch Bewegungen des betrachteten Gewebeteils relativ zur Messanordnung und somit, je nach Messmethode, Verzerrungen in der spektralen oder der räumlichen Dimension auftreten können, die eine zuverlässige Klassifikation erschweren oder unmöglich machen.When Measuring arrangements for recording suitable spectral and spatial resolved measurement data is in principle any arrangement in question, such data with for the application required spatial as well as spectral resolution can deliver. For practical use, it is advantageous to use measuring arrangements that store these data within one Time span of typically a maximum of 60 s, since otherwise the danger of significant falsification by movements of the considered tissue part relative to the measuring arrangement and thus, depending on the measuring method, distortions in the spectral or the spatial Dimension can occur, which is a reliable Make classification difficult or impossible.
Eine
prinzipielle Anordnung zur nicht-invasiven in-vivo Messung räumlich
aufgelöster, kontinuierlicher Spektraldaten von Gewebebereichen
ist in
Bei
Messung von Fluoreszenzdaten kann es ergänzend sinnvoll
sein, gemäß
Eine
prinzipielle Anordnung zur nicht-invasiven räumlich aufgelösten
in-vivo Messung bei definierten diskreten Wellenlängen
ist in
Die Auswahl der Wellenlängen und somit die Spektralinformation kann in Anordnungen dieser prinzipiellen Art auf verschiedene Arten erfolgen.The Selection of the wavelengths and thus the spectral information can in arrangements of this principal kind in different ways respectively.
Eine
vorteilhafte Möglichkeit sieht die Verwendung einer Mehrzahl
monochromatisch bzw. schmalbandig bei den relevanten Wellenlängen
emittierenden Strahlungsquellen
Alternativ
dazu ist es möglich, breitbandige Strahlungsquellen
Alternativ
zu einer Filterung der Beleuchtungsstrahlung ist es zur Auswahl
bestimmter relevanter Wellenlängen auch möglich,
das Gewebe
Insbesondere
für die Auswertung von Fluoreszenzerscheinungen kann es
ergänzend sinnvoll sein, sowohl zwischen Lichtquelle
Referenzen:References:
-
[1]
[1]Duda, R.O.; Hart, P.E. and Stork, D.G., Pattern Classification; John Wiley & Sons (ed.), 2nd Ed. (2001) Duda, RO; Hart, PE and Stork, DG, Pattern Classification; John Wiley & Sons (ed.), 2nd ed. (2001) -
[2]
[2]Martens, H., Naes, T., Multivariate Calibration, John Wiley & Sons (2002) Martens, H., Naes, T., Multivariate Calibration, John Wiley & Sons (2002) -
[3]
[3]Foley, J.D., van Dam, A., Feiner, S.K., Hughes J.F., Phillips R.L., Introduction to Computer Graphics, Addison-Wesley Professional (1993) Foley, JD, van Dam, A., Feiner, SK, Hughes JF, Phillips RL, Introduction to Computer Graphics, Addison-Wesley Professional (1993)
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| Publication number | Publication date |
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| AT505523B1 (en) | 2009-05-15 |
| AT505523A1 (en) | 2009-02-15 |
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