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DE102005020134A1 - Verfahren und Vorrichtung zur Durchführung eines parallelen und simultanen Mehrfachprozesses der trägerfreien isoelektrischen Fokussierung - Google Patents

Verfahren und Vorrichtung zur Durchführung eines parallelen und simultanen Mehrfachprozesses der trägerfreien isoelektrischen Fokussierung Download PDF

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Abstract

Gegenstand der Erfindung ist ein Verfahren zur parallelen und simultanen trägerfreien Ablenkungselektrophorese, dadurch gekennzeichnet, dass es in einem Trennraum durchgeführt, der nur durch eine Anode und eine Kathode begrenzt wird, wobei mehrere Trennmedien (TM) gleichzeitig und gemeinsam jeweils mit einem anodischen und kathodischen Stabilisierungsmedium so dem Trennraum zugeführt werden, dass jeweils ein kathodisches Stabilisierungsmedium (KS) und ein anionisches Stabilisierungsmedium (AS) benachbart sind.

Description

  • Beschreibung
  • Die Erfindung betrifft ein Verfahren und eine Vorrichtung zur trägerfreien isoelektrischen Fokussierung im parallelen und simultanen Mehrfachprozess.
  • Das Verfahren der trägerfreien isoelektrischen Fokussierung wird bisher so durchgeführt, dass die Trennung in den dazu notwendigen Trennmedien in einem Trennraum durchgeführt wird, der von den Elektroden begrenzt wird (siehe 1). Eine Parallelisierung dieses Verfahrens kann durchaus in einer Trennkammer mit einer erhöhten Anzahl von Elektroden durchgeführt werden (siehe 2). Die dazu notwendi gen Trennkammern sind aber deutlich komplizierter im Aufbau und die Anzahl der peripheren Pumpen wird gleichzeitig mit der Anzahl der peripheren Bausteine erhöht.
  • Das nachfolgend beschriebene Verfahren kann in einer Trennkammer mit 2 Elektroden durchgeführt werden. Zur Durchführung der n-fachen parallelen simultanen trägerfreien isoelektrischen Fokussierung werden mindestens 3 n Medieneinlässe benötigt.
  • Die Grundlagen der trägerfreien Ablenkungselektrophorese in kontinuierlichem Prozessablauf wurden bereits vor mehr als 30 Jahren in der Literatur beschrieben, u. a. auch im Jahrbuch 1968 der Max-Planck-Gesellschaft S. 117–137. Dieser Prozess wird auch in der Literatur unter dem Begriff FFE (Free Flow Elektrophorese) oder CFE (continuous flow electrophoresis) beschrieben [1], [2], [3] (siehe Literaturverzeichnis).
  • FFE-Trennverfahren dienen zur Trennung von Ionen beliebigen Molekulargewichts bis hin zu Biopartikeln, dabei ist es unerheblich, ob die zu trennende Probe selbst geladen ist oder die Ladung durch Anlagerung oder Sorption von Ionen entstand.
  • Dieses Verfahren wird sowohl für präparative wie auch analytische Trennungen eingesetzt.
  • Das Verfahren der kontinuierlichen Ablenkungselektrophorese wurde vor einigen Jahren vom Anmelder in wesentlichen Aspekten durch die Einführung von Stabilisierungsmedien bzw. dem Counterflow-Medium entscheidend verbessert ( DE 41 39 472 C1 ).
  • Die Qualität dieser Verbesserungen war bei den verschiedenen FFE-Trenntechniken unterschiedlich:
    Im Falle der kontinuierlichen isoelektrischen Fokussierung konnte dadurch die Trennleistung um den Faktor 10–50 verbessert werden.
  • Ein Verfahren der parallelen und simultanen isoelektrischen Fokussierung und die dazu notwendige Vorrichtung wurden in DE 100 63 097 A beschrieben. Das Schema des dort beschriebenen Verfah rens ist in 2 gezeigt. Die n-fache Parallelisierung des Verfahrens der kontinuierlichen isoelektrischen Fokussierung erfordert eine Trennkammer mit n + 1 Elektrodenräumen mit dazu gehörenden Bauelementen, die die unkontrollierte Querströmung zwischen den Trennräumen und den Elektrodenräumen verhindern. Aufwendige technische Maßnahmen sind notwendig, um einen gleichförmigen Trennspalt quer über alle Trennräume zu garantieren. Ein zusätzlicher Nachteil ist der relativ hohe „Platzbedarf" der Elektrodenräume bezogen auf den gesamten Trennraum.
  • Aufgabe der Erfindung ist es, ein Verfahren der parallelen und simultanen, kontinuierlichen isoelektrischen Fokussierung zwischen nur 2 Elektroden zu schaffen.
  • Diese Aufgabe wir erfindungsgemäß mit einem Verfahren gemäß Anspruch 1 gelöst.
  • In den Zeichnungen veranschaulicht
  • 1 einen bekannten Prozess der trägerfreien Elektrophorese mit einem Trennraum und 2 begrenzenden Elektroden,
  • 2 einen bekannten Prozess der mehrfach parallelen und simultanen trägerfreien Elektrophorese mit mehreren Trennräumen, jeweils begrenzt von 2 Elektroden,
  • 3 einen erfindungsgemäßen Prozess der mehrfach parallelen und simultanen trägerfreien Elektrophorese mit mehreren Trennräumen innerhalb von nur 2 begrenzenden Elektroden,
  • 4A das Verfahren bei Verwendung idealer Elektrodenlösungen mit geringer elektrophoretischer Mobilität und
  • 4B das Verfahren bei Verwendung herkömmlicher Elektrodenlösungen mit hoher elektrophoretischer Mobilität.
  • Nachfolgend wird die Durchführung der kontinuierlichen isoelektrischen Fokussierung in einem parallelen Mehrfachprozess in einer Trennkammer mit mehreren Trennräumen beschrieben, wobei nur 2 Elektro den zur Anwendung kommen. Der Prozess für die Durchführung des Verfahrens als ein 2-fach paralleles und simultanes Verfahren ist den 4A und 4B veranschaulicht.
  • Ein solches Verfahren ist vorzugsweise nicht mit den Medien durchzuführen, die bis dato in der Literatur als Elektrodenlösungen beschrieben werden.
  • In den bis dato beschriebenen Elektrodenlösungen werden Säuren bzw. Basen mit Anionen bzw. Kationen mit relativ hoher elektrophoretischer Beweglichkeit verwendet und diese Anionen bzw. Kationen verursachen trotz der „Sperrwirkung" dieser Stabilisierungsmedien eine Crosskontaminierung quer über die Trennräume, die in der 4B schematisch dargestellt wird.
  • Erfindungsgemäß wird bevorzugt ein anodisches Stabilisierungsmedium (AS) verwendet, das eine relativ starke Säure enthält, dessen Anion einen sehr niedrigen Wert der elektrophoretischen Mobilität besitzt. Als kathodisches Stabilisierungsmedium (KS) wird zudem eine starke Base eingesetzt, deren Kation ebenfalls einen niedrigen Wert der elektrophoretischen Wanderungsgeschwindigkeit besitzt. Dann ergeben sich die in 4A gezeigten Verhältnisse. Die Crosscontaminierung durch die Anionen bzw. die Kationen der Stabilisierungsmedien erfolgt nur über kurze Wegstrecken in jedem Fall aber innerhalb der Bereiche der Stabilisierungsmedien. Die bei der unvermeidlichen aber sehr begrenzten Crosscontaminierung der benachbarten Stabilisierungsmedien entstehende Neutralisationswärme kann über die sehr effektive Kühlung des Trennraumes ohne Probleme abgeführt werden.
  • Nachstehend wird das oben schematisch beschriebene Verfahren in Form eines 3-fach parallelen simultanen Prozesses der kontinuierlichen isoelektrischen Fokussierung beschrieben.
  • In der 3 ist die Trennkammer schematisiert dargestellt. Am unteren Ende der Trennkammer befinden sich mindestens 9 Einlassöff nungen (19), welche mit den Förderkanälen einer Multikanalpumpe (10) verbunden sind. Über die Einlässe (2, 5 und 8) wird das Trennmedium (TM), und über die Einlässe (1, 4 und 7) wird das anodische Stabilisierungsmedium (AS) dem Trennraum zugeführt. Zusätzlich wird das kathodische Stabilisierungsmedium (KS) über die Einlässe (3, 6 und 9) zudosiert.
  • Alle Medien strömen unter laminaren Flussbedingungen durch den Trennraum. Parallel zu den Seitenkanten der Trennkammer sind Elektroden (11, 12) angeordnet, die durch eine weitere Pumpe mit hoher Flussgeschwindigkeit im Kreislauf gespült werden. Membranen (13, 14), die den elektrischen Strom leiten, trennen die Elektrodenräume vom Trennraum und verhindern jeglichen Medienaustausch durch hydrodynamischen Fluss.
  • Wird bzw. werden die Probe(n) mittels einer unabhängigen Dosierpumpe (15) in die strömende Trennmedien aufgegeben, so wird bzw. werden diese Probe(n) in den verschiedenen Trennbereichen gemäß den unterschiedlichen pI-Werten der Analyten getrennt.
  • Die auf getrennten Bahnen strömenden Analyten erreichen an unterschiedlichen Orten eine quer zur Strömungsrichtung angeordnete Reihe von Schlauchöffnungen (16) und werden dann mit den Medien zu separaten Auffanggefäßen geführt. Diese Reihe von Schlauchöffnungen mit einem geringst möglichen Abstand zwischen den Öffnungen wird als Fraktioniervorrichtung bezeichnet und die Anzahl dieser parallel angeordneten Schläuche liegt im Bereich von 30 bis max. 180.
  • Vom oberen Ende der Trennkammer strömt ein zusätzliches Medium (Counterflow Medium) in entgegengesetzter Richtung (17) zu den Trennmedien und verlässt den Trennraum ebenfalls über die Schlauchöffnungen der Fraktioniervorrichtung.
  • Als beispielhafte Trennung wurde in der oben beschriebenen Apparatur u. a. die isoelektrische Trennung von kommerziellen Ampholyten (pH 4–9) durchgeführt.
  • In allen Trennräumen wird das erwartete pH-Profil erzielt und die pH-Werte bzw. die Werte der Leitfähigkeiten der FFE-Fraktionen zeigen die Bereiche der Crosskontamination an.
  • Aus dem Vorgenannten geht hervor, dass das erfindungsgemäße Verfahren der parallelen und simultanen kontinuierliche Ablenkungselektrophorese und die dabei notwendigen Medien entscheidende Vorteile bezüglich der Vereinfachung der technischen Ausrüstung und der Anwendungsbreite besitzt.
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Claims (2)

  1. Verfahren zur parallelen und simultanen trägerfreien Ablenkungselektrophorese, dadurch gekennzeichnet, dass es in einem Trennraum durchgeführt, der nur durch 1 Anode und 1 Kathode begrenzt wird, wobei mehrere Trennmedien (TM) gleichzeitig und gemeinsam jeweils mit einem anodischen und kathodischen Stabilisierungsmedium so dem Trennraum zu geführt werden, dass jeweils ein kathodisches Stabilisierungsmedium (KS) und ein anionisches Stabilisierungsmedium (AS) benachbart sind.
  2. Verfahren nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, dass als anodische und kathodische Stabilisierungsmedien Säuren und Basen mit Säure- bzw. Basenresten verwendet werden, deren Werte der elektrophoretischen Beweglichkeit niedrig ist.
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