DD240216A5 - Verfahren zur reinigung einer physiologisch aktiven substanz hergestellt durch rekombination von technischen dna - Google Patents
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Abstract
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Reinigung einer durch Rekombinant-DNA-Technik erzeugten physiologisch aktiven Substanz. Mit der Erfindung wird ein Verfahren zur Verfuegung gestellt, mit dem Human-TNF gewonnen wird, welches eine ausgezeichnete Antitumor-Wirkung besitzt und vom Menschen stammt. Die Aufgabe der Erfindung besteht in der Schaffung eines Verfahrens zur Reinigung von durch Rekombinant-DNA-Technik erzeugter Human-TNF. Eine waessrige Loesung, die eine physiologisch aktive Substanz enthaelt, die durch Rekombinant-DNA-Technik erzeugt wird und die zytotoxische Aktivitaet gegenueber L-M-Zellen besitzt und in der Lage ist, haemorrhagische Necrose von transplantiertem Meth A Sarcom in der BALB/c-Maus zu induzieren, kann tatsaechlich wirksam durch Saeulenchromatographie unter Einsatz einer mit einem Farbstoff gebundenen vernetzten Agarosegel gefuellten Saeule gereinigt werden.
Description
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Reinigung einer durch Rekombinant-DNA-Technik erzeugten physiologisch aktiven Substanz, die in der Medizin anwendbar ist, und genauer ein Verfahren für die Reinigung einer physiologisch aktiven Substanz, bei dem eine wäßrige Lösung, die eine rohe physiologisch aktive Substanz enthält, welche aus einem künstlich erzeugten Bakterium oder Hefe mit Hilfe der Rekombinant-DNA-Technik erzeugt wurde und eine Antitumor-Aktivität besitzt, der Säulenchromatographie unter Einsatz einer mit einem farbstoffgebundenen vernetzten Agarosegel gefüllten Säule unterzogen
Bekannt ist, daß es eine physiologisch aktive Substanz gibt, die vom Menschen stammt und die eine zytotoxische Aktivität in bezug auf L-M-Zellen besitzt und in der Lage ist, hämorrhagische Necrose eines transplantierten Tumors, Meth A Sarcom, in der BALB/c Maus zu induzieren. Eine solche physiologisch aktive Substanz besitzt eine Antitumor-Aktivität und wird Human Tumor Necrosis Factor genannt (anschließend häufig als „Human TNF" bezeichnet). Ebenfalls bekannt ist, daß ein solcher Human TNF keine toxische Wirkung auf normale Zellen in vitro ausübt. Außerdem besteht, da der Human-TNF vom Menschen stammt, keine Gefahr, daß ein anaphylaktischer Schock durch die Verabreichung einer Substanz an einen Menschen, von dem die Substanz nicht stammt, hervorgerufen wird. Daher sind die Erwartungen für die klinische Anwendung des oben genannten Human TNF als Antitumor-Medizin im Fachgebiet hoch gewesen.
Um die breite und sichere klinische Anwendung von Human-TNF als Antitumor-Medizin zu gewährleisten, muß Human-TNF in einer stark gereinigten Form in großen Mengen gewonnen werden können. Kürzlich wurde ein Verfahren zur Gewinnung von Human-TNF mit Hilfe der Rekombinant-DNA-Technik vorgeschlagen. Die vorgeschlagene Methode besteht in: Ligation einer Desoxyribonucleinsäure, die für Human-TNF kodiert auf ein reproduzierbares Expressions-Vehikel, zur Gewinnung einer reproduzierbaren Rekombinant DNA, die aus der Desoxyribonucleinsäure und dem reproduzierbaren Expressions-Vehikel besteht;
Transformation von Zellen eines Mikroorganismus oder einer Zellkultur mit der reproduzierbaren Rekombinant-DNA zur Bildung von Transformanten;
Selektion derTransformanten von Elternzellen des Mikroorganismus oder der Zellkultur; Inkubation derTransformanten, damit diese Transformanten zur Expression der Desoxyribonucleinsäure und zur Erzeugung von Human TNF gezwungen werden; und
Isolierung von Human-TNF von den inkubierten Transformanten und anschließende Reinigung.
Die Reinigung von Human-TNF wird gewöhnlich unter Anwendung einer Kombination von verschiedenen bekannten Techniken, wie Ultrafiltration, Dialyse, Ionenaustausch, Affinitäts-Chromatographie, Gelfiltration und Elektrophorese ausgeführt. Hinsichtlich der Affinitäts-Chromatographie, die als herkömmliches Verfahren angewandt wird, wird in der offengelegten japanischen Patentanmeldungs-Spezifikation Nr. 58-138383 (1983) dargelegt, daß es sich für eine wirksame Reinigung einer Substanz mit Antitumor-Aktivität, die von der Kultur von Säugetierzellen oder verschmolzenen Zellen davon gewonnen wurde, vorteilhaft erweisen kann, eine Technik der Affinitäts-Chromatographie anzuwenden, bei der ein bestimmter Antikörper gegen die Substanz mit der Antitumor-Aktivität als Adsorptionsmittel eingesetzt wird. Eine derartige Affinitäts-Chromatographie-Technik unter Einsatz eines bestimmten Antikörpers kann vorteilhaft mit der herkömmlichen Methode zur Reinigung des Human-TNF kombiniert werden.
Die herkömmlichen Reinigungsmethoden für die physiologisch aktiven Substanzen sind jedoch sehr arbeitsaufwendig, weil derartige Verfahren viele Schritte von Reinigungsvorgängen nach obiger Darstellung umfassen, und daher können sie nicht mit Erfolg für die Durchführung der Reinigung von rohem TNF im großtechnischen Maßstab angewandt werden. Darüber hinaus ist festzustellen, daß es für die Durchführung der Affinitäts-Chromtographie-Technik unter Verwendung eines spezifischen Antikörpers als Adsorptionsmittel, wobei diese Technik als eine vorteilhafte Technik nach obiger Darstellung angesehen wird, erforderlich ist, daß eine große Menge des spezifischen Antikörpers gegen eine physiologisch aktive Substanz in gleichbleibender Qualität gewonnen wird. Der spezifische Antikörper kann von einem Säugetier durch Immunisierung des Säugetieres mit der physiologisch aktiven Substanz oder aus der Kultur von antikörpererzeugenden Zellen gewonnen werden. Allerdings kann eine große Menge des spezifischen Antikörpers nicht beständig in einer gleichbleibenden Qualität weder von dem immunisierten Säugetier noch von der Kultur der antikörpererzeugenden Zellen gewonnen werden. Das hat folgenden Grund. Wenn ein immunisiertes Säugetier für die Gewinnung des spezifischen Antikörpers verwendet wird, ist die Züchtung der antikörpererzeugenden Zellen im großen Maßstab eine schwierige Aufgabe, und außerdem sind die antikörpererzeugenden Zellen nicht unbedingt beständig. Das heißt, es ist schwierig, einen spezifischen Antikörper mit einer einheitlichen Qualität in Mengen zur Verfügung zu stellen. Daher kann die physiologisch aktive Substanz nicht mit Hilfe der Affinitäts-Chromatographie unter Verwendung eines spezifischen Antikörpers als Adsorptionsmittel großtechnisch beständig gereinigt werden. Aus den oben angeführten Gründen kann die Reinigung der physiologisch aktiven Substanz mit Hilfe einer der herkömmlichen Methoden im großen nicht beständig und wirksam erreicht werden. Soweit es den Erfindern bekannt ist, gab es keinen Bericht, in dem die Reinigung von durch Rekombinant-DNA-Technik erzeugtem Human-TNF untersucht wurde. Unter diesen Umständen kann die wirksame und beständige Lieferung des im wesentlichen reinen Human-TNF, vor allem im kommerziellen Umfang, nicht gewährleistet werden, trotz der Kenntnisse, daß Human-TNF eine wirksame Antitumor-Medizin ist.
Zur Behebung der oben in bezug auf die Reinigung von Human-TNF genannten Schwierigkeiten haben die Erfinder ausgedehnte und intensive Untersuchungen unternommen. Als ein Ergebnis wurde ganz überraschend gefunden, daß, wenn eine Human-TNF in roher Form enthaltende wäßrige Lösung auf eine mit farbstoffgebundenem vemetztem Agarosegel gefüllte Säule aufgegeben wird, Human-TNF speziell auf dem Farbstoff adsorbiert wird und anschließend Human-TNF auseluiert wird, wobei ein Elutionsmittel verwendet wird, dessen pH-Wert oder dessen Salzkonzentration höher als die der auf die Säule aufgegebenen Lösung ist, wodurch Human-TNF in im wesentlichen reiner Form beständig und wirksam mit hoher Rückgewinnung gewonnen wird. Die Erfindung wurde auf der Basis dieser neuen Erkenntnisse vollendet. Ziel der Erfindung .
Mit der Erfindung wird ein Verfahren zur Reinigung einer durch Rekombinant-DNA-Technik erzeugten physiologisch aktiven Substanz zur Verfügung gestellt. Der nach dem erfindungsgemäßen Verfahren gewonnene Human-TNF besitzt eine ausgezeichnete Antitumor-Wirkung und stammt vom Menschen. Daher ist der gewonnene Human-TNF besonders nützlich, wenn der Human-TNF klinisch als Antitumor-Medizin verabreicht wird.
Die Aufgabe der Erfindung besteht daher in der Schaffung eines Verfahrens zur Reinigung von durch Rekombinant-DNA-Technik erzeugter Human-TNF.
Die oben genannte und andere Aufgaben, Merkmale und Vorteile der Erfindung werden Fachleuten aus der folgenden ausführlichen Beschreibung und den beigefügten Ansprüchen in Verbindung mit den begleitenden Zeichnungen deutlich werden, in denen darstellen:
Fig. 1: die Restriktions-Karten von Plasmid-Inserts, von denen jedes eine DNA-Kodierung für einen herkömmlichen Kaninchen-
TNF enthält; Fig. 2: das Flußdiagramm des Verfahrens zur Herstellung einer Rekombinant-DNA (pTNF-lac-1), die für den herkömmlichen Kaninchen-TNF kodiert;
— b-rw & ι ν
Fig.3: das Flußdiagramm des Verfahrens zur Herstellung einer anderen Rekombinant-DNA (pTNF-lacUV5-1), die für den
herkömmlichen Kaninchen-TNF kodiert; Fig. 4: die Restriktionskarte des Teiles eines Plasm ids, dasein Gen für Human-TNF zur erfindungsgemäßen Verwendung enthält;
Fig. 5: die Restriktionskarte des Teiles eines Plasmids, das ein Gen für einen herkömmlichen Kaninchen-TNF enthält; Fig. 6: das Flußdiagramm des Verfahrens zur Herstellung einer Rekombinant-DNA (pHTNF-lacUV5-1), die für Human-TNF zur
erfindungsgemäßen Verwendung kodiert; und Fig.7: das Flußdiagramm des Verfahrens zur Herstellung einer anderen Rekombinant-DNA (pHTNF-lacUV5-2), die für die erfindungsgemäß zu verwendende physiologisch aktive Substanz kodiert.
Erfindungsgemäß wird ein Verfahren zur Reinigung einer physiologisch aktiven Substanz zur Verfugung gestellt, bei dem eine physiologisch aktive Substanz in roher Form enthaltende wäßrige Lösung der Säulenchromatographie unterzogen wird, wobei eine mit einem farbstoffgebundenen vernetzten Agarosegel gefüllte Säule verwendet wird, wobei das farbstoffgebundene Agarosegel aus einem vernetzten Agarosegel als Träger und einem kovalent daran gebundenen Farbstoff als Liganden besteht,
wobei es sich bei der physiologisch aktiven Substanz um eine solche handelt, die durch Rekombinant-DNA-Technik unter Verwendung einer Rekombinant-DNA erzeugt wird, die eine für die physiologisch aktive Substanz kodierende DNA enthält und die zytotoxische Aktivität gegen L-M-Zellen besitzt und in der Lage ist, hämorrhagische Necrose von transplantiertem Meth A Sarcom in der BALB/c Maus zu induzieren.
Wie oben erwähnt, handelt es sich bei der für die erfindungsgemäße Verwendung vorgesehenen physiologisch aktiven Substanz um eine, die mit Hilfe einer herkömmlichen Rekombinant-DNA-Technik unter Verwendung einer Rekombinant-DNA hergestellt wird, die eine für die physiologisch aktive Substanz kodierende DNA enthält. Wenn Human-TNF Analysen nach später zu beschreibenden Verfahren unterzogen wird, zeigt Human-TNF zytotoxische Aktivität gegen L-M-Zellen und induziert hämorrhagische Necrose von transplantiertem Meth A Sarcom in der BALB/c Maus. Der Human-TBF ist speziell ein Polypeptid mit einer durch die folgende Formel (I) dargestellten Aminosäuresequenz:
Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro VaI Ala His VaI VaI AIa Asn Pro Gin Ala GIu GIy GIn Leu GIn Trp Leu Asn Arg Arg AIa Asn AIa Leu Leu AIa Asn GIy VaI GIu Leu Arg Asp Asn GIn Leu VaI VaI Pro Ser GIu GIy Leu Tyr Leu He Tyr Ser Gin VaI Leu Phe Lys GIy Gin GIy Cys Pro Ser Thr His VaI Leu Leu Thr His Thr He Ser Arg lie Ala VaI Ser Tyr GIn Thr Lys VaI Asn Leu Leu Ser Ala Me Lys Ser Pro Cys GIn Arg GIu Thr Pro GIu GIy Ala GIu AIa Lys Pro Trp Tyr GIu Pro He Tyr Leu GIy GIy VaI Phe GIh Leu GIu Lys GIy Asp Arg Leu Ser Ala GIu He Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe Ala GIu Ser GIy Gin VaI Tyr Phe GIy Helle AIa Leu worin GIn für einen Glutaminrest steht, Asp einen Asparaginsäurerest, Pro einen Prolinrest, Tyr einen Tyrosinrest, VaI einen Valinrest, Lys einen Lysinrest, GIu einen Glutaminsäurerest, AIa einen Alaninrest, Asn einen Asparaginrest, Leu einen Leucinrest, Phe einen Phenylalaninrest, GIy einen Glycinrest, His einen Histidinrest, Ser einen Erinrest, Thr einen Threoninrest, He einen Isoleucinrest, Trp einen Tryptophanrest, Arg einen Argininrest, Met einen Methioninrest und Cys einen Cysteinrest. Der die oben genannte Aminosäuresequenz aufweisende Human-TNF kann durch eine herkömmliche Rekombinant-DNA-Technik unter Verwendung einer Rekombinant-DNA hergestellt werden, die eine für die physiologisch aktive Substanz kodierende DNA enthält, die mindestens eine Basensequenz aufweist, die aus der Gruppe ausgewählt ist, die aus einer durch die folgende Formel (II) dargestellten Basensequenz und einer zu der Basensequenz komplementären Basensequenz besteht: TCATCTTCT CGAACC CCG AGT GAC AAG CCT GTA GCC CAT GTT GTA GCAAAC CCTCAA GCT GAG GGG CAG CTC CAG TGG CTG AAC CGC CGG GCC AAT GCC CTC CTG GCC AAT GGC GTG GAG CTG AGA GAT AAC CAG CTG GTG GTG CCA TCA GAG GGC CTG TAC CTC ATC TAC TCC CAG GTC CTC TTC AAG GGC CAA GGC TGC CCC TCC ACC CAT GTG CTC CTC ACC CAC ACC ATCAGCCGCATCGCCGTCTCCTACCAGACCAAGGTCAACCTCCTCTCTGCCATCAAGAGCCCCTGCCAGAGGGAGACC CCA GAG GGG GCT GAG GCC AAG CCC TGG TAT GAG CCC ATC TAT CTG GGA GGG GTC TTC CAG CTG GAG AAG GGT GAC CG A CTC AGC GCT GAG ATC AAT CGG CCC GAC TAT CTC GAC TTT GCC GAG TCT GGG CAG GTC TAC TTT GGG ATC ATT GCC CTG
worin A für einen Desoxyadenylsäurerest steht, G für einen Desoxyguanylsäurerest, C einen DesoxycytidylsäurerestundTeinen Thymidylsäurerest und worin das linke Ende und das rechte Ende der Formel (II) eine 5'-Hydroxylgruppenseite bzw. 3'-Hydroxylgruppenseite darstellen
Der oben genannte Human-TNF und die oben genannte DNA können auf folgende Weise gewonnen werden:
1. Eine BakteriophageA/Kaninchen-Genom-Sammlung und eine BakteriophageX/Human-Genom-Sammlung, hergestellt von Prof.T. Maniatis, Department of Biochemistry und Molecular Biology, Harvard University, 7 Divinity Avenue, Cambridge, Massachusetts 02138, USA, werden verwendet. Diese Stoffe können mit Hilfe der folgenden Verfahrensweisen hergestellt werden (siehe Cell, 15, S.687 [1978]):
(1) Kaninchen- oder Menschengewebe, zum Beispiel Kaninchen- oder Menschenpankreasgewebe, werden zu gefrorenem Pulver reduziert und zur Digestion von RNA und Eiweißstoffen behandelt und ergeben nach der Präzipitation hochmolekulare Kaninchen-oder Human-DNA;
(2) die hochmolekulare DNA wird teilweise zur willkürlichen Abtrennung hinsichtlich der Gen-Stelle digeriert;
(3) die resultierenden DNA-Fragmente werden größenfraktioniert und ergeben von 15 bis 20 Kilobasenpaar (KB)-Fragmente;
(4) die resultierenden Fragmente von Schritt 3 werden unter Verwendung eines \-Charon-4A-Phagenvektors geklont; und
(5) die resultierenden Vektoren werden in vitro zu infektiösen Phagenpartikeln, die rDNA enthalten, gepackt, um die oben genannte Kaninchen- oder Human-Genom-Sammlung zu erhalten.
2. Die im Bezugsbeispiel 1 gewonnene Kaninchen-TNF-cDNAwird nach der Einschnitt-Translationsmethode von P.W.J.Rigby u.a. (siehe J. Mol.Biol., 113, S.237 [1977]) 32P-markiert.
3. Jede der Bakteriophagen λ/Kaninchen-Genom-Sammlung und Bakteriophagen λ/Human-Genom-Sammlung wird bis zum tatsächlichen Zusammenfließen auf einem Bakterienrasen ausgestrichen und in bezug auf Hybridisierung mitder32P-markierten Kaninchen-TNF-cDNA gescreent.
4. Von den geeigneten Klonen wird die entsprechende DNA isoliert, restriktionskardiert und durch Southem-Hybridisierung analysiert (siehe E. M. Southern, J. Mol. Biol., 98, S. 503 [1975]).
Kaninchen- oder Human-TNF-Gene enthaltende Restriktionsfragmente werden in Plasmidvektoren subgeklont und anschließend sequenziert.
5. Die Basensequenz der Kaninchen-TNF-cDNA wird mit der des Kaninchen-TNF-Gens verglichen, um die Exone (bestimmte Sequenzen von Basen, die für die Aminosäuresequenz von Kaninchen-TN F kodieren) und die Introne (bestimmte Sequenzen von Basen, die nicht für die Aminosäuresequenz von Kaninchen-TNF kodieren) des Kaninchen-TNF-Gens zu bestimmen.
6. Anschließend wird die Basensequenz des Human-TNF-Gens mit der des Kaninchen-TNF-Gens verglichen, um die Exone und Introne des Human-TNF-Gens zu bestimmen.
7. Die Aminosäuresequenz von Kaninchen-TNF, die von der Basensequenz deduziert wurde, die durch Auslöschen der Introne des Kaninchen-TNF-Gens und Kombinieren der Exone davon gewonnen wurde, wird als mit der von der Basensequenz der Kaninchen-TNF-cDNA deduzierten übereinstimmend bestätigt.
8. Als nächstes wird die Aminosäuresequenz des für die Erfindung zu verwendenden Human-TNF von der Basensequenz derfür den Human-TNF kodierenden DNA deduziert, die durch Auslöschung der Introne des für den Human-TNF kodierenden Gens und Kombinieren von deren Exonen gewonnen wurde. Die Aminosäuresequenz des Human-TNF wird als teilweise mit der das Kaninchen-TNF übereinstimmend bestätigt.
9. Dann wird die für den Human-TNF kodierende DNA in vitro für die Insertion in ein passendes Expressionvehikel angepaßt, um die kodierende DNA enthaltende Rekombinant-DNA zu bilden. Die Rekombinant-DNA wird zur Transformation einer passenden Wirtszelle verwendet, die ihrerseits in einer Kultur wachsen und den verlangten Human-TNF verwirklichen kann.
10. Derauf diese Weise erzeugte Human-TNF hat 155 Aminosäurereste in seiner ausgereiften Form, beginnend mit Serin. Wenn er ein Signalpeptid in seiner Präsequenz besitzt, hat das Signalpeptid eine sehr hydrophobe Beschaffenheit.
Oben wurden die Verfahrensweisen für die Gewinnung des für den Human-TNF kodierenden Gens, die Basensequenzen derfür den Human-TNF kodierenden DNA und die Verfahren für die Erzeugung von Human-TNF durch die Verwendung der DNA offenbart. Man sollte aber beachten, daß durch die obige Beschreibung nicht beabsichtigt ist, das Verfahren zu begrenzen, und daß einleuchtende Veränderungen von Fachleuten vorgenommen werden können.
Infolge der variablen Anwendungshäufigkeit eines Codons (genetischen Kodes), der jeder Aminosäure entspricht, und aus anderen Gründen, kann ein teilweiser oder vollständiger Abschnitt der Basensequenz der für Human-TNF kodierenden DNA durch eine organochemisch synthetisierte künstliche DNA ersetzt werden, ohne daß dadurch die Aminosäuresequenz des daraus gewonnenen Polypeptids verändert würde.
Wahrscheinlich kann der Human-TNF intrazellulär in unausgereifter Form als ein Präpeptid oder Präpropeptid erzeugt werden, das über eine Zwischenform zu einem ausgereiften Human-TNF im Verarbeitungsstadium verarbeitet werden kann. Die unausgereifte Form von Human-TNF kann von der Basensequenz des Human-TNF-Gens deduziert werden. Die DNA, die eine den Human-TNF in unausgereifter oder Zwischenform verschlüsselnde DNA aufweist, kann gleichfalls mit einer natürlichen oder künstlich synthetisierten DNA rekombiniert werden.
Eine Anwendungsmöglichkeit dieser Technik könnte die Einfügung des Methionincodons (ATG) in das 5'-Ende und die Einfügung mindestens eines unter TAA, TAG und TGA ausgewählten Stoppcodons in das 3'-Ende der ausgereiften oder Zwischen- oder unausgereiften TNF-DNA umfassen. Infolge des Vorhandenseins des Methionincodons kann der ausgereifte oder Zwischen-oder unausgereifte Human-TNF an der mit Hilfe eines entsprechenden Promotors synthetisierten mRNA erzeugt werden. Allerdings wird der an den N-Terminusdes Human-TNF angefügte Methioninrestje nach der Art der verwendeten Wirtszelle gespalten oder nicht gespalten. Durch das Einfügen des Stoppcodons soll die Translation der mRNA, die von derfür die physiologisch aktive Substanz kodierenden DNA transkripiert wurde, an einer passenden Position (C-Terminus von Polypeptid der Formel I) gestoppt werden.
Eine andere Anwendungsmöglichkeit dieser Technik könnte die Zugabe einer stark hydrophoben Basensequenz, die als „Signalsequenz" bekannt ist, zu der DNA umfassen. Durch diese Zugabe könnte es möglich werden, den Human-TNF nach außerhalb der Wirtszelle, oder im Falle eines gramnegativen Bakteriums, in den als „Periplasma" bekannten Raum auszuscheiden.
Wenn ein Vektor mit einem eingebauten Startcodon verwendet wird, kann ein verschmolzenes Peptid erzeugt werden, das aus dem Human-TNF und einem auf den Vektor zurückzuführenden Peptid besteht. In diesem Fall kann das verschmolzene Peptid chemisch oder enzymatisch gespalten werden. Alternativ kann das verschmolzene Peptid auch, wenn die Hauptaktivität des Human-TNF nicht nachteilig beeinflußt wird, so wie es ist verwendet werden.
Die für Human-TNF kodierende DNA kann in ihrer vor dem 5'-Ende liegenden Region mit der Gensequenz eines Promotors verbunden werden, um dadurch eineTNF-DNA-Promotorsequenzzu erhalten, die ihre Replikation nicht behindert und nicht dazu führt, daß die Translation der resultierenden RNA nachteilig beeinflußt wird. Die auf diese Weise gewonnene TNF-DNA-Promotorsequenz kann mit einem in einer Bakterien- oder Zelle eines höheren Organismus replizierbaren Vektor kombiniert werden, um eine Rekombinant-DNA zu erhalten. Die so gewonnene Rekombinant-DNA kann zur Transformation einer als Wirt verwendeten Bakterien-oder Zelle eines höheren Organismus verwendet werden. Der dabei gewonnene Transformant kann zur Expression der für den Human-TNF kodierenden DNA gezüchtet werden, um den Human TNF zu erzeugen. Wenn Escherichia coli als der oben genannte Wirt verwendet wird, dann können als der geeignete Wirt verschiedene Mutantenstämme von E.coli K-12 angeführt werden, wie HB101 (ATCC33694), 0600K(ATCCaSSSB), D1210, RRI (ATCC31343), MC1061,LE392(ATCC33572),JM101 (ATCC33876), JM83 (J.Vieira und J.Messing, Gene, 19,259-268 [1982]), JM103 (Ray Wu, u.a., Method in Enzymology, Bd. 101, Academic Press, New York) und X1776 (ATCC31244). Wenn der E. coli-Wirt verwendet wird, dann können als der geeignete Vektor Plasmide wie pBR322, pBR325, pBR327, pUC3, pUC9, pMB9 (ATCC37019) pJB8 (ATCC37074) und pKC7 (ATCC37084), λ-Phagen wie Xgt, XB und Charon 4A und M13 Phage genannt werden. Damit die aktive Substanz in der E.coli Zelle erzeugt wird, kann ein unter den Promotoren der E.coli und Phagengene ausgewählter Promotor eingesetzt werden. Beispiele für den geeigneten Promotor umfassen die Gene für Lactoseabbauenzym (LAC), UV5-Mutanten davon, Penicillinase (BLA) und Tryptophansynthetase (TRP), λ-Phage PL-Promotor und tac-Promotor, bei dem es sich um einen verschmolzenen Promotor von Tryptophansynthetase und Lactoseabbauenzym handelt.
Wenn Bacillussubtilis als der Wirt verwendet wird, dann sind als der geeignete Wirt BD170 Stamm (ATCC33608), BR151 Stamm (ATCC33677) und Ml 112 Stamm (ATC33712) zu nennen. Wird der Bacillus subtilis Wirt eingesetzt, dann sind als der geeignete Vektor die Plasmide pC194(ATCC37034), pUB110 (ATCC37015), pSA2100 (ATCC37014) und PE 194 zu nennen. Außerdem können bei Verwendung des Bacillus subtilis Wirtes die Gene Chloramphenicolacetylierungsenzym (CAT), Penicillinase und Anti-Erythromycin als der geeignete Promotor angesehen werden.
Wenn eine Hefe als der Wirt verwendet wird, so kommen als der geeignete Wirt Stämme von Saccaromyces cerevisiae wie RH 218 (ATCC44076), SHY1 (ATCC44769), SHY3 (ATCC44771), D131A, 483 und 830 in Frage. Wenn der Hefewirt verwendet wird, so können als der geeignete Vektor Plasmide wie YEp 13, (ATCC37115), YEp 6, YRp 7 und YIp 5 angeführt werden. Außerdem sind bei Verwendung des Hefewirtes als geeigneter Promotor die Gene für Säurephosphatase, Alkoholdehydrogenase (ADHI), Tryptophansynthetase (TRP), Phosphoglyceratkinase (PGK), Cytochrom B (COB) und Actin zu nennen.
Der auf diese Weise erzeugte Transformant wird nach einem herkömmlichen Verfahren im großen gezüchtet, um den verlangten Human-TNFzu erzeugen. Wenn ein Transformant verwendet wird, der den Human-TNF ausscheiden kann, wird die überstehende Flüssigkeit der Kultur des Transformanten als wäßrige Lösung gesammelt, die ungereinigten Human-TNF enthält. Andererseits werden, wenn ein Transformant verwendet wird, der den Human-TNF nicht ausscheiden kann, sondern den darin befindlichen Human-TNF ansammelt, die gezüchteten Zellen des Transformanten gesammelt und lysiert, um dadurch einen lysierten Zellextrakt als wäßrige Lösung, die ungereinigten Human-TNF enthält, zu gewinnen.
Die dadurch gewonnene und ungereinigten Human-TNF enthaltende wäßrige Lösung kann direkt der Säulenchromatographie unterzogen werden, bei der eine mit einem erfindungsgemäßen farbstoffgebundenen vernetzten Agarosegel gefüllte Säule verwendet wird. Alternativ kann, bevor die erfindungsgemäße Säulenchromatographie vorgenommen wird, die ungereinigten Human-TNF enthaltende wäßrige Lösung teilweise gereinigt werden, wobei die unten angeführte herkömmliche biochemische Technik einzeln oder in Kombination angewandt wird, um eine wäßrige Lösung zu erhalten, die den teilweise gereinigten Human-TNF enthält. Als geeignetes biochemisches Verfahren zur teilweisen Reinigung von Human-TNF sind beispielsweise eine Aussalzungsmethode unter Verwendung von Ammoniumsulfat, eine lonenaustauschchromatographie zur Entfernung eiweißhaltiger Verunreinigungen unter Verwendung eines Anionenaustauscherharzes wie DEAE-Sepharose (Pharmacia Fine Chemical AB, Schweden), Behandlung mit einer wäßrigen Polymin-P-Lösung zur Entfernung von Nucleinsäuren, Wärmebehandlung zurEntfernung eiweißhaltiger Verunreinigungen, eine Gelfiltrationstechnik, eine Elektrophoresetechnik und dergleichen zu nennen.
Wie oben erwähnt, wird bei dem erfindungsgemäßen Verfahren eine physiologisch aktive Substanz in roher Form enthaltende wäßrige Lösung der Säulenchromatographie unter Verwendung einer mit einem farbstoffgebundenen vernetzten Agarosegel gefüllten Säule unterzogen. Die eine physiologisch aktive Substanz in roher Form enthaltende wäßrige Lösung (anschließend häufig als „wäßrige rohe physiologisch-aktive Substanz-Lösung" bezeichnet), die für die Erfindung verwendet werden soll, enthält sowohl dieoben genannten ungereinigten Human-TNF enthaltenden wäßrigen Lösungen als auch teilweise gereinigten Human-TNF enthaltende wäßrige Lösungen.
Ein erfindungsgemäß vorgesehenes farbstoffgebundenes vernetztes Agarosegel kann durch kovalente Bindung eines Farbstoffes als einen Liganden an ein vernetztes Agarosegel als Träger nach einer Triazin-Kopplungsmethode von Böhme, u. a., (J.Chromatogr.,69, S. 209-214 [1972]) hergestellt werden. Als vernetztes Agarosegel kann jedes im Handel erhältliche vernetzte Agarosegel, z. B. Sepharose (hergestellt und vertrieben von Pharmacia Fine Chemicals AB, Schweden) eingesetzt werden. Als erfindungsgemäß zu verwendender Farbstoff sind beispielsweise Cibäcron Blue F3GA (Farbindexbezeichnung: Reaktivfarbstoff Blau 2), Procion Red HE3B (Farbindexbezeichnung: Reaktivfarbstoff Rot 120), Green A (zu beziehen von Amicon Corporation, USA, in Form von Green Α-gebundenem Agarosegel unter dem Warenzeichen „Matrex Gel Green A") und dergleichen anzuführen. Die chemischen Strukturen von Cibaron Blue F3GA und Procion Red HE 3B werden durch die folgenden Formeln (1) bzw. (2) dargestellt, in denen sie in Form eines Cibaron Blue F3GA-gebundenen vernetzten Agarosegel (Mätrex Gel Blue A) bzw. Procion Red HE3B-gebundenen vernetzten Agarosegels (Mätrex Gel Red A) (jeweils hergestellt und vertrieben von Amicon Corporation, USA) gezeigt werden.
SO2ONa
(1)
Mätrex Gel
NaOO2S
SO2ONa
(2)
SO2ONa
Matrex Gel
Die farbstoffgebundenen vernetzten Agarosegele sind im Handel erhältlich. Als Cibaron F3GA-gebundenes vernetztes Agarosegel empfiehlt sich beispielsweise die Verwendung von Blue SepharoseCL-6 B (hergestellt und vertrieben von Pharmacia Fine Chemical AB, Schweden), Affigel Blue (hergestellt und vertrieben von Bio Rad Laboratories, USA), Mätrex Gel Blue A (hergestellt und vertrieben von Amicon Corporation, USA) und dergleichen. Als das Procion Red HE3B-gebundene vernetzte Agarosegel empfiehlt sich zum Beispiel Mätrex Gel Red A (hergestellt und vertrieben von Amicon Corporation, USA) und dergleichen. Als das Green Α-gebundene vernetzte Agarosegel empfiehlt sich Mätrex Gel Green A (hergestellt und vertrieben von Amicon Corporation, USA) und dergleichen.
Das oben erläuterte farbstoffgebundene vernetzte Agarosegel wird in eine Säule eingefüllt und für die Säulenchromatographie verwendet. Die erfindungsgemäße Säulenchromatographie wird wie folgt ausgeführt.
Die mit einem farbstoffgebundenen vernetzten Agarosegel gefüllte Säule wirrfmit einem 0,1 M NaCI enthaltenden Puffer (pH-Wert 5,5 bis 6,5) ausreichend äquilibriert. Als Puffer können beispielsweise Phosphatpuffer und dergleichen verwendet werden. Auf die in dieser Weise äquilibrierte Säule wird eine wäßrige rohe-physiologisch-aktive-Substanz-Lösung aufgebracht. Es empfiehlt sich, den pH-Wert der wäßrigen rohe-physiologisch-aktive-Substanz-Lösung auf 5,5 bis 6,5 einzustellen. Anschließend wird die Säule mit dem gleichen oben genannten Puffer gründlich gewaschen. Danach wird die Eluierung vorgenommen, wobei als Eluierungsmittel ein Puffer verwendet wird, dessen Natriumchloridkonzentration höher als die des für die Äquilibrierung der Säule verwendeten Puffers ist, zum Beispiel ein Puffer, der 0,5 M oder mehr NaCI enthält. Alternativ kann die Eluierung auch unter Verwendung eines Puffers mit einem pH-Wert von 8,0 oder höher als Eluierungsmittel ausgeführt werden. Auf diese Weise wird eine Fraktion gewonnen, die den Human-TNF in im wesentlichen reiner Form enthält. Mit Hilfe des erfindungsgemäßen Verfahrens kann der Human-TNF in im wesentlichen reiner Form und in hoher Ausbeute gewonnen werden. Außerdem kann das farbstoffgebundene vernetzte Agarosegel im Gegensatz zu dem herkömmlichen spezifischen antikörpergebundenen vernetzten Agarosegel wiederholt mit Erfolg unter verhältnismäßig harten Bedingungen dauerhaft verwendet werden. Erfindungsgemäß kann Human-TNF daher gleichbleibend im großen beigeringen Kosten gereinigt werden. Des weiteren ist zu erwähnen, daß die Behandlung eines für die Säulenchromatographie vorgesehenen Adsorptionsmittels mit einer wäßrigen alkalischen Lösung zur Entfernung von Pyrogenen, die im Adsorptionsmittel enthalten sind und unerwünschte Verunreinigungen bei pharmazeutischer Verwendung darstellen, bekannt ist, und daß ebenso die Sterilisation eines für die Säulenchromatographie vorgesehenen Adsorptionsmittels mit Hilfe eines Autoklaven bekannt ist. Allerdings kann weder eine Behandlung mit einer wäßrigen alkalischen Lösung noch die Sterilisation mit Hilfe eines Autoklaven für ein bei herkömmlichen Affinitäts-Chromatographietechniken vorgesehenes antikörpergebundenes vernetztes Agarosegel angewandt werden, weil es gegenüber einer alkalischen Bedingung oder Hitze nicht resistent sein kann. Im Gegensatz dazu ist das erfindungsgemäß zu verwendende farbstoffgebundene vernetzte Agarosegel gegenüber einer wäßrigen alkalischen Lösung und Hitze resistent und kann daher der Behandlung mit einer wäßrigen alkalischen Lösung unterzogen werden, so daß Pyrogene, bei denen es sich um unerwünschte, in dem farbstoffgebundenen Agarosegel enthaltene Verunreinigungen bei pharmazeutischer Verwendung handelt, leicht entfernt werden können, und die Sterilisation unter Verwendung eines Autoklaven erfolgen kann.
Der auf diese Weise gereinigte Human-TNF besitzt eine Antitumor-Aktivität und übt dabei keine toxische Wirkung auf normale Zellen aus. Zum Beispiel wird bei einem in vivo Versuch (der später erläutert wird), bei dem Meth A Sarcom in eine Maus transplantiert wurde, die Aktivität bei Verabreichung von 300 Einheiten des erfindungsgemäß gewonnenen gereinigten Human-TNF an die Maus mit (+) bewertet. Auch eine erhebliche Wachstumsinhibition oder Regression des Krebses wird nach Verabreichung des gereinigten Human-TNF bei den Mäusen, denen Colon-Karzinom Colon 26 transplantiert wurde, im Vergleich zu den Kontrollmäusen beobachtet, denen eine physiologische Kochsalzlösung injiziert worden war. Außerdem wird die zytotoxische Wirksamkeit des gereinigten Human-TNF gegenüber verschiedenen Krebszellen in fast der gleichen Weise wie bei der in vitro Versuchsmethode, die später erläutert wird, ermittelt, nur wurden KB-Zellen (Adenocarcinom), PC-8-Zellen (Lungenkrebs) und normale Zellen (fetale Human-Nierenzellen und fetale Human-Vorhautzellen) als Kontrollen anstelle von L-M-Zellen verwendet und die Zellen 72 Stunden lang bei 32°C inkubiert und nicht 48 Stunden lang bei 37°C.
Wie oben erläutert, besitzt der nach dem erfindungsgemäßen Verfahren gewonnene Human-TNF eine ausgezeichnete Antitumor-Wirkung und stammt vom Menschen. Daher ist der erfindungsgemäß gewonnene Human-TNF besonders nützlich, wenn der Human-TNF klinisch als Antitumor-Medizin verabreicht wird.
Anschließend wird das bei der Beurteilung der Antitumor-Wirkung des nach dem erfindungsgemäßen Verfahren gereinigten Human-TNF angewandte Analyseverfahren ausführlich erläutert.
(1) In vivo Analyseverfahren (Analysemethode unter Verwendung von Mäusen, denen Meth A Sarcom transplantiert wurde) Als das in vivo-Verfahren ist beispielsweise die Methode von Carswell, u. a., Proc. Nat. Acad. Sei USA, 72, (1975) 3666 zu nennen. Das von den Erfindern angewandte Verfahren wurde durch Verbesserung der oben genannten Methoden entwickelt. Bei dem Verfahren werden Meth ASarcom-Zellen (2 χ 10s Zellen) intradermal in jede der BALB/c-Mäuse transplantiert. Nach 7 Tagen werden Mäuse mit Tumoren mit einem Durchmesser von 7 bis 8mm, ohne hämorrhagische Necrose und guter Vaskularisierung für die Beurteilung ausgewählt. Eine Probe des mit einer physiologischen Kochsalzlösung verdünnten Human-TNF (0,5ml) wird durch die Schwanzvene jeder Maus injiziert. Die Wirksamkeit der Probe wird nach 24 Stunden nach folgendem Kriterium bewertet:
(-): keine Veränderung
(+): leichte hämorrhagische Necrose
( ++): mittlere hämorrhagische Necrose (zentrale Necrose, die sich über annähernd 50% dertransplantierten Tumoroberfläche
erstreckt) (+ ++): ausgeprägte hämorrhagische Necrose (massive Necrose in der Mitte des transplantierten Tumors, wobei ein kleiner lebensfähiger Rand an der Tumorpheripherie übrig ist)
(2) In vitro Analysemethode (Analysemethode unter Verwendung von L-M-Zellen)
Als das in vitro Verfahren zur Beurteilung der Wirksamkeit von Human-TNF ist beispielsweise das Verfahren von Ruff (Lymphokines, Bd.2, herausgegeben von E. Pick, Academic Press, N. Y. [1980] 235) und die Methode aus (J. Immunol., 126, [1981] 1279) zu erwähnen.
Das von den Erfindern angewandte Verfahren wurde durch Verbesserung der oben genannten Methoden entwickelt. Das erfindungsgemäße Verfahren, bei dem die zytotoxische Aktivität von Human-TNF gegenüber L-M-Zellen (American Type Culture Collection CCL 1,2) gemessen wird, wird wie folgt ausgeführt. Eine serienweise mit dem Medium und der L-M-Zellen-Suspension (0,1 ml, 1 χ 105 Zellen/ml) verdünnte Probe (0,1 ml) des Human-TNF wird in jede Vertiefung von 96-Vertiefungen-Mikrotiter-Platten (Flow Laboratories, Inc. USA) gegeben. Als Medium diente Eagle's minimal essentielles Medium, das 10 V/V% fetales Kalbsserum enthielt (die Zusammensetzung wird zum Beispiel in Tissue Culture, herausgegeben von Junnosuke Nakai, u.a., Asakura Shoten, 1967 beschrieben). Die Platten werden bei 370C 48 Stunden lang in einer 5% Kohlendioxid enthaltenden Luft inkubiert. Nach Beendigung der Kulturperiode werden 20μ\ einer 20%igen wäßrigen Lösung von Glutaraldehyd zum Festigen der Zellen zugesetzt. Nach der Fixierung werden die Platten gewaschen und zum Trocknen stehen gelassen, und es wird 0,1 ml 0,05%ige Methylenblaulösung zum Färben der lebensfähigen Zellen zugegeben. Die Platten werden gründlich zur Entfernung von überschüssigem Methylenblau gewaschen und trocknen gelassen. Anschließend wird 3%ige Chlorwasserstoffsäure in jede Vertiefung gegeben, um das Methylenblau aus den gefärbten Zellen zu extrahieren. Das Absorptionsvermögen jeder Vertiefung bei 665Nm wird mitTitertekMultiskan (Flow Laboratories, Inc. USA) gemessen. Das Absorptionsvermögen ist der Anzahl von lebensfähigen Zellen proportional. Die Verdünnung des Human-TNF, durch die das Absorptionsvermögen der Stubstanz gleich 50% des Absorptionsvermögens der Kontrollgruppe wird, der keine Probe des Human-TNF zugesetzt worden war, wird durch ein Diagramm oder durch Berechnung erhalten. Die Verdünnung wird als eine Einheit (U)/ml angegeben.
(3) Eiweißbestimmung
Die Eiweißmenge wird nach einem Verfahren von Lowry, u.a., (J.Biol.Chem., 193, S.265 [1951]) bestimmt.
Die Erfindung wird anschließend ausführlich unter Bezugnahme auf die folgenden Bezugsbeispiele, Arbeitsbeispiele und Vergleichsbeispiele beschrieben.
Bei der praktischen Ausführung der Erfindung werden die Konstruktion einer Rekombinant-DNA und das Einfügen einer Rekombinant-DNA in einen Mikroorganismus in Übereinstimmung mit der in den folgenden Versuchsberichten beschriebenen Verfahrensweise ausgeführt.
(1) Yasutaka Takagi, Manuel for Genetic Engineering, Kodan-sha
(2) Yasutaka Takagi, Experimental Method in Genetic Engineering, Kodan-sha
(3) T. Maniatis, E. F. Fritsch, J. Sambrook, Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Laboratory, USA
(4) Ray Wu, u. a., Method in Enzymology, Bd. 101, Academic Press, USA.
Außerdem wird die Rückgewinnung in den folgenden Beispielen und Vergleichsbeispielen durch die folgende Gleichung bestimmt:
Gesamtmenge (Einheiten) des Human-TNF in der durch Reinigungsschritte gewonnenen Fraktion
Rückgewinnung (%) x 100
Gesamtmenge (Einheiten von Human-TNF in der Rohlösung
Darüber hinaus wird der Reinigungsgrad durch die folgende Gleichung bestimmt:
Spezifische Aktivität (U/mg) von Human-TNF in der durch die Reinigungsschritte gewonnenen Fraktion
Reinigungsgrad (Male)
Spezifische Aktivität (U/mg) des Kulturextraktes
Ausführungsbeispiele
In den Bezugsbeispielen und Beispielen verwendete Abkürzungen
MOPS: Morpholinopropansulfonsäure
LB Medium: Luria-Bertani Medium
DMSO: Dimethylsulfoxid
PFU: Plaque-Bildungseinheit
EDTA: Ethylendiamintetraessigsäure
SDS: Natriumdodecylsulfat
BRL: Bethesda Research Laboratories Inc.
DMT: Dimethoxytrityl
Iac: Lactose
Tris: Tris(hydroxymethyl)aminomethan
XAR-5: Röntgenfilm, hergestellt und vertrieben von Eastman Kodak Company, USA
1 x SSC: ",löMNaCI + O^löMNatnumcitratpH-Wert?
2 χ SSC: 0,30 M NaCI + 0,030 M Natriumcitrat, pH-Wert 7
3 χ SSC: 0,45MNaCI + 0,045 M Natriumcitrat,pH-Wert7
5 χ SSC: 0,75 M NaCI+ 0,075 M Natriumcitrat, pH-Wert7
6 χ SSC: 0,90 M NaCI + 0,090 M Natriumcitrat,pH-Wert7
FDSS: 50% entionisiertes Formamid + 5x Denhardt's +5 x SSPE+ 0,1 %SDS + 100 ^g/ml denaturierte
Kalbs-Thymus-DNA
SSPE: 0,15 M NaCI+ 1OmM NaH2PO4 + 1 mM EDTA,pH-Wert7,4
SM: Phagenspeichermedium, das 5,8 g NaCI, 2 g MgSO4 · 7 H20,50 ml 1 M Tris-Cl (pH-Wert 7,5) und 5 ml 2%ige
Gelatine pro Liter enthält
NZ-Nährlösung: Medium, das 10g NZ-Amin, 5 g NaCI und 2 g MgSO4 · 7 H2O enthält (NZ-Amin ist ein Typ-A-Hydrolysat von
Casein, hergestellt und vertrieben von Humko Sheffield Chemical Division of Kraft, Inc. USA) IPTG: Isopropylthiogalactosid
x-gal: S-Brom-S-chlor-S-indolylgalactosid
TAE: 0,04 M Tris-acetat (pH-Wert 8,0) —0,002MEDTA
5 χ Denhardt's Eine wäßrige Lösung, die Ficoll 1 000 mg, Polyvinylpyrrolidon 1 000 mg und BSA1 000 mg pro Liter enthält Lösung:
BP: Basenpaar , Bezugsbeispiel 1
Schritt 1
(Herstellung von TNF aus Kaninchenserum)
Weibliche Kaninchen rryt einem Gewicht von 2,5 bis 3,0kg erhalten eine Injektion von 50 mg mit Formalin getöteten Propionibacterium acnes (Corynebacterium parvum, Wellcome Research Laboratories, England) durch die Ohrvene. Nach acht Tagen werden 100μς Endotoxin (Lipopolysaccharid von Escherichia coli 026:B6, hergestellt von Difco Laboratories, USA) gleichfalls durch die Ohrvene injiziert, und 2 Stunden später wird Vollblut aus dem Herzen entnommen. Dem gesammelten Blut wird Heparinnatrium in einer Menge von 100 Einheiten je 100 ml zugesetzt. Das Blut wurde anschließend mit 5000 U/min 30 Minuten lang unter Kühlung zentrifugiert, um Blutzellen und unlösliche Feststoffe zu entfernen. Als Ergebnis wird ein Plasma (2,4 Liter) mit einer zytotoxischen Serum-TNF Aktivität von 3 χ 104 Einheiten/ml von 40 Kaninchen gewonnen.
Schritt 2
(Teilweise Reinigung von TNF aus Serum)
Zu dem in Schritt 1 gewonnenem Plasma (2,4 Liter) werden 24g CeIMt gegeben. Das resultierende Gemisch wird eine Stunde lang gerührt und danach filtriert. Das Filtratwird mit 1,2 Litern 0,04M Tris-HCI-Puffer (pH-Wert 7,8) vermischt und danach auf eine Säule von DEAE-Sepharose CL-6B (hergestellt und vertrieben von Pharmacia Fine Chemicals, Inc. Schweden) aufgegeben, die ausreichend mit 0,04M Tris-HCI-Puffer (pH-Wert 7,8) äquilibriert wurde. Die Säule wird mit 0,04 M Tris-HCI-Puffer, der 0,1 M NaCI enthält, gewaschen, und der adsorbierte TNF wird unter Verwendung von 0,04M Tris-HCI-Puffer (pH-Wert 7,2) der 0,18 M NaCI enthält, eluiert. Fraktionen, die Anzeichen für zytotoxische Aktivitäten gegenüber L-Zellen zeigen, werden durch Ultrafiltration konzentriert. Das auf diese Weise gewonnene Konzentrat wird auf eine Säule von Sephacryl S-200 (hergestellt und vertrieben von Pharmacia Fiqe Chemicals, Inc., Schweden) aufgegeben, ausreichend mit 5mM Phsophatpuffer äquilibriert und unter Verwendung des gleichen Puffers gel-filtriert. Die aktiven Fraktionen werden durch Ultrafiltration eingeengt, wodurch ein • gereinigterTNFmit einer Aktivitätvon 3,5 x 106 Einheiten und einer spezifischen Aktivitätvon 18 x 108 Einheiten/mg gewonnen wird.
Schritt 3
(Anti-TNF Antikörper)
Der teilweise in Schritt 2 gereinigte Kaninchenserum-TNFwird mit vollständigem Freund's Adjuvans (1:1) gemischt und dann subkutan in den Rücken.einer 12 Wochen alten männlichen BALB/c-Maus injiziert. Der obige Vorgang wird nach 2 und 4 Wochen nach der ersten Injektion wiederholt. Eine Woche nach der letzten Injektion wird Vollblut entnommen. Aus dem entnommenen Blut wird ein Serum gewonnen.
Das auf diese Weise gewonnene Serum wird dem Kulturmedium für die Beurteilung der zytotoxischen Aktivität von TNF gegenüber L-Zellen in einer solchen Menge zugesetzt, daß es 500fach in der endgültigen Konzentration verdünnt ist. Die zytotoxische Aktivität des Kaninchen-Serum-TNF gegenüber L-Zellen wird bestimmt. Es wurde gefunden, daß der Kaninchenserum-TNF keine Zytotoxizität gegenüber L-Zellen aufweist. Aus dem obigen Ergebnis kann die Schlußfolgerung gezogen werden, daß das in diesem Schritt gewonnene Mäuseserum einen Antikörper gegen den Kaninchenserum-TNF (anschließend als „Anti-TNF-Antikörper" bezeichnet) enthält.
Schritt 4
(Herstellung von TNF-erzeugenden Zellen)
Einem weiblichen Kaninchen werden intravenös mit Formalin getötete Zellen von Propionibacterium acnes (Corynebacterium parvum); Wellcome Research Laboratories, England) injiziert. Sieben Tage später wird an dem Kaninchen eineTracheotomie vorgenommen, und die Lunge wird mit einer physiologischen Kochsalzlösung gewaschen, wodurch schwimmende Zellen gewonnen werden. Die auf diese Weise gewonnenen Zellen werden mit einer physiologischen Kochsalzlösung gewaschen. Unter Verwendung von RPM11640 (Flow Laboratories, Inc., USA) als Kulturmedium, das 10V/V% fetales Kalbsserum enthält, werden die Zellen bei 37°C in 5% Kohlendioxid enthaltender Luft inkubiert. Die Zellkultur wird in zwei Gruppen geteilt, und zu einer Gruppe wird von Escherichia coli (Lipopolysaccharid von Escherichia coli 026: B 6, hergestellt von Difco Laboratories, USA) gewonnenes Endotoxin in einer Konzentration von 10^g/ml zugegeben. Die gleiche Menge steriles Wasser wird zu der anderen Gruppe gegeben. Die überstehende Flüssigkeit der Zellkultur, der Endotoxin zugesetzt worden war, zeigt zytotoxische Aktivität gegenüber L-Zellen, und die Aktivität erreicht den Höchstwert innerhalb von sieben Stunden. Diese Aktivität wird durch den Anti-TNF-Antikörper aufgelöst, jedoch nicht durch das normale Mäuseserum.
Dagegen zeigt die überstehende Flüssigkeit der Zellkultur, der kein Endotoxin zugesetzt worden war, keine Zytotoxizität gegenüber L-Zellen.
Schritt 5
(Relative Molekülmasse von TNF)
Zu der in Schritt 4 hergestellten Zellkultur, die den Endotoxin-Zusatz erhalten hatte, wird außerdem radioaktives L-(35S) Methionin (1 300Ci/mMol, hergestellt von Amersham Industries plc, England) gegeben (1 mCi/ml). Gemäß dem Verfahren von Laemmli (Laemmli, U. K. [1970], Nature [London], Bd. 227, S. 680-685) wird die überstehende Flüssigkeit mit Hilfe der SDS-Polyacrylamidgel-Elektrophorese analysiert. Die Gelkonzentration wird auf 12,5 Ma.-% eingestellt. Nach der Elektrophorese wird das Gel mit ENHANCE® (Warenzeichen eines Produktes von New England Nuclear Inc., USA) behandelt und nach dem Trocknen auf einem Röntgenfilm belichtet (Fuji RX, hergestellt und vertriebefi von Fuji Photo Film Co. Ltd., Japan). In der überstehenden Flüssigkeit der Zellkultur mit dem Endotoxin wurde beobachtet, daß eine Substanz mit einer relativen Molekülmasse von über 17500 gebildet wurde.
Des weiteren wird die überstehende Flüssigkeit der in Schritt 4 hergestellten Zellkultur in der gleichen oben beschriebenen Weise der SDS-Polyacrylamidgel-Elektrophorese unterzogen. Anschließend wird das Gel in 2,5% NP40® (einem oberflächenaktiven Mittel, vertrieben von Calbiochem, USA) eine Stunde lang geschüttelt und danach zwei Stunden lang in Wasser.
Nach dem Schütteln wird jede Wanderungsbahn durch Ausschneiden abgetrennt und zu Streifen von 2 mm Breite in einer senkrecht zur Wanderungsrichtung verlaufenden Richtung geschnitten. Jeder Streifen wird mit L-Zellen kultiviert und zytotoxische Aktivität gegenüber L-Zellen beurteilt. In der Bahn, auf der die das Endotoxin enthaltende überstehende Flüssigkeit der Zellkultur entwickelt wird, wird Zytotoxizität gegenüber L-Zellen an einer Stelle beobachtet, die der relativen Molekülmasse von 17500 entspricht. An anderen Stellen ist keine Zytotoxizität zu beobachten.
Schritt 6
(Extraktion von mRNA)
Die in Schritt 4 hergestellte Zellkultur wird nach der Zugabe von Endotoxin 2 Stunden lang inkubiert, worauf Zentrifugieren zum Sammeln der Zellen folgt. Die Extraktion von zytoplasmatischer RNA aus den gesammelten Zellen und die Extraktion von mRNA von der zytoplasmatischen RNA werden nach dem Verfahren von Chirgwin, u.a., (siehe Chirgwin, J. M., u. a., Biochemistry, Bd. 18, S. 5294 [1979]) vorgenommen. 4ml einer 4M Guanidinthiocyanatlösung werden zu 3 χ 10s Zellen gegeben, und das Gemisch wird mit Hilfe eines Homogenisators (Modell: AM-7, hergestellt und vertrieben von Nihon Seiki Seisakusho, Japan) pulverisiert. Die Rückstände werden durch Zentrifugieren entfernt, und 2,4g Cesiumchlorid werden darin gelöst. Das Gemisch wird vorsichtig in ein Polyallomer-Röhrchen gegossen, in das zuvor 2,5 ml 5,7 M Cesiumchlorid und 0,1 MEDTA-Lösung (pH-Wert 7,5) eingefüllt wordenwaren, und anschließend mit 30000 U/min 12 Stunden lang bei 2O0C unter Verwendung eines Bekcman SW41 Rotors (hergestellt und vertrieben von Beckman Instruments, USA) ultrazentrifugiert. Nach Entfernung der überstehenden Flüssigkeit wird das Pellet in 1 ml 10mMTris-HCI-Puffer (der 5 mM EDTA und 1 Ma.-/Vol.-% SDS enthält) gelöst. Die resultierende Lösung wird mit einem 4:1-VoI.-Gemisch von Chloroform und 1-Butanol extrahiert. Zu der wäßrigen Phase werden 0,05 Volumen 2 M Natriumacetat und 2,5 Volumen Ethanol gegeben, und das Ganze wird 2 Stunden lang bei -20°C oder länger stehen gelassen, um dadurch RNA auszufällen. Das Präzipitat wird durch Zentrifugieren gesammelt, getrocknet und anschließend in 500μΙ sterilem Wasser gelöst. Als Ergebnis wird eine zytoplasmatische RNA-Lösung gewonnen. Die oben gewonnene RNA-Lösung wird 2 Minuten lang auf 68°C erhitzt und danach schnell abgeschreckt. 500 μ.Ι einer zweifachen Konzentration von 10mMTris-EDTA-Puffer (pH-Wert 7,4) (der 1mM EDTA, 0,1 Ma.-/Vol.-%SDS und 0,5 M Lithiumchlorid enthält) werden zu der Lösung gegeben, und das Gemisch wird auf eine 200-mg-Oligo-dT-Cellulosesäule (hergestellt und vertrieben von Bethesda Research Laboratories Inc., USA) aufgegeben und mit 10ml des gleichen Puffers (einfache Konzentration) wie oben beschrieben gewaschen. Das von der Säule zurückgehaltene Material wird mit 2 ml eines Eluierungspuffers, der 1OmM Tris-HCI-Puffer, pH-Wert 7,4,1 mM EDTA und 0,1 M/Vol.-% SDS enthält, eluiert. Dem Eluat werden 0,05 Volumen Natriumacetatlösung und 2,5 Volumen Ethanol zugesetzt, und die Mischung wird zur Ausfällung auf-200C abgekühlt. Das Präzipitat wird durch Zentrifugieren gesammelt und auf die Oligo-dT-Cellulose-Säule aufgegeben, und die auf der Oligo-dT-Cellulose adsorbierten Fraktionen werden gesammelt. 85/xg mRNA werden zurückgewonnen, wie durch die Ultraviolettspektrumanalyse bestimmt wurde.
Schritt 7
(Größenfraktionierung von mRNA)
880 ^g mRNA, die nach dem gleichen Verfahren wie in Schritt 6 beschrieben hergestellt wurde, werden in 250μ,Ι Wasser gelöst, und die resultierende Lösung wird auf einen 10ml 5 bis 25% linearen Sucrose-Dichtegradienten aufgebracht. Der Sucrose-Dichtegradient wird mit Hilfe des ISCO570 Gradienters (hergestellt und vertrieben von ISCO Inc., USA) unter Verwendung von Tris-Pufferlösung (die 25mM Tris-HCI (pH-Wert 7,2), 2 mM EDTA und 1 Ma.-/Vol.-% SDS enthält), der 5% Sucrose bzw. 25% Sucrose enthält, hergestellt.
Mit Hilfe des Beckman SW41 Rotors wird die Ultrazentrifugierung mit 40 000 U/min 12 Stundenlang bei 4°C vorgenommen, und Fraktionen von je 400/xl werden mit Hilfe eines Fraktion-Rückgewinnungsgerätes (hergestellt und vertrieben von Beckman Instruments, USA) zurückgewonnen und anschließend in Ethanol ausgefällt. Die ausgefällten Fraktionen werden zentrifugiert
- IU- £tU £- IU
Schritt8
(Versuch der Translation von mRNA)
Die Translation von mRNA unter Verwendung von Oocyten von Xenopus laevis (biologisches Lehrmaterial von Hamamatsu) wird nach der in den Versuchsberichten (zum Beispiel Hiroshi Teräoka, Miko Itsuki und Kentaro Tanaka, „Protein, Nucleic acid. Enzyme" Genetic Engineering, Sonderausgabe, 1981, S. 602) beschriebenen Verfahrensweise durchgeführt. Xenopus laevis wird von biologischem Lehrmaterial von Hamamatsu bezogen. In Schritt 5 gewonnene fraktionierte mRNA wird in sterilem Wasser gelöst, um eine Konzentration von 1 μg/μ.l zu erzielen, und die Lösung wird in Oocyten in einer so geringen Menge von 5OnI je Zelle injiziert. Die Zellen werden anschließend 24 Stunden lang in Barth's Lösung (die7,5mMTris-HCI [pH-Wert 7,6], 88mM NaCI, 1 mM Kaliumchlorid, 0,33mM Calciumnitrat, 0,41 mM Calciumchlorid, 0,82mM Magnesiumsulfat, 2,4mM Natriumhydrogencarbonat, 18U/ml Penicillin G und 18^g/ml Streptomycin enthält), die 1 mg"/ml Rinderserumalbumin enthält, gezüchtet. Die Oocyten werden in der Kulturflüssigkeit mit Hilfe eines Glasstabes zerstoßen. Die Kulturflüssigkeit wird danach zentrifugiert, und die überstehende Flüssigkeit wird auf zytotoxische Aktivität gegenüber L-Zellen analysiert. mRNA wird translatiert, um ein Polypeptid zu ergeben, das Sedimente von maximaler Aktivität mit einer Größe von 16S hat. Diese Aktivität wird durch den in Schritt 3 gewonnenen Anti-TNF-Antikörper eliminiert, jedoch nicht durch das normale Mäuseserum.
Schritt 9
(Herstellung von Transformanten)
Unter Verwendung von 5^g der in Schritt 7 gewonnenen fraktionierten mRNA wird in Übereinstimmung mit dem in Literaturangabe (1), Seite 96, beschriebenen Verfahren eine doppelsträngige DNA erzeugt. Als die Revers-Transcriptase wird ein Produkt von Life Science, Inc., USA verwendet. Diedoppelsträngige DNA wird auf einem 3,5%igen Polyacrylamidgel größenfraktioniert, und es wird 330ng Fraktion von annähernd 1000 bis 2000 BP gewonnen. Nach der in Literaturangabe (1) beschriebenen Verfahrensweise werden 7 ng dieser Fraktion mit DesoxyC-Resten unter Verwendung von Terminal-Desoxynucleotidyl-Transferase (hergestellt und vertrieben von Bethesda Research Laboratory Inc., USA) verlängert und mit 56 ng Plasmid pBR 322 geglüht, das mitPstl digeriert und mit DesoxyG-Resten verlängert worden war. Das in dieser Weise geglühte Gemisch wird in den E.coli.K-12Stamm (HB 101, ATCC33694) zur Transformation des Stammes eingefügt. Infolgedessen werden 12000 Transformanten gewonnen.
Schritt 10
(Partial-Aminosäure-Sequenz von Kaninchen-TNF)
Teilweise in Schritt 2 gereinigter Kaninchen-TNF (Aktivität: 5 x 107 Einheiten) wird derSDS-Polyacrylamidgel-Elektrophorese zur Reinigung wie in Schritt 5 unterzogen. Ein Teil des Gels wird mit Coomassie Brilliant Blue gefärbt. Ein Band wird an der einen relativen Molekülmasse von 17000 entsprechenden Stelle aus dem Gel ausgeschnitten und mit 1%igem Ammoniumhydrogencarbonat extrahiert. Etwa 180/zg TNF werden als Eiweiß gewonnen.
150/ng des zurückgewonnenen TNF werden in 75μΙ 1%igem Ammoniumhydrogencarbonat gelöst, worauf die Zugabe von 3;u.g TPCK Trypsin (hergestellt und vertrieben von Worthington Biochemical, USA) folgt. Das Gemisch wird 4 Stunden lang bei 37°C inkubiert. Das Gemisch wird anschließend mit Hilfe einer Hochleistungs-Flüssigkeits-Chromatographiesäule, die Cosmosil 5C8 (hergestellt und vertrieben von Nakarai Chemical, Ltd.) als Füllmaterial enthält, fraktioniert, um dadurch mit Trypsin digerierte Fragmente zu gewinnen.
Der stark gereinigte TNF und die trypsin-digerierten Fragmente werden danach mit Hilfe einer Sephadex G-25 Säule entsalzt und anschließend gefriergetrocknet. Nach der Methode von R. M.Hewick, u.a. (siehe J. Biol. Chem., Bd. 256, S. 7990-7997,1981) werden gereinigter TNF und typsin-digerierte Fragmente jeweils der Edman-Degradation vom N-Terminal unterzogen. In jedem Schritt freigesetzte PTH-Aminosäure wird nach dem herkömmlichen Verfahren mit Hilfe eines Hochleistungs-Chromatographie-Modells SP8100 (hergestellt und vertrieben von Spectra Physics, USA) unter Verwendung von Solpacks ODS (hergestellt und vertrieben von E. I. Du Pont, USA) als Säule analysiert. Als Ergebnis wird gefunden, daß TNF die folgende N-Terminal-Aminosäuresequenz besitzt: Ser-Ala-Ser-Arg-AIa-Leu-Ser-Asp-Lys-Pro-Leu-Ala-His-Val-Val-Ala-Asn-Pro-GIn-Val-Glu-Gly-Gln-Leu-Gln-
Eines dettrypsin-digerierten Fragmente hat die folgende N-Terminal-Aminosäuresequenz: GIu Thr Pro GIu GIu Ala GIu Pro Met AIa
Schritt 11
(Synthese von Oligodesoxynucleotid-Sonde)
Oligodesoxynucleotide, die zu der Basensequenz von mRNA komplementär sind, die von der in Schritt 10 gewonnenen Aminosäuresequenz von Kaninchen-TNF abgeleitet wurde, werden nach dem verbesserten Phosphotriester-Verfahren synthetisiert, über das der Erfinder bereits in H. Ito, u.a., „Nucleic Acid Res.", 10,1755-1769 (1982) berichtet hat. Bei der Herstellung von Oligodesoxynucleotiden werden 128 von der Aminosäuresequenz von Kaninchen-TNF berechnete Oligodesoxynucleotide in fünf Gruppen eingeteilt, und zwar in Gruppen von 16,16,32,32 und 32, und werden als Mischungen von Oligodesoxynucleotiden der jeweiligen Gruppen synthetisiert. Von den gewonnenen Oligodesoxynucleotiden der jeweiligen Gruppen wird die Schutzgruppe nach dem herkömmlichen Verfahren entfernt, und sie werden mit Hilfe von Säulenchromatographie unter Verwendung von Sephadex G-50 (hergestellt und vertrieben von Pharmacia Fine Chemicals, Inc., Schweden), Elektrophorese auf einem 20 Ma.-% Polyacrylamidgel, das 7 M Harnstoff enthält, und Säulenchromatographie unter Verwendung von DE52 (hergestellt und vertrieben von Whatman Ltd., USA) gereinigt. Die auf diese Weise gewonnenen Oligodesoxynucleotide der jeweiligen Gruppe werden gegen 0,1 mM Tris-EDTA-Pufferlösung dialysiert.
Jedes der gereinigten Oligodesoxynucleotide der entsprechenden Gruppe wird unter Verwendung von T4 Poly0nucleotid-Kinase (hergestellt und vertrieben von Bethesda Research Laboratories, Inc., USA) und 32-P-Adenosintriphosphat nach dem herkömmlichen Verfahren markiert und anschließend durch Säulenchromatographie unter Verwendung von DE52 (hergestellt und vertrieben von Whatman Ltd., USA) gereinigt. Das radioaktive Material wird in einer Menge von etwa 3x108cpm jug in jedes der Oligodesoxynucleotide der entsprechenden Gruppe eingebaut. Die in Form einer Mischung der jeweiligen Gruppe gewonnenen Oligodesoxynucleotid-Sonden werden wie in Tabelle 1 gekennzeichnet.
EinTeil der Aminosäuresequenz von Kaninchen-TNF, der Basensequenz von mRNA, berechnet aus der Aminosäuresequenz von Kaninchen-TNF, und der Basensequenzen von synthetischen Oligodesoxynucleotid-Sonden der jeweiligen Gruppen werden in Tabelle 1 gezeigt.
Anmerkung:
X stellt einen Ribonucleinsäurerestvon A, C, G oder U dar.
Y stellt einen Ribonucleinsäurerest von A oder G dar.
M stellt einen Desoxyribonucleinsäurerest von T oder C dar.
N stellt einen Desoxyribonucleinsäurerest von A oder G dar.
Z stellt einen Desoxyribonucleinsäurerest von A, C, G oder T dar.
| Aminosäure | Carboxyl | Ala | Met | Pro | GIu | Ala | GIu | GIu... | Amino |
| sequenz | terminal... | XCG | GTA | XCC | YAG | XCG | YAG | YAG | terminal |
| mRNA | 3' | GC | CAT | MGG | MTC | GGC | MTC | MTC | 5' |
| Sonde MH | 5' | GC | CAT | NGG | MTC | GGC | MTC | MTC | 3' |
| Sonde Ml | OJ | GC | CAT | ZGG | MTC | AGC | MTC | MTC | 3' |
| Sonde MJ | 5' | GC | CAT | ZGG | MTC | CGC | MTC | MTC | 3' |
| Sonde MK | 5' | GC | CAT | ZGG | MTC | TGC | MTC | MTC | 3' |
| Sonde ML | 5' | 3' | |||||||
Schritt 12
Untersuchung von Oligodesoxynucleotid)
Dienach Schritt 6 gewonnene mRNA der TNF erzeugenden Zellen wird mit einer 1 M Glyoxal, 1OmM NaH2PO4 und 50 Vol.-% Dimethylsulfoxid enthaltenden Lösung 60 Minuten lang bei 50°C behandelt und anschließend unter Anwendung von Elektrophorese auf einem 1,1 Ma.-% Agarosegel fraktioniert. Die fraktionierte mRNA wird nach den Hinweisen des Herstellers auf ein Filter eines Transfer-Tüpfel-Gerätes vom Elektrophorese-Typ (hergestellt und vertrieben von Bio-Rad, USA) übertragen. Danach wird die mRNA auf dem Filter des Gerätes mit einer 5 χ Denhardt's-Lösung,die eine 5 χ SSC-Lösung und 150,ug/ml denaturierte Lachs-Spermatozoen-DNA enthält, 2 Stundenlang bei 650C behandelt, und anschließend mit einer 5 χ Denhardt's-Lösung, die 1 x 107cpm/ml der markierten Oligodesoxynucleotide und eine 5 x SSC-Lösung enthält, 2 Stunden lang bei 500C behandelt. Das oben gewonnene Filter wird mit einer 6 x SSC Lösung viermal nacheinander bei Raumtemperatur, 400C, 500C und 60°C gewaschen. Ein XAR-5 Röntgenfilm (hergestellt und vertrieben von Eastman Kodak Company, USA) wird mit der Strahlung von dem Filter belichtet. Dadurch wird festgestellt, daß die durch Sonde MJ bezeichneten Oligodesoxynucleotide mit der mRNA am stärksten hybridisiert werden, woraus sich ergibt, daß das Oligodesoxynucleotid mit einer Basensequenz, die der mRNA vollkommen komplementär ist, in den durch Sonde MJ bezeichneten Oligodesoxynukleotiden vorhanden ist.
Schritt 13
(Klonen von TNF-Gen)
Nach der in Literaturangabe (2), Seite 162, beschriebenen Verfahrensweise werden die in Schritt 9 erhaltenen Transformanten auf ein Zellulosefilter übertragen, und die DNA der Transformanten wird mit dem in Schritt 12 ausgewählten markierten Oligodesoxynucleotid (Sonde MJ) unter den gleichen Bedingungen wie in Schritt 12 hybridisiert (Koloniehybridisierung). Bei der obigen Verfahrensweise werden 49 Kolonien, die mit den markierten Oligodesoxynucleotiden (Sonde MJ) stark hybridisiert wurden, ausgewählt und weiter auf einem anderen Nitrocellulose^lter untergebracht. Danach wird unter Verwendung von 49 Kolonien weitere Hybridisierung vorgenommen, um neun Kolonien auszuwählen, die mit den markierten Oligodesoxynucleotiden (Sonde MJ) stärker hybridisiert sind.
Nach dem in der Literaturangabe (1), Seite 6, beschriebenen Schnell-Plasmid-Trennverfahren werden etwa 5/x.g Plasmid von jeder der neun Kolonien gewonnen. Jedes der gewonnenen Plasmide wird unter Verwendung von Restriktionsenzymen PstI, Taql, Rsal und Pvull (jeweils hergestellt und vertrieben von Bethesda Research Laboratories, Inc., USA) nach der im Handbuch des Herstellers beschriebenen Verfahrensweise gespalten, worauf Elektrophorese auf einem 1 Ma.-% Agarosegel folgt. Dann werden die durch Spaltung durch die entsprechenden Restriktionsenzyme gewonnenen Fragmente hinsichtlich ihrer Länge verglichen.
Die Ergebnisse führen zu der Schlußfolgerung, daß alle den neun Kolonien entsprechenden neun Stämme die Basensequenz des durch Spaltung durch Pvull und Rsal gewonnenen und aus etwa 5OBP bestehenden Fragments haben und daß die meisten der neun Stämme die Basensequenz des durch Spaltung durch Rsal gewonnenen und aus etwa 200BP bestehenden Fragments besitzen. Mit anderen Worten, die Ergebnisse besagen, daß die neun Stämme teilweise gemeinsam Basensequenzen besitzen. Die Ergebnisse der Analyse mit Hilfe der Restriktionsenzyme sind die Fig. 1 wiedergegeben.
Sieben Stämme, die in der folgenden Tabelle 2 bezeichnete Plasmide enthalten, werden getrennt in 2 ml LB-Medium, das 10/xg/ml Tetracyclin enthält, gezüchtet, bis die optische Dichte der Lösungen die in der folgenden Tabelle 2 angeführten Werte zeigt, worauf Zentrifugieren zur Gewinnung entsprechender Stämme folgt. Jeder der gewonnenen Stämme wird einzeln in 2 ml physiologische Kochsalzlösung gegeben und durch Beschallung zerrissen. Die gewonnenen Lösungen werden zentrifugiert, und die zytotoxische Aktivität gegenüber L-Zellen der gewonnenen überstehenden Flüssigkeit wird bestimmt. Die Ergebnisse sind in der folgenden Tabelle 2 enthalten. Als Blindversuch werden die gleichen oben erläuterten Vorgänge unter Verwendung ' eines Plasmid pBR322 enthaltenden Stammes wiederholt. Die Ergebnisse enthält die folgende Tabelle 2.
— I 4L — CT\I €. I \>
| Anzahl von geglühten | ODeoo | Zytotoxische | |
| Basenpaaren | Aktivität gegen | ||
| L-Zellen | |||
| Plasmid | (Einheit/ml) | ||
| pB2-2 | 1400 | 1,369 | 35 |
| pB 2-3 | 800 | 1,605 | <10 |
| pB 2-7 | 1060 | 1,364 | <10 |
| pR9 | 1550 | 1,618 | <10 |
| pR12 | 1400 | 1,458 | 15 |
| pR18 | 1850 | 1,438 | <10 |
| pR25 | 1350 | 1,514 | <10 |
| pBR322 | 0 | 1,677 | <10 |
Die zytotoxische Aktivität gegenüber L-Zellen wird durch Anti-TNF-Antikörper eliminiert, aber nicht durch normales Mäuseserum. Daraus geht hervor, daß alle oben genannten neun Kolonien Plasmide haben, die für TNF kodierende Oligodesoxynucleotide enthalten.
Schritt 14
(Bestimmung der Basensequenz von für Kaninchen-TNF kodierender DNA)
E. coli Stämme, die die Plasmide pB2-7 und pR 18 enthalten, werden in einem Liter M 9-Medium gezüchtet, das in Literaturangabe (3), Seite 440, beschrieben wird und 10/xg/ml Tetracyclin enthält. Anschließend wird nach der in Literaturangabe (3), Seite 90, beschriebenen Verfahrensweise jedes der Plasmide in einer Menge von etwa 150/xg isoliert.
Die Basensequenz des Inserts jedes Plasmids wird nach dem chemischen Verfahren von Maxam-Gilbert, beschrieben in Maxam, u. a., „Method in Enzymology", 55, S. 490 (1980), Academic Press, bestimmt. Von der auf diese Weise bestimmten Basensequenz wurde ermittelt, daß sie mit den in Schritt 9 bestimmten Partial-Aminosäuresequenzen übereinstimmt. Somit ist anzunehmen, daß die gesamte Sequenz von TNF ermittelt ist.
Schritt 15
In diesem Schritt wird die Konstruktion eines Plasmids unter Verwendung des Rekombinatplasmids pR12 ausgeführt, um die direkte Expression von TNF in E. coli unter Verwendung von Iac als Promotor zu erzielen. Die Verfahren werden schematisch in Fig. 2 gezeigt. Zunächst werden 10μg Plasmid pR12 mit 10 Einheiten Apal (hergestellt und vertrieben von Bethesda Research Laboratories, Inc., USA) zwei Stunden lang bei 370C digeriert und auf einem 4Ma.-% Polyacrylamidge! elektrophoresiert, um 630BP-Fragmentezu isolieren. Annähernd 1/i.g des Fragmentes werden durch Elektroeluierung von dem Gel isoliert. In der gleichen Weise wie in Schritt 10 werden zwei in Fig. 2 gezeigte Oligodesoxynucleotide, und zwar 5'-GATCCATGTCAGCTTCTCGGGCC-3' und Ö'-CGAGAAGCTGACATG-S', synthetisiert. Anschließend wird jedes 5'-Ende der Oligodesoxynucleotide (etwa 10OpMoI) unter Verwendung vonT4-Polynucleotidkinase nach dem in Literaturangabe (3), Seite 122, beschriebenen Verfahren phosphoryliert. Nach Beendigung der Reaktion wird das Reaktionsgemisch mit Phenol und anschließend mit Chloroform extrahiert. Danach werden die gewonnenen synthetischen Oligomere mit0,5/xg des Apal 630 BP-Fragmentes vermischt und mit Ethanol ausgefällt.
Das Fragment wird nach der in Literaturangabe (1), Seite 37, beschriebenen Verfahrensweise mit den synthetischen Oligomeren über Nacht bei 4°C unter Verwendung von 10 Einheiten T4-DNA-Ligase ligiert. Nach Beendigung der Reaktion wird das Reaktionsgemisch mit Ethanol ausgefällt und mit 20 Einheiten BamHI drei Stunden lang bei 37°C degeriert, worauf Elektrophorese auf einem 4Ma.-% Polyacrylamidgel zur Gewinnung eines etwa 670BP Fragmentes durch Elektroeluierung folgt. 1 /x.g handelsübliches Plasmid pUC-8 (Katalog-Nr. 4916, hergestellt und vertrieben von P-L-Biochemicals, Inc., USA) wird mit BamHI digeriert und mit Phenol und anschließend mit Chloroform extrahiert, worauf Ethanolpräzipitation zur Gewinnung eines Vektors folgt. 0,5/xg des gewonnenen Vektors werden mit dem oben gewonnenen Fragment, das BamHI Stellen an seinen beiden Enden besitzt und etwa 67OfUrTNF kodierende BP enthält, unter Verwendung von T4-DNA-Ligase ligiert. Gemäß dem in der Literaturangabe (4), Seite 20, beschriebenen Verfahren wird E.coli unter Verwendung des oben gewonnenen Vektors transformiert und auf einem Agarmedium, das 1 mM IPTG und 0,004% (M/V) X-gal enthält, gezüchtet, um etwa 200 weiße Kolonien zu erhalten. Plasmid-DNA wird aus 100 dieser Transformanten hergestellt und mit BamHI digeriert. Als Ergebnis wird festgestellt, daß 15 Plasmide das vorgesehene BamHI-Fragment (etwa 670 BP) enthalten. Zur Untersuchung der Einfügungsrichtung werden die obigen 15 Plasmide mit EcoRI, das nur eine Erkennungsstelle an seinem pUC-8 hat, und Pvull, das nur eine Erkennungsstelle an seinem etwa 670-Basenpaar-Fragmentteil hat, digeriert und auf einem 6Ma.-% Polyacrylamidgel elektrophoresiert. Als Ergebnis wurde ermittelt, daß 7 Plasmide das aus etwa 140 BP bestehende beabsichtigte Fragment haben und daß dieTranscriptionsrichtung des lac-Promotors an pUC-8 mit der der für TNF kodierenden Oligodesoxynucleotide übereinstimmt.
Die DNA-Sequenzanalyse zeigt, daß diese sieben Plasmide die gleiche Sequenz haben sowie die erwünschte Nucleotidsequenz an den Verbindungsstellen zwischen dem lac-Promotor, synthetischer DNA und cDNA.
Schritt 16
Die Konstruktion weiterer Plasmide wird unter Verwendung des Plasmids pR17, um die direkte Expression von TNF in E. coli zu erzielen, unter Einsatz von lacUV5als Promotor ausgeführt. Die Verfahren sind schematisch in Fig. 3 gezeigt. Zunächst werden 10/i,g des Plasmids pR 17 mit 10 Einheiten Apal (hergestellt und vertrieben von Bethesda Research Laboratories, Inc., USA) zwei Stunden lang bei 37°C degeriert und auf einem 4Ma.-% Polyacrylamidgel elektrophoresiert, um ein aus etwa 630 BP bestehendes Fragment zu isolieren. Etwa 1 /xg des Fragmentes wird von dem Gel durch Elektroeluierung isoliert. In der gleichen Weise wie in Schritt 10 werden zwei in Fig.3 gezeigte Oligodesoxynucleotide, und zwar 5'-AATTCATGTCAGCTTCTCGGGCc-S' und 5'-CGAGAAGCTGACATG-3' synthetisiert. Danach wird in Übereinstimmung mit dem in Literaturangabe (3), Seite 122, beschriebenen Verfahren jedes 5'-Ende der beiden Oligodesoxynucleotide (etwa 10OpMoI) unter Verwendung von T4-Polynucleotidkinase phosphoryliert. Nach Beendigung der Reaktion wird das Reaktionsgemisch mit Phenol und anschließend
mit Chloroform extrahiert. Danach werden die synthetischen Oligomere mit 0,5/ig des zuvor gewonnenen Apal-Fragmentes (etwa 630 BP), das von dem Plasmid pR17 hergestellt wurde, vermischt und mit Ethanol ausgefällt. Das Fragment wird mit den synthetischen Oligomeren über Nacht bei 4°C unter Verwendung von 10 Einheiten T4-Ligase nach dem in Literaturangabe (1), Seite 37, beschriebenen Verfahren ligiert. Nach Beendigung der Reaktion wird das Reaktionsgemisch mit Ethanol ausgefällt und mit 20 Einheiten EcoRI drei Stunden lang bei 37°Cdegeriert und anschließend der Elektrophorese auf einem 4Ma.-% Polyacrylamidgel unterzogen, um ein Fragment (etwa 670 BP) durch Elektroeluierung zu gewinnen.
In Übereinstimmung mit der von F. Fuller, „Gene", 19, S. 42-54 (1982) beschriebenen Verfahrensweise wird Plasmid pOP95-15 hergestellt.
1 ;ug pOP95-15 wird mit EcoRI digeriert und mit Phenol und anschließend mit Chloroform extrahiert, worauf Ethanolpräzipitation zur Gewinnung eines Vektors folgt. Unter Verwendung von T4-Ligase werden 0,5/xg des gewonnenen Vektors mit dem Fragment von (etwa 670BP) ligiert, das durch Ligation des synthetischen Oligonucleotids mit dem für TNF kodierenden Oligonucleotid gewonnen wurde. In Übereinstimmung mit der in Literaturangabe (4), Seite 20, beschriebenen Verfahrensweise wird E. coli JM101 (ATCC 33876) unter Verwendung oben gewonnenen Vektors transformiert und auf einem 1 mM IPTG und 0,004% (M/V)X-gal enthaltenden Medium gezüchtet, um etwa 150 weiße Kolonien zu erhalten.
Plasmid-DNA wird aus 100 dieser Kolonien hergestellt und mit EcoRI digeriert. Als Ergebnis wird gefunden, daß 12 Plasmide das verlangte EcoRI-Fragment (etwa 670 BP) enthielten. Zur Untersuchung der Einfügungsrichtung werden die obigen 12 Plasmide mit Pvull und Pstl digeriert und auf einem 1,5Ma.-% Agarosegel elektrophoresiert. Dadurch wurde ermittelt, daß vier Plasmide die verlangten Fragmente (etwa 1280BP und etwa 2600 BP) haben und daß dieTranscriptionsrichtung des Iac UV5-Promotors mit der der für TNF kodierenden Oligodesoxynucleotide übereinstimmt.
Die Basensequenzanalyse zeigt, daß diese vier Plasmide die gleiche Sequenz haben und daß der Iac UV5-Promotor, das synthetische Oligodesoxynucleotid und cDNA einwandfrei miteinander kombiniert sind. Die gewonnenen Plasmide werden als pTNF-lacUV5-1 bezeichnet.
Schritt 17
(Reinigung von durch E. coli erzeugtem TNF)
E. coli Stämme, die in Schritt 16 gewonnene Plasmide enthalten, werden in 50ml Ampicillin enthaltendem LB-Medium über Nacht gezüchtet. Danach werden die Stämme in 5 Liter, 100^g/ml Ampicillin enthaltendes LB-Medium übertragen und weitere drei Stunden lang bei 37°C gezüchtet. Bis zu einer endgültigen Konzentration von 1 mMwirdlsopropyl-ß-D-thiogalactopyranosid (hergestellt und vertrieben von Sigma Chemical Company, Inc., USA) zugesetzt. Die weitere Züchtung erfolgt 6 Stunden lang, worauf Kühlen folgt. Danach werden Stämme durch Zentrifugieren gesammelt. In der gleichen wie in Schritt 13 beschriebenen Weise werden die Stämme in 5 Liter 0,04 M Tris-HCI-Pufferlösung (pH-Wert 7,8) gegeben und durch Beschallung zerteilt, um eine Stamm-Eiweißlösung zu erhalten. Die gewonnene Lösung besitzt eine zytotoxische Aktivität gegenüber L-Zellen von 5 x 107 Einheiten/Liter.
Die gewonnene Lösung wird in dergleichen Weise wie in Schritt 2 gereinigt, um 1,2 x 106 Einheiten TNF zu gewinnen. Die spezifische Aktivität von TNF beträgt 6,8 χ 107Einheiten/mg.
Schritt 18
(Bewertung unter Verwendung von transplantiertem Meth A Sarcom bei Mäusen)
Eine in Schritt 17 gewonnene Probe (0,2 ml) von TNF wird mit Hilfe der oben beschriebenen in-vivo-Analysemethode beurteilt. Außerdem werden 20 Tage nach der Injektion der Probe Untersuchungen über die Rückbildung von Tumoren vorgenommen, und die Heilungsrate wird nach folgender Gleichung bestimmt:
Anzahl der Mäuse, die vollständig vom Tumor geheilt waren
Heilungsrate=
Anzahl derfür den Test eingesetzten Mäuse Die Ergebnisse sind in Tabelle 3 enthalten.
| Injizierte Menge von durch | Anzahl derfürden | Bewertung der Aktivität | Heilungs |
| E. coli erzeugtem | Test eingesetzten | von Proben (nach 1 Tag) | rate |
| Kaninchen-TNF | Mäuse | (nach 2OT.) | |
| Einheiten/Maus | - + + + + + + | ||
| 2x105 | 5 | 0 0 1 4 | 5/5 |
| Bezug | |||
| (physiologische | |||
| Kochsalzlösung) | 5 | 5 0 0 0 | 0/5 |
Schritt 1
(Transformatin von E. coli K12 Stamm MC1061 mitpR18, pB2-7 und pB2-2 Plasmiden)
Kolonien von E. coli K12 Stamm MC1016 werden mit jedem der Plasmide pR18, pB2-7 und pB2-2, die in Bezugsbeispiel 1 gewonnen wurden, nach herkömmlichen Verfahren transformiert. Spezielle Kolonien von E. coli K12 Stamm MC 1061 werden in LB-Medium gezüchtet, bis die optische Dichte der Kulturlösung 0,3 bei 550 nm erreicht hat. 50 ml der gezüchteten E. coli Kultur werden geerntet, mit einem 10 mM MOPS (pH-Wert 7,0) und 10 mM RbCI enthaltenden 25-ml-Gemisch gewaschen und in einem 0,1 M MOPS (pH-Wert 6,5), 5OmM CaCI2 und 1OmM RbCI enthaltenden 25-ml-Gemisch resuspendiert. Die resultierende Suspension wird 30 Minuten lang auf Eis gekühlt, zentrifugiert und in einem 2-ml-Gemisch des oben genannten Gemischs, das 0,1 M MOPS (pH-Wert 6,5), 5OmM CaCI2 und 1OmM RbCI enthält, und 20μ\ DMSO suspendiert. Zu einer 200-p.l-Aliquote der resultierenden Suspension werden getrennt 10μ.Ι von jeder der Plasmid-DNA-Lösungen gegeben. Jedes der resultierenden Gemische wird 30 Minuten lang auf Eis gekühlt und anschließend 60 Sekunden lang einem Wärmeschok von 44°C ausgesetzt. Unmittelbar darauf werden 5 ml des auf 370C vorgewärmten LB-Mediums zu jedem der erwärmten Gemische gegeben, worauf
- 14- £Λ\3 £. IO
eine einstündige Inkubation bei 37°C folgt. Die gewonnenen Kulturlösungen werden jeweils zentrifugiert, um Zellpellets zu bilden. Die überstehende Flüssigkeit wird verworfen, und es wird LB-Medium zugesetzt und gerührt, um jedes der Zellpellets wieder zu suspendieren. Jede der resultierenden Suspensionen wird auf eine LB-Agarplatte, die 30/xg/ml Tetracyclin enthält, aufgeimpft, worauf Inkubation bei 37°C über Nacht folgt. Als Ergebnis werden Kolonien von tetracyclinresistenten Transformanten gewonnen, die jeweils mit pR18, pB2-7 und pB2-2 Plasmiden transformiert worden waren.
Schritt 2
(Herstellung von pB2-7 und pR 18 Plasmid-DNAn)
Jeder der in Schritt 1 gewonnenen und jeweils mit pB 2-7 und pR 18 Plasmiden transformierten Transformanten wird herangezogen zu (1) Vermehrung des Transformanten und Verstärkung des Plasmids; (2) Ernte und Lysis des Transformanten; und (3) Reinigung der Plasmid-DNA, in Übereinstimmung mit den Verfahren, die auf Seite 88 bis 96 von T. Mahiatis, E. F. Fritsch und J. Sambrook in „Molecular Cloning", veröffentlich von Cold Spring Harbor Laboratory, USA beschrieben werden. Jeder der Transformanten wird in LB-Medium eingeimpft, das 30/Ag/ml Tetracyclin enthält, und unter kräftigem Schütteln bei 37°C inkubiert. DieserSchritt wird wiederholt, um die Vermehrung des Transformanten und die Verstärkung des Plasmids zu erzielen. Die Transformantkultur wird durch Zentrifugieren mit 4 000 g über einen Zeitraum von 10 Minuten bei 40C geerntet. Die überstehende Flüssigkeit wird verworfen. Das resultierende Pellet wird in 100 ml eiskälter STE (0,1 M NaCI, lOmMTris.CI [pH-Wert 7,8] und 1 mM EDTA) gewaschen und durch Kochen in einer Lösung von 20mg/ml Lysozym in 10mMTris-CI, pH-Wert 8,0, lysiert. Das viskose Produkt wird in ein Ultrazentrifugenröhrchen übertragen und mit25000U/min 30 Minuten lang bei 4°C zentrifugiert, um eine DNA-Lösung zu gewinnen. Das Volumen der DNA-Lösung wird gemessen. Zu jedem Milliliter wird genau 1g festes Cesiumchlorid gegeben, und es wird vorsichtig gemischt, bis das gesamte Salz gelöst ist. Zu je 10 ml Cesiumchloridlösung werden 0,8ml einer Lösung von Ethidiumbromid (10mg/ml in H2O) gegeben. Die endgültige Dichte der Lösung beträgt 1,55g/ml. Die Cesiumchloridlösung wird in ein für das Zentrifugieren geeignetes Röhrchen übertragen, und das übrige Röhrchen wird mit Leichtparaffinöl aufgefüllt. Das Zentrifugieren erfolgt mit 45000 U/min 36 Stunden lang bei 200C, um zwei Bänder von DNA zu gewinnen, wobei das obere Band davon aus linearer Bakterien-DNA und eingekerbter kreisförmiger Plasmid-DNA und das untere Band davon aus geschlossener kreisförmiger Plasmid-DNA besteht. Das untere Band von DNA wird durch eine subkutane, in der Seite des Röhrchens eingeführte Nadel in ein Glasröhrchen übertragen. Das Ethidiumbromid wird entfernt, und die wäßrige Phase wird gegen TE-Puffer dialysiert. Die Plasmid-DNA-Lösung wird mit RNase behandelt und mit einem gleichen Volumen von äquilibriertem Phenol extrahiert. Die wäßrige Phase wird auf eine in TAE (pH-Wert 8,0) und 0,1 % SDS äquilibrierte Säure von Bio-Gel A-150 aufgegeben. Die DNA in der Säule wird gewaschen, und ein Behälter von TE mit 0,1 % SDS wird zum Sammeln von Fraktionen angebracht. Die Fraktionen werden mit Ethanol ausgefällt, um eine reine Plasmid-DNA zu gewinnen.
Durch Ausführung der obigen Verfahren werden 250/Ag reine pB2-7-Plasmid-DNA und 134μg reine pR 18-Plasmid-DNA gewonnen.
Schritt 3
(Einkerb-Translation von reinen pB2-7-und pR18-Plasmid-DNAn)
Von der reinen, in Schritt 2 gewonnenen pB2-7-Plasmid-DNA werden 40/Ag genommen, mit Pstl-Restriktionsenzym digeriert und der Elektrophorese durch ein 4%iges Acrylamidgel unterzogen. Nach der Elektrophorese wird die DNA gefärbt, und das erwünschte Band wird ausgeschnitten, um einen Pstl-Insert zu isolieren.
Unter Verwendung von 500 ng des isolierten Pstl-Inserts wirdI die Einkerb-Translation in der Weise nach Maniatis,T., u.a., Proc. Natl. Acad. Sei. USA, 72,1184(1975) ausgeführt. Für die Einkerb-Translation wird das von Bethesda Research Laboratories Inc. USA erzeugte und vertriebene Nick Translation Kit verwendet, und 8OpMoI radioaktives dCTP werden in ein 25-μ,Ι-Reaktionssystem (mit400Ci/mMol) gegeben. Zu einer Mischung, bestehend aus: 2,5 /aI Lösung A (dNTP's Lösung) 2,5 μΙ Lösung B (500ng Test-DNA, nämlich Pstl-Insert) 5 μ\ heißem dCTP (3200CiZmMoI) 1,3 /aI kaltem dCTP (65 pMol, 50 pMol/μΙ dCTP) 11,2 /aI Lösung E (H2O)
22,5 μΙ (insgesamt)
werden 2,5/aI Lösung C (DNase, DNA Polymerase I) gegeben, und die Umsetzung wird 60 Minuten lang bei 15°C vorgenommen. Dann wird Lösung D (Stopp-Puffer) zu dem resultierenden Gemisch gegeben, um die Reaktion zu stoppen. Weiterhin wird Träger-TRN A zugesetzt, zweimalige Präzipitation in Ethanol vorgenommen und in 500μ,Ι Wasser gelöst. Die spezifische Aktivität je /ag DNA beträgt 9,3 x 107cpm.
Mit der reinen, in Schritt 2 gewonnenen pR 18-Plasmid-DNA werden gleichfalls die oben beschriebenen Verfahren zur Einkerb-Translation ausgeführt. Die spezifische Aktivität je/Ag DNA beträgt 7 x 107cpm.
Schritt 4
(Herstellung von Rsal-Insert-Fragment von pR 18-Plasmid-DNA)
80/Ag der pR 18-Plasmid-DNA werden mit Rsal Restriktionsenzym digeriert und der Elektrophorese durch ein 4%iges Polyacrylamidgel unterzogen. Die folgenden verlangten Bänder von Inserts werden ausgeschnitten und mit Hilfe der BND-Säule gereinigt:
etwa 640 BP 3,77/Ag (Rückgewinnung 52%) etwa 175BP 1,77/Ag (Rückgewinnung 50%)
Der obige etwa 640-BP-lnsert wird als 3'-Fragment von pR 18 bezeichnet (das bedeutet 3'-untranslatierte Region von pR 18) und der obige etwa 175-BP-lnsertwird alspR18-cfr bezeichnet (das bedeutet Kodierungsregion von pR18). Weiterhin werden die obigen Verfahren unter Verwendung von Pstl und Mstll Restruktionsenzymen anstelle von Rsal Restriktionsenzym wiederholt, um folgendes Band zu gewinnen: etwa 450BP 3,65//,g (Rückgewinnung 60%) Der obige Insert wird als 5'-Fragmentvon pR 18 bezeichnet.
-Ib- £.<*U £. I O
Schritt 5
(Isolierung des Human-Genom-TNF-Gens)
Der in Schritt 3 von Bezugsbeispiel 1 gewonnene 32P-markierte Plasmid pB2-7-lnsertwird als Hybridisierungssondezum Screenen von 106-Plaquesder Bakteriophage Charon 4A/Human-Genom-Sammlung verwendet, hergestellt durch Insertion in dieCharon4AEcoRI-Ligationsstelle (Blattner, u.a., „Science" 196,161 [1977]) größenbestimmter Fragmente von teilweise digerierter Hüman-DNA (Maniatis, u.a., „Cell" 15, 687 [1978]). Es wird das Plaque-Hybridisierungsverfahren von Benton und Davis (Benton und Davis, „Science", 196,180 [1977]) angewandt. Da nicht alle Bakteriophagen in der Ausgangskultur das erforderliche genetische Material zur Herstellung von Human-TNF besitzen, wird eine Sonde verwendet, die eine mit dem Kaninchen-TNF-Gen komplementäre Basensequenz besitzt. DNA von Phagenplaques mit dem erforderlichen genetischen Material erhielten die radioaktive Sonde und wurden anhand ihrer Radioaktivität identifiziert. Neun Hybridisierungsplaques wurden aus der Sammlung isoliert
Die Verfahren und Bedingungen sind wie folgt
1) Anzahl von Plaques:
~1 χ 106 Plaques (~4 χ 1O4Plaques/0 150mm Platte χ 25)
2) Übertragung auf Nitrocellulosefilter:
(siehe Benton und Davis, Science, 196,180 [1977])
3) Hybridisierung:
Zugabe von 1,25 χ 1Q5cpm/ml pB2-7-lnsert-Sonde, hergestellt in Schritt 3 von Bezugsbeispiel 2,42°C, 191Ah
4) Waschen:
2 χ SSC — 0,1 % bei Raumtemperatur, Eintauchzeit j10min x 4 1 x SSC-0,1% SDS bei 5O0C Eintauchzeit 30min χ 2
5) Belichtung:
XAR-5 (Eastman Kodak Company, USA) -80°C, 2 Verstärkerfolien, 39h
Bei dem obigen Screenen werden 12 in Frage kommende Stämme gewonnen. In dergleichen oben erläuterten Weise wird ein zweites Screenen zur Gewinnung von neun Stämmen ausgeführt, die das vorgesehene Fragment enthalten. Unter Anwendung dieser Stämme wird ein drittes Screenen in der gleichen oben erwähnten Weise ausgeführt, um neun Stämme zu erhalten, die das vorgesehene Fragment enthalten. Unter Anwendung der gewonnenen Stämme wird ein viertes Screenen vorgenommen, um zu bestätigen, daß die neun Stämme das vorgesehene Fragment enthalten. Die neun, das vorgesehene Fragment enthaltenden Bakteriophagen werden als HG-1 bis HG-9 bezeichnet.
Schritte
(Isolierung von Kaninchen-Genom-TNF-Gen)
Das in Schritt5 von Bezugsbeispiel 2 beschriebene Verfahren wird im wesentlichen wiederholt mit dem Unterschied, daß 106 Plaques von Bakteriophage Charon 4A/Kaninchen-Genom-Sammlung, die unter Verwendung von digerierter Kaninchen-DNA hergestellt wird (Maniatis, u.a., Cell, 15,687 [1978]), anstelle von digerierter Human-DN A verwendet wird. 6,7 χ 105 Plaques von Bakteriophage Charon 4 A/Kaninchen-Genom-Sammlung werden anstelle von 106 Plaques der Bakteriophage Charon 4A/Human-Genom-Sammlung verwendet. Dabei werden zwei Bakteriophagenstämme (RG-1 und RG-2) gewonnen, die das Kaninchen-Genom-TNF-Gen enthalten.
Schritt 7
(Southern Tüpfelanalyse von Humanklonen)
Unter Verwendung der in Schritt 5 von Bezügsbeispiel 2 gewonnenen Bakteriophagen HG-3, HG-6und HG-7 wird DNA von jedem Bakteriophagen nach den folgenden Verfahrensweisen gewonnen.
6 x 1010 Zellen von E. coli LE 392 (Wirtszelle) werden in 18 ml SM suspendiert, und 3 x 109 PFU von Bakteriophage HG-3 werden zugegeben, so daß die E. coli 20 Minuten lang bei 370C infiziert werden können. Danach wird die gewonnene Mischung zu 3 Litern NZ-Nährlösung gegeben, und die Kultur wird 23 Stunden lang bei 37°C geschüttelt. 60 ml CHCI3 werden der Mischung zugesetzt, und die Kultur wird weitere 30 Minuten lang geschüttelt. NaCI wird zu der Mischung bis zu einer endgültigen Konzentration von 1 M gegeben, das Gemisch wird 15 Minuten lang stehen gelassen, worauf Zentrifugieren zur Gewinnung der überstehenden Flüssigkeit folgt. Anschließend wird Polyethylenglycol (relative Molekülmasse: etwa 6000) zu der Mischung gegeben, so daß die Konzentration von Polyethylenglycol 10% (M/V) erreicht, und es folgt eine Abstehzeit von 22 Stunden bei 4°C. Bakteriophagen werden durch Zentrifugieren gesammelt. Die gewonnenen Bakteriophagen werden in 28ml SM suspendiert, und ein gleiches Volumen von CHCI3 wird zugegeben. Nach einer Rührzeit von 30 Sekunden mit Hilfe eines Vortex wird das Gemisch zur Gewinnung der wäßrigen Phase zentrifugiert. Der wäßrigen Phase wird SM zugegeben, so daß die Gesamtmenge 30 ml erreicht. 26,4g CsCI werden zu der gewonnenen Mischung gegeben und vorsichtig gelöst, worauf Ultrazentrifugieren (45000 U/min, 20 Stunden) zur Gewinnung von Bakteriophagen in Form eines Bandes folgt. Das gewonnene, Bakteriophagen enthaltende Gemisch wird gegen 1OmM NaCI — 50mMTris (pH-Wert 8) — 1OmM MgCI2 dialysiert. Danach werden EDTA, ProteinaseKundSDSzu dem Gemisch gegeben, so daß ihre Konzentrationen 20ηηΜ,50μ^/ΓηΙ bzw. 0,5% (M/V) betragen. Anschließend wird das Gemisch von Phenol und CHCI3 (1:1 Volumen) und dann mit CHCI3 extrahiert. Die gewonnene wäßrige Phase wird gegen 1OmM Tris (pH-Wert 8) — 1 mM EDTA dialysiert. Die Ultraviolett-Absorptionsmessung der gewonnenen wäßrigen Phase zeigt, daß reine DNA des Bakteriophagen HG-3 gewonnen wurde.
Im wesentlichen werden die gleichen Verfahrensweisen wie hinsichtlich der Herstellung von DNA des Bakteriophagen HG-3 beschrieben wiederholt, um DNAn von Bakteriophagen HG-6 und HG-7 zu gewinnen. Auf diese Weise werden 2920^g HG-3,1ΙΟΟμ-g HG-6und819/ig HG-7 gewonnen.
In Übereinstimmung mit der Southern-Methode (E. M. Southern, J. Mol.ßiol., 98,503 [1975]), wird die Southern Tüpfelanalyse der gewonnenen DNAn durchgeführt. Die Verfahren und Bedingungen sind wie folgt: 1) DNA:
HG-3 825 ng je Hg-6 935ngje Hg-7 685ngje
2) Digestion mit verschiedenen Restriktionsenzymen: 10 Einheiten BamHI, 10 Einheiten EcoRI 10 Einheiten BamHI + 10 Einheiten EcoRI 10 Einheiten Hindlll 10 Einheiten Hindlll + 10 Einheiten EcoRI 10 Einheiten Pvull
3) Elektrophorese: 0,8% Agarosegel TAE
28 V, 15,5 h
4) Übertragung auf Nitrocellulosefilter:
(siehe E. M.Southern, J. Mol. Biol.,98,503 [1975])
5) Prähybridisierung: 3OmIFDSS
6) Hybridisierung:
5'-Fragment {1 x 105cpm/ml) von pR18 (hergestellt in Schritt 4 von Bezugsbeispiel 2) 420C, 14h
7) Waschen:
2 χ SSC-0,1%SDS bei Raumtemperatur Eintauchzeit j 10 min χ 1 x SSC-0,1 % SDS bei 500C Eintauchzeit 30 min χ
8) Belichtung:
XAR-5 (Eastman Kodak Company, USA) -80°C, 2 Verstärkerfolien, 14h Die Ergebnisse der Hybridisierung sind in Tabelle 4 enthalten.
| Enzym | Klon (Bakteriophage) | Hybridisierungs-Fragmentgröße mit Sonde (pR 18) 5'-Ende 3'-Ende | «— < — |
| BamHI | HG-3 -6 -7 | 6,7 kb 11,2 kb 9,2 kb | <·— < — |
| BamHI + EcoRI | HG-3 -6 -7 | 2,9 kb 2,9 kb 2,9 kb | «— |
| EcoRI | HG-3 -6 -7 | 2,9 kb 2,9 kb 2,9 kb | <— |
| Hindlll + EcoRI | HG-3 -6 -7 | 2,9 kb 2,9 kb 2,9 kb | «— |
| Hindlll | HG-3 -6 -7 | 9,7 kb 4,1 kb 9,7 kb | 0,9 kb 0,9 kb 0,9 kb |
| Pvull | HG-3 -6 -7 | 2,2 kb 1,9 kb 2,2 kb |
Anmerkung: Das Symbol „<—" bedeutet, daß das gleiche Fragment hybridisiert.
Schritt 8 (Southern Tüpfelanalyse von Kaninchenklonen)
Im wesentlichen werden die gleichen Verfahrensweisen wie in Schritt 7 von Bezugsbeispiel 2 wiederholt, nur daß jede der Bakteriophagen RG-1 und RG-2 anstelle jeder der Bakteriophagen HG-3, HG-6und HG-7 verwendet werden. Damit wird die Southern-Tüpfelanalyse vorgenommen. Als Ergebnis zeigt sich, daß pR 18 5'-Fragment mit einem einzigen Bandfragment von Fragmenten hybridisiert wird, die durch Spaltung von RG-1 und RG-2 mit jeweils BamHI, EcoRI, BgIII, Hindlll und BamHI + EcoRI gewonnen wurden.
-17- Z4UZ1Ö
Schritt 9
(Konstruktion von Bakterioklonen, die Human-Genom-TNF-Gen enthalten)
Es wird das Verfahren von Landy, u.a. (Biochemistry, Bd. 13,2134 [1974]) zur Gewinnnung von DNA von HG-3 angewandt, wie sie im obigen Schritt 5 erhalten wurde. 33 μρ der resultierenden HG-3 DNA werden mit 80 Einheiten von EcoRI bei 37°C3 Stunden lang digeriert. Das Digest wird auf 1%igem niedrigschmelzendem Agarosegel elektrophoresiert (Bedingungen: 1 χ TAE, 20 V, 14,5h). Das 2,9-KB-Band wird nach der Beschreibung von T. Maniatis (Molecular Cloning, Cold Harbor Spring Laboratory, S.377 [1981]) von dem Agarosegel isoliert. Das ausgeschnittene Gel des 2,9-KB-Band-Abschnittes wird speziell 15 Minuten lang auf 65°C erhitzt. Das EcoRI-gespaltene HG-3-Fragment mit einer Länge von 2,9 KB (anschließend häufig als „HG-3/EcoRI-2,9-KB-Fragment" bezeichnet) wird durch dreimalige Extraktion mit Phenol und anschließend dreimalige Extraktion mit Ether von dem geschmolzenen Gel zurückgewonnen und anschließend mit Ammoniumacetat enthaltendem Ethanol ausgefällt. Dadurch werden 637ng (Ausbeute: etwa 30%) HG-3/EcoRI-2,9-KB-Fragment gewonnen.
255 ng des oben gewonnenen Fragmentes werden mit 56,5 ng EcoRI-gespaltenem pUC13 (J.Messing, Methods in Enzymology, Bd. 101,20 [1983]) unter Verwendung von 2,5 Einheiten von T4-Ligase 20 Stunden lang bei 4°C ligiert. E. coli K12 Stamm JM 83 wird unter Verwendung des oben gewonnenen Ligationsproduktes transformiert. Der E. coil K12 Stamm JM83 wird speziell in LB-Medium gezüchtet, bis die optische Dichte der Nährlösung 0,3 bei 550nm erreicht. 50 ml der gezüchteten E. coli K12 Stamm JM 83 Kultur werden gesammelt, mit 25 ml von 1OmM MOPS (pH-Wert 7,0) —1OmM RbCI gewaschen und erneut in 25ml 0,1 M MOPS (pH-Wert 6,5) — 5OmM CaCI2 — 1OmM RbCI suspendiert. Die Suspension wird 30 Minuten lang auf Eis gekühlt, zentrifugiert und erneut in einer Mischung von 2 ml 0,1 M MOPS (pH-Wert 6,5) — 5OmM CaCI2— 1OmM RbCI und 30μΙ DMSO suspendiert. Zu 203 μΙ der Suspension werden 10μ.Ι einer wäßrigen Ligationsproduktlösung gegeben, die 10 ng des Ligationsproduktes enthält. Die Mischung wird 30 Minuten lang auf Eisgekühlt und danach 60 Sekunden lang auf 4O0C erhitzt. Unmittelbar danach werden 5 ml auf 37 0C vorgewärmte LB-Nährlösung zu dem erhitzten Gemisch gegeben, worauf eine einstündige Inkubation bei 37°C folgt. Die gewonnene Kulturnährlösung wird zentrifugiert, und die überstehende Flüssigkeit wird entfernt. Zu dem resultierenden Zellpellet wird ein LB-Medium gegeben und dann auf eine 30/xg/ml Ampicillin und 40^g/ml X-gal enthaltende LB-Platte aufgeimpft. Den E. coli K12 Stamm JM 83 enthaltende Kolonien, die mit den den Insert enthaltenden Plasmiden transformiert wurden, sind weiß, während die E. coli K12 Stamm JM83 enthaltenden, die nur mit dem Plasmid transformiert wurden, blau sind. Die gewonnenen weißen Kolonien werden wieder auf eine 30/tg/ml Ampicillin und 40jug/ml X-gal enthaltende LB-Platte zur Bestätigung aufgeimpft.
Von den oben gewonnenen weißen Kolonien werden zehn Kolonien (Bakterienklone) ausgewählt und unter Anwendung einer Mini-Präp-Technik gescreent.
Jede Kolonie wird über Nacht in 30/xg/ml Ampicillin enthaltendem LB-Medium gezüchtet. Die gewachsenen Zellen werden gesammelt und in einer Lösung, die 2 mg/ml Lysozym — 5OmM Glucose— 10mM EDTA—25 mM Tris-HCI (pH-Wert 8,0) enthält, suspendiert. Die Suspension wird 5 Minuten lang bei Raumtemperatur stehen gelassen, worauf die Zugabe von 200μ.Ι 0,2 N NaOH — 1% SDS folgt. Nach langsamem Rühren bleibt die Suspension 2 min bei Raumtemperatur stehen. Anschließend werden 150μ.Ι 3 M Natriumacetat (pH-Wert 5,2) zugegeben, worauf eine Abstehzeit von 10 min bei -200C vorgesehen ist, auf die Zentrifugieren von 15 min zur Rückgewinnung der resultierenden überstehenden Flüssigkeit folgt. Der überstehenden Flüssigkeit werden 900μ.1 kaltes Ethanol zugesetzt, worauf Zentrifugieren über einen Zeitraum von 5 min zur Gewinnung des resultierenden Präzipitats folgt. Das gewonnene Präzipitatwird mit70%igem Ethanol gewaschen und zur Gewinnung einer Plasmid-DNA getrocknet. Durch das oben erläuterte Verfahren werden zehn Plasmid-DNAn gewonnen.
Jede Plasmid-DNA wird in 1OmM Tris — 0,1 mM EDTA (pH-Wert 8,0) gelöst, mit EcoRI digeriert und zur Restriktionsanalyse elektrophoresiert. Die Bedingungen für die Digestion und Elektrophorese sind wie folgt: Digestion: Plasmid-DNA-Lösung, ein Fünftel der oben hergestellten Menge; EcoRI, 3 Einheiten; 370C;.11/2h. Elektrophorese: 1%iges Agarosegel; 1x TAE; 120V, 2h.
Die obige Restriktionsanalyse zeigt, daß acht von zehn Klonen positiv sind. Das heißt die acht Klone haben 2,9-KB-Fragment. Von den acht positiven Klonen wird ein Klon ausgewählt und als E. coli Stamm JM83 (pHGE) (ATCC 39656) bezeichnet. Im wesentlichen werden die gleichen Verfahren wie oben in Schritt 2 zur Herstellung von 1,89 mg pHGE DNA wiederholt, nur daß-E. coli K12 Stamm JM 83 (pHGE) anstelle von pB2-7 und pR 18 aufweisenden E. coli verwendet wird.
Schritt 10
(Subklonen von EcoRI-gespaltenem RG-1)
30/Ltg im obigen Schritt 6 hergestelltes RG-1 werden mit EcoRI digeriert. Aus dem resultierenden Fragmentgemisch wird das Fragment mit einer Länge von etwa 3,5 KB in im wesentlichen dergleichen Weise wie oben in Schritt 9 zurückgewonnen, nur werden dafür das oben hergestellte Fragmentgemisch und 0,8%iges niedrig-schmelzendes Agarosegel eingesetzt. Auf diese Weise wird 1,0^g EcoRI-gespaltenes RG-1 Fragment (etwa 3,5KB) gewonnen. Das oben gewonnene EcoRI-gespaltene RG-1 Fragment (3,5KB) wird an EcoRI-digeriertes pUC13 in im wesentlichen der gleichen Weise wie in Schritt 9 oben ligiert, nur wird das oben gewonnene EcoRI-gespaltene Fragment (3,5 KB) anstelle von EcoRI-gespaltenem HG-3 Fragment (2,9 KB) verwendet. Die Transformation von E. coli K12 Stamm JM83, das Screenen von Bakterienklonen, die Digestion von Klonen und die Elektrophorese werden in im wesentlichen der gleichen Weise wie in Schritt 9 ausgeführt, nur wird das oben gewonnene Ligationsprodukt verwendet. Der gewonnene Klon wird als E. coli K12 Stamm JM83(pRGE) (ATCC 39655) bezeichnet. Im wesentlichen werden die gleichen Verfahrensweisen wie im obigen Schritt 2 zur Herstellung von 1,70 mg pRGE DNA wiederholt, mit dem Unterschied, daß E. coli K12 Stamm JM 83 (pRGE) anstelle von pB2-7und pR-18 verwendet wird.
Schritt 11
(Restriktionsenzymanalyse von pHGE Plasmid DNA)
Die Restriktionsenzymanalyse von pHGE Plasmid DNA, die im obigen Schritt 9 gewonnen wurde, wird nach dem von Maniatis (Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Laboratory, 98 [1982]) beschriebenen Verfahren vorgenommen. Die angewandten Verfahrensweisen und Bedingungen sind wie folgt
T) Digestion von pHGE DNA mit EcoRI: 18,6A<.gpHGEDNA 64 Einheiten EcoRI 37°C, 2 h 2) Ethanolpräzipitation: Präzipitat
3) Zugabe von destilliertem Wasser zum Präzipitat: Herstellung von ^\μg/μ\ EcoRI-gespaltenem pHGE Stamm
4) Digestion mit verschiedenen Restriktionsenzymen: 1(ugpHGE/EcoRI Restriktionsenzym:5 Einheiten Pvull, 5 Einheiten Pvull + 10 Einheiten Rsal, 10 Einheiten Rsall, 4 Einheiten Mstll, 3 Einheiten Aval, 9 Einheiten Pstl
5) Elektrophorese:
2%iges Agarosegel, 1 x TAE, 28 V, 14,5 h
6) Übertragung auf Nitrocellulosefilter:
(siehe E. M.Southern, J. Mol. Biol., 98,503 [1975])
7) Erste Prähybridisierung: 3OmIFDSS
8) Erste Hybridisierung:
5'-Fragment (5 x 104cpm/ml) von pR 18 (hergestellt im obigen Schritt 4) 42°C, 14h
9) Waschen:
2 x SSC — 0,1% SDS, bei Raumtemperatur i ' Eintauchzeit 10 min χ 1 x SSC-0,1 % SDC bei 500C Eintauchzeit 30min χ
10) Belichtung:
XAR-5 (Eastman Kodak Company, USA) -800C, 2 V Verstärkerfolien, 17,5h
11) Auswaschen:
0,5M NaOH-1,5M NaCI (Eintauchzeit: 1 min) 0,5MTris —1,5M NaCI (Eintauchzeit: 1min)
3 x SSC (Eintauchzeit: 1 min)
12) Belichtung:
In dergleichen Weise wie oben unter 10) ausgeführt, nur beträgt die Belichtungszeit 19h.
13) Zweite Prähybridisierung:
In der gleichen Weise wie oben unter 7)
14) Zweite Hybridisierung:
pB2-7 Insert (hergestellt im obigen Schritt 3) 42°C, 16,5 h
15) Waschen:
In der gleichen Weise wie oben unter 9)
16) Belichtung:
In der gleichen Weise wie oben unter 10), nur betrug die Belichtungszeit 19,5h
17) Auswaschen:
In der gleichen Weise wie oben unter 11)
18) Belichtung:
In dergleichen Weise wie oben unter 10), nur betrug die Belichtungszeit 20 h
19) Dritte Prähybridisierung: ' In der gleichen Weise wie oben unter 7)
20) Dritte Hybridisierung:
3'-Fragment(4,5 x 105cpm/ml) von pR18 (Hergestellt im obigen Schritt 4), 42°C, 15h
21) Waschen:
In der gleichen Weise wie oben unter 9)
22) Belichtung:
In der gleichen Weise wie oben unter 10). Die Ergebnisse der Restriktionsenzymanalyse werden in Fig.4 gezeigt.
Schritt (Restriktionsenzymanalyse von pRGE Plasmid DNA)
in im wesentlichen der gleichen Weise wie im obigen Schritt 11 wird die Restriktionsenzymanalyse von im obigen Schritt hergestellter pRGE Plasmid DNA vorgenommen, nur wird pRGE Plasmid DNA anstelle von pHGE Plasmid DNA verwendet. Die Restruktionskarte des gewonnenen pRGE DNA Inserts wird in Fig. 5 gezeigt.
Schritt (Bestimmung von Basensequenzen von Kaninchen-TNF-Gen und Human-TNF-Gen)
Im wesentlichen werden die gleichen Verfahrensweisen wie im obigen Schritt 2 wiederholt, nur werden im obigen Schritt gewonnener E. coli K12 Stamm JM83(pHGE) und im obigen Sch ritt 10 gewonnener E. coli K12 Stamm JM83(pRGE) anstelle von E. coli K12 Stamm MC 1061 mit pB-27 und E. coli K12 Stamm MC 1061 mit pR 18 verwendet. Dadurch werden jeweils 150/xgpRGE Plasmid DNA und pHGE Plasmid DNA gewonnen.
Die Basensequenzen von pRGE und pHGE werden nach dem Maxam-Gilbert-Verfahren (Maxam, u.a., Methods in Enzymology, Bd. 55,490 [1980], veröffentlicht von Academic Press) bestimmt.
Die in Bezugsbeispiel 2 bestimmte Basensequenz von pR-18wird mit der oben bestimmten von pRGE verglichen, um die Struktur, einschließlich Exon und Intron, von Kaninchen-TNF-Gen zu ermitteln. Die Struktur von pRGE DNA Insert wird in Fig.
gezeigt. Anschließend wird die Basensequenz von pRGE mit der von pHGE verglichen, um die Homologie und Konsensussequenz um die Grenze zwischen Intron und Exon zu untersuchen. Dadurch wird die Struktur, einschließlich Exon und Intron, des Human-TNF-Gens ermittelt. Die Struktur von Human-TNF-Gen wird in Fig.4 gezeigt, das Substanz-Gen wird in Fig.4 (?, Fig. 5?) gezeigt.
Die für Kaninchen-TNF und Human-TNF kodierende oben gewonnene Basensequenz wird anschließend dargestellt. Bei den Basensequenzen zeigen die oberen Reihen die für Kaninchen-TNF (R) kodierende Basensequenz und die untere Reihe die für Human-TNF (H) kodierende Basensequenz.
R TCA GCT TCT CGG GCC CTG AGT GAC AAG CCT CTA GCC CAC CTA GTA H TCA TCT TCT CGA ACC CCG AGT GAC AAG CCT GTA GCC CAT GTT GTA
R GCA AAC CCG CAA GTG GAG GGC CAG CTC CAG TGG CTG AGC CAG CGT H GCA AAC CCT CAA GCT GAG GGG CAG CTC CAG TGG CTG AAC CGC CGG
R GCG AAC GCC CTG CTG CGC AAC GGC ATG AAG CTC ACG GAC AAC CAG H GCC AAT GCC CTC CTG GCC AAT GGC GTG GAG CTG AGA GAT AAC CAG
R CTG GTG GTG CCG GCC GAC GGG CTG TAC CTC ATC TAC TCC CAG GTT H CTG GTG GTG CCA TCA GAG GGC CTG TAC CTC ATC TAC TCC CAG GTC
R CTC TTC AGC GGT CAA GGC TGC CGC TCC ... TAC GTG CTC CTC ACT H CTC TTC AAG GGC CAA GGC TGC CCC TCC ACC CAT GTG CTC CTC ACC
R CAC ACT GTC AGC CGC TTC GCC GTC TCC TAC CCG AAC AAG GTC AAC H CAC ACC ATC AGC CGC ATC GCC GTC TCC TAC CAG ACC AAG GTC AAC
R CTC CTC TCT GCC ATC AAG AGC CCC TGC CAC CGG GAG ACC CCC GAG H CTC CTC TCT GCC ATC AAG AGC CCC TGC CAG AGG GAG ACC CCA GAG
R GAG GCT GAG CCC ATG GCC TGG TAC GAG CCC ATC TAC CTG GGC GGC H GGG GCT GAG GCC AAG CCC TGG TAT GAG CCC ATC TAT CTG GGA GGG
R GTC TTC CAG .TTG GAG AAG GGT GAC CGG CTC AGC ACC GAG GTC AAC H GTC TTC CAG CTG GAG AAG GGT GAC CGA CTC AGC GCT GAG ATC AAT
R CAG CCT GAG TAC CTG GAC CTT GCC GAG TCC GGG CAG GTC TAC TTT H CGG CCC GAC TAT CTC GAC TTT GCC GAG TCT GGG CAG GTC TAC TTT
R GGG ATC ATT GCC CTG GGG ATC ATT GCC CTG
Anmerkung: Das Symbol „..." bedeutet, daß dieser Abschnitt in der Basensequenz für die Kaninchen-TNF kodierender DNA Null ist, und daher sind zwei Kodone neben diesem Symbol an dessen beiden Seiten direkt verbunden.
Schritt 14
(Synthese von Oligodesoxynucleotiden)
In einen 500-/xl-Reaktionsbehälter aus rostfreiem Stahl mit Stahlfiltern an jedem Ende werden 20 mg eines Polystyrenharzes gegeben, mit dem ein Nucleosid (2,0μΜ) über eine Succinatkopplung verbunden ist. Das Harz wird mit Zinkbromid (1 M) in Dichlormethan-Isopropanol (85:15) behandelt, um die Dimethoxytrityl-(DMT)-Schutzgruppezu entfernen, mit Dimethylformamid, Pyridin und Acetonitril gewaschen und mit einem Stickstoffstrom getrocknet. Zu dem getrockneten Harz wird eine Lösung von DMT-Nucleotid (20μ.Μ) und Mesitylensulfonylnitrotriazol (60μΜ) in 200μΙ Pyridin gegeben. Die Kopplungsreaktion läßt man 20 Minuten lang bei 450C ablaufen. Dieser Zyklus der Schutzgruppenentfernung und der Kopplung wird für nachfolgende Nucleotide wiederholt, bis das verlangte Oligodesoxynucleotid auf dem Harz angesammelt ist. Das Harz wird danach zur Entfernung des Oligodesoxynucleotids davon behandelt und nach der Beschreibung von Ito, Ike, Ikuta und Itakura (Nuc. Ac. Res. 10: 1755 [1982]) gereinigt
Dadurch werden die folgenden Oligodesoxynucleotide gewonnen.
1) 5'-AATTCATGTCATCTTCTCGAACCCCGAGTGACAa-S'
2) 3'-GTACAGTAGAAGAGCTTGGGGCTCACTGTTCGg-S'
3) 5'-GCCTGTAGCCCATGTTGTAGCAAACCCTCAAGc-S'
4) 3'-ACATCGGGTACAACATCGTTTGGGAGTTCGACt-S'
Schritt 15
(Konstruktion vom M13mp9-HGE, das das Human-Minigen für TNF enthält)
Plasmid pHGE (1 Ομ-g) wird mit EcoRI (20 Einheiten) digeriert. Nach der Elektrophorese auf einem 1%igen niedrig-schmelzenden Agarosegel wird das 2,9 KB Fragment eluiert. Dieses Fragment wird in dasEcoRI-Fragmentvon derreplikativen Form von M13mp9-Phage eingesetzt. Der M13mp9 Phage wird gewählt, weil er besonders für die Gewinnung von Abschnitten von DNA geeignet ist. Das Produkt geht in E. coli JM103 über (transfectsto) (BRL [Bethesda Research Laboratories, Inc., USA] User Manual/M13mp7 Clonig/,Dideoxy'sequencing, 1980). Das Produkt wird als M13mp9-HGE bezeichnet.
' Schritt 16
(Deletion [Tilgung] von Intron 3 unter Verwendung von M13mp9-HGE einsträngiger DNA und Deleter E3-4) Die einsträngige DNA von M13mp9-HGE wird nach dem Verfahren von BRL User Manual/M13mp7-Cloning/,Dideoxy'-sequencing, 1980, hergestellt
In Schritt 14 erzeugtes Oligodesoxynucleotid 4) 3'-ACATCGGGTACAACATCGTTTGGGAGTTCGACt-B'
wird als Deleter für das Intron 3 verwendet. Der Deleter für das Intron 3 wird als E3-4 bezeichnet.
Der Deleter E3-4 besitzt eine Basensequenz, die der Basensequenz der Basen vor (Exon 3) und nach (Exon 4) von Intron 3, das getilgt werden soll, komplementär ist. Die Tilgung von Intron 3 erfolgt in Übereinstimmung mit der Beschreibung von Wallace, u.a., Science 209: 1396 (1980) wie folgt.
E3-4(164ng, 15pMol) wird unter Verwendung von T4-Kinase und ATP (3 mM) phosphoryliert und zu dem TemplatM13mp9-HGE (1,65/xg, 0,5pMol) gegeben. Das Reaktionsgemisch wird auf 65°C erhitzt, 5 Minuten lang auf Raumtemperatur abgekühlt und schließlich in Eiswasser gekühlt. Zu dATP, dCTP, dGTP, dTTP und ATP (0,4mM) werden Klenow-Fragment (5 Einheiten), 10 Einheiten von T4-Ligase in Hin-Puffer (Wallace, u. a., Nuc. Ac. Res. 9; 3647 [1981 ]), 10 mM Tris-HCI (pH-Wert 7,2), 2 mM MgCI2 und 1 mM ß-Mercaptoethanol gegeben. Das Reaktionsgemisch (endgültiges Volumen 50μ,Ι) wird 30 Minuten lang bei 4°C inkubiert und danach 30 Minuten lang bei Raumtemperatur. Die DNA von der durch Oligodesoxynucleotid angeregten Reaktion wird zur Transformation von E. coli JM103 in Übereinstimmung mit dem Verfahren von BRL User Manual/M 13mp7-Cloning/ ,Dideoxy'-sequencing, 1980 verwendet. Auf diese Weise gewonnene Plaques werden auf YT-Platten geklebt (J.H.Miller, S. 433, Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Laboratory [1972]). Die gewonnenen Kolonien werden 2 Stunden lang bei 55°C mit 32P-markiertem E3-4 hybridisiert. Für diesen Schritt wird der Deleter als Sonde zur Identifizierung von Sequenzen von DNA, die die entsprechende komplementäre Basensequenz nach Tilgung des Introns haben, benutzt. Phage wird von denjenigen Kolonien isoliert, die mit dem Deleter hybridisieren.
Der resultierende Phage wird auf Platten aufgebracht, und Plaques werden auf YT-Platten geklebt. Die Klone läßt man 2 Stunden lang bei 55°C mit 32P-markiertem E3-4 hybridisieren. Es werden positive Klone erhalten, und die Phagen-DNA wird sequenziert, um denjenigen Phagen auszuwählen, in dem Intron 3 vollständig getilgt ist. Ein solcher Phage wird als mp9-HGEA3-1 bezeichnet.
Schritt 17
(Konstruktion von pHTNF-lacUV5-2)
Die replikative Form von mp9-HGEA3-1 wird mit EcoRI digeriert. Das EcoRI-Fragment wird isoliert und mit EcoRI-gespaltenem pBR327 zur Gewinnung des Plasmids pHGEA3-1 geklont.
Die Konstruktion von weiterem Plasmid wird unter Verwendung von Plasmid pHGEA3-1 ausgeführt, um ein solches Plasmid zu gewinnen, das direkt zur Expression von TNF in E. coli bei Verwendung von lacUV5 als Promotor führen wird. Die Verfahrensweisen werden schematisch in Fig.7 gezeigt. Zunächst werden 10μg Plasmid pHGEA3-1 mit 10 Einheiten von Aval und EcoRI (hergestellt und vertrieben von Bethesda Research Laboratories Inc., USA) zwei Stunden lang bei 37°C digeriert und auf einem 4Ma.-% Polyacrylamidgel zur Isolierung von Fragmenten elektrophoresiert. Durch Elektroeluierung wird etwa 1 /xg Fragment von dem Gel isoliert. In dergleichen Weise wie in Schritt 14 werden zwei in Fig.7 gezeigte Oligodesoxynucleotide synthetisiert, und zwar ö'-AATTCATGTCATCTTCTCGAACC-S' und 5'-TCGGGGTTCGAGAAGATGACaTG-S'. Danach wird jedes 5'-Ende der beiden Oligodesoxynucleotide (etwa 10OpMoI) unter Verwendung von T4-Polynucleotid-Kinase nach dem in der Literaturangabe (3), Seite 122, beschriebenen Weise phosphoryliert. Nach Beendigung der Reaktion wird das Reaktionsgemisch zuerst mit Phenol und dann mit Chloroform extrahiert. Danach werden die dabei gewonnenen synthetischen Oligomere mit 5^g des zuvor gewonnenen Aval-EcoRI-Fragmentes von Plasmid pHGE3-1 gemischt und in Ethanol ausgefällt. Diese Fragmente werden über Nacht bei 4°C unter Verwendung von 10 Einheiten T4-Ligase nach dem in Literaturangabe (1), Seite 37, beschriebenen Verfahren ligiert. Nach Beendigung der Reaktion wird das Gemisch mit Ethanol ausgefällt, worauf Elektrophorese auf einem 4Ma.-% Polyacrylamidgel zur Gewinnung von Fragment durch Elektroeluierung folgt. Nach dem von F. Fuller („Gene", 19, S.42-54 [1982]) beschriebenen Verfahren wird Plasmid pOP95-15 hergestellt. Ein/xgpOP95-15wird mit EcoRI digeriert und mit Phenol und danach mit Chloroform extrahiert, worauf Ethanolpräzipitation zur Gewinnung eines Vektors folgt. Unter Verwendung von T4-DNA-Ligase werden 0,5μg des gewonnenen Vektors mit dem oben erhaltenen Fragment ligiert. Nach der in Literaturangabe (4), Seite 20; beschriebenen Verfahrensweise wird E. coli JM101 (ATCC 33876) unter Verwendung des oben gewonnenen Vektors transformiert und auf einem Agarmedium, das 1 mM IPTG und 0,004M/V%X-gal enthält, gezüchtet, um etwa 100 weiße Kolonien zu erhalten.
Plasmid-DNA wird von diesen Transformanten hergestellt und mit EcoRI digeriert, um diejenigen Plasmide, die das vorgesehene EcoRI-Fragment enthalten, zu identifizieren. Zur Untersuchung der Einfügungsrichtung, werden diese Plasmide mit Pvull und Pstl digeriert und auf einem 1,5Ma.-% Agarosegel elektrophoresiert, um Plasmide auszuwählen, die Fragmente von etwa 1 280 Basenpaaren und etwa 2600 Basenpaaren ergeben, wodurch ersichtlich wird, daß die Richtung der Transcription des Iac UV5-Promotors mit derjenigen der für TNF kodierenden Oligodesoxynucleotide übereinstimmt.
Die Basensequenzanalyse zeigt, daß diese beiden Plasmide die gleiche Sequenz haben, und daß der Iac UV5-Promotor, das synthetisierte Oligodesoxynucleotid und DNA einwandfrei miteinander kombiniert sind. Das gewonnene Plasmid wird als pHTNF-lacUV5-2 bezeichnet.
E. coli, die pHTNF-lacUV5-2 enthalten, werden in einem herkömmlichen Nährlösungsmedium gezüchtet. Die Bioanalyse des Produktes hinsichtlich von TNF-Aktivität zeigt fast die gleiche Aktivität, wie sie mit einem Plasmid pTNF-lacUV5-1, das das Kaninchen-TNF-Gen enthält, unter Steuerung durch den lac-Promotor erzielt wird.
Bezugsbeispiel 3
Unter Verwendung von Plasmid pHGE und der Oligodesoxynucleotide 1 bis 4, die nach dem in den Schritten 1 bis 14 von Bezugsbeispiel 2 beschriebenen Verfahren gewonnen wurden, wird pHTNF-lacUV5-1 in Übereinstimmung mit dem in Fig. 6 veranschaulichten Verfahren erzeugt.
Bezugsbeispiel 4
Schritt 1
(Reinigung von Antigen)
E. coli, die in Bezugsbeispiel 3 hergestelltes Plasmid pHTNFIacUV5-1 enthalten, werden in herkömmlicher Weise gezüchtet. Um den vorgesehenen Human-TNFzu erzeugen, wird zu der resultierenden Kultur zu 1 mM IPTG zur Auslösung der Induktion gegeben, und die Kultur weiterhin inkubiert, um Zellen von E. coli zu erhalten, die den Human-TNF enthalten. Die Zellen werden durch Zentrifugieren gesammelt, worauf Ultrabeschallung in 1 Liter 0,04 M Tris-HCI-Puffer (pH-Wert 7,8) folgt, um dadurch einen den Human-TNF enthaltenden Zellextrakt zu gewinnen.
Der Zellextrakt hat eine Aktivität von 4,5 χ 105U/ml und eine spezifische Aktivitätvon 3,0 χ 104U/mg.
Der Zellextrakt wird auf eine ausreichend mit 0,04 M Tris-HCI-Puffer (pH-Wert 8,0) äquilibrierte Säule von DEAE-SepharoseCL-6B (hergestellt und vertrieben von Pharmacia Fine Chemicals AB, Schweden) aufgegeben. Die Säule wird mit 0,4M Tris-HCI-Puffer (PH-Wert 8,0) gewaschen und danach erfolgt die Eluierung unter Verwendung von 0,1 M NaCI enthaltendem 0,04IVl Tris-HCI-Puffer (pH-Wert 8,0) als Eluiemngsmittel. Die Fraktion mitzytotoxischer Aktivität gegenüber L-Zellen wird durch Ultrafiltration konzentriert, um eine rohe Lösung mit einer spezifischen Aktivitätvon 4,0 x 105 U/mg zu gewinnen.
Die rohe Lösung wird auf eine mit 5 mM Phosphatpuffer (pH-Wert 7,4), der 0,15 M NaCI enthält, äquilibrierte Säule von Sephacryl S-200 (hergestellt und vertrieben von Pharmacia Fine Chemical AB, Schweden) aufgegeben. Die Gelfiltration erfolgt durch die Zugabe der gleichen Pufferlösung zu der Säule. Die Fraktion mit zytotoxischer Aktivität gegenüber L-Zellen wird durch Ultrafiltration konzentriert, um eine gereinigte Lösung zu erhalten, die eine zytotoxische Aktivität gegenüber L-Zellen von 2,0 χ 105U/ml hat und Human-TNFmit einer spezifischen Aktivitätvon 7,5 χ 105 U/mg enthält.
Schritt 2
(Immunisierung einer Maus)
Die in Schritt 1 oben gewonnene gereinigte Lösung wird mit einem gleichen Volumen vollständigem Freund's Adjuvans vermischt und zur Gewinnung einer Emulsion emulgiert. Die dadurch gewonnene Emulsion wird einer männlichen BALB/c-Maus intradermal dreimal in Abständen von 2 Wochen verabreicht, um eine Immunisierung der Maus zu erreichen. Die Menge der verabreichten Emulsion beträgt 0,2 ml/Verabreichung/Maus. 4 Wochen nach der dritten Verabreichung der Emulsion erhält die Maus intraperitoneal 0,5ml der gereinigten, in Schritt 1 gewonnenen Lösung, um die endgültige Immunisierung herbeizuführen.
Schritt 3
(Zellfusion)
3 Tage nach der endgültigen Immunisierung wird die Maus getötet und die Milz der Maus entfernt. Die Milz wird in Stückchen geschnitten, worauf Filtration unter Druck unter Verwendung eines rostfreien Stahlnetzes zur Gewinnung von Milzzellen folgt. Danach werden die Zellen in Eagle's Minimum Essential Medium (anschließend häufig als „MEM" bezeichnet) suspendiert, um eine Milzzellen-Suspension in MEM zu erhalten. Die Milzzellen und Myelomzellen der Maus (P3/X63-Ag8U1) werden jeweils dreimal mit MEM gewaschen und in einem Verhältnis von 4:1 vermischt, worauf 15 Minuten zentrifugieren mit 800 U/min folgt, um ein Präzipitatzu erhalten. Zu dem Präzipitat in einem Zentrifugenröhrchen werden allmählich 2ml 44 (V/V) %iger Polyethylenglycol-2000-Lösung in MEM gegeben, um eine Mischung zu gewinnen. Das die Mischung enthaltende Zentrifugenröhrchen wird 1 Minute lang langsam in einem Wasserbad von 37°C gedreht, damit die Zellfusion erfolgt. Danach wird der Mischung 1 ml MEM zugesetzt, und das die Mischung enthaltende Zentrifugenröhrchen wird langsam gedreht. Zu der Mischung wird weiterhin MEM mit einer Geschwindigkeit von 2 ml/min in einer solchen Menge gegeben, daß das Gesamtvolumen des resultierenden Gemischs 10ml erreicht. Anschließend wird die Mischung 5 Minuten lang mit 600U/min zentrifugiert, um ein Präzipitatzu erzeugen. Das Präzipitat wird in Rosewal Park Memorial Institute (anschließend meist als „RPMI" bezeichnet) 1640-Medium,das 10% fetales Kalbsserum (anschließend meist als „FCS" bezeichnet) enthält, suspendiert, um eine Suspension zu gewinnen, die Zellen in einer Menge von 7 χ 106 Myelomzellen/ml enthält. Die Suspension wird in jede Vertiefung einer 96-Vertiefungs-Mikrotiterplatte, hergestellt von Flow Laboratories, Inc. (USA), in einer Menge von 0,1 ml/Vertiefung eingeimpft.
Am nächsten Tag werden in jede Vertiefung 0,1 ml RPM11640—10%FCS-Medium gegeben, das HAT(I χ 10"4M Hypoxanthin,
4 χ 10~7M Aminopterin und 1,6 x 10~5M Thymidin) enthält (anschließend als „HAT-Medium" bezeichnet). Anschließend wird aller 3 oder 4 Tage die Hälfte des Mediums in jeder Vertiefung durch ein frisches HAT-Medium ersetzt. 7 Tage nach der Zugabe von RPM11640 —10% FCS-Medium,das HAT enthält, ist in verschiedenen Vertiefungen die Bildung von Hybridoma-Zellen zu beobachten, und 2 oder 3 Wochen später ist die Bildung von Hybridoma-Zellen in fast allen Vertiefungen festzustellen.
Schritt 4
(Screening von Antikörper bildenden Zellen und Klonen)
0,1 ml der überstehenden Flüssigkeit von der Kultur in der Vertiefung, in der die Bildung von Hybridoma-Zellen festzustellen ist, wird in jede Vertiefung einer 96-Vertiefungen aufweisenden Mikrotiterplatte gegeben, an der Human-TNF angebracht ist, und die Mikrotiterplatte wird 1 Stunde lang bei Raumtemperatur stehen gelassen. Die Zellen in jeder Vertiefung werden mit physiologischer Kochsalzlösung gewaschen, die 0,1 % Rinderserumalbumin enthält. Den gewaschenen Zellen wird eine lOOOOfach verdünnte Lösung von mit Peroxydase markiertem Anti-Mäuse-lgG (Cappel Laboratories, Inc., USA) in einer Menge von 0,1 ml/Vertiefung zugesetzt, worauf sie 1 Stunde lang bei Raumtemperaturstehen gelassen werden. Dann werden die Zellen mit 0,1 % Rinderserumalbumin enthaltender physiologischer Kochsalzlösung gewaschen. Zu den gewaschenen Zellen wird eine Substrat-Lösung (30 mg o-Phenylendiamin, 7μΙ 30%iges wäßriges Wasserstoffperoxid, 10 ml 0,1 M Zitronensäure und 10 ml 0,2 M Dinatriumhydrogenphosphat) in einer Menge von 0,15 ml/Vertiefung gegeben. 30 Minuten später wird das Absorptionsvermögen jeder Vertiefung bei 492 nm gemessen, um Vertiefungen zu finden, die einen Antikörper erzeugende Zellen enthalten.
Die Zellen in jeder Vertiefung, die eine hohe Antikörper-Aktivität zeigen, werden mit Hilfe eines Glaskapillarröhrchens entnommen und zur Gewinnung von Klonen geklont. Die Klone werden gescreent, wobei als Kriterium die Antikörper-Aktivität in der gleichen Weise wie unmittelbar oben beschrieben angewandt wird, um 2 Klone zu erhalten, die eine starke Antikörper-Aktivität aufweisen, d. h. Hybrid-Zell-Linie HII7C und Hybrid-Zell-Linie HMI2F.
Die oben gewonnenen Klone werden jeweils in RPMI-1640-Medium,das 10% FCS enthält, gezüchtet, um die Klonzellen zu vermehren. Danach werden die Klonzellen gesammelt und in RPMI-1640-Medium, das 15% FCS und 10% Dimethylsulfoxid enthält, suspendiert. Die dadurch gewonnene Suspension wird in flüssigem Stickstoff aufbewahrt.
Schritt 5
(Herstellung von aszitischer, Hybridoma-Zellen enthaltender Flüssigkeit)
Jeweils 1 χ 107-Zellen der im obigen Schritt 4 gewonnenen beiden Hybridoma-Zellen werden in den Abdomen einer BALB/c-Maus eingeimpft, der vorher 0,2 ml Pristan (2,6,10,14-Tetramethylpentadecan) zur Erzeugung von aszitischer Flüssigkeit intraperitoneal verabreicht worden waren. Nach 10 Tagen werden 3 bis 5 ml aszitische Flüssigkeit von der Maus entnommen.
Schritt 6
(Reinigung eines monoklonalen Antikörpers)
Zu 10 ml der in Schritt 5 gewonnenen aszitischen Flüssigkeit werden 2,66g Ammoniumsulfat (Sättigung 35%) gegeben, und das auf diese Weise gewonnene Gemisch wird über Nacht bei 4°C gerührt, wodurch sich ein Präzipitat bildet. Das Präzipitat wird durch Zentrifugieren entnommen und auf eine Säule von DEAE-Sepharose CL-6B (Pharmacia Fine Chemicals AB, Schweden) aufgegeben, die mit 0,01 M Phosphatpuffer (pH-Wert 8,0) äquilibriert wurde. Die Säule wird mit dem gleichen Puffer gewaschen, und danach erfolgt die Eluierung unter Verwendung von 0,01 M Phosphatpuffer (pH-Wert 8,0), der 0,2 M NaCI enthält, als Eluierungsmittel. Vom Boden der Säule gewonnene Fraktionen werden der Polyacrylamidgel-Elektrophorese unterzogen, um die einen monoklonalen Antikörper enthaltende Fraktion zu bestimmen. Es werden 97 mg eines monoklonalen Antikörpers gewonnen, der durch Hybrid-Zell-Linie HII7C erzeugt wurde (anschließend als „monoklonaler Antikörper HII7C" bezeichnet) und 199 mg eines monoklonalen Antikörpers, der durch Hybrid-Zell-Linie HIII2F erzeugt wurde (anschließend als „monoklonaler Antikörper HIII2F" bezeichnet.
Schritt 7
(Bestimmung einer Unterklasse von monoklonalem Antikörper)
Gemäß dem Ouchterlony-Immunodiffusionsverfahren (beschrieben z.B. von Hudson, u.a., in „Practical Immunology", herausgegeben von Blackwell Scientific Publications [1976], S. 107-115) erfolgt die Bestimmung der Unterklasse unter Verwendung von Anti-Mäuse IgGi, lgG2a, lgG2b (hergestellt und vertrieben von Miles Co., USA). Es wurde gefunden, daß beide, der monoklonale Antikörper HII7C und der monoklonale Antikörper HIII2F zur Klasse von IgGi gehören.
Schritt 8
(Eliminierung von Aktivität aus der physiologisch aktiven Substanz durch die Wirkung von monoklonalen Antikörpern)
Die gereinigte Lösung des in Schritt 1 gewonnenen Human-TNF wird mit 10% FCS enthaltendem MEM-Kulturmedium verdünnt, um Lösungen mit Konzentrationen von 20 U/ml und 200 U/ml zu gewinnen. Zwei oben gewonnene monoklonale Antikörper werden ebenfalls mit dem gleichen Kulturmedium verdünnt, um Lösungen mit entsprechender Konzentration zu erhalten. Die beiden Lösungen werden in jede Vertiefung einer 96-Vertiefung-Mikrotiterplatte in einer Menge von 0,05 ml/Vertiefung gegeben. Nach einstündiger Inkubation bei 37°C wird in jede Vertiefung 0,1 ml einer Suspension gegeben, die 105 L-M-Zellen/ml des gleichen Kulturmediums enthält. Anschließend werden im wesentlichen die gleichen Verfahrensschritte, wie sie für die in vitro Analysemethode beschrieben wurden, wiederholt, um die zytotoxische Aktivität gegenüber L-Zellen zu bestimmen. Gleichzeitig wird auch die Untersuchung (A) durchgeführt, bei der weder der Human-TNF noch ein monoklonaler Antikörper zugesetzt wird, sowie die Untersuchung (B), bei der kein monoklonaler Antikörper zugegeben wird, aber der Human-TNF zugesetzt wird. Die Ergebnisse sind in Tabelle 5 enthalten, worin die Rate (%) der Eliminierung von Aktivität durch einen aus folgender Gleichung errechneten Wert angegeben wird
(Absorptionsvermögen,
(Absorptionsvermögen ermittelt bei Unterder Probe) — suchung B) χ 100 (Absorptionsvermögen, — ermittelt bei Untersuchung A)
(Absorptionsvermögen, ermittelt bei Untersuchung B)
| Art des mo | Konzentration der | Konzentration | Eliminie- |
| noklonalen | physiologisch | von monoklona | rungsrate |
| Antikörpers | aktiven Substanz | lem Antikörper | von Aktivi |
| (U/ml) | (Mg/ml) | tät (%) |
20
50 3,2 0,2
100 46 6.
HIII2F
| 500 | 100 | |
| 200 | 32 | 70 |
| 2,0 | 9 | |
| 50 | 100 | |
| 20 | 3,2 | 100 |
| 0,2 | 40 | |
| 500 | 100 | |
| 200 | 32 | 100 |
| 2,0 | 93 |
-23- Z4UZ1Ö
Beide monoklonalen Antikörper eliminieren die Aktivität von Human-TNFbei hohen Konzentrationen vollständig. Bei niedrigen Konzentrationen weist der monoklonale Antikörper HIII2F eine höhere Eliminationsrate als der monoklonal Antikörper HII7C auf.
Schritt 9
(Messung des isoelektrischen Punktes von monoklonalen Antikörpern)
Zur Messung der isoelektrischen Punkte der beiden monoklonalen Antikörper wird ein Gerät zur isoelektrischen Dünnschicht-Gelfokussierung AB, (hergestellt und vertrieben von Pharmacia Fine Chemical AB, Schweden) verwendet. Die Messung wird unter Verwendung von Pharmalite pH3-10 (hergestellt und vertrieben von Pharmacia Fine Chemical AB, Schweden) und als Trägermittel Ampholite in Übereinstimmung mit dem Verfahren von Awdeh, u.a. (Nature, 219, S.66 [1980]) vorgenommen. Es wurde gefunden, daß monoklonaler Antikörper HII7C und monoklonalerAntikörper'HIII2F isoelektrische Punkte von 6,7 bis 7,0 bzw. 6,2 bis 6,5 haben.
Schritt 10
(Hersteilung von an monoklonale Antikörper gebundenen Harzen)
50ml der wäßrigen Lösung, die 150mg in Schritt 6 gewonnenen monoklonalen Antikörper HII7C enthält, werden gegen eine 0,5 M NaCI und 0,1 M Natriumcarbonat enthaltende wäßrige Lösung dialysiert. Die dialysierte Antikörperlösung wird zu 50 ml gequollenem und durch Cyanogenbromid aktiviertem Harz Sepharose CL-4B (hergestellt und vertrieben von Pharmacia Fine Chemical AB, Schweden) gegeben. Das Gemisch wird über Nacht leicht bei 4°C zur Herbeiführung der Reaktion gerührt. Nach Beendigung der Reaktion werden die Harze ausreichend mit einer wäßrigen Lösung, die 0,5 M NaCI und 0,1 M Natriumcarbonat enthält, gewaschen. Danach werden die Harze mit 50ml 1 M wäßrigem Ethanolamin vermischt, worauf 2 Stunden lang leichte Bewegung bei Raumtemperatur folgt, um dadurch nicht umgesetzte aktive Gruppen zu schützen. Anschließend werden die Harze ausreichend mit wäßrigem 8 M Harnstoff und physiologischer Kochsalzlösung gewaschen, um an monoklonalen Antikörper HII7Z gebundene Harze für die Verwendung als Adsorptionsmittel bei der Affinitäts-Chromatographie zu gewinnen. Im wesentlichen werden die gleichen Verfahrensweisen wie oben wiederholt, um an monoklonalen Antikörper HIII2F gebundene Harze zu erzielen
An monoklonalen Antikörper HII7C gebundene Harze werden in eine Säule (2,5 χ 8cm) gefüllt.
In Bezugsbeispiel 3 hergestellte, Plasmid pHTNF-lacUV5-1 enthaltende E. coli werden in einer herkömmlichen Weise gezüchtet, und danach werden die Zellen gesammelt. Die Zellen werden in 210,02 M Tris-HCI-Puffer (pH-Wert 7,8) lysiert, um dadurch einen den Human-TNF enthaltenden Zellextrakt zu gewinnen. Der Extrakt besitzt eine Aktivität von 5,2 x 105 U/ml und enthält Human-TNF mit einer spezifischen Aktivität von 4,2 x 104U/mg.
Zu dem Extrakt wird Streptomycin in einer solchen Menge gegeben, daß eine endgültige Konzentration von 0,7M/V% erzielt wird, um ein Präzipitat von Nucleinsäure zu erzeugen. Nach Entfernung des Präzipitats durch Zentrifugieren wird die überstehende Flüssigkeit auf eine Säule von DEAE-Sepharose CL-B (hergestellt und vertrieben von Pharmacia Fine Chemical AB, Schweden) aufgegeben, die mit 0,02 M Tris-HCI-Puffer (pH-Wert 8,0) äquilibriert wurde. Die Säule wird mit dem gleichen Puffer gewaschen, und danach erfolgt die Eluierung unter Verwendung von 1OmM Phosphatpuffer (pH-Wert 7,5), der 0,1 M Natriumchlorid enthält, als Eluierungsmittel, um eine rohe Lösung (A) mit einer spezifischen Aktivität von 3,90 χ 105U/mg zu erhalten.
Nach der Einstellung des pH-Wertes mit Chlorwasserstoffsäure auf 6 wird die Rohlösung (A) auf eine Säule von Blue Sepharose CL-6B (hergestellt und vertrieben von Pharmacia Fine Chemical AB, Schweden) aufgegeben, die mit 1OmM Phosphatpuffer (pH-Wert 6,0), der 0,1 M Natriumchlorid enthält, äquilibriert wurde. Die Säule wird ausreichend gewaschen und anschließend erfolgt die Eluierung unter Verwendung von 1OmM Phosphatpuffer (pH-Wert 8,0), der 0,5 M Natriumchlorid enthält, als Eluierungsmittel, um eine einen gereinigten Human-TNF enthaltende Fraktion zu gewinnen. Von dem Extrakt, der durch Entfernung der Nucleinsäure gewonnen überstehenden Flüssigkeit, der Rohlösung (A) und der durch erfindungsgemäße Säulenchromatographie erzielten Fraktion werden die spezifische Aktivität, die Rückgewinnung und der Reinigungsgrad nach den oben erläuterten Verfahren bestimmt. Die Ergebnisse sind in Tabelle 6 enthalten.
Die in Beispiel 1 erzeugte Rohlösung (A) wurde unter Einsatz einer Säule von monoklonalem Antikörper gereinigt.
Bei der hier verwendeten Säule von monoklonalem Antikörper handelt es sich um die Säule mit dem an den monoklonalen Antikörper gebundenen Harz, das nach Bezugsbeispiel 4 hergestellt wurde und in die Säule eingefüllt wird. Die Säule wird mit 5OmM Phosphatpuffer (pH-Wert 7,5), der 0,15 M Natriumchlorid enthält, äquilibriert, und danach wird auf die Säule die Rohlösung (A) aufgegeben. Nach gründlichem Waschen erfolgt die Eluierung unter Verwendung von 0,1 M Glycin-Natriumchlorid (pH-Wert 10,0) als Eluierungsmittel, um eine einen gereinigten Human-TNF enthaltende Fraktion zu gewinnen.
Die auf diese Weise gewonnene Fraktion wird für Bestimmungen der spezifischen Aktivität, der Rückgewinnung und des Reinigungsgrades nach oben genannten Verfahren herangezogen.
Die Ergebnisse sind in Tabelle 7 zusammen mit den in Beispiel 1 erzielten Ergebnissen enthalten.
Im wesentlichen werden die gleichen Verfahrensweisen wie in Beispiel 1 wiederholt, nur werden Matrix Gel Red A und Matrix Gel Red B (jeweils hergestellt und vertrieben von Amicon Co., Ltd., USA) getrennt anstelle von Blue Sepharose CK-6B verwendet, um dadurch einen gereinigten Human-TNF enthaltende Fraktionen zu gewinnen.
Die auf diese Weise gewonnenen Fraktionen werden für Bestimmungen der spezifischen Aktivität, der Rückgewinnung und des Reinigungsgrades nach den oben erläuterten Verfahren herangezogen. Die Ergebnisse sind in Tabelle 8 zusammen mit den in Beispiel 1 erzielten Ergebnissen enthalten.
| Spezifische | Rückge | Reinigungs | |
| Schritt | Aktivität | winnung | grad |
| (U/mg) | (%) | (Mal) | |
| Kulturextrakt | 4,2x10" | 100 | ' 1,0 |
| Nach Entfernung von | |||
| Nucleinsäuren | 4,8x104 | 76 . | 1,1 |
| Nach Behandlung mit | |||
| DEAE-Sepharose | 3,9x105 | 65 | 9,3 |
| (Rohlösung (A)) | |||
| Nach Behandlung mit | |||
| BlueSepharose | 1,5 x 106 | 63 | 35,7 |
| CL-6B | |||
| Tabelle 7 | |||
| Spezifische | Rückge | Reinigungs | |
| Schritt | Aktivität | winnung | grad |
| (U/mg) | (%) | (Mal) | |
| Rohlösung (A) | 3,9x105 | 100 | 1,0 |
| Nach Behandlung mit | |||
| BlueSepharoseCL-6B | 1,5 x 106 | 90 | 3,8 |
| Nach Behandlung mit | |||
| mönoklonaler Antikörper- | 1,4x10e | 55 | 3,6 |
| Säule | |||
| Tabelle 8 | |||
| Spezifische | Rückge | Reinigungs | |
| Schritt | Aktivität | winnung | grad |
| (U/mg) | (%) | (Mal) | |
| Rohlösung (A) | 3,9 χ 10s | 100 | 1,0 |
| Nach Behandlung | |||
| mitBlue | 1,5 x 106 | 90 | 3,8 |
| SepharoseCL-6B | |||
| Nach Behandlung | |||
| mitMatrexGel | 1,4 x 106 | 85 | 3,6 |
| Red A | |||
| Nach Behandlung | |||
| mitMatrexGel | 1,4 x 106 | 80 | 3,6 |
| Green A |
Claims (4)
- -1- Z4UZ1t> Erfindungsanspruch:1. Verfahren zur Reinigung einer physiologisch aktiven Substanz, gekennzeichnet dadurch, daß eine wäßrige Lösung, die eine physiologisch aktive Substanz in roher Form enthält, der Säulenchromatographie unter Verwendung einer mit einem farbstoffgebundenen vernetzten Agarosegel gefüllten Säule unterzogen wird, wobei das farbstoffgebundene vernetzte Agarosegel aus einem vernetzten Agarosegel als Träger und einem kovalent daran gebundenen Farbstoff als Liganden besteht.Wobei es sich bei der physiologisch aktiven Substanz um eine handelt, die durch Rekombinant-DNA-Technik unter Verwendung einer Rekombinant-DN A hergestellt wird, die eine für die physiologisch aktive Substanz kodierende DNA enthält und die zytotoxische Aktivität gegenüber L-M-Zellen aufweist und in der Lage ist, hämorrhagische Necrose von. transplantiertem Meth A Sarcom bei der BALB/c-Maus zu induzieren.
- 2. Verfahren nach Punkt 1, gekennzeichnet dadurch, daß es sich bei der physiologisch aktiven Substanz um ein Polypeptid mit einer durch die folgende Formel (I) dargestellten Aminosäuresequenz handelt:Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro VaI Ala His VaI VaI AIa Asn Pro Gin Ala GIu GIy GIn Leu GIn Trp Leu Asn Arg Arg AIa Asn AIa Leu Leu AIa Asn GIy VaI GIu Leu Arg Asp Asn GIn Leu VaI VaI Pro Ser GIu GIy Leu Tyr Leu He Tyr Ser Gin VaI Leu Phe Lys GIy Gin GIy Cys Pro Ser Thr His VaI Leu Leu Thr His Thr He Ser Arg lie Ala VaI SerTyr GIn Thr Lys VaI Asn Leu Leu Ser AIa He Lys Ser Pro Cys GIn Arg GIu Thr Pro GIu GIyAIa GIu AIa Lys Pro Trp Tyr GIu Pro He Tyr Leu GIy GIyVaI Phe GIn Leu GIu Lys GIy Asp Arg Leu Ser Ala GIu lie Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe Ala GIu Ser GIy Gin VaI Tyr Phe GIy lie lie AIa Leu worin Gin für einen Glutaminrest steht, Asp für einen Asparaginsäurerest, Pro einen Prolinrest, Tyr einen Tyrosinrest, VaI einen Valinrest, Lys einen Lysinrest, GIu einen Glutaminsäurerest, AIa einen Alaninrest, Asn einen Asparaginrest, Leu einen Leucinrest, Phe einen Phenylalaninrest, GIy einen Glycinrest, His einen Histidinrest, Ser einen Serinrest, Thr einen Threoninrest, Ne einen Isoleucinrest, Trp einen Trypthphanrest, Arg einen Argininrest, Met einen Meth ion inrest und Cys einen Cysteinrest.
- 3. Verfahren nach Punkt 1, gekennzeichnet dadurch, daß die für die physiologisch aktive Substanz kodierende DNA mindestens eine Basensequenz aufweist, die aus der Gruppe ausgewählt ist, die eine durch die folgende Formel (II) dargestellte Basensequenz und eine zu der Basensequenz komplementäre Basensequenz umfaßt:TCA TCTTCT CGA ACC CCG AGT GAC AAG CCT GTA GCC CAT GTT GTA GCA AAC CCT CAA GCT GAG GGG CAG CTC CAG TGG CTG AAC CGC CGG GCC AAT GCC CTC CTG GCC AAT GGC GTG GAG CTG AGA CAT AAC CAG CTG GTG GTG CCATCAACC ATC AGC CGC ATC GCC GTC TCC TAC CAG ACC AAG GTC AAC CTC CTC TCT GCC ATC AAG AGC CCC TGC CAG AGG GAGACCCCAGAGGGGGCTGAGGCCAAGCCCTGGTATGAGCCCATCTATCTGGGAGGGGTCTTCCAGCTGGAGAAG GGT GAC CGA CTC AGC GCT GAG ATC AAT CGG CCC GAC TAT CTC GAC TTT GCC GAG TCT GGG CAG GTC TAC TTT GGG ATC ATT GCC CTGworin A für einen Desoxyadenylsäurerest steht, Geinen Desoxyguanylsäurerest, CeinenDesoxycytidylsäurerestundTeinen Thymidylsäurerest, und worin das linke Ende und das rechte Ende von Formel (II) die 5'-Hydroxylgruppenseite bzw. die 3'-Hydroxylgruppenseite darstellen.
- 4. Verfahren nach einem der Punkte 1 bis 3, gekennzeichnet dadurch, daß es sich bei dem Farbstoff um ein Glied aus der Gruppe handelt, die Cebacron Blue F3GA (Farbindexname: Reaktivfarbstoff Blau 2), Procion Red HE3B (Farbindexname: Reaktivfarbstoff Rot 120) und Green A (zu beziehen von Amicon Corporation, USA in Form eines Green-A-gebundenen vernetzten Agarosegels unter dem Warenzeichen „Matrex Gel Green A") umfaßt.Hierzu 7 Seiten Zeichnungen
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