[go: up one dir, main page]

CZ130199A3 - Cirkulárně permutovaní agonisté receptoru erythropoietinu - Google Patents

Cirkulárně permutovaní agonisté receptoru erythropoietinu Download PDF

Info

Publication number
CZ130199A3
CZ130199A3 CZ991301A CZ130199A CZ130199A3 CZ 130199 A3 CZ130199 A3 CZ 130199A3 CZ 991301 A CZ991301 A CZ 991301A CZ 130199 A CZ130199 A CZ 130199A CZ 130199 A3 CZ130199 A3 CZ 130199A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
seq
ala
gly ser
gly
leu
Prior art date
Application number
CZ991301A
Other languages
English (en)
Inventor
Charles A. Mcwherter
Yiqing Feng
Neena Summers
Original Assignee
G. D. Searle & Co.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by G. D. Searle & Co. filed Critical G. D. Searle & Co.
Publication of CZ130199A3 publication Critical patent/CZ130199A3/cs

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475Growth factors; Growth regulators
    • C07K14/505Erythropoietin [EPO]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • A61P7/06Antianaemics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Description

Vynález se týká agonistů receptoru lidského erythropoietinu (EPO). Tyto agonisté receptoru EPO si zachovávají jednu nebo více aktivit nativního EPO a také mohou vykazovat zlepšenou stimulující aktivitu na hematopoietické buňky a nebo zlepšený aktivitm profil, který může zahrnovat snížení nežádoucích biologických aktivit spojených s nativní EPO a nebo mít zlepšené fyzikální vlastnosti, které mohou zahrnovat zvýšenou rozpustnost, stabilitu a účinnost skládám.
Dosavadní stav techniky
Kolonie stimulujících faktorů, které stimulují diferenciaci nebo proliferaci buněk kostní dřeně, vyvolaly již dávno velký zájem, pro svůj terapeutický potenciál při obnovení snížených hladin krvetvorných kmenových buněk - odvozených buněk.
Erythropoietin je přirozeně se vyskytující glykoproteinový hormon s molekulovou hmotností, která se nejprve udávala jako asi 39000 daltonů (T. Miyaki aj„ J. Biol. Chem., 252: 5558-5564 (1997)). Zralý hormon má délku 166 aminokyselin a prepro forma hormonu se svým vedoucím peptidem má délku 193 aminokyselin (F. Lih, US patent 4,703,008). Zralý hormon má molekulovou hmotnost vypočtenou ze sekvence svých aminokyselin 18399 daltonů (J. K. Browne aj., Nátuře, 313: 806-810 (1985), K. Browne aj., Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 5: 1693-1702 (1986).
Prvé mutantní erythropoietiny (například analogy erythropoietinu), připravené substitucemi a delecemi aminokyselin, vykázaly sníženou nebo nezlepšenou aktivitu. Jak se popisuje v US patentu 4,703,008, náhrada tyrosinových zbytků v polohách 15, 40 a 145 zbytky fenylalaninu, náhrada cysteinového zbytku v poloze 7 histidinem, substituce prohnu v poloze 2 asparaginem, delece zbytků 2-6 a delece zbytků 27-55 nevede k zřejmému zvýšení biologické aktivity. Mutace Cys-až-His eliminuje biologickou aktivitu. Série mutantních erythropoietinů s jedinou substitucí aminokyseliny na asparaginových zbytcích 24, 38 nebo 83 vykazují silně sníženou aktivitu (substituce v poloze 24), nebo vykazují rychlou mezibuněčnou degradaci a zřejmý nedostatek sekrece (substituce v poloze 38 nebo 183). Eliminace O-spojeného místa glykosylace na šeřinu 26 vede k rychlé degradaci nebo nedostatku sekrece analogu erythropoietinu (S. Dube aj., J. Biol. Chem., 33: 17516-17521 (1988)). Tito autoři vyvozují, že místa glykosylace na zbytcích 38, 83 a 126 jsou nutné pro správnou sekreci a že místa
... ... » t t t
... ···· ···· • ···· · · ····· · ··· ··· • . t t t t t ··· · · · · ·· ·· glykosylace lokalizovaná na zbytcích 24 a 38 se mohou účastnit na biologické aktivitě zralého erythropoietinu.
Deglykosylovaný erythropoietin je plně aktivní v biotestech in vitro (M. S. Dorsdal aj., Endocrinology, 116: 2293-2299 (1985), US patent 4,703,008, E. Tsuda aj., Eur. J. Biochem. 266: 20434-20439 (1991). Avšak všeobecně se uznává, že glykosylace erythropoietinu má klíčovou úlohu v aktivitě hormonu in vivo (Ρ. H Lowy aj., Nátuře 185: 102-105 (1960), E. Goldwasser a C. K. H. Kung, Ann. Ν. Y. Acad. Science 149: 49-53 (1968), W. A. Lukowsky a R. Painter, Can. J. Biochem. :909-917 (1972, D. W. Briggs aj., Amer. J. Phys., 201:1385-1388 (1974), J. C. Schooley, Exp. Hematol. 13:994-998, N. Imai aj., Eur. J. Biochem. 194: 457-462 (1990), M. S. Dorsdal aj., Endocrinology, 116: 2293-2299 (1985), E. Tsuda aj., Eur. J. Biochem. 188: 405-411 (1990), US patent 4,703,008, K. Browne aj., Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 51: 693702 (1986) a K. Yamaguchi aj., J. Biol. Chem., 266: 20434-20439 (1991). Pokud se nedostává deglykosylovaným analogům in vivo biologické aktivity, přičítá se rychlému mizení deglykosylovaného hormonu z oběhu ošetřovaných zvířat. Tento názor podporuje přímé srovnám poločasů glykosylováného a deglykosylovaného erythropoietinu v plazmě (J. C. Spivak a Β. B. Hoyans, Blood 73: 90-99 (1989) a Μ. N. Fukuda, aj., Blood 73: 84-89 (1989).
Mutagenese míst glykosylace erythropoietinu řízená oligonukleotidy účinně prověřila funkci glykosylace, avšak dosud selhala při porozumění efektivní strategii pro významné zlepšení charakteristik hormonu pro terapeutické aplikace.
Konstruovala se série mutantů s jedinou substitucí nebo deleci aminokyseliny zahrnující zbytky aminokyselin 15, 24, 49, 76, 78, 83, 143, 145, 160, 162, 163, 164, 165 a 166. V těchto mutantech se mění karboxy konec, místa glykosylace a tyrosinové zbytky erythropoietinu. Mutanty se podávaly zvířatům při sledování hladin hemoglobinu, hematokritu a retikulocytu (EP číslo 0 409 113). Zatím co mnohé z těchto mutantů in vivo žádné nevykazuje významné zvýšení jejich schopnosti zvyšovat hladiny hemoglobinu, hematokritu nebo retikulocytu (bezprostřední prekursor erytrocytu) ve srovnání s nativním erythropoietinu.
Konstruovala se jiná množina mutantů, aby se prověřila funkce zbytků 99-119 (doména 1) a zbytků 111-129 (doména 2) (Y. Chem aj., Eur. J. Biochem. 202: 225-230 (1991). Mutanty domény 1 se rychle degradují a jsou neaktivní v biotestech in vitro, zatím co mutanty domény 2 si při nejlepším udržují aktivitu in vitro. Tyto mutanty také nevykazují žádné zvýšení in vivo biologické aktivity ve srovnám s divokým typem lidského erythropoietinu. Tito autoři vyvozují, že zbytky 99-119 hrají klíčovou úlohu ve struktuře erythropoietinu.
Molekula lidského erythropoietinu má dva disulfidfcké můstky* jeden spojující cysteinové zbytky v polohách 7 a 161 a druhý spojující cysteiny v polohách 29 a 33 (Ρ. H. Lai aj., J. Biol: Chem., 261: 3116-3121 (1986). Mutagenese míst glykosylace erythropoietinu řízená oligonukleotidy se použila k prověření funkce disulfidického můstku spojujícího cysteiny v polohách 29 a 33 v lidském erythropoietinu. Cystein v poloze 33 se převedl na prolinový zbytek, který napodobuje strukturu myšího erythropoietinu na tomto zbytku. Vzniklý mutant má velmi sníženou aktivitu in vitro. Ztráta aktivity je tak silná, že autoři vyvozují, že disulfidický můstek mezi zbytky v polohách 29 a 33 je podstatný pro funkci erythropoietinu (F. K. Lin, Molecular and Cellular Aspects of Erythropoietin and Erythropoiesis, strany 23-36, ed. I. N. Rich, Springer Verlag, Berlin (1987)).
US patent 4,703,008 pro F. K. Lin (dále označovaný jako patent 008) spekuluje o široké řadě modifikací EPO, včetně adičních, delečních a substitučních analogů EPO. Patent 008 neukazuje, že by kterákoliv z navržených modifikací zvýšila biologickou aktivitu sama o sobě, ačkoliv se konstatuje, že delece míst glykosylace by mohla zvýšit aktivitu EPO produkovanou v kvasinkách (viz patent 008, sloupec 37, řádky 25-28). Patent 008 také spekuluje, že analogy EPO, které mají jeden nebo více tyrosinových zbytků nahrazených fenylalaninem, mohou vykazovat zvýšenou nebo sníženou vázebnou afinitu.
Australská patentová přihláška číslo AU-A-59145/90 pro FIbi, M. aj. také diskutuje řadu modifikovaných EPO proteinů (EPO muteiny). Obecně se spekuluje o změně aminokyselin 1055, 70-85 a 130-166. Zejména přidání positivně nabitých bazických aminokyselin v oblasti karboxylového konce se považuje za zvyšující biologickou aktivitu EPO.
US patent 4,835,260 pro Shoemaker, B. C. diskutuje modifikované EPO proteiny se substitucemi methioninu v poloze 54 a asparaginu v poloze 38. Považuje se, že takové EPO muteiny mají zlepšenou stabilitu, ale neuvádí se, že vykazují jakékoliv zvýšení biologické aktivity ve srovnání s divokým typem EPO.
WO 91/05867 popisuje analogy lidského erythropoietinu mající větší počet míst pro připojení karbohydrátů než lidský erythropoietin, jako EPO (Asn^9), EPO (Asn125, Ser12^), EPO (Thr125) a EPO (Pro124, Thr125).
WO 94/24160 popisuje muteiny erythropoietinu mající zvýšenou aktivitu, specificky se substitucemi aminokyselin v polohách 20,49, 73, 140, 143, 146, 147 a 154.
WO 94/25055 popisuje analogy erythropoietinu včetně EPO (X33, Cys139, des-Arg166) a EPO (Cys139, des-Arg166).
Přeskupení proteinových sekvencí
Při evoluci mají přeskupení proteinových sekvencí důležitou úlohu při vytváření rozmanitosti proteinových struktur a funkcí. Genová duplikace a míchám exonu poskytují důležitý mechanismus pro rychlé vytváření rozmanitosti a tím zabezpečují organismům výhodu soutěžení, zejména protože základní rychlost mutace je nízká (Doolittle, Protein Science 1: 191200 (1992)).
Rozvoj metod rekombinantní DNA umožnil studium účinků transposice sekvencí na skládání, struktury a funkce proteinů. Přístup použitý k vytváření nových sekvencí se podobá přirozeně se vyskytujícím párům proteinů, které jsou příbuzné lineární reorganizací svých sekvencí aminokyselin (Cunningham aj., Proč. Nati. Acad. Sci. U.S.A. 76: 3218-3222 (1979), Teather a Erfle, J. Bacteriol. 172: 3837-3841 (1990), Schimming aj., Eur. J. Biochem. 204: 1319 (1992), Yamiuchi a Minamikawa, FEBS Lett. 260: 127-130, 1991: MacGregor aj., FEBSLett 378.: 263-266 (1996)). Prvá aplikace in vitro tohoto typu přeskupení proteinů byl popsán Goldenbergem a Creightonem (J. Mol. Biol., 165: 407-413 (1983). Nový N-konec se vybere na vnitřním místě (místo zlomu) původní sekvence, nová sekvence má stejné pořadí aminokyselin jako originál od místa zlomu, dokud nedosáhne aminokyselinu, která je na místě původního Ckonce nebo blízko něj. V tomto místě se připojí nová sekvence, buď přímo nebo přes další část sekvence (spojovník) k aminokyselině, která je na místě původního N-konce nebo blízko něj a nová sekvence pokračuje se stejnou sekvencí jako původní, dokud nedosáhne bod, které je na místě aminokyseliny, která byla na místě N-konce k místu zlomu původní sekvence. Tento zbytek tvoří nový C-konec řetězce.
Tento přístup se použil na proteiny s rozsahem velikosti od 58 do 462 aminokyselin (Goldenberg a Creighton J. Mol. Biol., 165: 407-413 (1983), Li a Coffino, Mol. Cell. Biol. 13: 2377-2383 (1993)). Přezkoušené proteiny představovaly široký rozsah strukturních tříd, včetně proteinů, které obsahují převážně α-šroubovnici (interleukin-4, Kreitman aj., Cytokine 7: 311318 (1995), β-list (interleukin-1, Horlick aj. Protein Eng. 5: 427-431 (1992) nebo směsi těchto dvou (isomeráza fosforibosyl anthranilátu z kvasinek, Luger aj., Science 243: 206-210 (1989)). Široké kategorie funkce proteinů jsou představeny v těchto studiích reorganizací sekvencí:
• · · • ·
Enzymy
T4 lysozym: Zhang aj., Biochemistry 32: 12311-12318 (1993), Zhang aj., Nátuře Struct.
Biol 1: 434-438 (1995).
dihydrofolátreduktáza: Buchwalder aj., Biochemistry 31: 1621-1630 (1993), Protasova aj., Protein Eng. 7: 1373 - 1377(1995).
ribonukleáza TI: Mullins aj., J. Am. Chem. Soc. 116: 5529-5533 (1994), Garrett aj., Protein Science 5: 204-211 (1996).
Bacillus β-glucanse: Hahnaj., Proč. Nati. Acad. Sci. U.S.A. 91:10417-10421 (1994).
Aspartát-transkarbamoyláza: Yang a Schachman, Proč. Nati. Acad. Sci. U.S.A. 90: 1198011984(1993).
fosforibosylanthranilát isomeráza: Luger aj., Science 243: 206-210 (1989), Luger aj., Protein Eng. 3: 249-258 (1990).
pepsin/pepsinogen Lin aj., Protein Science 4: 159-166 (1995).
glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenáza: Vignais aj., Protein Science 4: 994-1000 (1995).
omithindekarboxyláza: Li a Coffino, Mol. Cell. Biol. 13: 2377-2383 (t983).
fosfoglycerátdehydrogenáza z kvasinek: Ritco-Vonsovici aj., Biochemistry 34: 1654316551 (1995).
Inhibitory enzymů
Inhibitor bazického trypsinu z pankreatu: Goldenberg a Creighton J. Mol. Biol., 165: 407413 (1983).
Cytokiny interleukin-ΐβ: Horlick aj. Protein Eng. 5: 427-431 (1992). interleukin-4: Kreitmanaj., Cytokinel·. 311-318 (1995).
Doména rozpoznávání kinázy tyrosinu doména α-spektrinu SH3: Viguera aj. J. Mol. Biol., 247: 670-681 (1995).
Transmembránový protein omp A: Koebnik a Kramer J. Mol. Biol., 250: 617-626 (1995).
44 .4 4 4 • 44 « 444 «44 4 « 444444 444444 444444
4··· · ·
444 · ·· · ·* **
Chimérní protein interleukin-4-p5,ewť/owo«a5· fuzní molekula exotoxinu: Kreitman aj., Proč. Nati. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6889-6893 (1994).
Výsledky těchto studií byly velmi rozdílné. V mnoha případech se pozorovala významně nižší aktivita, rozpustnost nebo termodynamická stabilita (reduktáza dihydrofolátu E.coli, aspartát-transkarbamoyláza, fosforibosyl-anthranilátu isomeráza, glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenáza, omithin dekarboxyláza, omp A, fosfoglycerát dehydrogenáza z kvasinek).
V jiných případech se zdálo, že reorganizované sekvence proteinů mají mnohé téměř shodné vlastnosti než jejich přirozené protějšky (inhibitor basického trypsinu z pankreatu, T4 lysozym, ribonukleáza TI, Bacillus β-glucanse, interleukin-1β, doména a-spektrinu, pepsinogen, interleukin-4). Ve výjimečných případech se pozorovalo neočekávané zlepšení některých vlastností nad přirozenou sekvencí, například rozpustnost a rychlost skládám' u reorganizovaných sekvencí domény α-spektrinu SH3 a afinity receptoru a aktivity proti tumorům reorganizované spojené molekuly exotoxinu EAQňQok\n-4-Pseudomonas (Kreitman aj., Proč. Nati. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6889-6893 (1994), Kreitman aj., CancerRes. 55: 3357-3363 (1995)).
Základní motivací těchto typů studií byla studie úlohy interakcí na krátkou a dlouhou vzdálenost při skládání a stabilitě proteinů. Přeskupení sekvencí tohoto typu mění podmnožinu interakcí, které jsou na dlouhou vzdálenost v původní sekvenci, na interakci na krátkou vzdálenost v nové sekvenci a obráceně. Skutečnost, že mnohé z těchto přeskupení sekvencí jsou schopné získat konformaci s alespoň nějakou aktivitou, je přesvědčujícím důkazem, že skládání proteinů probíhá mnoha cestami skládání (Viguera aj. J. Mol. Biol., 247: 670-681 (1995).
V případě domény α-spektrinu SH3 výběr nových konců v polohách, které odpovídají zlomům β-vlásenky vedlo k proteinům s mírně menší stabilitou, které jsou však přesto schopné se skládat.
Polohy vnitřních míst zlomu použité ve zde citovaných studiích se nalézají pouze na povrchu proteinů a jsou rozděleny podél lineární sekvence bez jakéhokoliv zřejmé chyby ke koncům nebo středu (variace relativní vzdálenosti od původního N-konce k místu zlomu je asi 10 až 80 % celkové délky sekvence). Spojovníky spojující původní N- a C-konce v těchto studiích se měnily od 0 do 9 zbytků. V jednom případě (Yang a Schachman, Proč. Nati. Acad. Sci. U.S.A. 90: 11980-11984 (1993)) část sekvence se odstranila od původního C-koncového segmentu a spojení se dosáhlo od skráceného C-konce k původnímu N-konci. Ve spojovnících se často používají flexibilní hydrofilní zbytky jako Gly a Ser. Viguera aj. J. Mol. Biol., 247: 670681 (1995) porovnali spojem původních N- a C-konců se spojovníkem s 3- nebo 4- zbytky,
4 4 spojovník s 3-zbytky byl termodynamicky méně stabilní. Protasova aj. (Protein Eng. Ί: 427431(1995)) použili spojovníky s 3- nebo 5-zbytky ke spojení původních N-konců dihydrofolát reduktázy E. coli, pouze spojovník s 3- zbytky produkoval protein v dobrém výtěžku.
4 44
4 4 4 4 · · · 4 4
44444 · 444
4 4 4 4 4 «4 4 44 44
Podstata vynálezu
Modifikované agonisty receptoru EPO lidského se mohou představit obecným vzorcem
X!-(L)a-X2 kde a je 0 nebo 1, χΐ je peptid, který obsahuje sekvenci aminokyselin odpovídající sekvenci zbytků n+1 až J,
X2 je peptid, který obsahuje sekvenci aminokyselin odpovídající sekvenci zbytků 1 až n, n je celé číslo v rozmezí od 1 do J-l a L je spojovník.
V obecném vzorci výše jsou číslovány postupně 1 až J od amino do karboxylového konce. Pár sousedních aminokyselin v tomto proteinu se může číslovat n a n+1, kde n je celé číslo v rozmezí od 1 do J-l. Zbytek n+1 se stává novým N-koncem nového agonistu EPO receptoru a zbytek n se stává novým C-koncem nového agonistu EPO receptoru.
Vynález se týká nových polypeptidů, agonistů receptoru EPO, obsahujících modifikovanou sekvenci aminokyselin s následujícím vzorcem:
Ala Pro Pro Arg Leu lle Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg 10
Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn lle Thr Thr Gly 20
Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn lle Thr Val Pro 30 40
Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val 50
Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu 60 70
Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser 80
Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala ·» 9
9 • · · · to • to • to ·· to to· · • to· · to · · · · · ·
Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu 100 110
Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ser Ala 120
Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu 130 140
Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu 150
Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg 160 166 kde případně 1 až 6 aminokyselin od N-konce a 1 až 5 od C-konce může být odstraněno z tohoto polypeptidu agonistu EPO receptoru, kde N-konec je spojen s C-koncem přímo nebo spojovníkem schopným spojit N-konec s C-koncem a mající nové C- a N-konce u aminokyselin: 23-24, 24-25, 25-26, 27-28, 28-29, 2930, 30-31, 31-32, 32-33, 33-34, 34-35, 35-36, 36-37, 37-38, 38-39, 40-41, 41-42, 43-44, 44-45, 45-46, 45-56, 46-47, 47-48, 48-49, 50-51, 51-52, 52-53, 53-54, 54-55, 55-56, 56-57, 57-58, 7778, 78-79, 79-80, 80-81, 81-82, 82-83, 83-84, 84-85, 85-86, 86-87, 87-88, 88-89, 108-109, 109110, 110-111, 111-112, 112-113, 113-114, 114-115, 115-116, 116-117, 117-118, 118-119, 119120, 120-121, 121-122, 123-124, 124-125, 125-126, 126-127, 127-128, 128-129, 129-130, 131132, a tento polypeptid agonisty EPO receptoru může být případně bezprostředně předcházen (methionin'1), (alanin-^) nebo (methionin’2, alanin 1).
Výhodější místa zlomu, u kterých lze připravit nový N-konec a N-konec, jsou: 23-24, 2425, 25-26, 27-28, 28-29, 29-30, 30-31, 31-32, 32-33, 33-34, 34-35, 35-36, 36-37, 37-38, 38-39, 40-41, 41-42, 42-43, 52-53, 53-54, 54-55, 55-56, 77-78, 78-79, 79-80, 80-81, 81-82, 82-83, 8384, 84-85, 85-86, 86-87, 87-88, 88-89, 109-110, 110-111, 111-112, 112-113, 113-114, 114-115, 115-116, 116-117, 117-118, 118-119, 119-120, 120-121, 121-122, 123-124, 124-125, 125-126, 126-127, 127-128,128-129, 129-130 a 131-132.
Nejlepší místa zlomu, u kterých lze připravit nový N-konec a N-konec, jsou: 23-24, 2425, 31-32, 32-33, 37-38, 38-39, 82-83, 83-84, 85-86, 86-87, 87-88,125-126, 126-127 a 131-132.
Nejlepší místa zlomu zahrnují místa glykosylace, ne-neutralizující protilátky, místa štěpení proteolytem. Agonisty EPO receptoru podle vynálezu mohou obsahovat substituce • · · 9 9 9 9 9 9 9 9 9 ♦ ··· Φ · Φ ΦΦΦ· · ··· ··· ΦΦΦ·· · ·
ΦΦΦ Φ ·· 9 Φ· ·· aminokyselin, jak je popisuje WO 94/24160, nebo jedno či více míst glykosylace u Asn24,
Asn83 a Asn12^ jsou zaměněna na jiné aminokyseliny, například nikoliv však omezeně, Asp nebo Glu, delece a inserce. Také se zamýšlí, aby agonisty EPO receptoru podle vynálezu mohly mít delece aminokyselin buď u jednoho, nebo obou N- a C-koncích původního proteinu a nebo delece od nových N- a C-konců sekvence přeskupených proteinů ve vzorcích ukázaných výše.
Ve výhodném provedení podle vynálezu spojovník (L) spojující N-konec k C-konci je polypeptid vybraný ze skupiny tvořené:
Gly Gly Gly Ser SEQ ID NO: 123,
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser SEQ ID NO: 124,
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser SEQ ID NO: 125,
Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Ser SEQ ID NO: 126,
Glu Phe Gly Asn Met SEQ ID NO: 127,
Glu Phe Gly Gly Asn Met SEQ ID NO: 128,
Glu Phe Gly Asn Gly Gly Asn Met SEQ ID NO: 129 a
Gly Gly Ser Asp Met Ala Gly SEQ ID NO: 130.
Vynález také zahrnuje rekombinantní agonisty receptoru lidského EPO podávané spolu s kolonie stimulujícími faktory (CSF) včetně cytokinů, lymfokinů, interleukinů, krvetvorných růstových faktorů, které zahrnují, nikoliv však omezeně, GM-CSF, G-CSF, c-mpl ligand (také známý jako TPO nebo MGDF), M-CSF, IL-1, IL-4, IL-2, IL-3, IL-5, IL-6, IL-7, IL8, IL-9, IL-10, IL-11, IL-12, IL-13, IL-15, LIF, lidský růstový hormon, růstový faktor B-buněk, faktor diferenciace B-buněk, faktor diferenciace eosinofilů, faktor kmenových buněk (SCF), také známý jako ocelový faktor nebo c-kit ligand (zde souhrnně uváděné jako faktory). Tyto spolu podávané směsi se mohou charakterizovat tím, že mají obvyklou aktivitu jak peptidů, tak směsi a ’ dále se mohou charakterizovat tím, že mají biologickou aktivitu větší, než je jednoduchá aditivní funkce přítomnosti agonistů EPO receptoru nebo samotné druhé kolonie stimulujícího faktoru. Společné podávání také může zabezpečit zvýrazněný účinek na aktivitu nebo aktivitu odlišnou od očekávané od přítomnosti EPO nebo druhé kolonie stimulujícího faktoru. Společné podávám také může mít zlepšený profil aktivity, který může zahrnovat zmenšení nežádoucích biologických aktivit spojených s nativním lidským EPO.
Mimo seznam výše se varianty IL-3, které se uvádějí vWO 94/12639 a WO 94/12638, fuzní proteiny, které se uvádějí v WO 95/21197 a 95/21254, G-CSF agonisty receptoru, které se i
• 4 ·♦ 4 ·· ·· · 4·· 4 4·· • 4 · 4 4 4 4 4 4·· • 44·· 44 · 4444 4 444 444 • 4 4 4 4 4 4 popisují vWO 97/12977, c-mpl agonisté receptoru, které se popisují vWO 97/12978, IL-3 agonisté receptoru, které se popisují v WO 97/12979 a multifunkční agonisté receptoru, které se popisují vWO 97/12985, mohou podávat spolu spolypeptidy tohoto vynálezu. Jak se zde používá, IL-3 varianty se týká variantů IL-3, které se uvádějí v WO 94/12639 a WO 94/12638. Jak se zde používá, fuzní proteiny se týká spojených proteinů, které se uvádějí v WO 95/21197 a 95/21254. Jak se zde používá, G-CSF agonisty receptoru se týká G-CSF agonistů receptoru, které se popisují v WO 97/12977. Jak se zde používá, c-mpl agonisty receptoru se týká c-mpl agonistů receptoru, které se popisují vWO 97/12978. Jak se zde používá, „IL-3 agonisty receptoru se týká IL-3 agonistů receptoru, které se popisují v WO 97/12979. Jak se zde používá, multifunkční agonisté receptoru se týká multifunkčmch agonistů receptoru, které se popisují v WO 97/12985.
Mimoto se předpokládá, že použití in vitro by zahrnovalo schopnost stimulovat kostní dřeň a aktivaci a růst buněk krve před infuzí expandovaných buněk pacientům.
Také se předpokládá, že použití agonistů EPO receptoru podle vynálezu zahrnovalo aplikace v krevních bankách, kde by se agonisté EPO receptoru podávaly pacientovi, aby se zvýšil počet červených krvinek a krevní produkty se pacientovi odejmou před některou lékařskou procedurou a krevní produkty se skladují a transfuzují se zpět pacientovi po lékařské proceduře. Mimoto se předpokládá, že použití agonistů EPQ receptoru podle vynálezu by zahrnovalo podávání agonistů EPO receptoru dárci krve před darováním krve, aby se zvýšil počet červených krvinek a tím se umožnilo dárci dát bezpečně více krve.
Agonisté EPO receptoru podle vynálezu mohou být užitečné při léčení nemocí charakterizovaných sníženými hladinami červených krvinek v krvetvorné soustavě.
Agonisté EPO receptoru mohou být užitečné při léčení nebo prevenci anemíe. Mnoho léků působí potlačení kostní dřeně nebo krvetvorné nedostatečnosti. Příklady takových léků jsou AZT, DDI, alkylační činidla a antimetabolity použité při chemoterapii, antibiotika, například chloramfenikol, penicilín, gancyklovir, daunomycin a sulfa léky, fenothiazony, trankvilizéry, například meprobamát, analgetika, například aminopyrin a dipyron, antikonvulzanty, například fenytoin nebo karbamazepin, antithyroidy, například propylthiouracil a methiazol, a diuretika. Agonisté EPO receptoru mohou být užitečné při prevenci nebo léčení potlačení kostní dřeně nebo krvetvorné nedostatečnosti, ke kterým často dochází u pacientů při léčení těmito léky.
Ke krvetvorné nedostatečnosti může také docházet jako důsledek virových, mikrobiálních nebo parazitických infekcí a jako důsledek léčení ledvinových nemocí nebo ledvinových selhání, • · ·* · *· ·· s
9 · · · · · * · « 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
9999 9 9 9 9999 9 999 999
9 9 9 9 9 9
999 9 99 9 99 99 například při dialýze. Tento peptid může být užitečný při léčení takové krvetvorné nedostatečnosti.
Jiný aspekt vynálezu poskytuje DNA plazmidové vektory pro použití při expresi těchto nových agonistů receptoru EPO. Tyto vektory obsahují nové DNA řetězce popsané výše, které kódují nové polypeptidy podle vynálezu. Vhodné vektory, které mohou transformovat hostitelské buňky schopné exprese agonistů EPO receptoru zahrnují vektory exprese obsahující řetězce nukleotidů kódující agonisty EPO receptoru spojené k transkripčmm a translačním regulačním řetězcům, které jsou vybrány podle použité hostitelské buňky.
Vektory zahrnující modifikované řetězce, jak jsou popsané výše, se zahrnují do tohoto vynálezu a jsou užitečné pří výrobě modifikovaných agonistů receptoru EPO. Vektor použitý při tomto způsobu také obsahuje vybrané regulační řetězce v operativním spojení s kódujícími DNA řetězci podle vynálezu a je schopný usměrnit jejich replikaci a expresi ve vybraných hostitelských buňkách.
Jako jiný aspekt vynálezu je dán způsob výroby nové skupiny agonistů receptoru EPO. Způsob podle vynálezu vyžaduje kultivaci vhodných buněk nebo linií buněk, které se transformovaly vektorem obsahujícím DNA řetězec kódující expresi nového polypeptidů agonisty EPO receptoru. Vhodné buňky nebo linie buněk mohou být bakteriální buňky. Například různé kmeny E. coli, kvasinek, savčí buňky nebo hmyzí buňky se mohou použít jako hostitelské buňky při způsobu podle vynálezu.
Jinými aspekty vynálezu jsou způsoby a terapeutické kompozice k lečem stavů uvedených výše. Takové kompozice obsahují terapeuticky účinné množství jednoho či více agonistů EPO receptoru podle vynálezu ve směsi s farmaceuticky přijatelným nosičem. Tato kompozice se může podávat parenterálně, intravenosně nebo podkožně. Když se podává, je terapeutická kompozice podle vynálezu s výhodou ve formě parenterálně přijatelného vodného roztoku bez pyrogenů. Příprava takového parenterálně přijatelného roztoku proteinů s patřičným ohledem na pH, isotonicitu, stabilitu a podobně, je v mezích schopností odborníků.
Podávám bude v souladu s dávkovým režimem, který snadno stanoví lékař s ohledem na specifickou aktivitu analogu in vivo se srovnání s lidským erythropoietinem a s ohledem na to, co je nyní v oboru známo o podávám lidského erythropoietinu pro indukci erythropoiesis a léčení různých stavů, například anemie, včetně anemie u lidí trpících selháním ledvin. Dávka analogu podle vynálezu se může od jednotlivce k jednotlivci poněkud měnit v závislosti na daném analogu a jeho specifické aktivitě in vivo, cestě podávám, medicínském stavu, citlivosti pacienta k analogu nebo složkám vehiklu a jiných faktorech, na které lékař bude schopný brát • · 99 9 99 99
9 9 9 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
9999 99 9 9999 9 999 999
9 9 9 9 9 9 ohled. S ohledem na terapeutické použití analogů podlé‘vynálezu šě odkazuje* *na *ŮS patenty čísla 4,703,008 a 4,835,260, viz také kapitolu o (rekombinantní) (des-Arg166) lidském erythropoíetinu na stranách 591-595 vPhysicians' Desk. Komerčně dostupné preparáty rekombinantního (des-Arg) lidského erythropoíetinu mají 2000, 3000, 4000 nebo 10000 jednotek glykohormonu na ml vodného roztoku bez prezervativů s 2,5 mg/ml lidského sérového albuminu, 5,8 mg/ml citrátu sodného, 5,8 mg/ml NaCl a 0,06 mg/ml kyseliny citrónové, pH 6,9 (+/-0,3).
Rekombinantně připravený EPO se ukázal zvlášť užitečný pro léčení pacientů trpících zhoršenou tvorbou červených krvinek (Physicians' Desk Reference (PDR), vydání 1993, strany 602-605). Rekombinantně připravený EPO se ukázal účinný při léčení anemie spojené s chronickým selháním ledvin a jednotlivců nakažených HIV, trpících sníženými hladinami ondogenní EPO, spojené s terapií s zidovudinem (AZT) (viz PDR, vydání 1993, strana 602).
Modifikace EPO proteinu, která by zlepšila jeho užitečnost jako nástroje pro diagnosu nebo léčení krevních potíží, by jistě byla žádoucí. Zejména modifikované formy EPO vykazující silnější biologickou aktivitu by byly účinnější a efektivní než nativní EPO při terapeutickém uspořádám, kdy se musí EPO podávat pacientovi. To dává možnost EPO podávat méně často a nebo v menších dávkách. Podávání snížených množství EPO také může snížit nebezpečí nepříznivých účinků spojených s EPO ošetřením, například hypertenze, návaly, bolesti hlavy etc. (viz PDR, vydání 1993, strany 603-604). Agonisty EPO receptorů podle vynálezu také mohou mít zlepšenou stabilitu a tím prodloužený poločas, což by umožnilo produkci ne-glykosylované formy EPO v bakteriální expresní soustavě za mnohem nižší cenu. V důsledku prodlouženého poločasu by tato ne-glykosylovaná forma EPO měla silnější biologickou aktivitu in vivo ve srovnání s de-glykosylovanou formou EPO.
Terapeutický způsob a kompozice mohou také zahrnovat společné dávkování s jinými hematopoietickými faktory. Neúplný seznam jiných vhodných hematopoietinů, kolonií stimulujících faktorů (CSF) a interleukinů pro simultánní nebo následné společné dávkování s polypeptidy tohoto vynálezu zahrnuje GM-CSF, G-CSF, c-mpl ligand (také známý jako TPO nebo MGDF), M-CSF, IL-1, IL-4, IL-2, IL-2, IL-3, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-11, IL-12, IL-13, IL-15, LIF, lidský růstový hormon, růstový faktor B-buněk, faktor diferenciace Bbuněk, faktor diferenciace eosinofilů, faktor kmenových buněk (SCF), také známý jako ocelový faktor nebo c-kit ligand (zde souhrnně uváděné jako faktory) nebo jejich kombinace. Mimo seznam výše se varianty IL-3, které se uvádějí v WO 94/12639 a WO 94/12638, fuzní proteiny, které se uvádějí v WO 95/21197 a 95/21254, G-CSF agonisty receptorů, které se popisují v WO ·
• •4 444 4444 • •4 4 4 « · · · · ·
4444 44 4 4444 · 444 444 444 4444 44
97/12977, c-mpl agonisty receptorů, které se popisují v WO 977l297*8, IL-*3 agomsty*receptoru, které se popisují vWO 97/12979 a multifunkční agonisty receptorů, které se popisují vWO
97/12985, mohou podávat spolu s polypeptidy tohoto vynálezu.
Agonisty EPO receptorů podle vynálezu mohou být užitečné při mobilizaci hematopoietických progenitorů a kmenových buněk v periferní krvi. Ukázalo se, že progenitory vzniklé v periferní krvi jsou účinné při rekonstituci pacientů v situaci autologní transplantace kostní dřeně.
Agonisty EPO receptorů podle vynálezu mohou být také užitečné při ex vivo expanzi hematopoietických progenitorů. Faktory stimulující kolonie (CSF), jako je G-CSF, se mohou podávat samotné nebo podávat společné s jinými CSF nebo v kombinaci stransplanty kostní dřeně po vysokých dávkách chemoterapie při léčení anemie, neutropenie a trombocytopenie, které často vznikají při takovém léčení.
Jiným aspektem vynálezu je zajištění způsobů udržovat nebo expandovat hematopoietické prekursomí buňky, což zahrnuje očkování buněk do kultivační nádoby, která obsahuje kultivační medium, které bylo upraveno expozicí s kmenovými buňkami, jako jsou HS-5 (WO 96/02662, Roecklein a Torok-Strob, Blood 85: 997-1105 (1995)), které byly doplněny agonisty receptorů EPO podle vynálezu.
Krátký popis obrázků
Obrázek 1 schématicky ukazuje přeskupení sekvence proteinu. N-konec (N) a C-konec (C) nativního proteinu jsou spojeny spojovníkem nebo jsou spojeny přímo. Protein je otevřen vmiste zlomu, což vytvoří nový N-konec (nový N) a nový C-konec (nový C), což vede k novému proteinu s novou sekvencí aminokyselin. Přeskupenou molekulu lze syntetizovat de novo jako lineární molekulu a nemusí se procházet kroky spojování původního N-konce a Ckonce a otvírání proteinu v místě zlomu.
Obrázek 2 ukazuje schematicky způsob I pro vytvoření nových proteinů, ve kterých původní N-konec a C-konec nativního proteinu jsou spojeny spojovníkem a vytvoří se odlišný N-konec a C-konec proteinu. V ukázaném příkladu přrskupení sekvence vede k novému kódování genu proteinu s novým N-koncem vytvořeným u aminokyseliny 97 původního proteinu. Původní C-konec (aminokyselina 174) je spojen k aminokyselině 11 (aminokyseliny 110 jsou odstraněny) spojovací oblastí a nový C-konec se vytvoří u aminokyseliny 96 původní sekvence.
• 44 4 44 44
4 444 4444
444 4 444 4 4 4 4
4444 44 4 444* · 444 444 4 4 4 4 4 4 4
4 4 44 4 44 44
Obrázek 3 ukazuje schematicky způsob II pro vytvoření nových proteinů, ve kterých původní N-konec a C-konec nativního proteinu jsou spojeny bez spojovníku, a vytvoří se odlišný N-konec a C-konec proteinu. V ukázaném příkladu reorganizace sekvence vede k novému kódování genu proteinu snovým N-koncem vytvořeným u aminokyseliny 97 původního proteinu. Původní C-konec (aminokyselina 174) je spojen k aminokyselině 96 původní sekvence.
Obrázek 4 ukazuje schematicky způsob III pro vytvoření nových proteinů, ve kterých původní N-konec a C-konec nativního proteinu jsou spojeny spojovníkem a vytvoří se odlišný N-konec a C-konec proteinu. V ukázaném příkladu reorganizace sekvence vede k novému kódování genu proteinu snovým N-koncem vytvořeným u aminokyseliny 97 původního proteinu. Původní C-konec (aminokyselina 174) je spojen k aminokyselině 1 spojovací oblastí a nový C-konec se vytvoří u aminokyseliny 96 původní sekvence.
Obrázek 5 ukazuje DNA sekvenci kódující lidský zralý EPO, založenou na sekvenci Lín aj. (PNAS 82: 7580-7584 (1985)).
Příklady provedení vynálezu
Stanovení spojovníku
Délka sekvence aminokyselin spojovníku se může vybrat empiricky nebo s ohledem na strukturní informaci nebo s použitím kombinace obou přístupů.
Když není dostupná žádná strukturní informace, může se připravit malá série spojovníků pro testování s použitím designu jehož délka se mění, aby přesáhl rozpětí od 0 do 50 cm'^ a jejichž sekvence se vybere, aby byla konzistentní s povrchovou expozicí (hydrofilnost, Hopp a Woods, Mol. Immunol. 20: 483-489 (1993), Kyte a Doolittle, J. Mol. Biol., 157: 105-132 (1982)), povrch exponovaný rozpouštědlu (Lee a Richards, J. Mol. Biol., 55: 379-400 (1971)) a schopnost zaujmout potřebnou konformaci bez rozbití konfigurace agonisty EPO receptoru (konformačně flexibilní, Karplus a Schulz, Naurwissenschaften 72: 212-213 (1985). Předpokládaje průměrnou translaci 2,0 až 3,8 108 na zbytek by to znamenalo, že délka ke zkoušení by byla mezi 0 až 30 zbytky s výhodným rozmezím mezi 0 až 15 zbytky. Příkladem pro takovou empirickou sérii by byla konstrukce spojovníků s pomocí kazetové sekvence GlyGly-Gly-Ser opakované n krát, kde n je 1, 2, 3 nebo 4. Odborníci poznají, že existuje mnoho takových sekvencí, které se liší délkou nebo složením, které mohou sloužit jako spojovníky s prvotním ohledem, aby nebyly příliš dlouhé nebo krátké (srovnej Sandhu, Critical Rev. Biotech. 12: 437-452 (1992)). Pokud jsou příliš dlouhé, entropické účinky by asi destabilizovaly aa aa » a a i troj-rozměrné složení a také by mohly učinit skládání kineticky nepraktické, a pokud jsou příliš krátké, budou asi destabilizovat molekulu z důvodu torsního a stérického pnutí.
• · a · • · · · • · · · · ···· · · · ·1 • » · • a r a aaa a a aa aa
Odborníci na analýzu strukturní informace proteinů poznají, že s využitím vzdálenosti mezi konci řetězce, definované jako vzdálenost mezi c-alfa uhlíky, se může definovat délka řetězce, který se má použít, nebo alespoň omezit počet možností, které se musí testovat při empirickém výběru spojovníků. Také poznají, že v některých případech jsou polohy konců polypeptidu špatně definované ve strukturních modelech odvozených z difrakce X-paprsků nebo ze spektroskopických údajů nukleární magnetické resonance. Pokud je to pravda, musí se brát zřetel na tuto situaci, aby se správně určila délka potřebného spojovníku. Z těch zbytků, jejichž polohy jsou dobře definované, se vyberou dva zbytky, které jsou v sekvenci blízko ke koncům řetězce a vzdálenost mezi jejich c-alfa uhlíky se využije k výpočtu přibližné délky spojovníku mezi nimi. S využitím vypočtené délky se pak vyberou spojovníky s rozmezím počtu zbytků -8 (vypočtené s využitím 2,0 až 3,8 10 cm na zbytek). Tyto spojovníky se mohou komponovat s původní sekvencí, podle potřeby zkrátit nebo prodloužit. Když se prodlužují, další zbytky se mohou vybrat, aby byly flexibilní nebo hydrofilní, jak se popisuje výše, nebo případně se původní sekvence může substituovat s použitím série spojovníků, jeden například je kazetový přístup Gly-Gly-Gly-Ser zmíněný výše nebo se případně může použít kombinace původní sekvence a nové sekvence mající přibližnou celkovou délku.
Stanovení aminových a karboxylových konců agonistů receptoru EPO
Sekvence agonistů receptoru EPO schopná se skládat do biologicky aktivních stavů se může připravit vhodným výběrem poloh počátku (aminový konec) a konce (karboxylový konec) z původního řetězce polypeptidu, jak se popisuje výše. Aminové a karboxylové konce se vyberou v rozmezí obecného rozpětí sekvence uváděného jako oblast místa zlomu s použitím směrnic, jak se popisují níže. Nová sekvence aminokyselin se tak vytvoří výběrem aminových a karboxylových konců v rozmezí stejné oblasti místa zlomu. V mnoha případech výběr nových konců bude takový, aby původní poloha karboxylového konce bezprostředně předcházela aminovému konci. Avšak odborníci poznají, že výběry konců kdekoliv uvnitř oblasti mohou fungovat a že povedou účinně buď k delecím, nebo adicím aminových nebo karboxylových částí nové sekvence.
Ústředním dogmatem molekulární biologie je to, že primární sekvence aminokyselin proteinu diktuje skládání do troj-rozměrné struktury potřebné pro expresi jeho biologické funkce. Odborníkům jsou známé způsoby, jak získat troj-rozměrnou strukturní informaci s využitím difrakce X-paprsků jednotlivých krystalů proteinu nebo nukleární magnetické resonančm
Φ φ ·» φ ·· *· ·· · ·♦· * · · · • · · · ·«· · · · · • ΦΦ·Φ φ · · ···· · »·· ♦ ·· • φ · « « · · • ΦΦ · φφ · ·· ·· spektroskopie roztoků proteinu. Příklady strukturní informace, která je relevantní k identifikaci oblastí míst zlomu zahrnují lokaci a typ sekundární struktury proteinu (alfa a 3-10 šroubovnice, paralelní a anti-paralelní beta vrstvy, zvraty a obraty a smyčky (Kabsch a Sander, Biopolymers 22: 2577-2637 (1983)), stupeň vystavení zbytků aminokyselin rozpouštědlu, rozsah a typ interakcí zbytků mezi sebou (Choyhia, Ann. Rev. Biochem. 53: 537-572 (1984)) a statické a dynamické rozdělení konformací podél řetězce polypeptidů (Alber a Mathews, Methods Enzymol. 154: 511-533 (1987)). V některých případech je známá další informace o vystavení zbytků aminokyselin rozpouštědlu, jedním případem je místo potranslačního spojem uhlovodíku, které je nutně na povrchu proteinu. Když není dostupná experimentální strukturní informace, nebo se nemůže získat, jsou též dostupné způsoby, jak analyzovat primární sekvenci aminokyselin, aby se mohly předpovědět terciární a sekundární struktury proteinu, přístupnost rozpouštědlu a výskyt obratů a smyček. Někdy lze aplikovat pro empirické stanovém' výstavem povrchu biochemické metody, když nejsou uskutečnitelné přímé strukturní metody, například s využitím identifikace míst štěpem řetězce po omezené proteolýze, aby se zjistilo vystavení povrchu (Gentile a Salvátore, Eur. J. Biochem. 218: 603-621 (1993)).
Tak s použitím buď experimentálně odvozené strukturní informace, nebo způsobů predikce (například Srisnivisan a Rose, Proteins: Struct. Funct. and Genetics, 22: 81-99 (1995)) se prohlédne původní sekvence aminokyselin, aby se klasifikovaly oblasti podle toho, jsou-li nebo nejsou-li integrální pro udržení sekundární a terciární struktury. Výskyt sekvencí s oblastmi, o nichž je známo, že se účastní periodické sekundární struktury (alfa a 3-10 šroubovnice, paralelní a anti-paralelní beta vrstvy, zvraty a obraty a smyčky jsou oblasti, kterým je nutné se vyhnout. Podobně oblasti sekvence aminokyselin, u nichž se pozorovalo nebo předpovědělo, že mají nízký stupeň vystavení rozpouštědlu, jsou pravděpodobněji částí tak zvaného hydrofobního jádra proteinu a mělo by se jim také vyhnout při výběru. Naproti tomu oblasti, o kterých je známo nebo předpovězeno, že jsou na povrchu obratů nebo smyček a zvláště ty oblasti, o kterých je známo, že nejsou potřebné pro biologickou aktivitu, jsou výhodná místa pro umístění extrémů řetězce polypeptidů. Kontinuální kusy sekvence aminokyselin, kterým se dává přednost na základě kriterií výše uvedených, se uvádějí jako oblasti míst zlomu.
to ·· · toto ·· ··· ··· «»··· ··· toto · » ·*·· to ···· ·· to ···· · »«· ♦·· to · μ · · ·· ··· · ·· · ·· ·· (100 gg/ml ampicillinu, 75 gg/ml spectinomycinu. Před sklizní se analyzuje 1 gg buněk pomocí PCR na přítomnost genu agonisty EPO receptorů. PCR se provádí s využitím kombinace primérů, které se spojují s genem agonisty EPO receptorů a nebo s vektorem. Když PCR skončí, přidá se k vzorku vedoucí barvivo a potom následuje elektroforéza, jak se popisovalo výše. Gen se spojil s vektorem, když se pozoruje produkt PCR očekávané velikosti.
Způsoby vytvoření genů s novým N-koncem/C-koncem
Způsob I. Vytvoření genů s novým N-koncem/C-koncem, které obsahují oblast spojovníku.
Geny s novým N-koncem/C-koncem, které obsahují oblast spojovníku oddělující původní C-konec a N-konec se mohou vytvořit podstatně podle způsobu popsaného v Mullins aj., J. Am. Chem. Soc. 116: 5529-5533 (1994). K přeskupení DNA sekvence kódující primární sekvenci aminokyselin proteinu se použije řada kroků amplifikace polymerázové řetězové reakce (PCR). Kroky jsou ukázány na obr. 2.
V prvém kroku se použije nastavení priméru (nový start a start spojovníku, aby se vytvořil a amplifikoval z původního řetězce genu fragment DNA start fragmentu kódující nový protein, následovaný spojovníkem, který spojuje C-terminální a N-terminální konce původního proteinu. V druhém kroku se použije nastavení priméru (nový stop a stop spojovníku, aby se vytvořil a amplifikoval z původního řetězce genu fragment DNA stop fragmentu kódující stejný spojovník, který se použil výše, následovaný novou C-terminální částí nového proteinu. Navrhnou se priméry označené nový start anový stop, aby zahrnovaly vhodná místa pro rozlišení restrikčními enzymy, což umožní klonování nového genu do plazmidu exprese.
o o
Typickými podmínkami PCR jsou jeden cykl 95 C po 2 minuty tání, 25 cyklů 94 C denaturace po 1 minutu, 50 °C po minutu žíhání a 72 °C po 1 minutu extenze, plus jeden cykl extenze při 72 °C po sedm minut. Použije se Perkin Elmer GeneAmp PCR Core souprava činidel. 100 gm reakční směsi obsahuje 100 pmol každého priméru a jeden gg vzorové DNA a 1 x ústoj PCR. 200 gmol dATP, 200 gmol dCTP, 2,5 jednotek AmpliTaq DNA polymerázy a 2 mmol MgCl2. Reakce PCR se provádějí v DNA tepelném cyklovači model 480 (Perkin Elmer Corporation, Norwalk, CT).
Start fragmentu a stop fragmentu, které mají komplementární sekvenci v oblasti spojovníku a kódující sekvenci pro dvě aminokyseliny na obou stranách spojovníku se spolu spojí v třetím kroku PCR, aby se vytvořila plná délka genu kódujícího nový protein. Fragmenty DNA start fragmentu a stop fragmentu se vyvolají na 1% TEA gelu barveného ethidium ·· ♦ • · · · · · ···· • · · ···· ···· • ···· · · · ·»·· · ··· ··· ·<··· · · e·· · ·· · ·· «·
Metody a materiály
Metody rekombinantní DNA
Pokud není uvedeno jinak, všechny speciální chemikálie byly získané od Sigma Co. (St. Louis, MO). Restrikční endonukleázy a T4 DNA ligáza byly získané od New England Biolabs (Beverly, MA) nebo od Boehringen Mannheim (Indianapolis, IN)
Transformace kmenů Escheria coli
Kmeny E. coli jako DH5a™ (Life Technologies, Gaithersburg, MD) a TG1 (Amersham Corp., Arlington Heights, IL) se užívají k transformaci ligačních reakcí a jsou zdrojem plazmidu «
DNA pro transfekci savčích buněk Kmeny E. coli jako MON105 a JM101 se mohou použít k expresi agonistů EPO receptoru podle vynálezu v cytoplazmě nebo periplazmickém místě.
MON105 ACTT #55204: F-, lamda-, IN(rmD, rrE)l, rpoD+, rpoH358.
DH5oc™: F-, phi80dlacZdeltaM15, delta(lacZYA-argF)U169, deoR, recAl, endAl, hsdR17(rk-,mk+), phoA, supE441amda-, thi-1, gyrA96, relAl.
JMI 01: delta (lac-pro), supE, thi-1, hsdD5/F’ (traD36, proA+B+, laclq, lacZdeltaM15).
DH5a™ subklonovací účinné buňky jsou získané jako kompetentní buňky a jsou připravené k transformaci podle protokolu výrobce, zatímco oba kmeny E. coli TG1 a MON105 se uschopní pro převzetí DNA pomocí CaCl2 metody. Typicky se pěstuje 20 až 50 ml buněk v LB mediu (1% Bacto-trypton, 0,5% Bacto-extrakt z kvasinek, 150 mmol NaCl) o hustotě asi 1,0 optických jednotek při 600 nanometrech (OD600) se měří na spektrofotometru Spectronics (Baush and Lomb, Rochester, NY). Buňky se odeberou odstředěním a znovu se suspendují v pětinovém objemu kultivačního roztoku CaCl2 (50 mmol CaCl2, 10 mmol Tris-Cl. pH 7,4) a «
udržují se při 30 minut 4 °C. Buňky se odeberou odstředěním a znovu se suspendují v desetině z objemu kultivačního roztoku CaCl2. Slitá DNA se přidá k 0,2 ml objemu těchto buněk a vzorky se drží při 4 °C jednu hodinu. Vzorky se uvedou na 42 °C po 2 minuty a přidá se 1 ml LB před třepáním vzorků při 37 °C po jednu hodinu. Buňky z těchto vzorků se rozestřou na misky (LB medium plus 1,5% Bacto-agar) obsahující buď ampicillin (100 mikrogramů/ml pg/ml), když se selektovalo na transformanty odolné proti ampicillinu, nebo spectinomycin (75 pg/ml), když se selektovalo na transformanty odolné proti spectinomycinu. Misky se inkubují přes noc při 37 °C.
o
Vyberou se osamělé kolonie, rostou za třepám při 37 C v LB s dodaným vhodným antibiotikem i
L • ·· · ·* ·· * ··· · · · · • · ···· ···· ···· · · · ···· · ··· ··· • · · · · · ··· * ·· · · · 9 9 bromidem a izolovaného s použitím extrakční soupravy Quiaex Gel (Quiagen). Tyto fragmenty se smísí v ekvimolekulárních množstvích, zahřejí se na 70 °C na 10 minut a pomalu ochladí, aby se umožnilo spojení přes jejich sdílenou sekvenci v oblasti start spojovníku a stop spojovníku. V třetím kroku PCR se přidají ke spojeným fragmentům priméry nový start a nový stop, aby se vytvořila a amplifíkovala plná délka genu N-konec/C-konec. Typickými podmínkami PCR jsou jeden cykl 95 °C po 2 minuty tání, 25 cyklů 94 °C denaturace po 1 minutu, 60 °C po minutu žíhání a 72 °C po minutu extenze, plus jeden cyklus extenze při 72 °C po sedm minut. Použije se Perkin Elmer GeneAmp PCR Core souprava činidel. 100 pm reakční směsi obsahuje 100 pmol každého priméru a asi 0,5 pg DNA a 1 x ústoj PCR. 200 pmol dATP, 200 pmol dCTP, 2,5 jednotek AmpliTaq DNA polymerázy a 2 mmol MgCl2. Reakce PCR se čistí pomocí soupravy Wizard PCR Preps (Promega).
Způsob II. Vytvoření genů s novým N-koncem/C-koncem bez oblasti spojovníku.
Geny s novým N-koncem/C-koncem bez spojovníku spojujícího původní C-konec a Nkonec se mohou vytvořit pomocí dvou kroků PCR amplifikace a spojení tupých konců. Kroky se ukazují na obrázku 3.
V prvém kroku se použije nastavení priméru (nový start a start P-bl), aby se vytvořil a amplifíkoval z původního řetězce genu fragment DNA start fragmentu, který obsahuje sekvenci kódující novou C-terminální část nového proteinu. V druhém kroku se použije nastavení priméru (nový stop a stop P-bl), aby se vytvořil a amplifíkoval z původního řetězce genu fragment DNA stop fragmentu, který obsahuje sekvenci kódující novou Cterminální část nového proteinu. Navrhnou se priméry označené nový start a nový stop, aby zahrnovaly vhodná restrikční místa, která umožňují klonování nového genu do vektorů exprese.
o o
Typickými podmínkami PCR jsou jeden cyklus 95 C po 2 minuty tání, 25 cyklů 94 C o o denaturace po 1 minutu, 50 C po 45 sekund žíhám a 72 C po 45 sekund extenze. Použije se polymeráza Deep Vent (New England Biolabs) za podmínek doporučených výrobcem, aby se snížil výskyt přesahů. Priméry start P-bl a stop P-bl se fosforylují na 5' konci, aby se usnadnilo následující spojení tupých konců start fragmentu a stop fragmentu k sobě. 100 pm reakční směsi obsahuje 100 pmol každého priméru a jeden pg vzorové DNA a 1 x ústoj Vent (New England Biolabs), 300 pmol dGTP, 300 pmol dATP, 300 pmol dTTP, 300 pmol dCTP a 1 jednotku polymerázy Deep Vent. Reakce PCR se provádějí v DNA tepelném cyklovači model 480 (Perkin Elmer Corporation, Norwalk, CT) a čistí se pomocí soupravy Wizard PCR Preps (Promega).
• * toto to ·· ·· ··· to to to to · · · • toto ···· ···· • to··· ·· to ···· · ··· ··· • toto·· ·« ··· « ·· · «· ·«
Primery se navrhnou, aby zahrnovaly vhodná místa rozpoznaná restrikčními enzymy, která umožňují klonování nového genu do vektorů exprese. Typicky se start fragmentu navrhne tak, aby vytvořil Ncol restrikční místo a stop fragmentu se navrhne tak, aby vytvořil HindlII restrikční místo. Restrikční stravovací reakce se čistí pomocí soupravy Magie DNA Clean-up System (Promega). Fragmenty Start a Stop se vyvolají na 1% TEA gelu barveného ethidium bromidem a izolovaného s použitím extrakční soupravy Qiaex Gel (Qiagen). Tyto fragmenty se smíchají a připojí se ke koncům fragmentu NcoI/HindlII s asi 3800 páry baží vektoru pMON3934 zahříváním na 50 °C na 10 minut a nechá se pomalu ochladit. Tři fragmenty se spolu spojí pomocí T4 DNA ligázy (Boehringen Mannheim). Výsledkem je plazmid obsahující plnou délku genu nový N-konec/C-konec. Část spojovací reakce se použije k transformaci DH5a buněk (Life Technologies, Gaithersburg, MD). Plazmid DNA se čistí a sekvence se potvrdí jako níže.
Způsob III. Vytvoření genů s novým N-koncem/C-koncem metodou tandemové duplikace.
Tandemově duplikované geny s N-koncem/C-koncem lze připravit způsobem popsaným vHorlick aj., Protein Eng. 5: 427-431 (1992). Amplifikace polymerázovou řetězovou reakcí (PCR) genů s novým N-koncem/C-koncem se provede pomocí tandemově duplikované vzorové DNA Kroky se ukazují na obrázku 4.
Tandemově duplikovaná vzorová DNA se vytvoří klonováním a obsahuje dvě kopie genu oddělené sekvencí DNA kódující spojovník původních C-terminálního a N-terminálního konce dvou kopií genu. Použijí se specifická nastavení priméru, aby se vytvořila a amplifikovala plná délka genu s novým N-koncem/C-koncem z tandemově duplikované vzorové DNA. Tyto priméry se navrhnou tak, aby zahrnovaly vhodná restrikční místa, což umožní klonování nového o
genu do vektorů exprese. Typickými podmínkami PCR jsou jeden cykl 95 C tání po 2 minuty, 25 cyklů 94 °C denaturace po 1 minutu, 50 °C žíhání po minutu a 72 C extenze po 1 minutu, plus jeden cykl extenze při 72 °C po sedm minut, Použije se Perkin Elmer GeneAmp PCR Core souprava reagentů (Perkin Elmer Corporation, Norwalk, CT). 100 pm reakční směsi obsahuje 100 pmol každého priméru a jeden pg vzorové DNA a 1 x ústoj PCR, 200 pmol dGTP, 200 pmol dATP, 200 pmol dTTP, 200 pmol dCTP, 2,5 jednotek AmpliTaq DNA polymerázy a 2 mmol MgCl2- Reakce PCR se provádějí v DNA tepelném cyklovači model 480 (Perkin Elmer Corporation, Norwalk, CT). Reakce PCR se čistí pomocí soupravy Wizard PCR Preps (Promega).
• « • · · · to · to a· to to
Izolace a charakterizace DNA • · to ···· · • · · · to «· ·
Plazmidová DNA se může izolovat řadou různých způsobů a s použitím komerčně dostupných souprav známých odborníkům. Plazmidová DNA se izoluje pomocí soupravy Promega Wizard™ Miniprep (Madison, WI), souprav Qiagen QIAwell Plazmid izolation (Chastsworth, CA) nebo soupravy Qiagen Plazmid Midi. Tyto soupravy sledují stejný obecný postup pro izolaci plazmidové DNA. Stručně, buňky se peletují odstředěním (5000 x g), plazmidová DNA se uvolní postupným ošetřením NaOH/kyselina a buněčné zlomky se odstraní odstředěním (10000 x g). Kalová voda (obsahující plazmidovou DNA) se naloží na kolonu obsahující pryskyřici, která váže DNA a plazmidová DNA se eluuje pomocí TE. Po screeningu na kolonie shledaným plazmidem se očkují buňky E. coli do 50-100 ml LP plus vhodné antibiotikum pro růst přes noc při 37 °C ve vzdušném inkubátoru za třepání. Vyčištěná plazmidová DNA se použije pro sekvenování DNA, další trávení restrikčními enzymy, další podklonování fragmentů DNA a transfekci do savců, E. coli nebo do jiných buněk.
Potvrzení sekvencí
Vyčištěná plazmidová DNA se znovu suspendují vdí^O a kvantifikují se měřením absorbance při 260/280 nm v spektrofotometru Spectronics 601 UV (Baush and Lomb). Vzorky DNA se sekvenují pomocí soupravy terminátorové sekvencující chemie ABI PRISM™ DyeDeoxy™ (Applied Biosystems Division of Perkin Elmer Corporation, Lincoln City, CA) podle protokolu navrženého výrobci, obvykle modifikovaného přidáním 5% BMSO k sekvenující směsi. Sekvenování se provádí v DNA tepelném cyklovači model 480 (Perkin Elmer Corporation, Norwalk, CT) podle doporučených podmínek amplifikace. Vzorky se čistí, aby se odstranil přebytek terminátorových barviv, kolonami Centri-Sep™ (Princenton Separations, Adelphia, NJ) a lyofilizují se. Sekvenující reakce označené fluorescentním barvivém se znovu suspendují v deionizovaném formamidu a sekvenují se na denaturujícím 4,75% polyakrylamid-8M moěovinových gelech pomocí automatizovaného sekvenovaěe DNA ABI Model 373A. Překrývající se fragmenty DNA a sekvence se analyzují a sestavují do master DNA sborů pomocí analytického software Sequencer v2.1 DNA (Gene Codes Corporation, Ann Arbor, MI).
Exprese agonistů receptoru EPO v savčích buňkách
Transfekce savčích buněk/ produkce upraveného media.
• · » · · · · • *· * Μ · ·* ·«
Buněčnou linii BHK-21 lze získat od ACTT (Rockville, MD). Buňky se kultivují v modifikovaném Dulbeccově Eagle mediu (DMEM, vysoká glukóza) obohaceném 10% fetálním hovězím sérem (FBS). Tato formulace je označena BHK růstové medium. Selektivním mediem je BHK růstové medium obohacené 453 jednotek/ml hydromycinu B (Calbiochem, San Diego, CA). Buněčná linie BHK-21 se před tím transfektovala HSV transaktivačním proteinem VP16, který transaktivuje promotor IE110, který se nalézá na plazmidu pMON3359 (viz Hippenmeyer aj., Bio/Technology, strany 1037-1041 (1993)). Protein VP16 podněcuje expresi genů vložených za promotor LEI 10. Buňky BHK-21 s expresí transaktivujícího proteinu VP16 je označena BHK-VP16. Plazmidu pMON1118 (viz Highkin aj., Poultry Sci, 70: 970-981 (1991)) vyjadřuje gen odolnosti proti hydromycinu z promotoru SV40. Podobný plazmid lze získat od ACTT, pSV2-hph.
Buňky BHK-VP16 se vysejí na 60 mm kultivační misky pro tkáně při 3 x 10^ buněk na misku 24 hodiny před transfekcí. Buňky se transfektují po 16 hodin v 3 ml OPTIMEM™ (Gibco-BRL, Gaithersburg, MD) obsahujícím 10 pg plazmidové DNA obsahující příslušný gen, 3 μg plazmidu odolnosti proti hydromycinu pMONl 118 a 80 pg LIPOFECTAMINE™ (GibcoBRL) na misku. Medium se potom odsálo a nahradilo se 3 ml růstového media. 48 hodin po transfekcí se medium z každé misky sebralo a testovalo se na aktivitu (přechodně kondiciované medium). Buňky se odstraní z misky pomocí trypsin-EDTA, zředilo se 1:10 a přeneslo se na 100 mm kultivační misky pro tkáně obsahující 10 ml selektivního media. Přibližně po 7 dnech v selektivním mediu odolné buňky vyrostou do kolonií s průměrem několika milimetru. Kolonie se odstraní z misky filtračním papírem (nařezaného asi na stejnou velikost jako kolonie a namočené do trypsin-EDTA) a přenesou se do jednotlivých jamek desky s 24 jamkami obsahujících 1 ml selektivního media. Když klony dostatečně vyrostou, kondiciované medium se znovu testuje a positivní klony se expandují do růstového media.
Exprese agonistů receptoru EPO v E. coli
Buňky E. coli kmen ΜΘΝ105 nebo JM101, obsahující příslušný plazmid rostou při 37 °C v M9 mediu plus kasaminové kyseliny za třepání ve vzdušném inkubátoru model G25 od New Brunswick Scientific (Edison, New Jersey). Růst se sleduje při OD600, dokud nedosáhne hodnotu 1, kdy se přidá nalidixová kyselina (10 mg/ml) v 0,1 N NaOH na konečnou koncentraci 50 pg/ml. Kultury se pak třepou při 37 °C tři až čtyři další hodiny. Během kultivační fáze se udržuje vysoký stupeň aerace, aby se dosáhla maximální produkce žádaného genového produktu. Buňky se zkoumají pod světelným mikroskopem na přítomnost zachycených částic (IB). Jedno mililitrové podíly kultury se odeberou pro analýzu obsahu proteinů vařením peletovaných buněk, jejich ošetřením redukujícím ústojem a elektroforézou přes SDS-PAGE (viz Maniatis aj.,
Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 1982). Kultura se odstřeďuje (5000 x g), aby se buňky peletovaly.
Další strategie pro dosažení vysokého stupně exprese genů v E.coli lze nalézt v Sawas C. M., Microbiological Reviews, 60: 512-538 (1996).
Příprava zachycených částic: Extrakce, nové složení, dialýza, DEAE chromatografie a charakterizace agonistů receptoru EPO, které se hromadí v zachycených částicích v E. coli Izolace zachycených částic:
Peleto váné buňky z kultury 330 ml E. coli,$Q znovu suspendují v sonifikačním ústoji (10 mmol hydrochloridu 2-amino-2-(hydroxymethyl)-l,3-propandiolu (Tris-HCl), pH 8,0, plus 1 mmol ethylendiaminotetraoctové kyseliny (EDTA). Resuspendované buňky se sonifikují pomocí mikrokonce rozbíječe buněk Sonicator (Model W-375 Heat Systems-Ultrasonics Inc., Farmingdale, New York). Použijí se tři kola sonifikace v sonifikačním ústoji následovaná odstředěním, aby se rozbily buňky a promyly se nachycené částice (IB). Prvé kolo sonifikace je 3 minutový impuls, následovaný 1 minutovým impulsem a konečná dvě kola sonifikace jsou po 1 minutě.
Extrakce a nové složení proteinů z pelet zachycených částic:
Po kroku konečného odstředění se IB pelety znovu suspendují v 10 ml 50 mmol Tris-HCl, pH 9,5, 8mol močoviny a 5 mmol dithiothreitolu (DTT) a míchají se asi 45 minut, aby se umožnila denaturace vyjádřeného proteinu.
Extrakční roztok se přenese do kádinky obsahující 70 ml 5 mmol Tris-HCl, pH 9,5, 2,3 mol močoviny a mírně se míchá za výstavem vzduchu při 4 °C po 18 až 48 hodin, aby se umožnilo nové složení proteinů. Nové skládání se sleduje analýzou na Cl8 koloně pro chromatografií v reversní fázi za vysokého tlaku (RP-HPLC) (0,46 x 25 cm) (Vydac, Hesperia, CA). K sledování nového skládám se použije lineární gradient od 40 % do 65 % acetonitrilu obsahujícího 0,1% trifluoroctové kyseliny (TFA). Tento gradient se vyvolává během 30 minut při průtokové rychlosti 1,5 ml za minutu. Denaturované proteiny se obecně eluují později v gradientu než složené proteiny.
Čistění:
Po novém složení se znečisťující proteiny E. coli odstraňují srážením kyselinou. pH roztoku pro nové složení se titruje, aby bylo mezi pH 5,0 a pH 5,2, pomocí 15% (objemově) octové kyseliny (HOAc). Tento roztok se míchá při 4 2 hodiny a pak se odstřeďuje 20 minut při 12000 x g, aby se peleto vály všechny nerozpustné proteiny.
Kalová voda z kroku srážení kyselinou se dialýzuje na membráně Spectra/Por 3 s hranicí molekulové hmotnosti (MWCO) 3500 daltonů. Dialýzuje se proti 2 změnám 4 litrů (50 násobný přebytek) 10 mmol Tris-HCl, pH 8,0, celkem 18 hodin. Dialýza snižuje vodivost vzorku a odstraňuje močovinu před chromatografií DEAE. Vzorek se pak odstřeďuje (20 minut pří 12000 x g), aby se peletovaly všechny nerozpustné proteiny po dialýze.
Pro iontovou výměnnou chromatografií se použije kolona Bio-Rad Bio-Scale DEAE2 (7 x 52 mm). Kolona se vyrovná ústojem obsahujícím 10 mmol Tris-HCl, pH 8,0. Protein se eluuje pomocí gradientu 0 až 500 mmol chloridu sodného (NaCl) v vyrovnávacím ústoji přes 45 objemů kolony. Pro vymytí se použije průtoková rychlost 1 ml za minutu. Frakce z kolony (2 ml na frakci) se sbírají během gradientu a analyzují se RP-HPLC na Cl8 koloně (0,46 x 25 cm) (Vydac, Hesperia, CA). Použije se lineární gradient od 40 % do 65 % acetonitrilu obsahujícího 0,1% trifiuoroctové kyseliny (TFA). Tento gradient se vyvolává během 30 minut při průtokové rychlosti 1,5 ml za minutu. Spojené frakce se pak dialýzují proti 2 změnám 4 litrů (50 až 500 násobný přebytek) 10 mmol octanu amonného (NH4AC), pH 4,0, celkem 18 hodin. Dialýza se provádí s použitím membrány Spectra/Por 3 s MWCO 3500 daltonů. Konečně se vzorek sterilně filtruje s použitím 0,22 pm injekčního filtru (pStar LB injekční filtr, Costar, Cambridge, Ma.) a skladuje se při 4 ®C.
V některých případech složené proteiny lze čistit afinitně s použitím afinitních činidel, jako je mAbs nebo receptorové podjednotky připojené k vhodné matrici. Alternativně (nebo navíc) lze čistém dosáhnout různými chromatografickými metodami, jako iontovou výměnou, gelovou filtrací nebo hydrofobní chromatografií nebo HPLC v reversní fázi.
Tyto a jiné metody jsou popsány podrobně v Methods in Enzymology, Volume 182, Guide to Protein Purification, Murray Deutcher, Ed., Academie Press, San Diego (1990).
Charakterizace proteinu:
Vyčištěný protein se analyzuje pomocí RP-HPLC, elektrorozprašovací hmotnostní spektrometrie a SDS-PAGE. Kvantifikace proteinu se provede podle složení aminokyselin, RP25 • ·· · ·· «· • ··· · » · · • · » · · · · · fl · ···· · · · ···· · ··· ··· * · · · · · to «· · »to «*
HPLC a pomocí Bradfodova stanovení proteinů. V některých případech lze provést mapování tryptického peptidu spolu s elektrorozprašovací hmotnostní spektrometrií, aby se potvrdila identita proteinu.
Methylcelulozový test
Tento test odráží schopnost kolonie stimulujících faktorů stimulovat normální buňky kostní dřeně, aby produkovaly různé typy krvetvorných kolonií in vitro (Bradley aj., 1966, Aust. Exp. Biol. Sci. 44: 287-300 (1966), Pluznik aj., J. Cell Comp. Physio. 66: 319-324 (1965)).
Metody
Asi 30 ml odsáté čerstvé normální zdravé kostní dřeně se získalo od jednotlivců po informovaném souhlasu. Za sterilních podmínek se vzorky zředily 1:5 roztokem IX PBS (číslo 14040.059 Life Technologies, Gaithersburg, MD.) v 50 ml konické zkumavce (číslo 25339-50 Corning, Corning, MD). Pod zředěný vzorek se rozprostřel ficoll (Histopaque 1077 Sigma H8889) a odstřeďovalo se při 300 x g po 30 minut. Pás mononukleámích buněk se odstranil a promyl se dvakrát IX PBS a jednou 1% BSA PBS (CellPro CO, Bothell, WA). Mononukleární buňky se spočítaly a CD34a buňky se vybraly pomocí kolony soupravy Ceprate LC (DC34) (CellPro CO, Bothel, WA). Tato frakcionace se provádí, dokud všechny kmenové a rodičovské buňky kostní dřeně nevykazují CD34 povrchový antigen.
Kultury se nasadí v trojnásobném počtu s konečným objemem 1.0 ml v 35*10 mm Petriho miskách (Nunc číslo 174926). Medium kultury se získá od Terry Fox Labs. (HCC 4230 medium, Terry Fox Labs. Vancouver, B. C. Kanada) a k medium kultury se přidá erythropoietin (Amgden, Thousands Oaks, CA.). 3000-10000 CD34a buněk se přidá na misku. Přidají se proteiny agonistů receptoru EPO, buď v kondiciovaném mediu z transfektovaných savčích buněk nebo čištěné z kondiciováného media z transfektovaných savčích buněk nebo z E. coli, aby se dosáhla konečná koncentrace mezi 0,001 nmol do 10 nmol. Kultury se znovu suspendují pomocí 3 ml injekční stříkačky a 1,0 ml se dá na misku. Kontrolní kultury (základní odpověď) nedostanou žádné kolonie stimulující faktory. Positivní kontrolní kultury dostanou kondiciovaná o
media (PHA stimulované lidské buňky (Terry Fox Labs. H2400). Kultury se inkubují při 37 C ve zvlhčeném vzduchu s 5 % CO2.
Krvetvorné kolonie, které jsou definovány jako větší než 50 buněk, se spočítají v den vrcholné odpovědi (dny 10-11) pomocí mikroskopu Nikon s invertovanou fází a kombinací objektivu 40x. Skupiny buněk obsahující méně než 50 buněk, se označují jako shluky.
Alternativně lze kolonie identifikovat rozprostřením kolonií na sklíčku a barvením, nebo je lze sebrat, znovu suspendovat a rozprostřít na sklíčku s cytospinem pro barvení.
• * *· · φφ φ» φφφ φφφ φ φ · · • · · · ΦΦβ φ φφ 9
Φ ΦΦΦΦ 9 9 9 ΦΦΦΦ Φ ΦΦΦ ΦΦΦ «ΦΦΦΦ Φ Φ «·» 9 φφ φ φφ φφ
Testy s lidským krvetvorným růstovým faktorem z pupeční šňůry.
Buňky kostní dřeně se tradičně používají pro testy aktivity in vitro stimulujícího faktoru krvetvorných kolonií (CSF). Avšak lidská kostní dřeň není vždy dostupná a mezi dárci existuje značná variabilita. Krev z pupeční šňůry je srovnatelná s kostní dření jako zdroj krvetvorných kmenových buněk a rodičovských buněk (Broxmeyer aj., PNAS 89: 3252-3258 (1992), Mayani aj., Blood 81: 3252-3258 (1993)). Na rozdíl od kostní dřeně krev z pupeční šňůry je snáze dostupná na pravidelné základně. Existuje rovněž možnost snížit variabilitu testů spojením buněk čerstvě získaných od více dárců, aby se vytvořila banka buněk skladovaných pro tyto účely za mrazu. Modifikací podmínek kultivace a nebo analýzou specifických značkovačů linií, by mělo být možné testovat specificky aktivitu kolonií tvořit impulsy (CFU-E).
Metody
Z krve pupeční šňůry se izolují mononukleární buňky (MNC) během 24 hodin po odebrání pomocí gradientu se standardní hustotou (1.077 g/ml Histopaque). MNC z krve pupeční šňůry se dále obohatí kmenovými a rodičovskými buňkami řadou postupů, včetně imunomagnetieké selekce CD34- a CD34a buněk, rýžováním SBA- a CD34a frakcí pomocí pokrytých baněk od Applied Immune Science (Santa Clara, CA) a selekcí CD34a pomocí avidinové kolony CellPro (Bothell, WA). Jak čerstvě izolované, tak skladované za mrazu obohacené frakce CD34a buněk se použijí pro testy. Zdvojené kultury pro každé sériové zředění vzorku (koncentrace jsou v rozmezí od 1 pmol do 1204 pmol) se připraví s 1 χ 104 buněk v 1 ml media obsahujícím 0.9% methylcelulozy bez dalších růstových faktorů (Methocult H4230 od Stem Cell Technologies, Vancouver, BC.). Po 7-9 denní kultivaci se spočítají kolonie obsahující víc než 30 buněk.
Transfektované buněčné linie
Buněčné linie, jako BHK nebo myší pro B buněčná linie Baf/3, se mohou transfektovat s receptorem stimulujícího faktoru kolonií, jako je receptor lidského EPO, který linie nemají. Tyto transfektované buněčné linie se mohou použít stanovení proliferační aktivity anebo vázání receptoru.
Příklad 1 • ·· · ♦* • · w « a • * · · · · · «·«· • ·!»« » « · ···· « ·«· ··· • · · · β · » ··· « ·» · a· ««
Geny kódující sekvenci permutovaných EPO ligandů se mohou konstruovat kterýmkoliv zde popsaným způsobem nebo jinou rekombinantní metodou známou odborníkům. Pro účely tohoto příkladu je místo permutace mezi zbytky EPO 131(Arg) a 132(Thr). To je místo, které je nejnáchylnější proteolytickému štěpení, a tím ukazuje vystavený povrch s relativně vysokým stupněm ohebnosti.
V tomto příkladu se vytvoří nový N-konec a C-konec bez spojovníku spojujícího původní konce. To se udělá, jak se popisuje v metodě Π, ve 2 krocích PCR a spojením tupých konců.
V prvém kroku se s použitím vektoru, který obsahuje sekvenci DNA SEQ ID NO: 120 jako vzor a priméry nový start a tupý start), vytvoří fragment DNA, který kóduje nový Cterminál. Tento fragment je označen start fragmentu. Sekvence podtržená v novém startovacím priméru je restrikční místo Ncol.
Nový startovací primér = gcgcgcCCATGGACAATCACTGCTGAC SEQ ID NO: 131.
Tupý startovací primér = TCTGTCCCCTGTCCT SEQ ID NO: 132. V druhém kroku se s použitím vektoru, který obsahuje sekvenci DNA SEQ ID NO: 120 jako vzor a priméry nový stop a tupý stop), vytvoří fragment DNA, který kóduje nový C-terminál. Tento fragment je označen stop fragmentu. Sekvence podtržená v novém startovacím priméru je restrikční místo Hindlll.
Nový stop primér = gcgcgcAAGCTTATTATCGGAGTGGAGCAGAGGCCGCATC SEQ ID NO: 133.
Tupý koncový primér = GCCCCACCACGCCTCATCTGT SEQ ID NO: 134.
V spojovacím kroku se oba fragmenty vytvořené ve dvou PCR reakcích se spojí, stráví se s Ncol a Hindlll a klonují se do vektoru exprese. Klony se prohlédnou restrikční analýzou a DNA se sekvenuje, aby se potvrdila správnost sekvence. Mohou se navrhnout priméry, aby se vytvořila restrikční místa jiná než Ncol a Hindlll a aby se klonovala do jiných vektorů exprese.
Příklad 2
Sekvence permutovaných agonistů EPO receptoru podle vynálezu lze testovat na bioaktivitu zde popsanými způsoby nebo jinými metodami známými odborníkům.
Další techniky pro konstrukci variantních genů, expresi rekombinantního proteinu, čistém proteinu, charakterizaci proteinu, stanovení biologické aktivity lze nalézt v WO 94/12639 a WO 94/12638, fuzní proteiny, které se uvádějí vWO 95/21197 a 95/21254, G-CSF agonisty receptoru, které se popisují v WO 97/12977, c-mpl agonisty receptoru, které se popisují v WO 97/12978, IL-3 agonisty receptoru, které se popisují vWO 97/12979 a multifunkční agonisty receptoru, které se popisují vWO 97/12985, mohou podávat spolu spolypeptidy tohoto vynálezu. Jak se zde používá, IL-3 varianty se týká variantů IL-3, které se uvádějí vWO 94/12639, WO 94/12638, WO 95/21197, WO 95/20977 a 95/21254, které jsou zahrnuty do popisu tímto odkazem.
Všechny reference, patenty nebo přihlášky zde citované jsou sem zařazeny odkazem ve své úplnosti, jako by zde byly napsány.
Různé jiné příklady budou zřejmé odborníkovi po přečtení tohoto popisu bez toho, že by se odchýlil od ducha a rozsahu vynálezu. Zamýšlí se, aby všechny takové jiné příklady byly zahrnuty rozsahu připojených nároků.
Seznam sekvencí
Popis sekvence SEQ ID NO: 1
i) Charakteristika řetězce:
A) Délka: 133 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 1
Asn lle Thr Thr Gly Cys Ala Glu
1 5
Thr Val Pro Asp 20 Thr Lys Val Asn
Val Gly Gin 35 Gin Ala Val Glu Val 40
Glu Ala 50 Val Leu Arg Gly Gin 55 Ala
Trp 65 Glu Pro Leu Gin Leu 70 His Val
Ser Leu Thr Thr Leu 85 Leu Arg Ala
Ser Pro Pro Asp 100 Ala Ala Ser Ala
Asp Thr Phe 115 Arg Lys Leu Phe Arg 120
Lys Leu 130 Lys Leu Tyr Thr Gly 135 Glu
Gly 145 Gly Ser Ala Pro Pro 150 Arg Leu
Arg Tyr Leu LeU Glu 165 Ala Lys Glu
His Cys 10 Ser Leu Asn Glu Asn 15 lle
Phe 25 Tyr Ala Trp Lys Arg 30 Met Glu
Trp Gin Gly Leu Ala 45 Leu Leu Ser
Leu Leu Val Asn 60 Ser Ser Gin Pro
Asp Lys Ala 75 Val Ser Gly Leu Arg 80
Leu Gly 90 Ala Gin Lys Glu Ala 95 lle
Ala 105 Pro Leu Arg Thr lle 110 Thr Ala
Val Tyr Ser Asn Phe 125 Leu Arg Gly
Ala Cys Arg Thr 140 Gly Asp Arg Gly
lle Ala Cys Glu 170 Asp 155 Ser Arg Val Leu Glu 160
Popis sekvence SEQ ID NO : 2
i) Charakteristika řetězce:
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární
ii) Typ molekuly: žádný • · 44 4 44 ·» **· »44 4 · 4 4 •»4 4444 4 44 4 • 4444 44 4 4444 4 444 444 4 4 4 4 4 44 ·*· · 44 4 44 4«
xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 2
Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr
1 5 10 15
Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val
20 25 30
Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu
35 40 45
Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp
50 55 60
Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser
65 70 75 80
Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser
85 90 95
Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp
100 105 110
Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys
115 120 125
Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly
130 135 140
Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg
145 150 155 160
Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 3
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný
xi) Popis řetězce: SEQ ID NO: 3
Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val
1 5 10 15
Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly
20 25 30
Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala
35 40 45
Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu
50 55 60
Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu
65 70 75 80
Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro
85 90 95
♦ ♦ · ·· ··
Pro Asp Ala Ala 100 Ser Ala Ala Pro
Phe Arg Lys 115 Leu Phe Arg Val Tyr 120
Lys Leu 130 Tyr Thr Gly Glu Ala 135 Cys
Ser 145 Ala Pro Pro Arg Leu 150 Ile Cys
Leu Leu Glu Ala 165 Lys Glu Ala Glu 170
• · · · · • · * 9 • • · » 999 ··«
Leu Arg Thr·Ile Thr Al*a As*]3 Ttfr
105 110
Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu
125
Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly
140
Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr
155 160
Asn Ile
Popis sekvence SEQ ID NO : 4
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 4
Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro
1 5 10 15
Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin
20 25 30
Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val
35 40 45
Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro
50 55 60
Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr
65 70 75 80
Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser ♦Pro Pro
85 90 95
Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe
100 105 110
Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys
115 120 125
Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser
130 135 140
Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu
145 150 155 160
Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 5
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný ♦ 4 · 4 4 4 4 4 * 444 4444
4444 4 44 4
444· 4 4 4 4444 « ··· 444
4 4 4 4 4
4 44 4 444« xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 5
Gly Cys Ala 1 Glu His 5 Cys Ser Leu Asn Glu Asn 10 lle Thr Val Pro 15 Asp
Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin
20 25 30
Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu
35 40 45
Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu
50 55 60
Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr
65 70 75 80
Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala lle Ser Pro Pro Asp
85 90 95
Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr lle Thr Ala Asp Thr Phe Arg
100 105 110
Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys .Leu Lys Leu
115 120 125
Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala
130 135 140
Pro Pro Arg Leu lle Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu
145 150 155 160
Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn lle Thr Thr
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 6
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 6
Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn lle Thr Val Pro Asp Thr 15 10 15 ♦ 00 0 00 00 « · 0 0 0000
0 0 0 0 0 00 0
0000 00 0 0000 0 000 000 0 0 0 0 0 0
Lys Val Asn Phe 20 Tyr Ala Trp Lys Arg 25 Met 000 Glu Val 00 Gly Gin 30 0 0 Gin 0 0 Ala
Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg
35 40 45
Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin
50 55 60
Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu
65 70 75 80
Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala
85 90 95
Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys
100 105 110
Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr
115 120 125
Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro
130 135 140
Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu
145 150 155 160
Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 7
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 7
Ala 1 Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn 5 Ile 10 Thr Val Pro Asp Thr 15 Lys
Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val
20 25 30
Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly
35 40 45
Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu
50 55 60
His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu
65 70 75 80
Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala
85 90 95
Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu
100 105 110
Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr
115 120 125
Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro
130 135 140
Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala
145 150
Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys
165 170
• · • · • · ·· • » ····
99
9 9 9
9 9 9
999 999 ***1*60
Popis sekvence SEQ ID NO : 8
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 8
Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val
1 5 10 15
Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu
20 25 30
Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin
35 40 45
Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His
50 55 60
Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg
65 70 75 80
Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser
85 90 95
Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe
100 105 110
Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly
115 120 125
Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg
130 135 140
Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys
145 150 155 160
Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 9
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 9
His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn 15 10 15
Phe Tyr Ala Trp 20 Lys Arg Met Glu Val 25 Gly Gin 4444 *Gl’n 4 4 Al’á • 444« • 4 Val 30 4 444 Gl’ú* • 44 vái
Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala
35 40 45
Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val
50 55 60
Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala
65 vo 75 80
Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala
85 90 95
Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg
100 105 110
Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu
115 120 125
Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu
130 135 140
Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu
145 150 155 160
Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 10
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 10
Cys 1 Ser Leu Asn Glu 5 Asn Ile Thr Val Pro Asp 10 Thr Lys Val Asn 15 Phe
Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp
20 25 30
Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu
35 40 45
Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp
50 55 60
Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu
65 70 75 80
Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala
85 90 95
Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val
100 105 110
Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala
115 120 125
Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile
130 135 140
• to to · to to · · · · *··· · · ····· · ··· ···
Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leů* GÍu Ala Lýs Glu Ala
145 150 155 160
Glu Asn lle Thr Thr Gly Cys Ala Glu His
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 11
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 11
Ser Leu Asn Glu Asn lle Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr
1 5 10 15
Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin
20 25 30
Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu
35 40 45
Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys
50 55 60
Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly
65 70 75 80
Ala Gin Lys Glu Ala lle Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro
85 90 95
Leu Arg Thr lle Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr
100 105 110
Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys
115 120 125
Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu lle Cys
130 135 140
Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu
145 150 155 160
Asn lle Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 12
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 12
Leu Asn Glu Asn lle Thr Val Pro Asp Thr • 4 Ly*s* • • • 4 ···· *Va’l 44 • • • 4 AsTl • • · • 4 · 'ptfe 44 • 4 • · 4 44 4 Týt 4 4 4 4 4 4 444 A’lá
1 5 10 15
Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly
20 25 30
Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val
35 40 45
Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala
50 55 60
Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala
65 70 75 80
Gin Lys Glu Ala lle Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu
85 90 95
Arg Thr lle Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser
100 105 110
Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg
115 120 125
Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu lle Cys Asp
130 135 140
Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn
145 150 155 160
lle Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 13
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 13
Asn Glu Asn lle Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp
1 5 10 15
Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu
20 25 30
Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn
35 40 45
Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val
50 55 60
Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin
65 70 75 80
Lys Glu Ala lle Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg
85 90 95
Thr lle Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn
100 105 110
Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr
115 120 125
Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu lle Cys Asp Ser
♦ · ·· · φ» *· *·· · · * φ··· φ · ♦ φφφφ φφφφ • ···· φ φ φ ·Φ«Φ φ *φ· φφφ
130 Arg Val Leu Glu Arg Tyr 135 Leu Leu Glu Ala ΦΦΦ Lys 1*40 ” Glu Ala Φ φφφφ Glu Asn Ile
145 150 155 160
Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 14
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 14
Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys
1 5 10 15
Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala
20 25 30
Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser
35 40 45
Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser
50 55 60
Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys
65 70 75 80
Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr
85 90 95
Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe
100 105 110
Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly
115 120 125
Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile cys Asp Ser Arg
130 135 140
Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr
145 150 155 160
Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 15
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární
4 44 · 44 »4 • 4 4 4 4 4 · 4 ·
444 4 444 4 44 4 • >4·· 4 4 4 4444 4 444 444
4 4 4 4 4 4
4 44 4 44 4» ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 15
Asn lle Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg
1 5 10 15
Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu
20 25 30
Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser
35 40 45
Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly
50 55 60
Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu
65 70 75 80
Ala lle Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr lle
85 90 95
Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu
100 105 110
Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp
115 120 125
Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu lle Cys Asp Ser Arg Val
130 135 140
Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn lle Thr Thr
145 150 155 160
Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 16
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 16 lle Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Třp Lys Arg Met
1 5 10 15
Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu
20 25 30
Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin
35 40 45
Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu
50 55 60
Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala
65 70 75 80
lle Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr lle Thr
85 90 95
Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg
100 • 105* • · 9 9 9 0 00 0 0 0 ©9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 • 0 0 0 9 0 » 0 0 0 0 9 0 0 0 0 0 9 •iiv 9 • • •
Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg
115 120 125
Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu
130 135 140
Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly
145 150 155 160
Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 17
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 17
Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val
1 5 10 15
Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu
20 25 30
Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp
35 40 45
Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser
50 55 60
Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser
65 70 75 80
Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp
85 90 95
Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys
100 105 110
Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly
115 120 125
Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg
130 135 140
Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala
145 150 155 160
Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 18
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina e · *
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 18
Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly
1 5 10 15
Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala
20 25 30
Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu
35 40 45
Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu
50 55 60
Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro
65 70 75 80
Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr
85 90 95
Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu
100 105 110
Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly
115 120 125
Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr
130 135 140
Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu
145 150 155 160
His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 19
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 19
Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin
1 5 10 15
Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val
20 25 30
Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro
35 40 45
Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr
50 55 60
Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro
65 70 75 80
to · ·· · toto ·· ··· to·· ···· • · · ···· · · a · • toto·· · · to toto·· to ··· ··· to · · »
Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg* Ťhř né* Thř Alá*Aé£ Thr Phe
85 90 95
Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys
100 105 110
Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser
115 120 125
Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu
130 135 140
Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His
145 150 155 160
Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 20
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 20
Arg 1 Met Glu Val Gly 5 Gin Gin Ala Val Glu 10 Val Trp Gin Gly Leu 15 Ala
Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser
20 25 30
Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser
35 40 45
Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys
50 55 60
Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr
65 70 75 80
Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe
85 90 95
Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly
100 105 110
Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg
115 120 125
Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr
130 135 140
Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro
145 150 155 160
Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys
165 170
* * ·* · ·· ·· • · · · · · «··· ··· ···· ·»··
Popis sekvence SEQ ID NO : 21
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 21
Met 1 Glu Val Gly Gin 5 Gin Ala Val
Leu Ser Glu Ala 20 Val Leu Arg Gly
Gin Pro Trp 35 Glu Pro Leu Gin Leu 40
Leu Arg 50 Ser Leu Thr Thr Leu 55 Leu
Ala 65 Ile Ser Pro Pro Asp 70 Ala Ala
Thr Ala Asp Thr Phe 85 Arg Lys Leu
Arg Gly Lys Leu 100 Lys Leu Tyr Thr
Arg Gly Gly 115 Gly Ser Ala Pro Pro 120
Leu Glu 130 Arg Tyr Leu Leu Glu 135 Ala
Gly 145 Cys Ala Glu His Cys 150 Ser Leu
Thr Lys Val Asn Phe 165 Tyr Ala Trp
Glu Val 10 Trp Gin Gly Leu Ala 15 Leu
Gin 25 Ala Leu Leu Val Asn 30 Ser Ser
His Val Asp Lys Ala 45 Val Ser Gly
Arg Ala Leu Gly 60 Ala Gin Lys Glu
Ser Ala Ala 75 Pro Leu Arg Thr Ile 80
Phe Arg 90 Val Tyr Ser Asn Phe 95 Leu
Gly 105 Glu Ala Cys Arg Thr 110 Gly Asp
Arg Leu Ile Cys Asp 125 Ser Arg Val
Lys Glu Ala Glu 140 Asn Ile Thr Thr
Asn Glu Asn 155 Ile Thr Val Pro Asp 160
Lys Arg 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 22
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 22
Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu 15 10 15
Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin 20 25 30
Pro Trp Glu 35 Pro Leu Gin Leu His 40 • Val’ • « · • · · · • • · Asp • 9 9 9 9 9 9 9 9 Lys • • · 9 · · 9 99 9 9 • · - Ala ·· ♦ • • · · • · Val 45 • · · • · · 9 9 9 9 9 9 9 9 Ser Gly Leu
Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala
50 55 60
Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr
65 70 75 80
Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg
85 90 95
Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg
100 105 110
Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu
115 120 125
Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly
130 135 140
Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr
145 150 155 160
Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 23
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 23
Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser
1 5 10 15
Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro
20 25 30
Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg
35 40 45
Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile
50 55 60
Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala
65 70 75 80
Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly
85 90 95
Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly
100 105 110
Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu
115 120 125
Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys
130 135 140
Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys
145 150 155 160
» · ·« · «β · ti ·« # · · · ···· ··· · · · · · · · · * ···· · · · ···· · ··· ··· • β · · · · ·
Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met**Glu
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 24
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 24
Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu
1 5 10 15
His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu
20 25 30
Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala
35 40 45
Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu
50 55 60
Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr
65 70 75 80
Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro
85 90 95
Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala
100 105 110
Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu
115 120 125
Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp
130 135 140
Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu
145 150 155 160
Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 25
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 25
Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His 15 10 15
Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg ·· ft
20
Ala Leu Gly 35 Ala Gin Lys Glu Ala 40
Ala Ala 50 Pro Leu Arg Thr Ile 55 Thr
Arg 65 Val Tyr Ser Asn Phe 70 Leu Arg
Glu Ala Cys Arg Thr 85 Gly Asp Arg
Leu Ile Cys Asp 100 Ser Arg Val Leu
Glu Ala Glu 115 Asn Ile Thr Thr Gly 120
Glu Asn 130 Ile Thr Val Pro Asp 135 Thr
Arg 145 Met Glu Val Gly Gin 150 Gin Ala
Leu Leu Ser Glu Ala 165 Val Leu Arg
• 25 * ft • ft • ftftft • • · ft ft • · • ft · ft · • ftft • · · · · • ft • ft • • ftft • · • · · ftft · • ftftft • · • · 30
Ile Ser Pro Pro Asp 45 Ala Ala Ser
Ala Asp Thr Phe 60 Arg Lys Leu Phe
Gly Lys Leu 75 Lys Leu Tyr Thr Gly 80
Gly Gly 90 Gly Ser Ala Pro Pro 95 Arg
Glu 105 Arg Tyr Leu Leu Glu 110 Ala Lys
Cys Ala Glu His Cys 125 Ser Leu Asn
Lys Val Asn Phe 140 Tyr Ala Trp Lys
Val Gly Glu Gin 170 Val 155 Trp Gin Gly Leu Ala 160
Popis sekvence SEQ ID NO : 26
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 26
Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val
1 5 10 15
Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala
20 25 30
Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala
35 40 45
Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg
50 55 60
Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu
65 70 75 80
Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu
85 90 95
Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu
100 105 110
Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu
115 120 125
Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg
130 135 140
Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu
145 150 155 160
• to to »· · · · 4
Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala
165 170 • to to • to
Popis sekvence SEQ ID NO : 27
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 27
Leu Val Asn 1 Ser Ser 5 Gin Pro Trp Glu Pro 10 Leu Gin Leu His Val 15 Asp
Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu
20 25 30
Gly Ala Gin Lys Glu Ala lle Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala
35 40 45
Pro Leu Arg Thr lle Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val
50 55 60
Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala
65 70 75 80
Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu lle
85 90 95
Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala
100 105 110
Glu Asn lle Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn
115 120 125
lle Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met
130 135 140
Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu
145 150 155 160
Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 28
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 28
Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys 1 5 .10 15 ♦ φφ · φφ φφ φ φφφ φφφφ • φ φφφφ ΦΦΦ·
Ala Val Ser Gly 20 Leu Arg Ser Leu Thr 25 Φ Φ Thr Leu Φ · Leu Φ Φ φ Φ Arg Ala 30 Leu Gly
Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro
35 40 45
Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr
50 55 60
Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys
65 70 75 80
Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys
85 90 95
Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu
100 105 110
Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile
115 120 125
Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu
130 135 140
Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser
145 150 155 160
Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 29
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 29
Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala
1 5 10 15
Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala
20 25 30
Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu
35 40 45
Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser
50 55 60
Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg
65 70 75 80
Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp
85 90 95
Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn
100 105 110
Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr
115 120 125
Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val
130 135 140
Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu
145 150 ”* ’ 155” * ” ” 160
Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 30
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 30
Ser 1 Ser Gin Pro Trp 5 Glu Pro Leu Gin Leu 10 His Val Asp Lys Ala 15 Val
Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin
20 25 30
Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg
35 40 45
Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn
50 55 60
Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr
65 70 75 80
Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser
85 90 95
Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile
100 105 110
Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val
115 120 125
Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala •Trp Lys Arg Met Glu Val Gly
130 135 140
Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala
145 150 155 160
Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 31
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 31
Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser 15 10 15
0
Gly Leu Arg Ser 20 Leu Thr Thr Leu
Glu Ala Ile 35 Ser Pro Pro Asp Ala 40
Ile Thr 50 Ala Asp Thr Phe Arg 55 Lys
Leu 65 Arg Gly Lys Leu Lys 70 Leu Tyr
Asp Arg Gly Gly Gly 85 Ser Ala Pro
Val Leu Glu Arg 100 Tyr Leu Leu Glu
Thr Gly Cys 115 Ala Glu His Cys Ser 120
Asp Thr 130 Lys Val Asn Phe Tyr 135 Ala
Gin 145 Ala Val Glu Val Trp 150 Gin Gly
Leu Arg Gly Gin Ala 165 Leu Leu Val
• Leu • 0 · 0 • 0 · 0 · 0 • • 0 · 0 • 0 0 Gin Lys
• • 0 Arg 0 4 · Ala 0 · 0 Leu 0 0 Gly 0 0 • 0 Ala
25 Ala Ser Ala Ala Pro 30 Leu Arg Thr
Leu Phe Arg Val 45 Tyr Ser Asn Phe
Thr Gly Glu 60 Ala Cys Arg Thr Gly
Pro Arg 75 Leu Ile Cys Asp Ser 80 Arg
Ala 90 Lys Glu Ala Glu Asn 95 Ile Thr
105 Leu Asn Glu Asn Ile 110 Thr Val Pro
Trp Lys Arg Met 125 Glu Val Gly Gin
Leu Ala Leu 140 Leu Ser Glu Ala Val
Asn Ser 170 155 160
Popis sekvence SEQ ID NO : 32
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO : 32
Gin 1 Pro Trp Glu Pro 5 Leu Gin Leu
Leu Arg Ser Leu 20 Thr Thr Leu Leu
Ala Ile Ser 35 Pro Pro Asp Ala Ala 40
Thr Ala 50 Asp Thr Phe Arg Lys 55 Leu
Arg 65 Gly Lys Leu Lys Leu 70 Tyr Thr
Arg Gly Gly Gly Ser 85 Ala Pro Pro
Leu Glu Arg Tyr 100 Leu Leu Glu Ala
Gly Cys Ala 115 Glu His Cys Ser Leu 120
Thr Lys 130 Val Asn Phe Tyr Ala 135 Trp
His Val 10 Asp Lys Ala Val Ser 15 Gly
Arg 25 Ala Leu Gly Ala Gin 30 Lys Glu
Ser Ala Ala Pro Leu 45 Arg Thr Ile
Phe Arg Val Tyr 60 Ser Asn Phe Leu
Gly Glu Ala 75 Cys Arg Thr Gly Asp 80
Arg Leu 90 Ile Cys Asp Ser Arg 95 Val
Lys 105 Glu Ala Glu Asn Ile 110 Thr Thr
Asn Glu Asn Ile Thr 125 Val Pro Asp
Lys Arg Met Glu 140 Val Gly Gin Gin
Φ ♦ φ» φ «φ φφ φφφ φφφ φφφφ φφφ φφφφ φφφφ — — w w « v V W > » » W W W » φφφφ φ φ
Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala* Φ Φ Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu
145 150 155 160
Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 33
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 33
Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu
1 5 10 15
Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala
20 25 30
Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr
35 40 45
Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg
50 55 60
Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg
65 70 75 80
Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu
85 90 95
Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly
100 105 110
Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr
115 120 125
Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala
130 135 140
Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg
145 150 155 160
Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 34
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 34
Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg
1 5 10 15
Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile
·· · · * 4444 4 444 444 • · · 4 4 4
20 . 25 ’ 4 4 • 4 4 4 4 4 4 30
Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala
35 40 45
Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly
50 55 60
Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly
65 70 75 80
Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu
85 90 95
Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys
100 105 110
Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys
115 120 125
Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val
130 135 140
Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly
145 150 155 160
Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 35
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 35
Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser
1 5 10 15
Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser
20 25 30
Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp
35 40 45
Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys
50 55 60
Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly
65 70 75 80
Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg
85 90 95
Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala
100 105 110
Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val
115 120 125
Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu
130 135 140
Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin
Pro Trp
170
145 150
Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin
165 fl ·
155 ·· ·· • · · · • · · · »·· ··· « · « · · ·
160
Popis sekvence SEQ ID NO : 36
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 36
Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala lle Ser Pro Pro Asp Ala
1 5 10 15
Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr lle Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys
20 25 30
Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr
35 40 45
Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro
50 55 60
Pro Arg Leu lle Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu
65 70 75 80
Ala Lys Glu Ala Glu Asn lle Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser
85 90 95
Leu Asn Glu Asn lle Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala
100 105 110
Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly
115 120 125
Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val
130 135 140
Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala
145 150 155 160
Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 37
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 37 • · »· · *· ·· ·· · 9 9 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
9999 99 9 9999 9 999 999
9 9 9 9 9 9
Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala
1 5 10 15
Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu
20 25 30
Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr
35 40 45
Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro
50 55 60
Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala
65 70 75 80
Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu
85 90 95
Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp
100 105 110
Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu
115 120 125
Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn
130 135 140
Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val
145 150 155 160
Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 38
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 38
Ala 1 Leu Gly Ala Gin 5 Lys Glu Ala Ile Ser 10 Pro Pro Asp Ala Ala 15 Ser
Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe
20 25 30
Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly
35 40 45
Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg
50 55 60
Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys
65 70 75 80
Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn
85 90 95
Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys
100 105 110
Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala
115 120 125
• · ·· · ·* ·· ··· ··« «·*
Leu Leu 130 Ser Glu Ala Val Leu 135 Arg Gly • · Gin • · Ala • Leu 140 ·· Leu • · Val Asn Ser
Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser
145 150 155 160
Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO: 39
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 39
Leu 1 Gly Ala Gin Lys 5 Glu Ala Ile Ser Pro 10 Pro Asp Ala Ala Ser 15 Ala
Ala Pro Leu Arg Thr' Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg
20 25 30
Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu
35 40 45
Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu
50 55 60
Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu
65 70 75 80
Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu
85 90 95
Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg
100 105 110
Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu
115 120 125
Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser
130 135 140
Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly
145 150 155 160
Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 40
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární • · 99 9
999 999
9 9 9 9 9 9
9999 99 9 9999 9 ii) Typ molekuly: žádný .......
xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 40
44 * 4 4 ·
4 4 4
999 99 9
9
99
Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala
1 5 10 15
Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val
20 25 30
Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala
35 40 45
Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile
50 55 60
Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala
65 70 75 80
Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn
85 90 95
Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met
100 105 110
Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu
115 120 125
Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin
130 135 140
Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu
145 150 155 160
Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 41
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 41
Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro
1 5 10 15
Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr
20 25 30
Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys
35 40 45
Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys
50 55 60
Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu
65 70 75 80
Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile
85 90 95
Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu
• ·· · ·· ·· • · · · · · · · • · ···· ···· ···· · · · ···· · ··· ···
100 105* • · • · 4 ·· 110
Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser
115 120 125
Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro
130 135 140
Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg
145 150 155 160
Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 42
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 42
Gin Lys Glu Ala lle Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu
1 5 10 15
Arg Thr lle Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser
20 25 30
Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg
35 40 45
Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu lle Cys Asp
50 55 60
Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn
65 70 75 80
lle Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn lle Thr
85 90 95
Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val
100 105 110
Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu
115 120 125
Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp
130 135 140
Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser
145 150 155 160
Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 43
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární • ·
0*9
O · · · 0 »0 • · · · · · 9
0 0 9 0·«· ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 43 • · · 0 * ·· 9 99 09
Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp
1 5
Thr Ile Thr Ala 20 Asp Thr Phe Arg
Phe Leu Arg 35 Gly Lys Leu Lys Leu 40
Gly Asp 50 Arg Gly Gly Gly Ser 55 Ala
Arg 65 Val Leu Glu Arg Tyr 70 Leu Leu
Thr Thr Gly Cys Ala 85 Glu His Cys
Pro Asp Thr Lys 100 Val Asn Phe Tyr
Gin Gin Ala 115 Val Glu Val Trp Gin 120
Val Leu 130 Arg Gly Gin Ala Leu 135 Leu
Pro 145 Leu Gin Leu His Val 150 Asp Lys
Thr Thr Leu Leu Arg 165 Ala Leu Gly
Ala Ala 10 Ser Ala Ala Pro Leu 15 Arg
Lys 25 Leu Phe Arg Val Tyr 30 Ser Asn
Tyr Thr Gly Glu Ala 45 Cys Arg Thr
Pro Pro Arg Leu 60 Ile Cys Asp Ser
Glu Ala Lys 75 Glu Ala Glu Asn Ile 80
Ser Leu 90 Asn Glu Asn Ile Thr 95 Val
Ala 105 Trp Lys Arg Met Glu 110 Val Gly
Gly Leu Ala Leu Leu 125 Ser Glu Ala
Val Asn Ser Ser 140 Gin Pro Trp Glu
Ala Ala Val Gin 170 Ser 155 Gly Leu Arg Ser Leu 160
Popis sekvence SEQ ID NO : 44
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 44
Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr
1 5 10 15
Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe
20 25 30
Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly
35 40 45
Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg
50 55 60
Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr
65 70 75 80
Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro
85 90 95
Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin
100 • 105' fl • • to • flflfl • · • • • to · to • to to • · ··· • ···· • · to • fl • • • flfl flfl •fl flfl fl • to · • flflfl • · • fl 110
Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val
115 120 125
Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro
130 135 140
Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr
145 150 155 160
Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 45
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 45
Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile
1 5 10 15
Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu
20 25 30
Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp
35 40 45
Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val
50 55 60
Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr
65 70 75 80
Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp
85 90 95
Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin
100 105 110
Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu
115 120 125
Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu
130 135 140
Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr
145 150 155 160
Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 46
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina • · ·· · ·· ·· • · · ··· · · · · • · · ···· ····
C) Řetězec: jednoduchý D) Topologie: lineární • • · · • · • • • · • • • « · · ·
ii) Typ molekuly: žádný
xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 46
lle Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr lle Thr
1 5 10 15
Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg
20 25 30
Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg
35 40 45
Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu lle Cys Asp Ser Arg Val Leu
50 55 60
Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn lle Thr Thr Gly
65 70 75 80
Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn lle Thr Val Pro Asp Thr
85 90 95
Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala
100 105 110
Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg
115 120 125
Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin
130 135 140
Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu
145 150 155 160
Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 47
A) Délka: 170 aminokyselin B) Typ: aminokyselina C) Řetězec: jednoduchý D) Topologie: lineární
ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: : 47
Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr lle Thr Ala
1 5 10 15
Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly
20 25 30
Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly
35 40 45
Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu lle Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu
50 55 60
Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn lle Thr Thr Gly Cys
65 70 75 80
• ·· · ·* ·· • ··· ···· • · · · · · ····
Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile •Ť\r *Val • · · Pro * * , ♦ · Asp Thr Lys
85 90 95
Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val
100 105 110
Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly
115 120 125
Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu
130 135 140
His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leů Leu
145 150 155 160
Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 48
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 48
Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp
1 5 10 15
Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys
20 25 30
Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly
35 40 45
Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg
50 55 60
Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala
65 70 75 80
Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val
85 90 95
Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu
100 105 110
Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin
115 120 125
Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His
130 135 140
Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg
145 150 155 160
Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser
165 170
I» to • · · • ··· • · · ··· ···· · to ····«
Popis sekvence SEQ ID NO : 49
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 49 ·· · toto
Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr lle Thr Ala Asp Thr
1 5 10 15
Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu
20 25 30
Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly
35 40 45
Ser Ala Pro Pro Arg Leu lle Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr
50 55 60
Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn lle Thr Thr Gly Cys Ala Glu
65 70 75 80
His Cys Ser Leu Asn Glu Asn lle Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn
85 90 95
Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val
100 105 110
Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala
115 120 125
Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val
130 135 140
Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala
145 150 155 160
Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala lle Ser Pro
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 50
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 50
Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr lle Thr Ala Asp Thr Phe
1 5 10 15
Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys
20 25 30
63 • • • · • • • • 9 • · • · · • 4 • • ft ·· 9 9 · • · ·
Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly • • · Asp • Arg • · • · Gly • 4 Gly • · » ·· Gly Ser
35 40 45
Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu
50 55 60
Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His
65 70 75 80
Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe
85 90 95
Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp
100 105 110
Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu
115 120 125
Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp
130 135 140
Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu
145 150 155 160
Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 51
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 51
Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg
1 5 10 15
Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu
20 25 30
Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala
35 40 45
Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu
50 55 60
Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys
65 70 75 80
Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr
85 90 95
Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin
100 105 110
Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu
115 120 125
Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys
130 135 140
Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly
145 150 155 160
Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp
··· · · · ···· • « · · · · · · · · # « ···« · · · ···· · ··· ··· • · · · · · ·
Popis sekvence SEQ ID NO : 52
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 52
Ala 1 Ser Ala Ala Pro 5 Leu Arg Thr Ile Thr Ala 10 Asp Thr Phe Arg 15 Lys
Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr
20 25 30
Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro
35 40 45
Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu
50 55 60
Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser
65 70 75 80
Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala
85 90 95
Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly
100 105 110
Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val
115 120 125
Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala
130 135 140
Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala
145 150 155 160
Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 53
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 53
Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu 15 10 15 • to to toto to
·· · • · · • • • to • · · • • • · • · • to
• · to • · «
Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr
20 25 30
Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro
35 40 45
Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala
50 55 60
Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu
65 70 75 80
Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp
85 90 95
Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu
100 105 110
Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn
115 120 125
Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val
130 135 140
Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin
145 150 155 160
Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO :; 54
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární
ii) Typ molekuly: žádný
xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 54
Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe
1 5 10 15
Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly
20 25 30
Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg
35 40 45
Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys
50 55 60
Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn
65 70 75 80
Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys
85 90 95
Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala
100 105 110
Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser
115 120 125
Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser
130 135 140 • · ·» · ·· ·· ··· · · · » * * · • · · ♦ · · · 9 9 9 9
9999 99 9 9999 9 999 999
9 9 * «· · · · · ·
Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys
145 150 155 160
Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 55
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 55
Ala 1 Pro Leu Arg Thr 5 Ile Thr Ala Asp Thr 10 Phe Arg Lys Leu Phe 15 Arg
Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu
20 25 30
Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu
35 40 45
Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu
50 55 60
Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu
65 70 75 80
Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg
85 90 95
Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu
100 105 110
Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser
115 120 125
Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly
130 135 140
Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu
145 150 155 160
Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 56
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 56 · 0· · 00 00 • 00 0 0 0 0 000
000 0 000 0 00 0 • ···· 00 0 0000 0 000 000 • · · 0 0 0 0
000 0 00 · 00 00
Pro 1 Leu Arg Thr Ile 5 Thr Ala Asp Thr Phe Arg 10 Lys Leu Phe Arg 15 Val
Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala
20 25 30
Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile
35 40 45
Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala
50 55 60
Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn
65 70 75 80
Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met
85 90 95
Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu
100 105 110
Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin
115 120 125
Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu
130 135 140
Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala
145 150 155 160
Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 57
A) Délka: 171 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 57
Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr
1 5 10 15
Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys
20 25 30
Arg Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys
35 40 45
Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu
50 55 60
Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile
65 70 75 80
Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu
85 90 95
Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser
100 105 110
Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro
115 120 125
φφ φ φφ φφ φφφ φφφφ φ φφφ φ · φ φ φ φφφφφ φ φφφ φφφ φφφ φ φ φφ · φφ φφ
Trp Glu 130 Pro Leu Gin Leu His 135 Val
Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala
145 150
Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser
165
Asp Lys Ala Val 140 Ser Gly Leu Arg
Leu Gly Ala Gin Ala Lys Glu Ala
155 160
Ala Ala Pro
170
Popis sekvence SEQ ID NO : 58
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ; aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 58
Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser
1 5 10 15
Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg
20 25 30
Thr Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp
35 40 45
Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn
50 55 60
Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr
65 70 75 80
Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val
85 90 95
Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu
100 105 110
Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp
115 120 125
Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser
130 135 140
Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser
145 150 155 160
Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 59
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární
Thr lle Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn • · • · ·« ··· ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 59
1 5 10 15
Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr
20 25 30
Gly Asp Arg Gly Gly Gly Ser Ala Pro Pro Arg Leu lle Cys Asp Ser
35 40 45
Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn lle
50 55 60
Thr Thr Gly Cys Ala Glu His Cys Ser Leu Asn Glu Asn lle Thr Val
65 70 75 80
Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly
85 90 95
Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala
100 105 110
Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu
115 120 125
Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu
130 135 140
Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala lle Ser Pro
145 150 155 160
Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg
165 170
Popis sekvence SEQ ID NO : 60
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 60
AATATCACGA CGGGCTGTGC TGAACACTGC AGCTTGAATG AGAATATCAC TGTCCCAGAC 60
ACCAAAGTTA ATTTCTATGC CTGGAAGAGG ATGGAGGTCG GGCAGCAGGC CGTAGAAGTC 120
TGGCAGGGCC TGGCCCTGCT GTCGGAAGCT GTCCTGCGGG GCCAGGCCCT GTTGGTCAAC 180
TCTTCCCAGC CGTGGGAGCC CCTGCAGCTG CATGTGGATA AAGCCGTCAG TGGCCTTCGC 240
AGCCTCACCA CTCTGCTTCG GGCTCTGGGA GCCCAGAAGG AAGCCATCTC CCCTCCAGAT 300
GCGGCCTCAG CTGCTCCACT CCGAACAATC ACTGCTGACA CTTTCCGCAA ACTCTTCCGA 360
GTCTACTCCA ATTTCCTCCG GGGAAAGCTG AAGCTGTACA CAGGGGAGGC CTGCAGGACA 420
GGGGACAGAT GAGGCGGCGG CTCCCCCCAC CACGCCTCAT CTGTGACAGC CGAGTCCTGG 480
AGAGGTACCT CTTGGAGGCC AAGGAGGCCG AG 512
Popis sekvence SEQ ID NO : 61
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
9 99 9 99 99
9 9 9 9 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
9999 99 9 9999 9 999 999
9 9 9 9 9 9 v 999 9 99 9 99 99
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 61
ATCACGACGG GCTGTGCTGA ACACTGCAGC TTGAATGAGA ATATCACTGT CCCAGACACC 60
AAAGTTAATT TCTATGCCTG GAAGAGGATG GAGGTCGGGC AGCAGGCCGT AGAAGTCTGG 120
CAGGGCCTGG CCCTGCTGTC GGAAGCTGTC CTGCGGGGCC AGGCCCTGTT GGTCAACTCT 180
TCCCAGCCGT GGGAGCCCCT GCAGCTGCAT GTGGATAAAG CCGTCAGTGG CCTTCGCAGC 240
CTCACCACTC TGCTTCGGGC TCTGGGAGCC CAGAAGGAAG CCATCTCCCC TCCAGATGCG 300
GCCTCAGCTG CTCCACTCCG AACAATCACT GCTGACACTT TCCGCAAACT CTTCCGAGTC 360
TACTCCAATT TCCTCCGGGG AAAGCTGAAG CTGTACACAG GGGAGGCCTG CAGGACAGGG 420
GACAGATGAG GCGGCGGCTC CCCCCACCAC GCCTCATCTG TGACAGCCGA GTCCTGGAGA 480
GGTACCTCTT GGAGGCCAAG GAGGCCGAGA AT 512
Popis sekvence SEQ ID NO : 62
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 62
ACGACGGGCT GTGCTGAACA CTGCAGCTTG AATGAGAATA TCACTGTCCC AGACACCAAA 60
GTTAATTTCT ATGCCTGGAA GAGGATGGAG GTCGGGCAGC AGGCCGTAGA AGTCTGGCAG 120
GGCCTGGCCC TGCTGTCGGA AGCTGTCCTG CGGGGCCAGG CCCTGTTGGT CAACTCTTCC 180
CAGCCGTGGG AGCCCCTGCA GCTGCATGTG GATAAAGCCG TCAGTGGCCT TCGCAGCCTC 240
ACCACTCTGC TTCGGGCTCT GGGAGCCCAG AAGGAAGCCA TCTCCCCTCC AGATGCGGCC 300
TCAGCTGCTC CACTCCGAAC AATCACTGCT GACACTTTCC GCAAACTCTT CCGAGTCTAC 360
TCCAATTTCC TCCGGGGAAA GCTGAAGCTG TACACAGGGG AGGCCTGCAG GACAGGGGAC 420
AGATGAGGCG GCGGCTCCCC CCACCACGCC TCATCTGTGA CAGCCGAGTC CTGGAGAGGT 480
ACCTCTTGGA GGCCAAGGAG GCCGAGAATA TC 512
Popis sekvence SEQ ID NO : 63
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 63
ACGGGCTGTG CTGAACACTG CAGCTTGAAT GAGAATATCA CTGTCCCAGA CACCAAAGTT 60
AATTTCTATG CCTGGAAGAG GATGGAGGTC GGGCAGCAGG CCGTAGAAGT CTGGCAGGGC 120
CTGGCCCTGC TGTCGGAAGC TGTCCTGCGG GGCCAGGCCC TGTTGGTCAA CTCTTCCCAG 180
CCGTGGGAGC CCCTGCAGCT GCATGTGGAT AAAGCCGTCA GTGGCCTTCG CAGCCTCACC 240
ACTCTGCTTC GGGCTCTGGG AGCCCAGAAG GAAGCCATCT CCCCTCCAGA TGCGGCCTCA 300
GCTGCTCCAC TCCGAACAAT CACTGCTGAC ACTTTCCGCA AACTCTTCCG AGTCTACTCC 360
AATTTCCTCC GGGGAAAGCT GAAGCTGTAC ACAGGGGAGG CCTGCAGGAC ÁGGGGACAGA 420
TGAGGCGGCG GCTCCCCCCA CCACGCCTCA TCTGTGACAG CCGAGTCCTG GAGAGGTACC 480
TCTTGGAGGC CAAGGAGGCC GAGAATATCA CG 512 *· 9 91 11 · · · 1 9 1
9 9 9 9 9 9 9
9 9999 9 999 999
9 9 9 9 9
99 9 99 99
Popis sekvence SEQ ID NO : 64
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 64
GGCTGTGCTG AACACTGCAG CTTGAATGAG AATATCACTG TCCCAGACAC CAAAGTTAAT 60 TTCTATGCCT GGAAGAGGAT GGAGGTCGGG CAGCAGGCCG TAGAAGTCTG GCAGGGCCTG 120 GCCCTGCTGT CGGAAGCTGT CCTGCGGGGC CAGGCCCTGT TGGTCAACTC TTCCCAGCCG 180 TGGGAGCCCC TGCAGCTGCA TGTGGATAAA GCCGTCAGTG GCCTTCGCAG CCTCACCACT 240 CTGCTTCGGG CTCTGGGAGC CCAGAAGGAA GCCATCTCCC CTCCAGATGC GGCCTCAGCT 300 GCTCCACTCC GAACAATCAC TGCTGACACT TTCCGCAAAC TCTTCCGAGT CTACTCCAAT 360 TTCCTCCGGG GAAAGCTGAA GCTGTACACA GGGGAGGCCT GCAGGACAGG GGACAGATGA 420 GGCGGCGGCT CCCCCCACCA CGCCTCATCT GTGACAGCCG AGTCCTGGAG AGGTACCTCT 480 TGGAGGCCAA GGAGGCCGAG AATATCACGA CG 512
Popis sekvence SEQ ID NO : 65
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 65
TGTGCTGAAC ACTGCAGCTT GAATGAGAAT ATCACTGTCC CAGACACCAA AGTTAATTTC 60 TATGCCTGGA AGAGGATGGA GGTCGGGCAG CAGGCCGTAG AAGTCTGGCA GGGCCTGGCC 120 CTGCTGTCGG AAGCTGTCCT GCGGGGCCAG GCCCTGTTGG TCAACTCTTC CCAGCCGTGG 180 GAGCCCCTGC AGCTGCATGT GGATAAAGCC GTCAGTGGCC TTCGCAGCCT CACCACTCTG 240 CTTCGGGCTC TGGGAGCCCA GAAGGAAGCC ATCTCCCCTC CAGATGCGGC CTCAGCTGCT 300 CCACTCCGAA CAATCACTGC TGACACTTTC CGCAAACTCT TCCGAGTCTA CTCCAATTTC 360 CTCCGGGGAA AGCTGAAGCT GTACACAGGG GAGGCCTGCA GGACAGGGGA CAGATGAGGC 420 GGCGGCTCCC CCCACCACGC CTCATCTGTG ACAGCCGAGT CCTGGAGAGG TACCTCTTGG 480 AGGCCAAGGA GGCCGAGAAT ATCACGACGG GC 512
Popis sekvence SEQ ID NO : 66
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 66 • ·· to toto to· ·«· 999 · · · · ··· to · to · 9 9 9 9
9999 9 9 9 9999 9 999 999
9 9 9 9 ·« •toto· ·· · *· toto
GCTGAACACT GCAGCTTGAA TGAGAATATC ACTGTCGCAG ACACCAAAGT TAATTTCTAT 60
GCCTGGAAGA GGATGGAGGT CGGGCAGCAG GCCGTAGAAG TCTGGCAGGG CCTGGCCCTG 120
CTGTCGGAAG CTGTCCTGCG GGGCCAGGCC CTGTTGGTCA ACTCTTCCCA GCCGTGGGAG 180
CCCCTGCAGC TGCATGTGGA TAAAGCCGTC AGTGGCCTTC GCAGCCTCAC CACTCTGCTT 240
CGGGCTCTGG GAGCCCAGAA GGAAGCCATC TCCCCTCCAG ATGCGGCCTC AGCTGCTCCA 300
CTCCGAACAA TCACTGCTGA CACTTTCCGC AAACTCTTCC GAGTCTACTC CAATTTCCTC 360
CGGGGAAAGC TGAAGCTGTA CACAGGGGAG GCCTGCAGGA CAGGGGACAG ATGAGGCGGC 420
GGCTCCCCCC ACCACGCCTC ATCTGTGACA GCCGAGTCCT GGAGAGGTAC CTCTTGGAGG 480
CCAAGGAGGC CGAGAATATC ACGACGGGCT GT 512
Popis sekvence SEQ ID NO : 67
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 67
GAACACTGCA GCTTGAATGA GAATATCACT GTCCCAGACA CCAAAGTTAA TTTCTATGCC 60
TGGAAGAGGA TGGAGGTCGG GCAGCAGGCC GTAGAAGTCT GGCAGGGCCT GGCCCTGCTG 120
TCGGAAGCTG TCCTGCGGGG CCAGGCCCTG TTGGTCAACT CTTCCCAGCC GTGGGAGCCC 180
CTGCAGCTGC ATGTGGATAA AGCCGTCAGT GGCCTTCGCA GCCTCACCAC TCTGCTTCGG 240
GCTCTGGGAG CCCAGAAGGA AGCCATCTCC CCTCCAGATG CGGCCTCAGC TGCTCCACTC 300
CGAACAATCA CTGCTGACAC TTTCCGCAAA CTCTTCCGAG TCTACTCCAA TTTCCTCCGG 360
GGAAAGCTGA AGCTGTACAC AGGGGAGGCC TGCAGGACAG GGGACAGATG AGGCGGCGGC 420
TCCCCCCACC ACGCCTCATC TGTGACAGCC GAGTCCTGGA GAGGTACCTC TTGGAGGCCA 480
AGGAGGCCGA GAATATCACG ACGGGCTGTG CT 512
Popis sekvence SEQ ID NO : 68
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 68
CACTGCAGCT TGAATGAGAA TATCACTGTC CCAGACACCA AAGTTAATTT CTATGCCTGG 60 AAGAGGATGG AGGTCGGGCA GCAGGCCGTA GAAGTCTGGC AGGGCCTGGC CCTGCTGTCG 120 GAAGCTGTCC TGCGGGGCCA GGCCCTGTTG GTCAACTCTT CCCAGCCGTG GGAGCCCCTG 180 CAGCTGCATG TGGATAAAGC CGTCAGTGGC CTTCGCAGCC TCACCACTCT GCTTCGGGCT 240 CTGGGAGCCC AGAAGGAAGC CATCTCCCCT CCAGATGCGG CCTCAGCTGC TCCACTCCGA 300 ACAATCACTG CTGACACTTT CCGCAAACTC TTCCGAGTCT ACTCCAATTT CCTCCGGGGA 360 AAGCTGAAGC TGTACACAGG GGAGGCCTGC AGGACAGGGG ACAGATGAGG CGGCGGCTCC 420 CCCCACCACG CCTCATCTGT GACAGCCGAG TCCTGGAGAG GTACCTCTTG GAGGCCAAGG 480 AGGCCGAGAA TATCACGACG GGCTGTGCTG AA 512 • · ·· · Φ· ·· • · · · · · ···· • · · · · · · · · · · • ···· · · · ···« · ··· ···
Popis sekvence SEQ ID NO : 69
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 69
TGCAGCTTGA ATGAGAATAT CACTGTCCCA GACACCAAAG TTAATTTCTA TGCCTGGAAG 60 AGGATGGAGG TCGGGCAGCA GGCCGTAGAA GTCTGGCAGG GCCTGGCCCT GCTGTCGGAA 120 GCTGTCCTGC GGGGCCAGGC CCTGTTGGTC AACTCTTCCC AGCCGTGGGA GCCCCTGCAG 180 CTGCATGTGG ATAAAGCCGT CAGTGGCCTT CGCAGCCTCA CCACTCTGCT TCGGGCTCTG 240 GGAGCCCAGA AGGAAGCCAT CTCCCCTCCA GATGCGGCCT CAGCTGCTCC ACTCCGAACA 300 ATCACTGCTG ACACTTTCCG CAAACTCTTC CGAGTCTACT CCAATTTCCT CCGGGGAAAG 360 CTGAAGCTGT ACACAGGGGA GGCCTGCAGG ACAGGGGACA GATGAGGCGG CGGCTCCCCC 420 CACCACGCCT CATCTGTGAC AGCCGAGTCC TGGAGAGGTA CCTCTTGGAG GCCAAGGAGG 480 CCGAGAATAT CACGACGGGC TGTGCTGAAC AC 512
Popis sekvence SEQ ID NO : 70
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 70
AGCTTGAATG AGAATATCAC TGTCCCAGAC ACCAAAGTTA ATTTCTATGC CTGGAAGAGG 60 ATGGAGGTCG GGCAGCAGGC CGTAGAAGTC TGGCAGGGCC TGGCCCTGCT GTCGGAAGCT 120 GTCCTGCGGG GCCAGGCCCT GTTGGTCAAC TCTTCCCAGC CGTGGGAGCC CCTGCAGCTG 180 CATGTGGATA AAGCCGTCAG TGGCCTTCGC AGCCTCACCA CTCTGCTTCG GGCTCTGGGA 240 GCCCAGAAGG AAGCCATCTC CCCTCCAGAT GCGGCCTCAG CTGCTCCACT CCGAACAATC 300 ACTGCTGACA CTTTCCGCAA ACTCTTCCGA GTCTACTCCA ATTTCCTCCG GGGAAAGCTG 360 AAGCTGTACA CAGGGGAGGC CTGCAGGACA GGGGACAGAT GAGGCGGCGG CTCCCCCCAC 420 CACGCCTCAT CTGTGACAGC CGAGTCCTGG AGAGGTACCT CTTGGAGGCC AAGGAGGCCG 480 AGAATATCAC GACGGGCTGT GCTGAACACT GC 512
Popis sekvence SEQ ID NO : 71
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 71 ·· • · · ·· 4
9
TTGAATGAGA ATATCACTGT GAGGTCGGGC AGCAGGCCGT CTGCGGGGCC AGGCCCTGTT GTGGATAAAG CCGTCAGTGG CAGAAGGAAG CCATCTCCCC GCTGACACTT TCCGCAAACT CTGTACACAG GGGAGGCCTG GCCTCATCTG TGACAGCCGA ATATCACGAC GGGCTGTGCT
CCCAGACACC AAAGTTAATT AGAAGTCTGG CAGGGCCTGG GGTCAACTCT TCCCAGCCGT CCTTCGCAGC CTCACCACTC TCCAGATGCG GCCTCAGCTG CTTCCGAGTC TACTCCAATT CAGGACAGGG GACAGATGAG GTCCTGGAGA GGTACCTCTT GAACACTGCA GC • 9449 99 9 9999 9 949
4 4 4 4 4
944 9 94 9 44
TCTATGCCTG GAAGAGGATG CCCTGCTGTC GGAAGCTGTC GGGAGCCCCT GCAGCTGCAT TGCTTCGGGC TCTGGGAGCC CTCCACTCCG AACAATCACT TCCTCCGGGG AAAGCTGAAG GCGGCGGCTC CCCCCACCAC GGAGGCCAAG GAGGCCGAGA
120
180
240
300
360
420
480
512
Popis sekvence SEQ ID NO : 72
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 72
AATGAGAATA TCACTGTCCC AGACACCAAA GTTAATTTCT ATGCCTGGAA GAGGATGGAG 60
GTCGGGCAGC AGGCCGTAGA AGTCTGGCAG GGCCTGGCCC TGCTGTCGGA AGCTGTCCTG 120
CGGGGCCAGG CCCTGTTGGT CAACTCTTCC CAGCCGTGGG AGCCCCTGCA GCTGCATGTG 180
GATAAAGCCG TCAGTGGCCT TCGCAGCCTC ACCACTCTGC TTCGGGCTCT GGGAGCCCAG 240
AAGGAAGCCA TCTCCCCTCC AGATGCGGCC TCAGCTGCTC CACTCCGAAC AATCACTGCT 300
GACACTTTCC GCAAACTCTT CCGAGTCTAC TCCAATTTCC TCCGGGGAAA GCTGAAGCTG 360
TACACAGGGG AGGCCTGCAG GACAGGGGAC AGATGAGGCG GCGGCTCCCC CCACCACGCC 420
TCATCTGTGA CAGCCGAGTC CTGGAGAGGT ACCTCTTGGA GGCCAAGGAG GCCGAGAATA 480
TCACGACGGG CTGTGCTGAA CACTGCAGCT TG 512
Popis sekvence SEQ ID NO : 73
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 73
GAGAATATCA CTGTCCCAGA CACCAAAGTT AATTTCTATG CCTGGAAGAG GATGGAGGTC 60
GGGCAGCAGG CCGTAGAAGT CTGGCAGGGC CTGGCCCTGC TGTCGGAAGC TGTCCTGCGG 120
GGCCAGGCCC TGTTGGTCAA CTCTTCCCAG CCGTGGGAGC CCCTGCAGCT GCATGTGGAT 180
AAAGCCGTCA GTGGCCTTCG CAGCCTCACC ACTCTGCTTC GGGCTCTGGG AGCCCAGAAG 240
GAAGCCATCT CCCCTCCAGA TGCGGCCTCA GCTGCTCCAC TCCGAACAAT CACTGCTGAC 300
ACTTTCCGCA AACTCTTCCG AGTCTACTCC AATTTCCTCC GGGGAAAGCT GAAGCTGTAC 360
ACAGGGGAGG CCTGCAGGAC AGGGGACAGA TGAGGCGGCG GCTCCCCCCA CCACGCCTCA 420
TCTGTGACAG CCGAGTCCTG GAGAGGTACC TCTTGGAGGC CAAGGAGGCC GAGAATATCA 480
CGACGGGCTG TGCTGAACAC TGCAGCTTGA AT 512
• 4 4
4 4
Popis sekvence SEQ ID NO : 74
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 74
AATATCACTG TCCCAGACAC CAAAGTTAAT TTCTATGCCT GGAAGAGGAT GGAGGTCGGG 60
CAGCAGGCCG TAGAAGTCTG GCAGGGCCTG GCCCTGCTGT CGGAAGCTGT CCTGCGGGGC 120
CAGGCCCTGT TGGTCAACTC TTCCCAGCCG TGGGAGCCCC TGCAGCTGCA TGTGGATAAA 180
GCCGTCAGTG GCCTTCGCAG CCTCACCACT CTGCTTCGGG CTCTGGGAGC CCAGAAGGAA 240
GCCATCTCCC CTCCAGATGC GGCCTCAGCT GCTCCACTCC GAACAATCAC TGCTGACACT 300
TTCCGCAAAC TCTTCCGAGT CTACTCCAAT TTCCTCCGGG GAAAGCTGAA GCTGTACACA 360
GGGGAGGCCT GCAGGACAGG GGACAGATGA GGCGGCGGCT CCCCCCACCA CGCCTCATCT 420
GTGACAGCCG AGTCCTGGAG AGGTACCTCT TGGAGGCCAA GGAGGCCGAG AATATCACGA 480
CGGGCTGTGC TGAACACTGC AGCTTGAATG AG 512
Popis sekvence SEQ ID NO : 75
A) Délka: 512 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 75
ATCACTGTCC CAGACACCAA AGTTAATTTC TATGCCTGGA AGAGGATGGA GGTCGGGCAG 60
CAGGCCGTAG AAGTCTGGCA GGGCCTGGCC CTGCTGTCGG AAGCTGTCCT GCGGGGCCAG 120
GCCCTGTTGG TCAACTCTTC CCAGCCGTGG GAGCCCCTGC AGCTGCATGT GGATAAAGCC 180
GTCAGTGGCC TTCGCAGCCT CACCACTCTG CTTCGGGCTC TGGGAGCCCA GAAGGAAGCC 240
ATCTCCCCTC CAGATGCGGC CTCAGCTGCT CCACTCCGAA CAATCACTGC TGACACTTTC 300
CGCAAACTCT TCCGAGTCTA CTCCAATTTC CTCCGGGGAA AGCTGAAGCT GTACACAGGG 360
GAGGCCTGCA GGACAGGGGA CAGATGAGGC GGCGGCTCCC CCCACCACGC CTCATCTGTG 420
ACAGCCGAGT CCTGGAGAGG TACCTCTTGG AGGCCAAGGA GGCCGAGAAT ATCACGACGG 480
GCTGTGCTGA ACACTGCAGC TTGAATGAGA AT 512
Popis sekvence SEQ ID NO : 76
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 76
ACTGTCCCAG ACACCAAAGT TAATTTCTAT GCCGTAGAAG TCTGGCAGGG CCTGGCCCTG CTGTTGGTCA ACTCTTCCCA GCCGTGGGAG AGTGGCCTTC GCAGCCTCAC CACTCTGCTT TCCCCTCCAG ATGCGGCCTC AGCTGCTCCA AAACTCTTCC GAGTCTACTC CAATTTCCTC GCCTGCAGGA CAGGGGACAG ATGAGGCGGC GCCGAGTCCT GGAGAGGTAC CTCTTGGAGG GTGCTGAACA CTGCAGCTTG AATGAGAATA • · ·» · · • fl · flflfl · • flfl fl··· · fl ···· flfl · ···· « fl • · · > fl
GCCTGGAAGA GGATGGAGGT CGGGCAGCAG CTGTCGGAAG CTGTCCTGCG GGGCCAGGCC CCCCTGCAGC TGCATGTGGA TAAAGCCGTC CGGGCTCTGG GAGCCCAGAA GGAAGCCATC CTCCGAACAA TCACTGCTGA CACTTTCCGC CGGGGAAAGC TGAAGCTGTA CACAGGGGAG GGCTCCCCCC ACCACGCCTC ATCTGTGACA CCAAGGAGGC CGAGAATATC ACGACGGGCT ATC • · · • flflfl • · • fl
120
180
240
300
360
420
480
513
Popis sekvence SEQ ID NO : 77
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 77
GTCCCAGACA CCAAAGTTAA TTTCTATGCC GTAGAAGTCT GGCAGGGCCT GGCCCTGCTG TTGGTCAACT CTTCCCAGCC GTGGGAGCCC GGCCTTCGCA GCCTCACCAC TCTGCTTCGG CCTCCAGATG CGGCCTCAGC TGCTCCACTC CTCTTCCGAG TCTACTCCAA TTTCCTCCGG TGCAGGACAG GGGACAGATG AGGCGGCGGC GAGTCCTGGA GAGGTACCTC TTGGAGGCCA CTGAACACTG CAGCTTGAAT GAGAATAATC
TGGAAGAGGA TGGAGGTCGG GCAGCAGGCC TCGGAAGCTG TCCTGCGGGG CCAGGCCCTG CTGCAGCTGC ATGTGGATAA AGCCGTCAGT GCTCTGGGAG CCCAGAAGGA AGCCATCTCC CGAACAATCA CTGCTGACAC TTTCCGCAAA GGAAAGCTGA AGCTGTACAC AGGGGAGGCC TCCCCCCACC ACGCCTCATC TGTGACAGCC AGGAGGCCGA GAATATCACG ACGGGCTGTG ACT
120
180
240
300
360
420
480
513
Popis sekvence SEQ ID NO : 78
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 78
CCAGACACCA AAGTTAATTT CTATGCCTGG GAAGTCTGGC AGGGCCTGGC CCTGCTGTCG GTCAACTCTT CCCAGCCGTG GGAGCCCCTG CTTCGCAGCC TCACCACTCT GCTTCGGGCT CCAGATGCGG CCTCAGCTGC TCCACTCCGA TTCCGAGTCT ACTCCAATTT CCTCCGGGGA AGGACAGGGG ACAGATGAGG CGGCGGCTCC TCCTGGAGAG GTACCTCTTG GAGGCCAAGG AACACTGCAG CTTGAATGAG AATAATCACT
AAGAGGATGG AGGTCGGGCA GCAGGCCGTA GAAGCTGTCC TGCGGGGCCA GGCCCTGTTG CAGCTGCATG TGGATAAAGC CGTCAGTGGC CTGGGAGCCC AGAAGGAAGC CATCTCCCCT ACAATCACTG CTGACACTTT CCGCAAACTC AAGCTGAAGC TGTACACAGG GGAGGCCTGC CCCCACCACG CCTCATCTGT GACAGCCGAG AGGCCGAGAA TATCACGACG GGCTGTGCTG GTC
120
180
240
300
360
420
480
513 ·· • ·
Popis sekvence SEQ ID NO : 79
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 79
GACACCAAAG
GTCTGGCAGG
AACTCTTCCC
CGCAGCCTCA
GATGCGGCCT
CGAGTCTACT
ACAGGGGACA
TGGAGAGGTA
ACTGCAGCTT
TTAATTTCTA
GCCTGGCCCT
AGCCGTGGGA
CCACTCTGCT
CAGCTGCTCC
CCAATTTCCT
GATGAGGCGG
CCTCTTGGAG
GAATGAGAAT
TGCCTGGAAG
GCTGTCGGAA
GCCCCTGCAG
TCGGGCTCTG
ACTCCGAACA
CCGGGGAAAG
CGGCTCCCCC
GCCAAGGAGG
AATCACTGTC
AGGATGGAGG
GCTGTCCTGC
CTGCATGTGG
GGAGCCCAGA
ATCACTGCTG
CTGAAGCTGT
CACCACGCCT
CCGAGAATAT
CCA
TCGGGCAGCA
GGGGCCAGGC
ATAAAGCCGT
AGGAAGCCAT
ACACTTTCCG
ACACAGGGGA
CATCTGTGAC
CACGACGGGC
GGCCGTAGAA
CCTGTTGGTC
CAGTGGCCTT
CTCCCCTCCA
CAAACTCTTC
GGCCTGCAGG
AGCCGAGTCC
TGTGCTGAAC
120
180
240
300
360
420
480
513
Popis sekvence SEQ ID NO : 80
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 80
AGGATGGAGG
GCTGTCCTGC
CTGCATGTGG
GGAGCCCAGA
ATCACTGCTG
CTGAAGCTGT
CACCACGCCT
CCGAGAATAT
CCAGACACCA
TCGGGCAGCA
GGGGCCAGGC
ATAAAGCCGT
AGGAAGCCAT
ACACTTTCCG
ACACAGGGGA
CATCTGTGAC
CACGACGGGC
AAGTTAATTT
GGCCGTAGAA
CCTGTTGGTC
CAGTGGCCTT
CTCCCCTCCA
CAAACTCTTC
GGCCTGCAGG
AGCCGAGTCC
TGTGCTGAAC
CTATGCCTGG
GTCTGGCAGG
AACTCTTCCC
CGCAGCCTCA
GATGCGGCCT
CGAGTCTACT
ACAGGGGACA
TGGAGAGGTA
ACTGCAGCTT
AAG
GCCTGGCCCT
AGCCGTGGGA
CCACTCTGCT
CAGCTGCTCC
CCAATTTCCT
GATGAGGCGG
CCTCTTGGAG
GAATGAGAAT
GCTGTCGGAA
GCCCCTGCAG
TCGGGCTCTG
ACTCCGAACA
CCGGGGAAAG
CGGCTCCCCC
GCCAAGGAGG
AATCACTGTC
120
180
240
300
360
420
480
513
Popis sekvence SEQ ID NO : 81
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 80
ATGGAGGTCG GGCAGCAGGC CGTAGAAGTC TGGCAGGGCC TGGCCCTGCT GTCGGAAGCT • ·
GTCCTGCGGG GCCAGGCCCT GTTGGTCAAC TCTTCCCAGC CGTGGGAGCC CCTGCAGCTG 120 CATGTGGATA AAGCCGTCAG TGGCCTTCGC AGCCTCACCA CTCTGCTTCG GGCTCTGGGA 180 GCCCAGAAGG AAGCCATCTC CCCTCCAGAT GCGGCCTCAG CTGCTCCACT CCGAACAATC 240 ACTGCTGACA CTTTCCGCAA ACTCTTCCGA GTCTACTCCA ATTTCCTCCG GGGAAAGCTG 300 AAGCTGTACA CAGGGGAGGC CTGCAGGACA GGGGACAGAT GAGGCGGCGG CTCCCCCCAC 360 CACGCCTCAT CTGTGACAGC CGAGTCCTGG AGAGGTACCT CTTGGAGGCC AAGGAGGCCG 420 AGAATATCAC GACGGGCTGT GCTGAACACT GCAGCTTGAA TGAGAATAAT CACTGTCCCA 480 GACACCAAAG TTAATTTCTA TGCCTGGAAG AGG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 82
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 82
GAGGTCGGGC AGCAGGCCGT AGAAGTCTGG CAGGGCCTGG CCCTGCTGTC GGAAGCTGTC 60
CTGCGGGGCC AGGCCCTGTT GGTCAACTCT TCCCAGCCGT GGGAGCCCCT GCAGCTGCAT 120
GTGGATAAAG CCGTCAGTGG CCTTCGCAGC CTCACCACTC TGCTTCGGGC TCTGGGAGCC 180
CAGAAGGAAG CCATCTCCCC TCCAGATGCG GCCTCAGCTG CTCCACTCCG AACAATCACT 240
GCTGACACTT TCCGCAAACT CTTCCGAGTC TACTCCAATT TCCTCCGGGG AAAGCTGAAG 300
CTGTACACAG GGGAGGCCTG CAGGACAGGG GACAGATGAG GCGGCGGCTC CCCCCACCAC 360
GCCTCATCTG TGACAGCCGA GTCCTGGAGA GGTACCTCTT GGAGGCCAAG GAGGCCGAGA 420
ATATCACGAC GGGCTGTGCT GAACACTGCA GCTTGAATGA GAATAATCAC TGTCCCAGAC 480
ACCAAAGTTA ATTTCTATGC CTGGAAGAGG ATG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 83
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 83 Popis sekvence SEQ ID NO : 83
GTCGGGCAGC AGGCCGTAGA AGTCTGGCAG GGCCTGGCCC TGCTGTCGGA AGCTGTCCTG 60
CGGGGCCAGG CCCTGTTGGT CAACTCTTCC CAGCCGTGGG AGCCCCTGCA GCTGCATGTG 120
GATAAAGCCG TCAGTGGCCT TCGCAGCCTC ACCACTCTGC TTCGGGCTCT GGGAGCCCAG 180
AAGGAAGCCA TCTCCCCTCC AGATGCGGCC TCAGCTGCTC CACTCCGAAC AATCACTGCT 240
GACACTTTCC GCAAACTCTT CCGAGTCTAC TCCAATTTCC TCCGGGGAAA GCTGAAGCTG 300
TACACAGGGG AGGCCTGCAG GACAGGGGAC AGATGAGGCG GCGGCTCCCC CCACCACGCC 360
TCATCTGTGA CAGCCGAGTC CTGGAGAGGT ACCTCTTGGA GGCCAAGGAG GCCGAGAATA 420
TCACGACGGG CTGTGCTGAA CACTGCAGCT TGAATGAGAA TAATCACTGT CCCAGACACC 480
AAAGTTAATT TCTATGCCTG GAAGAGGATG GAG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 84
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 84
CAGGCCCTGT TGGTCAACTC TTCCCAGCCG TGGGAGCCCC TGCAGCTGCA TGTGGATAAA 60 GCCGTCAGTG GCCTTCGCAG CCTCACCACT CTGCTTCGGG CTCTGGGAGC CCAGAAGGAA 120 GCCATCTCCC CTCCAGATGC GGCCTCAGCT GCTCCACTCC GAACAATCAC TGCTGACACT 180 TTCCGCAAAC TCTTCCGAGT CTACTCCAAT TTCCTCCGGG GAAAGCTGAA GCTGTACACA 240 GGGGAGGCCT GCAGGACAGG GGACAGATGA GGCGGCGGCT CCCCCCACCA CGCCTCATCT 300 GTGACAGCCG AGTCCTGGAG AGGTACCTCT TGGAGGCCAA GGAGGCCGAG AATATCACGA 360 CGGGCTGTGC TGAACACTGC AGCTTGAATG AGAATAATCA CTGTCCCAGA CACCAAAGTT 420 AATTTCTATG CCTGGAAGAG GATGGAGGTC GGGCAGCAGG CCGTAGAAGT CTGGCAGGGC 480 CTGGCCCTGC TGTCGGAAGC TGTCCTGCGG GGC 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 85
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 85
GCCCTGTTGG TCAACTCTTC CCAGCCGTGG GAGCCCCTGC AGCTGCATGT GGATAAAGCC 60
GTCAGTGGCC TTCGCAGCCT CACCACTCTG CTTCGGGCTC TGGGAGCCCA GAAGGAAGCC 120
ATCTCCCCTC CAGATGCGGC CTCAGCTGCT CCACTCCGAA CAATCACTGC TGACACTTTC 180
CGCAAACTCT TCCGAGTCTA CTCCAATTTC CTCCGGGGAA AGCTGAAGCT GTACACAGGG 240
GAGGCCTGCA GGACAGGGGA CAGATGAGGC GGCGGCTCCC CCCACCACGC CTCATCTGTG 300
ACAGCCGAGT CCTGGAGAGG TACCTCTTGG AGGCCAAGGA GGCCGAGAAT ATCACGACGG 360
GCTGTGCTGA ACACTGCAGC TTGAATGAGA ATAATCACTG TCCCAGACAC CAAAGTTAAT 420
TTCTATGCCT GGAAGAGGAT GGAGGTCGGG CAGCAGGCCG TAGAAGTCTG GCAGGGCCTG 480
GCCCTGCTGT CGGAAGCTGT CCTGCGGGGC CAG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 86
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 86 ··
CTGTTGGTCA ACTCTTCCCA GCCGTGGGAG CCCCTGCAGC TGCATGTGGA TAAAGCCGTC 60 AGTGGCCTTC GCAGCCTCAC CACTCTGCTT CGGGCTCTGG GAGCCCAGAA GGAAGCCATC 120 TCCCCTCCAG ATGCGGCCTC AGCTGCTCCA CTCCGAACAA TCACTGCTGA CACTTTCCGC 180 AAACTCTTCC GAGTCTACTC CAATTTCCTC CGGGGAAAGC TGAAGCTGTA CACAGGGGAG 240 GCCTGCAGGA CAGGGGACAG ATGAGGCGGC GGCTCCCCCC ACCACGCCTC ATCTGTGACA 300 GCCGAGTCCT GGAGAGGTAC CTCTTGGAGG CCAAGGAGGC CGAGAATATC ACGACGGGCT 360 GTGCTGAACA CTGCAGCTTG AATGAGAATA ATCACTGTCC CAGACACCAA AGTTAATTTC 420 TATGCCTGGA AGAGGATGGA GGTCGGGCAG CAGGCCGTAG AAGTCTGGCA GGGCCTGGCC 480 CTGCTGTCGG AAGCTGTCCT GCGGGGCCAG GCC 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 87
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 87
TTGGTCAACT CTTCCCAGCC GTGGGAGCCC CTGCAGCTGC ATGTGGATAA AGCCGTCAGT 60
GGCCTTCGCA GCCTCACCAC TCTGCTTCGG GCTCTGGGAG CCCAGAAGGA AGCCATCTCC 120
CCTCCAGATG CGGCCTCAGC TGCTCCACTC CGAACAATCA CTGCTGACAC TTTCCGCAAA 180
CTCTTCCGAG TCTACTCCAA TTTCCTCCGG GGAAAGCTGA AGCTGTACAC AGGGGAGGCC 240
TGCAGGACAG GGGACAGATG AGGCGGCGGC TCCCCCCACC ACGCCTCATC TGTGACAGCC 300
GAGTCCTGGA GAGGTACCTC TTGGAGGCCA AGGAGGCCGA GAATATCACG ACGGGCTGTG 360
CTGAACACTG CAGCTTGAAT GAGAATAATC ACTGTCCCAG ACACCAAAGT TAATTTCTAT 420
GCCTGGAAGA GGATGGAGGT CGGGCAGCAG GCCGTAGAAG TCTGGCAGGG CCTGGCCCTG 480
CTGTCGGAAG CTGTCCTGCG GGGCCAGGCC CTG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 88
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 88
GTCAACTCTT CCCAGCCGTG GGAGCCCCTG CAGCTGCATG TGGATAAAGC CGTCAGTGGC 60 CTTCGCAGCC TCACCACTCT GCTTCGGGCT CTGGGAGCCC AGAAGGAAGC CATCTCCCCT 120 CCAGATGCGG CCTCAGCTGC TCCACTCCGA ACAATCACTG CTGACACTTT CCGCAAACTC 180 TTCCGAGTCT ACTCCAATTT CCTCCGGGGA AAGCTGAAGC TGTACACAGG GGAGGCCTGC 240 AGGACAGGGG ACAGATGAGG CGGCGGCTCC CCCCACCACG CCTCATCTGT GACAGCCGAG 300 TCCTGGAGAG GTACCTCTTG GAGGCCAAGG AGGCCGAGAA TATCACGACG GGCTGTGCTG 360 AACACTGCAG CTTGAATGAG AATAATCACT GTCCCAGACA CCAAAGTTAA TTTCTATGCC 420 TGGAAGAGGA TGGAGGTCGG GCAGCAGGCC GTAGAAGTCT GGCAGGGCCT GGCCCTGCTG 480 TCGGAAGCTG TCCTGCGGGG CCAGGCCCTG TTG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 89
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 89
AACTCTTCCC AGCCGTGGGA GCCCCTGCAG CGCAGCCTCA CCACTCTGCT TCGGGCTCTG GATGCGGCCT CAGCTGCTCC ACTCCGAACA CGAGTCTACT CCAATTTCCT CCGGGGAAAG ACAGGGGACA GATGAGGCGG CGGCTCCCCC TGGAGAGGTA CCTCTTGGAG GCCAAGGAGG ACTGCAGCTT GAATGAGAAT AATCACTGTC AAGAGGATGG AGGTCGGGCA GCAGGCCGTA GAAGCTGTCC TGCGGGGCCA GGCCCTGTTG
CTGCATGTGG ATAAAGCCGT CAGTGGCCTT 60 GGAGCCCAGA AGGAAGCCAT CTCCCCTCCA 120 ATCACTGCTG ACACTTTCCG CAAACTCTTC 180 CTGAAGCTGT ACACAGGGGA GGCCTGCAGG 240 CACCACGCCT CATCTGTGAC AGCCGAGTCC 300 CCGAGAATAT CACGACGGGC TGTGCTGAAC 360 CCAGACACCA AAGTTAATTT CTATGCCTGG 420 GAAGTCTGGC AGGGCCTGGC CCTGCTGTCG 480 GTC 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 90
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 90
TCTTCCCAGC CGTGGGAGCC CCTGCAGCTG AGCCTCACCA CTCTGCTTCG GGCTCTGGGA GCGGCCTCAG CTGCTCCACT CCGAACAATC GTCTACTCCA ATTTCCTCCG GGGAAAGCTG GGGGACAGAT GAGGCGGCGG CTCCCCCCAC AGAGGTACCT CTTGGAGGCC AAGGAGGCCG GCAGCTTGAA TGAGAATAAT CACTGTCCCA AGGATGGAGG TCGGGCAGCA GGCCGTAGAA GCTGTCCTGC GGGGCCAGGC CCTGTTGGTC
CATGTGGATA AAGCCGTCAG TGGCCTTCGC 60 GCCCAGAAGG AAGCCATCTC CCCTCCAGAT 120 ACTGCTGACA CTTTCCGCAA ACTCTTCCGA 180 AAGCTGTACA CAGGGGAGGC CTGCAGGACA 240 CACGCCTCAT CTGTGACAGC.CGAGTCCTGG 300 AGAATATCAC GACGGGCTGT GCTGAACACT 360 GACACCAAAG TTAATTTCTA TGCCTGGAAG 420 GTCTGGCAGG GCCTGGCCCT GCTGTCGGAA 480 AAC 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 91
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární • · · · ·
xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 91
TCCCAGCCGT GGGAGCCCCT GCAGCTGCAT GTGGATAAAG CCGTCAGTGG CCTTCGCAGC 60 CTCACCACTC TGCTTCGGGC TCTGGGAGCC CAGAAGGAAG CCATCTCCCC TCCAGATGCG 120 GCCTCAGCTG CTCCACTCCG AACAATCACT GCTGACACTT TCCGCAAACT CTTCCGAGTC 180 TACTCCAATT TCCTCCGGGG AAAGCTGAAG CTGTACACAG GGGAGGCCTG CAGGACAGGG 240 GACAGATGAG GCGGCGGCTC CCCCCACCAC GCCTCATCTG TGACAGCCGA GTCCTGGAGA 300 GGTACCTCTT GGAGGCCAAG GAGGCCGAGA ATATCACGAC GGGCTGTGCT GAACACTGCA 360 GCTTGAATGA GAATAATCAC TGTCCCAGAC ACCAAAGTTA ATTTCTATGC CTGGAAGAGG 420 ATGGAGGTCG GGCAGCAGGC CGTAGAAGTC TGGCAGGGCC TGGCCCTGCT GTCGGAAGCT 480 GTCCTGCGGG GCCAGGCCCT GTTGGTCAAC TCT 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 92
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 92
CAGCCGTGGG AGCCCCTGCA GCTGCATGTG GATAAAGCCG TCAGTGGCCT TCGCAGCCTC 60 ACCACTCTGC TTCGGGCTCT GGGAGCCCAG AAGGAAGCCA TCTCCCCTCC AGATGCGGCC 120 TCAGCTGCTC CACTCCGAAC AATCACTGCT GACACTTTCC GCAAACTCTT CCGAGTCTAC 180 TCCAATTTCC TCCGGGGAAA GCTGAAGCTG TACACAGGGG AGGCCTGCAG GACAGGGGAC 240 AGATGAGGCG GCGGCTCCCC CCACCACGCC TCATCTGTGA CAGCCGAGTC CTGGAGAGGT 300 ACCTCTTGGA GGCCAAGGAG GCCGAGAATA TCACGACGGG CTGTGCTGAA CACTGCAGCT 360 TGAATGAGAA TAATCACTGT CCCAGACACC AAAGTTAATT TCTATGCCTG GAAGAGGATG 420 GAGGTCGGGC AGCAGGCCGT AGAAGTCTGG CAGGGCCTGG CCCTGCTGTC GGAAGCTGTC 480 CTGCGGGGCC AGGCCCTGTT GGTCAACTCT TCC 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 93
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 93
CCGTGGGAGC
ACTCTGCTTC
GCTGCTCCAC
AATTTCCTCC
TGAGGCGGCG
CCCTGCAGCT
GGGCTCTGGG
TCCGAACAAT
GGGGAAAGCT
GCTCCCCCCA
GCATGTGGAT
AGCCCAGAAG
CACTGCTGAC
GAAGCTGTAC
CCACGCCTCA
AAAGCCGTCA
GAAGCCATCT
ACTTTCCGCA
ACAGGGGAGG
TCTGTGACAG
GTGGCCTTCG
CCCCTCCAGA
AACTCTTCCG
CCTGCAGGAC
CCGAGTCCTG
CAGCCTCACC
TGCGGCCTCA
AGTCTACTCC
AGGGGACAGA
GAGAGGTACC
120
180
240
300 • * ·· · ·· ·· ··· · · · · · · · • · · »··· ···· • ···· · · ♦ ···· · ··· ··· • · · · · · · ··· * ·· · ·· ··
TCTTGGAGGC CAAGGAGGCC GAGAATATCA CGACGGGCTG TGCTGAACAC TGCAGCTTGA 360
ATGAGAATAA TCACTGTCCC AGACACCAAA GTTAATTTCT ATGCCTGGAA GAGGATGGAG 420
GTCGGGCAGC AGGCCGTAGA AGTCTGGCAG GGCCTGGCCC TGCTGTCGGA AGCTGTCCTG 480
CGGGGCCAGG CCCTGTTGGT CAACTCTTCC CAG 513
Popis sekvence SEQ ID NO ; 94
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 94
TGGGAGCCCC TGCAGCTGCA TGTGGATAAA GCCGTCAGTG GCCTTCGCAG CCTCACCACT 60
CTGCTTCGGG CTCTGGGAGC CCAGAAGGAA GCCATCTCCC CTCCAGATGC GGCCTCAGCT 120
GCTCCACTCC GAACAATCAC TGCTGACACT TTCCGCAAAC TCTTCCGAGT CTACTCCAAT 180
TTCCTCCGGG GAAAGCTGAA GCTGTACACA GGGGAGGCCT GCAGGACAGG GGACAGATGA 240
GGCGGCGGCT CCCCCCACCA CGCCTCATCT GTGACAGCCG AGTCCTGGAG AGGTACCTCT 300
TGGAGGCCAA GGAGGCCGAG AATATCACGA CGGGCTGTGC TGAACACTGC AGCTTGAATG 360
AGAATAATCA CTGTCCCAGA CACCAAAGTT AATTTCTATG CCTGGAAGAG GATGGAGGTC 420
GGGCAGCAGG CCGTAGAAGT CTGGCAGGGC CTGGCCCTGC TGTCGGAAGC TGTCCTGCGG 480
GGCCAGGCCC TGTTGGTCAA CTCTTCCCAG CCG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 95
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 95
GAGCCCCTGC AGCTGCATGT GGATAAAGCC GTCAGTGGCC TTCGCAGCCT CACCACTCTG 60 CTTCGGGCTC TGGGAGCCCA GAAGGAAGCC ATCTCCCCTC CAGATGCGGC CTCAGCTGCT 120 CCACTCCGAA CAATCACTGC TGACACTTTC CGCAAACTCT TCCGAGTCTA CTCCAATTTC 180 CTCCGGGGAA AGCTGAAGCT GTACACAGGG GAGGCCTGCA GGACAGGGGA CAGATGAGGC 240 GGCGGCTCCC CCCACCACGC CTCATCTGTG ACAGCCGAGT CCTGGAGAGG TACCTCTTGG 300 AGGCCAAGGA GGCCGAGAAT ATCACGACGG GCTGTGCTGA ACACTGCAGC TTGAATGAGA 360 ATAATCACTG TCCCAGACAC CAAAGTTAAT TTCTATGCCT GGAAGAGGAT GGAGGTCGGG 420 CAGCAGGCCG TAGAAGTCTG GCAGGGCCTG GCCCTGCTGT CGGAAGCTGT CCTGCGGGGC 480 CAGGCCCTGT TGGTCAACTC TTCCCAGCCG TGG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 96
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina « ·
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 96
• · · · · ····· · ···
CTTCGGGCTC TGGGAGCCCA GAAGGAAGCC ATCTCCCCTC CAGATGCGGC CTCAGCTGCT 60
CCACTCCGAA CAATCACTGC TGACACTTTC CGCAAACTCT TCCGAGTCTA CTCCAATTTC 120
CTCCGGGGAA AGCTGAAGCT GTACACAGGG GAGGCCTGCA GGACAGGGGA CAGATGAGGC 180
GGCGGCTCCC CCCACCACGC CTCATCTGTG ACAGCCGAGT CCTGGAGAGG TACCTCTTGG 240
AGGCCAAGGA GGCCGAGAAT ATCACGACGG GCTGTGCTGA ACACTGCAGC TTGAATGAGA 300
ATAATCACTG TCCCAGACAC CAAAGTTAAT TTCTATGCCT GGAAGAGGAT GGAGGTCGGG 360
CAGCAGGCCG TAGAAGTCTG GCAGGGCCTG GCCCTGCTGT CGGAAGCTGT CCTGCGGGGC 420
CAGGCCCTGT TGGTCAACTC TTCCCAGCCG TGGGAGCCCC TGCAGCTGCA TGTGGATAAA 480
GCCGTCAGTG GCCTTCGCAG CCTCACCACT CTG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 97
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 97
CGGGCTCTGG GAGCCCAGAA GGAAGCCATC TCCCCTCCAG ATGCGGCCTC AGCTGCTCCA 60
CTCCGAACAA TCACTGCTGA CACTTTCCGC AAACTCTTCC GAGTCTACTC CAATTTCCTC 120
CGGGGAAAGC TGAAGCTGTA CACAGGGGAG GCCTGCAGGA CAGGGGACAG ATGAGGCGGC 180
GGCTCCCCCC ACCACGCCTC ATCTGTGACA GCCGAGTCCT GGAGAGGTAC CTCTTGGAGG 240
CCAAGGAGGC CGAGAATATC ACGACGGGCT GTGCTGAACA CTGCAGCTTG AATGAGAATA 300
ATCACTGTCC CAGACACCAA AGTTAATTTC TATGCCTGGA AGAGGATGGA GGTCGGGCAG 360
CAGGCCGTAG AAGTCTGGCA GGGCCTGGCC CTGCTGTCGG AAGCTGTCCT GCGGGGCCAG 420
GCCCTGTTGG TCAACTCTTC CCAGCCGTGG GAGCCCCTGC AGCTGCATGT GGATAAAGCC 480
GTCAGTGGCC TTCGCAGCCT CACCACTCTG CTT 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 98
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 98
GCTCTGGGAG CCCAGAAGGA AGCCATCTCC CCTCCAGATG CGGCCTCAGC TGCTCCACTC 60 CGAACAATCA CTGCTGACAC TTTCCGCAAA CTCTTCCGAG TCTACTCCAA TTTCCTCCGG 120 GGAAAGCTGA AGCTGTACAC AGGGGAGGCC TGCAGGACAG GGGACAGATG AGGCGGCGGC 180 TCCCCCCACC ACGCCTCATC TGTGACAGCC GAGTCCTGGA GAGGTACCTC TTGGAGGCCA 240 AGGAGGCCGA GAATATCACG ACGGGCTGTG CTGAACACTG CAGCTTGAAT GAGAATAATC 300 ACTGTCCCAG ACACCAAAGT TAATTTCTAT GCCTGGAAGA GGATGGAGGT CGGGCAGCAG 360 . i ... · ·
... · ... ·· ··
GCCGTAGAAG TCTGGCAGGG CCTGGCCCTG CTGTCGGAAG CTGTCCTGCG GGGCCAGGCC 420
CTGTTGGTCA ACTCTTCCCA GCCGTGGGAG CCCCTGCAGC TGCATGTGGA TAAAGCCGTC 480
AGTGGCCTTC GCAGCCTCAC CACTCTGCTT CGG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 99
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 99
CTGGGAGCCC AGAAGGAAGC CATCTCCCCT CCAGATGCGG CCTCAGCTGC TCCACTCCGA 60 ACAATCACTG CTGACACTTT CCGCAAACTC TTCCGAGTCT ACTCCAATTT CCTCCGGGGA 120 AAGCTGAAGC TGTACACAGG GGAGGCCTGC AGGACAGGGG ACAGATGAGG CGGCGGCTCC 180 CCCCACCACG CCTCATCTGT GACAGCCGAG TCCTGGAGAG GTACCTCTTG GAGGCCAAGG 240 AGGCCGAGAA TATCACGACG GGCTGTGCTG AACACTGCAG CTTGAATGAG AATAATCACT 300 GTCCCAGACA CCAAAGTTAA TTTCTATGCC TGGAAGAGGA TGGAGGTCGG GCAGCAGGCC 360 GTAGAAGTCT GGCAGGGCCT GGCCCTGCTG TCGGAAGCTG TCCTGCGGGG CCAGGCCCTG 420 TTGGTCAACT CTTCCCAGCC GTGGGAGCCC CTGCAGCTGC ATGTGGATAA AGCCGTCAGT 480 GGCCTTCGCA GCCTCACCAC TCTGCTTCGG GTC 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 100
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 100
GGAGCCCAGA AGGAAGCCAT CTCCCCTCCA GATGCGGCCT CAGCTGCTCC ACTCCGAACA 60 ATCACTGCTG ACACTTTCCG CAAACTCTTC CGAGTCTACT CCAATTTCCT CCGGGGAAAG 120 CTGAAGCTGT ACACAGGGGA GGCCTGCAGG ACAGGGGACA GATGAGGCGG CGGCTCCCCC 180 CACCACGCCT CATCTGTGAC AGCCGAGTCC TGGAGAGGTA CCTCTTGGAG GCCAAGGAGG 240 CCGAGAATAT CACGACGGGC TGTGCTGAAC ACTGCAGCTT GAATGAGAAT AATCACTGTC 300 CCAGACACCA AAGTTAATTT CTATGCCTGG AAGAGGATGG AGGTCGGGCA GCAGGCCGTA 360 GAAGTCTGGC AGGGCCTGGC CCTGCTGTCG GAAGCTGTCC TGCGGGGCCA GGCCCTGTTG 420 GTCAACTCTT CCCAGCCGTG GGAGCCCCTG CAGCTGCATG TGGATAAAGC CGTCAGTGGC 480 CTTCGCAGCC TCACCACTCT GCTTCGGGCT CTG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 101
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina ·· ·
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 101
GCCCAGAAGG AAGCCATCTC CCCTCCAGAT GCGGCCTCAG CTGCTCCACT CCGAACAATC 60 ACTGCTGACA CTTTCCGCAA ACTCTTCCGA GTCTACTCCA ATTTCCTCCG GGGAAAGCTG 120 AAGCTGTACA CAGGGGAGGC CTGCAGGACA GGGGACAGAT GAGGCGGCGG CTCCCCCCAC 180 CACGCCTCAT CTGTGACAGC CGAGTCCTGG AGAGGTACCT CTTGGAGGCC AAGGAGGCCG 240 AGAATATCAC GACGGGCTGT GCTGAACACT GCAGCTTGAA TGAGAATAAT CACTGTCCCA 300 GACACCAAAG TTAATTTCTA TGCCTGGAAG AGGATGGAGG TCGGGCAGCA GGCCGTAGAA 360 GTČTGGCAGG GCCTGGCCCT GCTGTCGGAA GCTGTCCTGC GGGGCCAGGC CCTGTTGGTC 420 AACTCTTCCC AGCCGTGGGA GCCCCTGCAG CTGCATGTGG ATAAAGCCGT CAGTGGCCTT 480 CGCAGCCTCA CCACTCTGCT TCGGGCTCTG GGA 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 102
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 102
CAGAAGGAAG CCATCTCCCC TCCAGATGCG GCCTCAGCTG CTCCACTCCG AACAATCACT 60
GCTGACACTT TCCGCAAACT CTTCCGAGTC TACTCCAATT TCCTCCGGGG AAAGCTGAAG 120
CTGTACACAG GGGAGGCCTG CAGGACAGGG GACAGATGAG GCGGCGGCTC CCCCCACCAC 180
GCCTCATCTG TGACAGCCGA GTCCTGGAGA GGTACCTCTT GGAGGCCAAG GAGGCCGAGA 240
ATATCACGAC GGGCTGTGCT GAACACTGCA GCTTGAATGA GAATAATCAC TGTCCCAGAC 300
ACCAAAGTTA ATTTCTATGC CTGGAAGAGG ATGGAGGTCG GGCAGCAGGC CGTAGAAGTC 360
TGGCAGGGCC TGGCCCTGCT GTCGGAAGCT GTCCTGCGGG GCCAGGCCCT GTTGGTCAAC 420
TCTTCCCAGC CGTGGGAGCC CCTGCAGCTG CATGTGGATA AAGCCGTCAG TGGCCTTCGC 480
AGCCTCACCA CTCTGCTTCG GGCTCTGGGA GCC 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 103
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 103
AAGGAAGCCA TCTCCCCTCC AGATGCGGCC TCAGCTGCTC CACTCCGAAC AATCACTGCT 60
GACACTTTCC GCAAACTCTT CCGAGTCTAC TCCAATTTCC TCCGGGGAAA GCTGAAGCTG 120
TACACAGGGG AGGCCTGCAG GACAGGGGAC AGATGAGGCG GCGGCTCCCC CCACCACGCC 180
TCATCTGTGA CAGCCGAGTC CTGGAGAGGT ACCTCTTGGA GGCCAAGGAG GCCGAGAATA 240
TCACGACGGG CTGTGCTGAA CACTGCAGCT TGAATGAGAA TAATCACTGT CCCAGACACC 300
AAAGTTAATT TCTATGCCTG GAAGAGGATG GAGGTCGGGC AGCAGGCCGT AGAAGTCTGG 360
CAGGGCCTGG CCCTGCTGTC GGAAGCTGTC CTGCGGGGCC AGGCCCTGTT GGTCAACTCT 420 ·· ·· > · · «
CCGTCAGTGG CCTTCGCAGC «« · • *
TCCCAGCCGT GGGAGCCCCT GCAGCTGCAT GTGGATAAAG CTCACCACTC TGCTTCGGGC TCTGGGAGCC CAG
480
513
Popis sekvence SEQ ID NO : 104
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 104
GAAGCCATCT CCCCTCCAGA TGCGGCCTCA GCTGCTCCAC TCCGAACAAT CACTGCTGAC 60 ACTTTCCGCA AACTCTTCCG AGTCTACTCC AATTTCCTCC GGGGAAAGCT GAAGCTGTAC 120 ACAGGGGAGG CCTGCAGGAC AGGGGACAGA TGAGGCGGCG GCTCCCCCCA CCACGCCTCA 180 TCTGTGACAG CCGAGTCCTG GAGAGGTACC TCTTGGAGGC CAAGGAGGCC GAGAATATCA 240 CGACGGGCTG TGCTGAACAC TGCAGCTTGA ATGAGAATAA TCACTGTCCC AGACACCAAA 300 GTTAATTTCT ATGCCTGGAA GAGGATGGAG GTCGGGCAGC AGGCCGTAGA AGTCTGGCAG 360 GGCCTGGCCC TGCTGTCGGA AGCTGTCCTG CGGGGCCAGG CCCTGTTGGT CAACTCTTCC 420 CAGCCGTGGG AGCCCCTGCA GCTGCATGTG GATAAAGCCG TCAGTGGCCT TCGCAGCCTC 480 ACCACTCTGC TTCGGGCTCT GGGAGCCCAG AAG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 105
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 105
GCCATCTCCC CTCCAGATGC GGCCTCAGCT GCTCCACTCC GAACAATCAC TGCTGACACT 60 TTCCGCAAAC TCTTCCGAGT CTACTCCAAT TTCCTCCGGG GAAAGCTGAA GCTGTACACA 120 GGGGAGGCCT GCAGGACAGG GGACAGATGA GGCGGCGGCT CCCCCCACCA CGCCTCATCT 180 GTGACAGCCG AGTCCTGGAG AGGTACCTCT TGGAGGCCAA GGAGGCCGAG AATATCACGA 240 CGGGCTGTGC TGAACACTGC AGCTTGAATG AGAATAATCA CTGTCCCAGA CACCAAAGTT 300 AATTTCTATG CCTGGAAGAG GATGGAGGTC GGGCAGCAGG CCGTAGAAGT CTGGCAGGGC 360 CTGGCCCTGC TGTCGGAAGC TGTCCTGCGG GGCCAGGCCC TGTTGGTCAA CTCTTCCCAG 420 CCGTGGGAGC CCCTGCAGCT GCATGTGGAT AAAGCCGTCA GTGGCCTTCG CAGCCTCACC 480 ACTCTGCTTC GGGCTCTGGG AGCCCAGAAG GAA 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 106
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina 88 · · .··.:
• · · · · · ·· ·· • · · · • · · · • ··· ··· • ·
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 106
ATCTCCCCTC CAGATGCGGC CTCAGCTGCT CCACTCCGAA CAATCACTGC TGACACTTTC 60
CGCAAACTCT TCCGAGTCTA CTCCAATTTC CTCCGGGGAA AGCTGAAGCT GTACACAGGG 120
GAGGCCTGCA GGACAGGGGA CAGATGAGGC GGCGGCTCCC CCCACCACGC CTCATCTGTG 180
ACAGCCGAGT CCTGGAGAGG TACCTCTTGG AGGCCAAGGA GGCCGAGAAT ATCACGACGG 240
GCTGTGCTGA ACACTGCAGC TTGAATGAGA ATAATCACTG TCCCAGACAC CAAAGTTAAT 300
TTCTATGCCT GGAAGAGGAT GGAGGTCGGG CAGCAGGCCG TAGAAGTCTG GCAGGGCCTG 360
GCCCTGCTGT CGGAAGCTGT CCTGCGGGGC CAGGCCCTGT TGGTCAACTC TTCCCAGCCG 420
TGGGAGCCCC TGCAGCTGCA TGTGGATAAA GCCGTCAGTG GCCTTCGCAG CCTCACCACT 480
CTGCTTCGGG CTCTGGGAGC CCAGAAGGAA GCC 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 107
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 108
TCCCCTCCAG ATGCGGCCTC AGCTGCTCCA CTCCGAACAA TCACTGCTGA CACTTTCCGC 60
AAACTCTTCC GAGTCTACTC CAATTTCCTC CGGGGAAAGC TGAAGCTGTA CACAGGGGAG 120
GCCTGCAGGA CAGGGGACAG ATGAGGCGGC GGCTCCCCCC ACCACGCCTC ATCTGTGACA 180
GCCGAGTCCT GGAGAGGTAC CTCTTGGAGG CCAAGGAGGC CGAGAATATC ACGACGGGCT 240
GTGCTGAACA CTGCAGCTTG AATGAGAATA ATCACTGTCC CAGACACCAA AGTTAATTTC 300
TATGCCTGGA AGAGGATGGA GGTCGGGCAG CAGGCCGTAG AAGTCTGGCA GGGCCTGGCC 360
CTGCTGTCGG AAGCTGTCCT GCGGGGCCAG GCCCTGTTGG TCAACTCTTC CCAGCCGTGG 420
GAGCCCCTGC AGCTGCATGT GGATAAAGCC GTCAGTGGCC TTCGCAGCCT CACCACTCTG 480
CTTCGGGCTC TGGGAGCCCA GAAGGAAGCC ATC 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 108
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 108
CCTCCAGATG CGGCCTCAGC TGCTCCACTC CGAACAATCA CTGCTGACAC TTTCCGCAAA 60 CTCTTCCGAG TCTACTCCAA TTTCCTCCGG GGAAAGCTGA AGCTGTACAC AGGGGAGGCC 120 TGCAGGACAG GGGACAGATG AGGCGGCGGC TCCCCCCACC ACGCCTCATC TGTGACAGCC 180 GAGTCCTGGA GAGGTACCTC TTGGAGGCCA AGGAGGCCGA GAATATCACG ACGGGCTGTG 240 CTGAACACTG CAGCTTGAAT GAGAATAATC ACTGTCCCAG ACACCAAAGT TAATTTCTAT 300 GCCTGGAAGA GGATGGAGGT CGGGCAGCAG GCCGTAGAAG TCTGGCAGGG CCTGGCCCTG 360 CTGTCGGAAG CTGTCCTGCG GGGCCAGGCC CTGTTGGTCA ACTCTTCCCA GCCGTGGGAG 420 CCCCTGCAGC TGCATGTGGA TAAAGCCGTC AGTGGCCTTC GCAGCCTCAC CACTCTGCTT 480
CGGGCTCTGG GAGCCCAGAA GGAAGCCATC TCC
513 ·· · • · • · ·· ·· • · · · • · · · ··· ··· • · ·· ··
Popis sekvence SEQ ID NO : 109
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 109
CCAGATGCGG CCTCAGCTGC TCCACTCCGA ACAATCACTG CTGACACTTT CCGCAAACTC 60 TTCCGAGTCT ACTCCAATTT CCTCCGGGGA AAGCTGAAGC TGTACACAGG GGAGGCCTGC 120 AGGACAGGGG ACAGATGAGG CGGCGGCTCC CCCCACCACG CCTCATCTGT GACAGCCGAG 180 TCCTGGAGAG GTACCTCTTG GAGGCCAAGG AGGCCGAGAA TATCACGACG GGCTGTGCTG 240 AACACTGCAG CTTGAATGAG AATAATCACT GTCCCAGACA CCAAAGTTAA TTTCTATGCC 300 TGGAAGAGGA TGGAGGTCGG GCAGCAGGCC GTAGAAGTCT GGCAGGGCCT GGCCCTGCTG 360 TCGGAAGCTG TCCTGCGGGG CCAGGCCCTG TTGGTCAACT CTTCCCAGCC GTGGGAGCCC 420 CTGCAGCTGC ATGTGGATAA AGCCGTCAGT GGCCTTCGCA GCCTCACCAC TCTGCTTCGG 480 GCTCTGGGAG CCCAGAAGGA AGCCATCTCC CCT 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 110
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 110
GATGCGGCCT CAGCTGCTCC ACTCCGAACA ATCACTGCTG ACACTTTCCG CAAACTCTTC 60
CGAGTCTACT CCAATTTCCT CCGGGGAAAG CTGAAGCTGT ACACAGGGGA GGCCTGCAGG 120
ACAGGGGACA GATGAGGCGG CGGCTCCCCC CACCACGCCT CATCTGTGAC AGCCGAGTCC 180
TGGAGAGGTA CCTCTTGGAG GCCAAGGAGG CCGAGAATAT CACGACGGGC TGTGCTGAAC 240
ACTGCAGCTT GAATGAGAAT AATCACTGTC CCAGACACCA AAGTTAATTT CTATGCCTGG 300
AAGAGGATGG AGGTCGGGCA GCAGGCCGTA GAAGTCTGGC AGGGCCTGGC CCTGCTGTCG 360
GAAGCTGTCC TGCGGGGCCA GGCCCTGTTG GTCAACTCTT CCCAGCCGTG GGAGCCCCTG 420
CAGCTGCATG TGGATAAAGC CGTCAGTGGC CTTCGCAGCC TCACCACTCT GCTTCGGGCT 480
CTGGGAGCCC AGAAGGAAGC CATCTCCCCT CCA 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 111
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 111
• Φ
ΦΦ
GCGGCCTCAG CTGCTCCACT CCGAACAATC ACTGCTGACA CTTTCCGCAA ACTCTTCCGA 60 GTCTACTCCA ATTTCCTCCG GGGAAAGCTG AAGCTGTACA CAGGGGAGGC CTGCAGGACA 120 GGGGACAGAT GAGGCGGCGG CTCCCCCCAC CACGCCTCAT CTGTGACAGC CGAGTCCTGG 180 AGAGGTACCT CTTGGAGGCC AAGGAGGCCG AGAATATCAC GACGGGCTGT GCTGAACACT 240 GCAGCTTGAA TGAGAATAAT CACTGTCCCA GACACCAAAG TTAATTTCTA TGCCTGGAAG 300 AGGATGGAGG TCGGGCAGCA GGCCGTAGAA GTCTGGCAGG GCCTGGCCCT GCTGTCGGAA 360 GCTGTCCTGC GGGGCCAGGC CCTGTTGGTC AACTCTTCCC AGCCGTGGGA GCCCCTGCAG 420 CTGCATGTGG ATAAAGCCGT CAGTGGCCTT CGCAGCCTCA CCACTCTGCT TCGGGCTCTG 480 GGAGCCCAGA AGGAAGCCAT CTCCCCTCCA GAT 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 112
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 112
GCCTCAGCTG CTCCACTCCG AACAATCACT GCTGACACTT TCCGCAAACT CTTCCGAGTC 60
TACTCCAATT TCCTCCGGGG AAAGCTGAAG CTGTACACAG GGGAGGCCTG CAGGACAGGG 120
GACAGATGAG GCGGCGGCTC CCCCCACCAC GCCTCATCTG TGACAGCCGA GTCCTGGAGA 180
GGTACCTCTT GGAGGCCAAG GAGGCCGAGA ATATCACGAC GGGCTGTGCT GAACACTGCA 240
GCTTGAATGA GAATAATCAC TGTCCCAGAC ACCAAAGTTA ATTTCTATGC CTGGAAGAGG 300
ATGGAGGTCG GGCAGCAGGC CGTAGAAGTC TGGCAGGGCC TGGCCCTGCT GTCGGAAGCT 360
GTCCTGCGGG GCCAGGCCCT GTTGGTCAAC TCTTCCCAGC CGTGGGAGCC CCTGCAGCTG 420
CATGTGGATA AAGCCGTCAG TGGCCTTCGC AGCCTCACCA CTCTGCTTCG GGCTCTGGGA 480
GCCCAGAAGG AAGCCATCTC CCCTCCAGAT GCG 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 113
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 113
TCAGCTGCTC CACTCCGAAC AATCACTGCT GACACTTTCC GCAAACTCTT CCGAGTCTAC 60 TCCAATTTCC TCCGGGGAAA GCTGAAGCTG TACACAGGGG AGGCCTGCAG GACAGGGGAC 120 AGATGAGGCG GCGGCTCCCC CCACCACGCC TCATCTGTGA CAGCCGAGTC CTGGAGAGGT 180 ACCTCTTGGA GGCCAAGGAG GCCGAGAATA TCACGACGGG CTGTGCTGAA CACTGCAGCT 240 TGAATGAGAA TAATCACTGT CCCAGACACC AAAGTTAATT TCTATGCCTG GAAGAGGATG 300 GAGGTCGGGC AGCAGGCCGT AGAAGTCTGG CAGGGCCTGG CCCTGCTGTC GGAAGCTGTC 360 CTGCGGGGCC AGGCCCTGTT GGTCAACTCT TCCCAGCCGT GGGAGCCCCT GCAGCTGCAT 420 GTGGATAAAG CCGTCAGTGG CCTTCGCAGC CTCACCACTC TGCTTCGGGC TCTGGGAGCC 480 CAGAAGGAAG CCATCTCCCC TCCAGATGCG GCC 513 • » · 9 9 9 9 9 9 9 9 • 9999 99 9 9999 9 999 999 • 9 9 ♦ · · · ··· · ·· 9 99 99
Popis sekvence SEQ ID NO : 114
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 114
GCTGCTCCAC TCCGAACAAT CACTGCTGAC ACTTTCCGCA AACTCTTCCG AGTCTACTCC 60 AATTTCCTCC GGGGAAAGCT GAAGCTGTAC ACAGGGGAGG CCTGCAGGAC AGGGGACAGA 120 TGAGGCGGCG GCTCCCCCCA CCACGCCTCA TCTGTGACAG CCGAGTCCTG GAGAGGTACC 180 TCTTGGAGGC CAAGGAGGCC GAGAATATCA CGACGGGCTG TGCTGAACAC TGCAGCTTGA 240 ATGAGAATAA TCACTGTCCC AGACACCAAA GTTAATTTCT ATGCCTGGAA GAGGATGGAG 300 GTCGGGCAGC AGGCCGTAGA AGTCTGGCAG GGCCTGGCCC TGCTGTCGGA AGCTGTCCTG 360 CGGGGCCAGG CCCTGTTGGT CAACTCTTCC CAGCCGTGGG AGCCCCTGCA GCTGCATGTG 420 GATAAAGCCG TCAGTGGCCT TCGCAGCCTC ACCACTCTGC TTCGGGCTCT GGGAGCCCAG 480 AAGGAAGCCA TCTCCCCTCC AGATGCGGCC TCA 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 115
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 115
GCTCCACTCC GAACAATCAC TGCTGACACT TTCCGCAAAC TCTTCCGAGT CTACTCCAAT 60
TTCCTCCGGG GAAAGCTGAA GCTGTACACA GGGGAGGCCT GCAGGACAGG GGACAGATGA 120
GGCGGCGGCT CCCCCCACCA CGCCTCATCT GTGACAGCCG AGTCCTGGAG AGGTACCTCT 180
TGGAGGCCAA GGAGGCCGAG AATATCACGA CGGGCTGTGC TGAACACTGC AGCTTGAATG 240
AGAATAATCA CTGTCCCAGA CACCAAAGTT AATTTCTATG CCTGGAAGAG GATGGAGGTC 300
GGGCAGCAGG CCGTAGAAGT CTGGCAGGGC CTGGCCCTGC TGTCGGAAGC TGTCCTGCGG 360
GGCCAGGCCC TGTTGGTCAA CTCTTCCCAG CCGTGGGAGC CCCTGCAGCT GCATGTGGAT 420
AAAGCCGTCA GTGGCCTTCG CAGCCTCACC ACTCTGCTTC GGGCTCTGGG AGCCCAGAAG 480
GAAGCCATCT CCCCTCCAGA TGCGGCCTCA GCT 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 116
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 116
4 «· · • · 9
44444 « · • ®» 4 • * · • 4·
4 4 4
4 44 4
4 9
4 9
49
9 9 4
4 4 9 • 9·· 994
4
49
CCACTCCGAA CAATCACTGC TGACACTTTC CGCAAACTCT TCCGAGTCTA CTCCAATTTC 60 CTCCGGGGAA AGCTGAAGCT GTACACAGGG GAGGCCTGCA GGACAGGGGA CAGATGAGGC 120 GGGGGCTCCC CCCACCACGC CTCATCTGTG ACAGCCGAGT CCTGGAGAGG TACCTCTTGG 180 AGGCCAAGGA GGCCGAGAAT ATCACGACGG GCTGTGCTGA ACACTGCAGC TTGAATGAGA 240 ATAATCACTG TCCCAGACAC CAAAGTTAAT TTCTATGCCT GGAAGAGGAT GGAGGTCGGG 300 CAGCAGGCCG TAGAAGTCTG GCAGGGCCTG GCCCTGCTGT CGGAAGCTGT CCTGCGGGGC 360 CAGGCCCTGT TGGTCAACTC TTCCCAGCCG TGGGAGCCCC TGCAGCTGCA TGTGGATAAA 420 GCCGTCAGTG GCCTTCGCAG CCTCACCACT CTGCTTCGGG CTCTGGGAGC CCAGAAGGAA 480 GCCATCTCCC CTCCAGATGC GGCCTCAGCT GCT 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 117
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 117
CTCCGAACAA TCACTGCTGA CACTTTCCGC AAACTCTTCC GAGTCTACTC CAATTTCCTC 60 CGGGGAAAGC TGAAGCTGTA CACAGGGGAG GCCTGCAGGA CAGGGGACAG ATGAGGCGGC 120 GGCTCCCCCC ACCACGCCTC ATCTGTGACA GCCGAGTCCT GGAGAGGTAC CTCTTGGAGG 180 CCAAGGAGGC CGAGAATATC ACGACGGGCT GTGCTGAACA CTGCAGCTTG AATGAGAATA 240 ATCACTGTCC CAGACACCAA AGTTAATTTC TATGCCTGGA AGAGGATGGA GGTCGGGCAG 300 CAGGCCGTAG AAGTCTGGCA GGGCCTGGCC CTGCTGTCGG AAGCTGTCCT GCGGGGCCAG 360 GCCCTGTTGG TCAACTCTTC CCAGCCGTGG GAGCCCCTGC AGCTGCATGT GGATAAAGCC 420 GTCAGTGGCC TTCGCAGCCT CACCACTCTG CTTCGGGCTC TGGGAGCCCA GAAGGAAGCC 480 ATCTCCCCTC CAGATGCGGC CTCAGCTGCT CCA 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 118
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 118
CGAACAATCA CTGCTGACAC TTTCCGCAAA CTCTTCCGAG TCTACTCCAA TTTCCTCCGG 60
GGAAAGCTGA AGCTGTACAC AGGGGAGGCC TGCAGGACAG GGGACAGATG AGGCGGCGGC 120
TCCCCCCACC ACGCCTCATC TGTGACAGCC GAGTCCTGGA GAGGTACCTC TTGGAGGCCA 180
AGGAGGCCGA GAATATCACG ACGGGCTGTG CTGAACACTG CAGCTTGAAT GAGAATAATC 240
ACTGTCCCAG ACACCAAAGT TAATTTCTAT GCCTGGAAGA GGATGGAGGT CGGGCAGCAG 300
GCCGTAGAAG TCTGGCAGGG CCTGGCCCTG CTGTCGGAAG CTGTCCTGCG GGGCCAGGCC 360
CTGTTGGTCA ACTCTTCCCA GCCGTGGGAG CCCCTGCAGC TGCATGTGGA TAAAGCCGTC 420
AGTGGCCTTC GCAGCCTCAC CACTCTGCTT CGGGCTCTGG GAGCCCAGAA GGAAGCCATC 480
TCCCCTCCAG ATGCGGCCTC AGCTGCTCCA CTC 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 119
A) Délka: 513 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 119
ACAATCACTG CTGACACTTT CCGCAAACTC TTCCGAGTCT ACTCCAATTT CCTCCGGGGA 60 AAGCTGAAGC TGTACACAGG GGAGGCCTGC AGGACAGGGG ACAGATGAGG CGGCGGCTCC 120 CCCCACCACG CCTCATCTGT GACAGCCGAG TCCTGGAGAG GTACCTCTTG GAGGCCAAGG 180 AGGCCGAGAA TATCACGACG GGCTGTGCTG AACACTGCAG CTTGAATGAG AATAATCACT 240 GTCCCAGACA CCAAAGTTAA TTTCTATGCC TGGAAGAGGA TGGAGGTCGG GCAGCAGGCC 300 GTAGAAGTCT GGCAGGGCCT GGCCCTGCTG TCGGAAGCTG TCCTGCGGGG CCAGGCCCTG 360 TTGGTCAACT CTTCCCAGCC GTGGGAGCCC CTGCAGCTGC ATGTGGATAA AGCCGTCAGT 420 GGCCTTCGCA GCCTCACCAC TCTGCTTCGG GCTCTGGGAG CCCAGAAGGA AGCCATCTCC 480 CCTCCAGATG CGGCCTCAGC TGCTCCACTC CGA 513
Popis sekvence SEQ ID NO : 120
A) Délka: 501 párů bází
B) Typ: nukleová kyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 120
GCCCCACCAC GCCTCATCTG TGACAGCCGA GTCCTGGAGA GGTACCTCTT GGAGGCCAAG 60 GAGGCCGAGA ATATCACGAC GGGCTGTGCT GAACACTGCA GCTTGAATGA GAATATCACT 120 GTCCCAGACA CCAAAGTTAA TTTCTATGCC TGGAAGAGGA TGGAGGTCGG GCAGCAGGCC 180 GTAGAAGTCT GGCAGGGCCT GGCCCTGCTG TCGGAAGCTG TCCTGCGGGG CCAGGCCCTG 240 TTGGTCAACT CTTCCCAGCC GTGGGAGCCC CTGCAGCTGC ATGTGGATAA AGCCGTCAGT 300 GGCCTTCGCA GCCTCACCAC TCTGCTTCGG GCTCTGGGAG CCCAGAAGGA AGCCATCTCC 360 CCTCCAGATG CGGCCTCAGC TGCTCCACTC CGAACAATCA CTGCTGACAC TTTCCGCAAA 420 CTCTTCCGAG TCTACTCCAA TTTCCTCCGG GGAAAGCTGA AGCTGTACAC AGGGGAGGCC 480 TGCAGGACAG GGGACAGATG A 501
Popis sekvence SEQ ID NO : 121
A) Délka: 166 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 121 • « Φ· I ΦΦ ΦΦ • · · · φ I φφφφ
Ϊ· 9 ΦΦΦ· · · 4» Φ φφφφ · · φ φφφ· · φφφ φφφ φ < · · φ φ φ *·· ♦ C* * 99 ΦΦ
Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu
1 5 10 15
Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His
20 25 30
Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe
35 40 45
Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp
50 55 60
Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu
65 70 75 80
Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp
85 90 95
Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu
100 105 110
Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala
115 120 125
Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val
130 135 140
Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala
145 150 155 160
Cys Arg Thr Gly Asp Arg
165
Popis sekvence SEQ ID NO : 122
A) Délka: 170 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 122
Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu
1 5 10 15
Val Gly Gin Gin Ala Val Glu Val Trp Gin Gly Leu Ala Leu Leu Ser
20 25 30
Glu Ala Val Leu Arg Gly Gin Ala Leu Leu Val Asn Ser Ser Gin Pro
35 40 45
Trp Glu Pro Leu Gin Leu His Val Asp Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg
50 55 60
Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu Gly Ala Gin Lys Glu Ala Ile
65 70 75 80
Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala
85 90 95
Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly
100 105 110
Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala Cys Arg Thr Gly Asp Arg Gly
115 120 125
Gly Gly 130 Ser Ala Pro Pro Arg 135 Leu lle
Arg 145 Tyr Leu Leu Glu Ala 150 Lys Glu Ala
Ala Glu His Cys Ser 165 Leu Asn Glu Asn
'i · ·· · 9 · · • 4» * · · · · · · · · · · · · • ···♦·· ·····«> ··· ··· 9 9··· · 9 • 99 ·. 99; · 9 1' 99
Cys Asp Ser Arg 140 Val Leu Glu
Glu Asn lle Thr Thr Gly Cys
155 160
lle
170
Popis sekvence SEQ ID NO : 123
A) Délka: 4 aminokyseliny
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 123
Gly Gly Gly Ser 1
Popis sekvence SEQ ID NO : 124
A) Délka: 8 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 124
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser 1 5
Popis sekvence SEQ ID NO : 125
A) Délka: 12 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný ·♦ » ftft • ♦ · ft • · · » « • ftft xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 125
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser 15 10
Popis sekvence SEQ ID NO : 126
A) Délka: 7 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 126
Ser Gly Gly Ser Gly Gly Ser 1 5
Popis sekvence SEQ ID NO : 127
A) Délka: 5 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 127
Glu Phe Gly Asn Met 1 5
Popis sekvence SEQ ID NO : 128
A) Délka: 6 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný • 4 4 4
4 4 4 4 xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 128
Glu Phe Gly Gly Asn Met 1 5
Popis sekvence SEQ ID NO : 129
A) Délka: 9 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 129
Glu Phe Gly Gly Asn Gly Gly Asn Met 1 5
Popis sekvence SEQ ID NO : 130
A) Délka: 7 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 130
Gly Gly Ser Asp Met Ala Gly 1 5
Popis sekvence SEQ ID NO : 131
A) Délka: 27 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 131 • « * · 4
4 4 4
4 4 4 • 4 4 4 t 444 444
4
4 A 4 • · · • · · • a a * » «> a · t » · « • · · ·
GCGCGCCCAT GGACAATCAC TGCTGAC
Popis sekvence SEQ ID NO : 132
A) Délka: 15 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 132
TCTGTCCCCT GTCCT
Popis sekvence SEQ ID NO : 133
A) Délka: 43 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 133
GCGCGCAAGC TTATTATCGG AGTGGAGCAG CTGAGGCCGC ATC
Popis sekvence SEQ ID NO : 134
A) Délka: 21 aminokyselin
B) Typ: aminokyselina
C) Řetězec: jednoduchý
D) Topologie: lineární ii) Typ molekuly: žádný xi) Popis řetězce : SEQ ID NO: 134

Claims (22)

1. Polypeptid agonisty receptoru erythropoietinu obsahující modifikovanou sekvenci aminokyselin s následujícím vzorcem:
AlaProProArgLeuIleCysAspSerArgValLeuGluArgTyrLeuLeuGluAlaLys 10 20
GluAlaGluAsnlleThrThrGlyCysAlaGluHisCysSerLeuAsnGluAsnlleThr 30 40
ValProAspThrLysVaLAsnPheTyrAlaTrpLysArgMetGluValGlyGlnGlnAla 50 60
ValGluValTrpGlnGlyLeuAlaLeuLeuSerGluAlaValLeuArgGlyGlnAlaLeu 70 80
LeuValAsnSerSerGlnProTrpGluProLeuGlnLeuHisValAspLysAlaValSer 90 100
GlyLeuArgSerLeuThrThrLeuLeuArgAlaLeuGlyAlaGlnLysGluAlalleSer 110 120
ProProAspAlaAlaSerAlaAlaProLeuArgThrlleThrAlaAspThrPheArgLys 130 140
LeuPhe ArgV alT yrSer AsnPheLeu ArgGlyLysLeuLysLeuT yrThrGlyGlu Ala 150 160
CysArgThrGlyAspArg SEQ ID NO: 121 166 kde případně 1 až 6 aminokyselin od N-konce a 1 až 5 od C-konce může být odstraněno z tohoto polypeptidů agonistů receptoru erythropoietinu, kde N-konec je spojen s C-koncem přímo nebo spojovníkem schopným spojit N-konec s C-koncem a majícím nové C- a N-konce u aminokyselin:
23-24,24-25,25-26,27-28,28-29,29-30, 30-31, 31-32,32-33, 33-34,34-35, 35-36, 36-37, 37-38, 38-39, 40-41, 41-42, 43-44, 44-45, 45-46, 45-56, 46-47, 47-48, 48-49, 50-51, 51-52, 5253, 53-54, 54-55, 55-56, 56-57, 57-58, 77-78, 78-79, 79-80, 80-81, 81-82, 82-83, 84-85, 85-86, 86-87, 87-88, 88-89, 108-109, 109-110,110-111,111-112,112-113, 113-114, 114-115, 115-116, 116-117, 117-118, 118-119, 119-120, 120-121, 121-122, 123-124, 124-125, 125-126, 126-127, 127-128,128-129,129-130,131-132, a tento polypeptid agonisty receptoru erythropoietinu může být případně bezprostředně předcházen (methionin-1), (alanin-1) nebo (methionin2, alanin-1).
100 • 00 0 0« 00 0 ·00 0000
00 ·000 0000
0000 00 0 0000 0 000 000 • 0 0 0 0 0 0· »0 0 0 0 44
2. Polypeptid agonisty receptoru erythropoietinu podle nároku 1 vyznačený tím, že tento spojovník je vybraný ze skupiny sestávající z:
Gly Gly Gly Ser SEQ ID NO: 123,
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser SEQ ID NO: 124,
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser SEQ ID NO: 125,
Ser Gly Gly Ser Gly Gly Ser Glu Phe Gly Asn Met Glu Phe Gly Gly Asn Met Glu Phe Gly Asn Gly Gly Asn Met Gly Gly Ser Asp Met Ala Gly
SEQ ID NO: 126,
SEQ ID NO: 127, SEQ ID NO: 128, SEQ ID NO: 129 a SEQ ID NO: 130.
3. Polypeptid agonistů receptoru erythropoietinu podle nároku 1 vyznačený tím, že je vybraný ze skupiny sestávající z :
SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4,
SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8,
SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12,
SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16,
SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 20,
SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24,
SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 28,
SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32,
SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36,
SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40,
SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 44,
101 • ·· · ·· • · · · · · « · » · * · · 9 · · · 9 9 9 9
9 9 9 9 · 99
SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48,
SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 52,
SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56,
SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 59 a SEQ ID NO: 122.
4. Polypeptid agonisty receptoru erythropoietinu podle nároku 3 vyznačený tím, že sekvence spojovníku (Gly Gly Gly Ser SEQ ID NO: 123) je nahrazená sekvencí spojovníku vybranou ze skupiny sestávající z:
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser SEQ ID NO: 124, Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser SEQ ID NO: 125, Ser Gly Gly Ser Gly Gly Ser SEQ ID NO: 126, Glu Phe Gly Asn Met SEQ ID NO: 127, Glu Phe Gly Gly Asn Met SEQ ID NO: 128, Glu Phe Gly Asn Gly Gly Asn Met SEQ ID NO: 129 a Gly Gly Ser Asp Met Ala Gly SEQ ID NO: 130.
5. Molekula nukleové kyseliny obsahující sekvenci erythropoietinu kódující polypeptid agonisty receptoru erythropoietinu podle nároku 1.
6. Molekula nukleové kyseliny obsahující sekvenci erythropoietinu kódující polypeptid agonisty receptoru erythropoietinu podle nároku 2.
7. Molekula nukleové kyseliny obsahující sekvenci erythropoietinu kódující polypeptid agonisty receptoru erythropoietinu podle nároku 3.
8. Molekula nukleové kyseliny obsahující sekvenci erythropoietinu kódující polypeptid agonisty receptoru erythropoietinu vybraný ze skupinysestávající z:
SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 63,
102 « 00 * *· 00 0 000 0000
00 0000 0 000
0000 0 0 0 0000 0 000 000
0 0 0 0 · *
000 0 0· 0 00 90
SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 68,
SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 70, SEQ ID NO: 71, SEQ ID NO: 72,
SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 75, SEQ ID NO: 76,
SEQ ID NO: 77, SEQ ID NO: 78, SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80,
SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 83, SEQ ID NO: 84,
SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86, SEQ ID NO: 87, SEQ ID NO: 88,
SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 92,
SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96,
SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 100,
SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 104,
SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 108,
SEQ ID NO: 109, SEQ ID NO: 110, SEQ ID NO: 111, SEQ ID NO: 112,
SEQ ID NO: 113, SEQ ID NO: 114, SEQ ID NO: 115, SEQ ID NO: 116,
SEQ ID NO: 117, SEQ ID NO: 118a SEQ ID NO: 119.
9. Molekula nukleové kyseliny obsahující sekvenci DNA kódující polypeptid agonisty receptorů erythropoietinu podle nároku 4.
10. Způsob výroby polypeptidů agonisty receptorů erythropoietinu zahrnující kultivaci za vhodných nutričních podmínek hostitelské buňky transformované nebo transfektované replikovatelným vektorem obsahujícím tuto molekulu nukleové kyseliny podle nároku 5, 6, 7, 8 nebo 9 způsobem dovolujícím expresi tohoto polypeptidů agonisty receptorů erythropoietinu a získáním tohoto polypeptidů agonisty receptorů erythropoietinu.
11. Kompozice obsahující polypeptid agonisty receptorů erythropoietinu podle nároků 1, 2, 3 nebo 4 a farmaceuticky přijatelný nosič.
103 • ·
0 9 9· 0
00 *
0 0 0 * 9 0*
9 9 9 0·
09 90
9 0 9 9
9 9 9 9
999 99 9
9 9
00 9 9
12. Kompozice obsahující polypeptid agonisty receptoru erythropoietinu podle nároků 1, 2, 3 nebo 4 a faktor a farmaceuticky přijatelný nosič.
13. Kompozice podle nároku 12, kde faktor je vybraný ze skupiny sestávající z GM-CSF, G-CSF, c-mpl ligand, M-CSF, IL-1, IL-4, IL-2, IL-3, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-11, IL-12, IL-13, IL-15, LIF, lidský růstový hormon, růstový faktor B-buněk, faktor diferenciace Bbuněk, faktor diferenciace eosinofilů a faktor kmenových buněk, IL-3 varianty, fuzní proteiny, agonisty receptoru G-CSF, agonisty receptoru c-mpl, agonisty receptoru IL-3, multifunkční agonisty receptoru.
14. Způsob zvýšení tvorby krvetvorných buněk u pacienta vyznačený tím, že zahrnuje krok podávám tomuto pacientovi polypeptid agonisty receptoru erythropoietinu podle nároků 1, 2, 3 nebo 4.
15. Způsob zvýšení tvorby krvetvorných buněk ex vivo vyznačený tím, že zahrnuje kroky:
(a) kultivaci buněk progenitorů červených krvinek v kultivačním mediu obsahujícím polypeptid podle nároků 1,2, 3 nebo 4 a (b) sklizeň těchto kultivovaných buněk.
16. Způsob selektivního zvýšení tvorby krvetvorných buněk ex vivo vyznačený tím, že zahrnuje kroky:
a) oddělení buněk progenitorů červených krvinek od ostatních buněk,
b) kultivaci těchto oddělených buněk progenitorů červených krvinek ve vybraném kultivačním mediu obsahujícím polypeptid podle nároků 1, 2, 3 nebo 4 a
c) sklizeň těchto kultivovaných buněk.
17. Způsob léčení pacienta majícího krvetvornou poruchu vyznačený tím, že zahrnuje kroky:
a) odstranění buněk progenitorů červených krvinek,
104 • « ·· · ·« ·· ··« ··· »··· • * , · · » « ···« « ··»· · · · ···» · ·*ζ ···
b) kultivaci těchto oddělených buněk progenitorů červených krvinek 'vkúltivačním mediu obsahujícím polypeptid podle nároků 1,2,3 nebo 4 a
c) sklizeň těchto kultivovaných buněk,
d) transplantaci těchto kultivovaných buněk tomuto pacientovi.
18. Způsob léčení pacienta majícího krvetvornou poruchu vyznačený tím, že zahrnuje kroky:
a) odstranění buněk progenitorů červených krvinek,
b) oddělení buněk progenitorů červených krvinek od ostatních buněk,
c) kultivaci těchto oddělených buněk progenitorů červených krvinek v kultivačním mediu obsahujícím polypeptid podle nároků 1,2, 3 nebo 4 a
d) sklizeň těchto kultivovaných buněk,
e) transplantaci těchto kultivovaných buněk tomuto pacientovi.
19. Způsob podle nároku 15 vyznačený tím, že tyto buňky progenitorů červených krvinek se izolují z periferní krve.
20. Způsob podle nároku 16 vyznačený tím, že tyto buňky progenitorů červených krvinek se izolují z periferní krve.
21. Způsob podle nároku 17 vyznačený tím, že tyto buňky progenitorů červených krvinek se izolují z periferní krve.
22. Způsob podle nároku 18 vyznačený tím, že tyto buňky progenitorů červených krvinek se izolují z periferní krve.
CZ991301A 1996-10-25 1997-10-23 Cirkulárně permutovaní agonisté receptoru erythropoietinu CZ130199A3 (cs)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US3404496P 1996-10-25 1996-10-25

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ130199A3 true CZ130199A3 (cs) 1999-07-14

Family

ID=21873960

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ991301A CZ130199A3 (cs) 1996-10-25 1997-10-23 Cirkulárně permutovaní agonisté receptoru erythropoietinu

Country Status (13)

Country Link
US (1) US20060172932A1 (cs)
EP (1) EP0939816A1 (cs)
JP (1) JP2001503266A (cs)
KR (1) KR20000052807A (cs)
CN (1) CN1234073A (cs)
AU (1) AU721196B2 (cs)
BR (1) BR9712675A (cs)
CA (1) CA2268001A1 (cs)
CZ (1) CZ130199A3 (cs)
NO (1) NO991906D0 (cs)
NZ (1) NZ334546A (cs)
PL (1) PL189756B1 (cs)
WO (1) WO1998018926A1 (cs)

Families Citing this family (34)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7345019B1 (en) 1999-04-13 2008-03-18 The Kenneth S. Warren Institute, Inc. Modulation of excitable tissue function by peripherally administered erythropoietin
US7410941B1 (en) 1999-04-13 2008-08-12 The Kenneth S. Warren Institute, Inc. Methods for treatment of neurodegenerative conditions by peripherally administered erythropoietin
US6855544B1 (en) 1999-04-15 2005-02-15 Crucell Holland B.V. Recombinant protein production in a human cell
US8236561B2 (en) 1999-04-15 2012-08-07 Crucell Holland B.V. Efficient production of IgA in recombinant mammalian cells
US7297680B2 (en) 1999-04-15 2007-11-20 Crucell Holland B.V. Compositions of erythropoietin isoforms comprising Lewis-X structures and high sialic acid content
US7604960B2 (en) 1999-04-15 2009-10-20 Crucell Holland B.V. Transient protein expression methods
US7521220B2 (en) 1999-11-26 2009-04-21 Crucell Holland B.V. Production of vaccines
US7527961B2 (en) 1999-11-26 2009-05-05 Crucell Holland B.V. Production of vaccines
US7192759B1 (en) 1999-11-26 2007-03-20 Crucell Holland B.V. Production of vaccines
US6531121B2 (en) 2000-12-29 2003-03-11 The Kenneth S. Warren Institute, Inc. Protection and enhancement of erythropoietin-responsive cells, tissues and organs
PA8536201A1 (es) 2000-12-29 2002-08-29 Kenneth S Warren Inst Inc Protección y mejoramiento de células, tejidos y órganos que responden a la eritropoyetina
JP4480398B2 (ja) 2001-12-07 2010-06-16 クルセル ホランド ベー ヴェー ウイルス、ウイルス分離株及びワクチンの製造方法
ATE414144T1 (de) 2003-05-09 2008-11-15 Crucell Holland Bv Kulturen von e1-immortalisierten zellen und verfahren zu deren kultivierung zur erhöhung der produktausbeuten davon
WO2006079155A1 (en) * 2005-01-25 2006-08-03 Apollo Life Sciences Limited Molecules and chimeric molecules thereof
ES2839549T3 (es) 2005-11-23 2021-07-05 Acceleron Pharma Inc Antagonistas de activina-ActRIIa de utilización en la estimulación del crecimiento óseo
US8128933B2 (en) 2005-11-23 2012-03-06 Acceleron Pharma, Inc. Method of promoting bone growth by an anti-activin B antibody
CA2621705A1 (en) * 2005-11-24 2007-05-31 Laboratoires Serono S.A. Erythropoietin polypeptides and uses thereof
US8895016B2 (en) 2006-12-18 2014-11-25 Acceleron Pharma, Inc. Antagonists of activin-actriia and uses for increasing red blood cell levels
MX2009008222A (es) 2007-02-01 2009-10-12 Acceleron Pharma Inc Antagonistas de activina-actriia y usos para tratar o prevenir cancer de mama.
TW201803890A (zh) 2007-02-02 2018-02-01 艾瑟勒朗法瑪公司 衍生自ActRIIB的變體與其用途
BRPI0807506B1 (pt) 2007-02-09 2022-02-15 Acceleron Pharma, Inc Uso de uma proteína de fusão actriia-fc para a fabricação de um medicamento para tratar ou previnir mieloma múltiplo
EP2207562B1 (en) 2007-09-18 2017-05-31 Acceleron Pharma, Inc. Activin-actriia antagonists and uses for decreasing or inhibiting fsh secretion
US8216997B2 (en) 2008-08-14 2012-07-10 Acceleron Pharma, Inc. Methods for increasing red blood cell levels and treating anemia using a combination of GDF traps and erythropoietin receptor activators
PL3494986T3 (pl) 2008-08-14 2020-11-16 Acceleron Pharma Inc. Pułapki GDF
JP5912078B2 (ja) 2009-06-08 2016-04-27 アクセルロン ファーマ, インコーポレイテッド 熱発生性脂肪細胞を増加させるための方法
JP2012529294A (ja) 2009-06-12 2012-11-22 アクセルロン ファーマ, インコーポレイテッド 切断型ActRIIB−Fc融合タンパク質
CA2781152A1 (en) 2009-11-17 2011-05-26 Acceleron Pharma Inc. Actriib proteins and variants and uses therefore relating to utrophin induction for muscular dystrophy therapy
EP2638065A4 (en) 2010-11-08 2014-04-09 Acceleron Pharma Inc ACTRIIA-BINDING SUBSTANCES AND ITS USES
CA2869786A1 (en) 2012-06-08 2013-12-12 Alkermes, Inc. Fusion polypeptides comprising mucin-domain polypeptide linkers
NZ707477A (en) 2012-11-02 2019-09-27 Celgene Corp Activin-actrii antagonists and uses for treating bone and other disorders
TN2016000553A1 (en) 2014-06-13 2018-04-04 Acceleron Pharma Inc Methods and compositions for treating ulcers
MA41052A (fr) 2014-10-09 2017-08-15 Celgene Corp Traitement d'une maladie cardiovasculaire à l'aide de pièges de ligands d'actrii
EP4233889A3 (en) 2014-12-03 2023-10-11 Celgene Corporation Activin-actrii antagonists and uses for treating myelodysplastic syndrome
CN110144010B9 (zh) * 2018-02-14 2021-01-05 上海洛启生物医药技术有限公司 阻断型pd-l1驼源单域抗体及其用途

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4751180A (en) * 1985-03-28 1988-06-14 Chiron Corporation Expression using fused genes providing for protein product
CA2069746A1 (en) * 1990-09-28 1992-03-29 Jonathan I. Rosen Hybrid growth factors
US5738849A (en) * 1992-11-24 1998-04-14 G. D. Searle & Co. Interleukin-3 (IL-3) variant fusion proteins, their recombinant production, and therapeutic compositions comprising them
US5635599A (en) * 1994-04-08 1997-06-03 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Fusion proteins comprising circularly permuted ligands

Also Published As

Publication number Publication date
CN1234073A (zh) 1999-11-03
NZ334546A (en) 2000-12-22
EP0939816A1 (en) 1999-09-08
PL332960A1 (en) 1999-10-25
US20060172932A1 (en) 2006-08-03
KR20000052807A (ko) 2000-08-25
AU5081098A (en) 1998-05-22
JP2001503266A (ja) 2001-03-13
AU721196B2 (en) 2000-06-29
PL189756B1 (pl) 2005-09-30
NO991906L (no) 1999-04-21
CA2268001A1 (en) 1998-05-07
NO991906D0 (no) 1999-04-21
BR9712675A (pt) 1999-10-19
WO1998018926A1 (en) 1998-05-07

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CZ130199A3 (cs) Cirkulárně permutovaní agonisté receptoru erythropoietinu
US5773569A (en) Compounds and peptides that bind to the erythropoietin receptor
KR100459984B1 (ko) 에리트로포이에틴수용체(epo-r)에결합하는화합물및펩티드
US5830851A (en) Methods of administering peptides that bind to the erythropoietin receptor
AU734594B2 (en) Circularly permuted polypeptides as novel stem cell factor receptor agonists
JP4949844B2 (ja) エリスロポエチン受容体に結合する新規ペプチド
NO338435B1 (no) Nye peptider som binder til erytropoietinreseptoren
US6660257B1 (en) Circular permuteins of flt3 ligand
JPH11510062A (ja) 多機能性造血受容体アゴニスト
JP2008519858A (ja) エリスロポエチンレセプターに結合する新規ペプチド
MXPA99003874A (es) Agonistas del receptor de eritropoyetina circularmente permutados
JP2000510684A (ja) インターロイキン−3(il−3)受容体アゴニスト
JP2002515729A (ja) 新規g−csf受容体アゴニスト
JP2001190293A (ja) 組換肝実質細胞増殖因子
HK1021823A1 (en) Truncated glial cell line-derived neurotrophic factor

Legal Events

Date Code Title Description
PD00 Pending as of 2000-06-30 in czech republic