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CN120569477A - 靶向cfb的小干扰rna及其用途 - Google Patents

靶向cfb的小干扰rna及其用途

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CN120569477A
CN120569477A CN202380093389.6A CN202380093389A CN120569477A CN 120569477 A CN120569477 A CN 120569477A CN 202380093389 A CN202380093389 A CN 202380093389A CN 120569477 A CN120569477 A CN 120569477A
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CN
China
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seq
nucleic acid
acid sequence
sequence according
sense strand
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Application number
CN202380093389.6A
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张春阳
耿欣
王师钰
王为民
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Saint Germain Biotech Inc
Original Assignee
Saint Germain Biotech Inc
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Publication date
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Abstract

本公开内容涉及包含靶向人类CFB mRNA的双链体区域的分离的寡核苷酸,和包含其的递送系统、药盒和组合物,以及使用其用于抑制或下调CFB基因表达的方法。

Description

靶向CFB的小干扰RNA及其用途
相关申请
本申请要求2022年12月19日提交的美国临时申请第63/433,735号的优先权和权益,该申请的内容通过引用以其整体并入本文。
电子序列表的引用
电子序列表(SANB_018_001WO_SeqList_ST26.xml;大小:454,399字节;和创建日期:2023年12月15日)的内容通过引用以其整体并入本文。
背景
补体系统是先天免疫系统的一部分,由作为无活性前体存在于血清中的多于一种可溶性蛋白质组成。当激活时,这些补体组分形成导致生物活性效应化合物产生的放大级联。这种级联经由去除受损或死亡的细胞、免疫复合物和细胞碎片在维持细胞完整性和组织稳态中起中心作用。它还在免疫调节、代谢、炎症和宿主针对病原体的防御中起作用。补体系统具有三个激活途径,所有这些途径都围绕C3的蛋白水解裂解,C3是用作下游效应子功能的汇聚点的中心组分。裂解时,补体因子B的活性亚基Bb与C3的补体因子3b组分结合形成旁路途径C3或C5转化酶。补体因子B (CFB)在旁路补体级联功能中的中心作用使其成为用于补体治疗性调节的理想靶点。
普通补体组分的缺陷或功能丧失突变可导致正常补体系统功能的失调和可能的补体组分的过度产生。过量的产生和/或失调与越来越多数目的疾病,例如但不限于2型糖尿病、心血管、神经学、血液学、眼、肾和自身免疫疾病和/或紊乱及感染有关。因此,需要用于患有与补体CFB表达水平升高相关的疾病、紊乱和症状的受试者的疗法。本公开内容提供了靶向CFB的组合物和降低CFB表达以用于治疗患有补体相关疾病、紊乱或症状的受试者的方法。
概述
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中:有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307;和g) 2382至2468,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307;和g) 2382至2468。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d)1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307;和g) 2382至2468。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本相同的核苷酸序列:a) 503至523和b) 2190至2210。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自来自根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:a) 503至523和b)2190至2210。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 503至523和b) 2190至2210。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本上相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1666至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2136;g) 2232至2307和h) 2394至2468。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1666至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2136;g) 2232至2307和h) 2394至2468。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1666至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2136;g) 2232至2307和h) 2394至2468。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本上相同的核苷酸序列:a) 995至1019;b) 1606至1626;c) 1860至1880;和d) 2382至2402。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:a) 995至1019;b) 1606至1626;c) 1860至1880;和d) 2382至2402。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 995至1019;b) 1606至1626;c) 1860至1880;和d) 2382至2402。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,分离的寡核苷酸能够诱导CFB mRNA的降解。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链是单链RNA分子。在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链是单链RNA分子。在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链和反义链两者都是单链RNA分子。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链的单链RNA分子包含3’突出端。在一些实施方案中,在有义链的单链RNA分子中,3’突出端包含至少一个核苷酸。在一些实施方案中,在有义链的单链RNA分子中,3’突出端包含两个核苷酸。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链的单链RNA分子包含3’突出端。在一些实施方案中,在反义链的单链RNA分子中,3’突出端包含至少一个核苷酸。在一些实施方案中,在反义链的单链RNA分子中,3’突出端包含两个核苷酸。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,3’突出端包含胸苷-胸苷(dTdT)、腺嘌呤-腺嘌呤(AA)、胞嘧啶-胞嘧啶(CC)、鸟嘌呤-鸟嘌呤(GG)或尿嘧啶-尿嘧啶(UU)中的任一种。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含长度为至少20个核苷酸的RNA序列。在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含长度为20个核苷酸的RNA序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链包含长度为至少22个核苷酸的RNA序列。在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链包含长度为22个核苷酸的RNA序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,双链区域的长度在19个和21个核苷酸之间。在本公开内容的一些实施方案中,双链区域的长度为20个核苷酸。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,双链区域包含根据表1中的反义链和有义链序列对中的任一个的反义链和有义链,如本文中所描述的。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ ID NO: 2-35。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ ID NO: 36-69。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ ID NO: 2-35;并且有义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ IDNO: 36-69,其中反义链和有义链序列具有足够的互补性以允许在反义链和有义链之间形成双链区域。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307和g) 2382至2468,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50% (例如,50%至55%、55%至60%、60%至65%、65%至70%、70%至75%、75%至80%、80%至85%、85%至90%、90%至95%或95%至99%、99%至100%)。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307和g) 2382至2468,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50% (例如,50%至55%、55%至60%、60%至65%、65%至70%、70%至75%、75%至80%、80%至85%、85%至90%、90%至95%或95%至99%、99%至100%)。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307和g) 2382至2468,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50% (例如,20%至25%、25%至30%、30%至35%、35%至40%、40%至45%或45%至50%)。
本公开内容还提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1815至2313和h) 2378至2417,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1815至2313和h) 2378至2417,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1815至2313和h) 2378至2417,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1815至2313和h) 2378至2417,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1815至2313和h) 2378至2417,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%。
本公开内容还提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链或反义链或两者包含一种或更多种修饰的核苷酸。在一些实施方案中,反义链包含单甲基保护的磷酸模拟物(5’-MeEP)。在一些实施方案中,在有义链或反义链或两者中,末端或内部核苷酸连接至靶向配体。在一些实施方案中,靶向配体包含至少一个GalNAc G1b部分。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸:5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链包含以下任一项:i)根据SEQ ID NO: 370 (5’ [MeEPmUs][fGs][fU][mC][fA][mU][fA][mA][mA][fA][mU][mU][mC][fA][mG][fG][mA][mA][mU][mUs][mCs][mC] 3’)的核酸序列的反义链;ii)根据SEQ ID NO: 371 (5’ [MeEPmUs][fUs][fA][mA][fA][mA][fU][mU][mC][fA][mG][mG][mA][fA][mU][fU][mC][mC][mU][mGs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链;iii)根据SEQID NO: 372 (5’ [MeEPmUs][fGs][fG][mA][fA][mA][fG][mA][mG][fA][mU][mC][mU][fC][mA][fU][mC][mA][mC][mUs][mCs][mA] 3’)的核酸序列的反义链;iv)根据SEQ ID NO:373 (5’ [MeEPmUs][fAs][fA][mU][fU][mC][fA][mG][mG][fA][mA][mU][mU][fC][mC][fU][mG][mC][mU][mUs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链;v)根据SEQ ID NO: 374 (5’[MeEPmUs][fAs][fA][mC][fA][mC][fA][mU][mG][fU][mU][mG][mC][fU][mC][fA][mU][mU][mG][mUs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链;vi)根据SEQ ID NO: 375 (5’[MeEPmUs][fGs][fU][mG][fU][mA][fA][mC][mC][fG][mU][mC][mA][fU][mA][fG][mC][mA][mG][mUs][mGs][mG] 3’)的核酸序列的反义链;vii)根据SEQ ID NO: 376 (5’[MeEPmUs][fAs][fU][mA][fG][mC][fA][mG][mU][fG][mG][mA][mA][fA][mG][fA][mG][mA][mU][mCs][mUs][mC] 3’)的核酸序列的反义链;viii)根据SEQ ID NO: 377 (5’[mUs][fGs][fU][mC][fA][mU][fA][mA][mA][fA][mU][mU][mC][fA][mG][fG][mA][mA][mU][mUs][mCs][mC] 3’)的核酸序列的反义链;ix)根据SEQ ID NO: 378 (5’ [mUs][fUs][fA][mA][fA][mA][fU][mU][mC][fA][mG][mG][mA][fA][mU][fU][mC][mC][mU][mGs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链;或x)根据SEQ ID NO: 379 (5’ [mUs][fGs][fG][mA][fA][mA][fG][mA][mG][fA][mU][mC][mU][fC][mA][fU][mC][mA][mC][mUs][mCs][mA]3’)的核酸序列的反义链,其中“m”是2’-O-甲基修饰的核苷酸,“f”是2’-F修饰的核苷酸,“s”是硫代磷酸酯核苷酸间连接,“MeEP”是单甲基保护的磷酸模拟物。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含以下任一项:i)根据SEQ ID NO: 381 (5’ [mAs][mAs][mU][mU][mC][fC][mU][fG][fA][fA][fU][mU][mU][mU][mA][mU][mG][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;ii)根据SEQ ID NO: 382 (5’ [mCs][mAs][mG][mG][mA][fA][mU][fU][fC][fC][fU][mG][mA][mA][mU][mU][mU][mUs][mAs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;iii)根据SEQ ID NO: 383 (5’ [mAs][mGs][mU][mG][mA][fU][mG][fA][fG][fA][fU][mC][mU][mC][mU][mU][mU][mCs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;iv)根据SEQ ID NO: 384 (5’ [mAs][mAs][mG][mC][mA][fG][mG][fA][fA][fU][fU][mC][mC][mU][mG][mA][mA][mUs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;v)根据SEQ IDNO: 385 (5’ [mAs][mCs][mA][mA][mU][fG][mA][fG][fC][fA][fA][mC][mA][mU][mG][mU][mG][mUs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;vi)根据SEQ ID NO:386 (5’ [mAs][mCs][mU][mG][mC][fU][mA][fU][fG][fA][fC][mG][mG][mU][mU][mA][mC][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;或vii)根据SEQ ID NO:387 (5’ [mGs][mAs][mU][mC][mU][fC][mU][fU][fU][fC][fC][mA][mC][mU][mG][mC][mU][mAs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链,其中“m”是2’-O-甲基修饰的核苷酸,“f”是2’-F修饰的核苷酸,“s”是硫代磷酸酯核苷酸间连接,并且“G1b”是GalNac G1b部分。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,双链区域包含以下任一项:i)根据SEQ ID NO: 370 (5’ [MeEPmUs][fGs][fU][mC][fA][mU][fA][mA][mA][fA][mU][mU][mC][fA][mG][fG][mA][mA][mU][mUs][mCs][mC] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 381 (5’ [mAs][mAs][mU][mU][mC][fC][mU][fG][fA][fA][fU][mU][mU][mU][mA][mU][mG][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;ii)根据SEQ ID NO: 371 (5’ [MeEPmUs][fUs][fA][mA][fA][mA][fU][mU][mC][fA][mG][mG][mA][fA][mU][fU][mC][mC][mU][mGs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ IDNO: 382 (5’ [mCs][mAs][mG][mG][mA][fA][mU][fU][fC][fC][fU][mG][mA][mA][mU][mU][mU][mUs][mAs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;iii)根据SEQ IDNO: 372 (5’ [MeEPmUs][fGs][fG][mA][fA][mA][fG][mA][mG][fA][mU][mC][mU][fC][mA][fU][mC][mA][mC][mUs][mCs][mA] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 383(5’ [mAs][mGs][mU][mG][mA][fU][mG][fA][fG][fA][fU][mC][mU][mC][mU][mU][mU][mCs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;iv)根据SEQ ID NO: 373 (5’[MeEPmUs][fAs][fA][mU][fU][mC][fA][mG][mG][fA][mA][mU][mU][fC][mC][fU][mG][mC][mU][mUs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 384 (5’ [mAs][mAs][mG][mC][mA][fG][mG][fA][fA][fU][fU][mC][mC][mU][mG][mA][mA][mUs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;v)根据SEQ ID NO: 374 (5’ [MeEPmUs][fAs][fA][mC][fA][mC][fA][mU][mG][fU][mU][mG][mC][fU][mC][fA][mU][mU][mG][mUs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 385 (5’ [mAs][mCs][mA][mA][mU][fG][mA][fG][fC][fA][fA][mC][mA][mU][mG][mU][mG][mUs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;vi)根据SEQ ID NO: 375 (5’ [MeEPmUs][fGs][fU][mG][fU][mA][fA][mC][mC][fG][mU][mC][mA][fU][mA][fG][mC][mA][mG][mUs][mGs][mG] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 386 (5’ [mAs][mCs][mU][mG][mC][fU][mA][fU][fG][fA][fC][mG][mG][mU][mU][mA][mC][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b]3’)的核酸序列的有义链;vii)根据SEQ ID NO: 376 (5’ [MeEPmUs][fAs][fU][mA][fG][mC][fA][mG][mU][fG][mG][mA][mA][fA][mG][fA][mG][mA][mU][mCs][mUs][mC] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 387 (5’ [mGs][mAs][mU][mC][mU][fC][mU][fU][fU][fC][fC][mA][mC][mU][mG][mC][mU][mAs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;viii)根据SEQ ID NO: 377 (5’ [mUs][fGs][fU][mC][fA][mU][fA][mA][mA][fA][mU][mU][mC][fA][mG][fG][mA][mA][mU][mUs][mCs][mC] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 381 (5’ [mAs][mAs][mU][mU][mC][fC][mU][fG][fA][fA][fU][mU][mU][mU][mA][mU][mG][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;ix)根据SEQ ID NO: 378 (5’ [mUs][fUs][fA][mA][fA][mA][fU][mU][mC][fA][mG][mG][mA][fA][mU][fU][mC][mC][mU][mGs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO:382 (5’ [mCs][mAs][mG][mG][mA][fA][mU][fU][fC][fC][fU][mG][mA][mA][mU][mU][mU][mUs][mAs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;或x)根据SEQ ID NO:379 (5’ [mUs][fGs][fG][mA][fA][mA][fG][mA][mG][fA][mU][mC][mU][fC][mA][fU][mC][mA][mC][mUs][mCs][mA] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 383 (5’[mAs][mGs][mU][mG][mA][fU][mG][fA][fG][fA][fU][mC][mU][mC][mU][mU][mU][mCs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链。
本公开内容还提供了编码本文公开的分离的寡核苷酸的载体。
本公开内容还提供了包含本文公开的分离的寡核苷酸或载体的递送系统。
本公开内容还提供了药物组合物,所述药物组合物包含本文公开的分离的寡核苷酸、载体或递送系统,和药学上可接受的运载体、稀释剂或赋形剂。
本公开内容还提供了包含本文公开的分离的寡核苷酸、载体、递送系统或药物组合物的药盒。
本公开内容还提供了一种在有相应需要的受试者中抑制或下调CFB的表达或水平的方法,其中该方法包括向受试者施用有效量的本文公开的至少一种分离的寡核苷酸、载体、递送系统或药物组合物。
本公开内容还提供了一种在有相应需要的受试者中治疗或预防与CFB的异常或增加的表达或活性相关的疾病或紊乱或其中CFB起作用的疾病或紊乱的方法,其中该方法包括向受试者施用有效量的本文公开的至少一种分离的寡核苷酸、载体、递送系统或药物组合物。
附图简述
图1是示出表2中列出的siRNA化合物在培养的Huh-7细胞中沉默人类CFB中的功效的图。将化合物以0.02 nM浓度转染到细胞中。数据呈现为当针对Gapdh mRNA水平(平均值,+/- SEM)归一化时剩余的人类CFB mRNA相对于模拟转染的%。每个条代表测试的单一化合物。
图2是示出表2中列出的siRNA化合物在培养的Huh-7细胞中沉默人类CFB中的功效的图。将化合物以0.1 nM浓度转染到细胞中。数据呈现为当针对Gapdh mRNA水平(平均值,+/- SEM)归一化时剩余的人类CFB mRNA相对于模拟转染的%。每个条代表测试的单一化合物。
图3是示出在表2中列出的化合物的子集在以1 mg/kg给药后第4天在小鼠HDI肝中的体内效力的图。数据呈现为当针对NeoR mRNA水平(平均值,+/- SEM)归一化时剩余的人类CFB mRNA相对于PBS的%。
图4是示出在表2中列出的化合物的子集在以0.25 mg/kg、0.5 mg/kg或1 mg/kg给药后第4天在小鼠HDI肝中的体内剂量响应的图。数据呈现为当针对NeoR mRNA水平(平均值,+/- SEM)归一化时剩余的人类CFB mRNA相对于PBS的%。
图5A-图5B是示出在表3中列出的化合物在以3 mg/kg单次皮下(s.c.)给药后在食蟹猴(Macaca fascicularis)中的体内效力评价的图。随时间推移测量肝中剩余的食蟹猴CFB mRNA (图5A)和剩余的血清CFB蛋白质(图5B)。将数据针对每只动物的给药前mRNA或蛋白质水平归一化。
详述
本公开内容提供了形成双链区域的分离的寡核苷酸(oligonucleotides/oligonucleotide(s)),优选地小干扰RNA (siRNA),其可以降低补体CFB mRNA表达,继而导致靶细胞中CFB蛋白质表达的程度降低。本文公开的寡核苷酸可以具有调节CFB表达的治疗应用,用于涉及补体组分相关疾病的疾病的治疗,诸如但不限于阵发性睡眠性血红蛋白尿(PNH)、类风湿性关节炎、缺血再灌注损伤、多发性硬化(MS)、吉兰-巴雷综合征、系统性红斑狼疮、C3肾小球肾炎、非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS)、重症肌无力(MG)、视神经脊髓炎谱系疾病(Neuromyelistis Optic nerve and Spinal Cord,NMOSD)、致密物沉积病(DDD)、年龄相关性黄斑变性(AMD)、IgA肾病、多灶性运动神经病(MMN)、器官移植和神经退行性疾病。
在一些方面中,本发明提供了治疗患有将从补体CFB表达的降低中受益的紊乱的受试者的组合物和方法。在一些方面中,本文公开的方法预防患有将从补体CFB表达的降低中受益的疾病或紊乱的受试者中的至少一种症状。
本公开内容已经鉴定了CFB mRNA内提供用于结合双链寡核苷酸(例如,siRNA)的靶标,导致CFB mRNA的表达水平降低的特定区域。
本文描述的补体因子B (CFB) mRNA序列是由根据GenBank登录号NM_001710.6的CFB基因编码的mRNA序列:
GGGAAGGGAATGTGACCAGGTCTAGGTCTGGAGTTTCAGCTTGGACACTGAGCCAAGCAGACAAGCAAAGCAAGCCAGGACACACCATCCTGCCCCAGGCCCAGCTTCTCTCCTGCCTTCCAACGCCATGGGGAGCAATCTCAGCCCCCAACTCTGCCTGATGCCCTTTATCTTGGGCCTCTTGTCTGGAGGTGTGACCACCACTCCATGGTCTTTGGCCCGGCCCCAGGGATCCTGCTCTCTGGAGGGGGTAGAGATCAAAGGCGGCTCCTTCCGACTTCTCCAAGAGGGCCAGGCACTGGAGTACGTGTGTCCTTCTGGCTTCTACCCGTACCCTGTGCAGACACGTACCTGCAGATCTACGGGGTCCTGGAGCACCCTGAAGACTCAAGACCAAAAGACTGTCAGGAAGGCAGAGTGCAGAGCAATCCACTGTCCAAGACCACACGACTTCGAGAACGGGGAATACTGGCCCCGGTCTCCCTACTACAATGTGAGTGATGAGATCTCTTTCCACTGCTATGACGGTTACACTCTCCGGGGCTCTGCCAATCGCACCTGCCAAGTGAATGGCCGATGGAGTGGGCAGACAGCGATCTGTGACAACGGAGCGGGGTACTGCTCCAACCCGGGCATCCCCATTGGCACAAGGAAGGTGGGCAGCCAGTACCGCCTTGAAGACAGCGTCACCTACCACTGCAGCCGGGGGCTTACCCTGCGTGGCTCCCAGCGGCGAACGTGTCAGGAAGGTGGCTCTTGGAGCGGGACGGAGCCTTCCTGCCAAGACTCCTTCATGTACGACACCCCTCAAGAGGTGGCCGAAGCTTTCCTGTCTTCCCTGACAGAGACCATAGAAGGAGTCGATGCTGAGGATGGGCACGGCCCAGGGGAACAACAGAAGCGGAAGATCGTCCTGGACCCTTCAGGCTCCATGAACATCTACCTGGTGCTAGATGGATCAGACAGCATTGGGGCCAGCAACTTCACAGGAGCCAAAAAGTGTCTAGTCAACTTAATTGAGAAGGTGGCAAGTTATGGTGTGAAGCCAAGATATGGTCTAGTGACATATGCCACATACCCCAAAATTTGGGTCAAAGTGTCTGAAGCAGACAGCAGTAATGCAGACTGGGTCACGAAGCAGCTCAATGAAATCAATTATGAAGACCACAAGTTGAAGTCAGGGACTAACACCAAGAAGGCCCTCCAGGCAGTGTACAGCATGATGAGCTGGCCAGATGACGTCCCTCCTGAAGGCTGGAACCGCACCCGCCATGTCATCATCCTCATGACTGATGGATTGCACAACATGGGCGGGGACCCAATTACTGTCATTGATGAGATCCGGGACTTGCTATACATTGGCAAGGATCGCAAAAACCCAAGGGAGGATTATCTGGATGTCTATGTGTTTGGGGTCGGGCCTTTGGTGAACCAAGTGAACATCAATGCTTTGGCTTCCAAGAAAGACAATGAGCAACATGTGTTCAAAGTCAAGGATATGGAAAACCTGGAAGATGTTTTCTACCAAATGATCGATGAAAGCCAGTCTCTGAGTCTCTGTGGCATGGTTTGGGAACACAGGAAGGGTACCGATTACCACAAGCAACCATGGCAGGCCAAGATCTCAGTCATTCGCCCTTCAAAGGGACACGAGAGCTGTATGGGGGCTGTGGTGTCTGAGTACTTTGTGCTGACAGCAGCACATTGTTTCACTGTGGATGACAAGGAACACTCAATCAAGGTCAGCGTAGGAGGGGAGAAGCGGGACCTGGAGATAGAAGTAGTCCTATTTCACCCCAACTACAACATTAATGGGAAAAAAGAAGCAGGAATTCCTGAATTTTATGACTATGACGTTGCCCTGATCAAGCTCAAGAATAAGCTGAAATATGGCCAGACTATCAGGCCCATTTGTCTCCCCTGCACCGAGGGAACAACTCGAGCTTTGAGGCTTCCTCCAACTACCACTTGCCAGCAACAAAAGGAAGAGCTGCTCCCTGCACAGGATATCAAAGCTCTGTTTGTGTCTGAGGAGGAGAAAAAGCTGACTCGGAAGGAGGTCTACATCAAGAATGGGGATAAGAAAGGCAGCTGTGAGAGAGATGCTCAATATGCCCCAGGCTATGACAAAGTCAAGGACATCTCAGAGGTGGTCACCCCTCGGTTCCTTTGTACTGGAGGAGTGAGTCCCTATGCTGACCCCAATACTTGCAGAGGTGATTCTGGCGGCCCCTTGATAGTTCACAAGAGAAGTCGTTTCATTCAAGTTGGTGTAATCAGCTGGGGAGTAGTGGATGTCTGCAAAAACCAGAAGCGGCAAAAGCAGGTACCTGCTCACGCCCGAGACTTTCACATCAACCTCTTTCAAGTGCTGCCCTGGCTGAAGGAGAAACTCCAAGATGAGGATTTGGGTTTTCTATAAGGGGTTTCCTGCTGGACAGGGGCGTGGGATTGAATTAAAACAGCTGCGACAACA (SEQ ID NO: 1)。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c)1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307;和g) 2382至2468,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307;和g) 2382至2468。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d)1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307;和g) 2382至2468。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本相同的核苷酸序列:a) 503至523和b) 2190至2210。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自来自根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:a) 503至523和b)2190至2210。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 503至523和b) 2190至2210。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本上相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1666至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2136;g) 2232至2307和h) 2394至2468。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1666至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2136;g) 2232至2307和h)2394至2468。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1666至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2136;g) 2232至2307和h) 2394至2468。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本上相同的序列:a) 995至1019;b) 1606至1626;c) 1860至1880和d) 2382至2402。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的序列:a) 995至1019;b) 1606至1626;c) 1860至1880和d) 2382至2402。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的序列:a) 995至1019;b) 1606至1626;c) 1860至1880和d) 2382至2402。
如本文描述的根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列是允许与本公开内容的寡核苷酸的反义链结合的与如本文描述的根据登录号NM_001710.6的CFB具有足够同一性的任何异源mRNA序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,分离的寡核苷酸能够诱导CFB mRNA的降解。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链是单链RNA分子。在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链是单链RNA分子。在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链和反义链两者都是单链RNA分子。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸是小干扰RNA (siRNA)。因此,本公开内容提供了siRNA,其中siRNA包含有义区和与有义区互补的反义区,它们一起形成RNA双链体,并且其中有义区包含与CFB mRNA序列至少70%至100%相同的序列。
定义
“RNAi”或“RNA干扰”是指由双链RNA (dsRNA)介导的序列特异性转录后基因沉默的过程。双链体RNA siRNA (小干扰RNA)、miRNA (微RNA)、shRNA (短发夹RNA)、ddRNA(DNA-定向RNA,DNA-directed RNA)、piRNA (Piwi相互作用RNA)或rasiRNA (重复相关siRNA)及其修饰形式都能够介导RNA干扰。这些dsRNA分子可以是商购可得的,或者可以基于已知的序列信息等设计和制备。这些分子的反义链可以包括RNA、DNA、PNA或其组合。这些DNA/RNA嵌合体多核苷酸包括但不限于抑制靶基因表达的由DNA和RNA组成的双链多核苷酸。这些dsRNA分子还可以包括可以掺入任一链上的如本文描述的一个或更多个修饰的核苷酸。
在RNAi基因沉默或敲低过程中,将包含与靶基因的一部分互补的第一(反义)链和与第一反义链完全或部分互补的第二(有义)链的dsRNA引入生物体中。在引入生物体中之后,靶基因特异性dsRNA被加工成相对小的片段(siRNA),并且随后可以变得分布在整个生物体中,减少靶基因的信使RNA,导致表型可能接近类似于由靶基因的完全或部分缺失引起的表型。
细胞中的某些dsRNA可以经历Dicer酶(核糖核酸酶III酶)的作用。Dicer可以将dsRNA加工成较短的dsRNA片段,即siRNA。RNAi还涉及称为RNA诱导的沉默复合物(RISC)的核酸内切酶复合物。在被Dicer裂解后,siRNA进入RISC复合物并指导具有与siRNA双链体的反义链互补的序列的单链RNA靶标的裂解。siRNA的另一条链是过客链。靶标RNA的裂解发生在与siRNA双链体的反义链互补的区域的中间。因此,siRNA可以通过以序列特异性方式介导RNA干扰来下调或敲低基因表达。
如本文使用的,“靶基因”或“靶序列”是指其对应的RNA被靶向用于使用本文描述的dsRNA或siRNA通过RNAi途径降解的基因或基因序列。为了靶向基因,例如使用siRNA靶向基因,siRNA包含与靶基因或序列的至少一部分互补或基本互补的反义区和与反义链互补的有义链。在引入细胞中后,siRNA指导RISC复合物裂解包含靶序列的RNA,从而降解RNA。
如本文使用的,“寡核苷酸”、“核酸”、“核苷酸序列”和“多核苷酸”可互换地使用,并且涵盖RNA和DNA两者,包括cDNA、基因组DNA、mRNA、合成(例如,化学合成的) DNA或RNA以及RNA和DNA的嵌合体。术语多核苷酸、核苷酸序列或核酸是指核苷酸的链,而不考虑链的长度。核酸可以是双链的或单链的。其中单链的核酸可以是有义链或反义链。可以使用寡核苷酸类似物或衍生物(例如,肌苷或硫代磷酸酯核苷酸)合成核酸。此类寡核苷酸可用于,例如,制备具有改变的碱基配对能力或对核酸酶增加的抗性的核酸。本公开内容还提供了为本公开内容的核酸、核苷酸序列或多核苷酸的互补物(其可以是完全互补物或部分互补物)的核酸。当合成产生dsRNA时,不太常见的碱基诸如肌苷、5-甲基胞嘧啶、6-甲基腺嘌呤、次黄嘌呤和其他碱基也可用于反义、dsRNA和核酶配对。也可以进行其它修饰,诸如对磷酸二酯主链的修饰或RNA的核糖基团中的2’-氟、2’-羟基或2’O-甲基。
术语“分离的”可以指基本上不含细胞物质、病毒物质和/或培养基(当通过重组DNA技术产生时)、或化学前体或其他化学物质(当化学合成时)的核酸、核苷酸序列或多肽。此外,“分离的片段”是核酸、核苷酸序列或多肽的不作为片段天然存在并且在天然状态下不会被发现的片段。“分离的”不是指制剂在技术上是纯的(均质的),而是指它足够纯来以可用于预期目的的形式提供多肽或核酸。
术语“区域”或“片段”可互换地使用并且应用于寡核苷酸。
如本文描述,CFB mRNA序列将理解为意指相对于CFB mRNA序列的参考核酸或核苷酸序列长度减小,并且包括、主要由、和/或由与参考核酸或核苷酸序列相同或几乎相同(例如,60%、70%、80%、90%、92%、95%、98%或99%相同)的连续核苷酸组成的核苷酸序列。在适当的情况下,根据本公开内容的这样的核酸片段可以包括在其为组分的更大的多核苷酸中。在一些实施方案中,这样的片段可以包括、主要由、和/或由具有根据本公开内容的核酸或核苷酸序列的至少约8个、10个、12个、15个、20个、25个、30个、35个、40个、45个、50个、75个、100个、150个、200个或更多个连续核苷酸的长度的寡核苷酸组成。
如本文使用的,“互补的”多核苷酸是能够根据标准Watson-Crick互补性规则进行碱基配对的那些。具体地,嘌呤将与嘧啶碱基配对以形成鸟嘌呤与胞嘧啶(G:C)配对和腺嘌呤与胸腺嘧啶(A:T)配对(在DNA的情况下)或腺嘌呤与尿嘧啶(A:U)配对(在RNA的情况下)的组合。例如,序列“A-G-T”与互补序列“T-C-A”结合。应理解的是,即使两个多核苷酸彼此不完全互补,它们也可以彼此杂交,前提是它们各自具有至少一个基本上与另一个互补的区域。
如本文使用的,术语“基本上互补”是与有义链至少90% (例如,91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%)互补,即与SEQ ID NO: 1中限定区域内的核苷酸序列基本上相同。如本文使用的,术语“基本上互补”意指两个核酸序列在它们的核苷酸的至少约90%、95%或99%处互补。
在一些实施方案中,两个核酸序列可以在它们的核苷酸的至少90%、95%、96%、97%、98%、99%或更多处互补。在一些实施方案中,两个核酸序列可以是90%至95%之间互补、70%至100%之间互补、95%和96%之间互补、90%和100%之间互补、96%至97%之间互补、60%至80%之间互补、97%和98%之间互补、70%和90%之间互补、98%和99%之间互补、80%和100%之间互补或99%和100%之间互补。
术语“基本上互补”还可以意指有义链和反义链两个核酸序列具有允许有义链和反义链之间结合以形成由长度为19-25个核苷酸之间组成的双链区域的足够的互补性。术语“基本上互补”还可以意指两个核酸序列可以在高严格条件下杂交,并且这样的条件是本领域熟知的。
如本文使用的,术语“基本上相同”或“足够的同一性”在本文中可互换地使用,是与SEQ ID NO: 1中限定区域内的核苷酸序列至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99% (例如,在70%至80%、85%至90%或90%至95%或95%至99%或99%至100%之间)相同。
如本文使用的,术语“同一性”意指如下将序列与彼此比较。为了确定两个核酸序列的同一性百分比,可以首先将序列相对于彼此对齐,以便随后使这些序列的比较成为可能。为此,例如,可以将空位插入第一核酸序列的序列中,并且可以将核苷酸与第二核酸序列的对应位置进行比较。如果第一核酸序列中的位置被与第二序列中的位置处相同的核苷酸占据,则这两个序列在该位置处是相同的。两个序列之间的同一性百分比是相同位置的数目除以所研究的序列中比较的所有位置的数目的函数。
对于测试序列和参考序列的比对区段,如本文可互换地使用的“同一性百分比”或“%同一性”是由两个比对序列共有的相同组分除以参考序列区段(即,整个参考序列或参考序列的较小限定部分)中组分的总数的百分比。
两个序列的同一性百分比可以借助于数学算法来确定。可用于两个序列的比较的数学算法的优选但非限制性实例是Karlin等人(1993), PNAS USA, 90:5873-5877的算法。这样的算法被整合到NBLAST程序中,利用该程序可以鉴定与本公开内容的序列具有期望同一性的序列。为了获得有空位的比对,如此处描述,可以使用“Gapped BLAST”程序,如Altschul等人(1997), Nucleic Acids Res, 25:3389-3402中所描述。如果使用BLAST和Gapped BLAST程序,则可以使用特定程序(例如NBLAST)的预设参数。可以使用“GeneticComputing Group”的GAP (全局比对程序)的版本9进一步比对序列,使用预设(BLOSUM62)矩阵(值-4至+11),其中空位开启罚分为-12 (对于空位的第一个零),并且空位延伸罚分为-4 (对于空位中每个另外的连续的零)。在比对之后,通过将一致性数表达为所要求保护的序列中核酸的百分比含量来计算同一性百分比。如有必要,描述的用于确定两个核酸序列的同一性百分比的方法也可以对应地用于编码的氨基酸序列上。
用于确定序列同一性的有用方法也公开于Guide to Huge Computers (MartinJ. Bishop, ed., Academic Press, San Diego (1994)),和Carillo, H.和Lipton, D.,(Applied Math48:1073(1988))中。更具体地,用于确定序列同一性的优选计算机程序包括但不限于基本局部比对搜索工具(BLAST)程序,该程序可从位于Bethesda, Md. 20894的美国国立卫生研究院,美国国家医学图书馆的美国国家生物技术信息中心(NCBI)公开可得;参见BLAST Manual, Altschul等人,NCBI, NLM, NIH; (Altschul等人,J. Mol. Biol.215:403-410 (1990));2.0版本或更高版本的BLAST程序允许在比对中引入空位(缺失和插入);对于肽序列,可以使用BLASTX来确定序列同一性;并且,对于多核苷酸序列,可以使用BLASTN来确定序列同一性。同一性百分比可以是70%同一性或更高,例如,至少70%同一性、至少75%同一性、至少80%同一性、至少85%同一性、至少90%同一性、至少95%同一性、至少98%同一性、至少99%同一性或100%同一性。
如本文使用的,“异源的”是指源自另一物种或来自相同物种或生物体但由其原始形式或主要在细胞中表达的形式修饰的核酸序列。因此,衍生自不同于引入核苷酸序列的细胞的生物体或物种的核苷酸序列相对于该细胞和该细胞的后代是异源的。另外,异源核苷酸序列包括衍生自相同天然原始细胞类型并插入相同天然原始细胞类型中,但其以非天然状态存在,例如,不同的拷贝数,和/或处于与自然界中发现的不同的调节序列的控制下的核苷酸序列。
靶向人类补体因子B (CFB)的双链RNA
本公开内容提供了分离的寡核苷酸,其包含靶向CFB mRNA序列以进行降解的双链RNA (dsRNA)双链体区域。本公开内容的双链RNA分子可以是本领域已知的任何类型的RNA干扰分子的形式。在一些实施方案中,双链RNA分子是小干扰RNA (siRNA)。在其他实施方案中,双链RNA分子是短发夹RNA (shRNA)分子。在其他实施方案中,双链RNA分子是在细胞中加工以产生siRNA的Dicer底物。在其他实施方案中,双链RNA分子是微RNA前体分子的一部分。
在一些实施方案中,dsRNA是靶向CFB mRNA序列以进行降解的小干扰RNA(siRNA)。在一些实施方案中,靶向CFB的siRNA被包装在本文描述的递送系统(例如,纳米颗粒)中。
本公开内容的靶向CFB以进行降解的分离的寡核苷酸可以包含与CFB mRNA的任何片段(例如SEQ ID NO: 1的CFB mRNA)至少70%相同的有义链。在一些实施方案中,有义链包含或主要由与SEQ ID NO: 1的任何片段至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或100%相同的序列组成。靶向CFB进行降解的siRNA可以包含与互补于CFB mRNA的任何片段(例如SEQ IDNO: 1的CFB mRNA)的序列至少70%相同的反义链。在一些实施方案中,反义链包含与互补于SEQ ID NO: 1的任何片段的序列至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或100%相同的序列或主要由其组成。在一些实施方案中,有义区和反义区互补,并且碱基配对以形成RNA双链体结构。与siRNA的有义区具有同一性百分比并且与siRNA的反义区互补的CFB mRNA的片段可以是mRNA的蛋白质编码序列、mRNA的非翻译区(UTR) (5’UTR或3’UTR)或两者。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸包含有义区和与有义区互补的反义区,它们一起形成RNA双链体,并且有义区包含与CFB mRNA序列至少70%相同的序列。在一些实施方案中,有义区与CFB mRNA序列相同。
如本文使用的,术语“有义链”或“有义区”是指与siRNA分子的对应反义链或反义区的至少一部分部分或完全互补的siRNA分子的核苷酸序列。本公开内容分子的分离的寡核苷酸的有义链可以包括与靶核酸序列诸如CFB mRNA序列具有一定同一性百分比的核酸序列。在一些情况下,有义区可与靶核酸序列具有100%同一性,即,完全同一性或同源性。在其他情况下,有义区和靶核酸序列之间可以存在一个或更多个错配。例如,在有义区和靶核酸序列之间可以存在1个、2个、3个、4个、5个、6个或7个错配。
如本文使用的,术语“反义链”或“反义区”是指本公开内容的分离的寡核苷酸中与靶核酸序列的至少一部分部分或完全互补的核苷酸序列。本公开内容分子的分离的寡核苷酸的反义链可以包括与分离的寡核苷酸的对应有义链的至少一部分互补的核酸序列。
在一些实施方案中,有义区包含与如本文公开的SEQ ID NO: 1的序列或SEQ IDNO:1的区域至少70%相同、至少75%相同、至少80%相同、至少85%相同、至少90%相同、至少95%相同、至少97%相同、至少99%相同或100%相同的序列。在一些实施方案中,有义区主要由与如本文公开的SEQ ID NO: 1的序列或SEQ ID NO:1的区域至少70%相同、至少75%相同、至少80%相同、至少85%相同、至少90%相同、至少95%相同、至少97%相同、至少99%相同或100%相同的序列组成。在一些实施方案中,有义区包含与如本文公开的SEQ ID NO: 1的序列或SEQID NO: 1的区域相同的序列。在一些实施方案中,有义区主要由与如本文公开的SEQ IDNO: 1的序列或SEQ ID NO: 1的区域相同的序列组成。
在一些实施方案中,本公开内容的靶向CFB的分离的寡核苷酸的有义区在分离的寡核苷酸的序列和CFB序列之间具有一个或更多个错配。例如,有义区的序列在分离的寡核苷酸的有义区的序列和CFB序列之间可以具有1个、2个、3个、4个或5个错配。在一些实施方案中,CFB序列是CFB 3’非翻译区序列(3’ UTR)。不希望受理论束缚,认为当与靶向基因编码区的分离的寡核苷酸中的错配相比时,靶向3’ UTR的siRNA具有升高的错配耐受性。此外,分离的寡核苷酸RNA可以耐受种子区外的错配。如本文使用的,分离的寡核苷酸的“种子区”是指分离的寡核苷酸的反义区的碱基对2-8,即,分离的寡核苷酸的与靶mRNA互补并杂交的链。
在一些实施方案中,反义区包含与互补于如本文公开的SEQ ID NO: 1的序列或SEQ ID NO: 1的区域的序列至少70%相同、至少75%相同、至少80%相同、至少85%相同、至少90%相同、至少95%相同、至少97%相同、至少99%相同或100%相同的序列。在一些实施方案中,反义区主要由与互补于SEQ ID NO: 1的序列或SEQ ID NO: 1的区域互补的序列至少70%相同、至少75%相同、至少80%相同、至少85%相同、至少90%相同、至少95%相同、至少97%相同、至少99%或100%相同的序列组成。在一些实施方案中,反义区包含与互补于SEQ ID NO: 1的序列或SEQ ID NO: 1的区域互补的序列相同的序列。在一些实施方案中,有义区主要由与SEQID NO: 1的序列或SEQ ID NO: 1的区域互补的序列组成。
本公开内容的靶向CFB的分离的寡核苷酸的反义区与有义区互补。在一些实施方案中,有义区和反义区是完全互补的(无错配)。在一些实施方案中,反义区与有义区部分互补,即,有义区与反义区之间存在1个、2个、3个、4个或5个错配。
通常,本公开内容的分离的寡核苷酸包含长度为约16个至约25个核苷酸的RNA双链体。在一些实施方案中,RNA双链体的长度在约17个和约24个核苷酸之间、长度在约18个和约23个核苷酸之间或长度在约19个和约22个核苷酸之间。在一些实施方案中,RNA双链体的长度为19个核苷酸。在一些实施方案中,RNA双链体的长度为20个核苷酸。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链是单链RNA分子。在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链是单链RNA分子。在一些实施方案中,有义链和反义链两者都是单链RNA分子。在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸是靶向CFB的siRNA,其包含两条不同的单链RNA,第一条包含有义区,并且第二条包含反义区,它们杂交以形成RNA双链体。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸可以具有来自双链体区域的一个或更多个突出端。在一些实施方案中,突出端(其是非碱基配对的单链区域)长度可为从1个至8个核苷酸或更长。在一些实施方案中,突出端可以是3’突出端,其中链的3’末端具有从1个至8个核苷酸的单链区域。在一些实施方案中,突出端可以是5’突出端,其中链的5’末端具有从1个至8个核苷酸的单链区域。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的突出端是相同长度。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的突出端是不同长度。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链的单链RNA分子包含3’突出端。在一些实施方案中,有义链的单链RNA分子的3’突出端包含至少一个核苷酸。在一些实施方案中,有义链的单链RNA分子的3’突出端包含两个核苷酸。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链的单链RNA分子包含3’突出端。在一些实施方案中,反义链的单链RNA分子的3’突出端包含至少一个核苷酸。在一些实施方案中,反义链的单链RNA分子的3’突出端包含两个核苷酸。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,分离的寡核苷酸的两个末端都具有突出端,例如,在每个末端上具有3’二核苷酸突出端。在一些实施方案中,5’末端和3’末端处的突出端是不同长度。在一些实施方案中,5’末端和3’末端处的突出端是相同长度。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,突出端可以包含一个或更多个脱氧核糖核苷酸、一个或更多个核糖核苷酸或脱氧核糖核苷酸和核糖核苷酸的组合。在一些实施方案中,siRNA的一个或两个突出端核苷酸可以是2’-脱氧核糖核苷酸。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,第一单链RNA分子包含第一3’突出端。在一些实施方案中,第二单链RNA分子包含第二3’突出端。在一些实施方案中,第一3’突出端和第二3’突出端包含二核苷酸。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,3’突出端包含胸苷-胸苷(dTdT)、腺嘌呤-腺嘌呤(AA)、胞嘧啶-胞嘧啶(CC)、鸟嘌呤-鸟嘌呤(GG)或尿嘧啶-尿嘧啶(UU)中的任一种。在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,3’突出端包含胸苷-胸苷(dTdT)或尿嘧啶-尿嘧啶(UU)突出端。在一些实施方案中,3’突出端包含尿嘧啶-尿嘧啶(UU)突出端。不希望受理论束缚,认为3’突出端(诸如二核苷酸突出端)通过增强siRNA-RISC复合物形成和/或增强通过siRNA-RISC复合物裂解靶mRNA的速率来增强siRNA介导的mRNA降解。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸可以具有一个或更多个平末端,其中双链体区域末端没有突出端,并且链与双链体区域末端碱基配对。在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸可具有一个或更多个平末端,或可具有一个或更多个突出端,或可具有平末端和突出端末端的组合。例如,siRNA的5’末端可以是平的,并且相同分离的寡核苷酸的3’末端包含突出端,或反之亦然。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸的两端均为平末端。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,双链区域包含根据表1中的反义链和有义链序列对中的任一个的反义链和有义链,如下所述。
补体系统
补体系统是先天免疫系统的关键组分,并且包含一组通常以非活性状态存在的蛋白质。这些蛋白质被组织成三种激活途径:经典途径、凝集素途径和旁路途径。
来自微生物、抗体或细胞组分的分子可以激活这些途径,导致形成称为C3转化酶和C5转化酶的蛋白酶复合物。第一种酶促活化的级联,称为经典途径,是钙/镁依赖性级联,其通常通过抗原-抗体复合物的形成而活化。它也可以通过与配体复合的C反应蛋白的结合以及通过包括革兰氏阴性细菌的许多病原体以抗体非依赖性方式活化。
如US 8,703,136中所描述的,经典途径包含几种组分,C1、C4、C2、C3和C5 (按在途径中的顺序列出)。补体系统的经典途径的起始发生在第一补体组分(C1)被免疫激活剂和非免疫激活剂两者结合和活化之后。C1包含组分C1q、C1r和C1s的钙依赖性复合物,并且通过C1q组分的结合而活化。C1q含有六个相同的亚基,并且每个亚基包含三条链(A链、B链和C链)。每条链具有一个连接到胶原样尾部的球状头部区域。抗原-抗体复合物对C1q的结合和活化通过C1q头部基团区域发生。许多非抗体C1q激活剂,包括蛋白质、脂质和核酸,通过胶原样茎区上的独特位点结合并激活C1q。然后,C1qrs复合物催化补体组分C4和C2的活化,形成C4b2a复合物,其起到C3转化酶的作用。
第二种酶促活化的级联,称为旁路途径,是补体系统活化和扩增的快速、抗体非依赖性途径(route)。旁路途径是镁依赖性级联,其通过C3在某些易感表面(例如,酵母和细菌的细胞壁多糖和某些生物聚合物材料)上的沉积和活化而被激活。旁路途径包括若干组分,其包括:C3、补体因子B (CFB)和因子D (按在途径中的顺序列出)。当C3b (C3的蛋白水解裂解和活性形式)与活化表面剂(activating surface agent)诸如细菌结合时,发生旁路途径的活化。然后CFB与C3b结合并被因子D裂解以产生活性酶Bb。所得补体复合物C3bBb是旁路途径C3转化酶。酶C3b-Bb裂解C3以产生C3b,从而在活化表面上产生C3b-Bb复合物的广泛的沉积。
因此,经典补体途径和旁路补体途径两者都产生将因子C3分成C3a和C3b的C3转化酶。此时,两种C3转化酶都还组装成C5转化酶(C4b2a3b和C3b3bBb)。这些复合物随后将补体组分C5裂解成两种组分:C5a多肽(9 kDa)和C5b多肽(170 kDa)。C5a多肽结合至7跨膜G蛋白偶联受体,其最初与白细胞相关,并且现在已知在包括肝细胞和神经元的多种组织上表达。C5a分子是人类补体系统的主要趋化组分,并且可触发多种生物学反应,包括白细胞趋化性、平滑肌收缩、细胞内信号转导途径的激活、中性粒细胞-内皮黏附、细胞因子和脂质介质释放以及氧化剂形成。
较大的C5b片段顺序地与补体级联的稍后组分C6、C7、C8和C9结合以形成C5b-9膜攻击复合物(“MAC”)。亲脂的C5b-9 MAC可以直接裂解红细胞,并且在更大量的情况中,它裂解白细胞并损害诸如肌肉、上皮和内皮细胞的组织。在亚裂解性的量中,C5b-9 MAC可以刺激黏附分子的上调、细胞内钙增加和细胞因子释放。另外,在亚裂解性的浓度,C5b-9 MAC可以刺激诸如内皮细胞和血小板的细胞,而不会引起细胞裂解。C5a和C5b-9 MAC的非裂解性效应是相当的且可互换的。
当模式识别分子(MBL、CL-K1和纤胶凝蛋白)与病原体表面上的所谓病原体相关分子模式(PAMP) (D-甘露糖、N-乙酰基-D-葡糖胺或乙酰基基团)或与凋亡或坏死细胞结合时,凝集素途径启动(Beltrame等人, 2015)。
尽管补体系统在健康的维持中具有重要作用,但它具有导致或促进疾病的潜力。
补体靶向药物被美国食品和药品管理局(FDA)和欧洲药品管理局批准用于常规临床用途的疾病有四种(Garred等人, 2021)。在2007年示出阻断C5裂解的mAb依库珠单抗(Soliris)在防止PNH中的溶血中非常有效(Brodsky等人, 2008; Parker, 2009),并且这随后是非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS)的治疗(Tschumi等人, 2011; Loirat等人,2016)。最近,它还被批准用于神经系统疾病全身型重症肌无力(Dhillon, 2018)和视神经脊髓炎谱系紊乱(Selmaj和Selmaj, 2019)。
依库珠单抗一直是唯一被批准用于常规使用的补体抑制剂,直到最近当引入雷夫利珠单抗(Ultomiris)和Zilucoplan时。雷夫利珠单抗是依库珠单抗的第二代;换句话说,在依库珠单抗分子中进行了一些微小的氨基酸修饰,从而显著地增加了半衰期,因此治疗间隔可以从每2周一次增加到每8周一次。它与依库珠单抗具有相同的C5结合位点(即,阻断C5的裂解,并从而防止C5a的释放和C5b-9的形成) (Kulasekararaj等人, 2019; Lee等人,2019; McKeage, 2019; Stern和Connell, 2019; Lee和Kulasekararaj, 2020)。
Zilucoplan是一种结构上与上述抗体完全不同但具有相同主要功能的药物。它是一种用于皮下自我施用的合成大环肽抑制剂,与依库珠单抗具有主要相同的功能,阻断C5的裂解(Beecher等人, 2019; Albazli等人, 2020; Howard等人, 2020)。一项2期随机、双盲、安慰剂对照、多中心临床试验证实,在广泛的患有中度至重度乙酰胆碱受体抗体阳性全身型重症肌无力患者群体中,Zilucoplan施用在12周内产生了快速、有意义和持续的改善(Howard等人,2020)。Zilucoplan (RA101495)的一种密切类似物RA 101295已用于动物研究中,并已示出增加狒狒大肠杆菌败血症中的存活(Keshari等人, 2017)。
因此,本公开内容中公开的分离的寡核苷酸可用于治疗或预防与CFB的异常或增加的表达或活性相关的疾病或紊乱或其中CFB起作用的疾病或紊乱。本公开内容的示例性分离的寡核苷酸描述于表1中。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含选自表1、表2或表3中列出的有义链/过客链序列的组中的任一个的序列。在一些实施方案中,反义链包含选自表1、表2或表3中列出的反义链/引导链序列的组中的任一个的序列。在一些实施方案中,有义区和反义区包含选自表1、表2和表3中列出的组的互补序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ ID NO: 2-35。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ ID NO: 36-69。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ ID NO: 2-35;并且有义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ IDNO: 36-69,其中反义链和有义链序列具有足够的互补性以允许在反义链和有义链之间形成双链区域。
本公开内容的序列
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307和g) 2382至2468,并且反义链与有义链基本上互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307和g) 2382至2468。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c)1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307和g) 2382至2468。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本相同的核苷酸序列:a) 503至523和b) 2190至2210。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:a) 503至523和b) 2190至2210。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 503至523和b) 2190至2210。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 503至523和b) 2190至2210,双链区域包含:i)根据SEQ ID NO:5 (5’ UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;或ii)根据SEQ ID NO: 28 (5’UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本相同的序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1666至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2136;g) 2232至2307和h) 2394至2468。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的序列:a) 493至534;b)991至1054;c) 1384至1500;d) 1666至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2136;g) 2232至2307和h) 2394至2468。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1666至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2136;g) 2232至2307和h) 2394至2468。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1666至1686;e)1821至1881;f) 2116至2136;g) 2232至2307和h) 2394至2468,双链区域包含:i)根据SEQID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 36(5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;ii)根据SEQ ID NO: 3 (5’UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;iii)根据SEQ ID NO: 4 (5’UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38 (5’AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;iv)根据SEQ ID NO: 6 (5’UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 389 (5’ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;v)根据SEQ ID NO: 7 (5’UUUGACUAGACACUUUUUGGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 41 (5’CCAAAAAGUGUCUAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;vi)根据SEQ ID NO: 9 (5’UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;vii)根据SEQ ID NO: 11 (5’UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;viii)根据SEQ ID NO: 12 (5’UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;ix)根据SEQ ID NO: 13 (5’UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;x)根据SEQ ID NO: 14 (5’UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xi)根据SEQ ID NO: 15 (5’UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;xii)根据SEQ ID NO: 16 (5’UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xiii)根据SEQ ID NO: 17 (5’UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xiv)根据SEQ ID NO: 19 (5’UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;xv)根据SEQ ID NO: 20 (5’UAUUCAGGAAUUCCUGCUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 54 (5’GAAGCAGGAAUUCCUGAAUA 3’)的核酸序列的有义链;xvi)根据SEQ ID NO: 21 (5’UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;xvii)根据SEQ ID NO: 22 (5’UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;xviii)根据SEQ ID NO: 23 (5’UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xix)根据SEQ ID NO: 24 (5’UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;xx)根据SEQ ID NO: 26 (5’UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxi)根据SEQ ID NO: 27 (5’UUUGACUUUGUCAUAGCCUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 61 (5’CAGGCUAUGACAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxii)根据SEQ ID NO: 29 (5’UUUCUCUUGUGAACUAUCAAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 63 (5’UUGAUAGUUCACAAGAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxiii)根据SEQ ID NO: 30 (5’UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxiv)根据SEQ ID NO: 31 (5’UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxv)根据SEQ ID NO: 33 (5’UAACCCAAAUCCUCAUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 67 (5’CAAGAUGAGGAUUUGGGUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxvi)根据SEQ ID NO: 34 (5’UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;或xxvii)根据SEQ ID NO: 35 (5’UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本相同的序列:a) 995至1019;b) 1606至1626;c) 1860至1880和d) 2382至2402。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的序列:a) 995至1019;b)1606至1626;c) 1860至1880和d) 2382至2402。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 995至1019;b) 1606至1626;c) 1860至1880和d) 2382至2402。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的序列:a) 995至1019;b) 1606至1626;c) 1860至1880和d) 2382至2402,并且双链区域包括:i)根据SEQ ID NO: 8 (5’ UUAAGUUGACUAGACACUUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 42 (5’ AAAGUGUCUAGUCAACUUAA 3’)的核酸序列的有义链;ii)根据SEQ IDNO: 10 (5’ UCAAUUAAGUUGACUAGACACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 44(5’ UGUCUAGUCAACUUAAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;iii)根据SEQ ID NO: 18 (5’UGAGAUCUUGGCCUGCCAUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 52 (5’CAUGGCAGGCCAAGAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;iv)根据SEQ ID NO: 25 (5’UUAUUCUUGAGCUUGAUCAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 59 (5’CUGAUCAAGCUCAAGAAUAA 3’)的核酸序列的有义链;或v)根据SEQ ID NO: 32 (5’UCAUCUUGGAGUUUCUCCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 66 (5’AAGGAGAAACUCCAAGAUGA 3’)的核酸序列的有义链。
以0.1 nM使CFB敲低至少50%
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307和g) 2382至2468,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,其中分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50% (例如,50%至55%、55%至60%、60%至65%、65%至70%、70%至75%、75%至80%、80%至85%、85%至90%、90%至95%或95%至99%、99%至100%)。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307和g) 2382至2468,并且反义链与有义链基本上互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.1nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%,其中双链区域包括:i)根据SEQ ID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 36 (5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;ii)根据SEQ ID NO: 3 (5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’ AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;iii)根据SEQ IDNO: 4 (5’ UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38(5’ AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;iv)根据SEQ ID NO: 6 (5’UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 389 (5’ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;v)根据SEQ ID NO: 7 (5’UUUGACUAGACACUUUUUGGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 41 (5’CCAAAAAGUGUCUAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;vi)根据SEQ ID NO: 9 (5’UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;vii)根据SEQ ID NO: 11 (5’UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;viii)根据SEQ ID NO: 12 (5’UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;ix)根据SEQ ID NO: 13 (5’UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;x)根据SEQ ID NO: 14 (5’UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xi)根据SEQ ID NO: 15 (5’UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;xii)根据SEQ ID NO: 16 (5’UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xiii)根据SEQ ID NO: 17 (5’UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xiv)根据SEQ ID NO: 19 (5’UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;xv)根据SEQ ID NO: 20 (5’UAUUCAGGAAUUCCUGCUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 54 (5’GAAGCAGGAAUUCCUGAAUA 3’)的核酸序列的有义链;xvi)根据SEQ ID NO: 21 (5’UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;xvii)根据SEQ ID NO: 22 (5’UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;xviii)根据SEQ ID NO: 23 (5’UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xix)根据SEQ ID NO: 24 (5’UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;xx)根据SEQ ID NO: 26 (5’UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxi)根据SEQ ID NO: 27 (5’UUUGACUUUGUCAUAGCCUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 61 (5’CAGGCUAUGACAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxii)根据SEQ ID NO: 29 (5’UUUCUCUUGUGAACUAUCAAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 63 (5’UUGAUAGUUCACAAGAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxiii)根据SEQ ID NO: 30 (5’UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxiv)根据SEQ ID NO: 31 (5’UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxv)根据SEQ ID NO: 33 (5’UAACCCAAAUCCUCAUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 67 (5’CAAGAUGAGGAUUUGGGUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxvi)根据SEQ ID NO: 34 (5’UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxvii)根据SEQ ID NO: 35 (5’UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxviii)根据SEQ ID NO: 8 (5’UUAAGUUGACUAGACACUUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 42 (5’AAAGUGUCUAGUCAACUUAA 3’)的核酸序列的有义链;xxix)根据SEQ ID NO: 10 (5’UCAAUUAAGUUGACUAGACACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 44 (5’UGUCUAGUCAACUUAAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxx)根据SEQ ID NO: 18 (5’UGAGAUCUUGGCCUGCCAUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 52 (5’CAUGGCAGGCCAAGAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;xxxi)根据SEQ ID NO: 25 (5’UUAUUCUUGAGCUUGAUCAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 59 (5’CUGAUCAAGCUCAAGAAUAA 3’)的核酸序列的有义链;xxxii)根据SEQ ID NO: 32 (5’UCAUCUUGGAGUUUCUCCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 66 (5’AAGGAGAAACUCCAAGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxiii)根据SEQ ID NO: 5 (5’UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;或xxxiv)根据SEQ ID NO: 28 (5’UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链。
以0.02 nM使CFB敲低至少50%
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307和g) 2382至2468,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,其中分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50% (例如,50%至55%、55%至60%、60%至65%、65%至70%、70%至75%、75%至80%、80%至85%、85%至90%、90%至95%或95%至99%、99%至100%)。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307和g) 2382至2468,并且反义链与有义链基本上互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%,其中双链区域包含:i)根据SEQ ID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 36 (5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;ii)根据SEQ ID NO: 3 (5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’ AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;iii)根据SEQID NO: 4 (5’ UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38(5’ AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;iv)根据SEQ ID NO: 6 (5’UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 389 (5’ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;v)根据SEQ ID NO: 9 (5’UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;vi)根据SEQ ID NO: 12 (5’UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;vii)根据SEQ ID NO: 13 (5’UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;viii)根据SEQ ID NO: 14 (5’UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;ix)根据SEQ ID NO: 22 (5’UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;x)根据SEQ ID NO: 23 (5’UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xi)根据SEQ ID NO: 24 (5’UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;xii)根据SEQ ID NO: 30 (5’UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xiii)根据SEQ ID NO: 34 (5’UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xiv)根据SEQ ID NO: 35 (5’UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链;xv)根据SEQ ID NO: 5 (5’UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;或xvi)根据SEQ ID NO: 28 (5’UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链。
以0.02 nM使CFB敲低20% - 50%
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307和g) 2382至2468,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50% (例如,20%至25%、25%至30%、30%至35%、35%至40%、40%至45%或45%至50%)。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 991至1054;c) 1384至1500;d) 1606至1686;e) 1821至1881;f) 2116至2307;和g) 2382至2468,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%,其中双链区域包含:i)根据SEQ ID NO: 8 (5’UUAAGUUGACUAGACACUUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 42 (5’AAAGUGUCUAGUCAACUUAA 3’)的核酸序列的有义链;ii)根据SEQ ID NO: 10 (5’UCAAUUAAGUUGACUAGACACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 44 (5’UGUCUAGUCAACUUAAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;iii)根据SEQ ID NO: 18 (5’UGAGAUCUUGGCCUGCCAUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 52 (5’CAUGGCAGGCCAAGAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;iv)根据SEQ ID NO: 25 (5’UUAUUCUUGAGCUUGAUCAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 59 (5’CUGAUCAAGCUCAAGAAUAA 3’)的核酸序列的有义链;v)根据SEQ ID NO: 32 (5’UCAUCUUGGAGUUUCUCCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 66 (5’AAGGAGAAACUCCAAGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;vi)根据SEQ ID NO: 31 (5’UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;vii)根据SEQ ID NO: 33 (5’UAACCCAAAUCCUCAUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 67 (5’CAAGAUGAGGAUUUGGGUUA 3’)的核酸序列的有义链;viii)根据SEQ ID NO: 26 (5’UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;ix)根据SEQ ID NO: 27 (5’UUUGACUUUGUCAUAGCCUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 61 (5’CAGGCUAUGACAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;x)根据SEQ ID NO: 29 (5’UUUCUCUUGUGAACUAUCAAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 63 (5’UUGAUAGUUCACAAGAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;xi)根据SEQ ID NO: 15 (5’UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;xii)根据SEQ ID NO: 16 (5’UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xiii)根据SEQ ID NO: 17 (5’UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xiv)根据SEQ ID NO: 19 (5’UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;xv)根据SEQ ID NO: 20 (5’UAUUCAGGAAUUCCUGCUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 54 (5’GAAGCAGGAAUUCCUGAAUA 3’)的核酸序列的有义链;xvi)根据SEQ ID NO: 21 (5’UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;xvii)根据SEQ ID NO: 7 (5’UUUGACUAGACACUUUUUGGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 41 (5’CCAAAAAGUGUCUAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;或xviii)根据SEQ ID NO: 11 (5’UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链。
本公开内容提供了包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1815至2313和h) 2378至2417,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域。
以0.1 nM使CFB敲低20% - 50%
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1815至2313和h) 2378至2417,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1845至2313和h) 2378至2417,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%,其中双链区域包含:i)根据SEQ ID NO: 94(5’ UGACACUUUUUGGCUCCUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 204 (5’ACAGGAGCCAAAAAGUGUCA 3’)的核酸序列的有义链;ii)根据SEQ ID NO: 124 (5’UAUGUUGCUCAUUGUCUUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 234 (5’GAAAGACAAUGAGCAACAUA 3’)的核酸序列的有义链;iii)根据SEQ ID NO: 169 (5’UCUCUUGUGAACUAUCAAGGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 279 (5’CCUUGAUAGUUCACAAGAGA 3’)的核酸序列的有义链;iv)根据SEQ ID NO: 87 (5’UGUACAUGAAGGAGUCUUGGCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 197 (5’CCAAGACUCCUUCAUGUACA 3’)的核酸序列的有义链;v)根据SEQ ID NO: 163 (5’UGUCAGCAUAGGGACUCACUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 273 (5’AGUGAGUCCCUAUGCUGACA 3’)的核酸序列的有义链;vi)根据SEQ ID NO: 104 (5’UCUUCAACUUGUGGUCUUCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 214 (5’UGAAGACCACAAGUUGAAGA 3’)的核酸序列的有义链;vii)根据SEQ ID NO: 121 (5’UCUCAUUGUCUUUCUUGGAAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 231 (5’UUCCAAGAAAGACAAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;viii)根据SEQ ID NO: 99 (5’UUUCUCAAUUAAGUUGACUAGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 209 (5’UAGUCAACUUAAUUGAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;ix)根据SEQ ID NO: 155 (5’UCUCUCUCACAGCUGCCUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 265 (5’AAAGGCAGCUGUGAGAGAGA 3’)的核酸序列的有义链;x)根据SEQ ID NO: 144 (5’UCUUAUUCUUGAGCUUGAUCAG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 254 (5’GAUCAAGCUCAAGAAUAAGA 3’)的核酸序列的有义链;xi)根据SEQ ID NO: 136 (5’UCUGACCUUGAUUGAGUGUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 246 (5’AACACUCAAUCAAGGUCAGA 3’)的核酸序列的有义链;xii)根据SEQ ID NO: 76 (5’UGGAUUGCUCUGCACUCUGCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 186 (5’GCAGAGUGCAGAGCAAUCCA 3’)的核酸序列的有义链;xiii)根据SEQ ID NO: 134 (5’UAACAAUGUGCUGCUGUCAGCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 244 (5’CUGACAGCAGCACAUUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;xiv)根据SEQ ID NO: 158 (5’UAUUGAGCAUCUCUCUCACAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 268 (5’UGUGAGAGAGAUGCUCAAUA 3’)的核酸序列的有义链;xv)根据SEQ ID NO: 153 (5’UCAUUCUUGAUGUAGACCUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 263 (5’GAGGUCUACAUCAAGAAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xvi)根据SEQ ID NO: 73 (5’UGAAACUCCAGACCUAGACCUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 183 (5’GGUCUAGGUCUGGAGUUUCA 3’)的核酸序列的有义链;xvii)根据SEQ ID NO: 152 (5’UCUUGAUGUAGACCUCCUUCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 262 (5’GAAGGAGGUCUACAUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;xviii)根据SEQ ID NO: 147 (5’UCAGAGCUUUGAUAUCCUGUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 257 (5’ACAGGAUAUCAAAGCUCUGA 3’)的核酸序列的有义链;xix)根据SEQ ID NO: 101 (5’UCAUAACUUGCCACCUUCUCAA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 211 (5’GAGAAGGUGGCAAGUUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xx)根据SEQ ID NO: 174 (5’UUUCUGGUUUUUGCAGACAUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 284 (5’AUGUCUGCAAAAACCAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxi)根据SEQ ID NO: 118 (5’UUUUCUUGGAAGCCAAAGCAUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 228 (5’UGCUUUGGCUUCCAAGAAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxii)根据SEQ ID NO: 149 (5’UAAACAGAGCUUUGAUAUCCUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 259 (5’GGAUAUCAAAGCUCUGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxiii)根据SEQ ID NO: 95 (5’UGACUAGACACUUUUUGGCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 205 (5’AGCCAAAAAGUGUCUAGUCA 3’)的核酸序列的有义链;xxiv)根据SEQ ID NO: 142 (5’UUUCUUGAGCUUGAUCAGGGCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 252 (5’CCCUGAUCAAGCUCAAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxv)根据SEQ ID NO: 160 (5’UCAUAUUGAGCAUCUCUCUCAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 270 (5’GAGAGAGAUGCUCAAUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxvi)根据SEQ ID NO: 164 (5’UGUAUUGGGGUCAGCAUAGGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 274 (5’CCUAUGCUGACCCCAAUACA 3’)的核酸序列的有义链;xxvii)根据SEQ ID NO: 74 (5’UUGAAACUCCAGACCUAGACCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 184 (5’GUCUAGGUCUGGAGUUUCAA 3’)的核酸序列的有义链;xxviii)根据SEQ ID NO: 91 (5’UAUCCAUCUAGCACCAGGUAGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 201 (5’UACCUGGUGCUAGAUGGAUA 3’)的核酸序列的有义链;xxix)根据SEQ ID NO: 167 (5’UGUGAACUAUCAAGGGGCCGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 277 (5’CGGCCCCUUGAUAGUUCACA 3’)的核酸序列的有义链;xxx)根据SEQ ID NO: 175 (5’UUUGGAGUUUCUCCUUCAGCCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 285 (5’GCUGAAGGAGAAACUCCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxxi)根据SEQ ID NO: 72 (5’UAAACUCCAGACCUAGACCUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 182 (5’AGGUCUAGGUCUGGAGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxxii)根据SEQ ID NO: 119 (5’UCUUUCUUGGAAGCCAAAGCAU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 229 (5’GCUUUGGCUUCCAAGAAAGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxiii)根据SEQ ID NO: 154 (5’UCUUUCUUAUCCCCAUUCUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 264 (5’AAGAAUGGGGAUAAGAAAGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxiv)根据SEQ ID NO: 70 (5’UCUAGACCUGGUCACAUUCCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 180 (5’GGAAUGUGACCAGGUCUAGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxv)根据SEQ ID NO: 92 (5’UCUGUCUGAUCCAUCUAGCACC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 202 (5’UGCUAGAUGGAUCAGACAGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxvi)根据SEQ ID NO: 116 (5’UCAAAGCAUUGAUGUUCACUUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 226 (5’AGUGAACAUCAAUGCUUUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxvii)根据SEQ ID NO: 84 (5’UGAGAGUGUAACCGUCAUAGCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 194 (5’CUAUGACGGUUACACUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;xxxviii)根据SEQ ID NO: 89 (5’UGUCGUACAUGAAGGAGUCUUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 199 (5’AGACUCCUUCAUGUACGACA 3’)的核酸序列的有义链;xxxix)根据SEQ ID NO: 83 (5’UGAGUGUAACCGUCAUAGCAGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 193 (5’UGCUAUGACGGUUACACUCA 3’)的核酸序列的有义链;xL)根据SEQ ID NO: 107 (5’UUAAUUGGGUCCCCGCCCAUGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 217 (5’AUGGGCGGGGACCCAAUUAA 3’)的核酸序列的有义链;xLi)根据SEQ ID NO: 100 (5’UAUAACUUGCCACCUUCUCAAU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 210 (5’UGAGAAGGUGGCAAGUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xLii)根据SEQ ID NO: 157 (5’UUUGAGCAUCUCUCUCACAGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 267 (5’CUGUGAGAGAGAUGCUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xLiii)根据SEQ ID NO: 77 (5’UCUCACAUUGUAGUAGGGAGAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 187 (5’CUCCCUACUACAAUGUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;xLiv)根据SEQ ID NO: 105 (5’UGACUUCAACUUGUGGUCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 215 (5’AAGACCACAAGUUGAAGUCA 3’)的核酸序列的有义链;xLv)根据SEQ ID NO: 130 (5’UCAGGUUUUCCAUAUCCUUGAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 240 (5’CAAGGAUAUGGAAAACCUGA 3’)的核酸序列的有义链;xLvi)根据SEQ ID NO: 166 (5’UAACUAUCAAGGGGCCGCCAGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 276 (5’UGGCGGCCCCUUGAUAGUUA 3’)的核酸序列的有义链;xLvii)根据SEQ ID NO: 131 (5’UCACAGAGACUCAGAGACUGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 241 (5’CAGUCUCUGAGUCUCUGUGA 3’)的核酸序列的有义链;xLviii)根据SEQ ID NO: 127 (5’UCUUUGAACACAUGUUGCUCAU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 237 (5’GAGCAACAUGUGUUCAAAGA 3’)的核酸序列的有义链;xLix)根据SEQ ID NO: 111 (5’UAUCAAUGACAGUAAUUGGGUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 221 (5’CCCAAUUACUGUCAUUGAUA 3’)的核酸序列的有义链;L)根据SEQ ID NO: 93 (5’UCUUUUUGGCUCCUGUGAAGUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 203 (5’CUUCACAGGAGCCAAAAAGA 3’)的核酸序列的有义链;或Li)根据SEQ ID NO: 71 (5’UAACUCCAGACCUAGACCUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 181 (5’CAGGUCUAGGUCUGGAGUUA 3’)的核酸序列的有义链。
以0.1 nM使CFB敲低至少50%
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1815至2313和h) 2378至2417,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1845至2313和h) 2378至2417,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%,其中双链区域包含:i)根据SEQ ID NO: 171(5’ UAUGAAACGACUUCUCUUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 281 (5’ACAAGAGAAGUCGUUUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;ii)根据SEQ ID NO: 165 (5’UAUCACCUCUGCAAGUAUUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 275 (5’CAAUACUUGCAGAGGUGAUA 3’)的核酸序列的有义链;iii)根据SEQ ID NO: 129 (5’UUUUCCAUAUCCUUGACUUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 239 (5’AAAGUCAAGGAUAUGGAAAA 3’)的核酸序列的有义链;iv)根据SEQ ID NO: 176 (5’UAUCUUGGAGUUUCUCCUUCAG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 286 (5’GAAGGAGAAACUCCAAGAUA 3’)的核酸序列的有义链;v)根据SEQ ID NO: 177 (5’UCUCAUCUUGGAGUUUCUCCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 287 (5’GGAGAAACUCCAAGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;vi)根据SEQ ID NO: 138 (5’UCAUAAAAUUCAGGAAUUCCUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 248 (5’GGAAUUCCUGAAUUUUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;vii)根据SEQ ID NO: 140 (5’UGUCAUAGUCAUAAAAUUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 250 (5’UGAAUUUUAUGACUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;viii)根据SEQ ID NO: 148 (5’UAACAGAGCUUUGAUAUCCUGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 258 (5’AGGAUAUCAAAGCUCUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;ix)根据SEQ ID NO: 150 (5’UCAAACAGAGCUUUGAUAUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 260 (5’GAUAUCAAAGCUCUGUUUGA 3’)的核酸序列的有义链;x)根据SEQ ID NO: 179 (5’UGAAAACCCAAAUCCUCAUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 289 (5’GAUGAGGAUUUGGGUUUUCA 3’)的核酸序列的有义链;xi)根据SEQ ID NO: 90 (5’UAAAGCUUCGGCCACCUCUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 200 (5’AAGAGGUGGCCGAAGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xii)根据SEQ ID NO: 172 (5’UUUUUGCAGACAUCCACUACUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 282 (5’GUAGUGGAUGUCUGCAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;xiii)根据SEQ ID NO: 88 (5’UCGUACAUGAAGGAGUCUUGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 198 (5’CAAGACUCCUUCAUGUACGA 3’)的核酸序列的有义链;xiv)根据SEQ ID NO: 168 (5’UUUGUGAACUAUCAAGGGGCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 278 (5’GCCCCUUGAUAGUUCACAAA 3’)的核酸序列的有义链;xv)根据SEQ ID NO: 81 (5’UGUGGAAAGAGAUCUCAUCACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 191 (5’UGAUGAGAUCUCUUUCCACA 3’)的核酸序列的有义链;xvi)根据SEQ ID NO: 159 (5’UAUAUUGAGCAUCUCUCUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 269 (5’UGAGAGAGAUGCUCAAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xvii)根据SEQ ID NO: 82 (5’UCAUAGCAGUGGAAAGAGAUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 192 (5’AUCUCUUUCCACUGCUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xviii)根据SEQ ID NO: 97 (5’UUUAAGUUGACUAGACACUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 207 (5’AAGUGUCUAGUCAACUUAAA 3’)的核酸序列的有义链;xix)根据SEQ ID NO: 132 (5’UUUGCUUGUGGUAAUCGGUACC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 242 (5’UACCGAUUACCACAAGCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xx)根据SEQ ID NO: 123 (5’UGUUGCUCAUUGUCUUUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 233 (5’AAGAAAGACAAUGAGCAACA 3’)的核酸序列的有义链;xxi)根据SEQ ID NO: 126 (5’UUUUGAACACAUGUUGCUCAUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 236 (5’UGAGCAACAUGUGUUCAAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxii)根据SEQ ID NO: 162 (5’UGAGAUGUCCUUGACUUUGUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 272 (5’ACAAAGUCAAGGACAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;xxiii)根据SEQ ID NO: 79 (5’UCAUCACUCACAUUGUAGUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 189 (5’UACUACAAUGUGAGUGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxiv)根据SEQ ID NO: 151 (5’UCAGACACAAACAGAGCUUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 261 (5’AAAGCUCUGUUUGUGUCUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxv)根据SEQ ID NO: 143 (5’UAUUCUUGAGCUUGAUCAGGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 253 (5’CCUGAUCAAGCUCAAGAAUA 3’)的核酸序列的有义链;xxvi)根据SEQ ID NO: 117 (5’UAAGCCAAAGCAUUGAUGUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 227 (5’AACAUCAAUGCUUUGGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxvii)根据SEQ ID NO: 133 (5’UAAAGUACUCAGACACCACAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 243 (5’UGUGGUGUCUGAGUACUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxviii)根据SEQ ID NO: 122 (5’UUUGCUCAUUGUCUUUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 232 (5’CAAGAAAGACAAUGAGCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxix)根据SEQ ID NO: 110 (5’UCAAUGACAGUAAUUGGGUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 220 (5’GACCCAAUUACUGUCAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxx)根据SEQ ID NO: 173 (5’UGUUUUUGCAGACAUCCACUAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 283 (5’AGUGGAUGUCUGCAAAAACA 3’)的核酸序列的有义链;xxxi)根据SEQ ID NO: 156 (5’UGAGCAUCUCUCUCACAGCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 266 (5’AGCUGUGAGAGAGAUGCUCA 3’)的核酸序列的有义链;xxxii)根据SEQ ID NO: 141 (5’UCUUGAUCAGGGCAACGUCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 251 (5’UGACGUUGCCCUGAUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxiii)根据SEQ ID NO: 135 (5’UCUUGAUUGAGUGUUCCUUGUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 245 (5’CAAGGAACACUCAAUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxiv)根据SEQ ID NO: 170 (5’UGACUUCUCUUGUGAACUAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 280 (5’AUAGUUCACAAGAGAAGUCA 3’)的核酸序列的有义链;xxxv)根据SEQ ID NO: 178 (5’UAAUCCUCAUCUUGGAGUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 288 (5’AAACUCCAAGAUGAGGAUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxxvi)根据SEQ ID NO: 114 (5’UAUAGACAUCCAGAUAAUCCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 224 (5’GGAUUAUCUGGAUGUCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xxxvii)根据SEQ ID NO: 139 (5’UCAUAGUCAUAAAAUUCAGGAA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 249 (5’CCUGAAUUUUAUGACUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxviii)根据SEQ ID NO: 125 (5’UCAUGUUGCUCAUUGUCUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 235 (5’AAAGACAAUGAGCAACAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxix)根据SEQ ID NO: 145 (5’UGAGACAAAUGGGCCUGAUAGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 255 (5’UAUCAGGCCCAUUUGUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;xL)根据SEQ ID NO: 113 (5’UCUCAUCAAUGACAGUAAUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 223 (5’AAUUACUGUCAUUGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;xLi)根据SEQ ID NO: 120 (5’UGUCUUUCUUGGAAGCCAAAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 230 (5’UUUGGCUUCCAAGAAAGACA 3’)的核酸序列的有义链;xLii)根据SEQ ID NO: 75 (5’UGAUCUGCAGGUACGUGUCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 185 (5’AGACACGUACCUGCAGAUCA 3’)的核酸序列的有义链;xLiii)根据SEQ ID NO: 112 (5’UCAUCAAUGACAGUAAUUGGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 222 (5’CCAAUUACUGUCAUUGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xLiv)根据SEQ ID NO: 108 (5’UAUGACAGUAAUUGGGUCCCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 218 (5’GGGACCCAAUUACUGUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;xLv)根据SEQ ID NO: 128 (5’UGACUUUGAACACAUGUUGCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 238 (5’GCAACAUGUGUUCAAAGUCA 3’)的核酸序列的有义链;xLvi)根据SEQ ID NO: 161 (5’UCUUGACUUUGUCAUAGCCUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 271 (5’AGGCUAUGACAAAGUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;xLvii)根据SEQ ID NO: 85 (5’UUUGUCACAGAUCGCUGUCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 195 (5’AGACAGCGAUCUGUGACAAA 3’)的核酸序列的有义链;xLviii)根据SEQ ID NO: 137 (5’UGAAUUCCUGCUUCUUUUUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 247 (5’AAAAAAGAAGCAGGAAUUCA 3’)的核酸序列的有义链;xLix)根据SEQ ID NO: 80 (5’UGAAAGAGAUCUCAUCACUCAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 190 (5’GAGUGAUGAGAUCUCUUUCA 3’)的核酸序列的有义链;L)根据SEQ ID NO: 115 (5’UCAUAGACAUCCAGAUAAUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 225 (5’GAUUAUCUGGAUGUCUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;Li)根据SEQ ID NO: 96 (5’UGUUGACUAGACACUUUUUGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 206 (5’CAAAAAGUGUCUAGUCAACA 3’)的核酸序列的有义链;Lii)根据SEQ ID NO: 146 (5’UAAGUGGUAGUUGGAGGAAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 256 (5’CUUCCUCCAACUACCACUUA 3’)的核酸序列的有义链;Liii)根据SEQ ID NO: 78 (5’UAUCACUCACAUUGUAGUAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 188 (5’CUACUACAAUGUGAGUGAUA 3’)的核酸序列的有义链;Liv)根据SEQ ID NO: 103 (5’UUUCACACCAUAACUUGCCACC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 213 (5’UGGCAAGUUAUGGUGUGAAA 3’)的核酸序列的有义链;Lv)根据SEQ ID NO: 102 (5’UCACCAUAACUUGCCACCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 212 (5’AAGGUGGCAAGUUAUGGUGA 3’)的核酸序列的有义链;Lvi)根据SEQ ID NO: 109 (5’UAAUGACAGUAAUUGGGUCCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 219 (5’GGACCCAAUUACUGUCAUUA 3’)的核酸序列的有义链;Lvii)根据SEQ ID NO: 86 (5’UCAUGAAGGAGUCUUGGCAGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 196 (5’CUGCCAAGACUCCUUCAUGA 3’)的核酸序列的有义链;Lviii)根据SEQ ID NO: 106 (5’UCUCAUCAUGCUGUACACUGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 216 (5’CAGUGUACAGCAUGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;Lix)根据SEQ ID NO: 98 (5’UCUCAAUUAAGUUGACUAGACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 208 (5’UCUAGUCAACUUAAUUGAGA 3’)的核酸序列的有义链。
以0.02 nM使CFB敲低20% - 50%
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1815至2313和h) 2378至2417,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1845至2313和h) 2378至2417,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%,其中双链区域包含:i)根据SEQ ID NO:165 (5’ UAUCACCUCUGCAAGUAUUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 275 (5’CAAUACUUGCAGAGGUGAUA 3’)的核酸序列的有义链;ii)根据SEQ ID NO: 129 (5’UUUUCCAUAUCCUUGACUUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 239 (5’AAAGUCAAGGAUAUGGAAAA 3’)的核酸序列的有义链;iii)根据SEQ ID NO: 176 (5’UAUCUUGGAGUUUCUCCUUCAG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 286 (5’GAAGGAGAAACUCCAAGAUA 3’)的核酸序列的有义链;iv)根据SEQ ID NO: 177 (5’UCUCAUCUUGGAGUUUCUCCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 287 (5’GGAGAAACUCCAAGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;v)根据SEQ ID NO: 138 (5’UCAUAAAAUUCAGGAAUUCCUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 248 (5’GGAAUUCCUGAAUUUUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;vi)根据SEQ ID NO: 140 (5’UGUCAUAGUCAUAAAAUUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 250 (5’UGAAUUUUAUGACUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;vii)根据SEQ ID NO: 148 (5’UAACAGAGCUUUGAUAUCCUGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 258 (5’AGGAUAUCAAAGCUCUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;viii)根据SEQ ID NO: 150 (5’UCAAACAGAGCUUUGAUAUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 260 (5’GAUAUCAAAGCUCUGUUUGA 3’)的核酸序列的有义链;ix)根据SEQ ID NO: 179 (5’UGAAAACCCAAAUCCUCAUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 289 (5’GAUGAGGAUUUGGGUUUUCA 3’)的核酸序列的有义链;x)根据SEQ ID NO: 90 (5’UAAAGCUUCGGCCACCUCUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 200 (5’AAGAGGUGGCCGAAGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xi)根据SEQ ID NO: 172 (5’UUUUUGCAGACAUCCACUACUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 282 (5’GUAGUGGAUGUCUGCAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;xii)根据SEQ ID NO: 88 (5’UCGUACAUGAAGGAGUCUUGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 198 (5’CAAGACUCCUUCAUGUACGA 3’)的核酸序列的有义链;xiii)根据SEQ ID NO: 168 (5’UUUGUGAACUAUCAAGGGGCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 278 (5’GCCCCUUGAUAGUUCACAAA 3’)的核酸序列的有义链;xiv)根据SEQ ID NO: 81 (5’UGUGGAAAGAGAUCUCAUCACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 191 (5’UGAUGAGAUCUCUUUCCACA 3’)的核酸序列的有义链;xv)根据SEQ ID NO: 159 (5’UAUAUUGAGCAUCUCUCUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 269 (5’UGAGAGAGAUGCUCAAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xvi)根据SEQ ID NO: 82 (5’UCAUAGCAGUGGAAAGAGAUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 192 (5’AUCUCUUUCCACUGCUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xvii)根据SEQ ID NO: 97 (5’UUUAAGUUGACUAGACACUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 207 (5’AAGUGUCUAGUCAACUUAAA 3’)的核酸序列的有义链;xviii)根据SEQ ID NO: 132 (5’UUUGCUUGUGGUAAUCGGUACC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 242 (5’UACCGAUUACCACAAGCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xix)根据SEQ ID NO: 123 (5’UGUUGCUCAUUGUCUUUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 233 (5’AAGAAAGACAAUGAGCAACA 3’)的核酸序列的有义链;xx)根据SEQ ID NO: 79 (5’UCAUCACUCACAUUGUAGUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 189 (5’UACUACAAUGUGAGUGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxi)根据SEQ ID NO: 117 (5’UAAGCCAAAGCAUUGAUGUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 227 (5’AACAUCAAUGCUUUGGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxii)根据SEQ ID NO: 122 (5’UUUGCUCAUUGUCUUUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 232 (5’CAAGAAAGACAAUGAGCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxiii)根据SEQ ID NO: 110 (5’UCAAUGACAGUAAUUGGGUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 220 (5’GACCCAAUUACUGUCAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxiv)根据SEQ ID NO: 135 (5’UCUUGAUUGAGUGUUCCUUGUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 245 (5’CAAGGAACACUCAAUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;xxv)根据SEQ ID NO: 178 (5’UAAUCCUCAUCUUGGAGUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 288 (5’AAACUCCAAGAUGAGGAUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxvi)根据SEQ ID NO: 114 (5’UAUAGACAUCCAGAUAAUCCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 224 (5’GGAUUAUCUGGAUGUCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xxvii)根据SEQ ID NO: 125 (5’UCAUGUUGCUCAUUGUCUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 235 (5’AAAGACAAUGAGCAACAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxviii)根据SEQ ID NO: 113 (5’UCUCAUCAAUGACAGUAAUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 223 (5’AAUUACUGUCAUUGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;xix)根据SEQ ID NO: 120 (5’UGUCUUUCUUGGAAGCCAAAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 230 (5’UUUGGCUUCCAAGAAAGACA 3’)的核酸序列的有义链;xxx)根据SEQ ID NO: 75 (5’UGAUCUGCAGGUACGUGUCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 185 (5’AGACACGUACCUGCAGAUCA 3’)的核酸序列的有义链;xxxi)根据SEQ ID NO: 112 (5’UCAUCAAUGACAGUAAUUGGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 222 (5’CCAAUUACUGUCAUUGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxii)根据SEQ ID NO: 108 (5’UAUGACAGUAAUUGGGUCCCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 218 (5’GGGACCCAAUUACUGUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;xxxiii)根据SEQ ID NO: 115 (5’UCAUAGACAUCCAGAUAAUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 225 (5’GAUUAUCUGGAUGUCUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxiv)根据SEQ ID NO: 102 (5’UCACCAUAACUUGCCACCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 212 (5’AAGGUGGCAAGUUAUGGUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxv)根据SEQ ID NO: 109 (5’UAAUGACAGUAAUUGGGUCCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 219 (5’GGACCCAAUUACUGUCAUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxxvi)根据SEQ ID NO: 106 (5’UCUCAUCAUGCUGUACACUGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 216 (5’CAGUGUACAGCAUGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxvii)根据SEQ ID NO: 98 (5’UCUCAAUUAAGUUGACUAGACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 208 (5’UCUAGUCAACUUAAUUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;xxxviii)根据SEQ ID NO: 124 (5’UAUGUUGCUCAUUGUCUUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 234 (5’GAAAGACAAUGAGCAACAUA 3’)的核酸序列的有义链;xxxix)根据SEQ ID NO: 121 (5’UCUCAUUGUCUUUCUUGGAAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 231 (5’UUCCAAGAAAGACAAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;或xL)根据SEQ ID NO: 107 (5’UUAAUUGGGUCCCCGCCCAUGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 217 (5’AUGGGCGGGGACCCAAUUAA 3’)的核酸序列的有义链。
以0.02 nM使CFB敲低至少50%
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1815至2313和h) 2378至2417,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 5至38;b) 340至606;c) 776至828;d) 939至1227;e) 1305至1606;f) 1667至1746;g) 1815至2313和h) 2378至2417,并且反义链基本上与有义链互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%,其中双链区域包含根据SEQ ID NO: 171(5’ UAUGAAACGACUUCUCUUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 281 (5’ACAAGAGAAGUCGUUUCAUA 3’)的核酸序列的有义链。
CFB表达的体内减少
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 995至1018;c) 1034至1054;d) 1384至1404;e) 1431至1500;f) 1606至1686;g) 1822至1849;h) 1860至1881;i) 2190至2210;j) 2239至2262;k) 2287至2307;l) 2382至2402;m) 2395至2415和n)2448至2468,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以1 mg/kg的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少25%。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 995至1018;c) 1034至1054;d) 1384至1404;e) 1431至1500;f) 1606至1686;g) 1822至1849;h) 1860至1881;i) 2190至2210;j) 2239至2262;k) 2287至2307;l) 2382至2402;m) 2395至2415和n)2448至2468,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以1 mg/kg的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少25%,其中双链区域包含:i)根据SEQ ID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQID NO: 36 (5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;ii)根据SEQ ID NO: 3(5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;iii)根据SEQ ID NO: 4 (5’UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38 (5’AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;iv)根据SEQ ID NO: 5 (5’UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;v)根据SEQ ID NO: 6 (5’UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 391 (5’ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;vi)根据SEQ ID NO: 8 (5’UUAAGUUGACUAGACACUUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 42 (5’AAAGUGUCUAGUCAACUUAA 3’)的核酸序列的有义链;vii)根据SEQ ID NO: 9 (5’UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;viii)根据SEQ ID NO: 11 (5’UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;ix)根据SEQ ID NO: 12 (5’UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;x)根据SEQ ID NO: 13 (5’UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;xi)根据SEQ ID NO: 14 (5’UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xii)根据SEQ ID NO: 15 (5’UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;xiii)根据SEQ ID NO: 16 (5’UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xiv)根据SEQ ID NO: 17 (5’UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xv)根据SEQ ID NO: 18 (5’UGAGAUCUUGGCCUGCCAUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 52 (5’CAUGGCAGGCCAAGAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;xvi)根据SEQ ID NO: 19 (5’UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;xvii)根据SEQ ID NO: 21 (5’UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;xviii)根据SEQ ID NO: 22 (5’UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;xix)根据SEQ ID NO: 23 (5’UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xx)根据SEQ ID NO: 24 (5’UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;xxi)根据SEQ ID NO: 25 (5’UUAUUCUUGAGCUUGAUCAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 59 (5’CUGAUCAAGCUCAAGAAUAA 3’)的核酸序列的有义链;xxii)根据SEQ ID NO: 26 (5’UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxiii)根据SEQ ID NO: 28 (5’UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxiv)根据SEQ ID NO: 30 (5’UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxv)根据SEQ ID NO: 171 (5’UAUGAAACGACUUCUCUUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 281 (5’ACAAGAGAAGUCGUUUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;xxvi)根据SEQ ID NO: 31 (5’UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxvii)根据SEQ ID NO: 32 (5’UCAUCUUGGAGUUUCUCCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 66 (5’AAGGAGAAACUCCAAGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;xxviii)根据SEQ ID NO: 34 (5’UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;或xxix)根据SEQ ID NO: 35 (5’UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链。
在包含有义链和反义链的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:a) 493至534;b) 995至1018;c) 1034至1054;d) 1384至1404;e) 1431至1500;f) 1606至1686;g) 1822至1849;h) 1860至1881;i) 2190至2210;j) 2239至2262;k) 2287至2307;l) 2382至2402;m) 2395至2415和n)2448至2468,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,并且分离的寡核苷酸以1 mg/kg的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少25%,其中双链区域包含:i)根据SEQ ID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQID NO: 36 (5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;ii)根据SEQ ID NO: 3(5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;iii)根据SEQ ID NO: 4 (5’UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38 (5’AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;iv)根据SEQ ID NO: 5 (5’UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;v)根据SEQ ID NO: 6 (5’UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 391 (5’ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;vi)根据SEQ ID NO: 9 (5’UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;vii)根据SEQ ID NO: 11 (5’UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;viii)根据SEQ ID NO: 12 (5’UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;ix)根据SEQ ID NO: 13 (5’UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;x)根据SEQ ID NO: 14 (5’UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xi)根据SEQ ID NO: 15 (5’UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;xii)根据SEQ ID NO: 16 (5’UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;xiii)根据SEQ ID NO: 17 (5’UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xiv)根据SEQ ID NO: 19 (5’UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;xv)根据SEQ ID NO: 21 (5’UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;xvi)根据SEQ ID NO: 22 (5’UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;xvii)根据SEQ ID NO: 23 (5’UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;xviii)根据SEQ ID NO: 24 (5’UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;xix)根据SEQ ID NO: 26 (5’UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;xx)根据SEQ ID NO: 28 (5’UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxi)根据SEQ ID NO: 30 (5’UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;xxii)根据SEQ ID NO: 171 (5’UAUGAAACGACUUCUCUUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 281 (5’ACAAGAGAAGUCGUUUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;xxiii)根据SEQ ID NO: 31 (5’UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;xxiv)根据SEQ ID NO: 34 (5’UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;或xxv)根据SEQ ID NO: 35 (5’UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸可以包含接头,有时称为环。包含接头或环的siRNA有时称为短发夹RNA (shRNA)。在一些实施方案中,siRNA的有义区和反义区两者由一条单链RNA编码。在这些实施方案中,反义区和有义区杂交以形成双链体区域。有义区和反义区通过接头序列连接,形成“发夹”或“茎环”结构。siRNA可以在单链分子的相对末端处具有互补的有义区和反义区,使得分子可以用互补序列部分形成双链体区域,并且链在双链体区域的一个末端处通过接头连接。接头可以是核苷酸接头或非核苷酸接头或其组合。接头可以通过共价键或非共价相互作用与第一链和任选地第二链相互作用。
设想任何合适的核苷酸接头序列在本公开内容的范围内。本公开内容的siRNA可以包括将核酸的有义区连接到核酸的反义区的核苷酸、非核苷酸或混合核苷酸/非核苷酸接头。核苷酸接头可以是长度≥2个核苷酸的接头,例如长度约3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个、11个、12个、13个、14个、15个或16个核苷酸。
非核苷酸接头的实例包括无碱基核苷酸、聚醚、多胺、聚酰胺、肽、糖类、脂质、聚烃或其他聚合剂,例如聚乙二醇,诸如具有从2个至100个乙二醇单元的那些。一些实例描述于Seela等人,Nucleic Acids Research, 1987, Vol. 15, pp. 3113-3129; Cload等人,J.Am. Chem. Soc, 1991, Vol. 113, pp. 6324-6326; Jaeschke等人,Tetrahedron Lett.,1993, Vol. 34, pp. 301; Arnold等人,WO 1989/002439; Usman等人,WO 1995/006731;Dudycz等人,WO 1995/011910,和Ferentz等人,J. Am. Chem. Soc, 1991, Vol. 113, pp.4000-4002。
核苷酸接头序列的实例包括但不限于AUG、CCC、UUCG、CCACC、AAGCAA、CCACACC和UUCAAGAGA。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸是siRNA,所述siRNA可以是长度适合作为Dicer底物的dsRNA,所述dsRNA可以被加工以产生RISC活性siRNA分子。参见例如,Rossi等人,US2005/0244858。
Dicer底物双链RNA (dsRNA)可以具有足以被Dicer加工以产生活性siRNA的长度,并且可以进一步包括以下性质中的一种或更多种:(i) Dicer底物dsRNA可以是不对称的,例如,在反义链上具有3’突出端,(ii) Dicer底物dsRNA可以在有义链上具有修饰的3’末端,以指导Dicer结合的取向和将dsRNA加工成活性siRNA,例如一个或更多个DNA核苷酸的掺入,和(iii) Dicer底物dsRNA的第一链和第二链的长度可从19 bp-30 bp。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸包含至少一个修饰的核苷酸。在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链或反义链或两者包含一个或更多个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,仅有义链包含一个或更多个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,仅反义链包含一个或更多个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,有义链和反义链两者均包含一个或更多个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸是部分化学修饰的。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸是完全化学修饰的。
在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少两个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少三个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少四个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少五个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少六个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少七个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少八个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少九个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十一个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十二个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十三个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十四个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十五个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十六个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十七个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十八个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十九个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少二十个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含超过二十个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含二十个和三十个之间修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含三十个和四十个之间修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含四十个和五十个之间修饰的核苷酸。
在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少一个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少两个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少三个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少四个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少五个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少六个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少七个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少八个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少九个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十一个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十二个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十三个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十四个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十五个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十六个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十七个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十八个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十九个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少二十个修饰的核苷酸。
在一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸包含多于一个修饰的核苷酸,至少第一核苷酸包含第一修饰,并且至少第二核苷酸包含第二修饰。在一些实施方案中,第一修饰和第二修饰是不同的。在一些实施方案中,至少第一核苷酸和至少第二核苷酸位于分离的寡核苷酸的不同链上。在一些实施方案中,至少第一核苷酸和至少第二核苷酸位于分离的寡核苷酸的相同链上。
在分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸包含多于一个修饰的核苷酸,至少第一修饰的核苷酸包含第一修饰,并且至少第二修饰的核苷酸包含第二修饰,并且至少第三核苷酸包含第三修饰。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含第一修饰、第二修饰、第三修饰和第四修饰。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含多于四个修饰。在一些实施方案中,所有修饰都在有义链上。在一些实施方案中,所有修饰都在反义链上。在本公开内容的分离的寡核苷酸内设想有义链和反义链之间的修饰的位置的任何组合。
在一些实施方案中,修饰的核苷酸连续地位于有义链或反义链或两者上。在一些实施方案中,一些但不是全部修饰的核苷酸连续地位于有义链或反义链或两者上。在一些实施方案中,修饰的核苷酸不连续地位于有义链或反义链或两者上。
在本公开内容内设想的是分离的寡核苷酸,其中有义链或反义链上的任何核苷酸可以被修饰。在一些实施方案中,可以修饰反义链上的任何核苷酸。在一些实施方案中,可以修饰反义链上的任何核苷酸。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸包含至少一个修饰的核苷酸。在一些实施方案中,一个或更多个修饰的核苷酸增加分离的寡核苷酸的稳定性或效力或两者。在一些实施方案中,一个或更多个修饰的核苷酸增加RNA双链体和siRNA的稳定性。
增加RNA稳定性的修饰包括但不限于锁核酸。如本文使用的,术语“锁核酸”或“LNA”包括但不限于修饰的RNA核苷酸,其中核糖部分包含连接2’氧和4’碳的亚甲基桥。该亚甲基桥将核糖锁在3’-内构象中,也称为北方构象,是在A型RNA双链体中发现的构象。术语不可接近的RNA可以与LNA互换地使用。具有2’-4’环状连接的LNA,如国际专利申请WO99/14226、WO 00/56746、WO 00/56748和WO 00/66604中所描述,这些申请的内容通过引用并入本文。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链或反义链或两者包含至少一个具有修饰的磷酸主链的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链包含至少一个具有修饰的磷酸主链的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的反义链包含至少一个具有修饰的磷酸主链的核苷酸。在一些实施方案中,其中本公开内容的分离的寡核苷酸包含修饰的磷酸主链,该修饰的磷酸主链包含修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,修饰的磷酸二酯键通过用部分置换一个或更多个氧原子来修饰,其中该部分用在该部分中的碳、氮或硫原子与磷酸二酯键中的磷原子键合,或通过形成2’-5’键来修饰。在一些实施方案中,修饰的磷酸二酯键包含硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、甲基膦酸酯、氨基磷酸酯二酯、甲磺酰基氨基磷酸酯或膦酰基乙酸酯。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸包含一个或更多个含有非天然碱基的核苷酸、锁核苷酸或无碱基核苷酸。在一些实施方案中,一种或更多种修饰的核苷酸包含硫代磷酸酯衍生物或吖啶取代的核苷酸。在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸在反义链的5’末端处包含磷酸模拟物,包括但不限于乙烯基膦酸酯或其他磷酸类似物。在一些实施方案中,5’-磷酸模拟物是乙基膦酸酯、乙烯基膦酸酯或其类似物。
在一些实施方案中,修饰的核苷酸包括5-氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-氯尿嘧啶、5-碘尿嘧啶、次黄嘌呤、黄嘌呤、4-乙酰基胞嘧啶、5-(羧基羟基甲基)尿嘧啶、5-羧基甲基氨基甲基-2-硫代尿苷、5-羧基甲基氨基甲基尿嘧啶、二氢尿嘧啶、β-D-半乳糖基辫苷(β-D-galactosylqueosine)、肌苷、N6-异戊烯腺嘌呤、1-甲基鸟嘌呤、1-甲基肌苷、2,2-二甲基鸟嘌呤、2-甲基腺嘌呤、2-甲基鸟嘌呤、3-甲基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、N6-腺嘌呤、7-甲基鸟嘌呤、5-甲基-氨基甲基尿嘧啶、5-甲氧氨基甲基-2-硫代尿嘧啶、β-D-甘露糖基辫苷、5’-甲氧基羧基甲基尿嘧啶、5-甲氧基尿嘧啶、2-甲基硫代-N-异戊烯腺嘌呤、尿嘧啶-5-羟乙酸(v)、wybutoxosine、假尿嘧啶、Q苷、2-硫胞嘧啶、5-甲基-2-硫尿嘧啶、2-硫尿嘧啶、4-硫尿嘧啶、5-甲基尿嘧啶、尿嘧啶-5-羟乙酸甲酯、尿嘧啶-5-羟乙酸(v)、5-甲基-2-硫代尿嘧啶、3-(3-氨基-3-N-2-羧基丙基)尿嘧啶、(acp3)w或2,6二氨基嘌呤。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链或反义链或两者包含连接至一个或更多个靶向配体的末端或内部核苷酸。在一些实施方案中,末端或内部核苷酸与一个或更多个靶向配体直接连接。在一些实施方案中,末端或内部核苷酸通过接头间接连接至一个或更多个靶向配体。在一些实施方案中,直接或间接连接至末端或内部核苷酸的一个或更多个靶向配体可进一步包含PK调节剂。在一些实施方案中,PK调节剂是竞争性调节剂、正别构调节剂、负别构调节剂或中性别构调节剂。在一些实施方案中,靶向配体选自糖类、肽、脂质、抗体或其片段、适配体、白蛋白、纤维蛋白原和叶酸中的一种或更多种。
核苷酸的修饰
本文提供了分离的寡核苷酸,包含:(a)包含X1个核苷酸的有义链,其中至少一个核苷酸用第一修饰修饰,其余核苷酸中的每一个独立地用第二修饰修饰,并且X1是选自13-36的整数,其中第一修饰和第二修饰不同;和(b)包含X2个核苷酸的反义链,其中至少一个核苷酸用第三修饰修饰,其余核苷酸中的每一个独立地用第四修饰修饰,并且X2是选自18-31的整数,其中第三修饰和第四修饰不同。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链的X1个核苷酸是18-21个,并且本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链的X2个核苷酸是20-23个。在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链的X1个核苷酸是20个或21个,并且本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链的X2个核苷酸是22个或23个。在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链的X2个核苷酸等于本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链的X1个核苷酸加2个。在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链的X1个核苷酸是21个,并且本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链的X2个核苷酸是23个。在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链的X1个核苷酸是20个,并且本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链的X2个核苷酸是22个。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含:(a)包含20个核苷酸的有义链,其中至少一个核苷酸用第一修饰修饰,其余核苷酸中的每一个独立地用第二修饰修饰,其中第一修饰和第二修饰相同或不同;和(b)包含22个核苷酸的反义链,其中至少一个核苷酸用第三修饰修饰,其余核苷酸中的每一个独立地用第四修饰修饰,其中第三修饰和第四修饰相同或不同。
在一些实施方案中,第一修饰是至少一个核苷酸的糖部分的2’-位置处选自2’-F修饰、2’-CN修饰、2’-N3修饰、2’-脱氧修饰及其等同物、及其组合的修饰。在一些实施方案中,第一修饰是2’-F修饰、2’-CN修饰、2’-N3修饰或2’-脱氧修饰或其立体异构体。在一些实施方案中,第一修饰是2’-F修饰、2’-CN修饰或2’-N3修饰或其立体异构体。在一些实施方案中,第一修饰是2’-F修饰或其立体异构体。
在一些实施方案中,第二修饰是一个或更多个剩余核苷酸的糖部分的2’-位置处选自2’-C1-C6烷基、2’-OR修饰、2’-氨基和吗啉代置换、及其等同物和其组合的修饰,在2’-OR修饰中,R为任选地被以下取代的C1-C6烷基:C1-C6烷氧基、乙酰胺、苯基或包含5元环或6元环和1个或2个选自N、O和S的杂原子的杂芳基。在一些实施方案中,第二修饰是2’-OR修饰、或吗啉代置换、或其组合。在一些实施方案中,第二修饰是2’-OR修饰。在一些实施方案中,第二修饰是2’-O-甲基修饰或2’-甲氧基乙氧基修饰。在一些实施方案中,第二修饰是2’-O-甲基修饰。在一些实施方案中,第二修饰是吗啉代置换。
在一些实施方案中,第一修饰是2’-F修饰或其立体异构体,并且第二修饰是2’-O-甲基修饰或2’-甲氧基乙氧基修饰。在一些实施方案中,第一修饰是2’-F修饰或其立体异构体,并且第二修饰是2’-O-甲基修饰。
在一些实施方案中,第三修饰是至少一个核苷酸的糖部分的2’-位置处选自2’-F修饰、2’-CN修饰、2’-N3修饰、2’-脱氧修饰及其等同物及其组合的修饰。在一些实施方案中,第三修饰是2’-F修饰、2’-CN修饰、2’-N3修饰或2’-脱氧修饰、或其立体异构体。在一些实施方案中,第三修饰是2’-F修饰、2’-CN修饰或2’-N3修饰、或其立体异构体。在一些实施方案中,第三修饰是2’-F修饰或其立体异构体。
在一些实施方案中,第四修饰是一个或更多个剩余核苷酸的糖部分的2’-位置处选自2’-C1-C6烷基、2’-OR修饰、2’-氨基和吗啉代置换、及其等同物和其组合的修饰,在2’-OR修饰中,R为任选地被以下取代的C1-C6烷基:C1-C6烷氧基、乙酰胺、苯基或包含5元环或6元环和1个或2个选自N、O和S的杂原子的杂芳基。在一些实施方案中,第四修饰是2’-OR修饰、或吗啉代置换、或其组合。在一些实施方案中,第四修饰是2’-OR修饰。在一些实施方案中,第四修饰是2’-O-甲基修饰或2’-甲氧基乙氧基修饰。在一些实施方案中,第四修饰是2’-O-甲基修饰。在一些实施方案中,第四修饰是吗啉代置换。
在一些实施方案中,第三修饰是2’-F修饰或其立体异构体,并且第四修饰是2’-O-甲基修饰或2’-甲氧基乙氧基修饰。在一些实施方案中,第三修饰是2’-F修饰或其立体异构体,并且第四修饰是2’-O-甲基修饰。
有义链
在包含有义链和反义链的本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,至少三个核苷酸被第一修饰修饰。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少三个核苷酸中的至少两个连续定位。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少三个核苷酸中的至少三个连续定位。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,在有义链中至少四个核苷酸被第一修饰修饰。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少四个核苷酸中的至少三个连续定位。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少四个核苷酸中的至少四个连续定位。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,在有义链中至少五个核苷酸被第一修饰修饰。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少五个核苷酸中的至少三个连续定位。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少五个核苷酸中的至少四个连续定位。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少三个核苷酸、至少四个核苷酸或至少五个核苷酸位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置10至位置15。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少三个核苷酸中的两个位于选自从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置10、11、12和13处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少三个核苷酸中的三个位于选自从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置10、11、12和13处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少三个核苷酸中的一个位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置11处。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少三个核苷酸中的三个位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置11、12和13处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少三个核苷酸中的三个位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置12、13和14处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少三个核苷酸中的三个位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置10、11和12处。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少四个核苷酸中的一个位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置10处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少四个核苷酸中的一个位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置11处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少四个核苷酸中的一个位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置12处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少四个核苷酸中的一个位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置13处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少四个核苷酸中的一个位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置14处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少四个核苷酸中的一个位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置15处。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少四个核苷酸位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置10、11、12和13处。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少五个核苷酸位于从与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸起位置10、11、12、13和15处。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含用第一修饰修饰的五个核苷酸,其中用第一修饰修饰的五个核苷酸位于与反义链的5’末端处的第一核苷酸互补的核苷酸的位置10、11、12、13和15处。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,用第一修饰修饰的至少三个核苷酸、至少四个核苷酸或至少五个核苷酸并非全部连续定位。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链中,该至少三个核苷酸、该至少四个核苷酸或该至少五个核苷酸用2’-F修饰修饰。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’(M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,有义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ ID NO: 37、39、49、55、56、58或389。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,有义链包含根据SEQ ID NO: 58的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 58的核苷酸序列,反义链包含根据SEQ IDNO: 24的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,有义链包含根据SEQ ID NO: 56的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 56的核苷酸序列,反义链包含根据SEQ IDNO: 22的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,有义链包含根据SEQ ID NO: 37的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 37的核苷酸序列,反义链包含根据SEQ IDNO: 3的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,有义链包含根据SEQ ID NO: 55的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 55的核苷酸序列,反义链包含根据SEQ IDNO: 21的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,有义链包含根据SEQ ID NO: 49的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 49的核苷酸序列,反义链包含根据SEQ IDNO: 15的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,有义链包含根据SEQ ID NO: 389的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 389的核苷酸序列,反义链包含根据SEQ IDNO: 6的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,有义链包含根据SEQ ID NO: 39的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):5’ (M)g(F)f(M)e(F)d(M)c(F)b(M)a 3’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f和g是0-16中的任一个,并且其中有义链是5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 39的核苷酸序列,反义链包含根据SEQ IDNO: 5的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的核苷酸位置1829至1849之间的区域相同的核苷酸序列,双链区域包含根据SEQ ID NO: 24 (5' UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5' AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3')的核酸序列的有义链。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的核苷酸位置1825至1845之间的区域相同的核苷酸序列,双链区域包含根据SEQ ID NO: 22 (5’ UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’ CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的核苷酸位置495至515之间的区域相同的核苷酸序列,双链区域包含根据SEQ ID NO: 3 (5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’ AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的核苷酸位置1822至1842之间的区域相同的核苷酸序列,双链区域包含根据SEQ ID NO: 21 (5’ UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’ AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的核苷酸位置1465至1485之间的区域相同的核苷酸序列,双链区域包含根据SEQ ID NO: 15 (5’ UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的核苷酸位置514至534之间的区域相同的核苷酸序列,双链区域包含根据SEQ ID NO: 6 (5’ UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 389 (5’ ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的核苷酸位置503至523之间的区域相同的核苷酸序列,双链区域包含根据SEQ ID NO: 5 (5’ UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’ GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链。
反义链
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,至多七个核苷酸被第三修饰修饰。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的至多四个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置2至位置8。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的至少一个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置2处。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的至多两个连续定位。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的至多两个连续定位的核苷酸位于从反义链5’末端处的第一核苷酸起的位置2和3处。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的至少一个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置14处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的两个或三个位于选自从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置2、3、5和6处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的三个位于选自从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置2、3、5和6处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的两个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置2和5处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的两个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置2和3处。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的三个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置2、3和5处。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的一个或两个位于选自从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置14和16处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的两个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置14和16处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,该至多七个核苷酸被2’-F修饰修饰。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的一个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置14处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的两个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置14和16处。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中反义链包含用第三修饰修饰的至多七个核苷酸,该至多七个核苷酸用2’-F修饰修饰。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的一个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置2处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的一个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置3处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的一个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置5处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的一个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置7处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的一个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置10处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的一个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置14处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸中的一个位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置16处。在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,用第三修饰修饰的至多七个核苷酸位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起的位置2、3、5、7、10、14和16处。
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链中,反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,反义链包含根据SEQ ID NO: 3、5、6、15、21、22或24中任一项的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 24的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 24的核苷酸序列,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 58的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 22的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 22的核苷酸序列,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 56的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 3的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 3的核苷酸序列,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 37的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 21的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 21的核苷酸序列,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 55的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 15的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 15的核苷酸序列,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 49的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 6的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 6的核苷酸序列,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 389的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 5的核苷酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸的反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸(“F”)和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸(“M”):3’(M)a(F)b(M)c(F)d(M)e(F)f(M)g(F)h(M)i(F)j(M)k(F)l(M)m(F)n(M)o 5’,其中M是2’-O-甲基修饰的核苷酸,F是2’-F修饰的核苷酸,并且a、b、c、d、e、f、g、h、i、j、k、l、m、n和o是0-16中的任一个,其中反义链是以下中的任一种:3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’,并且反义链包含根据SEQ ID NO: 5的核苷酸序列,并且有义链包含根据SEQ ID NO: 39的核苷酸序列。
靶向配体
在一些实施方案中,在本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链或反义链或两者中,末端或内部核苷酸连接至靶向配体。在一些实施方案中,靶向配体附接至本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链的5’末端处的一个或更多个核苷酸。在一些实施方案中,靶向配体附接至本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链的3’末端处的一个或更多个核苷酸。在一些实施方案中,靶向配体附接至本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链的5’末端处的一个或更多个核苷酸。在一些实施方案中,靶向配体附接至本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链的3’末端处的一个或更多个核苷酸。在一些实施方案中,靶向配体附接至本公开内容的分离的寡核苷酸的反义链的3’末端处至少两个单链核苷酸中的一个或更多个核苷酸。
在一些实施方案中,靶向配体选自糖类、肽、脂质、抗体或其片段、适配体、白蛋白、纤维蛋白原和叶酸中的一种或更多种。在一些实施方案中,靶向配体结合表达本公开内容的分离的寡核苷酸的靶mRNA的细胞上的表面蛋白。在一些实施方案中,靶向配体介导本公开内容的分离的寡核苷酸进入表达本公开内容的分离的寡核苷酸的靶mRNA的细胞。
在一些实施方案中,靶向配体是治疗性配体。在一些实施方案中,靶向配体是治疗性抗体。
在一些实施方案中,靶向配体通过接头附接至本公开内容的分离的寡核苷酸。在一些实施方案中,接头是蛋白质、DNA、RNA或化合物中的任一种。在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸、接头和靶向配体形成支架。如本文使用的,术语“支架”是指包含本公开内容的接头的化合物或复合物,其中接头共价附接至配体或分离的寡核苷酸或两者。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸、接头和靶向配体形成缀合物。如本文使用的,术语“缀合物”是指包含经由本公开内容的接头共价附接至配体的分离的寡核苷酸的化合物或复合物。
如本文使用的,术语“靶向配体”或“配体”是指当共价附接至寡核苷酸时,能够介导其进入或促进或允许其递送至靶位点(例如,靶细胞或组织)的部分。在一些实施方案中,靶向配体包含糖配体部分(例如,N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)),可以指导寡核苷酸摄取到肝中。
在一些实施方案中,靶向配体结合无唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)。在一些实施方案中,靶向配体结合(例如,通过ASGPR)肝,诸如肝的实质细胞。
合适的靶向配体包括但不限于Winkler (Ther. Deliv., 2013, 4(7): 791-809)、PCT专利申请公布第WO/2016/100401号、第WO/2012/089352号和第WO/2009/082607号,和美国专利申请公布第2009/0239814号、第2012/0136042号、第2013/0158824号和第2009/0247608号中公开的配体,这些申请中的每一项通过引用并入。
在一些实施方案中,靶向配体包含糖类部分。
如本文使用的,“糖类部分”是指包含一个或更多个单糖单元的部分,每个单糖单元具有至少六个碳原子(可以是线性的、支链的或环状的),其中氧原子、氮原子或硫原子与每个碳原子键合。在一些实施方案中,糖类部分包含单糖、二糖、三糖或四糖。在一些实施方案中,糖类部分包含含有来自约4-9个单糖单元的寡糖。在一些实施方案中,糖类部分包含多糖(例如,淀粉、糖原、纤维素或多糖胶)。
在一些实施方案中,糖类部分包含单糖、二糖、三糖或四糖。在一些实施方案中,糖类部分包含寡糖(例如,含有从约4个至约9个单糖单元)。在一些实施方案中,糖类部分包含多糖(例如,淀粉、糖原、纤维素或多糖胶)。
在一些实施方案中,配体能够结合人类无唾液酸糖蛋白受体(ASGPR),例如,人类无唾液酸糖蛋白受体2 (ASGPR2)。
在一些实施方案中,糖类部分包含糖(例如,一个、两个或三个糖)。在一些实施方案中,糖类部分包含半乳糖或其衍生物(例如,一个、两个或三个半乳糖或其衍生物)。在一些实施方案中,糖类部分包含N-乙酰半乳糖胺或其衍生物(例如,一个、两个或三个N-乙酰半乳糖胺或其衍生物)。在一些实施方案中,糖类部分包含N-乙酰基-D-半乳糖胺或其衍生物(例如,一个、两个或三个N-乙酰基-D-半乳糖胺或其衍生物)。
在一些实施方案中,糖类部分包含N-乙酰半乳糖胺(例如,一个、两个或三个N-乙酰半乳糖胺)。在一些实施方案中,糖类部分包含N-乙酰基-D-半乳糖胺(例如,一个、两个或三个N-乙酰基-D-半乳糖胺)。
在一些实施方案中,糖类部分包含甘露糖或其衍生物(例如,甘露糖-6-磷酸)。在一些实施方案中,糖类部分还包含将一个或更多个糖(例如,N-乙酰基-D-半乳糖胺)与接头相连的连接部分。
在一些实施方案中,接头包含硫醚(例如,硫代琥珀酰亚胺或其水解类似物)、二硫化物、三唑、硫代磷酸酯、磷酸二酯、酯、酰胺或其任何组合。在一些实施方案中,接头是三分支连接部分。合适的靶向配体包括但不限于PCT申请公布第WO/2015/006740号、第WO/2016/100401号、第WO/2017/214112号、第WO/2018/039364号和第WO/2018/045317号中公开的配体,其中的每一项通过引用并入本文。
在一些实施方案中,靶向配体包含脂质或脂质部分(例如,一个、两个或三个脂质部分)。在一些实施方案中,脂质部分包含(例如,一个、两个或三个) C8-C24脂肪酸、胆固醇、维生素、甾醇、磷脂或其任何组合。
在一些实施方案中,靶向配体包含肽或肽部分(例如,一个、两个或三个肽部分)。在一些实施方案中,肽部分包含(例如,一个、两个或三个)整联蛋白、胰岛素、胰高血糖素样肽或其任何组合。在一些实施方案中,靶向配体包含抗体或抗体部分(例如,转铁蛋白)。在一些实施方案中,靶向配体包含一个、两个或三个抗体部分(例如,转铁蛋白)。
在一些实施方案中,靶向配体包含寡核苷酸(例如,适配体或CpG)。在一些实施方案中,靶向配体包含一个、两个或三个寡核苷酸(例如,适配体或CpG)。
在一些实施方案中,配体包含:一个、两个或三个糖(例如,N-乙酰基-D-半乳糖胺);一个、两个或三个脂质部分;一个、两个或三个肽部分;一个、两个或三个抗体部分;一个、两个或三个寡核苷酸;或其任意组合。
在一些实施方案中,接头经由分离的寡核苷酸中的磷酸基团或磷酸基团的类似物附接至本公开内容的分离的寡核苷酸。
在一些实施方案中,配体包含糖配体部分(例如,N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)),该糖配体部分可以指导寡核苷酸摄取到肝中。
在一些实施方案中,配体包含GalNAc或其衍生物。在一些实施方案中,配体包含如下示出的GalNAc G1b结构。
GalNAc G1b
在一些实施方案中,配体包含三个GalNAc部分或其三个衍生物。在一些实施方案中,配体包含三个GalNAc G1b部分。在一些实施方案中,其中配体包含三个GalNAc G1b部分,GalNAc G1b部分是连续定位的。在一些实施方案中,连续定位的GalNAc G1b部分位于有义链的3’末端上。在一些实施方案中,其中配体包含连续定位的三个GalNAc G1b (“G1b”)部分,第一G1b部分连接至第二G1b部分,并且第二G1b连接至第三Glb部分。在一些实施方案中,第一GalNAc G1b部分连接至本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中配体包含三个GalNAcG1b (“G1b”)部分,其中第一GalNAc G1b部分连接至分离的寡核苷酸的有义链,第一GalNAcG1b部分还连接至第二GalNAc G1b部分,并且第二G1b连接至第三G1b部分。在一些实施方案中,其中配体包含三个GalNAc G1b部分,三个GalNAc G1b部分连续地位于有义链的3’末端上。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,分离的寡核苷酸与配体(例如,GalNAc G1b或三个GalNAc G1b部分)连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸经由分离的寡核苷酸的内部或末端核苷酸与配体连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸经由配体接头与配体连接。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中分离的寡核苷酸包含有义链和反义链,并且其中配体包含三个GalNAc G1b部分,并且三个GalNAc G1b部分连续地位于有义链的3’末端上,配体与分离的寡核苷酸的有义链上的末端核苷酸连接。在一些实施方案中,配体经由配体接头与有义链上的末端核苷酸连接。在一些实施方案中,配体接头是单价接头。在一些实施方案中,配体接头是二价接头。在一些实施方案中,配体接头是三价接头。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 495至534;b) 1465至1485;和c) 1822至1849,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,靶向配体附接至有义链的3’末端。在一些实施方案中,靶向配体包含三个GalNAc G1b部分。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 495至534;b) 1465至1485和c) 1822至1849,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,其中靶向配体包含附接至有义链的3’末端的三个GalNAc Glb部分,有义链包含根据SEQ ID NO: 37 (5’ AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA3’);SEQ ID NO: 39 (5’ GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’);SEQ ID NO: 49 (5’ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’);SEQ ID NO: 55 (5’ AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’);SEQ IDNO: 56 (5’ CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’);SEQ ID NO: 58 (5’ AAUUCCUGAAUUUUAUGACA3’);或SEQ ID NO: 389 (5’ ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列。
本公开内容的分离的寡核苷酸的3’末端处的连接可以直接经由5’、3’或2’羟基基团,或间接经由非核苷酸接头或核苷(利用核苷的2’或3’羟基位置)。连接也可以利用3’末端核苷酸的官能化糖或核碱基。在一些实施方案中,本文描述的配体可以通过各种配体接头附接至本公开内容的分离的寡核苷酸,所述配体接头可以是可裂解的或不可裂解的。
磷酸基团的修饰
修饰的末端磷酸基团
本公开内容还提供了用于核酸递送的含有修饰的磷酸基团(也称为磷酸模拟物或磷酸衍生物)的寡核苷酸和缀合物。本公开内容还涉及含有修饰的磷酸基团的寡核苷酸和缀合物,例如,在递送核酸和/或治疗或预防疾病中的用途。
在一些实施方案中,本公开内容提供了5’末端核苷酸的磷酸模拟物。不希望受理论束缚,应理解的是,当掺入寡核苷酸中(例如,在反义链的5’末端处)时,磷酸模拟物可以改善Ago2结合/负载并增强寡核苷酸的代谢稳定性,从而增强分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的效力和持续时间。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,寡核苷酸包含5’末端核苷酸修饰。在一些实施方案中,5’末端修饰提供了磷酸基团的功能效应,但在施用于受试者时寡核苷酸将暴露于的环境条件中更稳定。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含对磷酸酶和其他酶更具抗性的磷酸模拟物,同时最小化对寡核苷酸的功能的负面影响(例如,当用作RNAi抑制剂分子时,最小化基因靶敲低中的任何降低)。
在一些实施方案中,5’末端修饰是化学修饰。在一些实施方案中,化学修饰增强了针对降解或干扰分离的寡核苷酸的结构或活性的核酸酶或其他酶的稳定性。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链或反义链包含5’末端磷酸基团。在一些实施方案中,5’末端磷酸基团包含具有下式的未修饰的磷酸:-O-P(=O)(OH)OH。在一些实施方案中,5’末端磷酸基团包含修饰的磷酸。在一些实施方案中,5’末端磷酸基团包含具有式-CH2-P(=X)(OR1)OR2的修饰的磷酸,其中X为O或S,R1为H或C1-C6烷基,并且R2为H或C1-C6烷基。在一些实施方案中,修饰的磷酸被称为“磷酸模拟物”。
如本文使用的,术语“卤素(halo)”或“卤素(halogen)”是指氟、氯、溴和碘。
如本文使用的,术语“芳基”包括具有芳香性(包括“共轭”)的基团或具有一个或更多个芳族环的多环体系,并且在环结构中不包含任何杂原子。术语芳基包括单价种类和二价种类两者。芳基基团的实例包括但不限于苯基、联苯基、萘基等。方便地,芳基是苯基。
如本文使用的,术语“烷基”或“C1-C6烷基”旨在包括C1、C2、C3、C4、C5或C6直链(线性)饱和脂肪烃基团和C3、C4、C5或C6支链饱和脂肪烃基团。例如,C1-C6烷基旨在包括C1、C2、C3、C4、C5和C6烷基基团。烷基的实例包括具有1个至6个碳原子的部分,诸如但不限于甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基、异戊基或正己基。在一些实施方案中,直链或支链烷基具有六个或更少的碳原子(例如,对于直链为C1-C6,对于支链为C3-C6),并且在另一种实施方案中,直链或支链烷基具有四个或更少的碳原子。在一些实施方案中,直链烷基具有一个碳原子。在一些实施方案中,直链烷基具有两个碳原子。
在一些实施方案中,磷酸模拟物连接至分离的寡核苷酸(例如,siRNA)的5’末端,如下式中示出:
其中:
B是H或核碱基部分;
X是O或S;
R1是H或C1-C6烷基;
R2是H或C1-C6烷基;
Y1是O或S;
Y2是O或S;
Z是H、卤素或-ORZ
RZ是H、C1-C6烷基或-(C1-C6烷基)-(C6-C10芳基),其中C1-C6烷基或-(C1-C6烷基)-(C6-C10芳基)任选地被一个或更多个RZa取代;
每个RZa独立地是卤素、C1-C6烷基或-O-(C1-C6烷基),其中C1-C6烷基或-O-(C1-C6烷基)任选地被一个或更多个卤素取代;和
表明与分离的寡核苷酸(例如,siRNA)的核苷酸的附接。
在一些实施方案中,磷酸模拟物连接至分离的寡核苷酸(例如,siRNA)的5’末端,如下式中示出:
其中:
B是H或核碱基部分;
X是O或S;
R1是H或C1-C6烷基;
R2是H或C1-C6烷基;
Y1是O或S;
Y2是O或S;和
表明与分离的寡核苷酸(例如,siRNA)的核苷酸的附接。
在一些实施方案中,磷酸模拟物连接至分离的寡核苷酸(例如,siRNA)的5’末端,如下式中示出:
其中:
B是H或核碱基部分;
X是O或S;
R1是H或C1-C6烷基;
R2是H或C1-C6烷基;和
表明与分离的寡核苷酸(例如,siRNA)的核苷酸的附接。
在一些实施方案中,X是O。
在一些实施方案中,X是S。
在一些实施方案中,R1是H。
在一些实施方案中,R1是C1-C6烷基(例如,甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)。
在一些实施方案中,R1是甲基。
在一些实施方案中,R2是H。
在一些实施方案中,R2是C1-C6烷基(例如,甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)。
在一些实施方案中,R2是甲基。
在一些实施方案中,Y1是O。
在一些实施方案中,Y1是S。
在一些实施方案中,Y2是O。
在一些实施方案中,Y2是S。
在一些实施方案中,Z是H。
在一些实施方案中,Z不是H。
在一些实施方案中,Z是卤素(例如,F、Cl、Br或I)。
在一些实施方案中,Z是F或Cl。
在一些实施方案中,Z是F。
在一些实施方案中,Z是-ORZ
在一些实施方案中,Z是-OH。
在一些实施方案中,Z不是-OH。
在一些实施方案中,Z是-O-(C1-C6烷基)(例如,其中C1-C6烷基是甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)。
在一些实施方案中,Z是-OCH3
在一些实施方案中,Z是-O-(C1-C6烷基)-O-(C1-C6烷基)(例如,其中C1-C6烷基是甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)。
在一些实施方案中,Z是-OCH2CH2OCH3
在一些实施方案中,Z是任选地被一个或更多个RZa取代的-O-(C1-C6烷基)-(C6-C10芳基)。
在一些实施方案中,Z是-O-(C1-C6烷基)-(C6-C10芳基)。
在一些实施方案中,Z是
在一些实施方案中,Z是任选地被一个或更多个RZa取代的
在一些实施方案中,Z是任选地被一个或更多个卤素取代的
在一些实施方案中,Z是任选地被一个或更多个C1-C6烷基或-O-(C1-C6烷基)取代的,其中C1-C6烷基或-O-(C1-C6烷基)任选地被一个或更多个卤素取代。
在一些实施方案中,RZ是H。
在一些实施方案中,RZ不是H。
在一些实施方案中,RZ是任选地被一个或更多个RZa取代的C1-C6烷基(例如,甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)。
在一些实施方案中,RZ是任选地被一个或更多个卤素(例如,F、Cl、Br或I)取代的C1-C6烷基(例如,甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基),或任选地被一个或更多个卤素取代的-O-(C1-C6烷基)(例如,其中C1-C6烷基是甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)。
在一些实施方案中,RZ是C1-C6烷基(例如,甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)。
在一些实施方案中,RZ是甲基、乙基或丙基。
在一些实施方案中,RZ是甲基。
在一些实施方案中,RZ是被一个或更多个卤素(例如,F、Cl、Br或I)取代的C1-C6烷基(例如,甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)。
在一些实施方案中,RZ是被一个或更多个-O-(C1-C6烷基)(例如,其中C1-C6烷基是甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)取代的C1-C6烷基(例如,甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基),其中-O-(C1-C6烷基)任选地被一个或更多个卤素取代。
在一些实施方案中,RZ是任选地被一个或更多个RZa取代的-(C1-C6烷基)-(C6-C10芳基)。
在一些实施方案中,RZ是任选地被一个或更多个卤素(例如,F、Cl、Br或I)取代的-(C1-C6烷基)-(C6-C10芳基)、C1-C6烷基(例如,甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)或-O-(C1-C6烷基)(例如,其中C1-C6烷基是甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基),其中C1-C6烷基或-O-(C1-C6烷基)任选地被一个或更多个卤素取代。
在一些实施方案中,RZ是-(C1-C6烷基)-(C6-C10芳基)。
在一些实施方案中,至少一个RZa是卤素(例如,F、Cl、Br或I)。
在一些实施方案中,至少一个RZa是F或Cl。
在一些实施方案中,至少一个RZa是任选地被一个或更多个卤素(例如,F、Cl、Br或I)取代的C1-C6烷基(例如,甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)。
在一些实施方案中,至少一个RZa是C1-C6烷基(例如,甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)。
在一些实施方案中,至少一个RZa是被一个或更多个卤素(例如,F、Cl、Br或I)取代的C1-C6烷基(例如,甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基或己基)。
在一些实施方案中,至少一个RZa是任选地被一个或更多个卤素(例如,F、Cl、Br或I)取代的-O-(C1-C6烷基)。
在一些实施方案中,至少一个RZa是-O-(C1-C6烷基)。
在一些实施方案中,至少一个RZa是被一个或更多个卤素(例如,F、Cl、Br或I)取代的-O-(C1-C6烷基)。
在一些实施方案中,B是H。
在一些实施方案中,B是核碱基部分。
如本文使用的,术语“核碱基部分”是指附接,例如,经由核碱基的原子或其官能团附接至本公开内容的分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的其余部分的核碱基。
在一些实施方案中,核碱基部分是腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)。
在一些实施方案中,核碱基部分是尿嘧啶(U)。
在一些实施方案中,磷酸模拟物连接至分离的寡核苷酸的5’末端,如下式中示出:
其中:
B是核碱基部分,其中核碱基部分是尿嘧啶(U),其中尿嘧啶在从有义链的5’末端起的位置1处或在从反义链的5’末端起的位置1处;
X是O;
R1是C1烷基;
R2是H;和
表明与分离的寡核苷酸(例如,siRNA)的核苷酸的附接。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,磷酸模拟物附接至分离的寡核苷酸的反义链的5’末端。
在一些实施方案中,磷酸模拟物附接至分离的寡核苷酸的反义链的5’末端尿苷,具有以下结构(5’-MeEPmU)。
5’-MeEPmU,
其中“mU”是2’-O-甲基修饰的尿苷核苷酸,并且“MeEP”是单甲基保护的磷酸模拟物。
在一些实施方案中,磷酸模拟物附接至分离的寡核苷酸的反义链的5’末端尿苷,具有以下结构(5’-MeEPmUs)。
5’-MeEPmUs,
其中“mU”是2’-O-甲基修饰的尿苷核苷酸,“MeEP”是单甲基保护的磷酸模拟物,并且“s”是硫代磷酸酯核苷酸间连接。
在一些实施方案中,磷酸模拟物附接至分离的寡核苷酸的反义链的5’末端尿苷,具有以下结构(5’-EPmUs)。
5’-EPmUs,
其中“mU”是2’-O-甲基修饰的尿苷核苷酸,“EP”是磷酸模拟物,并且“s”是硫代磷酸酯核苷酸间连接。
术语“5’-MeEP”、“5’ - MeEP”和“5’ MeEP”在本文中可互换地使用。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 495至534;b) 1465至1485;和c) 1822至1849,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,反义链包含单甲基保护的磷酸模拟物(MeEP)。在一些实施方案中,MeEP连接至反义链的5’末端(5’-MeEP)。
在一些实施方案中,其中MeEP连接至反义链的5’末端,磷酸模拟物附接至反义链的5’末端尿苷。
在一些实施方案中,5’末端尿苷是2’-O-甲基修饰的核苷酸。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 495至534;b) 1465至1485和c) 1822至1849,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,其中反义链包含连接至反义链的5’末端的5’-MeEP,反义链包含根据SEQ ID NO: 3 (5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’);SEQ IDNO: 5 (5’ UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’);SEQ ID NO: 6 (5’ UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG3’);SEQ ID NO: 15 (5’ UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’);SEQ ID NO: 21 (5’UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’);SEQ ID NO: 22 (5’ UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’);或SEQID NO: 24 (5’ UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:a) 495至534;b) 1465至1485和c) 1822至1849,并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域,其中反义链包含连接至反义链的5’末端的5’-MeEP,有义链包含靶向配体,所述靶向配体包含三个附接至有义链的3’末端的GalNAc G1b部分。
修饰的主链磷酸/磷酸二酯键
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链或反义链或两者包含至少一个具有修饰的磷酸主链的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链包含至少一个具有修饰的磷酸主链的核苷酸。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的反义链包含至少一个具有修饰的磷酸主链的核苷酸。在一些实施方案中,其中本公开内容的分离的寡核苷酸包含修饰的磷酸主链,该修饰的磷酸主链包含修饰的磷酸二酯键。磷酸二酯键包含具有下式的连接:,其中表示与本公开内容的分离的寡核苷酸中的第一核苷酸的3’碳的附接;并且表示与本公开内容的分离的寡核苷酸中的第二核苷酸的5’碳的附接。在一些实施方案中,磷酸二酯键是未修饰的,其中Z1是O并且Z2是OH或O。在一些实施方案中,磷酸二酯键是修饰的,其中Z1是O、S、NH或N(C1-C6烷基)并且Z2是OH、SH、NH2、NH(C1-C6烷基)、O、S、HN或(C1-C6烷基)N,并且其中当Z1是O时,Z2不是OH或O
在一些实施方案中,Z1是O。
在一些实施方案中,Z1是S。
在一些实施方案中,Z1是NH。
在一些实施方案中,Z1是N(C1-C6烷基)。
在一些实施方案中,Z2是OH。
在一些实施方案中,Z2是SH。
在一些实施方案中,Z2是NH2
在一些实施方案中,Z2是NH(C1-C6烷基)。
在一些实施方案中,Z2是SH、NH2或NH(C1-C6烷基)。
在一些实施方案中,Z2是O
在一些实施方案中,Z2是S
在一些实施方案中,Z2是HN
在一些实施方案中,Z2是(C1-C6烷基)N
在一些实施方案中,Z2是S、HN或(C1-C6烷基)N
在一些实施方案中,Z1是O并且Z2是SH。
在一些实施方案中,Z1是O并且Z2是NH2
在一些实施方案中,Z1是O并且Z2是NH(C1-C6烷基)。
在一些实施方案中,Z1是S并且Z2是OH。
在一些实施方案中,Z1是S并且Z2是SH。
在一些实施方案中,Z1是S并且Z2是NH2
在一些实施方案中,Z1是S并且Z2是NH(C1-C6烷基)。
在一些实施方案中,Z1是NH并且Z2是OH。
在一些实施方案中,Z1是NH并且Z2是SH。
在一些实施方案中,Z1是NH并且Z2是NH2
在一些实施方案中,Z1是NH并且Z2是NH(C1-C6烷基)。
在一些实施方案中,Z1是N(C1-C6烷基)并且Z2是OH。
在一些实施方案中,Z1是N(C1-C6烷基)并且Z2是SH。
在一些实施方案中,Z1是N(C1-C6烷基)并且Z2是NH2
在一些实施方案中,Z1是N(C1-C6烷基)并且Z2是NH(C1-C6烷基)。
在一些实施方案中,Z1是O并且Z2是S
在一些实施方案中,Z1是O并且Z2是HN
在一些实施方案中,Z1是O并且Z2是(C1-C6烷基)N
在一些实施方案中,Z1是S并且Z2是O
在一些实施方案中,Z1是S并且Z2是S
在一些实施方案中,Z1是S并且Z2是HN
在一些实施方案中,Z1是S并且Z2是(C1-C6烷基)N
在一些实施方案中,Z1是NH并且Z2是O
在一些实施方案中,Z1是NH并且Z2是S
在一些实施方案中,Z1是NH并且Z2是HN
在一些实施方案中,Z1是NH并且Z2是(C1-C6烷基)N
在一些实施方案中,Z1是N(C1-C6烷基)并且Z2是O
在一些实施方案中,Z1是N(C1-C6烷基)并且Z2是S
在一些实施方案中,Z1是N(C1-C6烷基)并且Z2是HN
在一些实施方案中,Z1是N(C1-C6烷基)并且Z2是(C1-C6烷基)N
在一些实施方案中,修饰的磷酸二酯键包含硫代磷酸酯核苷酸间连接。
在一些实施方案中,修饰的磷酸二酯键包含,其中表示与本公开内容的分离的寡核苷酸中的第一核苷酸的3’碳的附接;并且表示与本公开内容的分离的寡核苷酸中的第二核苷酸的5’碳的附接。
在一些实施方案中,修饰的磷酸二酯键包含,其中表示与本公开内容的分离的寡核苷酸中的第一核苷酸的3’碳的附接;并且表示与本公开内容的分离的寡核苷酸中的第二核苷酸的5’碳的附接。
在一些实施方案中,修饰的磷酸二酯键包含,其中表示与本公开内容的分离的寡核苷酸中的第一核苷酸的3’碳的附接;并且表示与本公开内容的分离的寡核苷酸中的第二核苷酸的5’碳的附接。
在一些实施方案中,本公开内容的分离的寡核苷酸包含至少一个修饰的磷酸二酯键。在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链或反义链或两者包含一个或更多个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,仅有义链包含一个或更多个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,仅反义链包含一个或更多个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,有义链和反义链两者均包含一个或更多个修饰的磷酸二酯键。
在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少两个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少三个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少四个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少五个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少六个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少七个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少八个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少九个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十一个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十二个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十三个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十四个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十五个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十六个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十七个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十八个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十九个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少二十个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含超过二十个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含二十个和三十个之间修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含三十个和四十个之间修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含四十个和五十个之间修饰的磷酸二酯键。
在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少两个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少三个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少四个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少五个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少六个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少七个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少八个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少九个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十一个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十二个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十三个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十四个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十五个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十六个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十七个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十八个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少十九个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含至少二十个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含多于二十个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含二十个和三十个之间硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含三十个和四十个之间硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸包含四十个和五十个之间硫代磷酸酯核苷酸间连接。
在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少一个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少两个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少三个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少四个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少五个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少六个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少七个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少八个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少九个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十一个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十二个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十三个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十四个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十五个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十六个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十七个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十八个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十九个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少二十个修饰的磷酸二酯键。
在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少一个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少两个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少三个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少四个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少五个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少六个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少七个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少八个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少九个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十一个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十二个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十三个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十四个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十五个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十六个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十七个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十八个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少十九个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链各自包含至少二十个硫代磷酸酯核苷酸间连接。
在一些实施方案中,修饰的磷酸二酯键连续地位于有义链或反义链或两者上。在一些实施方案中,一些但不是全部修饰的磷酸二酯键连续地位于有义链或反义链或两者上。在一些实施方案中,修饰的磷酸二酯键不连续地位于有义链或反义链或两者上。
在本公开内容内设想的是分离的寡核苷酸,其中有义链或反义链上的任何磷酸二酯键可以被修饰。在一些实施方案中,反义链上的任何磷酸二酯键可以被修饰。在一些实施方案中,反义链上的任何磷酸二酯键可以被修饰。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链包含一个和二十个之间、一个和十五个之间、一个和十个之间、一个和五个之间或少于五个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,一个和二十个之间、一个和十五个之间、一个和十个之间、一个和五个之间或少于五个修饰的磷酸二酯键包含硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,反义链包含少于五个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,反义链包含一个、两个、三个或四个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,其中反义链包含一个、两个、三个或四个修饰的磷酸二酯键,该一个、两个、三个或四个修饰的磷酸二酯键包含硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,反义链包含四个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,其中反义链包含四个修饰的磷酸二酯键,修饰的磷酸二酯键包含硫代磷酸酯。
在一些实施方案中,其中反义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个硫代磷酸酯核苷酸间连接,硫代磷酸酯核苷酸间连接从反义链的5’末端处的第一核苷酸起位置1和位置2处的核苷酸。在一些实施方案中,其中反义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个硫代磷酸酯核苷酸间键,硫代磷酸酯核苷酸间连接从反义链的5’末端处的第一核苷酸起位置2和位置3处的核苷酸。在一些实施方案中,其中反义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个硫代磷酸酯核苷酸间键,硫代磷酸酯核苷酸间连接从反义链的5’末端处的第一核苷酸起位置20和位置21处的核苷酸。在一些实施方案中,其中反义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个硫代磷酸酯核苷酸间键,硫代磷酸酯核苷酸间连接从反义链的5’末端处的第一核苷酸起位置21和位置22处的核苷酸。在一些实施方案中,其中反义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个修饰的磷酸二酯键,其中修饰的磷酸二酯键包含硫代磷酸酯核苷酸间连接,硫代磷酸酯核苷酸间连接位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起位置1和位置2、位置2和位置3、位置20和位置21以及位置21和位置22处的核苷酸之间。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中反义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个硫代磷酸酯核苷酸间连接,硫代磷酸酯核苷酸间连接位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起位置1至位置3处的核苷酸和位置20至位置22处的核苷酸之间。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中反义链包含至少四个硫代磷酸酯核苷酸间连接,硫代磷酸酯核苷酸间连接位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起位置1至位置3处的核苷酸和位置20至位置22处的核苷酸之间。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链包含四个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,其中反义链包含四个硫代磷酸酯核苷酸间连接,硫代磷酸酯核苷酸间连接位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起位置1至位置3处的核苷酸和位置20至位置22处的核苷酸之间。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含一个和二十个之间、一个和十五个之间、一个和十个之间、一个和五个之间或少于五个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,一个和二十个之间、一个和十五个之间、一个和十个之间、一个和五个之间或少于五个修饰的磷酸二酯键包含硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,有义链包含少于五个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,其中有义链包含少于五个修饰的磷酸二酯键,有义链包含一个、两个、三个或四个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,其中有义链包含一个、两个、三个或四个修饰的磷酸二酯键,该一个、两个、三个或四个修饰的磷酸二酯键包含硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,有义链包含四个修饰的磷酸二酯键。在一些实施方案中,其中有义链包含四个修饰的磷酸二酯键,修饰的磷酸二酯键包含硫代磷酸酯核苷酸间连接。
在一些实施方案中,其中有义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个修饰的磷酸二酯键,磷酸二酯键包含硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,其中有义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个硫代磷酸酯核苷酸间连接,硫代磷酸酯核苷酸间连接从有义链的5’末端处的第一核苷酸起位置1和位置2处的核苷酸。在一些实施方案中,其中有义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个硫代磷酸酯核苷酸间连接,硫代磷酸酯核苷酸间连接从有义链的5’末端处的第一核苷酸起位置2和位置3处的核苷酸。在一些实施方案中,其中有义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个硫代磷酸酯核苷酸间连接,硫代磷酸酯核苷酸间连接从有义链的5’末端处的第一核苷酸起位置18和位置19处的核苷酸。在一些实施方案中,其中有义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个硫代磷酸酯核苷酸间连接,硫代磷酸酯核苷酸间连接从有义链的5’末端处的第一核苷酸起位置19和位置20处的核苷酸。在一些实施方案中,其中有义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个修饰的磷酸二酯键,其中修饰的磷酸二酯键包含硫代磷酸酯核苷酸间连接,硫代磷酸酯核苷酸间连接位于从有义链的5’末端处的第一核苷酸起位置1和位置2、位置2和位置3、位置18和位置19以及位置19和位置20处的核苷酸之间。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含至少一个、至少两个、至少三个或至少四个硫代磷酸酯核苷酸间连接,硫代磷酸酯核苷酸间连接位于从有义链的5’末端处的第一核苷酸起位置1至位置3处的核苷酸和位置18至位置20处的核苷酸之间。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含至少四个硫代磷酸酯核苷酸间连接,至少四个硫代磷酸酯核苷酸间连接位于从有义链的5’末端处的第一核苷酸起位置1至位置3处的核苷酸和位置18至位置20处的核苷酸之间。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,有义链包含四个硫代磷酸酯核苷酸间连接。在一些实施方案中,其中有义链包含四个硫代磷酸酯核苷酸间连接,硫代磷酸酯核苷酸间连接位于从有义链的5’末端处的第一核苷酸起位置1至位置3处的核苷酸和位置18至位置20处的核苷酸之间。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中反义链和有义链包含四个硫代磷酸酯核苷酸间连接,反义链包含位于从反义链的5’末端处的第一核苷酸起位置1至位置3处的核苷酸和位置20至位置22处的核苷酸之间的硫代磷酸酯核苷酸间连接,并且有义链包含位于从有义链的5’末端处的第一核苷酸起位置1至位置3处的核苷酸和位置18至位置20处的核苷酸之间的硫代磷酸酯核苷酸间连接。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,反义链包含以下中的任一个:i)根据SEQ ID NO: 370 (5’ [MeEPmUs][fGs][fU][mC][fA][mU][fA][mA][mA][fA][mU][mU][mC][fA][mG][fG][mA][mA][mU][mUs][mCs][mC] 3’)的核酸序列的反义链;
ii)根据SEQ ID NO: 371 (5’ [MeEPmUs][fUs][fA][mA][fA][mA][fU][mU][mC][fA][mG][mG][mA][fA][mU][fU][mC][mC][mU][mGs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链;
iii)根据SEQ ID NO: 372 (5’ [MeEPmUs][fGs][fG][mA][fA][mA][fG][mA][mG][fA][mU][mC][mU][fC][mA][fU][mC][mA][mC][mUs][mCs][mA] 3’)的核酸序列的反义链;
iv)根据SEQ ID NO: 373 (5’ [MeEPmUs][fAs][fA][mU][fU][mC][fA][mG][mG][fA][mA][mU][mU][fC][mC][fU][mG][mC][mU][mUs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链;
v)根据SEQ ID NO: 374 (5’ [MeEPmUs][fAs][fA][mC][fA][mC][fA][mU][mG][fU][mU][mG][mC][fU][mC][fA][mU][mU][mG][mUs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链;
vi)根据SEQ ID NO: 375 (5’ [MeEPmUs][fGs][fU][mG][fU][mA][fA][mC][mC][fG][mU][mC][mA][fU][mA][fG][mC][mA][mG][mUs][mGs][mG] 3’)的核酸序列的反义链;
vii)根据SEQ ID NO: 376 (5’ [MeEPmUs][fAs][fU][mA][fG][mC][fA][mG][mU][fG][mG][mA][mA][fA][mG][fA][mG][mA][mU][mCs][mUs][mC] 3’)的核酸序列的反义链;
viii)根据SEQ ID NO: 377 (5’ [mUs][fGs][fU][mC][fA][mU][fA][mA][mA][fA][mU][mU][mC][fA][mG][fG][mA][mA][mU][mUs][mCs][mC] 3’)的核酸序列的反义链;
ix)根据SEQ ID NO: 378 (5’ [MeEPmUs][fUs][fA][mA][fA][mA][fU][mU][mC][fA][mG][mG][mA][fA][mU][fU][mC][mC][mU][mGs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链;或
x)根据SEQ ID NO: 379 (5’ [mUs][fGs][fG][mA][fA][mA][fG][mA][mG][fA][mU][mC][mU][fC][mA][fU][mC][mA][mC][mUs][mCs][mA] 3’)的核酸序列的反义链,其中“m”是2’-O-甲基修饰的核苷酸,“f”是2’-F修饰的核苷酸,“s”是硫代磷酸酯核苷酸间连接,“MeEP”是单甲基保护的磷酸模拟物。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,其中有义链包含以下中的任一个:
i)根据SEQ ID NO: 381 (5’ [mAs][mAs][mU][mU][mC][fC][mU][fG][fA][fA][fU][mU][mU][mU][mA][mU][mG][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 382 (5’ [mCs][mAs][mG][mG][mA][fA][mU][fU][fC][fC][fU][mG][mA][mA][mU][mU][mU][mUs][mAs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 383 (5’ [mAs][mGs][mU][mG][mA][fU][mG][fA][fG][fA][fU][mC][mU][mC][mU][mU][mU][mCs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 384 (5’ [mAs][mAs][mG][mC][mA][fG][mG][fA][fA][fU][fU][mC][mC][mU][mG][mA][mA][mUs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 385 (5’ [mAs][mCs][mA][mA][mU][fG][mA][fG][fC][fA][fA][mC][mA][mU][mG][mU][mG][mUs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 386 (5’ [mAs][mCs][mU][mG][mC][fU][mA][fU][fG][fA][fC][mG][mG][mU][mU][mA][mC][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;或
vii)根据SEQ ID NO: 387 (5’ [mGs][mAs][mU][mC][mU][fC][mU][fU][fU][fC][fC][mA][mC][mU][mG][mC][mU][mAs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链,其中“m”是2’-O-甲基修饰的核苷酸,“f”是2’-F修饰的核苷酸,“s”是硫代磷酸酯核苷酸间连接,并且“G1b”是GalNac G1b部分。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,选自:
i)根据SEQ ID NO: 370 (5’ [MeEPmUs][fGs][fU][mC][fA][mU][fA][mA][mA][fA][mU][mU][mC][fA][mG][fG][mA][mA][mU][mUs][mCs][mC] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 381 (5’ [mAs][mAs][mU][mU][mC][fC][mU][fG][fA][fA][fU][mU][mU][mU][mA][mU][mG][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 371 (5’ [MeEPmUs][fUs][fA][mA][fA][mA][fU][mU][mC][fA][mG][mG][mA][fA][mU][fU][mC][mC][mU][mGs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 382 (5’ [mCs][mAs][mG][mG][mA][fA][mU][fU][fC][fC][fU][mG][mA][mA][mU][mU][mU][mUs][mAs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 372 (5’ [MeEPmUs][fGs][fG][mA][fA][mA][fG][mA][mG][fA][mU][mC][mU][fC][mA][fU][mC][mA][mC][mUs][mCs][mA] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 383 (5’ [mAs][mGs][mU][mG][mA][fU][mG][fA][fG][fA][fU][mC][mU][mC][mU][mU][mU][mCs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 373 (5’ [MeEPmUs][fAs][fA][mU][fU][mC][fA][mG][mG][fA][mA][mU][mU][fC][mC][fU][mG][mC][mU][mUs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 384 (5’ [mAs][mAs][mG][mC][mA][fG][mG][fA][fA][fU][fU][mC][mC][mU][mG][mA][mA][mUs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 374 (5’ [MeEPmUs][fAs][fA][mC][fA][mC][fA][mU][mG][fU][mU][mG][mC][fU][mC][fA][mU][mU][mG][mUs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 385 (5’ [mAs][mCs][mA][mA][mU][fG][mA][fG][fC][fA][fA][mC][mA][mU][mG][mU][mG][mUs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 375 (5’ [MeEPmUs][fGs][fU][mG][fU][mA][fA][mC][mC][fG][mU][mC][mA][fU][mA][fG][mC][mA][mG][mUs][mGs][mG] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 386 (5’ [mAs][mCs][mU][mG][mC][fU][mA][fU][fG][fA][fC][mG][mG][mU][mU][mA][mC][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 376 (5’ [MeEPmUs][fAs][fU][mA][fG][mC][fA][mG][mU][fG][mG][mA][mA][fA][mG][fA][mG][mA][mU][mCs][mUs][mC] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 387 (5’ [mGs][mAs][mU][mC][mU][fC][mU][fU][fU][fC][fC][mA][mC][mU][mG][mC][mU][mAs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 377 (5’ [mUs][fGs][fU][mC][fA][mU][fA][mA][mA][fA][mU][mU][mC][fA][mG][fG][mA][mA][mU][mUs][mCs][mC] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 381 (5’ [mAs][mAs][mU][mU][mC][fC][mU][fG][fA][fA][fU][mU][mU][mU][mA][mU][mG][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 378 (5’ [mUs][fUs][fA][mA][fA][mA][fU][mU][mC][fA][mG][mG][mA][fA][mU][fU][mC][mC][mU][mGs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 382 (5’ [mCs][mAs][mG][mG][mA][fA][mU][fU][fC][fC][fU][mG][mA][mA][mU][mU][mU][mUs][mAs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;或
x)根据SEQ ID NO: 379 (5’ [mUs][fGs][fG][mA][fA][mA][fG][mA][mG][fA][mU][mC][mU][fC][mA][fU][mC][mA][mC][mUs][mCs][mA] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 383 (5’ [mAs][mGs][mU][mG][mA][fU][mG][fA][fG][fA][fU][mC][mU][mC][mU][mU][mU][mCs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链,其中“m”是2’-O-甲基修饰的核苷酸,“f”是2’-F修饰的核苷酸,“s”是硫代磷酸酯核苷酸间连接,“MeEP”是单甲基保护的磷酸模拟物,并且“G1b”是GalNAc G1b部分。
核酸和载体
本公开内容还提供了编码至少一种本文公开的分离的寡核苷酸的载体。在一些实施方案中,载体是质粒、黏粒或病毒载体中的任一种。在一些实施方案中,载体是腺病毒载体。在一些实施方案中,载体是慢病毒载体。在一些实施方案中,质粒是表达质粒。在一些实施方案中,载体编码本文公开的一种分离的寡核苷酸。在一些实施方案中,载体编码多于一种本文公开的分离的寡核苷酸。在一些实施方案中,载体编码两种、三种、四种或五种本文公开的分离的寡核苷酸。在一些实施方案中,载体编码多于五种本文公开的分离的寡核苷酸。
本公开内容提供了包含编码本文描述的靶向CFB的分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的序列的核酸。
在一些实施方案中,核酸是核糖核酸(RNA)。在一些实施方案中,核酸是脱氧核糖核酸(DNA)。DNA可以是载体或质粒,例如,表达载体。
“载体”是用于将核酸克隆和/或转移到细胞中的任何核酸分子。载体可以是复制子,另一个核苷酸序列可以附接至其上以允许附接的核苷酸序列的复制。“复制子”可以是起核酸体内复制的自主单位的作用,即,能够在其自身控制下复制的任何遗传元件(例如,质粒、噬菌体、黏粒、染色体、病毒基因组)。术语“载体”包括用于在体外、离体和/或体内将核酸引入细胞中的病毒和非病毒(例如,质粒)两者的核酸分子。本领域已知的大量载体可用于操纵核酸、将响应元件和启动子掺入基因等。例如,将对应于响应元件和启动子的核酸片段插入到合适的载体中可以通过将适当的核酸片段连接到具有互补黏性末端的所选载体中来完成。可选地,核酸分子的末端可以酶促修饰,或者可以通过将核苷酸序列(接头)连接至核酸末端来产生任何位点。这样的载体可以被工程化以含有编码选择性标志物的序列,所述选择性标志物提供含有载体和/或已经将载体的核酸掺入细胞基因组中的细胞的选择。这样的标志物允许掺入和表达由标志物编码的蛋白质的宿主细胞的鉴定和/或选择。“重组”载体是指包含一个或更多个异源核苷酸序列(即,转基因),例如,两个、三个、四个、五个或更多个异源核苷酸序列的病毒载体或非病毒载体。
多核苷酸编码序列的术语“表达(express)”或“表达(expression)”意指该序列被转录,并且任选地被翻译。通常,根据本公开内容,本公开内容的编码序列的表达将导致本公开内容的多肽的产生。完整的表达多肽或片段也可以在完整的细胞中不经纯化发挥作用。
在一些实施方案中,载体是用于制造本公开内容的siRNA的表达载体。示例性表达载体可以包含在合适的用于转录的启动子的控制下编码本公开内容的分离的寡核苷酸的有义链和/或反义链的序列。干扰RNA可以从本领域普通技术人员已知的多种真核启动子表达,包括pol III启动子,诸如U6或H1启动子,或pol II启动子,诸如巨细胞病毒启动子。本领域中的技术人员将认识到,这些启动子也可以适于允许干扰RNA的诱导型表达。
本公开内容的分离的寡核苷酸(例如,dsRNA和siRNA)可以从质粒或病毒表达载体,或从最小表达盒(例如,PCR产生的包含一个或更多个启动子和用于转录siRNA的适当的一个或更多个模板(template or templates)的片段)内源性表达。用于shRNA的商购可得的基于质粒的表达载体的实例包括pSilencer系列(Ambion)的成员,和pCpG-siRNA(InvivoGen)。用于PCR产生的shRNA表达盒的生产的试剂盒的实例包括Silencer Express(Ambion)和siXpress (Mirus)。
用于分离的寡核苷酸(例如,siRNA和dsRNA)在真核细胞中的体内表达的病毒载体也被考虑在本公开内容的范围内。病毒载体可以衍生自多种病毒,包括腺病毒、腺相关病毒、慢病毒(例如,HIV、FIV和EIAV)和疱疹病毒。用于shRNA表达的商购可得的病毒载体的实例包括pSilencer adeno (Ambion)和pLenti6/BLOCK-iT™-DEST (Invitrogen)。病毒载体的选择、从载体表达siRNA的方法和递送病毒载体的方法(例如掺入纳米颗粒内)在本领域技术人员的普通技术范围内。
对于本领域技术人员将明显的是,任选地掺入纳米颗粒中的任何合适的载体可用于将本文描述的本公开内容的分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)递送至细胞或受试者。载体可以在体内递送至细胞。在其他实施方案中,可以将载体离体递送至细胞,并且然后将含有载体的细胞递送至受试者。递送载体的选择可以基于本领域已知的许多因素做出,包括靶宿主的年龄和物种、体外与体内递送、期望的表达的水平和持久性、预期目的(例如,用于治疗或筛选)、靶细胞或器官、递送途径、分离的多核苷酸的大小、安全性问题等。
递送系统
本公开内容还提供了一种递送系统,包含至少一种本文公开的分离的寡核苷酸或编码至少一种本文公开的分离的寡核苷酸的本公开内容的载体。在一些实施方案中,递送系统是脂质体、纳米颗粒、基于聚合物的递送系统或配体-缀合物递送系统中的任一种。在一些实施方案中,配体-缀合物递送系统包含抗体、肽、糖部分或其组合中的一种或更多种。
在一些实施方案中,本公开内容的递送系统包含纳米颗粒,所述纳米颗粒包含靶向CFB mRNA用于降解的本公开内容的分离的寡核苷酸(例如,siRNA或dsRNA)。在一些实施方案中,纳米颗粒包含基于聚合物的纳米颗粒、基于脂质-聚合物的纳米颗粒、基于金属的纳米颗粒、基于碳纳米管的纳米颗粒、纳米晶体或聚合物胶束。在一些实施方案中,基于聚合物的纳米颗粒包含多嵌段共聚物、双嵌段共聚物、聚合物胶束或超支化大分子。在一些实施方案中,基于聚合物的纳米颗粒包含多嵌段共聚物或双嵌段共聚物。在一些实施方案中,基于聚合物的纳米颗粒是pH响应的。在一些实施方案中,基于聚合物的纳米颗粒还包含缓冲组分。
在一些实施方案中,递送系统包含脂质体。脂质体是具有至少一个脂质双层的球形囊泡,并且在一些实施方案中,具有水性核。在一些实施方案中,脂质体的脂质双层可以包含磷脂。磷脂的示例性但非限制性实例是磷脂酰胆碱,但脂质双层可包含另外的脂质,诸如磷脂酰乙醇胺。脂质体可以是多层的,即由几个层状相脂质双层组成,或具有单个脂质双层的单层脂质体。脂质体可以在使它们用作吞噬作用的可行靶标的特定尺寸范围内制备。脂质体的尺寸范围可为从20 nm至100 nm、100 nm至400 nm、1 µm及更大或200 nm至3 µm。类脂质和基于脂质的制剂的实例在美国公布的申请20090023673中提供。在其他实施方案中,一种或更多种脂质是一种或更多种阳离子脂质。本领域的技术人员将认识到哪些脂质体适于siRNA包封。
在一些实施方案中,本公开内容的脂质体或纳米颗粒包含胶束。胶束是表面活性剂分子的聚集。示例性胶束包含水溶液中的两亲性大分子、聚合物或共聚物的聚集,其中亲水性头部部分接触周围溶剂,而疏水性尾部区域被隔离在胶束的中心。
在一些实施方案中,纳米颗粒包含纳米晶体。示例性纳米晶体是具有至少一个尺寸小于1000纳米,优选地小于100纳米的结晶颗粒。
在一些实施方案中,纳米颗粒包含基于聚合物的纳米颗粒。在一些实施方案中,聚合物包含多嵌段共聚物、双嵌段共聚物、聚合物胶束或超支化大分子。在一些实施方案中,颗粒包含一种或更多种阳离子聚合物。在一些实施方案中,阳离子聚合物是壳聚糖、鱼精蛋白质、聚赖氨酸、聚组氨酸、聚精氨酸或聚(乙烯)亚胺。在其他实施方案中,一种或更多种聚合物含有缓冲组分、可降解组分、亲水性组分、可裂解键组分或其某个组合。
在一些实施方案中,纳米颗粒或其某个部分是可降解的。在其他实施方案中,纳米颗粒的脂质和/或聚合物是可降解的。
在一些实施方案中,本公开内容的这些递送系统中的任一项可以包含缓冲组分。在其他实施方案中,本公开内容的任一项可包含缓冲组分和可降解组分。在仍然其他实施方案中,本公开内容的任一项可包含缓冲组分和亲水性组分。在又其他实施方案中,本公开内容的任一项可包含缓冲组分和可裂解键组分。在又其他实施方案中,本公开内容的任一项可包含缓冲组分、可降解组分和亲水性组分。在仍然其他实施方案中,本公开内容的任一项可包含缓冲组分、可降解组分和可裂解键组分。在另外的实施方案中,本公开内容的任一项可包含缓冲组分、亲水性组分和可裂解键组分。在又另一种实施方案中,本公开内容的任一项可包含缓冲组分、可降解组分、亲水性组分和可裂解键组分。在一些实施方案中,颗粒由一种或更多种含有任何前述组分的组合的聚合物组成。
在本公开内容的分离的寡核苷酸的一些实施方案中,递送系统包含配体-缀合物递送系统。在一些实施方案中,配体-缀合物递送系统包含抗体、肽、糖部分、脂质或其组合中的一种或更多种。
在另外的实施方案中,靶向CFB mRNA的本公开内容的分离的寡核苷酸(例如,siRNA或dsRNA)与递送系统的一种或更多种脂质或聚合物缀合、复合或由递送系统的一种或更多种脂质或聚合物包封。在另外的实施方案中,靶向CFB mRNA的本公开内容的分离的寡核苷酸(例如,siRNA或dsRNA)可以包封在纳米颗粒的中空核心中。可选地或另外,靶向CFB mRNA的本公开内容的分离的寡核苷酸(例如,siRNA或dsRNA)可以掺入,例如经由嵌入来掺入递送系统的基于脂质或聚合物的壳中。可选地或另外,靶向CFB mRNA的本公开内容的分离的寡核苷酸(例如,siRNA或dsRNA)可以附接至递送系统的表面。在一些实施方案中,靶向CFB mRNA的本公开内容的分离的寡核苷酸(例如,siRNA或dsRNA)与递送系统的一种或更多种脂质或聚合物缀合,例如经由共价附接缀合。
在一些实施方案中,配体缀合物递送系统还包含靶向剂。在一些实施方案中,靶向剂包含肽配体、核苷酸配体、多糖配体、脂肪酸配体、脂质配体、小分子配体、抗体、抗体片段、抗体模拟物或抗体模拟物片段。
在一些实施方案中,本文公开的分离的寡核苷酸还可以包含促进分离的寡核苷酸递送或摄取到特定组织或细胞(诸如肝细胞)的配体。在某些实施方案中,配体靶向RNAi构建体至肝细胞的递送。在这些和其他实施方案中,配体可以包含半乳糖、半乳糖胺或N-乙酰基-半乳糖胺(GalNAc)。在某些实施方案中,配体包含多价半乳糖或多价GalNAc部分,诸如三价或四价半乳糖或GalNAc部分。配体可以任选地经由接头共价附接至RNAi构建体的有义链的5’末端或3’末端。
在一些实施方案中,靶向剂包含在编码CFB mRNA并表达CFB蛋白质的靶细胞中上调或过表达或正常表达的细胞表面蛋白质的结合配偶体。在一些实施方案中,结合配偶体可以是在许多类型的此类细胞的表面上表达的跨膜肽聚糖。因此,通过本公开内容的递送系统靶向细胞表面蛋白质提供了本公开内容的组合物对靶细胞的优异递送和特异性。在一些实施方案中,靶细胞可以是肠细胞、动脉细胞、心血管系统的细胞、肝细胞、胰腺细胞或其组合中的任一种。
在一些实施方案中,本公开内容的递送系统包括基于聚合物的递送系统。在一些实施方案中,基于聚合物的递送系统包含共混聚合物。在一些实施方案中,共混聚合物是包含可降解组分和亲水性组分的共聚物。在一些实施方案中,共混聚合物的可降解组分是聚酯、聚(原酸酯)、聚(乙烯亚胺)、聚(己内酯)、聚酸酐、聚(丙烯酸)、聚乙交酯或聚(氨基甲酸酯)。在一些实施方案中,共混聚合物的可降解组分是聚(乳酸)(PLA)或聚(乳酸-共-羟基乙酸)(PLGA)。在一些实施方案中,共混聚合物的亲水性组分是聚亚烷基二醇或聚亚烷基氧化物。在一些实施方案中,聚亚烷基二醇是聚乙二醇(PEG)。在其他实施方案中,聚亚烷基氧化物是聚环氧乙烷(PEO)。
在一些实施方案中,本公开内容的递送系统是基于聚合物的纳米颗粒。基于聚合物的纳米颗粒包含一种或更多种聚合物。在一些实施方案中,一种或更多种聚合物包含聚酯、聚(原酸酯)、聚(乙烯亚胺)、聚(己内酯)、聚酸酐、聚(丙烯酸)、聚乙交酯或聚(氨基甲酸酯)。在仍然其他实施方案中,一种或更多种聚合物包含聚(乳酸)(PLA)或聚(乳酸-共-羟基乙酸)(PLGA)。在一些实施方案中,一种或更多种聚合物包含聚(乳酸-共-羟基乙酸)(PLGA)。在一些实施方案中,一种或更多种聚合物包含聚(乳酸)(PLA)。在一些实施方案中,一种或更多种聚合物包含聚亚烷基二醇或聚亚烷基氧化物。在一些实施方案中,聚亚烷基二醇是聚乙二醇(PEG)或聚亚烷基氧化物是聚环氧乙烷(PEO)。
在一些实施方案中,基于聚合物的纳米颗粒包含聚(乳酸-共-羟基乙酸) PLGA聚合物。在一些实施方案中,PLGA纳米颗粒还包含如本文描述的靶向剂。
在一些实施方案中,本公开内容的递送系统是平均特征尺寸小于约500 nm、400nm、300 nm、250 nm、200 nm、180 nm、150 nm、120 nm、100 nm、90 nm、80 nm、70 nm、60 nm、50 nm、40 nm、30 nm或20 nm的纳米颗粒。在其他实施方案中,纳米颗粒具有10 nm、20 nm、30 nm、40 nm、50 nm、60 nm、70 nm、80 nm、90 nm、100 nm、120 nm、150 nm、180 nm、200 nm、250 nm或300 nm的平均特征尺寸。在另外的实施方案中,纳米颗粒具有10 nm-500 nm、10nm-400 nm、10 nm-300 nm、10 nm-250 nm、10 nm-200 nm、10 nm-150 nm、10 nm-100 nm、10nm-75 nm、10 nm-50 nm、50 nm-500 nm、50 nm-400 nm、50 nm-300 nm、50 nm-200 nm、50nm-150 nm、50 nm-100 nm、50 nm-75 nm、100 nm-500 nm、100 nm-400 nm、100 nm-300 nm、100 nm-250 nm、100 nm-200 nm、100 nm-150 nm、150 nm-500 nm、150 nm-400 nm、150 nm-300 nm、150 nm-250 nm、150 nm-200 nm、200 nm-500 nm、200 nm-400 nm、200 nm-300 nm、200 nm-250 nm、200 nm-500 nm、200 nm-400 nm或200 nm-300 nm的平均特征尺寸。
治疗剂
在一些实施方案中,本公开内容的递送系统与一种或更多种另外的治疗剂施用。在一些实施方案中,另外的治疗剂可以是类固醇、抗炎剂、抗体、融合蛋白、小分子或其组合。在一些实施方案中,将另外的治疗剂掺入包含至少一种本文公开的靶向CFB的分离的寡核苷酸的本公开内容的递送系统中。在一些实施方案中,另外的治疗剂与递送系统的一种或更多种脂质或聚合物缀合、复合,或由递送系统的一种或更多种脂质或聚合物包封。另外的治疗剂可以被包封在递送系统的中空核心中。可选地、另外地,另外的治疗剂可以例如经由嵌入,掺入递送系统的基于脂质或聚合物的壳中。可选地、另外地,另外的治疗剂可以附接至递送系统的表面。在一些实施方案中,另外的治疗剂例如经由共价附接与递送系统的一种或更多种脂质或聚合物缀合。
在一些实施方案中,本文公开的另外的治疗剂和包含至少一种靶向CFB的分离的寡核苷酸的递送系统被配制在同一组合物中。例如,包含本公开内容的靶向CFB的至少一种分离的寡核苷酸的递送系统和另外的治疗剂可以配制在相同的药物组合物中。
在一些实施方案中,本文公开的另外的治疗剂和包含至少一种靶向CFB的分离的寡核苷酸的递送系统被配制为单独的组合物,例如,用于单独施用至受试者。
药物组合物
本公开内容还提供了药物组合物,所述药物组合物包含本文公开的至少一种寡核苷酸、编码本文公开的至少一种分离的寡核苷酸的本公开内容的载体或本公开内容的递送系统,和药学上可接受的运载体、稀释剂或赋形剂。
本公开内容的药物组合物可任选地包含治疗剂、药剂、运载体、佐剂、分散剂、稀释剂等。在一些实施方案中,药物组合物包含治疗剂,诸如化学治疗剂。在一些实施方案中,在包含本公开内容的靶向CFB的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的递送系统中配制治疗剂。
在一些实施方案中,在包含本公开内容的靶向CFB的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的递送系统中未配制另外的治疗剂,而是将递送系统和治疗剂两者配制在相同的药物组合物中。在一些实施方案中,在包含本公开内容的靶向CFB的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的递送系统中未配制另外的治疗剂,并且将递送系统和治疗剂配制在单独的药物组合物中。
本公开内容的药物组合物可以含有任何以上讨论的试剂,以及药学上可接受的运载体、稀释剂或赋形剂中的一种或更多种。
本公开内容的药物组合物呈适于施用至受试者的形式。在一种实施方案中,药物组合物是散装的(bulk)或呈单位剂型。单位剂型是各种形式中的任何一种,包括,例如,胶囊、IV袋、片剂、气雾剂吸入器上的单个泵或小瓶。组合物的单位剂量中活性成分(例如,所公开剂的制剂)的量是有效量,并且根据所涉及的特定治疗而变化。本领域技术人员将理解,有时必需根据患者的年龄和状况对剂量进行常规改变。剂量也将取决于施用途径。设想了各种途径,包括口服、肺、直肠、肠胃外、透皮、皮下、静脉内、肌内、腹膜内、吸入、含服、舌下、胸膜内、鞘内、鼻内等。用于本公开内容组合物的表面或透皮施用的剂型包括粉末、喷雾剂、软膏、糊剂、霜剂、洗剂、凝胶、溶液、贴剂和吸入剂。在一种实施方案中,活性剂在无菌条件下与药学上可接受的运载体以及所需的任何防腐剂、缓冲剂或推进剂混合。
如本文使用的,短语“药学上可接受”是指在合理医学判断的范围内适用于与人类和动物的组织接触而无过度毒性、刺激、过敏反应或其他问题或并发症,与合理的益处/风险比相称的那些化合物、阴离子、阳离子、材料、组合物、运载体和/或剂型。
“药学上可接受的赋形剂”意指在制备药物组合物中有用的赋形剂,其通常是安全、无毒的并且既不是生物学上不合意的也不是其他方面不合意的,并且包括对于兽医用途以及人类药物用途可接受的赋形剂。如本说明书和权利要求书中使用的“药学上可接受的赋形剂”既包括一种这样的赋形剂,也包括多于一种这样的赋形剂。
本公开内容的药物组合物被配制为与其预期的施用途径相容。施用途径的实例包括肠胃外,例如,静脉内、皮内、皮下、口服(例如,吸入)、透皮(表面)、腹膜内(进入体腔)和经黏膜施用。用于肠胃外、皮内、腹膜内或皮下应用的溶液或悬浮液可以包括以下组分:无菌稀释剂,诸如注射用水、盐水溶液、不挥发性的油、聚乙二醇、甘油、丙二醇或其他合成溶剂;抗细菌剂诸如苯甲醇或对羟基苯甲酸甲酯;抗氧化剂诸如抗坏血酸或亚硫酸氢钠;螯合剂诸如乙二胺四乙酸;缓冲剂诸如乙酸盐、柠檬酸盐或磷酸盐,以及用于调节张力的剂诸如氯化钠或右旋糖。pH可以用酸或碱(诸如盐酸或氢氧化钠)来调节。肠胃外制剂可以包封在安瓿、一次性注射器或由玻璃或塑料制成的多剂量小瓶中。这些制剂可以含有抗氧化剂、缓冲剂、抑菌剂和使制剂与预期接受者的血液等渗的溶质。水性和非水性无菌悬浮液可以包括悬浮剂和增稠剂。制剂可以呈现于单位剂量或多剂量容器中,例如密封的安瓿和小瓶,并且可以储存在冷冻干燥(冻干)条件中,仅需要在临使用之前添加无菌液体运载体,例如,盐水或注射用水。
含有本文描述的纳米颗粒的药物组合物可以以通常已知的方式制备,例如,通过常规的混合、溶解、粒化、糖衣制备、磨细、乳化、包封、包埋或冻干工艺。药物组合物可以以常规方式使用一种或更多种药学上可接受的运载体(包括赋形剂和/或辅剂)来配制,该运载体有助于将活性剂加工为可以被药学上使用的制剂。当然,适当的制剂取决于选择的施用途径。
适于可注射使用的药物组合物包括无菌水性溶液(在水溶性的情况下)或分散体和用于临时制备无菌的可注射溶液或分散体的无菌粉末。对于静脉内施用,合适的运载体包括生理盐水、抑菌水、Cremophor EL™ (BASF)或磷酸盐缓冲盐水(PBS)。在所有情况下,组合物必须是无菌的,并且应当是流动性达到存在易于注射性的程度。它在制造和储存条件下必须是稳定的,并且必须防止微生物诸如细菌和真菌的污染作用。运载体可以是包含例如水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇和液体聚乙二醇等)及其合适的混合物的溶剂或分散介质。合适的流动性可以例如通过使用包衣诸如卵磷脂来维持,在分散体的情况下通过维持所需要的纳米颗粒尺寸来维持,以及通过使用表面活性剂来维持。通过各种抗细菌剂和抗真菌剂,例如对羟基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、抗坏血酸、硫柳汞等,可以实现防止微生物的作用。在许多情况下,优选的将是在组合物中包括等渗剂,例如糖、多元醇诸如甘露醇和山梨醇和氯化钠。可注射的组合物的延长吸收可以通过在组合物中包含延迟吸收的剂例如单硬脂酸铝和明胶来引起。
口服组合物通常包含惰性稀释剂或可食用的药学上可接受的运载体。它们可以被包封在明胶胶囊中或被压缩成片剂。为了口服治疗施用的目的,活性剂可以掺入赋形剂并且以片剂、锭剂或胶囊的形式使用。口服组合物也可以使用流体运载体制备以用作漱口水,其中流体运载体中的剂口服应用并且漱口且吐出或吞咽。可以包括药学上相容的黏合剂和/或辅助材料作为组合物的一部分。片剂、丸剂、胶囊、锭剂等可以包含以下任何成分或类似性质的剂:黏合剂,诸如微晶纤维素、黄蓍胶或明胶;赋形剂,诸如淀粉或乳糖;崩解剂,诸如海藻酸,Primogel或玉米淀粉;润滑剂,诸如硬脂酸镁或Sterotes;助流剂,诸如胶体二氧化硅;甜味剂,诸如蔗糖或糖精;或调味剂,诸如薄荷、水杨酸甲酯或柑橘调味剂。
为了通过吸入施用,剂以气雾剂喷雾的形式从包含合适推进剂(例如,气体,诸如二氧化碳)的压力容器或分配器或者雾化器递送。
本公开内容的药物组合物可以用将保护本公开内容的靶向CFB mRNA的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)免于从体内快速消除药学上可接受的运载体制备,所述运载体诸如控释制剂,包括植入物和微囊化递送系统。可以使用生物可降解的生物相容性聚合物,诸如乙烯乙酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、胶原蛋白、聚原酸酯和聚乳酸。用于制备这样的制剂的方法对本领域技术人员将是明显的,并且材料可以商购获得。脂质体悬浮液(包含含有针对病毒抗原的单克隆抗体的靶向受感染细胞的脂质体)也可以用作药学上可接受的运载体。这些可以根据本领域技术人员已知的方法(例如,如美国专利第4,522,811号中描述的)制备。
为了容易施用和剂量的一致性,以剂量单位形式配制口服或肠胃外组合物是特别有益的。如本文使用的剂量单位形式是指作为用于待治疗的受试者的单一剂量合适的物理上离散的单位;每个单位包含计算为与所需药物运载体联合产生所期望的治疗效果的活性剂的预定的量。本公开内容的剂量单位形式的规格由活性剂的独特特性和待实现的特定治疗效果决定并直接取决于此。
药物组合物可以与施用的使用说明一起被包括在容器、包装或分配器中。
如本文使用的,“药学上可接受的盐”指的是本公开内容的化合物的衍生物,其中母体化合物通过制备其酸盐或碱盐来修饰。药学上可接受的盐的实例包括但不限于碱性残基诸如胺的无机酸盐或有机酸盐、酸性残基诸如羧酸的碱盐或有机盐等。药学上可接受的盐包括例如由无毒性的无机酸或有机酸形成的母体化合物的常规无毒性盐或季铵盐。
用于本公开内容公开的组合物的配制和施用的技术可见于Remington: theScience and Practice of Pharmacy,第19版,Mack Publishing Co., Easton, PA(1995)中。
除非另有指示,否则本文中使用的所有百分比和比率以重量计。本公开内容的其他特征和优点根据不同的实例而明显。所提供的实例说明了可用于实践本公开内容的不同组分和方法。这些实例并不限制所要求保护的公开内容。基于本公开内容,本领域技术人员可以鉴定并采用可用于实践本公开内容的其他组份和方法。
制备分离的寡核苷酸的方法
本文提供了制备本公开内容的靶向CFB的一种或更多种寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的方法,以及包含其的递送系统。
本公开内容的靶向CFB的一种或更多种寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)可以通过化学合成、通过体外转录或通过用Dicer或具有类似活性的另一种适当的核酸酶裂解较长的双链RNA来外源产生。使用常规DNA/RNA合成仪由受保护的核糖核苷亚磷酰胺产生的化学合成的siRNA可以从商业供应商获得。siRNA可以通过例如用溶剂或树脂提取、沉淀、电泳、层析或其组合来纯化。可选地,siRNA可以经很少(如果有的话)纯化使用,以避免由于样品处理造成的损失。
在一些实施方案中,本公开内容的靶向CFB的一种或更多种寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)可以使用编码双链RNA的核酸已经克隆到其中,例如在合适的启动子的控制下的表达载体产生。
在一些实施方案中,本公开内容的靶向CFB的一种或更多种寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)可以掺入本公开内容的递送系统(例如,纳米颗粒)中。
包含本公开内容的dsRNA或siRNA的递送系统可以通过本领域已知的任何合适的手段制备。例如,聚合物纳米颗粒可以使用各种方法制备,包括但不限于溶剂蒸发、自发乳化、溶剂扩散、脱溶胶化、透析、离子凝胶化、纳米沉淀、盐析、喷雾干燥和超临界流体方法。预成型聚合物的分散和单体的聚合是聚合物纳米颗粒的制备的另外两种策略。然而,适当方法的选择取决于本领域普通技术人员将已知的各种因素。
包含本公开内容的递送系统的无菌可注射溶液可以通过将本文公开的靶向CFB的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如dsRNA和siRNA)以需要的量在根据需要具有本文列举的一种成分或多种成分的组合的适当溶剂中掺入递送系统(例如纳米颗粒)中,然后过滤灭菌来制备。可选地或另外,灭菌可以通过其他手段实现,诸如辐射或气体。通常,通过将递送颗粒掺入到包含基础分散介质和来自上文列举的那些的所需的其他成分的无菌媒介物中来制备分散体。在用于制备无菌可注射溶液的无菌粉末的情况下,制备方法是真空干燥和冷冻干燥,这产生递送系统的粉末,所述递送系统的粉末包含本文公开的靶向CFB的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如dsRNA和siRNA),加上来自其先前无菌过滤的溶液的任何另外的期望成分。
使用方法
本公开内容还提供了一种在有相应需要的受试者中抑制或下调补体CFB的表达或水平的方法,其中该方法包括向受试者施用有效量的本文公开的至少一种分离的寡核苷酸、至少一种本文公开的载体、至少一种本文公开的递送系统或至少一种本文公开的药物组合物。
本公开内容还提供了一种在有相应需要的受试者中治疗或预防与补体CFB的异常或增加的表达或活性相关的疾病或紊乱或其中补体CFB起作用的疾病或紊乱的方法,其中该方法包括向受试者施用有效量的本文公开的至少一种分离的寡核苷酸、本文公开的至少一种载体、本文公开的至少一种递送系统或本文公开的至少一种药物组合物。
本公开内容还提供了本文公开的至少一种分离的寡核苷酸、编码本文公开的至少一种分离的寡核苷酸的本公开内容的载体、本公开内容的递送系统或本公开内容的药物组合物,用于在有相应需要的受试者中治疗或预防与CFB的异常或增加的表达或活性相关的疾病或紊乱或其中CFB起作用的疾病或紊乱。
本公开内容还提供了本文公开的至少一种分离的寡核苷酸、编码本文公开的至少一种分离的寡核苷酸的本公开内容的载体、本公开内容的递送系统或本公开内容的药物组合物在制备用于在有相应需要的受试者中治疗或预防与CFB的异常或增加的表达或活性相关的疾病或紊乱或其中CFB起作用的疾病或紊乱的药物中的用途。
本文提供了抑制或下调细胞中CFB表达或活性的方法,包括使细胞与如本文描述的靶向CFB的一种或更多种寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)接触。如本文描述的靶向CFB的一种或更多种寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)可以通过RNAi途径减少或抑制CFB活性。细胞可以是体外的、体内的或离体的。例如,细胞可以来自细胞系,或在有相应需要的受试者体内。
在一些实施方案中,如本文描述的靶向CFB的一种或更多种寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)能够诱导受试者的细胞中RNAi介导的CFB mRNA降解。
如本文使用的,术语“接触”、“引入”和“施用”可互换地使用,并且是指将本公开内容的dsRNA或siRNA或编码本公开内容的dsRNA或siRNA的核酸分子递送至细胞以抑制或改变或修饰靶基因的表达的过程。dsRNA可以以许多方式施用,包括但不限于直接引入到细胞中(即,细胞内)和/或细胞外引入到生物体的腔、间质空间中或到循环中。
在细胞或生物体的上下文中,“引入”意指以核酸分子进入细胞内部的方式将核酸分子呈递至生物体和/或细胞。当要引入多于一个核酸分子时,这些核酸分子可以组装为单个多核苷酸或核酸构建体的一部分,或组装为单独的多核苷酸或核酸构建体,以及可以位于相同或不同的核酸构建体上。因此,这些多核苷酸可以在单个转化事件中或在单独的转化事件中引入细胞。因此,如本文使用的术语“转化”是指将异源核酸引入细胞中。细胞的转化可以是稳定的或瞬时的。
如本文使用的,术语“抑制”或“减少”或其语法变化是指特定水平或活性中降低或减弱至少约5%、约10%、约15%、约25%、约35%、约40%、约50%、约60%、约75%、约80%、约90%、约95%或更多。在一些实施方案中,抑制或减少导致很少或基本上没有可检测的活性(至多不显著的量,例如,小于约10%或甚至5%)。
相反,如本文使用的,术语“增加”或其语法变化是指特定水平或活性中增加或升高至少约5%、约10%、约15%、约25%、约35%、约40%、约50%、约60%、约75%、约80%、约90%、约95%或更多。活性中的增加可以就倍数变化而言来描述。例如,与活性的基线水平相比,活性可以增加1.2X、1.5X、2X、3X、5X、6X、7X、8X、9X、10X或更多。
如本文使用的,术语“IC50”或“IC50值”是指细胞生存力降低一半时的剂的浓度。因此,IC50是剂在抑制生物过程中的有效性的量度。在示例性模型中,使用标准技术培养细胞系,用如本文描述的靶向CFB的一种或更多种寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)中的任一种处理,并且在24小时、48小时和/或72小时后计算靶向CFB的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的IC50值,以确定其与未处理细胞中或在开始用分离的寡核苷酸处理之前的相同细胞中的CFBmRNA或蛋白质的水平相比,下调或抑制CFB mRNA或蛋白质的水平至50%的有效性。
监测CFB mRNA和/或蛋白质表达的方法可用于表征基因沉默,和确定本文描述的组合物的有效性。CFB的表达可以通过本领域中已知的任何技术来评估。其实例包括,在诸如ELISA、蛋白质印迹或免疫组织化学的测定中利用CFB抗体以可视化细胞中的CFB蛋白质表达的免疫沉淀方法,或流式细胞术。另外的方法包括利用与编码CFB或其独特片段的核酸或所述核酸的转录产物(例如,mRNA)或剪接产物特异性杂交的核酸的各种杂交方法、RNA印迹方法、DNA印迹方法和各种基于PCR的方法诸如RT-PCR、qPCR或数字液滴PCR。另外可以使用高通量测序技术评估CFB mRNA表达。
测定靶向CFB的单个分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的作用的方法包括用分离的寡核苷酸转染代表性细胞系,并测量生存力。例如,来自代表性细胞系的细胞可以使用本领域已知的方法诸如RNAiMAX Lipofectamine试剂盒(Invitrogen)转染,并使用本领域已知的任何合适的技术培养。任选地,如本文描述的另外的治疗剂可以在转染后以可变浓度添加到细胞培养基中。在合适的温育时间段(诸如24小时-96小时)之后,可以使用诸如Cell Titer Glo 2.0 (Promeg)的方法测量细胞生存力以确定细胞生存力,和/或可以使用本文描述的方法评估CFB mRNA和蛋白质水平。
在本公开内容的抑制或下调细胞中CFB表达或活性的方法的一些实施方案中,至少一种分离的寡核苷酸、载体、递送系统或药物组合物肠胃外施用。在一些实施方案中,肠胃外施用是静脉内、皮下、腹膜内或肌内。
在本公开内容的抑制或下调细胞中CFB表达或活性的方法的一些实施方案中,受试者是人类。在本公开内容的抑制或下调细胞中CFB表达或活性的方法的一些实施方案中,受试者出现以下疾病的症状或罹患以下疾病:阵发性睡眠性血红蛋白尿(PNH)、类风湿性关节炎、缺血再灌注损伤、多发性硬化(MS)、吉兰-巴雷综合征、系统性红斑狼疮、C3肾小球肾炎、非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS)、重症肌无力(MG)、视神经脊髓炎谱系疾病(NMOSD)、致密物沉积病(DDD)、年龄相关性黄斑变性(AMD)、IgA肾病、多灶性运动神经病(MMN)、器官移植和神经退行性疾病。
在本公开内容的抑制或下调细胞中CFB表达或活性的方法的一些实施方案中,该方法包括施用与至少第二治疗剂组合的至少一种分离的寡核苷酸、载体、递送系统或药物组合物。在一些实施方案中,第二治疗剂是抗体、小分子药物、肽、核苷酸分子或其组合。在一些实施方案中,第二治疗剂是本公开内容的分离的寡核苷酸。
本公开内容还提供了一种在有相应需要的受试者中抑制或下调CFB的表达或水平的方法,其中该方法包括向受试者施用有效量的本文公开的第一寡核苷酸和至少第二寡核苷酸,其中第一寡核苷酸和至少第二寡核苷酸包含不同的序列。在一些实施方案中,第一寡核苷酸和至少第二寡核苷酸同时施用。在一些实施方案中,第一寡核苷酸和至少第二寡核苷酸顺序施用。
在本公开内容的抑制或下调细胞中CFB表达或活性的方法的一些实施方案中,受试者是人类。在本公开内容的抑制或下调细胞中CFB表达或活性的方法的一些实施方案中,受试者出现以下疾病或紊乱的症状或罹患以下疾病或紊乱:阵发性睡眠性血红蛋白尿(PNH)、类风湿性关节炎、缺血再灌注损伤、多发性硬化(MS)、吉兰-巴雷综合征、系统性红斑狼疮、C3肾小球肾炎、非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS)、重症肌无力(MG)、视神经脊髓炎谱系疾病(NMOSD)、致密物沉积病(DDD)、年龄相关性黄斑变性(AMD)、IgA肾病、多灶性运动神经病(MMN)、器官移植和神经退行性疾病,或与过度反应性炎症反应相关联的相关紊乱或症状。
在本公开内容的治疗或预防与CFB的异常或增加的表达或活性相关的疾病或紊乱或其中CFB起作用的疾病或紊乱的方法的一些实施方案中,受试者是人类。在本公开内容的治疗或预防与CFB的异常或增加的表达或活性相关的疾病或紊乱或其中CFB起作用的疾病或紊乱的方法的一些实施方案中,疾病或紊乱是以下疾病或紊乱或与以下疾病或紊乱相关联:阵发性睡眠性血红蛋白尿(PNH)、类风湿性关节炎、缺血再灌注损伤、多发性硬化(MS)、吉兰-巴雷综合征、系统性红斑狼疮、C3肾小球肾炎、非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS)、重症肌无力(MG)、视神经脊髓炎谱系疾病(NMOSD)、致密物沉积病(DDD)、年龄相关性黄斑变性(AMD)、IgA肾病、多灶性运动神经病(MMN)、器官移植、神经退行性疾病,或与过度反应性炎症反应相关联的相关紊乱或症状。
在本公开内容的治疗或预防与CFB的异常或增加的表达或活性相关的疾病或紊乱或其中CFB起作用的疾病或紊乱的用途的一些实施方案中,受试者是人类。在本公开内容的治疗或预防与CFB的异常或增加的表达或活性相关的疾病或紊乱或其中CFB起作用的疾病或紊乱的用途的一些实施方案中,疾病或紊乱是以下疾病或紊乱或与疾病或紊乱相关联:阵发性睡眠性血红蛋白尿(PNH)、类风湿性关节炎、缺血再灌注损伤、多发性硬化(MS)、吉兰-巴雷综合征、系统性红斑狼疮、C3肾小球肾炎、非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS)、重症肌无力(MG)、视神经脊髓炎谱系疾病(NMOSD)、致密物沉积病(DDD)、年龄相关性黄斑变性(AMD)、IgA肾病、多灶性运动神经病(MMN)、器官移植、神经退行性疾病,或与过度反应性炎症反应相关联的相关紊乱或症状。
在本公开内容的制备用于治疗或预防与CFB的异常或增加的表达或活性相关的疾病或紊乱的药物中的用途的一些实施方案中,受试者是人类。在一些实施方案中,受试者不是人类。在一些实施方案中,疾病或紊乱是以下疾病或紊乱或与以下疾病或紊乱相关联:阵发性睡眠性血红蛋白尿(PNH)、类风湿性关节炎、缺血再灌注损伤、多发性硬化(MS)、吉兰-巴雷综合征、系统性红斑狼疮、C3肾小球肾炎、非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS)、重症肌无力(MG)、视神经脊髓炎谱系疾病(NMOSD)、致密物沉积病(DDD)、年龄相关性黄斑变性(AMD)、IgA肾病、多灶性运动神经病(MMN)、器官移植、神经退行性疾病,或与过度反应性炎症反应相关联的相关紊乱或症状。
施用途径
包含本公开内容的靶向CFB mRNA的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的纳米颗粒可以通过目前用于治疗性治疗的许多熟知方法施用于受试者。例如,为了治疗与CFB的表达或活性相关的哺乳动物疾病,可以将包含本公开内容的靶向CFB的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的组合物直接注射到细胞中、注射到血流中或体腔中、口服摄入或用贴剂通过皮肤施用。选择的剂量应当足以构成有效治疗,但不高到引起无法接受的副作用。患者的疾病状况和健康的状态应当优选地在治疗期间和在治疗之后的合理的时间段内被密切监测。
包含本公开内容的靶向CFB mRNA的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的组合物可以口服、经鼻、透皮、肺、吸入、含服、舌下、腹膜内、皮下、肌内、静脉内、直肠内、胸膜内、鞘内和肠胃外施用。在一些实施方案中,肠胃外施用包括肌内、腹膜内、皮下或静脉内施用。本领域技术人员将认识到某些施用途径的优点。
本公开内容的组合物可以肠胃外施用。包含本公开内容的纳米颗粒的组合物的全身施用也可以通过静脉内、经黏膜、皮下、腹膜内、肌内或透皮方式进行。对于静脉内肠胃外施用,可以通过注射或输注施用包含纳米颗粒的组合物。对于经黏膜或透皮施用,在制剂中使用适于待渗透的屏障的渗透剂。这样的渗透剂是本领域通常已知的,并且包括例如,对于经黏膜施用,去垢剂、胆盐和夫西地酸衍生物。经黏膜施用可以通过使用鼻喷雾或栓剂来实现。
剂量
在治疗应用中,根据本公开内容使用的药物组合物的剂量取决于剂,受体患者的年龄、体重和临床状况,以及施用疗法的临床医师或从业者的经验和判断,以及影响所选择的剂量的其他因素而变化。通常,剂量应足以导致与CFB的表达或活性相关的状况或症状的减缓,和优选地消退或治疗。剂量可以根据受试者的年龄和尺寸和与CFB表达相关的疾病或紊乱的类型和严重程度而变化。
如本文可互换地使用的术语“有效量”或“治疗有效量”是指治疗、改善、抑制、下调或控制受试者中CFB的表达或与CFB的异常(aberrant)或不正常(abnormal)表达相关的症状,或在受试者中表现出可检测的治疗或抑制作用的药剂的量。所述作用可以通过本领域已知的任何测定方法来检测。对受试者的精确有效量将取决于受试者的体重、尺寸和健康;状况的性质和程度;以及选择用于施用的治疗剂或治疗剂的组合。对于特定情况的治疗有效量可以通过临床医师的技能之内的常规实验和判断来确定。
对于本公开内容的靶向CFB mRNA的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)中的任一种,可以在细胞培养测定中(例如,肿瘤细胞的)或在动物模型(通常是大鼠、小鼠、兔、狗或猪)中初始估计治疗有效量。动物模型也可以用于确定适当的浓度范围和施用途径。在一些实施方案中,标准异种移植物或患者来源的异种移植物小鼠模型可用于确定本公开内容的靶向CFB mRNA的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的有效性。然后这样的信息可以用来确定用于人类施用的有用剂量和途径。治疗性/预防性功效和毒性可以通过细胞培养物或实验动物中的标准药物程序确定,例如,最大耐受剂量和没有可观察到的不良影响的剂量。表现出大治疗窗口的药物组合物是优选的。剂量可以根据采用的剂型、患者的敏感性和施用途径而在该范围内变化。
调整剂量和施用以提供足够水平的活性剂或维持期望的作用。可以考虑的因素包括疾病状态的严重程度、受试者的一般健康、受试者的年龄、体重和性别、饮食、施用的时间和频率、药物组合、反应敏感性和对疗法的耐受性/响应。长效药物组合物可以取决于特定制剂的半衰期和清除速率每3天至每4天一次、每周一次或每两周一次施用。
所需的包含本公开内容的靶向CFB mRNA的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的纳米颗粒的剂量取决于施用途径的选择;制剂的性质;患者疾患的性质;受试者的尺寸、体重、表面积、年龄和性别;正在施用的其他药物;和主治医师的判断。考虑到各种施用途径的不同效率,应预期所需剂量的广泛变化。例如,口服施用应预期需要比静脉注射施用更高的剂量(例如,2倍、3倍、4倍、6倍、8倍、10倍、20倍、50倍、100倍、150倍或更多倍)。这些剂量水平的变化可以使用本领域熟知的用于优化的标准经验例程来调节。施用可以是单次或多于一次的。将抑制剂包封在合适的递送媒介物(例如,胶囊或可植入装置)中可以提高递送效率,特别是对于口服递送。
治疗有效剂量的本公开内容的靶向CFB mRNA的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)可以任选地与批准量的治疗剂组合,并且如本文描述。
药盒和制品
本公开内容还提供了药盒,其包含至少一种本文公开的分离的寡核苷酸、编码本文公开的分离的寡核苷酸的本公开内容的载体、本公开内容的递送系统或本公开内容的药物组合物。在一些实施方案中,载体编码本文公开的一种分离的寡核苷酸。在一些实施方案中,载体编码多于一种本文公开的分离的寡核苷酸。
药盒用于治疗与人类CFB的不正常或异常表达相关的疾病。药盒用于部分或完全下调或抑制补体CFB的表达。在一些实施方案中,药盒用于治疗哺乳动物中的疾病或下调或抑制CFB的表达。在一些实施方案中,哺乳动物是人类、小鼠、大鼠、兔、猪、牛科动物、犬科动物、猫科动物、有蹄类动物、猿、猴或马科动物物种。在一些实施方案中,哺乳动物是人类。
在本公开内容的药盒的一些实施方案中,药盒包含纳米颗粒。包含本公开内容的靶向补体CFB mRNA的一种或更多种分离的寡核苷酸(例如,dsRNA或siRNA)的纳米颗粒可以在包装在药盒中之前冻干,或者可以在具有药学上可接受的运载体、稀释剂或赋形剂的溶液中提供。
在本公开内容的药盒的一些实施方案中,药盒包含治疗有效量的组合物及其使用说明,所述组合物包含本公开内容的递送系统,所述递送系统包含一种或更多种靶向补体CFB的本公开内容的分离的寡核苷酸(dsRNA或siRNA)。在一些实施方案中,药盒还包含至少一种如本文描述的另外的治疗剂。
本公开内容的制品包括但不限于使用药盒治疗与补体CFB的不正常或异常表达相关的疾病或与补体CFB的表达相关的疾病的说明。
在一些实施方案中,药盒还包含用于施用本公开内容的分离的寡核苷酸、载体、递送系统和药物组合物的说明。
除非另有指示,否则本文中使用的所有百分比和比率以重量计。本公开内容的其他特征和优点根据不同的实例而明显。所提供的实例说明了可用于实践本公开内容的不同组分和方法。这些实例并不限制所要求保护的发明。基于本公开内容,本领域技术人员可以鉴定并采用可用于实践本公开内容的其他组份和方法。
本公开内容的序列
表1. 本申请的示例性序列
表2. 本申请的示例性序列和它们的效力
*图3示出了HDI小鼠肝中体内CFB剂量响应的示例性结果
^图4示出了HDI小鼠肝中体内CFB剂量响应的示例性结果
表3. 本公开内容的示例性修饰的序列
G:引导链,P:过客链
“m”表示2’-O-甲基修饰,“f”表示2’-F修饰,“EPmU”是连接到5’-末端尿嘧啶的磷酸模拟物(下文示出);“MeEPmU”是连接至5’-末端尿嘧啶的单甲基保护的磷酸模拟物(下文示出),“s”是硫代磷酸酯核苷酸间连接,并且“G1b”是GalNAc G1b部分(下文示出)。
(5’-MeEPmU)
(GalNAc G1b)
(5’-EPmUs)
实施例
实施例1:针对人类补体因子B (CFB) mRNA的siRNA化合物的设计和功效
化合物设计
设计了一组184种针对人类CFB转录物(登录号: NM_001710.6)的siRNA化合物(见表2)。
寡核苷酸合成
根据标准方案通过固相合成制备寡核苷酸。简言之,在固体支持物上进行寡核苷酸合成以从3’末端至5’末端掺入每个核苷亚磷酰胺以制备寡核苷酸单链。使用ETT或BTT作为偶联反应的活化剂。使用水/吡啶/THF中的碘氧化亚磷酸三酯(P(III))以提供磷酸主链,并且使用DDTT制备硫代磷酸酯连接。使用铵水溶液从固体支持物裂解寡核苷酸并全局去除保护基团。然后粗制寡核苷酸通过Genevac浓缩并通过AEX-HPLC纯化。将纯级分合并和浓缩,并通过LC-MS分析它们的纯度。然后使用MidiTrap G-25柱针对水透析寡核苷酸,浓缩,并测量它们的OD量。
为了制备siRNA双链体,将有义链和反义链基于等摩尔量在95℃退火10分钟,并冷却至室温。通过AEX-HPLC测定双链体纯度,并将溶液冻干以提供期望的siRNA双链体粉末。
体外筛选
用PBS将化合物稀释到期望的浓度。然后在第0天用Lipofectamine RNAiMAX(Invitrogen-13778-150)试剂将稀释的化合物转染到培养的Huh-7细胞中。以0.02 nM和0.1 nM的浓度测试每种化合物。在第1天转染后24小时,使用RNeasy 96试剂盒(Qiagen-74182)从转染的细胞中提取mRNA。
对于浓度为0.02 nM和0.1 nM的每种化合物,确定当针对Gapdh mRNA水平归一化时相对于模拟转染细胞中剩余的人类CFB mRNA的百分比。结果鉴定了能够以指定浓度将转染的细胞中的人类CFB mRNA的水平降低20%至50%或超过50%的几种化合物,如表2和图1和图2中描述。此外,来自在表2中以粗体示出的几种化合物能够以0.02 nM和0.1 nM将转染的细胞中的人类CFB mRNA的水平降低20%至50%之间或至少50% (参见表2,和图1和图2)。总之,本公开内容鉴定了当以0.02 nM或0.1 nM的剂量或以两者的浓度施用时降低靶细胞中CFB mRNA水平的许多siRNA化合物。
体内HDI筛选
将来自表2的具有GalNAc缀合的化合物的子集配制在1X PBS中,在第1天通过皮下给药,给药至BALB/c雌性动物(6~8周龄)。然后在第4天,使动物接受10 µg pcDNA3.1-hsCFB质粒。在第5天采集肝活检,用于通过RT-qPCR进行剩余的mRNA分析。
对于剂量响应研究,6-8周龄雌性BALB/c小鼠以0.25 mg/kg (灰色三角形)、0.5mg/kg (灰色方形)或1 mg/kg (黑色圆圈) (图4)皮下给药。对照动物用PBS给药。在给药后4天处死动物,并收集肝样品用于RNA提取和通过RT-qPCR分析人类CFB mRNA表达。实验结果示出于图3和图4中。测试的化合物能够降低人类CFB mRNA的水平。
食蟹猴中体内效力和持续时间评估
为了确定非人灵长类动物中的CFB敲低,在食蟹猴中进行了一项非终末期的研究。具有GalNAc缀合的化合物的子集(表3)进行了测试。在给药前一周(第-7天),从研究中的食蟹猴采集肝活检以确定基线mRNA表达水平。活检后一周(第1天),对动物进行皮下单剂量3mg/kg的给药。在给药后第15天、29天、57天、85天和113天采集肝活检。在给药后第7天、14天、21天、28天、42天、56天、70天和84天收集血清样品。肝样品用于通过RT-qPCR进行剩余的mRNA分析,并且血液样品用于通过ELISA进行血清CFB蛋白质分析。
RT-qPCR
用RNeasy Plus微型试剂盒(Qiagen, 74104)制备肝mRNA样品。使用具有RNA酶抑制剂的高容量cDNA逆转录试剂盒(Thermo, 4374967)将mRNA逆转录成cDNA。进行TaqMan多重qPCR测定(Thermo, 4444557)以确定随时间的相对CFB mRNA水平。
ELISA
验证了CFB人类ELISA试剂盒(Abcam, ab137973)对食蟹猴的交叉反应性。将血清样品1:3,000稀释并进行ELISA。基于标准曲线计算CFB蛋白质水平(µg/ml),并针对给药前归一化。实验结果示出于图5A和图5B中。如图5A中示出,到第15天,所有化合物相对于给药前水平(第-7天)使肝CFB mRNA降低至少80%。如图5A中示出,在给药后第15天对于所有化合物观察到CFB mRNA的最大降低。如图5B中示出,到第14天、21天、28天、42天和56天,所有化合物相对于给药前水平(第-7天)使血清CFB蛋白质降低至少60%。如图5B中示出,在给药后第28天对于所有化合物观察到血清CFB蛋白质的最大降低。
本公开内容的另外的实施方案包括以下:
实施方案1. 一种分离的寡核苷酸,包含有义链和反义链,其中:
有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:
a) 493至534;
b) 991至1054;
c) 1384至1500;
d) 1606至1686;
e) 1821至1881;
f) 2116至2307;和
g) 2382至2468,
并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域。
实施方案2. 根据实施方案1的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:
a) 493至534;
b) 991至1054;
c) 1384至1500;
d) 1606至1686;
e) 1821至1881;
f) 2116至2307;和
g) 2382至2468。
实施方案3. 根据实施方案1的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域相同的核苷酸序列:
a) 493至534;
b) 991至1054;
c) 1384至1500;
d) 1606至1686;
e) 1821至1881;
f) 2116至2307;和
g) 2382至2468。
实施方案4. 根据实施方案1-3中任一项的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本相同的核苷酸序列:
a) 503至523;和
b) 2190至2210。
实施方案5. 根据实施方案4的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:
a) 503至523;和
b) 2190至2210。
实施方案6. 根据实施方案4的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:
a) 503至523;和
b) 2190至2210。
实施方案7. 根据实施方案1-3中任一项的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本相同的核苷酸序列:
a) 493至534;
b) 991至1054;
c) 1384至1500;
d) 1666至1686;
e) 1821至1881;
f) 2116至2136;
g) 2232至2307;和
h) 2394至2468。
实施方案8. 根据实施方案7的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:
a) 493至534;
b) 991至1054;
c) 1384至1500;
d) 1666至1686;
e) 1821至1881;
f) 2116至2136;
g) 2232至2307;和
h) 2394至2468。
实施方案9. 根据实施方案7的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:
a) 493至534;
b) 991至1054;
c) 1384至1500;
d) 1666至1686;
e) 1821至1881;
f) 2116至2136;
g) 2232至2307;和
h) 2394至2468。
实施方案10. 根据实施方案1-3中任一项的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本相同的核苷酸序列:
a) 995至1019;
b) 1606至1626;
c) 1860至1880;和
d) 2382至2402。
实施方案11. 根据实施方案10的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:
a) 995至1019;
b) 1606至1626;
c) 1860至1880;和
d) 2382至2402。
实施方案12. 根据实施方案10的分离的寡核苷酸,其中有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:
a) 995至1019;
b) 1606至1626;
c) 1860至1880;和
d) 2382至2402。
实施方案13. 根据实施方案1-12中任一项的分离的寡核苷酸,其中分离的寡核苷酸能够诱导CFB mRNA的降解。
实施方案14. 根据实施方案1-13中任一项的分离的寡核苷酸,其中有义链或反义链是单链RNA分子。
实施方案15. 根据实施方案1-13中任一项的分离的寡核苷酸,其中有义链和反义链两者都是单链RNA分子。
实施方案16. 根据实施方案1-15中任一项的分离的寡核苷酸,其中反义链包含3’突出端。
实施方案17. 根据实施方案16的分离的寡核苷酸,其中3’突出端包含至少一个核苷酸。
实施方案18. 根据实施方案1-17中任一项的分离的寡核苷酸,其中有义链包含长度为至少20个核苷酸的RNA序列。
实施方案19. 根据实施方案1-18中任一项的分离的寡核苷酸,其中反义链包含长度为至少22个核苷酸的RNA序列。
实施方案20. 根据实施方案1-19中任一项的分离的寡核苷酸,其中双链区域的长度在19个和21个核苷酸之间。
实施方案21. 根据实施方案1-20中任一项的分离的寡核苷酸,其中反义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ ID NO: 2-35。
实施方案22. 根据实施方案1-21中任一项的分离的寡核苷酸,其中有义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ ID NO: 36-69。
实施方案23. 根据实施方案6的分离的寡核苷酸,其中双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 5 (5’ UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’ GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;或
ii)根据SEQ ID NO: 28 (5’ UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’ UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链。
实施方案24. 根据实施方案9的分离的寡核苷酸,其中双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 36 (5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 3 (5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’ AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 4 (5’ UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38 (5’ AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 6 (5’ UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 389 (5’ ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 7 (5’ UUUGACUAGACACUUUUUGGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 41 (5’ CCAAAAAGUGUCUAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 9 (5’ UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’ GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 11 (5’ UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’ UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 12 (5’ UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’ AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 13 (5’ UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’ CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 14 (5’ UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’ AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 15 (5’ UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 16 (5’ UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’ AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 17 (5’ UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’ UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 19 (5’ UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’ CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 20 (5’ UAUUCAGGAAUUCCUGCUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 54 (5’ GAAGCAGGAAUUCCUGAAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 21 (5’ UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’ AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 22 (5’ UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’ CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xviii)根据SEQ ID NO: 23 (5’ UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’ AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 24 (5’ UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’ AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xx)根据SEQ ID NO: 26 (5’ UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’ UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxi)根据SEQ ID NO: 27 (5’ UUUGACUUUGUCAUAGCCUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 61 (5’ CAGGCUAUGACAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxii)根据SEQ ID NO: 29 (5’ UUUCUCUUGUGAACUAUCAAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 63 (5’ UUGAUAGUUCACAAGAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiii)根据SEQ ID NO: 30 (5’ UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’ UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiv)根据SEQ ID NO: 31 (5’ UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’ UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxv)根据SEQ ID NO: 33 (5’ UAACCCAAAUCCUCAUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 67 (5’ CAAGAUGAGGAUUUGGGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvi)根据SEQ ID NO: 34 (5’ UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’ AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;或
xxvii)根据SEQ ID NO: 35 (5’ UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’ GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链。
实施方案25. 根据实施方案12的分离的寡核苷酸,其中双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 8 (5’ UUAAGUUGACUAGACACUUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 42 (5’ AAAGUGUCUAGUCAACUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 10 (5’ UCAAUUAAGUUGACUAGACACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 44 (5’ UGUCUAGUCAACUUAAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 18 (5’ UGAGAUCUUGGCCUGCCAUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 52 (5’ CAUGGCAGGCCAAGAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 25 (5’ UUAUUCUUGAGCUUGAUCAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 59 (5’ CUGAUCAAGCUCAAGAAUAA 3’)的核酸序列的有义链;或
v)根据SEQ ID NO: 32 (5’ UCAUCUUGGAGUUUCUCCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 66 (5’ AAGGAGAAACUCCAAGAUGA 3’)的核酸序列的有义链。
实施方案26. 根据实施方案1-25中任一项的分离的寡核苷酸,其中分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%。
实施方案27. 根据实施方案26的分离的寡核苷酸,其中双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 36 (5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 3 (5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’ AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 4 (5’ UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38 (5’ AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 6 (5’ UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 389 (5’ ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 7 (5’ UUUGACUAGACACUUUUUGGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 41 (5’ CCAAAAAGUGUCUAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 9 (5’ UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’ GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 11 (5’ UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’ UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 12 (5’ UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’ AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 13 (5’ UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’ CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 14 (5’ UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’ AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 15 (5’ UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 16 (5’ UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’ AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 17 (5’ UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’ UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 19 (5’ UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’ CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 20 (5’ UAUUCAGGAAUUCCUGCUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 54 (5’ GAAGCAGGAAUUCCUGAAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 21 (5’ UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’ AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 22 (5’ UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’ CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xviii)根据SEQ ID NO: 23 (5’ UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’ AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 24 (5’ UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’ AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xx)根据SEQ ID NO: 26 (5’ UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’ UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxi)根据SEQ ID NO: 27 (5’ UUUGACUUUGUCAUAGCCUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 61 (5’ CAGGCUAUGACAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxii)根据SEQ ID NO: 29 (5’ UUUCUCUUGUGAACUAUCAAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 63 (5’ UUGAUAGUUCACAAGAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiii)根据SEQ ID NO: 30 (5’ UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’ UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiv)根据SEQ ID NO: 31 (5’ UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’ UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxv)根据SEQ ID NO: 33 (5’ UAACCCAAAUCCUCAUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 67 (5’ CAAGAUGAGGAUUUGGGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvi)根据SEQ ID NO: 34 (5’ UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’ AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvii)根据SEQ ID NO: 35 (5’ UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’ GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxviii)根据SEQ ID NO: 8 (5’ UUAAGUUGACUAGACACUUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 42 (5’ AAAGUGUCUAGUCAACUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxix)根据SEQ ID NO: 10 (5’ UCAAUUAAGUUGACUAGACACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 44 (5’ UGUCUAGUCAACUUAAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxx)根据SEQ ID NO: 18 (5’ UGAGAUCUUGGCCUGCCAUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 52 (5’ CAUGGCAGGCCAAGAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxi)根据SEQ ID NO: 25 (5’ UUAUUCUUGAGCUUGAUCAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 59 (5’ CUGAUCAAGCUCAAGAAUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxii)根据SEQ ID NO: 32 (5’ UCAUCUUGGAGUUUCUCCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 66 (5’ AAGGAGAAACUCCAAGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiii)根据SEQ ID NO: 5 (5’ UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’ GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;或
xxxiv)根据SEQ ID NO: 28 (5’ UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’ UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链。
实施方案28. 根据实施方案1-25中任一项的分离的寡核苷酸,其中分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%。
实施方案29. 根据实施方案28的分离的寡核苷酸,其中双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 36 (5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 3 (5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’ AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 4 (5’ UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38 (5’ AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 6 (5’ UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 389 (5’ ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 9 (5’ UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’ GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 12 (5’ UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’ AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 13 (5’ UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’ CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 14 (5’ UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’ AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 22 (5’ UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’ CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 23 (5’ UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’ AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 24 (5’ UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’ AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 30 (5’ UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’ UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 34 (5’ UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’ AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 35 (5’ UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’ GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 5 (5’ UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’ GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;或
xvi)根据SEQ ID NO: 28 (5’ UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’ UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链。
实施方案30. 根据实施方案25的分离的寡核苷酸,其中分离的寡核苷酸以0.02nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%。
实施方案31. 根据实施方案30的分离的寡核苷酸,其中双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 8 (5’ UUAAGUUGACUAGACACUUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 42 (5’ AAAGUGUCUAGUCAACUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 10 (5’ UCAAUUAAGUUGACUAGACACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 44 (5’ UGUCUAGUCAACUUAAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 18 (5’ UGAGAUCUUGGCCUGCCAUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 52 (5’ CAUGGCAGGCCAAGAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 25 (5’ UUAUUCUUGAGCUUGAUCAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 59 (5’ CUGAUCAAGCUCAAGAAUAA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 32 (5’ UCAUCUUGGAGUUUCUCCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 66 (5’ AAGGAGAAACUCCAAGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 31 (5’ UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’ UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 33 (5’ UAACCCAAAUCCUCAUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 67 (5’ CAAGAUGAGGAUUUGGGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 26 (5’ UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’ UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 27 (5’ UUUGACUUUGUCAUAGCCUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 61 (5’ CAGGCUAUGACAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 29 (5’ UUUCUCUUGUGAACUAUCAAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 63 (5’ UUGAUAGUUCACAAGAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 15 (5’ UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 16 (5’ UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’ AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 17 (5’ UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’ UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 19 (5’ UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’ CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 20 (5’ UAUUCAGGAAUUCCUGCUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 54 (5’ GAAGCAGGAAUUCCUGAAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 21 (5’ UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’ AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 7 (5’ UUUGACUAGACACUUUUUGGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 41 (5’ CCAAAAAGUGUCUAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;或
xviii)根据SEQ ID NO: 11 (5’ UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’ UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链。
实施方案32. 一种分离的寡核苷酸,包含有义链和反义链,其中:
有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:
a) 5至38;
b) 340至606;
c) 776至828;
d) 939至1227;
e) 1305至1606;
f) 1667至1746;
g) 1815至2313;和
h) 2378至2417,
并且反义链与有义链基本互补,使得有义链和反义链一起形成双链区域。
实施方案33. 根据实施方案32的分离的寡核苷酸,其中分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%。
实施方案34. 根据实施方案33的分离的寡核苷酸,其中双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 94 (5’ UGACACUUUUUGGCUCCUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 204 (5’ ACAGGAGCCAAAAAGUGUCA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 124 (5’ UAUGUUGCUCAUUGUCUUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 234 (5’ GAAAGACAAUGAGCAACAUA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 169 (5’ UCUCUUGUGAACUAUCAAGGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 279 (5’ CCUUGAUAGUUCACAAGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 87 (5’ UGUACAUGAAGGAGUCUUGGCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 197 (5’ CCAAGACUCCUUCAUGUACA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 163 (5’ UGUCAGCAUAGGGACUCACUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 273 (5’ AGUGAGUCCCUAUGCUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 104 (5’ UCUUCAACUUGUGGUCUUCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 214 (5’ UGAAGACCACAAGUUGAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 121 (5’ UCUCAUUGUCUUUCUUGGAAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 231 (5’ UUCCAAGAAAGACAAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 99 (5’ UUUCUCAAUUAAGUUGACUAGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 209 (5’ UAGUCAACUUAAUUGAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 155 (5’ UCUCUCUCACAGCUGCCUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 265 (5’ AAAGGCAGCUGUGAGAGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 144 (5’ UCUUAUUCUUGAGCUUGAUCAG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 254 (5’ GAUCAAGCUCAAGAAUAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 136 (5’ UCUGACCUUGAUUGAGUGUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 246 (5’ AACACUCAAUCAAGGUCAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 76 (5’ UGGAUUGCUCUGCACUCUGCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 186 (5’ GCAGAGUGCAGAGCAAUCCA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 134 (5’ UAACAAUGUGCUGCUGUCAGCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 244 (5’ CUGACAGCAGCACAUUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 158 (5’ UAUUGAGCAUCUCUCUCACAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 268 (5’ UGUGAGAGAGAUGCUCAAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 153 (5’ UCAUUCUUGAUGUAGACCUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 263 (5’ GAGGUCUACAUCAAGAAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 73 (5’ UGAAACUCCAGACCUAGACCUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 183 (5’ GGUCUAGGUCUGGAGUUUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 152 (5’ UCUUGAUGUAGACCUCCUUCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 262 (5’ GAAGGAGGUCUACAUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xviii)根据SEQ ID NO: 147 (5’ UCAGAGCUUUGAUAUCCUGUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 257 (5’ ACAGGAUAUCAAAGCUCUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 101 (5’ UCAUAACUUGCCACCUUCUCAA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 211 (5’ GAGAAGGUGGCAAGUUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xx)根据SEQ ID NO: 174 (5’ UUUCUGGUUUUUGCAGACAUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 284 (5’ AUGUCUGCAAAAACCAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxi)根据SEQ ID NO: 118 (5’ UUUUCUUGGAAGCCAAAGCAUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 228 (5’ UGCUUUGGCUUCCAAGAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxii)根据SEQ ID NO: 149 (5’ UAAACAGAGCUUUGAUAUCCUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 259 (5’ GGAUAUCAAAGCUCUGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiii)根据SEQ ID NO: 95 (5’ UGACUAGACACUUUUUGGCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 205 (5’ AGCCAAAAAGUGUCUAGUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiv)根据SEQ ID NO: 142 (5’ UUUCUUGAGCUUGAUCAGGGCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 252 (5’ CCCUGAUCAAGCUCAAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxv)根据SEQ ID NO: 160 (5’ UCAUAUUGAGCAUCUCUCUCAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 270 (5’ GAGAGAGAUGCUCAAUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvi)根据SEQ ID NO: 164 (5’ UGUAUUGGGGUCAGCAUAGGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 274 (5’ CCUAUGCUGACCCCAAUACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvii)根据SEQ ID NO: 74 (5’ UUGAAACUCCAGACCUAGACCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 184 (5’ GUCUAGGUCUGGAGUUUCAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxviii)根据SEQ ID NO: 91 (5’ UAUCCAUCUAGCACCAGGUAGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 201 (5’ UACCUGGUGCUAGAUGGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxix)根据SEQ ID NO: 167 (5’ UGUGAACUAUCAAGGGGCCGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 277 (5’ CGGCCCCUUGAUAGUUCACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxx)根据SEQ ID NO: 175 (5’ UUUGGAGUUUCUCCUUCAGCCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 285 (5’ GCUGAAGGAGAAACUCCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxi)根据SEQ ID NO: 72 (5’ UAAACUCCAGACCUAGACCUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 182 (5’ AGGUCUAGGUCUGGAGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxii)根据SEQ ID NO: 119 (5’ UCUUUCUUGGAAGCCAAAGCAU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 229 (5’ GCUUUGGCUUCCAAGAAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiii)根据SEQ ID NO: 154 (5’ UCUUUCUUAUCCCCAUUCUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 264 (5’ AAGAAUGGGGAUAAGAAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiv)根据SEQ ID NO: 70 (5’ UCUAGACCUGGUCACAUUCCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 180 (5’ GGAAUGUGACCAGGUCUAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxv)根据SEQ ID NO: 92 (5’ UCUGUCUGAUCCAUCUAGCACC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 202 (5’ UGCUAGAUGGAUCAGACAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxvi)根据SEQ ID NO: 116 (5’ UCAAAGCAUUGAUGUUCACUUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 226 (5’ AGUGAACAUCAAUGCUUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxvii)根据SEQ ID NO: 84 (5’ UGAGAGUGUAACCGUCAUAGCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 194 (5’ CUAUGACGGUUACACUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxviii)根据SEQ ID NO: 89 (5’ UGUCGUACAUGAAGGAGUCUUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 199 (5’ AGACUCCUUCAUGUACGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxix)根据SEQ ID NO: 83 (5’ UGAGUGUAACCGUCAUAGCAGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 193 (5’ UGCUAUGACGGUUACACUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xL)根据SEQ ID NO: 107 (5’ UUAAUUGGGUCCCCGCCCAUGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 217 (5’ AUGGGCGGGGACCCAAUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xLi)根据SEQ ID NO: 100 (5’ UAUAACUUGCCACCUUCUCAAU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 210 (5’ UGAGAAGGUGGCAAGUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xLii)根据SEQ ID NO: 157 (5’ UUUGAGCAUCUCUCUCACAGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 267 (5’ CUGUGAGAGAGAUGCUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xLiii)根据SEQ ID NO: 77 (5’ UCUCACAUUGUAGUAGGGAGAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 187 (5’ CUCCCUACUACAAUGUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLiv)根据SEQ ID NO: 105 (5’ UGACUUCAACUUGUGGUCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 215 (5’ AAGACCACAAGUUGAAGUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xLv)根据SEQ ID NO: 130 (5’ UCAGGUUUUCCAUAUCCUUGAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 240 (5’ CAAGGAUAUGGAAAACCUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLvi)根据SEQ ID NO: 166 (5’ UAACUAUCAAGGGGCCGCCAGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 276 (5’ UGGCGGCCCCUUGAUAGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xLvii)根据SEQ ID NO: 131 (5’ UCACAGAGACUCAGAGACUGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 241 (5’ CAGUCUCUGAGUCUCUGUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLviii)根据SEQ ID NO: 127 (5’ UCUUUGAACACAUGUUGCUCAU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 237 (5’ GAGCAACAUGUGUUCAAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLix)根据SEQ ID NO: 111 (5’ UAUCAAUGACAGUAAUUGGGUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 221 (5’ CCCAAUUACUGUCAUUGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
L)根据SEQ ID NO: 93 (5’ UCUUUUUGGCUCCUGUGAAGUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 203 (5’ CUUCACAGGAGCCAAAAAGA 3’)的核酸序列的有义链;或
Li)根据SEQ ID NO: 71 (5’ UAACUCCAGACCUAGACCUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 181 (5’ CAGGUCUAGGUCUGGAGUUA 3’)的核酸序列的有义链。
实施方案35. 根据实施方案32的分离的核苷酸,其中分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%。
实施方案36. 根据实施方案35的分离的寡核苷酸,其中双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 171 (5’ UAUGAAACGACUUCUCUUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 281 (5’ ACAAGAGAAGUCGUUUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 165 (5’ UAUCACCUCUGCAAGUAUUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 275 (5’ CAAUACUUGCAGAGGUGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 129 (5’ UUUUCCAUAUCCUUGACUUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 239 (5’ AAAGUCAAGGAUAUGGAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 176 (5’ UAUCUUGGAGUUUCUCCUUCAG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 286 (5’ GAAGGAGAAACUCCAAGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 177 (5’ UCUCAUCUUGGAGUUUCUCCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 287 (5’ GGAGAAACUCCAAGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 138 (5’ UCAUAAAAUUCAGGAAUUCCUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 248 (5’ GGAAUUCCUGAAUUUUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 140 (5’ UGUCAUAGUCAUAAAAUUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 250 (5’ UGAAUUUUAUGACUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 148 (5’ UAACAGAGCUUUGAUAUCCUGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 258 (5’ AGGAUAUCAAAGCUCUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 150 (5’ UCAAACAGAGCUUUGAUAUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 260 (5’ GAUAUCAAAGCUCUGUUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 179 (5’ UGAAAACCCAAAUCCUCAUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 289 (5’ GAUGAGGAUUUGGGUUUUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 90 (5’ UAAAGCUUCGGCCACCUCUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 200 (5’ AAGAGGUGGCCGAAGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 172 (5’ UUUUUGCAGACAUCCACUACUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 282 (5’ GUAGUGGAUGUCUGCAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 88 (5’ UCGUACAUGAAGGAGUCUUGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 198 (5’ CAAGACUCCUUCAUGUACGA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 168 (5’ UUUGUGAACUAUCAAGGGGCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 278 (5’ GCCCCUUGAUAGUUCACAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 81 (5’ UGUGGAAAGAGAUCUCAUCACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 191 (5’ UGAUGAGAUCUCUUUCCACA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 159 (5’ UAUAUUGAGCAUCUCUCUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 269 (5’ UGAGAGAGAUGCUCAAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 82 (5’ UCAUAGCAGUGGAAAGAGAUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 192 (5’ AUCUCUUUCCACUGCUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xviii)根据SEQ ID NO: 97 (5’ UUUAAGUUGACUAGACACUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 207 (5’ AAGUGUCUAGUCAACUUAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 132 (5’ UUUGCUUGUGGUAAUCGGUACC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 242 (5’ UACCGAUUACCACAAGCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xx)根据SEQ ID NO: 123 (5’ UGUUGCUCAUUGUCUUUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 233 (5’ AAGAAAGACAAUGAGCAACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxi)根据SEQ ID NO: 126 (5’ UUUUGAACACAUGUUGCUCAUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 236 (5’ UGAGCAACAUGUGUUCAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxii)根据SEQ ID NO: 162 (5’ UGAGAUGUCCUUGACUUUGUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 272 (5’ ACAAAGUCAAGGACAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiii)根据SEQ ID NO: 79 (5’ UCAUCACUCACAUUGUAGUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 189 (5’ UACUACAAUGUGAGUGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiv)根据SEQ ID NO: 151 (5’ UCAGACACAAACAGAGCUUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 261 (5’ AAAGCUCUGUUUGUGUCUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxv)根据SEQ ID NO: 143 (5’ UAUUCUUGAGCUUGAUCAGGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 253 (5’ CCUGAUCAAGCUCAAGAAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvi)根据SEQ ID NO: 117 (5’ UAAGCCAAAGCAUUGAUGUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 227 (5’ AACAUCAAUGCUUUGGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvii)根据SEQ ID NO: 133 (5’ UAAAGUACUCAGACACCACAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 243 (5’ UGUGGUGUCUGAGUACUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxviii)根据SEQ ID NO: 122 (5’ UUUGCUCAUUGUCUUUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 232 (5’ CAAGAAAGACAAUGAGCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxix)根据SEQ ID NO: 110 (5’ UCAAUGACAGUAAUUGGGUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 220 (5’ GACCCAAUUACUGUCAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxx)根据SEQ ID NO: 173 (5’ UGUUUUUGCAGACAUCCACUAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 283 (5’ AGUGGAUGUCUGCAAAAACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxi)根据SEQ ID NO: 156 (5’ UGAGCAUCUCUCUCACAGCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 266 (5’ AGCUGUGAGAGAGAUGCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxii)根据SEQ ID NO: 141 (5’ UCUUGAUCAGGGCAACGUCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 251 (5’ UGACGUUGCCCUGAUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiii)根据SEQ ID NO: 135 (5’ UCUUGAUUGAGUGUUCCUUGUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 245 (5’ CAAGGAACACUCAAUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiv)根据SEQ ID NO: 170 (5’ UGACUUCUCUUGUGAACUAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 280 (5’ AUAGUUCACAAGAGAAGUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxv)根据SEQ ID NO: 178 (5’ UAAUCCUCAUCUUGGAGUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 288 (5’ AAACUCCAAGAUGAGGAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxvi)根据SEQ ID NO: 114 (5’ UAUAGACAUCCAGAUAAUCCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 224 (5’ GGAUUAUCUGGAUGUCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxvii)根据SEQ ID NO: 139 (5’ UCAUAGUCAUAAAAUUCAGGAA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 249 (5’ CCUGAAUUUUAUGACUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxviii)根据SEQ ID NO: 125 (5’ UCAUGUUGCUCAUUGUCUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 235 (5’ AAAGACAAUGAGCAACAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxix)根据SEQ ID NO: 145 (5’ UGAGACAAAUGGGCCUGAUAGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 255 (5’ UAUCAGGCCCAUUUGUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xL)根据SEQ ID NO: 113 (5’ UCUCAUCAAUGACAGUAAUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 223 (5’ AAUUACUGUCAUUGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLi)根据SEQ ID NO: 120 (5’ UGUCUUUCUUGGAAGCCAAAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 230 (5’ UUUGGCUUCCAAGAAAGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xLii)根据SEQ ID NO: 75 (5’ UGAUCUGCAGGUACGUGUCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 185 (5’ AGACACGUACCUGCAGAUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xLiii)根据SEQ ID NO: 112 (5’ UCAUCAAUGACAGUAAUUGGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 222 (5’ CCAAUUACUGUCAUUGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLiv)根据SEQ ID NO: 108 (5’ UAUGACAGUAAUUGGGUCCCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 218 (5’ GGGACCCAAUUACUGUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xLv)根据SEQ ID NO: 128 (5’ UGACUUUGAACACAUGUUGCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 238 (5’ GCAACAUGUGUUCAAAGUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xLvi)根据SEQ ID NO: 161 (5’ UCUUGACUUUGUCAUAGCCUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 271 (5’ AGGCUAUGACAAAGUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLvii)根据SEQ ID NO: 85 (5’ UUUGUCACAGAUCGCUGUCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 195 (5’ AGACAGCGAUCUGUGACAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xLviii)根据SEQ ID NO: 137 (5’ UGAAUUCCUGCUUCUUUUUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 247 (5’ AAAAAAGAAGCAGGAAUUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xLix)根据SEQ ID NO: 80 (5’ UGAAAGAGAUCUCAUCACUCAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 190 (5’ GAGUGAUGAGAUCUCUUUCA 3’)的核酸序列的有义链;
L)根据SEQ ID NO: 115 (5’ UCAUAGACAUCCAGAUAAUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 225 (5’ GAUUAUCUGGAUGUCUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
Li)根据SEQ ID NO: 96 (5’ UGUUGACUAGACACUUUUUGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 206 (5’ CAAAAAGUGUCUAGUCAACA 3’)的核酸序列的有义链;
Lii)根据SEQ ID NO: 146 (5’ UAAGUGGUAGUUGGAGGAAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 256 (5’ CUUCCUCCAACUACCACUUA 3’)的核酸序列的有义链;
Liii)根据SEQ ID NO: 78 (5’ UAUCACUCACAUUGUAGUAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 188 (5’ CUACUACAAUGUGAGUGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
Liv)根据SEQ ID NO: 103 (5’ UUUCACACCAUAACUUGCCACC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 213 (5’ UGGCAAGUUAUGGUGUGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
Lv)根据SEQ ID NO: 102 (5’ UCACCAUAACUUGCCACCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 212 (5’ AAGGUGGCAAGUUAUGGUGA 3’)的核酸序列的有义链;
Lvi)根据SEQ ID NO: 109 (5’ UAAUGACAGUAAUUGGGUCCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 219 (5’ GGACCCAAUUACUGUCAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
Lvii)根据SEQ ID NO: 86 (5’ UCAUGAAGGAGUCUUGGCAGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 196 (5’ CUGCCAAGACUCCUUCAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
Lviii)根据SEQ ID NO: 106 (5’ UCUCAUCAUGCUGUACACUGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 216 (5’ CAGUGUACAGCAUGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;或
Lix)根据SEQ ID NO: 98 (5’ UCUCAAUUAAGUUGACUAGACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 208 (5’ UCUAGUCAACUUAAUUGAGA 3’)的核酸序列的有义链。
实施方案37. 根据实施方案32的分离的寡核苷酸,其中分离的寡核苷酸以0.02nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%。
实施方案38. 根据实施方案37的分离的寡核苷酸,其中双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 165 (5’ UAUCACCUCUGCAAGUAUUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 275 (5’ CAAUACUUGCAGAGGUGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 129 (5’ UUUUCCAUAUCCUUGACUUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 239 (5’ AAAGUCAAGGAUAUGGAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 176 (5’ UAUCUUGGAGUUUCUCCUUCAG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 286 (5’ GAAGGAGAAACUCCAAGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 177 (5’ UCUCAUCUUGGAGUUUCUCCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 287 (5’ GGAGAAACUCCAAGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 138 (5’ UCAUAAAAUUCAGGAAUUCCUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 248 (5’ GGAAUUCCUGAAUUUUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 140 (5’ UGUCAUAGUCAUAAAAUUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 250 (5’ UGAAUUUUAUGACUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 148 (5’ UAACAGAGCUUUGAUAUCCUGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 258 (5’ AGGAUAUCAAAGCUCUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 150 (5’ UCAAACAGAGCUUUGAUAUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 260 (5’ GAUAUCAAAGCUCUGUUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 179 (5’ UGAAAACCCAAAUCCUCAUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 289 (5’ GAUGAGGAUUUGGGUUUUCA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 90 (5’ UAAAGCUUCGGCCACCUCUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 200 (5’ AAGAGGUGGCCGAAGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 172 (5’ UUUUUGCAGACAUCCACUACUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 282 (5’ GUAGUGGAUGUCUGCAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 88 (5’ UCGUACAUGAAGGAGUCUUGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 198 (5’ CAAGACUCCUUCAUGUACGA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 168 (5’ UUUGUGAACUAUCAAGGGGCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 278 (5’ GCCCCUUGAUAGUUCACAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 81 (5’ UGUGGAAAGAGAUCUCAUCACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 191 (5’ UGAUGAGAUCUCUUUCCACA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 159 (5’ UAUAUUGAGCAUCUCUCUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 269 (5’ UGAGAGAGAUGCUCAAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 82 (5’ UCAUAGCAGUGGAAAGAGAUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 192 (5’ AUCUCUUUCCACUGCUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 97 (5’ UUUAAGUUGACUAGACACUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 207 (5’ AAGUGUCUAGUCAACUUAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xviii)根据SEQ ID NO: 132 (5’ UUUGCUUGUGGUAAUCGGUACC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 242 (5’ UACCGAUUACCACAAGCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 123 (5’ UGUUGCUCAUUGUCUUUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 233 (5’ AAGAAAGACAAUGAGCAACA 3’)的核酸序列的有义链;
xx)根据SEQ ID NO: 79 (5’ UCAUCACUCACAUUGUAGUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 189 (5’ UACUACAAUGUGAGUGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxi)根据SEQ ID NO: 117 (5’ UAAGCCAAAGCAUUGAUGUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 227 (5’ AACAUCAAUGCUUUGGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxii)根据SEQ ID NO: 122 (5’ UUUGCUCAUUGUCUUUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 232 (5’ CAAGAAAGACAAUGAGCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiii)根据SEQ ID NO: 110 (5’ UCAAUGACAGUAAUUGGGUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 220 (5’ GACCCAAUUACUGUCAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiv)根据SEQ ID NO: 135 (5’ UCUUGAUUGAGUGUUCCUUGUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 245 (5’ CAAGGAACACUCAAUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxv)根据SEQ ID NO: 178 (5’ UAAUCCUCAUCUUGGAGUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 288 (5’ AAACUCCAAGAUGAGGAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvi)根据SEQ ID NO: 114 (5’ UAUAGACAUCCAGAUAAUCCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 224 (5’ GGAUUAUCUGGAUGUCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvii)根据SEQ ID NO: 125 (5’ UCAUGUUGCUCAUUGUCUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 235 (5’ AAAGACAAUGAGCAACAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxviii)根据SEQ ID NO: 113 (5’ UCUCAUCAAUGACAGUAAUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 223 (5’ AAUUACUGUCAUUGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 120 (5’ UGUCUUUCUUGGAAGCCAAAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 230 (5’ UUUGGCUUCCAAGAAAGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxx)根据SEQ ID NO: 75 (5’ UGAUCUGCAGGUACGUGUCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 185 (5’ AGACACGUACCUGCAGAUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxi)根据SEQ ID NO: 112 (5’ UCAUCAAUGACAGUAAUUGGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 222 (5’ CCAAUUACUGUCAUUGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxii)根据SEQ ID NO: 108 (5’ UAUGACAGUAAUUGGGUCCCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 218 (5’ GGGACCCAAUUACUGUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiii)根据SEQ ID NO: 115 (5’ UCAUAGACAUCCAGAUAAUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 225 (5’ GAUUAUCUGGAUGUCUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiv)根据SEQ ID NO: 102 (5’ UCACCAUAACUUGCCACCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 212 (5’ AAGGUGGCAAGUUAUGGUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxv)根据SEQ ID NO: 109 (5’ UAAUGACAGUAAUUGGGUCCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 219 (5’ GGACCCAAUUACUGUCAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxvi)根据SEQ ID NO: 106 (5’ UCUCAUCAUGCUGUACACUGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 216 (5’ CAGUGUACAGCAUGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxvii)根据SEQ ID NO: 98 (5’ UCUCAAUUAAGUUGACUAGACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 208 (5’ UCUAGUCAACUUAAUUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxviii)根据SEQ ID NO: 124 (5’ UAUGUUGCUCAUUGUCUUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 234 (5’ GAAAGACAAUGAGCAACAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxix)根据SEQ ID NO: 121 (5’ UCUCAUUGUCUUUCUUGGAAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 231 (5’ UUCCAAGAAAGACAAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;或
xL)根据SEQ ID NO: 107 (5’ UUAAUUGGGUCCCCGCCCAUGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 217 (5’ AUGGGCGGGGACCCAAUUAA 3’)的核酸序列的有义链。
实施方案39. 根据实施方案32的分离的寡核苷酸,其中分离的寡核苷酸以0.02nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%。
实施方案40. 根据实施方案39的分离的寡核苷酸,其中双链区域包含根据SEQ IDNO: 171 (5’ UAUGAAACGACUUCUCUUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 281(5’ ACAAGAGAAGUCGUUUCAUA 3’)的核酸序列的有义链。
实施方案41. 根据实施方案1-40中任一项的分离的寡核苷酸,其中有义链或反义链或两者包含一个或更多个修饰的核苷酸。
实施方案42. 一种载体,编码实施方案1-41中任一项的分离的寡核苷酸。
实施方案43. 一种递送系统,包含根据实施方案1-41中任一项的分离的寡核苷酸或实施方案42的载体。
实施方案44. 一种药物组合物,包含至少一种根据实施方案1-41中任一项的分离的寡核苷酸、根据实施方案42的载体、或根据实施方案43的递送系统和药学上可接受的运载体、稀释剂或赋形剂。
实施方案45. 一种药盒,包含至少一种根据实施方案1-41中任一项的分离的寡核苷酸、根据实施方案42的载体、根据实施方案43的递送系统或根据实施方案44的药物组合物。
实施方案46. 一种在有相应需要的受试者中抑制或下调CFB的表达或水平的方法,其中该方法包括向受试者施用有效量的至少一种根据实施方案1-41中任一项的分离的寡核苷酸、根据实施方案42的载体、根据实施方案43的递送系统或根据实施方案44的药物组合物。
实施方案47. 一种在有相应需要的受试者中治疗或预防与CFB的异常或增加的表达或活性相关的疾病或紊乱或其中CFB起作用的疾病或紊乱的方法,其中该方法包括向受试者施用有效量的至少一种根据实施方案1-41中任一项的分离的寡核苷酸、根据实施方案42的载体、根据实施方案43的递送系统或根据实施方案44的药物组合物。
实施方案48. 根据实施方案1的分离的寡核苷酸,其中分离的寡核苷酸以1 mg/kg的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少25%。
实施方案49. 根据实施方案48的分离的寡核苷酸,其中双链区域包含:i)根据SEQID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 36(5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 3 (5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’ AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 4 (5’ UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38 (5’ AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 5 (5’ UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’ GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 6 (5’ UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 391 (5’ ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 8 (5’ UUAAGUUGACUAGACACUUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 42 (5’ AAAGUGUCUAGUCAACUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 9 (5’ UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’ GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 11 (5’ UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’ UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 12 (5’ UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’ AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 13 (5’ UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’ CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 14 (5’ UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’ AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 15 (5’ UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 16 (5’ UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’ AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 17 (5’ UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’ UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 18 (5’ UGAGAUCUUGGCCUGCCAUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 52 (5’ CAUGGCAGGCCAAGAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 19 (5’ UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’ CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 21 (5’ UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’ AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xviii)根据SEQ ID NO: 22 (5’ UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’ CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 23 (5’ UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’ AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xx)根据SEQ ID NO: 24 (5’ UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’ AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxi)根据SEQ ID NO: 25 (5’ UUAUUCUUGAGCUUGAUCAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 59 (5’ CUGAUCAAGCUCAAGAAUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxii)根据SEQ ID NO: 26 (5’ UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’ UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiii)根据SEQ ID NO: 28 (5’ UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’ UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiv)根据SEQ ID NO: 30 (5’ UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’ UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxv)根据SEQ ID NO: 171 (5’ UAUGAAACGACUUCUCUUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 281 (5’ ACAAGAGAAGUCGUUUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvi)根据SEQ ID NO: 31 (5’ UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’ UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvii)根据SEQ ID NO: 32 (5’ UCAUCUUGGAGUUUCUCCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 66 (5’ AAGGAGAAACUCCAAGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxviii)根据SEQ ID NO: 34 (5’ UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’ AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;或
xxix)根据SEQ ID NO: 35 (5’ UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’ GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链。
实施方案50. 根据实施方案48的分离的寡核苷酸,其中双链区域包含:i)根据SEQID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 36(5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 3 (5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’ AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 4 (5’ UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38 (5’ AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 5 (5’ UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’ GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 6 (5’ UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 391 (5’ ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 9 (5’ UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’ GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 11 (5’ UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’ UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 12 (5’ UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’ AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 13 (5’ UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’ CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 14 (5’ UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’ AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 15 (5’ UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 16 (5’ UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’ AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 17 (5’ UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’ UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 19 (5’ UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’ CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 21 (5’ UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’ AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 22 (5’ UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’ CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 23 (5’ UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’ AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xviii)根据SEQ ID NO: 24 (5’ UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’ AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 26 (5’ UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’ UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xx)根据SEQ ID NO: 28 (5’ UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’ UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxi)根据SEQ ID NO: 30 (5’ UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’ UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxii)根据SEQ ID NO: 171 (5’ UAUGAAACGACUUCUCUUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 281 (5’ ACAAGAGAAGUCGUUUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiii)根据SEQ ID NO: 31 (5’ UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’ UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiv)根据SEQ ID NO: 34 (5’ UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’ AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;或
xxv)根据SEQ ID NO: 35 (5’ UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’ GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链。

Claims (55)

1.一种分离的寡核苷酸,包含有义链和反义链,其中:
所述有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:
a) 493至534;
b) 991至1054;
c) 1384至1500;
d) 1606至1686;
e) 1821至1881;
f) 2116至2307;和
g) 2382至2468,
并且所述反义链与所述有义链基本互补,使得所述有义链和所述反义链一起形成双链区域。
2.根据权利要求1所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:
a) 493至534;
b) 991至1054;
c) 1384至1500;
d) 1606至1686;
e) 1821至1881;
f) 2116至2307;和
g) 2382至2468。
3.根据权利要求1所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域相同的核苷酸序列:
a) 493至534;
b) 991至1054;
c) 1384至1500;
d) 1606至1686;
e) 1821至1881;
f) 2116至2307;和
g) 2382至2468。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本相同的核苷酸序列:
a) 503至523;和
b) 2190至2210。
5.根据权利要求4所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含与在选自从根据SEQID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:
a) 503至523;和
b) 2190至2210。
6.根据权利要求4所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含与在选自从根据SEQID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:
a) 503至523;和
b) 2190至2210。
7.根据权利要求1-3中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本相同的核苷酸序列:
a) 493至534;
b) 991至1054;
c) 1384至1500;
d) 1666至1686;
e) 1821至1881;
f) 2116至2136;
g) 2232至2307;和
h) 2394至2468。
8.根据权利要求7所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含与在选自从根据SEQID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:
a) 493至534;
b) 991至1054;
c) 1384至1500;
d) 1666至1686;
e) 1821至1881;
f) 2116至2136;
g) 2232至2307;和
h) 2394至2468。
9.根据权利要求7所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含与在选自从根据SEQID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:
a) 493至534;
b) 991至1054;
c) 1384至1500;
d) 1666至1686;
e) 1821至1881;
f) 2116至2136;
g) 2232至2307;和
h) 2394至2468。
10.根据权利要求1-3中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含与在选自从根据SEQ ID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域基本相同的核苷酸序列:
a) 995至1019;
b) 1606至1626;
c) 1860至1880;和
d) 2382至2402。
11.根据权利要求10所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含与在选自从根据SEQID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或至少99%相同的核苷酸序列:
a) 995至1019;
b) 1606至1626;
c) 1860至1880;和
d) 2382至2402。
12.根据权利要求10所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含与在选自从根据SEQID NO: 1的人类CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的区域相同的核苷酸序列:
a) 995至1019;
b) 1606至1626;
c) 1860至1880;和
d) 2382至2402。
13.根据权利要求1-12中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述分离的寡核苷酸能够诱导所述CFB mRNA的降解。
14.根据权利要求1-13中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链或反义链是单链RNA分子。
15.根据权利要求1-13中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链和所述反义链两者都是单链RNA分子。
16.根据权利要求1-15中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述反义链包含3’突出端。
17.根据权利要求16所述的分离的寡核苷酸,其中所述3’突出端包含至少一个核苷酸。
18.根据权利要求1-17中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含长度为至少20个核苷酸的RNA序列。
19.根据权利要求1-18中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述反义链包含长度为至少22个核苷酸的RNA序列。
20.根据权利要求1-19中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述双链区域的长度在19个和21个核苷酸之间。
21.根据权利要求1-20中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述反义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ ID NO: 2-35。
22.根据权利要求1-21中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含根据以下任一项的核苷酸序列:SEQ ID NO: 36-69。
23.根据权利要求6所述的分离的寡核苷酸,其中所述双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 5 (5’ UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’ GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;或
ii)根据SEQ ID NO: 28 (5’ UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’ UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链。
24.根据权利要求9所述的分离的寡核苷酸,其中所述双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 36 (5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 3 (5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’ AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 4 (5’ UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38 (5’ AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 6 (5’ UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 389 (5’ ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 7 (5’ UUUGACUAGACACUUUUUGGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 41 (5’ CCAAAAAGUGUCUAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 9 (5’ UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’ GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 11 (5’ UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’ UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 12 (5’ UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’ AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 13 (5’ UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’ CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 14 (5’ UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’ AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 15 (5’ UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 16 (5’ UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’ AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 17 (5’ UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’ UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 19 (5’ UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’ CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 20 (5’ UAUUCAGGAAUUCCUGCUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 54 (5’ GAAGCAGGAAUUCCUGAAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 21 (5’ UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’ AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 22 (5’ UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’ CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xviii)根据SEQ ID NO: 23 (5’ UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’ AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 24 (5’ UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’ AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xx)根据SEQ ID NO: 26 (5’ UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’ UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxi)根据SEQ ID NO: 27 (5’ UUUGACUUUGUCAUAGCCUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 61 (5’ CAGGCUAUGACAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxii)根据SEQ ID NO: 29 (5’ UUUCUCUUGUGAACUAUCAAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 63 (5’ UUGAUAGUUCACAAGAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiii)根据SEQ ID NO: 30 (5’ UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’ UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiv)根据SEQ ID NO: 31 (5’ UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’ UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxv)根据SEQ ID NO: 33 (5’ UAACCCAAAUCCUCAUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 67 (5’ CAAGAUGAGGAUUUGGGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvi)根据SEQ ID NO: 34 (5’ UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’ AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;或
xxvii)根据SEQ ID NO: 35 (5’ UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’ GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链。
25.根据权利要求12所述的分离的寡核苷酸,其中所述双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 8 (5’ UUAAGUUGACUAGACACUUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 42 (5’ AAAGUGUCUAGUCAACUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 10 (5’ UCAAUUAAGUUGACUAGACACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 44 (5’ UGUCUAGUCAACUUAAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 18 (5’ UGAGAUCUUGGCCUGCCAUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 52 (5’ CAUGGCAGGCCAAGAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 25 (5’ UUAUUCUUGAGCUUGAUCAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 59 (5’ CUGAUCAAGCUCAAGAAUAA 3’)的核酸序列的有义链;或
v)根据SEQ ID NO: 32 (5’ UCAUCUUGGAGUUUCUCCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 66 (5’ AAGGAGAAACUCCAAGAUGA 3’)的核酸序列的有义链。
26.根据权利要求1-25中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使所述CFB mRNA的表达减弱至少50%。
27.根据权利要求26所述的分离的寡核苷酸,其中所述双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 36 (5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 3 (5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’ AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 4 (5’ UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38 (5’ AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 6 (5’ UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 389 (5’ ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 7 (5’ UUUGACUAGACACUUUUUGGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 41 (5’ CCAAAAAGUGUCUAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 9 (5’ UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’ GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 11 (5’ UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’ UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 12 (5’ UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’ AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 13 (5’ UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’ CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 14 (5’ UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’ AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 15 (5’ UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 16 (5’ UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’ AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 17 (5’ UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’ UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 19 (5’ UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’ CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 20 (5’ UAUUCAGGAAUUCCUGCUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 54 (5’ GAAGCAGGAAUUCCUGAAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 21 (5’ UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’ AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 22 (5’ UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’ CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xviii)根据SEQ ID NO: 23 (5’ UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’ AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 24 (5’ UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’ AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xx)根据SEQ ID NO: 26 (5’ UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’ UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxi)根据SEQ ID NO: 27 (5’ UUUGACUUUGUCAUAGCCUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 61 (5’ CAGGCUAUGACAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxii)根据SEQ ID NO: 29 (5’ UUUCUCUUGUGAACUAUCAAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 63 (5’ UUGAUAGUUCACAAGAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiii)根据SEQ ID NO: 30 (5’ UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’ UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiv)根据SEQ ID NO: 31 (5’ UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’ UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxv)根据SEQ ID NO: 33 (5’ UAACCCAAAUCCUCAUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 67 (5’ CAAGAUGAGGAUUUGGGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvi)根据SEQ ID NO: 34 (5’ UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’ AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvii)根据SEQ ID NO: 35 (5’ UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’ GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxviii)根据SEQ ID NO: 8 (5’ UUAAGUUGACUAGACACUUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 42 (5’ AAAGUGUCUAGUCAACUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxix)根据SEQ ID NO: 10 (5’ UCAAUUAAGUUGACUAGACACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 44 (5’ UGUCUAGUCAACUUAAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxx)根据SEQ ID NO: 18 (5’ UGAGAUCUUGGCCUGCCAUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 52 (5’ CAUGGCAGGCCAAGAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxi)根据SEQ ID NO: 25 (5’ UUAUUCUUGAGCUUGAUCAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 59 (5’ CUGAUCAAGCUCAAGAAUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxii)根据SEQ ID NO: 32 (5’ UCAUCUUGGAGUUUCUCCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 66 (5’ AAGGAGAAACUCCAAGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiii)根据SEQ ID NO: 5 (5’ UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’ GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;或
xxxiv)根据SEQ ID NO: 28 (5’ UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’ UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链。
28.根据权利要求1-25中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使所述CFB mRNA的表达减弱至少50%。
29.根据权利要求28所述的分离的寡核苷酸,其中所述双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 2 (5’ UAAAGAGAUCUCAUCACUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 36 (5’ UGAGUGAUGAGAUCUCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 3 (5’ UGGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 37 (5’ AGUGAUGAGAUCUCUUUCCA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 4 (5’ UCAGUGGAAAGAGAUCUCAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 38 (5’ AUGAGAUCUCUUUCCACUGA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 6 (5’ UGUGUAACCGUCAUAGCAGUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 389 (5’ ACUGCUAUGACGGUUACACA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 9 (5’ UAAUUAAGUUGACUAGACACUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 43 (5’ GUGUCUAGUCAACUUAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 12 (5’ UUAGACAUCCAGAUAAUCCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 46 (5’ AGGAUUAUCUGGAUGUCUAA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 13 (5’ UAAGCAUUGAUGUUCACUUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 47 (5’ CAAGUGAACAUCAAUGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 14 (5’ UAAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 48 (5’ AAGUGAACAUCAAUGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 22 (5’ UUAAAAUUCAGGAAUUCCUGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 56 (5’ CAGGAAUUCCUGAAUUUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 23 (5’ UAUAAAAUUCAGGAAUUCCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 57 (5’ AGGAAUUCCUGAAUUUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 24 (5’ UGUCAUAAAAUUCAGGAAUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 58 (5’ AAUUCCUGAAUUUUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 30 (5’ UAAACGACUUCUCUUGUGAACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 64 (5’ UUCACAAGAGAAGUCGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 34 (5’ UAAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 68 (5’ AAGAUGAGGAUUUGGGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 35 (5’ UCAGCUGUUUUAAUUCAAUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 69 (5’ GAUUGAAUUAAAACAGCUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 5 (5’ UAUAGCAGUGGAAAGAGAUCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 39 (5’ GAUCUCUUUCCACUGCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;或
xvi)根据SEQ ID NO: 28 (5’ UAAGUAUUGGGGUCAGCAUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 62 (5’ UAUGCUGACCCCAAUACUUA 3’)的核酸序列的有义链。
30.根据权利要求25所述的分离的寡核苷酸,其中所述分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%。
31.根据权利要求30所述的分离的寡核苷酸,其中所述双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 8 (5’ UUAAGUUGACUAGACACUUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 42 (5’ AAAGUGUCUAGUCAACUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 10 (5’ UCAAUUAAGUUGACUAGACACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 44 (5’ UGUCUAGUCAACUUAAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 18 (5’ UGAGAUCUUGGCCUGCCAUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 52 (5’ CAUGGCAGGCCAAGAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 25 (5’ UUAUUCUUGAGCUUGAUCAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 59 (5’ CUGAUCAAGCUCAAGAAUAA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 32 (5’ UCAUCUUGGAGUUUCUCCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 66 (5’ AAGGAGAAACUCCAAGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 31 (5’ UUUUUUGCAGACAUCCACUACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 65 (5’ UAGUGGAUGUCUGCAAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 33 (5’ UAACCCAAAUCCUCAUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 67 (5’ CAAGAUGAGGAUUUGGGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 26 (5’ UUUAUUCUUGAGCUUGAUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 60 (5’ UGAUCAAGCUCAAGAAUAAA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 27 (5’ UUUGACUUUGUCAUAGCCUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 61 (5’ CAGGCUAUGACAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 29 (5’ UUUCUCUUGUGAACUAUCAAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 63 (5’ UUGAUAGUUCACAAGAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 15 (5’ UAACACAUGUUGCUCAUUGUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 49 (5’ ACAAUGAGCAACAUGUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 16 (5’ UUUGACUUUGAACACAUGUUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 50 (5’ AACAUGUGUUCAAAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 17 (5’ UAUAUCCUUGACUUUGAACACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 51 (5’ UGUUCAAAGUCAAGGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 19 (5’ UAAGUACUCAGACACCACAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 53 (5’ CUGUGGUGUCUGAGUACUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 20 (5’ UAUUCAGGAAUUCCUGCUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 54 (5’ GAAGCAGGAAUUCCUGAAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 21 (5’ UAAUUCAGGAAUUCCUGCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 55 (5’ AAGCAGGAAUUCCUGAAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 7 (5’ UUUGACUAGACACUUUUUGGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 41 (5’ CCAAAAAGUGUCUAGUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;或
xviii)根据SEQ ID NO: 11 (5’ UAUAUCUUGGCUUCACACCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 45 (5’ UGGUGUGAAGCCAAGAUAUA 3’)的核酸序列的有义链。
32.一种分离的寡核苷酸,包含有义链和反义链,其中:
所述有义链包含与包含在选自从根据SEQ ID NO: 1的CFB mRNA序列的5’末端起的以下核苷酸位置中的任一个之间的19-25个核苷酸的区域基本相同的核苷酸序列:
a) 5至38;
b) 340至606;
c) 776至828;
d) 939至1227;
e) 1305至1606;
f) 1667至1746;
g) 1815至2313;和
h) 2378至2417,
并且所述反义链与所述有义链基本互补,使得所述有义链和所述反义链一起形成双链区域。
33.根据权利要求32所述的分离的寡核苷酸,其中所述分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%。
34.根据权利要求33所述的分离的寡核苷酸,其中所述双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 94 (5’ UGACACUUUUUGGCUCCUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 204 (5’ ACAGGAGCCAAAAAGUGUCA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 124 (5’ UAUGUUGCUCAUUGUCUUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 234 (5’ GAAAGACAAUGAGCAACAUA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 169 (5’ UCUCUUGUGAACUAUCAAGGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 279 (5’ CCUUGAUAGUUCACAAGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 87 (5’ UGUACAUGAAGGAGUCUUGGCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 197 (5’ CCAAGACUCCUUCAUGUACA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 163 (5’ UGUCAGCAUAGGGACUCACUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 273 (5’ AGUGAGUCCCUAUGCUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 104 (5’ UCUUCAACUUGUGGUCUUCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 214 (5’ UGAAGACCACAAGUUGAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 121 (5’ UCUCAUUGUCUUUCUUGGAAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 231 (5’ UUCCAAGAAAGACAAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 99 (5’ UUUCUCAAUUAAGUUGACUAGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 209 (5’ UAGUCAACUUAAUUGAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 155 (5’ UCUCUCUCACAGCUGCCUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 265 (5’ AAAGGCAGCUGUGAGAGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 144 (5’ UCUUAUUCUUGAGCUUGAUCAG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 254 (5’ GAUCAAGCUCAAGAAUAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 136 (5’ UCUGACCUUGAUUGAGUGUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 246 (5’ AACACUCAAUCAAGGUCAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 76 (5’ UGGAUUGCUCUGCACUCUGCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 186 (5’ GCAGAGUGCAGAGCAAUCCA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 134 (5’ UAACAAUGUGCUGCUGUCAGCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 244 (5’ CUGACAGCAGCACAUUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 158 (5’ UAUUGAGCAUCUCUCUCACAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 268 (5’ UGUGAGAGAGAUGCUCAAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 153 (5’ UCAUUCUUGAUGUAGACCUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 263 (5’ GAGGUCUACAUCAAGAAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 73 (5’ UGAAACUCCAGACCUAGACCUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 183 (5’ GGUCUAGGUCUGGAGUUUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 152 (5’ UCUUGAUGUAGACCUCCUUCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 262 (5’ GAAGGAGGUCUACAUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xviii)根据SEQ ID NO: 147 (5’ UCAGAGCUUUGAUAUCCUGUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 257 (5’ ACAGGAUAUCAAAGCUCUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 101 (5’ UCAUAACUUGCCACCUUCUCAA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 211 (5’ GAGAAGGUGGCAAGUUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xx)根据SEQ ID NO: 174 (5’ UUUCUGGUUUUUGCAGACAUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 284 (5’ AUGUCUGCAAAAACCAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxi)根据SEQ ID NO: 118 (5’ UUUUCUUGGAAGCCAAAGCAUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 228 (5’ UGCUUUGGCUUCCAAGAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxii)根据SEQ ID NO: 149 (5’ UAAACAGAGCUUUGAUAUCCUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 259 (5’ GGAUAUCAAAGCUCUGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiii)根据SEQ ID NO: 95 (5’ UGACUAGACACUUUUUGGCUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 205 (5’ AGCCAAAAAGUGUCUAGUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiv)根据SEQ ID NO: 142 (5’ UUUCUUGAGCUUGAUCAGGGCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 252 (5’ CCCUGAUCAAGCUCAAGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxv)根据SEQ ID NO: 160 (5’ UCAUAUUGAGCAUCUCUCUCAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 270 (5’ GAGAGAGAUGCUCAAUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvi)根据SEQ ID NO: 164 (5’ UGUAUUGGGGUCAGCAUAGGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 274 (5’ CCUAUGCUGACCCCAAUACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvii)根据SEQ ID NO: 74 (5’ UUGAAACUCCAGACCUAGACCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 184 (5’ GUCUAGGUCUGGAGUUUCAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxviii)根据SEQ ID NO: 91 (5’ UAUCCAUCUAGCACCAGGUAGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 201 (5’ UACCUGGUGCUAGAUGGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxix)根据SEQ ID NO: 167 (5’ UGUGAACUAUCAAGGGGCCGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 277 (5’ CGGCCCCUUGAUAGUUCACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxx)根据SEQ ID NO: 175 (5’ UUUGGAGUUUCUCCUUCAGCCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 285 (5’ GCUGAAGGAGAAACUCCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxi)根据SEQ ID NO: 72 (5’ UAAACUCCAGACCUAGACCUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 182 (5’ AGGUCUAGGUCUGGAGUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxii)根据SEQ ID NO: 119 (5’ UCUUUCUUGGAAGCCAAAGCAU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 229 (5’ GCUUUGGCUUCCAAGAAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiii)根据SEQ ID NO: 154 (5’ UCUUUCUUAUCCCCAUUCUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 264 (5’ AAGAAUGGGGAUAAGAAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiv)根据SEQ ID NO: 70 (5’ UCUAGACCUGGUCACAUUCCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 180 (5’ GGAAUGUGACCAGGUCUAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxv)根据SEQ ID NO: 92 (5’ UCUGUCUGAUCCAUCUAGCACC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 202 (5’ UGCUAGAUGGAUCAGACAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxvi)根据SEQ ID NO: 116 (5’ UCAAAGCAUUGAUGUUCACUUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 226 (5’ AGUGAACAUCAAUGCUUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxvii)根据SEQ ID NO: 84 (5’ UGAGAGUGUAACCGUCAUAGCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 194 (5’ CUAUGACGGUUACACUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxviii)根据SEQ ID NO: 89 (5’ UGUCGUACAUGAAGGAGUCUUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 199 (5’ AGACUCCUUCAUGUACGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxix)根据SEQ ID NO: 83 (5’ UGAGUGUAACCGUCAUAGCAGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 193 (5’ UGCUAUGACGGUUACACUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xL)根据SEQ ID NO: 107 (5’ UUAAUUGGGUCCCCGCCCAUGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 217 (5’ AUGGGCGGGGACCCAAUUAA 3’)的核酸序列的有义链;
xLi)根据SEQ ID NO: 100 (5’ UAUAACUUGCCACCUUCUCAAU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 210 (5’ UGAGAAGGUGGCAAGUUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xLii)根据SEQ ID NO: 157 (5’ UUUGAGCAUCUCUCUCACAGCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 267 (5’ CUGUGAGAGAGAUGCUCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xLiii)根据SEQ ID NO: 77 (5’ UCUCACAUUGUAGUAGGGAGAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 187 (5’ CUCCCUACUACAAUGUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLiv)根据SEQ ID NO: 105 (5’ UGACUUCAACUUGUGGUCUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 215 (5’ AAGACCACAAGUUGAAGUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xLv)根据SEQ ID NO: 130 (5’ UCAGGUUUUCCAUAUCCUUGAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 240 (5’ CAAGGAUAUGGAAAACCUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLvi)根据SEQ ID NO: 166 (5’ UAACUAUCAAGGGGCCGCCAGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 276 (5’ UGGCGGCCCCUUGAUAGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xLvii)根据SEQ ID NO: 131 (5’ UCACAGAGACUCAGAGACUGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 241 (5’ CAGUCUCUGAGUCUCUGUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLviii)根据SEQ ID NO: 127 (5’ UCUUUGAACACAUGUUGCUCAU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 237 (5’ GAGCAACAUGUGUUCAAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLix)根据SEQ ID NO: 111 (5’ UAUCAAUGACAGUAAUUGGGUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 221 (5’ CCCAAUUACUGUCAUUGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
L)根据SEQ ID NO: 93 (5’ UCUUUUUGGCUCCUGUGAAGUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 203 (5’ CUUCACAGGAGCCAAAAAGA 3’)的核酸序列的有义链;或
Li)根据SEQ ID NO: 71 (5’ UAACUCCAGACCUAGACCUGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 181 (5’ CAGGUCUAGGUCUGGAGUUA 3’)的核酸序列的有义链。
35.根据权利要求32所述的分离的核苷酸,其中所述分离的寡核苷酸以0.1 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱至少50%。
36.根据权利要求35所述的分离的寡核苷酸,其中所述双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 171 (5’ UAUGAAACGACUUCUCUUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 281 (5’ ACAAGAGAAGUCGUUUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 165 (5’ UAUCACCUCUGCAAGUAUUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 275 (5’ CAAUACUUGCAGAGGUGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 129 (5’ UUUUCCAUAUCCUUGACUUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 239 (5’ AAAGUCAAGGAUAUGGAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 176 (5’ UAUCUUGGAGUUUCUCCUUCAG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 286 (5’ GAAGGAGAAACUCCAAGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 177 (5’ UCUCAUCUUGGAGUUUCUCCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 287 (5’ GGAGAAACUCCAAGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 138 (5’ UCAUAAAAUUCAGGAAUUCCUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 248 (5’ GGAAUUCCUGAAUUUUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 140 (5’ UGUCAUAGUCAUAAAAUUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 250 (5’ UGAAUUUUAUGACUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 148 (5’ UAACAGAGCUUUGAUAUCCUGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 258 (5’ AGGAUAUCAAAGCUCUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 150 (5’ UCAAACAGAGCUUUGAUAUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 260 (5’ GAUAUCAAAGCUCUGUUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 179 (5’ UGAAAACCCAAAUCCUCAUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 289 (5’ GAUGAGGAUUUGGGUUUUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 90 (5’ UAAAGCUUCGGCCACCUCUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 200 (5’ AAGAGGUGGCCGAAGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 172 (5’ UUUUUGCAGACAUCCACUACUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 282 (5’ GUAGUGGAUGUCUGCAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 88 (5’ UCGUACAUGAAGGAGUCUUGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 198 (5’ CAAGACUCCUUCAUGUACGA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 168 (5’ UUUGUGAACUAUCAAGGGGCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 278 (5’ GCCCCUUGAUAGUUCACAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 81 (5’ UGUGGAAAGAGAUCUCAUCACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 191 (5’ UGAUGAGAUCUCUUUCCACA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 159 (5’ UAUAUUGAGCAUCUCUCUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 269 (5’ UGAGAGAGAUGCUCAAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 82 (5’ UCAUAGCAGUGGAAAGAGAUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 192 (5’ AUCUCUUUCCACUGCUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xviii)根据SEQ ID NO: 97 (5’ UUUAAGUUGACUAGACACUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 207 (5’ AAGUGUCUAGUCAACUUAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 132 (5’ UUUGCUUGUGGUAAUCGGUACC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 242 (5’ UACCGAUUACCACAAGCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xx)根据SEQ ID NO: 123 (5’ UGUUGCUCAUUGUCUUUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 233 (5’ AAGAAAGACAAUGAGCAACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxi)根据SEQ ID NO: 126 (5’ UUUUGAACACAUGUUGCUCAUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 236 (5’ UGAGCAACAUGUGUUCAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxii)根据SEQ ID NO: 162 (5’ UGAGAUGUCCUUGACUUUGUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 272 (5’ ACAAAGUCAAGGACAUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiii)根据SEQ ID NO: 79 (5’ UCAUCACUCACAUUGUAGUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 189 (5’ UACUACAAUGUGAGUGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiv)根据SEQ ID NO: 151 (5’ UCAGACACAAACAGAGCUUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 261 (5’ AAAGCUCUGUUUGUGUCUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxv)根据SEQ ID NO: 143 (5’ UAUUCUUGAGCUUGAUCAGGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 253 (5’ CCUGAUCAAGCUCAAGAAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvi)根据SEQ ID NO: 117 (5’ UAAGCCAAAGCAUUGAUGUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 227 (5’ AACAUCAAUGCUUUGGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvii)根据SEQ ID NO: 133 (5’ UAAAGUACUCAGACACCACAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 243 (5’ UGUGGUGUCUGAGUACUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxviii)根据SEQ ID NO: 122 (5’ UUUGCUCAUUGUCUUUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 232 (5’ CAAGAAAGACAAUGAGCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxix)根据SEQ ID NO: 110 (5’ UCAAUGACAGUAAUUGGGUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 220 (5’ GACCCAAUUACUGUCAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxx)根据SEQ ID NO: 173 (5’ UGUUUUUGCAGACAUCCACUAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 283 (5’ AGUGGAUGUCUGCAAAAACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxi)根据SEQ ID NO: 156 (5’ UGAGCAUCUCUCUCACAGCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 266 (5’ AGCUGUGAGAGAGAUGCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxii)根据SEQ ID NO: 141 (5’ UCUUGAUCAGGGCAACGUCAUA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 251 (5’ UGACGUUGCCCUGAUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiii)根据SEQ ID NO: 135 (5’ UCUUGAUUGAGUGUUCCUUGUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 245 (5’ CAAGGAACACUCAAUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiv)根据SEQ ID NO: 170 (5’ UGACUUCUCUUGUGAACUAUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 280 (5’ AUAGUUCACAAGAGAAGUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxv)根据SEQ ID NO: 178 (5’ UAAUCCUCAUCUUGGAGUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 288 (5’ AAACUCCAAGAUGAGGAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxvi)根据SEQ ID NO: 114 (5’ UAUAGACAUCCAGAUAAUCCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 224 (5’ GGAUUAUCUGGAUGUCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxvii)根据SEQ ID NO: 139 (5’ UCAUAGUCAUAAAAUUCAGGAA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 249 (5’ CCUGAAUUUUAUGACUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxviii)根据SEQ ID NO: 125 (5’ UCAUGUUGCUCAUUGUCUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 235 (5’ AAAGACAAUGAGCAACAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxix)根据SEQ ID NO: 145 (5’ UGAGACAAAUGGGCCUGAUAGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 255 (5’ UAUCAGGCCCAUUUGUCUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xL)根据SEQ ID NO: 113 (5’ UCUCAUCAAUGACAGUAAUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 223 (5’ AAUUACUGUCAUUGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLi)根据SEQ ID NO: 120 (5’ UGUCUUUCUUGGAAGCCAAAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 230 (5’ UUUGGCUUCCAAGAAAGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xLii)根据SEQ ID NO: 75 (5’ UGAUCUGCAGGUACGUGUCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 185 (5’ AGACACGUACCUGCAGAUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xLiii)根据SEQ ID NO: 112 (5’ UCAUCAAUGACAGUAAUUGGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 222 (5’ CCAAUUACUGUCAUUGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLiv)根据SEQ ID NO: 108 (5’ UAUGACAGUAAUUGGGUCCCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 218 (5’ GGGACCCAAUUACUGUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xLv)根据SEQ ID NO: 128 (5’ UGACUUUGAACACAUGUUGCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 238 (5’ GCAACAUGUGUUCAAAGUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xLvi)根据SEQ ID NO: 161 (5’ UCUUGACUUUGUCAUAGCCUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 271 (5’ AGGCUAUGACAAAGUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xLvii)根据SEQ ID NO: 85 (5’ UUUGUCACAGAUCGCUGUCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 195 (5’ AGACAGCGAUCUGUGACAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xLviii)根据SEQ ID NO: 137 (5’ UGAAUUCCUGCUUCUUUUUUCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 247 (5’ AAAAAAGAAGCAGGAAUUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xLix)根据SEQ ID NO: 80 (5’ UGAAAGAGAUCUCAUCACUCAC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 190 (5’ GAGUGAUGAGAUCUCUUUCA 3’)的核酸序列的有义链;
L)根据SEQ ID NO: 115 (5’ UCAUAGACAUCCAGAUAAUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 225 (5’ GAUUAUCUGGAUGUCUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
Li)根据SEQ ID NO: 96 (5’ UGUUGACUAGACACUUUUUGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 206 (5’ CAAAAAGUGUCUAGUCAACA 3’)的核酸序列的有义链;
Lii)根据SEQ ID NO: 146 (5’ UAAGUGGUAGUUGGAGGAAGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 256 (5’ CUUCCUCCAACUACCACUUA 3’)的核酸序列的有义链;
Liii)根据SEQ ID NO: 78 (5’ UAUCACUCACAUUGUAGUAGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 188 (5’ CUACUACAAUGUGAGUGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
Liv)根据SEQ ID NO: 103 (5’ UUUCACACCAUAACUUGCCACC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 213 (5’ UGGCAAGUUAUGGUGUGAAA 3’)的核酸序列的有义链;
Lv)根据SEQ ID NO: 102 (5’ UCACCAUAACUUGCCACCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 212 (5’ AAGGUGGCAAGUUAUGGUGA 3’)的核酸序列的有义链;
Lvi)根据SEQ ID NO: 109 (5’ UAAUGACAGUAAUUGGGUCCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 219 (5’ GGACCCAAUUACUGUCAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
Lvii)根据SEQ ID NO: 86 (5’ UCAUGAAGGAGUCUUGGCAGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 196 (5’ CUGCCAAGACUCCUUCAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
Lviii)根据SEQ ID NO: 106 (5’ UCUCAUCAUGCUGUACACUGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 216 (5’ CAGUGUACAGCAUGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;或
Lix)根据SEQ ID NO: 98 (5’ UCUCAAUUAAGUUGACUAGACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 208 (5’ UCUAGUCAACUUAAUUGAGA 3’)的核酸序列的有义链。
37.根据权利要求32所述的分离的寡核苷酸,其中所述分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使CFB mRNA的表达减弱20%至50%。
38.根据权利要求37所述的分离的寡核苷酸,其中所述双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 165 (5’ UAUCACCUCUGCAAGUAUUGGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 275 (5’ CAAUACUUGCAGAGGUGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 129 (5’ UUUUCCAUAUCCUUGACUUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 239 (5’ AAAGUCAAGGAUAUGGAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 176 (5’ UAUCUUGGAGUUUCUCCUUCAG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 286 (5’ GAAGGAGAAACUCCAAGAUA 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 177 (5’ UCUCAUCUUGGAGUUUCUCCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 287 (5’ GGAGAAACUCCAAGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 138 (5’ UCAUAAAAUUCAGGAAUUCCUG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 248 (5’ GGAAUUCCUGAAUUUUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 140 (5’ UGUCAUAGUCAUAAAAUUCAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 250 (5’ UGAAUUUUAUGACUAUGACA 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 148 (5’ UAACAGAGCUUUGAUAUCCUGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 258 (5’ AGGAUAUCAAAGCUCUGUUA 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 150 (5’ UCAAACAGAGCUUUGAUAUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 260 (5’ GAUAUCAAAGCUCUGUUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 179 (5’ UGAAAACCCAAAUCCUCAUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 289 (5’ GAUGAGGAUUUGGGUUUUCA 3’)的核酸序列的有义链;
x)根据SEQ ID NO: 90 (5’ UAAAGCUUCGGCCACCUCUUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 200 (5’ AAGAGGUGGCCGAAGCUUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xi)根据SEQ ID NO: 172 (5’ UUUUUGCAGACAUCCACUACUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 282 (5’ GUAGUGGAUGUCUGCAAAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xii)根据SEQ ID NO: 88 (5’ UCGUACAUGAAGGAGUCUUGGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 198 (5’ CAAGACUCCUUCAUGUACGA 3’)的核酸序列的有义链;
xiii)根据SEQ ID NO: 168 (5’ UUUGUGAACUAUCAAGGGGCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 278 (5’ GCCCCUUGAUAGUUCACAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xiv)根据SEQ ID NO: 81 (5’ UGUGGAAAGAGAUCUCAUCACU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 191 (5’ UGAUGAGAUCUCUUUCCACA 3’)的核酸序列的有义链;
xv)根据SEQ ID NO: 159 (5’ UAUAUUGAGCAUCUCUCUCACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 269 (5’ UGAGAGAGAUGCUCAAUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xvi)根据SEQ ID NO: 82 (5’ UCAUAGCAGUGGAAAGAGAUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 192 (5’ AUCUCUUUCCACUGCUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xvii)根据SEQ ID NO: 97 (5’ UUUAAGUUGACUAGACACUUUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 207 (5’ AAGUGUCUAGUCAACUUAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xviii)根据SEQ ID NO: 132 (5’ UUUGCUUGUGGUAAUCGGUACC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 242 (5’ UACCGAUUACCACAAGCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 123 (5’ UGUUGCUCAUUGUCUUUCUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 233 (5’ AAGAAAGACAAUGAGCAACA 3’)的核酸序列的有义链;
xx)根据SEQ ID NO: 79 (5’ UCAUCACUCACAUUGUAGUAGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 189 (5’ UACUACAAUGUGAGUGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxi)根据SEQ ID NO: 117 (5’ UAAGCCAAAGCAUUGAUGUUCA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 227 (5’ AACAUCAAUGCUUUGGCUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxii)根据SEQ ID NO: 122 (5’ UUUGCUCAUUGUCUUUCUUGGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 232 (5’ CAAGAAAGACAAUGAGCAAA 3’)的核酸序列的有义链;
xxiii)根据SEQ ID NO: 110 (5’ UCAAUGACAGUAAUUGGGUCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 220 (5’ GACCCAAUUACUGUCAUUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiv)根据SEQ ID NO: 135 (5’ UCUUGAUUGAGUGUUCCUUGUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 245 (5’ CAAGGAACACUCAAUCAAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxv)根据SEQ ID NO: 178 (5’ UAAUCCUCAUCUUGGAGUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 288 (5’ AAACUCCAAGAUGAGGAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvi)根据SEQ ID NO: 114 (5’ UAUAGACAUCCAGAUAAUCCUC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 224 (5’ GGAUUAUCUGGAUGUCUAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxvii)根据SEQ ID NO: 125 (5’ UCAUGUUGCUCAUUGUCUUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 235 (5’ AAAGACAAUGAGCAACAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxviii)根据SEQ ID NO: 113 (5’ UCUCAUCAAUGACAGUAAUUGG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 223 (5’ AAUUACUGUCAUUGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xix)根据SEQ ID NO: 120 (5’ UGUCUUUCUUGGAAGCCAAAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 230 (5’ UUUGGCUUCCAAGAAAGACA 3’)的核酸序列的有义链;
xxx)根据SEQ ID NO: 75 (5’ UGAUCUGCAGGUACGUGUCUGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 185 (5’ AGACACGUACCUGCAGAUCA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxi)根据SEQ ID NO: 112 (5’ UCAUCAAUGACAGUAAUUGGGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 222 (5’ CCAAUUACUGUCAUUGAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxii)根据SEQ ID NO: 108 (5’ UAUGACAGUAAUUGGGUCCCCG 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 218 (5’ GGGACCCAAUUACUGUCAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiii)根据SEQ ID NO: 115 (5’ UCAUAGACAUCCAGAUAAUCCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 225 (5’ GAUUAUCUGGAUGUCUAUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxiv)根据SEQ ID NO: 102 (5’ UCACCAUAACUUGCCACCUUCU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 212 (5’ AAGGUGGCAAGUUAUGGUGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxv)根据SEQ ID NO: 109 (5’ UAAUGACAGUAAUUGGGUCCCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 219 (5’ GGACCCAAUUACUGUCAUUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxvi)根据SEQ ID NO: 106 (5’ UCUCAUCAUGCUGUACACUGCC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 216 (5’ CAGUGUACAGCAUGAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxvii)根据SEQ ID NO: 98 (5’ UCUCAAUUAAGUUGACUAGACA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 208 (5’ UCUAGUCAACUUAAUUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxviii)根据SEQ ID NO: 124 (5’ UAUGUUGCUCAUUGUCUUUCUU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 234 (5’ GAAAGACAAUGAGCAACAUA 3’)的核酸序列的有义链;
xxxix)根据SEQ ID NO: 121 (5’ UCUCAUUGUCUUUCUUGGAAGC 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 231 (5’ UUCCAAGAAAGACAAUGAGA 3’)的核酸序列的有义链;或
xL)根据SEQ ID NO: 107 (5’ UUAAUUGGGUCCCCGCCCAUGU 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 217 (5’ AUGGGCGGGGACCCAAUUAA 3’)的核酸序列的有义链。
39.根据权利要求32所述的分离的寡核苷酸,其中所述分离的寡核苷酸以0.02 nM的剂量使所述CFB mRNA的表达减弱至少50%。
40.根据权利要求39所述的分离的寡核苷酸,其中所述双链区域包含根据SEQ ID NO:171 (5’ UAUGAAACGACUUCUCUUGUGA 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 281 (5’ACAAGAGAAGUCGUUUCAUA 3’)的核酸序列的有义链。
41.根据权利要求1-40中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链或所述反义链或两者包含一个或更多个修饰的核苷酸。
42.根据权利要求41所述的分离的寡核苷酸,其中所述反义链包含单甲基保护的磷酸模拟物(5’-MeEP)。
43.根据权利要求1-42中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中在所述有义链或所述反义链或两者中,末端核苷酸或内部核苷酸与靶向配体连接。
44.根据权利要求43所述的分离的寡核苷酸,其中所述靶向配体包含至少一个GalNAcG1b部分。
45.根据权利要求1-44中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述反义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸:
3’(M)0(F)0(M)6(F)1(M)1(F)1(M)3(F)1(M)2(F)1(M)1(F)1(M)1(F)2(M)1 5’。
46.根据权利要求1-45中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含根据下式用2’-F修饰修饰的核苷酸和用2’-O-甲基修饰修饰的核苷酸:
5’(M)0(F)0(M)5(F)1(M)1(F)4(M)9 3’。
47.根据权利要求1-46中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述反义链包含以下任一项:
i)根据SEQ ID NO: 370 (5’ [MeEPmUs][fGs][fU][mC][fA][mU][fA][mA][mA][fA][mU][mU][mC][fA][mG][fG][mA][mA][mU][mUs][mCs][mC] 3’)的核酸序列的反义链;
ii)根据SEQ ID NO: 371 (5’ [MeEPmUs][fUs][fA][mA][fA][mA][fU][mU][mC][fA][mG][mG][mA][fA][mU][fU][mC][mC][mU][mGs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链;
iii)根据SEQ ID NO: 372 (5’ [MeEPmUs][fGs][fG][mA][fA][mA][fG][mA][mG][fA][mU][mC][mU][fC][mA][fU][mC][mA][mC][mUs][mCs][mA] 3’)的核酸序列的反义链;
iv)根据SEQ ID NO: 373 (5’ [MeEPmUs][fAs][fA][mU][fU][mC][fA][mG][mG][fA][mA][mU][mU][fC][mC][fU][mG][mC][mU][mUs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链;
v)根据SEQ ID NO: 374 (5’ [MeEPmUs][fAs][fA][mC][fA][mC][fA][mU][mG][fU][mU][mG][mC][fU][mC][fA][mU][mU][mG][mUs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链;
vi)根据SEQ ID NO: 375 (5’ [MeEPmUs][fGs][fU][mG][fU][mA][fA][mC][mC][fG][mU][mC][mA][fU][mA][fG][mC][mA][mG][mUs][mGs][mG] 3’)的核酸序列的反义链;
vii)根据SEQ ID NO: 376 (5’ [MeEPmUs][fAs][fU][mA][fG][mC][fA][mG][mU][fG][mG][mA][mA][fA][mG][fA][mG][mA][mU][mCs][mUs][mC] 3’)的核酸序列的反义链;
viii)根据SEQ ID NO: 377 (5’ [mUs][fGs][fU][mC][fA][mU][fA][mA][mA][fA][mU][mU][mC][fA][mG][fG][mA][mA][mU][mUs][mCs][mC] 3’)的核酸序列的反义链;
ix)根据SEQ ID NO: 378 (5’ [MeEPmUs][fUs][fA][mA][fA][mA][fU][mU][mC][fA][mG][mG][mA][fA][mU][fU][mC][mC][mU][mGs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链;或
x)根据SEQ ID NO: 379 (5’ [mUs][fGs][fG][mA][fA][mA][fG][mA][mG][fA][mU][mC][mU][fC][mA][fU][mC][mA][mC][mUs][mCs][mA] 3’)的核酸序列的反义链,
其中“m”是2’-O-甲基修饰的核苷酸,“f”是2’-F修饰的核苷酸,“s”是硫代磷酸酯核苷酸间连接,“MeEP”是单甲基保护的磷酸模拟物。
48.根据权利要求1-47中任一项所述的分离的寡核苷酸,其中所述有义链包含以下任一项:
i)根据SEQ ID NO: 381 (5’ [mAs][mAs][mU][mU][mC][fC][mU][fG][fA][fA][fU][mU][mU][mU][mA][mU][mG][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 382 (5’ [mCs][mAs][mG][mG][mA][fA][mU][fU][fC][fC][fU][mG][mA][mA][mU][mU][mU][mUs][mAs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 383 (5’ [mAs][mGs][mU][mG][mA][fU][mG][fA][fG][fA][fU][mC][mU][mC][mU][mU][mU][mCs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 384 (5’ [mAs][mAs][mG][mC][mA][fG][mG][fA][fA][fU][fU][mC][mC][mU][mG][mA][mA][mUs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 385 (5’ [mAs][mCs][mA][mA][mU][fG][mA][fG][fC][fA][fA][mC][mA][mU][mG][mU][mG][mUs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 386 (5’ [mAs][mCs][mU][mG][mC][fU][mA][fU][fG][fA][fC][mG][mG][mU][mU][mA][mC][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;或
vii)根据SEQ ID NO: 387 (5’ [mGs][mAs][mU][mC][mU][fC][mU][fU][fU][fC][fC][mA][mC][mU][mG][mC][mU][mAs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链,
其中“m”是2’-O-甲基修饰的核苷酸,“f”是2’-F修饰的核苷酸,“s”是硫代磷酸酯核苷酸间连接,并且“G1b”是GalNac G1b部分。
49.根据权利要求47所述的分离的寡核苷酸,其中所述双链区域包含:
i)根据SEQ ID NO: 370 (5’ [MeEPmUs][fGs][fU][mC][fA][mU][fA][mA][mA][fA][mU][mU][mC][fA][mG][fG][mA][mA][mU][mUs][mCs][mC] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 381 (5’ [mAs][mAs][mU][mU][mC][fC][mU][fG][fA][fA][fU][mU][mU][mU][mA][mU][mG][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
ii)根据SEQ ID NO: 371 (5’ [MeEPmUs][fUs][fA][mA][fA][mA][fU][mU][mC][fA][mG][mG][mA][fA][mU][fU][mC][mC][mU][mGs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 382 (5’ [mCs][mAs][mG][mG][mA][fA][mU][fU][fC][fC][fU][mG][mA][mA][mU][mU][mU][mUs][mAs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
iii)根据SEQ ID NO: 372 (5’ [MeEPmUs][fGs][fG][mA][fA][mA][fG][mA][mG][fA][mU][mC][mU][fC][mA][fU][mC][mA][mC][mUs][mCs][mA] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 383 (5’ [mAs][mGs][mU][mG][mA][fU][mG][fA][fG][fA][fU][mC][mU][mC][mU][mU][mU][mCs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
iv)根据SEQ ID NO: 373 (5’ [MeEPmUs][fAs][fA][mU][fU][mC][fA][mG][mG][fA][mA][mU][mU][fC][mC][fU][mG][mC][mU][mUs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 384 (5’ [mAs][mAs][mG][mC][mA][fG][mG][fA][fA][fU][fU][mC][mC][mU][mG][mA][mA][mUs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
v)根据SEQ ID NO: 374 (5’ [MeEPmUs][fAs][fA][mC][fA][mC][fA][mU][mG][fU][mU][mG][mC][fU][mC][fA][mU][mU][mG][mUs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 385 (5’ [mAs][mCs][mA][mA][mU][fG][mA][fG][fC][fA][fA][mC][mA][mU][mG][mU][mG][mUs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
vi)根据SEQ ID NO: 375 (5’ [MeEPmUs][fGs][fU][mG][fU][mA][fA][mC][mC][fG][mU][mC][mA][fU][mA][fG][mC][mA][mG][mUs][mGs][mG] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 386 (5’ [mAs][mCs][mU][mG][mC][fU][mA][fU][fG][fA][fC][mG][mG][mU][mU][mA][mC][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
vii)根据SEQ ID NO: 376 (5’ [MeEPmUs][fAs][fU][mA][fG][mC][fA][mG][mU][fG][mG][mA][mA][fA][mG][fA][mG][mA][mU][mCs][mUs][mC] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 387 (5’ [mGs][mAs][mU][mC][mU][fC][mU][fU][fU][fC][fC][mA][mC][mU][mG][mC][mU][mAs][mUs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
viii)根据SEQ ID NO: 377 (5’ [mUs][fGs][fU][mC][fA][mU][fA][mA][mA][fA][mU][mU][mC][fA][mG][fG][mA][mA][mU][mUs][mCs][mC] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 381 (5’ [mAs][mAs][mU][mU][mC][fC][mU][fG][fA][fA][fU][mU][mU][mU][mA][mU][mG][mAs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;
ix)根据SEQ ID NO: 378 (5’ [mUs][fUs][fA][mA][fA][mA][fU][mU][mC][fA][mG][mG][mA][fA][mU][fU][mC][mC][mU][mGs][mCs][mU] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 382 (5’ [mCs][mAs][mG][mG][mA][fA][mU][fU][fC][fC][fU][mG][mA][mA][mU][mU][mU][mUs][mAs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链;或
x)根据SEQ ID NO: 379 (5’ [mUs][fGs][fG][mA][fA][mA][fG][mA][mG][fA][mU][mC][mU][fC][mA][fU][mC][mA][mC][mUs][mCs][mA] 3’)的核酸序列的反义链,和根据SEQ ID NO: 383 (5’ [mAs][mGs][mU][mG][mA][fU][mG][fA][fG][fA][fU][mC][mU][mC][mU][mU][mU][mCs][mCs][mA][G1b][G1b][G1b] 3’)的核酸序列的有义链。
50.一种载体,编码根据权利要求1-49中任一项所述的分离的寡核苷酸。
51.一种递送系统,所述递送系统包含根据权利要求1-49中任一项所述的分离的寡核苷酸或根据权利要求50所述的载体。
52.一种药物组合物,所述药物组合物包含至少一种根据权利要求1-49中任一项所述的分离的寡核苷酸、根据权利要求50所述的载体、或根据权利要求51所述的递送系统和药学上可接受的运载体、稀释剂或赋形剂。
53.一种药盒,所述药盒包含根据权利要求1-49中任一项所述的至少一种分离的寡核苷酸、根据权利要求50所述的载体、根据权利要求51所述的递送系统或根据权利要求52所述的药物组合物。
54.一种在有相应需要的受试者中抑制或下调CFB的表达或水平的方法,其中所述方法包括向所述受试者施用有效量的至少一种根据权利要求1-49中任一项所述的分离的寡核苷酸、根据权利要求50所述的载体、根据权利要求51所述的递送系统或根据权利要求52所述的药物组合物。
55.一种在有相应需要的受试者中治疗或预防与CFB的异常或增加的表达或活性相关的疾病或紊乱或其中CFB起作用的疾病或紊乱的方法,其中所述方法包括向所述受试者施用有效量的至少一种根据权利要求1-49中任一项所述的分离的寡核苷酸、根据权利要求50所述的载体、根据权利要求51所述的递送系统或根据权利要求52所述的药物组合物。
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