[go: up one dir, main page]

CN111718984A - 一种对法医混合dna样本进行str分型的方法 - Google Patents

一种对法医混合dna样本进行str分型的方法 Download PDF

Info

Publication number
CN111718984A
CN111718984A CN201910203024.XA CN201910203024A CN111718984A CN 111718984 A CN111718984 A CN 111718984A CN 201910203024 A CN201910203024 A CN 201910203024A CN 111718984 A CN111718984 A CN 111718984A
Authority
CN
China
Prior art keywords
dna
sample
mixed
str typing
pcr amplification
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201910203024.XA
Other languages
English (en)
Inventor
苑美青
李万水
凃政
孟庆振
李永久
刘志芳
王冲
丰蕾
徐秀兰
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Institute of Forensic Science Ministry of Public Security PRC
Original Assignee
Institute of Forensic Science Ministry of Public Security PRC
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Institute of Forensic Science Ministry of Public Security PRC filed Critical Institute of Forensic Science Ministry of Public Security PRC
Priority to CN201910203024.XA priority Critical patent/CN111718984A/zh
Publication of CN111718984A publication Critical patent/CN111718984A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869Methods for sequencing

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了一种对法医混合DNA样本进行STR分型的方法。本发明提供了一种对生物样本进行STR分型的方法,包括如下步骤:提取生物样本的基因组DNA,将基因组DNA作为模板,进行微滴式数字PCR扩增,将扩增产物进行测序,根据测序结果进行STR分型。所述生物样本为混合生物样本。本发明还保护一种对DNA样本进行STR分型的方法,包括如下步骤:将DNA样本作为模板,进行微滴式数字PCR扩增,将扩增产物进行测序,根据测序结果进行STR分型。所述DNA样本为混合DNA样本。本发明在法医DNA检验中有巨大的应用前景。

Description

一种对法医混合DNA样本进行STR分型的方法
技术领域
本发明涉及一种对法医混合DNA样本进行STR分型的方法。
背景技术
随着DNA检验水平的提高,微量接触类检材逐渐成为DNA实验室的主要检材,而在此类检材上获得的绝大部分都是混合DNA分型(比如受害人与嫌疑人的DNA混合,2个或2个以上嫌疑人样本的混合,或者是嫌疑人与另一无关个体的混合等等)。而恰恰是这些混合样本对提供案件线索、确立侦查范围和提供法庭证据等方面有很重要的现实意义。然而,混合样本DNA图谱因混合的人数不同、混合比例不同,而造成STR峰谱多、带型复杂、峰型不稳定,导致混合样本结果分析困难、定性风险高,使得混合结果极易被舍弃或忽略,造成遗漏重要的案件信息或者使得DNA证据效力大打折扣。
目前国内外法医界对于混合DNA样本的检验和分析方法主要有将混合DNA图谱进行基于计算机软件的拆分,或者专家人工拆分,或者将混合DNA样品进行单细胞分离,从而获得单一DNA分型,从而从混合样本中分解出有价值的DNA信息。其中单细胞分离技术有赖于专业的显微操作设备和训练有素的操作人员,并且能够进行单细胞分离的条件受限。而基于计算机技术或者基于有经验专家的人工拆分,都依赖于高质量的混合图谱的获得,而无法改变检材中DNA混合的初始状态。但是在实际案件中,检材本身可能的混合情况是受害人DNA背景强,而嫌疑人的DNA含量相对很低,低含量DNA模板被淹没于高含量的DNA模板的海洋中。
微滴式数字PCR技术是将样本通过微滴发生器进行微滴化处理,利用油包水技术将其“分割”为2×104个1nL体积的微滴后进行PCR反应,每一个微滴都是一个独立的PCR反应体系,该方法通量高,操作简单、成本低。
发明内容
本发明的目的是提供一种对法医混合DNA样本进行STR分型的方法。
本发明提供了一种对生物样本进行STR分型的方法,包括如下步骤:提取生物样本的基因组DNA,将基因组DNA作为模板,进行微滴式数字PCR扩增,将扩增产物进行测序,根据测序结果进行STR分型。所述生物样本为混合生物样本,例如来源于2个以上个体的混合血样,来源于2个以上个体的混合细胞样等。所述方法用于法医鉴定领域。所述微滴式数字PCR扩增的反应程序为:95℃1min;94℃30s、59℃1.5min,29个循环;60℃10min;98℃10min。所述微滴式数字PCR扩增的升降温速度设置为2℃/s。所述微滴式数字PCR扩增的反应体系(20μL):2μL模板、2μL
Figure BDA0001998068740000011
Primer Set、6μL
Figure BDA0001998068740000012
Master Mix和10μLddPCR Super Mix for probes (no dUTP)。所述测序采用遗传分析仪。具体采用
Figure BDA0001998068740000021
ID-X分析软件进行STR分型。
本发明还保护一种对DNA样本进行STR分型的方法,包括如下步骤:将DNA样本作为模板,进行微滴式数字PCR扩增,将扩增产物进行测序,根据测序结果进行STR分型。所述DNA样本为混合DNA样本,即来源于2个以上个体的DNA样本,例如来源于2个以上个体的混合血样的DNA样本,来源于2个以上个体的混合细胞样的DNA样本等。所述方法用于法医鉴定领域。所述微滴式数字PCR扩增的反应程序为:95℃1min;94℃30s、59℃1.5min,29个循环;60℃10min;98℃10min。所述微滴式数字PCR扩增的升降温速度设置为2℃/s。所述微滴式数字PCR扩增的反应体系(20μL):2μL模板、2μL
Figure BDA0001998068740000022
Primer Set、6μL
Figure BDA0001998068740000023
Master Mix和10μL ddPCR Super Mix for probes(no dUTP)。所述测序采用遗传分析仪。具体采用
Figure BDA0001998068740000024
ID-X分析软件进行STR分型。
本发明还保护一种对生物样本进行STR分型的系统,其特征在于:包括用于进行DNA提取的组件甲、用于进行微滴式数字PCR扩增的组件乙和用于进行测序的组件丙。所述组件乙为微滴生成仪、梯度PCR扩增仪、ddPCR Super Mix for probes(no dUTP)、
Figure BDA0001998068740000025
Primer Set和
Figure BDA0001998068740000026
Master Mix。所述组件丙为遗传分析仪。所述生物样本为混合生物样本,例如来源于2个以上个体的混合血样,来源于2个以上个体的混合细胞样等。所述STR分型为法医鉴定领域的STR分型。
本发明还保护一种对DNA样本进行STR分型的系统,其特征在于:包括用于进行微滴式数字PCR扩增的组件乙和用于进行测序的组件丙。所述组件乙为微滴生成仪、梯度PCR扩增仪、ddPCR Super Mix for probes(no dUTP)、
Figure BDA0001998068740000027
Primer Set和
Figure BDA0001998068740000028
Master Mix。所述组件丙为遗传分析仪。所述DNA样本为混合DNA样本,即来源于2个以上个体的DNA样本,例如来源于2个以上个体的混合血样的DNA样本,来源于2个以上个体的混合细胞样的DNA样本等。所述STR分型为法医鉴定领域的STR分型。
本发明还保护用于进行DNA提取的组件甲、用于进行微滴式数字PCR扩增的组件乙和用于进行测序的组件丙在制备对生物样本进行STR分型的系统中的应用。所述组件乙为微滴生成仪、梯度PCR扩增仪、ddPCR Super Mix for probes(no dUTP)、
Figure BDA0001998068740000029
Primer Set和
Figure BDA00019980687400000210
Master Mix。所述组件丙为遗传分析仪。所述生物样本为混合生物样本,例如来源于2个以上个体的混合血样,来源于2个以上个体的混合细胞样等。所述STR分型为法医鉴定领域的STR分型。
本发明还保护用于进行微滴式数字PCR扩增的组件乙和用于进行测序的组件丙在制备对DNA样本进行STR分型的系统中的应用。所述组件乙为微滴生成仪、梯度PCR扩增仪、ddPCR Super Mix for probes(no dUTP)、
Figure BDA0001998068740000031
Primer Set和
Figure BDA0001998068740000032
Master Mix。所述组件丙为遗传分析仪。所述DNA样本为混合DNA样本,即来源于2个以上个体的DNA样本,例如来源于2个以上个体的混合血样的DNA样本,来源于2个以上个体的混合细胞样的DNA样本等。所述STR分型为法医鉴定领域的STR分型。
本发明还保护用于进行微滴式数字PCR扩增的组件在对生物样本进行STR分型中的应用。所述STR分型为法医鉴定领域的STR分型。所述用于进行微滴式数字PCR扩增的组件为微滴生成仪、梯度PCR扩增仪、ddPCR Super Mix for probes(no dUTP)、
Figure BDA0001998068740000033
Primer Set和
Figure BDA0001998068740000034
Master Mix。所述生物样本为混合生物样本,例如来源于2个以上个体的混合血样,来源于2个以上个体的混合细胞样等。
本发明还保护用于进行微滴式数字PCR扩增的组件在对DNA样本进行STR分型中的应用。所述STR分型为法医鉴定领域的STR分型。所述用于进行微滴式数字PCR扩增的组件为微滴生成仪、梯度PCR扩增仪、ddPCR Super Mix for probes(no dUTP)、
Figure BDA0001998068740000035
Primer Set和
Figure BDA0001998068740000036
Master Mix。所述DNA样本为混合DNA样本,即来源于2个以上个体的DNA样本,例如来源于2个以上个体的混合血样的DNA样本,来源于2个以上个体的混合细胞样的DNA样本等。
本发明还保护用于进行微滴式数字PCR扩增的组件在制备对生物样本进行STR分型的系统中的应用。所述STR分型为法医鉴定领域的STR分型。所述用于进行微滴式数字PCR扩增的组件为微滴生成仪、梯度PCR扩增仪、ddPCR Super Mix for probes(no dUTP)、
Figure BDA0001998068740000037
Primer Set和
Figure BDA0001998068740000038
Master Mix。所述生物样本为混合生物样本,例如来源于2个以上个体的混合血样,来源于2个以上个体的混合细胞样等。
本发明还保护用于进行微滴式数字PCR扩增的组件在制备对DNA样本进行STR分型的系统中的应用。所述STR分型为法医鉴定领域的STR分型。所述用于进行微滴式数字PCR扩增的组件为微滴生成仪、梯度PCR扩增仪、ddPCR Super Mix for probes(no dUTP)、
Figure BDA0001998068740000039
Primer Set和
Figure BDA00019980687400000310
Master Mix。所述DNA样本为混合DNA样本,即来源于2个以上个体的DNA样本,例如来源于2个以上个体的混合血样的DNA样本,来源于2个以上个体的混合细胞样的DNA样本等。
以上任一所述遗传分析仪为Applied Biosystems公司生产的3500XL型遗传分析仪。
以上任一所述梯度PCR扩增仪为美国Bio-Rad公司生产的T100型梯度PCR仪。
将9947A、007等DNA标准物质制成不同混合比例的DNA混合样本并搜集实际案件中混合DNA检材,分别使用传统PCR扩增和微滴式数字PCR扩增,扩增产物经遗传分析仪检测和STR图谱分析。经过比较两种方法的扩增效果,微滴式数字PCR对混合DNA样本扩增结果更好。在9947A与007混合比例低至20:1时仍可较好的检出007的STR峰谱,在实际案件的混合DNA样本中可以获得质量更好的DNA混合图谱。微滴式数字PCR技术可以提高混合DNA中低浓度组分的扩增效力,削弱扩增偏嗜效应,有利于DNA混合图谱的判读,在法医混合DNA检验中有很好的应用潜力。
到目前为止,还没有将ddPCR技术应用到法医学领域混合DNA扩增和分析上,是一项技术空白。本发明利用微滴式数字PCR油包水可以生成2万个微滴的特点,改变反应体系和调整反应参数,削弱DNA的扩增偏嗜作用,可以提高混合样本中低组分DNA扩增概率,调整DNA产物混合比例,更加利于DNA图谱分析,深度挖掘混合DNA样本信息,为混合DNA检验提供新思路和新方法。本发明提供的方法,使得低含量的DNA模板能得到均等的扩增机会,具有更高的扩增灵敏度和精确度,能够检测到混合比例大于5%(20:1)的低组分混合物。本发明在法医DNA检验中有巨大的应用前景。
附图说明
图1为9947:007=1:1时常规PCR扩增结果。
图2为9947:007=2:1时常规PCR扩增结果。
图3为9947:007=5:1时常规PCR扩增结果。
图4为9947:007=10:1时常规PCR扩增结果。
图5为9947:007=20:1时常规PCR扩增结果。
图6为9947:007=50:1时常规PCR扩增结果。
图7为9947:007=1:1时ddPCR扩增结果。
图8为9947:007=2:1时ddPCR扩增结果。
图9为9947:007=5:1时ddPCR扩增结果。
图10为9947:007=10:1时ddPCR扩增结果。
图11为9947:007=20:1时ddPCR扩增结果。
图12为9947:007=50:1时ddPCR扩增结果。
图13为9号样品常规扩增结果。
图14为9号样品ddPCR扩增结果。
图15为10号样品常规扩增结果。
图16为10号样品ddPCR扩增结果。
图17为12号样品常规扩增结果。
图18为12号样品ddPCR扩增结果。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。
STR(short tandem repeat,短片段重复序列)广泛存在于人类及哺乳动物的基因组中,具有高度多态性,它们一般由2-6个核苷酸构成一个核心序列,核心序列串联重复排列,由核心序列重复数目的变化产生长度多态性。对于一个特定的个体,染色体上某个特定位置的重复序列的重复次数是固定的,而对于不同的个体在同一位置处的重复次数可能不同,这就构成了人群中这些重复序列的多态性。
9947A人类基因组DNA标准物(简称9947A标准物),女性,1ng/μl,为上海博升生物科技有限公司产品,产品目录号为AM100035,产品链接为http://www.biosun.cn/news/7718.htm。
007人类基因组DNA标准物(简称007标准物),男性,0.1ng/μl,为Thermo公司的
Figure BDA0001998068740000056
PCR Amplification Kit中的组件,试剂盒的产品目录号为4476135,试剂盒的产品链接为https://assets.qa.thermofisher.com/TFS-Assets/LSG/manuals/4477596.pdf。
Figure BDA0001998068740000051
PCR Amplification Kit中还具有组件
Figure BDA0001998068740000052
Primer Set和组件
Figure BDA0001998068740000053
Master Mix。
AmpFLSTRTMIdentifilerTMPCR Amplification Kit,为Thermo公司产品,产品目录号为4322288,产品链接为
https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/4322288?SID=srch-srp-4322288。
Bio-Rad QX200微滴式数字PCR系统,为美国Bio-Rad公司产品,由QX200微滴生成仪和QX200微滴分析仪组成,实施例中仅用到微滴生成仪。梯度PCR扩增仪为美国Bio-Rad公司生产的T100型梯度PCR仪。遗传分析仪为Applied Biosystems公司生产的3500XL型遗传分析仪,
Figure BDA0001998068740000054
ID-X分析软件为其配套软件。
ddPCR Super Mix for probes(no dUTP),为BIO-RAD公司产品,产品目录号为1863023,产品链接为
http://www.bio-rad.com/en-us/sku/1863023-ddpcr-supermix-for-probes-no-dutp?ID=1863023。
采用
Figure BDA0001998068740000055
PCR Amplification Kit并按说明书操作,分别检测9947A标准物和007标准物各个基因座的等位基因基因型,结果见表1。各个STR基因座的各个等位基因的信息见STRBase数据库(网址https://strbase.nist.gov/index.htm)。Amelogenin基因即牙釉基因,人X染色体中具有一类牙釉基因(AMG),人Y染色体中心粒附近具有一类牙釉基因(AMGL),AMG与AMGL序列有90%同源性,X表示AMG的特征峰,Y代表Y的特征峰。表1中,每个单元格中填写的都是两条染色体的基因型,用逗号隔开。表1中,-代表无相应基因座扩增产物。
表1
Figure BDA0001998068740000061
实施例1、检测标准物混合样本
一、混合样本的制备
6个混合样本的配比见表2。
表2
Figure BDA0001998068740000062
Figure BDA0001998068740000071
二、常规PCR扩增
采用
Figure BDA0001998068740000072
PCR Amplification Kit并按说明书操作。
反应体系为20μL,由2μL模板、2μL
Figure BDA0001998068740000073
Primer Set、6μL
Figure BDA0001998068740000074
Master Mix和10μL ddH2O组成。
模板分别为步骤一制备的6个混合样本。
反应程序见试剂盒说明书,29个循环。
三、微滴式数字PCR扩增
反应体系为20μL,由2μL模板、2μL
Figure BDA0001998068740000075
Primer Set、6μL
Figure BDA0001998068740000076
Master Mix和10μL ddPCR Super Mix for probes(no dUTP)组成。
模板分别为步骤一制备的6个混合样本。
1、分别将20μL反应体系和70μL微滴生成油加在微滴发生卡上,盖上胶垫后放入微滴生成仪中,生成微滴。
2、将步骤1得到的约40μL微滴转移到96孔板中,用热封膜仪进行封膜,然后置于T100型梯度PCR扩增仪中进行反应。反应程序:95℃1min;94℃30s、59℃1.5min,29个循环;60℃10min;98℃10min;15℃∞;升降温速度设置为2℃/s。产物4℃保存。
3、将步骤2的产物离心,初步去掉管底的油相,加10μL TE溶液,在通风橱中加入40μL氯仿,上下混匀后转入一个1.5ml带盖离心管中,最高速度涡旋震荡1分钟,15000g离心10分钟,弃去上层氯仿相,转移至一个新的1.5ml离心管中。
四、电泳分析
步骤二的产物或步骤三的产物上样于遗传分析仪进行检测(上样量为1μL)。用
Figure BDA0001998068740000077
ID-X分析软件(V3.2)进行STR分型,荧光峰的RFU值设定为≥50。
6个混合样本常规PCR后电泳分析的结果见图1至图6。当混合样品中女性成分与男性成分比例为5:1时,还可以勉强检出混合STR峰谱,并且基本能够对混合样本进行人工拆分(图3),但当混合样品中女性成分与男性成分比例变为10:1时,可以从性别位点Amel检出有极低的Y峰,但是其他基因座上想拆分出007的等位基因已经很困难(图4),而当混合比例提高到20:1甚至50:1时,从STR峰谱判读已经只剩下9947的单一分型,较难发现混合成分了(图5,图6)。
6个混合样本微滴式数字PCR扩增后电泳分析的结果见图7至图12。在男女混合比例为1:1和1:2时(图7,图8),与常规PCR的效果差异不明显,但当混合比例提高到5:1时,经微滴式数字PCR扩增的结果明显好于传统PCR,可以清晰的看出男性成分的混合,并且男性的STR位点可以非常明确的拆分而获得单一分型(图9),当混合比例为10:1时,混合图谱依然可以对男性成分进行确认和拆分(图10)。即使当混合比例提高至20:1和50:1,仍然可以在Amel位点检出男性成分,提示该样品为混合样品,可以继续做Y-STR分型,而不会造成混合图谱的信息遗漏或者误判,在部分基因座上仍然可以获得男性成分的STR分型(图11,图12)。可见改用微滴式数字PCR扩增,混合图谱质量有了明显提高。
实施例2、检测实际样本
供试样本:来自中心日常接检的血样混合物(12号样品)、脱落细胞混合物(9号样本、10号样本)。
一、分别提取各个供试样本的基因组DNA。
二、常规PCR扩增
采用AmpFLSTRTMIdentifilerTMPCR Amplification Kit并按说明书操作。
每个反应体系中,基因组DNA的含量为0.5ng。
模板分别为步骤一制备的各个供试样本的基因组DNA。
三、微滴式数字PCR扩增
反应体系为20μL,由2μL模板(2微升模板中的DNA含量为0.5ng)、2μL
Figure BDA0001998068740000081
Primer Set、6μL
Figure BDA0001998068740000082
Master Mix和10μL ddPCR Super Mixfor probes(no dUTP)组成。
模板分别为步骤一制备的各个供试样本的基因组DNA。
方法同实施例1的步骤三。
四、电泳分析
步骤二的产物或步骤三的产物上样于遗传分析仪进行检测(上样量为1μL)。用
Figure BDA0001998068740000083
ID-X分析软件(V3.2)进行STR分型,荧光峰的RFU值设定为≥50。
9号样本的结果见图13和图14。对于9号脱落细胞检材在常规PCR扩增后的检测结果显示为未检出(图13),但是经过ddPCR扩增后获得混合STR峰谱并且提示可能为三人以上混合(图14)。经过比对,获得的混合峰谱中包含一个已知受害人的DNA分型。其他供体DNA来源未知。
10号样本的结果见图15和图16。10号样品的常规PCR扩增后获得一个单一来源的不完整STR峰谱(图15),但是经ddPCR扩增后提示为两人混合样本(图16)并且有条件进行初步拆分。
12号样本的结果见图17和图18。12号样本经常规PCR扩增和ddPCR扩增后都显示为有混合,但是混合图谱质量ddPCR优于传统PCR结果。

Claims (10)

1.一种对生物样本进行STR分型的方法,包括如下步骤:
提取生物样本的基因组DNA,将基因组DNA作为模板,进行微滴式数字PCR扩增,将扩增产物进行测序,根据测序结果进行STR分型。
2.一种对DNA样本进行STR分型的方法,包括如下步骤:
将DNA样本作为模板,进行微滴式数字PCR扩增,将扩增产物进行测序,根据测序结果进行STR分型。
3.一种对生物样本进行STR分型的系统,其特征在于:包括用于进行DNA提取的组件甲、用于进行微滴式数字PCR扩增的组件乙和用于进行测序的组件丙。
4.一种对DNA样本进行STR分型的系统,其特征在于:包括用于进行微滴式数字PCR扩增的组件乙和用于进行测序的组件丙。
5.权利要求4中所述的组件甲、组件乙和组件丙在制备对生物样本进行STR分型的系统中的应用。
6.权利要求5中所述的组件乙和组件丙在制备对DNA样本进行STR分型的系统中的应用。
7.用于进行微滴式数字PCR扩增的组件在对生物样本进行STR分型中的应用。
8.用于进行微滴式数字PCR扩增的组件在对DNA样本进行STR分型中的应用。
9.用于进行微滴式数字PCR扩增的组件在制备对生物样本进行STR分型的系统中的应用。
10.用于进行微滴式数字PCR扩增的组件在制备对DNA样本进行STR分型的系统中的应用。
CN201910203024.XA 2019-03-18 2019-03-18 一种对法医混合dna样本进行str分型的方法 Pending CN111718984A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910203024.XA CN111718984A (zh) 2019-03-18 2019-03-18 一种对法医混合dna样本进行str分型的方法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910203024.XA CN111718984A (zh) 2019-03-18 2019-03-18 一种对法医混合dna样本进行str分型的方法

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN111718984A true CN111718984A (zh) 2020-09-29

Family

ID=72562977

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201910203024.XA Pending CN111718984A (zh) 2019-03-18 2019-03-18 一种对法医混合dna样本进行str分型的方法

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN111718984A (zh)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112813147A (zh) * 2021-01-08 2021-05-18 郑州高新生物技术有限公司 一种应用于法医混合检材的高灵敏检测方法
CN113160892A (zh) * 2021-05-25 2021-07-23 北京众诚天合系统集成科技有限公司 一种混合dna分型亲缘关系确定方法及系统
CN114373507A (zh) * 2022-01-27 2022-04-19 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) 一种混合dna图谱的分析方法

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20120315633A1 (en) * 2009-12-23 2012-12-13 Genetic Technologies Limited Methods of enriching and detecting fetal nucleic acids
CN103917661A (zh) * 2011-05-12 2014-07-09 网络百奥有限公司 用于快速多重扩增str基因座的方法和组合物
CN104673907A (zh) * 2015-02-12 2015-06-03 上海市刑事科学技术研究院 一种用于高通量检验str分型的系统及其检测方法
CN105755129A (zh) * 2016-03-21 2016-07-13 北京市理化分析测试中心 基于新一代测序的基因座d8s1179的str分型方法

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20120315633A1 (en) * 2009-12-23 2012-12-13 Genetic Technologies Limited Methods of enriching and detecting fetal nucleic acids
CN103917661A (zh) * 2011-05-12 2014-07-09 网络百奥有限公司 用于快速多重扩增str基因座的方法和组合物
CN104673907A (zh) * 2015-02-12 2015-06-03 上海市刑事科学技术研究院 一种用于高通量检验str分型的系统及其检测方法
CN105755129A (zh) * 2016-03-21 2016-07-13 北京市理化分析测试中心 基于新一代测序的基因座d8s1179的str分型方法

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
耿娟 等: "微滴式数字PCR技术用于检测产前诊断标本母体细胞污染的初步研究", 《中华妇产科杂志》 *
董小欢等: "PCR技术在产前诊断常见非整倍体疾病中的临床应用", 《中国产前诊断杂志(电子版)》 *

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112813147A (zh) * 2021-01-08 2021-05-18 郑州高新生物技术有限公司 一种应用于法医混合检材的高灵敏检测方法
CN113160892A (zh) * 2021-05-25 2021-07-23 北京众诚天合系统集成科技有限公司 一种混合dna分型亲缘关系确定方法及系统
CN113160892B (zh) * 2021-05-25 2023-12-01 北京众诚天合系统集成科技有限公司 一种混合dna分型亲缘关系确定方法及系统
CN114373507A (zh) * 2022-01-27 2022-04-19 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) 一种混合dna图谱的分析方法

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN102337345B (zh) 基于20个三等位基因snp遗传标记的法医学复合检测试剂盒
CN103131787A (zh) 基于y染色体snp遗传标记的法医学复合检测试剂盒
WO2023092872A1 (zh) 基于已知标签的内参进行高通量测序的方法
CN108624700B (zh) 基于二代测序技术同步检测124个微单倍型基因座的试剂盒及其专用引物对组合
CN106222288A (zh) 用于kir基因pcr‑ssp分型检测的引物组合及试剂盒及方法
CN111718984A (zh) 一种对法医混合dna样本进行str分型的方法
CN108642208A (zh) 一种樟属及其近缘属植物通用ssr分子标记及其开发方法和应用
CN108823327B (zh) 樟树全基因组ssr分子标记及其制备方法和应用
CN108060237B (zh) 基于55个y染色体snp遗传标记的法医学复合检测试剂盒
CN106399553B (zh) 一种基于多重pcr的人线粒体全基因组高通量测序方法
CN106520980B (zh) 一种对男性个体进行y-str分型的方法和系统
Zhang et al. Set of 15 SNP-SNP markers for detection of unbalanced degraded DNA mixtures and noninvasive prenatal paternity testing
CN108192964A (zh) Hla-c全长基因分型试剂盒
CN104212894B (zh) 基于26个线粒体snp遗传标记的法医学复合检测试剂盒
CN109280696B (zh) Snp检测技术拆分混合样本的方法
CN105648063B (zh) 一种基于快速突变y-str基因座的复合扩增体系、方法及应用
CN103468800B (zh) 基于20个多重插入缺失遗传标记的法医学复合检测试剂盒
CN108517364B (zh) 基于56个y染色体snp遗传标记的法医学复合检测试剂盒
Wei et al. CRISPR/Cas13a-based single-nucleotide polymorphism detection for reliable determination of ABO blood group genotypes
CN108070636A (zh) 一种荧光pcr扩增样本的处理方法和试剂盒
CN110791573B (zh) 适用于滇金丝猴个体鉴定的微卫星位点与引物
CN108642190B (zh) 基于14个常染色体snp遗传标记的法医学复合检测试剂盒
CN115948574B (zh) 一种基于三代测序的个体识别体系、试剂盒及其应用
CN112725426B (zh) 一种用于波棱瓜性别鉴定的特异性scar分子标记、引物组、试剂盒、鉴定方法及其应用
CN113512595B (zh) 一种用于dna样本跟踪检测的生物标志物、方法和应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
RJ01 Rejection of invention patent application after publication

Application publication date: 20200929

RJ01 Rejection of invention patent application after publication