[go: up one dir, main page]

CN111574616A - 分离的t细胞受体和应用 - Google Patents

分离的t细胞受体和应用 Download PDF

Info

Publication number
CN111574616A
CN111574616A CN202010555880.4A CN202010555880A CN111574616A CN 111574616 A CN111574616 A CN 111574616A CN 202010555880 A CN202010555880 A CN 202010555880A CN 111574616 A CN111574616 A CN 111574616A
Authority
CN
China
Prior art keywords
cell
cells
cell receptor
ser
seq
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN202010555880.4A
Other languages
English (en)
Other versions
CN111574616B (zh
Inventor
于川
李宜声
侯晨芳
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Shenzhen Haoshi Biotech Co ltd
Original Assignee
Shenzhen Haoshi Biotech Co ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Shenzhen Haoshi Biotech Co ltd filed Critical Shenzhen Haoshi Biotech Co ltd
Priority to CN202010555880.4A priority Critical patent/CN111574616B/zh
Publication of CN111574616A publication Critical patent/CN111574616A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN111574616B publication Critical patent/CN111574616B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/7051T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • A61K39/001102Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • A61K39/001111Immunoglobulin superfamily
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86Viral vectors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/06Animal cells or tissues; Human cells or tissues
    • C12N5/0602Vertebrate cells
    • C12N5/0634Cells from the blood or the immune system
    • C12N5/0636T lymphocytes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A61K2039/515Animal cells
    • A61K2039/5156Animal cells expressing foreign proteins
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A61K2039/515Animal cells
    • A61K2039/5158Antigen-pulsed cells, e.g. T-cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2510/00Genetically modified cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/15011Lentivirus, not HIV, e.g. FIV, SIV
    • C12N2740/15041Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2740/15043Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2800/00Nucleic acids vectors
    • C12N2800/10Plasmid DNA
    • C12N2800/106Plasmid DNA for vertebrates
    • C12N2800/107Plasmid DNA for vertebrates for mammalian

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

本发明分离的T细胞受体和应用,所述分离的T细胞受体包括α链和β链中的至少一者,β链可变区的CDR3具有SEQ ID NO.7至10任一所示的序列,用此TCR修饰的免疫细胞具有显著的抗肿瘤效果。

Description

分离的T细胞受体和应用
技术领域
本发明本发明属于细胞免疫学、基因工程领域,涉及一种分离的T细胞受体和应用。
背景技术
T细胞相关免疫疗法在近期的癌症研究中大放异彩,“主力部队”是CAR-T和TCR-T这两种技术。相对于CAR-T细胞疗法,TCR-T疗法的关注度相对低些,但是这两种细胞疗法都属于利用患者自身的T淋巴细胞治疗癌症的前沿基因疗法。TCR-T疗法通过转导嵌合抗原受体或者TCRα/β异二聚体,来提高特异性识别肿瘤相关抗原(Tumor Associated Antigen,TAA)的TCR(T cell receptor,T细胞抗原受体)的亲和力和战斗力,使T淋巴细胞能够重新高效的识别靶细胞。通过输注能够识别特异靶标的基因修饰T淋巴细胞,TCR-T疗法赋予免疫系统以新的非自然免疫活性。这种方法除了能像化疗和靶向治疗一样快速杀灭肿瘤外,还避免了疫苗和T淋巴细胞检查点疗法的延迟效应。
目前已知,TCR的多肽链依据抗原结构和编码基因的不同,有α、β、γ和δ4种。TCR分子的4条多肽链可分为细胞外、跨膜和细胞质3部分,其中肽链氨基端在细胞外,羧基端在细胞内;氨基端肽链的氨基酸顺序变化较大,称为可变域;近膜端肽链的氨基酸顺序变化少,称为保守域。根据受控基因片段的不同,细胞外肽链又分为V(可变区)、D(高变区)、J(结合区)和C(恒定区)4个区域,其中α链由V、J和C基因节段编码,β链由V、D、J和C基因节段编码。细胞外肽链的可变域存在4个互补结合功能区(complementary determining religion,CDR)。V基因编码CDR1和CDR2,而CDR3是唯一非胚系编码的抗原特异性结合部位。TCR基因多态性主要由CDR3决定。
到目前为止,TCR-T细胞免疫疗法已在部分实体肿瘤的治疗中取得了较好的疗效,但是仍存在受抗原限制、杀伤活性低等缺点,研究高效、低毒及可操控的TCR-T细胞免疫法在肿瘤治疗中具有理想的应用前景。
发明内容
为了弥补现有技术的不足,本发明提供一种的分离的T细胞受体以及与该受体相关的核酸、重组表达载体、T细胞。本发明还提供了用于治疗或预防肿瘤和/或癌症、或用于检测宿主的肿瘤和/或癌症的包含T细胞受体的药物组合物。本发明提供的T细胞受体及其相关的产品具有较好的杀伤效果。
具体而言,本发明提供了如下内容:
(1)一种分离的T细胞受体,包所述括α链和β链中的至少一者,β链可变区的CDR3具有SEQ ID NO.7至10任一所示的序列。
根据(1)所述的T细胞受体,所述T细胞受体的β链可变区的CDR1序列和CDR2序列分别具有如SEQ ID NO.5和6所示的序列。
作为一种优选的实施方式,所述T细胞受体的β链可变区具有SEQ ID NO.11所示的氨基酸序列。
作为另外一种优选的实施方式,所述T细胞受体的β链可变区具有SEQ ID NO.12所示的氨基酸序列。
作为作为另外一种优选的实施方式,所述T细胞受体的β链可变区具有SEQ IDNO.13所示的氨基酸序列。
作为作为另外一种优选的实施方式,所述T细胞受体的β链可变区具有SEQ IDNO.14所示的氨基酸序列。
根据(1)所述的T细胞受体,所述T细胞受体的α链可变区的CDR3具有SEQ ID NO.3所示的序列。
作为一种优选的实施方式,α链可变区的CDR1和CDR2具有SEQ ID NO.1和SEQ IDNO.2所示的序列。
(2)一种分离的分离的、编码T细胞受体的核酸,所述核酸编码(1)所述的T细胞受体,或α或β链,或可变结构域,或具有结合抗原能力的片段。
作为一种优选的实施方式,本发明的核酸的核苷酸序列进行编码子优化以增加基因表达、蛋白翻译效率以及蛋白表达,从而增强TCR识别抗原的能力。编码子优化包括但不限于翻译启动区域的修饰、改变mRNA结构片段、以及使用编码同一氨基酸的不同密码子。
在其它的实施方案中,可以对上述TCR编码核酸的序列进行突变,包括去除、插入和/或置换一个或多个氨基酸密码子,使得所表达的TCR识别抗原的功能不变或者增强。例如,在一个实施方案中,进行保守氨基酸置换,包括对上述TCRα链和/或β链的可变区中的一个氨基酸用结构和/或化学属性相似的另一个氨基酸进行置换。术语“相似的氨基酸”是指具有相似的极性、电负荷、可溶性、疏水性、亲水性等属性的氨基酸残基。突变后的TCR仍具有识别上述被靶细胞提呈的抗原多肽的生物活性。
(3)一种重组表达载体,含有与启动子有效连接的、(2)中所述的核酸,和/或其互补序列。
作为一种优选的实施方式,在所述重组表达载体中,本发明所述的DNA合适地与启动子、增强子、终止子和/或polyA信号序列有效连接。本发明的重组表达载体的上述作用元件的组合能够促进DNA的转录和翻译,并增强mRNA的稳定性。
在一个实施方案中,重组表达载体上的α链和β链基因的表达可以由两个不同的启动子所驱动,启动子包括各种已知的类型,例如强表达的、弱表达的、可诱导的、组织特异性的、和分化特异性的启动子。启动子可以是病毒来源的或者非病毒来源的,例如CMV启动子、MSCV的LTR上的启动子、EF1-α启动子、和PGK-1启动子。两个启动子的驱动方向可以是同向也可以是反向的。
在另一个实施方案中,重组表达载体上的α链和β链基因的表达可以由同一个启动子所驱动,例如编码单链嵌合T细胞受体的情况,α链的核苷酸序列和β链的核苷酸序列由Furin-F2A多肽编码序列相连接。
在另一些实施方案中,重组表达载体除了包含α链和β链基因外,还可以包含其它功能分子的编码序列。一个实施方案包括表达自发荧光蛋白(如GFP或其它荧光蛋白)以用于体内追踪成像。另一个实施方案包括表达可诱导的自杀基因系统。
本发明对表达载体没有特别的限制,但可以是能在包括哺乳动物细胞(例如,人、猴、兔、大鼠、仓鼠或小鼠细胞)、植物细胞、酵母细胞、昆虫细胞和细菌细胞(如大肠杆菌(E.coli))在内的真核或原核细胞内复制和/或表达多核苷酸的载体。较佳地,它可以是载体,包括至少一选择性标记,可操作地连接到合适的启动子,以致可以在宿主细胞内表达多核苷酸。例如,载体可以包括导入噬菌体、质粒、粘粒、微型染色体、病毒或反转录病毒载体的多核苷酸。
(3)一种T细胞受体修饰的细胞,所述细胞的表面被(1)所述的T细胞受体修饰。
作为优选的实施方式,所述细胞包括原始T细胞或其前体细胞,NKT细胞,或T细胞株。
所述“T细胞受体修饰”中的“修饰”是指,通过基因转染使细胞表达有本发明所述的T细胞受体,即,所述T细胞受体通过跨膜区锚定在所修饰的细胞的细胞膜上,并具有识别抗原多肽的功能。
(4)一种制备(3)所述的T细胞受体修饰的细胞的方法,包括以下步骤:
1)提供细胞;
2)提供(2)所述的核酸;
3)将所述核酸转染入所述细胞中。
作为一种可选择的实施方式,所述的细胞来自自体。
作为另一种可选择的实施方式,所述的细胞来自自体。
在本发明中,所述的细胞包括原始T细胞或其前体细胞、NKT细胞、或T细胞株。术语“原始T细胞(naive T cell)”是指外周血中尚未被相应抗原活化的成熟T细胞。这些细胞可以通过本领域已知的方法分离得到。例如,T细胞可以从不同组织器官获得,包括外周血、骨髓、淋巴组织、脾脏、脐带血、肿瘤组织。作为一种可选择的实施方式,T细胞可以来自造血干细胞(HSCs),包括来自骨髓、外周血或者脐带血,通过干细胞标记分子例如CD34而分离获得。
作为另一种可选择的实施方式,T细胞可以来自诱导性多功能干细胞(iPScells),包括把特定基因或特定基因产物导入体细胞,使该体细胞转化为干细胞后,体外诱导分化成T细胞或其前体细胞。T细胞可以通过常用方法如密度梯度离心法而获得,密度梯度离心法的例子包括Ficoll或者Percoll密度离心。
作为一种可选择的实施方式,是利用血浆分离置换法(apheresis)或白细胞去除法(leukapheresis)从外周血获得富集的T细胞的产物。
作为另一种可选择的实施方式,是用抗体标记特定细胞群后,通过磁珠分离的方式(如系统(Miltenyi Biotec))、或流式细胞分离的方式获得富集的CD8+或CD4+T细胞。
优选地,所述T细胞前体细胞为造血干细胞。可以将本发明所述TCR的编码基因直接引入造血干细胞,然后转输到体内,进一步分化成为成熟T细胞;也可以将编码基因引入在体外特定条件下由造血干细胞分化成熟的T细胞中。
作为一种可选择的实施方式,所述转染的方式为病毒载体转染的方式,包括但不限于γ逆转录病毒载体或慢病毒载体。
作为另一种可选择的实施方式,所述转染的方式为化学方式,包括但不限于大分子复合物、纳米胶囊、微球体、微珠、微团和脂质体。
作为另一种可选择的实施方式,所述转染的方式为物理方式,物理方式包括但不限于通过磷酸钙沉淀、脂质体、微注射、电穿孔、基因枪等途径把TCR基因以DNA或RNA的形式导入细胞内。
(5)一种药物组合物,该药物组合物包括作为活性成分的根据(3)所述的T细胞受体修饰的细胞,及药学上可接受的载体。药学上可接受的载体是指不会对生物体引起显著刺激且不会消除所施用化合物的生物活性和性质的载体或稀释剂。
可用于将本发明组合物配制为液体溶液形式的药学上可接受的载体包括生理盐水,无菌水,林格氏溶液,缓冲盐溶液,葡萄糖溶液,麦芽糊精溶液,甘油,乙醇,和其中两种或更多种的混合物。如果需要,本发明的组合物也可含有其它常规添加剂,如抗氧化剂,缓冲剂和抑菌剂。此外,本发明组合物还可包含稀释剂,分散剂,表面活性剂,粘合剂和润滑剂,以将它配置成可注射制剂,如水性溶液,悬浮液和乳剂,丸剂,胶囊剂,颗粒剂和片剂。
药物组合物可以是各种口服或胃肠外制剂形式。使用包括填料,填充剂,粘合剂,润湿剂,崩解剂,和表面活性剂在内的常规稀释剂或赋形剂配制药物组合物。固体口服制剂包括片剂,丸剂,粉剂,颗粒剂,胶囊等。这些固体制剂可通过将至少一种化合物与一种或多种赋形剂,例如,淀粉,碳酸钙,蔗糖,乳糖,明胶等混合来制备。除了简单的赋形剂,也可使用润滑剂如硬脂酸镁或滑石。此外,液体口服制剂包括悬浮液,溶液,乳剂和糖浆等。除了通常用作简单稀释剂的水和液体石蜡外,还可包括各种赋形剂,例如,润湿剂,甜味剂,香料,防腐剂等。肠胃外给药的制剂包括灭菌水溶液,非水溶剂,悬浮剂,乳剂,冻干剂,栓剂等。丙二醇,聚乙二醇,植物油如橄榄油,可注射酯如油酸乙酯等可以用作非水溶剂和悬浮剂。栓剂主要成分可以包括witepsol,聚乙二醇,吐温61,可可脂,月桂脂,甘油明胶等。
药物组合物可具有选自下组的任意一种制剂:片剂,丸剂,粉末,颗粒,胶囊,悬浮液,溶液,乳剂,糖浆,灭菌水溶液,非水溶液,悬浮液,乳液,冻干制剂和栓剂。
(6)(3)所述的T细胞受体修饰的细胞或(5)所述的药物组合物在制备用于治疗或预防肿瘤和/或癌症、或用于检测宿主的肿瘤和/或癌症的产品中的用途。
附图说明
图1是TCR-T杀伤功能检测图。
具体的实施方式
以下通过例子的方式进一步解释或说明本发明的内容,但这些例子不应被理解为对本发明的保护范围的限制。
以下除非特别说明,否则以下例子中所用实验方法均使用生物工程领域的常规实验流程、操作、材料和条件进行。
实施例1高通量测序筛选TCR序列
1、RNA提取及质控
收集急性髓系白血病患者的外周血样本,患者无甲肝,乙肝,丙肝,戊肝,艾滋病,梅毒,淋病和结核感染。
在5mL Ficoll中缓慢加入外周血,离心2000rpm,15min。吸取中间白膜层,加入0.9%生理盐水,计数单个核细胞数量,离心1000rpm,5min,磁珠分选T细胞。采用TRIzol法对处理的细胞样本进行RNA的提取,对提取后的RNA质量使用Qubit RNA HS Assay kits,经2100生物分析仪(安捷伦)检测RNA完整性。
2、反转录及文库制备
用Repertoire Analysis Kit(Human TCR alpha,beta)进行建库。将所有试剂置于冰上解冻,在配置mix之前,混匀和离心这些试剂。在冰上配置杂交引物需用的mix(表1)。充分混匀后离心,加热反转录引物杂交mix,65℃5min,冰上孵育至少2min。在冰上准备配制反转录mix(表2),混匀后离心mix。
表1反应体系
组分 体积
RT dNTP Mixture 1μl
RT Primer H TCRα/β 1μl
RNA 样本(100pg-1000ng) 最多到6.2μl
Nuclease-free water 补足至8.2μl
表2反转录体系
组分 体积
RT buffer A 4μl
RT buffer B 1μl
RT buffer C 3.8μl
RT Universal primer 1μl
RNase inhibitor 1μl
Reverse Transcriptase 1μl
总体积 11.8μl
将11.8μl的杂交buffer加到上一步反应的杂交RNA中混匀,然后离心,在PCR仪(T100,Bio-RAD)上运行以下程序(表3):
表3反应条件
Figure BDA0002544230710000081
3、第一步PCR
准备第一步PCR需用的试剂(表4),并在冰上解冻,混匀后瞬时离心,在冰上配制第一步PCR反应的mix,配置好的mix用移液器混匀,然后离心。
表4第一步PCR反应体系
Figure BDA0002544230710000082
每管中加入41μl的第一步PCR mix,加入9μl的第一链cDNA产物中混匀,然后离心,在PCR仪(T100,Bio-RAD)上运行以下程序:
表5第一步PCR反应条件
Figure BDA0002544230710000083
Figure BDA0002544230710000091
4、第二步PCR
准备第二步PCR需用的试剂(表6),并在冰上解冻,混匀后瞬时离心,在冰上配制第二步PCR反应的mix,配置好的mix用移液器混匀,然后离心。
表6第二步PCR反应体系
组分 体积
PCR buffer 25μl
PCR dNTP Mixture 10μl
Nuclease-free water 3μl
DNA polymerase 1μl
总体积 39μl
准备一个新的PCR管,每管中加入1μl的第二步PCR引物,hTCRα#1-18(编号:A1-A18),或者hTCRβ#1-18(编号:B1-B18)。加入39μl第二步反应的mix和10μl的第一步PCR产物混匀,然后离心,在PCR仪(T100,Bio-RAD)上运行以下程序:
表7第二步PCR反应条件
Figure BDA0002544230710000092
5、第三步PCR
准备第三步PCR需用的试剂在冰上解冻(表9),混匀后瞬时离心。在冰上配制第二步PCR反应的mix,配置好的mix用移液器混匀,然后离心。
表8第三步PCR反应体系
组分 体积
PCR buffer 25μl
PCR dNTP Mixture 10μl
3rd universal primer 2.5μl
Nuclease-free water 6.5μl
DNA polymerase 1μl
总体积 45μl
准备一个新的PCR管,每管中加入45μl的第三步PCR mix,加入5μl的第二步PCR产物中,用手指肚弹匀,然后离心,在PCR仪(T100,Bio-RAD)上运行以下程序:
表9第三步PCR反应条件
Figure BDA0002544230710000101
6、琼脂糖凝胶电泳
配置1.5%的琼脂糖胶,用1*TAE buffer和核酸染料(北京金博益),DNA marker上样量为2μl,加1μl的6*loading buffer到PCR产物中,点样。100V电泳30-45min。使用凝胶到成像系统(1708195,Bio-RAD),判断产物大小。hTCRɑ/β片段在650bp左右。
7、用AGENCOURT AMPure XP(BEACKMAN)磁珠纯化
准备nuclease-free 0.2mL的8连管,按照表10稀释文库。
表10稀释体系
组分 体积
第三步PCR产物 30μl
Nuclease-free water 20μl
总体积 50μl
配置DNase-free 70%乙醇(sigma)。磁珠使用前室温平衡30min,将22.5μl的磁珠加到稀释后文库中,用移液器混匀至少10次。室温孵育5min,然后简单的离心。将8连管放置在96孔磁力架上磁吸5min,观察液体和磁珠分离。将所有的上清转移到新的8连管中。再次混匀未使用过的磁珠,加17.5μl的磁珠到上清中,用移液器混匀至少10次。室温孵育5min,然后简单离心。将8连管放在96孔磁力架上磁吸5min,观察液体和磁珠分离。弃85μl的上清,保留5μl的上清以免吸到磁珠。不要将磁珠与磁力架分离。加200μl的70%的乙醇漂洗。室温30s,弃酒精,重复酒精洗涤步骤。弃所有上清,加30μl的10mM Tris-HCl到每个PCR管中,用移液器混匀至少10次。室温孵育2min然后简单离心。将离心管放置在磁力架上室温5min,分离液体和磁珠。将上清20μl转移至新的PCR管中。
8、文库浓度定量及质控
测定文库浓度用Qubit dsDNA HS kit(英潍捷基),使用设备Qubit 2.0(life),取2μl的样本用于测定。通常文库浓度集中在5-40ng/μl。如果样本浓度≥1.72ng/μl可用于Miseq测序。
9、文库目标片段质控
人的TCRα/β文库目标片段集中在650bp,使用1.5%的琼脂糖凝胶电泳对文库片段进行质控,用1*TAE buffer和核酸染料(北京金博益),DNA marker上样量为2μl,加1μl的6*loading buffer到PCR产物中,点样。100V电泳30-45min。使用凝胶到成像系统(1708195,Bio-RAD),判断产物大小。
10、文库混库及质控
文库混样,是按此批次浓度最低的文库为标准,浓度最低文库乘以10μl为基准纳克数,其他文库按照此纳克数进行取样,确保每个文库的总量是一致的,混样后按照纳克与摩尔数之间的换算,稀释到8.58ng/μl(20nM,650bp)。
11、高通量测序
文库使用Miseq(Illumina)进行2×300bp双端测序,对上述混合完成的文库再次使用设备Qubit 2.0(life)进行文库定量,最终稀释到10pM,与10pM denatured PhiX进行混合(PhiX占比30%),混合后的600μl进行上机测序。
12、数据分析
采用MiXCR进行初级分析,可以对高度个性化的TCR和免疫球蛋白序列进行分析。MiXCR可以针对不同的数据类型在参数上进行调整,并对分析结果和输出进行优化。进一步高级分析多个多样性指数,如香农指数(Shannon)、辛普森指数(Simpson)、Inverse-Simpson指数和基尼指数(Gini)等。采用VDJtools用于二级TCR profiling分析以及多样性评估。
13、噬菌体展示技术筛选高亲和力的TCR序列。
14、结果
通过噬菌体展示技术筛选出高亲和力的TCR,其α链可变区的氨基酸序列如SEQ IDNO.4所示,其中CDR1-3的序列分别如SEQ ID NO.1-3所示;其β链可变区的氨基酸序列如SEQID NO.11-14任一项所示,其中,CDR1-2的序列分别如SEQ ID NO.5-6所示,CDR3的序列如SEQ ID NO.7~10任一项所示。
实施例2 TCR-T的构建
1、利用高通量测序和数据分析结果,全合成相关序列,通过XbaI/SalI限制内切酶切点,连接到pCDH载体中。
2、TCR-T细胞制备
采集健康人外周血,在Ficoll中缓慢加入外周血,离心2000rpm,15min。吸取中间白膜层,加入0.9%生理盐水,计数单个核细胞数量,离心1000rpm,5min。磁珠分选T细胞。同时加入CD3/CD28抗体偶联磁珠刺激,24h及48h后加入病毒感染2次,病毒感染时加入IL-2,培养3-20天,获得TCR-T细胞。
实施例3 TCR-T杀伤功能检测
从本研究中所述的序列构建的TCR-T中任选一个进行功能检测。
计数靶细胞(急性髓系白血病细胞OCI-AMLP3)和阴性参照靶细胞(Daudi),分别标记Celltrace far red和CFSE染色。计数TCR-T(TCR的Vβ可变区的氨基酸序列如SEQ IDNO.11所示)细胞作为效应细胞。按照计划效靶比(3:1,9:1,18:1),重悬效应细胞和靶细胞至相应浓度。圆底96孔板中每个效靶比分别铺入铺入组1效应细胞、组2靶细胞和组3效应细胞+靶细胞,每组4个复孔。培养2-24h,收细胞样本,分别收管A:组1效应细胞+组2靶细胞,管B:组3效应细胞+靶细胞,多聚甲醛液固定,流式上机。作Killing Rate与E:T Ratio曲线图。其中,
Figure BDA0002544230710000131
结果,如图1所示,相比对照组,本申请的TCR-T具有较好的杀伤效果。
上述实施例的说明只是用于理解本发明的方法及其核心思想。应当指出,对于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以对本发明进行若干改进和修饰,这些改进和修饰也将落入本发明权利要求的保护范围内。
序列表
<110> 深圳豪石生物科技有限公司
<120> 分离的T细胞受体和应用
<160> 14
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
Val Ser Asn Ala Tyr Asn
1 5
<210> 2
<211> 4
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
Gly Ser Lys Pro
1
<210> 3
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
Cys Ala Val Asp Glu Asp Gln Thr Gly Ala Asn Asn Leu Phe Phe
1 5 10 15
<210> 4
<211> 109
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
Lys Asp Gln Val Phe Gln Pro Ser Thr Val Ala Ser Ser Glu Gly Ala
1 5 10 15
Val Val Glu Ile Phe Cys Asn His Ser Val Ser Asn Ala Tyr Asn Phe
20 25 30
Phe Trp Tyr Leu His Phe Pro Gly Cys Ala Pro Arg Leu Leu Val Lys
35 40 45
Gly Ser Lys Pro Ser Gln Gln Gly Arg Tyr Asn Met Thr Tyr Glu Arg
50 55 60
Phe Ser Ser Ser Leu Leu Ile Leu Gln Val Arg Glu Ala Asp Ala Ala
65 70 75 80
Val Tyr Tyr Cys Ala Val Asp Glu Asp Gln Thr Gly Ala Asn Asn Leu
85 90 95
Phe Phe Gly Thr Gly Thr Arg Leu Thr Val Ile Pro Tyr
100 105
<210> 5
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
Lys Gly His Asp Arg
1 5
<210> 6
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
Ser Phe Asp Val Lys Asp
1 5
<210> 7
<211> 14
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
Cys Ala Thr Ser Asp Ala Ser Arg Thr Asp Thr Gln Tyr Phe
1 5 10
<210> 8
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
Cys Ala Thr Ser Pro Gln Gly Thr Glu Gln Phe Phe
1 5 10
<210> 9
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 9
Cys Ala Thr Ala Ser Gly Arg Gly Gly Glu Leu Phe Phe
1 5 10
<210> 10
<211> 14
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 10
Cys Ala Ile Arg Leu Ala Gly Gly Tyr His Glu Gln Phe Phe
1 5 10
<210> 11
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 11
Asp Ala Asp Val Thr Gln Thr Pro Arg Asn Arg Ile Thr Lys Thr Gly
1 5 10 15
Lys Arg Ile Met Leu Glu Cys Ser Gln Thr Lys Gly His Asp Arg Met
20 25 30
Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Gly Leu Gly Leu Arg Leu Ile Tyr Tyr
35 40 45
Ser Phe Asp Val Lys Asp Ile Asn Lys Gly Glu Ile Ser Asp Gly Tyr
50 55 60
Ser Val Ser Arg Gln Ala Gln Ala Lys Phe Ser Leu Ser Leu Glu Ser
65 70 75 80
Ala Ile Pro Asn Gln Thr Ala Leu Tyr Phe Cys Ala Thr Ser Trp Tyr
85 90 95
Arg Gln Asp Pro Gly Leu Gly Leu Arg Leu Ile Tyr Tyr Ser Phe Asp
100 105 110
Val Lys Asp Ile Asn Lys Gly Glu Ile Ser Asp Gly Tyr Ser Val Ser
115 120 125
Arg Gln Ala Gln Ala Lys Phe Ser Leu Ser Leu Glu Ser Ala Ile Pro
130 135 140
Asn Gln Thr Ala Leu Tyr Phe Cys Ala Thr Ser Asp Ala Ser Arg Thr
145 150 155 160
Asp Thr Gln Tyr Phe Gly Ser Gly Thr Arg Leu Thr Val Val
165 170
<210> 12
<211> 172
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 12
Asp Ala Asp Val Thr Gln Thr Pro Arg Asn Arg Ile Thr Lys Thr Gly
1 5 10 15
Lys Arg Ile Met Leu Glu Cys Ser Gln Thr Lys Gly His Asp Arg Met
20 25 30
Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Gly Leu Gly Leu Arg Leu Ile Tyr Tyr
35 40 45
Ser Phe Asp Val Lys Asp Ile Asn Lys Gly Glu Ile Ser Asp Gly Tyr
50 55 60
Ser Val Ser Arg Gln Ala Gln Ala Lys Phe Ser Leu Ser Leu Glu Ser
65 70 75 80
Ala Ile Pro Asn Gln Thr Ala Leu Tyr Phe Cys Ala Thr Ser Trp Tyr
85 90 95
Arg Gln Asp Pro Gly Leu Gly Leu Arg Leu Ile Tyr Tyr Ser Phe Asp
100 105 110
Val Lys Asp Ile Asn Lys Gly Glu Ile Ser Asp Gly Tyr Ser Val Ser
115 120 125
Arg Gln Ala Gln Ala Lys Phe Ser Leu Ser Leu Glu Ser Ala Ile Pro
130 135 140
Asn Gln Thr Ala Leu Tyr Phe Cys Ala Thr Ser Pro Gln Gly Thr Glu
145 150 155 160
Gln Phe Phe Gly Ser Gly Thr Arg Leu Thr Val Val
165 170
<210> 13
<211> 173
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 13
Asp Ala Asp Val Thr Gln Thr Pro Arg Asn Arg Ile Thr Lys Thr Gly
1 5 10 15
Lys Arg Ile Met Leu Glu Cys Ser Gln Thr Lys Gly His Asp Arg Met
20 25 30
Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Gly Leu Gly Leu Arg Leu Ile Tyr Tyr
35 40 45
Ser Phe Asp Val Lys Asp Ile Asn Lys Gly Glu Ile Ser Asp Gly Tyr
50 55 60
Ser Val Ser Arg Gln Ala Gln Ala Lys Phe Ser Leu Ser Leu Glu Ser
65 70 75 80
Ala Ile Pro Asn Gln Thr Ala Leu Tyr Phe Cys Ala Thr Ser Trp Tyr
85 90 95
Arg Gln Asp Pro Gly Leu Gly Leu Arg Leu Ile Tyr Tyr Ser Phe Asp
100 105 110
Val Lys Asp Ile Asn Lys Gly Glu Ile Ser Asp Gly Tyr Ser Val Ser
115 120 125
Arg Gln Ala Gln Ala Lys Phe Ser Leu Ser Leu Glu Ser Ala Ile Pro
130 135 140
Asn Gln Thr Ala Leu Tyr Phe Cys Ala Thr Ala Ser Gly Arg Gly Gly
145 150 155 160
Glu Leu Phe Phe Gly Ser Gly Thr Arg Leu Thr Val Val
165 170
<210> 14
<211> 174
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 14
Asp Ala Asp Val Thr Gln Thr Pro Arg Asn Arg Ile Thr Lys Thr Gly
1 5 10 15
Lys Arg Ile Met Leu Glu Cys Ser Gln Thr Lys Gly His Asp Arg Met
20 25 30
Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Gly Leu Gly Leu Arg Leu Ile Tyr Tyr
35 40 45
Ser Phe Asp Val Lys Asp Ile Asn Lys Gly Glu Ile Ser Asp Gly Tyr
50 55 60
Ser Val Ser Arg Gln Ala Gln Ala Lys Phe Ser Leu Ser Leu Glu Ser
65 70 75 80
Ala Ile Pro Asn Gln Thr Ala Leu Tyr Phe Cys Ala Thr Ser Trp Tyr
85 90 95
Arg Gln Asp Pro Gly Leu Gly Leu Arg Leu Ile Tyr Tyr Ser Phe Asp
100 105 110
Val Lys Asp Ile Asn Lys Gly Glu Ile Ser Asp Gly Tyr Ser Val Ser
115 120 125
Arg Gln Ala Gln Ala Lys Phe Ser Leu Ser Leu Glu Ser Ala Ile Pro
130 135 140
Asn Gln Thr Ala Leu Tyr Phe Cys Ala Ile Arg Leu Ala Gly Gly Tyr
145 150 155 160
His Glu Gln Phe Phe Gly Ser Gly Thr Arg Leu Thr Val Val
165 170

Claims (10)

1.一种分离的T细胞受体,包括α链和β链中的至少一者,其特征在于,β链可变区的CDR3具有SEQ ID NO.7至10任一所示的序列。
2.根据权利要求1所述的T细胞受体,其特征在于,β链可变区的CDR1和CDR2分别具有如SEQ ID NO.5和6所示的序列;优选的,β链可变区具有SEQ ID NO.11至14任一所示的序列。
3.根据权利要求1所述的T细胞受体,其特征在于,α链可变区的CDR3具有SEQ ID NO.3所示的序列;优选的,α链可变区的CDR1和CDR2具有SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的序列。
4.一种分离的、编码T细胞受体的核酸,其特征在于,所述核酸编码权利要求1至3任一项所述的T细胞受体,或α或β链,或可变结构域,或具有结合抗原能力的片段。
5.一种重组表达载体,其特征在于,含有与启动子有效连接的、根据权利要求4中所述的核酸,和/或其互补序列。
6.一种T细胞受体修饰的细胞,其特征在于,该细胞的表面被权利要求1至3任一项中所述的T细胞受体修饰;优选的,所述细胞包括原始T细胞或其前体细胞,NKT细胞,或T细胞株。
7.一种制备权利要求6所述的T细胞受体修饰的细胞的方法,包括以下步骤:
1)提供细胞;
2)提供权利要求4所述的核酸;
3)将所述核酸转染入所述细胞中。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述的细胞来自自体或异体;优选的,所述转染的方式包括:采用病毒载体转染的方式,优选的,所述病毒载体包括γ逆转录病毒载体或慢病毒载体;化学方式,优选的,所述化学方式包括采用脂质体转染的方式;物理方式,优选的,所述物理方式包括电转染方式。
9.一种药物组合物,其特征在于,该药物组合物包括作为活性成分的根据权利要求6所述的T细胞受体修饰的细胞,及药学上可接受的载体。
10.权利要求6所述的T细胞受体修饰的细胞或权利要求9所述的药物组合物在制备用于治疗或预防肿瘤和/或癌症、或用于检测宿主的肿瘤和/或癌症的产品中的用途。
CN202010555880.4A 2020-06-17 2020-06-17 分离的t细胞受体和应用 Active CN111574616B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202010555880.4A CN111574616B (zh) 2020-06-17 2020-06-17 分离的t细胞受体和应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202010555880.4A CN111574616B (zh) 2020-06-17 2020-06-17 分离的t细胞受体和应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN111574616A true CN111574616A (zh) 2020-08-25
CN111574616B CN111574616B (zh) 2021-02-02

Family

ID=72122324

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202010555880.4A Active CN111574616B (zh) 2020-06-17 2020-06-17 分离的t细胞受体和应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN111574616B (zh)

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2017048593A1 (en) * 2015-09-15 2017-03-23 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services T cell receptors recognizing hla-cw8 restricted mutated kras
CN107106670A (zh) * 2014-10-31 2017-08-29 宾夕法尼亚大学董事会 用于修饰的t细胞的方法和组合物
CN110036027A (zh) * 2016-12-08 2019-07-19 伊玛提克斯生物技术有限公司 新型t细胞受体及其免疫治疗应用
CN111718409A (zh) * 2020-06-17 2020-09-29 深圳豪石生物科技有限公司 一种t细胞受体及其应用

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107106670A (zh) * 2014-10-31 2017-08-29 宾夕法尼亚大学董事会 用于修饰的t细胞的方法和组合物
WO2017048593A1 (en) * 2015-09-15 2017-03-23 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services T cell receptors recognizing hla-cw8 restricted mutated kras
CN110036027A (zh) * 2016-12-08 2019-07-19 伊玛提克斯生物技术有限公司 新型t细胞受体及其免疫治疗应用
CN111718409A (zh) * 2020-06-17 2020-09-29 深圳豪石生物科技有限公司 一种t细胞受体及其应用

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
赵芮等: "嵌合抗原受体修饰的T细胞治疗急性髓系白血病的临床试验进展", 《实用医学杂志》 *
陈昭等: "肿瘤抗原特异性TCR基因筛选", 《中国免疫学杂志》 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN111574616B (zh) 2021-02-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ES3042082T3 (en) Methods of making chimeric antigen receptor-expressing cells
CN104910278B (zh) 一种用于制备cart细胞的具有高效转染能力和生物学活性的慢病毒
CN111344394A (zh) 分离对p53癌症-特异性突变具有抗原特异性的t细胞的方法
CN113677353A (zh) 修饰细胞的扩增及其用途
CN111647071B (zh) 识别靶细胞表面抗原的t细胞受体及其组合物
CN113248616A (zh) 靶向gpc3的嵌合抗原受体及其用途
CN113195526B (zh) 针对过继性t细胞疗法中的突变myd88l265p蛋白表位的特异性t细胞受体
KR20220157435A (ko) 면역요법을 위해 단일 세포 분석에 의해 종양으로부터 t 세포 및 t 세포 수용체를 단리하는 방법
JP2024133625A (ja) 癌の個別化療法に関する物品および方法
CN108251442A (zh) Flt3嵌合抗原受体及其应用
CN111718409B (zh) 一种t细胞受体及其应用
CN104892770B (zh) 一种对t细胞和造血干细胞具有高效感染和促增殖能力的慢病毒载体
CN114502723B (zh) 一种经修饰的免疫细胞及其用途
WO2023184616A1 (zh) 一种克隆tcr序列的检测方法及其应用
CN111574616B (zh) 分离的t细胞受体和应用
CN114907485A (zh) 一种以内源性蛋白质分子替代单结构域抗体的嵌合抗原受体
CN113789304B (zh) 高亲和力tcr及其应用
CN113817044B (zh) T细胞受体、相关工程化细胞及其应用
CN111647070A (zh) T细胞受体或其抗原结合片段及应用
CN113999320A (zh) 以cd28和4-1bb为共刺激结构域的靶向cd276的嵌合抗原受体及其应用
CN113773378B (zh) T细胞受体及其应用
US12111319B2 (en) Articles and methods directed to personalized therapy of cancer
CN113912701A (zh) Tcr及其在诊断/治疗中的应用
CN111378623A (zh) 一种靶向性抗肿瘤t细胞及其制备方法和应用
CN111647069A (zh) 一种改进的tcr及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant