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CN111560467B - miR-21和miR-92a作为检测并区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的标志物的应用 - Google Patents

miR-21和miR-92a作为检测并区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的标志物的应用 Download PDF

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CN111560467B
CN111560467B CN202010184874.2A CN202010184874A CN111560467B CN 111560467 B CN111560467 B CN 111560467B CN 202010184874 A CN202010184874 A CN 202010184874A CN 111560467 B CN111560467 B CN 111560467B
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Abstract

本发明首次公开了miR‑21和miR‑92a作为检测并区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的标志物的应用。通过联合检测血清sEV中的miR‑21和miR‑92a,可高效地诊断CHB和HBV相关HCC,也可在HBV感染人群中区分CHB与HCC。而且诊断功效高,AUC达0.88,且上样量低,只需要200μL血清。诊断CHB与诊断HBV相关HCC的功效较高,可与健康人区分开,AUC达0.97以上。上样量低,也只需要200μL血清。

Description

miR-21和miR-92a作为检测并区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的标志物的应用
技术领域
本发明属于生物技术领域,更具体地,涉及miR-21和miR-92a作为检测并区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的标志物的应用。
背景技术
外泌体是一种细胞分泌的细胞外囊泡(extracellular vesicle,EV),大小约为30-150nm,内含功能性的核酸和蛋白质,是细胞间通讯中的重要一环。肿瘤细胞可通过外泌体特异性地分泌癌症相关的生物分子,从而促进癌症的发生发展。而且,外泌体可分泌到外周血中,具有溯源性,通过抽血的手段即可检测来源于肿瘤的外泌体。因此,外泌体是重要的疾病生物标志物来源。
在外泌体相关研究中,因为尚无外泌体特异性生物标志物,且难以追踪分离出来的外泌体是否起源于内含体(endosome),因此越来越多的研究更倾向于用“小细胞外囊泡”(small extracellular vesicle,sEV)这个词来替代“外泌体”。这种sEV是指小于200nm的EV。
微小RNA(microRNA,miRNA)是一种小片段单链RNA,参与调控生物进程。在多种癌症中,肿瘤细胞的miRNA谱都发生改变。已有大量文献表明血清或血浆中的miRNA可作为肿瘤的潜在生物标志物。在外周血中,miRNA主要以3种形式存在:游离的miRNA,与蛋白质结合的miRNA,以及存在于EV中的miRNA。但是,游离的miRNA容易被体内的RNA酶降解,与蛋白质结合的miRNA难以分离检测,只有存在于EV中的miRNA是最稳定、最容易被检测的。因此,直接检测血清或血浆中的miRNA,受到的干扰相对较大,可能存在某些微量的miRNA难以被检出,或同一种miRNA的量在不同人中差异较大的情况。事实上,同一种血清或血浆miRNA的量,在不同文献中报道的变化趋势可能是相反的。例如,有文献表明血清中miR-92a在肝癌中是显著上调的,有文献却表明该miRNA是显著下调的。因此,检测血清/血浆sEV中的miRNA,比起直接检测血清/血浆中的miRNA,更准确、更可靠,使得在血清/血浆sEV中寻找miRNA生物标志物具有更重要的意义。
此外,血清/血浆sEV中某种miRNA的量是难以预测的,需要用大量的临床样品验证。在血清/血浆sEV miRNA的研究中,不同文献中可能出现相互冲突的结论。例如,血清/血浆sEV中的miR-21和miR-92a是被广泛报道的结直肠癌生物标志物,但我们的用了大量的临床样品证明血清sEV中miR-21和miR-92a的诊断功效均较低(详见实施例2)。因此,从少数文献或样品中得出的结论,并不能轻易地推广到所有临床样品中。
慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)是由乙型肝炎病毒(hepatitis Bvirus,HBV)持续感染引起的肝脏慢性炎症性疾病。HBV感染人群十分庞大,全球约20亿人曾感染HBV,其中有2.4亿人为慢性HBV感染者。与其它肝病相比,CHB和HBV相关HCC是占比最大、对健康影响最大、最受关注的疾病。如何监控CHB并从中及早筛查发现HCC,尽量避免CHB恶化成HCC,成为领域内重大问题。
目前对HBV感染或CHB的血清学检测,主要以“乙肝两对半”为主,即检测HBV相关的抗原抗体。对HCC的血清学检测,主要以甲胎蛋白(alpha-fetoprotein,AFP)为主。这种基于免疫法的检测,难以检测极微量的蛋白质,也难以检测极早期的病变,使得诊断和治疗滞后,错过最佳时期。寻找更加灵敏、高效的血清生物标志物,显得十分重要。
血清EV中的miRNA有重大的HBV相关HCC诊断前景,已有不少文献表明血清EV中的miRNA具有潜在的诊断功效。但这些文献普遍存在着一些问题,如样本量不足、设计实验组和对照组时没有考虑HBV感染情况、诊断功效不明确(无ROC曲线)以及AUC偏低等。
发明内容
本发明第一个方面的目的,在于针对乙型肝炎中尚无早期预警其转化为肝癌的高效的指标,提供一种在临床上容易实现的检测指标(血清EV miR-21和miR-92a),在HBV感染的人群中筛查出将会恶化成肝癌的患者。
本发明第二个方面的目的,在于提供miR-21的引物、探针和miR-92a的引物、探针在制备检测并区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的试剂中的应用。
本发明第三个方面的目的,在于提供
本发明所采取的技术方案是:
本发明的第一个方面,在于提供miR-21和miR-92a作为检测并区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的标志物的应用。
本发明的第二个方面,提供miR-21的引物、探针和miR-92a的引物、探针在制备检测并区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的试剂中的应用。
本发明的第三个方面,miR-21的引物、探针和miR-92a的引物、探针在制备检测并区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的试剂盒中的应用。
根据本发明第一至第三任一个方面所述的应用,miR-21和miR-92a为血清中的miR-21和miR-92a。
根据本发明第一至第三任一个方面所述的应用,miR-21和miR-92a为血清中小细胞外囊泡中的miR-21和miR-92a。
根据本发明第二或第三个方面所述的应用,所述miR-21的引物、探针的序列为:
反转录引物miR-21-RT:
GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACTCAACA(SEQ ID NO:1),
上游引物miR-21-F:GCCCGCTAGCTTATCAGACTGATG(SEQ ID NO:2),
下游引物miR-21-R:GTGCAGGGTCCGAGGT(SEQ ID NO:3),
探针miR-21-P:CTGGATACGACTCAACA(SEQ ID NO:4)。
根据本发明第二或第三个方面所述的应用,所述miR-92a的引物、探针序列为:
反转录引物miR-92a-RT:
GTCGTATCCAGTGCTGGGTCCGAGTGATTCGCGCTGGATACGACACAGGCCG(SEQ ID NO:5),
上游引物miR-92a-F:CCCTGTATTGCACTTGTCC(SEQ ID NO:6),
下游引物miR-92a-R:CAGTGCTGGGTCCGAGTGA(SEQ ID NO:7),
探针miR-92a-P:CGGCCTGTGTCGTATCCA(SEQ ID NO:8)。
本发明的第四个方面,提供一种非疾病诊断目的的检测并区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的方法,包括以下步骤:
S1.提取血清样本中的小细胞外囊泡中;
S2.提取步骤S1中小细胞外囊泡中的miRNA;
S3.将步骤S2 miRNA中的miR-21和miR-92a逆转录为cDNA;
S4.采用权利要求5和6中引物、探针对S3中cDNA进行对miR-21和miR-92a的qPCR检测,根据检测结果,区分HBV相关肝癌与乙型肝炎。
根据本发明第四个方面所述的方法,步骤S4所述区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的方法为:
当样本中miR-21的定量结果和miR-92a的定量结果与健康人的定量结果都没有显著差异,则说明样本的来源不患HBV相关肝癌与乙型肝炎;
当样本中miR-21的定量结果和miR-92a的定量结果与健康人的定量结果都有显著差异,且样本中miR-21的定量结果与乙型肝炎组的定量结果之间具有显著差异,则说明样本的来源患有HBV相关肝癌;
当样本中miR-21的定量结果和miR-92a的定量结果与健康人的定量结果都有显著差异,且样本中miR-21的定量结果与HBV相关肝癌组的定量结果之间没有显著差异,则说明样本的来源患有乙型肝炎。
根据本发明第四个方面所述的方法,步骤S4所述区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的方法为:
将样本的miR-21定量值经log10转换后,分别代入公式1、公式2和公式3中的x1处,将样本的miR-92a定量值经log10转换后,分别代入公式1、公式2和公式3中的x2处;
当公式1中的p1<0.1,且公式2中的p2<0.12,则说明样本的来源不患HBV相关肝癌与乙型肝炎;
当公式1中的p1>0.1,且公式3中的p3>0.31,则说明样本的来源患有HBV相关肝癌;
当公式2中的p2>0.12,且公式3中的p3<0.31,则说明样本的来源患有乙型肝炎;
公式1:
公式2:
公式3:
本发明的有益效果:
本发明首次发现联合血清sEV中的miR-21和miR-92a,可高效地诊断CHB和HBV相关HCC,也可在HBV感染人群中区分CHB与HCC。该发现诊断功效较高,具有在CHB人群中预警HCC的潜力,在HBV感染的人群中筛查出将会恶化成肝癌的患者。可在HBV感染人群中区分CHB与HCC,具有在CHB人群中预警患HCC的潜力。而且诊断功效高,AUC达0.88。诊断CHB与诊断HBV相关HCC的功效较高,可与健康人区分开,AUC达0.97以上。上样量低,只需要200μL血清。
附图说明
图1肝癌、肝炎与健康组的miRNA定量值差异分析。注:定量值经log10转换后进行分析,其中,HBV相关肝癌组(HCC)n=47,慢乙肝组(CHB)n=77,健康组(Normal)n=569。图A、F:定量值分布情况。*代表与任一其它组比较,P<0.05,多组间差异分析采用Kruskal-Wallis test,进一步采用Dunn's test进行多重比较。图B、G:定量值的bootstrap分析。以bias-corrected and accelerated(BCa)bootstrap法进行10000次重取样并确定均值的95%置信区间。*表示定量值的均值,线段表示重取样后均值的95%置信区间。图C~E、H~J:定量值的ROC曲线分析。红圈表示该指标约登指数(Youden's index)最大时选取的阈值,该阈值及其相应的灵敏度和特异性已标出。图K~M:联合miR-21和miR-92a定量值的ROC曲线分析。
图2结直肠癌组、腺瘤组与健康组的miRNA定量值差异分析。注:定量值经log10转换后进行分析,结直肠癌组(CRC)n=288,腺瘤组(Adenoma)n=135,健康组(Normal)n=569。图A、E:定量值分布情况。*代表与任一其它组比较,P<0.05,多组间差异分析采用Kruskal-Wallis test,进一步采用Dunn's test进行多重比较。图B~D、F~H:定量值的ROC曲线分析。红圈表示该指标约登指数(Youden's index)最大时选取的阈值,该阈值及其相应的灵敏度和特异性已标出。
图3鼻咽癌、肺癌、乳腺癌、膀胱癌与健康组的miRNA定量值差异分析。注:定量值经log10转换后进行分析,其中,鼻咽癌组(NPC)n=38,肺癌组(lung cancer)n=28,乳腺癌组(breast cancer)n=22,膀胱组(bladder cancer)n=31,健康组(Normal)n=569。图A、G:定量值分布情况。*P<0.05,多组间差异分析采用Kruskal-Wallis test,进一步采用Dunn'stest进行多重比较。图B、H:定量值的bootstrap分析。以bias-corrected and accelerated(BCa)bootstrap法进行10000次重取样并确定均值的95%置信区间。*表示定量值的均值,线段表示重取样后均值的95%置信区间。图C~F、I~L:定量值的ROC曲线分析。
图4miR-92a引物序列的优化。图A:G1~G3引物组的扩增曲线(SYBR法)。图B~D:G1~G3引物组的溶解曲线(SYBR法)。图E:G2引物组与miR-92a引物组的扩增曲线(探针法)。Positive表示阳性样品,negative表示阴性样品,NTC表示空白对照。
具体实施方式
以下通过具体的实施例对本发明的内容作进一步详细的说明。实施例中所用的原料如无特殊说明,均可从常规商业途径得到。
实施例1血清sEV中miR-21和miR-92a的区分功能
首先提取血清中的sEV,然后提取其miRNA,再逆转录为DNA,然后用qPCR方法对miR-21和miR-92a进行绝对定量,最后对定量值进行分析。
1)sEV提取:用外泌体分离试剂盒(广州海力特生物科技有限公司)提取sEV。操作步骤按照说明书进行。具体地,取200μL血清,加入100μL提取液A和5μL提取液B,混匀,常温孵育10min。将混合液转移至Exo柱上层滤腔,以3000×g离心10min,弃掉上次滤腔。收集中间层滤腔截留物,即为sEV。
2)miRNA提取:按照miRcute血清/血浆miRNA提取分离试剂盒(天根生化科技(北京)有限公司)说明书进行提取。具体地,将提取后的sEV转移至EP管中,加入900μL裂解液MZA,振荡混匀30s。室温放置5min,加入200μL氯仿,剧烈振荡15s,室温放置5min。以13400g,4℃离心15min,将上层透明水相转移至新EP管中。根据转移液的体积,缓慢加入转移液2倍体积的无水乙醇,混匀,转入吸附柱miRelute,室温放置2min。以13400g离心30s,弃掉流出液,保留吸附柱miRelute。向吸附柱miRelute中加入700μL去蛋白液MRD,室温静置2min。以13400g离心30s,弃掉流出液。向吸附柱miRelute中加入500μL漂洗液RW,室温静置2min。以13400g离心30s,弃掉流出液。再次加入500μL漂洗液RW,室温静置2min,离心(13400g,30s),弃掉流出液。在室温条件下以13400g离心2min,弃收集管。将吸附柱miRelute转入一个新的EP管中,向吸附膜中心位置加30μL RNase-Free ddH2O,室温放置2min。在室温条件下以13400g离心2min。收集滤出液,即为miRNA。
3)逆转录和qPCR:用微小核糖核酸(microRNA-21)定量检测试剂盒(PCR-荧光探针法)及微小核糖核酸(microRNA-92a)定量检测试剂盒(PCR-荧光探针法)(广州海力特生物科技有限公司)对上述miRNA进行逆转录和qPCR定量。该方法通过用特异性逆转录引物,逆转录靶标miRNA,再用基于TaqMan MGB探针技术的绝对定量方法,对靶标miRNA进行qPCR定量。操作步骤按说明书进行。
microRNA-21和microRNA-92a的引物、探针序列如下所示:
反转录引物miR-21-RT:
GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACTCAACA(SEQ ID NO:1),
上游引物miR-21-F:GCCCGCTAGCTTATCAGACTGATG(SEQ ID NO:2),
下游引物miR-21-R:GTGCAGGGTCCGAGGT(SEQ ID NO:3),
探针miR-21-P:(6-FAM)CTGGATACGACTCAACA(MGB)(SEQ ID NO:4)。
反转录引物miR-92a-RT:
GTCGTATCCAGTGCTGGGTCCGAGTGATTCGCGCTGGATACGACACAGGCCG(SEQ ID NO:5),
上游引物miR-92a-F:CCCTGTATTGCACTTGTCC(SEQ ID NO:6),
下游引物miR-92a-R:CAGTGCTGGGTCCGAGTGA(SEQ ID NO:7),
探针miR-92a-P:VIC/FAM-CGGCCTGTGTCGTATCCA-MGB(SEQ ID NO:8)。
为了更加精确地定量检测microRNA-21和microRNA-92a的含量,发明人的研究团队共设计了4组microRNA-92a引物组合,并从中筛选出检测效果最好的一组microRNA-92a引物及探针(上述序列)。我们首先用SYBR法评价G1~G3这3组引物组的扩增效果。具体表现为,在G1-G3这3组引物组比较中,G2组引物组在阳性样品中扩增信号较强,在阴性样品中扩增信号最弱,Ct值最大,且阳性样品和阴性样品的Ct值差最大(图4A);与G1、G3组引物组(图4B、D)相比,G2引物组(图4C)的溶解曲线峰较为集中,阴性样品的信号较低。然后,我们用探针法比较上文引物组(简称为:miR-92a)与G2引物组的扩增效果。具体表现为,miR-92a引物组比G2引物组扩增信号更强,Ct值更小,效果更好。因此,上述microRNA-92a引物探针组简称效果最好。其余候选引物组(G1-G3)序列如下:
反转录引物G1-RT:
GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGACACAGGCCG(SEQ ID NO:9),
上游引物G1-F:CGGGGTATTGCACTTGTCC(SEQ ID NO:10),
下游引物G1-R:GTATCCAGTGCGTGTCGTG(SEQ ID NO:11);
反转录引物G2-RT:
GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACACAGGCCG(SEQ ID NO:12),
上游引物G2-F:CCCCGTATTGCACTTGTCC(SEQ ID NO:13),
下游引物G2-R:GTGCAGGGTCCGAGGTATT(SEQ ID NO:14);
反转录引物G3-RT:
CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGACAGGCCG(SEQ ID NO:15),
上游引物G3-F:GCCCCTATTGCACTTGTCC(SEQ ID NO:16),
下游引物G3-R:CTCAACTGGTGTCGTGGAGT(SEQ ID NO:17)。
根据试剂盒说明书,对microRNA-21和microRNA-92a进行qPCR定量的操作具体为,按比例(逆转录反应液13μL/测试+miR-21或miR-92a RT引物1μL/测试+逆转录酶系1μL/测试)取相应体积组分,充分混匀后按15μL/孔分装至PCR反应板上。向反应板中加入5μL/孔的核酸样本(待测核酸样本、miR-21或miR-92a定量参考品),混匀,盖好反应板薄膜,1000rpm离心1min。立即按以下参数进行逆转录反应:25℃×5min;42℃×60min;70℃×15min;4℃∞。即获得cDNA。
然后,按比例(miR-21或miR-92a反应液29.4μL/测试+PCR酶0.6μL/测试)取相应体积组分,充分混匀后按30μL/孔分装至PCR反应板上。向反应板中加入20μL/孔的逆转录后的cDNA,混匀,盖好反应板薄膜,1000rpm离心1min。立即按以下参数进行qPCR:95℃×10min;95℃×15s,65℃×1min(FAM通道荧光采集),循环40次。即获取目标样品的miR-21和miR-92a定量数据。
对47例HBV相关HCC样本、77例CHB样本与569例健康人样本(Normal)进行比较,分别确定本发明对CHB和HBV相关HCC的诊断功效,以及区分两者的诊断功效。我们用了大规模的健康对照样本,尽可能地反映人群中的实际情况,增加统计功效和结果的可信度。由于健康人样本数是HCC或CHB样本数的8倍以上,除了普通的差异分析,我们还增加了bootstrap分析,提高统计功效,直观地反映差异情况。具体地,以bias-corrected and accelerated(BCa)bootstrap法进行10000次重取样并确定均值的95%置信区间。若两组95%置信区间有重叠,则差异不明显,若不重叠,则差异明显。我们用接受者操作特性(receiveroperating characteristic,ROC)曲线最终确定指标的诊断功效,用AUC表示,AUC越接近1,则诊断功效越高。结果如附图1所示。
从附图1中结果可以看出,我们发现CHB组的miR-21都分别显著高于其它组,HCC组显著高于Normal组(图1A,P<0.05)。我们通过bootstrap分析发现,CHB组分别与其它组的miR-21定量值均值的95%置信区间不重叠,但HCC组与Normal组有部分重叠(图1B)。
ROC曲线表明,区分HCC组与Normal组的miR-21的AUC为0.68(图1C),区分CHB组与Normal组的miR-21的AUC为0.89(图1D),区分HCC组与CHB组的miR-21的AUC为0.73(图1E)。上述结果表明,血清sEV中miR-21定量值可区分CHB与健康人,但区分HBV相关HCC与CHB或区分CHB与健康人的诊断功效则较低。
HCC组与CHB组的血清sEV miR-92a定量值分别显著高于Normal组(图1F,P<0.05),HCC组与CHB组的值无显著差异(图1F)。经bootstrap法分析后发现,HCC组与CHB组的95%置信区间分别与Normal组不重叠,HCC组和CHB组的95%置信区间有部分重叠(图1G),结果与上述检验结果一致。ROC曲线表明,区分HCC组与Normal组的miR-92a的AUC为0.96(图1H),区分CHB组与Normal组的miR-92a的AUC为0.97(图1I),HCC组与CHB组的miR-92a的AUC为0.66(图1J)。上述结果表明,血清sEV中的miR-92a可区分HBV相关HCC患者与健康人,可区分CHB患者与健康人,区分HBV相关HCC与CHB患者的诊断功效则较低。
用logistic regression方法联合miR-21和miR-92a两个指标时,ROC曲线表明,区分HCC组与Normal组的AUC为0.98(图1K),区分CHB组与Normal组的AUC为0.97(图1L),区分HCC组与CHB组的AUC为0.88(图1M)。上述结果表明,联合血清sEV中的miR-21和miR-92a两个指标,可提高区分HBV相关HCC患者与CHB患者的诊断功效,且诊断功效较高,具区分HBV相关HCC患者与健康人的诊断功效,具区分CHB患者与健康人的诊断功效。
经logistic regression方法联合miR-21和miR-92a两个指标后,在比较CHB组与Normal组时,可获得公式1;在比较CHB组与Normal组时,可获得公式2;在比较HCC组与CHB组时,可获得公式3。将样本的miR-21定量值经log10转换后,分别代入公式1、公式2和公式3中的x1处,将样本的miR-92a定量值经log10转换后,分别代入公式1、公式2和公式3中的x2处。我们将各公式计算出的p值分别进行ROC曲线分析,并选择约登指数(Youden's index=sensitivity+specificity)最大时的p值作为cut-off值。各公式的cut-off值分别为:p1=0.1,p2=0.12,p3=0.31。所以,将待测样本的miR-21定量值和miR-92a定量值经log10转换后,分别代入3个公式中的x1处和x2处;当公式1中的p1<0.1,且公式2中的p2<0.12,则说明样本的来源不患HBV相关肝癌与乙型肝炎;当公式1中的p1>0.1,且公式3中的p3>0.31,则说明样本的来源患有HBV相关肝癌;当公式2中的p2>0.12,且公式3中的p3<0.31,则说明样本的来源患有乙型肝炎。
公式1:
公式2:
公式3:
对比实施例1血清sEV中miR-21和miR-92a不具有直肠癌诊断功效
对288例结直肠癌(CRC)样本、135例腺瘤(Adenoma)样本与569例健康人样本(Normal)进行比较,分别确定本发明对CRC和腺瘤的诊断功效,以及区分两者的诊断功效。分析方法与实施例1类似。分析结果见附图2。
从实验结果中发现,结直肠癌组和腺瘤组的miR-21(图2A,P<0.05)都分别显著低于健康组,结直肠癌组和腺瘤组两组间无显著差异。ROC曲线表明,miR-21定量值区分结直肠癌组与健康组的曲线下面积(AUC)为0.68(图2B),区分腺瘤组与健康组的AUC为0.63(图2C),区分结直肠癌组与腺瘤组的AUC为0.53(图2D)。在结直肠癌组、腺瘤和健康组中,任意2组间的miR-92a定量值比较,均无显著差异(图2E)。ROC曲线表明,miR-92a定量值区分结直肠癌组与健康组的AUC为0.51(图2F),区分结腺瘤组与健康组的AUC为0.54(图2G),区分结直肠癌组与腺瘤组的AUC为0.54(图2H)。上述结果表明,在血清sEV中,无论是miR-21还是miR-92a,区分结直肠癌患者、腺瘤患者与健康人三者间的诊断功效均较低,与文献报道的不一致。
对比实施例2血清sEV中miR-21和miR-92a不具有的诊断功效
发明人的研究团队,使用实施例1中类似的分析方法对38例鼻咽癌样本(NPC)、28例肺癌样本(lung cancer)、22例乳腺癌样本(breast cancer)、31例膀胱癌样本(bladdercancer)与569例健康人样本(Normal)进行比较,分别确定本发明对上述4种癌症的诊断功效。结果如附图3所示。
从实验结果中发现,肺癌组分别和鼻咽癌组与健康组的miR-21定量值间有显著差异(图3A,P<0.05),其它各组间都分别无显著差异(图3A)。我们用bootstrap方法分析发现,肺癌组分别和鼻咽癌组与健康组的miR-21定量值均值的95%置信区间不重叠,其它各组均有部分重叠(图3B)。ROC曲线表明,区分鼻咽癌组与健康组的AUC为0.56(图3C),区分肺炎组与健康组的AUC为0.68(图3D),区分乳腺癌组与健康组的AUC为0.52(图3E),区分膀胱癌组与健康组的AUC为0.54(图3F)。上述结果表明,血清sEV中的miR-21区分上述4种癌症患者与健康人的诊断功效均较低。
鼻咽癌组分别和肺癌组与健康组的miR-92a定量值间有显著差异,其它各组间均无显著差异(图3G)。经bootstrap法分析后发现,鼻咽癌组与肺癌组的95%置信区间无重叠,其它各组间的95%置信区间均有部分重叠(图3H)。ROC曲线表明,区分鼻咽癌组与健康组的AUC为0.64(图3I),区分肺炎组与健康组的AUC为0.60(图3J),区分乳腺癌组与健康组的AUC为0.54(图3K),区分膀胱癌组与健康组的AUC为0.57(图3L)。上述结果表明,血清sEV中的miR-92a区分健康人与鼻咽癌、肺癌、乳腺癌或膀胱癌患者的诊断功效均较低。
综上,实施例1表明血清sEV中miR-21和miR-92a对CHB和HBV相关HCC的诊断功效较高,且具在HBV感染人群中区分CHB与HCC的诊断功效,且诊断功效较高。对比实施例1结果表明血清EV中miRNA的量与文献报道的不一致,文献的结果不能一概而论地拓展到所有临床样本中。对比实施例1和对比实施例2的结果共同表明了本发明具有一定的疾病特异性,血清EV中的miR-21与miR-92a在其它5种癌症中不具诊断功效。
以上所述实施例仅表达了本发明的几种实施方式,其描述较为具体和详细,但并不能因此而理解为对本发明专利范围的限制。应当指出的是,对于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明构思的前提下,还可以做出若干变形和改进,这些都属于本发明的保护范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 暨南大学
广州海力特生物科技有限公司
<120> miR-21和miR-92a作为检测并区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的标志物的应用
<130>
<160> 17
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
gtcgtatcca gtgcagggtc cgaggtattc gcactggata cgactcaaca 50
<210> 2
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
gcccgctagc ttatcagact gatg 24
<210> 3
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
gtgcagggtc cgaggt 16
<210> 4
<211> 17
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
ctggatacga ctcaaca 17
<210> 5
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 5
gtcgtatcca gtgctgggtc cgagtgattc gcgctggata cgacacaggc cg 52
<210> 6
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 6
ccctgtattg cacttgtcc 19
<210> 7
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
cagtgctggg tccgagtga 19
<210> 8
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
cggcctgtgt cgtatcca 18
<210> 9
<211> 56
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
gtcgtatcca gtgcgtgtcg tggagtcggc aattgcactg gatacgacac aggccg 56
<210> 10
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 10
cggggtattg cacttgtcc 19
<210> 11
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 11
gtatccagtg cgtgtcgtg 19
<210> 12
<211> 52
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 12
gtcgtatcca gtgcagggtc cgaggtattc gcactggata cgacacaggc cg 52
<210> 13
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 13
ccccgtattg cacttgtcc 19
<210> 14
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 14
gtgcagggtc cgaggtatt 19
<210> 15
<211> 44
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 15
ctcaactggt gtcgtggagt cggcaattca gttgagacag gccg 44
<210> 16
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 16
gcccctattg cacttgtcc 19
<210> 17
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 17
ctcaactggt gtcgtggagt 20

Claims (6)

1.检测miR-21和miR-92a的表达水平的物质在制备检测并区分HBV相关肝癌与乙型肝炎的产品中的应用,所述miR-21和miR-92a为血清中小细胞外囊泡中的miR-21和miR-92a。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述产品为试剂。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述产品为试剂盒。
4.根据权利要求1~3任一项所述的应用,其特征在于:
所述物质为miR-21的引物、探针和miR-92a的引物、探针。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述miR-21的引物、探针的序列为:
反转录引物miR-21-RT:
GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACTCAACA(SEQ ID NO:1),
上游引物miR-21-F:GCCCGCTAGCTTATCAGACTGATG(SEQ ID NO:2),
下游引物miR-21-R:GTGCAGGGTCCGAGGT(SEQ ID NO:3),
探针miR-21-P:CTGGATACGACTCAACA(SEQ ID NO:4)。
6.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述miR-92a的引物、探针序列为:
反转录引物miR-92a-RT:
GTCGTATCCAGTGCTGGGTCCGAGTGATTCGCGCTGGATACGACACAGGCCG(SEQ ID NO:5),
上游引物miR-92a-F:CCCTGTATTGCACTTGTCC(SEQ ID NO:6),
下游引物miR-92a-R:CAGTGCTGGGTCCGAGTGA(SEQ ID NO:7),
探针miR-92a-P: CGGCCTGTGTCGTATCCA(SEQ ID NO:8)。
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