CN111220429A - 一种阵列高通量蛋白质样品预处理装置 - Google Patents
一种阵列高通量蛋白质样品预处理装置 Download PDFInfo
- Publication number
- CN111220429A CN111220429A CN201811406709.6A CN201811406709A CN111220429A CN 111220429 A CN111220429 A CN 111220429A CN 201811406709 A CN201811406709 A CN 201811406709A CN 111220429 A CN111220429 A CN 111220429A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- temperature
- denaturation
- sample
- heating
- pump
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims description 29
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims description 29
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 claims description 30
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 claims description 30
- 230000009467 reduction Effects 0.000 claims description 29
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 claims description 23
- 239000002904 solvent Substances 0.000 claims description 20
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 17
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 17
- 239000007788 liquid Substances 0.000 claims description 11
- 238000001802 infusion Methods 0.000 claims description 9
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims description 7
- 108010026552 Proteome Proteins 0.000 claims description 6
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 5
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims description 4
- 230000005611 electricity Effects 0.000 claims description 2
- 238000005485 electric heating Methods 0.000 claims 4
- 239000012510 hollow fiber Substances 0.000 claims 4
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims 4
- 239000012295 chemical reaction liquid Substances 0.000 claims 1
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 claims 1
- 238000006722 reduction reaction Methods 0.000 description 16
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 6
- ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N Ammonium bicarbonate Chemical compound [NH4+].OC([O-])=O ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 229910000013 Ammonium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 5
- 235000012538 ammonium bicarbonate Nutrition 0.000 description 5
- 239000001099 ammonium carbonate Substances 0.000 description 5
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 238000010612 desalination reaction Methods 0.000 description 2
- 238000011033 desalting Methods 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 2
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 2
- 229960000789 guanidine hydrochloride Drugs 0.000 description 2
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 2
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 230000029936 alkylation Effects 0.000 description 1
- 238000005804 alkylation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 239000003978 infusion fluid Substances 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 238000007781 pre-processing Methods 0.000 description 1
- 238000002203 pretreatment Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N1/00—Sampling; Preparing specimens for investigation
- G01N1/28—Preparing specimens for investigation including physical details of (bio-)chemical methods covered elsewhere, e.g. G01N33/50, C12Q
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N1/00—Sampling; Preparing specimens for investigation
- G01N1/28—Preparing specimens for investigation including physical details of (bio-)chemical methods covered elsewhere, e.g. G01N33/50, C12Q
- G01N1/44—Sample treatment involving radiation, e.g. heat
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N27/00—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means
- G01N27/62—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means by investigating the ionisation of gases, e.g. aerosols; by investigating electric discharges, e.g. emission of cathode
- G01N27/622—Ion mobility spectrometry
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Electrochemistry (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
Abstract
本发明涉及一种阵列高通量蛋白质样品预处理装置,是一种可对多个蛋白质样品同时进行在线变性和还原、除盐以及酶解的样品处理系统,包括:蛋白质处理模块,电源模块,加热控制模块,泵及泵控制模块。本发明的特点是在单路蛋白质预处理仪的基础上,增加到八路同时处理,把单路装置的每个操作模块,在电路、控制及液体流路都分别重新做了优化设计,用最优的方式把各个模块集成到一个操作装置中同时控制八路操作。该装置操作简单,控制精确可靠,样品处理量大,可满足大批量样品的检测要求。
Description
技术领域
本发明涉及一种高通量蛋白质样品预处理装置,是一种可对多个蛋白质样品同时进行在线变性和还原、除盐以及酶解的样品处理系统。
背景技术
随着蛋白质分离检测技术的发展,一些特殊的参数和指标越来越引起医学领域的重视,由此产生了对大批量,快速临床样本检测的需求.
传统的蛋白质组样品预处理包括变性、还原、烷基化、除盐以及酶解等步骤,通常离线手工进行,不仅花费时间长,而且存在着样品污染、丢失的可能性,严重影响了规模化蛋白质分析的结果。因此发展在线的蛋白质样品预处理方法和装置具有非常重要的意义。然而,目前现有的在线蛋白质组样品处理系统只能集成少数几个步骤(如在线酶解,AnalyticaChimicaActa,2018,1000,172-179;Talanta,2015,141,235-238.)或只能单次处理一个样品,难以满足临床等领域对大队列样品分析的需求,因此,为了解决上述问题,我们在前期开发的高通量蛋白质组样品预处理装置的基础上,进一步研制了阵列式在线蛋白质组样品处理系统(专利号:201210517241.4)
该装置是一种具备在线蛋白变性、还原、除盐以及在线酶解功能的蛋白样品预处理设备。该设备可以实现高通量、低损失的蛋白质样品预处理,在蛋白质组学研究和临床检验中具有很好的应用前景。
发明内容
本发明目的是提供一种阵列集蛋白质变性、还原、除盐以及在线酶解于一体的样品预处理装置,该功能的实现需要同时控制交换液输送,控制高温变性和还原及一定温度的酶反应,因此本发明采用如下技术方案。
一种阵列高通量蛋白质样品预处理装置,包括:蛋白质预处理模块,电源模块,加热控制模块,泵及泵控制模块。具体包括:高温变性和还原器组件,溶剂置换器组件,酶反应器组件,加热器电源,泵驱动电源,加热控制器,泵流量控制器,输液泵。
所述高温变性和还原器组件,溶剂置换器组件中的交换液采用串联输送的模式,分别由输液泵完成,这种流动方式可以保证高温变性和还原器每个组件流量一样.
所述电源模块分别为高温变性和还原器组件及酶反应器组件加热电源,和泵电源,高温变性和还原器组件及酶反应器组件分别采用并联加热方式,保证每个加热件温度一样。
所述加热控制器分别为高温变性和还原器组件及酶反应器组件的提供温度控制。
所述输液泵分别为高温变性和还原器组件,溶剂置换器组件,输送交换液。
所述泵流量控制器,分别为输液泵提供流量控制。
交换液的输液泵,用4个泵分2组,分别为高温变性和还原器组件,溶剂置换器组件输送交换液,可保证流体压力和流速稳定,采用流路串联的输液方式.
高温变性和还原器组件,溶剂置换器组件的加热采用并联电路连接,使加热部件热量稳定,均匀.分别用36伏的安全电压,保证仪器用电环境安全。
加热控制器采用传感器件并联连接,可以切换观测每个加热器件的温度,避免每个被检测部件分别检测和控制造成仪器成本增加,体积加大,等问题,并能保证每个加热部件温度一致.
阵列高通量蛋白质预处理设备可应用于临床、食品安全和环境暴露人群等蛋白质组样品处理。
本发明具有如下特点:
1,整个仪器各个操作单元模块经优化处理,模块间达到最佳匹配。
2,样品处理量大,耗电省,安全可靠。
3,操作及部件更换方便,维护简单。
附图说明
图1:阵列式装置处理实际样品图,其中(a)(b)(c)为阵列式装置的三路分别处理Hela样品结果;
图2:阵列式装置处理实际样品图,其中(a)(b)(c)(d)(e)(f)阵列式装置的六路分别处理血浆样品结果;
图3:阵列高通量蛋白质样品预处理装置示意图。
具体实施方式
实验采用八路高通量蛋白质样品预处理装置,八个高温变性和还原器八个溶剂置换器,八酶反应器,八路样品同时操作,用四个泵均分两组,分别为高温变性和还原器和溶剂置换器输送交换液,
实施例1
如图1所示的,在连接好的系统内打开泵驱动电源(04),将所有高温变性和还原器组件(06)内填满2M的盐酸胍与10mM DTT的混合溶液,所有溶剂置换器组件(07)内填满50mM的碳酸氢铵溶液,连接6cm长的酶柱作为酶反应器组件(08)。同时,打开加热器电源(05),设置加热控制器(03)温度为95℃。
取3份8M尿素提取的Hela细胞蛋白(BCA法测浓度为3mg/mL)4μL,各用50mM的碳酸氢铵溶液稀释十倍。待组件(06)的温度达到95℃后,分别通过注射器的方式,以速度为1μL/min向整个体系的不同管路中同时通入Hela细胞蛋白样品。通入结束后,再向系统通入20μL的50mM的碳酸氢铵溶液。保证体系运行中溶剂置换器组件(07)始终运行。同时,收集各个部件得到酶解物质,得到25μL。向收集的样品中加入甲酸,保证溶液甲酸的终质量分数为0.1%。后每组16000rpm离心20min。每组通过Q-Exactive质谱分析,各上样5μL。鉴定蛋白数分别为2100,2008,2156种。
实施例2
在连接好的系统内打开泵驱动电源(04),将所有高温变性和还原器组件(06)内填满6M的盐酸胍与50mM DTT的混合溶液,所有溶剂置换器组件(07)内填满50mM的碳酸氢铵溶液,连接4cm长的酶柱作为酶反应器组件(08)。同时,打开加热器电源(05),设置加热控制器(03)温度为95℃。
取6份用1×PBS稀释至浓度为0.1mg/mL的人正常血浆样品100μL。待组件(06)的温度达到95℃后,分别通过注射器的方式,以速度为8μL/min向整个体系的不同管路中同时通入血浆样品。通入结束后,再向系统通入100μL的50mM的碳酸氢铵溶液。保证体系运行中溶剂置换器组件(07)始终运行。同时,收集各个部件得到酶解物质,得到70μL。将样品冻干后,每组以8μL 0.1%FA复溶。后每组16000g离心20min。每组通过Q-Exactive质谱分析,各上样3μL。鉴定蛋白数分别为220,218,225,206,236,210种。
Claims (7)
1.一种阵列高通量蛋白质样品预处理装置,包括:2个以上的高温变性和还原器(06),2个以上的溶剂置换器(07),2个以上的酶反应器(08),加热器电源(05),泵驱动电源(04),加热控制器(03),泵流量控制器(02),输液泵(01);
其特征在于:
所述高温变性和还原器(06)为中空密闭腔室,腔室上设有交换液进口和出口,腔室内设有中空纤维膜,中空纤维膜二端穿过腔室侧壁分别与样品进口和样品出口相连;溶剂置换器(07)为中空密闭腔室,腔室上设有交换液进口和出口,腔室内设有中空纤维膜,中空纤维膜二端穿过腔室侧壁分别与样品进口和样品出口相连;
一个高温变性和还原器样品出口与一个溶剂置换器样品进口相连,溶剂置换器样品出口与一个酶反应器(08)进样口相连,酶反应器(08)内的反应液由出样口排出,构成一连续的蛋白质样品预处理结构;
2个以上的蛋白质样品预处理结构中的:2个以上的高温变性和还原器中的交换液采用依次串联输送的模式由输液泵与变性和还原交换液储罐相连;这种流动方式可以保证高温变性和还原器每个组件流量一样;2个以上的溶剂置换器中的交换液采用依次串联输送的模式由输液泵与置换溶剂的交换液储罐相连;
于高温变性和还原器(06)及酶反应器(08)上分别设有电加热元件和温度传感器;
所述电源模块包括:为高温变性和还原器(06)及酶反应器(08)的电加热元件的加热电源(05)和泵驱动电源(04),高温变性和还原器组件(06)及酶反应器组件(08)的电加热元件分别采用并联加热方式;保证每个加热件温度一样;
所述加热控制器(03),分别为高温变性和还原器组件(06)及酶反应器组件(08)的提供温度控制;
所述输液泵(01)为二组以上,分别为高温变性和还原器组件(06),溶剂置换器组件(07),输送交换液;
所述泵流量控制器(02),分别为输液泵(01)提供流量控制。
2.按照权利要求1所述的阵列高通量蛋白质预处理装置,其特征在于:
交换液的输液泵(01),为4个泵均分2组,2组分别为高温变性和还原器组件(06),溶剂置换器组件(07)输送交换液,可保证流体压力和流速稳定,采用流路串联的输液方式。
3.按照权利要求1所述的阵列高通量蛋白质预处理设备,其特征在于:高温变性和还原器组件(06),溶剂置换器组件(07)的加热采用并联电路连接,使加热部件热量稳定,均匀.分别用36伏的安全电压,保证仪器用电环境安全。
4.按照权利要求1所述的阵列高通量蛋白质预处理设备,其特征在于:
加热控制器(03)采用传感器件并联连接,可以切换观测每个加热器件的温度,避免每个被检测部件分别检测和控制造成仪器成本增加,体积加大,等问题,并能保证每个加热部件温度一致。
5.按照权利要求1或4所述的阵列高通量蛋白质预处理设备,其特征在于:所述加热控制器(03)为温度控制器,分别为高温变性和还原器组件(06)及酶反应器组件(08)的提供温度控制;温度传感器与温度控制器信号连接,电加热元件经温度控制器与加热电源(05)相连。
6.按照权利要求1所述的阵列高通量蛋白质预处理设备,其特征在于:所述泵流量控制器(02)为泵流量控制板。
7.按照权利要求1所述的阵列高通量蛋白质预处理设备可应用于临床、食品安全或环境暴露人群等蛋白质组样品处理。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201811406709.6A CN111220429A (zh) | 2018-11-23 | 2018-11-23 | 一种阵列高通量蛋白质样品预处理装置 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201811406709.6A CN111220429A (zh) | 2018-11-23 | 2018-11-23 | 一种阵列高通量蛋白质样品预处理装置 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN111220429A true CN111220429A (zh) | 2020-06-02 |
Family
ID=70826995
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN201811406709.6A Pending CN111220429A (zh) | 2018-11-23 | 2018-11-23 | 一种阵列高通量蛋白质样品预处理装置 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN111220429A (zh) |
Citations (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN1263893A (zh) * | 1999-02-05 | 2000-08-23 | 上海复旦张江生物医药有限公司 | 变性蛋白质复性装置 |
| CN1331345A (zh) * | 2000-07-04 | 2002-01-16 | 清华大学 | 集成式微阵列装置 |
| CN1995319A (zh) * | 2007-01-12 | 2007-07-11 | 北京工业大学 | 面向聚合酶链式反应微流控芯片的多通道智能温控装置 |
| CN101838609A (zh) * | 2010-03-15 | 2010-09-22 | 上海浩源生物科技有限公司 | 加样装置及其应用 |
| CN102206573A (zh) * | 2011-03-22 | 2011-10-05 | 博奥生物有限公司 | 用于微阵列芯片的自动进样装置及自动进样杂交微阵列芯片 |
| CN103852527A (zh) * | 2012-12-05 | 2014-06-11 | 中国科学院大连化学物理研究所 | 一种高通量蛋白质样品预处理装置 |
| CN106255542A (zh) * | 2014-02-17 | 2016-12-21 | 拜耳公司 | 用于从蛋白质溶液的连续缓冲或介质交换的超滤单元 |
| CN107588997A (zh) * | 2016-07-08 | 2018-01-16 | 中国科学院大连化学物理研究所 | 一种高通量蛋白质样品预处理设备 |
-
2018
- 2018-11-23 CN CN201811406709.6A patent/CN111220429A/zh active Pending
Patent Citations (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN1263893A (zh) * | 1999-02-05 | 2000-08-23 | 上海复旦张江生物医药有限公司 | 变性蛋白质复性装置 |
| CN1331345A (zh) * | 2000-07-04 | 2002-01-16 | 清华大学 | 集成式微阵列装置 |
| CN1995319A (zh) * | 2007-01-12 | 2007-07-11 | 北京工业大学 | 面向聚合酶链式反应微流控芯片的多通道智能温控装置 |
| CN101838609A (zh) * | 2010-03-15 | 2010-09-22 | 上海浩源生物科技有限公司 | 加样装置及其应用 |
| CN102206573A (zh) * | 2011-03-22 | 2011-10-05 | 博奥生物有限公司 | 用于微阵列芯片的自动进样装置及自动进样杂交微阵列芯片 |
| CN103852527A (zh) * | 2012-12-05 | 2014-06-11 | 中国科学院大连化学物理研究所 | 一种高通量蛋白质样品预处理装置 |
| CN106255542A (zh) * | 2014-02-17 | 2016-12-21 | 拜耳公司 | 用于从蛋白质溶液的连续缓冲或介质交换的超滤单元 |
| CN107588997A (zh) * | 2016-07-08 | 2018-01-16 | 中国科学院大连化学物理研究所 | 一种高通量蛋白质样品预处理设备 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN112538425A (zh) | 一种基于微流控芯片的片上核酸扩增检测系统及方法 | |
| US20130040324A1 (en) | Perifusion device | |
| JP2006504957A (ja) | 核酸を分析するためのマイクロ流体システム | |
| CN103257213A (zh) | 一种全集成高通量细胞水平微流控芯片药物评价系统 | |
| US20230407230A1 (en) | Methods to incorporate machine learning analytics for optimizing protein purity, potency and quality in an on-demand production system for point-of-care delivery | |
| US20230001415A1 (en) | Method and Apparatus for Isolating and Detecting Biological and Other Particles | |
| WO2018090652A1 (zh) | 一种高通量体液蛋白质样品预处理装置及其应用 | |
| Cantoni et al. | A microfluidic chip carrier including temperature control and perfusion system for long-term cell imaging | |
| KR20220024766A (ko) | 대변 샘플 처리 시스템 및 방법 | |
| CN102507706A (zh) | 细菌介电电泳阻抗检测的微流控芯片分析微系统 | |
| EP3867350A1 (en) | A system and method of performing a biological experiment with adaptive cybernetic control of procedural conditions | |
| CN113302487B (zh) | 能使多个样品独立进行电泳的电泳装置 | |
| US12415982B2 (en) | Automated closed system for cell therapy manufacturing | |
| CN111220429A (zh) | 一种阵列高通量蛋白质样品预处理装置 | |
| CN101718698A (zh) | Pcr-ce联用微流控芯片激光诱导荧光分析仪 | |
| CN103852527B (zh) | 一种高通量蛋白质样品预处理装置 | |
| EP1877764B1 (en) | Method for electrophoresis involving parallel and simultaneous separation | |
| WO2019035998A1 (en) | SYSTEMS WITH CONTROL AND REGULATION OF FLUID PATH | |
| CN107406816A (zh) | 用于从人类血液制造蛋白质的微量生物处理系统和方法 | |
| KR101983580B1 (ko) | 히터 유닛이 반복 배치된 열 블록을 포함하는 전기화학적 신호를 검출하기 위한 pcr 칩, 이를 포함하는 pcr 장치, 및 이를 이용한 실시간 pcr 방법 | |
| CN104877990A (zh) | 一种高通量的连续性核酸扩增检测联用装置及方法 | |
| CA3091171A1 (en) | Method for determining an analyte, and analysis system | |
| CN119608258A (zh) | 一种用于生物分子富集检测的微流控系统 | |
| KR101950210B1 (ko) | 히터 유닛이 반복 배치된 열 블록을 포함하는 전기화학적 신호를 검출하기 위한 실시간 pcr 장치, 및 이를 이용한 실시간 pcr 방법 | |
| Chen et al. | Microfluidic system for biological agent detection |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PB01 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| WD01 | Invention patent application deemed withdrawn after publication |
Application publication date: 20200602 |
|
| WD01 | Invention patent application deemed withdrawn after publication |