CN115803091A - Ace2-fc融合蛋白及其用途 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及ACE2与IgG Fc的融合蛋白以及这些融合蛋白的医学用途,特别是在预防或治疗冠状病毒如SARS‑CoV‑2的感染中。
Description
发明领域
本发明涉及ACE2与IgG Fc的融合蛋白以及这些融合蛋白的医学用途,特别是在预防或治疗冠状病毒如SARS-CoV-2的感染方面。
技术背景
ACE2(血管紧张素转换酶2)是肾素-血管紧张素系统的关键金属蛋白酶,中心有催化锌原子(Donoghue et al.(2002)Circ.Res.87:e1-e9)。全长的ACE2由N端细胞外肽酶域、collectrin样域、单个跨膜螺旋和短的细胞内段组成。它的作用是裂解血管紧张素II以产生血管紧张素(1-7),以及裂解血管紧张素I以产生血管紧张素(1-9)然后由其他酶加工成血管紧张素(1-7)。ACE2的作用是降低血压,并对抗ACE的活性,以维持Ras/MAS系统的平衡。因此,它是治疗心血管疾病的有希望的靶标。
最近,ACE2作为冠状病毒,特别是新型冠状病毒SARS-CoV-2的受体获得了广泛关注。SARS-CoV-2是一种冠状病毒。2020年5月22日,约翰霍普金斯大学计数出全世界超过500万的确诊感染,造成超过33万人死亡。这场大流行导致许多国家被封锁,产生了非常重大的经济和社会影响。
已经表明ACE2作为SARS-CoV(Li et al.(2003)Nature 426:450-454;Prakabaranet al.(2004)Biochem.Biophys.Res.Comm.314:235-241)和SARS-CoV-2(Yan et al.(2020)Science 367:1444-1485)的受体起作用。进一步,SARS-CoV-2进入呼吸道细胞取决于ACE2和丝氨酸蛋白酶TMPRSS2(Hoffmann et al.(2020)Cell 181:1-10)。
鉴于ACE2对病毒进入细胞的重要作用,提出使用可溶性ACE2来阻断SARS与细胞的结合(WO 2005/032487;WO 2006/122819)。同样的方法也被建议用于治疗SARS-CoV-2的感染(Kruse(2020)F1000Res.9:72)。Apeiron公司已经启动用可溶性形式的ACE2治疗SARS-CoV-2感染的临床试验(Pharmazeutische Zeitung,2020年4月10日),并且首次结果显示,一名患有由SARS-CoV-2引起的重度Covid-19的患者在用可溶性ACE2治疗后迅速康复(Zoufaly et al.(2020)The Lancet Respiratory Medicine 8:1154-1158,获于https:// doi.org/10.1016/S2213-2600(20)30418-5)。
然而,分离的受体域通常特征在于低稳定性和血浆半衰期。对于ACE2的可溶性形式,显示出10小时的剂量依赖性的终末半衰期(Haschke et al.(2013)Clin.Pharmacokinet.52:783-792)。鉴于这些结果,在后来的研究中,决定以每天两次输注施用可溶性形式的ACE2(Khan et al.(2017)Critical Care 21:234)。然而,每天超过一次的施用对患者和医务人员都很不方便。
构建并测试了ACE2的融合蛋白,该ACE2的融合蛋白由与人IgG1的Fc域连接的酶促活性或酶促失活ACE2的细胞外域组成。结果显示,这两种构建体都能有力地中和SARS-CoV和SARS-CoV-2两者,并抑制S(刺突)蛋白介导的融合(Lei et al.(2020)NatureCommunications 11:2070)。进一步地,Sorrento Therapeutics公司开发了名为COVIDTRAPTM或STI-4398的融合蛋白,用于临床试验(参见https:// www.globenewswire.com/news-release/2020/03/20/2003957/0/en/SORRENTO-DEVELOPS- STI-4398-COVIDTRAP-PROTEIN-FOR-POTENTIAL-PREVENTION-AND-TREATMENT-OF-SARS- COV-2-CORONAVIRUS-DISEASE-COVID-19.html)。Liu et al.(2020)Int.J.Biol.Macromol.165:1626-1633,获于https://www.biorxiv.org/content/ 10.1101/2020.08.13.248351v1.full.pdf,描述了影响ACE2催化活性的野生型ACE2和九个ACE2突变体与人IgG1的Fc区的融合蛋白。然而,人IgG1的Fc域与免疫细胞上的Fcγ受体的相互作用可能增强病毒感染(Perlman and Dandekar(2005)Nat.Rev.Immunol.5(12):917-927;Chen et al.(2020)Current Tropical Medicine Reports 3:1-4)。
Tada et al.(2020),获于https://www.biorxiv.org/content/10.1101/ 2020.09.16.300319v1.full,其公开了“ACE2微体”,其中催化无活性ACE2的细胞外域与免疫球蛋白重链的Fc域3融合。
因此,仍然需要可以用于治疗和/或预防冠状病毒,特别是SARS-CoV-2感染的药剂。
发明内容
本发明提供了融合蛋白,其包含第一部分和第二部分,该第一部分包含人ACE2的片段或所述片段的变体,所述人ACE2具有根据SEQ ID No.1的氨基酸序列,该第二部分包含人IgG4的Fc部分或人IgG4的Fc部分的变体,所述人IgG4的Fc部分具有根据SEQ ID No.5的氨基酸序列,其中所述第一部分和第二部分通过根据SEQ ID No.4的氨基酸序列链接。
人ACE2的片段可以由SEQ ID No.2组成,也可以是由SEQ ID No.3组成的ACE2的细胞外域。
在一个实施方案中,融合蛋白具有根据SEQ ID No.6至9中任一个的氨基酸序列。
在一个实施方案中,本发明提供了融合蛋白,其包含第一部分和第二部分,该第一部分包含由根据SEQ ID No.2的氨基酸序列组成的人ACE2的片段或所述片段的变体,该第二部分包含人IgG的Fc部分或人IgG的Fc部分的变体。
在一个实施方案中,IgG是IgG1或IgG4。
在一个实施方案中,IgG是IgG4,并且第一部分和第二部分由根据SEQ ID No.4的氨基酸序列连接。
在一个实施方案中,IgG是IgG1,并且第一部分和第二部分由根据SEQ ID No.15的氨基酸序列连接。
在一个实施方案中,融合蛋白具有根据SEQ ID No.6、8、10和12中任一个的氨基酸序列。
在一个实施方案中,本发明提供了融合蛋白,其包含第一部分和第二部分,该第一部分包含人ACE2的片段或所述片段的变体,所述人ACE2具有根据SEQ ID No.1的氨基酸序列,该第二部分包含人IgG2或IgG3的Fc部分或人IgG1、IgG2或IgG3的Fc部分的变体,其中该融合蛋白与包含相同的第一部分和含有野生型人IgG1的Fc部分的第二部分的融合蛋白相比,具有降低的与FcγRIIIa的结合。
在一个实施方案中,该融合蛋白与包含相同的第一部分和包含野生型人IgG1的Fc部分的第二部分的融合蛋白相比,具有基本相同的与FcRn的结合。
在一个实施方案中,人IgG1的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.16的序列中的氨基酸取代L3A和L4A。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的氨基酸序列组成,或者是由根据SEQ ID No.3的氨基酸序列组成的ACE2的细胞外域。
在一个实施方案中,人ACE2片段的变体是人ACE2的酶促失活变体,其可能包含H374N和H378N突变,该编号参照SEQ ID No.1。
人ACE2片段的变体可以包含在亮氨酸584处的氨基酸取代,该编号参照SEQ IDNo.1和/或在选自赖氨酸619、精氨酸621、赖氨酸625、精氨酸697、赖氨酸702、精氨酸705、精氨酸708、精氨酸710和精氨酸716的至少一个残基处的至少一个氨基酸取代,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2片段的变体包含在赖氨酸619、精氨酸621、赖氨酸625、精氨酸697、赖氨酸702、精氨酸705、精氨酸708、精氨酸710和精氨酸716处的氨基酸取代,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2片段的变体包含S645C突变,该编号参照SEQ ID No.1。
本发明还涉及包含编码所述融合蛋白的核酸序列的核酸分子、包含所述核酸分子的表达载体和包含所述核酸分子或所述表达载体的宿主细胞。
进一步,本发明涉及用于产生所述融合蛋白的方法,其包括在适当的培养基中培养所述宿主细胞。
本发明还涉及所述融合蛋白用于医疗用途,特别是用于预防和/或治疗与ACE2结合的冠状病毒感染。
在一个实施方案中,与ACE2结合的冠状病毒选自由SARS、SARS-CoV-2和NL-63组成的组,优选是SARS-CoV-2。
所述融合蛋白可以与抗病毒剂联合施用,该抗病毒剂可以选自由瑞德西韦(remdesivir)、盐酸阿比多尔(arbidol HCl)、利托那韦(ritonavir)、洛匹那韦(lopinavir)、达芦那韦(darunavir)、利巴韦林(ribavirin)、氯喹(chloroquin)及其衍生物、硝唑尼特(nitazoxanide)、甲磺酸卡莫司他(camostat mesilate)、托珠单抗(tocilizumab)、司妥昔单抗(siltuximab)、沙利鲁单抗(sarilumab)和磷酸巴瑞替尼(baricitinib phosphate)组成的组。
本发明还涉及所述融合蛋白用于治疗高血压病(包括高血压)、充血性心力衰竭、慢性心力衰竭、急性心力衰竭、收缩性心力衰竭、心肌梗塞、动脉硬化、肾衰竭(kidneyfailure)、肾脏衰竭(renal failure)、急性呼吸窘迫综合征(ARDS)、急性肺损伤(ALI)、慢性阻塞性肺病(COPD)、肺动脉高压、肾脏纤维化、慢性肾脏衰竭、急性肾脏衰竭、急性肾脏损伤、炎症性肠病和多器官功能障碍综合征。
本发明还涉及药物组合物,其包含所述融合蛋白和药学上可接受的载剂或赋形剂。该药物组合物可以进一步包含抗病毒剂。
附图说明
图1:如通过斜率光谱法确定的蛋白A色谱法后不同融合蛋白的蛋白质产率
图2:通过分析尺寸排阻色谱法的不同融合蛋白的高分子量种类的分析
图3:不同融合蛋白的O-糖基化的分析
图4:如通过竞争性ELISA确定的不同融合蛋白对S1与ACE2结合的抑制
a)具有IgG4的Fc部分的构建体1-4
b)具有IgG1的Fc部分的构建体5-8
图5:构建体1、3、5和7对SARS-CoV-2(株Victoria/1/2020)的中和
图6:构建体1至8和两个参照蛋白(Ref1,Ref2)的酶活性分析
a)来自六个个体实验的酶活性的平均值与标准偏差
b)在六个个体实验中获得的每个构建体的单个值
图7:构建体1至8对不同冠状病毒的中和
a)对SARS-CoV(株SARS-CoV-Fra-1(AY291315.1))的中和;来自三个独立实验的平均IC50值;误差条表示95%置信区间。
b)对SARS-CoV-2(SARS-CoV-2-Munich-TUM-1(EPI_ISL_582134))的中和;来自三个独立实验的平均IC50值;误差条表示95%置信区间
c)对SARS-CoV-2D614G的中和;来自三个独立实验的平均IC50值;误差条表示95%置信区间
图8:如通过结合ELISA确定的根据SEQ ID NO.6的融合蛋白与ACE2的结合
图9:不同病毒分离株(A:SARS-CoV-2Munich-TUM-1;B:SARS-CoV-2D614G;C:SARS-CoV-2B.1.1.7;D:SARS-CoV-2B.1.351)与根据SEQ ID No.6(构建体1,左手侧)和SEQ IDNo.8(构建体3,右手侧)的融合蛋白的中和。虚线描绘了IC50值的确定。给出的数据是三个独立实验各自的平均值±SEM。
发明详述
如以下说明性地描述的本发明可以在缺乏本文未具体公开的任何一个元素或多个元素、一个限制或多个限制的情况下适当地进行实施。
本发明将就特定的实施方案进行描述,但本发明并不局限于此,而仅由权利要求所限定。
在本说明书和权利要求中使用术语“包含”时,它并不排除其他元素。为了本发明的目的,认为术语“由…组成”是术语“包含”的优选实施方案。如果下文将组定义为包含至少一定数量的实施方案,这也应理解为公开了优选仅由这些实施方案组成的组。
为了本发明的目的,认为术语“获得”是术语“可获得”的优选实施方案。如果在下文中,例如将细胞或生物体定义为通过特定的方法可获得的,这也理解为公开了通过该方法获得的细胞或生物体。
在提及单数名词时,如果使用了不定冠词或定冠词,例如“一个(a、an)”或“该(the)”,则包括该名词的复数,除非有其他特别说明。
如上所讨论,本发明提供了融合蛋白,其包含第一部分和第二部分,该第一部分包含人ACE2的片段或所述片段的变体,该第二部分包含人IgG4的Fc部分或人IgG4的Fc部分的变体。已经表明,包含氨基酸18至732的人ACE2片段提供更高的产率和更少的高分子量物种,并且没有O-糖基化。考虑到文献(例如Tada et al.(2020),获于https:// www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.09.16.300319v1.full),假设这种融合蛋白与SARS-CoV-2的刺突蛋白的亲和力高于没有Fc部分的可溶性ACE2二聚体。还假设Fc部分之间的二硫桥稳定融合蛋白与它们的靶标,如SARS-CoV-2的刺突蛋白的结合。本发明的融合蛋白与FcRn结合,导致比可溶性ACE2二聚体更长的半衰期。最后,由于本发明的融合蛋白包含IgG4的Fc部分,它们不与Fcγ受体结合,降低了病毒感染的抗体依赖性增强的风险。
“融合蛋白”是由至少两个多肽部分形成的蛋白质,这两个多肽部分彼此之间没有天然连接。这两个多肽部分通过肽键连接,也可以任选地在两个多肽部分之间插入接头分子。这两个多肽部分被转录并翻译成单一分子。融合蛋白通常具有衍生自两个多肽部分的功能。在本发明的背景下,融合蛋白保留了ACE2的结合特性,特别是与病毒如冠状病毒的结合,以及人IgG4的Fc部分所赋予的增加的半衰期和Fc受体结合。
术语“人ACE2”是指衍生自人受试者的血管紧张素转换酶2。人ACE2的全长序列有805个氨基酸。它包含信号肽、N端细胞外肽酶域、然后是collectrin样域、单个跨膜螺旋和短的细胞内段。人ACE2的全长序列在SEQ ID No.1中描述。除非另有说明,本文所用的氨基酸编号是指根据SEQ ID No.1对人ACE2的全长序列进行的编号。人ACE2的细胞外域由SEQID No.1的氨基酸18至740组成。
术语“人ACE2片段”是指与根据SEQ ID No.1的人ACE2全长序列相比,缺少一个或多个氨基酸的多肽。人ACE2的片段能够与至少一种冠状病毒的S蛋白,特别是与SARS-CoV-2的S蛋白结合。人ACE2片段与至少一种冠状病毒的S蛋白的结合可以在ELISA测定中确定,其中S蛋白被固定在底物上并与人ACE2片段接触,检测S蛋白和人ACE2片段之间的相互作用。或者,人ACE2片段与至少一种冠状病毒的S蛋白的结合可以通过表面等离子体共振来确定,例如,如Shang et al.(2020)Nature doi:10.1038/s41586-020-2179-y;Wrapp et al.(2020)Science 367(6483):1260-1263;Lei et al.(2020)Nature Communications 11(1):2070中所述。在进一步替代中,人ACE2的片段与至少一种冠状病毒的S蛋白的结合可以通过生物层干涉仪来确定,例如如Seydoux et al.(2020)https://doi.org/10.1101/ 2020.05.12.091298中所描述的。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的360至723个连续的氨基酸组成。优选地,人ACE2的片段由在根据SEQ ID No.1的序列中的380至723、400至723、420至723、440至723、460至723、480至723或500至723个连续的氨基酸组成。优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的520至723、540至723、560至723、580至723或600至723个连续的氨基酸组成。更优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的620至723、640至723、660至723、680至723、700至723或720至723个连续的氨基酸组成。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含氨基酸残基K31和K353,该编号参照SEQ IDNo.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含氨基酸残基Q24、D30、E35和Q42,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含氨基酸残基Q24、D30、K31、E35、Q42和K353,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的360至723个连续的氨基酸组成,并包含氨基酸残基K31和K353,该编号参照SEQ ID No.1。优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的380至723、400至723、420至723、440至723、460至723、480至723或500至723个连续的氨基酸组成,并包含氨基酸残基K31和K353,该编号参照SEQ ID No.1。更优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的520至723、540至723、560至723、580至723或600至723个连续氨基酸组成,并包含氨基酸残基K31和K353,该编号参照SEQ ID No.1。更优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的620至723、640至723、660至723、680至723、700至723或720至723个连续的氨基酸组成,并包含氨基酸残基K31和K353,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的360至723个连续的氨基酸组成,并包含氨基酸残基Q24、D30、E35和Q42,该编号参照SEQ ID No.1。优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的380至723、400至723、420至723、440至723、460至723、480至723或500至723个连续的氨基酸组成,并包含氨基酸残基Q24、D30、E35和Q42,该编号参照SEQ ID No.1。优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的520至723、540至723、560至723、580至723或600至723个连续的氨基酸组成,并包含氨基酸残基Q24、D30、E35和Q42,该编号参照SEQ ID No.1。更优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的620至723、640至723、660至723、680至723、700至723或720至723个连续的氨基酸组成,并包含氨基酸残基Q24、D30、E35和Q42,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的360至723个连续的氨基酸组成,并包含氨基酸残基Q24、D30、K31、E35、Q42和K353,该编号参照SEQ IDNo.1。优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的380至723、400至723、420至723、440至723、460至723、480至723或500至723个连续的氨基酸组成,并包含氨基酸残基Q24、D30、K31、E35、Q42和K353,该编号参照SEQ ID No.1。优选地,人ACE2的片段由根据SEQID No.1的序列中的520至723、540至723、560至723、580至723或600至723个连续的氨基酸组成,并包含氨基酸残基Q24、D30、K31、E35、Q42和K353,该编号参照SEQ ID No.1。更优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列中的620至723、640至723、660至723、680至723、700至723或720至723个连续的氨基酸组成,并包含氨基酸残基Q24、D30、K31、E35、Q42和K353,该编号参照SEQ IDNo.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列的氨基酸18至380、18至400、18至420、18至440、18至460、18至480或18至500组成。优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列的氨基酸18至520、18至540、18至560、18至580或18至600组成。更优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列的氨基酸18至605、18至615、18至620、18至640、18至660、18至680或18至700组成。甚至更优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列的氨基酸18至710、18至720或18至730组成。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的氨基酸序列组成。根据SEQ ID No.2的氨基酸序列从根据SEQ ID No.1的序列中以氨基酸Q18开始并以氨基酸G732结束。该片段C端的氨基酸甘氨酸提供了较高的旋转自由度,有利于两个蛋白部分的融合,增加了融合蛋白的稳定性。此外,从根据SEQ ID No.1的序列中以氨基酸Q18开始并以氨基酸G732结束的ACE2片段的使用提供了比较长的ACE2片段更好的产率。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由具有根据SEQ ID No.3的氨基酸序列的人ACE2的完整细胞外域组成。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.14的氨基酸序列组成。根据SEQ ID No.14的氨基酸序列从根据SEQ ID No.1的序列中以氨基酸Q18开始并以氨基酸G605结束。
在一个实施方案中,在选自N53、N90、N103、N322、N432、N546和N690的至少一个氨基酸残基处将人ACE2的片段N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,在氨基酸残基N53、N90和N322处将人ACE2的片段N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,在氨基酸残基N53、N90、N103、N322、N432、N546和N690处将人ACE2的片段N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的氨基酸序列组成,并且在选自N53、N90、N103、N322、N432、N546和N690的至少一个氨基酸残基处将其N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的氨基酸序列组成,并在氨基酸残基N53、N90和N322处将其N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的氨基酸序列组成,并在氨基酸残基N53、N90、N103、N322、N432、N546和N690处将其N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的氨基酸序列组成,并且在选自N53、N90、N103、N322、N432、N546和N690的至少一个氨基酸残基处将其N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的氨基酸序列组成,并在氨基酸残基N53、N90和N322处将其N-糖基化,编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的氨基酸序列组成,并在氨基酸残基N53、N90、N103、N322、N432、N546和N690处将其N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的360至723个连续的氨基酸或由其鉴定。优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的380至723、400至723、420至723、440至723、460至723、480至723或500至723个连续的氨基酸或由其鉴定。优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的520至723、540至723、560至723、580至723或600至723个连续的氨基酸或由其鉴定。更优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的620至723、640至723、660至723、680至723、700至723或720至723个连续的氨基酸组成或由其鉴定。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含氨基酸残基K31和K353,该编号参照SEQ IDNo.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含氨基酸残基Q24、D30、E35和Q42,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含氨基酸残基Q24、D30、K31、E35、Q42和K353,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的360至723个连续的氨基酸或由其鉴定,并包含氨基酸残基K31和K353,该编号参照SEQ ID No.1。优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的380至723、400至723、420至723、440至723、460至723、480至723或500至723个连续的氨基酸或由其鉴定,并且包含氨基酸残基K31和K353,该编号参照SEQ ID No.1。优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的520至723、540至723、560至723、580至723或600至723个连续的氨基酸或由其鉴定,并且包含氨基酸残基K31和K353,该编号参照SEQ ID No.1。更优选地,人ACE2的片段包含根据SEQID No.1的序列中的620至723、640至723、660至723、680至723、700至723或720至723个连续的氨基酸或由其鉴定,并包含氨基酸残基K31和K353,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的360至723个连续的氨基酸或由其鉴定,并包含氨基酸残基Q24、D30、E35和Q42,该编号参照SEQ IDNo.1。优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的380至723、400至723、420至723、440至723、460至723、480至723或500至723个连续的氨基酸或由其鉴定,并且包含氨基酸残基Q24、D30、E35和Q42,该编号参照SEQ ID No.1。优选地,人ACE2的片段包含根据SEQID No.1的序列中的520至723、540至723、560至723、580至723或600至723个连续的氨基酸或由其鉴定,并且包含氨基酸残基Q24、D30、E35和Q42,该编号参照SEQ ID No.1。更优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的620至723、640至723、660至723、680至723、700至723或720至723个连续的氨基酸或由其鉴定,并且包含氨基酸残基Q24、D30、E35和Q42,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的360至723个连续的氨基酸或由其鉴定,并包含氨基酸残基Q24、D30、K31、E35、Q42和K353,该编号参照SEQ ID No.1。优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的380至723、400至723、420至723、440至723、460至723、480至723或500至723个连续的氨基酸或由其鉴定,并且包含氨基酸残基Q24、D30、K31、E35、Q42和K353,该编号参照SEQ ID No.1。优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的520至723、540至723、560至723、580至723或600至723个连续的氨基酸或由其鉴定,并包含氨基酸残基Q24、D30、K31、E35、Q42和K353,该编号参照SEQ ID No.1。更优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列内的620至723、640至723、660至723、680至723、700至723或720至723个连续的氨基酸或由其鉴定,并包含氨基酸残基Q24、D30、K31、E35、Q42和K353,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的18至380、18至400、18至420、18至440、18至460、18至480或18至500的氨基酸或由其鉴定。优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的氨基酸18至520、18至540、18至560、18至580或18至600或由其鉴定。更优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的氨基酸18至605、18至615、18至620、18至640、18至660、18至680或18至700或由其鉴定。甚至更优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列中的氨基酸18至710、18至720或18至730或由其鉴定。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的氨基酸序列或由其鉴定。根据SEQ ID No.2的氨基酸序列从根据SEQ ID No.1的序列中以氨基酸Q18开始并以氨基酸G732结束。该片段C端的氨基酸甘氨酸提供了高的旋转自由度,有利于两个蛋白部分的融合,增加了融合蛋白的稳定性。此外,包含从根据SEQ ID No.1的序列中以氨基酸Q18开始并以氨基酸G732结束的氨基酸序列或由其鉴定的ACE2片段的使用提供了比较长的ACE2片段更好的产率。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含人ACE2的完整细胞外域或由其鉴定,该人ACE2的完整细胞外域具有根据SEQ ID No.3的氨基酸序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.14的氨基酸序列或由其鉴定。根据SEQ ID No.14的氨基酸序列从根据SEQ ID No.1的序列中以氨基酸Q18开始并以氨基酸G605结束。
在一个实施方案中,在选自N53、N90、N103、N322、N432、N546和N690的至少一个氨基酸残基处将人ACE2的片段N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,在氨基酸残基N53、N90和N322处将人ACE2的片段N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,在氨基酸残基N53、N90、N103、N322、N432、N546和N690处将人ACE2的片段N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的氨基酸序列或由其鉴定,并且在选自N53、N90、N103、N322、N432、N546和N690的至少一个氨基酸残基处将其N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的氨基酸序列或由其鉴定,并在氨基酸残基N53、N90和N322处将其N-糖基化,该编号参照SEQID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的氨基酸序列或由其鉴定,并在氨基酸残基N53、N90、N103、N322、N432、N546和N690处将其N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的氨基酸序列或由其鉴定,并且在选自N53、N90、N103、N322、N432、N546和N690的至少一个氨基酸残基处将其N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的氨基酸序列或由其鉴定,并在氨基酸残基N53、N90和N322处将其N-糖基化,该编号参照SEQID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的氨基酸序列或由其鉴定,并在氨基酸残基N53、N90、N103、N322、N432、N546和N690处将其N-糖基化,该编号参照SEQ ID No.1。
术语“N-糖基化的”或“N-糖基化”是指在蛋白质的天冬酰胺残基的酰胺氮上附接聚糖结构。聚糖是分支的、柔性的碳水化合物链,并且附接至蛋白质的天冬酰胺残基上的聚糖的确切结构取决于用于生产糖蛋白的表达系统。
人ACE2片段的“变体”是指如上定义的片段,其中与根据SEQ ID No.1的野生型全长人ACE2的氨基酸序列中的相应序列相比,至少有一个氨基酸残基不同,或至少有两个、至少三个、至少四个、至少五个、至少六个、至少七个、至少八个、至少九个、至少十个、至少十一个或至少十三个氨基酸不同。人ACE2片段的“变体”包含人ACE2片段的序列中的一个或多个氨基酸取代。人ACE2片段的“变体”与变体衍生自其的序列相比,不包含任何氨基酸的添加或缺失。在一个实施方案中,人ACE2片段的变体是根据SEQ ID No.2或3的人ACE2片段的变体,并且与根据SEQ ID No.2或3的序列相比不包含任何氨基酸的添加或缺失,即它与根据SEQ ID No.2或3的序列具有相同的长度。在本发明的范围内,人ACE2片段的变体能够与至少一种冠状病毒的S蛋白结合,特别是与SARS-CoV-2的S蛋白结合。人ACE2片段的变体与至少一种冠状病毒的S蛋白的结合,特别是与SARS-CoV-2的S蛋白的结合,可以按照上述对于人ACE2片段的来确定。
在一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQ ID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差一个氨基酸。在另一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQ ID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差两个氨基酸。在另一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQ ID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差三个氨基酸。在另一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQ ID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差四个氨基酸。在另一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQ ID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差五个氨基酸。在另一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQ ID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差六个氨基酸。在另一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQ ID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差七个氨基酸。在另一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差八个氨基酸。在另一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQ ID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差九个氨基酸。在另一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQ ID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差十个氨基酸。在另一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQ ID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差十一个氨基酸。在另一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQ ID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差十二个氨基酸。在另一个实施方案中,人ACE2片段的变体与根据SEQID No.1的序列中的相应氨基酸序列相差十三个氨基酸。
人ACE2片段的变体可能是酶促失活的变体。“人ACE2片段的酶促失活变体”缺乏将血管紧张素II裂解为Ang1-7的能力。人ACE2的酶活性可以通过技术人员已知的方法确定。测定人ACE2酶活性的合适试剂盒是市售的,例如来自BioVision或Anaspec公司的。通过使用酶促失活的ACE2变体,可以消除与ACE2的酶活性相关的任何副作用,如对心血管系统或血压调节的影响。进一步地,也减少平衡RAS-MAS平衡的风险。
人ACE2片段的酶促失活变体可包含ACE2催化中心内的一个或多个氨基酸突变。特别是,人ACE2片段的酶促失活变体包含根据SEQ ID No.1的序列中残基374处的野生型组氨酸的突变和/或根据SEQ ID No.1的序列中残基378处的野生型组氨酸的突变。野生型组氨酸可以突变为组氨酸以外的任何氨基酸,特别是将野生型组氨酸突变为天冬酰胺。优选地,人ACE2片段的酶促失活变体包含H374N和H378N突变,该编号参照SEQ ID No.1的序列。
在另一个实施方案中,人ACE2片段的酶促失活变体包含在以下氨基酸残基中的一个或多个处的突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列:残基345(野生型的组氨酸)、273(野生型的精氨酸)、402(野生型的谷氨酸)和505(野生型的组氨酸)。在一个实施方案中,人ACE2片段的酶促失活变体包含在残基345处的组氨酸到丙氨酸或亮氨酸的突变、在残基273处的精氨酸到丙氨酸、谷氨酰胺或赖氨酸的突变、在残基402处的谷氨酸到丙氨酸的突变和/或在残基505处的组氨酸到丙氨酸或亮氨酸的突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列的氨基酸18至380、18至400、18至420、18至440、18至460、18至480或18至500组成,并包含H374N和H378N突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列的氨基酸18至520、18至540、18至560、18至580或18至600组成,并包含H374N和H378N突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。更优选地,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.1的序列的氨基酸18至615、18至620、18至640、18至660、18至680或18至700组成,并包含H374N和H378N突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。甚至更优选地,人ACE2的片段由根据SEQ IDNo.1的序列的氨基酸18至710、18至720或18至730组成,并包含H374N和H378N突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,包含H374N和H378N突变。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,包含H374N和H378N突变。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列的氨基酸18至380、18至400、18至420、18至440、18至460、18至480或18至500或由其鉴定,并包含H374N和H378N突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ IDNo.1的序列的氨基酸18至520、18至540、18至560、18至580或18至600或由其鉴定,并包含H374N和H378N突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。更优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列的氨基酸18至615、18至620、18至640、18至660、18至680或18至700或由其鉴定,并包含H374N和H378N突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。甚至更优选地,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.1的序列的氨基酸18至710、18至720或18至730或由其鉴定,并包含H374N和H378N突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含H374N和H378N突变。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含H374N和H378N突变。
人ACE2片段的另一个变体可能是抑制ACE2脱落的变体。已经表明,ACE2通过裂解ACE2的胞外域而从人气道上皮细胞中脱落,而ADAM17调节ACE2的裂解。进一步,位于ACE2的胞外域的全长ACE2的亮氨酸584处的点突变消除了脱落(Jia et al.(2009)Am.J.Physiol.Lung Cell.Mol.Physiol.297(1):L84-96)。因此,在一个实施方案中,人ACE2片段的变体包含在亮氨酸584处的突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。在一个实施方案中,亮氨酸584处的突变是L584A突变。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含L584A突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含L584A突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含L584A突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含L584A突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2片段的变体包含H374N突变、H378N突变和L584A突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含H374N突变、H378N突变和L584A突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含H374N突变、H378N突变和L584A突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含H374N突变、H378N突变和L584A突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含H374N突变、H378N突变和L584A突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
人ACE2片段的另一个变体可能是抑制蛋白酶TMPRSS2对ACE2进行裂解的变体。已经表明,TMPRSS2对ACE2的蛋白水解增强SARS-CoV的进入((Heurich et al.(2014)J.Virol.88(2):1293-1307)。TMPRSS2在SARS-CoV-2进入细胞中也起作用(Hoffmann etal.(2020)Cell 181:1-10)。为了废除TMPRSS2对ACE2的裂解,可以对裂解所必需的氨基酸残基进行突变。已经表明,横跨ACE2的氨基酸697至716的氨基酸区域内的精氨酸和赖氨酸残基对TMPRSS2裂解ACE2至关重要(Heurich et al.(2014)J.Virol.88(2):1293-1307)。因此,在一个实施方案中,人ACE2片段的变体包含在选自氨基酸697、702、705、708、710和716的至少一个残基处的突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。优选地,人ACE2片段的变体包含在选自氨基酸697、702、705、708、710和716的至少两个或三个残基处的突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。更优选地,人ACE2片段的变体包含在选自氨基酸697、702、705、708、710和716的至少四个或五个残基处的突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。最优选地,人ACE2片段的变体包含在残基697、702、705、708、710和716处的突变,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。这些残基中的任何一处的野生型氨基酸残基可以突变为任何其他氨基酸,特别是野生型氨基酸残基突变为丙氨酸。
在一个实施方案中,人ACE2片段的变体包含以下突变中的至少一个:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。优选地,人ACE2片段的变体至少包含以下突变中的两个或三个:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。更优选地,人ACE2片段的变体包含以下突变中的至少四个或五个:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。最优选地,人ACE2片段的变体包含以下突变:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。
人ACE2片段的变体可以进一步包含在残基619、621和/或625处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。特别地,人ACE2片段的变体可以进一步包含以下突变:K619A、R621A和/或K625A,该编号参照SEQ ID No.1。
因此,在一个实施方案中,人ACE2片段的变体包含以下突变:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含在选自氨基酸697、702、705、708、710和716的至少一个残基处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含在残基697、702、705、708、710和716处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含以下突变中的至少一个:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含以下突变:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含在选自氨基酸697、702、705、708、710和716的至少一个残基处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含在残基697、702、705、708、710和716处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含以下突变中的至少一个:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含以下突变:R697A,K702A,R705A,R708A,R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和以下突变:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和以下突变:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含在选自氨基酸619、621、625、697、702、705、708、710和716的至少一个残基处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含在残基619、621、625、697、702、705、708、710和716处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含下列突变中的至少一个:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ IDNo.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含以下突变:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含在选自氨基酸619、621、625、697、702、705、708、710和716的至少一个残基处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含在残基619、621、625、697、702、705、708、710和716处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含下列突变中的至少一个:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ IDNo.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含以下突变:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和下列突变:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和下列突变:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含在选自氨基酸697、702、705、708、710和716的至少一个残基处的突变,该编号参照SEQ IDNo.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含在残基697、702、705、708、710和716处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含下列突变中的至少一个:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含以下突变:R697A,K702A,R705A,R708A,R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含在选自氨基酸697、702、705、708、710和716的至少一个残基处的突变,该编号参照SEQ IDNo.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含在残基697、702、705、708、710和716处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含下列突变中的至少一个:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含以下突变:R697A,K702A,R705A,R708A,R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和以下突变:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和以下突变:R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含在选自氨基酸619、621、625、697、702、705、708、710和716的至少一个残基处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含在残基619、621、625、697、702、705、708、710和716处的突变,该编号参照SEQID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含下列突变中的至少一个:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含以下突变:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含在选自氨基酸619、621、625、697、702、705、708、710和716的至少一个残基处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含在残基619、621、625、697、702、705、708、710和716处的突变,该编号参照SEQID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含下列突变中的至少一个:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含以下突变:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和以下突变:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由鉴定,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和以下突变:K619A、R621A、K625A、R697A、K702A、R705A、R708A、R710A和R716A,该编号参照根据SEQ ID No.1的序列。
人ACE2片段的另一个变体可能是为两个ACE2分子之间形成二硫桥提供额外的半胱氨酸的变体。二硫桥增加了融合蛋白的内在稳定性,也可能对融合蛋白与靶标的结合产生影响。额外的半胱氨酸可以通过用半胱氨酸取代SEQ ID NO.1的编号中的丝氨酸645来提供。
因此,在一个实施方案中,人ACE2片段的变体包含S645C突变,该编号参照SEQ IDNo.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含S645C突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含S645C突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和S645C突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和S645C突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含S645C突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含S645C突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和S645C突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和S645C突变,该编号参照SEQ ID No.1。
人ACE2片段的另一个变体可以是抑制二聚化的变体。因此,在一个实施方案中,人ACE2片段的变体包含氨基酸Q139处的突变,该编号参照SEQ ID No.1。在一个实施方案中,人ACE2片段的变体包含Q139A突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,并包含Q139A突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含Q139A的突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的序列组成,包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和Q139A突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.3的序列组成,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和Q139A突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.14的序列组成,并包含Q139A突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段由根据SEQ ID No.14的序列组成,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和Q139A突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含Q139A突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含或由根据SEQ ID No.3的序列鉴定,并包含Q139A突变,编号指SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.2的序列或由其鉴定,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和Q139A突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.3的序列或由其鉴定,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和Q139A突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.14的序列或由其鉴定,并包含Q139A突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,人ACE2的片段包含根据SEQ ID No.14的序列或由其鉴定,并包含H374N突变、H378N突变、L584A突变和Q139A突变,该编号参照SEQ ID No.1。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白的第二部分包含人IgG的Fc部分。人IgG的Fc部分可以是IgG1、IgG2、IgG3或IgG4的Fc部分。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白的第二部分包含人IgG4的Fc部分。人IgG4的Fc部分包含人IgG4的CH2和CH3域,其连接在一起形成Fc部分。在全长的人IgG4抗体中,Fc部分通过铰链区与Fab片段相连。Fab片段包含重链可变区和CH1域。优选地,本发明融合蛋白中使用的人IgG4的Fc部分具有根据SEQ ID No.5的序列。
由于IgG4亚类抗体对Fcγ受体只有部分亲和力,并且不激活补体(见Muhammed(2020)Immunome Res.16(1):173),它不以与IgG1亚类抗体相同的程度激活免疫系统。因此,刺激细胞因子的表达的程度较低,细胞因子风暴的风险也会降低。IgG4亚类抗体能够与FcRn结合。
“人IgG4的Fc部分的变体”是指人IgG4的Fc部分与根据SEQ ID No.5的人IgG4的野生型Fc部分相比有一个或多个氨基酸取代。在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体与根据SEQ ID No.5的人IgG4的野生型Fc部分相比有一至十二、一至十一、一至十、一至九、一至八、一至七、一至六、一至五、一至四、一至三、一或两个氨基酸取代。在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体与根据SEQ ID No.5的人IgG4的野生型Fc部分相比有一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个、十一个或十二个氨基酸取代。在一个实施方案中,与根据SEQ ID No.5的人IgG4的野生型Fc部分相比,一个或多个氨基酸取代导致效应器功能降低。在一个实施方案中,与根据SEQ ID No.5的人IgG4的野生型Fc部分相比,一个或多个氨基酸取代导致半衰期增加。在一个实施方案中,一个或多个氨基酸取代与根据SEQID No.5的人IgG4的野生型Fc部分相比导致效应器功能降低,并且与根据SEQ ID No.5的人IgG4的野生型Fc部分相比导致半衰期增加。
在一个实施方案中,根据SEQ ID No.16,一个或多个氨基酸取代不产生IgG1的野生型Fc部分。在一个实施方案中,一个或多个氨基酸取代不给与改变后的IgG4 Fc部分野生型IgG1的效应器功能。
优选地,效应器功能的降低包括补体依赖性细胞毒性(CDC)的降低。更优选地,该CDC与根据SEQ ID No.5的人IgG4的野生型Fc部分的CDC相比,降低至少2倍、至少3倍、至少4倍或至少5倍。确定和量化CDC的方法对于技术人员来说是众所周知的。一般来说,CDC可以通过将与抗原结合部分融合的Fc部分与合适的靶细胞和补体一起温育并检测靶细胞的死亡来确定。补体募集可以通过使用ELISA板的C1q结合测定进行分析(见,例如,Schlothaueret al.(2016)Protein Eng.Des.Sel.29(10):457-466).
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含在选自根据SEQ IDNo.5的序列的F3、L4、G6、P7、F12、V33、N66和P98的氨基酸残基处的至少一个氨基酸取代。这些氨基酸残基对应于全长人IgG4的氨基酸残基F234、L235、G237、P238、F243、V264、N297和P329。已经表明,这些残基的氨基酸取代导致效应器功能降低(WO 94/28027;WO 94/29351;WO95/26403;WO 2011/066501;WO 2011/149999;WO 2012/130831;Wang et al.(2018)Protein Cell.9(1):63-73)。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代L4E/A,其对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代L235E/A。该变体具有降低的效应器功能,特别是降低的CDC。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代F3A和L4A,其对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代F234A和L235A。该变体具有降低的效应器功能,特别是降低的CDC。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代F3A、L4E、G6A和P7S,其对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代F234A、L235E、G237A和P238S。该变体具有降低的效应器功能,特别是降低的CDC。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代F12A和V33A,其对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代F243A和V264A。该变体具有降低的效应器功能,特别是降低的CDC。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代L4E和P98G,其对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代L235E和P329G。该变体具有降低的效应器功能,特别是降低的CDC。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代N66A/Q/G,其对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代N297A/Q/G。该变体具有降低的效应器功能,特别是降低的CDC。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含选自全长人IgG4的T250、M252、S254、T256、E258、K288、T307、V308、Q311、V427、M428、H433、N434和H435的氨基酸残基处的至少一个氨基酸取代。这些氨基酸残基对应于根据SEQ ID No.5的序列的氨基酸残基T19、M21、S23、T25、E27、K57、T76、V77、Q80、V196、M197、H202、N203和H204。已经表明,这些氨基酸取代导致含Fc蛋白的半衰期增加(WO 00/42072;WO 02/060919;WO 2004/035752;WO 2006/053301;WO 2009/058492;WO 2009/086320;US 2010/0204454;GB 2013/02878;WO 2013/163630;US 2019/0010243)。抗体或Fc融合蛋白的半衰期可以通过在施用抗体或Fc融合蛋白后的不同时间点测量血清中的抗体或Fc融合蛋白浓度并由此计算出半衰期来确定。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代M21Y、S23T和T25E,这对应于全长的人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代M252Y、S254T和T256E。该变体具有增加的半衰期。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代T19Q/E和M197L/F,这对应于全长的人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代T250Q/E和M428L/F。该变体具有增加的半衰期。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代N203S和V77W/Y/F,这对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代N434S和V308W/Y/F。该变体具有增加的半衰期。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代M21Y和M197L,这对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代M252Y和M428L。该变体具有增加的半衰期。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代T76Q和N203S,这对应于全长的人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代T307Q和N434S。该变体具有增加的半衰期。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代M197L和V77F,这对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代M428L和V308F。该变体具有增加的半衰期。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代Q80V和N203S,这对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代Q311V和N434S。该变体具有增加的半衰期。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代H202K和N203F,这对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代H433K和N434F。该变体具有增加的半衰期。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代E27F和V196T,这对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代E258F和V427T。该变体具有增加的半衰期。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代K57E和H204K,这对应于全长的人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代K288E和H435K。该变体具有增加的半衰期。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.5的序列中的氨基酸取代R178K,这对应于全长人IgG4的氨基酸序列中的氨基酸取代R409K。这个变体可以防止人IgG4的酸诱导聚集(参见Namisaki et al.(2020)PloS ONE 15(3):e0229027)。
在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体不包含根据SEQ ID No.5的序列中位置37、43、65、96、99、100、124、125、127、187和214中一个或多个处的氨基酸取代。在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体不包含Q37H、Q43K、F65Y、G96A、S99A、S100P、Q124R、E125D、M127L、R178K、E187Q和L214P中的一个或多个氨基酸取代。在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体不包含根据SEQ ID No.5的序列中位置37、43、65、96、99、100、124、125、127、187和214中任何处的任何氨基酸取代。在一个实施方案中,人IgG4的Fc部分的变体不包含Q37H、Q43K、F65Y、G96A、S99A、S100P、Q124R、E125D、M127L、R178K、E187Q和L214P中的任何氨基酸取代。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白的第二部分包含人IgG1的Fc部分或其变体。人IgG1的Fc部分包含人IgG1的CH2和CH3域,其连接在一起形成Fc部分。在全长的人IgG1抗体中,Fc部分通过铰链区与Fab片段相连。Fab片段包含重链可变区和CH1域。优选地,用于本发明融合蛋白的人IgG1的Fc部分具有根据SEQ ID No.16的序列。
“人IgG1的Fc部分的变体”是指人IgG1的Fc部分与根据SEQ ID No.16的人IgG1的野生型Fc部分相比有一个或多个氨基酸取代。在一个实施方案中,与根据SEQ ID No.16的人IgG1的野生型Fc部分相比,一个或多个氨基酸取代导致降低的效应器功能。
优选地,降低的效应器功能包括降低的补体依赖性细胞毒性(CDC)。更优选地,该CDC与根据SEQ ID No.16的人IgG1的野生型Fc部分的CDC相比,降低至少2倍、至少3倍、至少4倍或至少5倍。确定和量化CDC的方法对于技术人员来说是众所周知的,并且已经在上面进行了描述。
在一个实施方案中,人IgG1的Fc部分的变体包含在选自根据SEQ ID No.16的序列的L3、L4和P98的氨基酸残基处的至少一个氨基酸取代。这些氨基酸残基对应于全长人IgG1的氨基酸残基L234、L235和P329。
在一个实施方案中,人IgG1的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.16的序列中的氨基酸取代L4E/A,其对应于全长人IgG1的氨基酸序列中的氨基酸取代L235E/A。该变体具有降低的效应器功能,特别是降低的CDC。
在一个实施方案中,人IgG1的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.16的序列中的氨基酸取代L3A和L4A,其对应于全长人IgG1的氨基酸序列中的氨基酸取代L234A和L235A。该变体具有降低的效应器功能,特别是降低的CDC。
在一个实施方案中,人IgG1的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.16的序列中的氨基酸取代L3A、L4A、P98G,其对应于全长人IgG1的氨基酸序列中的氨基酸取代L234A、L235A和P329G。该变体具有降低的效应器功能,特别是降低的CDC。
在一个实施方案中,人IgG1的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.16的序列中的氨基酸取代L4A和P98G,其对应于全长人IgG1的氨基酸序列中的氨基酸取代L235A和P329G。该变体具有降低的效应器功能,特别是降低的CDC。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白的第二部分包含人IgG2或IgG3的Fc部分或人IgG1、IgG2或IgG3的Fc部分的变体,该融合蛋白与包含相同的第一部分和包含野生型人IgG1的Fc部分的第二部分的融合蛋白相比,具有降低的与FcγRIIIa的结合。与根据SEQ IDNo.16的包含相同的第一部分和包含野生型人IgG1的Fc部分的第二部分的融合蛋白的结合相比,该融合蛋白与FcγRIIIa的结合降低至少2倍、至少3倍、至少4倍、至少5倍或至少10倍。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白的第二部分包含人IgG2或IgG3的Fc部分或人IgG1、IgG2或IgG3的Fc部分的变体,该融合蛋白与包含相同的第一部分和包含野生型人IgG1的Fc部分的第二部分的融合蛋白相比,具有降低的与FcγRIIIa的结合以及基本相同的与FcRn的结合。术语“基本相同的与FcRn的结合”是指与根据SEQ ID No.16的包含相同的第一部分和包含野生型人IgG1的Fc部分的第二部分的融合蛋白比,包含人IgG2或IgG3的Fc部分或人IgG1、IgG2或IgG3的Fc部分的变体的融合蛋白与FcRn的结合差异不超过20%或不超过15%,优选不超过10%或不超过5%,更优选不超过3%或不超过2%,最优选不超过1%。
如本文实施例中所述,融合蛋白与FcγRIIIa或FcRn的结合可以通过表面等离子体共振来确定。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白的第一部分和第二部分通过连接序列连接。连接序列是短的氨基酸序列,它本身不具有功能,也不影响融合蛋白的折叠。在一个实施方案中,连接序列包含8至20个氨基酸,优选10至18个氨基酸,更优选11至17个氨基酸或12至16个氨基酸,最优选13个氨基酸。
在一个实施方案中,连接序列由选自甘氨酸和丝氨酸的小氨基酸组成。Chen etal.(2013)Adv.Drug Deliv.Rev.65(10):1357-1369中提供了连接序列的概述。
在一个实施方案中,如果融合蛋白的第二部分是人IgG4的Fc部分,连接序列由人IgG4的铰链区组成。在一个实施方案中,连接序列由根据SEQ ID No.4的序列组成。在根据SEQ ID No.4的序列中,IgG4野生型铰链区的残基10处的丝氨酸(对应于全长IgG4的丝氨酸228)由脯氨酸取代,导致IgG半分子的交换减少。众所周知,IgG4抗体可以进行Fab臂交换,导致两个不同的Fab臂的结合,并产生新的双特异性抗体分子(参见,例如,Aalberse etal.(2009)Clin.Exp.Allergy 39(4):469-477)。通过Fc区的丝氨酸228突变为脯氨酸可以防止该Fab臂的交换(S228P;参见Silva et al.(2015)J.Biol.Chem.290:5462-5469),该突变位于IgG4的铰链区。进一步,使用短的连接序列增加了融合蛋白的稳定性,降低了融合蛋白对蛋白酶的可及性。
在特定的实施方案中,本发明的融合蛋白具有根据SEQ ID No.6的氨基酸序列,该序列包含人ACE2(SEQ ID No.2)的氨基酸18至732,连接序列根据SEQ ID No.4和人IgG4的Fc部分根据SEQ ID No.5。
在另一个特定的实施方案中,本发明的融合蛋白具有根据SEQ ID No.7的氨基酸序列,该序列包含人ACE2(SEQ ID No.3)的氨基酸18至740,根据SEQ ID No.4的连接序列和根据SEQ ID No.5的人IgG4的Fc部分。
在另一个特定的实施方案中,本发明的融合蛋白具有根据SEQ ID No.8的氨基酸序列,该序列包含有H374N和H378N突变的人ACE2(SEQ ID No.2)的氨基酸18至732,该编号参照SEQ ID No.1,连接序列根据SEQ ID No.4和人IgG4的Fc部分根据SEQ ID No.5。
在另特定的一个实施方案中,本发明的融合蛋白具有根据SEQ ID No.9的氨基酸序列,该序列包含具有H374N和H378N突变的人ACE2(SEQ ID No.3)的氨基酸18至740,该编号参照SEQ ID No.1,连接序列根据SEQ ID No.4和人IgG4的Fc部分根据SEQ ID No.5。
在一个实施方案中,如果融合蛋白的第二部分是人IgG1的Fc部分,连接序列由人IgG1的铰链区组成。在一个实施方案中,连接序列由根据SEQ ID No.15的序列组成。
在特定的实施方案中,本发明的融合蛋白具有根据SEQ ID No.10的氨基酸序列,该序列包含人ACE2(SEQ ID No.2)的氨基酸18至732,连接序列根据SEQ ID No.15和人IgG1的Fc部分根据SEQ ID No.16。
在另一个特定的实施方案中,本发明的融合蛋白具有根据SEQ ID No.12的氨基酸序列,该序列包含有H374N和H378N突变的人ACE2(SEQ ID No.2)的氨基酸18至732,该编号参照SEQ ID No.1,连接序列根据SEQ ID No.15和人IgG1的Fc部分根据SEQ ID No.16。
本发明还涉及核酸分子,其包含编码本发明融合蛋白的核酸序列。当蛋白质的氨基酸序列已知时技术人员知道如何构建核酸分子。特别是,核酸分子的构建涉及使用三字母遗传密码将蛋白质的氨基酸序列反翻译成核酸序列,并选择性地考虑到要使用核酸分子表达蛋白质的宿主细胞的密码子用法。
在一个实施方案中,包含编码本发明融合蛋白的核酸序列的核酸分子是分离的核酸分子。术语“分离的核酸分子”是指被鉴定并与在其产生的环境中通常与该核酸分子有关的至少一种污染核酸分子分离的核酸分子。优选地,分离的核酸与与生产环境有关的所有组分没有关联。
本文所用的术语“载体”是指能够传播与其连接的另一种核酸的核酸分子。该术语包含作为自我复制的核酸结构的载体,以及纳入其被引入的宿主细胞基因组的载体。某些载体能够引导它们可操作地连接的核酸的表达。此类载体在这里被称为“表达载体”。
表达载体含有用于表达核酸的元件,如合适的启动子和多腺苷酸化信号。此外,表达载体通常含有在合适的启动子控制下的选择标志物基因,以使含有表达载体的细胞与不含表达载体的细胞相区别。构建适合表达重组蛋白,如本发明的融合蛋白的表达载体所需的元件和方法是技术人员所熟知的,例如在Makrides et al.(1999)ProteinExpr.Purif.17:183-202和Kaufman(2000)Mol.Biotechnol.16:151-161中描述的。
表达载体被用来转化,即对合适的宿主细胞进行基因改造。
技术人员知道将表达载体引入哺乳动物细胞的方法。这些方法包括使用市售的转染试剂盒,如ThermoFisher的Polyplus Sciences的PEImax)、293-Free转染试剂(Millipore)或Invitrogen的Freestyle Max。进一步合适的方法包括电穿孔、磷酸钙介导的转染和DEAE-葡聚糖转染。在转染后,通过用基于表达载体编码的选择标志物的适当药剂处理,对细胞进行选择,以鉴定含有重组核酸分子的稳定转染细胞。
术语“宿主细胞”、“宿主细胞系”和“宿主细胞培养”可互换使用,指的是已引入外源核酸或表达载体的细胞,包括此类细胞的后代。宿主细胞包括“转化体”和“转化细胞”,其中包括原代转化细胞和由此衍生的后代,不考虑传代次数。
本发明的融合蛋白优选在哺乳动物宿主细胞中产生。适合表达本发明融合蛋白的哺乳动物宿主细胞包括中国仓鼠卵巢(CHO)细胞(包括使用DHFR可选择标记的dhfr阴性CHO细胞)、NS0骨髓瘤细胞、COS细胞、SP2细胞、猴肾CV1、人胚胎肾系293、小仓鼠肾细胞(BHK)、小鼠Sertoli细胞(TM4)、非洲绿猴肾细胞(VERO-76)、人宫颈癌细胞(HELA)、犬肾细胞(MDC)、水牛大鼠肝细胞(BRL 3A)、人肺细胞(W138)、人肝细胞(Hep G2)、小鼠乳腺肿瘤细胞(MMT 060562)、TRI细胞、MRC 5细胞和FS4细胞。更优选地,宿主细胞衍生自啮齿类动物。最优选地,哺乳动物细胞是中国仓鼠卵巢(CHO)细胞。
为了生产本发明的融合蛋白,将宿主细胞在适当的培养基中进行培养。
术语“培养基(medium)”、“细胞培养基”和“培养基(culture medium)”在此可互换使用,指的是含有哺乳动物细胞生长所需营养物质的溶液。通常,细胞培养基提供细胞达到最小的生长和/或生存所需的必需和非必需氨基酸、维生素、能量源、脂类和微量元素。细胞培养基还可以包含生长因子。优选地,该培养基是化学限定的,即其所有组分及其浓度是已知的。同样优选地,该培养基不含血清和水解物,不含任何衍生自动物的组分。在更优选的实施方案中,培养基不含血清和水解物,不含任何衍生自动物的组分或胰岛素。
在一个实施方案中,本发明方法中使用的培养基是市售的培养基,如FreeStyle293表达培养基(Life Technologies)、PolCHO P Powder Base CD、ActiPro(均可从GE获得)、PowerCHO-2、ProCHO-5(均可从Lonza获得)或Advanced CHO补料分批(fed batch)培养基(可从Sigma获得)。
对于培养哺乳动物细胞,有不同的策略,包含分批培养、灌注培养、连续培养和补料分批培养。优选地,采用补料分批培养的过程。在补料分批培养中,培养过程从一定量的基础培养基开始,在培养过程的后期补料包含一种或多种营养物质的一种或多种补料培养基,以防止营养物质的消减,同时不从细胞培养液中去除产物。因此,术语“补料(feeding)”是指将至少一种组分添加到已有的细胞培养物中。
术语“基础培养基”是指从细胞培养过程开始使用的培养基。将哺乳动物细胞接种到基础培养基中,并在此培养基中生长一段时间,直到开始补料。基础培养基符合上述培养基的定义。如果使用市售的培养基,可以在基础培养基中添加额外组分。
细胞在基础培养基中培养一段时间后将补料培养基添加到细胞培养中。补料培养基的作用是防止营养物质的耗竭,因此它的组分可能与基础培养基不一样。特别是,一种或多种营养物质的浓度在补料培养基中可能比在基础培养基中高。在一个实施方案中,补料培养基具有与基础培养基相同的组分。在另一个实施方案中,补料培养基具有与基础培养基相同的另一种组分。补料培养基可以连续添加,也可以在规定的时间点以大剂量(bolus)方式添加。
合适的补料培养基是技术人员已知的,包括PolCHO Feed-A Powder Base CD、PolCHO Feed-B Powder Base CD、Cell Boost 7a和Cell Boost 7b(均可从GE获得)、CHO Feed 3培养基(可从Irvine Scientific获得)和EX-AdvancedCHO Feed 1(可从Sigma获得)。
宿主细胞的培养可以在恒定的温度下进行,例如在37℃±0.2℃的温度下进行。或者,培养温度可以从第一温度降低到第二温度,即主动调低温度。因此,第二温度比第一温度低。第一温度可以是37℃±0.2℃。第二温度可在30℃至36℃的范围内。
通过在合适的培养基中培养宿主细胞而产生本发明的融合蛋白后,从细胞培养物中收获融合蛋白。由于从哺乳动物细胞中表达的Fc融合蛋白通常在培养过程中分泌到细胞培养液中,因此在培养过程结束时,通过从细胞中分离包含融合蛋白的细胞培养液来收获产物。细胞分离方法应该是温和的,以尽量减少细胞的破坏,避免细胞碎片的增加和蛋白酶和其他分子的释放,从而影响融合蛋白产物的质量。通常,收获包含融合蛋白的细胞培养液涉及离心和/或过滤,据此,融合蛋白分别存在于上清液和滤液中。扩张床吸附色谱法是避免离心/过滤方法的替代方法。
在收获含有融合蛋白的细胞培养液后,必须将融合蛋白从细胞培养液中纯化出来。Fc融合蛋白的纯化通常通过一系列标准技术完成,其中包括色谱步骤,如阴离子交换色谱、阳离子交换色谱、亲和色谱,特别是蛋白A亲和色谱、疏水作用色谱、羟基磷灰石色谱和尺寸排阻色谱法。进一步,纯化过程可包含一个或多个超滤、纳滤或双滤,以及切向流过滤和/或交叉流过滤步骤。
纯化融合蛋白后,可用于制备药物组合物。药物组合物是旨在向患者递送的组合物,用于治疗或预防疾病或病况。除了活性剂,即本发明的融合蛋白外,药物组合物通常还含有至少一种药学上可接受的赋形剂。药学上可接受的赋形剂是不干扰融合蛋白的生理活性的物质,它可以稳定药物组合物和/或增强药物组合物的溶解度或降低其粘度。重组蛋白的典型药学上可接受的赋形剂包括缓冲剂、盐、糖或糖醇、氨基酸和表面活性剂。
该药物组合物包含治疗有效量的本发明的融合蛋白。术语“治疗有效量”是指本发明的融合蛋白的量足以治疗特定的病症、病况或疾病,如改善、缓解、减轻和/或延迟其一个或多个症状。对于冠状病毒的感染,特别是SARS-CoV-2,本发明的治疗有效量的融合蛋白可以改善、缓解、减轻和/或延缓选自咳嗽、气短、呼吸困难、发烧、发冷、疲倦、肌肉酸痛、喉咙痛、头痛、胸痛和嗅觉和/或味觉丧失的一个或多个症状。治疗有效量可分一次或多次施用。
本发明的融合蛋白用于医疗用途,即意在用于预防和/或治疗疾病。
如本文所使用的,“治疗(treatment或treating)”是获得有益或期望的结果(包括临床结果)的方法。就本发明而言,有益的或期望的临床结果包括但不限于以下一项或多项:缓解由疾病引起的一项或多项症状,减轻疾病的程度,稳定疾病(例如。防止或推迟疾病的恶化),防止或推迟疾病的扩散,防止或推迟疾病的复发,推迟或减缓疾病的发展,改善疾病状态,提供疾病的缓解(部分或全部),减少治疗疾病所需的一种或多种其他药物的剂量,和/或延长生存期。本发明的用途设想了这些治疗的任何一个或多个方面。
术语“预防”和类似的词,如“防止”等,表示预防、抑制或减少疾病或病况复发的可能性的方法。它还指延迟疾病或病况的复发或延迟疾病或病况的症状复发。如本文所用,“预防”和类似术语还包括在疾病或病况复发之前减少该疾病或病况的强度、影响、症状和/或负担。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于预防和/或治疗与ACE2结合的冠状病毒的感染。冠状病毒是有包膜的病毒,具有正义的单链RNA基因组和二十面体的蛋白壳。由S1和S2亚基组成的刺突蛋白形成同源三聚体,从包膜中伸出,通过与ACE2结合介导与靶细胞的相互作用。冠状病毒经常引起人和其他哺乳动物以及鸟类的呼吸道疾病。在人中,已知有七种冠状病毒株:HCoV-OC43、HCoV-HKU1、HCoV-229E、HCoV-NL63、MERS-CoV、SARS-CoV和SARS-CoV-2。前四种冠状病毒株(HCoV-OC43、HCoV-HKU1、HCoV-229E、HCoV-NL63)只引起轻微症状,而感染MERS-CoV、SARS-CoV和SARS-CoV-2可能导致严重的、可能危及生命的疾病。
已经证明SARS-CoV、SARS-CoV-2和HCoV-NL63与ACE2结合,并利用这种结合进入靶细胞(Li et al.(2003)Nature 426(6965):450-4;Hoffmann et al.(2020)Cell 181:1-10;Hofmann et al.(2005)Proc Natl Acad Sci U S A.102(22):7988-93)。因此,本发明的融合蛋白可用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,特别是感染SARS-CoV、SARS-CoV-2或HCoV-NL63。通过用表达冠状病毒刺突蛋白和报告蛋白的假型VSV(水泡性口炎病毒)瞬时或构成性地接种表达ACE2的细胞,并在接种期后检测报告蛋白的活性,可以鉴定与ACE2结合的进一步冠状病毒(参见Hoffmann et al.(2020)Cell 181:1-10的方案)。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒感染,其中与ACE2结合的冠状病毒不是SARS-CoV。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2或SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代D614G和/或氨基酸取代N439K。包含D614G氨基酸取代的SARS-CoV-2变体在Korber etal.(2020)Cell 182(4):812-827中描述,而氨基酸取代N439K在Thomson et al.(2021)Cell 184(5):1171,1187.e20中描述;可获于https://doi.org/10.1101/ 2020.11.04.355842。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代D614G。氨基酸取代D614G是由武汉参照毒株中23,403位的A-G核苷酸突变引起的。变体中氨基酸的编号是指根据SEQ ID No.18的SARS-CoV-2的刺突蛋白中的编号。因此,将具有根据SEQ ID No.18的刺突蛋白的SARS-CoV-2病毒定义为野生型SARS-CoV-2,任何变体都是由它衍生出来的。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,包含氨基酸取代D614G和至少一个额外氨基酸取代。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代D614G、N501Y、A570D、P681H、T716I、S982A和D1118H,并包含氨基酸69、70和145的缺失。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代D614G、Y453F、I692V和M1229I,并包含氨基酸69和70的缺失。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是包含氨基酸取代D614G、S13I、W152C和L452R的SARS-CoV-2的变体。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代D614G、E484K和V1176F。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代D614G、L18F、T20N、P26S、D138Y、R190S、K417T、E484K、N501Y、H655Y、T1027I和V1176F。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代D614G、D80A、D215G、K417N、E484K、N501Y和A701V,并包含氨基酸242、243和244的缺失。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代D614G、L18F、D80A、D215G、K417N、E484K、N501Y和A701V,并包含氨基酸242、243和244的缺失。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代D614G、D80A、R246I、K417N、E484K、N501Y和A701V,并包含氨基酸242、243和244的缺失。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代E484Q和L452R。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代E484K和D614G,并包含氨基酸145和146的缺失。
变体中氨基酸的编号是指根据SEQ ID NO.18的SARS-CoV-2的刺突蛋白中的编号。为了定义变体,将根据SEQ ID NO.18的氨基酸序列认为是SARS-CoV-2的刺突蛋白的野生型序列。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域中的一个或多个氨基酸取代。SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域包含SEQ ID No.18的氨基酸331至524(参见Tai et al.(2020)Cell.Mol.Immunol.17:613-620)。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是包含氨基酸取代N501Y的SARS-CoV-2变体。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代E484K。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,其包含氨基酸取代K417T/N。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,与包含根据SEQ ID No 18的野生型刺突蛋白的SARS-CoV-2相比,其与ACE2的结合亲和力更高。SARS-CoV-2的变体对ACE2的亲和力例如可以用假病毒测定来确定。假病毒测定使用慢病毒,用野生型SARS-CoV-2或其变体的S蛋白将其假型化,并含有报告基因,如荧光素酶基因。此类慢病毒例如可以从BPSBioscience获得。将假型慢病毒与表达ACE2的细胞进行温育,使病毒进入细胞并表达报告基因。如果用变体SARS-CoV-2的S蛋白假型化的慢病毒的报告基因的表达高于用野生型SARS-CoV-2的S蛋白假型化的慢病毒的报告基因的表达,则该变体对ACE2的结合亲和力更高。在本发明的背景下,已经发现本发明的融合蛋白对那些与ACE2有较高结合亲和力的变体,如变体B.1.1.7,具有较高的亲和力。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白用于治疗和/或预防与ACE2结合的冠状病毒的感染,其中与ACE2结合的冠状病毒是SARS-CoV-2的变体,与包含根据SEQ ID No 18的野生型刺突蛋白的SARS-CoV-2相比具有更高的传播性。病毒的传播性可以用基本繁殖数R0来确定,它是指平均有多少人会从一个有传染性的人身上感染疾病。
施用途径符合已知和接受的方法,例如,通过皮下、静脉、腹膜内、肌肉内、动脉内、病灶内或关节内途径注射或输注。在另一个实施方案中,本发明的融合蛋白要进行鼻内施用,例如通过鼻腔喷雾、鼻腔软膏或鼻腔滴剂的方式。在另一个实施方案中,本发明的融合蛋白通过局部施用或吸入施用。优选地,本发明的融合蛋白通过静脉注射或输注施用。
本发明的药物组合物的剂量和所需的药物浓度可根据设想的特定用途而变化。确定适当的剂量或施用途径完全属于普通技术人员的技能范围。动物实验为确定人疗法的有效剂量提供了可靠的指导。有效剂量的种间比例可以按照Mordenti,J.and Chappell,W.“The Use of Interspecies Scaling in Toxicokinetics,”In Toxicokinetics and NewDrug Development,Yacobi et al.,Eds,Pergamon Press,New York 1989,pp.42-46的原则进行。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白以0.1mg/kg体重至4mg/kg体重的剂量进行静脉施用,如0.1mg/kg体重、0.2mg/kg体重、0.3mg/kg体重、0.4mg/kg体重、0.5mg/kg体重、0.6mg/kg体重、0.7mg/kg体重、0.8mg/kg体重、0.9mg/kg体重、1.0mg/kg体重、1.1mg/kg体重、1.2mg/kg体重、1.3mg/kg体重、1.4mg/kg体重、1.5mg/kg体重、1.6mg/kg体重、1.7mg/kg体重、1.8mg/kg体重、1.9mg/kg体重、2.0mg/kg体重、2.1mg/kg体重、2.2mg/kg体重、2.3mg/kg体重、2.4mg/kg体重、2.5mg/kg体重、2.6mg/kg体重、2.7mg/kg体重、2.8mg/kg体重、2.9mg/kg体重、3.0mg/kg体重、3.1mg/kg体重、3.2mg/kg体重、3.3mg/kg体重、3.4mg/kg体重、3.5mg/kg体重、3.6mg/kg体重、3.7mg/kg体重、3.8mg/kg体重、3.9mg/kg体重或4.0mg/kg体重的剂量。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白以10mg/kg体重至150mg/kg体重的剂量进行静脉施用,如10mg/kg体重、15mg/kg体重、20mg/kg体重、25mg/kg体重、30mg/kg体重、35mg/kg体重、40mg/kg体重、45mg/kg体重、50mg/kg体重、55mg/kg体重、60mg/kg体重、65mg/kg体重、70mg/kg体重、75mg/kg体重、80mg/kg体重、85mg/kg体重、90mg/kg体重、95mg/kg体重、100mg/kg体重、105mg/kg体重、110mg/kg体重、115mg/kg体重、120mg/kg体重、125mg/kg体重、130mg/kg体重、135mg/kg体重、140mg/kg体重、145mg/kg体重或150mg/kg体重的剂量。
融合蛋白可以每天一次、两次、三次、每隔一天、每周一次或每两周一次施用。
融合蛋白的施用时间段可以是三天、四天、五天、六天、七天、八天、九天或十天。
通过施用本发明的融合蛋白,冠状病毒,特别是SARS-CoV-2的感染得到了治疗,即至少有一种感染SARS-CoV-2的症状被减轻或消除。感染SARS-CoV-2的症状包含咳嗽、气短、呼吸困难、发烧、发冷、疲倦、肌肉酸痛、喉咙痛、头痛、胸痛和失去嗅觉和/或味觉。在一个实施方案中,通过施用本发明的融合蛋白,由SARS-CoV-2感染引起的发烧得以减少。在一个实施方案中,向受试者施用本发明的融合蛋白可降低受试者经历SARS-CoV-2严重感染过程的风险。在一个实施方案中,向受试者施用本发明的融合蛋白可降低受试者出现多器官衰竭、急性呼吸窘迫综合征(ARDS)或肺炎的风险。在一个实施方案中,向受试者施用本发明的融合蛋白可降低受试者经历SARS-CoV-2感染的长期影响的风险,如肺部损伤、神经系统病症、皮肤病和心血管疾病。在一个实施方案中,向受试者施用本发明的融合蛋白可降低血液中细胞因子IL6和/或IL8的浓度。在一个实施方案中,向受试者施用本发明的融合蛋白可降低血液中SARS-CoV-2病毒颗粒的浓度。在一个实施方案中,给受试者施用本发明的融合蛋白可刺激抗病毒抗体的产生。在一个实施方案中,给受试者施用本发明的融合蛋白可刺激抗病毒IgA和/或IgG抗体的产生。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白施用于患有SARS-CoV-2严重感染的受试者。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白施用于感染了SARS-CoV-2并需要人工通气的受试者。在一个实施方案中,本发明的融合蛋白施用于感染SARS-CoV-2并需要体外膜氧合(ECMO)的受试者。
通过施用本发明的融合蛋白,可以预防冠状病毒,特别是SARS-CoV-2的感染,即接受治疗的受试者不出现SARS-CoV-2感染的症状。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白施用于与感染SARS-CoV-2的受试者接触过的受试者。与感染SARS-CoV-2的受试者接触过的受试者可以通过使用安装在智能手机上的“Corona警告应用程序”来鉴定。
在一个实施方案中,本发明的融合蛋白施用于受试者,所述受试者的咽喉或鼻拭子的测试表明其感染了SARS-CoV-2,但其没有出现任何感染SARS-CoV-2的症状。
在治疗或预防与ACE2结合的冠状病毒,特别是SARS-CoV-2的感染时,本发明的融合蛋白可与已知的抗病毒剂相结合。抗病毒剂是用于治疗病毒感染的药物,包含特异性抗病毒剂和广谱性病毒剂。合适的抗病毒剂包含但不限于核苷类似物、病毒蛋白酶抑制剂、病毒聚合酶抑制剂、病毒进入细胞的阻断剂、Janus激酶抑制剂,还包含炎症介质的抑制剂。
在具体实施方案中,抗病毒剂选自由瑞德西韦、盐酸阿比多尔、利托那韦、洛匹那韦、达芦那韦、利巴韦林、氯喹及其衍生物,如羟氯喹、硝唑尼特、卡莫司他、甲磺酸盐,抗IL6和抗IL-6受体抗体,如托珠单抗、斯妥昔单抗和沙利鲁单抗和磷酸巴瑞替尼组成的组。
除了结合冠状病毒的功能外,ACE2还与一些病症和疾病有关,如高血压病(包含高血压)、充血性心力衰竭、慢性心力衰竭、急性心力衰竭、收缩性心力衰竭、心肌梗死、动脉硬化、肾衰竭、肾脏衰竭、急性呼吸窘迫综合征(ARDS)、急性肺损伤(ALI)、慢性阻塞性肺疾病(COPD)、肺动脉高压、肾脏纤维化、慢性肾脏衰竭、急性肾脏衰竭、急性肾损伤、炎症性肠病和多器官功能障碍综合征。因此,本发明的融合蛋白也可用于治疗这些病症和疾病。
虽然本发明已在附图和前述描述中进行了详细说明和描述,但此类说明和描述应被视为说明性或示例性的,而不是限制性的。本发明不限于所公开的实施例。通过对附图、公开内容和从属权利要求的研究,本领域技术人员在实施要求保护的发明时可以理解并实现对公开的实施方案的其他变化。
详细描述只是示例性的,并不意在限制应用和用途。下面的实施例进一步说明了本发明,但并没有将本发明的范围限制在其上。本领域的技术人员可以在本发明描述的基础上做出各种改变和修改,此类改变和修改也包括在本发明中。
实施例
A.材料和方法
1.融合蛋白的构建
构建了四种本发明的融合蛋白。此外,还构建了四种包含人IgG1的Fc部分而非人IgG4的Fc部分的融合蛋白作为比较例。下表1显示了融合蛋白的部分。
表1:测试的融合蛋白的部分
使用HindIII/XhoI限制性酶将编码该构建体的核酸序列插入表达载体pcDNA3.1(Invitrogen V860-20)的变体中。将根据SEQ ID No.17的白蛋白信号序列附接到构建体的N端。然后使用FreeStyle表达系统(可从ThermoFisher获得)用该表达载体瞬时转染293细胞。在第六天,分析样品的细胞存活力和细胞密度,并且通过两步离心收获上清液并进行无菌过滤。将材料合并,并且将一半储存在-80℃直到纯化。另一半则进行蛋白A纯化。此外,从合并物里取少量样品(约0.5ml)以通过生物层干涉法(BLI)确定表达。
2.蛋白质的纯化
瞬时材料的纯化通过蛋白A柱色谱法和随后的制备SEC进行。对于蛋白A的纯化,在装载样品后,清洗柱,并使用40mM NaAc,pH=3.0洗脱ACE2-Fc融合蛋白。洗脱后,样品首先用1M Tris,pH=9.0中和至pH=7.5,随后用50mM Tris,pH=7.5,300mM NaCl以1:1稀释,并用旋转过滤器浓缩至10mg/mL。浓缩的蛋白质用Superdex 200增加柱(GE Healthcare)进一步纯化,该柱用50mM Tris,pH=7.5,150NaCl平衡。将主峰合并,将蛋白质浓度调整到1mg/ml,通过无菌过滤器,并储存在4℃,直到进一步使用。
3.通过斜率光谱测定法确定蛋白质浓度(A280)
不同的ACE2-Fc融合蛋白的纯化材料通过斜率光谱学进行分析,以确定蛋白质含量。检查了没有缓冲液干扰的验证,并且通过使用可变路径长度,在纯化过程中没有任何样品预稀释的前提条件下,准确测量了蛋白质浓度。
4.通过分析尺寸排阻色谱法确定高分子量种类
通过分析尺寸排阻色谱法(SEC)分析不同的纯化蛋白构建体。简而言之,使用Acquity UPLC Protein BEH SEC柱,4.6mm x 150mm,1.7μm将样品在Waters H-Class bio UPLC系统上进行分析。检测基于280nm处的UV吸光度。装载20μg样品,流动相由20mM磷酸钠pH=7.0,150mM NaCl组成,并且蛋白质以0.3mL/min的流速等度洗脱(elutedisocratically)。
5.稳定性研究
对于所有8个纯化的Fc融合蛋白,稳定性研究使用740μL(300μL备用)等分进行,该等分浓度为1mg/ml,在紧闭的小瓶中。每个Fc融合蛋白的一个小瓶首先在37℃下温育3周。随后,将每个Fc融合蛋白的第二小瓶添加到温育中。此外,再过2周后,将每个Fc融合蛋白的第3小瓶添加到温育中。温育又持续一周,因此第一组小瓶温育6周,第二组小瓶温育3周,以及第三组小瓶温育1周。最后,与在稳定性研究的最后一周同步,第四组小瓶在-80℃下经历3次冻融(F/T)循环。所有测试区间的样品,即6周、3周和1周的样品以及F/T样品均使用上述分析SEC的方法进行分析。对于T=0,来自使用纯化后的测试的数据。
6.通过Pepmap确定O-糖基化
纯化的ACE2-Fc融合蛋白通过使用UPLC-RP/MS的肽作图(peptide mapping)进行分析。蛋白质在盐酸胍中变性,然后在4℃下用DTT还原1小时,并在室温下黑暗中用碘乙酰胺烷基化30分钟。用胰蛋白酶和Lys-C酶的混合物对样品进行蛋白水解消化4小时。在C18反相UPLC(例如Peptide BEH C18,2.1x 300mm,1.7μm)柱上,使用Milli-Q中的0.1%甲酸和乙腈作为流动相,在60分钟的肽作图梯度中分离蛋白水解肽,初始保持时间为4.5分钟。应用两种不同的碰撞能量来提高糖肽的覆盖(15-30eV的低碰撞能量和60-100eV的高碰撞能量)。肽的检测通过214nm处的UV和使用来自Waters的Xevo G2-XS QToF质谱仪通过质谱法进行。在MSE模式下进行分析,除了通过MS的质量验证外,还通过碎片化(MS/MS)获得肽验证。MSE光谱用Waters UNIFI 1.9软件处理,其包括Waters MaxEnt3用于去卷积。在运行过程中使用单独的参照探针输注Glu1-纤维蛋白肽B,并用于质量锁定(lockmass)校正。去卷积质量与理论序列相匹配,前体离子质量的离子公差为10ppm,并且碎片离子质量的离子公差为20ppm。对于糖基化肽的鉴定,检索中包括了C-、N-和O-聚糖的有限文库。为了提高分配的置信度,检查糖基化肽的碎片光谱是否存在标志物离子(例如在m/z 292和204)。此外,对于序列覆盖图,排除少于3个碎片离子的肽。
7.确定融合蛋白与SARS-CoV-2的刺突蛋白的结合
a)表面等离子体共振
使用市售的SARS-CoV-2刺突蛋白(ACROBiosystems,Newark,USA),通过表面等离子体共振(Biacore)分析了融合蛋白与SARS-CoV-2的刺突蛋白的结合。
材料:
具有His标签和AviTag的SARS-CoV-2RBD来自Acrobiosystems(Cat.No.SPD-C82E9,Lot.No.BV3541b-2043F1-RD)。根据制造商的建议重构蛋白质,等分,在液氮中冲击冷冻(shock frozen),并储存在-80℃直至使用。每次测量都使用新鲜的等分。
运行缓冲液为从10X HBS-EP+(Cytiva)用MilliQ水以1:10稀释制备的1X HBS-EP+。稀释的缓冲液通过0.1μm的过滤器过滤。
使用了生物素CAPture试剂盒(Cytiva)和Biacore X-100系统用于测量。
方法:
用1X HBS-EP+缓冲液将ACE2-Fc稀释到200nM。在10mm的石英比色皿中通过UV光谱测定法验证浓度,使用1.84的A280,0.1%。用1X HBS-EP+将200nM的ACE2-Fc稀释到40、8、1.6和0.32nM。用1X HBS-EP+以1:100将解冻的SARS-CoV-2RBD域稀释至浓度为2μg/mL。
使用了单循环动力学方法。流量为30μL/min。在每次测量前,用三次注射的再生溶液来调节芯片。具有AviTag(Acrobiosystems)的SARS-CoV-2的固定化时间为30s。配体固定化后,在单循环动力学模式下,从低到高开始,在固定化配体上注射不同浓度的ACE2-Fc(0.32、1.6、8、40和200nM)。从仅用缓冲液注射的两个循环中获得基线。
在Biacore软件中使用产生KD的1:1的结合模型评估数据。
b)ELISA 1
为了量化融合蛋白与SARS-CoV-2的刺突蛋白的结合,进行了ELISA测定。用在包被缓冲液(15mM Na2 CO3,35mM NAHCO3,7.7mM NaN3,pH 9.6)中的0.2μg/孔的市售SARS-CoV-2刺突蛋白(ACROBiosystems,Newark,USA)包被ELISA板。用每孔300μL的清洗缓冲液(0.05%Tween-20在TBS中,pH7.4)清洗孔四次。用300μL封闭缓冲液(在清洗缓冲液中2%BSA,pH7.4)在37℃下封闭90分钟,然后用每孔300μL清洗缓冲液(0.05% Tween-20在TBS中,pH7.4)清洗孔4次。然后在每个孔中添加100μL连续稀释的融合蛋白,并将孔在37℃下温育一小时。融合蛋白在样品稀释缓冲液(在清洗缓冲液中0.5%BSA,pH7.4)中稀释。温育后,用每孔300μL的清洗缓冲液(在TBS中0.05% Tween-20,pH 7.4)清洗孔四次。然后,添加100μL辣根过氧化物酶缀合的抗人Fc抗体(在清洗缓冲液中的0.5%BSA中稀释,pH 7.4)至每个孔,并将孔在37℃下温育一小时。温育后,用每孔300μL的清洗缓冲液(在TBS中0.05%Tween-20,pH 7.4)清洗孔四次,然后添加200μL辣根过氧化物酶底物(8μLH2 O2和100μL10mg/ml TMB,在10ml底物溶液A(50mM Na2 HPO4 x 12H2 O,25mM柠檬酸,pH 5.5)中),并将孔在37℃下黑暗中温育20分钟。在添加50μL的1M硫酸至每个孔来终止反应。在ELISA读数器中,在OD450 nm处读板。
根据制造商的说明和调整的中和规程,使用ACE2:SARS-CoV-2Spike S1Inhibitor Screening Assay Kit(BPS Bioscience;Catalog#79945)测试SARS-CoV-2刺突S1蛋白与ACE2的结合的抑制作用。简而言之,将生物素化SARS-CoV-2刺突S1蛋白(25nM)与ACE2-Fc融合蛋白的连续稀释物在96孔中和板中在室温下缓慢摇动温育一小时(=中和混合物)。
ACE2蛋白以1μg/mL的浓度附接到镍包被的96孔板上,并在室温下缓慢摇动温育一小时。未结合的ACE2通过清洗步骤去除。随后,将中和混合物转移到ACE2包被的板,并在室温下缓慢摇动板温育一小时。在10分钟的封闭步骤后,用链霉亲和素-HRP在室温下缓慢摇动板温育1小时。经过清洗和10分钟的封闭,添加HRP底物,并在化学发光读数器上对板进行分析。
c)ELISA 2
为了量化融合蛋白与SARS-CoV-2的刺突蛋白的结合,进行了ELISA测测定。使用在包被缓冲液(PBS)中的100μL/孔,用1.0μg/mL的市售SARS-CoV-2刺突蛋白(SPN-C52H9,ACROBiosystems)包被ELISA板(NUNC)。将孔在4℃下温育过夜。第二天,去除包被,用每孔300μl的清洗缓冲液(10mM磷酸钠,150mM NaCl,0.05% Tween-20,pH=7.5)清洗孔三次。在室温下用200μl封闭缓冲液(补充有1%BSA的清洗缓冲液)封闭孔一小时,同时以150rpm摇动。之后去除封闭缓冲液,并且在每个孔中添加100μl连续稀释的融合蛋白,并将孔在室温下以150rpm温育一小时。融合蛋白在样品稀释缓冲液(在清洗缓冲液中1%BSA)中稀释。温育后,用每孔300μL的清洗缓冲液清洗孔三次。接下来,添加100μl辣根过氧化物酶缀合的抗人IgG4Fc抗体(Southern Biotech,9200-05,在封闭缓冲液中以1:4000稀释)至每个孔,并将孔在室温下摇动温育一小时。温育后,用每孔300μL的清洗缓冲液清洗孔三次,然后添加100μl TMB溶液(Invitrogen,SB02),并将孔在室温下温育两分钟。用100μl/孔的1M HCl停止反应,并在室温下避光温育30秒,同时摇动。在室温下在黑暗中进一步温育15分钟后,在微孔板读数器(Synergy HTX,BioTek)中以OD655为参照在OD450 nm处读板。使用4参数logistic曲线拟合模型将浓度(μg/mL)对OD450(背景减去后)绘图。
8.在融合蛋白存在下对SARS-CoV-2株Victoria/1/2020感染的分析
在没有或有融合蛋白的情况下,用Vero细胞对SARS-CoV-2的感染进行分析。通过确定免疫空斑的数量来检测SARS-CoV-2的感染。
将VeroE6细胞铺板于96孔板中并温育过夜。在96孔转移板中制备6个ACE2-Fc融合蛋白样品的2倍连续稀释物。将Victoria/1/2020SARS-CoV-2野生型病毒以大约100个空斑形成单位[PFU]/孔的靶标工作浓度序贯添加稀释物中,并在37℃下温育60至90分钟。温育期结束后,将中和混合物转移到具有VeroE6细胞的测定板上,随后在37℃和5%的CO2下温育。在60至90分钟的温育期后,向孔中添加羧甲基纤维素(CMC)覆盖培养基,并将板再温育24小时。然后,固定细胞并使用对SARS-CoV-2RBD S蛋白的特异的抗体对进行染色。使用TrueBlueTM底物对免疫空斑进行可视化,并使用Immunospot分析仪(CTL)进行计数。将免疫空斑计数输出到SoftMax Pro(Molecular Devices),并将血清样品的中和滴度计算为对应于该特定样品的50%中和滴度(ID50)的倒数稀释。
9.ACE2活性测定法
使用来自Abcam(ab273297)的ACE2活性测定试剂盒来测量构建体的酶活性。该测定是根据制造商的手册进行的。将两个市售的ACE2-Fc融合蛋白(来自Genscript(Cat.No.Z03484-1)和Acrobiosystems(Cat.No.AC2-H5257)用作参照蛋白(Ref1和Ref2)。该测定基于合成肽基-MCA衍生物的裂解。该底物由活性ACE2裂解以释放游离MCA荧光团,与肽基-MCA相比,该游离MCA荧光团在420nm的荧光强度增加(在320nm处激发)。根据荧光强度增加的斜率和已知MCA浓度的标准曲线,计算出由于ACE2裂解而释放的MCA的量。
10.病毒中和测定法
病毒株
SARS-CoV-2-Munich-TUM-1(EPI_ISL_582134)是从慕尼黑COVID-19阳性患者的鼻咽拭子中分离出来的(2020年1月),并在DMEM培养基(5% FCS、1%青霉素/链霉素、200mmol/L-谷氨酰胺、1% MEM-非必需氨基酸、1%丙酮酸钠(均来自Gibco))中的Vero E6细胞上生长和繁殖。
SARS-CoV-2D614G是从德国慕尼黑的患者材料中分离出来的(2020年4月),在Caco-2细胞上生长并在Vero E6细胞上繁殖。
来自法兰克福的SARS-CoV-Fra-1(AY291315.1)在DMEM培养基(10%胎牛血清(FCS),100μg/ml链霉素,100IU/ml青霉素)(均来自Gibco)中的Vero E6细胞上生长和繁殖。
病毒中和测定后的细胞内ELISA
将VeroE6细胞以1.6E04个细胞/孔铺板在96孔板上在DMEM培养基(Gibco)中,其补充有5% FCS、1%青霉素-链霉素、200mmol/L L-谷氨酰胺、1%MEM-非必需氨基酸、1%丙酮酸钠(均来自Gibco),并在37℃和5%CO2温育过夜。在新鲜培养基中将ACE2-Fc融合蛋白的连续稀释物与病毒混合,并在37℃下预温育1小时。在37℃下用中和的病毒溶液以0.3的MOI感染VeroE6细胞1小时。接下来,去除中和混合物,添加培养基,并在37℃下温育细胞24小时。模拟细胞代表未感染的Vero E6细胞,用培养基温育。24小时后,用PBS清洗细胞一次,并用4%多聚甲醛(ChemCruz)在RT下固定10分钟。在用PBS的清洗步骤后,用PBS中的0.5%皂苷(Roth)在室温下将固定的VeroE6细胞透化10分钟。接下来,去除透化溶液,并用0.1%皂苷和10%山羊血清(Sigma)在PBS中的混合物在RT下封闭细胞1小时,同时轻轻摇动。随后,将Vero E6细胞与抗dsRNA J2抗体(Jena Bioscience)在补充有1%FCS的PBS中的1:500稀释物在4℃下摇动温育过夜,然后用清洗缓冲液(补充有0.05% Tween-20(Roth)的1X PBS)进行四次清洗步骤。接下来,将板与山羊抗小鼠IgG2a-HRP抗体(Southern Biotech)在补充有1%FCS的PBS中的1:2000的稀释物温育,并在RT下轻轻摇动温育1小时。在四个清洗步骤之后,将3,3′,5,5′-四甲基联苯胺(TMB)底物(Invitrogen)添加到孔中,并在黑暗中温育10分钟。通过添加2N H2SO4(Roth)停止颜色反应后,进行在Tecan infinite F200 pro阅板器上450nm和560nm处的比色检测。在针对用未感染的Vero E6细胞获得的数值进行标准化后,将光密度转化为中和百分比值,并计算出半数最大抑制浓度(IC50值)(Graphpad Prism)。
11.利用表面等离子体共振(SPR)确定ACE2融合蛋白对Fc-受体的结合亲和力
使用Biacore T200用于Fc-受体结合研究。对于FcγRI和FcγRIIIa的实验,浓度为1.5nM的带His标签的FcγRI和FcγRIIIa通过在CM5芯片上以5μL/min的流速将溶液注入共价固定化的抗His标签抗体上90秒来捕获。运行缓冲液是HBS-EP+pH 7.4(Cytiva)。以单循环动力学模式注入五种不同浓度的ACE2-Fc构建体(FcγRI的实验为3.7-300nM,并且对于FcγRIIIa为25-2000nM)。将FcγRI结合数据拟合至异质性配体模型,并报告了第一结合常数。将FcγRIIIa结合数据拟合至二态反应模型中以推到结合常数。对于FcRn的实验,将FcRn共价固定化在CM5芯片上至约50RU(反应单位)。样品缓冲液是HBS-EP+pH6.0(Cytiva)。在单循环动力学模式下以205至8000nM的五个不同浓度注入ACE2-Fc构建体。用稳态亲和拟合来评估FcRn的结合。
12.用细胞存活力测定法确定病毒中和
病毒株
SARS-CoV-2-Munich-TUM-1(EPI_ISL_582134)是从慕尼黑COVID-19阳性患者的鼻咽拭子中分离出来的(2020年1月),并在DMEM培养基(5% FCS、1%青霉素/链霉素、200mmol/L-谷氨酰胺、1% MEM-非必需氨基酸、1%丙酮酸钠(均来自Gibco))中的Vero E6细胞上生长和繁殖。
SARS-CoV-2D614G是从德国慕尼黑的患者材料中分离出来的(2020年4月),在Caco-2细胞上生长并在Vero E6细胞上繁殖。
SARS-CoV-2B.1.1.7获得自德国联邦国防军微生物研究所(Institute forMicrobiology of the Bundeswehr)的Bugert博士(GISAID:EPI_ISL_755639)并在Vero E6细胞上繁殖。
SARS-CoV-2B.1.351获得自LGL(Oberschleiβheim,Germany)。它是从德国的患者中分离出来的,在Caco-2细胞上生长并在Vero E6细胞上繁殖。该变体的身份通过测序得到确认。
感染前24小时,工程化以过表达人血管紧张素转换酶2受体,ACE2(A549-hACE2)的人肺上皮A549细胞(ATCC-CCL-185)以每孔15,000个细胞铺板在96孔透明底白孔半区板(Corning)中的含有2%胎牛血清、100U/mL青霉素-链霉素和1% NEAA的DMEM中。
SARS-CoV-2-Munich-TUM-1和SARS-CoV-2变体D614G、B1.1.7和B.1.351在Vero E6细胞上生长。为此,在感染前一天将15x 106个Vero E6细胞接种在每个T150烧瓶中。通过在37℃,5%CO2下以0.01的MOI添加病毒进行感染。添加病毒一小时后,将培养基改为具有10%胎牛血清、100U/mL青霉素-链霉素和1% NEAA、200mmol/l L-谷氨酰胺和1%丙酮酸钠(均来自Gibco)的DMEM。
使用病毒诱导的细胞毒性的发光读数来确定感染。简而言之,感染后72小时,根据制造商的说明处理细胞:在每个孔中添加15μL CellTiter-Glo 2.0试剂(Promega,Wisconsin,USA),在室温下黑暗中温育10分钟,并使用Infinite F200微板读数器(Tecan)记录发光(0.5s积分时间,无过滤器)。通过将感染的细胞对于未处理的对照细胞(设置为100%)进行标准化,计算出对于每个病毒分离株的细胞存活力和相应的感染滴度。对构建体进行连续稀释,并与规定体积的指示SARS-CoV-2临床分离株的病毒库存混合,产生80%的细胞毒性。预温育1小时后,将构建体和相应的SARS-CoV-2分离株的混合物添加到A549-hACE2细胞中。感染后72小时,如上所述测定病毒诱导的细胞毒性。
13.通过空斑测定法确定病毒滴度
病毒滴度按照Baer et al.(2014)J Vis Exp,e52065所述测定,进行了一些修改。简而言之,将HepG2或Vero E6细胞以5E05个/孔铺板在12孔板的中的补充有5% FCS、1%P/S、200mmol/LL-谷氨酰胺、1% MEM-NEAA、1%丙酮酸钠(均来自Gibco)的DMEM培养基(Gibco)中,并在37℃和5% CO2温育过夜。用细胞培养基中的病毒样品的连续稀释物在37℃下感染细胞一小时。弃去上清液后,每孔添加1ml在最小必需培养基(Gibco)中稀释的5%羧甲基纤维素(Sigma),并在37℃下温育板,直到出现明显空斑。去除上清液后,用10%多聚甲醛(ChemCruz)在RT下固定细胞30分钟。接下来,用PBS进行清洗步骤,然后添加1%结晶紫(Sigma;在20%的甲醇和水中稀释)。在RT下温育15分钟后,用PBS洗去溶液,并将板干燥。样品的病毒滴度(PFU/mL)通过计算稀释的平均空斑数和总稀释因子的倒数来确定。
B.结果
图1显示了具有包含氨基酸18至732的较短的ACE2片段的那些融合蛋白(构建体1、3、5和7)与包含ACE2的氨基酸18至740的融合蛋白(构建体2、4、6和8)相比更高的产率。
进一步,具有包含氨基酸18至732的较短的ACE2片段的融合蛋白(构建体1、3、5和7)相比包含ACE2的氨基酸18至740的融合蛋白(构建体2、4、6和8)具有较低的指示蛋白质聚集的高分子量种类的百分比(见图2)。
在表面等离子体共振中,所有的构建体都显示出相当的与SARS-CoV-2的刺突蛋白的结合(见表2)。
表2:
图3显示,构建体1、3、5和7基本上没有O-糖基化,而构建体2、4、6和8有不同数量的单和双O-聚糖。
图4显示,如通过ELISA1所确定,所有构建体1至8都抑制了SARS-CoV-2刺突S1蛋白与ACE2的结合。
构建体1、3、5和7几乎完全抑制了SARS-CoV-2株Victoria/1/2020对VeroE6细胞的感染(见图5)。所有构建体都能中和SARS-CoV-2株Victoria/1/2020,IC50值在0.5nM范围内。
构建体1、2、5和6在温育30分钟后裂解相同量的合成肽基-MCA衍生物,而在活性ACE2位点发生突变的构建体则完全失去了酶活性(见图6a和6b)。
所有构建体1至8都能中和SARS-CoV,IC50值在150nM范围内(见图7a),SARS-CoV-2的IC50值在10nM范围内(见图7b),并且SARS-CoV-2D614G的IC50值在1nM范围内(见图7c)。
ACE2-IgG4-Fc融合蛋白与IgG1对应物相比显示略低的对FcγRI的亲和力(见表3)。ACE2-IgG4-Fc没有显示出与FcγRIIIa的结合,这与ACE2-IgG1-Fc分子形成对比(见表3)。所有四个构建体与FcRn的亲和力相似(见表3)。
表3:ACE2-Fc构建体对Fc受体的结合亲和力
重复测量的平均值±SD
如由ELISA 2所确定,构建体1与野生型SARS-CoV-2的刺突蛋白结合,EC50值为25.9ng/ml(见图8)。
图9显示,根据SEQ ID No.6和8的ACE2-Fc融合蛋白(构建体1和3)中和所有测试的SARS-CoV-2临床分离株。SARS-CoV-2变体的传染性越强,融合蛋白中和它的效果越好,这一点从更低的IC50(50%抑制浓度)值可以看出。特别地,融合蛋白对SARS-CoV-2变体B.1.1.7和B.1.351最有效,已经证明这些变体是难于被大多数针对刺突蛋白N端域的单克隆抗体和针对受体结合基序的单克隆抗体中和的(Wang et al.(2021)Nature)。此外,B.1.351变体显示对接种过疫苗的个体的血清和恢复期血浆的中和的逃逸。
不同构建体和临床分离株的IC50值显示在表4中。
表4:不同构建体和临床分离株的IC50和95%置信区间
| 构建体 | 分离株 | IC50(nM) | CI95 |
| 1 | SARS-CoV-2-Munich-TUM-1 | 4.7 | 3.9-5.8 |
| 1 | SARS-CoV-2D14G | 1.3 | 1.0-1.6 |
| 1 | SARS-CoV-2B.1.1.7 | 0.6 | 0.5-0.8 |
| 1 | SARS-CoV-2B.1.351 | 0.4 | 0.3-0.5 |
| 3 | SARS-CoV-2-Munich-TUM-1 | 7.4 | 6.2-8.6 |
| 3 | SARS-CoV-2D14G | 1.6 | 1.3-2.0 |
| 3 | SARS-CoV-2B.1.1.7 | 0.6 | 0.4-0.8 |
| 3 | SARS-CoV-2B.1.351 | 0.5 | 0.4-0.7 |
序列表
<110> 福迈康股份公司
<120> ACE2-FC融合蛋白及其用途
<130> F09553WO/LA
<150> EP20176139.2
<151> 2020-05-22
<150> EP20204774.2
<151> 2020-10-29
<150> EP20210297.6
<151> 2020-11-27
<150> EP21164684.9
<151> 2021-03-24
<150> EP21170519.9
<151> 2021-04-26
<160> 18
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 805
<212> PRT
<213> 人
<400> 1
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Gly Glu Ile Pro Lys Asp Gln Trp Met Lys Lys Trp Trp Glu Met Lys
450 455 460
Arg Glu Ile Val Gly Val Val Glu Pro Val Pro His Asp Glu Thr Tyr
465 470 475 480
Cys Asp Pro Ala Ser Leu Phe His Val Ser Asn Asp Tyr Ser Phe Ile
485 490 495
Arg Tyr Tyr Thr Arg Thr Leu Tyr Gln Phe Gln Phe Gln Glu Ala Leu
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Cys Gln Ala Ala Lys His Glu Gly Pro Leu His Lys Cys Asp Ile Ser
515 520 525
Asn Ser Thr Glu Ala Gly Gln Lys Leu Phe Asn Met Leu Arg Leu Gly
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Lys Ser Glu Pro Trp Thr Leu Ala Leu Glu Asn Val Val Gly Ala Lys
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Asn Met Asn Val Arg Pro Leu Leu Asn Tyr Phe Glu Pro Leu Phe Thr
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<213> SARS-CoV2
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1250 1255 1260
Val Leu Lys Gly Val Lys Leu His Tyr Thr
1265 1270
Claims (32)
1.融合蛋白,其包含第一部分和第二部分,所述第一部分包含人ACE2的片段或所述片段的变体,所述人ACE2具有根据SEQ ID No.1的氨基酸序列,所述第二部分包含人IgG4的Fc部分或所述人IgG4的Fc部分的变体,所述人IgG4的Fc部分具有根据SEQ ID No.5的氨基酸序列,其中所述第一部分和所述第二部分由根据SEQ ID No.4的氨基酸序列连接。
2.根据权利要求1所述的融合蛋白,其中所述人ACE2的片段由根据SEQ ID No.2的氨基酸序列组成。
3.根据权利要求1所述的融合蛋白,其中所述人ACE2的片段是由根据SEQ ID No.3的氨基酸序列组成的ACE2的胞外域。
4.根据权利要求1所述的融合蛋白,其具有根据SEQ ID No.6至9中任一个的氨基酸序列。
5.融合蛋白,其包含第一部分和第二部分,所述第一部分包含由根据SEQ ID No.2的氨基酸序列组成的人ACE2的片段或所述片段的变体,所述第二部分包含人IgG的Fc部分或所述人IgG的Fc部分的变体。
6.根据权利要求5所述的融合蛋白,其中所述IgG是IgG1或IgG4。
7.根据权利要求5所述的融合蛋白,其中所述IgG是IgG4,并且所述第一部分和所述第二部分由根据SEQ ID No.4的氨基酸序列连接。
8.根据权利要求5所述的融合蛋白,其中所述IgG是IgG1,并且所述第一部分和所述第二部分由根据SEQ ID No.15的氨基酸序列连接。
9.根据权利要求5所述的融合蛋白,其具有根据SEQ ID No.6、8、10或12中任一个的氨基酸序列。
10.融合蛋白,其包含第一部分和第二部分,所述第一部分包含人ACE2的片段或所述片段的变体,所述人ACE2具有根据SEQ ID No.1的氨基酸序列,所述第二部分包含人IgG2或IgG3的Fc部分或人IgG1、IgG2或IgG3的Fc部分的变体,其中所述融合蛋白与包含相同的第一部分和含有野生型人IgG1的Fc部分的第二部分的融合蛋白相比,具有降低的与FcγRIIIa的结合。
11.根据权利要求10所述的融合蛋白,其中所述融合蛋白与包含相同的第一部分和含有野生型人IgG1的Fc部分的第二部分的融合蛋白相比,具有基本相同的与FcRn的结合。
12.根据权利要求10或11所述的融合蛋白,其中所述人IgG1的Fc部分的变体包含根据SEQ ID No.16的序列中的氨基酸取代L3A和L4A。
13.根据权利要求10至12中任一项所述的融合蛋白,其中所述人ACE2的片段由根据SEQID No.2的氨基酸序列组成。
14.根据权利要求10至12中任一项所述的融合蛋白,其中所述人ACE2的片段是由根据SEQ ID No.3的氨基酸序列组成的ACE2的胞外域。
15.根据权利要求1至14中任一项所述的融合蛋白,其中所述人ACE2片段的变体是人ACE2的酶促失活变体。
16.根据权利要求15所述的融合蛋白,其中所述人ACE2的酶促失活变体包含H374N和H378N突变,所述编号参照SEQ ID No.1。
17.根据权利要求1至16中任一项所述的融合蛋白,其中所述人ACE2片段的变体包含在亮氨酸584处的氨基酸取代,所述编号参照SEQ ID No.1。
18.根据权利要求1至17中任一项所述的融合蛋白,其中所述人ACE2片段的变体包含在选自赖氨酸619、精氨酸621、赖氨酸625、精氨酸697、赖氨酸702、精氨酸705、精氨酸708、精氨酸710和精氨酸716的至少一个残基处的至少一个氨基酸取代,所述编号参照SEQ ID No1。
19.根据权利要求1至18中任一项所述的融合蛋白,其中所述人ACE2片段的变体包含在赖氨酸619、精氨酸621、赖氨酸625、精氨酸697、赖氨酸702、精氨酸705、精氨酸708、精氨酸710和精氨酸716处的氨基酸取代,所述编号参照SEQ ID No.1。
20.根据权利要求1至18中任一项所述的融合蛋白,其中所述人ACE2片段的变体包含S645C突变,所述编号参照SEQ ID No.1。
21.核酸分子,其包含编码根据权利要求1至20中任一项所述的融合蛋白的核酸序列。
22.表达载体,其包含根据权利要求21所述的核酸分子。
23.宿主细胞,其包含根据权利要求21所述的核酸分子或根据权利要求22所述的表达载体。
24.产生根据权利要求1至20中任一项所述的融合蛋白的方法,其包括在适当的培养基中培养根据权利要求23所述的宿主细胞。
25.根据权利要求1至20中任一项所述的融合蛋白,其用于医疗用途。
26.根据权利要求1至20中任一项所述的融合蛋白,其用于预防和/或治疗与ACE2结合的冠状病毒感染。
27.根据权利要求26所述使用的融合蛋白,其中所述与ACE2结合的冠状病毒选自由SARS、SARS-CoV-2和NL63组成的组,优选是SARS-CoV-2。
28.根据权利要求26或27所述使用的融合蛋白,其中所述融合蛋白与抗病毒剂联合施用。
29.根据权利要求28所述使用的融合蛋白,其中所述抗病毒剂选自由瑞德西韦(remdesivir)、盐酸阿比多尔(Arbidol HCl)、利托那韦(ritonavir)、洛匹那韦(lopinavir)、达芦那韦(darunavir)、利巴韦林(ribavirin)、氯喹(chloroquin)及其衍生物,硝唑尼特(nitazoxanide)、甲磺酸卡莫司他(camostat mesilate)、托珠单抗(tocilizumab)、司妥昔单抗(Siltuximab)、沙利鲁单抗(sarilumab)和磷酸巴瑞替尼(baricitinib phosphate)组成的组。
30.根据权利要求1至20中任一项所述的融合蛋白,其用于治疗高血压病(包括高血压)、充血性心力衰竭、慢性心力衰竭、急性心力衰竭、收缩性心力衰竭、心肌梗塞、动脉硬化、肾衰竭(kidney failure)、肾脏衰竭(renal failure)、急性呼吸窘迫综合征(ARDS)、急性肺损伤(ALI)、慢性阻塞性肺病(COPD)、肺动脉高压、肾脏纤维化、慢性肾脏衰竭、急性肾脏衰竭、急性肾损伤、炎症性肠病和多器官功能障碍综合征。
31.药物组合物,其包含有效量的根据权利要求1至20中任一项所述的融合蛋白和药学上可接受载体或赋形剂。
32.根据权利要求31所述的药物组合物,其进一步包含抗病毒剂。
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