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CN109477106A - 二酰基甘油酰基转移酶2（dgat2）的调节剂 - Google Patents

二酰基甘油酰基转移酶2（dgat2）的调节剂 Download PDF

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Abstract

本发明实施方案提供可用于抑制DGAT2表达，从而可用于治疗、预防或减轻与DGAT2相关的疾病的方法、化合物和组合物。

Description

二酰基甘油酰基转移酶2（DGAT2）的调节剂
序列表
本申请连同序列表一起以电子格式提交。序列表提供为在2016 年6月8日创建的名称为BIOL0178WOSEQ_ST25.txt的文件，所述文件的大小为1mb。电子格式的序列表中的信息以引用的方式整体并入本文。
领域
本发明实施方案提供用于通过向个体施用二酰基甘油酰基转移酶2(DGAT2)特异性抑制剂来治疗、预防或减轻与非酒精性脂肪性肝病，包括非酒精性脂肪性肝炎(NASH)和肝脂肪变性，相关的疾病的方法。
背景
非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)，包括NASH(非酒精性脂肪性肝炎)被认为是代谢综合征的肝脏表现(Marchesini G等人Hepatology 2003；37：917-923)并且特征在于在没有过量饮酒史的患者的肝脏中甘油三酯积聚。多数患有NAFLD的患者是肥胖或病态肥胖的并且伴随有胰岛素抵抗(Byrne CD和Targher G.J Hepatol2015年4月；62(1S)： S47-S64)。NAFLD/NASH的发病率在世界范围内迅速上升，这与肥胖症患病率的增加一致，并且是目前最常见的慢性肝病。最近，据报道在主要为中年的群体中NAFLD和NASH的发病率分别为46％和 12％，(Williams CD等人Gastroenterology 2011；140：124-131)。
NAFLD分为单纯性脂肪变性，其中仅观察到肝脂肪变性；和NASH，其中连同肝脂肪变性观察到肝细胞的小叶内炎症和气球样变性。患有NASH的NAFLD患者的比例仍不明确，但是可能在20％-40％之间。NASH是进行性疾病，并且可能导致肝硬化和肝细胞癌(FarrellGC和Larter CZ.Hepatology 2006；43：S99-S112；Cohen JC等人Science 2011；332：1519-1523)。据报道20％的NASH患者发展有硬化症，并且30％-40％患有NASH硬化症的患者经历肝相关死亡(McCullough AJ.J Clin Gastroenterol 2006；40增刊1：S17-S29)。最近，在美国NASH 已成为肝移植的第三个最常见的适应症(Charlton MR等人 Gastroenterology2011；141：1249-1253)。
目前，NAFLD/NASH的主要治疗方法是通过饮食和锻炼来改变生活方式。然而，药物疗法是必不可少的，因为肥胖的NAFLD患者常常难以维持改善的生活方式。
脂肪营养不良综合征是一组罕见的代谢性疾病，其特征在于脂肪组织的选择性丧失，这导致肝脏和肌肉中的异位脂肪沉积以及胰岛素抵抗、糖尿病、血脂异常和脂肪性肝病的发展(Shulman GI.N Engl J Med 2014；371：1131-1141；Garg A.J Clin EndocrinolMetab 2011；96： 3313-3325；Chan JL和Oral EA.Endocr Pract 2010；16：310-323；GargA. N Engl J Med 2004；350：1220-1234)。这些综合征构成了显著的尚未满足的医疗需求，因为这些患者用目前疗法是难以治疗的，所述目前疗法主要用于治疗糖尿病和TG水平升高，以试图降低严重的相关并发症(冠状动脉疾病、糖尿病性肾病、硬化症和胰腺炎)的风险。
部分脂肪营养不良的患病率(估计一(1)百万分之～2-3)比全身脂肪营养不良的高，但患病率的范围未知，因为这些患者大大诊断不足 (Chan JL和Oral EA.Endocr Pract2010；16：310-323；Garg A.J Clin Endocrinol Metab 2011；96：3313-3325)。部分脂肪营养不良进一步分为获得性部分脂肪营养不良(APL)或家族性部分脂肪营养不良(FPL)。 PL的诊断主要是临床的并且在表现有胰岛素抵抗(伴有或不伴有明显的糖尿病)、呈高甘油三酯血症形式的显著血脂异常和脂肪肝的三元组的患者中需要考虑(Huang-Doran I等人JEndocrinol 2010；207： 245-255)。患者常常表现出糖尿病和严重的胰岛素抵抗，从而需要高剂量的胰岛素。
目前的治疗方法包括改变生活方式，诸如减少热量摄入和通过锻炼增加能量消耗。用于治疗严重胰岛素抵抗(二甲双胍、噻唑烷二酮类、GLP-1、胰岛素)和/或高TG(饮食脂肪限制、贝特类、鱼油)的常规疗法在这些患者中并不是非常有效的(Chan JL和OralEA.Endocr Pract 2010；16：310-323；Garg A.J Clin Endocrinol Metab 2011)。部分脂肪营养不良是一种超级罕见病(ultra-orphan indication)，对其存在明显尚未满足的医学需求。与这种病状相关的糖尿病、NASH和/或高甘油三酯血症可能导致严重的并发症(Handelsman Y等人Endocr Pract 2013；19：107-116)。
二酰基甘油O-酰基转移酶(DGAT)通过促进sn-1，2-二酰基甘油 (DAG)与酰基辅酶A的键合催化甘油三酯(TG)合成中的最终步骤。 DGAT有两种同种型(DGAT1和DGAT2)，并且研究表明DGAT1和 DGAT2在TG合成中起均重要作用。DGAT1在小肠和白色脂肪组织 (WAT)中表达水平最高，而DGAT2主要在肝脏和WAT中表达(Cases S等人Proc Natl Acad Sci USA1998；95，13018-13023；Cases S等人J Biol Chem 2001；276，38870-38876)。虽然DGAT1和DGAT2在用DAG 或单酰基甘油(MAG)和酰基辅酶A作为底物的TG合成中催化相同的反应，但是它们的功能上区别不仅在于其组织表达，而且在于其在以下方面上的不同：催化特性(Cao J等人J Lipid Res 2007；48：583-591； Cheng D等人J Biol Chem 2008；283：29802-29811)、亚细胞定位(Stone SJ等人J Biol Chem 2004；279：11767-11776)和生理调控(Meegalla RL 等人Biochem Biophys Res Commun 2002，298，317-323)。例如，在肥胖症啮齿动物模型中通过反义寡核苷酸治疗抑制DGAT2而不是 DGAT1改善了肝脂肪变性和血脂水平而与脂肪过多无关，并且数据表明这些作用与降低肝脂质合成有关(Yu XX等人Hepatology 2005； 42：362-371)。
这些研究证实，DGAT2抑制可通过减少甘油三酯、改善胰岛素敏感性和降低肝脂肪变性来改善NAFLD/NASH以及脂肪营养不良综合征患者的代谢特征。
概要
本文提供的本发明实施方案涉及可用于治疗、预防、减轻NAFLD (诸如NASH)以及脂肪营养不良综合征(诸如部分脂肪营养不良)或减缓所述疾病的进展的强力且/或可耐受化合物和组合物。
本文提供的若干个实施方案涉及比早期已公布的申请WO 2005/019418中的反义寡核苷酸更强力且更有效的若干种反义化合物。本文提供的若干个实施方案涉及强力且可耐受的化合物和组合物。
详述
应理解，以上概述和以下详述都仅是示例性和解释性的，并且不限制要求保护的本发明。在本文中，除非另外确切说明，否则单数的使用包括复数。如本文所用，除非另外说明，否则“或”的使用意指“和/或”。此外，术语“包括(including)”以及其他形式诸如“包括(includes)”和“包括(included)”的使用不是限制性的。此外，除非另外明确陈述，否则如“要素”或“组分”的术语涵盖包含一个单元的要素和组分与包含一个以上亚单元的要素和组分两者。
本文所用的章节标题仅出于组织目的，并且不应解释为限制所述主题。本申请中引用的所有文献或文献的部分(包括但不限于专利、专利申请、文章、书籍、论文以及GenBank和NCBI参考序列记录)关于本文所论述的文献部分明确地以引用方式特此并入以及以引用方式特此整体并入。
应了解，本文中所含的实例中的每个SEQ ID NO中所示的序列与糖部分、核苷间键合或核碱基的任何修饰无关。因而，由SEQ ID NO定义的反义化合物可独立地包含糖部分、核苷间键合或核碱基的一个或多个修饰。由ISIS编号(ISIS#)所述的反义化合物指示核碱基序列、化学修饰和基序的组合。
除非另外指出，否则以下术语具有以下含义：
“2′-脱氧核苷”意指包含2′-H(H)呋喃糖基部分的核苷，如在天然存在的脱氧核糖核酸(DNA)中发现的。在某些实施方案中，2’-脱氧核苷可包含修饰核碱基或可包含RNA核碱基(例如，尿嘧啶)。
“2’-O-甲氧基乙基”(又为2’-MOE和2’-O(CH2)2-OCH3)是指糖环例如呋喃糖环的2′位上的O-甲氧基-乙基修饰。2’-O-甲氧基乙基修饰的糖是修饰糖。
“2′-MOE核苷”(又为2′-O-甲氧基乙基核苷)意指包含2′-MOE修饰的糖部分的核苷。
“2′-取代核苷”或“2-修饰核苷”意指包含2′-取代或2’-修饰的糖部分的核苷。如本文所用，关于糖部分的“2′-取代的”或“2-修饰的”意指包含不同于H或OH的2′-取代基的呋喃糖基部分。
“3’靶位点”是指与特定反义化合物的最3’核苷酸互补的靶核酸的核苷酸。
“5’靶位点”是指与特定反义化合物的最5’核苷酸互补的靶核酸的核苷酸。
“5-甲基胞嘧啶”意指用连接至5位的甲基修饰的胞嘧啶。5-甲基胞嘧啶是修饰核碱基。
“约”意指在值的±10％以内。例如，如果指出“化合物影响DGAT2 至少约70％的抑制”，那么暗示60％至80％范围内的DGAT2水平被抑制。
“施用(Administration)”或“施用(administering)”是指将本文所提供的化合物或组合物引入个体以进行其预期功能的途径。可以使用的施用途径的实例包括但不限于肠胃外施用，诸如皮下、静脉内或肌肉内注射或输注。
“伴随施用”或“共同施用”意指对两种或更多种化合物以两者的药理作用均在患者中显现的任何方式进行施用。伴随施用不需要以单一药物组合物、以相同剂型、通过相同施用途径或同时对两种药剂进行施用。两种药剂的作用不需要同时显现。所述作用仅需要重叠一段时间但不需要同延。伴随施用或共同施用涵盖并行或依序施用。
“减轻”是指相关疾病、病症或病状的至少一种指标、征象或症状的减轻。在某些实施方案中，减轻包括延缓或减缓病状或疾病的一个或多个指标的进展。指标的严重性可通过本领域的技术人员已知的主观或客观度量来确定。
“动物”是指人类或非人类动物，包括但不限于小鼠、大鼠、家兔、狗、猫、猪，和非人灵长类，包括但不限于猴子和猩猩。
“反义活性”意指可归因于反义化合物与其靶核酸的杂交的任何可检测或可测量的活性。在某些实施方案中，反义活性是相比于在针对靶标的反义化合物不存在下的靶核酸水平或靶蛋白质水平，由这种靶核酸编码的靶核酸或蛋白质的量或表达的减少。
“反义化合物”意指包含反义寡核苷酸和选择的一个或多个附加特征(诸如缀合基团或末端基团)的化合物。反义化合物的实例包括单链和双链化合物。实例是反义寡核苷酸、核糖酶、siRNA、shRNA、 ssRNA和占位型化合物。
“反义抑制”意指在与靶核酸互补的反义化合物存在下靶核酸水平相比于在不存在反义化合物下的靶核酸水平有所减少。
“反义机制”为所有涉及化合物与靶核酸的杂交的机制，其中杂交的结果或效果为靶标降解或靶标占用，伴随阻碍涉及例如转录或剪接的细胞机构。
“反义寡核苷酸”意指具有与靶核酸或其区或区段互补的核碱基序列的寡核苷酸。在某些实施方案中，反义寡核苷酸可与靶核酸或其区或区段特异性杂交。
“双环核苷”或“BNA”意指包含双环糖部分的核苷。如本文所用，“双环糖”或“双环糖部分”意指包含两个环的修饰糖部分，其中第二环通过连接第一环中的两个原子的桥形成，从而形成双环结构。在某些实施方案中，双环糖部分的第一个环是呋喃糖基部分。在某些实施方案中，双环糖部分不包括呋喃糖基部分。
“支链基团”意指具有至少3个能够与至少3个基团形成共价键的位置的原子团。在某些实施方案中，支链基团提供多个反应位点，以用于通过缀合接头和/或可裂解部分将系接配体连接至寡核苷酸。
“细胞靶向部分”意指能够结合一种或多种特定细胞类型的缀合基团或缀合基团的一部分。
“可裂解部分”意指在生理条件下例如在细胞、动物或人体内被裂解的键或原子团。
“cEt”或“限制性乙基”意指包含连接4′-碳与2′-碳的桥的双环糖部分，其中所述桥具有下式：4’-CH(CH3)-O-2’。
“化学修饰”意指当与天然存在的对应物相比时化合物的化学差异。寡核苷酸的化学修饰包括核苷修饰(包括糖部分修饰和核碱基修饰)和核苷间键合修饰。就寡核苷酸而言，化学修饰不包括仅在核碱基序列上的差异。
“化学上不同的区”是指以某种方式化学上不同于同一反义化合物的另一区的反义化合物的区。例如，具有2’-O-甲氧基乙基核苷酸的区化学上不同于具有无2’-O-甲氧基乙基修饰的核苷酸的区。
“嵌合反义化合物”意指具有至少2个化学相异区的反义化合物，每一位置具有多个亚单位。
“可裂解键”意指能够被分裂的任何化学键。在某些实施方案中，可裂解键选自以下：酰胺、聚酰胺、酯、醚、磷酸二酯的一个或两个酯、磷酸酯、氨基甲酸酯、二硫化物或肽。
“可裂解部分”意指在生理条件下例如在细胞、动物或人体内被裂解的键或原子团。
关于寡核苷酸的“互补”意指当两个核碱基序列在相对方向上比对时，这种寡核苷酸或其一个或多个区的核碱基序列与另一个寡核苷酸或核酸或其一个或多个区的核碱基序列匹配。如本文所述的核碱基匹配或互补核碱基限于腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A)和尿嘧啶 (U)、胞嘧啶(C)和鸟嘌呤(G)以及5-甲基胞嘧啶(mC)和鸟嘌呤(G)，除非另有说明。互补的寡核苷酸和/或核酸不需要在每个核苷处具有核碱基互补性并且可以包括一个或多个核碱基错配。相比之下，关于寡核苷酸的“完全互补”或“100％互补”意指这种寡核苷酸在每个核苷处具有核碱基匹配而没有任何核碱基错配。
“缀合基团”意指直接或间接地连接至母体化合物，例如寡核苷酸的原子团。
“缀合接头”意指将缀合基团连接至母体化合物，例如寡核苷酸的原子团。
“限制性乙基核苷”(又为cEt核苷)意指包含含有4’-CH(CH3)-O-2’桥的双环糖部分的核苷。
寡核苷酸背景下的“连续”是指彼此紧邻的核苷、核碱基、糖部分或核苷间键合。例如，“连续核碱基”意指彼此紧邻的核碱基。
“设计”或“被设计来”是指设计与所选核酸分子特异性杂交的寡聚化合物的方法。
“DGAT2”意指DGAT2的任何核酸或蛋白质。“DGAT2核酸”意指编码DGAT2的任何核酸。例如，在某些实施方案中，DGAT2核酸包括编码DGAT2的DNA序列、从编码DGAT2的DNA(包括含有内含子和外显子的基因组DNA)转录的RNA序列(包括非蛋白质编码 (即非编码)的RNA序列)以及编码DGAT2的mRNA序列。“DGAT2 mRNA”意指编码DGAT2蛋白的mRNA。
“DGAT2特异性抑制剂”是指能够在分子水平上特异性抑制 DGAT2 RNA和/或DGAT2蛋白表达或活性的任何试剂。例如， DGAT2特异性抑制剂包括核酸(包括反义化合物)、肽、抗体、小分子和其他能够抑制DGAT2 RNA和/或DGAT2蛋白的表达的试剂。
“剂量”意指在单个施用中或在指定时间内提供的指定量的药剂。在某些实施方案中，可以两次或更多次快速浓注(bolus)、片剂或注射来施用剂量。例如，在某些实施方案中，在需要皮下施用时，所需剂量可能需要不易由单次注射提供的体积。在所述实施方案中，可使用两次或更多次注射来达成所需剂量。在某些实施方案中，可以两次或更多次注射施用剂量以使个体的注射部位反应减至最小。在其他实施方案中，药剂通过经长时段或连续输注来施用。剂量可被规定为每小时、每天、每周或每个月的药剂的量。
“给药方案”为被设计以达成一种或多种所需作用的剂量的组合。
“双链反义化合物”意指包含彼此互补并形成双链体的两种寡聚化合物的反义化合物，并且其中两种所述寡聚化合物中的一种包括反义寡核苷酸。
“有效量”意指足以在需要药剂的个体中实现所需生理学结果的化合物的量。有效量可在个体间变化，取决于待治疗个体的健康和身体条件、待治疗个体的分类群、组合物的制剂、个体的医疗条件的评价和其他相关因素。
“功效”意指产生所需效果的能力。
“表达”包括基因密码信息借以转化成细胞中存在且起作用的结构的所有功能。此类结构包括但不限于转录和翻译的产物。
关于寡核苷酸的“完全修饰的”意指每个核苷被修饰的修饰寡核苷酸。关于寡核苷酸的“均匀修饰的”意指每个核苷的至少一个修饰是相同的完全修饰寡核苷酸。例如，均匀修饰的寡核苷酸的核苷可以各自具有2′-MOE修饰但不同的核碱基修饰，并且核苷间键合可以不同。
“间隔体(Gapmer)”意指具有多个核苷的内部区位于具有一个或多个核苷的外部区之间的嵌合反义化合物，其中构成内部区的核苷在化学上不同于构成外部区的核苷。内部区可称为“间隔区”且外部区可称为“翼区”。在某些实施方案中，间隔体的结构可以支持RNA酶H 裂解。
“杂交”意指互补寡核苷酸和/或核酸分子的配对或退火。虽然不限于具体机制，但杂交的最常见机制涉及氢键合，所述氢键合可以是互补核碱基之间的Watson-Crick、Hoogsteen或反向Hoogsteen氢键合。在某些实施方案中，互补核酸分子包括但不限于反义化合物与核酸靶标。在某些实施方案中，互补核酸分子包括但不限于反义寡核苷酸与核酸靶标。
“鉴定具有疾病、病症和/或病状或处于患有疾病、病症和/或病状的风险中的动物”意指鉴定已被诊断为疾病、病症和/或病状的动物或鉴定易发展疾病、病症和/或病状的动物。此鉴定可通过包括评估个体的医疗史和标准临床测试或评估的任何方法来实现。
“紧邻”意指在相同种类的紧邻的要素之间没有插入要素(例如，在相邻核碱基之间没有插入核碱基)。
“个体”意指选用于治疗或疗法的人或非人动物。
“抑制表达或活性”是指相对于未治疗或对照样品的表达或活性降低、阻断表达或活性，并且不一定指示完全消除表达或活性。
“核苷间键合”意指在寡核苷酸中的相邻核苷之间形成共价键的基团或键。如本文所用，“修饰核苷间键合”意指除了天然存在的磷酸核苷间键合之外的任何核苷间键合。天然存在的非磷酸键合在本文中被称为修饰核苷间键合。“硫代磷酸酯键合”意指核苷之间的键合，其中磷酸酯键合的磷酸二酯键通过用硫原子置换非桥联氧原子之一而被修饰。硫代磷酸酯键合为修饰核苷间键合。
“延长的”反义寡核苷酸为相对于本文所公开的反义寡核苷酸；例如亲本寡核苷酸具有一个或多个额外核苷的反义寡核苷酸。
“线性修饰糖”或“线性修饰糖部分”意指包含无环或非桥连修饰的修饰糖部分。此类线性修饰不同于双环糖修饰。
“连接脱氧核苷”意指由磷酸酯连接形成核苷酸的被脱氧核糖取代的核酸碱基(A、G、C、T、U)。
“连接核苷”为以连续顺序连接的核苷(即，在那些连接核苷之间不存在另外的核苷)。
如本文所用，“错配”或“非互补”意指当第一寡核苷酸和第二寡核苷酸比对时，第一寡核苷酸的核碱基与第二寡核苷酸或靶核酸的对应核碱基不互补。例如，通用的核碱基、肌苷和次黄嘌呤能够与至少一个核碱基杂交，但是仍然与所述核碱基所杂交的核碱基错配或非互补。又如，当第一寡核苷酸和第二寡核苷酸比对时，不能与第二寡核苷酸或靶核酸的对应核碱基杂交的第一寡核苷酸的核碱基是错配或非互补核碱基。
“修饰核碱基”意指任何除腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶以外的核碱基。“未修饰核碱基”意指嘌呤碱基腺嘌呤(A)和鸟嘌呤(G)，以及嘧啶碱基胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)及尿嘧啶(U)。“通用碱基”是可以与五种未修饰核碱基中的任何一种配对的核碱基。
“修饰核苷”意指独立地具有修饰糖部分和/或修饰核碱基的核苷。
“修饰核苷酸”意指单独地具有修饰糖部分、修饰核苷间键合或修饰核碱基的核苷酸。
“修饰寡核苷酸”意指包含至少一个修饰核苷间键合、修饰糖和/ 或修饰核碱基的寡核苷酸。
“调节”是指改变或调整细胞、组织、器官或生物体的特征。例如，调节DGAT2 RNA可以意指增加或降低细胞、组织、器官或生物体中的DGAT2 RNA和/或DGAT2蛋白的水平。“调节剂”实现细胞、组织、器官或生物体的改变。例如，DGAT2反义化合物可以为降低细胞、组织、器官或生物体中的DGAT2 RNA和/或DGAT2蛋白的量的调节剂。
“单体”是指寡聚物的单个单元。单体包括但不限于天然存在或修饰核苷及核苷酸。
“基序”意指寡核苷酸中的未修饰和/或修饰糖部分、核碱基和/或核苷间键合的模式。
“天然”或“天然存在的”意指存在于自然界中。“天然存在的核苷间键合”意指3′至5′磷酸二酯键合。“天然糖部分”意指见于DNA(2′-H) 或RNA(2′-OH)中的糖部分。“天然存在的核碱基”意指嘌呤碱基腺嘌呤(A)和鸟嘌呤(G)，和嘧啶碱基胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)和尿嘧啶(U)。“非互补核碱基”是指一对彼此不形成氢键或以其他方式支持杂交的核碱基。
“核酸”是指由单体核苷酸组成的分子。核酸包括但不限于核糖核酸(RNA)、脱氧核糖核酸(DNA)、单链核酸以及双链核酸。
“核碱基”意指能够与另一核酸的碱基配对的杂环部分。
“核碱基序列”意指连续核碱基的次序，而与任何糖、键和/或核碱基修饰无关。
“核苷”意指包含核碱基部分和糖部分的化合物。核碱基和糖部分各自独立地是未修饰或修饰的。
“核苷酸”意指具有共价连接至核苷的糖部分的磷酸酯基团的核苷。
“寡聚化合物”意指包含寡核苷酸和选择的一个或多个附加特征 (诸如缀合基团或末端基团)的化合物。寡聚化合物的实例包括单链和双链化合物，诸如反义化合物、反义寡核苷酸、核糖酶、siRNA、 shRNA、ssRNA和占位型化合物。
“寡核苷”意指核苷间键合不含磷原子的寡核苷酸。
“寡核苷酸”意指连接核苷的聚合物，每个核苷可被修饰或未修饰，彼此无关。
“亲本寡核苷酸”意指其序列被用作设计具有相似序列但具有不同长度、基序和化学性质的更多寡核苷酸的基础的寡核苷酸。新设计的寡核苷酸可以具有与亲本寡核苷酸相同或重叠的序列。
“肠胃外施用”意指通过注射或输注来施用。肠胃外施用包括皮下施用、静脉内施用、肌肉内施用、动脉内施用、腹膜内施用或颅内施用，例如鞘内或脑室内施用。
“药学上可接受的载体或稀释剂”意指适用于向动物施用的介质或稀释剂。例如，药学上可接受的载体可以是无菌水性溶液，诸如 PBS或注射用水。
“药学上可接受的盐”意指化合物诸如寡聚化合物或反义化合物的生理上和药学上可接受的盐，即保留了母体化合物的所需生物活性并且不赋予其不希望的毒理学效应的盐。
“药剂”意指当施用给个体时提供治疗益处的化合物。
“药物组合物”意指适用于对个体施用的化合物的混合物。例如，药物组合物可包含一种或多种化合物或其盐和无菌水性溶液。
“硫代磷酸酯键合”意指核苷之间的修饰核苷间键合，其中磷酸二酯键通过用硫原子置换非桥联氧原子之一而被修饰。
“磷部分”意指包含磷原子的原子团。在某些实施方案中，磷部分包含单-、二-或三磷酸酯或硫代磷酸酯。
“部分”意指核酸中确定数目的连续(即连接的)核碱基。在某些实施方案中，部分是靶核酸的限定数目的连续核碱基。在某些实施方案中，部分是寡聚化合物的限定数目的连续核碱基
“预防”是指延迟或阻止疾病、病症或病状的发作、发展或进程达数分钟到无限期的时间段。预防还可意指降低发展疾病、病症或病状的风险。
“前药”意指化合物当给予至个体时代谢成另一种形式的形式。在某些实施方案中，代谢形式是化合物(例如药物)的活性或更具活性的形式。
“防治有效量”是指向动物提供防治或预防益处的药剂的量。
“RefSeq No.”是分配给序列以指示所述序列是针对特定靶转录物 (例如，靶基因)的字母和数字的唯一组合。关于靶基因的这种序列和信息(统称为基因记录)可以在基因序列数据库中找到。基因序列数据库包括NCBI参考序列数据库、GenBank、欧洲核苷酸归档和日本的DNA数据库(后三者形成国际核苷酸序列数据库协作或INSDC)。
“区”被定义为靶核酸中具有至少一个可鉴别的结构、功能或特征的部分。
“核糖核苷酸”意指在核苷酸的糖部分的2′位上具有羟基的核苷酸。
“RNAi化合物”意指至少部分地通过RISC或Ago2来调节靶核酸和/或由靶核酸编码的蛋白质的寡聚化合物。RNAi化合物包括但不限于双链siRNA、单链RNA(ssRNA)和微RNA，包括微RNA模拟物。术语RNAi化合物不包括通过RNA酶H起作用的反义寡核苷酸。
“区段”被定义为反义化合物、寡核苷酸或靶核酸内的区的较小部分或子部分。
“副作用”意指可归因于治疗的非所需作用的生理疾病和/或病状。在某些实施方案中，副作用包括注射部位反应、肝脏功能测试异常、肾功能异常、肝脏毒性、肾毒性、中枢神经系统异常、肌病和不适。例如，血清中的转氨酶水平升高可指示肝脏中毒或肝脏功能异常。例如，胆红素增加可指示肝脏中毒或肝脏功能异常。
关于反义化合物或寡聚化合物的“单链”意指化合物中有一个寡核苷酸。关于反义化合物或寡聚化合物的“自身互补”意指与其自身至少部分杂交的化合物。由一种反义或寡聚化合物组成的化合物是单链化合物，其中化合物的寡核苷酸是自身互补的。单链反义或寡聚化合物可以能够与互补化合物结合形成双链体。
如本文所用，“位点”被定义为靶核酸内的独特核碱基位置。
“减缓进展”意指减慢所述疾病的发展。
“可特异性杂交的”是指反义化合物在反义寡核苷酸与靶核酸之间具有足够的互补度以诱导所需作用，而对非靶核酸表现出极小的作用或无作用。
“特异性抑制”靶核酸意指减少或阻断靶核酸的表达，而对非靶核酸减少表现出较小、极小或没有作用，并不一定指示完全消除靶核酸的表达。
“糖部分”意指可以将核碱基连接至另一基团，诸如核苷间键合、缀合基团或末端基团上的原子团。在某些实施方案中，糖部分连接至核碱基以形成核苷。如本文所用，“未修饰糖部分”或“未修饰糖”意指如在RNA中发现的2’-OH(H)呋喃糖基部分，或如在DNA中发现的 2’-H(H)部分。未修饰糖部分在1′、3′和4′位各有一个氢，在3′位有一个氧，并且在5′位有两个氢。如本文所用，“修饰糖部分”或“修饰糖”意指包含替代未修饰糖部分的至少一个氢的非氢取代基的呋喃糖基部分或糖替代物。在某些实施方案中，修饰糖部分为2’-取代的糖部分。此类修饰糖部分包括双环糖和线性修饰糖。
“糖替代物”意指具有除呋喃糖基部分之外的可以将核碱基连接至另一基团，诸如核苷间键合、缀合基团或末端基团的部分的修饰糖部分。包含糖替代物的修饰核苷可以被掺入到寡核苷酸内的一个或多个位置中。在某些实施方案中，此类寡核苷酸能够与互补寡聚化合物或核酸杂交。
“协同作用”或“协同”是指组合的作用大于单独每种组分作用的加和作用。
“靶基因”是指编码靶标的基因。
“靶核酸”、“靶RNA”、“靶RNA转录物”及“核酸靶标”意指能够由反义化合物靶向的核酸。
“靶向”意指设计及选择将与靶核酸特异性杂交并诱导所需作用的反义化合物的过程。
“靶区”意指靶核酸中由一种或多种反义化合物所靶向的部分。
“靶区段”意指反义化合物所靶向的靶核酸的核苷酸的序列。“5’靶位点”是指靶区段的最5’核苷酸。“3’靶位点”是指靶区段的最3’核苷酸。
“末端基团”意指与寡核苷酸的末端共价连接的化学基团或原子团。
“治疗有效量”意指向个体提供治疗益处的化合物、药剂或组合物的量。
“治疗”是指向动物施用化合物或药物组合物以便实现动物的疾病、病症或病状的改变或改善。
“未修饰的”核碱基意指嘌呤碱基腺嘌呤(A)和鸟嘌呤(G)，以及嘧啶碱基胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)及尿嘧啶(U)。
“未修饰核苷酸”意指由天然存在的核碱基、糖部分及核苷间键合构成的核苷酸。在某些实施方案中，未修饰核苷酸为RNA核苷酸(即，β-D-核糖核苷酸)或DNA核苷酸(即，β-D-脱氧核糖核苷酸)。
某些实施方案
某些实施方案提供用于抑制DGAT2(DGAT2)表达的方法、化合物及组合物。
某些实施方案提供靶向DGAT2核酸的反义化合物。在某些实施方案中，DGAT2核酸具有RefSeq No.NM_032564.3中所示的序列(通过引用并入，在本文中公开为SEQ ID NO：1)或RefSeq No. NT_033927.5的核苷酸5669186至5712008(通过引用并入，在本文中公开为SEQ ID NO：2)。在某些实施方案中，反义化合物是单链寡核苷酸。
某些实施方案提供包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679 中的任一核碱基序列的至少8个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，反义化合物是单链寡核苷酸。
某些实施方案提供包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679 中的任一核碱基序列的至少9个、至少10个、至少11个或至少12 个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，反义化合物是单链寡核苷酸。
某些实施方案提供包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679 中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，反义化合物是单链寡核苷酸。
某些实施方案提供包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由SEQ IDNO：16-4679中的任一者的核碱基序列组成。在某些实施方案中，反义化合物是单链寡核苷酸。
在某些实施方案中，反义化合物或反义寡核苷酸靶向DGAT2核酸的26711-26802。在某些方面，反义化合物或反义寡核苷酸靶向在具有SEQ ID NO：2的核碱基序列(RefSeqNo.NT_033927.5的核苷酸 5669186至5712008)的DGAT2核酸的核苷酸26711-26802内。在某些方面，反义化合物或反义寡核苷酸具有与具有SEQ ID NO：2的核碱基序列(RefSeqNo.NT_033927.5的核苷酸5669186至5712008)的 DGAT2核酸的核苷酸26711-26802内的等长部分互补的至少8、9、 10、11、12、13、14、15或16个连续核碱基部分。
在某些实施方案中，反义化合物或反义寡核苷酸靶向具有SEQ ID NO：2的核碱基序列的DGAT2核酸的在核碱基26711-26799、 26711-26730、26721-26740、26755-26744、26778-26797、26779-26798、26755-26798和26780-26799内的区。在某些方面，反义化合物或反义寡核苷酸靶向前述核碱基区内的至少8、9、10、11、12、13、14、 15或16个连续核碱基。
在某些实施方案中，SEQ ID NO：2的下列核苷酸区当由反义化合物或寡核苷酸靶向时显示至少60％抑制：9930-9949、9953-9973、 9959-9978、9961-9981、9970-9992、9975-9994、9984-10003、 10040-10059、10043-10063、10045-10064、10046-10065、10049-10068、10054-10073、10160-10179、10209-10229、10212-10231、10214-10235、 10217-10236、10218-10238、10327-10346、10389-10413、10490-10511、 10522-10548、10530-10549、10531-10551、10533-10553、10645-10669、 10651-10670、10653-10673、10655-10674、10656-10675、10657-10676、 10658-10680、10662-10681、10663-10684、10666-10685、10667-10684、 10670-10689、10702-10721、10727-10747、10729-10748、10730-10750、10733-10755、10737-10756、10742-10761、10763-10782、10814-10835、 10817-10836、10818-10837、10940-10964、11008-11027、11074-11097、 11123-11150、11158-11182、11168-11187、11170-11190、11171-11197、 11199-11218、11200-11220、11209-11228、11318-11342、11413-11432、 11559-11578、11594-11618、11707-11731、11872-11891、11920-11939、 12247-12266、12285-12304、12549-12573、12671-12695、12806-12826、12839-12863、12890-12909、12927-12961、13098-13117、13212-13231、 13239-13258、13441-13461、13921-13945、13962-13996、14177-14201、 14194-14218、14239-14258、14385-14404、14457-14522、14504-14527、 14537-14556、14648-14697、14715-14790、14715-14739、14735-14764、 14746-14765、14749-14774、14756-14779、14765-14789、14771-14790、 14807-14831、14852-14871、14882-14901、14953-15015、14997-15065、15041-15107、15041-15092、15083-15107、15178-15197、15214-15243、 15219-15243、15248-15276、15255-15276、15292-15311、15318-15338、 15321-15342、15353-15372、15368-15392、15514-15533、15573-15665、 15573-15597、15729-15753、15804-15828、15814-15833、15876-15900、15876-15896、15933-15962、15933-15954、15991-16010、16046-16073、 16082-16124、16237-16256、16288-16314、16288-16478、16308-16329、16428-16478、16510-16529、16808-16855、16808-16828、16811-16855、 16898-16921、17007-17031、17038-17057、17207-17229、17269-17298、 17273-17294、17328-17357、17420-17444、17450-17471、17530-17559、 17328-17559、17960-17989、18078-18097、18155-18176、18155-18198、 18177-18200、18225-18305、18306-18327、18309-18330、18312-18330、 18312-18332、18315-18344、18329-18355、18379-18398、18417-18446、18430-18451、1818450-18473、18470-18494、18581-18601、 18583-18605、18581-18611、18588-18611、18821-18850、18821-18847、 18836-18899、18890-18914、18898-18919、19013-19037、19013-19040、 19360-19411、19363-19383、19804-19823、19909-19932、19987-20009、 20232-20256、20296-20325、20462-20481、20541-20560、20668-20692、20775-20797、20779-20797、20817-20841、20828-20863、20878-20897、 20956-20979、21046-21120、21091-21120、21164-21203、21164-21188、 21374-21403、21659-21678、21708-21727、21765-21784、21933-21955、 22153-22191、22153-22175、22158-22179、22167-22191、22439-22463、 22547-22567、22770-22790、22770-22795、22775-22795、22835-22870、 22841-22865、22881-22901、22885-22905、22889-22910、23095-23115、23098-23119、23099-23119、23128-23157、23179-23251、23238-23258、 23240-23260、23242-23262、23429-23449、23480-23566、23547-23581、 23553-23573、23555-23576、23562-23586、23597-23616、23641-23670、 24123-24144、24123-24147、24202-24223、24202-24241、24799-25039、 24799-24847、25018-2509、25023-25053、25026-25053、25069-25092、 25069-25114、25077-25104、25088-25114、25183-25205、25183-25217、25198-25217、25226-25250、25226-25265、25236-25260、25244-25291、 25312-25394、25380-25400、25717-25736、25782-25860、25845-25866、 25866-25935、25919-25939、25950-25971、25954-25973、25981-26030、 26102-26126、26162-26220、26300-26324、26331-26372、26363-26405、 26389-26409、26396-26420、26479-26504、26516-26550、26534-26555、26534-26560、26540-26560、26610-26634、26620-26640、26626-26648、26620-26664、26633-26655、26640-26664、26716-26740、26716-26799、 26755-26799、26786-26807、26789-26809、26786-26809、26811-26831、 26849-26869、26869-26898、26883-26903、26926-26943、27046-27075、 27106-27130、27174-27230、27221-27241、27226-27258、27241-27265、 27249-27269、27367-27406、27367-27402、27386-27406、27638-27664、 27769-27791、27775-27810、27852-27877、28026-28049、28128-28154、28462-28492、28475-28508、28516-28542、28584-28605、28804-28826、 29010-29035、29143-29167、29151-29180、29196-29218、29244-29268、 29253-29282、29361-29383、29369-29391、29450-29495、29480-29504、 29538-29654、29673-29697、29681-29702、29781-29801、29804-29828、 29827-29847、29832-29852、29838-29858、29844-29878、30484-30504、 30524-30548、30554-30588、30669-30731、30972-30997、30984-31005、31551-31571、31554-31584、31794-31818、31932-31952、31936-31956、 31939-31963、31946-31971、32115-32136、32119-32140、32130-32159、 32175-32201、32428-32454、32436-32467、32459-32479、32463-32489、 32474-32495、32480-32529、32586-32638、32621-32641、32756-32776、 32801-32825、32816-32840、33070-33180、33176-33199、33182-33202、 33411-33433、33572-33601、33729-33759、33846-33876、33860-33882、33866-33886、34063-34117、34211-34232、34686-34710、34739-34887、 34901-34950、35263-35292、35277-35302、35322-35346、35408-35433、 35421-35441、35436-35457、35665-35685、36246-36267、36250-36270、 36253-36274、36258-36281、36268-36531、36516-36537、36573-36597、 36581-36603、36632-36666、36677-36698、36682-36702、36689-36757、 36742-36772、36841-36874、36846-36874、36865-37041、37054-37073、37838-37858、39668-39694、39684-39705、39820-39840、39830-39852 和40909-40933。
在某些实施方案中，SEQ ID NO：2的下列核苷酸区当由反义化合物或寡核苷酸靶向时显示至少70％抑制：9971-9991、9975-9994、9984-10003、10040-10059、10044-10063、10045-10064、10049-10068、 10054-10179、10210-10229、10214-10234、10216-10235、10217-10236、 10218-10237、10327-10346、10490-10509、10491-10511、10522-10541、10528-10548、10530-10549、10531-10550、10532-10551、10533-10553、 10536-10555、10537-10556、10645-10664、10647-10666、10649-10669、 10653-10673、10655-10674、10656-10675、10657-10676、10658-10677、 10659-10679、10661-10680、10662-10681、10663-10683、10665-10684、 10666-10685、10667-10686、10668-10687、10670-10689、10672-10691、 10702-10721、10727-10747、10729-10748、10730-10750、10732-10751、10733-10752、10734-10753、10735-10754、10737-10756、10742-10756、 10742-10761、10763-10782、10815-10835、10817-10836、10818-10837、 10819-10840、10940-10959、10941-10960、10942-10961、10944-10963、 11008-11027、11074-11093、11075-11094、11076-11095、11078-11097、 11124-11146、11128-11147、11129-11148、11130-11149、11131-11177、 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在某些实施方案中，SEQ ID NO：2的下列核苷酸区当由反义化合物或寡核苷酸靶向时显示至少80％抑制：10040-10059、10044-10063、10045-10064、10054-10073、10210-10229、10214-10234、10217-10236、 10490-10509、10531-10550、10532-10551、10533-10552、10645-10664、 10650-10669、10655-10674、10656-10675、10657-10676、10659-10678、 10660-10679、10661-10680、10663-10682、10664-10683、10665-10684、 10666-10685、10667-10686、10670-10689、10727-10746、10730-10749、 10731-10750、10732-10751、10734-10753、10735-10754、10737-10756、 10816-10835、10817-10836、10818-10837、10819-10838、10820-10840、 10940-10959、10941-10960、10942-10961、10944-10963、11074-11093、11075-11094、11127-11146、11128-11147、11129-11148、11130-11149、 11131-11177、11159-11178、11160-11179、11170-11190、11172-11191、 11173-11192、11174-11193、11175-11196、11178-11197、11199-11218、 11200-11219、11201-11220、11202-11221、11203-11222、11559-11578、 11599-11618、12285-12304、13442-13461、14462-14481、14503-14522、 14504-14523、14505-14524、14506-14527、14648-14667、14649-14668、 14650-14669、14651-14670、14658-14682、14664-14683、14666-14686、 14673-14697、14741-14760、14743-14764、14746-14765、14750-04769、 14752-14774、14756-14775、14757-14775、14758-14777、14759-14778、 14769-14789、14771-14790、14772-14791、14773-14792、14774-14793、 14807-14826、14882-14901、14986-15005、14993-15012、14995-15015、 14997-15016、14998-15017、14999-15018、15000-15019、15001-15020、 15016-15035、15248-15268、15250-15269、15251-15270、15252-15272、 15254-15273、15319-15338、15321-15342、15574-15593、15646-15665、 15881-15952、16310-16329、16813-16832、16830-16852、16900-16921、 17007-17026、17208-17227、17450-17470、18156-18175、18157-18176、 18161-18180、18164-18183、18166-18185、18173-18193、18175-18194、 18176-18195、18180-18199、18308-18327、18310-18329、18311-18330、 18312-18331、18321-18340、18323-18342、18324-18343、18325-18344、 18326-18345、18327-18346、18328-18347、18331-18350、18379-18436、 18432-18451、18450-18469、18581-18600、18585-18604、18828-18847、 18829-18848、18900-18919、19911-19930、20300-20321、20668-20687、 20830-20849、20837-20857、20958-20977、22444-22463、22548-22567、 22771-22790、22772-22791、22773-22792、22886-22905、23096-23115、 23100-23119、23239-23258、23242-23261、23243-23262、23244-23263、 23245-23264、23246-23262、23427-23446、23551-23570、23552-23571、 23557-23576、24123-24142、24878-24897、25023-25042、25028-25047、 25033-25088、25073-25092、25075-25094、25078-25101、25085-25104、 25183-25202、25193-25212、25246-25291、25375-25394、25380-25399、 25782-25804、25787-25806、25841-25860、25846-25865、25900-25919、25905-25928、25911-25930、25915-25934、25950-25970、26005-26025、 26010-26029、26162-26185、26169-26191、26174-26194、26179-26219、 26300-26319、26302-26321、26304-26324、26353-26372、26358-26377、 26482-26501、26517-26536、26519-26538、26520-26539、26521-26540、 26536-26550、26537-26556、26538-26557、26615-26634、26620-26639、 26627-26646、26629-26648、26630-26649、26631-26650、26632-26651、 26635-26654、26640-26659、26711-26730、26778-26798、26788-26807、 26811-26830、26884-26903、27050-27070、27053-27072、27055-27075、 27221-27240、27231-27250、27236-27256、27241-27260、27382-27401、 27383-27402、27387-27406、27770-27789、27775-27794、27777-27796、 27779-27799、27782-27804、27787-27809、27853-27877、28026-28046、 28029-28048、28128-28149、28133-28152、28463-28482、28468-28488、 28476-28497、28480-28500、29011-29030、29143-29163、29160-29179、 29193-29212、29245-29265、26253-26272、29369-29388、29548-29589、 29678-29697、29683-29702、29782-29801、29827-29847、29829-29848、 29830-29849、29838-29858、29840-29859、29841-29860、29842-29861、 29844-29863、29854-29873、30483-30502、30484-30503、30529-30548、 30674-30693、30982-31001、31554-31573、32131-32151、32135-32154、 32182-32201、32431-32450、32432-32451、32433-32452、32434-32453、 32446-32466、32448-32467、32449-32468、32450-32469、32451-32470、 32452-32471、32453-32472、32454-32473、32455-32474、32456-32475、 32459-32479、32461-32480、32462-32481、32463-32482、32464-32483、 32465-32484、32466-32485、32467-32486、32468-32487、32469-32488、 32470-32489、32476-32495、32477-32496、32480-32499、32619-32638、 32620-32639、32621-32640、32623-32642、32645-32664、32752-32771、 32753-32772、32757-32776、32816-32835、33179-33199、33181-33200、 33182-33201、33412-33433、33729-33749、33866-33885、34211-34231、 34739-34758、34931-34950、35436-35456、35666-35685、36247-36266、 36249-36268、36250-36269、36251-36270、36252-36271、36253-36272、 36258-36277、36354-36373、36409-36428、36512-36531、36517-36536、36583-36602、36680-36699、36681-36700、36841-36860、36846-36865、 39670-39689和39832-39851。
在某些实施方案中，SEQ ID NO：2的下列核苷酸区当由反义化合物或寡核苷酸靶向时显示至少90％抑制：32447-32466、32452-32471、 32460-32479、32462-32481、32464-32483、32465-32484、32466-32485、 32467-32486、32468-32487、32619-32638、32620-32639、32753-32772、 36250-36269、36517-36536、32432-32451、32431-32450、30483-30502、 29828-29847、29011-29030、28026-28045、29011-29030、29828-29847、 30483-30502、32431-32450、32432-32451、32447-32466、32452-32471、 32460-32479、32462-32481、32464-32483、32465-32484、32466-32485、 32467-32486、32468-32487、32619-32638、32620-32639、32753-32772、 36250-36269、36252-36271、36409-36428和36517-36536。
在某些实施方案中，下列反义化合物或反义寡核苷酸靶向 DGAT2核酸的以下区并且实现DGAT2 mRNA的至少60％抑制：ISIS NO：413236、413284、413391、413399、413413、413422、413433、 413433、413441、413446、423460-423466、423520-423527、 423601-423604、472182、472188、472189、472194-472196、 472203-472206、472208、472347、472349-472352、472398、483803、 483811-483814、483816-483818、483821-483823、483825-483835、 483838-483842、483846-483848、483852、483853、483862、483866、483868-483875、483879、483886-483890、483892、483895、 483897-483903、483906-483913、483916-483929、483932-483934、 483936、483942、483948-483950、483952、483954、483956、483961、 483968-483973、483975-483979、483981、483983-483989、483992-483997、484001、484002、484004-484006、484008-484013、 484015-484017、484019、484020、484028、484030、484031、484041、 484049、484050、484054-484057、484063-484065、484069-484073、 484081-484083、484085、484089、484094、484097-484107、484110、 484111、484114-484119、484123、484125-484127、484129-484137、484139-484142、484145-484149、484152、484154、484156-484159、 484161、484162、484164、484165、484167-484172、484178-484182、 484184、484185、484188、484190-484198、484202-484204、 484209-484211、484213、484215、484217-484221、484227、484231、 484232、484234、484235、484237、484240-484243、484248-484250、 484257、484263、484265-484271、484273-484276、484281-484285、 484290、484292、484293、484298、484299、484301、484302、484310、 484319-484325、484327、484336、484338、484342-484344、 484346-484357、484359、484362-484365、484368、484370-484387、484390、484404、484411、495425、495428、495429、495430、495436、 495438、495440-495459、495461-495473、495475、495476、 495479-495492、495495-495511、495514-495545、495548-495580、 495584、495585、495587-495594、495596-495626、495630-495639、 495641-495644、495648-495651、495656、495657、495660-495662、 495664-495667、495669-495671、495676、495677、495684-495689、 495692-495707、495711、495713、495714、495717-495732、495734、 495736-495739、495742-495757、495762-495766、495772-495774、 495781-495786、495788、495789、495791、495793-495797、495799、 495800、495804、495808-495813、495817-495844、495847-495860、 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523000-523002、523015、523016、523022、523025-523027、525388、 525391、525394、525395、525399、525401-525405、525414-525416、 525419、525420、525423、525424、525431、525434-525436、 525441-525444、525450、525461、525468-525474、525477、525479、525480、525484、525485、525488-525491、525498-525501、 525504-525507、525511-525518、525520、525528、525535-525537、 525539、525541、525542、525544、525547-525558、525565、 525577-525579、525606、525609-525612、525619、525631、525632、525649、525650、525658、525683、525687、525688、525690、 525705-525711、525733、525737、525740、525741和525754。
在某些实施方案中，下列反义化合物或反义寡核苷酸靶向 DGAT2核酸的以下区并且实现DGAT2 mRNA的至少60％抑制：SEQ ID NO：20、38、39、41、46-48、61-64、68、69、74、75、76、103、 120、121、122、131、134、144、145、150、152、153、154、181、 182、183、202-204、221、225、226、229、236、237、246、247、 251、259、262、272、277-280、283、383、391、405、414、425、433、438、450、452、453、455-479、482-496、504-507、509-511、514-516、518-528、531-535、539-541、545、546、555、559、561-568、 574、575、577、578、583、584、589、594-596、597、601、607、 608、613-615、622-625、627、652、653、660、674、706、709-711、 718-720、726、738、740-745、749-752、754-756、758-769、774、789、 793、794、807-812、815、819、820、839、841-846、848-852、878-880、 884、885、889、890、892-895、897、899、900、902、904、907、 910、913-916、923、935-940、960-964、968、972-977、979-981、983-985、 988、991-1010、1014、1015、1017、1018、1020、1023-1025、1032-1034、 1036-1038、1040、1043-1049、1051-1054、1057-1061、1065、1071-1073、 1078-1080、1083、1084、1092-1098、1103、1107、1108、1117、1118、 1136、1141、1142、1148、1149、1153、1155、1159、1165、1172-1176、 1178、1181、1183-1189、1192-1199、1202-1215、1218-1220、1222、 1228、1234-1236、1238、1240、1242、1247、1254-1259、1261-1265、 1267、1269-1275、1278-1283、1287、1288、1290-1292、1294-1299、1301-1303、1305、1306、1314、1316、1317、1327、1335、1336、 1340-1343、1349-1351、1355-1359、1367-1369、1371、1375、1380、 1383-1393、1396、1397、1400-1405、1409、1411-1413、1415-1423、 1425-1428、1431-1435、1438、1440、1442-1445、1447、1448、1450、 1451、1453-1458、1464-1468、1470、1471、1474、1476-1484、1488-1490、 1495-1497、1499、1501、1503-1507、1513、1517、1518、1520、1521、 1523、1526-1529、1534-1536、1543、1549、1551-1557、1559-1562、 1567-1571、1576、1578、1579、1584、1585、1587、1588、1596、1605-1611、1613、1622、1624、1628-1630、1632-1643、1645、1648-1651、 1654、1656-1673、1676、1677、1690、1697、1698、1701-1703、1709、 1711、1713-1746、1748、1749、1752-1765、1768-1784、1787-1818、 1821-1853、1857、1858、1860-1867、1869-1899、1903-1912、1914-1917、 1921-1924、1929、1930、1933-1935、1937-1940、1942-1944、1949、 1950、1957-1962、1965-1980、1984、1986、1987、1990-2005、2007、 2009-2012、2015-2030、2035-2039、2045-2047、2054-2059、2061、 2062、2064、2066-2070、2072、2073、2077、2081-2086、2090-2117、2120-2133、2135-2143、2146-2156、2159、2172-2177、2182、2184-2187、 2191、2193-2196、2228、2230、2231、2256、2265、2277、2282、 2283、2285、2306、2308、2310-2334、2338-2340、2342、2350、2351、2354-2359、2362-2371、2373-2385、2402、2405、2409、2415、2418、 2425、2428、2436、2440、2453、2465-2468、2478、2479、2482、 2485-2487、2492、2494、2502、2508、2525、2527、2528、2535、 2543、2544、2547、2554、2560、2565、2566、2571-2573、2582、 2583、2588、2589、2598、2599、2601-2603、2606、2613、2615、 2632-2637、2639、2642、2643、2645、2647、2650、2656-2658、2661-2669、 2679、2691、2692、2694、2695、2701、2704、2705、2713、2715-2717、 2722、2723、2726、2727、2728、2730-2732、2734-2739、2748、2754、 2755、2757、2760-2763、2779、2780、2785、2786、2793、2795-2797、 2801、2804、2808、2811、2812、2817、2825、2826、2830、2833、 2836、2837、2840、2841、2846、2848、2849、2857、2864、2871、 2872、2875、2876、2897、2900、2917、2918、2929、2933、2935、 2936-2951、2953、2959、2965、2969、2978、2981、2982、2984-2988、 2998、3001、3014、3030-3032、3042、3044、3045、3048、3049、 3055、3057、3058、3064、3066、3074、3075、3077、3079、3080、 3081、3089、3094、3109、3111-3113、3117、3122-3126、3129、3132、 3134-3140、3143、3144、3148、3151、3153、3154、3160、3163、 3166-3168、3172-3174、3181-3183、3193-3198、3200、3204、3208、 3211、3212、3215、3217、3218、3220、3222、3225、3229、3233、 3242、3244、3247、3248、3252-3254、3256、3261、3262、3265、 3270-3274、3277、3284、3287、3289、3290、3292、3302、3304、 3313、3318、3321、3326、3334、3388、3390、3392、3393、3396、 3398、3404、3408、3410、3412、3417、3418、3420、3422-3429、 3432、3434、3438、3442-3452、3464、3466、3468、3470、3471、 3473-3480、3488-3491、3494、3496、3500、3501、3503-3518、3521-3527、 3529-3545、3547-3557、3559、3561、3562、3566-3572、3574-3579、 3583-3595、3597-3618、3621-3623、3626、3627、3630、3634、3635、3638-3640、3645-3655、3657-3663、3666-3670、3678、3682-3687、 3691-3698、3702、3703、3707-3719、3722-3730、3732-3744、3747-3750、 3762-3768、3771-3773、3776-3789、3791-3807、3809-3833、3837、 3838、3843-3845、3849-3854、3859、3862-3866、3868-3876、3881-3883、 3885、3887-3890、3893-3902、3906-3908、3910、3912-3914、3918、 3926-3929、3934-3936、3940-3944、3947、3949、3951-3955、3957-3959、 3961、3962、3970-3978、3980-3985、3992-3995、3997-4000、4002-4004、 4006、4009-4011、4014、4018、4019、4022、4029、4030、4032、 4036-4040、4044-4048、4050-4055、4061、4069、4070、4075、4082、 4083、4085、4086、4092、4095-4097、4105-4109、4113、4114、4123、 4124、4127-4129、4143、4146、4149、4150、4154、4156-4160、4169-4171、 4174、4175、4178、4179、4186、4189-4191、4196-4199、4205、4222、 4229-4235、4238、4240、4241、4245、4246、4249-4252、4259-4262、4265-4268、4272-4279、4281、4289、4296-4298、4300、4302、4303、 4305、4308-4319、4326、4338-4340、4364、4367、4368、4372、4373、 4380、4392、4393、4410、4411、4419、4444、4448、4449、4451、 4466-4472、4494、4498、4501、4502、4515、4526-4530、4532-4535、 4537、4538-4541、4544-4546、4556-4573、4575-4578、4580-4583、 4588、4589、4592-4594、4596、4597、4599-4601、4604、4605、4612-4614、 4616、4620、4622-4625、4634-4636、4644、4652、4655、4656、4667-4670 和4672。
在某些实施方案中，下列反义化合物或反义寡核苷酸靶向 DGAT2核酸的以下区并且实现DGAT2 mRNA的至少70％抑制：ISIS NO：413236、413433、413446、423437、423440-423445、423447、 423449、423450、423452-423454、423460-423465、423522-423528、423601-423604、472204、472205、472208、472349-472351、483803、 483811-483814、483816-483818、483825、483826、483828-483835、 483838-483842、483846、483848、483852、483862、483866、483869、 483870、483872-483875、483879、483887-483890、483892、483895、483897-483903、483908-483913、483916-483921、483923、483924、483926-483928、483934、483948-483950、483952、483954、 483968-483970、483972、483973、483975、483977-483979、 483984-483989、483992-483994、483996、483997、484001、484004、 484006、484010、484012、484017、484019、484020、484030、484031、484041、484049、484056、484064、484069、484070、484071、484073、 484082、484083、484085、484089、484094、484099-484102、484104、 484105、484107、484110、484111、484114-484118、484126、484127、 484129-484131、484133、484135-484137、484139-484142、 484145-484148、484156-484158、484161、484167、484169-484172、 484178、484180-484182、484185、484190、484192-484194、484198、 484202-484204、484209、484211、484215、484217-484220、484231、 484232、484235、484241、484248、484249、484263、484265、 484267-484271、484273、484274、484276、484283-484285、484290、484292、484293、484301、484302、484320-484322、484324、484327、 484336、484342-484344、484346、484348-484350、484352、484353、 484355-484357、484359、484368、484370-484378、484381-484383、 484390、495425、495429、495430、495440-495443、495445-495454、 495456、495458、495461-495473、495476、495479-495485、 495487-495492、495495-495499、495501-495511、495514-495531、 495533-495545、495548-495556、495558、495560-495566、 495568-495580、495584、495585、495588-495592、495597-495600、 495602-495610、495612-495614、495616-495626、495631-495633、495636-495639、495641-495643、495649、495650、495656、495657、 495661、495664、495666、495669-495671、495677、495685、495686、 495694、495695、495697、495699-495702、495705-495707、495711、 495714、495718-495720、495724、495730、495731、495736-495739、 495743-495746、495748-495754、495756、495757、495762、495763、495766、495772、495782、495784、495785、495789、495794、495795、 495800、495804、495808-495813、495817-495822、495825-495833、495835-495837、495838-495844、495848-495850、495852-495857、 495859、495860、495867-495869、495873-495878、495882、495899-495902、495904、495911、495912、495955、495957、495958、 495992、500841、500844、500852、500859、500867、500892、500913、 500928、500942、500950、500953、500966、500975、500986、500989、 500990、500994、500998、501018-501020、501025、501030、 501033-501035、501038-501041、501062、501064、501067、501069、 501093、501094、501097、501098、501100、501103、501111、501118、 501122、501123、501127、501128、501154、501165、501171、501176、 501183、501184、501199、501200、501210、501212-501214、501224、 501240、501249、501270、501287、501382-501385、501387-501396、 501398-501402、501404-501406、501410-501412、501414、 501426-501430、501435、501436、501438-501443、501445、 501447-501452、501454-501457、501849、501850、501852、501855、 501861、501871、501883、501884、501886、501890、501916、501932、 501944、501946、501950、501951、501959、501960、501966、501968、 501981-501983、502013、502015、502025、502026、502037、502040、 502045、502046、502056、502083、502098、502099、502106、502110、 502119、502120、502131、502135、502154-502156、502163、502164、 502175、502179、502189、502191、502194、502220、502319、502322、 502334、507663、507679、507684、507692-507696、507710、 507716-507718、507724、522363、522366、522368、522370、 522373-522375、522383-522385、522399、522404-522406、522408、 522409、522411、522418、522421、522422、522424、522427、522428、 522434-522437、522440、522442、522444-522446、522450、522452、 522457、522462-522467、522470、522473、522474、522478、522479、 522482、522484-522490、522492、522494-522496、522501、 522503-522505、522509、522510、522518、522529、522534、522540、 522542-522550、522552-522556、522561、522562、522565、 522578-522582、522587-522592、522602-522610、522612-522614、522618、522619、522621、522622、522625、522627、522630-522638、 522642-522645、522657、522658、522661-522663、522666、522667、 522671-522683、522687-522694、522696-522702、522705、522706、522709、522710、522714-522719、522722-522728、522740、 522745-522748、522754、522757-522759、522761、522766-522771、 522776-522778、522780、522783、522784、522789、522791、522793、 522794、522797、522801、522802、522807、522821、522831、522838、 522842、522844、522853、522857、522865、522866、522869-522872、 522877、522878、522888、522889、522894、522897、522898、522905、 522913、522917、522924、522925、522932、522939、522940-522943、 522947、522950、522964、522965、522996、523000、523002、523026、 525395、525401、525402、525415、525431、525442、525443、525468-525472、525474、525477、525479、525480、525499-525501、525505、525506、525512、525513、525515、525536、525544、 525551-525554、525578、525612、525631、525688、525705、525708、 525711、525733和525754。
在某些实施方案中，下列反义化合物或反义寡核苷酸靶向 DGAT2核酸的以下区并且实现DGAT2 mRNA的至少70％抑制：SEQ ID NO：20、38、39、46、47、62、63、103、120、121、131、144、 145、150、152、153、154、182、183、202、203、204、221、225、 229、246、259、283、425、438、452、453、455-458、460、462-477、 479、482-485、487-496、504-507、509-511、518、519、521-528、531-535、 539、541、545、555、559、562、563、565-568、574、575、577、 594、595、597、623、624、627、653、706、710、740、742-744、 749-752、754-756、758、760-766、768、769、789、808-811、841-843、 845、846、848、850-852、880、890、893、895、897、914-916、939、940、960、961、973、974、981、991-997、1000、1001、1003-1008、 1015、1020、1024、1032、1034、1036、1043-1045、1047-1049、1052、 1059-1061、1079、1080、1083、1084、1092、1093、1096、1098、1155、1165、1173-1176、1178、1181、1183-1189、1194-1199、1202-1207、 1209、1210、1212-1214、1220、1234-1236、1238、1240、1254-1256、 1258、1259、1261、1263-1265、1270-1275、1278-1280、1282、1283、 1287、1290、1292、1296、1298、1303、1305、1306、1316、1317、 1327、1335、1342、1350、1355-1357、1359、1368、1369、1371、 1375、1380、1385-1388、1390、1391、1393、1396、1397、1400-1404、 1412、1413、1415-1417、1419、1421-1423、1425-1428、1431-1434、 1442-1444、1447、1453、1455-1458、1464、1466-1468、1471、1476、 1478-1480、1484、1488-1490、1495、1497、1501、1503-1506、1517、1518、1521、1527、1534、1535、1549、1551、1553-1557、1559、 1560、1562、1569-1571、1576、1578、1579、1587、1588、1606-1608、 1610、1613、1622、1628-1630、1632、1634-1636、1638、1639、1641-1643、 1645、1654、1656-1664、1667-1669、1676、1677、1698、1702、1703、 1713-1716、1718-1727、1729、1731、1734-1746、1749、1752-1758、 1760-1765、1768-1772、1774-1784、1787-1804、1806-1818、1821-1829、 1831、1833-1839、1841-1853、1857、1858、1861-1865、1870-1873、 1875-1883、1885-1887、1889-1899、1904-1906、1909-1912、1914-1916、 1922、1923、1929、1930、1934、1937、1939、1942-1944、1950、 1958、1959、1967、1968、1970、1972-1975、1978-1980、1984、1987、 1991-1993、1997、2003、2004、2009-2012、2016-2019、2021-2027、 2029、2030、2035、2036、2039、2045、2055、2057、2058、2062、 2067、2068、2073、2077、2081-2086、2090-2095、2098-2106、2108-2117、 2121-2123、2125-2130、2132、2133、2140-2142、2146-2151、2155、2172-2175、2177、2184、2185、2228、2230、2231、2265、2308、 2310-2313、2315-2324、2326-2330、2332-2334、2338-2340、2342、 2350、2351、2354-2358、2363、2364、2366-2371、2373、2375-2380、 2382-2385、2478、2487、2508、2525、2543、2554、2560、2565、 2572、2573、2588、2589、2599、2601-2603、2613、2632、2633、 2636、2637、2639、2642、2650、2657、2661、2662、2666、2667、 2691、2695、2715-2717、2722、2727、2730-2732、2735-2738、2755、2757、2760、2762、2779、2793、2801、2804、2817、2826、2837、 2840、2841、2846、2849、2857、2864、2872、2897、2918、2947、 2948、2950、2953、2959、2969、2981、2982、2984、2988、3014、 3030、3042、3044、3048、3049、3057、3058、3064、3066、3079-3081、 3111、3113、3123、3124、3135、3138、3143、3144、3154、3173、 3181、3196、3197、3204、3208、3217、3218、3229、3233、3252-3254、3261、3262、3273、3277、3287、3289、3292、3318、3388、3393、 3404、3412、3417、3420、3425-3429、3432、3443、3449-3451、3464、 3468、3471、3473、3475、3478-3480、3488-3490、3504、3509-3511、 3513-3516、3523、3526、3527、3529、3532、3533、3539-3542、3545、 3547、3549-3551、3555、3557、3562、3567-3572、3575、3578、3579、 3583、3584、3587、3589-3595、3597、3599-3601、3606、3608-3610、 3614、3615、3623、3634、3639、3645、3647-3655、3657-3661、3666、 3667、3670、3683-3687、3692-3697、3707-3715、3717-3719、3723、 3724、3726、3727、3730、3732、3735-3743、3747-3750、3762、3763、 3766-3768、3771、3772、3776-3788、3792-3799、3801-3807、3810、 3811、3814、3815、3819-3824、3827-3833、3845、3850-3853、3859、3862-3864、3866、3871-3876、3881-3883、3885、3888、3889、3894、 3896、3898、3899、3902、3906、3907、3912、3926、3936、3943、 3947、3949、3958、3962、3970、3971、3974-3977、3982、3983、 3993、3994、3999、4002、4003、4010、4018、4022、4029、4030、 4037、4044-4048、4052、4055、4069、4070、4096、4123、4127、 4129、4150、4156、4157、4170、4186、4197、4198、4229-4233、 4235、4238、4240、4241、4260-4262、4266、4267、4273、4274、 4276、4297、4305、4312-4315、4339、4373、4392、4449、4466、 4469、4472、4494、4515、4526-4530、4532、4533、4535、4537-4540、 4545、4546、4558-4560、4562-4570、4573、4575、4576、4578、4580、 4582、4588、4589、4592、4596、4600、4601、4604、4612-4614、 4616、4622-4625、4634、4635、4652、4667和4668。
在某些实施方案中，下列反义化合物或反义寡核苷酸靶向 DGAT2核酸的以下区并且实现DGAT2 mRNA的至少80％抑制：ISIS NO：413433、423463、423464、423523、423524、423526、472351、 483817、483825、483826、483828、483830-483835、483839-483841、483848、483852、483866、483869、483870、483873-483875、483887、 483889、483890、483895、483897、483898、483900、483901、 483908-483910、483913、483916、483919、483921、483923、483924、 483927、483952、483968-483970、483972、483984、483986-483988、 483992、483993、483996、483997、484004、484017、484031、484041、 484049、484064、484070、484085、484094、484099、484100、 484115-484117、484126、484127、484129-484131、484133、484137、 484139-484141、484148、484156-484158、484167、484169-484171、 484181、484182、484192、484193、484203、484204、484209、484215、484217、484218、484220、484231、484235、484249、484267-484271、 484273、484283、484284、484292、484293、484301、484327、484336、 484343、484344、484348、484350、484353、484357、484368、484377、 484378、495425、495429、495440、495442、495446、495449-495451、 495453、495454、495463、495464、495466、495467、495469-495472、495481、495482、495484、495485、495488-495492、495495-495498、 495505-495510、495514-495531、495533-495537、495539-495541、 495543-495545、495550-495556、495560、495561-495564、495566、 495568-495578、495585、495591、495598-495600、495604、495606、 495608、495609、495618-495622、495639、495649、495650、495685、495686、495697、495702、495705-495707、495718、495730、495736、 495738、495739、495744、495745、495749、495751-495753、495756、 495785、495808-495810、495817-495820、495822、495825-495832、 495835-495844、495849、495852-495854、495856、495857、 495867-495869、495874-495878、495902、495992、500859、500867、 500913、500998、501020、501034、501035、501064、501094、501098、 501100、501103、501127、501183、501199、501213、501385、501387-501393、501396、501398、501404-501406、501411、501412、 501427-501430、501435、501436、501438、501440、501442、501443、 501447-501452、501454-501855、501861、501884、501944、501950、 501983、502040、502046、502056、502083、502099、502119、502154、502164、502175、502179、502189、502191、502319、507692、507694、 507696、507717、522366、522373-522375、522383、522435-522437、522444、522445、522450、522465、522473、522484、522485、522495、 522501、522509、522529、522546、522550、522553-522556、 522579-522582、522587-522589、522606-522610、522618、522621、 522627、522630-522632、522634、522638、522643、522645、522667、 522671、522672、522674-522683、522687-522692、522694、 522696-522700、522705、522709、522715-522719、522745、522757、 522770、522783、522784、522807、522865、522866、522888、522889、 522897、522913、522942、522964、523002、525401、525469、525470、 525501和525612。
在某些实施方案中，下列反义化合物或反义寡核苷酸靶向 DGAT2核酸的以下区并且实现DGAT2 mRNA的至少80％抑制：SEQ ID NO：103、120、121、131、144、145、150、152、153、182、204、 246、259、283、425、456、457、462、463、467-469、487-490、504、 506、509、510、518、519、521、523、524-528、532-534、541、545、 559、562、563、566-568、594、742、750、751、762、808-810、843、 845、893、915、939、973、993-995、997、1000、1001、1005、1006、 1008、1034、1060、1061、1079、1084、1173、1175、1176、1181、 1183、1184、1186、1187、1194-1196、1199、1202、1205、1207、 1209、1210、1213、1238、1254-1256、1258、1270、1272-1274、1278、1279、1282、1283、1290、1303、1317、1327、1335、1350、1356、 1371、1380、1385、1386、1401-1403、1412、1413、1415-1417、1419、 1423、1425-1427、1434、1442-1444、1453、1455-1457、1467、1468、 1478、1479、1489、1490、1495、1501、1503、1504、1506、1517、1521、1535、1553-1557、1559、1569、1570、1578、1579、1587、 1613、1622、1629、1630、1634、1636、1639、1643、1654、1663、 1664、1677、1698、1702、1713、1715、1719、1722-1724、1726、 1727、1736、1737、1739、1740、1742-1745、1754、1755、1757、 1758、1761-1765、1768-1771、1778-1783、1787-1804、1806-1810、 1812-1814、1816-1818、1823-1829、1833-1837、1839、1841-1851、 1858、1864、1871-1873、1877、1879、1881、1882、1891-1895、1912、 1922、1923、1958、1959、1970、1975、1978-1980、1991、2003、 2009、2011、2012、2017、2018、2022、2024-2026、2029、2058、2081-2083、2090-2093、2095、2098-2105、2108-2117、2122、2125-2127、 2129、2130、2140-2142、2147-2151、2175、2265、2313、2315-2321、 2324、2326、2332-2334、2339、2340、2355-2358、2363、2364、2366、 2368、2370、2371、2375-2380、2382、2383、2572、2588、2602、 2633、2637、2639、2642、2666、2695、2717、2731、2732、2757、 2864、2872、2918、2953、2959、2982、3042、3048、3081、3138、 3144、3154、3181、3197、3217、3252、3262、3273、3277、3287、 3289、3404、3417、3425、3427、3429、3450、3471、3478-3480、 3488、3540-3542、3549、3550、3555、3570、3578、3589、3590、 3600、3606、3614、3634、3651、3655、3658-3661、3684-3687、3692-3694、 3711-3715、3723、3726、3732、3735-3737、3739、3743、3748、3750、 3772、3776、3777、3779-3788、3792-3797、3799、3801-3803、3805、 3810、3814、3820-3824、3850、3862、3875、3888、3889、3912、 3970、3971、3993、3994、4002、4018、4047、4069、4129、4156、 4230、4231、4262、4373、4526、4529、4532、4538、4540、4560、 4562-4564、4566-4570、4578、4623、4625和4667。
在某些实施方案中，下列反义化合物或反义寡核苷酸靶向 DGAT2核酸的以下区并且实现DGAT2 mRNA的至少90％抑制：ISIS NO：413433、423463、483817、483825、483834、483848、483866、 483869、483873、483874、483895、483898、483908、483910、483913、483952、484085、484148、484157、484170、484181、484231、484271、 484283、484350、484353、495449、495450、495495、495498、495505、 495506、495516-495520、495522-495524、495526、495527、495535、 495553-495555、495562、495563、495570、495571、495575-495577、 495620、495752、495809、495825、495829、495836、495837、 495839-495842、495853、495857、495876、495878、501385、501387、 501404、501412、501427、501430、501442、501443、501447、501448、 501450、501452、501861、522632、522688和522745。
在某些实施方案中，下列反义化合物或反义寡核苷酸靶向 DGAT2核酸的以下区并且实现DGAT2 mRNA的至少90％抑制：SEQ ID NO：283、425、457、467、510、518、527、541、559、562、566、 567、1181、1184、1194、1196、1199、1238、1371、1434、1443、 1456、1467、1517、1557、1569、1636、1639、1722、1723、1768、 1771、1778、1779、1789-1793、1795-1797、1799、1800、1808、1826-1828、 1835、1836、1843、1844、1848-1850、1893、2025、2082、2098、 2102、2109、2110、2112-2115、2126、2130、2149、2151、2313、 2315、2332、2340、2355、2358、2370、2371、2375、2376、2378、 2380、2959、3737、3793、3850、4562、4564、4566、4568和4569。
在某些实施方案中，化合物包含修饰寡核苷酸，所述修饰寡核苷酸由8至80个连接核苷组成、具有与SEQ ID NO：2的核苷酸 26778-26797、23242-23261、26630-26649、15251-15270、28026-28045、 35436-35455、10820-10836、23246-23262内的等长部分互补的至少8、 9、10、11、12、13、14、15或16个连续核碱基部分
在某些实施方案中，化合物包含由在SEQ ID NO：2的核苷酸 26778-26797、23242-23261、26630-26649、15251-15270、28026-28045、 35436-35455、10820-10836、23246-23262内互补的10至30个连接核苷组成的修饰寡核苷酸。
在某些实施方案中，化合物包含修饰寡核苷酸，所述修饰寡核苷酸由8至80个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、 1849、2959、3292、4198和4373中任一者的至少8、9、10、11、12、 13、14、15或16个连续核碱基部分的核碱基序列。
在某些实施方案中，化合物包含修饰寡核苷酸，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、 1415、1849、2959、3292、4198和4373中任一者的核碱基序列。
在某些实施方案中，化合物包含具有由SEQ ID NO：1423、1371、 1415、1849、2959、3292、4198和4373中的任一者组成的核碱基序列的修饰寡核苷酸。在某些实施方案中，靶向DGAT2的修饰寡核苷酸是ISIS 484137、484085、484129、495576、501861、502194、525443 和525612。
在某些实施方案中，靶向DGAT2的修饰寡核苷酸是ISIS 484137、 484085、484129、495576、501861、502194、525443和525612。在如下文实施例部分中所述被筛选的约5,000种反义寡核苷酸之中ISIS 484137、484085、484129、495576、501861、502194、525443和525612显现为热点先导化合物。具体地，在约5,000种反义寡核苷酸之中就效力和耐受性而言ISIS484137表现出最佳的特性组合。
在某些实施方案中，前述化合物或寡核苷酸中的任一种包含至少一个修饰核苷间键合、至少一个修饰糖和/或至少一个修饰核碱基。
在某些方面，前述化合物或寡核苷酸中的任一种包含至少一个修饰糖。在某些方面，至少一个修饰糖包含2′-O-甲氧基乙基。在某些方面，至少一个修饰糖为双环糖，诸如4’-CH(CH3)-O-2’基团、 4’-CH2-O-2’基团或4’-(CH2)2-O-2’基团。
在某些方面，修饰寡核苷酸包含至少一个修饰核苷间键合，诸如硫代磷酸酯核苷间键合。
在某些实施方案中，前述化合物或寡核苷酸中的任一种包含至少一个修饰核碱基，诸如5-甲基胞嘧啶。
在某些方面，前述化合物或寡核苷酸中的任一种包含：
由连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由连接核苷组成的5’翼区段；以及
由连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间，并且其中每个翼区段的每个核苷包含修饰糖。在某些实施方案中，寡核苷酸由8至80 个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、 2959、3292、4198和4373中列出的序列的核碱基序列。在某些方面，寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、 1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373中列出的序列的核碱基序列。
在某些方面，修饰寡核苷酸具有SEQ ID NO：1423、1371、1415、 1849、2959或3292中列出的序列的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸由20-80个连接核苷组成。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸由20-30个连接核苷组成。
在某些方面，修饰寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：4198或4373 中列出的序列的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由三个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由四个连接核苷组成的3’翼段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸由17-80个连接核苷组成。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸由17-30个连接核苷组成。
在某些实施方案中，化合物包含ISIS 484137或由ISIS 484137组成并且具有以下化学结构或其盐：
在某些实施方案中，化合物包含ISIS 484137(用接受的寡核苷酸命名法命名的)或由ISIS 484137组成，显示了如下的每个3′-O至5′-O- 连接的硫代磷酸二酯核苷酸间键合：
2′-O-(2-甲氧基乙基)-5-甲基-P-硫代尿苷酰-(3′-O→5′-O)-2′-O-(2- 甲氧基乙基)-P-硫代鸟苷酰-(3′-O→5′-O)-2′-O-(2-甲氧基乙基)-5-甲基 -P-硫代胞苷酰-(3′-O→5′-O)-2′-O-(2-甲氧基乙基)-5-甲基-P-硫代胞苷酰-(3′-O→5′-O)-2′-O-(2-甲氧基乙基)-P-硫代腺苷酰-(3′-O→5′-O)-P- 硫代胸苷酰-(3′-O→5′-O)-P-硫代胸苷酰-(3′-O→5′-O)-P-硫代胸苷酰 -(3′-O→5′-O)-2′-脱氧-P-硫代腺苷酰-(3′-O→5′-O)-2′-脱氧-P-硫代腺苷酰-(3′-O→5′-O)-P-硫代胸苷酰-(3′-O→5′-O)-2′-脱氧-P-硫代鸟苷酰 -(3′-O→5′-O)-2′-脱氧-P-硫代腺苷酰-(3′-O→5′-O)-2′-脱氧-P-硫代鸟苷酰-(3′-O→5′-O)-2′-脱氧-5-甲基-P-硫代胞苷酰-(3′-O→5′-O)-2′-O-(2-甲氧基乙基)-5-甲基-P-硫代尿苷酰-(3′-O→5′-O)-2′-O-(2-甲氧基乙基)-5- 甲基-P-硫代尿苷酰-(3′-O→5′-O)-2′-O-(2-甲氧基乙基)-5-甲基-P-硫代胞苷酰-(3′-O→5′-O)-2′-O-(2-甲氧基乙基)-P-硫代腺苷酰 -(3′-O→5′-O)-2′-O-(2-甲氧基乙基)-5-甲基-胞苷，19种钠盐。
在前述实施方案的任一个中，化合物或寡核苷酸与编码DGAT2 的核酸可以至少85％、至少90％、至少95％、至少98％、至少99％或100％互补。
在任一前述实施方案中，反义化合物可以是单链寡核苷酸。
在任一前述实施方案中，寡核苷酸可以由8至80个、10至30 个、12至50个、13至30个、13至50个、14至30个、14至50个、 15至30个、15至50个、16至30个、16至50个、17至30个、17 至50个、18至22个、18至24个、18至30个、18至50个、19至 22个、19至30个、19至50个或20至30个连接核苷组成。
在某些实施方案中，本文提供的化合物或组合物包含修饰寡核苷酸的盐。在某些实施方案中，所述盐是钠盐。在某些实施方案中，所述盐是钾盐。
在某些实施方案中，化合物包含本文所述的修饰寡核苷酸和缀合基团。在某些实施方案中，缀合基团在修饰寡核苷酸的5’端连接至修饰寡核苷酸。在某些实施方案中，缀合基团在修饰寡核苷酸的3’端连接至修饰寡核苷酸。在某些实施方案中，缀合基团包含至少一个N- 乙酰基半乳糖胺(GalNAc)、至少两个N-乙酰基半乳糖胺(GalNAc)或至少三个N-乙酰基半乳糖胺(GalNAc)。
在某些实施方案中，具有以下化学结构的化合物包含以下项或由以下项组成：具有包括如本文所述的GalNAc的缀合基团的ISIS 484137或其盐：
其中对于相同环上的每对R1和R2，独立地对于每个环，R1为-OCH2CH2OCH3(MOE)并且R2为H；或者R1和R2一起形成桥，其中R1为-O-并且R2为-CH2-、-CH(CH3)-或-CH2CH2-，并且R1和R2直接相连使得所得桥选自：-O-CH2-、-O-CH(CH3)-和-O-CH2CH2-；并且对于相同环上的每对R3和R4，独立地对于每个环：R3选自H和 -OCH2CH2OCH3并且R4为H；或者R3和R4一起形成桥，其中R3为 -O-并且R4为-CH2-、-CH(CH3)-或-CH2CH2-，并且R3和R4直接相连使得所得桥选自：-O-CH2-、-O-CH(CH3)-和-O-CH2CH2-；并且每个 R5独立地选自H和-CH3；并且每个Z独立地选自S-和O-。
在某些实施方案中，化合物包含以下项或由以下项组成：SEQ ID NO：1423、5’-GalNAc以及如以下化学结构所呈现的化学修饰：
其中对于相同环上的每对R1和R2，独立地对于每个环，R1为 -OCH2CH2OCH3(MOE)并且R2为H；或者R1和R2一起形成桥，其中R1为-O-并且R2为-CH2-、-CH(CH3)-或-CH2CH2-，并且R1和R2直接相连使得所得桥选自：-O-CH2-、-O-CH(CH3)-和-O-CH2CH2-；并且对于相同环上的每对R3和R4，独立地对于每个环：R3选自H和 -OCH2CH2OCH3并且R4为H；或者R3和R4一起形成桥，其中R3为 -O-并且R4为-CH2-、-CH(CH3)-或-CH2CH2-，并且R3和R4直接相连使得所得桥选自：-O-CH2-、-O-CH(CH3)-和-O-CH2CH2-；并且每个 R5独立地选自H和-CH3；并且每个Z独立地选自S-和O-；并且X 为H或任选包含缀合接头和/或可裂解部分的缀合基团。
在某些实施方案中，化合物包含ISIS 769355或其盐。在某些实施方案中，化合物由ISIS 769355或其盐组成。在某些实施方案中， ISIS 769355具有以下化学结构：
在某些实施方案中，化合物包含ISIS 769356或其盐。在某些实施方案中，化合物由ISIS 769356或其盐组成。在某些实施方案中， ISIS 769356具有以下化学结构：
在某些实施方案中，化合物包含ISIS 769357或其盐。在某些实施方案中，化合物由ISIS 769357或其盐组成。在某些实施方案中， ISIS 769357具有以下化学结构：
某些实施方案提供包含有包含以下项或由以下项组成的化合物中的任一种以及药学上可接受的载体或稀释剂中的至少一种的组合物：靶向DGAT2的修饰寡核苷酸或其盐以及缀合基团。
在某些实施方案中，如本文所述的化合物或组合物因具有以下至少一种体外IC50而有效：小于2nM、小于3nM、小于4nM、小于5 nM、小于6nM、小于7nM、小于8nM、小于9nM、小于10nM、小于20nM、小于30nM、小于35nM、小于40nM、小于45nM、小于50nM、小于60nM、小于70nM、小于80nM、小于90nM、小于100nM、小于110nM、小于300nM、小于400nM、小于500nM、小于600nM、小于700nM、小于800nM、小于900nM、小于1μM、小于1.1μM、小于1.2μM、小于1.3μM、小于1.4μM、小于1.5μM、小于1.6μM、小于1.7μM、小于1.8μM、小于1.9μM、小于2μM、小于2.5μM、小于3μM、小于3.5μM、小于4μM、小于4.5μM、小于5μM、小于5.5μM、小于6μM、小于6.5μM或小于10μM。
在某些实施方案中，如本文所述的化合物或组合物具有高度可耐受性，如由以下至少一个所表明：ALT或AST值增加至用生理盐水处理过的动物的至多4倍、3倍或2倍，或肝脏、脾脏或肾脏重量增加至多30％、20％、15％、12％、10％、5％或2％。在某些实施方案中，如本文所述的化合物或组合物具有高度可耐受性，如由相比于用生理盐水处理过的动物而言ALT或AST未增加所表明。在某些实施方案中，如本文所述的化合物或组合物具有高度可耐受性，如由相比于用生理盐水处理过的动物而言肝脏、脾脏或肾脏重量未增加所表明。
某些适应症
本文提供的某些实施方案涉及通过施用DGAT2特异性抑制剂 (诸如靶向DGAT2的反义化合物)治疗、预防或减轻个体中与DGAT2 相关的疾病的方法。
与用本文提供的方法可治疗、可预防和/或可减轻的与DGAT2相关的疾病的实例包括非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)、非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、肝脂肪变性、脂肪肝病、脂肪营养不良综合征，包括先天性全身脂肪营养不良(CGL)、获得性全身脂肪营养不良(AGL)、家族性部分脂肪营养不良(FPL)和获得性部分脂肪营养不良(PL)、代谢综合征和心血管疾病。
在某些实施方案中，治疗、预防或减轻个体中与NAFLD相关的疾病的方法包括向个体施用特定的DGAT2抑制剂，从而治疗、预防或减轻疾病。在某些实施方案中，治疗、预防或减轻个体中与脂肪营养不良综合征相关的疾病的方法包括向个体施用特定的DGAT2抑制剂，从而治疗、预防或减轻疾病。在某些实施方案中，脂肪营养不良综合征是部分脂肪营养不良。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是靶向DGAT2的反义化合物，诸如靶向DGAT2的反义寡核苷酸。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679 中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2 特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一核碱基序列的至少8个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO： 16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中， DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列组成。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含 SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373 中的任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的反义化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和 4373中任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸具有由 SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373 中任一者组成的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 484137、ISIS 484085、ISIS 484129、ISIS 495576、ISIS501861、ISIS 502194、ISIS 525443和ISIS 525612。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 769355、ISIS 769356和ISIS 769357。在任一前述实施方案中，反义化合物可以是单链寡核苷酸。
在某些实施方案中，治疗、预防或减轻NAFLD/NASH的方法包括向个体施用DGAT2特异性抑制剂，从而治疗、预防或减轻 NALFD/NASH。在某些实施方案中，治疗、预防或减轻脂肪营养不良的方法包括向个体施用DGAT2特异性抑制剂，从而治疗、预防或减轻脂肪营养不良综合征。在某些实施方案中，脂肪营养不良综合征是部分脂肪营养不良。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是靶向DGAT2的反义化合物，诸如靶向DGAT2的反义寡核苷酸。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ IDNO：16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由 10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一核碱基序列的至少8个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO： 16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中， DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列组成。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含 SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373 中的任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的反义化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和 4373中任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸具有由 SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373中任一者组成的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 484137、ISIS484085、ISIS 484129、ISIS 495576、ISIS 501861、ISIS 502194、ISIS 525443和ISIS525612。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 769355、ISIS 769356和ISIS769357。在任一前述实施方案中，反义化合物可以是单链寡核苷酸。在某些方面，反义化合物以肠胃外方式施用至个体。在某些方面，施用反义化合物导致DGAT2表达的特异性降低、甘油三酯合成速率的降低、肝脂肪变性和血脂水平的改善、肝脂质的减少、饮食诱导的肝胰岛素抵抗的逆转以及肝胰岛素敏感性的改善。在某些方面，施用反义化合物导致肝脏脂肪变性和纤维化减少。在某些方面，施用反义化合物导致 ALT水平改善。在某些方面，施用反义化合物导致NAFLD活性评分 (NAS)降低。在某些方面，施用反义化合物导致血清总胆固醇和甘油三酯减少。在某些方面，施用反义化合物导致中性胰岛素敏感性和血糖控制。在某些方面，施用反义化合物导致胰岛素敏感性和血糖控制改善。在某些方面，个体被鉴定为患有与NAFLD相关的疾病或处于患所述疾病的风险中。在某些方面，个体被鉴定为患有与脂肪营养不良综合征相关的疾病或处于患所述疾病的风险中。
在某些实施方案中，在患有与NAFLD相关的疾病或处于患所述疾病的风险中的个体中抑制DGAT2表达的方法包括向个体施用 DGAT2特异性抑制剂，从而抑制个体中的DGAT2表达。在某些实施方案中，抑制患有与脂肪营养不良综合征相关的疾病或处于患所述疾病的风险中的个体中的DGAT2表达的方法包括向个体施用 DGAT2特异性抑制剂，从而抑制个体中的DGAT2表达。在某些方面，施用抑制剂抑制肝脏中DGAT2的表达。在某些方面，施用抑制剂抑制脂肪组织中DGAT2的表达。在某些方面，个体患有以下疾病或处于患以下疾病的风险中：脂肪营养不良综合征、部分脂肪营养不良、肝脏脂肪变性、NAFLD或NASH。在某些实施方案中，DGAT2 特异性抑制剂是靶向DGAT2的反义化合物，诸如靶向DGAT2的反义寡核苷酸。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO： 16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中， DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO： 16-4679中的任一核碱基序列的至少8个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列组成。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、 4198和4373中的任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2 特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的反义化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、 4198和4373中任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2 特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸具有由SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和 4373中任一者组成的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS484137、ISIS 484085、ISIS 484129、ISIS 495576、 ISIS 501861、ISIS 502194、ISIS525443和ISIS 525612。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 769355、ISIS769356和ISIS 769357。在任一前述实施方案中，反义化合物可以是单链寡核苷酸。
在某些实施方案中，减少或抑制患有与DGAT2相关的疾病或处于患所述疾病的风险中的个体的肝脏中的甘油三酯合成、肝脂质合成和胰岛素抵抗的方法包括向个体施用DGAT2特异性抑制剂，从而减少或抑制个体的肝脏中的甘油三酯合成、肝脂质合成和胰岛素抵抗。在某些实施方案中，减少或抑制患有与DGAT2相关的疾病或处于患所述疾病的风险中的个体的脂肪组织中的甘油三酯合成、脂质合成和胰岛素抵抗的方法包括向个体施用DGAT2特异性抑制剂，从而减少或抑制个体的脂肪组织中的甘油三酯合成、脂质合成和胰岛素抵抗。在某些方面，施用DGAT2抑制剂导致肝胰岛素信号传导、肝胰岛素敏感性和心血管风险特征改善。在某些方面，施用DGAT2特异性抑制剂导致肝脏脂肪变性和纤维化减少。在某些方面，施用DGAT2特异性抑制剂导致ALT水平改善。在某些方面，施用DGAT2特异性抑制剂导致NAFLD活性评分(NAS)降低。在某些方面，施用DGAT2 特异性抑制剂导致血清总胆固醇和甘油三酯减少。在某些方面，施用 DGAT2特异性抑制剂导致中性胰岛素敏感性和血糖控制。在某些方面，施用反义化合物导致胰岛素敏感性和血糖控制改善。在某些方面，个体患有NAFLD或NASH或处于患NAFLD或NASH的风险中。在某些方面，个体患有脂肪营养不良综合征或部分脂肪营养不良或处于患脂肪营养不良综合征或部分脂肪营养不良的风险中。在某些方面，抑制剂为靶向DGAT2的反义化合物。在某些实施方案中，DGAT2 特异性抑制剂是靶向DGAT2的反义化合物，诸如靶向DGAT2的反义寡核苷酸。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO： 16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中， DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一核碱基序列的至少8个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列组成。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、 4198和4373中的任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2 特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的反义化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、 4198和4373中任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2 特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸具有由SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和 4373中任一者组成的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 484137、ISIS 484085、ISIS484129、ISIS 495576、 ISIS 501861、ISIS 502194、ISIS 525443和ISIS 525612。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 769355、ISIS 769356和ISIS 769357。在任一前述实施方案中，反义化合物可以是单链寡核苷酸。在某些方面，反义化合物以肠胃外方式施用至个体。
某些实施方案涉及用于治疗与NAFLD相关的疾病的DGAT2特异性抑制剂。在某些方面，疾病是NASH。在某些方面，疾病是肝脂肪变性。在某些方面，疾病是肝硬化。在某些方面，疾病是肝细胞癌。某些实施方案涉及用于治疗与脂肪营养不良综合征相关的疾病的 DGAT2特异性抑制剂。在某些方面，疾病是部分脂肪营养不良。在某些方面，抑制剂为靶向DGAT2的反义化合物。在某些实施方案中， DGAT2特异性抑制剂是靶向DGAT2的反义化合物，诸如靶向 DGAT2的反义寡核苷酸。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含 SEQ ID NO：16-4679中的任一核碱基序列的至少8个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列组成。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30 个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、 2959、3292、4198和4373中的任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的反义化合物，其中修饰寡核苷酸由10 至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、 2959、3292、4198和4373中任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸具有由SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、 3292、4198和4373中任一者组成的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 484137、ISIS 484085、ISIS 484129、ISIS 495576、ISIS501861、ISIS 502194、ISIS 525443和ISIS 525612。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 769355、ISIS 769356 和ISIS 769357。在任一前述实施方案中，反义化合物可以是单链寡核苷酸。在某些方面，反义化合物以肠胃外方式施用至个体。
某些实施方案涉及用于减少或抑制患有与NAFLD或脂肪营养不良综合征相关的疾病或处于患所述疾病的风险中的个体的肝脏中的甘油三酯合成、肝脂质合成和胰岛素抵抗的DGAT2特异性抑制剂，包括向个体施用DGAT2特异性抑制剂，从而减少或抑制个体的肝脏中的甘油三酯合成、肝脂质合成和胰岛素抵抗。某些实施方案涉及用于减少或抑制患有与NAFLD或脂肪营养不良综合征相关的疾病或处于患所述疾病的风险中的个体的脂肪组织中的甘油三酯合成、脂质合成和胰岛素抵抗的DGAT2特异性抑制剂，包括向个体施用DGAT2 特异性抑制剂，从而减少或抑制个体的脂肪组织中的甘油三酯合成、脂质合成和胰岛素抵抗。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是靶向DGAT2的反义化合物，诸如靶向DGAT2的反义寡核苷酸。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2 特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一核碱基序列的至少8个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO： 16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中， DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列组成。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含 SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373 中的任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的反义化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和 4373中任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸具有由 SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373 中任一者组成的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 484137、ISIS 484085、ISIS 484129、ISIS 495576、ISIS 501861、ISIS502194、ISIS 525443和ISIS 525612。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS769355、ISIS 769356和ISIS 769357。在任一前述实施方案中，反义化合物可以是单链寡核苷酸。
某些实施方案涉及DGAT2特异性抑制剂用于制造用于治疗与 NAFLD相关的疾病的药物的用途。在某些方面，疾病是NASH。在某些方面，疾病是肝脂肪变性。在某些方面，疾病是肝硬化。在某些方面，疾病是肝细胞癌。某些实施方案涉及DGAT2特异性抑制剂用于制造用于治疗与脂肪营养不良相关的疾病的药物的用途。在某些方面，疾病是部分脂肪营养不良。在某些方面，抑制剂为靶向DGAT2 的反义化合物。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是靶向 DGAT2的反义化合物，诸如靶向DGAT2的反义寡核苷酸。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的化合物，其中修饰寡核苷酸由 10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10 至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ IDNO：16-4679中的任一核碱基序列的至少8个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO： 16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中， DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列组成。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含 SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373 中的任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的反义化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和 4373中任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸具有由 SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373 中任一者组成的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 484137、ISIS 484085、ISIS 484129、ISIS 495576、ISIS 501861、ISIS 502194、ISIS 525443和ISIS 525612。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 769355、ISIS 769356和ISIS 769357。在任一前述实施方案中，反义化合物可以是单链寡核苷酸。在某些方面，反义化合物以肠胃外方式施用至个体。
某些实施方案涉及DGAT2特异性抑制剂用于制造用于减少或抑制患有与NAFLD或脂肪营养不良综合征相关的疾病或处于患所述疾病的风险中的个体的肝脏中的甘油三酯合成、肝脂质合成和胰岛素抵抗的药物的用途。某些实施方案涉及DGAT2特异性抑制剂用于制造用于减少或抑制患有与NAFLD或脂肪营养不良综合征相关的疾病或处于患所述疾病的风险中的个体的肝脏中的甘油三酯合成、肝脂质合成和胰岛素抵抗的药物的用途。某些实施方案涉及DGAT2特异性抑制剂用于制造用于减少或抑制患有与NAFLD或脂肪营养不良综合征相关的疾病或处于患所述疾病的风险中的个体的脂肪组织中的甘油三酯合成、脂质合成和胰岛素抵抗的药物的用途。某些实施方案涉及 DGAT2特异性抑制剂用于制造用于减少或抑制患有与NAFLD或脂肪营养不良综合征相关的疾病或处于患所述疾病的风险中的个体的脂肪组织中的甘油三酯合成、脂质合成和胰岛素抵抗的药物的用途。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是靶向DGAT2的反义化合物，诸如靶向DGAT2的反义寡核苷酸。在某些实施方案中，DGAT2 特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一核碱基序列的至少8个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30 个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由SEQ ID NO： 16-4679中的任一者的核碱基序列组成。在某些实施方案中，DGAT2 特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、 1849、2959、3292、4198和4373中的任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的反义化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、 1849、2959、3292、4198和4373中任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸具有由SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、 3292、4198和4373中任一者组成的核碱基序列。在某些实施方案中， DGAT2特异性抑制剂是ISIS 484137、ISIS 484085、ISIS 484129、ISIS 495576、ISIS 501861、ISIS 502194、ISIS 525443和ISIS525612。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 769355、ISIS 769356 和ISIS769357。在任一前述实施方案中，反义化合物可以是单链寡核苷酸。
在某些实施方案中，抑制细胞中的DGAT2表达的方法包括使细胞与DGAT2特异性抑制剂接触。在某些实施方案中，细胞是肝细胞。在某些实施方案中，细胞在个体的肝脏中。在某些实施方案中，细胞是个体的脂肪组织细胞。在某些实施方案中，细胞在个体的脂肪组织中。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是靶向DGAT2的反义化合物，诸如靶向DGAT2的反义寡核苷酸。在某些实施方案中， DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一核碱基序列的至少8个连续核碱基的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由 10至30个连接核苷组成并且具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列组成。在某些实施方案中， DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：1423、 1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373中的任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸和缀合基团或由修饰寡核苷酸和缀合基团组成的反义化合物，其中修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO： 1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373中任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是包含修饰寡核苷酸的反义化合物，所述修饰寡核苷酸具有由SEQ ID NO：1423、 1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373中任一者组成的核碱基序列。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS 484137、 ISIS 484085、ISIS 484129、ISIS 495576、ISIS 501861、ISIS502194、 ISIS 525443和ISIS 525612。在某些实施方案中，DGAT2特异性抑制剂是ISIS769355、ISIS 769356和ISIS 769357。在任一前述实施方案中，反义化合物可以是单链寡核苷酸。在某些方面，反义化合物以肠胃外方式施用至个体。
在任一前述实施方案中，DGAT2特异性抑制剂可以是靶向 DGAT2的反义化合物。在某些方面，反义化合物是反义寡核苷酸，例如由8至80个连接核苷、12至30个连接核苷或20个连接核苷组成的反义寡核苷酸。在某些方面，反义寡核苷酸与SEQ ID No：1-4中列出的任一核碱基序列至少80％、85％、90％、95％或100％互补。在某些方面，反义寡核苷酸包含至少一个修饰核苷间键合、至少一个修饰糖和/或至少一个修饰核碱基。在某些方面，修饰核苷间键合是硫代磷酸酯核苷间键合，修饰糖是双环糖或2′-O-甲氧基乙基，并且修饰核碱基是5-甲基胞嘧啶。在某些方面，修饰寡核苷酸包含由连接2’- 脱氧核苷组成的缺口区段；由连接核苷组成的5’翼区段；由连接核苷组成的3’翼区段，其中缺口区段紧邻5’翼区段和3’翼区段定位并且位于5’翼区段与3’翼区段之间，并且其中每个翼区段的每个核苷包含修饰糖。
在任一前述实施方案中，反义寡核苷酸由12至30个、15至30 个、15至25个、15至24个、16至24个、17至24个、18至24个、 19至24个、20至24个、19至22个、20至22个、16至20个或17 个或20个连接核苷组成。在某些方面，反义寡核苷酸与SEQ ID No： 1-4中列出的任一核碱基序列至少80％、85％、90％、95％或100％互补。在某些方面，反义寡核苷酸包含至少一个修饰核苷间键合、至少一个修饰糖和/或至少一个修饰核碱基。在某些方面，修饰核苷间键合是硫代磷酸酯核苷间键合，修饰糖是双环糖或2′-O-甲氧基乙基，并且修饰核碱基是5-甲基胞嘧啶。在某些方面，修饰寡核苷酸包含由连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；由连接核苷组成的5’翼区段；由连接核苷组成的3’翼区段，其中缺口区段紧邻5’翼区段和3’翼区段定位并且位于5’翼区段与3’翼区段之间，并且其中每个翼区段的每个核苷包含修饰糖。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ IDNO：16-4679中的任一者的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由连接核苷组成的5’翼区段；以及
由连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间，并且其中每个翼区段的每个核苷包含修饰糖。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含缀合基团和修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成、具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由连接核苷组成的5’翼区段；以及
由连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间，并且其中每个翼区段的每个核苷包含修饰糖。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 10至30个连接核苷组成、具有包含1423、1371、1415、1849、2959、 3292、4198或4373中的任一者的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由连接核苷组成的5’翼区段；以及
由连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间，并且其中每个翼区段的每个核苷包含修饰糖。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 16至30个连接核苷组成、具有包含SEQ IDNO：1423中列出的序列的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 20个连接核苷组成、具有由SEQ ID NO：1423中列出的序列组成的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含缀合基团和修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸由20个连接核苷组成、具有由SEQ ID NO：1423中列出的序列组成的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 16至30个连接核苷组成、具有包含SEQ IDNO：1371中列出的序列的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 20个连接核苷组成、具有由SEQ ID NO：1371中列出的序列组成的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 16至30个连接核苷组成、具有包含SEQ IDNO：1415中列出的序列的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 20个连接核苷组成、具有由SEQ ID NO：1415中列出的序列组成的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 16至30个连接核苷组成、具有包含SEQ IDNO：1849中列出的序列的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 20个连接核苷组成、具有由SEQ ID NO：1849中列出的序列组成的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 16至30个连接核苷组成、具有包含SEQ IDNO：2959中列出的序列的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 20个连接核苷组成、具有由SEQ ID NO：2959中列出的序列组成的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 16至30个连接核苷组成、具有包含SEQ IDNO：3292中列出的序列的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 20个连接核苷组成、具有由SEQ ID NO：3292中列出的序列组成的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 14至30个连接核苷组成、具有包含SEQ IDNO：4198中列出的序列的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由三个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由四个连接核苷组成的3’翼段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 17个连接核苷组成、具有由SEQ ID NO：4198中列出的序列组成的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由三个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由四个连接核苷组成的3’翼段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 14至30个连接核苷组成、具有包含SEQ IDNO：4373中列出的序列的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由三个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由四个连接核苷组成的3’翼段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一前述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂可以是包含修饰寡核苷酸或由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸由 17个连接核苷组成、具有由SEQ ID NO：4373中列出的序列组成的核碱基序列，其中修饰寡核苷酸包含：
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由三个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由四个连接核苷组成的3’翼段；
其中缺口区段位于5’翼区段与3’翼区段之间并且其中每个翼区段的每个核苷包含2’MOE糖，其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
在任一上述方法或用途中，DGAT2特异性抑制剂以皮下方式，诸如通过皮下注射施用。
反义化合物
寡聚化合物包括但不限于寡核苷酸、寡核苷、寡核苷酸类似物、反义化合物、反义寡核苷酸和siRNA。寡聚化合物可以是靶核酸的“反义序列”，意味着其能够与靶核酸经由氢键合进行杂交。
在某些实施方案中，反义化合物具有在按5′至3′方向书写时包含其所靶向的靶核酸的靶区段的反向互补序列的核碱基序列。
在某些实施方案中，反义化合物的长度为10至30个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为12至30个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为12至22个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为14至30个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为14至20个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为15至30个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为15至20个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为 16至30个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为16至 20个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为17至30个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为17至20个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为18至30个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为18至21个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为18至20个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为20至30个亚单位。换句话来说，所述反义化合物分别为12至30个连接的亚单位、14至30个连接的亚单位、14至 20个亚单位、15至30个亚单位、15至20个亚单位、16至30个亚单位、16至20个亚单位、17至30个亚单位、17至20个亚单位、 18至30个亚单位、18至20个亚单位、18至21个亚单位、20至30 个亚单位或12至22个连接的亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为14个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为 16个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为17个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为18个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为19个亚单位。在某些实施方案中，反义化合物的长度为20个亚单位。在其他实施方案中，反义化合物为 8至80个、12至50个、13至30个、13至50个、14至30个、14 至50个、15至30个、15至50个、16至30个、16至50个、17至 30个、17至50个、18至22个、18至24个、18至30个、18至50 个、19至22个、19至30个、19至50个或20至30个连接的亚单位。在某些此类实施方案中，反义化合物的长度为8、9、10、11、 12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、 27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、 57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、 72、73、74、75、76、77、78、79或80个连接亚单位，或处于由上述任何两个值所界定的范围内。在一些实施方案中，反义化合物为反义寡核苷酸，并且连接亚单位为核苷酸、核苷或核碱基。
在某些实施方案中，反义化合物或寡聚化合物还可以包含与寡核苷酸连接的附加特征或元素，诸如缀合基团。在缀合基团包含核苷(即将缀合基团连接至寡核苷酸的核苷)的实施方案中，缀合基团的核苷不计数在寡核苷酸的长度中。
在某些实施方案中，反义寡核苷酸可以是缩短或截短的。例如，单个核苷可自5′端缺失(5′截短)，或者自3′端缺失(3′截短)。靶向 DGAT2核酸的缩短或截短的反义化合物可有两个亚单位自反义化合物的5′端缺失，或者可有两个亚单位自反义化合物的3′端缺失。另选地，缺失的核苷可散布于整个反义化合物中，例如在5′端有一个核苷缺失和3′端有一个核苷缺失的反义化合物中。
当单个额外亚单位存在于延长的反义化合物中时，所述额外亚单位可位于反义化合物的5′端或3′端处。当存在两个或更多个额外亚单位时，所添加的亚单位可彼此邻近，例如在反义化合物的5′端上添加有两个亚单位(5′添加)或3′端上添加有两个亚单位(3′添加)的反义化合物中。另选地，所添加的亚单位可散布于整个反义化合物中，例如在 5′端上添加有一个亚单位和3′端上添加有一个亚单位的反义化合物中。
有可能增加或减少反义化合物(诸如反义寡核苷酸)的长度和/或引入错配碱基而不消除活性(Woolf等人(Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89：7305-7309，1992；Gautschi等人J.Natl.Cancer Inst.93：463-471， March 2001；Maher和DolnickNuc.Acid.Res.16：3341-3358，1988)。然而，寡核苷酸序列、化学过程和基序中的看似微小的变化可以在临床开发所需的许多特性中一个或多个上产生大的差异(Seth等人J. Med.Chem.2009，52，10；Egli等人J.Am.Chem.Soc.2011，133，16642)。
在某些实施方案中，反义化合物是单链的，由一种寡聚化合物组成。此类单链反义化合物的寡核苷酸是反义寡核苷酸。在某些实施方案中，单链反义化合物的反义寡核苷酸被修饰。在某些实施方案中，单链反义化合物或寡聚化合物的寡核苷酸包含自身互补的核碱基序列。在某些实施方案中，反义化合物是双链的，包含形成双链体的两种寡聚化合物。在某些此类实施方案中，双链反义化合物的一种寡聚化合物包含一个或多个缀合基团。在某些实施方案中，双链反义化合物的每种寡聚化合物包含一个或多个缀合基团。在某些实施方案中，双链反义化合物的每种寡核苷酸为修饰寡核苷酸。在某些实施方案中，双链反义化合物的一种寡核苷酸为修饰寡核苷酸。在某些实施方案中，双链反义化合物的一种寡核苷酸为反义寡核苷酸。在某些此类实施方案中，反义寡核苷酸为修饰寡核苷酸。单链反义化合物和双链反义化合物的实例包括但不限于反义寡核苷酸、siRNA、微RNA靶向寡核苷酸和单链RNAi化合物，诸如小发夹RNA(shRNA)、单链 siRNA(ssRNA)和微RNA模拟物。
在某些实施方案中，反义化合物干扰RNA化合物(RNAi)，所述 RNA化合物包括双链RNA化合物(也称为短干扰RNA或siRNA)和单链RNAi化合物(或ssRNA)。此类化合物至少部分地通过RISC途径起作用以降解和/或螯合靶核酸(因此包括微RNA/微RNA模拟化合物)。如本文所用，术语siRNA意思等同于用来描述能够介导序列特异性RNAi的核酸分子的其他术语，例如，短干扰RNA(siRNA)、双链RNA(dsRNA)、微RNA(miRNA)、短发夹RNA(shRNA)、短干扰寡核苷酸、短干扰核酸、短干扰修饰寡核苷酸、化学修饰的siRNA、转录后基因沉默RNA(ptgsRNA)以及其他。此外，如本文所用，术语 RNAi意思等同于用来描述序列特异性RNA干扰其他术语，诸如转录后基因沉默、翻译抑制或表观遗传学。
在某些实施方案中，双链化合物可以包含靶向本文所述的 DGAT2的任何寡核苷酸序列。在某些实施方案中，双链化合物包含第一链和第二链，所述第一链包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的至少8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基部分。在某些实施方案中，双链化合物包含第一链和第二链，所述第一链包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，双链化合物包含其中第一链在SEQ ID NO：16-4679 中的任一者中具有尿嘧啶(U)代替胸腺嘧啶(T)的核糖核苷酸。在某些实施方案中，双链化合物包含(i)第一链和(ii)第二链，所述第一链包含与DGAT2上SEQ ID NO：16-4679中的任一者所靶向的位点互补的核碱基序列。在某些实施方案中，双链化合物包含一个或多个修饰核苷酸，其中糖中的2′位含有卤素(诸如氟基；2′-F)或含有烷氧基(诸如甲氧基；2′-OMe)。在某些实施方案中，双链化合物包含至少一个2′-F 糖修饰和至少一个2′-OMe糖修饰。在某些实施方案中，所述至少一个2′-F糖修饰和至少一个2′-OMe糖修饰沿着dsRNA化合物的链以交替模式布置至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、 15、16、17、18、19或20个的连续核碱基。在某些实施方案中，双链化合物包括相邻核苷酸之间的一个或多个键合而非天然存在的磷酸二酯键合。此类键合的实例包括磷酰胺、硫代磷酸酯和二硫代磷酸酯键合。双链化合物还可以是如美国专利号6,673,661中所教导的化学修饰核酸分子。在其他实施方案中，dsRNA含有一个或两个加帽链，如例如由2000年4月19日提交的WO 00/63364所公开的。在某些实施方案中，双链化合物的第一链是siRNA引导链(guide strand)，并且双链化合物的第二链是siRNA客链(passenger strand)。在某些实施方案中，双链化合物的第二链与第一链互补。在某些实施方案中，双链化合物的每条链由16、17、18、19、20、21、22或23个连接核苷组成。在某些实施方案中，双链化合物的第一链或第二链可以包含缀合基团。
在某些实施方案中，单链RNAi(ssRNAi)化合物可以包含本文所述的靶向DGAT2的任何寡核苷酸序列。在某些实施方案中，ssRNAi 化合物包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的至少8、9、10、11、 12、13、14、15、16、17、18、19或20个连续核碱基部分。在某些实施方案中，ssRNAi化合物包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列。在某些实施方案中，ssRNAi化合物包含其中在SEQ ID NO：16-4679中的任一者中尿嘧啶(U)代替胸腺嘧啶(T)的核糖核苷酸。在某些实施方案中，ssRNAi化合物包含与DGAT2上SEQ ID NO： 16-4679中的任一者所靶向的位点互补的核碱基序列。在某些实施方案中，ssRNAi化合物包含一个或多个修饰核苷酸，其中糖中的2′位含有卤素(诸如氟基；2′-F)或含有烷氧基(诸如甲氧基；2′-OMe)。在某些实施方案中，ssRNAi化合物包含至少一个2′-F糖修饰和至少一个2′-OMe糖修饰。在某些实施方案中，所述至少一个2′-F糖修饰和至少一个2′-OMe糖修饰沿着ssRNAi化合物的链以交替模式布置至少 2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、 19或20个的连续核碱基。在某些实施方案中，ssRNAi化合物包括相邻核苷酸之间的一个或多个键合而非天然存在的磷酸二酯键合。此类键合的实例包括磷酰胺、硫代磷酸酯和二硫代磷酸酯键合。ssRNAi 化合物还可以是如美国专利号6,673,661中所教导的化学修饰核酸分子。在其他实施方案中，ssRNAi含有加帽链，如例如由2000年4月 19日提交的WO 00/63364所公开的。在某些实施方案中，ssRNAi化合物由16、17、18、19、20、21、22或23个连接核苷组成。在某些实施方案中，ssRNAi化合物可以包含缀合基团。
在某些实施方案中，反义化合物包含修饰寡核苷酸。某些修饰寡核苷酸具有一个或多个不对称中心并且因此产生对映异构体、非对映异构体和可根据绝对立体化学定义为(R)或(S)、α或β(诸如对于糖端基异构体)或定义为(D)或(L)(诸如对于氨基酸等)的其他立体异构构型。所有此类可能的异构体包括在本文提供的修饰寡核苷酸中，包括它们的外消旋和光学纯的形式，除非另有说明。同样，也包括所有顺式-和反式-异构体和互变异构体形式。
在某些实施方案中，本文所述的反义化合物和寡聚化合物包含修饰寡核苷酸。此类修饰寡核苷酸可含有本文所述的修饰糖部分、修饰核碱基、修饰核苷间键、基序和/或长度的任何组合。
某些反义化合物机制
在某些实施方案中，反义化合物能够与靶核酸杂交，从而产生至少一种反义活性。在某些实施方案中，反义化合物特异性地影响一种或多种靶核酸。此类特异性反义化合物包含与一种或多种靶核酸杂交的核碱基序列，从而产生一种或多种所需的反义活性并且不与一种或多种非靶核酸杂交或不以产生不需要的反义活性的方式与一种或多种非靶核酸杂交。
在某些反义活性中，反义化合物与靶核酸的杂交导致裂解靶核酸的蛋白质募集。例如，某些反义化合物导致RNA酶H介导的靶核酸裂解。RNA酶H为裂解RNA：DNA双链体的RNA链的细胞核酸内切酶。这种RNA：DNA双链体中的DNA不需要是未修饰的DNA。在某些实施方案中，本发明提供足够“DNA样”以引起RNA酶H活性的反义化合物。此外，在某些实施方案中，间隔体缺口中的一个或多个非DNA样核苷是耐受的。
在某些反义活性中，将反义化合物或反义化合物的一部分加载到 RNA诱导的沉默复合物(RISC)中，最终导致靶核酸裂解。例如，某些反义化合物导致Argonaute蛋白对靶核酸的裂解。在某些实施方案中，加载到RISC中的反义化合物是RNAi化合物。
在某些实施方案中，反义化合物与靶核酸的杂交不导致裂解靶核酸的蛋白质募集。在某些此类实施方案中，反义化合物与靶核酸的杂交导致靶核酸的剪接改变。在某些实施方案中，反义化合物与靶核酸的杂交导致对靶核酸与蛋白质或其他核酸之间的结合相互作用的抑制。在某些此类实施方案中，反义化合物与靶核酸的杂交导致靶核酸的翻译改变。
反义活性可以直接或间接地观察。在某些实施方案中，反义活性的观察或检测包括观察或检测靶核酸或由这种靶核酸编码的蛋白质的量的变化、核酸或蛋白质的剪接变体比例的变化和/或细胞或动物的表型变化。
在某些实施方案中，与非间隔体寡核苷酸或与具有其他糖基序的间隔体相比，具有本文所述的间隔体糖基序的修饰寡核苷酸具有所需特性。在某些情况下，鉴定产生强力反义活性和相对低毒性的有利组合的基序是所需的。在某些实施方案中，本发明的化合物具有有利的治疗指数(活性的量度除以毒性的量度)。
靶核酸、靶区和核苷酸序列
在某些实施方案中，反义化合物包含含有与靶核酸互补的区的寡核苷酸或由所述寡核苷酸组成。在某些实施方案中，靶核酸为内源性 RNA分子。在某些实施方案中，靶核酸编码蛋白质。在某些此类实施方案中，靶核酸选自：mRNA和前体mRNA，包括内含子区、外显子区和非翻译区。在某些实施方案中，靶RNA为mRNA。在某些实施方案中，靶核酸为前体mRNA。在某些此类实施方案中，靶区完全在内含子内。在某些实施方案中，靶区跨越内含子/外显子接合区。在某些实施方案中，靶区是内含子内至少为50％。
编码DGAT2的核苷酸序列包括但不限于以下：RefSeq No. NM_032564.3(通过引用并入本文；在本文中命名为SSEQ ID NO：1)、 RefSeq No.NT_033927.5的核苷酸5669186至5712008(通过引用并入本文，在本文中命名为SEQ ID NO：2)、RefSeq No.NT_167190.1的核苷酸20780400至20823450(通过引用并入本文，在本文中命名为 SEQ ID NO：4878)、RefSeqNo.AK091870.1(通过引用并入本文；在本文中命名为SSEQ ID NO：4879)和RefSeq No.NW_001100387.1的核苷酸1232000至1268000(通过引用并入本文，在本文中命名为SEQ ID NO：3)。
杂交
在一些实施方案中，在本文公开的反义化合物与DGAT2核酸之间发生杂交。杂交的最常见机制涉及核酸分子的互补核碱基之间的氢键合(例如沃森-克里克、霍氏或反霍氏氢键合)。
杂交可在不同条件下发生。杂交条件具有序列依赖性并且由待杂交的核酸分子的性质和组成决定。
确定序列是否可与靶核酸特异性杂交的方法在本领域中是熟知的。在某些实施方案中，本文提供的反义化合物可与DGAT2核酸特异性杂交。
互补性
当两个核碱基序列在相对方向上比对时，当寡核苷酸或其一个或多个区的核碱基序列与另一寡核苷酸或核酸或其一个或多个区的核碱基序列匹配时，则认为这种寡核苷酸与另一核酸互补。如本文所述的核碱基匹配或互补核碱基限于腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A) 和尿嘧啶(U)、胞嘧啶(C)和鸟嘌呤(G)以及5-甲基胞嘧啶(mC)和鸟嘌呤(G)，除非另有说明。互补的寡核苷酸和/或核酸不需要在每个核苷处具有核碱基互补性并且可以包括一个或多个核碱基错配。当寡核苷酸在每个核苷处具有核碱基匹配而没有任何核碱基错配时，则这种寡核苷酸是“完全互补”或“100％互补”的。
可容忍反义化合物与DGAT2核酸之间的非互补性核碱基，前提是所述反义化合物仍能够与靶核酸特异性杂交。此外，反义化合物可在DGAT2核酸的一个或多个区段上杂交，以使得介入或相邻区段不参与杂交事件(例如环结构、错配或发夹结构)。
在某些实施方案中，本文提供的反义化合物或其指定部分与 DGAT2核酸、靶区、靶区段或其指定部分具有或具有至少70％、 80％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、 94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％互补性。在某些此类实施方案中，具有完全互补性的区的长度为6至20个核碱基。在某些此类实施方案中，具有完全互补性的区的长度为10至18个核碱基。在某些此类实施方案中，具有完全互补性的区的长度为18至20个核碱基。反义化合物与靶核酸的互补性百分比可使用常规方法测定。
例如，反义化合物中反义化合物的20个核碱基中有18个核碱基与靶区互补且因此特异性杂交将表示90％互补性。在这个实施例中，其余非互补核碱基可与互补核碱基丛集或交替并且不需要彼此相邻或与互补核碱基相邻。因而，长度为18个核碱基并具有4个非互补核碱基且所述非互补核碱基由与靶核酸完全互补的两个区侧接的反义化合物与靶核酸将具有77.8％的总体互补性且因而处于本发明的范围内。反义化合物与靶核酸的区的互补性百分比可根据常规使用本领域中已知的BLAST程序(基础局部比对搜索工具(basiclocal alignment search tools))和PowerBLAST程序确定(Altschul等人，J. Mol.Biol.，1990，215，403 410；Zhang和Madden，Genome Res.，1997，7， 649 656)。同源性、序列同一性或互补性百分比可通过例如Gap程序 (Wisconsin序列分析包，Unix第8版，GeneticsComputer Group， University Research Park，Madison Wis.)，使用缺省设置来确定，所述程序使用Smith和Waterman的算法(Adv.Appl.Math.，1981，2，482 489)。
在某些实施方案中，本文提供的反义化合物或其指定部分与靶核酸或其指定部分完全互补(即100％互补)。例如，反义化合物可与 DGAT2核酸或其靶区或靶区段或靶序列完全互补。如本文所用，“完全互补”意指反义化合物的每个核碱基皆能够与靶核酸的对应核碱基进行准确碱基配对。例如，只要靶核酸中有对应的20个核碱基部分与反义化合物完全互补，则20个核碱基的反义化合物与400个核碱基长的靶序列完全互补。完全互补还可对于第一核酸和/或第二核酸的指定部分来使用。例如，30个核碱基的反义化合物中的20个核碱基的部分可与400个核碱基长的靶序列“完全互补”。如果靶序列具有对应的20个核碱基部分，其中每个核碱基与反义化合物的20个核碱基部分互补，则30个核碱基的寡核苷酸中的20个核碱基部分与靶序列完全互补。同时，整个30个核碱基的反义化合物与靶序列可以或可以不完全互补，这取决于反义化合物的其余10个核碱基是否也与靶序列互补。
在某些实施方案中，反义化合物相对于靶核酸包含一个或多个错配的核碱基。在某些此类实施方案中，针对靶标的反义活性通过这种错配而减少，但针对非靶标的活性减少更多的量。因此，在某些此类实施方案中，反义化合物的选择性得到改善。在某些实施方案中，错配特异性地位于具有间隔体基序的寡核苷酸内。在某些此类实施方案中，错配位于距缺口区5′端的位置1、2、3、4、5、6、7或8处。在某些此类实施方案中，错配位于距缺口区3′端的位置9、8、7、6、5、 4、3、2或1处。在某些此类实施方案中，错配位于距翼区5′端的位置1、2、3或4处。在某些此类实施方案中，错配位于距翼区3′端的位置4、3、2或1处。
非互补核碱基的位置可处于反义化合物的5′端或3′端处。另选地，一个或多个非互补核碱基可处于反义化合物的内部位置处。当存在两个或更多个非互补核碱基时，它们可为连续(即连接的)或不连续的。在一个实施方案中，非互补核碱基位于间隔体反义寡核苷酸的翼区段中。
在某些实施方案中，反义化合物相对于靶核酸包含一个或多个错配的核碱基。在某些此类实施方案中，针对靶标的反义活性通过这种错配而减少，但针对非靶标的活性减少更多的量。因此，在某些此类实施方案中，反义化合物的选择性得到改善。在某些实施方案中，错配特异性地位于具有间隔体基序的寡核苷酸内。在某些此类实施方案中，错配位于距缺口区5′端的位置1、2、3、4、5、6、7或8处。在某些此类实施方案中，错配位于距缺口区3′端的位置9、8、7、6、5、 4、3、2或1处。在某些此类实施方案中，错配位于距翼区5′端的位置1、2、3或4处。在某些此类实施方案中，错配位于距翼区3′端的位置4、3、2或1处。
在某些实施方案中，长度为或多达11、12、13、14、15、16、 17、18、19个或20个核碱基的反义化合物相对于靶核酸(诸如DGAT2 核酸)或其指定部分包含至多4个、至多3个、至多2个或至多1个非互补核碱基。
在某些实施方案中，长度为或多达11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29个或30个核碱基的反义化合物相对于靶核酸(诸如DGAT2核酸)或其指定部分包含至多6个、至多5个、至多4个、至多3个、至多2个或至多1 个非互补核碱基。
提供的反义化合物还包括与靶核酸的一部分互补的反义化合物。如本文所用，“部分”是指靶核酸的区或区段内确定数目的连续(即连接的)核碱基。“部分”还可指反义化合物中确定数目的连续核碱基。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段中的至少8个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段中的至少9个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段中的至少10个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段中的至少 11个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段中的至少12个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段中的至少13个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段中的至少14个核碱基部分互补。在某些实施方案中，反义化合物与靶区段中的至少15个核碱基部分互补。还涵盖与靶区段中的至少9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20个或更多个(或在由这些值中的任何两个所界定的范围内)核碱基部分互补的反义化合物。
同一性
本文提供的反义化合物还可与特定核苷酸序列SEQ ID NO或由特定Isis编号表示的化合物或其部分具有确定的同一性百分比。如本文所用，如果反义化合物具有相同的核碱基配对能力，那么其与本文公开的序列同一。例如，在所公开的DNA序列中含有尿嘧啶代替胸苷的RNA将被认为与DNA序列同一，因为尿嘧啶和胸苷皆与腺嘌呤配对。还涵盖本文所述的反义化合物的缩短及延长型式以及相对于本文提供的反义化合物具有非同一碱基的化合物。非同一碱基可彼此相邻或散布于整个反义化合物中。反义化合物的同一性百分比是根据相对于与其比较的序列具有同一碱基配对的碱基的数目来计算的。
在某些实施方案中，反义化合物或其部分与本文公开的一种或多种反义化合物或SEQ ID NO或其部分具有或至少具有70％、75％、 80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、 99％或100％同一性。
在某些实施方案中，将反义化合物的一部分与靶核酸的等长部分相比较。在某些实施方案中，将8、9、10、11、12、13、14、15、 16、17、18、19、20、21、22、23、24个或25个核碱基部分与靶核酸的等长部分相比较。
在某些实施方案中，将反义寡核苷酸的一部分与靶核酸的等长部分相比较。在某些实施方案中，将8、9、10、11、12、13、14、15、 16、17、18、19、20、21、22、23、24个或25个核碱基部分与靶核酸的等长部分相比较。
修饰
反义化合物的修饰涵盖核苷间键、糖部分或核碱基的取代或改变。修饰反义化合物常因具有如以下各项的所需特性而优于原生形式：细胞吸收增强、对核酸靶标的亲和力增强、在核酸酶存在下的稳定性增强或抑制活性增强。
化学上修饰的核苷还可用于增强缩短或截短型反义寡核苷酸对其靶核酸的结合亲和力。因此，常可以具有此类化学上修饰的核苷的较短反义化合物获得相当的结果。
修饰核苷间键合
RNA和DNA的天然存在的核苷间键合为3′至5′磷酸二酯键合。相比于具有天然存在的核苷间键合的反义化合物，具有一个或多个修饰(即非天然存在)的核苷间键合的反义化合物常会因具有所需特性 (例如像细胞吸收增强、对靶核酸的亲和力增强及在核酸酶存在下的稳定性增强)而被优先选择。
具有修饰核苷间键合的寡核苷酸包括保留磷原子的核苷间键合以及不具磷原子的核苷间键合。代表性含磷的核苷间键合包括但不限于磷酸二酯、磷酸三酯、甲基膦酸酯、氨基磷酸酯和硫代磷酸酯。制备含磷键合和不含磷键合的方法是熟知的。
在所述实施方案中，修饰寡核苷酸的核苷可使用任何核苷间键合连接在一起。通过磷原子的存在或不存在来定义两大类核苷间连接基团。代表性含磷的核苷间键合包括但不限于磷酸酯，其含有磷酸二酯键(“P＝O”)(也被称为未修饰或天然存在的键合)、磷酸三酯、甲基膦酸酯、氨基磷酸酯和硫代磷酸酯(“P＝S”)以及二硫代磷酸酯 (“HS-P＝S”)。代表性的不含磷的核苷间连接基团包括但不限于亚甲基甲基亚氨基(CH2-N(CH3)-O-CH2-)、硫二酯(-O-C(O)-S-)、硫羰氨基甲酸酯(-O-C(＝O)(NH)-S-)；硅氧烷(-O-SiH2-O-)；和N，N′-二甲基肼 (-CH2-N(CH3)-N(CH3)-)。与天然存在的磷酸酯键合相比，修饰核苷间键合可用来改变(通常为增加)寡核苷酸的核酸酶抗性。在某些实施方案中，具有手性原子的核苷间键合可制备为外消旋混合物或制备为单独的对映异构体。代表性手性核苷间键合包括但不限于烷基膦酸酯和硫代磷酸酯。制备含磷和不含磷核苷间键合的方法是本领域技术人员熟知的。
中性核苷间键合包括但不限于磷酸三酯、甲基膦酸酯、MMI (3′-CH2-N(CH3)-O-5′)、酰胺-3(3′-CH2-C(＝O)-N(H)-5′)、酰胺-4 (3′-CH2-N(H)-C(＝O)-5′)、甲乙缩醛(formacetal)(3′-O-CH2-O-5′)、甲氧基丙基和硫代甲乙缩醛(3′-S-CH2-O-5’)。另外的中性核苷间键合包括非离子键合，其包括硅氧烷(二烷基硅氧烷)、羧酸酯、羧酰胺、硫化物、磺酸酯和酰胺(参见例如：Carbohydrate Modifications in Antisense Research；Y.S.Sanghvi和P.D.Cook编，ACS Symposium Series 580；第 3和4章，40-65)。另外的中性核苷间键合包括含有混合N、O、S和 CH2组成部分的非离子键合。
在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的反义化合物包含一个或多个修饰核苷间键合。在某些实施方案中，修饰核苷间键合为硫代磷酸酯键合。在某些实施方案中，反义化合物的每个核苷间键合为硫代磷酸酯核苷间键合。
在某些实施方案中，寡核苷酸包含以限定的模式或修饰核苷间键合基序沿着寡核苷酸或其区布置的修饰核苷间键合。在某些实施方案中，核苷间键合以有缺口的基序布置。在此类实施方案中，两个翼区的每一个中的核苷间键合不同于缺口区中的核苷间键合。在某些实施方案中，翼中的核苷间键合为磷酸二酯并且缺口中的核苷间键合为硫代磷酸酯。核苷基序被独立地选择，使得具有有缺口的核苷间键合基序的此类寡核苷酸可以或可以不具有有缺口的核苷基序并且如果它具有有缺口的核苷基序，则翼和缺口长度可以是或可以不是相同的。
在某些实施方案中，寡核苷酸包含具有交替的核苷间键合基序的区。在某些实施方案中，本发明的寡核苷酸包含具有均匀修饰的核苷间键合区。在某些此类实施方案中，寡核苷酸包含通过硫代磷酸酯核苷间键合均匀连接的区。在某些实施方案中，寡核苷酸通过硫代磷酸酯均匀连接。在某些实施方案中，寡核苷酸的每个核苷间键合选自磷酸二酯和硫代磷酸酯。在某些实施方案中，寡核苷酸的每个核苷间键合选自磷酸二酯和硫代磷酸酯并且至少一个核苷间键合为硫代磷酸酯。
在某些实施方案中，寡核苷酸包含至少6个硫代磷酸酯核苷间键合。在某些实施方案中，寡核苷酸包含至少8个硫代磷酸酯核苷间键合。在某些实施方案中，寡核苷酸包含至少10个硫代磷酸酯核苷间键合。在某些实施方案中，寡核苷酸包含至少一个具有至少6个连续的硫代磷酸酯核苷间键合的嵌段。在某些实施方案中，寡核苷酸包含至少一个具有至少8个连续的硫代磷酸酯核苷间键合的嵌段。在某些实施方案中，寡核苷酸包含至少一个具有至少10个连续的硫代磷酸酯核苷间键合的嵌段。在某些实施方案中，寡核苷酸包含至少一个具有至少12个连续的硫代磷酸酯核苷间键合的嵌段。在某些此类实施方案中，至少一个这种嵌段位于寡核苷酸的3’端。在某些此类实施方案中，至少一个这种嵌段位于寡核苷酸的3’端的3个核苷内。
在某些实施方案中，寡核苷酸包含一个或多个甲基膦酸酯 (methylphosponate)键合。在某些实施方案中，具有间隔体核苷基序的寡核苷酸包含包括除一个或两个甲基膦酸酯键合之外所有的硫代磷酸酯键合的键合基序。在某些实施方案中，一个甲基膦酸酯键合位于具有间隔体核苷基序的寡核苷酸的中心缺口中。
在某些实施方案中，布置硫代磷酸酯核苷间键合和磷酸二酯核苷间键合的数量以保持核酸酶抗性是所需的。在某些实施方案中，布置硫代磷酸酯核苷间键合的数量和位置与磷酸二酯核苷间键合的数量和位置以保持核酸酶抗性是所需的。在某些实施方案中，可以减小硫代磷酸酯核苷间键合的数量并且可以增加磷酸二酯核苷间键合的数量。在某些实施方案中，在可以减小硫代磷酸酯核苷间键合的数量并且可以增加磷酸二酯核苷间键合的数量的同时还能保持核酸酶抗性。在某些实施方案中，在减小硫代磷酸酯核苷间键合的数量的同时保持核酸酶抗性是所需的。在某些实施方案中，在增加磷酸二酯核苷间键合的数量的同时保持核酸酶抗性是所需的。
修饰糖部分
反义化合物可任选含有其中糖基已被修饰的一个或多个核苷。此类糖修饰的核苷可赋予反义化合物以增强的核酸酶稳定性、增强的结合亲和力或某种其他有利生物特性。
在某些实施方案中，修饰寡核苷酸包含含有修饰糖部分的一个或多个修饰核苷。包含一个或多个糖修饰的核苷的此类寡核苷酸可具有所需特性，诸如相对于缺乏此类糖修饰的核苷的寡核苷酸增强的核酸酶稳定性或增大的与靶核酸的结合亲合力。在某些实施方案中，修饰糖部分为线性修饰的糖部分。在某些实施方案中，修饰糖部分为双环或三环糖部分。在某些实施方案中，修饰糖部分为糖替代物。此类糖替代物可包含对应于取代的糖部分的那些取代的一个或多个取代。
在某些实施方案中，修饰糖部分为线性取代的糖部分，其包含具有一个或多个无环取代基，包括但不限于在2’位和/或5’位处的取代基的呋喃糖基环。适用于线性修饰的糖部分的2′-取代基的实例包括但不限于：2’-F、2′-OCH3(“OMe”或“O-甲基”)和 2′-O(CH2)2OCH3(“MOE”)。在某些实施方案中，2’-取代基选自以下各项：卤素、烯丙基、氨基、叠氮基、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、 O-C1-C10烷氧基、O-C1-C10取代烷氧基、O-C1-C10烷基、O-C1-C10取代烷基、S-烷基、N(Rm)-烷基、O-烯基、S-烯基、N(Rm)-烯基、O-炔基、S-炔基、N(Rm)-炔基、O-亚烷基-O-烷基、炔基、烷芳基、芳烷基、O-烷芳基、O-芳烷基、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)或OCH2C(＝O)-N(Rm)(Rn)，其中每个Rm和Rn独立地为H、氨基保护基或取代或未取代的C1-C10烷基。这些2′-取代基的某些实施方案可被独立地选自以下各项的一个或多个取代基进一步取代：羟基、氨基、烷氧基、羧基、苯甲基、苯基、硝基(NO2)、巯基、硫代烷氧基、硫代烷基、卤素、烷基、芳基、烯基和炔基。适用于线性修饰的糖部分的5′-取代基的实例包括但不限于：5’-甲基(R或S)、5′-乙烯基和5’- 甲氧基。在某些实施方案中，线性修饰的糖包含一个以上的非桥接糖取代基，例如，2′-F-5′-甲基糖部分(对于另外的2′，5′-双取代的糖部分和核苷，参见，例如，PCT国际申请WO 2008/101157)。
在某些实施方案中，2′-取代的核苷或2′-线性修饰的核苷包含含有选自以下各项的线性2′-取代基的糖部分：F、NH2、N3、OCF3、OCH3、 O(CH2)3NH2、CH2CH＝CH2、OCH2CH＝CH2、OCH2CH2OCH3、 O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、O(CH2)2O(CH2)2N(CH3)2和N-取代乙酰胺(OCH2C(＝O)-N(Rm)(Rn))，其中每个Rm和Rn独立地为H、氨基保护基或取代或未取代的C1-C10烷基。
在某些实施方案中，2′-取代的核苷或2′-线性修饰的核苷包含含有选自以下各项的线性2′-取代基的糖部分：F、OCF3、OCH3、OCH2 CH2OCH3、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(CH3)2、O(CH2)2O(CH2)2N(CH3) 2和OCH2C(＝O)-N(H)CH3(“NMA”)。
在某些实施方案中，2′-取代的核苷或2′-线性修饰的核苷包含含有选自以下各项的线性2′-取代基的糖部分：F、OCH3和 OCH2CH2OCH3。
包含修饰糖部分(例如线性修饰的糖部分)的核苷根据核苷的糖部分上的取代基位置来引用。例如，包含2′-取代的或2-修饰的糖部分的核苷被称为2′-取代的核苷或2-修饰的核苷。
某些修饰糖部分包含桥接糖取代基，其形成第二个环，从而产生双环糖部分。在某些此类实施方案中，双环糖部分包含4′呋喃糖环原子与2′呋喃糖环原子之间的桥。这种4′至2′桥接糖取代基的实例包括但不限于：4′-CH2-2′、4′-(CH2)2-2′、4′-(CH2)3-2′、4′-CH2-O-2′(“LNA”)、 4′-CH2-S-2′、4′-(CH2)2-O-2′(“ENA”)、4′-CH(CH3)-O-2′(当呈S构型时称之为“限制性乙基”或“cEt”)、4’-CH2-O-CH2-2’、4’-CH2-N(R)-2’、 4′-CH(CH2OCH3)-O-2′(“限制性MOE”或“cMOE”)及其类似物(参见例如美国专利7,399,845)、4′-C(CH3)(CH3)-O-2’及其类似物(参见例如 WO2009/006478)、4′-CH2-N(OCH3)-2′及其类似物(参见例如 WO2008/150729)、4′-CH2-O-N(CH3)-2′(参见例如US2004/0171570)、 4′-CH2-C(H)(CH3)-2′(参见例如Chattopadhyaya等人、J. Org.Chem.，2009，74，118-134)、4′-CH2-C(＝CH2)-2′及其类似物(参见，公布的PCT国际申请WO 2008/154401)、4’-C(RaRb)-N(R)-O-2’、 4’-C(RaRb)-O-N(R)-2’、4′-CH2-O-N(R)-2’和4′-CH2-N(R)-O-2′，其中每个R、Ra和Rb独立地为H、保护基或C1-C12烷基(参见例如美国专利 7,427,672)。
在某些实施方案中，此类4′至2′桥独立地包含1至4个独立地选自以下各项的连接基团：-[C(Ra)(Rb)]n-、-[C(Ra)(Rb)]n-O-、-C(Ra)＝C(R b)-、-C(Ra)＝N-、-C(＝NRa)-、-C(＝O)-、-C(＝S)-、-O-、-Si(Ra)2-、-S(＝O)x-和-N(Ra)-；
其中：
x为0、1或2；
n为1、2、3或4；
每个Ra和Rb独立地为H、保护基C1-C12烷基、取代的C1-C12烷基、C2-C12烯基、取代的C2-C12烯基、C2-C12炔基、取代的C2-C12炔基、C5-C20芳基、取代的C5-C20芳基、杂环基、取代的杂环基、杂芳基、取代的杂芳基、C5-C7脂环族基、取代的C5-C7脂环族基、卤素、 OJ1、NJ1J2、SJ1、N3、COOJ1、酰基(C(＝O)-H)、取代的酰基、CN、磺酰基(S(＝O)2-J1)或次硫酰基(sulfoxyl)(S(＝O)-J1)；并且
每个J1和J2独立地为H、C1-C12烷基、取代的C1-C12烷基、C2-C12烯基、取代的C2-C12烯基、C2-C12炔基、取代的C2-C12炔基、C5-C20芳基、取代的C5-C20芳基、酰基(C(＝O)-H)、取代的酰基、杂环基、取代的杂环基、C1-C12氨基烷基、取代的C1-C12氨基烷基或保护基。
另外的双环糖部分在本领域中是已知的，例如：Freier等人， Nucleic AcidsResearch，1997，25(22)，4429-4443；Albaek等人，J. Org.Chem.，2006，71，7731-7740；Singh等人，Chem.Commun.，1998，4， 455-456；Koshkin等人，Tetrahedron，1998，54，3607-3630；Wahlestedt 等人，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.，2000，97，5633-5638；Kumar等人，Bioorg.Med.Chem.Lett.，1998，8，2219-2222；Singh等人，J.Org.Chem.， 1998，63，10035-10039；Srivastava等人，J.Am.Chem.Soc.，20017，129， 8362-8379；Elayadi等人，Curr.Opinion Invens.Drugs，2001，2，558-561； Braasch等人，Chem.Biol.，2001，8，1-7；Orum等人，Curr.Opinion Mol.Ther.，2001，3，239-243；美国专利号7,053,207、6,268,490、6,770,748、6,794,499、7,034,133、6,525,191、6,670,461和7,399,845； WO 2004/106356、WO 1994/14226、WO 2005/021570和WO 2007/134181；美国专利公布号US2004/0171570、US2007/0287831和US2008/0039618；美国专利序列号12/129,154、60/989,574、 61/026,995、61/026,998、61/056,564、61/086,231、61/097,787和 61/099,844；以及PCT国际申请号PCT/US2008/064591、 PCT/US2008/066154和PCT/US2008/068922。
在某些实施方案中，双环糖部分和掺入所述双环糖部分的核苷通过异构构型进一步定义。例如，LNA核苷(如上所述)可呈α-L构型或呈β-D构型。
已将α-L-亚甲基氧基(4’-CH2-O-2’)或α-L-LNA双环核苷掺入到显示反义活性的反义寡核苷酸中(Frieden等人，Nucleic Acids Research， 2003，21，6365-6372)。在本文中，双环核苷的一般描述包括两种异构构型。当在本文例示的实施方案中鉴定特定双环核苷(例如LNA或cEt) 的位置时，它们呈β-D构型，除非另有规定。
在某些实施方案中，修饰糖部分包含一个或多个非桥接糖取代基和一个或多个桥接糖取代基(例如，5’-取代的糖和4’-2’桥接的糖)。(参见例如WO 2007/134181，其中LNA核苷进一步被例如5′-甲基或5′- 乙烯基取代，并且参见例如美国专利7,547,684；7,750,131；8,030,467； 8,268,980；7,666,854和8,088,746)。
在某些实施方案中，修饰糖部分为糖替代物。在某些此类实施方案中，糖部分的氧原子例如被硫、碳或氮原子代替。在某些此类实施方案中，所述修饰糖部分还包含如上所述的桥接取代基和/或非桥接取代基。例如，某些糖替代物包含4’-硫原子和2′-位(参见，例如，US2005/0130923)和/或5’位处的取代。
在某些实施方案中，糖替代物包含具有除了5个原子以外的环。例如，在某些实施方案中，糖替代物包含六元四氢吡喃(“THP”)。此类四氢吡喃可被进一步修饰或取代。包含此类修饰四氢吡喃的核苷包括但不限于己糖醇核酸(“HNA”)、anitol核酸(“ANA”)、甘露醇核酸 (“MNA”)(参见Leumann，CJ.Bioorg.& Med.Chem.2002，10，841-854)、氟代HNA：
(“F-HNA”，参见例如美国专利8,088,904；8,440,803；和8,796,437， F-HNA也可称为F-THP或3′-氟代四氢呋喃)和具有下式的包含另外的修饰THP化合物的核苷：
其中，独立地，对于所述修饰THP核苷中的每一种：
Bx为核碱基部分；
T3和T4各自独立地为将修饰THP核苷连接至寡核苷酸的剩余部分的核苷间连接基团，或者T3和T4中的一者是将修饰THP核苷连接至寡核苷酸的剩余部分的核苷间连接基团，并且T3和T4中的另一者是H、羟基保护基、连接的缀合基团或5’或3′-末端基团；q1、q2、q3、q4、q5、q6和q7各自独立地为H、C1-C6烷基、取代的C1-C6烷基、C2-C6烯基、取代的C2-C6烯基、C2-C6炔基或取代的C2-C6炔基；并且R1和R2中的每一者独立地选自以下各项：氢、卤素、取代或未取代的烷氧基、NJ1J2、SJ1、N3、OC(＝X)J1、OC(＝X)NJ1J2、NJ3C(＝X)NJ1J2和CN，其中X是O、S或NJ1并且每个J1、J2和J3独立地为H或C1-C6烷基。
在某些实施方案中，提供了修饰的THP核苷，其中q1、q2、q3、 q4、q5、q6和q7各自为H。在某些实施方案中，q1、q2、q3、q4、q5、 q6和q7中的至少一者不是H。在某些实施方案中，q1、q2、q3、q4、 q5、q6和q7中的至少一者是甲基。在某些实施方案中，提供了修饰的 THP核苷，其中R1和R2中的一者为F。在某些实施方案中，R1为F 并且R2为H，在某些实施方案中，R1为甲氧基并且R2为H，并且在某些实施方案中，R1为甲氧基乙氧基并且R2为H。
在某些实施方案中，糖替代物包含具有多于5个原子和多于一个杂原子的环。例如，包含吗啉代糖部分的核苷以及它们在寡聚化合物中的用途已有所报道(参见例如：Braasch等人，Biochemistry，2002，41， 4503-4510；和美国专利5,698,685；5,166,315；5,185,444以及 5,034,506)。如在此所用，术语“吗啉代”意指具有以下结构的糖替代物：
在某些实施方案中，可例如通过添加或改变来自以上吗啉代结构的各种取代基来修饰吗啉代。此类糖替代物在本文中称为“修饰吗啉代”。
在某些实施方案中，糖替代物包含无环部分。包含此类无环糖替代物的核苷和寡核苷酸的实例包括但不限于：肽核酸(“PNA”)、无环丁基核酸(参见，例如，Kumar等人，Org.Biomol.Chem.，2013，11，5853-5865)以及WO2011/133876中所述的核苷和寡核苷酸。
许多可用于修饰核苷中的其他双环和三环糖和糖替代物环体系也为本领域中已知的(参见，例如，Leumann，J.C，Bioorganic & Medicinal Chemistry，2002，10，841-854)。
修饰核碱基
核碱基(或碱基)修饰或取代与天然存在的或合成的未修饰核碱基在结构上不同，但在功能上是可以互换的。天然和修饰的核碱基能够参与氢键合。此类核碱基修饰可赋予反义化合物核酸酶稳定性、结合亲和力或一些其他有益的生物学特性。
在某些实施方案中，修饰寡核苷酸包含含有未修饰核碱基的一个或多个核苷。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸包含含有修饰核碱基的一个或多个核苷。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸包含一个或多个不包含核碱基的核苷(被称为无碱基核苷)。
在某些实施方案中，修饰核碱基选自：5-取代的嘧啶、6-氮杂嘧啶、烷基或炔基取代的嘧啶、烷基取代的嘌呤以及N-2、N-6和O-6 取代的嘌呤。在某些实施方案中，修饰核碱基选自：2-氨基丙基腺嘌呤、5-羟甲基胞嘧啶、黄嘌呤、次黄嘌呤、2-氨基腺嘌呤、6-N-甲基鸟嘌呤、6-N-甲基腺嘌呤、2-丙基腺嘌呤、2-硫尿嘧啶、2-硫代胸腺嘧啶和2-硫代胞嘧啶、丙炔基(-C≡C-CH3)尿嘧啶、5-丙炔基胞嘧啶、 6-偶氮尿嘧啶(azouracil)、6-偶氮胞嘧啶、6-偶氮胸腺嘧啶、5-核糖基尿嘧啶(假尿嘧啶)、4-硫代尿嘧啶、8-卤代、8-氨基、8-硫醇、8-硫代烷基、8-羟基、8-氮杂和其他8-取代的嘌呤、5-卤代、具体地是5-溴代、5-三氟甲基、5-卤代尿嘧啶和5-卤代胞嘧啶、7-甲基鸟嘌呤、7- 甲基腺嘌呤、2-F-腺嘌呤、2-氨基腺嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤、7-脱氮腺嘌呤、3-脱氮鸟嘌呤、3-脱氮腺嘌呤、6-N-苯甲酰基腺嘌呤、2-N-异丁酰基鸟嘌呤、4-N-苯甲酰基胞嘧啶、4-N-苯甲酰基尿嘧啶、5-甲基 4-N-苯甲酰基胞嘧啶、5-甲基-4-N-苯甲酰基尿嘧啶、通用碱基、疏水碱基、混杂碱基、大小扩大的碱基和氟化碱基。另外的修饰核碱基包括三环嘧啶，诸如1，3-二氮杂吩噁嗪-2-酮、1，3-二氮杂吩噻嗪-2-酮和 9-(2-氨基乙氧基)-1，3-二氮杂吩噁嗪-2-酮(G-夹钳)。修饰核碱基还可包括其中嘌呤或嘧啶碱基被其他杂环例如7-脱氮-腺嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤、2-氨基吡啶和2-吡啶酮替代的那些。另外的核碱基包括美国专利号3,687,808中公开的那些；The Concise EncyclopediaOf Polymer Science And Engineering，Kroschwitz，J.I.编，John Wiley & Sons，1990，858-859；Englisch等人，Angewandte Chemie，国际版，1991，30，613； Sanghvi，Y.S.，第15章，Antisense Research and Applications，Crooke， S.T.和Lebleu，B.编，CRC Press，1993，273-288中公开的那些；以及第 6和15章，Antisense Drug Technology，Crooke S.T.编，CRC Press，2008， 163-166和442-443中公开的那些。
教导某些上述修饰核碱基以及其他修饰核碱基的制备的代表性美国专利包括但不限于US2003/0158403；U.S.3,687,808；4,845,205； 5,130,302；5,134,066；5,175,273；5,367,066；5,432,272；5,434,257； 5,457,187；5,459,255；5,484,908；5,502,177；5,525,711；5,552,540； 5,587,469；5,594,121；5,596,091；5,614,617；5,645,985；5,681,941；5,750,692；5,763,588；5,830,653和6,005,096。
在某些实施方案中，靶向DGAT2核酸的反义化合物包含一个或多个修饰核碱基。在某些实施方案中，修饰核碱基为5-甲基胞嘧啶。在某些实施方案中，每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
某些基序
寡核苷酸可以具有基序，例如未修饰和/或修饰的糖部分、核碱基和/或核苷间键合的模式。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸包含含有修饰糖的一个或多个修饰核苷。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸包含含有修饰核碱基的一个或多个修饰核苷。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸包含一个或多个修饰核苷间键合。在此类实施方案中，修饰寡核苷酸的修饰、未修饰和不同修饰的糖部分、核碱基和/或核苷间键合限定模式或基序。在某些实施方案中，糖部分、核碱基和核苷间键合的模式各自彼此独立。因此，修饰寡核苷酸可通过其糖基序、核碱基修饰基序和/或核苷间键合基序来描述(如本文所用，核碱基基序描述对核碱基的修饰，而与核碱基的序列无关)。
1.某些糖基序
在某些实施方案中，寡核苷酸包含以限定的模式或糖基序沿着寡核苷酸或其区布置的一种或多种类型的修饰糖部分和/或未修饰糖部分。在某些情况下，此类糖基序包括但不限于本文论述的任何糖修饰。
在某些实施方案中，修饰寡核苷酸包含具有间隔体基序的区或由所述区组成，所述间隔体糖基序包含两个外部区或“翼”以及中心区或内部区或“缺口”。间隔体基序的三个区(5’-翼、缺口和3’-翼)形成连续的核苷序列，其中每个翼的核苷的至少一些糖部分不同于缺口的核苷的至少一些糖部分。确切来说，每个翼的核苷的至少最接近缺口的糖部分(5’-翼的最3’核苷和3’-翼的最5’核苷)不同于邻近缺口核苷的糖部分，从而限定了翼与缺口之间的边界(即翼/缺口接合区)。在某些实施方案中，缺口内的糖部分彼此相同。在某些实施方案中，缺口包括一个或多个核苷，所述核苷具有不同于缺口的一个或多个其他核苷的糖部分的糖部分。在某些实施方案中，两翼的糖基序彼此相同(对称的间隔体)。在某些实施方案中，5′-翼的糖基序不同于3′-翼的糖基序(不对称的间隔体)。
在某些实施方案中，间隔体的翼包含1-5个核苷。在某些实施方案中，间隔体的翼包含2-5个核苷。在某些实施方案中，间隔体的翼包含3-5个核苷。在某些实施方案中，间隔体的核苷全部是修饰核苷。
在某些实施方案中，间隔体的缺口包含7-12个核苷。在某些实施方案中，间隔体的缺口包含7-10个核苷。在某些实施方案中，间隔体的缺口包含8-10个核苷。在某些实施方案中，间隔体的缺口包含10个核苷。在某些实施方案中，间隔体的缺口的每个核苷均为未修饰的2’-脱氧核苷。
在某些实施方案中，间隔体是脱氧间隔体。在此类实施方案中，每个翼/缺口接合区的缺口侧上的核苷是未修饰的2′-脱氧核苷，并且每个翼/缺口接合区的翼侧上的核苷是修饰核苷。在某些此类实施方案中，缺口的每个核苷均为未修饰的2’-脱氧核苷。在某些此类实施方案中，每个翼的每个核苷均为修饰核苷。
在某些实施方案中，修饰寡核苷酸包含具有完全修饰的糖基序的区或由所述区组成。在此类实施方案中，修饰寡核苷酸的完全修饰的区的每个核苷包含修饰糖部分。在某些此类实施方案中，整个修饰寡核苷酸的每个核苷包含修饰糖部分。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸包含具有完全修饰的糖基序的区或由所述区组成，其中完全修饰的区内的每个核苷包含相同的修饰糖部分(在本文中称之为均匀修饰糖部分)。在某些实施方案中，完全修饰的寡核苷酸是均匀修饰的寡核苷酸。在某些实施方案中，均匀修饰的寡核苷酸的每个核苷包含相同的2′-修饰。
2.某些核碱基基序
在某些实施方案中，寡核苷酸包含以限定的模式或基序沿着寡核苷酸或其区布置的修饰和/或未修饰核碱基。在某些实施方案中，每个核碱基均为修饰的。在某些实施方案中，没有一个核碱基为修饰的。在某些实施方案中，每个嘌呤或每个嘧啶均为修饰的。在某些实施方案中，每个腺嘌呤均为修饰的。在某些实施方案中，每个鸟嘌呤均为修饰的。在某些实施方案中，每个胸腺嘧啶均为修饰的。在某些实施方案中，每个尿嘧啶均为修饰的。在某些实施方案中，每个胞嘧啶均为修饰的。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸中的一些或所有胞嘧啶核碱基为5-甲基胞嘧啶。
在某些实施方案中，修饰寡核苷酸包含修饰核碱基的嵌段。在某些此类实施方案中，嵌段处于寡核苷酸的3’-端处。在某些实施方案中，嵌段在寡核苷酸的3’-端的3个核苷内。在某些所述实施方案中，嵌段处于寡核苷酸的5’-端处。在某些实施方案中，嵌段在寡核苷酸的3’-端的5个核苷内。
在某些实施方案中，具有间隔体基序的寡核苷酸包含含有修饰核碱基的核苷。在某些此类实施方案中，包含修饰核碱基的一个核苷位于具有间隔体基序的寡核苷酸的中心缺口中。在某些此类实施方案中，所述核苷的糖部分为2’-脱氧核糖基部分。在某些实施方案中，修饰核碱基选自：2-硫代嘧啶和5-丙炔嘧啶。
3.某些核苷间键合基序
在某些实施方案中，寡核苷酸包含以限定的模式或基序沿着寡核苷酸或其区布置的修饰和/或未修饰核苷间键合。在某些实施方案中，基本上每个核苷间连接基团为磷酸酯核苷间键合(P＝O)。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸的每个核苷间连接基团为硫代磷酸酯 (P＝S)。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸的每个核苷间连接基团独立地选自硫代磷酸酯和磷酸酯核苷间键合。在某些实施方案中，修饰寡核苷酸的糖基序是间隔体并且缺口内的核苷间键合全部是修饰的。在某些此类实施方案中，翼中的一些或所有核苷间键合是未修饰的磷酸酯键合。在某些实施方案中，末端核苷间键合是修饰的。
某些寡核苷酸
寡核苷酸的特征在于其基序和总长度。在某些实施方案中，此类参数各自彼此独立。因此，除非另外指明，否则具有间隔体基序的寡核苷酸的每个核苷间键合均可为修饰或未修饰的并且可以或可以不遵循糖修饰的间隔体修饰模式。例如，间隔体的翼区内的核苷间键合可为彼此相同或不同的，并且可与缺口区的核苷间键合相同或不同。同样，此类间隔体寡核苷酸可包含一个或多个独立于糖修饰的间隔体模式的修饰核碱基。此外，除非另外指明，否则完全修饰的寡核苷酸的每个核苷间键合和每个核碱基可以是修饰的或未修饰的。本领域技术人员将了解，可将所述基序组合以产生各种寡核苷酸。在本文中，如果寡核苷酸的描述没有提及一个或多个参数，那么这个参数不受限制。因此，仅被描述为具有间隔体基序而没有进一步描述的修饰寡核苷酸可具有任何长度、核苷间键合基序和核碱基基序。除非另外指明，否则所有修饰与核碱基序列无关。
在某些实施方案中，寡核苷酸具有与第二寡核苷酸或靶核酸互补的核碱基序列。在某些此类实施方案中，寡核苷酸的区具有与第二寡核苷酸或靶核酸互补的核碱基序列。在某些实施方案中，寡核苷酸的区或整个长度的核苷碱基序列与第二寡核苷酸或靶核酸至少 50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少90％、至少95％或 100％互补。在某些实施方案中，反义化合物包含两种寡聚化合物，其中寡聚化合物的两种寡核苷酸彼此至少80％、至少90％或100％互补。在某些实施方案中，双链反义化合物的一种或两种寡核苷酸包含不与另一寡核苷酸互补的两个核苷。
缀合基团和末端基团
在某些实施方案中，反义化合物和寡聚化合物包含缀合基团和/ 或末端基团。在某些此类实施方案中，寡核苷酸与一个或多个缀合基团共价连接。在某些实施方案中，缀合基团改变所连接的寡核苷酸的一种或多种特性，包括但不限于药效学、药物代谢动力学、稳定性、结合、吸收、细胞分布、细胞摄取、电荷和清除率。在某些实施方案中，缀合基团在所连接的寡核苷酸上赋予新特性，例如能够检测寡核苷酸的荧光团或报道基团。缀合基团和/或末端基团可添加至具有上述任何修饰或基序的寡核苷酸。因此，例如，包含具有间隔体基序的寡核苷酸的反义化合物或寡聚化合物还可包含缀合基团。
缀合基团包括但不限于嵌入剂、报道分子、聚胺、聚酰胺、肽、碳水化合物、维生素部分、聚乙二醇、硫醚、聚醚、胆固醇、硫代胆固醇、胆酸部分、叶酸、脂质、磷脂、生物素、吩嗪、菲啶、蒽醌、金刚烷、吖啶、荧光素、若丹明、香豆素、荧光团和染料。先前已经描述了某些缀合基团，例如：胆固醇部分(Letsinger等人，Proc.Natl. Acad.Sci.USA，1989，86，6553-6556)，cholic acid(Manoharan等人，B ioorg.Med.Chem.Lett.，1994，4，1053-1060)、硫醚，例如己基-S-三苯甲基硫醇(Manoharah等人，Ann.N.Y.Acad.Sci.，1992，660，306-309；Manoharan等人，Bioorg.Med.Chem.Let.，1993，3，2765-2770)、硫代胆固醇(Oberhauser等人，Nucl.Acids Res.，1992，20，533-538)、脂族链例如，十二烷基二醇(do-decan-diol)十一烷基残基(Saison-Behmoaras等人，EMBO J.，1991，10，1111-1118；Kabanov等人，FEBSLett.，199 0，259，327-330；Svinarchuk等人，Biochimie，1993，75，49-54)、磷脂例如双-十六烷基-rac-甘油或三乙基-铵1，2-二-O-十六烷基-rac-甘油 -3-H-膦酸酯(Manoharan等人，Tetrahedron Lett.，1995，36，3651-365 4；Shea等人，Nucl.Acids Res.，1990，18，3777-3783)、聚胺或聚乙二醇链(Manoharan等人，Nucleosides & Nucleotides，1995，14，969-973) 或金刚烷乙酸(Manoharan等人，Tetrahedron Lett.，1995，36，3651-36 54)、棕榈基部分(Mishra等人，Biochim.Biophys.Acta，1995，1264，229 -237)、十八烷基胺或己氨基-羰基-氧基胆固醇部分(Crooke等人，J.Ph armacol.Exp.Ther.，1996，277，923-937)、生育酚基团(Nishina等人， Molecular Therapy Nucleic Acids，2015，4，e220；doi：10.1038/mtna.2 014.72和Nishina等人，Molecular Therapy，2008，16，734-740)或GalNAc簇(例如WO2014/179620)。
在某些实施方案中，缀合基团包括活性药物，例如阿司匹林、华法林(warfarin)、苯基丁氮酮、布洛芬、舒洛芬、芬布芬、酮洛芬、(S)-(+)- 普拉洛芬、卡洛芬、丹酰基肌氨酸、2，3，5-三碘苯甲酸、芬戈莫德 (fingolimod)、氟灭酸、亚叶酸、苯并噻二嗪、氯噻嗪、二氮杂卓、吲哚美辛(indo-methicin)、巴比妥酸盐、头孢菌素、磺胺药、抗糖尿病剂、抗菌剂或抗生素。
缀合基团直接或通过任选的缀合接头连接至母体化合物，诸如寡核苷酸。在某些实施方案中，缀合基团直接连接至寡核苷酸。在某些实施方案中，缀合基团通过缀合接头间接连接至寡核苷酸。在某些实施方案中，缀合接头包含链结构诸如烃基链，或重复单元诸如乙二醇或氨基酸单元的寡聚物。在某些实施方案中，缀合基团包含可裂解部分。在某些实施方案中，缀合基团通过可裂解部分连接至寡核苷酸。在某些实施方案中，缀合接头包含可裂解部分。在某些此类实施方案中，缀合接头通过可裂解部分连接至寡核苷酸。在某些实施方案中，寡核苷酸包含可切割部分，其中可裂解部分是连接至可裂解的核苷间键，诸如磷酸酯核苷间键合的核苷。在某些实施方案中，缀合基团包含核苷或寡核苷酸，其中缀合基团的核苷或寡核苷酸间接连接至亲本寡核苷酸。
在某些实施方案中，缀合接头包含选自以下各项的一个或多个基团：烷基、氨基、氧代、酰胺、二硫化物、聚乙二醇、醚、硫醚和羟基氨基。在某些此类实施方案中，缀合接头包含选自以下各项的基团：烷基、氨基、氧代、酰胺和醚基。在某些实施方案中，缀合接头包含选自烷基和酰胺基的基团。在某些实施方案中，缀合接头包含选自烷基和醚基的基团。在某些实施方案中，缀合接头包含至少一个磷部分。在某些实施方案中，缀合接头包含至少一个磷酸酯基团。在某些实施方案中，缀合接头包含至少一个中性连接基团。
在某些实施方案中，缀合接头(包括上述缀合接头)是双官能连接部分，例如本领域已知可用于将缀合基因连接至母体化合物诸如本文提供的寡核苷酸的那些。一般来讲，双官能连接部分包含至少两个官能团。一个官能团被选择来结合母体化合物上的特定位点，并且另一个被选择来结合缀合基团。在双官能连接部分中使用的官能团的实例包括但不限于用于与亲核基团反应的亲电子试剂和用于与亲电子基团反应的亲核试剂。在某些实施方案中，双官能连接部分包含选自以下各项的一个或多个基团：氨基、羟基、羧酸、硫醇、烷基、烯基和炔基。
缀合接头的实例包括但不限于吡咯烷、8-氨基-3，6-二氧杂辛酸 (ADO)、4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1-羧酸琥珀酰亚胺酯(SMCC) 和6-氨基己酸(AHEX或AHA)。其他缀合接头包括但不限于取代或未取代的C1-C10烷基、取代或未取代的C2-C10烯基或取代或未取代的 C2-C10炔基，其中优选取代基的非限制性列表包括羟基、氨基、烷氧基、羧基、苄基、苯基、硝基、硫醇、硫代烷氧基、卤素、烷基、芳基、烯基和炔基。
在某些实施方案中，可裂解部分为可裂解键。在某些实施方案中，在某些实施方案中，包含可裂解键。在某些实施方案中，可裂解部分为包含至少一个可裂解键的原子团。在某些实施方案中，可裂解部分包含具有一、二、三、四个或多于四个的可裂解键的原子团。在某些实施方案中，可裂解部分在细胞或亚细胞隔室(诸如溶酶体)内部选择性裂解。在某些实施方案中，可裂解部分通过内源性酶诸如核酸酶选择性裂解。
在某些实施方案中，可裂解键选自以下各项：酰胺、聚酰胺、酯、醚、磷酸二酯的一个或两个酯、磷酸酯、氨基甲酸酯或二硫化物。在某些实施方案中，可裂解键是磷酸二酯的一个或两个酯。在某些实施方案中，可裂解部分包括磷酸酯或磷酸二酯。在某些实施方案中，可裂解部分是寡核苷酸与缀合接头或缀合基团之间的磷酸酯键合。
在某些实施方案中，可裂解部分是核苷。在某些此类实施方案中，未修饰或修饰的核苷包含选自以下各项的任选保护的杂环碱基：嘌呤、取代的嘌呤、嘧啶或取代的嘧啶。在某些实施方案中，可裂解部分是选自以下各项的核苷：尿嘧啶、胸腺嘧啶、胞嘧啶、4-N-苯甲酰基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶、腺嘌呤、6-N- 苯甲酰基腺嘌呤、鸟嘌呤和2-N-异丁酰基鸟嘌呤。在某些实施方案中，可裂解部分是2′-脱氧核苷，所述2′-脱氧核苷通过磷酸酯核苷间键合连接至寡核苷酸的3’或5′-末端核苷并且通过磷酸酯或硫代磷酸酯键合共价连接至缀合接头或缀合基团。在某些此类实施方案中，可裂解部分是2′-脱氧腺苷。
缀合基团可连接至寡核苷酸的任一端或两端和/或连接在任何内部位置处。在某些实施方案中，缀合基团连接至修饰寡核苷酸的核苷的2’-位。在某些实施方案中，连接至寡核苷酸的任一端或两端的缀合基团是末端基团。在某些此类实施方案中，缀合基团或末端基团连接在寡核苷酸的3′和/或5′-端。在某些此类实施方案中，缀合基团(或末端基团)连接在寡核苷酸的3′-端。在某些实施方案中，缀合基团连接在寡核苷酸的3’-端附近。在某些实施方案中，缀合基团(或末端基团)连接在寡核苷酸的5′-端。在某些实施方案中，缀合基团连接在寡核苷酸的5’-端附近。
末端基团的实例包括但不限于缀合基团、封端基团、磷酸酯部分、保护基团、修饰或未修饰的核苷以及独立修饰或未修饰的两个或更多个核苷。
在某些实施方案中，缀合基团是细胞靶向部分。在某些实施方案中，缀合基团、任选的缀合接头和任选的可裂解部分具有以下通式：
其中n为1至约3，当n为1时m为0，当n为2或更大时m为 1，j为1或0，并且k为1或0。
在某些实施方案中，n为1，j为1并且k为0。在某些实施方案中，n为1，j为0并且k为1。在某些实施方案中，n为1，j为1并且k为1。在某些实施方案中，n为2，j为1并且k为0。在某些实施方案中，n为2，j为0并且k为1。在某些实施方案中，n为2，j 为1并且k为1。在某些实施方案中，n为3，j为1并且k为0。在某些实施方案中，n为3，j为0并且k为1。在某些实施方案中，n 为3，j为1并且k为1。
在某些实施方案中，缀合基团包括细胞靶向部分，所述细胞靶向部分具有至少一个系接配体。在某些实施方案中，细胞靶向部分包含共价连接至支链基团的两个系接配体。在某些实施方案中，细胞靶向部分包含共价连接至支链基团的三个系接配体。
在某些实施方案中，细胞靶向部分包含支链基团，所述支链基团包含选自以下各项的一个或多个基团：烷基、氨基、氧代、酰胺、二硫化物、聚乙二醇、醚、硫醚和羟基氨基。在某些实施方案中，支链基团包括支链脂族基团，所述支链脂族基团包含选自以下各项的基团：烷基、氨基、氧代、酰胺、二硫化物、聚乙二醇、醚、硫醚和羟氨基。在某些此类实施方案中，支链脂族基团包含选自以下各项的基团：烷基、氨基、氧代、酰胺和醚基。在某些此类实施方案中，支链脂族基团包含选自以下各项的基团：烷基、氨基和醚基。在某些此类实施方案中，支链脂族基团包含选自以下各项的基团：烷基和醚基。在某些实施方案中，支链基团包含单环系统或多环系统。
在某些实施方案中，细胞靶向部分的每个系链包含选自以下各项的一个或多个基团：处于任何组合的烷基、取代的烷基、醚、硫醚、二硫化物、氨基、氧代、酰胺、磷酸二酯和聚乙二醇。在某些实施方案中，每个系链为包含选自以下各项的一个或多个基团的线性脂族基团：处于任何组合的烷基、醚、硫醚、二硫化物、氨基、氧代、酰胺和聚乙二醇。在某些实施方案中，每个系链为包含选自以下各项的一个或多个基团的线性脂族基团：处于任何组合的烷基、磷酸二酯、醚、氨基、氧代和酰胺。在某些实施方案中，每个系链为包含选自以下各项的一个或多个基团的线性脂族基团：处于任何组合的烷基、醚、氨基、氧代和酰胺(amid)。在某些实施方案中，每个系链为包含选自以下各项的一个或多个基团的线性脂族基团：处于任何组合的烷基、氨基和氧代。在某些实施方案中，每个系链为包含选自以下各项的一个或多个基团的线性脂族基团：处于任何组合的烷基和氧代。在某些实施方案中，每个系链为包含选自以下各项的一个或多个基团的线性脂族基团：处于任何组合的烷基和磷酸二酯。在某些实施方案中，每个系链包含至少一个磷连接基团或中性连接基团。在某些实施方案中，每个系链包括长度为约6至约20个原子的链。在某些实施方案中，每个系链包括长度为约10至约18个原子的链。在某些实施方案中，每个系链包括约10个原子的链长。
在某些实施方案中，细胞靶向部分的每个配体对靶细胞上的至少一种类型的受体具有亲合力。在某些实施方案中，每个配体对哺乳动物肝脏细胞表面上的至少一种类型的受体具有亲合力。在某些实施方案中，每个配体对肝去唾液酸糖蛋白受体(ASGP-R)具有亲合力。在某些实施方案中，每个配体为碳水化合物。在某些实施方案中，每个配体独立地选自半乳糖、N-乙酰基半乳糖胺(GalNAc)、甘露糖、葡萄糖、葡糖胺以及岩藻糖。在某些实施方案中，每个配体为N-乙酰基半乳糖胺(GalNAc)。在某些实施方案中，细胞靶向部分包含3个GalNAc配体。在某些实施方案中，细胞靶向部分包含2个GalNAc 配体。在某些实施方案中，细胞靶向部分包含1个GalNAc配体。
在某些实施方案中，细胞靶向部分的每个配体是碳水化合物、碳水化合物衍生物、改性碳水化合物、多糖、改性多糖或多糖衍生物。在某些此类实施方案中，缀合基团包含碳水化合物簇(参见例如Maier 等人，“Synthesis of Antisense OligonucleotidesConjugated to a Multivalent Carbohydrate Cluster for Cellular Targeting，”Bioconjugate Chemistry，2003，14，18-29，或Rensen等人，“Design and Synthesis ofNovel N-Acetylgalactosamine-Terminated Glycolipids for Targeting ofLipoproteins to the Hepatic Asiaglycoprotein Receptor，”J. Med.Chem.2004，47，5798-5808，两个文献均以引用的方式整体并入本文)。在某些此类实施方案中，每个配体为氨基糖或硫代糖。例如，氨基糖可选自任何数目的本领域中已知的化合物，诸如唾液酸、α-D- 半乳糖胺、β-胞壁酸、2-脱氧-2-甲基氨基-L-吡喃葡萄糖、4，6-二脱氧 -4-甲酰氨基-2，3-二-O-甲基-D-吡喃甘露糖、2-脱氧-2-磺氨基-D-吡喃葡萄糖和N-磺基-D-葡糖胺和N-乙醇酰基-α-神经氨酸。例如，硫代糖可选自5-硫代-β-D-吡喃葡萄糖、2，3，4-三-O-乙酰基-1-硫代-6-O-三苯甲基-α-D-吡喃葡萄糖苷甲酯、4-硫代-β-D-吡喃半乳糖和3，4，6，7-四-O-乙酰基-2-脱氧-1，5-二硫代-α-D-吡喃葡庚糖苷乙酯。
在某些实施方案中，缀合基团包括具有下式的细胞靶向部分：
在某些实施方案中，缀合基团包括具有下式的细胞靶向部分：
在某些实施方案中，缀合基团包括具有下式的细胞靶向部分：
在某些实施方案中，反义化合物和寡聚化合物包含本文描述为“LICA-1”的缀合基团和缀合接头。LICA-1有以下公式：
在某些实施方案中，包含LICA-1的反义化合物和寡聚化合物具有下式：
其中oligo是寡核苷酸。
教导某些上述缀合基团、包含缀合基团、系链、缀合接头、支链基团、配体、可裂解部分以及其他修饰的寡聚化合物和反义化合物的代表性美国专利、美国专利申请公布、国际专利申请公布和其他出版物包括但不限于US 5,994,517、US 6,300,319、US 6,660,720、US 6,906,182、US 7,262,177、US 7,491,805、US 8,106,022、US 7,723,509、 US 2006/0148740、US 2011/0123520、WO 2013/033230和WO 2012/037254；Biessen等人，J.Med.Chem.1995，38，1846-1852、Lee等人，Bioorganic & Medicinal Chemistry 2011，19，2494-2500、Rensen等人，J.Biol.Chem.2001，276，37577-37584、Rensen等人，J.Med.Chem.2004，47，5798-5808、Sliedregt等人，J.Med.Chem.1999，42， 609-618和Valentijn等人，Tetrahedron，1997，53，759-770，每个所述文献均以引用的方式整体并入本文。
在某些实施方案中，反义化合物和寡聚化合物包含修饰寡核苷酸，所述修饰寡核苷酸包含间隔体或完全修饰的基序和包含至少一个、两个或三个GalNAc配体的缀合基团。在某些实施方案中，反义化合物和寡聚化合物包含以下参考文献中任一个中出现的缀合基团： Lee，Carbohydr Res，1978，67，509-514；Connolly等人，J Biol Che m，1982，257，939-945；Pavia等人，Int J Pep Protein Res，1983，2 2，539-548；Lee等人，Biochem，1984，23，4255-4261；Lee等人，Gl ycoconjugate J，1987，4，317-328；Toyokuni等人，TetrahedronLett， 1990，31，2673-2676；Biessen等人，J Med Chem，1995，38，1538-1 546；Valentijn等人，Tetrahedron，1997，53，759-770；Kim等人，Tet rahedron Lett，1997，38，3487-3490；Lee等人，Bioconjug Chem，19 97，8，762-765；Kato等人，Glycobiol，2001，11，821-829；Rensen等人，J Biol Chem，2001，276，37577-37584；Lee等人，Methods Enzy mol，2003，362，38-43；Westerlind等人，Glycoconj J，2004，21，227 -241；Lee等人，Bioorg Med ChemLett，2006，16(19)，5132-5135； Maierhofer等人，Bioorg Med Chem，2007，15，7661-7676；Khorev 等人，Bioorg Med Chem，2008，16，5216-5231；Lee等人，Bioorg M ed Chem，2011，19，2494-2500；Kornilova等人，Analyt Biochem，2 012，425，43-46；Pujol等人，AngewChemie Int Ed Engl，2012，51， 7445-7448；Biessen等人，J Med Chem，1995，38，1846-1852；Slied regt等人，J Med Chem，1999，42，609-618；Rensen等人，J Med C hem，2004，47，5798-5808；Rensen等人，Arterioscler Thromb Vasc Biol，2006，26，169-175；vanRossenberg等人，Gene Ther，2004，11， 457-464；Sato等人，J Am Chem Soc，2004，126，14013-14022；Le e等人，J Org Chem，2012，77，7564-7571；Biessen等人，FASEB J， 2000，14，1784-1792；Rajur等人，Bioconjug Chem，1997，8，935-94 0；Duff等人，MethodsEnzymol，2000，313，297-321；Maier等人，B ioconjug Chem，2003，14，18-29；Jayaprakash等人，Org Lett，2010，12，5410-5413；Manoharan，Antisense Nucleic Acid Drug Dev，2002， 12，103-128；Merwin等人，Bioconjug Chem，1994，5，612-620；To miya等人，BioorgMed Chem，2013，21，5275-5281；国际申请WO1 998/013381；WO2011/038356；WO1997/046098；WO2008/098788； WO2004/101619；WO2012/037254；WO2011/120053；WO2011/100131；WO2011/163121；WO2012/177947；WO2013/033230；WO2013/ 075035；WO2012/083185；WO2012/083046；WO2009/082607；WO2 009/134487；WO2010/144740；WO2010/148013；WO1997/020563； WO2010/088537；WO2002/043771；WO2010/129709；WO2012/0681 87；WO2009/126933；WO2004/024757；WO2010/054406；WO2012/ 089352；WO2012/089602；WO2013/166121；WO2013/165816；美国专利4,751,219；8,552,163；6,908,903；7,262,177；5,994,517；6,300, 319；8,106,022；7,491,805；7,491,805；7,582,744；8,137,695；6,383,812；6,525,031；6,660,720；7,723,509；8,541,548；8,344,125；8,313, 772；8,349,308；8,450,467；8,501,930；8,158,601；7,262,177；6,906, 182；6,620,916；8,435,491；8,404,862；7,851,615；公布的美国专利申请公布US2011/0097264；US2011/0097265；US2013/0004427；US 2005/0164235；US2006/0148740；US2008/0281044；US2010/024073 0；US2003/0119724；US2006/0183886；US2008/0206869；US2011/0 269814；US2009/0286973；US2011/0207799；US2012/0136042；US2 012/0165393；US2008/0281041；US2009/0203135；US2012/0035115； US2012/0095075；US2012/0101148；US2012/0128760；US2012/0157 509；US2012/0230938；US2013/0109817；US2013/0121954；US201 3/0178512；US2013/0236968；US2011/0123520；US2003/0077829；U S2008/0108801和US2009/0203132；每个文献均以引用的方式整体并入本文。
在某些实施方案中，本文所述的靶向DGAT2的修饰寡核苷酸还包含GalNAc缀合基团。在某些实施方案中，GalNAc缀合基团是5′- 三己基氨基-(THA)-C6 GalNAc3。在某些实施方案中，5′-三己基氨基-(THA)-C6 GalNAc3缀合物具有式
在某些实施方案中，修饰寡核苷酸通过可裂解部分连接至5′-三己基氨基-(THA)-C6 GalNAc3缀合物。在某些实施方案中，可裂解部分是磷酸酯基团。
用于配制药物组合物的组合物和方法
在某些实施方案中，本发明提供包含一种或多种反义化合物或其盐的药物组合物。在某些此类实施方案中，药物组合物包含合适的药学上可接受的稀释剂或载体。在某些实施方案中，药物组合物包含无菌盐水溶液和一种或多种反义化合物。在某些实施方案中，所述药物组合物由无菌盐水溶液和一种或多种反义化合物组成。在某些实施方案中，无菌盐水为药用级盐水。在某些实施方案中，药物组合物包含一种或多种反义化合物和无菌水。在某些实施方案中，药物组合物由一种反义化合物和无菌水组成。在某些实施方案中，无菌水为药用级水。在某些实施方案中，药物组合物包含一种或多种反义化合物和磷酸盐缓冲盐水(PBS)。在某些实施方案中，药物组合物由一种或多种反义化合物和无菌PBS组成。在某些实施方案中，无菌PBS为药用级PBS。用于配制药物组合物的组合物和方法取决于许多标准，包括但不限于施用途径、疾病程度或所施用的剂量。
靶向DGAT2核酸的反义化合物可通过将反义化合物与适合的药学上可接受的稀释剂或载体组合而用于药物组合物中。在某些实施方案中，药学上可接受的稀释剂是水，诸如适于注射的无菌水。因此，在一个实施方案中，在本文所述的方法中使用包含靶向DGAT2核酸的反义化合物及药学上可接受的稀释剂的药物组合物。在某些实施方案中，药学上可接受的稀释剂为水。在某些实施方案中，反义化合物为本文提供的反义寡核苷酸。
包含反义化合物的药物组合物涵盖在施用至动物(包括人)时能够提供(直接或间接地)其生物活性代谢物或残余物的任何药学上可接受的盐、酯或此类酯的盐，或任何其他寡核苷酸。因此，例如，本公开还涉及反义化合物的药学上可接受的盐、前药、此类前药的药学上可接受的盐以及其他生物等效物。合适的药学上可接受的盐包括但不限于钠盐和钾盐。
前药可包括在反义化合物的一端或两端处并入可由体内内源性核酸酶裂解而形成活性反义化合物的额外核苷。
在某些实施方案中，化合物或组合物还包含药学上可接受的载体或稀释剂。
某些化合物
使用表现出与人基因DGAT2序列具有100％互补性的约5,000 种反义寡核苷酸人HepG2细胞中进行体外筛选。将新化合物与先前设计的化合物进行比较，所述先前设计的化合物在先前已经确定是一些体外最强力的反义化合物(参见例如公布的PCT申请WO 2005/019418)。从这些体外筛选中，在减少人DGAT2 mRNA的表达方面表现出最大效力的若干种反义寡核苷酸被选择用于体内耐受性测定。
在CD1小鼠模型以及Sprague-Dawley大鼠模型中测试选择的寡核苷酸的耐受性。在这些模型中，测量体重和器官重量、肝脏功能标志物(诸如丙氨酸转氨酶、天冬氨酸转氨酶和胆红素)和肾功能标志物(诸如BUN和肌酸酐)。
所有研究(实施例1-15)的最终评价导致选择具有以下各项的核碱基序列的八种寡核苷酸：1371(ISIS 484085)、SEQ ID NO：1415 (ISIS 484129)、SEQ ID NO：1423(ISIS484137)、SEQ ID NO：1844 (ISIS 495576)、SEQ ID NO：2959(ISIS 501861)、SEQ IDNO：3292 (ISIS 502194)、SEQ ID NO：4198(ISIS 525443)和SEQ ID NO：4373 (ISIS525612)。化合物与区23242-23261、26630-26649、 26778-26797、15251-15270、28026-28045、35436-35455、 10820-10836和23246-23262互补。在某些实施方案中，如本文进一步所述的靶向所列区的化合物包含具有SEQ ID No中列出的序列的一些核碱基部分的修饰寡核苷酸，如本文进一步所述。在某些实施方案中，靶向所列区或具有所列SEQ ID No中列出的序列的核碱基部分的化合物可以具有各种长度，如本文进一步所述，并且可以具有各种基序中的一种，如本文进一步所述。在某些实施方案中，靶向区或具有所列SEQ ID No中序列的核碱基部分的化合物具有特定的长度和基序，如通过以下各项指示的：ISIS No：484085、484129、484137、495576、501861、502194、525443和525612。
测试这八种化合物在食蟹猴中的活性、药物代谢动力学特征和耐受性(实施例16)。具体地，在这个猴子研究中发现ISIS 484137是强力且最具耐受性的。在单独猴子研究(实施例17)中进一步评价 ISIS 484137确认了这一发现。
ISIS 484137的核苷酸序列与猕猴DGAT2 mRNA转录物完全同源。食蟹猴被认为是寡核苷酸治疗剂的相关的临床前安全性模型体系，并且ISIS 484137在该物种中展示的药理活性使其成为用于安全性评估的适当物种。使用ISIS 484137在猴子中进行一般的毒理学研究，治疗持续13周，并且其耐受性良好，其中没有明显的不良反应并且也没有常规实验室参数的变化。ISIS 484137将肝DGAT2的表达降低约70％。
在ISIS 484137治疗13周之后，在小鼠和猴子毒理学研究中观察到的发现通常是2′-MOE ASO典型的非特异性类效应。直到最高测试剂量(小鼠中的100mg/kg和猴子中的40mg/kg)，没有药物相关死亡率或临床征象变化。在小鼠和猴子研究中，在剂量高达12mg/kg/ 周，持续13周时没有毒理学显著的发现，因此有足够的治疗范围来支持ISIS 484137在建议的临床剂量和方案下的安全临床使用。
在13周的小鼠和猴子研究中，药物代谢动力学结果确认对ISIS 484137的连续且剂量依赖性暴露。在猴子中观察到的反义寡核苷酸的药物代谢动力学通常很好地预测基于mg/kg当量剂量的观察到的人血浆(和预期组织)暴露水平(Geary等人2003；31：1419-1428；Yu等人Drug Metab Dispos 2007；35：460-468)。
因此，用ISIS 484137减少DGAT2表达提供了减少肝脂肪变性的机制，从而潜在地减弱随后的炎症和纤维化。这种作用机制可以为患有与NAFLD和NASH相关的显著肝脂肪变性的患者提供有吸引力的治疗选择。
实施例
下面的实施例描述了鉴定靶向DGAT2的先导化合物的筛选过程。在筛选的约5,000种反义寡核苷酸之中，ISIS 484085、ISIS 484129、 ISIS 484137、ISIS 495576、ISIS501861、ISIS 502194、ISIS 525443 和ISIS 525612显现为热点先导化合物。具体地，在约5,000种反义寡核苷酸之中就对DGAT2的效力和耐受性而言ISIS 484137表现出最佳的特性组合。
非限制性公开且以引用方式并入
虽然在要求时随附本文件的序列表将每个序列鉴定为“RNA”或“DNA”，但实际上，那些序列可用任何化学修饰组合来修饰。本领域技术人员将容易了解，在某些情况下，这种命名为“RNA”或“DNA”来描述修饰寡核苷酸是任意的。例如，包含含有2’-OH糖部分和胸腺嘧啶碱基的核苷的寡核苷酸可被描述为具有修饰的糖(对于 DNA的天然2’-H为2’-OH)的DNA或具有修饰碱基(对于RNA的天然尿嘧啶为胸腺嘧啶(甲基化尿嘧啶))的RNA。
因此，本文提供的核酸序列(包括但不限于序列表中的那些)意图涵盖含有任何组合的天然或修饰RNA和/或DNA的核酸，包括但不限于具有修饰核碱基的所述核酸。通过进一步举例而非限制的方式，具有核碱基序列“ATCGATCG”的寡核苷酸涵盖具有这种核碱基序列(无论修饰的或未修饰的)的任何寡核苷酸，包括但不限于包含RNA 碱基的此类化合物，诸如具有序列“AUCGAUCG”的那些和具有一些 DNA碱基和一些RNA碱基诸如“AUCGATCG”的那些。
虽然已根据某些实施方案具体描述了本文所述的某些化合物、组合物和方法，但以下实施例仅用以说明本文所述的化合物并且不意图限制所述化合物。本申请中所述的各参考文献以引用的方式整体并入本文。
实施例1：MOE间隔体对HepG2细胞中的人二酰基甘油酰基转移酶2的反义抑制
设计靶向二酰基甘油酰基转移酶2(DGAT2)核酸的反义寡核苷酸并且测试其在体外对DGAT2 mRNA的影响。在具有类似培养条件的一系列实验中测试反义寡核苷酸。每个实验的结果呈现在以下所示的单独表格中。使用脂质转染试剂以120nM反义寡核苷酸转染密度为每孔10,000个细胞的培养的HepG2细胞。在约24小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组RTS2367(正向序列GGCCTCCCGGAGACTGA，在本文中命名为SEQ ID NO：4；反向序列 AAGTGATTTGCAGCTGGTTCCT，在本文中命名为SEQ ID NO：5；探针序列AGGTGAACTGAGCCAGCCTTCGGG，在本文中命名为SEQID NO：6)测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。
来自早期公布的申请WO 2005/019418的ISIS寡核苷酸也包括在此测定中。这些ISIS寡核苷酸是ISIS 217312-217322、ISIS 217324、 ISIS 217325、ISIS 217328、ISIS217333、ISIS 217336-217339、ISIS 217341-217343、ISIS 217346-217348、ISIS 217353-217355、ISIS 334177、ISIS 366710、ISIS 366714、ISIS 366722、ISIS 366728、ISIS366730、ISIS 366741、ISIS 366746、ISIS 369220、ISIS 369221、ISIS 369255、ISIS370727、ISIS 370747、ISIS 370784。
以下表中新设计的嵌合反义寡核苷酸被设计为5-10-5 MOE间隔体。间隔体的长度为20个核苷，其中，中心缺口区段包含十个2’- 脱氧核苷并且在5’方向和3’方向上各自侧接包含五个核苷的翼区段。 5’翼区段中的每个核苷和3’翼区段中的每个核苷具有2’-MOE修饰。每个间隔体整个的核苷间键合为硫代磷酸酯(P＝S)键合。每个间隔体整个的所有胞嘧啶残基为5-甲基胞嘧啶。“起始位点”指示人基因序列中间隔体所靶向的最5’核苷酸。“终止位点”指示人基因序列中间隔体所靶向的最3’核苷酸。下表中所列的每个间隔体靶向在本文中命名为 SEQ ID NO：1的人DGAT2 mRNA(RefSeq No.NM_032564.3)或在本文中命名为SEQ ID NO：2的人DGAT基因组序列(从核苷酸5669186 至5712008截短的RefSeq No.NT_033927.5)。‘n/a’指示反义寡核苷酸不以100％互补性靶向那个特定基因序列。
表1
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表2
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表3
靶向SEQ ID NO：1和2的MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表4
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表5
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表6
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
实施例2：MOE间隔体对HepG2细胞中的人二酰基甘油酰基转移酶2的反义抑制
设计靶向二酰基甘油酰基转移酶2(DGAT2)核酸的反义寡核苷酸并且测试其在体外对DGAT2 mRNA的影响。在具有类似培养条件的一系列实验中测试反义寡核苷酸。每个实验的结果呈现在以下所示的单独表格中。使用脂质转染试剂以120nM反义寡核苷酸转染密度为每孔10,000个细胞的培养的HepG2细胞。在约24小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组RTS2988_MGB(正向序列AACTGGCCCTGCGTCA TG，在本文中命名为SEQ ID NO：7；反向序列CTTGTACACTTCATTCTCTCCAAAGG，在本文中命名为SEQ ID NO：8；探针序列C TGACCTGGTTCCC，在本文中命名为SEQ ID NO：9)测量mRNA 水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。
来自早期公布的申请WO 2005/019418的ISIS寡核苷酸也包括在此测定中。这些ISIS寡核苷酸是ISIS 217316、ISIS 217317、ISIS 217328、ISIS 217329、ISIS 334177、ISIS 334178、ISIS 366730、ISIS 366731和ISIS 369255。如下表所示，与这些基准寡核苷酸中的任一种相比，若干种新设计的反义寡核苷酸展示出相似或更大的效力。
下表中新设计的嵌合反义寡核苷酸被设计为5-10-5 MOE、3-14-3 MOE或2-13-5MOE间隔体。5-10-5 MOE间隔体的长度为20个核苷，其中，中心缺口区段包含十个2’-脱氧核苷并且在5’方向和3’方向上各自侧接包含五个核苷的翼区段。3-14-3MOE间隔体的长度为20个核苷，其中，中心缺口区段包含十四个2’-脱氧核苷并且在5’方向和 3’方向上各自侧接包含三个核苷的翼区段。2-13-5 MOE间隔体的长度为20个核苷，其中，中心缺口区段包含十三个2’-脱氧核苷并且在 5’方向和3’方向上分别侧接包含两和三个核苷的翼区段。5’翼区段中的每个核苷和3’翼区段中的每个核苷具有2’-MOE修饰。每个间隔体整个的核苷间键合为硫代磷酸酯(P＝S)键合。每个间隔体整个的所有胞嘧啶残基为5-甲基胞嘧啶。“起始位点”指示人基因序列中间隔体所靶向的最5’核苷酸。“终止位点”指示人基因序列中间隔体所靶向的最3’核苷酸。下表中所列的每个间隔体靶向在本文中命名为SEQ ID NO： 1的人DGAT2 mRNA(RefSeq No.NM_032564.3)或在本文中命名为 SEQ ID NO：2的人DGAT基因组序列(从核苷酸5669186至5712008 截短的RefSeq No.NT_033927.5)。‘n/a’指示反义寡核苷酸不以100％互补性靶向那个特定基因序列。
表8
靶向SEQ ID NO：1和2的MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表9
靶向SEQ ID NO：1和2的MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表10
靶向SEQ ID NO：1和2的MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
实施例3：MOE间隔体对HepG2细胞中的人DGAT2的反义抑制
设计靶向DGAT2核酸的反义寡核苷酸并且测试其在体外对DG AT2 mRNA的影响。在具有类似培养条件的一系列实验中测试反义寡核苷酸。先前公开的寡核苷酸ISIS 217317、217328、ISIS 366722、 ISIS 366710、ISIS 366714、ISIS 366728、ISIS 366746和ISIS3692 55包括在本研究中作为基准寡核苷酸。每个实验的结果呈现在以下所示的单独表格中。使用电穿孔以4,500nM反义寡核苷酸转染密度为每孔20,000个细胞的培养的HepG2细胞。在约24小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组RTS2988_MGB测量mRNA水平。使用人引物探针组RTS2367(正向序列GGCCTCCCGGAGACTGA，在本文中命名为 SEQ ID NO：4；反向序列AAGTGATTTGCAGCTGGTTCCT，在本文中命名为SEQ ID NO：5；探针序列AGGTGAACTGAGCCAGCC TTCGGG，在本文中命名为SEQID NO：6)测量一些寡核苷酸的效力。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mR NA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。结果显示若干种反义寡核苷酸展示出比基准寡核苷酸更大的效力。
以下表中新设计的嵌合反义寡核苷酸被设计为5-10-5 MOE间隔体。5-10-5 MOE间隔体的长度为20个核苷，其中，中心缺口区段包含十个2’-脱氧核苷并且在5’方向和3’方向上各自侧接包含五个核苷的翼区段。5’翼区段中的每个核苷和3’翼区段中的每个核苷具有2’-MOE修饰。每个间隔体整个的核苷间键合为硫代磷酸酯(P＝S)键合。每个间隔体整个的所有胞嘧啶残基为5-甲基胞嘧啶。“起始位点”指示人基因序列中间隔体所靶向的最5’核苷酸。“终止位点”指示人基因序列中间隔体所靶向的最3’核苷酸。下表中所列的每个间隔体靶向 SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2或两者。‘n/a’指示反义寡核苷酸不以 100％互补性靶向那个特定基因序列。特定的表中未示出靶基因序列的序列比对情况，应理解所述表中呈现的寡核苷酸没有一个以100％互补性比对这个靶基因序列。
表7
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表11
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表12
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表13
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表14
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表15
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
实施例4：MOE间隔体对HepG2细胞中的人DGAT2的反义抑制
设计靶向DGAT2核酸的反义寡核苷酸并且测试其在体外对 DGAT2 mRNA的影响。在具有类似培养条件的一系列实验中测试反义寡核苷酸。在上述研究中一致展示出比先前公开的寡核苷酸中的任一种具有更高效力的ISIS 413433包括在本研究中作为基准寡核苷酸。因此，与ISIS 413433相比展示出相同或更大效力的反义寡核苷酸被考虑用于进一步的实验。
每个实验的结果呈现在以下所示的单独表格中。使用电穿孔以 4,500nM反义寡核苷酸转染密度为每孔20,000个细胞的培养的 HepG2细胞。在约24小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组 RTS2988_MGB测量mRNA水平。使用人引物探针组RTS2367(正向序列GGCCTCCCGGAGACTGA，在本文中命名为SEQID NO：4；反向序列AAGTGATTTGCAGCTGGTTCCT，在本文中命名为SEQ ID NO：5；探针序列AGGTGAACTGAGCCAGCCTTCGGG，在本文中命名为SEQ ID NO：6)测量一些寡核苷酸的效力。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。结果显示若干种反义寡核苷酸展示出比基准寡核苷酸更大的效力。
下表中新设计的嵌合反义寡核苷酸被设计为5-10-5 MOE间隔体或3-10-4MOE间隔体。5-10-5 MOE间隔体的长度为20个核苷，其中，中心缺口区段包含十个2’-脱氧核苷并且在5’方向和3’方向上各自侧接包含五个核苷的翼区段。3-10-4MOE间隔体的长度为17个核苷，其中，中心缺口区段包含十个2’-脱氧核苷并且在5’方向和3’方向上分别侧接包含三和四个核苷的翼区段。5’翼区段中的每个核苷和 3’翼区段中的每个核苷具有2’-MOE修饰。每个间隔体整个的核苷间键合为硫代磷酸酯(P＝S)键合。每个间隔体整个的所有胞嘧啶残基为 5-甲基胞嘧啶。“起始位点”指示人基因序列中间隔体所靶向的最5’核苷酸。“终止位点”指示人基因序列中间隔体所靶向的最3’核苷酸。下表中所列的每个间隔体靶向SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2或两者。‘n/a’指示反义寡核苷酸不以100％互补性靶向那个特定基因序列。特定的表中未示出靶基因的序列比对情况，应理解所述表中呈现的寡核苷酸没有一个以100％互补性比对这个靶基因。
表16
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表17
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表18
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表19
靶向SEQ ID NO：1和2的3-10-4MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表20
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表21
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表22
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表23
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表24
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表25
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表26
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表27
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表28
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表29
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表30
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表31
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表32
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表33
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表34
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表35
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表36
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表37
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表38
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表39
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表40
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表41
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表42
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表43
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表44
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表45
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表46
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表47
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表48
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表49
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表50
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表51
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表52
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表53
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表54
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表55
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表56
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表57
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表58
靶向SEQ ID NO：2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表59
靶向SEQ ID NO：2的3-10-4MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表60
靶向SEQ ID NO：2的3-10-4MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表61
靶向SEQ ID NO：2的3-10-4MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表62
靶向SEQ ID NO：2的3-10-4MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表63
靶向SEQ ID NO：2的3-10-4MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
实施例5：MOE间隔体对HepG2细胞中的人DGAT2的反义抑制
设计靶向二酰基甘油酰基转移酶2(DGAT2)核酸的反义寡核苷酸并且测试其在体外对DGAT2 mRNA的影响。在具有类似培养条件的一系列实验中测试反义寡核苷酸。每个实验的结果呈现在以下所示的单独表格中。使用电穿孔以1,000nM反义寡核苷酸转染密度为每孔20,000个细胞的培养的HepG2细胞。在约24小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组RTS2988_MGB测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。在上述研究中一致展示出比先前公开的寡核苷酸中的任一种具有更高效力的 ISIS 413433包括在本研究中作为基准寡核苷酸。因此，与ISIS 413433相比展示出相同或更大效力的反义寡核苷酸被考虑用于进一步的实验。
以下表中新设计的嵌合反义寡核苷酸被设计为5-10-5 MOE间隔体。间隔体的长度为20个核苷，其中，中心缺口区段包含十个2’- 脱氧核苷并且在5’方向和3’方向上各自侧接包含五个核苷的翼区段。 5’翼区段中的每个核苷和3’翼区段中的每个核苷具有2’-MOE修饰。每个间隔体整个的核苷间键合为硫代磷酸酯(P＝S)键合。每个间隔体整个的所有胞嘧啶残基为5-甲基胞嘧啶。“起始位点”指示人基因序列中间隔体所靶向的最5’核苷酸。“终止位点”指示人基因序列中间隔体所靶向的最3’核苷酸。下表中所列的每个间隔体靶向在本文中命名为 SEQ ID NO：2的人DGAT2基因组序列(从核苷酸5669186至5712008 截短的RefSeq No.NT_033927.5)。‘n/a’指示反义寡核苷酸不以100％互补性靶向那个特定基因序列。特定的表中未示出靶基因的序列比对情况，应理解所述表中呈现的寡核苷酸没有一个以100％互补性比对这个靶基因。
表64
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表65
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
表66
靶向SEQ ID NO：1和2的5-10-5 MOE间隔体对DGAT2 mRNA的抑制
实施例6：MOE间隔体对HepG2细胞中的人DGAT2的剂量依赖性反义抑制
选择来自以上实施例中所述的研究且对DGAT2 mRNA表现出显著的体外抑制的间隔体，并且在HepG2细胞中以各种剂量测试。在具有类似培养条件的一系列实验中测试反义寡核苷酸。来自先前公布的申请WO 2005/019418的先前公开的寡核苷酸ISIS 21316、ISIS217317、ISIS 217328、ISIS 369185、ISIS 366714、ISIS 366730、ISIS 366746和ISIS369241包括在所述测定中。每个实验的结果呈现在以下所示的单独表格中。将细胞以10,000个细胞/孔的密度铺板并且使用脂质转染试剂以下表中规定的6.25nM、12.5nM、25.0nM、50nM、 100nM或200.0nM浓度的反义寡核苷酸进行转染。在约16小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA 水平。使用人引物探针组RTS2367测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。‘0’指示 mRNA水平不受抑制。‘n.d.’指示抑制水平未记录。
也呈现了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度(IC50)。在反义寡核苷酸处理的细胞中，DGAT2 mRNA水平以剂量依赖性方式显著降低。结果还证明若干种新设计的寡核苷酸具有大于先前公开的寡核苷酸的功效。
表67
表68
表69
表70
表71
实施例7：MOE间隔体对HepG2细胞中的人DGAT2的剂量依赖性反义抑制
选择来自以上实施例中所述的研究且对DGAT2 mRNA表现出显著的体外抑制的间隔体，并且在HepG2细胞中以各种剂量测试。在具有类似培养条件的一系列实验中测试反义寡核苷酸。来自早期公布的申请WO 2005/019418的先前公开的寡核苷酸包括在所述测定中。每个实验的结果呈现在以下所示的单独表格中。
研究1
将细胞以10,000个细胞/孔的密度铺板并且使用脂质转染试剂以下表中规定的18.75nM、37.5nM、75.0nM或150.0nM浓度的反义寡核苷酸进行转染。在约16小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组 RTS2988_MGB测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。‘0’指示mRNA水平不受抑制。
也呈现了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度(IC50)。在反义寡核苷酸处理的细胞中，DGAT2 mRNA水平以剂量依赖性方式显著降低。
表72
表73
还使用电穿孔在HepG2细胞中以各种剂量测试相同的间隔体。将细胞以20,000个细胞/孔的密度铺板并且使用电穿孔，以下表中规定的2.5μM、5.0μM、10.0μM以及20.0μM浓度的反义寡核苷酸进行转染。在约16小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时 PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组RTS2988_MGB 测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的 DGAT2的抑制百分比。‘0’指示mRNA水平不受抑制。
也呈现了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度(IC50)。在反义寡核苷酸处理的细胞中，DGAT2 mRNA水平以剂量依赖性方式显著降低。
表74
表75
研究2
将细胞以35,000个细胞/孔的密度铺板并且使用电穿孔，以下表中规定的0.22μM、0.67μM、2.0μM、6.0μM或18.0μM浓度的反义寡核苷酸进行转染。在约16小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组RTS2977_MGB(正向序列ACTGGGCGGGCTTCATATT，在本文中命名为SEQ ID NO：10；反向序列CCCGGAGTAGGCGGCTAT，在本文中命名为SEQ ID NO：11；探针序列AGCCATGAAGACCC，在本文中命名为SEQ ID NO：12)测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。‘0’指示mRNA水平不受抑制。
也呈现了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度(IC50)。在反义寡核苷酸处理的细胞中，DGAT2 mRNA水平以剂量依赖性方式显著降低。
表76
研究3
将细胞以10,000个细胞/孔的密度铺板并且使用脂质转染试剂以下表中规定的12.5nM、25.0nM、50.0nM、100.0nM或200.0nM浓度的反义寡核苷酸进行转染。在约16小时的处理期后，自细胞分离 RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组RTS2988_MGB测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。‘0’指示mRNA水平不受抑制。
也呈现了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度(IC50)。在反义寡核苷酸处理的细胞中，DGAT2 mRNA水平以剂量依赖性方式显著降低。
表77
研究4
将细胞以10,000个细胞/孔的密度铺板并且使用脂质转染试剂以下表中规定的12.5nM、25.0nM、50.0nM、100.0nM或200.0nM浓度的反义寡核苷酸进行转染。在约16小时的处理期后，自细胞分离 RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组RTS2988_MGB测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。‘0’指示mRNA水平不受抑制。
也呈现了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度(IC50)。在反义寡核苷酸处理的细胞中，DGAT2 mRNA水平以剂量依赖性方式显著降低。
表78
研究5
将细胞以20,000个细胞/孔的密度铺板并且使用电穿孔，以下表中规定的12.5μM、25.0μM、50.0μM、100.0μM或200.0μM浓度的反义寡核苷酸进行转染。在约16小时的处理期后，自细胞分离 RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组RTS2988_MGB(正向序列AACTGGCCCTGCGTCATG，在本文中命名为SEQ ID NO：7；反向序列CTTGTACACTTCATTCTCTCC AAAGG，在本文中命名为SEQ ID NO：8；探针序列CTGACCTGGTTCCC，在本文中命名为SEQ ID NO：9)测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。‘0’指示mRNA水平不受抑制。
也呈现了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度(IC50)。在反义寡核苷酸处理的细胞中，DGAT2 mRNA水平以剂量依赖性方式显著降低。
表79
研究6
将细胞以20,000个细胞/孔的密度铺板并且使用电穿孔，以下表中规定的0.625μM、1.25μM、2.5μM、5.0μM、10μM或20μM浓度的反义寡核苷酸进行转染。在约16小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组RTS2988_MGB测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。‘0’指示mRNA水平不受抑制。
也呈现了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度(IC50)。在反义寡核苷酸处理的细胞中，DGAT2 mRNA水平以剂量依赖性方式显著降低。
表80
实施例8：MOE间隔体对HepG2细胞中的人DGAT2的剂量依赖性反义抑制
选择来自以上实施例中所述的研究且对DGAT2 mRNA表现出显著的体外抑制的间隔体，并且在HepG2细胞中以各种剂量测试。在具有类似培养条件的一系列实验中测试反义寡核苷酸。每个实验的结果呈现在以下所示的单独表格中。将细胞以20,000个细胞/孔的密度铺板并且使用电穿孔，以下表中规定的0.625μM、1.25μM、2.50μM、 5.00μM或10.00μM浓度的反义寡核苷酸进行转染。在约16小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA 水平。使用人引物探针组RTS2988_MGB测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。‘0’指示 mRNA水平不受抑制。
也呈现了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度(IC50)。在反义寡核苷酸处理的细胞中，DGAT2 mRNA水平以剂量依赖性方式显著降低。
表81
表82
表83
表84
表85
表86
表87
表88
表89
表90
表91
表92
表93
表94
表95
表96
表97
表98
表99
表100
表101
表102
表103
表104
表105
表106
表107
表108
表109
表110
表111
表112
实施例9：MOE间隔体对HepG2细胞中的人DGAT2的剂量依赖性反义抑制
选择来自以上实施例中所述的研究且对DGAT2 mRNA表现出显著的体外抑制的间隔体，并且在HepG2细胞中以各种剂量测试。在具有类似培养条件的一系列实验中测试反义寡核苷酸。每个实验的结果呈现在以下所示的单独表格中。将细胞以20,000个细胞/孔的密度铺板并且使用电穿孔，以下表中规定的0.3125μM、0.625μM、1.25 μM、2.50μM、5.00μM或10.00μM浓度的反义寡核苷酸进行转染。在约16小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组RTS2988_MGB测量 mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整 DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2 的抑制百分比。‘0’指示mRNA水平不受抑制。
也呈现了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度(IC50)。在反义寡核苷酸处理的细胞中，DGAT2 mRNA水平以剂量依赖性方式显著降低。表113
表114
表115
表116
表117
表118
表119
表120
表121
表122
表123
表124
表125
实施例10：对MOE间隔体对HepG2细胞中的人DGAT2的反义抑制的最终确认
选择来自以上实施例中所述的研究且对DGAT2 mRNA表现出显著的体外抑制的间隔体，并且在HepG2细胞中以各种剂量测试。将细胞以20,000个细胞/孔的密度铺板并且使用电穿孔，以下表中规定的0.3125μM、0.625μM、1.25μM、2.50μM、5.00μM或10.00μM 浓度的反义寡核苷酸进行转染。在约16小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组RTS2988_MGB测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。‘0’指示mRNA水平不受抑制。
也呈现了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度(IC50)。在反义寡核苷酸处理的细胞中，DGAT2 mRNA水平以剂量依赖性方式显著降低。
表126
表127
表128
表129
表130
表131
表132
表133
表134
表135
表136
表137
表138
实施例11：对MOE间隔体对HepG2细胞中的人DGAT2的反义抑制的最终确认
选择来自以上实施例中所述的研究且对DGAT2 mRNA表现出显著的体外抑制的间隔体，并且在HepG2细胞中以各种剂量测试。将细胞以20,000个细胞/孔的密度铺板并且使用电穿孔，以下表中规定的0.625μM、1.25μM、2.50μM、5.00μM或10.00μM浓度的反义寡核苷酸进行转染。在约16小时的处理期后，自细胞分离RNA且通过定量实时PCR测量DGAT2 mRNA水平。使用人引物探针组 RTS2988_MGB测量mRNA水平。根据如由所测量的总RNA含量调整DGAT2 mRNA水平。结果呈现为相对于未处理的对照细胞的DGAT2的抑制百分比。‘0’指示mRNA水平不受抑制。
也呈现了每种寡核苷酸的半数最大抑制浓度(IC50)。在反义寡核苷酸处理的细胞中，DGAT2 mRNA水平以剂量依赖性方式显著降低。
表139
表140
表141
表142
实施例12：在CD1小鼠中靶向人DGAT2的反义寡核苷酸的耐受性
小鼠(Charles River，MA)是经常被用于安全性和功效测试的多用途小鼠模型。将小鼠用选自上述研究的ISIS反义寡核苷酸治疗，并且评价各种血浆化学标志物水平的改变。通过显微镜观察治疗的小鼠的肝脏和肾组织；在任何治疗的动物中没有看到毒性或组织损伤。
治疗
每周两次地向五只雄性CD1小鼠的各组皮下注射100mg/kg(200 mg/kg/周)的ISIS寡核苷酸，持续6周。每周两次地向一个十只雄性 CD1小鼠的组皮下注射PBS，持续6周。最后一次剂量48小时后使小鼠安乐死，并且收获器官和血浆用于进一步分析。
血浆化学标志物
为了评价ISIS寡核苷酸对肝脏和肾功能的影响，在第27天使用自动临床化学分析仪(Hitachi Olympus AU400e，Melville，NY)测量转氨酶、胆红素、白蛋白以及BUN的血浆水平。结果在下表中呈现。引起超出反义寡核苷酸预期范围之外的肝脏或肾功能标志物的水平改变的ISIS寡核苷酸被排除在进一步的研究之外。
表143
CD1小鼠中的血浆化学标志物
体重及器官重量
在第35天测量小鼠的体重并呈现在下表中。在研究结束时(第41 天)测量肝脏、心脏、脾和肾的重量，并且呈现在下表中。引起超出反义寡核苷酸预期范围之外的体重或器官重量的任何改变的ISIS寡核苷酸被排除在进一步的研究之外。‘n/a’指示未在小鼠组中测量特定端点。
表144
CD1小鼠的体重和器官重量(g)
体重 肾 肝脏 脾
PBS 41.2 0.7 2.0 0.1
ISIS 483984 41.0 n/a n/a n/a
ISIS 484129 41.0 0.6 2.1 0.2
ISIS 484157 38.8 n/a n/a n/a
ISIS 495576 41.4 0.6 2.1 0.2
ISIS 495609 42.5 0.6 2.1 0.2
ISIS 495753 40.0 0.5 2.2 0.2
ISIS 495756 42.0 0.7 2.6 0.2
ISIS 501849 42.3 0.6 2.4 0.2
ISIS 501850 41.7 0.7 2.5 0.2
ISIS 501855 39.9 n/a n/a n/a
ISIS 501861 40.3 0.6 2.3 0.2
ISIS 502322 41.1 0.7 2.2 0.2
ISIS 507696 38.9 0.6 2.3 0.2
ISIS 507710 42.7 0.6 2.5 0.2
实施例13：在CD1小鼠中靶向人DGAT2的反义寡核苷酸的耐受性
将小鼠用选自上述研究的ISIS反义寡核苷酸治疗，并且评价各种血浆化学标志物水平的改变。
治疗
每周两次向五只雄性CD1小鼠的各组皮下注射50mg/kg以下化合物，持续6周：ISIS483817、ISIS 483910、ISIS 484085、ISIS 484127、ISIS 484130、ISIS 484137、ISIS484215、ISIS 484231、ISIS 484271、 ISIS 501871、ISIS 502098、ISIS 502119、ISIS502154、ISIS 502163、 ISIS 502164、ISIS 502194、ISIS 525443、ISIS 525474、ISIS525552、 ISIS 525612、ISIS 525688、ISIS 525705、ISIS 525708、ISIS 525711 和ISIS525733。每周两次地向一个十只雄性CD1小鼠的组皮下注射 PBS，持续6周。最后一次剂量48小时后使小鼠安乐死，并且收获器官和血浆用于进一步分析。
血浆化学标志物
为了评价ISIS寡核苷酸对肝脏和肾功能的影响，在第26天使用自动临床化学分析仪(Hitachi Olympus AU400e，Melville，NY)测量转氨酶、胆红素、白蛋白以及BUN的血浆水平。结果在下表中呈现。引起超出反义寡核苷酸预期范围之外的肝脏或肾功能标志物的水平改变的ISIS寡核苷酸被排除在进一步的研究之外。
表145
CD1小鼠中的血浆化学标志物
体重及器官重量
在第36天测量小鼠的体重并呈现在下表中。在研究结束时测量肝脏、脾和肾的重量，并且也呈现在下表中。引起超出反义寡核苷酸预期范围之外的体重或器官重量的任何改变的ISIS寡核苷酸被排除在进一步的研究之外。‘n/a’指示未在小鼠组中测量特定端点。
表146
CD1小鼠的体重和器官重量(g)
实施例14：在Sprague-Dawley大鼠中靶向人DGAT2的反义寡核苷酸的耐受性
Sprague-Dawley大鼠是用于安全性和功效评价的多用途模型。将大鼠用来自上述研究的ISIS反义寡核苷酸治疗，并且评价各种血浆化学标志物水平的改变。
治疗
将雄性Sprague-Dawley大鼠维持在12小时亮/暗循环中并且随意喂食Purina正常大鼠食物饲料5001。每周两次地向4只 Sprague-Dawley大鼠的各组皮下注射50mg/kg以下化合物，持续8 周：ISIS 484129、ISIS 495576、ISIS 495609、ISIS 495753、ISIS 495756、ISIS 501849、ISIS 501850、ISIS 501861、ISIS 502322、ISIS 507696 及ISIS 507710。最后一次剂量48小时后使大鼠安乐死，并且收获器官和血浆用于进一步分析。
肝脏功能
为评价ISIS寡核苷酸对肝功能的影响，在第56天时，使用自动临床化学分析仪(Hitachi Olympus AU400e，Melville，NY)测量转氨酶的血浆水平。测量ALT和AST的血浆水平并且结果呈现于下表中，以IU/L表示。也使用同一临床化学分析仪测量胆红素的血浆水平且结果也呈现于下表中。引起超出反义寡核苷酸预期范围之外的肝脏功能标志物的水平改变的ISIS寡核苷酸被排除在进一步的研究之外。
表147
Sprague-Dawley大鼠中的肝脏功能标志物
肾功能
为评价ISIS寡核苷酸对肾功能的影响，在第56天使用自动临床化学分析仪(Hitachi Olympus AU400e，Melville，NY)测量肌酸酐和总蛋白的尿水平。结果呈现在下表中，以mg/dL表示。
表148
Sprague-Dawley大鼠中的肾功能标志物(mg/dL)
肌酸酐 总蛋白
PBS 146 114
ISIS 495756 63 978
ISIS 501849 82 445
ISIS 501861 67 309
ISIS 501850 52 268
ISIS 502322 84 507
ISIS 495576 108 587
ISIS 495609 38 264
ISIS 495753 73 411
ISIS 484129 66 312
体重及器官重量
在第50天测量大鼠的体重并呈现在下表中。在研究结束时测量肝脏、心脏、脾和肾的重量，并且也呈现在下表中。引起超出反义寡核苷酸预期范围之外的体重或器官重量的任何改变的ISIS寡核苷酸被排除在进一步的研究之外。‘n/a’指示未在小鼠组中测量特定端点。
表149
Sprague-Dawley大鼠的体重和器官重量(g)
实施例15：在Sprague-Dawley大鼠中靶向人DGAT2的反义寡核苷酸的耐受性
将Sprague-Dawley大鼠用来自上述研究的ISIS反义寡核苷酸治疗，并且评价各种血浆化学标志物水平的改变。
治疗
将雄性Sprague-Dawley大鼠维持在12小时亮/暗循环中并且随意喂食Purina正常大鼠食物饲料5001。每周两次地对4只 Sprague-Dawley大鼠的各组皮下注射50mg/kg以下化合物，持续8 周：ISIS 483817、ISIS 483910、ISIS 484085、ISIS 484137、ISIS 484215、ISIS 484231、ISIS 501871、ISIS 502098、ISIS 502163、ISIS 502164、 ISIS 502194、ISIS525443、ISIS 525474、ISIS 525612和ISIS 525708。最后一次剂量48小时后使大鼠安乐死，并且收获器官和血浆用于进一步分析。
肝脏功能
为评价ISIS寡核苷酸对肝功能的影响，在第53天时，使用自动临床化学分析仪(Hitachi Olympus AU400e，Melville，NY)测量转氨酶的血浆水平。测量ALT和AST的血浆水平并且结果呈现于下表中，以IU/L表示。也使用同一临床化学分析仪测量胆红素的血浆水平且结果也呈现于下表中。引起超出反义寡核苷酸预期范围之外的肝脏功能标志物的水平改变的ISIS寡核苷酸被排除在进一步的研究之外。
表150
Sprague-Dawley大鼠中的肝脏功能标志物
肾功能
为评价ISIS寡核苷酸对肾功能的影响，在第53天使用自动临床化学分析仪(Hitachi Olympus AU400e，Melville，NY)测量肌酸酐和总蛋白的血浆水平。结果呈现在下表中，以mg/dL表示。在第53天也使用同一自动化临床化学分析仪测量肌酸酐和总蛋白的尿水平。结果呈现在下表中，以mg/dL表示。
表151
Sprague-Dawley大鼠中血浆中的肾功能标志物(mg/dL)
表152
Sprague-Dawley大鼠中尿中的肾功能标志物(mg/dL)
体重及器官重量
在第49天测量大鼠的体重并呈现在下表中。在研究结束时测量肝脏、心脏、脾和肾的重量，并且也呈现在下表中。引起超出反义寡核苷酸预期范围之外的体重或器官重量的任何改变的ISIS寡核苷酸被排除在进一步的研究之外。‘n/a’指示未在小鼠组中测量特定端点。
表153
Sprague-Dawley大鼠的体重和器官重量(g)
体重 心脏 肾 肝脏 脾
PBS 485 1.6 3.5 14.5 0.9
ISIS 483817 362 1.2 4.2 17.0 2.3
ISIS 483910 358 1.0 3.2 19.0 3.0
ISIS 484085 348 1.1 2.9 15.3 1.6
ISIS 484137 353 1.1 3.0 14.2 1.6
ISIS 484215 391 1.2 3.7 16.6 2.0
ISIS 484231 386 1.1 3.2 16.6 2.5
ISIS 501871 322 1.1 3.5 17.4 1.8
ISIS 502098 315 1.2 2.9 15.8 2.3
ISIS 502163 326 1.0 3.5 14.5 3.4
ISIS 502164 381 1.2 2.8 15.4 2.2
ISIS 502194 439 1.3 3.4 18.6 2.0
ISIS 525443 469 1.5 3.7 22.1 1.7
ISIS 525474 445 1.7 3.8 19.2 2.2
ISIS 525612 427 1.5 3.1 13.1 1.4
ISIS 525708 338 1.0 3.6 15.9 2.3
实施例16：靶向人DGAT2的ISIS反义寡核苷酸在食蟹猴中的作用
将食蟹猴用选自以上研究的ISIS反义寡核苷酸治疗。评价了反义寡核苷酸功效和耐受性。
在进行此研究时，食蟹猴基因组序列在National Center for BiotechnologyInformation(NCBI)数据库中是不可用的；因此，不能确认与食蟹猴基因序列的交叉反应性。取而代之，将食蟹猴中所用的 ISIS反义寡核苷酸的序列与恒河猴序列针对同源性进行比较。预期与恒河猴序列具有同源性的ISIS寡核苷酸也与食蟹猴序列完全交叉反应。所测试的人反义寡核苷酸与恒河猴基因组序列(从核苷酸1232000 至1268000截短的RefSeqNo.NW_001100387.1，在本文中命名为 SEQ ID NO：3)交叉反应。人寡核苷酸与恒河猴序列之间的互补性越高，人寡核苷酸与恒河猴序列交叉反应的可能性越大。相对于SEQ ID NO：3的每个寡核苷酸的起始位点和终止位点呈现在下表中。“起始位点”指示恒河猴基因序列中间隔体所靶向的最5’核苷酸。
表154
与SEQ ID NO：3互补的反义寡核苷酸
治疗
在研究之前，将猴子保持隔离30周的时间段，在此期间，每天观察动物的一般健康状况。猴子是2-4岁并且重量在2至4kg之间。使用适当尺寸的不锈钢给药针头和注射器将ISIS寡核苷酸或PBS分别皮下注射到八组随机分配的雄性食蟹猴(每组5只)的猴子囊内区和外大腿中。使用20mg/kg ISIS寡核苷酸对猴子在第一周每周3次(第 1、3和5天)给药以作为负荷剂量，随后每周两次给药，持续2-13周。向6只食蟹猴的对照组皮下注射0.9％无菌生理盐水，在第一周每周三次(第1、3和5天)，随后每周一次，持续2-13周。
在研究期间，观察猴子的死亡率、临床观察和体重、定性食物消耗、检眼镜检查和心电图检查、临床和解剖病理学的征象。对动物预先安排的安乐死对于分配给终末尸检的动物在第93天进行，并且对于分配给恢复尸检的动物在第182天进行。采集完整的一组组织，处理成切片并用显微镜检查组织病理学。实施例中所述的实验方案得到了实验动物护理和使用委员会(Institutional Animal Care and Use Committee)(IACUC)的批准。
肝靶标减少
靶基因RNA分析
在第93天，从肝脏组织提取RNA用于DGAT2的实时PCR分析，所述实时PCR分析使用引物探针组mkDGAT2(正向序列 CCGCAAGGGCTTTGTGAA，在本文中命名为SEQ ID NO：13；反向序列TTCTCTCCAAAGGAGTACATGGG，在本文中命名为SEQ ID NO：14；探针序列CCTGCGCCATGGAGCCGAC，在本文中命名为 SEQ ID NO：15)测量一些寡核苷酸的效力。结果呈现为相对于PBS对照、相对于管家基因亲环蛋白A归一化的DGAT2 mRNA的抑制百分比。用归一化时获得了类似的结果。如下表中所示，用ISIS反义寡核苷酸的治疗导致与无菌生理盐水对照相比DGAT2 mRNA显著减少。具体地说，用ISIS 484137和ISIS501861的治疗导致DGAT2 mRNA表达显著降低。
还用人引物探针组RTS2977_MGB测量了用选择的寡核苷酸的抑制水平。如下表所呈现，用ISIS寡核苷酸的治疗显著降低DGAT2 水平。具体地说，用ISIS 484137和ISIS501861的治疗导致DGAT2 mRNA表达显著降低。
表155
相对于生理盐水对照食蟹猴肝脏中DGAT2 mRNA的抑制百分比(mkDGAT2引物探针组)
ISIS No RIBOGREEN 亲环蛋白A
484085 20 21
484129 54 52
484137 71 69
495576 70 66
501861 89 88
502194 26 29
525443 49 48
525612 35 43
表156
相对于生理盐水对照食蟹猴肝脏中DGAT2 mRNA的抑制百分比 (RTS2977_MGB引物探针组)
ISIS No RIBOGREEN 亲环蛋白A
501861 82 79
484137 63 58
525443 22 17
次级脂质基因RNA分析
还进行了次级脂质基因DGAT1、ACC1、ACC2、FAS和SCD1 2 的基因表达分析。结果在下表中呈现，表达为相比于PBS对照每个基因的抑制％。如下表所呈现，用ISIS寡核苷酸的治疗显著降低脂肪生成性基因水平。具体地说，用ISIS 484137的治疗导致mRNA表达显著降低。
表157
脂质基因表达％
耐受性研究
体重测量
为了评价ISIS寡核苷酸对动物总体健康的影响，定期测量体重并且将其呈现于下表中。所述结果表明用反义寡核苷酸的治疗对体重的影响在反义寡核苷酸的预期范围内。具体地说，用ISIS 484137的治疗就猴子的体重而言耐受良好。
表158
食蟹猴的体重
肝脏功能
为了评价ISIS寡核苷酸对肝功能的影响，从所有研究组中收集血液样本。给药后48小时，在第93天通过股静脉穿刺收集血液样品。在采血之前，将猴子禁食过夜。将血液收集在没有任何抗凝剂的管中，并在室温下保持至少30min以进行血清分离。然后将管离心获得血清。各种肝脏功能标志物的水平使用Toshiba 200FR NEO化学分析仪 (Toshiba Co.，Japan)来测量。测量ALT和AST的血清水平并且结果呈现于下表中，以IU/L表示。胆红素，一种肝脏功能标志物，类似地加以测量并且结果呈现于下表中，以mg/dL表示。所述结果表明反义寡核苷酸对肝脏功能没有超出反义寡核苷酸预期范围之外的影响。具体地说，用ISIS484137的治疗就猴子的肝脏功能而言耐受良好。
表159
食蟹猴血清中的肝脏功能标志物
肾功能
为了评价ISIS寡核苷酸对肾功能的影响，从所有研究组中收集血液样本。给药后48小时，在第93天通过股静脉穿刺收集血液样品。在采血之前，将猴子禁食过夜。将血液收集在没有任何抗凝剂的管中，并在室温下保持至少30min以进行血清分离。然后将管离心获得血清。使用Toshiba 200FR NEO化学分析仪(Toshiba Co.，Japan)来测量 BUN和肌酸酐的水平。结果呈现在下表中，以mg/dL表示。
血浆化学数据表明大部分ISIS寡核苷酸对肾功能没有超出反义寡核苷酸预期范围之外的任何影响。具体地说，用ISIS 484137的治疗就猴子的肾功能而言耐受良好。
表160
食蟹猴中的BUN和肌酸酐水平(mg/dL)
BUN 肌酸酐
无菌生理盐水 25 0.87
ISIS 484085 26 0.94
ISIS 484129 21 0.81
ISIS 484137 24 0.94
ISIS 495576 22 0.92
ISIS 501861 25 0.90
ISIS 502194 27 0.86
ISIS 525443 26 1.08
ISIS 525612 23 0.98
实施例17：靶向人DGAT2的ISIS 484137在食蟹猴中的作用
用ISIS 484137治疗食蟹猴以在13周给药期接着13周恢复期内评估该反义寡核苷酸的安全性。实施例中所述的实验方案得到了测试机构的实验动物护理和使用委员会(IACUC)的批准。
治疗
猴子是2-4岁并且重量在2.3至3.7kg之间。使用适当尺寸的不锈钢给药针头和注射器将ISIS寡核苷酸或0.9％无菌生理盐水分别皮下注射到五组随机分配的食蟹猴(每组6-10只)的猴子背上的四个划定位点之一中。在第1、3、5和7天向猴子给药，然后每周一次给药，总共13周，剂量水平为4mg/kg、8mg/kg、12mg/kg或40mg/kg ISIS 484137。使用相同的方案向10只食蟹猴的对照组皮下注射0.9％无菌生理盐水。在8mg/kg剂量水平下，在14只动物的第六组(每种性别7只)中评估毒代动力学。在对照中并在12mg/kg和40mg/kg的 ISIS484137剂量水平(每种性别2只)下评估恢复性。
在研究期间，观察猴子的死亡率、临床观察和体重、定性食物消耗、检眼镜检查和心电图检查、临床和解剖病理学的征象。对动物预先安排的安乐死对于分配给终末尸检的动物在第93天进行，并且对于分配给恢复尸检的动物在第182天进行。采集完整的一组组织，处理成切片并用显微镜检查组织病理学。
体重和器官重量测量
为了评价ISIS 484137对动物总体健康的影响，定期测量体重并且将其呈现于下表中。安乐死后测量器官重量。‘n.d.’指示对于该时间点没有数据。所述结果表明用ISIS484137的治疗对体重和器官重量的影响在反义寡核苷酸的预期范围内。具体地说，用ISIS484137的治疗就猴子的体重和器官重量而言耐受良好。
表161
食蟹猴的体重(g)
表162
在第93天食蟹猴的器官重量(g)
血浆稳态
为了评价ISIS 484137产生补体激活的可能性，在第-7天开始治疗前获得一次血浆样品，然后在第1天第一次剂量后在4、8和24小时处，以及最后在第91天最后一次剂量给药前和之后4小时处获得血浆样品以使用ELISA测定补体分裂产物Bb。还在第-7天、第1天(在给药后24小时处)、第91天(给药前和在给药后24小时处) 获得血清样品用于使用自动化临床化学分析仪测量补体C5并且对于恢复动物在121和182天进行。另外，在第1天(给药后4小时)和第91天(给药前、给药后1、4、8和24小时)进行凝血分析，并且使用自动凝血分析仪进行评加。
在40mg/kg剂量水平下，在第1天和第91天给药后4小时处，观察到补体途径激活的适应症为补体Bb的急性短暂增加(超过基线高达7倍)。然后补体Bb在第1天24小时处恢复到基线水平或在第 91天接近基线水平。在研究期间未观察到补体C5的显著变化。在给药后4至8小时观察到相对于对照APTT轻微短暂的延长(高达 29％)，然后在给药后24或48小时减少。用ISIS 484137治疗后观察到的补体Bb和APTT的急性短暂增加是那些常见的经寡核苷酸治疗的猴子的典型。
肝脏功能
为了评价ISIS484137对肝功能的影响，在第44、93、121和182 天从所有研究组收集血液样品以用于测定肝脏转氨酶和肝脏功能。测量ALT和AST的血清水平并且结果呈现于下表中，以IU/L表示。胆红素，一种肝脏功能标志物，类似地加以测量并且结果呈现于下表中，以mg/dL表示。ISIS 484137对肝脏功能没有超出反义寡核苷酸预期范围之外的不良影响。‘n.d.’指示对于该时间点没有数据。结果表明，用ISIS 484137的治就猴子肝脏功能而言耐受良好。
表163
食蟹猴血清中的ALT水平(IU/L)
表164
食蟹猴血清中的AST水平(IU/L)
表165
食蟹猴血清中的总胆红素水平(mg/dL)
肾功能
为了评价ISIS484137对肾功能的影响，在第44、93、121和182 天从所有研究组收集血液样品。结果呈现在下表中，以mg/dL表示。
血清化学数据表明ISIS 484137对肾功能没有超出反义寡核苷酸预期范围之外的任何影响。在猴子的尿样品中发现了类似的结果。因此用ISIS 484137的治疗就猴子的肾功能而言耐受良好。
表166
食蟹猴血清中的白蛋白水平(g/dL)
表167
食蟹猴血清中的BUN水平(mg/dL)
表168
食蟹猴血清中的肌酸酐水平(mg/dL)
血浆毒代动力学
在猴子中进行皮下注射之后，ISIS 484137被迅速吸收到体循环中，其中中值Tmax(达到血浆Cmax的时间)在1至4小时的范围内。在第1天、第7天和第91天，峰值暴露(Cmax)和总暴露(AUC0-48h)是剂量依赖性的。在第1天(单剂量后)与第91天(16次剂量后)之间观察到类似的AUC(曲线下面积)值。这些结果表明在多剂量后没有ISIS 484137的血浆累积。根据单次或多次施用以所有剂量水平进行皮下施用之后的平均清除率值(CL/F0-48h)在31.3至75.8mL/h/kg 的范围内并且似乎随剂量增加而减小。治疗13周后，分布后血浆消除半衰期(t1/2λz)在从9.42天至20.2天的范围内。对ISIS 484137血浆毒代动力学参数的检查揭示没有性别差异。下表呈现出了结果。‘n.d.’意指“未测定的”。
表169
针对ISIS 484137的猴子中的血浆毒代动力学总结
组织毒代动力学
在ISIS 484137剂量增加10倍时，肾皮质和肝脏浓度呈剂量依赖性增加。基于治疗结束时和恢复后的平均组织ISIS 484137浓度，在肾和肝脏中估计的组织半衰期分别为16.4至21.3天和17.8至22.8天，这类似于8mg/kg ISIS 484137后测定的组织半衰期。这些发现也与估计的血浆中终末消除半衰期值相一致。下表呈现出了结果。‘n.d.’意指“未测定的”。
观察到的组织半衰期(大约2-3周)支持罕见的临床给药方案。
表170
针对ISIS 484137的猴子中的组织毒代动力学总结
促炎性作用
炎症标志物水平的变化均未超出反义寡核苷酸的预期范围。因此，用ISIS 484137的治疗不会引起任何不利的炎症并且在猴子中耐受良好。
总之，在高达40mg/kg/周的剂量下用ISIS 484137治疗13周在临床上耐受良好。在研究期间没有死亡，并且在研究期间在临床发现、体重、食物消耗/食欲、检眼镜检查和心电图检查、血液学，尿分析或补体C3水平方面没有与治疗相关的影响。总的来说，研究结果表明，ISIS 484137是针对抑制DGAT2所测试的那些化合物中的最强力且耐受性良好的化合物，并且是用于治疗代谢性疾病诸如NAFLD和 NASH的重要候选物。
实施例18：双盲、安慰剂对照、剂量递增I期研究
在研究中心进行双盲、安慰剂对照、剂量递增I期研究以评估对健康超重自愿者皮下施用的单剂量和多剂量的ISIS484137的安全性、耐受性、药物代谢动力学和药效学。
治疗方案
在本研究中计划招募大约48名受试者：16名受试者在单剂量群组中并且32名受试者在多剂量群组中。受试者是年龄为18-65岁(包括端值)的健康男性或女性，他们已经书面同意并能够遵守所有的研究要求。志愿者的BMI为29.0-38.0kg/m2(包括端值)。任何有临床意义的病史异常的志愿者都被排除在研究之外。ISIS 484137溶液或安慰剂(0.9％无菌生理盐水)由非盲选药剂师或合格代表在使用前不久使用无菌技术制备。对药物身份不知情的研究人员将药物给予受试者。
有4个单剂量群组(群组A-D)，每个群组4名受试者，ISIS 484137：安慰剂随机化为3∶1。每名受试者参与的时长大约为8周，所述8周包括4周的筛选期、单剂量和4周的治疗后评价期。受试者通过皮下施用接受单剂量的ISIS 484137。针对每个群组的反义寡核苷酸剂量呈现在下表中。
表171
ISIS 484137的单剂量群组给药方案
有4个多剂量群组(群组AA-DD)，每个群组8名受试者，ISIS 484137：安慰剂随机化为3∶1。每名受试者参与的时长大约为23周，所述23周包括4周的筛选期、6周的治疗期和13周的治疗后评价期。受试者在第一周期间(第1、3和5天)通过皮下施用接受3次剂量的ISIS484137，随后在接下来的5周(第8、15、22、29和36天) 每周一次地接受一次皮下剂量，共8次剂量。受试者在第37、43、 50、64、78、92、106和127天在研究中心处进行随访。
表172
ISIS 484137的多剂量群组给药方案
在整个研究中定期收集血液和尿样品，以进行安全性、药物代谢动力学和药效学分析。ISIS 484137的安全性和耐受性通过确定不良事件、生命征象、体格检查、ECG发现和临床实验室参数的发生率、严重性和剂量关系来评估。将服用ISIS 484137的受试者的安全性结果与服用安慰剂的受试者的安全性结果进行比较。

Claims (57)

1.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷、具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一核碱基序列的至少8个连续核碱基的核碱基。
2.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷、具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一核碱基序列的至少9个连续核碱基的核碱基。
3.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷、具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一核碱基序列的至少10个连续核碱基的核碱基。
4.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷、具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一核碱基序列的至少11个连续核碱基的核碱基。
5.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷、具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一核碱基序列的至少12个连续核碱基的核碱基。
6.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷、具有包含SEQ ID NO：16-4679中的任一者的核碱基序列的核碱基序列。
7.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸具有由SEQ ID NO：16-4679中的任一者组成的核碱基序列。
8.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷、具有与SEQ ID NO：2的核碱基25636-31076(内含子2)互补的核碱基序列，其中所述修饰寡核苷酸与SEQ ID NO：2至少85％、90％、95％或100％互补。
9.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷、与SEQ ID NO：2的以下核碱基互补：核碱基26711-26802、26778-26797、9930-9949、9953-9973、9959-9978、9961-9981、9970-9992、9975-9994、9984-10003、10040-10059、10043-10063、10045-10064、10046-10065、10049-10068、10054-10073、10160-10179、10209-10229、10212-10231、10214-10235、10217-10236、10218-10238、10327-10346、10389-10413、10490-10511、10522-10548、10530-10549、10531-10551、10533-10553、10645-10669、10651-10670、10653-10673、10655-10674、10656-10675、10657-10676、10658-10680、10662-10681、10663-10684、10666-10685、10667-10684、10670-10689、10702-10721、10727-10747、10729-10748、10730-10750、10733-10755、10737-10756、10742-10761、10763-10782、10814-10835、10817-10836、10818-10837、10940-10964、11008-11027、11074-11097、11123-11150、11158-11182、11168-11187、11170-11190、11171-11197、11199-11218、11200-11220、11209-11228、11318-11342、11413-11432、11559-11578、11594-11618、11707-11731、11872-11891、11920-11939、12247-12266、12285-12304、12549-12573、12671-12695、12806-12826、12839-12863、12890-12909、12927-12961、13098-13117、13212-13231、13239-13258、13441-13461、13921-13945、13962-13996、14177-14201、14194-14218、14239-14258、14385-14404、14457-14522、14504-14527、14537-14556、14648-14697、14715-14790、14715-14739、14735-14764、14746-14765、14749-14774、14756-14779、14765-14789、14771-14790、14807-14831、14852-14871、14882-14901、14953-15015、14997-15065、15041-15107、15041-15092、15083-15107、15178-15197、15214-15243、15219-15243、15248-15276、15255-15276、15292-15311、15318-15338、15321-15342、15353-15372、15368-15392、15514-15533、15573-15665、15573-15597、15729-15753、15804-15828、15814-15833、15876-15900、15876-15896、15933-15962、15933-15954、15991-16010、16046-16073、16082-16124、16237-16256、16288-16314、16288-16478、16308-16329、16428-16478、16510-16529、16808-16855、16808-16828、16811-16855、16898-16921、17007-17031、17038-17057、17207-17229、17269-17298、17273-17294、17328-17357、17420-17444、17450-17471、17530-17559、17328-17559、17960-17989、18078-18097、18155-18176、18155-18198、18177-18200、18225-18305、18306-18327、18309-18330、18312-18330、18312-18332、18315-18344、18329-18355、18379-18398、18417-18446、18430-18451、1818450-18473、18470-18494、18581-18601、18583-18605、18581-18611、18588-18611、18821-18850、18821-18847、18836-18899、18890-18914、18898-18919、19013-19037、19013-19040、19360-19411、19363-19383、19804-19823、19909-19932、19987-20009、20232-20256、20296-20325、20462-20481、20541-20560、20668-20692、20775-20797、20779-20797、20817-20841、20828-20863、20878-20897、20956-20979、21046-21120、21091-21120、21164-21203、21164-21188、21374-21403、21659-21678、21708-21727、21765-21784、21933-21955、22153-22191、22153-22175、22158-22179、22167-22191、22439-22463、22547-22567、22770-22790、22770-22795、22775-22795、22835-22870、22841-22865、22881-22901、22885-22905、22889-22910、23095-23115、23098-23119、23099-23119、23128-23157、23179-23251、23238-23258、23240-23260、23242-23262、23429-23449、23480-23566、23547-23581、23553-23573、23555-23576、23562-23586、23597-23616、23641-23670、24123-24144、24123-24147、24202-24223、24202-24241、24799-25039、24799-24847、25018-2509、25023-25053、25026-25053、25069-25092、25069-25114、25077-25104、25088-25114、25183-25205、25183-25217、25198-25217、25226-25250、25226-25265、25236-25260、25244-25291、25312-25394、25380-25400、25717-25736、25782-25860、25845-25866、25866-25935、25919-25939、25950-25971、25954-25973、25981-26030、26102-26126、26162-26220、26300-26324、26331-26372、26363-26405、26389-26409、26396-26420、26479-26504、26516-26550、26534-26555、26534-26560、26540-26560、26610-26634、26620-26640、26626-26648、26620-26664、26633-26655、26640-26664、26716-26740、26716-26799、26786-26807、26789-26809、26786-26809、26811-26831、26849-26869、26869-26898、26883-26903、26926-26943、27046-27075、27106-27130、27174-27230、27221-27241、27226-27258、27241-27265、27249-27269、27367-27406、27367-27402、27386-27406、27638-27664、27769-27791、27775-27810、27852-27877、28026-28049、28128-28154、28462-28492、28475-28508、28516-28542、28584-28605、28804-28826、29010-29035、29143-29167、29151-29180、29196-29218、29244-29268、29253-29282、29361-29383、29369-29391、29450-29495、29480-29504、29538-29654、29673-29697、29681-29702、29781-29801、29804-29828、29827-29847、29832-29852、29838-29858、29844-29878、30484-30504、30524-30548、30554-30588、30669-30731、30972-30997、30984-31005、31551-31571、31554-31584、31794-31818、31932-31952、31936-31956、31939-31963、31946-31971、32115-32136、32119-32140、32130-32159、32175-32201、32428-32454、32436-32467、32459-32479、32463-32489、32474-32495、32480-32529、32586-32638、32621-32641、32756-32776、32801-32825、32816-32840、33070-33180、33176-33199、33182-33202、33411-33433、33572-33601、33729-33759、33846-33876、33860-33882、33866-33886、34063-34117、34211-34232、34686-34710、34739-34887、34901-34950、35263-35292、35277-35302、35322-35346、35408-35433、35421-35441、35436-35457、35665-35685、36246-36267、36250-36270、36253-36274、36258-36281、36268-36531、36516-36537、36573-36597、36581-36603、36632-36666、36677-36698、36682-36702、36689-36757、36742-36772、36841-36874、36846-36874、36865-37041、37054-37073、37838-37858、39668-39694、39684-39705、39820-39840、39830-39852和40909-40933，其中所述修饰寡核苷酸与SEQ ID NO：2至少85％、90％、95％或100％互补。
10.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷、具有包含与SEQ ID NO：2的以下核碱基的等长部分100％互补的至少8个连续核碱基部分的核碱基序列：核碱基26711-26802、26778-26797、9930-9949、9953-9973、9959-9978、9961-9981、9970-9992、9975-9994、9984-10003、10040-10059、10043-10063、10045-10064、10046-10065、10049-10068、10054-10073、10160-10179、10209-10229、10212-10231、10214-10235、10217-10236、10218-10238、10327-10346、10389-10413、10490-10511、10522-10548、10530-10549、10531-10551、10533-10553、10645-10669、10651-10670、10653-10673、10655-10674、10656-10675、10657-10676、10658-10680、10662-10681、10663-10684、10666-10685、10667-10684、10670-10689、10702-10721、10727-10747、10729-10748、10730-10750、10733-10755、10737-10756、10742-10761、10763-10782、10814-10835、10817-10836、10818-10837、10940-10964、11008-11027、11074-11097、11123-11150、11158-11182、11168-11187、11170-11190、11171-11197、11199-11218、11200-11220、11209-11228、11318-11342、11413-11432、11559-11578、11594-11618、11707-11731、11872-11891、11920-11939、12247-12266、12285-12304、12549-12573、12671-12695、12806-12826、12839-12863、12890-12909、12927-12961、13098-13117、13212-13231、13239-13258、13441-13461、13921-13945、13962-13996、14177-14201、14194-14218、14239-14258、14385-14404、14457-14522、14504-14527、14537-14556、14648-14697、14715-14790、14715-14739、14735-14764、14746-14765、14749-14774、14756-14779、14765-14789、14771-14790、14807-14831、14852-14871、14882-14901、14953-15015、14997-15065、15041-15107、15041-15092、15083-15107、15178-15197、15214-15243、15219-15243、15248-15276、15255-15276、15292-15311、15318-15338、15321-15342、15353-15372、15368-15392、15514-15533、15573-15665、15573-15597、15729-15753、15804-15828、15814-15833、15876-15900、15876-15896、15933-15962、15933-15954、15991-16010、16046-16073、16082-16124、16237-16256、16288-16314、16288-16478、16308-16329、16428-16478、16510-16529、16808-16855、16808-16828、16811-16855、16898-16921、17007-17031、17038-17057、17207-17229、17269-17298、17273-17294、17328-17357、17420-17444、17450-17471、17530-17559、17328-17559、17960-17989、18078-18097、18155-18176、18155-18198、18177-18200、18225-18305、18306-18327、18309-18330、18312-18330、18312-18332、18315-18344、18329-18355、18379-18398、18417-18446、18430-18451、1818450-18473、18470-18494、18581-18601、18583-18605、18581-18611、18588-18611、18821-18850、18821-18847、18836-18899、18890-18914、18898-18919、19013-19037、19013-19040、19360-19411、19363-19383、19804-19823、19909-19932、19987-20009、20232-20256、20296-20325、20462-20481、20541-20560、20668-20692、20775-20797、20779-20797、20817-20841、20828-20863、20878-20897、20956-20979、21046-21120、21091-21120、21164-21203、21164-21188、21374-21403、21659-21678、21708-21727、21765-21784、21933-21955、22153-22191、22153-22175、22158-22179、22167-22191、22439-22463、22547-22567、22770-22790、22770-22795、22775-22795、22835-22870、22841-22865、22881-22901、22885-22905、22889-22910、23095-23115、23098-23119、23099-23119、23128-23157、23179-23251、23238-23258、23240-23260、23242-23262、23429-23449、23480-23566、23547-23581、23553-23573、23555-23576、23562-23586、23597-23616、23641-23670、24123-24144、24123-24147、24202-24223、24202-24241、24799-25039、24799-24847、25018-2509、25023-25053、25026-25053、25069-25092、25069-25114、25077-25104、25088-25114、25183-25205、25183-25217、25198-25217、25226-25250、25226-25265、25236-25260、25244-25291、25312-25394、25380-25400、25717-25736、25782-25860、25845-25866、25866-25935、25919-25939、25950-25971、25954-25973、25981-26030、26102-26126、26162-26220、26300-26324、26331-26372、26363-26405、26389-26409、26396-26420、26479-26504、26516-26550、26534-26555、26534-26560、26540-26560、26610-26634、26620-26640、26626-26648、26620-26664、26633-26655、26640-26664、26716-26740、26716-26799、26786-26807、26789-26809、26786-26809、26811-26831、26849-26869、26869-26898、26883-26903、26926-26943、27046-27075、27106-27130、27174-27230、27221-27241、27226-27258、27241-27265、27249-27269、27367-27406、27367-27402、27386-27406、27638-27664、27769-27791、27775-27810、27852-27877、28026-28049、28128-28154、28462-28492、28475-28508、28516-28542、28584-28605、28804-28826、29010-29035、29143-29167、29151-29180、29196-29218、29244-29268、29253-29282、29361-29383、29369-29391、29450-29495、29480-29504、29538-29654、29673-29697、29681-29702、29781-29801、29804-29828、29827-29847、29832-29852、29838-29858、29844-29878、30484-30504、30524-30548、30554-30588、30669-30731、30972-30997、30984-31005、31551-31571、31554-31584、31794-31818、31932-31952、31936-31956、31939-31963、31946-31971、32115-32136、32119-32140、32130-32159、32175-32201、32428-32454、32436-32467、32459-32479、32463-32489、32474-32495、32480-32529、32586-32638、32621-32641、32756-32776、32801-32825、32816-32840、33070-33180、33176-33199、33182-33202、33411-33433、33572-33601、33729-33759、33846-33876、33860-33882、33866-33886、34063-34117、34211-34232、34686-34710、34739-34887、34901-34950、35263-35292、35277-35302、35322-35346、35408-35433、35421-35441、35436-35457、35665-35685、36246-36267、36250-36270、36253-36274、36258-36281、36268-36531、36516-36537、36573-36597、36581-36603、36632-36666、36677-36698、36682-36702、36689-36757、36742-36772、36841-36874、36846-36874、36865-37041、37054-37073、37838-37858、39668-39694、39684-39705、39820-39840、39830-39852和40909-40933，其中所述修饰寡核苷酸的核碱基序列与SEQ ID NO：2至少85％、90％、95％或100％互补。
11.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸与具有SEQ ID NO：2的核碱基序列的DGAT2A核酸的以下核苷酸互补：核苷酸10040-10059、10044-10063、10045-10064、10054-10073、10210-10229、10214-10234、10217-10236、10490-10509、10492-10511、10522-10541、10530-10549、10531-10550、10532-10551、10533-10552、10535-10554、10536-10555、10645-10664、10650-10669、10655-10674、10656-10675、10657-10676、10659-10678、10660-10679、10661-10680、10663-10682、10664-10683、10665-10684、10666-10685、10667-10686、10670-10689、10727-10746、10730-10749、10731-10750、10732-10752、10734-10753、10735-10754、10737-10756、10816-10835、10818-10837、10819-10840、10940-10961、10944-10963、11074-11094、11127-11149、11131-11178、11170-11190、11172-11193、11175-11196、11178-11197、11199-11219、11201-11221、11203-11222、11559-11578、11599-11618、12285-12304、13442-13461、14462-14522、14504-14523、14505-14527、14648-14669、14651-14670、14658-14682、14666-14686、14673-14697、14741-14765、14750-14774、14757-14777、14759-14779、14769-14789、14772-14792、14773-14793、14807-14901、14993-15015、14999-15020、15248-15273、15321-15342、15573-15665、15881-15952、16830-16852、16900-16921、17450-17470、18155-18176、18173-18193、18310-18331、18323-18344、18379-18436、20300-20321、20837-20857、22439-22463、22771-22792、23242-23262、25033-25092、25075-25104、25246-25291、25782-25860、25900-25934、25950-26030、26165-26185、26169-26219、26300-26372、26520-26550、26629-26650、26721-26799、27050-27075、27236-27256、27382-27402、27775-27799、27782-27809、27853-27877、28026-28048、28128-28152、28468-28488、28476-28500、29010-29031、29143-29164、29245-29265、29548-29589、29827-29847、29838-29858、29844-29873、30483-30503、32431-32450、32432-32452、32446-32468、32455-32475、32459-32479、32462-32487、32591-32639、33179-33199、33412-33433、33729-33749、34211-34231、35436-35457、36251-36272或36354-36428。
12.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷、具有包含与具有SEQ ID NO：2的核碱基序列的DGAT2A核酸的以下核碱基的等长部分互补的至少8个连续核碱基部分的核碱基序列：核碱基10040-10059、10044-10063、10045-10064、10054-10073、10210-10229、10214-10234、10217-10236、10490-10509、10492-10511、10522-10541、10530-10549、10531-10550、10532-10551、10533-10552、10535-10554、10536-10555、10645-10664、10650-10669、10655-10674、10656-10675、10657-10676、10659-10678、10660-10679、10661-10680、10663-10682、10664-10683、10665-10684、10666-10685、10667-10686、10670-10689、10727-10746、10730-10749、10731-10750、10732-10752、10734-10753、10735-10754、10737-10756、10816-10835、10818-10837、10819-10840、10940-10961、10944-10963、11074-11094、11127-11149、11131-11178、11170-11190、11172-11193、11175-11196、11178-11197、11199-11219、11201-11221、11203-11222、11559-11578、11599-11618、12285-12304、13442-13461、14462-14522、14504-14523、14505-14527、14648-14669、14651-14670、14658-14682、14666-14686、14673-14697、14741-14765、14750-14774、14757-14777、14759-14779、14769-14789、14772-14792、14773-14793、14807-14901、14993-15015、14999-15020、15248-15273、15321-15342、15573-15665、15881-15952、16830-16852、16900-16921、17450-17470、18155-18176、18173-18193、18310-18331、18323-18344、18379-18436、20300-20321、20837-20857、22439-22463、22771-22792、23242-23262、25033-25092、25075-25104、25246-25291、25782-25860、25900-25934、25950-26030、26165-26185、26169-26219、26300-26372、26520-26550、26629-26650、26721-26799、27050-27075、27236-27256、27382-27402、27775-27799、27782-27809、27853-27877、28026-28048、28128-28152、28468-28488、28476-28500、29010-29031、29143-29164、29245-29265、29548-29589、29827-29847、29838-29858、29844-29873、30483-30503、32431-32450、32432-32452、32446-32468、32455-32475、32459-32479、32462-32487、32591-32639、33179-33199、33412-33433、33729-33749、34211-34231、35436-35457、36251-36272或36354-36428，其中所述修饰寡核苷酸的核碱基序列与SEQ ID NO：2互补。
13.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷、在SEQ ID NO：2的核苷酸26778-26797、23242-23261、26630-26649、15251-15270、28026-28045、35436-35455、10820-10836、23246-23262内互补。
14.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷并且具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373中的任一者的核碱基序列。
15.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸具有由SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373中的任一者组成的核碱基序列。
16.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为8至80个连接核苷、具有包含SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959、3292、4198和4373中的任一者的核碱基序列，其中所述修饰寡核苷酸包含
由连接脱氧核苷组成的缺口区段；
由连接核苷组成的5’翼区段；以及
由连接核苷组成的3’翼区段；
其中所述缺口区段位于所述5’翼区段与所述3’翼区段之间，并且其中每个翼区段的每个核苷包含修饰糖。
17.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为20个连接核苷、具有由SEQ ID NO：1423、1371、1415、1849、2959和3292中列出的序列中的任一者组成的核碱基序列，其中所述修饰寡核苷酸包含
由十个连接脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中所述缺口区段位于所述5’翼区段与所述3’翼区段之间；其中每个翼区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基糖；其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
18.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸长度为17个连接核苷、具有由SEQ ID NO：4198和4373中列出的序列中的任一者组成的核碱基序列，其中所述修饰寡核苷酸包含
由十个连接脱氧核苷组成的缺口区段；
由三个连接的核苷组成的5’翼区段；以及
由四个连接核苷组成的3’翼段；
其中所述缺口区段位于所述5’翼区段与所述3’翼区段之间；其中每个翼区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基糖；其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
19.如权利要求1-18中任一项所述的化合物，其中所述寡核苷酸与SEQ ID No：1或2至少80％、85％、90％、95％或100％互补。
20.如权利要求1-19中任一项所述的化合物，其中所述修饰寡核苷酸包含至少一个修饰核苷间键合、至少一个修饰糖或至少一个修饰核碱基。
21.如权利要求20所述的化合物，其中所述修饰核苷间键合为硫代磷酸酯核苷间键合。
22.如权利要求20或21所述的化合物，其中所述修饰糖为双环糖。
23.如权利要求22所述的化合物，其中所述双环糖选自由以下各项组成的组：4′-(CH2)-O-2′(LNA)；4′-(CH2)2-O-2′(ENA)和4′-CH(CH3)-O-2′(cEt)。
24.如权利要求20或21所述的化合物，其中所述修饰糖为2’-O-甲氧基乙基。
25.如权利要求20-24中任一项所述的化合物，其中所述修饰核碱基为5-甲基胞嘧啶。
26.如权利要求1-25中任一项所述的化合物，其中所述修饰寡核苷酸包含：
由连接脱氧核苷组成的缺口区段；
由连接核苷组成的5’翼区段；以及
由连接核苷组成的3’翼区段；
其中所述缺口区段紧邻所述5’翼区段和所述3’翼区段定位并且位于所述5’翼区段与所述3’翼区段之间，并且其中每个翼区段的每个核苷包含修饰糖。
27.如权利要求1-26中任一项所述的化合物，其中所述化合物为单链的。
28.如权利要求1-26中任一项所述的化合物，其中所述化合物为双链的。
29.如权利要求1-28中任一项所述的化合物，其中所述化合物包含核糖核苷酸。
30.如权利要求1-28中任一项所述的化合物，其中所述化合物包含脱氧核糖核苷酸。
31.如权利要求1-30中任一项所述的化合物，其中所述修饰寡核苷酸由10至30个连接核苷组成。
32.如权利要求1-30中任一项所述的化合物，其中所述修饰寡核苷酸由12至30个连接核苷组成。
33.如权利要求1-30中任一项所述的化合物，其中所述修饰寡核苷酸由15至30个连接核苷组成。
34.一种包含修饰寡核苷酸的化合物，所述修饰寡核苷酸由20个连接核苷组成、具有由SEQ ID NO：1423中列出的序列组成的核碱基序列，其中所述修饰寡核苷酸包含
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中所述缺口区段位于所述5’翼区段与所述3’翼区段之间；其中每个翼区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基糖；其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
35.一种由修饰寡核苷酸组成的化合物，所述修饰寡核苷酸具有由SEQ ID NO：1423中列出的序列组成的核碱基序列，其中所述修饰寡核苷酸包含
由十个连接2’-脱氧核苷组成的缺口区段；
由五个连接核苷组成的5’翼区段；以及
由五个连接核苷组成的3’翼区段；
其中所述缺口区段位于所述5’翼区段与所述3’翼区段之间；其中每个翼区段的每个核苷包含2’-O-甲氧基乙基糖；其中每个核苷间键合为硫代磷酸酯键合并且其中每个胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶。
36.一种化合物，其包含根据下式的修饰寡核苷酸：Tes Ges mCes mCes Aes Tds TdsTds Ads Ads Tds Gds Ads Gds mCds Tes Tes mCes Aes mCe(SEQ ID NO：1423)；其中，
A＝腺嘌呤，
mC＝5’-甲基胞嘧啶
G＝鸟嘌呤，
T＝胸腺嘧啶，
e＝2’-O-甲氧基乙基修饰核苷，
d＝2’-脱氧核苷，并且
s＝硫代磷酸酯核苷间键合。
37.如前述权利要求中任一项所述的化合物，其还包含缀合基团。
38.如前述权利要求中任一项所述的化合物，其还包含缀合的GalNAc部分。
39.一种根据下式的修饰寡核苷酸或其盐：
40.一种化合物，其由如权利要求1-39所述的化合物中的任一种的药学上可接受的盐组成。
41.如权利要求40所述的化合物，其中所述药学上可接受的盐为钠盐。
42.如权利要求40所述的化合物，其中所述药学上可接受的盐为钾盐。
43.一种组合物，其包含如权利要求1-42中任一项所述的化合物或修饰寡核苷酸或其盐和药学上可接受的载体。
44.一种用于疗法中的组合物，其包含如前述任一项权利要求所述的化合物或修饰寡核苷酸。
45.一种治疗、预防或减轻个体中与DGAT2相关的疾病的方法，其包括向所述个体施用如权利要求1-44中任一项所述的化合物或组合物或其盐，从而治疗、预防或减轻所述疾病。
46.如权利要求45所述的方法，其中所述疾病为NAFLD、NASH、脂肪营养不良或部分脂肪营养不良。
47.根据权利要求45和46中任一项所述的方法，其中施用所述化合物或组合物减少、抑制或改善甘油三酯合成、脂质合成、胰岛素抵抗、胰岛素信号传导、胰岛素敏感性和心血管风险特征。
48.一种抑制细胞中的DGAT2表达的方法，其包括使所述细胞与如权利要求1-44中任一项所述的化合物或组合物接触，从而抑制所述细胞中的DGAT2表达。
49.如权利要求48所述的方法，其中所述细胞在任何个体的肝脏或白色脂肪组织中。
50.如权利要求49所述的方法，其中所述个体患有NAFLD、NASH、脂肪营养不良或部分脂肪营养不良或处于患所述疾病的风险中。
51.一种减少或抑制患有与DGAT2相关的疾病或处于患所述疾病的风险中的个体的肝脏或白色脂肪组织中的甘油三酯合成、脂质合成和胰岛素抵抗的方法，其包括向所述个体施用如权利要求1-44中任一项所述的化合物或组合物，从而减少或抑制所述个体的肝脏或白色脂肪组织中的甘油三酯合成、脂质合成和胰岛素抵抗。
52.如权利要求51所述的方法，其中所述个体患有NAFLD、NASH、脂肪营养不良或部分脂肪营养不良或处于患所述疾病的风险中。
53.如权利要求51或52中任一项所述的方法，其中所述化合物或组合物以肠胃外方式施用至所述个体。
54.如权利要求1-44中任一项所述的化合物或组合物用于治疗、预防或减轻与DGAT2相关的疾病的用途。
55.如权利要求54所述的用途，其中所述疾病为NAFLD、NASH、脂肪营养不良或部分脂肪营养不良。
56.如权利要求1-44中任一项所述的化合物或组合物在制造或制备用于治疗、预防或减轻与DGAT2相关的疾病的药物中的用途。
57.如权利要求56所述的用途，其中所述疾病为NAFLD、NASH、脂肪营养不良或部分脂肪营养不良。
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