CN108299561A - 一种pd-1纳米抗体及其克隆表达方法与应用 - Google Patents
一种pd-1纳米抗体及其克隆表达方法与应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN108299561A CN108299561A CN201810002873.4A CN201810002873A CN108299561A CN 108299561 A CN108299561 A CN 108299561A CN 201810002873 A CN201810002873 A CN 201810002873A CN 108299561 A CN108299561 A CN 108299561A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- nanobody
- seq
- antibody
- well
- add
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 17
- 238000010367 cloning Methods 0.000 title claims abstract description 13
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims abstract description 47
- 108010074708 B7-H1 Antigen Proteins 0.000 claims abstract description 35
- 102000008096 B7-H1 Antigen Human genes 0.000 claims abstract description 33
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 33
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 25
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims abstract description 17
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims abstract description 10
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 claims abstract description 5
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 31
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 18
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 17
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 14
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 14
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 claims description 10
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 claims description 8
- 238000000746 purification Methods 0.000 claims description 8
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 7
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 6
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims description 4
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 claims description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 2
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 claims description 2
- 101710089372 Programmed cell death protein 1 Proteins 0.000 abstract description 182
- 102100040678 Programmed cell death protein 1 Human genes 0.000 abstract description 180
- 230000027455 binding Effects 0.000 abstract description 22
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 20
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 abstract description 8
- 229940076838 Immune checkpoint inhibitor Drugs 0.000 abstract description 3
- 108091008026 Inhibitory immune checkpoint proteins Proteins 0.000 abstract description 3
- 102000037984 Inhibitory immune checkpoint proteins Human genes 0.000 abstract description 3
- 239000012274 immune-checkpoint protein inhibitor Substances 0.000 abstract description 3
- 230000003993 interaction Effects 0.000 abstract description 3
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 abstract description 2
- 229940041181 antineoplastic drug Drugs 0.000 abstract description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 34
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 20
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 16
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 16
- 108010003723 Single-Domain Antibodies Proteins 0.000 description 15
- UQLDLKMNUJERMK-UHFFFAOYSA-L di(octadecanoyloxy)lead Chemical compound [Pb+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O UQLDLKMNUJERMK-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 15
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 14
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 14
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 14
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 14
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 12
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 12
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 11
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 11
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 11
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 10
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 10
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 9
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 description 9
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 9
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 9
- 101100112922 Candida albicans CDR3 gene Proteins 0.000 description 8
- 108010047620 Phytohemagglutinins Proteins 0.000 description 8
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 8
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 8
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 8
- 230000001885 phytohemagglutinin Effects 0.000 description 8
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 7
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 7
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 7
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 6
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 6
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 6
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 6
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 6
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 6
- 235000020183 skimmed milk Nutrition 0.000 description 6
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 5
- 230000005754 cellular signaling Effects 0.000 description 5
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 5
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 5
- 235000013882 gravy Nutrition 0.000 description 5
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 5
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 5
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 5
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 5
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 5
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 5
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 4
- 230000003698 anagen phase Effects 0.000 description 4
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 4
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 4
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 4
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 4
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 4
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 4
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 4
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 4
- AJBVYEYZVYPFCF-CIUDSAMLSA-N Ala-Lys-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O AJBVYEYZVYPFCF-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- PBSOQGZLPFVXPU-YUMQZZPRSA-N Arg-Glu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O PBSOQGZLPFVXPU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- VSMYBNPOHYAXSD-GUBZILKMSA-N Asp-Lys-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VSMYBNPOHYAXSD-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HHWQMFIGMMOVFK-WDSKDSINSA-N Gln-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O HHWQMFIGMMOVFK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 3
- ZFBBMCKQSNJZSN-AUTRQRHGSA-N Gln-Val-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O ZFBBMCKQSNJZSN-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 3
- 108010050006 Gly-Asp-Gly-Arg Proteins 0.000 description 3
- ZLCLYFGMKFCDCN-XPUUQOCRSA-N Gly-Ser-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN)C(O)=O ZLCLYFGMKFCDCN-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 3
- CQMFNTVQVLQRLT-JHEQGTHGSA-N Gly-Thr-Gln Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O CQMFNTVQVLQRLT-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 3
- 101000611936 Homo sapiens Programmed cell death protein 1 Proteins 0.000 description 3
- PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N L-Arginyl-L-glutamin-acetat Natural products NC(=N)NCCCC(N)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WGNOPSQMIQERPK-UHFFFAOYSA-N Leu-Asn-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(=O)N)C(=O)N1CCCC1C(=O)O WGNOPSQMIQERPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ZTLGVASZOIKNIX-DCAQKATOSA-N Leu-Gln-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N ZTLGVASZOIKNIX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N N-L-methionyl-L-tyrosine Natural products CSCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108700030875 Programmed Cell Death 1 Ligand 2 Proteins 0.000 description 3
- YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N Ser-Gly-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- GFDUZZACIWNMPE-KZVJFYERSA-N Thr-Ala-Met Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O GFDUZZACIWNMPE-KZVJFYERSA-N 0.000 description 3
- IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N Thr-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 3
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- SVGAWGVHFIYAEE-JSGCOSHPSA-N Trp-Gly-Gln Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 SVGAWGVHFIYAEE-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 3
- SLOYNOMYOAOUCX-BVSLBCMMSA-N Trp-Phe-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O SLOYNOMYOAOUCX-BVSLBCMMSA-N 0.000 description 3
- ANHVRCNNGJMJNG-BZSNNMDCSA-N Tyr-Tyr-Cys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O ANHVRCNNGJMJNG-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 3
- HTONZBWRYUKUKC-RCWTZXSCSA-N Val-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HTONZBWRYUKUKC-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 3
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 3
- 108010076324 alanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 3
- 108010008355 arginyl-glutamine Proteins 0.000 description 3
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 3
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 3
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 description 3
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 3
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 3
- 108010078144 glutaminyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Natural products NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 3
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 3
- 238000004091 panning Methods 0.000 description 3
- 210000001322 periplasm Anatomy 0.000 description 3
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 3
- 229910021642 ultra pure water Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000012498 ultrapure water Substances 0.000 description 3
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 3
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 3
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KZMAWJRXKGLWGS-UHFFFAOYSA-N 2-chloro-n-[4-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-n-(3-methoxypropyl)acetamide Chemical compound S1C(N(C(=O)CCl)CCCOC)=NC(C=2C=CC(OC)=CC=2)=C1 KZMAWJRXKGLWGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100033400 4F2 cell-surface antigen heavy chain Human genes 0.000 description 2
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 2
- BUDNAJYVCUHLSV-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asp-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BUDNAJYVCUHLSV-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- DVJSJDDYCYSMFR-ZKWXMUAHSA-N Ala-Ile-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(O)=O DVJSJDDYCYSMFR-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- VMVUDJUXJKDGNR-FXQIFTODSA-N Asp-Met-Asn Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N VMVUDJUXJKDGNR-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- 210000003771 C cell Anatomy 0.000 description 2
- 241000282836 Camelus dromedarius Species 0.000 description 2
- 235000019750 Crude protein Nutrition 0.000 description 2
- 102100039498 Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Human genes 0.000 description 2
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- VYOILACOFPPNQH-UMNHJUIQSA-N Gln-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N VYOILACOFPPNQH-UMNHJUIQSA-N 0.000 description 2
- KRRMJKMGWWXWDW-STQMWFEESA-N Gly-Arg-Phe Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KRRMJKMGWWXWDW-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- 101000800023 Homo sapiens 4F2 cell-surface antigen heavy chain Proteins 0.000 description 2
- 101000889276 Homo sapiens Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Proteins 0.000 description 2
- 101000599940 Homo sapiens Interferon gamma Proteins 0.000 description 2
- 101000914514 Homo sapiens T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Proteins 0.000 description 2
- 101000914484 Homo sapiens T-lymphocyte activation antigen CD80 Proteins 0.000 description 2
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 2
- KPJJOZUXFOLGMQ-CIUDSAMLSA-N Lys-Asp-Asn Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N KPJJOZUXFOLGMQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- RMKJOQSYLQQRFN-KKUMJFAQSA-N Lys-Tyr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RMKJOQSYLQQRFN-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- 101100519207 Mus musculus Pdcd1 gene Proteins 0.000 description 2
- 101100407308 Mus musculus Pdcd1lg2 gene Proteins 0.000 description 2
- AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012124 Opti-MEM Substances 0.000 description 2
- 229930040373 Paraformaldehyde Natural products 0.000 description 2
- MGDFPGCFVJFITQ-CIUDSAMLSA-N Pro-Glu-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MGDFPGCFVJFITQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- UIUWGMRJTWHIJZ-ULQDDVLXSA-N Pro-Tyr-Lys Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O UIUWGMRJTWHIJZ-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- 102100024213 Programmed cell death 1 ligand 2 Human genes 0.000 description 2
- KCNSGAMPBPYUAI-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O KCNSGAMPBPYUAI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- VXYQOFXBIXKPCX-BQBZGAKWSA-N Ser-Met-Gly Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N VXYQOFXBIXKPCX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 102100027213 T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Human genes 0.000 description 2
- 102100027222 T-lymphocyte activation antigen CD80 Human genes 0.000 description 2
- UYTYTDMCDBPDSC-URLPEUOOSA-N Thr-Ile-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N UYTYTDMCDBPDSC-URLPEUOOSA-N 0.000 description 2
- HUPLKEHTTQBXSC-YJRXYDGGSA-N Thr-Ser-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 HUPLKEHTTQBXSC-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 2
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 2
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 2
- TZXFLDNBYYGLKA-BZSNNMDCSA-N Tyr-Asp-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 TZXFLDNBYYGLKA-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- XYBNMHRFAUKPAW-IHRRRGAJSA-N Tyr-Ser-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N XYBNMHRFAUKPAW-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 2
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 2
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 238000002648 combination therapy Methods 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 230000034994 death Effects 0.000 description 2
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000017188 evasion or tolerance of host immune response Effects 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 108010084389 glycyltryptophan Proteins 0.000 description 2
- 102000048362 human PDCD1 Human genes 0.000 description 2
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 2
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 2
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 2
- 229920002866 paraformaldehyde Polymers 0.000 description 2
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 2
- 230000035699 permeability Effects 0.000 description 2
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 2
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N puromycin Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C[C@H](N)C(=O)N[C@H]1[C@@H](O)[C@H](N2C3=NC=NC(=C3N=C2)N(C)C)O[C@@H]1CO RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 2
- 238000003998 size exclusion chromatography high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- VSIVTUIKYVGDCX-UHFFFAOYSA-M sodium;4-[2-(2-methoxy-4-nitrophenyl)-3-(4-nitrophenyl)tetrazol-2-ium-5-yl]benzene-1,3-disulfonate Chemical compound [Na+].COC1=CC([N+]([O-])=O)=CC=C1[N+]1=NC(C=2C(=CC(=CC=2)S([O-])(=O)=O)S([O-])(=O)=O)=NN1C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 VSIVTUIKYVGDCX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 2
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MASUWVVNWALEEM-UHFFFAOYSA-M 1-methoxy-5-methylphenazin-5-ium;methyl sulfate Chemical compound COS([O-])(=O)=O.C1=CC=C2N=C3C(OC)=CC=CC3=[N+](C)C2=C1 MASUWVVNWALEEM-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- FWBHETKCLVMNFS-UHFFFAOYSA-N 4',6-Diamino-2-phenylindol Chemical compound C1=CC(C(=N)N)=CC=C1C1=CC2=CC=C(C(N)=N)C=C2N1 FWBHETKCLVMNFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YUOXLJYVSZYPBJ-CIUDSAMLSA-N Asn-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O YUOXLJYVSZYPBJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MKJBPDLENBUHQU-CIUDSAMLSA-N Asn-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MKJBPDLENBUHQU-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- JSHWXQIZOCVWIA-ZKWXMUAHSA-N Asp-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O JSHWXQIZOCVWIA-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- -1 CD8a Proteins 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 108010008165 Etanercept Proteins 0.000 description 1
- VEYGCDYMOXHJLS-GVXVVHGQSA-N Gln-Val-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O VEYGCDYMOXHJLS-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N Gly-Leu-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- WNZOCXUOGVYYBJ-CDMKHQONSA-N Gly-Phe-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)CN)O WNZOCXUOGVYYBJ-CDMKHQONSA-N 0.000 description 1
- SKYULSWNBYAQMG-IHRRRGAJSA-N His-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O SKYULSWNBYAQMG-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- CDGLBYSAZFIIJO-RCOVLWMOSA-N Ile-Gly-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)NCC([O-])=O CDGLBYSAZFIIJO-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- 102000037982 Immune checkpoint proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091008036 Immune checkpoint proteins Proteins 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- XVSJMWYYLHPDKY-DCAQKATOSA-N Leu-Asp-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O XVSJMWYYLHPDKY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- GQZMPWBZQALKJO-UWVGGRQHSA-N Lys-Gly-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GQZMPWBZQALKJO-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 206010061309 Neoplasm progression Diseases 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 239000012270 PD-1 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 239000012668 PD-1-inhibitor Substances 0.000 description 1
- 239000008118 PEG 6000 Substances 0.000 description 1
- OQTDZEJJWWAGJT-KKUMJFAQSA-N Phe-Lys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O OQTDZEJJWWAGJT-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- FGWUALWGCZJQDJ-URLPEUOOSA-N Phe-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O FGWUALWGCZJQDJ-URLPEUOOSA-N 0.000 description 1
- 229920002584 Polyethylene Glycol 6000 Polymers 0.000 description 1
- 108010048233 Procalcitonin Proteins 0.000 description 1
- 102000043850 Programmed Cell Death 1 Ligand 2 Human genes 0.000 description 1
- 102000002727 Protein Tyrosine Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 1
- PIQRHJQWEPWFJG-UWJYBYFXSA-N Ser-Tyr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O PIQRHJQWEPWFJG-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 230000006044 T cell activation Effects 0.000 description 1
- YGZWVPBHYABGLT-KJEVXHAQSA-N Thr-Pro-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 YGZWVPBHYABGLT-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- QSFJHIRIHOJRKS-ULQDDVLXSA-N Tyr-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O QSFJHIRIHOJRKS-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- 108010064997 VPY tripeptide Proteins 0.000 description 1
- QWCZXKIFPWPQHR-JYJNAYRXSA-N Val-Pro-Tyr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 QWCZXKIFPWPQHR-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- 101150063416 add gene Proteins 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 1
- 229940125644 antibody drug Drugs 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 238000004061 bleaching Methods 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000010001 cellular homeostasis Effects 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- MTHSVFCYNBDYFN-UHFFFAOYSA-N diethylene glycol Chemical compound OCCOCCO MTHSVFCYNBDYFN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 238000009509 drug development Methods 0.000 description 1
- 238000002651 drug therapy Methods 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 229940073621 enbrel Drugs 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 1
- 108010063718 gamma-glutamylaspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 238000012637 gene transfection Methods 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 238000001794 hormone therapy Methods 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 230000002998 immunogenetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 1
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 1
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 1
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 229940126619 mouse monoclonal antibody Drugs 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 229960003301 nivolumab Drugs 0.000 description 1
- 230000036963 noncompetitive effect Effects 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 229940121655 pd-1 inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 229960002621 pembrolizumab Drugs 0.000 description 1
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 1
- 108091005981 phosphorylated proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- CWCXERYKLSEGEZ-KDKHKZEGSA-N procalcitonin Chemical compound C([C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)NCC(O)=O)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H]1NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CSSC1)[C@@H](C)O)[C@@H](C)O)[C@@H](C)O)C1=CC=CC=C1 CWCXERYKLSEGEZ-KDKHKZEGSA-N 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 239000012460 protein solution Substances 0.000 description 1
- 239000012521 purified sample Substances 0.000 description 1
- 229950010131 puromycin Drugs 0.000 description 1
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000013341 scale-up Methods 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 230000001568 sexual effect Effects 0.000 description 1
- 238000012807 shake-flask culturing Methods 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 238000004088 simulation Methods 0.000 description 1
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 1
- 229940126585 therapeutic drug Drugs 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000005909 tumor killing Effects 0.000 description 1
- 230000005751 tumor progression Effects 0.000 description 1
- 210000003171 tumor-infiltrating lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/2803—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
- C07K16/2818—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against CD28 or CD152
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
- C07K2317/565—Complementarity determining region [CDR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
- C07K2317/567—Framework region [FR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
- C07K2317/569—Single domain, e.g. dAb, sdAb, VHH, VNAR or nanobody®
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
本发明公开了一种PD‑1纳米抗体及其克隆表达方法与应用。该PD‑1纳米抗体分子量小、特异性强、亲和力高,能抑制PD‑L1与PD‑1分子之间的相互作用,并能特异识别细胞表面天然构象PD‑1,阻断PD‑L1与PD‑1结合从而保持T细胞活性;具有与PD‑1单克隆抗体(IgG全抗体)相同的结合能力;并能逆转活化T细胞被PD‑L1抑制的状态。同时,与PD‑1单克隆抗体相比,经过相同高温处理后本发明纳米抗体的相对活性更高,热稳定性更好,具有开发成为免疫检查点抑制剂的潜力。同时,本发明的纳米抗体克隆表达方法产量较高,获得蛋白纯度可达93%以上,制备方法简单,成本低廉,在制备抗肿瘤药物中具有良好的应用前景。
Description
技术领域
本发明属于生物医药技术领域,特别涉及一种PD-1纳米抗体及其克隆表达方法与应用。
背景技术
肿瘤是全球致死率最高疾病之一,严重威胁人类健康;除手术、放射治疗外,肿瘤的治疗方法还包括:化学疗法、激素疗法、靶向药物疗法和肿瘤免疫疗法。自2013年《科学》杂志将肿瘤免疫疗法列为年度最重要科学突破后,近年来肿瘤免疫疗法愈发备受关注。
靶向阻断免疫检查点肿瘤免疫疗法逐渐成为了肿瘤治疗的关注热点,自2014年,FDA先后批准默沙东的Keytruda和百时美施贵宝的Opdivo用于治疗黑色素瘤以来,靶向程序性死亡分子1(programmed death-1,PD-1,CD279)的抗体在临床上展示了优异、广谱的抗肿瘤活性,使得PD-1抑制剂成为目前肿瘤免疫治疗中最具前景的治疗药物。T细胞被激活后诱导PD-1表达,与其配体PD-L1(programmed cell death 1ligand 1)或PD-L2(programmedcell death 1 ligand 2,PD-L2)结合后,ITSM区的酪氨酸发生磷酸化,蛋白酪氨酸磷酸酶分子被招募,使得下游的效应分子去磷酸化,激活PD-1/PD-Ls信号通路,转导负调节信号,抑制T细胞活化,下调免疫反应。正常情况下,该信号通路在维持T细胞稳态方面起关键性作用。但在肿瘤微环境中,肿瘤侵润淋巴细胞、肿瘤特异性T细胞及一些损伤相关的T细胞表面高表达PD-1分子,肿瘤表面PD-L1与T细胞表面PD-1结合后,传递抑制性信号,使T细胞活性下调,从而抑制机体对肿瘤的免疫反应,导致肿瘤产生免疫逃逸。由于PD-1、PD-L1广泛地参与到肿瘤免疫逃逸,因此,靶向并阻断PD-1/PD-Ls通路可释放T淋巴细胞杀伤肿瘤的活性,从而有效抑制肿瘤进展。
目前上市或获批临床试验的PD-1抗体均是单克隆抗体(monoclonal anbibody,mAb)(图1),单克隆IgG全抗体具有组织渗透性弱、免疫原性较强、成本高等先天不足,此外,靶向PD-1的全抗体半衰期长,有引起机体过度免疫的潜在风险。
1993年,Hamers Casterman等从骆驼血清中分离出天然缺失轻链、仅含有重链的骆驼抗体,命名为重链抗体(heavy-chain antibody,HCAb)。而VHH(variable domain ofheavy chain of heavy-chain antibody)是重链抗体上能特异性结合抗原的结构域,是通过基因工程技术克隆重链抗体的可变区,得到只由一个重链可变区组成的单域抗体。因为VHH晶体直径2.5nm,长4nm,所以VHH也被称为纳米抗体(Nanobody,Nb)。纳米抗体具有高亲和力、高稳定性、高水溶性、高抗原结合性、高表达、强组织渗透性、低免疫原性以及半衰期短的特点,在治疗性抗体药物开发领域具有独特优势,目前尚未有具功能活性的PD-1纳米抗体药物的报道。
发明内容
本发明的首要目的在于克服现有技术的缺点与不足,提供一种新的抗PD-1抗体(纳米抗体)。
本发明的另一目的在于提供所述的PD-1纳米抗体的克隆表达方法。
本发明的又一目的在于提供所述的PD-1纳米抗体的应用。
本发明的目的通过下述技术方案实现:
一种程序性死亡分子1的纳米抗体(PD-1纳米抗体),包含由框架区FR(frameworkregion)和互补决定区CDR(complementarity-determining regions)组成的可变区结构域,所述的可变区结构域包含选自以下的CDR1、CDR2和CDR3:
(1)SEQ ID No.1或SEQ ID No.2所示的CDR1,
(2)SEQ ID No.3所示的CDR2,
(3)SEQ ID No.4或SEQ ID No.5所示的CDR3。
所述的可变区结构域包含选自以下的CDR1、CDR2和CDR3:
(1)SEQ ID No.1所示的CDR1,SEQ ID No.3所示的CDR2和SEQ ID No.4所示的CDR3;
(2)SEQ ID No.2所示的CDR1,SEQ ID No.3所示的CDR2和SEQ ID No.5所示的CDR3。
所述的框架区FR选自下组的FR1、FR2、FR3和FR4:
(1)SEQ ID No.6所示的FR1;
(2)SEQ ID No.7或SEQ ID No.8所示的FR2;
(3)SEQ ID No.9所示的FR3;
(4)SEQ ID No.10所示的FR4。
所述的PD-1纳米抗体的氨基酸序列选自如下任一序列所示:
QVQLQESGGGSVQAGGSLRLSCVASGFTHLRYSMGWFRQVLDKEREGVAAIGGDGRTSYADSVKGRFTIFKDNAKNTLYLDMNSLNPEDTAMYYCAAAVLLDGSFSLLAPLVPYKYDYWGQGTQVTVSS(SEQ ID No.11)或
QVQLQESGGGSVQAGGSLRLSCVASGLTYLRYSMGWFRQVPDKEREGVAAIGGDGRTSYADSVKGRFTIFKDNAKNTLYLDMNSLNPEDTAMYYCAAAVLLDGSFSLLAPLTPYKYDYWGQGTQVTVSS(SEQ ID No.12);
上述的氨基酸序列左侧开始为氨基端,右侧结束为羧基端,其顺序为:无下划线的序列分别是框架区:FR1~FR4;有下划线的是互补决定区,CDR1~CDR3。
所述的PD-1纳米抗体包含与SEQ ID No.11或SEQ ID No.12所示的任一氨基酸序列具有至少90%,优选至少95%,更优选地至少99%序列相同性的氨基酸序列。
如SEQ ID No.11或SEQ ID No.12所示的任一氨基酸序列经过取代、缺失或者添加一个或者几个氨基酸的氨基酸序列。
所述的取代优选为与SEQ ID No.11或SEQ ID No.12所示的任一氨基酸序列相比包含一个或多个氨基酸取代,优选保守氨基酸取代。例如,包含1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个保守氨基酸取代。
编码所述的PD-1纳米抗体氨基酸序列的核苷酸序列,选自如下的(1)、(2)或(3):
(1)如SEQ ID No.13或SEQ ID No.14所示的核苷酸序列;
(2)与SEQ ID No.13或SEQ ID No.14所示的核苷酸序列不同,但是编码如SEQ IDNo.11或SEQ ID No.12所示的氨基酸序列的核苷酸序列;
(3)与(1)或(2)任一项所述的核苷酸序列互补的核苷酸序列。
所述的PD-1纳米抗体,具有下述特征中的至少一个:
(1)阻断PD-1和PD-L1结合;
(2)逆转PD-L1引起的T细胞失活状态;
(3)抑制肿瘤生长。
一种核酸分子,编码所述的PD-1纳米抗体。
一种重组表达载体,含有编码所述的PD-1纳米抗体氨基酸序列的核苷酸序列的重组表达载体。
所述的表达载体为噬菌粒载体或者能编码所述PD-1纳米抗体氨基酸序列的其他细菌表达载体,以及酵母表达载体、真核细胞表达载体。
所述的噬菌粒载体优选为噬菌粒pMECS。
一种宿主细胞,其转化了所述的重组表达载体或者基因组上整合了所述的编码所述的PD-1纳米抗体的核苷酸序列的宿主细胞及其后代细胞。
所述的宿主细胞及其后代细胞指细菌细胞、真菌细胞、动物细胞或者植物细胞及这些宿主细胞的后代。
所述的宿主细胞优选为大肠杆菌;进一步优选为E.coli WK6。
所述的PD-1纳米抗体的克隆表达方法,包括如下步骤:
将编码所述的PD-1纳米抗体的核苷酸序列克隆入表达载体中,构建重组表达载体;再将所述的重组表达载体转入表达系统中进行表达;对目的蛋白进行分步纯化,最后得到所述的PD-1纳米抗体。
所述的PD-1纳米抗体在制备预防和/或治疗癌症药物中的应用。
所述的预防和/或治疗癌症药物优选为免疫检查点抑制剂药物。
所述的药物可为药物组合物,包括药学上可接受的载体。
所述的药物也可以在联合治疗中施用,即与其他药剂联用。例如,联合治疗可以包括本发明的PD-1纳米抗体联合至少一种其他的抗肿瘤药物。
本发明相对于现有技术具有如下的优点及效果:
1.本发明的PD-1纳米抗体分子量小(约18kDa)、特异性强、亲和力高,能抑制PD-L1与PD-1分子之间的相互作用,并且能特异识别细胞表面天然构象PD-1,阻断PD-L1与PD-1结合从而保持T细胞活性;具有与PD-1mAb相同的结合能力。在体外PBMC活化模型中,本发明的PD-1纳米抗体能够逆转活化T细胞被PD-L1抑制的状态,上调IFN-γ的表达。
2.与PD-1单克隆抗体(本发明选择商业化鼠抗PD-1单克隆抗体作为对照)相比,本发明的纳米抗体(简写为NbPD-1,如SEQ ID No.11或SEQ ID No.12所示的Nb2和Nb3)的特异性与之相当,并且经过相同高温处理后本发明的纳米抗体的相对活性更高,热稳定性更好;具有开发成为免疫检查点抑制剂的潜力,为后续肿瘤治疗候选药物提供了物质材料。
3.本发明的PD-1纳米抗体克隆表达方法,经试管或摇瓶培养后,产量可达3.6mg/L~4.5mg/L,蛋白纯度超过93%,制备方法简单,成本低廉,未来可进一步优化培养条件并放大,以获得更高产量。
4.本发明成功构建了编码人PD-1胞外段(PD-1ECD)重组蛋白的真核表达质粒,通过表达纯化,获得纯度大于90%、具有功能活性的PD-1ECD重组蛋白,并以此为抗原,从大容量天然噬菌体纳米抗体库中筛选出两株分子量小、特异性强、亲和力高、热稳定性好的纳米抗体Nb2和Nb3。
附图说明
图1是现有技术中PD-1抗体研究现状的概况图。
图2是PD-1纳米抗体Nb2和Nb3的亲和力测定曲线图。
图3是PD-1纳米抗体Nb2和Nb3与市售PD-1单克隆抗体的热稳定性分析图;其中,A:25℃处理;B:37℃处理;C:60℃处理;D:90℃处理。
图4是PD-1纳米抗体Nb2和Nb3与PD-1mAb的竞争结合实验的结果分析图;Control为阴性对照。
图5是PD-1纳米抗体Nb2和Nb3与PD-L1的竞争结合实验的结果分析图;Control为阴性对照。
图6是PD-1纳米抗体Nb2和Nb3与HEK 293T/PD-1细胞膜表面PD-1分子结合情况分析图;其中,A:PD-1mAb组;B:Nb 2组;C:Nb 3组;D:为PD-1mAb组、Nb 2组和Nb 3组的样品峰形数据叠加处理综合比较。
图7是PD-1纳米抗体Nb2和Nb3对PD-L1抑制T细胞活性的阻断效果分析图。
具体实施方式
下面结合实施例及附图对本发明作进一步详细的描述,但本发明的实施方式不限于此。
实施例中相关试剂的配制:
1.RPMI 1640/FBS培养基:89mL RPMI 1640Medium,10mL FBS,1mL双抗,1μg HumanIL-2,充分混匀,4℃保存备用,一周有效期。
2.DMEM/FBS培养基:445mL DMEM,50mL FBS,5mL双抗,充分混匀,4℃保存备用。
3.WST-8溶液:1.8mg 1-methoxy PMS,0.1158g WST-8,0.351g NaCl,充分溶解于40mL超纯水中,0.45μm滤膜过滤,分装,-20℃避光保存备用。
4.PEG/NaCl溶液:PEG6000 200g,NaCl 146.1g,超纯水充分溶解,定容至1L,121℃灭菌20min,4℃保存备用。
5.TES溶液:0.146g EDTA(终浓度0.5mM),171.15g蔗糖(终浓度0.5M),Tris-HCl(0.2M,pH 8.0)充分溶解,定容至1L,0.22μm滤膜除菌,4℃保存备用。
实施例1人PD-1胞外段蛋白在真核细胞中的表达、纯化与鉴定
根据PD-1胞外段(PD-1ECD)基因序列(NCBI Gene ID:5133)并参考pCMV(购自上海碧云天生物技术有限公司)多克隆位点信息,设计合适的引物并加入Nhe I、BamH I酶切位点,以及6XHis标签,以pEZ-M02-PD-1(购自广州复能基因有限公司)作为模板,使用TaKaRa的PrimerSTAR HS DNA Polymerase进行PCR反应,PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳检验,在500bp上方有一清晰地扩增条带,与预期大小546bp相符。使用Fermentas公司的FastDigestNhe I和BamH I对pCMV载体和扩增出的PD-1ECD基因进行双酶切,插入pCMV质粒,构建编码PD-1ECD重组蛋白的真核表达载体pCMV-PD-1ECD。通过转染技术将pCMV-PD-1ECD导入HEK293F细胞(购自Thermo Fisher,USA)瞬时表达PD-1ECD重组蛋白,粗蛋白经过Ni-NTA亲和层析柱(购自GE Healthcare,USA)纯化、浓缩后得到PD-1ECD重组蛋白。通过SEC-HPLC和ELISA检测鉴定PD-1ECD重组蛋白纯度大于90%,且与鼠PD-1mAb、PD-L1有结合活性,可作为抗原蛋白用于后续筛选纳米抗体工作。
实施例2PD-1纳米抗体筛选
1.VCSM13辅助噬菌体制备及滴度测定
取不同稀释度的VCSM13(购自Agilent Technologies)加入新扩增的E.coli TG1(购自中国质粒载体菌种细胞基因保藏中心)菌液中,室温孵育15min。混合物各添加3mL液化(低于50℃)的LB top agar,混匀后倒入LB平板,37℃过夜培养,计算噬菌斑数并以获得单个噬菌斑。挑取单个噬菌斑至5mL新扩增的E.coli TG1菌液,37℃振荡培养3h后,转移培养物至100mL 2YT液体培养基中(含卡那霉素70μg/mL),37℃振荡培养过夜。离心收集培养上清,70℃水浴后离心取上清,加入7%DMSO,-20℃或-80℃保存。
2.大容量天然噬菌体纳米抗体文库扩增
取100μL大容量天然噬菌体纳米抗体文库(所用噬菌粒为pMECS,该纳米抗体文库已公开于Yan J,Wang P,Zhu M,Li G, E,Xiong S,Wan Y.Characterization andapplications of Nanobodies against human procalcitonin selected from a novel Nanobody phage display library.J Nanobiotechnology.2015May 6;13(1):33,可参见“ VHH library construction”章节)加入2mL新扩增的E.Coli TG1菌液,37℃静置后,加8mL 2×YT/Amp-Glu液体培养基,37℃振荡培养30min后,再加入1mL辅助噬菌体VCSM13摇匀,室温静置30min。低速室温离心,沉淀用适量2×YT/Amp-Kan液体培养基重悬,37℃振荡培养过夜。次日,回收培养液,PEG沉淀噬菌体,1×PBS重悬后经0.22μm滤器过滤,新鲜制备得到的噬菌体库制备液用于后续的淘洗实验。
3.大容量天然噬菌体纳米抗体文库淘洗
采用噬菌体展示技术筛选天然噬菌体库中(6.68×1011CFU/Total)与PD-1胞外段特异性结合的噬菌体。
用100mM NaHCO3稀释PD-1ECD抗原(即实施例1制得的PD-1ECD重组蛋白,下同)至合适浓度,加入96孔酶标板内,包被4~6孔,于4℃过夜。次日以0.05%PBST洗板1次,2%脱脂牛奶室温封闭2h后,PBST洗板2次。取适量步骤2得到的噬菌体文库制备液,用PBS稀释噬菌体浓度至1×1012phage/mL,得到噬菌体文库稀释液。每孔加入100μL噬菌体文库稀释液,室温孵育1h后吸去噬菌体文库稀释液,PBST洗板5~20次(每轮淘洗按上轮淘洗结果调整洗板次数)。加入新鲜配制的100mM三乙胺溶液,室温静置10min后吸出洗脱液,加入1M Tris-HCl中和,获得结合于固相的噬菌体抗体。取600μL噬菌体抗体加入2mL新扩增的E.Coli TG1菌液混匀,37℃静置,得到感染后菌液,取出适量测定CFU,感染后菌液中加入8mL 2×YT/Amp-Glu培养基,37℃振荡培养后加入1mL辅助噬菌体VCSM13摇匀,室温静置30min。800×g离心10min,适量2×YT/Amp-Kan培养基重悬沉淀,37℃振荡培养过夜。第三天,回收培养液,PEG沉淀噬菌体,1×PBS重悬后经0.22μm滤器过滤,用于后续的淘洗实验。最后一轮淘洗,4℃保存计算文库大小的平板(30<单克隆<300)或其上一稀释度平板备用。
4.PD-1胞外段噬菌体纳米抗体文库富集验证(噬菌体ELISA法)
PD-1ECD以100ng/孔包被酶标板过夜,以100mM NaHCO3作为阴性对照,次日洗板1次,2%脱脂牛奶室温封闭2h后,PBST洗板2次。每轮淘洗制备的噬菌体库溶液用1×PBS稀释至2×1011phage/mL,与2%脱脂牛奶1:1混合,即为每轮的混合液。每轮的混合液以100μL/孔加入抗原孔及其对应无抗原孔,室温孵育1h。吸出混合液,弃入漂白液中,用PBST洗板5次后加入Anti-M13 Bacteriophage antibody(HRP)(购自北京义翘神州生物科技公司)进行反应,室温静置1h。吸出抗体稀释液,洗板后加入TMB显色,硫酸终止,酶标仪测定OD 450nm。以OD450nm(抗原孔-无抗原孔)作图,能看到每轮淘洗后吸光值逐渐加强,即针对抗原的噬菌体纳米抗体得到富集。结果显示,三轮淘洗后特异性结合PD-1ECD的噬菌体明显富集。
5.PD-1胞外段噬菌体纳米抗体文库筛选
96孔深孔板,每孔加入1mL TB/Amp培养基;每孔随机挑选加入步骤3中最后一轮保存平板上的一个单克隆。备LB/Amp-Glu平板,每个克隆对应一个区域,37℃过夜培养,4℃保存。接种后的96孔深孔板37℃振荡培养3h,加入IPTG(终浓度1mM),28℃振荡培养过夜,同时包被两块96孔板,同一酶标板上抗原孔与无抗原孔各半,4℃过夜。次日,0.05%PBST洗板1次,用2%脱脂牛奶室温封闭2h。96孔深孔板离心弃上清,TES重悬后,4℃振荡2h,再每孔加入300μL TES/4,4℃振荡2h,离心取上清。96孔板吸去封闭液,用0.05%PBST洗板2次。深孔板上清加入包被PD-1ECD抗原的96孔板,100μL/孔,同时对应的无抗原孔也加入100μL/孔,室温孵育1h。吸出孵育液,PBST洗板,加入Anti-6X His tag antibody(HRP)(购自Abmart)进行反应,室温孵育1h;吸出抗体稀释液,洗板后加入TMB显色,酶标仪测定OD 450nm。吸光值大于1,且高于同一周质提取液无抗原孔两倍以上,认定为阳性克隆;经过ELISA初步鉴定,共获得22个可能的阳性抗体克隆。阳性克隆在平板上对应区域菌体的接入5mL LB/Amp培养基中,37℃振荡培养至合适浓度。参照试剂盒说明,小量质粒抽提法制备pMECS-NbPD-1质粒,送检测序。
将22个阳性抗体克隆进行测序后得到的DNA序列,用Bioedit软件翻译获得氨基酸序列。根据国际免疫遗传学信息系统(IMGT)对蛋白序列的框架区(framework region,FR)和抗体识别区域(complementarity-determining regions,CDR)进行区分,把CDR1、CDR2、CDR3序列均相同的克隆视为同一抗体株,CDR序列不同的克隆视为不同抗体株,最终共得到6个阳性抗体克隆(编号为Nb1~6),它们的CDR区氨基酸序列存在差异,其中2株纳米抗体的氨基酸序列特征见表1。
表1抗PD-1胞外段纳米抗体的一级结构序列特征
实施例3PD-1纳米抗体的表达纯化
1.E.coli WK6电转感受态制备
取-80℃保存的E.coli WK6(购自中国质粒载体菌种细胞基因保藏中心)种子液接种扩增后,按1%(v/v)的比例接种至250mL LB培养基中,37℃振荡培养至菌液OD600=0.35~0.4,冰浴30min。4℃离心,沉淀加入无菌超纯水重悬,重复离心一次,加入20mL冷10%无菌甘油溶液重悬菌体沉淀。4℃离心后,小心吸出上清,1mL冷10%无菌甘油溶液重悬菌体沉淀,分装到预冷的灭菌1.5mL EP管中,-80℃保存备用。
2.pMECS-Nb PD-1电转化
电转杯冰上预冷,取出步骤1制得的WK6感受态细胞,于冰上融化10min。取100ngpMECS-Nb PD-1质粒储备液(即实施例1“5.PD-1胞外段噬菌体纳米抗体文库筛选”中得到的pMECS-NbPD-1质粒),加入WK6感受态菌液中混匀,按照电转仪推荐的参数电转后,立即加入1mL SOC培养基混匀,吸出混合物,置于37℃振荡培养20min,加入1μL Amp储备液,继续培养20min。取适量菌液涂布于LB/Amp琼脂平板表面,37℃培养12h~16h,检测转染效率。次日,挑单克隆扩增冻存菌种。
3.PD-1纳米抗体WK6表达
将冻存的菌种接种到10mL LB-Amp培养基,于37℃振荡培养7h,作为细菌种子液。将细菌种子液按1%(v/v)的比例接种至TB/Amp-Glu-Mg摇瓶培养基中,37℃,振荡培养至合适密度后,加入IPTG(终浓度1mM),28℃,200rpm培养过夜。次日,离心弃上清,用1×PBS洗涤菌体两遍后,菌体沉淀-20℃保存。
4.渗透压冲击法提取菌体周质空间总蛋白
步骤3得到的菌体室温解冻30min,TES重悬,4℃,200rpm振荡1~6h。再加入两倍TES体积的TES/4,继续4℃,200rpm振荡2h或过夜。11,300×g,4℃离心30min,取上清。加入0.2M MgCl2溶液,至终浓度为1mM,得到菌体周质空间总蛋白。
5.PD-1纳米抗体纯化
Ni SepharoseTM excel(购自GE Healthcare)装柱,柱子规格为1.6×20cm,柱床体积为5mL。用1×PBS(pH 7.4)平衡Ni-NTA亲和层析柱后,1mL/min上样(步骤4得到的菌体周质空间总蛋白)。1×PBS(pH 7.4)复平衡后,用20mM咪唑洗脱蛋白,收集洗脱峰(PD-1纳米抗体)。通过15%SDS-PAGE蛋白电泳检测PD-1纳米抗体的分子量大小及纯度:SDS-PAGE电泳结果显示在18kDa附近出现明显条带,与预期相符;Western Blot的检验结果证明18kDa附近出现的条带能与anti-His mAb结合,NbPD-1具有His标签,证明NbPD-1被成功表达;说明收集的溶液中有目标蛋白的富集。SDS-PAGE电泳结果中6株NbPD-1纯化后样品泳道条带较单一,说明NbPD-1纯度较高;Western Blot的检验结果中穿透峰样品均无出现条带,纯化平衡过程中无目的蛋白被洗脱下来;说明纯化效果较好。
6.PD-1纳米抗体浓缩
以Millipore的Amicon-Ultra-15超滤管(MWCO 3kDa),1×PBS(PH7.4)作为洗涤缓冲液,4℃,4 000rpm离心超滤,去除咪唑并浓缩至需要体积,0.22μm除菌后保存。
BCA法测定抗体蛋白浓度,SDS-PAGE和Western Blot验证纳米抗体表达,SEC-HPLC检测纳米抗体纯度。
2株NbPD-1工程菌产量及获得蛋白纯度如表2所示。
表2 NbPD-1蛋白产量及纯度
由表2数据可知,2株NbPD-1工程菌产量超过3.6mg/L,纯度在93~97%之间。
7.NbPD-1理化性质预测
通过利用生物信息学网站ExPASy对纳米蛋白序列进行分子量、理论等电点(PI)和总平均亲水性(GRAVY)分析,其结果见表3所示。
表3 Nb PD-1ECD理化参数分析
由表3数据可知,NbPD-1分子量均约为18.3kDa,说明所表达的这2株NbPD-1均为小分子量蛋白,符合纳米抗体分子量小的特点。理论等电点(PI),NbPD-1理论等电点在PI为6.3左右。总平均亲水性(GRAVY)是指蛋白中所有氨基酸亲水值的平均值,通过对每个氨基酸进行记分而获得,亲水性最强的蛋白GRAVY为-4.5,疏水性最强的蛋白GRAVY为4.5。从疏水特性来看,当GRAVY为负值时判定为亲水性蛋白。由此可知6株NbPD-1均为亲水性蛋白质。
实施例4NbPD-1的理化性质
1.ELISA法检测NbPD-1特异性
本实施例中使用的CTLA4、CD4、CD8a、CD28和CD80均购自北京义翘神州生物科技公司。
本实施例中所涉及的PD-L1按如下方法制备得到:根据PD-L1基因序列(Gene ID:29126),并参考pCMV(上海碧云天生物技术有限公司)多克隆位点信息,设计引物并引入NheI/Xba I酶切位点,同时加入6XHis标签。以pReceiver-M02-PD-L1(购自复能基因)作为模板,使用TaKaRa的PrimerSTAR HS DNA Polymerase进行PCR反应,PCR产物1%琼脂糖凝胶电泳检验。使用Fermentas公司的FastDigest Nhe I和Xba I对pCMV载体和扩增出的PD-L1基因进行双酶切,插入pCMV质粒,构建编码PD-L1重组蛋白的真核表达载体pCMV-PD-L1。通过转染技术将pCMV-PD-L1导入HEK 293F细胞(ThermoFisher,USA)瞬时表达PD-L1重组蛋白,粗蛋白经过Ni-NTA亲和层析柱纯化、浓缩后得到PD-L1重组蛋白。
使用包被液将实施例1得到的PD-1ECD重组蛋白、PD-L1、Enbrel(无关蛋白对照,购自Pfizer,USA)、CTLA4、CD4、CD8a、CD28和CD80分别配制成终浓度为1μg/mL溶液,以100μL/孔加入96孔酶标板内,于4℃包被过夜。次日,0.05%PBST洗板2次,5%脱脂牛奶37℃封闭2h。洗板2次后分别将浓度为600ng/mL的阳性对照PD-1mAb(Mouse anti-PD-1antibody,购自abcam)、空白对照PBS以及实施例2制得的PD-1纳米抗体(Nb2、Nb3)加入到96孔板内,100μL/孔,37℃孵育1h。洗板3次后加入一抗(Mouse anti-HA tag antibody,购自Abmart)进行反应,37℃孵育1h。洗板3次后加入二抗(Goat anti-mouse IgG mAb,购自Cell SignalingTechnology),37℃孵育1h。洗板5次后加入TMB显色,硫酸终止,酶标仪测定OD 450nm和OD630nm。
吸光值直观反映NbPD-1与PD-1的结合能力。NbPD-1和PD-1结合的吸光值与它们和对照抗原结合最高的吸光值相比,比值大于3的,定义该纳米抗体为阳性纳米抗体。结果显示,纳米抗体Nb 2和Nb 3与PD-1特异性结合能力较强,和其他7个对照抗原的结合能力较弱。
2.NbPD-1亲和常数测定
采用非竞争酶免疫法测定PD-1纳米抗体的亲和常数。
分别配制浓度为2μg/mL、1μg/mL、0.5μg/mL、0.25μg/mL的4种不同浓度的PD-1ECD的抗原溶液,以100μL/孔加入96孔酶标板内,于4℃包被过夜。次日洗板并封闭。将制备得到的PD-1纳米抗体度调节为1*10-6mol/L(Nb2:18.398ug/mL,Nb3:18.37669ug/mL)水平,3倍倍比稀释,空白对照为PBS,洗板2次后将样品加入到96孔酶标板内,100μL/孔,37℃孵育1h。洗板3次后加入一抗(Mouse anti-HA tag antibody,购自Abmart)进行反应,37℃孵育1h。洗板3次后加入二抗(Goat anti-mouse IgG mAb,购自Cell Signaling Technology),37℃孵育1h。洗板5次后加入TMB显色10min,加入2.29%硫酸终止,酶标仪测定OD 450nm和OD 630nm。拟合“S”型曲线,得出4个半数吸光值所对应的NbPD-1浓度(EC50),结果如图2所示。
纳米抗体为单价抗体,按公式KA=(n-1)/(nAb'-Ab)计算亲和常数(式中Ab和Ab'分别表示当抗原浓度为Ag和Ag'时,产生半数吸光值的抗体浓度(mol/L),n=Ag/Ag'),得6个KA值,计算平均值及标准差。结果如表4所示,可知,Nb 2和Nb 3亲和常数分别为(2.28±1.38)和(4.57±1.64)×107L/mol。
表4 NbPD-1亲和力测定曲线模拟后求解得KA值
3.NbPD-1热稳定性
配制成终浓度为0.5μg/mL PD-1的包被液,以100μL/孔加入96孔酶标板内,于4℃包被过夜。次日,0.05%PBST洗板2次,5%BSA 37℃封闭2h。封闭期间处理样品:将浓度为500ng/mL的阳性对照PD-1mAb和NbPD-1分别置于25℃,37℃,60℃,90℃四种不同温度的下各0min、10min、30min、60min、120min以及180min。随后立即置于冰上。洗板2次后,将处理好的样品加入到96孔酶标板中,100μL/孔,37℃孵育1h。洗板5次后加入一抗(Mouse anti-HAtag antibody,购自Abmart)进行反应(PD-1mAb组加入PBS),37℃孵育1h。洗板后加入二抗(Goat anti-mouse IgG mAb,购自Cell Signaling Technology)反应,洗板后加入TMB显色,酶标仪测定OD 450nm和OD 630nm。
采用公式Relative activity%=Ab'/Ab×100%(式中Ab和Ab'分别表示样品处理前和处理后所产生的吸光值)计算热稳定相对活性,即热处理后抗体结合抗原的相对活性。
结果如图3所示,经过60℃处理后,PD-1mAb相对活性随时间增加而显著下降,180min后相对活性接近0%,而Nb 2保持在80%以上,Nb 3保持在60%以上;经过90℃处理后,PD-1mAb相对活性显著下降,处理10min后相对活性已降至0%,而Nb 2处理120min后相对活性才降至0%,Nb 3相对活性在处理60min后下降至0%;由此可见,本发明的NbPD-1相对于常用的鼠单克隆抗体,在高温处理时的稳定性更加好。
实施例5NbPD-1生物活性研究
1.蛋白标记HRP实验
取250μL要标记的蛋白液,加入25μL反应启动液,轻轻混匀。将混合液加入辣根过氧化酶瓶中混匀,置于37℃温箱2h。加入25μL终止剂混匀,置于室温1h。加入甘油(终浓度为50%),-20℃保存备用。
2.NbPD-1的竞争实验
2.1NbPD-1与PD-1mAb的竞争结合实验
配制成终浓度为0.5μg/mL PD-1的包被液,以100μL/孔加入96孔酶标板内,于4℃包被过夜。次日,0.05%PBST洗板2次,5%脱脂牛奶37℃封闭2h。以稀释32000倍的鼠PD-1mAb梯度稀释NbPD-1,同时以一株针对兔IgG的纳米抗体(美国Abcam公司ab218695)作为阴性对照(Control),平行操作,纳米抗体最大浓度为100μg/mL,稀释11个梯度,洗板2次后加入到96孔酶标板中,100μL/孔,37℃孵育1h。洗板5次后加入二抗(Goat anti-mouse IgGmAb,购自Cell Signaling Technology),37℃孵育1h。洗板5次后加入TMB显色,酶标仪测定OD 450nm和OD 630nm。
Nb 2和Nb 3对稀释32000倍的PD-1mAb与0.5μg/mL PD-1的半数有效抑制浓度分别0.55831μg/mL、0.20549μg/mL。由图4可知,随着NbPD-1浓度增加,PD-1mAb与PD-1的结合力呈现出递减的趋势,说明这Nb 3(Nb 2)与PD-1的结合表位同PD-1mAb与PD-1表位重叠或相近,或者是Nb 3与PD-1的亲和力高于PD-1mAb与PD-1之间的亲和力。同时,结果显示Nb 2和Nb 3结合PD-1的区域可能不同,或者Nb 3与PD-1亲和力可能低于PD-1mAb与PD-1亲和力。
2.2NbPD-1与PD-L1的竞争结合实验
配制成终浓度为0.5μg/mL PD-1的包被液,以100μL/孔加入96孔酶标板内,于4℃包被过夜。次日,0.05%PBST洗板2次,5%BSA封闭2h。以2.5μg/mL的PD-L1-HRP稀释NbPD-1(0~20μg/mL)成相应浓度,洗板2次后加入到96孔酶标板中,100μL/孔,37℃孵育1h;以纳米抗体ab218695作为阴性对照组(Control),平行操作。洗板5次后加入二抗(Goat anti-mouseIgG mAb,购自Cell Signaling Technology),37℃孵育1h。洗板5次后加入TMB显色10min,加入2.29%硫酸终止,酶标仪测定OD 450nm和OD 630nm。
由图5可知,随着Nb 2或Nb 3浓度增加,PD-L1与PD-1的结合力呈现出递减的趋势,说明这两株纳米抗体与PD-1的结合表位同PD-L1与PD-1表位重叠或相近,或者Nb 2、Nb 3与PD-1的亲和力高于PD-L1,能将结合在PD-1表面的PD-L1竞争下来,即Nb 2或Nb 3能有效阻断PD-L1与PD-1的结合。
3.pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro-PD-1重组质粒构建
根据PD-1基因序列并参考pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro(购自System Biosciences,USA)多克隆位点信息,设计引物并加入Xba I/BamH I酶切位点,用以克隆PD-1胞外段基因序列;通过PCR扩增PD-1基因片段;Xba I、BamH I双酶切PD-1基因片段及pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro;随后连接、转化;筛选阳性克隆,测序验证,最后重组质粒大量抽提,得到含PD-1的重组质粒。
4.慢病毒载体介导PD-1基因转染HEK 293T细胞及稳定株筛选
用DMEM/FBS培养基于37℃、5%CO2培养箱内培养HEK 293T细胞(购自ThermoFisher,USA),待细胞密度达70%~80%时,换无血清DMEM培养基。将1.5mL Opti-MEM、各DNA溶液(7.5μg psPAX2、5μg慢病毒包装质粒pMD2.G(购自Addgene,USA)和10μg含PD-1的重组质粒充分混合,室温静置5min。
DNA/PEI混合液:另一EP管加入1.5mL Opti-MEM及112.5μg PEI,充分混合后加入混合液1中混匀,室温静置15min。将DNA/PEI混合液均匀滴加至细胞密度为70~80%的处于对数生长期的HEK 293T细胞。37℃培养12h后,更换为10mL DMEM/FBS培养基,继续培养,48h后离心收集HEK 293T细胞上清液,经0.45μm滤膜过滤,常规PEG沉淀病毒颗粒。DMEM/FBS培养基重悬病毒颗粒加入处于对数生长期的HEK 293T细胞中,37℃,5%CO2,培养48h。离心换液,加入含10μg/mL嘌呤霉素的DMEM/FBS培养基培养。视细胞密度换液或传代,至获得稳定的HEK 293T/PD-1细胞株。Western blot鉴定HEK293T/PD-1细胞,对照组HEK 293T没有出现条带,即HEK 293T本身不表达PD-1,而筛选出的HEK 293T/PD-1细胞出现特异性条带,即HEK293T/PD-1表达PD-1。
5.激光共聚焦鉴定HEK 293T/PD-1细胞
取对数生长期的HEK 293T/PD-1和HEK 293T细胞,经0.25%胰酶消化,吹打重悬至单细胞悬液,稀释浓度至2×105cells/mL。加入共聚焦专用小皿,培养至细胞密度合适。1×PBS清洗2遍后加入4%多聚甲醛固定15min。1×PBS清洗2遍后加入1%BSA重悬,37℃封闭1h。1×PBS清洗后孵育抗体(Mouse anti-PD-1antibody(PE),购自BD公司),37℃避光孵育1h。PBST清洗3遍,加入DAPI溶液孵育15min。PBST清洗3遍加入抗荧光猝灭剂。共聚焦荧光显微镜检测HEK 293T细胞膜上PD-1表达情况。共聚焦结果显示,相比于对照组HEK 293T,HEK293T/PD-1在细胞膜位置出现明显荧光,HEK 293T/PD-1细胞膜有PD-1分子;说明HEK 293T/PD-1稳定细胞株筛选成功。
6.流式验证NbPD-1与HEK 293T/PD-1细胞膜上PD-1分子结合
以稳定表达PD-1分子的HEK 293T/PD-1细胞为实验材料分析本发明的NbPD-1与细胞膜表面PD-1分子的结合情况,以分析本发明的纳米抗体与天然表达的PD-1分子特异性识别活性。
取对数生长期的HEK 293T/PD-1和HEK 293T细胞,经0.25%胰酶消化,吹打重悬成单细胞悬液。取5×106cells/管,1×PBS清洗1遍。各组HEK 293T/PD-1孵育抗体顺序为:PD-1mAb组:Mouse anti-PD-1antibody+Goat anti-mouse IgG-FITC;Nb 2组:(Nb 2+Mouseanti-His antibody)+Goat anti-mouse IgG-FITC;Nb 3组:(Nb 3+Mouse anti-Hisantibody)+Goat anti-mouse IgG-FITC。对照组:HEK 293T细胞+1%BSA+Goat anti-mouseIgG(FITC)1×PBS清洗2遍后加入4%多聚甲醛固定15min。1×PBS清洗3遍后加入1%BSA重悬,37℃封闭1h。1×PBS清洗后按上述分组孵育蛋白/抗体,37℃避光孵育1h。孵育荧光抗体(Goat anti-mouse IgG-FITC),加入100μL抗体稀释液重悬,37℃孵育避光1h。PBST清洗3遍,1×PBS重悬,流式细胞仪检测。
结果如图6所示,从A、B、C可看出,PD-1mAb、Nb 2、Nb 3均能识别天然构象PD-1。Nb2和Nb 3组Mean值分别为50.7、46.9,与PD-1mAb组Mean值44.8基本相同,PD-1mAb组Median值(36.8)、Nb 2组Median值(36.5)和Nb 3组Median值(37.5)也基本一致(图6中的D进一步将A、B、C中的PD-1mAb、Nb 2、Nb 3数据进行叠加比对呈现),即表明Nb 2和Nb 3具有与鼠PD-1mAb相同的、识别细胞表面PD-1的能力,说明NbPD-1中Nb 2和Nb 3能特异性结合细胞膜表面PD-1分子。
7.PHA体外激活PBMC模型研究NbPD-1功能
利用PHA(植物血凝素)体外激活T细胞,以IFN-γ浓度检测T细胞活化情况,研究该体系中NbPD-1对PD-L1抑制T细胞活性的阻断效果。
取1名健康志愿者全血10~15mL,利用人淋巴细胞分离液分离人PBMC细胞。平衡液清洗两遍,RPMI 1640/FBS培养基重悬细胞并计数,以5×104/孔接种于96孔板,每孔50μL。将梯度的PHA以25μL/孔加入对应培养孔,至终浓度分别为0μg/mL、2.5μg/mL、5μg/mL、10μg/mL。同时在培养体系中以25μL/孔加入梯度稀释好的PD-L1至终浓度为0μg/mL、5μg/mL、10μg/mL、20μg/mL、30μg/mL和40μg/mL置于37℃细胞培养箱培养72h。300×g离心10min收获上清,利用人IFN-γELISA检测试剂盒(购自联科生物)测定上清中IFN-γ的表达情况,最终选择5μg/mL PHA为刺激浓度,10μg/mL PD-L1为抑制浓度,进行NbPD-1活性评价实验。
同样的方法分离人PBMC细胞并以同样的细胞密度接种于96孔板中。配置最适PHA刺激浓度(5μg/mL)以及PD-L1抑制浓度(10μg/mL)加入相应的孔中。RPMI 1640/FBS培养基稀释抗体NbPD-1至终浓度为0μg/mL、1.25μg/mL、2.5μg/mL、5μg/mL、10μg/mL和20μg/mL加入对应的反应体系,37℃细胞培养箱培养72h,收获上清并利用人IFN-γELISA检测试剂盒测定上清中IFN-γ的表达情况。取3名健康志愿者全血分别重复实验,统计数据。
结果如图7所示,在以上抑制体系中,分别添加Nb 2或Nb 3后IFN-γ浓度都有所回升,且在一定NbPD-1浓度下,IFN-γ浓度随着NbPD-1浓度升高而升高。说明在一定条件下,两株NbPD-1都能够逆转活化T细胞被PD-L1抑制的状态,进而上调IFN-γ的表达。同时,在Nb 2浓度为2.5μg/mL时(PHA+PD-L1+Nb2组),IFN-γ浓度最高;在Nb 3浓度为5μg/mL时(PHA+PD-L1+Nb 3组),IFN-γ浓度最高。
上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110>暨南大学
<120>一种PD-1纳米抗体及其克隆表达方法与应用
<160> 14
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 10
<212> PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-1纳米抗体CDR1氨基酸序列
<400> 1
Gly Phe Thr His Leu Arg Tyr Ser Met Gly
1 5 10
<210> 2
<211> 10
<212> PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-1纳米抗体CDR1氨基酸序列
<400> 2
Gly Leu Thr Tyr Leu Arg Tyr Ser Met Gly
1 5 10
<210> 3
<211> 7
<212> PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-1纳米抗体CDR2氨基酸序列
<400> 3
Ile Gly Gly Asp Gly Arg Thr
1 5
<210> 4
<211> 23
<212> PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-1纳米抗体CDR3氨基酸序列
<400> 4
Ala Ala Ala Val Leu Leu Asp Gly Ser Phe Ser Leu Leu Ala Pro Leu
1 5 10 15
Val Pro Tyr Lys Tyr Asp Tyr
20
<210> 5
<211> 23
<212> PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-1纳米抗体CDR3氨基酸序列
<400> 5
Ala Ala Ala Val Leu Leu Asp Gly Ser Phe Ser Leu Leu Ala Pro Leu
1 5 10 15
Thr Pro Tyr Lys Tyr Asp Tyr
20
<210> 6
<211> 25
<212> PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-1纳米抗体FR1氨基酸序列
<400> 6
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Ser Val Gln Ala Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser
20 25
<210> 7
<211> 15
<212> PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-1纳米抗体FR2氨基酸序列
<400> 7
Trp Phe Arg Gln Val Leu Asp Lys Glu Arg Glu Gly Val Ala Ala
1 5 10 15
<210> 8
<211> 15
<212> PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-1纳米抗体FR2氨基酸序列
<400> 8
Trp Phe Arg Gln Val Pro Asp Lys Glu Arg Glu Gly Val Ala Ala
1 5 10 15
<210> 9
<211> 38
<212> PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-1纳米抗体FR3氨基酸序列
<400> 9
Ser Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Phe Lys Asp Asn
1 5 10 15
Ala Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Asp Met Asn Ser Leu Asn Pro Glu Asp
20 25 30
Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
35
<210> 10
<211> 11
<212> PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-1纳米抗体FR4氨基酸序列
<400> 10
Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
1 5 10
<210> 11
<211> 129
<212> PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-1纳米抗体氨基酸序列
<400> 11
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Ser Val Gln Ala Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser Gly Phe Thr His Leu Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Phe Arg Gln Val Leu Asp Lys Glu Arg Glu Gly Val
35 40 45
Ala Ala Ile Gly Gly Asp Gly Arg Thr Ser Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Phe Lys Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Asp Met Asn Ser Leu Asn Pro Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Ala Ala Val Leu Leu Asp Gly Ser Phe Ser Leu Leu Ala Pro Leu Val
100 105 110
Pro Tyr Lys Tyr Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser
115 120 125
Ser
<210> 12
<211> 129
<212> PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-1纳米抗体氨基酸序列
<400> 12
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Ser Val Gln Ala Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser Gly Leu Thr Tyr Leu Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Phe Arg Gln Val Pro Asp Lys Glu Arg Glu Gly Val
35 40 45
Ala Ala Ile Gly Gly Asp Gly Arg Thr Ser Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Phe Lys Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Asp Met Asn Ser Leu Asn Pro Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Ala Ala Val Leu Leu Asp Gly Ser Phe Ser Leu Leu Ala Pro Leu Thr
100 105 110
Pro Tyr Lys Tyr Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser
115 120 125
Ser
<210> 13
<211> 513
<212> DNA
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223>编码PD-1纳米抗体的核苷酸序列
<400> 13
atgaaatacc tattgcctac ggcagccgct ggattgttat tactcgcggc ccagccggcc 60
atggcccagg tgcagctgca ggagtctggg ggaggctcgg tgcaggctgg agggtctctg 120
agactctcct gtgtagcctc agggttcacc cacttgcgct actccatggg gtggttccgc 180
caggttctag ataaggagcg cgagggggtc gcagctattg gcggtgatgg taggacaagc 240
tacgcagact ccgtaaaggg ccgattcacc atcttcaaag acaacgccaa gaatactctg 300
tatctggaca tgaacagcct gaaccccgag gacactgcca tgtactactg tgcggcagcg 360
gtactcctag atggtagctt ctcgctcctg gcccctctag taccatataa gtatgactac 420
tggggccagg ggacccaggt caccgtctcc tcagcggccg catacccgta cgacgttccg 480
gactacggtt cccaccacca tcaccatcac tag 513
<210> 14
<211> 513
<212> DNA
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223>编码PD-1纳米抗体的核苷酸序列
<400> 14
atgaaatacc tattgcctac ggcagccgct ggattgttat tactcgcggc ccagccggcc 60
atggcccagg tgcagctgca ggagtctgga ggaggctcgg tgcaggctgg agggtctctg 120
agactctcct gtgtagcctc agggttaacc tacctgcgct actccatggg ctggttccgc 180
caggttccag ataaggagcg cgagggggtc gcagctattg gcggtgatgg taggacaagc 240
tacgcagact ccgtaaaggg ccgattcacc atcttcaaag acaacgccaa gaatactctg 300
tatctggaca tgaacagcct gaaccccgag gacactgcca tgtactactg tgcggcagcg 360
gtactcctgg atggtagctt ctcgctcctg gcccctctaa caccatataa gtatgactac 420
tggggccagg ggacccaggt caccgtctcc tcagcggccg catacccgta cgacgttccg 480
gactacggtt cccaccacca tcaccatcac tag 513
Claims (10)
1.一种PD-1纳米抗体,包含由框架区FR和互补决定区CDR组成的可变区结构域,其特征在于,所述的可变区结构域包含选自以下的CDR1、CDR2和CDR3:
(1)SEQ ID No.1或SEQ ID No.2所示的CDR1;
(2)SEQ ID No.3所示的CDR2;
(3)SEQ ID No.4或SEQ ID No.5所示的CDR3。
2.根据权利要求1所述的PD-1纳米抗体,其特征在于,所述的可变区结构域包含选自以下的CDR1、CDR2和CDR3:
(1)SEQ ID No.1所示的CDR1,SEQ ID No.3所示的CDR2和SEQ ID No.4所示的CDR3;
(2)SEQ ID No.2所示的CDR1,SEQ ID No.3所示的CDR2和SEQ ID No.5所示的CDR3。
3.根据权利要求1所述的PD-1纳米抗体,其特征在于,所述的框架区FR选自以下的FR1、FR2、FR3和FR4:
(1)SEQ ID No.6所示的FR1;
(2)SEQ ID No.7或SEQ ID No.8所示的FR2;
(3)SEQ ID No.9所示的FR3;
(4)SEQ ID No.10所示的FR4。
4.根据权利要求1所述的PD-1纳米抗体,其特征在于:
所述的PD-1纳米抗体的氨基酸序列如SEQ ID No.11或SEQ ID No.12所示。
5.根据权利要求1所述的PD-1纳米抗体,具有下述特征中的至少一个:
(1)阻断PD-1和PD-L1结合;
(2)逆转PD-L1引起的T细胞失活状态;
(3)抑制肿瘤生长。
6.一种核酸分子,其特征在于:
编码权利要求1~5任一项所述的PD-1纳米抗体。
7.一种重组表达载体,其特征在于:
含有编码权利要求1~5任一项所述的PD-1纳米抗体氨基酸序列的核苷酸序列的重组表达载体。
8.一种宿主细胞,其特征在于:
转化了权利要求7所述的重组表达载体或者基因组上整合了编码权利要求1~5任一项所述的PD-1纳米抗体的核苷酸序列的宿主细胞及其后代细胞。
9.权利要求1~5任一项所述的PD-1纳米抗体的克隆表达方法,其特征在于,包括如下步骤:
将编码所述的PD-1纳米抗体的核苷酸序列克隆入表达载体中,构建重组表达载体;再将所述的重组表达载体转入表达系统中进行表达;对目的蛋白进行分步纯化,最后得到所述的PD-1纳米抗体。
10.权利要求1~5任一项所述的PD-1纳米抗体的应用,其特征在于:
所述的应用为在制备预防和/或治疗癌症药物中的应用。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201810002873.4A CN108299561B (zh) | 2018-01-02 | 2018-01-02 | 一种pd-1纳米抗体及其克隆表达方法与应用 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201810002873.4A CN108299561B (zh) | 2018-01-02 | 2018-01-02 | 一种pd-1纳米抗体及其克隆表达方法与应用 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN108299561A true CN108299561A (zh) | 2018-07-20 |
| CN108299561B CN108299561B (zh) | 2020-11-13 |
Family
ID=62868461
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN201810002873.4A Active CN108299561B (zh) | 2018-01-02 | 2018-01-02 | 一种pd-1纳米抗体及其克隆表达方法与应用 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN108299561B (zh) |
Cited By (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN111153997A (zh) * | 2020-01-16 | 2020-05-15 | 佛山汉腾生物科技有限公司 | 抗ctla-4纳米抗体及其在肿瘤治疗中的应用 |
| CN111153998A (zh) * | 2020-01-16 | 2020-05-15 | 佛山汉腾生物科技有限公司 | 抗ctla-4纳米抗体及其应用 |
| CN111234019A (zh) * | 2020-01-16 | 2020-06-05 | 佛山汉腾生物科技有限公司 | 抗ctla-4纳米抗体、药物组合物及其应用 |
| WO2023011654A1 (zh) * | 2021-08-06 | 2023-02-09 | 启愈生物技术(上海)有限公司 | 抗pd-1纳米抗体及其应用 |
| CN116023492A (zh) * | 2021-10-27 | 2023-04-28 | 新疆优迈生物技术有限公司 | 一种阻断pd1与pdl1结合的抗人pdl1纳米抗体的制备方法及其编码序列 |
| WO2023116781A1 (zh) * | 2021-12-21 | 2023-06-29 | 博生吉医药科技(苏州)有限公司 | 一种新型pd1单域抗体的开发 |
| CN116829584A (zh) * | 2020-12-31 | 2023-09-29 | 浙江道尔生物科技有限公司 | 一种抗pd-1的单域抗体 |
| WO2023186121A1 (en) * | 2022-04-02 | 2023-10-05 | Biotheus Inc. | Anti-cd39 nanobody and uses thereof |
| WO2023186061A1 (zh) * | 2022-03-31 | 2023-10-05 | 浙江特瑞思药业股份有限公司 | 抗pd-1纳米抗体、其应用及其治疗疾病的方法 |
| CN119874915A (zh) * | 2025-01-23 | 2025-04-25 | 百吉生物医药(广州)股份有限公司 | 一种程序性死亡受体1的纳米抗体及其制备方法和应用 |
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN106008714A (zh) * | 2016-05-24 | 2016-10-12 | 瑞阳(苏州)生物科技有限公司 | 抗人pd-1人源化单克隆抗体及其应用 |
| CN106939049A (zh) * | 2017-04-20 | 2017-07-11 | 苏州思坦维生物技术有限责任公司 | 拮抗抑制人pd‑1抗原与其配体结合的单克隆抗体及其制备方法与应用 |
| CN107474135A (zh) * | 2017-02-17 | 2017-12-15 | 广西医科大学 | 抗PD‑1的纳米抗体PD‑1/Nb20及其制备方法与应用 |
-
2018
- 2018-01-02 CN CN201810002873.4A patent/CN108299561B/zh active Active
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN106008714A (zh) * | 2016-05-24 | 2016-10-12 | 瑞阳(苏州)生物科技有限公司 | 抗人pd-1人源化单克隆抗体及其应用 |
| CN107474135A (zh) * | 2017-02-17 | 2017-12-15 | 广西医科大学 | 抗PD‑1的纳米抗体PD‑1/Nb20及其制备方法与应用 |
| CN106939049A (zh) * | 2017-04-20 | 2017-07-11 | 苏州思坦维生物技术有限责任公司 | 拮抗抑制人pd‑1抗原与其配体结合的单克隆抗体及其制备方法与应用 |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| ZHIJUAN LIN 等: "PD-1 Antibody Monotherapy for Malignant Melanoma: A Systematic Review and MetaAnalysis", 《PLOS ONE》 * |
Cited By (13)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN111153997A (zh) * | 2020-01-16 | 2020-05-15 | 佛山汉腾生物科技有限公司 | 抗ctla-4纳米抗体及其在肿瘤治疗中的应用 |
| CN111153998A (zh) * | 2020-01-16 | 2020-05-15 | 佛山汉腾生物科技有限公司 | 抗ctla-4纳米抗体及其应用 |
| CN111234019A (zh) * | 2020-01-16 | 2020-06-05 | 佛山汉腾生物科技有限公司 | 抗ctla-4纳米抗体、药物组合物及其应用 |
| CN111153998B (zh) * | 2020-01-16 | 2022-06-24 | 佛山汉腾生物科技有限公司 | 抗ctla-4纳米抗体及其应用 |
| CN111234019B (zh) * | 2020-01-16 | 2022-06-24 | 佛山汉腾生物科技有限公司 | 抗ctla-4纳米抗体、药物组合物及其应用 |
| CN111153997B (zh) * | 2020-01-16 | 2022-06-24 | 佛山汉腾生物科技有限公司 | 抗ctla-4纳米抗体及其在肿瘤治疗中的应用 |
| CN116829584A (zh) * | 2020-12-31 | 2023-09-29 | 浙江道尔生物科技有限公司 | 一种抗pd-1的单域抗体 |
| WO2023011654A1 (zh) * | 2021-08-06 | 2023-02-09 | 启愈生物技术(上海)有限公司 | 抗pd-1纳米抗体及其应用 |
| CN116023492A (zh) * | 2021-10-27 | 2023-04-28 | 新疆优迈生物技术有限公司 | 一种阻断pd1与pdl1结合的抗人pdl1纳米抗体的制备方法及其编码序列 |
| WO2023116781A1 (zh) * | 2021-12-21 | 2023-06-29 | 博生吉医药科技(苏州)有限公司 | 一种新型pd1单域抗体的开发 |
| WO2023186061A1 (zh) * | 2022-03-31 | 2023-10-05 | 浙江特瑞思药业股份有限公司 | 抗pd-1纳米抗体、其应用及其治疗疾病的方法 |
| WO2023186121A1 (en) * | 2022-04-02 | 2023-10-05 | Biotheus Inc. | Anti-cd39 nanobody and uses thereof |
| CN119874915A (zh) * | 2025-01-23 | 2025-04-25 | 百吉生物医药(广州)股份有限公司 | 一种程序性死亡受体1的纳米抗体及其制备方法和应用 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN108299561B (zh) | 2020-11-13 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN108299561B (zh) | 一种pd-1纳米抗体及其克隆表达方法与应用 | |
| US11912770B2 (en) | Blocking type PD-L1 single-domain camel antibody and application thereof | |
| CN111320694B (zh) | 一种由重链抗体的可变区组成的纳米抗体gn2及其制备方法和应用 | |
| WO2020038147A1 (zh) | 抗bcma的单域抗体及其应用 | |
| CN112457404A (zh) | 一种抗人egfr的纳米抗体和应用 | |
| WO2015089881A1 (zh) | 全人源抗cd26抗体及其应用 | |
| CN101863980B (zh) | 全人源抗血管内皮细胞生长因子受体2单链抗体 | |
| CN110144011B (zh) | 针对t淋巴细胞免疫球蛋白黏蛋白3的单域抗体 | |
| CN116874599A (zh) | 靶向人dll3的嵌合抗原受体t细胞及其应用 | |
| WO2023125842A1 (zh) | 一种新型upar单域抗体的开发 | |
| CN113527500B (zh) | 一种磷脂酰肌醇蛋白聚糖3的全人源单克隆抗体、其嵌合抗原受体及应用 | |
| CN109867725B (zh) | PD-1-Fc融合蛋白及其制备方法和用途 | |
| CN103275226B (zh) | 特异性抗人上皮细胞粘附分子(EpCAM)的单克隆抗体的制备、鉴定及应用 | |
| CN101143902B (zh) | 抗HER2单链抗体-力达霉素强化融合蛋白HER2(Fv-LDM) | |
| CN110655581B (zh) | 一种抗癌胚抗原的抗体及其制备方法和用途 | |
| CN116732078A (zh) | 以pET28a作为载体制备肿瘤相关抗原NY-ESO-1的方法及应用 | |
| CN116789826A (zh) | 抗人lilrb2全人源单域抗体及其应用 | |
| CN108635579B (zh) | 抗人bFGF纳米抗体在制备治疗黑色素瘤药物中的应用 | |
| WO2022152222A1 (zh) | 靶向pd-1的单域抗体及其衍生物和用途 | |
| CN105969777A (zh) | 一种抗人mCRP单链抗体及其应用 | |
| CN111234019A (zh) | 抗ctla-4纳米抗体、药物组合物及其应用 | |
| CN102746402A (zh) | 全人源抗人催乳素受体单链抗体及其应用 | |
| CN114763379B (zh) | 新冠病毒s蛋白的特异性抗体及其制备方法与应用 | |
| CN111153997B (zh) | 抗ctla-4纳米抗体及其在肿瘤治疗中的应用 | |
| WO2023279803A1 (zh) | Rbv的蛋白结合分子及其用途 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PB01 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| GR01 | Patent grant | ||
| GR01 | Patent grant |