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CN106048002A - 胶质瘤细胞中gdnf基因启动子检测方法 - Google Patents

胶质瘤细胞中gdnf基因启动子检测方法 Download PDF

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CN106048002A
CN106048002A CN201610372267.2A CN201610372267A CN106048002A CN 106048002 A CN106048002 A CN 106048002A CN 201610372267 A CN201610372267 A CN 201610372267A CN 106048002 A CN106048002 A CN 106048002A
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CN
China
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cells
culture
trypsin
glioma
gene promoter
Prior art date
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Application number
CN201610372267.2A
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English (en)
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陈茂华
孙军
陆川
陈献东
巴华君
蔡建勇
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Wenzhou Central Hospital
Original Assignee
Wenzhou Central Hospital
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Publication date
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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686Polymerase chain reaction [PCR]

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Abstract

本发明公开了一种胶质瘤细胞中GDNF基因启动子检测方法,步骤一:提取胶质瘤细胞;步骤二:细胞培养;步骤三:药物处理;步骤四:mRNA提取;步骤五:反应:95℃预变性30s;95℃变性20S,60℃退火15s;72℃延伸15s,扩增40个循环;步骤六:计算:样品以GAPDH基因的mRNA表达作为内参照,通过相对定量(2‑△△CT)法计算目的基因在各样品中相对mRNA的表达水平。引物的序列为:GAPDH:F:5’TCCCTCAAGATTGTCAGCAA3’;R:5’AGATCCACAACGGATACATT3’GDNF:F:5’GACTTGGGTTTGGGCTACGA3’;R:5’TGGTAAACCAGGCTGTCGTC3’。通过本发明通过本发明处理过程后,经过检测的胶质瘤细胞2^‑△△CT表达水平更高,同时通过两者方差对比,本发明的检测方法,2^‑△△CT的表达水平更加稳定。

Description

胶质瘤细胞中GDNF基因启动子检测方法
技术领域
本发明涉及医学检测方法,更具体的说是涉及一种胶质瘤细胞中GDNF基因启动子检测方法。
背景技术
胶质细胞系源性神经营养因子(GDNF)是胶质瘤发性胶质瘤细胞的重要促生长因子,在原发性胶质瘤组织和多种胶质瘤细胞系中转录异常升高。目前,基因高转录对胶质瘤细胞恶性增殖与迁移机制的研究已经很多,然而鲜见对其高转录发生机制的报道。本课题组前期的研究发现,gdnf 基因的高转录与基因突变无关,推测基于非DNA 序列改变的表观遗传修饰可能参与其高转录调控过程。近来的研究表明,翻译后组蛋白的乙酰化修饰在调节基因转录过程中发挥了重要作用。
通过现有技术的发展,GDNF 基因 mRNA表达及其启动子Ⅰ区组蛋白 H3K9 的乙酰化修饰状态,GDNF 基因 上mRNA与基因癌变有重要关系,现有技术中也有记载检测GDNF 基因 上mRNA的方法,但是现有技术中的方法由于受到外界影响过大,检测出来的未定型不高。
发明内容
针对现有技术存在的不足,本发明的目的在于提供一种高稳定性胶质瘤细胞中GDNF基因启动子mRNA检测方法。
为实现上述目的,本发明提供了如下技术方案:
一种胶质瘤细胞中GDNF基因启动子mRNA检测方法,步骤一:提取胶质瘤细胞:取48h内的胶质瘤样本,首先剪碎并用清洗,加入0.25 %胰酶溶液在37℃条件下消化5min;收集细胞培养于含有10%胎牛血清的DMEM/F12培养液,每周换液两次;在原代培养7-9天后,将培养瓶置于恒温摇床37℃,200rpm,20h震荡纯化,以去除小胶质细胞及少突胶质细胞;
经GFAP 免疫荧光鉴定阳性的细胞视为成熟的细胞,取第4代的处于对数生长期为胶质瘤细胞株;
步骤二:细胞培养:胶质瘤细胞株用含10%胎牛血清、100U/ml 青霉素,100U/ml链霉素的培养基,置于37℃,5% CO2培养箱中培养;
步骤三:药物处理:取对数生长期细胞培养24 h同步化后进行药物处理,加入终浓度为25~100μmol/L的姜黄素继续培养24h;
步骤四:mRNA提取,采用TRIzol一步法从细胞中提取总 RNA,取RNA模板2μg用PrimeScript II逆转录试剂盒行逆转录反应合成cD-NA第一链,再以逆转录反应液1μl作为模板,加入相应引物进行PCR扩增,所述引物的序列为:
GAPDH:F:5’ TCCCTCAAGATTGTCAGCAA3’
R:5’ AGATCCACAACGGATACATT3’
GDNF: F:5’ GACTTGGGTTTGGGCTACGA3’
R:5’ TGGTAAACCAGGCTGTCGTC3’;
步骤五:反应:95 ℃预变性30s;95℃变性20S,60℃退火15s; 72℃延伸15s,扩增40个循环;
步骤六:计算:样品以GAPDH 基因的mRNA表达作为内参照,通过相对定量 (2^-△△CT)法计算目的基因在各样品中相对mRNA的表达水平。
作为本发明的进一步改进:所述步骤一中,在将样本剪碎后,通过75%的酒精进行一次清洗,之后通过清洗液中浸泡15min后,在用清洗液冲洗至少三次,所述清洗液包括下列重量份组成:
去离子水 800~1000份
氯化钠 5~10份
氯化钾 0.1~1份
磷酸二氢钾 0.1~1份
磷酸氢二钠 1~2份
磷酸甘油 1~2份
海藻糖 0.1~1份;
再加入0.25 %胰酶溶液在37℃条件下消化5min,所述胰酶溶液包括:0.25%的胰酶、0.02%的EDTA、0.02%的海藻糖、5%的丙三醇、0.5%的磷酸甘油,余量为PBS缓冲液。
作为本发明的进一步改进:所述步骤二中,培养基为以DMEM/F12培养液为基体,再添加海藻糖、壳聚糖、巯基乙醇、亚硒酸钠,所述海藻糖添加量为DMEM/F12培养液质量的0.5%,壳聚糖为DMEM/F12培养液质量的1~5 %,所述亚硒酸钠最终浓度为5~7ng/L。
作为本发明的进一步改进:所述步骤三中,在加入姜黄素进行乙酰化的过程中,同时加入去甲氧基姜黄素,所述去甲氧基姜黄素用量为姜黄素用量的1~5%。
作为本发明的进一步改进:所述步骤一中,胰酶溶液完成消化后,加入胰酶抑制剂解除胰酶溶液的消化作用,之后加入PBS缓冲液、甘油醇进行稀释,通过高速离心机将整个混合液进行离心,将上清液弃去后,收集细胞培养于含有10%胎牛血清的DMEM/F12培养液。
作为本发明的进一步改进:所述步骤一种,分离得到去胰酶的细胞后,再通过清洗液浸泡5min,浸泡过后在使用清洗剂清洗至少三次,收集细胞培养于含有10%胎牛血清的DMEM/F12培养液。
作为本发明的进一步改进:所述步骤二中的培养基中还添加有载体,所述载体为聚乳酸、淀粉、聚苯乙烯以葡萄糖水溶液为介质在60~80℃下通过聚合反应生成的微孔材料。
作为本发明的进一步改进:所述载体中以重量份计:聚苯乙烯为30~50份,聚乳酸为5~15份,淀粉为5~15份,葡萄糖水溶液浓度为5~10%。
作为本发明的进一步改进:所述步骤二中,在培养过程中,保持搅拌,所述搅拌速度为30~50r/min。
作为本发明的进一步改进:所述步骤三中,在提取细胞时,先在步骤二培养基中加入0.25%的胰酶、0.02%的EDTA、0.02%的海藻糖、5%的丙三醇、0.5%的磷酸甘油,余量为PBS缓冲液,消化5min后,使得细胞从载体上脱落,取出载体,通过PBS缓冲液冲洗至少三次,冲下来的液体倒回原培养基,加入胰酶抑制剂解除胰酶溶液的消化作用,之后加入PBS缓冲液、甘油醇进行稀释,经过告诉离心后的到的细胞,取对数生长期细胞培养24 h同步化后进行药物处理,加入终浓度为25~100μmol/L的姜黄素继续培养24h。
本发明的有益效果,通过本发明的方法进行检测的胶质瘤细胞GDNF基因mRNA的表达更加稳定。
首先,经过步骤一处理的胶质瘤细胞,能够在被处理完过后,仍然能够保持较好的活性,加入胰酶,将细胞与细胞之间分离,以便后续处理能够是的细胞能够以单个细胞存在。胰酶的处理时间不宜过长,过长会导致细胞被胰酶分解,从而被破坏。之后将分离的细胞放入培养基中培养。这样就能够培养出完整性较好的细胞。最后制得细胞株。
之后将细胞株进一步培养,胎牛血清主要是给细胞生长提供营养,而青霉素和链霉素主要是保证细胞不会被感染,保证细胞的存活率的同时,也保证不会导入其他DNA或者RNA。
而步骤三中,选用姜黄素作为乙酰化的试剂,能够更好地将组织蛋白乙酰化。乙酰化程度更高。使得之后进入步骤四mRNA提取过程中,逆转录的表达更加准确。
在步骤五中,通过设定的参数,能够得到更加准确的诗句。最后通过对比,得到mRNA的表达水平。
而在步骤一中,先将样本碎片通过酒精清洗,先初步清洗掉黏附在样本细胞表面的杂质,之后通过清洗剂浸泡,清洗剂中的去离子水、氯化钠、氯化钾、磷酸二氢钾、磷酸氢二钠能够形成适应细胞生存的体系,特别是胶质瘤细胞,其细胞活性能够得到极大限度的保证,同时通过磷酸甘油和海藻糖的加入,能够进一步保证细胞的活性,特别是蛋白质的活性,是的后期mRNA的表达更加准确。同时,胰酶溶液中EDTA能够提高胰酶的分离细胞的效果,同时海藻糖、丙三醇、磷酸甘油的加入,一方面保证了胰酶溶液的活性,同时液保护细胞组织不会被胰酶过度分解导致细胞失活。
另外在步骤二中的培养基中添加海藻糖、壳聚糖、巯基乙醇、亚硒酸钠,海藻糖能够对肿瘤细胞起到保护作用,使得细胞活性更高,同时亚硒酸钠能够提供细胞生长所需要的微量元素,而壳聚糖不仅仅能够起到保护细胞,提高活性,还能够调整整体液体的粘稠度,是使得细胞生存的环境更加稳定。
在步骤三中姜黄素乙酰化过长中加入去甲氧基姜黄素,能够提高姜黄素的稳定性,提高其乙酰化的表达。
步骤一中,在完成胰酶消化后,通过胰酶抑制剂的加入能够彻底抑制胰酶的分解反应,使得胰酶失活,而不会造成肿瘤细胞的失活,之后再清洗过程中,加入的甘油醇也同样能够对肿瘤细胞形成保护,目的是为了防止胰酶抑制剂对肿瘤细胞产生损伤。
在分离胰酶后,浸泡清洗液也是为了能够去除肿瘤细胞表面的杂质以外,还能够对肿瘤细胞起到一个保护作用。使得后期培养前就保证了肿瘤细胞的活性。
另外,在培养过程中,加入了载体,通过聚乳酸、淀粉、聚苯乙烯制备的载体,是一种环保型载体,给细胞生长提供了一个优质的环境,载体是一个多孔材料是的细胞生长能够有更多的贴壁面积,更好的模拟了生物体内的环境,保证了其细胞培养的成活率以及活性。
而在使用载体后,为了使得细胞从载体上脱落就需要用胰酶溶液进行浸泡,之后冲洗,冲洗下来的冲洗液为了充分利用,倒回到培养基中,进行肿瘤细胞的提取。
具体实施方式
实施例:
步骤一:提取胶质瘤细胞:取48h内的胶质瘤样本,首先剪碎并用清洗,加入0.25 %胰酶溶液在37℃条件下消化5min;收集细胞培养于含有10%胎牛血清的DMEM/F12培养液,每周换液两次;在原代培养7-9天后,将培养瓶置于恒温摇床37℃,200rpm,20h震荡纯化,以去除小胶质细胞及少突胶质细胞;
经GFAP 免疫荧光鉴定阳性的细胞视为成熟的细胞,取第4代的处于对数生长期为胶质瘤细胞株;
所述步骤一中,在将样本剪碎后,通过75%的酒精进行一次清洗,之后通过清洗液中浸泡15min后,在用清洗液冲洗至少三次,所述清洗液包括下列重量份组成:
去离子水 800~1000份
氯化钠 5~10份
氯化钾 0.1~1份
磷酸二氢钾 0.1~1份
磷酸氢二钠 1~2份
磷酸甘油 1~2份
海藻糖 0.1~1份;
再加入0.25 %胰酶溶液在37℃条件下消化5min,所述胰酶溶液包括:0.25%的胰酶、0.02%的EDTA、0.02%的海藻糖、5%的丙三醇、0.5%的磷酸甘油,余量为PBS缓冲液。
所述步骤一中,分离得到去胰酶的细胞后,再通过清洗液浸泡5min,浸泡过后在使用清洗剂清洗至少三次,收集细胞培养于含有10%胎牛血清的DMEM/F12培养液。
步骤二:细胞培养:胶质瘤细胞株用含10%胎牛血清、100U/ml 青霉素,100U/ml链霉素的培养基,置于37℃,5% CO2培养箱中培养;所述步骤二中,培养基为以DMEM/F12培养液为基体,再添加海藻糖、壳聚糖、巯基乙醇、亚硒酸钠,所述海藻糖添加量为DMEM/F12培养液质量的0.5%,壳聚糖为DMEM/F12培养液质量的1~5 %,所述亚硒酸钠最终浓度为5~7ng/L。所述步骤二中的培养基中还添加有载体,所述载体为聚乳酸、淀粉、聚苯乙烯以葡萄糖水溶液为介质在60~80℃下通过聚合反应生成的微孔材料。在培养过程中,保持搅拌,所述搅拌速度为30~50r/min。
所述载体中以重量份计:聚苯乙烯为30~50份,聚乳酸为5~15份,淀粉为5~15份,葡萄糖水溶液浓度为5~10%。
步骤三:药物处理:取对数生长期细胞培养24 h同步化后进行药物处理,加入终浓度为25~100μmol/L的姜黄素继续培养24h;
所述步骤三中,在加入姜黄素进行乙酰化的过程中,同时加入去甲氧基姜黄素,所述去甲氧基姜黄素用量为姜黄素用量的1~5%。
作为本发明的进一步改进:所述步骤一中,胰酶溶液完成消化后,加入胰酶抑制剂解除胰酶溶液的消化作用,之后加入PBS缓冲液、甘油醇进行稀释,通过高速离心机将整个混合液进行离心,将上清液弃去后,收集细胞培养于含有10%胎牛血清的DMEM/F12培养液。
所述步骤三中,在提取细胞时,先在步骤二培养基中加入0.25%的胰酶、0.02%的EDTA、0.02%的海藻糖、5%的丙三醇、0.5%的磷酸甘油,余量为PBS缓冲液,消化5min后,使得细胞从载体上脱落,取出载体,通过PBS缓冲液冲洗至少三次,冲下来的液体倒回原培养基,加入胰酶抑制剂解除胰酶溶液的消化作用,之后加入PBS缓冲液、甘油醇进行稀释,经过告诉离心后的到的细胞,取对数生长期细胞培养24 h同步化后进行药物处理,加入终浓度为25~100μmol/L的姜黄素继续培养24h。
步骤四:mRNA提取,采用TRIzol一步法从细胞中提取总 RNA,取RNA模板2μg用Prime Script II逆转录试剂盒行逆转录反应合成cD-NA第一链,再以逆转录反应液1μl作为模板,加入相应引物进行PCR扩增,所述引物的序列为:
GAPDH:F:5’ TCCCTCAAGATTGTCAGCAA3’
R:5’ AGATCCACAACGGATACATT3’
GDNF: F:5’ GACTTGGGTTTGGGCTACGA3’
R:5’ TGGTAAACCAGGCTGTCGTC3’;
步骤五:反应:95 ℃预变性30s;95℃变性20S,60℃退火15s; 72℃延伸15s,扩增40个循环;
步骤六:计算:样品以GAPDH 基因的mRNA表达作为内参照,通过相对定量 (2^-△△CT)法计算目的基因在各样品中相对mRNA的表达水平。
本发明的有益效果,通过本发明的方法进行检测的胶质瘤细胞GDNF基因mRNA的表达更加稳定。
首先,经过步骤一处理的胶质瘤细胞,能够在被处理完过后,仍然能够保持较好的活性,加入胰酶,将细胞与细胞之间分离,以便后续处理能够是的细胞能够以单个细胞存在。胰酶的处理时间不宜过长,过长会导致细胞被胰酶分解,从而被破坏。之后将分离的细胞放入培养基中培养。这样就能够培养出完整性较好的细胞。最后制得细胞株。
之后将细胞株进一步培养,胎牛血清主要是给细胞生长提供营养,而青霉素和链霉素主要是保证细胞不会被感染,保证细胞的存活率的同时,也保证不会导入其他DNA或者RNA。
而步骤三中,选用姜黄素作为乙酰化的试剂,能够更好地将组织蛋白乙酰化。乙酰化程度更高。使得之后进入步骤四mRNA提取过程中,逆转录的表达更加准确。
在步骤五中,通过设定的参数,能够得到更加准确的诗句。最后通过对比,得到mRNA的表达水平。
而在步骤一中,先将样本碎片通过酒精清洗,先初步清洗掉黏附在样本细胞表面的杂质,之后通过清洗剂浸泡,清洗剂中的去离子水、氯化钠、氯化钾、磷酸二氢钾、磷酸氢二钠能够形成适应细胞生存的体系,特别是胶质瘤细胞,其细胞活性能够得到极大限度的保证,同时通过磷酸甘油和海藻糖的加入,能够进一步保证细胞的活性,特别是蛋白质的活性,是的后期mRNA的表达更加准确。同时,胰酶溶液中EDTA能够提高胰酶的分离细胞的效果,同时海藻糖、丙三醇、磷酸甘油的加入,一方面保证了胰酶溶液的活性,同时液保护细胞组织不会被胰酶过度分解导致细胞失活。
另外在步骤二中的培养基中添加海藻糖、壳聚糖、巯基乙醇、亚硒酸钠,海藻糖能够对肿瘤细胞起到保护作用,使得细胞活性更高,同时亚硒酸钠能够提供细胞生长所需要的微量元素,而壳聚糖不仅仅能够起到保护细胞,提高活性,还能够调整整体液体的粘稠度,是使得细胞生存的环境更加稳定。
在步骤三中姜黄素乙酰化过长中加入去甲氧基姜黄素,能够提高姜黄素的稳定性,提高其乙酰化的表达。
步骤一中,在完成胰酶消化后,通过胰酶抑制剂的加入能够彻底抑制胰酶的分解反应,使得胰酶失活,而不会造成肿瘤细胞的失活,之后再清洗过程中,加入的甘油醇也同样能够对肿瘤细胞形成保护,目的是为了防止胰酶抑制剂对肿瘤细胞产生损伤。
在分离胰酶后,浸泡清洗液也是为了能够去除肿瘤细胞表面的杂质以外,还能够对肿瘤细胞起到一个保护作用。使得后期培养前就保证了肿瘤细胞的活性。
另外,在培养过程中,加入了载体,通过聚乳酸、淀粉、聚苯乙烯制备的载体,是一种环保型载体,给细胞生长提供了一个优质的环境,载体是一个多孔材料是的细胞生长能够有更多的贴壁面积,更好的模拟了生物体内的环境,保证了其细胞培养的成活率以及活性。
而在使用载体后,为了使得细胞从载体上脱落就需要用胰酶溶液进行浸泡,之后冲洗,冲洗下来的冲洗液为了充分利用,倒回到培养基中,进行肿瘤细胞的提取。
对比例1:
选用中国科学院细胞库的大鼠 C6 胶质瘤细胞株,大鼠 C6 胶质瘤细胞株用含10%胎牛血清、100U/ml 青霉素,100U/ml链霉素的DMEM/F12培养基,置于37℃,5% CO2培养箱中培养。取对数生长期细胞培养24 h同步化后进行药 物处理,分别加入Curcumin 继续培养24h。
采用TRIzol一步法从细胞中提取总 RNA,取RNA模板2μg用Prime ScriptTM II逆转录试剂盒行逆转录反应合成cD-NA第一链,再以逆转录反应液1μl作为模板,加入相应引物进行PCR扩增。引物序列见表1。反应条件设置如下:95 ℃预变性30s;95℃变性20S,60℃退火15s; 72℃延伸15s,扩增40个循环。通过溶解曲线分析PCR 产物特异性。每个样品以GAPDH 基因的mRNA表达作为内参照,通过相对定量 (2-△△CT) 法计算目的基因在各样品中相对mRNA的表达水平。
对比例二:
取出生48 h 内的SD大鼠的双侧大脑皮质,剪碎并用PBS冲洗数次,加入0.25 %胰酶37℃消化5min。收集细胞培养于含有10%胎牛血清的DMEM/F12培养液,每周换液两次。在原代培养7-9天后,将培养瓶置于恒温摇床37℃,200rpm,20h震荡纯化,以去除小胶质细胞及少突胶质细胞。经GFAP 免疫荧光鉴定阳性的细胞视为成熟的星形胶质细胞。取第4代的处于对数生长期的细胞用于实验研究。
采用TRIzol一步法从细胞中提取总 RNA,取RNA模板2μg用Prime ScriptTM II逆转录试剂盒行逆转录反应合成cD-NA第一链,再以逆转录反应液1μl作为模板,加入相应引物进行PCR扩增。引物序列见表1。反应条件设置如下:95 ℃预变性30s;95℃变性20S,60℃退火15s; 72℃延伸15s,扩增40个循环。通过溶解曲线分析PCR 产物特异性。每个样品以GAPDH 基因的mRNA表达作为内参照,通过相对定量 (2^-△△CT) 法计算目的基因在各样品中相对mRNA的表达水平。
上述实施例和对比例一均做10次检测,以及对比例二为空白试验对照组,并且记录其2^-△△CT,进行对比,同时记录其标准差。
表1
通过上述数据,可以得出,在癌变细胞中,2-△△CT的表达水平有明显提高。同时通过实施例和对比例一的对比,能够得,通过本发明处理过程后,经过检测的胶质瘤细胞2^-△△CT表达水平更高,同时通过两者方差对比,本发明的检测方法,2^-△△CT的表达水平更加稳定。
以上所述仅是本发明的优选实施方式,本发明的保护范围并不仅局限于上述实施例,凡属于本发明思路下的技术方案均属于本发明的保护范围。应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理前提下的若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。

Claims (10)

1.一种胶质瘤细胞中GDNF基因启动子检测方法,其特征在于:
步骤一:提取胶质瘤细胞:取48h内的胶质瘤样本,首先剪碎并用清洗,加入0.25 %胰酶溶液在37℃条件下消化5min;收集细胞培养于含有10%胎牛血清的DMEM/F12培养液,每周换液两次;在原代培养7-9天后,将培养瓶置于恒温摇床37℃,200rpm,20h震荡纯化,以去除小胶质细胞及少突胶质细胞;
经GFAP 免疫荧光鉴定阳性的细胞视为成熟的细胞,取第4代的处于对数生长期为胶质瘤细胞株;
步骤二:细胞培养:胶质瘤细胞株用含10%胎牛血清、100U/ml 青霉素,100U/ml链霉素的培养基,置于37℃,5% CO2培养箱中培养;
步骤三:药物处理:取对数生长期细胞培养24 h同步化后进行药物处理,加入终浓度为25~100μmol/L的姜黄素继续培养24h;
步骤四:mRNA提取,采用TRIzol一步法从细胞中提取总 RNA,取RNA模板2μg用PrimeScript II逆转录试剂盒行逆转录反应合成cD-NA第一链,再以逆转录反应液1μl作为模板,加入相应引物进行PCR扩增,所述引物的序列为:
GAPDH:F:5’ TCCCTCAAGATTGTCAGCAA3’
R:5’ AGATCCACAACGGATACATT3’
GDNF: F:5’ GACTTGGGTTTGGGCTACGA3’
R:5’ TGGTAAACCAGGCTGTCGTC3’;
步骤五:反应:95 ℃预变性30s;95℃变性20S,60℃退火15s; 72℃延伸15s,扩增40个循环;
步骤六:计算:样品以GAPDH 基因的mRNA表达作为内参照,通过相对定量 (2^-△△CT)法计算目的基因在各样品中相对mRNA的表达水平。
2.根据权利要求1所述的大鼠 C6 胶质瘤细胞中GDNF基因启动子检测方法,其特征在于:所述步骤一中,在将样本剪碎后,通过75%的酒精进行一次清洗,之后通过清洗液中浸泡15min后,在用清洗液冲洗至少三次,所述清洗液包括下列重量份组成:
去离子水 800~1000份
氯化钠 5~10份
氯化钾 0.1~1份
磷酸二氢钾 0.1~1份
磷酸氢二钠 1~2份
磷酸甘油 1~2份
海藻糖 0.1~1份;
再加入0.25 %胰酶溶液在37℃条件下消化5min,所述胰酶溶液包括:0.25%的胰酶、0.02%的EDTA、0.02%的海藻糖、5%的丙三醇、0.5%的磷酸甘油,余量为PBS缓冲液。
3.根据权利要求1所述的胶质瘤细胞中GDNF基因启动子检测方法,其特征在于:所述步骤二中,培养基为以DMEM/F12培养液为基体,再添加海藻糖、壳聚糖、巯基乙醇、亚硒酸钠,所述海藻糖添加量为DMEM/F12培养液质量的0.5%,壳聚糖为DMEM/F12培养液质量的1~5 %,所述亚硒酸钠最终浓度为5~7ng/L。
4.根据权利要求1所述的胶质瘤细胞中GDNF基因启动子检测方法,其特征在于:所述步骤三中,在加入姜黄素进行乙酰化的过程中,同时加入去甲氧基姜黄素,所述去甲氧基姜黄素用量为姜黄素用量的1~5%。
5.根据权利要求1所述的胶质瘤细胞中GDNF基因启动子mRNA检测方法,其特征在于:所述步骤一中,胰酶溶液完成消化后,加入胰酶抑制剂解除胰酶溶液的消化作用,之后加入PBS缓冲液、甘油醇进行稀释,通过高速离心机将整个混合液进行离心,将上清液弃去后,收集细胞培养于含有10%胎牛血清的DMEM/F12培养液。
6.根据权利要求5所述的胶质瘤细胞中GDNF基因启动子检测方法,其特征在于:所述步骤一种,分离得到去胰酶的细胞后,再通过清洗液浸泡5min,浸泡过后在使用清洗剂清洗至少三次,收集细胞培养于含有10%胎牛血清的DMEM/F12培养液。
7.根据权利要求1所述的胶质瘤细胞中GDNF基因启动子检测方法,其特征在于:所述步骤二中的培养基中还添加有载体,所述载体为聚乳酸、淀粉、聚苯乙烯以葡萄糖水溶液为介质在60~80℃下通过聚合反应生成的微孔材料。
8.根据权利要求7所述的胶质瘤细胞中GDNF基因启动子mRNA检测方法,其特征在于:所述载体中以重量份计:聚苯乙烯为30~50份,聚乳酸为5~15份,淀粉为5~15份,葡萄糖水溶液浓度为5~10%。
9.根据权利要求8所述的胶质瘤细胞中GDNF基因启动子检测方法,其特征在于:所述步骤二中,在培养过程中,保持搅拌,所述搅拌速度为30~50r/min。
10.根据权利要求9所述的胶质瘤细胞中GDNF基因启动子检测方法,其特征在于:所述步骤三中,在提取细胞时,先在步骤二培养基中加入0.25%的胰酶、0.02%的EDTA、0.02%的海藻糖、5%的丙三醇、0.5%的磷酸甘油,余量为PBS缓冲液,消化5min后,使得细胞从载体上脱落,取出载体,通过PBS缓冲液冲洗至少三次,冲下来的液体倒回原培养基,加入胰酶抑制剂解除胰酶溶液的消化作用,之后加入PBS缓冲液、甘油醇进行稀释,经过高速离心后的到的细胞,取对数生长期细胞培养24 h同步化后进行药物处理,加入终浓度为25~100μmol/L的姜黄素继续培养24h。
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