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CN104561031A - 柑橘mlo型抗白粉病基因快速鉴定 - Google Patents

柑橘mlo型抗白粉病基因快速鉴定 Download PDF

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CN104561031A
CN104561031A CN201310524961.8A CN201310524961A CN104561031A CN 104561031 A CN104561031 A CN 104561031A CN 201310524961 A CN201310524961 A CN 201310524961A CN 104561031 A CN104561031 A CN 104561031A
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CN
China
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gene
powdery mildew
mlo
tangerines
oranges
Prior art date
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Pending
Application number
CN201310524961.8A
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English (en)
Inventor
钱春桃
其他发明人请求不公开姓名
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Changshu City Dongbang Town Limu Vegetable Profession Cooperatives
Original Assignee
Changshu City Dongbang Town Limu Vegetable Profession Cooperatives
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Abstract

本发明是快速鉴定柑橘抗白粉病基因;涉及到植物比较基因组学,遗传学和生物信息学等学科知识,属于植物生物技术科学领域。该发明主要步骤为:1)柑橘全基因组序列的下载及MLO型基因的采集;2)MLO型基因的鉴定;3)MLO型基因系统发育关系;4)MLO型白粉病基因的比对。该发明有效的缩短了柑橘白粉病基因挖掘周期,有利于白粉病基因的快速鉴定;通过鉴定的候选白粉病基因开发相应的共分离功能性标记(SNP、SCAR等),还可以快速的用于抗白粉病基因的分子标记辅助选择,准确性高;结合其它抗病基因分子标记可进行多抗性育种材料的创制,缩短育种年限,提高育种效率;为阐述柑橘抗白粉病分子机制奠定了基础。

Description

柑橘MLO型抗白粉病基因快速鉴定
技术领域
本发明是借助于柑橘测序全基因组序列,利用植物比较基因组学、遗传学、生物信息学和候选基因策略等方法快速鉴定柑橘白粉病基因,主要涉及到柑橘全基因组序列的下载,候选基因的鉴定,基因的比对,聚类等手段,进而鉴定出白粉病基因,属于植物生物技术科学领域。
背景技术
柑橘属于芸香科柑橘属,是一种常绿小乔木或灌木。柑橘果实营养丰富,色香味兼优,既可鲜食,又可加工成以果汁为主的各种加工制品。柑橘产量居百果之首,柑橘汁占果汁的3/4,广受消费者呃青睐。柑橘维生素C含量最高,是人体最好的维生素C供给源。橘皮所含营养丰富,尤其富含维生素B1,维生素C、维生素P和挥发油,挥发油中主要含柠檬烯等物质。橘皮中含有的维生素C远高于果肉,维生素C为抗坏血酸,在体内起着抗氧化的作用,能降低胆固醇,预防血管破裂或渗血;维生素C、维生素P配合,可以增强对坏血病的治疗效果;经常饮用橘皮茶,对患有动脉硬化或维生素C缺乏症者有益。柑橘白粉病发病症状在嫩叶正、反两面呈现白色霉斑,大多近圆形,外观疏松,霉斑常由中心向外扩散。霉层下面叶片组织最初呈水渍状,以后逐渐失绿,形成黄斑。严重时病斑扩及全叶,使较嫩的叶片枯萎,较老的叶片扭曲畸形。柑橘白粉病的防治主要靠化学防治,但长期使用药物会导致环境污染和病菌生理小种变异,因此推广抗病品种是最安全有效的方法。但目前尚无柑橘白粉病研究方面的文献报道,这严重阻碍了柑橘白粉病研究的步伐。
MLO基因是植物中特异的一类基因,它对植物的抗病过程起负调控作用。研究者最早发现MLO基因对白粉病抗性是始于1937-1938年,由德国人在埃塞俄比亚采集了很多品种的大麦,其中的两个株系对白粉病菌(Blumeria.graminisf.sp.hexleiBgh)所有已知的生理小种都具有高效抗性。进一步研究表明,大麦中MLO基因的隐性突变mlo可以使大麦对几乎所有已知大麦白粉病菌的生理小种产生持久、广谱的抗性。最近,研究发现番茄,豌豆、拟南芥、蔷薇、辣椒、百脉根等很多植物的白粉病基因都是MLO型抗病基因控制。因此挖掘植物中的MLO型抗病基因对植物抗白粉病育种具有重要的意义。目前,常用挖掘抗病基因常用的方法有图位克隆,转座子标签等方法。但是由于柑橘的基础研究不够深入,因此利用这些方法不仅时间长而且很难准确地克隆这些基因。
MLO是人们发现的第一个抗病基因。由于长期的进化过程中使植物形成了使自身免受病原物的侵害,一系列抗病相关基因的表达和调控。Mlo基因就是植物抗病基因中的重要成员,该基因最初在大麦中被发现,这类基因在植物中编码一个七次跨膜结构域的蛋白家族,可能起到与G蛋白偶联受体类似的功能。它们的拓扑结构,亚细胞定位和序列多样化与动物和真菌的G蛋白偶联受体很相似。野生型MLO基因是大麦抗白粉病的负调控因子,可赋予大麦对白粉菌的广谱抗性。已有的研究表明,MLO基因在许多作物里呈家族形式,具有多个家族成员,其中拟南芥中有15个家族成员。在玉米中发现至少有9个。在水稻中有12个家族成员,由于其他植物的全基因组测序上作的滞后等因素,在大麦,小麦、莲藕、辣椒、番茄等作物上相对很少有MLO家族其它成员被发现。白粉病是由白粉菌引起的真菌性病害,白粉菌能侵染650多种单子叶植物和9000多种双子叶植物。
植物比较基因组学(comparative genomics)又称比较遗传学,是指在不同物种之间利用共同的标记构建图谱或对不同物种基因组相应部分(或全部)区域进行测序,比较它们之间的基因数目、相对位置、结构关系等,以揭示不同物种之间的基因家族成员数目和排列顺序的异同。一般来讲,比较基因组学主要包括两个方面:基于遗传图谱的宏观共线性和基于物理图谱或测序的微观共线性。利用模式植物基因组与其它植物基因组之间编码顺序上和结构上的同源性,克隆其他植物基因,揭示基因功能和分子机制,阐明物种进化关系及基因组的内在结构。植物比较基因组学的重要性在于它把不同的学科、不同的生物种类联系在一起,架起了基础研究和应用研究之间的桥梁。跨种、跨属、跨界的基因组比较对我们了解基因及基因组的结构、基因结构与功能的关系及DNA变化如何导致生物多样性等有十分重要的意义。
本专利所采用的方法及思路:模式植物拟南芥基因组研究已经揭示了MLO型基因的功能,利用基因其顺序上的同源性克隆柑橘MLO型抗病基因,根据模式植物拟南芥实验系统上的优越性和已知MLO型抗病基因的特点,快速“捕捉”柑橘抗白粉病基因。本专利介绍了以柑橘全基因组序列为前提,结合比较基因组学、遗传学、基因组学、生物信息学和候选基因策略等知识,快速挖掘白粉病基因。
发明内容
技术问题
本发明的目的是提供一种通过结合植物比较基因组学、植物遗传学、基因组学和生物信息学等知识,快速挖掘柑橘抗白粉病基因。其结果一方面可用于柑橘白粉病基因紧密连锁分子标记的开发,进行分子标记辅助选择育种,另一方面也为其他作物白粉病基因鉴定提供参考依据。
技术方案
主要原理:第一个植物抗白粉病基因(MLO)是从大麦中克隆的,研究发现此基因是一类特殊的抗病基因,不同于先前克隆的大多数NBS(nucleotide-binding site)类型抗病基因;随后,研究者相继从番茄、拟南芥、豌豆、辣椒、百脉根等植物中克隆了白粉病基因,研究发现这些基因编码的都是MLO型抗病基因。随后,众多研究者通过多次试验证实MLO型抗病基因已经成为植物特有的一类抗白粉病基因。进一步发现,植物MLO类型基因是一个基因家族;而且对来源于不同物种的MLO基因家族进行系统发育关系分析发现,不同物种中抗白粉病基因总是聚类一起,成为一类,这一类MLO基因都具有抗白粉病基因序列的典型特征。柑橘基因组测序的完成为挖掘白粉病基因提供了一条便利途径。因此,可以借助于已经测序的柑橘全基因组中MLO基因家族和已经克隆的MLO白粉病基因的系统发育关系以及对于维持白粉病基因MLO重要功能的氨基酸保守性来鉴定柑橘白粉病基因。
主要步骤如下:
1)柑橘全基因组序列的下载及其MLO型基因的采集
首先从柑橘测序基因组数据库(http://citrus.hzau.edu.cn/orange/index.php)下载柑橘全基因组序列;使用“DNATOOLS”软件对获得的柑橘全基因组氨基酸序列数据建立数据库,然后用pfam数据库(蛋白家族数据库,http://pfam.janelia.org/search/sequence)中的隐马尔可夫模型(HMM)对MLO结构域的氨基酸序列与已建立的柑橘全基因组氨基酸序列数据库进行Blastp(E-value=0.001)序列比对,初步筛选出候选基因序列。其次,利用已经公布的MLO型基因序列,对柑橘基因组数据库进行BLAST比对,获得候选基因序列。
2)柑橘MLO型基因家族的鉴定
将上述结果中得到的同源氨基酸序列的候选基因,通过Pfam(E-value=1.0)进行分析,去除无‘MLO’结构域的基因序列(图1)。再将候选抗病基因序列通过MEGA3.1软件提供的ClustalW工具(多序列比对程序)进行多序列比对,去除重复序列。
3)通过植物MLO型基因的系统发育关系鉴定候选的柑橘MLO型白粉病基因
由于先前的研究已经证明,双子叶植物MLO型白粉病基因位于植物MLO基因系统发育树同一区组,因此在系统发育关系研究中,我们把拟南芥的MLO型基因家族和一些其他作物的MLO型抗白粉病基因和柑橘MLO型基因一起聚类分析,以获得候选的柑橘抗白粉病基因(图2)。
4)柑橘白粉病基因与已知的植物MLO白粉病基因的比对
利用BioXM2.6软件将柑橘候选的MLO型白粉病基因和拟南芥、番茄、豌豆、大麦的MLO白粉病基因的氨基酸序列转换成Fasta格式的文件,将这些文件导入BioEdit7.0软件,运用此软件中Clustal软件进行多序列比对,揭示候选白粉病基因重要氨基酸残基及区域的保守性。从而进一步鉴定柑橘候选的白粉病基因(图3)。
本发明的积极效果:
1)缩短了柑橘白粉病基因挖掘周期,有利于白粉病基因的快速鉴定。采用常规方法(图位克隆、转座子标签等)挖掘抗白粉病基因不仅耗时耗力、效率低,且难以成功。本发明基于植物比较基因组学、遗传学、生物信息学方法快速挖掘柑橘白粉病基因,不仅可以缩短时间,还可以提高白粉病基因鉴定效率。
2)柑橘是全世界重要果树之一。由于相橘遗传基础狭窄,种质资源多样性低,因此通过常规的分子标记(RAPD、ISSR、SSR、AFLP等)鉴定柑橘白粉病基因比较困难。通过鉴定的候选白粉病基因开发相应的共分离功能性标记(SNP、SCAR等),可以快速的用于抗病基因的分子标记辅助选择,准确性高。
3)多抗性育种材料的创制。基于新鉴定的白粉病基因开发的功能性分子标记,结合已经定位的其他抗病基因的分子标记,进行多抗性育种材料的创制,可以缩短育种年限,提高育种效率。
4)为阐述柑橘抗白粉病分子机制奠定了基础。柑橘抗白粉病基因的鉴定,通过转基因技术、RNAi、病毒诱导的基因沉默(virus induced gene silencing,VIGS)技术等研究抗白粉病的分子机制提供了基因资源,有利于快速阐述柑橘抗白粉病的作用机理。
附图说明
图1柑橘MLO基因的鉴定;
本图显示的是27个MLO型基因鉴定结果,每一个基因都含有一个‘MLO’保守结构域。
图2植物MLO基因家族的系统发育关系分析及其柑橘MLO型白粉病基因的鉴定;
拟南芥是植物科学研究的模式植物,在构建系统发育树中,拟南芥的15个MLO型基因(其中3个基因是白粉病基因:AtMLO02,AtMLO06和AtMLO12)、番茄抗白粉病基因(SlMLO)、大麦白粉病基因(HvMLO)和豌豆的白粉病基因(PsMLO)被选择用来和柑橘MLO型基因聚类分析。共鉴定出3个柑橘候选的MLO型白粉病基因。图中斜体标记的基因就是候选柑橘白粉病基因。
图3柑橘MLO型白粉病基因的比对分析;
3个柑橘白粉病基因与大麦(HvMLO)、番茄(SlMLO)、豌豆(PsMLO)、拟南芥白粉病基因(AtMLO02,AtMLO06和AtMLO12)进行比对,鉴定白粉菌侵染有重要作用的氨基酸残基和区域的保守型。图中TM1-TM7表示柑橘MLO型白粉病基因的7个转模区域;黑色圆点表示白粉菌侵染重要的氨基酸残基;CaMBD表示钙调蛋白结合区;I和II表示对白粉菌侵染重要的氨基酸区域。
具体实施方式
抗病基因的鉴定在作物抗病遗传理论研究和抗病品种选育中具有重要的作用。本方法可以快速鉴定出柑橘白粉病基因。具体实施过程如下:
1)柑橘MLO型基因的采集及鉴定
为了获得柑橘全部的MLO型基因家族成员,我们首先以拟南芥的MLO型基因,番茄、豌豆、辣椒、蔷薇、辣椒、百脉根的抗白粉病MLO基因序列构建HMM模型,从柑橘基因组序列中收索MLO型基因;其次以不同作物中已经发表的MLO基因序列作为靶序列(来自DFCI数据库:TC171015,TC267529,DFCI:TC327983,TC289653,TC312087,TC132500,TC133436,TC317623,TC317025,TC315947,TC325903,TC315944,TC315912,TC322759,TC322059,TC330654,TC282713,TC293173,TC281861,TC283253,TC283383,TC285032,TC290021,TC302716,TC283487,TC282866,TC283441,TC281428,TC285118,TC285090;来自GenBank数据库:AY967408,AF384145,AF384144,AY029312-AY029315,AY029317-AY029319,Z95352,AF369563-AF369565,AF369567,AF369569-AF369576,Z83834,Z95496,AY581255),对柑橘数据库(http://www.phytozome.net/search.php)进行BLAST比对,选择相似度最高的序列进行下载,共获得了27条候选的MLO型基因(Cs8g16920.1;Cs8g16920.2;Cs8g16910.1;Cs8g16910.2;Cs8g16910.3;Cs3g27540.1;Cs7g27330.1;Cs1g26710.1;Cs3g27560.1;Cs2g05450.1;Cs1g26710.2;Cs3g01070.1;Cs7g16050.2;Cs5g20600.2;Cs5g20590.1;Cs1g06980.1;Cs7g16050.3;Cs7g16050.1;Cs5g20600.1;Cs7g16050.4;Cs5g20600.3;Cs1g06980.2;Cs1g06980.3;Cs1g25610.1;Cs3g03660.1;orange1.1t05228.1;orange1.1t05047.1)。
2)柑橘MLO型基因家族的鉴定
为了进一步验证这些MLO基因准确性,我们对这27个候选的MLO基因进行了保守结构域“MLO”的鉴定。以每一个候选的MLO型基因的氨基酸序列为基准,在PFAM(http://pfam.sanger.ac.uk/)网站上进行‘MLO’保守结构域的鉴定,具体结果见图1。
3)柑橘MLO型基因的系统发育关系分析
在先前的研究中,发现双子叶植物白粉病基因聚合成一个区组;因此,在构建系统发育树中,我们选择了模式植物拟南芥的15个MLO型基因(其中3个基因是白粉病基因:AtMLO02,AtMLO06和AtMLO12)、番茄抗白粉病基因、大麦白粉病基因和豌豆的白粉病基因和柑橘MLO型基因聚类分析一起聚类分析。将柑橘MLO型基因和其他作物白粉病基因蛋白质序列进行多序列联配(采用Clustal X1.83软件进行),并利用Genedoc软件(http://www.nrbsc.org/gfx/genedoc/index.html)显示多序列联配的结果。将Clustal多序列联配的结果输出到MEGA4.0软件中,并利用此软件分别构建了邻接树(neighbor-joining,NJ),利用Bootstrapping方法对这些进化树进行了评估。结果发现在双子叶植物抗白粉病基因区组内,存在3个柑橘候选的MLO型白粉病基因(见图2)。
4)柑橘MLO型抗病基因的比对
在大麦MLO型白粉病基因研究中,研究中相继发现了一些重要区域和单个氨基酸,它们对大麦白粉菌侵染有着不可替代的作用。为了鉴定3个候选的柑橘白粉病基因中,这些重要区域和氨基酸是否高度保守,我们对来自拟南芥的3个抗白粉病基因(AtMLO02、AtMLO6和AtMLO12)、番茄白粉病基因(SlMLO)、豌豆白粉病基因(PsMLO)进行了比对分析。发现柑橘3个候选的白粉病基因与已知的MLO型白粉病基因7个跨膜区,30个重要的氨基酸,1个钙调蛋白结合区(CaMBD)和两个重要的区域(I和II)高度保守(图3)。

Claims (2)

1.柑橘抗白粉病基因,其特征在于选自下列3个基因或其之一:
1Cs8g16910.2
氨基酸:
MAGASGGRSLEETPTWAVAVVCFVLVTISIIIEHIIHLIGKWLTKKHKRALYEALEKIKSELMLLGFISLLLTVAGSWISKICIPESVANTWHPCDKEREAELNNEKETTEQETTEHENRRRLLAAVAASGGSIRRALAAGSTTDKCSKGKVPFVSEDGLHQLHIFIFVLALFHVLYSILTMALSRAKMKKWKKWEKETRTIEYQFSHDPERFRFARETSFGRRHLSSWTKTPVLIWIVCFFRQFVRSVPKVDYLTLRHGFVTAHLAPQSHTQFNFQKYINRSLEEDFKVVVGISPLIWFFAVVFLLFNTHGWYAYLWLPFIPLIVILLVGTKLQVIITKMGIRIQERGEVLKGVPVVQLGDDLFWFSQPRLILYLINFVLFQNAFQLAFFAWSWFEFGIESCFHEHTEDIVIRITMGYVTLPLYALVTQMGSNMKPTIFNERVAAALKNWHHTAKKHIKQNKGSVTPLSSRPSTPSYNMSPVHLLRHYRGEMDSVQTSPRRSMEQYLDSESPSPSHTFHGEGSSPHHIEQGFYIEYNKGANDPGPSQQHEIDIVTTKEFSFDKRTIT
核苷酸:
ATGGCCGGAGCTAGCGGAGGAAGATCTTTGGAGGAGACGCCGACATGGGCCGTTGCGGTCGTTTGTTTTGTTTTGGTTACGATTTCAATAATTATCGAGCACATAATCCATCTTATCGGAAAGTGGCTGACAAAGAAACACAAGAGAGCTTTATACGAAGCACTCGAAAAGATCAAATCAGAGTTGATGCTACTGGGGTTCATATCGTTGCTACTAACAGTAGCAGGTAGTTGGATATCAAAAATATGCATACCAGAAAGTGTAGCAAATACATGGCATCCATGCGATAAGGAAAGAGAAGCAGAGCTAAACAATGAGAAGGAGACTACTGAACAAGAAACGACAGAACACGAAAACCGCCGGAGGCTTCTGGCGGCGGTGGCCGCCTCGGGTGGAAGTATCCGAAGAGCTTTGGCGGCGGGATCAACAACCGACAAATGTTCCAAGGGCAAAGTTCCATTTGTGTCTGAGGACGGTCTCCATCAACTCCATATTTTCATCTTTGTCTTAGCACTTTTCCATGTCCTTTACAGTATCCTTACAATGGCCTTGAGCAGAGCCAAGATGAAGAAGTGGAAGAAATGGGAAAAGGAAACAAGAACCATTGAGTATCAGTTCTCTCACGATCCTGAGAGGTTCAGATTTGCAAGAGAGACATCGTTTGGCAGGAGGCATTTGAGTTCGTGGACCAAGACACCTGTCCTCATTTGGATAGTTTGTTTCTTCAGGCAATTTGTTCGGTCGGTTCCCAAGGTTGATTACTTAACTCTCAGGCATGGATTTGTCACGGCACATTTGGCACCACAAAGCCATACCCAATTTAACTTCCAAAAATACATCAATAGGTCACTGGAAGAGGATTTCAAGGTGGTTGTGGGAATCAGTCCATTAATCTGGTTCTTCGCAGTGGTGTTTCTGCTTTTCAACACTCATGGCTGGTATGCTTATCTATGGCTACCCTTTATCCCATTAATTGTGATCTTGCTGGTGGGAACCAAGCTGCAAGTGATCATAACCAAAATGGGAATTAGAATTCAAGAAAGAGGAGAAGTTCTAAAGGGAGTTCCAGTAGTTCAGCTTGGTGATGACCTGTTTTGGTTCAGTCAGCCTCGCCTCATTCTTTATCTCATCAACTTTGTTCTCTTTCAGAACGCCTTTCAGCTAGCTTTCTTTGCATGGAGTTGGTTTGAGTTCGGGATCGAATCTTGTTTCCATGAGCATACAGAGGACATAGTCATCAGAATCACAATGGGCTATGTCACTCTCCCACTCTATGCCCTGGTAACTCAGATGGGTTCAAATATGAAACCAACCATATTCAACGAAAGAGTAGCAGCAGCTCTAAAGAATTGGCATCATACAGCCAAAAAACACATTAAACAAAACAAAGGGTCTGTGACACCTTTGTCCAGCAGGCCATCCACCCCATCCTACAACATGTCTCCGGTGCACCTCCTCCGCCATTACCGGGGCGAAATGGACAGCGTCCAGACGTCACCGAGAAGATCCATGGAGCAG TATTTGGACTCCGAGTCACCGTCTCCGTCGCACACGTTCCACGGCGAAGGCTCATCGCCACACCACATTGAACAAGGTTTCTACATAGAATATAACAAGGGTGCAAATGACCCGGGGCCTAGCCAACAACATGAGATCGATATTGTAACAACGAAAGAATTTTCGTTTGATAAGAGGACAATTACATAA
2Cs8g16910.3
氨基酸:
MAGASGGRSLEETPTWAVAVVCFVLVTISIIIEHIIHLIGKWLTKKHKRALYEALEKIKSELMLLGFISLLLTVAGSWISKICIPESVANTWHPCDKEREAELNNEKETTEQETTEHENRRRLLAAVAASGGSIRRALAAGSTTDKCSKGKVPFVSEDGLHQLHIFIFVLALFHVLYSILTMALSRAKMKKWKKWEKETRTIEYQFSHDPERFRFARETSFGRRhLSSWTKTPVLIWIVCFFRQFVRSVPKVDYLTLRHGFVTAHLAPQSHTQFNFQKYTNRSLEEDFKVVVGISPLIWFFAVVFLLFNTHGWYAYLWLPFIPLIVILLVGTKLQVIITKMGIRIQERGEVLKGVPVVQLGDDLFWFSQPRLILYLINFVLFQNAFQLAFFAWSWFEFGIESCFHEHTEDIVIRITMGVLIQILCSYVTLPLYALVTQMGSNMKPTIFNERVAAALKNWHHTAKKHIKQNKGSVTPLSSRPSTPSYNMSPVHLLRHYRGEMDSVQTSPRRSMEQYLDSESPSPSHTFHGEGSSPHHIEQGFYIEYNKGANDPGPSQQHEIDIVTTKEFSFDKRTIT
核苷酸:
ATGGCCGGAGCTAGCGGAGGAAGATCTTTGGAGGAGACGCCGACATGGGCCGTTGCGGTCGTTTGTTTTGTTTTGGTTACGATTTCAATAATTATCGAGCACATAATCCATCTTATCGGAAAGTGGCTGACAAAGAAACACAAGAGAGCTTTATACGAAGCACTCGAAAAGATCAAATCAGAGTTGATGCTACTGGGGTTCATATCGTTGCTACTAACAGTAGCAGGTAGTTGGATATCAAAAATATGCATACCAGAAAGTGTAGCAAATACATGGCATCCATGCGATAAGGAAAGAGAAGCAGAGCTAAACAATGAGAAGGAGACTACTGAACAAGAAACGACAGAACACGAAAACCGCCGGAGGCTTCTGGCGGCGGTGGCCGCCTCGGGTGGAAGTATCCGAAGAGCTTTGGCGGCGGGATCAACAACCGACAAATGTTCCAAGGGCAAAGTTCCATTTGTGTCTGAGGACGGTCTCCATCAACTCCATATTTTCATCTTTGTCTTAGCACTTTTCCATGTCCTTTACAGTATCCTTACAATGGCCTTGAGCAGAGCCAAGATGAAGAAGTGGAAGAAATGGGAAAAGGAAACAAGAACCATTGAGTATCAGTTCTCTCACGATCCTGAGAGGTTCAGATTTGCAAGAGAGACATCGTTTGGCAGGAGGCATTTGAGTTCGTGGACCAAGACACCTGTCCTCATTTGGATAGTTTGTTTCTTCAGGCAATTTGTTCGGTCGGTTCCCAAGGTTGATTACTTAACTCTCAGGCATGGATTTGTCACGGCACATTTGGCACCACAAAGCCATACCCAATTTAACTTCCAAAAATACATCAATAGGTCACTGGAAGAGGATTTCAAGGTGGTTGTGGGAATCAGTCCATTAATCTGGTTCTTCGCAGTGGTGTTTCTGCTTTTCAACACTCATGGCTGGTATGCTTATCTATGGCTACCCTTTATCCCATTAATTGTGATCTTGCTGGTGGGAACCAAGCTGCAAGTGATCATAACCAAAATGGGAATTAGAATTCAAGAAAGAGGAGAAGTTCTAAAGGGAGTTCCAGTAGTTCAGCTTGGTGATGACCTGTTTTGGTTCAGTCAGCCTCGCCTCATTCTTTATCTCATCAACTTTGTTCTCTTTCAGAACGCCTTTCAGCTAGCTTTCTTTGCATGGAGTTGGTTTGAGTTCGGGATCGAATCTTGTTTCCATGAGCATACAGAGGACATAGTCATCAGAATCACAATGGGGGTCCTCATTCAGATACTTTGCAGCTATGTCACTCTCCCACTCTATGCCCTGGTAACTCAGATGGGTTCAAATATGAAACCAACCATATTCAACGAAAGAGTAGCAGCAGCTCTAAAGAATTGGCATCATACAGCCAAAAAACACATTAAACAAAACAAAGGGTCTGTGACACCTTTGTCCAGCAGGCCATCCACCCCATCCTACAACATGTCTCCGGTGCACCTCCTCCGCCATTACCGGGGCGAAATGGACAGCGTCCAGACGTCACCGAGAAGATCCATGGAGCAGTATTTGGACTCCGAGTCACCGTCTCCGTCGCACACGTTCCACGGCGAAGGCTCATCGCCACACCACATTGAACAAGGTTTCTACATAGAATATAACAAGGGTGCAAATGACCCGGGGCCTAGCCAACAACATGAGATCGATATTGTAACAACGAAAGAATTTTCGTTTGATAAGAGGACAATTACATAA
3Cs2g05450.1
氨基酸:
MAGETTVEERSIEVTPTWAVATVCLMLISVSVLIEHLLHLLAKYFNKKKKSSLIQTLHKIKSDLMMLGFMSLILTVSEKRISNICIPKSMAETFLPCGTMDSDDYSEEELKCLEQGKVSLLSRKGVNQLQYLIFVLAFFHSLSCVLTFSLGMAKMRSWESVWEAETRTLEYQFTNDPRRFRFTHQTSFGKRHLRFWSEHSRLLRWPACFLRQFYASVSRTDYLTLRRGFITAHFAKESHFNFQRYINRALEKDFGMVAGMSWWIWIISVLFIFFNAQGFYNYLWLPFIPLVMLLVVGTKLEGIITQMCLDSHGKSQVVIGPLLVRPSDHYFWFNWPKLLLHVIHLVLLQNSFQLAFFAWTWYKFGLRSCFHEKTEDIIIKIVLGVVVHMLCGYVTLPLYALVTQVIN
核苷酸:
ATGGCTGGAGAGACAACAGTTGAAGAAAGATCAATTGAAGTAACGCCAACATGGGCTGTGGCAACGGTTTGCCTCATGTTGATATCCGTTTCTGTTCTTATTGAGCATTTACTTCATCTTTTAGCTAAGTATTTCAATAAGAAGAAGAAGAGCTCCCTCATTCAGACTCTCCACAAGATCAAATCAGACCTGATGATGTTGGGGTTCATGTCATTGATCCTGACTGTGAGTGAAAAGCGGATTTCAAATATATGCATACCAAAGAGCATGGCCGAAACTTTTTTACCTTGCGGCACCATGGACTCGGATGATTATAGCGAGGAAGAACTCAAATGTTTGGAGCAGGGGAAGGTCTCTTTGTTGTCAAGGAAAGGTGTGAATCAACTTCAGTATTTGATATTTGTTCTGGCCTTTTTCCATTCTTTGTCCTGCGTTCTGACATTCAGTCTCGGCATGGCCAAGATGCGAAGTTGGGAATCTTGGGAAGCAGAAACGAGAACTTTAGAGTATCAATTTACAAATGATCCACGGAGGTTCCGATTCACCCATCAAACATCATTTGGGAAGCGCCACCTGAGGTTTTGGAGTGAACACAGCAGATTACTTCGTTGGCCGGCATGCTTTCTGCGACAGTTTTATGCATCTGTGTCCAGAACAGATTATTTAACCCTAAGGCGTGGATTCATCACGGCGCATTTTGCAAAGGAAAGCCACTTTAATTTCCAAAGATACATAAATAGAGCCTTAGAAAAAGATTTTGGAATGGTGGCAGGAATGAGCTGGTGGATTTGGATAATCTCAGTACTTTTCATATTCTTCAATGCACAAGGATTTTACAATTATTTATGGCTTCCCTTCATACCTTTAGTGATGCTATTGGTGGTGGGAACTAAGCTGGAAGGCATTATAACTCAGATGTGCTTAGATAGCCATGGCAAATCTCAAGTCGTTATAGGACCTTTGCTTGTTAGGCCTAGTGACCATTATTTTTGGTTTAACTGGCCTAAACTGCTTCTACACGTCATTCACTTGGTATTGCTTCAGAATTCTTTTCAACTGGCATTCTTTGCATGGACTTGGTACAAATTTGGACTGAGATCTTGTTTCCACGAGAAAACAGAAGACATTATCATAAAGATAGTGTTGGGAGTGGTAGTACACATGCTTTGTGGCTATGTAACGCTACCTCTCTATGCTTTGGTGACACAGGTAATTAACTAG
2.权利要求1所述快速鉴定柑橘白粉病基因的应用,包括:
1)携带有抗白粉病MLO基因的育种材料的创制或者新品种创制:利用权利1所给出的MLO基因源为亲本材料,在杂交、回交后代中,可以获得转育有MLO抗性基因的育种材料。
2)抗白粉病基础理论研究:对权利1的MLO型抗白粉病基因进行分子标记分析;对该基因进行分子作图或者基因定位;对该基因进行克隆以及基因间互作分析。
3)抗白粉病转基因研究:利用权利要求1所给出的MLO型白粉病基因进行转基因研究。
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Title
陈玲等: "不同物种Mlo基因生物信息学分析", 《西南农业学报》 *

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