故事主怎是一個名叫小智的男孩，今年剛滿10歲，住在真新鎮中，與母親相依為命。原來在那裡，任何人只要一滿十歲，就可以獲得神奇寶貝使用執照，並從神奇寶貝博士大木博士手中領取一隻神奇寶貝。小智為了要成為一流的神奇寶貝大師，而必須踏上修行的旅程接受考驗，不料出發的當天，小智卻因為睡懶覺而誤了時間，比其他人晚了一步，好不容易從博士那裡領來沒人要的「皮卡丘」，誰知「皮卡丘」卻難以照料又特別固執。就在前往下一站常盤市的途中，他們遇上了麻煩！皮卡丘被野生神奇寶貝襲擊，危在旦夕……成功是必須靠團隊的努力與默契……就這樣，小智和皮卡丘就此展開他們艱辛的冒險旅程……

在現世，死神朽木露琪亞突然闖進了從小就有強大靈力的少年—黑崎一護的臥室，緊接著一隻名為虛的怪物攻擊了一護的家人，一護和露琪亞一起投入了消滅虛的戰鬥中。露琪亞在戰鬥中受傷並無法行動，所以她只得把斬魄刀插進一護的身體裡，藉此把死神的靈力給一護，讓他變成一位死神。從此，擁有了「為了守護」所需力量的少年，他的生活，發生了翻天覆地的變化……

A mysterious organization is interested in fledging duelist Shobu Kirifuda's ability to bring Duel Master creatures to life. With the support of his friends, Shobu duels with passion, discipline, and heart as he strives to be like his father and become the next Kaijudo master.

故事以江戶時代後期為舞台，最強死刑犯忍者「畫眉丸」為了能再次與最愛的妻子見面，與處刑人「山田淺右衛門佐切」一同前往被稱為極樂淨土的小島，找尋「不老不死的仙藥」以換取無罪釋放，並在島上與神秘的怪物以及其他死刑犯互相殘殺。

「精靈寶可夢」簡稱「寶可夢」，是種神秘又不可思議的生物。既有與人類和睦共處的寶可夢，也有棲息於草叢、洞窟和海洋等地方的野生寶可夢。關於牠們的生態，至今仍然存在著許多未解的謎團。

持有不可思議吊墜，來自帕底亞的少女「莉可」。持有神秘精靈球，來自關都的少年「羅伊」。以廣闊的寶可夢世界為舞台，莉可和羅伊的新冒險即將展開！即將迎來未知邂逅的兩人，命運將會是⋯！？

這是關於在探險中「尋找」重要事物的故事。

每一個人，都有不能展現給任何人看的一面──這是個世界各國都在檯面下進行激烈情報戰的時代。東國與西國，兩國之間已持續冷戰了十多年。隸屬於西國情報局對東課〈WISE〉的幹練間諜〈黃昏〉，被指派一項極機密任務，奉命接近威脅東西和平的危險人物，要刺探出東國國家統一黨黨魁──唐納文‧戴斯蒙德的戰爭計畫。其任務名為──行動代號〈梟〉。任務內容是：「在一週內組好家庭，並潛入戴斯蒙德兒子所就讀的名校。」於是〈黃昏〉扮起精神科醫生──洛伊德‧佛傑，開始組織家庭。然而，他找到的女兒‧安妮亞是會讀心的超能力者，妻子‧約兒則是位暗殺者！由於利害一致，三人便互相隱瞞真實身分，並展開共同生活。世界的和平，就這樣被託付給狀況百出的臨時家庭──

《遊戲王5D's》的故事主要發生在新童實野市裡，除了在〈毀滅鎮〉篇裡場景短暫轉往毀滅鎮之外，多數的情節都發生在該市的不同區域[4]。新童實野市是《遊戲王－怪獸之決鬥》裡的童實野市經過數十年後的模樣，呈現階級社會。市內被分為數個區域，頂級區為尊、衛星區為卑。由治安維持局管理。在新童實野市裡盛行騎乘決鬥（ライディングデュエル），決鬥者駕駛著一種名為「D輪」的摩托車型決鬥盤，同時進行駕駛和決鬥。整個城市的能源建立於永轉機（モーメント，Moment）之上，永轉機是主角不動遊星的父親──不動博士開發、海馬娛樂集團管理的能源系統，是決鬥盤、D輪、立體影像系統的動力來源。而故事開始的17年前，因為第1號永轉機控制系統不完全運轉而引發的事故零點逆轉（ゼロ・リバース），造成鄰近的市區與衛星區地面裂開，身為負責人的遊星雙親死亡，主角也因此成為孤兒。

本作品是繼承了動畫《遊戲王－怪獸之決鬥》世界觀的新系列第2部。男主角從原作的武藤遊戲更換為遊城十代，一些基礎設定也煥然一新。但舞台與《遊戲王－怪獸之決鬥》是同一個世界，也有數名前作的人物登場。故事共分為四季，主要場景是在島嶼上的學院「決鬥學院」，為三年制、全住宿制。學生分為三個等級，從低到高分別是「歐西里斯紅」、「太陽神黃」、「歐貝利斯克藍」，而主角遊城十代就讀歐西里斯紅。該島嶼上除了校舍主要建築外，也有河川、森林、火山等環境，以及宿舍、港口等設施。學院的課程以教授決鬥為主，也教授一般課程，亦會舉辦現實學校中存在的活動。

一位因為看得見妖怪而被人類疏遠的女子夏目玲子，為了打發寂寞的日子，她向妖怪們發起挑戰，並將敗在自己手下的妖怪的名字寫在一紙契約上，以此做為妖怪們成為自己屬下的證據。

玲子的孫子夏目貴志得到了那些契約書所做成的『友人帳』，還繼承了玲子的力量，能看到不會顯現在人前的物體。而且也和玲子一樣成為了被周圍人疏遠的一員。

可是，作為唯一繼續了玲子血統的他卻做出了一個重要的決定：將玲子奪過來的姓怪們的名字一一歸還。在這樣的夏目的身邊，開始聚集起各種各樣的妖怪們……

能看到妖怪的少年夏目貴志，與招財貓外表的妖怪喵先生一起，將為大家講述一個奇異、悲傷，懷念、令人感動的夏日怪談故事。

雷門中學的足球部是一個僅有7名部員的弱小隊伍。社團活動室內聚集了一批擁有各自愛好，度過糜爛每一日的部員。

熱血足球少年的隊長·圓堂守激勵部員們“為了明天的比賽練習吧！”。其中居然有強隊帝國學園那裡發來的比賽邀請。但是要比賽的話還缺少4人。而且如果不參賽的話將會關係到足球部的存活。所以無論如何為了要實現與帝國學園的比賽，圓堂開始致力於一個人練習。

某一天，圓堂與擁有必殺射門技“烈焰龍捲風”的“傳說中的前鋒”豪炎寺修也相遇了，且遊說他入隊。其它成員找齊了。在比賽當日圓堂守他們以大比數落後，在一位隊員退場以後，豪炎寺修也代替他加入比賽並進了一球。最後帝國學園竟然放棄比賽，因此算是雷門中獲勝。為此雷門中學足球部得以保留，這班足球少年又可以向全國大會進發。

主角埼玉於求職無門時碰到怪人、決定依循兒時成為英雄的夢想而當上「因為興趣使然的英雄」；苦練了三年、以掉光所有頭髮為代價，化身成毫無弱點的超級英雄，只需一拳便能輕鬆地擊敗怪獸。然而，他變得如此強大，甚至從災禍中拯救了多個城市，卻竟然無人知曉，一直在一個破爛小鎮當一個無名英雄，在他意外間收下的徒弟傑諾斯的提議下，埼玉決定申請加入英雄協會，期望獲得更多尊重與認同。

故事中的「魔導士公會」是個為魔導士們仲介各式工作的地方，而以成為獨當一面的魔導士為目標的少女「露西」，一直憧憬著加入擁有眾多厲害魔法師雲集的公會「妖精尾巴」。她在操縱火的魔導士「納茲」的引導下順利加入了妖精尾巴 ，並在認識了許多高手之後，與納茲等人組成了隊伍展開冒險。

故事描述松野家六胞胎的日常生活。

中學生九十九遊馬與學校頭號不良少年神代凌牙決鬥，而這場決鬥改變遊馬的命運。於該決鬥中，出現在九十九遊馬夢裡的詭異大門突然出現，並由九十九遊馬利用掛墜打開。大門散發出無數光芒，站著九十九遊馬身旁的是從異世界來的神秘生命體阿斯特拉爾，為取回阿斯特拉爾失去的記憶，需要拿回99張編號怪獸，因此九十九遊馬及阿斯特拉爾兩人開始一起行動。

阿斯特拉爾出現真正目的是什麼？新的怪獸「編號怪獸」的存在到底是何方神聖？面對持續出現在遊馬面前的強力勁敵，阿斯特拉爾身上的謎團也逐漸明朗。而本作就是講述這搭擋締造的新決鬥傳說。

這是個怪獸會在日常生活中威脅百姓安全的世界。　「日比野卡夫卡」曾立志加入專精討伐怪獸組織「日本防衛隊」，但在不知不覺間放棄了這個夢想，成為了一位專營怪獸清潔業者。「兩人一起將怪獸通通消滅！」過去一同立下這個誓言的兒時玩伴「亞白米娜」，現在已成了受人矚目的第3部隊隊長，無法與她站上同一陣線的卡夫卡，深深地為自己感到慚愧。然而，以遇見立志加入防衛隊的「市川雷諾」為契機，他停止的時間再度動了起來。為了能站在米娜的身邊，為了能從怪獸手中守護百姓，卡夫卡再度朝著過去的夢想邁進。但他卻不知道，怪獸的威脅，正以他料想不到的方式接近他......。

新學期開始，青春學園實力強勁的網球社來了一個國一新生 - 越前龍馬，在美國青少年網球大賽上連續四次獲勝，被譽為網球天才少年。越前龍馬在青春學園網球社遇到了實力強勁的學長們，但他以驚人的實力，最終贏得了學長們的認可正式加入了校隊，開始了通往全國大賽的奮鬥之路。

淀治是個背負了父親遺留下的龐大債務，因此過著極端負窮生活的少年，他救了惡魔波奇塔，並與牠一起以惡魔獵人的身分斬殺低階惡魔來換取酬勞。有一天，流氓騙了淀治，讓他成為一堆惡魔的祭品，淀治在臨死之際，波奇塔犧牲自己，把心臟給了他，讓他復活並擁有了惡魔的力量，只要一拉位在心臟那邊的鏈子就能發動。之後淀治被警察人員看上，因此成為警察的惡魔獵人…

他們是黑色教團的黑暗聖職者、擁有異能感的除魔師……

在很久很久以前，千年伯爵曾經想霸占地球，但，有人用神的力量消滅千年伯爵后世界恢復和平，但預言說：千年伯爵會再度來臨……

如今，千年伯爵再次為了霸占世界！將死去的靈魂變成惡魔，但，將死去靈魂變成惡魔的人居然是它的最重要的人。他們不是故意將靈魂變成惡魔，而是他們很迷惘，相信了千年伯爵的話，以為能將死去的人復活過來。——但，不但不能將他們復活過來，而且讓他們變成惡魔，變成千年伯爵的武器……那就是惡魔。

由某個人發現一個石箱以后，一切都改變了!

對付惡魔，有一些被神的選中的使者能破坏惡魔，他們的組織是「黑色教團」！「黑色教團」的黑暗聖職者被成為—“除魔師”……他們擁有異能感的克魔武器。一切會被他們改變……他們是千年伯爵的克星。

戰鬥陀螺是世界上最受歡迎的陀螺戰鬥玩具，會隨著陀螺戰士的熱情在對戰盤互相碰撞。

過去於 1989 年至 1996 年間，在「週刊少年 JUMP」連載，故事描述雖然不擅長魔法但是憧憬勇者的主角「達爾」某天被來到島上的勇者家庭教師「阿邦」認可才能，展開了勇者的特訓，隨後與阿邦的弟子等人一同踏上打倒魔王的旅程。