Keď sa kapitán Colter Stevens prebudí v prímestskom vlaku, netuší, odkiaľ sa tam vzal a čo tam robí. Colter zisťuje, že sa prebudil v tele iného človeka. Kým sa však stihne zo vzniknutej situácie spamätať, vlak rozmetá silný výbuch. Vzápätí sa Colter ocitne v podivnom bunkri izolovanom od okolitého sveta. Cez obrazovku k nemu hovorí dôstojníčka Carol Goodwinová a požaduje informácie o všetkom, čo práve videl. Kapitán Colter Stevens sa stal súčasťou náročného pátrania po útočníkovi na vlak, v ktorom sa ešte pred chvíľou nachádzal. Atentátnik totiž plánuje odpáliť oveľa väčšiu bombu priamo v srdci Chicaga. Ak ho Colter pomôže dolapiť včas, môže zachrániť tisíce životov. Táto vládna misia je založená na experimente nazvanom Zdrojový kód, ktorý Colterovmu vedomiu umožňuje na krátky čas existovať v paralelnej realite – v tele Seana v chicagskom prímestskom vlaku. Seanovu identitu môže využívať iba osem minút, má teda práve osem minút na odhalenie bombového útočníka.