In 2017 a.t.b., tijdens de oorlog tussen United Europia en Brikmnia, vormt het Europese leger het speciale team ‘uni± wZERO’ met verbannen Japanse Elfen. Luitenant-kolonel Leila en Akito, een overlevende van een missie, leiden de groep bestaande uit RF, Ayano en Yukiya. Ze moeten een afleiding creëren en botsen met Shin, die de kracht van Geass gebruikt om de controle over Michael's Knights over te nemen. De botsing tussen Shin en Akito onthult bovennatuurlijke krachten in een context van intriges en oorlog.