南京六部とは、明朝の政治機構。 明は金陵應天府（zh）（現在の南京）に都をおいていたが、皇族の朱棣が靖難の変により皇位を奪い明成祖として即位し、自らの本拠地であった燕京を都に定め、北京と改称した。 ただし、金陵は依然として副都の地位を保ち、南京と改称され、吏、戶、禮、兵、刑、工からなる南京六部が置かれ、南直隷が管轄した。