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HK40016611B - System and method with reflective fiducials - Google Patents

System and method with reflective fiducials Download PDF

Info

Publication number
HK40016611B
HK40016611B HK62020006361.3A HK62020006361A HK40016611B HK 40016611 B HK40016611 B HK 40016611B HK 62020006361 A HK62020006361 A HK 62020006361A HK 40016611 B HK40016611 B HK 40016611B
Authority
HK
Hong Kong
Prior art keywords
array
fiducial
fiducials
features
flow cell
Prior art date
Application number
HK62020006361.3A
Other languages
German (de)
English (en)
Chinese (zh)
Other versions
HK40016611A (en
Inventor
S. VIECELI John
Nemiroski Alex
Belitz Paul
Langlois Robert
Shane BOWEN M.
Yuan CHAN Danny
Murali K. Venkatesan Bala
Han Hui
Samiee Kevan
Tanner Stephen
Original Assignee
Illumina, Inc.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Illumina, Inc. filed Critical Illumina, Inc.
Publication of HK40016611A publication Critical patent/HK40016611A/en
Publication of HK40016611B publication Critical patent/HK40016611B/en

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Claims (14)

  1. Un arrangement (12), comprenant :
    une flow cell (cellule à écoulement) ayant des emplacements qui, en fonctionnement, reçoivent des échantillons biologiques différant les uns des autres afin de répondre différemment dans des cycles successifs d'imagerie fluorescente ; et
    un élément de repère (270) qui est formé comme des tranchées (282) dans ou comme des arêtes (284) sur une surface (280) de la flow cell et qui est réfléchissant optiquement afin, durant l'imagerie, de renvoyer au moins une portion de rayonnement incident (272) pour situer, régler l'emplacement de, ou enregistrer la flow cell ou les emplacements dans une position x-y.
  2. L'arrangement (12) de la revendication 1, dans lequel l'élément de repère (270) est disposé par-dessus une surface (280) de la flow cell.
  3. L'arrangement (12) de la revendication 1, dans lequel l'élément de repère (270) est formé dans la flow cell.
  4. L'arrangement (12) de la revendication 1, dans lequel l'élément de repère (270) se trouve en dehors d'une zone dans laquelle les emplacements sont fournis.
  5. L'arrangement (12) de la revendication 1, dans lequel l'élément de repère (270) comprend un réseau de Bragg.
  6. L'arrangement (12) de la revendication 1, dans lequel la flow cell comprend un matériau de verre, un matériau semi-conducteur, ou des combinaisons de ceux-ci, et dans lequel l'élément de repère (270) comprend un matériau métallique.
  7. L'arrangement (12) de la revendication 1, dans lequel les emplacements sont disposés dans un motif se répétant régulièrement sur la flow cell.
  8. L'arrangement (12) de la revendication 1, dans lequel l'élément de repère (270) comprend une pluralité d'éléments de repère.
  9. L'arrangement (12) de la revendication 1,
    a) dans lequel l'élément de repère (270) comprend un repère d'enregistrement situé parmi les emplacements de la flow cell qui reçoivent les échantillons biologiques, ou
    b) dans lequel l'élément de repère (270) comprend un repère à auto-centrage situé en dehors d'une zone de la flow cell où les emplacements de la flow cell qui reçoivent les échantillons biologiques sont disposés, ou
    c) dans lequel l'élément de repère (270) comprend une forme non fermée.
  10. L'arrangement (12) de la revendication 1, comprenant en outre une pluralité d'éléments de repère, et dans lequel les éléments de repère sont disposés sur la flow cell dans un agencement non rectiligne.
  11. L'arrangement (12) de la revendication 1, dans lequel l'élément de repère (270) est structuré afin de produire des informations de codage de données d'image.
  12. Un procédé, comprenant :
    la disposition d'échantillons biologiques au niveau d'une pluralité d'emplacements sur une flow cell, les échantillons biologiques différant les uns des autres afin de répondre différemment dans des cycles successifs d'imagerie fluorescente ; et
    la disposition d'un élément de repère comme des tranchées dans ou comme des arêtes sur la flow cell, l'élément de repère étant réfléchissant optiquement afin, durant l'imagerie, de renvoyer au moins une portion de rayonnement incident pour situer,
    régler l'emplacement de, ou enregistrer la flow cell ou la pluralité d'emplacements dans une position x-y.
  13. Le procédé de la revendication 12, comprenant en outre :
    l'accès à des données d'image codant des images successives d'échantillons biologiques disposés au niveau d'emplacements sur la flow cell ;
    l'enregistrement, pour les images successives, des emplacements sur la flow cell en référence à l'élément de repère ; et
    le traitement des images successives enregistrées afin de transformer des données dérivées des images successives en données de séquence.
  14. Le procédé de la revendication 12,
    a) dans lequel dans la réalisation des cycles successifs d'imagerie fluorescente seulement certains des échantillons biologiques apparaissent dans des images successives à l'exclusion d'autres des échantillons biologiques, mais l'élément de repère apparaissant dans toutes les images, ou
    b) dans lequel les cycles successifs d'imagerie fluorescente sont réalisés en utilisant de la lumière à différentes longueurs d'onde, facultativement
    dans lequel les cycles successifs d'imagerie fluorescente sont réalisés en utilisant de la lumière à au moins deux longueurs d'onde différentes, et dans lequel un matériau fluorescent de l'élément de repère est réactif à la fois aux deux des au moins deux longueurs d'onde différentes.
HK62020006361.3A 2017-02-01 2018-01-31 System and method with reflective fiducials HK40016611B (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GB1701691.6 2017-02-01

Publications (2)

Publication Number Publication Date
HK40016611A HK40016611A (en) 2020-09-11
HK40016611B true HK40016611B (en) 2023-03-31

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