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HK1231511B - Arrays of monoliths with attached recognition compounds - Google Patents

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Info

Publication number
HK1231511B
HK1231511B HK17105263.0A HK17105263A HK1231511B HK 1231511 B HK1231511 B HK 1231511B HK 17105263 A HK17105263 A HK 17105263A HK 1231511 B HK1231511 B HK 1231511B
Authority
HK
Hong Kong
Prior art keywords
nucleic acid
monolith
array
compounds
attached
Prior art date
Application number
HK17105263.0A
Other languages
English (en)
French (fr)
Chinese (zh)
Other versions
HK1231511A1 (en
Inventor
Pehr Harbury
Madan Paidhungat
Robin Prince
Original Assignee
Dice Molecules SV. LLC
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Dice Molecules SV. LLC filed Critical Dice Molecules SV. LLC
Priority claimed from PCT/US2015/013382 external-priority patent/WO2015116739A1/en
Publication of HK1231511A1 publication Critical patent/HK1231511A1/en
Publication of HK1231511B publication Critical patent/HK1231511B/en

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Claims (11)

  1. Anordnung (T1) zur präparativen Aufteilung einer nukleinsäureprogrammierten Bibliothek chemischer Verbindungen, wobei die Anordnung einen Block mit zwei oder mehr Vertiefungen umfasst, wobei innerhalb jeder Vertiefung eine andere Säule kovalent an die Oberfläche der Vertiefung durch Bildung eines Amids, Esters, Harnstoffs, Urethans, Kohlenstoff-Siliziums, Kohlenstoff-Stickstoffs, Kohlenstoff-Kohlenstoffs, Ethers, Thioethers, Disulfidbindung oder durch Cycloaddition gebunden ist, wobei jede Säule ein Monolith ist, der ein gebundenes Oligonukleotid beinhaltet, das gezielt ein komplementäres Oligonukleotid bindet, welches funktionell an eine chemische Reaktionsstelle oder einen Liganden gebunden ist, wobei das komplementäre Nukleotid ein Bestandteil eines Gemisches ist.
  2. Anordnung nach Anspruch 1, wobei das Gemisch verschiedene Oligonukleotide beinhaltet, die funktionsfähig an verschiedene chemische Reaktionsstellen oder Liganden gebunden sind.
  3. Anordnung nach Anspruch 1 oder Anspruch 2, wobei der Block aus Titan, Aluminium, Edelstahl, dotierten Metallen, Glas, Quarz, Polycarbonat, Kieselglas, Poly(methylmethacrylat), Kunststoff, Polyetheretherketon, dotiertem Polyetheretherketon, dotiertem Polystyrol, cyclischem Olefin-Copolymer, Ultem-Polyetherimid, dotiertem Polypropylen oder Kombinationen davon besteht, wobei optional der Block aus Titan, Aluminium, Edelstahl oder dotierten Metallen besteht.
  4. Anordnung nach einem beliebigen vorhergehenden Anspruch, wobei der Block aus Aluminium besteht.
  5. Anordnung nach einem beliebigen vorhergehenden Anspruch, wobei jeder Monolith organische Copolymere umfasst.
  6. Anordnung nach Anspruch 5, wobei jeder Monolith Poly(GMA-co-EDMA) umfasst.
  7. Anordnung nach einem beliebigen vorhergehenden Anspruch, wobei jede Säule zwischen 0,5 fmol/µl und 0,4 nmol/µl einzelsträngiger Nukleinsäure binden kann.
  8. Anordnung nach einem beliebigen vorhergehenden Anspruch, wobei jedes gebundene Oligonukleotid auf seinem Monolith in einer Dichte zwischen 1 pmol/10 µl und 1 µmol/10 µl vorhanden ist.
  9. Anordnung nach einem beliebigen vorhergehenden Anspruch, wobei die Geschwindigkeitskonstante der Bindung an ein komplementäres Oligonukleotid des gebundenen Oligonukleotids zwischen 1 x 102 M-1s-1 und 1 x 106 M-1s-1 liegt.
  10. Hybridisierungsanordnung zur präparativen Aufteilung einer nukleinsäureprogrammierten Bibliothek chemischer Verbindungen, umfassend fünf Platten, die von oben nach unten A11, D11, T1, D12 und A12 angeordnet sind, wobei:
    Platte T1 eine Anordnung nach einem der Ansprüche 1 bis 9 ist, wobei jede Vertiefung eine adressierbare Vertiefung ist, die einen Monolithen mit einem gebundenen Oligonukleotid umfasst,
    wobei das gebundene Oligonukleotid eine spezifische Anticodon-Erkennungsverbindung ist,
    die Platten D11 und D12 Löcher aufweisen, die die Monolithen mit gebundenen spezifischen Anticodon-Erkennungsverbindungen auf Platte Tl mit den Nuten auf den Innenflächen der Platten A11 und A12 verbinden, wobei die Nuten mit Kanälen verbunden sind, durch die Luftdruck und Vakuum angelegt werden können,
    wobei zwischen den A- und D-Platten angeordnete Membranen eine abgedichtete kontinuierliche Serpentinenkammer gestalten, die aus den Nuten auf den A-Platten, den Löchern in den D-Platten und den Monolithen in der T-Platte besteht,
    wobei die Platte D11 Öffnungen aufweist, durch die Flüssigkeit in die Serpentinenkammer eintreten und aus ihr austreten kann, und
    wobei die Nuten in den Platten A11 und A12 so ausgebildet sind, dass eine sachgerechte zyklische Anwendung von Luftdruck und Vakuum auf die Kanäle in den A-Platten einen direktionalen Fluss der Flüssigkeit in der Serpentinkammer erzeugt.
  11. Hybridisierungsanordnung nach Anspruch 10, ferner umfassend Elemente einer DNA-Bibliothek, die das geeignete Codon enthält, das an den Monolithen hybridisiert ist, der an die kognitive Anticodon-Erkennungsverbindung in der Hybridisierungsanordnung gebunden ist.
HK17105263.0A 2014-01-28 2015-01-28 Arrays of monoliths with attached recognition compounds HK1231511B (en)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201461932747P 2014-01-28 2014-01-28
US201461932747P 2014-01-28
US201462006845P 2014-06-02 2014-06-02
US201462006845P 2014-06-02
PCT/US2015/013382 WO2015116739A1 (en) 2014-01-28 2015-01-28 Monoliths with attached recognition compounds, arrays thereof and uses thereof

Publications (2)

Publication Number Publication Date
HK1231511A1 HK1231511A1 (en) 2017-12-22
HK1231511B true HK1231511B (en) 2020-07-03

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