HK1208885B - Methods to assess the likelihood of dysplasia or esophageal adenocarcinoma - Google Patents
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Claims (8)
- Procédé in vitro pour aider à évaluer la probabilité d'une dysplasie ou d'un adénocarcinome de l'oesophage présent chez un sujet, dans lequel l'échantillon provient d'un sujet ayant un oesophage de Barrett, le procédé comprenant :(a) fournir un échantillon d'oesophage du sujet ;(b) déterminer le statut de méthylation de :dans ledit échantillon ; comparer les valeurs de méthylation de (b) à un étalon de référence, dans lequel ledit étalon de référence provient d'un sujet ayant un oesophage de Barrett, mais n'ayant pas de dysplasie ou adénocarcinome de l'oesophage ; dans lequel si 2 ou plus desdits gènes sont méthylés à un niveau supérieur à l'étalon de référence, alors une probabilité accrue de présence de dysplasie ou d'adénocarcinome de l'oesophage est déterminée.(i) SLC22A18 ;(ii) PIGR ;(iii) GJA12 ; et(iv) RIN2
- Procédé in vitro selon la revendication 1, dans lequel le procédé comprend en outre la détermination du statut de méthylation de (v) TCEAL7.
- Procédé in vitro selon la revendication 1 ou la revendication 2, dans lequel si ledit sujet est un homme, le procédé comprend en outre la détermination de l'état de méthylation de (vi) RGN.
- Procédé in vitro d'évaluation du risque pour un sujet particulier comprenant la mise en oeuvre du procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans laquelle si 0 ou 1 desdits gènes sont méthylés, alors un risque faible est déterminé, et si 2 desdits gènes sont méthylés alors un risque intermédiaire est déterminé, si 3 ou plus de ces gènes sont méthylés alors un risque élevé est déterminé.
- Procédé in vitro selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel l'état de méthylation est déterminé par pyroséquençage, dans lequel ledit pyroséquençage est effectué en utilisant une ou plusieurs amorces de séquençage choisies parmi le Tableau additionnel 5.
- Procédé in vitro selon l'une quelconque des revendications précédentes dans lequel l'état de méthylation est noté en déterminant le pourcentage de méthylation de chacun desdits gènes et en comparant les valeurs aux pourcentages de seuil de méthylation suivants :
Gène Seuil de méthylation (%) GJA12 51,74000 SLC22A18 49,25000 PIGR 64,755000 RIN2 37,85500 RGN (hommes uniquement) 18,645000 TCEAL7 58,54000 - Procédé in vitro selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel ledit échantillon comprend un matériau de biopsie congelé.
- Procédé in vitro selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel ledit étalon de référence comprend un épithélium colonnaire par exemple un oesophage de Barrett ou duodénum.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| GB1208874.6 | 2012-05-18 | ||
| GB201208874A GB201208874D0 (en) | 2012-05-18 | 2012-05-18 | Methods |
| PCT/GB2013/051278 WO2013171504A1 (fr) | 2012-05-18 | 2013-05-17 | Procédés d'évaluation de probabilité d'une dysplasie ou d'un adénocarcinome oesophagien |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| HK1208885A1 HK1208885A1 (en) | 2016-03-18 |
| HK1208885B true HK1208885B (en) | 2021-01-15 |
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