HK1192191B - Device for assays using binding members - Google Patents

Claims (15)

1. Vorrichtung, umfassend eine Reaktionskammer, die ein erstes Bindeelement, das dafür adaptiert ist, Zielverbindungen einzufangen, und ein zweites Bindeelement, das dafür adaptiert ist, Reporterverbindungen, die für das Vorhandensein und/oder die Menge der Zielverbindungen indikativ sind, zu fangen, umfasst, wobei das erste Bindeelement synthetische Partikel, Perlen oder eine poröse Matrix, die dazu konfiguriert sind, Komplexe aus einer Fangverbindung und einer Zielverbindung zu binden, umfasst, und wobei das zweite Bindeelement ein Mikroarray aus reporterspezifischen Fangverbindungen, die auf einer Oberfläche angeordnet sind, ist.
2. Vorrichtung nach Anspruch 1, wobei die Perlen magnetische Perlen oder Latexperlen sind.
3. Vorrichtung nach Anspruch 1 oder 2, wobei das erste Bindeelement Perlen umfasst, die dazu konfiguriert sind, Komplexe einschließlich eine Fangverbindung und eine Zielverbindung durch Binden einer Ankergruppe der Fangverbindung zu binden.
4. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei mindestens 10 verschiedene Arten, mindestens 20 verschiedene Arten, oder mindestens 50 verschiedene Arten von reporterspezifischen Fangelementen auf der Oberfläche des zweiten Bindeelements angeordnet sind.
5. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, umfassend mindestens einen Filter, optional mindestens eine Fritte, angeordnet an der Reaktionskammer und dafür adaptiert, zu verhindern, dass das erste Bindeelement aus der Reaktionskammer entfernt wird.
6. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei die Reaktionskammer ein Volumen in einem Bereich von 1 µL bis 1 mL, optional in einem Bereich von 20 µL bis 300 µL, hat.
7. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, wobei das Substrat einen Fensterteil angrenzend an die Reaktionskammer, der für elektromagnetische Strahlung in einem Bereich von Wellenlängen von 1 nm bis 10 µm, optional in einem Bereich von Wellenlängen von 400 nm bis 800 nm transparent ist, um dadurch einen auf elektromagnetischer Strahlung basierenden Nachweis eines Meniskus einer Flüssigkeit, die durch die Struktur fließt, zu erlauben, hat.
8. Vorrichtung nach einem der vorhergehenden Ansprüche, weiterhin umfassend ein flexibles Deckelement, das das Substrat mindestens teilweise abdeckt.
9. Verwendung der Vorrichtung nach einem der Ansprüche 1 bis 8 in einem Verfahren, umfassend:

   Binden eines Zielpolynukleotids an das erste Bindeelement und Freisetzen des Zielpolynukleotids von dem ersten Bindeelement vor dem Schritt des Amplifizierens, wobei sich das erste Bindeelement in der Reaktionskammer befindet,

   Amplifizieren des Zielpolynukleotids in einem Amplifizierungsgemisch, um Amplikons zu bilden, wobei die Amplifizierung in der Gegenwart einer Reporterverbindung durchgeführt wird, und wobei mindestens eine Untergruppe der Amplikons fähig ist, mir der Reporterverbindung Komplexe zu bilden,

   Bilden von Komplexen von einer Untergruppe der Menge an Reporterverbindung mit mindestens einer Untergruppe der Amplikons,

   Binden von nicht mit den Amplikons komplexierter Reporterverbindung an das zweite Bindeelement, das in Bezug auf eine Oberfläche immobilisiert ist, wobei sich das zweite Bindeelement in der Reaktionskammer befindet; und

   Nachweisen einer verbleibenden Untergruppe der Reporterverbindung, wobei die Mitglieder der verbleibenden Untergruppe nicht mit den Amplikons komplexiert sind und wobei das Nachweisen mit der verbleibenden Untergruppe der Reporterverbindung, die an das zweite Bindeelement gebunden ist, durchgeführt wird.
10. Verwendung nach Anspruch 9, weiterhin umfassend das Bestimmen eines Werts, der für eine Anzahl von Amplikons, die nach dem Amplifizieren vorhanden sind, indikativ ist, basierend auf der nachgewiesenen verbleibenden Untergruppe an Reporterverbindung; optional weiterhin umfassend das Bestimmen eines Werts, der für die Anzahl der Zielpolynukleotide, die in dem Amplifikationsgemisch vorhanden sind, indikativ ist, basierend auf dem Wert, der für die Anzahl der Amplikons indikativ ist.
11. Verwendung nach Anspruch 9 oder 10, wobei:

    der Schritt des Amplifizierens weiterhin Amplifizieren eines Kontrollpolynukleotids, das in der Amplifizierungsmischung vorhanden ist, um Kontrollamplikons zu bilden, umfasst, wobei die Amplifizierung in der Gegenwart einer

    Kontrollreporterverbindung durchgeführt wird, wobei mindestens eine Untergruppe der Kontrollamplikons fähig ist mit der Kontrollreporterverbindung Komplexe zu bilden,

    Bilden von Komplexen von einer Untergruppe der Menge an Kontrollreporterverbindung mit mindestens einer Untergruppe der Kontrollamplikons;

    Nachweisen einer verbleibenden Untergruppe der Kontrollreporterverbindung, wobei die Mitglieder der verbleibenden Untergruppe nicht mit den Kontrollamplikons komplexiert sind; und

    Bestimmen des Werts, der für die Anzahl der Amplikons, die nach dem Amplifizieren vorhanden sind, indikativ ist, basierend auf der nachgewiesenen verbleibenden Untergruppe an Reporterverbindung und der nachgewiesenen verbleibenden Untergruppe an Kontrollreporterverbindung,

    wobei optional die Reporterverbindung und die Kontrollreporterverbindung je ein optisches Label umfassen und die Schritte des Nachweisens den Nachweis des optischen Labels umfassen.
12. Verwendung nach einem der Ansprüche 9 bis 11, weiterhin umfassend Binden von Kontrollreporterverbindung, die nicht mit den Kontrollamplikons komplexiert sind, an das zweite Bindeelement, dass in Bezug auf eine Oberfläche immobilisiert ist, und wobei das Nachweisen der verbleibenden Untergruppe an Kontrollreporterverbindung mit der verbleibenden Untergruppe an Kontrollreporterverbindung, die an das zweite Bindeelement gebunden ist, durchgeführt wird, wobei optional die Schritte des Nachweisens der Reporterverbindung und der Kontrollreporterverbindung in der Struktur für das Beherbergen von Flüssigkeiten durchgeführt wird.
13. Verwendung nach einem der Ansprüche 9 bis 12, weiterhin umfassend ein Wiederholen der Schritte des Amplifizierens, Bildens von Komplexen, und Nachweisens für eine Anzahl N-mal, wobei N mindestens 2 ist und der wiederholte Schritt(e) des Amplifizierens das Amplifizieren der Amplikons umfasst, optional weiterhin umfassend, für jeden von mindestens einigen der N Wiederholungen, Bestimmen eines Werts, der für die Anzahl von Amplikons indikativ ist, basierend auf der nachgewiesenen verbleibenden Untergruppe an Reporterverbindung, weiterhin optional umfassend, für mindestens eine der N Wiederholungen, Bestimmen eines Werts, der für die Anzahl der Zielpolynukleotide, die in der Amplifizierungsmischung vorhanden sind, indikativ sind, basierend auf dem Wert, der für die Anzahl der Amplikons indikativ ist.
14. Verwendung nach einem der Ansprüche 9 bis 13, wobei das Zielpolynukleotid von einem Pathogen abgeleitet ist und die Verwendung ein Lysieren des Pathogenes, um das Zielpolynukleotid freizusetzen, umfasst, wobei optional das Pathogen ein Virus ist, wobei optional der Virus HIV ist.
15. Verwendung nach einem der Ansprüche 9 bis 14, wobei die Reporterverbindung ein optisch nachweisbares Label umfasst, und die Nachweisbarkeit des optisch nachweisbaren Labels im Wesentlichen gleich ist, wenn die Reporterverbindung an die Amplikons komplexiert ist und wenn die Reporterverbindung nicht komplexiert ist, wobei optional das Label fluoreszent ist und eine Quantenausbeute des fluoreszenten Labels, wenn die Reporterverbindung mit den Amplikons komplexiert ist, innerhalb von 10% einer Quantenausbeute des Labels, wenn die Reporterverbindung nicht mit den Amplikons komplexiert ist, ist, oder wobei optional die Kontrollreporterverbindung ein optisch nachweisbares Label umfasst, und die Nachweisbarkeit des optisch nachweisbaren Labels im Wesentlichen gleich ist, wenn die Kontrollreporterverbindung an die Kontrollamplikons komplexiert ist und wenn die Kontrollreporterverbindung nicht komplexiert ist, wobei optional das Label der Kontrollreporterverbindung fluoreszent ist und eine Quantenausbeute des fluoreszenten Labels, wenn die Kontrollreporterverbindung mit den Kontrollamplikons komplexiert ist, innerhalb von 10% einer Quantenausbeute des Labels, wenn die Kontrollreporterverbindung nicht komplexiert ist, ist.