HK1188128B - Tumor specific antibodies and uses therefor - Google Patents

Claims (20)

1. Isolierter Antikörper oder Fragment davon zur spezifischen Bindung an ein in einem MUC1-Polypeptid und/oder einem mutierten K-Ras-Polypeptid vorhandenes tumorassoziiertes Epitop, wobei der isolierte Antikörper oder das Fragment davon polyklonal oder monoklonal ist und gegebenenfalls wobei der isolierte Antikörper oder das Fragment davon humanisiert ist und wobei:

   (i) der Antikörper oder das Fragment davon die komplementaritätsbestimmenden Regionen (CDRs) des monoklonalen Antikörpers TAB-004 umfasst: CDR1 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 8; CDR2 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 9; CDR3 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 10; CDR1 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 11; CDR2 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 12; und CDR3 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 13; oder

   (ii) der Antikörper oder das Fragment davon eine variable Region der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 5 oder codiert durch ein Nucleinsäuremolekül, umfassend SEQ ID Nr. 4; und eine variable Region der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 7 oder codiert durch ein Nucleinsäuremolekül, umfassend SEQ ID Nr. 6, umfasst.
2. Isolierter Antikörper oder Fragment davon nach Anspruch 1, der/das ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus einem monoklonalen Antikörper, produziert von der Hybridomzelllinie TAB-004, die bei der American Type Culture Collection (ATCC) als Accession Nr. PTA-11550 am 16. Dezember 2010 hinterlegt wurde; einem chimären Antikörper oder einem Fragment davon; einem humanisierten Antikörper oder einem Fragment davon; einem Einzelketten-Antikörper oder einem Fragment davon; und einem Fab-Fragment, wobei der chimäre Antikörper, der humanisierte Antikörper, der Einzelketten-Antikörper oder das Fab-Fragment die CDRs des monoklonalen Antikörpers TAB-004 umfasst, und wobei:

   (i) der Antikörper oder das Fragment davon die CDRs des monoklonalen Antikörpers TAB-004 umfasst: CDR1 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 8; CDR2 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 9; CDR3 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 10; CDR1 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 11; CDR2 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 12; und CDR3 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 13; oder

   (ii) der Antikörper oder das Fragment davon eine variable Region der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 5 oder codiert durch ein Nucleinsäuremolekül, umfassend SEQ ID Nr. 4; und eine variable Region der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 7 oder codiert durch ein Nucleinsäuremolekül, umfassend SEQ ID Nr. 6, umfasst.
3. Zusammensetzung, umfassend den Antikörper oder das Fragment davon nach Anspruch 1 und einen pharmazeutisch akzeptablen Träger, gegebenenfalls wobei der pharmazeutisch akzeptable Träger für die Verwendung bei einem Menschen akzeptabel ist.
4. Zusammensetzung, umfassend den Antikörper oder das Fragment davon nach Anspruch 1, konjugiert mit einem Wirkstoff, wobei der Wirkstoff gegebenenfalls ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus

   einem radioaktiven Molekül;

   einem Radionuklid;

   einem Sensibilisatormolekül;

   einem bildgebenden Reagens;

   einem Radioisotop, gegebenenfalls ¹⁰B, ²¹¹At, ²¹²Pb, ²¹²Bi, ¹²⁵I, ¹³¹I, ³⁵S oder ³H;

   einem Toxin;

   einem Zytotoxin;

   einem antiangiogenen Mittel;

   einem Antitumormitttel;

   einem Chemotherapeutikum;

   einem Immunmodulator, gegebenenfalls einem Inhibitor der Indolamin-2,3-Dioxygenase (IDO), gegebenenfalls 1-Methyl-DL-tryptophan (1MT); einem EP2/EP4-Rezeptor-Antagonisten; einem Cyclooxygenase-Inhibitor, gegebenenfalls Indomethacin; oder einem Aktivator dendritischer Zellen, gegebenenfalls CpG-Oligodesoxynucleotiden (CpG-ODN); einem Zytokin;

   einer Reportergruppe;

   und Kombinationen davon.
5. Kit, umfassend den Antikörper oder das Fragment davon nach Anspruch 1 und Anweisungen für dessen Verwendung.
6. Abgabevehikel zur Verwendung bei der Behandlung von Krebs durch gezielte Abgabe eines Wirkstoffs an eine Tumorzelle, wobei das Abgabevehikel ein Targeting-Mittel umfasst, das den isolierten Antikörper oder das Fragment davon nach Anspruch 1 umfasst, wobei der Wirkstoff gegebenenfalls ein radioaktives Molekül, ein Radionuklid, ein Sensibilisatormolekül, ein bildgebendes Reagens, ein Radioisotop, ein Toxin, ein Zytotoxin, ein antiangiogenes Mittel, ein Antitumormitttel, ein Chemotherapeutikum, einen Immunmodulator, ein Zytokin, eine Reportergruppe, oder eine Kombination davon umfasst.
7. Isolierte Zelle, die den Antikörper oder das Fragment davon nach Anspruch 1, produziert.
8. Hybridom, das den Antikörper nach Anspruch 1 produziert, gegebenenfalls wobei das Hybridom die Hybridomzelllinie ATCC Accession Nr. PTA-11550, hinterlegt bei der American Type Culture Collection gemäß dem Budapester Vertrag am 16. Dezember 2010, ist.
9. Verfahren zur Feststellung des Vorhandenseins eines MUC1-Polypeptids und/oder eines mutierten K-Ras-Polypeptids, umfassend:

   (a) Inkontaktbringen der biologischen Probe mit dem isolierten Antikörper oder dem Fragment davon nach Anspruch 1; und

   (b) Feststellen des Vorhandenseins eines MUC1-Polypeptids und/oder eines mutierten K-Ras-Polypeptids, an die/das der monoklonale Antikörper TAB-004 in der biologischen Probe bindet.
10. Verfahren zur Herstellung eines Antikörpers oder eines Fragments davon, umfassend:

    (a) Kultivieren der isolierten Zelle nach Anspruch 7 oder des Hybridoms nach Anspruch 8 unter Bedingungen derart, dass der Antikörper oder das Fragment davon exprimiert wird; und

    (b) Gewinnen des Antikörpers oder des Fragments davon aus der Zelle oder dem Hybridom und/oder aus derUmgebung, in der die Zelle oder das Hybridom wächst.
11. In-vitro-Verfahren zum Nachweisen eines Tumors und/oder einer Krebszelle bei einem Individuum durch Verwendung des Antikörpers oder des Fragments davon nach Anspruch 1, umfassend:

    (a) Inkontaktbringen einer biologischen Probe, gegebenenfalls einer Blutprobe oder einer davon abgeleiteten Fraktion, von dem Individuum mit einer Zusammensetzung, umfassend den Antikörper oder das Fragment davon nach Anspruch 1, unter Bedingungen, die ausreichend sind, dass der Antikörper oder das Fragment davon nach Anspruch 1 an ein auf einem Tumor und/oder einer Krebszelle vorliegendes Antigen, sofern vorhanden, in der biologischen Probe bindet; und

    (b) Nachweisen der Bindung des Antikörpers oder des Fragments davon nach Anspruch 1 an die biologische Probe,

    wobei das Nachweisen indikativ dafür ist, dass ein Tumor und/oder eine Krebszelle bei dem Individuum vorhanden ist, und gegebenenfalls wobei:

    (i) der Tumor und/oder die Krebszelle ein Tumor der Bauchspeicheldrüse, der Brust, des Eierstocks, des Kolons oder des Rektums und/oder eine davon abgeleitete metastatische Zelle ist, welche(r) gegebenenfalls MUC1, ein mutiertes K-Ras oder beide exprimiert, oder

    (ii) der Antikörper oder das Fragment davon konjugiert ist mit einer nachweisbaren Markierung, umfassend ein bildgebendes Mittel, ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus paramagnetischen, radioaktiven und fluorogenenIonen, gegebenenfalls wobei das radioaktive bildgebende Mittel ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus ⁴³K, ⁵²Fe, ⁵⁷Co, ⁶⁷Cu, ⁶⁷Ga, ⁶⁸Ga, ⁷⁷Br, ⁸¹Rb/^81MKr, ^87MSr, ^99MTc, ¹¹¹In, ¹¹³In, ¹²³I, ¹²⁵I, ¹²⁷Cs, ¹²⁹Cs, ¹³¹I, ¹³²I, ¹⁹⁷Hg, ²⁰³Pb und ²⁰⁶Bi.
12. Zusammensetzung, umfassend den Antikörper oder das Fragment davon nach Anspruch 1, konjugiert mit einem Wirkstoff, umfassend ein Chemotherapeutikum, ein Toxin, ein Radiotherapeutikum, oder eine Kombination davon, zur Verwendung in einem Verfahren zur Behandlung eines Tumors bei einem Individuum, wodurch der Wirkstoff in Kontakt mit dem Tumor kommt, um dadurch den Tumor zu behandeln, und gegebenenfalls wobei:

    (i) das Chemotherapeutikum ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus einem Antitumorarzneimittel, einem Zytokin, einem Antimetaboliten, einem Alkylans, einem Hormon, Methotrexat, Doxorubicin, Daunorubicin, Cytosinarabinosid, Etoposid, 5-Fluorouracil, Melphalan, Chlorambucil, einem Stickstofflost, Cyclophosphamid, Cisplatin, Vindesin, Vinca-Alkaloiden, Mitomycin, Bleomycin, Purothionin, Macromomycin, 1,4-Benzochinon-Derivaten, Trenimon, Steroiden, Aminopterin, Anthracyclinen, Demecolcin, Mithramycin, Daunomycin, Vinblastin, Neocarzinostatin, Macromycin, α-Amanitin, und Kombinationen davon; oder

    (ii) das Toxin ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Gift der Kettenviper, aktiviertem Faktor IX, aktiviertem Faktor X, Thrombin, Phospholipase C, Kobragiftfaktor, Ricin, A-Kette von Ricin, Exotoxin von Pseudomonas, Diphtherie-Toxin, Ribonuclease ausRinderpankreas, antiviralem Protein der Kermesbeere, Abrin, A-Kette von Abrin, Gelonin, Saporin, Modeccin, Viscumin, Volkensin, und Kombinationen davon; oder

    (iii) das Radiotherapeutikum ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus ⁴⁷Sc, ⁶⁷Cu, ⁹⁰Y, ¹⁰⁹Pd, ¹²³I, ¹²⁵I, ¹³¹I, ¹⁸⁶Re, ¹⁸⁸Re, ¹⁹⁹Au, ²¹¹At, ²¹²Pb, ²¹²Bi, ³²P, ³³P, ⁷¹Ge, ⁷⁷As, ¹⁰³Pb, ¹⁰⁵Rh, ¹¹¹Ag, ¹¹⁹Sb, ¹²¹Sn, ¹³¹Cs, ¹⁴³Pr, ¹⁶¹Tb, ¹⁷⁷Lu, ¹⁹¹Os, ^193MPt und ¹⁹⁷Hg.
13. Isolierter Antikörper oder Fragment davon zur spezifischen Bindung an ein in einem MUC1-Polypeptid und/oder einem mutierten K-Ras-Polypeptid vorhandenes tumorassoziiertes Epitop, der/das die komplementaritätsbestimmenden Regionen (CDRs) des monoklonalen Antikörpers TAB-004 umfasst, zur Verwendung in einem Verfahren zur Unterdrückung des Tumorwachstums bei einem Individuum, wobei das Verfahren das Verabreichen einer wirksamen Menge des isolierten Antikörpers oder des Fragments davon, umfassend die komplementaritätsbestimmenden Regionen (CDRs) des monoklonalen Antikörpers TAB-004, an ein einen Tumor tragendes Individuum umfasst, wobei der Tumor gegebenenfalls ein Tumor der Bauchspeicheldrüse, der Brust, des Eierstocks, des Kolons oder des Rektums und/oder eine davon abgeleitete metastatische Zelle ist, welche(r) weiterhin gegebenenfalls MUC1, ein mutiertes K-Ras oder beide exprimiert, und wobei:

    (i) der Antikörper oder das Fragment davon die CDRs des monoklonalen Antikörpers TAB-004 umfasst: CDR1 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 8; CDR2 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 9; CDR3 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 10; CDR1 derleichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 11; CDR2 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 12; und CDR3 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 13; oder

    (ii) der Antikörper oder das Fragment davon eine variable Region der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 5 oder codiert durch ein Nucleinsäuremolekül, umfassend SEQ ID Nr. 4; und eine variable Region der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 7 oder codiert durch ein Nucleinsäuremolekül, umfassend SEQ ID Nr. 6, umfasst.
14. Zusammensetzung zur Verwendung nach Anspruch 12 oder isolierter Antikörper oder Fragment davon zur Verwendung nach Anspruch 13, weiterhin umfassend das Verabreichen einer zusätzlichen oder mehrerer zusätzlicher Antitumorbehandlung(en) an das Individuum, gegebenenfalls wobei die eine zusätzliche oder die mehreren zusätzlichen Antitumorbehandlung(en) ausgewählt ist/sind aus der Gruppe bestehend aus Strahlentherapie; Chemotherapie; einer zusätzlichen Immuntherapie; einer entzündungshemmenden Therapie, gegebenenfalls umfassend das Verabreichen eines Cyclooxygenase-Inhibitors, gegebenenfalls eines spezifischen Inhibitors der Cyclooxygenase-2; und von Kombinationen davon an das Individuum, gegebenenfalls wobei die eine zusätzliche oder die mehreren zusätzlichen Antitumorbehandlung(en) das Verabreichen von Gemcitabin (4-Amino-1-(2-desoxy-2,2-difluor-β-D-erythro-pentofuranosyl)pyrimidin-2(1H)-on-2',2'-Difluor-2'-desoxycytidin), Celecoxib (4-[5-(4-Methylphenyl)-3-(trifluormethyl)pyrazol-1-yl]benzensulfonamid), pharmazeutisch akzeptablen Salzen davon und/oder Kombinationen davon an das Individuum umfasst/umfassen.
15. Verfahren zur Reinigung einer Krebsstammzelle, wobei das Verfahren umfasst:

    (a) Bereitstellen einer Population von Zellen, die im Verdacht steht, Krebsstammzellen zu umfassen, gegebenenfalls wobei die Population von Zellen zirkulierende Zellen, isoliert von einem Individuum, das einen Tumor und/oder einen Krebs hat, umfasst;

    (b) Identifizieren einer Subpopulation der Zellen, die an einen Antikörper oder ein Fragment davon binden, der/das zur spezifischen Bindung an ein in einem MUC1-Polypeptid und/oder einem mutierten K-Ras-Polypeptid vorhandenes tumorassoziiertes Epitop dient, der/das die CDRs des monoklonalen Antikörpers TAB-004 umfasst, und wobei:

    (i) der Antikörper oder das Fragment davon die CDRs des monoklonalen Antikörpers TAB-004 umfasst: CDR1 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 8; CDR2 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 9; CDR3 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 10; CDR1 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 11; CDR2 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 12; und CDR3 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 13; oder

    (ii) der Antikörper oder das Fragment davon eine variable Region der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 5 oder codiert durch ein Nucleinsäuremolekül, umfassend SEQ ID Nr. 4; und eine variable Region der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 7 oder codiert durch ein Nucleinsäuremolekül, umfassend SEQ ID Nr. 6, umfasst;

    (c) Reinigen der Subpopulation; und gegebenenfalls

    (d) Entfernen von linienpositiven Zellen (Lin⁺-Zellen) aus der Population von Zellen vor dem Identifizierungsschritt und/oder nach dem Reinigungsschritt.
16. Zusammensetzung, umfassend einen Antikörper oder ein Fragment davon zur spezifischen Bindung an ein in einem MUC1-Polypeptid und/oder einem mutierten K-Ras-Polypeptid vorhandenes tumorassoziiertes Epitop, der/das die CDRs des monoklonalen Antikörpers TAB-004 umfasst, und einen Wirkstoff, zur Verwendung in einem Verfahren zur Behandlung von Krebs durch Abzielen des Wirkstoffs auf eine zirkulierende Krebsstammzelle bei einem Individuum, wobei das Verfahren das Inkontaktbringen der zirkulierenden Krebsstammzelle mit der Zusammensetzung umfasst, wobei:

    (i) der Antikörper oder das Fragment davon die CDRs des monoklonalen Antikörpers TAB-004 umfasst: CDR1 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 8; CDR2 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 9; CDR3 der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 10; CDR1 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 11; CDR2 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 12; und CDR3 der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 13; oder

    (ii) der Antikörper oder das Fragment davon eine variable Region der schweren Kette, umfassend SEQ ID Nr. 5 oder codiert durch ein Nucleinsäuremolekül, umfassend SEQ ID Nr. 4; und eine variable Region der leichten Kette, umfassend SEQ ID Nr. 7 oder codiert durch ein Nucleinsäuremolekül, umfassend SEQ ID Nr. 6, umfasst, und

    wobei der Wirkstoff ein Therapeutikum, gegebenenfalls ausgewählt aus einem Chemotherapeutikum, einem Toxin, einem Radiotherapeutikum, oder einer Kombination davon, umfasst, und weiterhin gegebenenfalls wobei das Therapeutikum einen Immunmodulator umfasst, wobei der Immunmodulator gegebenenfalls ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus einem Inhibitor der Indolamin-2,3-Dioxygenase (IDO), gegebenenfalls 1-Methyl-DL-tryptophan (1MT); einem EP2/EP4-Rezeptor-Antagonisten; und einem Aktivator dendritischer Zellen, gegebenenfalls CpG-Oligodesoxynucleotiden (CpG-ODN).
17. In-vitro-Verfahren zum Diagnostizieren des Wiederauftretens und/oder Fortschreitens von Krebs bei einem Individuum, das zuvor wegen des Krebses behandelt wurde, wobei das Verfahren umfasst:

    (a) Inkontaktbringen einer isolierten biologischen Probe, umfassend zirkulierende Zellen von einem Individuum mit einem Krebs, mit dem Antikörper oder dem Fragment davon nach Anspruch 1 oder Anspruch 2 unter Bedingungen, die ausreichend sind, dass der Antikörper oder das Fragment davon nach Anspruch 1 oder Anspruch 2 an ein auf einem Tumor und/oder einer Krebszelle vorliegendes Epitop, sofern vorhanden, in der biologischen Probe bindet; und

    (b) Identifizieren in der biologischen Probe einer zirkulierenden Zelle oder mehrerer zirkulierender Zellen, die an den Antikörper oder das Fragment davon nach Anspruch 1 oder Anspruch 2 bindet/binden, wobei Wiederauftreten und/oder Fortschreiten eines Krebses bei dem Individuum prognostiziert werden/wird, wobei gegebenenfalls:

    (i) die isolierte biologische Probe eine Blutprobe, eine Lymphprobe, oder eine Fraktion davonumfasst; oder

    (ii) der Krebs ein Bauchspeicheldrüsenkrebs oder ein Brustkrebs ist.
18. Isoliertes Nucleinsäuremolekül, umfassend SEQ ID Nr. 4 und SEQ ID Nr. 6 oder codierend SEQ ID Nr. 5 und SEQ ID Nr. 7.
19. Isoliertes Nucleinsäuremolekül nach Anspruch 18, wobei das isolierte Nucleinsäuremolekül vorliegt: in einem Vektor, gegebenenfalls einem Expressionsvektor, und weiterhin gegebenenfalls in einem Expressionsvektor, funktionell verknüpft mit einer oder mehreren zusätzlichen Nucleotidsequenzen, die Subsequenzen der Antikörpermoleküle derart codieren, dass nach Einführung des Expressionsvektors in einen geeigneten Wirt ein intakter rekombinanter Antikörper, umfassend SEQ ID Nr. 5 und SEQ ID Nr. 7, oder ein Fragment davon von der Wirtszelle exprimiert wird.
20. Verfahren zum Nachweisen eines Tumors und/oder einer Krebszelle bei einem Individuum in vitro, umfassend:

    (a) Inkontaktbringen einer biologischen Probe, gegebenenfalls einer Blutprobe oder einer davon abgeleiteten Fraktion, die von dem Individuum isoliert wurde, mit einer Zusammensetzung, umfassend den Antikörper oder das Fragment davon nach Anspruch 1, unter Bedingungen, die ausreichend sind, dass der Antikörper oder das Fragment davon nach Anspruch 1 an ein auf einem Tumor und/oder einer Krebszelle vorliegendes Antigen, sofern vorhanden, in der biologischen Probe bindet; und

    (b) Nachweisen der Bindung des Antikörpers oder desFragments davon nach Anspruch 1 an die biologische Probe,

    wobei das Nachweisen indikativ dafür ist, dass ein Tumor und/oder eine Krebszelle bei dem Individuum vorhanden ist, und gegebenenfalls wobei:

    (i) der Tumor und/oder die Krebszelle ein Tumor der Bauchspeicheldrüse, der Brust, des Eierstocks, des Kolons oder des Rektums und/oder eine davon abgeleitete metastatische Zelle ist, welche(r) gegebenenfalls MUC1, ein mutiertes K-Ras oder beide exprimiert, oder

    (ii) der Antikörper oder das Fragment davon konjugiert ist mit einer nachweisbaren Markierung, umfassend ein bildgebendes Mittel, ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus paramagnetischen, radioaktiven und fluorogenen Ionen, gegebenenfalls wobei das radioaktive bildgebende Mittel ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus ⁴³K, ⁵²Fe, ⁵⁷Co, ⁶⁷Cu, ⁶⁷Ga, ⁶⁸Ga, ⁷⁷Br, ⁸¹Rb/^81MKr, ^87MSr, ^99MTc, ¹¹¹In, ¹¹³In, ¹²³I, ¹²⁵I, ¹²⁷Cs, ¹²⁹Cs, ¹³¹I, ¹³²I, ¹⁹⁷Hg, ²⁰³Pb und ²⁰⁶Bi.