HK1180371B - Compositions and assays to detect seasonal h1 influenza a virus nucleic acids - Google Patents

Claims (10)

1. Zusammensetzung, umfassend:

   mindestens zwei saisonale H1 Influenza A-spezifische Amplifikationsprimer, wobei die Primer einen Nukleinsäure-Oligonukleotid-Primer, umfassend mindestens 18 zusammenhängende Nukleotide von SEQ ID NR.:72 und SEQ ID NR.:73 oder deren vollständig komplementäre Sequenzen, umfassen; und

   eine für saisonale H1 Influenza A spezifische Oligonukleotid-Nachweissonde, umfassend mindestens 18 zusammenhängende Nukleotide von SEQ ID. NR. 74.
2. Zusammensetzung nach Anspruch 1, wobei jedes der Oligonukleotide ein oder mehrere Nukleotide an dem 5'-Ende enthält, die keinem Abschnitt der Nukleinsäuresequenz entsprechen, die das H1-Protein von der saisonalen H1 Influenza A oder dessen Komplement kodiert und wobei der Nukleinsäureprimer und die Sonde nicht mehr als 50 Nukleinsäuren in der Länge sind.
3. Zusammensetzung nach Anspruch 1, wobei die Nachweissonde mindestens ein erstes nachweisbares Label, funktionsfähig an die Oligonukleotid-Nachweissonde gebunden, umfasst.
4. Zusammensetzung nach Anspruch 1, umfassend :

   SEQ ID NR.:72 TTGAGGCAAATGGAAATCTAATA;

   SEQ ID NR.:73 TACATTCTGGAAAGGAAGACT; und

   SEQ ID NR.:74 AGTAGAGGCTTTGGATCAGGAATCATC.
5. Kit, umfassend die Zusammensetzung nach Anspruch 1.
6. Kit nach Anspruch 5, umfassend die Zusammensetzung in einem geeigneten Behälter und Anweisungen zur Verwendung der Zusammensetzung in einem beliebigen Assay zur Amplifikation von Polynukleotiden in einer biologischen Probe.
7. Verfahren zum Nachweis von saisonalem H1 Influenza A-Virus aus einer Probe, umfassend die Schritte:

   a. Kontaktieren einer Influenza A-Virus-Nukleinsäure von einer Probe mit einer Zusammensetzung nach einem der Ansprüche 1 bis 4;

   b. Bereitstellen von Bedingungen zum Amplifizieren der Nukleinsäure von Schritt a durch eine Polymerasekettenreaktion zum Erzeugen eines Amplifizierungsprodukts von der Nukleinsäure; und

   c. Nachweisen des Vorliegens oder der Abwesenheit von Amplifizierungsprodukt von Schritt b, wobei das Vorliegen des Amplifizierungsprodukts anzeigt, dass die Probe einen saisonalen H1 Influenza A-Virus enthält.
8. Verfahren zum Nachweisen und Differenzieren zwischen einem saisonalen H1 Influenza A-Virus, einem saisonalen H3 Influenza A-Virus und einem Schweine-H1N1 Influenza A-Virus von einer Probe, umfassend die Schritte:

   a. Kontaktieren der Nukleinsäure von einer Probe, die ein Influenza A-Virus enthält, ausgewählt aus der Gruppe, bestehend aus: saisonalem H1 Influenza A-Virus, saisonalem H3 Influenza A-Virus oder Schweine-H1N1Influenza A-Virus oder einer Kombination davon mit einer Zusammensetzung nach einem von Gemischen 1 bis 21, wie in Beispiel 5 definiert;

   b. Bereitstellen von Bedingungen zum Amplifizieren der Nukleinsäure von Schritt a durch eine Polymerasekettenreaktion zum Erzeugen eines Amplifizierungsprodukts von der Nukleinsäure; und

   c. Nachweisen des Vorliegens oder der Abwesenheit von Amplifizierungsprodukt aus Schritt b, wobei das Vorliegen des Amplifizierungsprodukts anzeigt, dass die Probe ein saisonales H1 Influenza A-Virus, saisonales H3 Influenza A-Virus oder Schweine-H1N1 Influenza A-Virus oder eine Kombination davon enthält.
9. Verfahren nach Anspruch 7 oder Anspruch 8, wobei der Nachweisschritt ein Echtzeit-Nachweisschritt ist, vorzugsweise, wobei der Nachweisschritt ein taqman PCR-Nachweisschritt ist; oder wobei die Probe eine saisonale H1 Influenza A-Virus-Nukleinsäure enthält und ein Amplifizierungsprodukt daraus erzeugt wird.
10. Zusammensetzung nach einem der Ansprüche 1 bis 4 oder das Kit nach Anspruch 5, wobei die Zusammensetzung oder das Kit weiter Nukleinsäureoligomere spezifisch für Schweine-H1N1 Influenza A-Virus und/oder saisonale H3 Influenza A enthält; vorzugsweise, wobei das Kit ein Multiplexnachweiskit ist, das mindestens zwei Primerpaare zum Amplifizieren von saisonaler H1 Influenza A und ein oder mehrere von Schweine-H1N1 Influenza A-Virus und saisonaler H3 Influenza A beinhaltet.