HK1012005B

HK1012005B - G-cap stabilized oligonucleotides

Info

Publication number: HK1012005B
Application number: HK98113227.1A
Authority: HK
Inventors: Peyman Anuschirwan; Uhlmann Eugen
Original assignee: Sanofi-Aventis Deutschland Gmbh
Priority date: 1995-01-31
Filing date: 1998-12-11
Publication date: 2002-07-05

Claims

Oligonucléotide de formule 5'-(CAP)-(Oligo)-(CAP)-3' dans laquelle (Oligo) représente une séquence de nucléotides de 10 à 40 nucléotides de longueur et la séquence de nucléotides de la fraction "Oligo" provient de domaines de gènes importants pour la transcription de l'ADN ou la traduction de l'ARNm correspondant; et CAP représente G_m, où m est un nombre entier de 0 à 10, et les deux CAP peuvent être définis indépendamment l'un de l'autre, et, dans le cas où m est 0 à l'extrémité 5' ou 3', les CAP doivent être différents, et l'extrémité de la séquence de "Oligo" n'est pas formée d'une guanine.
Oligonucléotide selon la revendication 1, dans lequel m est un nombre entier de 2 à 6.
Oligonucléotide selon la revendication 1, dans lequel m est un nombre de 3 à 5.
Oligonucléotide selon la revendication 1, dans lequel m est égal à 4.
Oligonucléotide de formule 5'-(CAP)-(Oligo)-(CAP)-3' dans laquelle (Oligo) représente une séquence de nucléotides de 10 à 40 nucléotides de longueur et la séquence de nucléotides de la fraction "Oligo" provient de domaines de gènes importants pour la transcription de l'ADN ou la traduction de l'ARNm correspondant, la séquence (Oligo) se terminant à l'extrémité 5' ou 3' par une ou plusieurs guanines; CAP représente G_(m-n), où m a la définition donnée dans la revendication 1 et n est le nombre de guanines présentes naturellement à l'extrémité 5' ou 3' de l'oligonucléotide (Oligo), et (m-n) est égal à 2 à 6, et les deux CAP présents dans la molécule peuvent être définis indépendamment l'un de l'autre.
Oligonucléotide selon la revendication 5, dans lequel (m-n) est un nombre de 3 à 5.
Oligonucléotide selon la revendication 5, dans lequel (m-n) est égal à 4.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 7, l'oligonucléotide étant modifié.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 8, dans lequel 2 à 10 nucléosides pyrimidiques non terminaux sont modifiés.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 9, l'oligonucléotide étant modifié au niveau du nucléotide terminal de l'extrémité 5' et/ou de l'extrémité 3'.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 10, dans lequel un ou plusieurs groupes d'au moins 1 à 4 nucléotides liés entre eux ne sont pas modifiés.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 11, dans lequel la modification est définie comme
(a) le remplacement total ou partiel des ponts phosphodiester en 3' et/ou 5' et/ou

(b) le remplacement total ou partiel des ponts phosphodiester en 3' et/ou 5' par des ponts "déphospho" et/ou

(c) le remplacement total ou partiel du squelette de phosphates de sucres et/ou

(d) le remplacement total ou partiel des unités β-D-2'-désoxyribose et/ou

(e) le remplacement total ou partiel des bases de nucléosides naturelles.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 12, dans lequel la modification est définie comme
(a) le remplacement total ou partiel des ponts phosphodiester en 3' et/ou 5' par des ponts phosphorothioate, phosphorodithioate, (NR¹R²)-phosphoramidate, boranophosphate, phosphate de O-alkyle en C₁-C₂₁, phosphate de [(aryl en C₆-C₂₀)-O-(alkyle en C₁-C₂₁)], phosphonate de 2,2,2-trichlorodiméthyléthyle, phosphonate d'alkyle en C₁-C₈, phosphonate d'aryle en C₆-C₁₂, où R¹ et R² représentent indépendamment l'un de l'autre un atome d'hydrogène ou un groupe alkyle en C₁-C₁₈, aryle en C₆-C₂₀, (aryl en C₆-C₁₄)-(alkyle en C₁-C₈), -(CH₂)_c-[NH(CH₂)_c]_d-NR³R³, où c est un nombre entier de 2 à 6 et d un nombre entier de 0 à 6, et les R³ représentent, indépendamment l'un de l'autre, un atome d'hydrogène ou un groupe alkyle en C₁-C₆ ou (alcoxy en C₁-C₄)-(alkyle en C₁-C₆), ou R¹ et R² forment ensemble, avec l'atome d'azote qui les porte, un cycle hétérocyclique de 5 à 6 chaînons pouvant contenir en outre un autre hétéroatome de la série O, S, N; et/ou

(b) le remplacement total ou partiel des ponts phosphodiester en 3' et/ou 5' par du formacétal, du 3'-thioformacétal, de la méthylhydroxylamine, une oxime, un groupe méthylènediméthylhydrazo, une diméthylènesulfone ou des groupes silyle et/ou

(c) le remplacement total ou partiel du squelette de phosphates de sucres par des oligomères de "morpholinonucléosides", des PNA ou des hybrides PNA-ADN, et/ou

(d) le remplacement total ou partiel des unités β-D-2'-désoxyribose par des unités α-D-2'-désoxyribose, L-2'-désoxyribose, 2'-F-2'-désoxyribose, 2'-O-(alkyl en C₁-C₆)ribose, 2'-O-(alcényl en C₂-C₆)ribose, 2'-NH₂-2'-désoxyribose, β-D-xylofuranose, α-arabinofuranose, 2,4-didésoxy-β-D-érythro-hexopyranose, des analogues de sucres carbocycliques, linéaires ou bicyclo, et/ou

(e) le remplacement total ou partiel des bases de nucléosides naturelles par du 5-(hydroxyméthyl)uracile, du 5-aminouracile, du pseudouracile, du dihydrouracile, un 5-(alkyl en C₁-C₆)uracile, un 5-(alcényl en C₂-C₆)uracile, un 5-(alcynyl en C₂-C₆)uracile, une 5-(alkyl en C₁-C₆)cytosine, une 5-(alcényl en C₂-C₆)cytosine, une 5-(alcynyl en C₂-C₆)cytosine, du 5-fluorouracile, de la 5-fluorocytosine, du 5-chlorouracile, de la 5-chlorocytosine, du 5-bromouracile, de la 5-bromocytosine, le remplacement des bases de nucléosides ne devant pas se faire dans les domaines CAP.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 13, dans lequel la modification est définie comme
(a) le remplacement total ou partiel des ponts phosphodiester en 3' et/ou 5' par des ponts phosphate de O-méthyle, phosphate de O-éthyle, phosphate de O-isopropyle, méthylphosphonate et/ou phénylphosphonate; et/ou

(b) le remplacement total ou partiel des unités β-D-2'-désoxyribose par du 2'-O-méthylribose, du 2'-O-allylribose et/ou du 2'-O-butylribose et/ou

(c) le remplacement total ou partiel des bases de nucléosides naturelles par la 5-pentynylcytosine, le 5-hexynyluracile et/ou la 5-hexynylcytosine, le remplacement de bases de nucléosides ne devant pas se faire dans les domaines CAP.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 14, dans lequel 2 ou 3 ponts phosphodiester à l'extrémité 5' et/ou à l'extrémité 3' de l'oligonucléotide sont remplacés.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 12, dans lequel des ponts phosphodiester sont remplacés au niveau des positions des pyrimidines.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 15 et 16, dans lequel les ponts phosphodiester sont remplacés par des ponts phosphorothioate.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 17, dans lequel deux ou trois unités de ribose sont remplacées à l'extrémité 5' et/ou à l'extrémité 3'.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 18, dans lequel des unités ribose sont remplacées au niveau des positions des pyrimidines.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 19, l'oligonucléotide étant lié à l'extrémité 3' et/ou 5' avec des molécules qui ont un effet favorable sur la pénétration des cellules, la résistance aux nucléases, l'affinité pour l'ARN/ADN cible ou la pharmacocinétique.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 20, l'oligonucléotide étant lié à l'extrémité 5' et/ou 3' avec des molécules choisies parmi une polylysine, des espaceurs, des composés fluorescents, des lieurs, des molécules lipophiles, des lipides, des stéroïdes, des vitamines, du polyéthylèneglycol ou de l'oligoéthylèneglycol, des phosphates de di(alkyle en C₁₂-C₁₈) ou des restes -O-CH₂-CH(OH)-O-(alkyle en C₁₂-C₁₈).
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 21, l'oligonucléotide étant lié à l'extrémité 5' et/ou 3' avec des molécules choisies parmi le pyrène, l'acridine, la phénazine, la phénanthridine, la fluorescéine, le psoralène, l'azidoproflavine, un alkyle en C₁₂-C₂₀, le 1,2-dihexadécyl-rac-glycérol, le cholestérol, la testostérone ou la vitamine E.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 22, l'oligonucléotide portant des inversions 3'-3' ou 5'-5' à l'extrémité 3' et/ou 5'.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications, dans lequel (Oligo) représente l'une des séquences
Oligonucléotide ayant l'une des séquences ou dans lesquelles "*" indique un pont phosphorothioate et "PY" représente le pyrène.
Oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 24, l'oligonucléotide ayant une séquence dirigée contre une cible qui est responsable de l'apparition d'un cancer ou du développement d'un cancer.
Procédé de préparation d'un oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 26, caractérisé en ce que l'on synthétise l'oligonucléotide par voie chimique sur un support solide.
Médicament contenant un ou plusieurs oligonucléotides selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 26 et un support physiologiquement acceptable, ainsi qu'éventuellement des additifs et/ou des agents auxiliaires appropriés.
Utilisation d'un oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 26 pour la préparation d'un médicament.
Utilisation d'un oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 26 pour la préparation d'un médicament destiné au traitement de maladies provoquées par des virus ou au traitement du cancer, de la resténose ou de maladies influencées par des intégrines ou des récepteurs d'adhésion cellule-cellule, ou déclenchées par des facteurs diffusibles.
Utilisation d'un oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 26 pour la préparation d'un agent de diagnostic.
Utilisation d'un oligonucléotide selon l'une ou plusieurs des revendications 1 à 26 pour la préparation d'un agent de diagnostic pour des maladies provoquées par des virus, pour le cancer, la resténose ou pour des maladies influencées par des intégrines ou des récepteurs d'adhésion cellule-cellule, ou déclenchées par des facteurs diffusibles.