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HK1060373A1 - Enzymes having alpha amylase activity and methods of use thereof - Google Patents

Enzymes having alpha amylase activity and methods of use thereof Download PDF

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HK1060373A1
HK1060373A1 HK04103245.3A HK04103245A HK1060373A1 HK 1060373 A1 HK1060373 A1 HK 1060373A1 HK 04103245 A HK04103245 A HK 04103245A HK 1060373 A1 HK1060373 A1 HK 1060373A1
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HK
Hong Kong
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polypeptide
set forth
nucleic acid
sequence
seq
Prior art date
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HK04103245.3A
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Chinese (zh)
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HK1060373B (en
Inventor
Walter Callen
Toby Richardson
Gerhard Frey
Carl Miller
Martin Kazaoka
Eric J. Mathur
Jay M. Short
Original Assignee
Verenium Corporation
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Filing date
Publication date
Application filed by Verenium Corporation filed Critical Verenium Corporation
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Publication of HK1060373B publication Critical patent/HK1060373B/en

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Claims (74)

  1. Acide nucléique isolé, synthétique ou recombinant, comprenant une séquence choisie dans le groupe consistant en :
    (a) la SEQ ID NO:1,
    (b) codant pour un polypeptide ayant une séquence représentée dans la SEQ ID NO:2, ou un fragment enzymatiquement actif ayant une activité d'amylase de la SEQ ID NO:2 d'au moins 75, 100 ou 150 résidus d'amino-acides de longueur ;
    (c) codant pour un polypeptide ayant une activité d'amylase de la SEQ ID NO:2 et (i) ayant une identité de séquence d'au moins 90 % sur la longueur totale de la SEQ ID NO:1, ou (ii) ayant une longueur d'au moins 200 nucléotides de la SEQ ID NO:1 et ayant une identité de séquence d'au moins 95 % avec la SEQ ID NO:1, ou (iii) ayant une longueur d'au moins 150 nucléotides de la SEQ ID NO:1 et ayant une identité de séquence d'au moins 97 % avec la SEQ ID NO:1, ou (iv) ayant une longueur d'au moins 75 nucléotides de la SEQ ID NO:1 ayant une identité de séquence d'au moins 89 % avec la SEQ ID NO:1 ;
    (d) codant pour un polypeptide ayant une activité d'amylase de la SEQ ID NO:2 et (i) ayant une identité de séquence d'au moins 95 % avec la SEQ ID NO:2, ou (ii) comprenant un fragment enzymatiquement actif de (i) et ayant au moins 150 résidus d'amino-acides de longueur et présentant une identité de séquence d'au moins 95 % avec la SEQ ID NO:2, ou un fragment enzymatiquement actif de (i) d'au moins 75 résidus d'amino-acides de longueur et ayant une identité de séquence d'au moins 98 % avec la SEQ ID NO:2 ; et
    (e) des séquences totalement complémentaires de (a), (b), (c) ou (d),
    où l'identité de séquence est déterminée en utilisant un algorithme de comparaison de séquences comprenant la version FASTA 3.0t78 avec les paramètres par défaut.
  2. Polypeptide isolé, synthétique ou recombinant, choisi dans le groupe consistant en :
    (a) une séquence d'amino-acides représentée dans la SEQ ID NO:2, ou un fragment enzymatiquement actif de la SEQ ID NO:2 ayant une activité d'amylase de la SEQ ID NO:2 d'au moins 75, 100 ou 150 résidus d'amino-acides de longueur ;
    (b) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique de la revendication 1(a) à 1(d) ayant l'activité d'amylase de la SEQ ID NO:2 ; et
    (c) une séquence d'amino-acides (i) ayant une identité de séquence d'au moins 95 % sur la longueur totale de la SEQ ID NO:2 ; ou (ii) comprenant un fragment enzymatiquement actif de (i) d'au moins 150 résidus d'amino-acides de longueur et ayant une identité de séquence d'au moins 95 % avec la SEQ ID NO:2, ou un fragment enzymatiquement actif de (i) d'au moins 75 résidus d'amino-acides de longueur ayant une identité de séquence d'au moins 98 % avec la SEQ ID NO:2, où le polypeptide de (i) ou (ii) a une activité d'amylase de la SEQ ID NO:2 ;
    l'identité de séquence étant déterminée en utilisant un algorithme de comparaison de séquences comprenant la version FASTA 3.0t78 avec les paramètres par défaut.
  3. Acide nucléique suivant la revendication 1, codant pour un polypeptide ayant une séquence d'amino-acides de (a), (b), (c), (d) ou (e), de la revendication 1, comprenant une séquence signal ou un peptide ou polypeptide hétérologue.
  4. Polypeptide suivant la revendication 2, comprenant une séquence d'aminoacides de (a), (b) ou (c), de la revendication 2, comprenant une séquence signal ou un peptide ou polypeptide hétérologue.
  5. Anticorps isolé ou recombinant qui se lie spécifiquement à un polypeptide choisi dans le groupe consistant en :
    (a) un polypeptide indiqué dans la revendication 2 ; et
    (b) un polypeptide codé par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1.
  6. Anticorps suivant la revendication 5, les anticorps étant polyclonaux ou monoclonaux.
  7. Procédé pour la production d'un polypeptide, comprenant les étapes d'introduction d'un acide nucléique codant pour un polypeptide dans une cellule hôte, et de culture de la cellule hôte dans des conditions qui permettent l'expression du polypeptide, dans lequel le polypeptide est choisi dans le groupe consistant en :
    (a) un polypeptide indiqué dans la revendication 2 ; et
    (b) un polypeptide codé par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1.
  8. Procédé pour engendrer un polynucléotide variant, comprenant :
    l'obtention d'un acide nucléique comprenant un polynucléotide indiqué dans la revendication 1 ou codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2 ; et
    la modification d'un ou plusieurs nucléotides dans ledit polynucléotide en un autre nucléotide, la délétion d'un ou plusieurs nucléotides présents dans ledit polynucléotide, ou l'addition d'un ou plusieurs nucléotides audit polynucléotide.
  9. Procédé suivant la revendication 8, dans lequel les modifications sont introduites par un procédé choisi dans le groupe consistant en : la PCR sensible à l'erreur, le brassage, la mutagenèse dirigée à un oligonucléotide, la PCR avec assemblage, la mutagenèse par PCR sexuelle, la mutagenèse in vivo, la mutagenèse de cassette, la mutagenèse d'ensemble récursif, la mutagenèse d'ensemble exponentiel, la mutagénèse spécifique d'un site, le réassemblage de gènes, la mutagenèse saturée à des sites de gènes et n'importe quelle combinaison de ces procédés.
  10. Procédé d'hydrolyse d'une liaison amylacée ou d'une liaison glycosidique dans une substance contenant une liaison glycosidique, comprenant la mise en contact d'une substance contenant la liaison amylacée ou glycosidique avec un polypeptide choisi dans le groupe consistant en
    (a) un polypeptide capable d'hydrolyser une liaison amylacée, codé par un polynucléotide ayant une séquence indiquée dans la revendication 1 ; et
    (b) un polypeptide capable d'hydrolyser une liaison amylacée, et une séquence indiquée dans la revendication 2,
    dans des conditions qui facilitent l'hydrolyse de la liaison amylacée.
  11. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant la catalyse de l'hydrolyse d'une liaison alpha-1,4-glucosidique, qui comprend l'étape de mise en contact d'un échantillon contenant une composition comprenant une liaison alpha-1,4-glucosidique avec un polypeptide ayant une séquence choisie dans le groupe consistant en :
    (a) un polypeptide capable d'hydrolyser une liaison alpha-1,4-glucosidique, codé par un polynucléotide ayant une séquence indiquée dans la revendication 1 ; et
    (b) un polypeptide capable d'hydrolyser une liaison alpha-1,4-glucosidique, ayant une séquence indiquée dans la revendication 2,
    dans des conditions qui facilitent l'hydrolyse de la liaison alpha-1,4-glucosidique.
  12. Analyse pour identifier un polypeptide enzymatiquement actif, ladite analyse comprenant les étapes :
    de mise en contact d'un polypeptide ayant une séquence indiquée dans la revendication 2 avec une molécule servant de substrat, dans des conditions qui permettent au polypeptide d'agir ; et
    de détection soit d'une diminution d'une quantité du substrat soit d'une augmentation d'une quantité d'un produit de réaction qui résulte d'une réaction entre ledit polypeptide et ledit substrat ; où une diminution de la quantité du substrat ou une augmentation de la quantité du produit de réaction indiquant un polypeptide fonctionnel.
  13. Sonde d'acide nucléique, comprenant une séquence d'acide nucléique indiquée dans la revendication 1, ou codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  14. Sonde suivant la revendication 13, dans laquelle l'oligonucléotide est un ADN ou un ARN ou un acide nucléique peptidique (PNA).
  15. Sonde suivant la revendication 13 ou 14, lesdites sondes comprenant en outre un marqueur isotopique détectable, ou comprenant en outre un marqueur non isotopique détectable choisi dans le groupe consistant en une molécule fluorescente, une molécule chimioluminescente, une enzyme, un cofacteur, un substrat d'enzyme et un haptène.
  16. Préparation de protéine, comprenant un polypeptide choisi dans le groupe consistant en :
    (a) un polypeptide codé par un polynucléotide ayant une séquence indiquée dans la revendication 1 ; et
    (b) un polypeptide ayant une séquence indiquée dans la revendication 2.
  17. Préparation de protéine suivant la revendication 16, ladite préparation de protéine comprenant une substance solide ou un liquide.
  18. Vecteur de clonage comprenant un polynucléotide ayant une séquence choisie dans le groupe consistant en :
    (a) une séquence d'acide nucléique indiquée dans la revendication 1 ; et
    (b) une séquence d'acide nucléique codant pour un polypeptide indiquée dans la revendication 2.
  19. Cellule hôte comprenant un vecteur de clonage suivant la revendication 18.
  20. Vecteur d'expression apte à la réplication dans une cellule hôte, comprenant un polynucléotide ayant une séquence choisie dans le groupe consistant en
    (a) une séquence d'acide nucléique indiquée dans la revendication 1 ; et
    (b) une séquence d'acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  21. Vecteur suivant les revendications 18 à 20, ledit vecteur étant choisi dans le groupe consistant en des vecteurs viraux, des vecteurs consistant en plasmides, des vecteurs consistant en phages, des vecteurs consistant en phagemides, des cosmides, des fosmides, des bactériophages, des chromosomes artificiels, des vecteurs adénoviraux, des vecteurs rétroviraux et des vecteurs viraux adéno-associés.
  22. Cellule hôte comprenant un vecteur d'expression suivant la revendication 21.
  23. Cellule hôte suivant la revendication 19 ou 22, ladite cellule hôte étant une cellule procaryotique, une cellule eucaryotique, une cellule fongique, une cellule de levure, une cellule d'insecte, une cellule de mammifère ou une cellule végétale.
  24. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant la liquéfaction d'une composition contenant de l'amidon, comprenant la mise en contact de l'amidon avec un polypeptide
    (a) codé par une séquence d'acide nucléique indiquée dans la revendication 1 ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2 ; ou
    (b) tel qu'indiqué dans la revendication 2.
  25. Sirop liquéfié produit par le procédé de la revendication 24 et ayant un rapport Mn/Mw inférieur à environ 2,0 à un équivalent en dextrose (DE) de 18 et inférieur à environ 4,0 à un DE de 12.
  26. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant le lavage d'un objet, comprenant la mise en contact dudit objet avec un polypeptide de la revendication 2 dans des conditions suffisantes pour ledit lavage.
  27. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant le désencollage d'une matière textile, qui comprend la mise en contact de ladite matière textile avec un polypeptide de la revendication 2 dans des conditions suffisantes pour ledit désencollage.
  28. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant le traitement de fibres ligno-cellulosiques, dans lequel les fibres sont traitées avec un polypeptide de la revendication 2.
  29. Procédé suivant la revendication 28, pour le désencrage enzymatique de pâte à papier recyclée, dans lequel le polypeptide de la revendication 2 est appliqué en une quantité qui est efficace pour le désencrage efficace de la surface des fibres.
  30. Additif pour détergents, comprenant un polypeptide de la revendication 2.
  31. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant la production d'un sirop à haute teneur en maltose ou d'un sirop à haute teneur en glucose ou bien d'un sirop mixte, comprenant :
    la liquéfaction d'amidon en utilisant une quantité efficace d'un polypeptide de la revendication 2 pour obtenir un hydrolysat d'amidon soluble ; et
    la saccharification de l'hydrolysat d'amidon soluble, avec ainsi pour résultat un sirop.
  32. Procédé suivant la revendication 10 ou 24, dans lequel l'amidon provient d'une matière choisie entre le riz, le riz germé, le maïs, l'orge, le blé, des légumes, la patate douce, le sorgho, le seigle, le boulgour ou une de leurs associations.
  33. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant l'augmentation de l'écoulement de fluides de production provenant d'une formation souterraine en éliminant un fluide perturbateur visqueux contenant de l'amidon formé au cours d'opérations de production et présent à l'intérieur de la formation souterraine qui entoure un puits de forage complété, comprenant les étapes consistant :
    à laisser des fluides de production s'écouler hors du puits de forage ;
    à réduire l'écoulement des fluides de production provenant de la formation à une vitesse d'écoulement inférieure aux vitesses d'écoulement prévues ;
    à formuler un agent de traitement enzymatique en mélangeant ensemble un fluide aqueux et un polypeptide de la revendication 2 ;
    à amener par pompage l'agent de traitement enzymatique à un emplacement désiré à l'intérieur du puits de forage ;
    à laisser l'agent de traitement enzymatique dégrader le puits perturbateur visqueux contenant l'amidon, ce qui fait que le fluide peut être éliminé de la formation souterraine jusqu'à la surface du puits ; et
    dans lequel le traitement enzymatique est efficace pour attaquer les liaisons alpha-glucosidiques présentes dans le fluide contenant de l'amidon.
  34. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant la liquéfaction d'une composition comprenant de l'amidon, le procédé comprenant l'étape de mise en contact de l'amidon avec un polypeptide ayant une activité d'amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  35. Amidon liquéfié produit par le procédé de la revendication 34, et comprenant
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1 ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2;ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  36. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant la préparation d'un additif alimentaire, d'un épaississant, d'un agent de charge à basse teneur en calories ou d'un agent filmogène, comprenant la mise en contact d'une composition comprenant de l'amidon avec une quantité suffisante d'un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase pour liquéfier l'amidon, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  37. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant la préparation d'un aliment pour animaux, comprenant la mise en contact d'une composition d'aliment pour animaux comprenant de l'amidon avec une quantité suffisante d'un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase pour liquéfier l'amidon présent dans l'aliment pour animaux, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  38. Procédé suivant l'une quelconque des revendications 31, 34-36, dans lequel l'amidon provient d'une matière comprenant le riz, le riz germé, le maïs, l'orge, le blé, des légumes, la patate douce, le millet, le sorgho, le seigle et/ou le boulgour ou une de leurs associations.
  39. Procédé suivant l'une quelconque des revendications 26-27, 31, 33-38, comprenant en outre l'addition d'une seconde alpha-amylase ou d'une bêta-amylase ou d'une de leurs associations.
  40. Aliment pour animaux, comprenant un polypeptide ayant une activité d'amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  41. Composition comprenant une composition de maltodextrine uniforme préparée par un procédé comprenant la liquéfaction d'une composition comprenant de l'amidon avec un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, où le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2 : ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  42. Additif alimentaire épaississant, agent servant de charge à basse teneur en calories ou agent filmogène comprenant des sirops liquéfiés, des sirops liquéfiés traités au carbone ou des sirops liquéfiés séchés par atomisation, comprenant un polypeptide ayant une activité d'amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  43. Composition d'aliment pour animaux, comprenant des sirops liquéfiés, des sirops liquéfiés traités au carbone ou des sirops liquéfiés séchés par atomisation, comprenant un polypeptide ayant une activité d'amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  44. Composition d'aliment pour animaux suivant la revendication 43, ladite composition d'aliment pour animaux comprenant un aliment pour animaux comprenant de l'amidon, ou bien la composition d'aliment pour animaux comprenant du maïs, du blé, du mil, du sorgho, du seigle et/ou du boulgour.
  45. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant la préparation d'un aliment pour animaux, comprenant l'utilisation d'un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  46. Procédé suivant la revendication 8, dans lequel la variation comprend une variation de la spécificité pour le substrat, de la liaison au substrat, du motif de clivage du substrat, de la stabilité thermique, du profil de pH / d'activité, du profil de pH / stabilité, d'une stabilité accrue à un pH bas inférieur à 6, d'une stabilité accrue à un pH bas inférieur à 5, d'une stabilité accrue à un pH élevé supérieur à 9, d'une stabilité vis-à-vis de l'oxydation, de la dépendance au Ca2+, de l'activité spécifique ou bien est moins sensible à des conditions de déplétion d'ions calcium.
  47. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant la préparation d'un alcool, comprenant la mise en contact d'une composition comprenant de l'amidon avec un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  48. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant un procédé de mouture humide du maïs, comprenant l'utilisation d'un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  49. Procédé de mouture humide du maïs suivant la revendication 48, ledit procédé comprenant en outre l'utilisation d'un second polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, ou d'une bêta-amylase ou bien d'une autre enzyme.
  50. Détergent comprenant un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2;ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  51. Procédé de cuisson au four, comprenant l'utilisation d'un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  52. Boisson comprenant un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans laquelle le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  53. Pâte à pain, produit de boulangerie ou produit cuit au four, comprenant un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  54. Prémélange pour cuisson au four, comprenant une farine comprenant un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  55. Additif pour cuisson au four, comprenant un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  56. Matière textile comprenant un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans laquelle le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  57. Papier, pâte à papier ou papier recyclé, comprenant un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  58. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant un procédé de forage comprenant l'utilisation d'un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  59. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant un procédé de mouture sèche, comprenant l'utilisation d'un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase pour la liquéfaction de céréales de mouture intégrale, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2 ; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  60. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant un procédé de brassage, comprenant l'utilisation d'un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  61. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant un procédé de traitement de matières textiles, comprenant l'utilisation d'un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  62. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant un procédé de traitement de papier, de pâte à papier ou de papier recyclé, comprenant l'utilisation d'un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  63. Procédé suivant la revendication 10, ledit procédé comprenant un procédé pour la préparation d'une boisson comprenant l'utilisation d'un polypeptide ayant une activité d'alpha-amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2 ; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  64. Polypeptide suivant la revendication 2, dans lequel la séquence signal a une longueur de 13 à 36 résidus d'amino-acides.
  65. Procédé pour la préparation d'un additif alimentaire, d'un épaississant, d'un agent servant de charge à basse teneur en calories ou d'un agent filmogène, comprenant l'utilisation d'un polypeptide ayant une activité d'amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2;ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  66. Procédé pour la préparation d'un éthanol pour carburants, comprenant l'utilisation d'un polypeptide ayant une activité d'amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  67. Procédé en champ pétrolifère, comprenant l'utilisation d'un polypeptide ayant une activité d'amylase, dans lequel le polypeptide comprend
    (a) une séquence d'amino-acides codée par un acide nucléique indiqué dans la revendication 1, ou un acide nucléique codant pour un polypeptide indiqué dans la revendication 2; ou
    (b) un polypeptide indiqué dans la revendication 2.
  68. Acide nucléique isolé, synthétique ou recombinant, suivant la revendication 1, codant pour un polypeptide ayant une activité d'amylase de la SEQ ID NO:2 et ayant une identité de séquence d'au moins 97 % avec la SEQ ID NO:2.
  69. Acide nucléique isolé, synthétique ou recombinant, suivant la revendication 1, codant pour un polypeptide ayant une activité d'amylase de la SEQ ID NO:2 et ayant une identité de séquence d'au moins 98 % avec la SEQ ID NO:2.
  70. Polypeptide isolé, synthétique ou recombinant, suivant la revendication 2, comprenant une séquence d'amino-acides ayant une identité de séquence d'au moins 97 % sur la longueur totale de la SEQ ID NO:2 et ayant une activité d'amylase de la SEQ ID NO:2.
  71. Polypeptide isolé, synthétique ou recombinant, suivant la revendication 2, comprenant une séquence d'amino-acides ayant une identité de séquence d'au moins 98 % sur la longueur totale de la SEQ ID NO:2 et ayant une activité d'amylase de la SEQ ID NO: 2.
  72. Polypeptide isolé, synthétique ou recombinant, suivant la revendication 2, dépourvu de séquence signal.
  73. Polypeptide isolé, synthétique ou recombinant, suivant la revendication 2, dépourvu de séquence signal, comprenant en outre un peptide hétérologue ou comprenant en outre une séquence peptidique ou polypeptidique hétérologue, dans lequel la séquence peptidique ou polypeptidique hétérologue comprend de préférence une séquence leader, une séquence de sécrétion, ou une séquence d'un pro-protéine.
  74. Polypeptide isolé, synthétique ou recombinant, suivant la revendication 2, 72 ou 73, comprenant une modification comprenant une glycosylation, une acétylation, une acylation, une ADP-ribosylation, une amidation, la fixation covalente de flavine, la fixation covalente d'un groupement hème, la fixation covalente d'un nucléotide ou d'un dérivé de nucléotide, la fixation covalente d'un lipide ou d'un dérivé lipidique, la fixation covalente d'un phosphatidylinositol, une cyclisation par réticulation, la formation de liaisons disulfure, une déméthylation, la formation de réticulations covalentes, la formation de cystéine, la formation de pyroglutamate, une formylation, une gamma-carboxylation, une glycosylation, une ancre GPI, une hydroxylation, une iodation, une méthylation, une myristoylation, une oxydation, une pégylation, un traitement protéolytique, une phosphorylation, une prénylation, une racémisation, une sélénoylation ou une sulfatation.
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